FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDB0068, 1032 aa
1>>>pF1KSDB0068 1032 - 1032 aa - 1032 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.6938+/-0.00177; mu= -7.1314+/- 0.104
mean_var=450.9376+/-94.502, 0's: 0 Z-trim(107.1): 184 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.060397
statistics sampled from 9215 (9356) to 9215 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.614), E-opt: 0.2 (0.287), width: 16
Scan time: 4.870
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8945.1 KIF5A gene_id:3798|Hs108|chr12 (1032) 6605 591.7 2.6e-168
CCDS74586.1 KIF5C gene_id:3800|Hs108|chr2 ( 957) 4656 421.9 3.2e-117
CCDS7171.1 KIF5B gene_id:3799|Hs108|chr10 ( 963) 4384 398.2 4.4e-110
CCDS75296.1 KIF3A gene_id:11127|Hs108|chr5 ( 726) 969 100.5 1.4e-20
CCDS13200.1 KIF3B gene_id:9371|Hs108|chr20 ( 747) 953 99.1 3.7e-20
CCDS75295.1 KIF3A gene_id:11127|Hs108|chr5 ( 702) 948 98.6 4.8e-20
CCDS34235.1 KIF3A gene_id:11127|Hs108|chr5 ( 699) 931 97.2 1.3e-19
CCDS34042.1 CENPE gene_id:1062|Hs108|chr4 (2701) 925 97.2 4.9e-19
CCDS47324.1 KIF4B gene_id:285643|Hs108|chr5 (1234) 910 95.6 7e-19
CCDS14401.1 KIF4A gene_id:24137|Hs108|chrX (1232) 899 94.6 1.4e-18
CCDS68768.1 CENPE gene_id:1062|Hs108|chr4 (2580) 873 92.7 1.1e-17
CCDS44079.1 KIF17 gene_id:57576|Hs108|chr1 (1028) 859 91.1 1.3e-17
CCDS213.1 KIF17 gene_id:57576|Hs108|chr1 (1029) 859 91.1 1.3e-17
CCDS33744.1 KIF15 gene_id:56992|Hs108|chr3 (1388) 816 87.4 2.2e-16
CCDS112.1 KIF1B gene_id:23095|Hs108|chr1 (1153) 746 81.3 1.3e-14
CCDS7867.1 KIF18A gene_id:81930|Hs108|chr11 ( 898) 743 80.9 1.3e-14
CCDS111.1 KIF1B gene_id:23095|Hs108|chr1 (1770) 746 81.4 1.8e-14
CCDS45709.2 KIF18B gene_id:146909|Hs108|chr17 ( 852) 733 80.0 2.4e-14
CCDS45494.1 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16 ( 687) 724 79.1 3.5e-14
CCDS81988.1 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16 ( 724) 724 79.1 3.7e-14
CCDS45493.1 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16 ( 826) 724 79.2 4e-14
CCDS10789.2 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16 ( 833) 724 79.2 4e-14
CCDS81989.1 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16 ( 848) 724 79.2 4.1e-14
CCDS58555.1 KIF18B gene_id:146909|Hs108|chr17 ( 833) 721 78.9 4.8e-14
CCDS4844.1 KIF6 gene_id:221458|Hs108|chr6 ( 814) 717 78.6 6.1e-14
CCDS81987.1 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16 ( 684) 712 78.1 7.2e-14
CCDS32718.2 KIF19 gene_id:124602|Hs108|chr17 ( 998) 710 78.1 1.1e-13
CCDS72722.1 KIF17 gene_id:57576|Hs108|chr1 ( 929) 695 76.7 2.5e-13
CCDS58444.1 KIF22 gene_id:3835|Hs108|chr16 ( 597) 672 74.5 7.4e-13
CCDS7422.1 KIF11 gene_id:3832|Hs108|chr10 (1056) 678 75.3 7.7e-13
CCDS10653.1 KIF22 gene_id:3835|Hs108|chr16 ( 665) 672 74.6 8e-13
CCDS2751.1 KIF9 gene_id:64147|Hs108|chr3 ( 725) 645 72.3 4.3e-12
CCDS2752.1 KIF9 gene_id:64147|Hs108|chr3 ( 790) 645 72.3 4.6e-12
>>CCDS8945.1 KIF5A gene_id:3798|Hs108|chr12 (1032 aa)
initn: 6605 init1: 6605 opt: 6605 Z-score: 3135.3 bits: 591.7 E(32554): 2.6e-168
Smith-Waterman score: 6605; 99.9% identity (100.0% similar) in 1032 aa overlap (1-1032:1-1032)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAETNNECSIKVLCRFRPLNQAEILRGDKFIPIFQGDDSVVIGGKPYVFDRVFPPNTTQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 MAETNNECSIKVLCRFRPLNQAEILRGDKFIPIFQGDDSVVIGGKPYVFDRVFPPNTTQE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD QVYHACAMQIVKDVLAGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDPQLMGIIPRIARDIFNHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 QVYHACAMQIVKDVLAGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDPQLMGIIPRIARDIFNHI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD YSMDENLEFHIKVSYFEIYLDKIRDLLDVTKTNLSVHEDKNRVPFVKGCTERFVSSPEEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 YSMDENLEFHIKVSYFEIYLDKIRDLLDVTKTNLSVHEDKNRVPFVKGCTERFVSSPEEI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD LDVIDEGKSNRHVAVTNMNEHSSRSHSIFLINIKQENMETEQKLSGKLYLVDLAGSEKVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 LDVIDEGKSNRHVAVTNMNEHSSRSHSIFLINIKQENMETEQKLSGKLYLVDLAGSEKVS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD KTGAEGAVLDEAKNINKSLSALGNVISALAEGTKSYVPYRDSKMTRILQDSLGGNCRTTM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 KTGAEGAVLDEAKNINKSLSALGNVISALAEGTKSYVPYRDSKMTRILQDSLGGNCRTTM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD FICCSPSSYNDAETKSTLMFGQRAKTIKNTASVNLELTAEQWKKKYEKEKEKTKAQKETI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 FICCSPSSYNDAETKSTLMFGQRAKTIKNTASVNLELTAEQWKKKYEKEKEKTKAQKETI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD AKLEAELSRWRNGENVPETERLAGEEAALGAELCEETPVNDNSSIVVRIAPEERQKYEEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 AKLEAELSRWRNGENVPETERLAGEEAALGAELCEETPVNDNSSIVVRIAPEERQKYEEE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD IRRLYKQLDDKDDEINQQSQLIEKLKQQMLDQEELLVSTRGDNEKVQRELSHLQSENDAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 IRRLYKQLDDKDDEINQQSQLIEKLKQQMLDQEELLVSTRGDNEKVQRELSHLQSENDAA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD KDEVKEVLQVLEELAVNYDQKSQEVEEKSQQNQLLVDELSQKVATMLSLESELQRLQEVS
:::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 KDEVKEVLQALEELAVNYDQKSQEVEEKSQQNQLLVDELSQKVATMLSLESELQRLQEVS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD GHQRKRIAEVLNGLMKDLSEFSVIVGNGEIKLPVEISGAIEEEFTVARLYISKIKSEVKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 GHQRKRIAEVLNGLMKDLSEFSVIVGNGEIKLPVEISGAIEEEFTVARLYISKIKSEVKS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD VVKRCRQLENLQVECHRKMEVTGRELSSCQLLISQHEAKIRSLTEYMQSVELKKRHLEES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 VVKRCRQLENLQVECHRKMEVTGRELSSCQLLISQHEAKIRSLTEYMQSVELKKRHLEES
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD YDSLSDELAKLQAQETVHEVALKDKEPDTQDADEVKKALELQMESHREAHHRQLARLRDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 YDSLSDELAKLQAQETVHEVALKDKEPDTQDADEVKKALELQMESHREAHHRQLARLRDE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD INEKQKTIDELKDLNQKLQLELEKLQADYEKLKSEEHEKSTKLQELTFLYERHEQSKQDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 INEKQKTIDELKDLNQKLQLELEKLQADYEKLKSEEHEKSTKLQELTFLYERHEQSKQDL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD KGLEETVARELQTLHNLRKLFVQDVTTRVKKSAEMEPEDSGGIHSQKQKISFLENNLEQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 KGLEETVARELQTLHNLRKLFVQDVTTRVKKSAEMEPEDSGGIHSQKQKISFLENNLEQL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD TKVHKQLVRDNADLRCELPKLEKRLRATAERVKALEGALKEAKEGAMKDKRRYQQEVDRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 TKVHKQLVRDNADLRCELPKLEKRLRATAERVKALEGALKEAKEGAMKDKRRYQQEVDRI
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD KEAVRYKSSGKRGHSAQIAKPVRPGHYPASSPTNPYGTRSPECISYTNSLFQNYQNLYLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 KEAVRYKSSGKRGHSAQIAKPVRPGHYPASSPTNPYGTRSPECISYTNSLFQNYQNLYLQ
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD ATPSSTSDMYFANSCTSSGATSSGGPLASYQKANMDNGNATDINDNRSDLPCGYEAEDQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 ATPSSTSDMYFANSCTSSGATSSGGPLASYQKANMDNGNATDINDNRSDLPCGYEAEDQA
970 980 990 1000 1010 1020
1030
pF1KSD KLFPLHQETAAS
::::::::::::
CCDS89 KLFPLHQETAAS
1030
>>CCDS74586.1 KIF5C gene_id:3800|Hs108|chr2 (957 aa)
initn: 4634 init1: 3190 opt: 4656 Z-score: 2217.9 bits: 421.9 E(32554): 3.2e-117
Smith-Waterman score: 4656; 75.3% identity (92.4% similar) in 952 aa overlap (7-952:6-956)
10 20 30 40 50
pF1KSD MAETNNECSIKVLCRFRPLNQAEILRGDKFIPIFQGDDSVVIG-GKPYVFDRVFPPNTTQ
::::::.:::::::.::::::::::: :.::..:::: :::::::::.::::::
CCDS74 MADPAECSIKVMCRFRPLNEAEILRGDKFIPKFKGDETVVIGQGKPYVFDRVLPPNTTQ
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD EQVYHACAMQIVKDVLAGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDPQLMGIIPRIARDIFNH
::::.::: ::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:
CCDS74 EQVYNACAKQIVKDVLEGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDPQLMGIIPRIAHDIFDH
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD IYSMDENLEFHIKVSYFEIYLDKIRDLLDVTKTNLSVHEDKNRVPFVKGCTERFVSSPEE
::::::::::::::::::::::::::::::.::::.:::::::::.::::::::::::::
CCDS74 IYSMDENLEFHIKVSYFEIYLDKIRDLLDVSKTNLAVHEDKNRVPYVKGCTERFVSSPEE
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD ILDVIDEGKSNRHVAVTNMNEHSSRSHSIFLINIKQENMETEQKLSGKLYLVDLAGSEKV
..:::::::.::::::::::::::::::::::::::::.:::.:::::::::::::::::
CCDS74 VMDVIDEGKANRHVAVTNMNEHSSRSHSIFLINIKQENVETEKKLSGKLYLVDLAGSEKV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD SKTGAEGAVLDEAKNINKSLSALGNVISALAEGTKSYVPYRDSKMTRILQDSLGGNCRTT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::..:::::::::::::::::::::::
CCDS74 SKTGAEGAVLDEAKNINKSLSALGNVISALAEGTKTHVPYRDSKMTRILQDSLGGNCRTT
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD MFICCSPSSYNDAETKSTLMFGQRAKTIKNTASVNLELTAEQWKKKYEKEKEKTKAQKET
. :::::: .:.:::::::::::::::::::.:::::::::.:::::::::::.:. :..
CCDS74 IVICCSPSVFNEAETKSTLMFGQRAKTIKNTVSVNLELTAEEWKKKYEKEKEKNKTLKNV
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD IAKLEAELSRWRNGENVPETERLAGEEAALGAELCEETPVNDN-SSIVVRIAPEERQKYE
: .:: ::.:::::: ::: :...... . : :..::. :: . .:. :. ::..::.
CCDS74 IQHLEMELNRWRNGEAVPEDEQISAKDQK-NLEPCDNTPIIDNIAPVVAGISTEEKEKYD
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KSD EEIRRLYKQLDDKDDEINQQSQLIEKLKQQMLDQEELLVSTRGDNEKVQRELSHLQSEND
::: ::.::::::::::::::: ::::::::::.:::.::: : ::.:.::..:: ::.
CCDS74 EEISSLYRQLDDKDDEINQQSQLAEKLKQQMLDQDELLASTRRDYEKIQEELTRLQIENE
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KSD AAKDEVKEVLQVLEELAVNYDQKSQEVEEKSQQNQLLVDELSQKVATMLSLESELQRLQE
:::::::::::.::::::::::::::::.:.. :. :.:::.::..:. . . ::..:::
CCDS74 AAKDEVKEVLQALEELAVNYDQKSQEVEDKTRANEQLTDELAQKTTTLTTTQRELSQLQE
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KSD VSGHQRKRIAEVLNGLMKDLSEFSVIVGNGEIKLPVEISGAIEEEFTVARLYISKIKSEV
.:.::.:: .:.:: :.:::.:.. :.:....: ....:.::::::.:::::::.::::
CCDS74 LSNHQKKRATEILNLLLKDLGEIGGIIGTNDVKTLADVNGVIEEEFTMARLYISKMKSEV
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KSD KSVVKRCRQLENLQVECHRKMEVTGRELSSCQLLISQHEAKIRSLTEYMQSVELKKRHLE
::.:.: .:::. :.. .:::... :::..::::::::::::.:::.:::..: :.:.::
CCDS74 KSLVNRSKQLESAQMDSNRKMNASERELAACQLLISQHEAKIKSLTDYMQNMEQKRRQLE
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KSD ESYDSLSDELAKLQAQETVHEVALKDKEPD----TQDADEVKKALELQMESHREAHHRQL
:: ::::.:::::.::: .:::...::: . :::.:.::::: :::::::::..::
CCDS74 ESQDSLSEELAKLRAQEKMHEVSFQDKEKEHLTRLQDAEEMKKALEQQMESHREAHQKQL
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KSD ARLRDEINEKQKTIDELKDLNQKLQLELEKLQADYEKLKSEEHEKSTKLQELTFLYERHE
.::::::.:::: :::..::::::::: :::..::.::: :..:. ::..: .: ...:
CCDS74 SRLRDEIEEKQKIIDEIRDLNQKLQLEQEKLSSDYNKLKIEDQEREMKLEKLLLLNDKRE
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KSD QSKQDLKGLEETVARELQTLHNLRKLFVQDVTTRVKKSAEMEPEDSGGIHSQKQKISFLE
:...:::::::::.::::::::::::::::.:::::::.:.. .:.:: .:::::::::
CCDS74 QAREDLKGLEETVSRELQTLHNLRKLFVQDLTTRVKKSVELDNDDGGGSAAQKQKISFLE
780 790 800 810 820 830
840 850 860 870 880 890
pF1KSD NNLEQLTKVHKQLVRDNADLRCELPKLEKRLRATAERVKALEGALKEAKEGAMKDKRRYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::.::.:..:::
CCDS74 NNLEQLTKVHKQLVRDNADLRCELPKLEKRLRATAERVKALESALKEAKENAMRDRKRYQ
840 850 860 870 880 890
900 910 920 930 940 950
pF1KSD QEVDRIKEAVRYKSSGKRGHSAQIAKPVRPGHYPASSPTNPYGTRSPECISYTNSLFQNY
::::::::::: :. ..:.::::::::.::::::::::: .. :. : ... .:
CCDS74 QEVDRIKEAVRAKNMARRAHSAQIAKPIRPGHYPASSPTAVHAIRGGGGSSSNSTHYQK
900 910 920 930 940 950
960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD QNLYLQATPSSTSDMYFANSCTSSGATSSGGPLASYQKANMDNGNATDINDNRSDLPCGY
>>CCDS7171.1 KIF5B gene_id:3799|Hs108|chr10 (963 aa)
initn: 4366 init1: 1521 opt: 4384 Z-score: 2089.7 bits: 398.2 E(32554): 4.4e-110
Smith-Waterman score: 4384; 72.0% identity (90.4% similar) in 939 aa overlap (7-939:6-941)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAETNNECSIKVLCRFRPLNQAEILRGDKFIPIFQGDDSVVIGGKPYVFDRVFPPNTTQE
::.:::.:::::::..:. ::::.: :::.:.:::..:::.::::: .:.::
CCDS71 MADLAECNIKVMCRFRPLNESEVNRGDKYIAKFQGEDTVVIASKPYAFDRVFQSSTSQE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD QVYHACAMQIVKDVLAGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDPQLMGIIPRIARDIFNHI
:::. :: .:::::: :::::::::::::::::::::::::::. :::::::..::::.:
CCDS71 QVYNDCAKKIVKDVLEGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDPEGMGIIPRIVQDIFNYI
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KSD YSMDENLEFHIKVSYFEIYLDKIRDLLDVTKTNLSVHEDKNRVPFVKGCTERFVSSPEEI
:::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::.::::::::: ::.:.
CCDS71 YSMDENLEFHIKVSYFEIYLDKIRDLLDVSKTNLSVHEDKNRVPYVKGCTERFVCSPDEV
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KSD LDVIDEGKSNRHVAVTNMNEHSSRSHSIFLINIKQENMETEQKLSGKLYLVDLAGSEKVS
.:.:::::::::::::::::::::::::::::.:::: .:::::::::::::::::::::
CCDS71 MDTIDEGKSNRHVAVTNMNEHSSRSHSIFLINVKQENTQTEQKLSGKLYLVDLAGSEKVS
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KSD KTGAEGAVLDEAKNINKSLSALGNVISALAEGTKSYVPYRDSKMTRILQDSLGGNCRTTM
::::::::::::::::::::::::::::::::. .::::::::::::::::::::::::.
CCDS71 KTGAEGAVLDEAKNINKSLSALGNVISALAEGS-TYVPYRDSKMTRILQDSLGGNCRTTI
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KSD FICCSPSSYNDAETKSTLMFGQRAKTIKNTASVNLELTAEQWKKKYEKEKEKTKAQKETI
:::::::::..::::::.:::::::::::. ::.:::::::::::::::::.: ..::
CCDS71 VICCSPSSYNESETKSTLLFGQRAKTIKNTVCVNVELTAEQWKKKYEKEKEKNKILRNTI
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410
pF1KSD AKLEAELSRWRNGENVPETERLAGEEAALGAELCEE--TPVNDNSSIVVRI----APEER
:: ::.::::::.:: :.. :.: : : .. : .::. . .. . . ::
CCDS71 QWLENELNRWRNGETVPIDEQFDKEKANLEAFTVDKDITLTNDKPATAIGVIGNFTDAER
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KSD QKYEEEIRRLYKQLDDKDDEINQQSQLIEKLKQQMLDQEELLVSTRGDNEKVQRELSHLQ
.: :::: .:::::::::.::::::::.:::: :::::::::.::: :....: ::..::
CCDS71 RKCEEEIAKLYKQLDDKDEEINQQSQLVEKLKTQMLDQEELLASTRRDQDNMQAELNRLQ
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KSD SENDAAKDEVKEVLQVLEELAVNYDQKSQEVEEKSQQNQLLVDELSQKVATMLSLESELQ
.::::.:.:::::::.::::::::::::::::.:... .:: :::.:: ::. :...:::
CCDS71 AENDASKEEVKEVLQALEELAVNYDQKSQEVEDKTKEYELLSDELNQKSATLASIDAELQ
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KSD RLQEVSGHQRKRIAEVLNGLMKDLSEFSVIVGNGEIKLPVEISGAIEEEFTVARLYISKI
.:.:...::.:: ::.. .:.:::.:... :::...: : : .: :.::::::::::::.
CCDS71 KLKEMTNHQKKRAAEMMASLLKDLAEIGIAVGNNDVKQP-EGTGMIDEEFTVARLYISKM
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KSD KSEVKSVVKRCRQLENLQVECHRKMEVTGRELSSCQLLISQHEAKIRSLTEYMQSVELKK
:::::..::::.:::. :.: ..::: . .::..::: ::::::::.:::::.:.:: ::
CCDS71 KSEVKTMVKRCKQLESTQTESNKKMEENEKELAACQLRISQHEAKIKSLTEYLQNVEQKK
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KSD RHLEESYDSLSDELAKLQAQETVHEVALKDKEPDTQDADEVKKALELQMESHREAHHRQL
:.:::: :.::.::..:.::: :::. :.. .: :.:::.:.: :..::::.:..:.
CCDS71 RQLEESVDALSEELVQLRAQEKVHEME-KEHLNKVQTANEVKQAVEQQIQSHRETHQKQI
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KSD ARLRDEINEKQKTIDELKDLNQKLQLELEKLQADYEKLKSEEHEKSTKLQELTFLYERHE
. ::::.. : : : .:.: :::..:: :.:....::::. ..::: ::.::: . .:.:
CCDS71 SSLRDEVEAKAKLITDLQDQNQKMMLEQERLRVEHEKLKATDQEKSRKLHELTVMQDRRE
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KSD QSKQDLKGLEETVARELQTLHNLRKLFVQDVTTRVKKSAEMEPEDSGGIHSQKQKISFLE
:..:::::::::::.:::::::::::::::..::::::::.. .:.:: .:::::::::
CCDS71 QARQDLKGLEETVAKELQTLHNLRKLFVQDLATRVKKSAEIDSDDTGGSAAQKQKISFLE
780 790 800 810 820 830
840 850 860 870 880 890
pF1KSD NNLEQLTKVHKQLVRDNADLRCELPKLEKRLRATAERVKALEGALKEAKEGAMKDKRRYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::.: .:..:::
CCDS71 NNLEQLTKVHKQLVRDNADLRCELPKLEKRLRATAERVKALESALKEAKENASRDRKRYQ
840 850 860 870 880 890
900 910 920 930 940 950
pF1KSD QEVDRIKEAVRYKSSGKRGHSAQIAKPVRPGHYPASSPTNPYGTRSPECISYTNSLFQNY
::::::::::: :. ..::::::::::.:::..::.:::.: . :
CCDS71 QEVDRIKEAVRSKNMARRGHSAQIAKPIRPGQHPAASPTHPSAIRGGGAFVQNSQPVAVR
900 910 920 930 940 950
960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD QNLYLQATPSSTSDMYFANSCTSSGATSSGGPLASYQKANMDNGNATDINDNRSDLPCGY
CCDS71 GGGGKQV
960
>>CCDS75296.1 KIF3A gene_id:11127|Hs108|chr5 (726 aa)
initn: 881 init1: 407 opt: 969 Z-score: 483.1 bits: 100.5 E(32554): 1.4e-20
Smith-Waterman score: 1002; 32.8% identity (60.2% similar) in 716 aa overlap (2-676:6-699)
10 20 30 40
pF1KSD MAETNNEC-SIKVLCRFRPLNQAEI------------LRGDKFIPIFQGDDSVVIG
.: . : ..::. : ::::. : .:: : . . :.:
CCDS75 MPINKSEKPESCDNVKVVVRCRPLNEREKSMCYKQAVSVDEMRGT--ITVHKTDSSNE-P
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KSD GKPYVFDRVFPPNTTQEQVYHACAMQIVKDVLAGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDP
: ..:: :: :.. : .::. : :. .:: ::::::::::::..::: :::: :
CCDS75 PKTFTFDTVFGPESKQLDVYNLTARPIIDSVLEGYNGTIFAYGQTGTGKTFTMEGVRAIP
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KSD QLMGIIPRIARDIFNHIYSMDENLEFHIKVSYFEIYLDKIRDLLDVTKTN-LSVHEDKNR
.: :::: ::.:: . . . .: ..:::.::: ...:::: .:. : :.: .
CCDS75 ELRGIIPNSFAHIFGHIAKAEGDTRFLVRVSYLEIYNEEVRDLLGKDQTQRLEVKERPDV
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KSD VPFVKGCTERFVSSPEEILDVIDEGKSNRHVAVTNMNEHSSRSHSIFLINIK--QENMET
..: . :.. ... .. :..:: :..:::::::::::.:: :.:. .....
CCDS75 GVYIKDLSAYVVNNADDMDRIMTLGHKNRSVGATNMNEHSSRSHAIFTITIECSEKGIDG
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270
pF1KSD EQKLS-GKLYLVDLAGSEKVSKTGAEGAVLDEAKNINKSLSALGNVISALAEGTKSYVPY
.... :::.::::::::. .:::: : : :: .:: :::.::::::::..: ...:::
CCDS75 NMHVRMGKLHLVDLAGSERQAKTGATGQRLKEATKINLSLSTLGNVISALVDGKSTHVPY
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KSD RDSKMTRILQDSLGGNCRTTMFICCSPSSYNDAETKSTLMFGQRAKTIKNTASVNLELTA
:.::.::.:::::::: .: : .:..:: :: ::: ...:::.::: : .: :
CCDS75 RNSKLTRLLQDSLGGNSKTMMCANIGPADYNYDETISTLRYANRAKNIKNKARIN-EDPK
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KSD EQWKKKYEKEKEKTKAQKETIAKL---------EAELSRWRNGENVPETERLAGEEAALG
. ....:: :. : . : .. : . . . ::. . .. : .. .
CCDS75 DALLRQFQKEIEELKKKLEEGEEISGSDISGSEEDDDEEGEVGEDGEKRKKRRGSSSSSS
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440
pF1KSD AE-LCE--ETPVND---NSSIVVRIAP----EERQKYEEEIRRLYKQLDDKDDEINQQSQ
.. : : :.. :.. ...: : . : .:: . : .:: ...: :.
CCDS75 SDSTCSVIEKPLDKFLPNQAGKKKVSPDKMIEMQAKIDEERKALETKLDMEEEERNKARA
420 430 440 450 460 470
450 460 470 480 490 500
pF1KSD LIEKLKQQMLDQEELLVSTRGDNEKVQRELSHLQSENDAAKDEVKEVLQVLEELAVNYDQ
.:: ....: .. ..... ..:: : :. . : ..: :: ..
CCDS75 ELEKREKDLLKAQQ-------EHQSLLEKLSAL--EKKVIVGGV-DLLAKAEEQEKLLEE
480 490 500 510 520
510 520 530 540 550 560
pF1KSD KSQEVEEKSQQNQLLVDELSQKVATMLSLESELQRLQEVSGHQRKRIAEVLNGLMKDLSE
...:.::. .. . : :: .: :..: . ::: . . :.. .: . :: ::
CCDS75 SNMELEERRKRAEQLRRELEEKEQERLDIEEKYTSLQEEAQGKTKKLKKVWTMLMAAKSE
530 540 550 560 570 580
570 580 590 600 610
pF1KSD FSVIVGNGEIKLPVEISGAIEEEFTVAR-LYISKIKSEVKSVVKRCRQLENLQVECHRKM
.. . . . :: : .:. ..: : .. . . . . : : : .. : .
CCDS75 MADL----QQEHQREIEGLLENIRQLSRELRLQMLI--IDNFIPRDYQ-EMIENYVHWNE
590 600 610 620 630
620 630 640 650 660 670
pF1KSD EVTGRELSSCQLLISQHEAKIRSLTEYMQS----VELKKRHLEESYDSLSDELAKLQAQE
.. :. .: ... : . . .. :.:.. .: . .:: . : ::. .
CCDS75 DI-GEWQLKCVAYTGNNMRKQTPVPDKKEKDPFEVDLSHVYLAYTEESLRQSLMKLERPR
640 650 660 670 680 690
680 690 700 710 720 730
pF1KSD TVHEVALKDKEPDTQDADEVKKALELQMESHREAHHRQLARLRDEINEKQKTIDELKDLN
:
CCDS75 TSKGKARPKTGRRKRSAKPETVIDSLLQ
700 710 720
>>CCDS13200.1 KIF3B gene_id:9371|Hs108|chr20 (747 aa)
initn: 806 init1: 416 opt: 953 Z-score: 475.4 bits: 99.1 E(32554): 3.7e-20
Smith-Waterman score: 1014; 33.1% identity (62.9% similar) in 726 aa overlap (1-692:1-702)
10 20 30 40 50
pF1KSD MAETNNECSIKVLCRFRPLNQAEILRG-DKFIPIFQGDDSVVIGG---------KPYVFD
:.. .. :..:. : ::.: : . :: . . .: . . : ..::
CCDS13 MSKLKSSESVRVVVRCRPMNGKEKAASYDKVVDVDVKLGQVSVKNPKGTAHEMPKTFTFD
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD RVFPPNTTQEQVYHACAMQIVKDVLAGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDPQLMGIIP
:. :. : ..: .: .:: :.::::::::::..:::.:::: ::. :.::
CCDS13 AVYDWNAKQFELYDETFRPLVDSVLQGFNGTIFAYGQTGTGKTYTMEGIRGDPEKRGVIP
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160
pF1KSD RIARDIFNHIYSMDENLEFHIKVSYFEIYLDKIRDLLDVTKTN-LSVHEDKNRVPFVKGC
::.:: : ..: .. ...::.::: ..:::::. .:. : ..: . .::
CCDS13 NSFDHIFTHI-SRSQNQQYLVRASYLEIYQEEIRDLLSKDQTKRLELKERPDTGVYVKDL
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KSD TERFVSSPEEILDVIDEGKSNRHVAVTNMNEHSSRSHSIFLINIK--QENMETEQKLS-G
. ..: .:: :.. :..:: :..:::::::::::.::.:.:. . ... :... :
CCDS13 SSFVTKSVKEIEHVMNVGNQNRSVGATNMNEHSSRSHAIFVITIECSEVGLDGENHIRVG
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KSD KLYLVDLAGSEKVSKTGAEGAVLDEAKNINKSLSALGNVISALAEGTKSYVPYRDSKMTR
:: ::::::::. .::::.: : :: .:: ::::::::::::..: ....::::::.::
CCDS13 KLNLVDLAGSERQAKTGAQGERLKEATKINLSLSALGNVISALVDGKSTHIPYRDSKLTR
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KSD ILQDSLGGNCRTTMFICCSPSSYNDAETKSTLMFGQRAKTIKNTASVNLELTAEQWKKKY
.:::::::: .:.: .:.::: :: .:: ...:::.::: :: : . ...
CCDS13 LLQDSLGGNAKTVMVANVGPASYNVEETLTTLRYANRAKNIKNKPRVN-EDPKDALLREF
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KSD EKEKEKTKAQ--KETIAKLEAELSRWRNGENVP--ETERLAGEEAALGAELCEETPVNDN
..: . ::: :..:.. . . .: ..: . : :. :::. .. .. ...
CCDS13 QEEIARLKAQLEKRSIGRRKRREKRREGGGSGGGGEEEEEEGEEGEEEGDDKDDYWREQQ
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450
pF1KSD SSIVV--RIAPEERQKYEEEIRRLYKQLDDKDDEINQQSQLIEKLKQQMLDQE-ELLVST
.. . : :... :: :: :. . : ... .... : : .. .: .:::.
CCDS13 EKLEIEKRAIVEDHSLVAEEKMRLLKEKEKKMEDLRREKDAAEMLGAKIKAMESKLLVGG
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KSD RG----DNEKVQRELSHLQSENDAAKDEVKEVLQVLEELAVNYDQKSQEVEEKSQQNQLL
.. ::. :. : . ..: : . .:. : .: . :... :..: .. :
CCDS13 KNIVDHTNEQ-QKILEQKRQEIAEQKRREREIQQQME----SRDEETLELKETYSSLQQE
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550 560 570
pF1KSD VDELSQKVATMLS----LESELQRLQEVSGHQRKRIAEVLNGLMKDLSEFSVIVGNGEIK
:: ..:. ..: ...:.. ::: ..:... .. : : ..:. .:. :
CCDS13 VDIKTKKLKKLFSKLQAVKAEIHDLQEEHIKERQELEQTQNELTRELKLKHLIIENF---
540 550 560 570 580 590
580 590 600 610 620
pF1KSD LPVEISGAIEEEFTVARLYISKIKSEVKSVVKRCRQLENLQVECHRKMEVTG--RELSSC
.:.: :. . : .... ... : .. .::: :. .: . ..: : ::.
CCDS13 IPLE-----EKSKIMNRAFFDEEEDHWK--LHPITRLENQQMM-KRPVSAVGYKRPLSQH
600 610 620 630 640
630 640 650 660 670 680
pF1KSD --QLLISQHEAKIRSLTEYMQSVELKKRHLEESYDSLSDELA-KLQAQETVHEVALKDKE
. .. . ::. :. . . ... .: . : . .: :.:: . ..::.:..
CCDS13 ARMSMMIRPEARYRAENIVLLELDMPSR---TTRDYEGPAIAPKVQA---ALDAALQDED
650 660 670 680 690
690 700 710 720 730 740
pF1KSD PDTQDADEVKKALELQMESHREAHHRQLARLRDEINEKQKTIDELKDLNQKLQLELEKLQ
::
CCDS13 EIQVDASSFESTANKKSKARPKSGRKSGSSSSSSGTPASQLYPQSRGLVPK
700 710 720 730 740
>>CCDS75295.1 KIF3A gene_id:11127|Hs108|chr5 (702 aa)
initn: 881 init1: 407 opt: 948 Z-score: 473.4 bits: 98.6 E(32554): 4.8e-20
Smith-Waterman score: 1018; 33.5% identity (60.8% similar) in 701 aa overlap (2-676:6-675)
10 20 30 40
pF1KSD MAETNNEC-SIKVLCRFRPLNQAEI------------LRGDKFIPIFQGDDSVVIG
.: . : ..::. : ::::. : .:: : . . :.:
CCDS75 MPINKSEKPESCDNVKVVVRCRPLNEREKSMCYKQAVSVDEMRGT--ITVHKTDSSNE-P
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KSD GKPYVFDRVFPPNTTQEQVYHACAMQIVKDVLAGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDP
: ..:: :: :.. : .::. : :. .:: ::::::::::::..::: :::: :
CCDS75 PKTFTFDTVFGPESKQLDVYNLTARPIIDSVLEGYNGTIFAYGQTGTGKTFTMEGVRAIP
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KSD QLMGIIPRIARDIFNHIYSMDENLEFHIKVSYFEIYLDKIRDLLDVTKTN-LSVHEDKNR
.: :::: ::.:: . . . .: ..:::.::: ...:::: .:. : :.: .
CCDS75 ELRGIIPNSFAHIFGHIAKAEGDTRFLVRVSYLEIYNEEVRDLLGKDQTQRLEVKERPDV
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KSD VPFVKGCTERFVSSPEEILDVIDEGKSNRHVAVTNMNEHSSRSHSIFLINIK--QENMET
..: . :.. ... .. :..:: :..:::::::::::.:: :.:. .....
CCDS75 GVYIKDLSAYVVNNADDMDRIMTLGHKNRSVGATNMNEHSSRSHAIFTITIECSEKGIDG
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270
pF1KSD EQKLS-GKLYLVDLAGSEKVSKTGAEGAVLDEAKNINKSLSALGNVISALAEGTKSYVPY
.... :::.::::::::. .:::: : : :: .:: :::.::::::::..: ...:::
CCDS75 NMHVRMGKLHLVDLAGSERQAKTGATGQRLKEATKINLSLSTLGNVISALVDGKSTHVPY
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KSD RDSKMTRILQDSLGGNCRTTMFICCSPSSYNDAETKSTLMFGQRAKTIKNTASVNLELTA
:.::.::.:::::::: .: : .:..:: :: ::: ...:::.::: : .: :
CCDS75 RNSKLTRLLQDSLGGNSKTMMCANIGPADYNYDETISTLRYANRAKNIKNKARIN-EDPK
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KSD EQWKKKYEKEKEKTKAQKETIAKLEAELSRWRNGENVPETERLAGEEAALGAELCEETPV
. ....:: :. : . : :.: : .. .:. ::. .: . ..
CCDS75 DALLRQFQKEIEELKKKLEE----GEEIS----GSDISGSEEDDDEEGEVGEDGEKRKKR
360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KSD NDNSSIVVRIAP----EERQKYEEEIRRLYKQLDDKDDEINQQSQLIEKLKQQMLDQEEL
:... ...: : . : .:: . : .:: ...: :. .:: ....: ..
CCDS75 RDQAGKK-KVSPDKMIEMQAKIDEERKALETKLDMEEEERNKARAELEKREKDLLKAQQ-
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500 510
pF1KSD LVSTRGDNEKVQRELSHLQSENDAAKDEVKEVLQVLEELAVNYDQKSQEVEEKSQQNQLL
..... ..:: : :. . : ..: :: .....:.::. .. . :
CCDS75 ------EHQSLLEKLSAL--EKKVIVGGV-DLLAKAEEQEKLLEESNMELEERRKRAEQL
470 480 490 500 510
520 530 540 550 560 570
pF1KSD VDELSQKVATMLSLESELQRLQEVSGHQRKRIAEVLNGLMKDLSEFSVIVGNGEIKLPVE
:: .: :..: . ::: . . :.. .: . :: ::.. . . . :
CCDS75 RRELEEKEQERLDIEEKYTSLQEEAQGKTKKLKKVWTMLMAAKSEMADL----QQEHQRE
520 530 540 550 560 570
580 590 600 610 620 630
pF1KSD ISGAIEEEFTVAR-LYISKIKSEVKSVVKRCRQLENLQVECHRKMEVTGRELSSCQLLIS
: : .:. ..: : .. . . . . : : : .. : . .. :. .: .
CCDS75 IEGLLENIRQLSRELRLQMLI--IDNFIPRDYQ-EMIENYVHWNEDI-GEWQLKCVAYTG
580 590 600 610 620
640 650 660 670 680 690
pF1KSD QHEAKIRSLTEYMQS----VELKKRHLEESYDSLSDELAKLQAQETVHEVALKDKEPDTQ
.. : . . .. :.:.. .: . .:: . : ::. .:
CCDS75 NNMRKQTPVPDKKEKDPFEVDLSHVYLAYTEESLRQSLMKLERPRTSKGKARPKTGRRKR
630 640 650 660 670 680
700 710 720 730 740 750
pF1KSD DADEVKKALELQMESHREAHHRQLARLRDEINEKQKTIDELKDLNQKLQLELEKLQADYE
CCDS75 SAKPETVIDSLLQ
690 700
>>CCDS34235.1 KIF3A gene_id:11127|Hs108|chr5 (699 aa)
initn: 881 init1: 407 opt: 931 Z-score: 465.4 bits: 97.2 E(32554): 1.3e-19
Smith-Waterman score: 1016; 33.4% identity (60.5% similar) in 697 aa overlap (2-676:6-672)
10 20 30 40
pF1KSD MAETNNEC-SIKVLCRFRPLNQAEI------------LRGDKFIPIFQGDDSVVIG
.: . : ..::. : ::::. : .:: : . . :.:
CCDS34 MPINKSEKPESCDNVKVVVRCRPLNEREKSMCYKQAVSVDEMRGT--ITVHKTDSSNE-P
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KSD GKPYVFDRVFPPNTTQEQVYHACAMQIVKDVLAGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDP
: ..:: :: :.. : .::. : :. .:: ::::::::::::..::: :::: :
CCDS34 PKTFTFDTVFGPESKQLDVYNLTARPIIDSVLEGYNGTIFAYGQTGTGKTFTMEGVRAIP
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KSD QLMGIIPRIARDIFNHIYSMDENLEFHIKVSYFEIYLDKIRDLLDVTKTN-LSVHEDKNR
.: :::: ::.:: . . . .: ..:::.::: ...:::: .:. : :.: .
CCDS34 ELRGIIPNSFAHIFGHIAKAEGDTRFLVRVSYLEIYNEEVRDLLGKDQTQRLEVKERPDV
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KSD VPFVKGCTERFVSSPEEILDVIDEGKSNRHVAVTNMNEHSSRSHSIFLINIK--QENMET
..: . :.. ... .. :..:: :..:::::::::::.:: :.:. .....
CCDS34 GVYIKDLSAYVVNNADDMDRIMTLGHKNRSVGATNMNEHSSRSHAIFTITIECSEKGIDG
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270
pF1KSD EQKLS-GKLYLVDLAGSEKVSKTGAEGAVLDEAKNINKSLSALGNVISALAEGTKSYVPY
.... :::.::::::::. .:::: : : :: .:: :::.::::::::..: ...:::
CCDS34 NMHVRMGKLHLVDLAGSERQAKTGATGQRLKEATKINLSLSTLGNVISALVDGKSTHVPY
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KSD RDSKMTRILQDSLGGNCRTTMFICCSPSSYNDAETKSTLMFGQRAKTIKNTASVNLELTA
:.::.::.:::::::: .: : .:..:: :: ::: ...:::.::: : .: :
CCDS34 RNSKLTRLLQDSLGGNSKTMMCANIGPADYNYDETISTLRYANRAKNIKNKARIN-EDPK
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KSD EQWKKKYEKEKEKTKAQKETIAKLEAELSRWRNGENVPETERLAGEEAALGAELCEETPV
. ....:: :. : . : :.: : .. .:. ::. .: . ..
CCDS34 DALLRQFQKEIEELKKKLEE----GEEIS----GSDISGSEEDDDEEGEVGEDGEKRKKR
360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KSD NDNSSIVVRIAPEERQKYEEEIRRLYKQLDDKDDEINQQSQLIEKLKQQMLDQEELLVST
.... : . : .:: . : .:: ...: :. .:: ....: ..
CCDS34 RGKKKVSPDKMIEMQAKIDEERKALETKLDMEEEERNKARAELEKREKDLLKAQQ-----
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500 510
pF1KSD RGDNEKVQRELSHLQSENDAAKDEVKEVLQVLEELAVNYDQKSQEVEEKSQQNQLLVDEL
..... ..:: : :. . : ..: :: .....:.::. .. . : ::
CCDS34 --EHQSLLEKLSAL--EKKVIVGGV-DLLAKAEEQEKLLEESNMELEERRKRAEQLRREL
470 480 490 500 510
520 530 540 550 560 570
pF1KSD SQKVATMLSLESELQRLQEVSGHQRKRIAEVLNGLMKDLSEFSVIVGNGEIKLPVEISGA
.: :..: . ::: . . :.. .: . :: ::.. . . . :: :
CCDS34 EEKEQERLDIEEKYTSLQEEAQGKTKKLKKVWTMLMAAKSEMADL----QQEHQREIEGL
520 530 540 550 560 570
580 590 600 610 620 630
pF1KSD IEEEFTVAR-LYISKIKSEVKSVVKRCRQLENLQVECHRKMEVTGRELSSCQLLISQHEA
.:. ..: : .. . . . . : : : .. : . .. :. .: ...
CCDS34 LENIRQLSRELRLQMLI--IDNFIPRDYQ-EMIENYVHWNEDI-GEWQLKCVAYTGNNMR
580 590 600 610 620 630
640 650 660 670 680 690
pF1KSD KIRSLTEYMQS----VELKKRHLEESYDSLSDELAKLQAQETVHEVALKDKEPDTQDADE
: . . .. :.:.. .: . .:: . : ::. .:
CCDS34 KQTPVPDKKEKDPFEVDLSHVYLAYTEESLRQSLMKLERPRTSKGKARPKTGRRKRSAKP
640 650 660 670 680 690
700 710 720 730 740 750
pF1KSD VKKALELQMESHREAHHRQLARLRDEINEKQKTIDELKDLNQKLQLELEKLQADYEKLKS
CCDS34 ETVIDSLLQ
>>CCDS34042.1 CENPE gene_id:1062|Hs108|chr4 (2701 aa)
initn: 762 init1: 207 opt: 925 Z-score: 455.2 bits: 97.2 E(32554): 4.9e-19
Smith-Waterman score: 967; 29.1% identity (59.1% similar) in 976 aa overlap (1-902:1-936)
10 20 30 40 50
pF1KSD MAETNNECSIKVLCRFRPLNQAEILRGDKFIPIFQGDDSVVI---GGKPYVFDRVFPPNT
::: : .. : : ::::. : :. .. :..:. :.: . ::::: :
CCDS34 MAE---EGAVAVCVRVRPLNSREESLGETAQVYWKTDNNVIYQVDGSKSFNFDRVFHGNE
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD TQEQVYHACAMQIVKDVLAGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDPQLMGIIPRIARDIF
: ..::. : :. ... ::::::::::::.::::.:: : . . .:.::: .:::
CCDS34 TTKNVYEEIAAPIIDSAIQGYNGTIFAYGQTASGKTYTMMG---SEDHLGVIPRAIHDIF
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD NHIYSMDENLEFHIKVSYFEIYLDKIRDLLDVTKTN--LSVHEDKNRVPFVKGCTERFVS
..: .. . :: ..:::.::: . : ::: :. : ..:: :: .: ::. :
CCDS34 QKIKKFPDR-EFLLRVSYMEIYNETITDLLCGTQKMKPLIIREDVNRNVYVADLTEEVVY
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KSD SPEEILDVIDEGKSNRHVAVTNMNEHSSRSHSIFLINIKQE------NMETEQKLSGKLY
. : : : .:...:: . :.::..:::::.:: . .... : : :.: .:
CCDS34 TSEMALKWITKGEKSRHYGETKMNQRSSRSHTIFRMILESREKGEPSNCEGSVKVS-HLN
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KSD LVDLAGSEKVSKTGAEGAVLDEAKNINKSLSALGNVISALAEG-TKSYVPYRDSKMTRIL
::::::::....::: :. : :. :::.:: ::.::. :..: . ... :::::.::::
CCDS34 LVDLAGSERAAQTGAAGVRLKEGCNINRSLFILGQVIKKLSDGQVGGFINYRDSKLTRIL
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KSD QDSLGGNCRTTMFICCSPSSYNDAETKSTLMFGQRAKTIKNTASVNLELTAEQWKKKYEK
:.::::: .: .. .: :.. :: ..:.:.. :: .::: :: : : :.:.:
CCDS34 QNSLGGNAKTRIICTITPVSFD--ETLTALQFASTAKYMKNTPYVNEVSTDEALLKRYRK
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390
pF1KSD E----KEK-------TKAQ---KETIAKL--EAELSRWRNGENVPETERL--AGEEAALG
: :.. :.:: :. .:.: : .: . ..:.. . :. .. .:
CCDS34 EIMDLKKQLEEVSLETRAQAMEKDQLAQLLEEKDLLQKVQNEKIENLTRMLVTSSSLTLQ
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430
pF1KSD AEL----------C-------EETPVNDNSSIVVRIAPEERQKYEEEIRRLYKQLDDKDD
:: : ... :. .: . :. . .. . .:.. ... ...:
CCDS34 QELKAKRKRRVTWCLGKINKMKNSNYADQFNIPTNITTKTHKLSINLLREIDESVCSESD
420 430 440 450 460 470
440 450 460 470 480
pF1KSD EINQQSQLIEKLKQ----QMLDQEEL---LVSTRGDNEKVQRELSHLQSENDAAKDEVKE
... . . ... ..:.::.. : : :.: ... . .:..:.. . ..::
CCDS34 VFSNTLDTLSEIEWNPATKLLNQENIESELNSLRADYDNLVLDYEQLRTEKEEMELKLKE
480 490 500 510 520 530
490 500 510 520 530
pF1KSD V--LQVLEELA--VNYDQKSQEVEEKSQ----------QNQLLVDELSQKVATMLSLESE
:. .: : .. ::. : ..: :. :: : .:::.:: . :..
CCDS34 KNDLDEFEALERKTKKDQEMQLIHEISNLKNLVKHAEVYNQDLENELSSKVELLREKEDQ
540 550 560 570 580 590
540 550 560 570 580 590
pF1KSD LQRLQEVSGHQRKRIAEVLNGLMKDLSEFSVIVGNGEIKLPVEISGAIEEEFTVARLYIS
...::: :. :... ::: .:. :. : ... .. . :::
CCDS34 IKKLQEYIDSQK------LENIKMDLS-YSL----ESIEDPKQMKQTLFDAETVA-----
600 610 620 630
600 610 620 630 640
pF1KSD KIKSEVKSVVKRCRQLENLQVECHRKMEVTGREL-SSCQLLISQHEAKIR---SLTEYMQ
. .. .:. : ..:: :. : ... .: ... .. :: :: ::: . .: . .:
CCDS34 -LDAKRESAFLRSENLE-LK-EKMKELATTYKQMENDIQLYQSQLEAKKKMQVDLEKELQ
640 650 660 670 680 690
650 660 670 680 690 700
pF1KSD SVELKKRHLEESYDSL--SDELAKLQAQETVHEVALKDKEPDTQDADEVKKALELQMESH
:. . .: :. .: : .:. . . .. :. . .... . ... :. . :.
CCDS34 SAFNEITKLTSLIDGKVPKDLLCNLELEGKITDLQ-KELNKEVEENEALRE--EVILLSE
700 710 720 730 740
710 720 730 740 750 760
pF1KSD REAHHRQLARLRDEINEKQKTIDELKDLNQKLQLELEKLQADYEKLKSEEHEKSTKLQEL
.. .. ::: ::..:.. . . . ..:: :. . .. . : : . . :
CCDS34 LKSLPSEVERLRKEIQDKSEELHIITSEKDKLFSEVVHKESRVQGLLEEIGKTKDDLATT
750 760 770 780 790 800
770 780 790 800 810 820
pF1KSD TFLYERHEQSKQDLKGLEETVARELQTLHNLRKLFVQDVTTRVKKSAEMEPEDSGGIHSQ
:. .: :..: :. .. . . . . . :.. :. : : . ::. . .
CCDS34 QSNYKSTDQEFQNFKTLHMDFEQKYKMVLEENERMNQEI---VNLSKEAQKFDSS-LGAL
810 820 830 840 850 860
830 840 850 860 870 880
pF1KSD KQKISFLENNLEQLTKVHKQLVRDNADLRCELPKLEKRLRATAERVKALEGALKEAKEGA
: ..:. ..:.. :. .. . . .:. .: . .. :. :.:: :.: . : . .
CCDS34 KTELSYKTQELQEKTREVQERLNEMEQLKEQLENRDSTLQ-TVEREKTL---ITEKLQQT
870 880 890 900 910 920
890 900 910 920 930 940
pF1KSD MKDKRRYQQEVDRIKEAVRYKSSGKRGHSAQIAKPVRPGHYPASSPTNPYGTRSPECISY
... . :: : .:.
CCDS34 LEEVKTLTQEKDDLKQLQESLQIERDQLKSDIHDTVNMNIDTQEQLRNALESLKQHQETI
930 940 950 960 970 980
>>CCDS47324.1 KIF4B gene_id:285643|Hs108|chr5 (1234 aa)
initn: 621 init1: 233 opt: 910 Z-score: 452.4 bits: 95.6 E(32554): 7e-19
Smith-Waterman score: 959; 29.0% identity (59.9% similar) in 960 aa overlap (1-902:1-925)
10 20 30 40 50
pF1KSD MAETNNECSIKVLCRFRPLNQAEILRGDK----FIPIFQGDDSVVIG-GKPYVFDRVFPP
: : . ..: : ::: :: .: . :.: :. .::.: : ...: :: :
CCDS47 MKEEVKGIPVRVALRCRPLVPKEISEGCQMCLSFVP---GETQVVVGTDKSFTYDFVFDP
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD NTTQEQVYHACAMQIVKDVLAGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDPQ----LMGIIPR
: ::.:.. . ..: .. :::.:..:::::.::::..: : : .:::::
CCDS47 CTEQEEVFNKAVAPLIKGIFKGYNATVLAYGQTGSGKTYSMGGAYTAEQENEPTVGIIPR
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KSD IARDIFNHIYSMDENLEFHIKVSYFEIYLDKIRDLL--DVTKTNLSVHEDKNRVPFVKGC
. . .:..: . ..:: .::::.::: ..: ::: . :......:: .. . :
CCDS47 VIQLLFKEI-DKKSDFEFTLKVSYLEIYNEEILDLLCPSREKAQINIREDPKEGIKIVGL
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KSD TERFVSSPEEILDVIDEGKSNRHVAVTNMNEHSSRSHSIFLINIKQENMETEQ-KLSGKL
::. : . .. ...:...: :: : :: .:::::.:: :.:.:.. .. .. .::
CCDS47 TEKTVLVALDTVSCLEQGNNSRTVASTAMNSQSSRSHAIFTISIEQRKKSDKNCSFRSKL
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KSD YLVDLAGSEKVSKTGAEGAVLDEAKNINKSLSALGNVISALAEGTK-SYVPYRDSKMTRI
.::::::::. .:: ::: : :. :::..: ::::::::.. : :.:::::::.::.
CCDS47 HLVDLAGSERQKKTKAEGDRLKEGININRGLLCLGNVISALGDDKKGSFVPYRDSKLTRL
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KSD LQDSLGGNCRTTMFICCSPSSYNDAETKSTLMFGQRAKTIKNTASVNLE-LTAEQWKKKY
:::::::: .: :. : ::.. : :: ::: ...::. ::: ::.. ::: . :
CCDS47 LQDSLGGNSHTLMIACVSPADSNLEETLSTLRYADRARKIKNKPIVNIDPHTAELNHLKQ
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KSD EKEKEKT---KAQKETI-AKLEAELSRWRNGENVPE-TERLAGEEAALGAELCEETPVND
. .. .. .:. :. ....:: :. : ... : .. :. :. :. : ...
CCDS47 QVQQLQVLLLQAHGGTLPGSINAEPSE--NLQSLMEKNQSLVEENEKLSR--CLSKAAGQ
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450
pF1KSD NSSIVVRIAPEER--QKYEEEIRRLYKQLDDKDDEINQQSQLIEKLKQQMLDQEELLVST
..... :: :. .: . ....: ... : : ..:.: :..: : .. .. .
CCDS47 TAQMLERIILTEQVNEKLNAKLEELRQHVACKLD----LQKLVETLEDQELKENVEIICN
420 430 440 450 460
460 470 480 490 500 510
pF1KSD RGDNEKVQRELSHLQSENDAAKDEVKEVLQVLEELAVNYD-QKSQEVEEKSQQNQLLVDE
.:. ...:..:. : . .. : :: :. . . :. . . :. : .
CCDS47 ------LQQLITQLSDETVACTAAAIDT-AVEEEAQVETSPETSRSSDAFTTQHALHQAQ
470 480 490 500 510 520
520 530 540 550 560 570
pF1KSD LSQKVATM---LSLESELQRLQEVSGHQRKRIAEVLNGLMKDLSEFSVIVGNGEIKLPVE
.:..:. . :.:. : : . . .: . : . .:.: :. :: . : . :.
CCDS47 MSKEVVELNNALALKEALVRKMTQNDNQLQPIQFQYQDNIKNL-ELEVINLQKEKEELVR
530 540 550 560 570 580
580 590 600 610 620 630
pF1KSD ISGAIEEEFTVARL--YISKIKSEVKSVVKRCRQLENLQVECHRKMEVTGRELSSCQ---
. ... . :.: . :. .:... . .. : : . . : : : .:. .
CCDS47 ELQTAKKNVNQAKLSEHRHKLLQELEGQIADLKKKLNEQSKLLKLKESTERTVSKLNQEI
590 600 610 620 630 640
640 650 660 670
pF1KSD -LLISQHEAKIRSLTEYMQS------------VELKKRHLEESYDSLSDELAKLQAQETV
.. .:. .:.. : .. ..::.: ...:. :. : ..: : .:
CCDS47 WMMKNQRVQLMRQMKEDAEKFRQWKQKKDKEVIQLKERDRKRQYELLKLE-RNFQKQSSV
650 660 670 680 690
680 690 700 710 720
pF1KSD HEVALKDKEPDTQDADE-VKKALELQME-----SHREAHHRQ--LARLRDEINEKQKTID
:. : .. :.. .: ::. : : .. ..: .. ::.:. .... ...
CCDS47 ----LRRKTEEAAAANKRLKDALQKQREVTDKRKETQSHGKEGIAARVRNWLGNEIEVMV
700 710 720 730 740 750
730 740 750 760 770 780
pF1KSD ELKDLNQKLQ--LELEKLQA-DYEKLKSEEHEKST---KLQELTF-LYERHEQSKQDLKG
.. ...:. :: .:. : : .:: ... . . ::.. :: : : : : ..
CCDS47 STEEAKRHLNDLLEDRKILAQDVVQLKEKKESRENPPPKLRKCTFSLSEVHGQVLES---
760 770 780 790 800 810
790 800 810 820 830 840
pF1KSD LEETVARELQTLHNLRKLFVQDVTTRVKKSAEMEPEDSGGIHSQKQKISFLENNLEQLTK
:. .......:.. .: ... .: . : :: :: . . ::
CCDS47 -EDCITKQIESLETEMELRSAQIADLQQKLLDAESED-----RPKQCWENIATILEAKCA
820 830 840 850 860
850 860 870 880 890 900
pF1KSD VHKQLVRDNADLRCELPKLEKRLRATAERVKALEGALKEAKEGAMKDKRRYQQEVDRIKE
. : :. . .. . .. :::. :: . .. : : .. . . . : :. :...
CCDS47 L-KYLIGELVSSKIHVTKLENSLRQSKASCADMQKMLFEEQNHFSEIETELQAELVRMEQ
870 880 890 900 910 920
910 920 930 940 950 960
pF1KSD AVRYKSSGKRGHSAQIAKPVRPGHYPASSPTNPYGTRSPECISYTNSLFQNYQNLYLQAT
CCDS47 QHQEKVLYLVSQLQESQMAEKQLEKSASEKEQQLVSTLQCQDEELEKMREVCEQNQQLLQ
930 940 950 960 970 980
>>CCDS14401.1 KIF4A gene_id:24137|Hs108|chrX (1232 aa)
initn: 614 init1: 224 opt: 899 Z-score: 447.2 bits: 94.6 E(32554): 1.4e-18
Smith-Waterman score: 969; 28.1% identity (60.3% similar) in 958 aa overlap (1-902:1-925)
10 20 30 40 50
pF1KSD MAETNNECSIKVLCRFRPLNQAEILRGDK----FIPIFQGDDSVVIG-GKPYVFDRVFPP
: : . ..: : ::: :: .: . :.: :. .::.: : ...: :: :
CCDS14 MKEEVKGIPVRVALRCRPLVPKEISEGCQMCLSFVP---GEPQVVVGTDKSFTYDFVFDP
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD NTTQEQVYHACAMQIVKDVLAGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDPQ----LMGIIPR
.: ::.:... . ..: :. :::.:..:::::.::::..: : : .:.:::
CCDS14 STEQEEVFNTAVAPLIKGVFKGYNATVLAYGQTGSGKTYSMGGAYTAEQENEPTVGVIPR
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KSD IARDIFNHIYSMDENLEFHIKVSYFEIYLDKIRDLL--DVTKTNLSVHEDKNRVPFVKGC
. . .:..: . ..:: .::::.::: ..: ::: . :......:: .. . :
CCDS14 VIQLLFKEI-DKKSDFEFTLKVSYLEIYNEEILDLLCPSREKAQINIREDPKEGIKIVGL
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KSD TERFVSSPEEILDVIDEGKSNRHVAVTNMNEHSSRSHSIFLINIKQ-ENMETEQKLSGKL
::. : . .. ...:...: :: : :: .:::::.:: :...: .. . .... .::
CCDS14 TEKTVLVALDTVSCLEQGNNSRTVASTAMNSQSSRSHAIFTISLEQRKKSDKNSSFRSKL
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KSD YLVDLAGSEKVSKTGAEGAVLDEAKNINKSLSALGNVISALAEGTKS-YVPYRDSKMTRI
.::::::::. .:: ::: : :. :::..: ::::::::.. :. .:::::::.::.
CCDS14 HLVDLAGSERQKKTKAEGDRLKEGININRGLLCLGNVISALGDDKKGGFVPYRDSKLTRL
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KSD LQDSLGGNCRTTMFICCSPSSYNDAETKSTLMFGQRAKTIKNTASVNLE-LTAEQWKKKY
:::::::: .: :. : ::.. : :: .:: ...::. ::: ::.. ::: . :
CCDS14 LQDSLGGNSHTLMIACVSPADSNLEETLNTLRYADRARKIKNKPIVNIDPQTAELNHLKQ
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390
pF1KSD EKEKEKT---KAQKETI-AKLEAELSR------WRNGENVPETERLA---GEEAALGAEL
. .. .. .:. :. ... .: :. .: : :.:.:. .: :. :..
CCDS14 QVQQLQVLLLQAHGGTLPGSITVEPSENLQSLMEKNQSLVEENEKLSRGLSEAAGQTAQM
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440
pF1KSD CEETPVNDNSSIVVRIAPEERQKYEE---EIRRLYKQLDDKDDEINQQSQLIEKLKQ---
:. ...... . :: ... ....: . :.:. :.... ..: .:.:
CCDS14 LERIILTEQANEKMNAKLEELRQHAACKLDLQKLVETLEDQ--ELKENVEIICNLQQLIT
420 430 440 450 460 470
450 460 470 480
pF1KSD QMLDQEELLVSTRGDN---EKVQRELS-------------HLQSENDAAKD--EVKEVLQ
:. :. ... :. ...: : : : . . .:. :....:
CCDS14 QLSDETVACMAAAIDTAVEQEAQVETSPETSRSSDAFTTQHALRQAQMSKELVELNKALA
480 490 500 510 520 530
490 500 510 520 530 540
pF1KSD VLEELAVNYDQKSQEVEEKSQQNQLLVDELSQKVATMLSLESELQRLQEVSGHQRKRIAE
. : :: .. :...... . : : . :: .: . :. :.: :. .... :.
CCDS14 LKEALARKMTQNDSQLQPIQYQYQDNIKELELEVIN-LQKEKEELVLELQTAKKDANQAK
540 550 560 570 580 590
550 560 570 580 590 600
pF1KSD VLNGLMKDLSEFSVIVGNGEIKLPVEISGAIEEEFTVARLYISKIKSEVKSVVKRCRQLE
. . : :.:. ... . :: : : .. . .. : .::...:. :...
CCDS14 LSERRRKRLQELEGQIADLKKKLN-EQSKLLKLKESTERT-VSKLNQEI-------RMMK
600 610 620 630 640
610 620 630 640 650 660
pF1KSD NLQVECHRKMEVTGRELSSCQLLISQHEAKIRSLTEYMQSVELKKRHLEESYDSLSDELA
: .:. :.:. .... . . .... .. .: : .. . . .::..... :. :
CCDS14 NQRVQLMRQMKEDAEKFRQWK---QKKDKEVIQLKERDRKRQYELLKLERNFQKQSNVLR
650 660 670 680 690 700
670 680 690 700 710 720
pF1KSD KLQAQETVHEVALKDKEPDTQDADEVKKALELQMESHREAHHRQLARLRDEINEKQKTID
. . .. . ::: ... . .: : : .. . . : : .::. .: .
CCDS14 RKTEEAAAANKRLKDALQKQREVADKRK--ETQSRGMEGTAARVKNWLGNEIEVMVSTEE
710 720 730 740 750
730 740 750 760 770 780
pF1KSD ELKDLNQKLQLELEKLQADYEKLKSEEHEKST----KLQELTF-LYERHEQSKQDLKGLE
. ::. :. . . : : .:: :..:.. ::.. :: : : . : ... :
CCDS14 AKRHLNDLLE-DRKILAQDVAQLK-EKKESGENPPPKLRRRTFSLTEVRGQVSES----E
760 770 780 790 800 810
790 800 810 820 830 840
pF1KSD ETVARELQTLHNLRKLFVQDVTTRVKKSAEMEPEDSGGIHSQKQKISFLENNLEQLTKVH
.........:.. .. ... .: . : :: ::. . . :: .
CCDS14 DSITKQIESLETEMEFRSAQIADLQQKLLDAESED-----RPKQRWENIATILEAKCAL-
820 830 840 850 860
850 860 870 880 890 900
pF1KSD KQLVRDNADLRCELPKLEKRLRATAERVKALEGALKEAKEGAMKDKRRYQQEVDRIKEAV
: :. . .. . .. :::. :. . .. : : .. . . . : :. :...
CCDS14 KYLIGELVSSKIQVSKLESSLKQSKTSCADMQKMLFEERNHFAEIETELQAELVRMEQQH
870 880 890 900 910 920
910 920 930 940 950 960
pF1KSD RYKSSGKRGHSAQIAKPVRPGHYPASSPTNPYGTRSPECISYTNSLFQNYQNLYLQATPS
CCDS14 QEKVLYLLSQLQQSQMAEKQLEESVSEKEQQLLSTLKCQDEELEKMREVCEQNQQLLREN
930 940 950 960 970 980
1032 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 08:29:10 2016 done: Thu Nov 3 08:29:11 2016
Total Scan time: 4.870 Total Display time: 0.410
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]