Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDB0040
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDB0040, 620 aa
1>>>pF1KSDB0040 620 - 620 aa - 620 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.1009+/-0.00122; mu= 4.5811+/- 0.071
mean_var=188.9718+/-37.967, 0's: 0 Z-trim(105.5): 196 B-trim: 2 in 1/51
Lambda= 0.093299
statistics sampled from 8262 (8480) to 8262 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.62), E-opt: 0.2 (0.26), width: 16
Scan time: 3.300
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS45313.1 LINGO1 gene_id:84894|Hs108|chr15 ( 620) 4149 572.2 7.2e-163
CCDS73766.1 LINGO1 gene_id:84894|Hs108|chr15 ( 614) 4112 567.2 2.3e-161
CCDS6524.1 LINGO2 gene_id:158038|Hs108|chr9 ( 606) 2519 352.8 7.9e-97
CCDS45905.1 LINGO3 gene_id:645191|Hs108|chr19 ( 592) 1857 263.6 5.2e-70
CCDS30855.1 LINGO4 gene_id:339398|Hs108|chr1 ( 593) 1491 214.4 3.5e-55
CCDS31449.1 LGR4 gene_id:55366|Hs108|chr11 ( 951) 533 85.6 3.3e-16
CCDS31464.1 LRRC4C gene_id:57689|Hs108|chr11 ( 640) 529 84.9 3.5e-16
CCDS33920.1 CPN2 gene_id:1370|Hs108|chr3 ( 545) 522 83.9 6e-16
CCDS44933.1 LRIG3 gene_id:121227|Hs108|chr12 (1059) 520 83.9 1.2e-15
CCDS8960.1 LRIG3 gene_id:121227|Hs108|chr12 (1119) 520 83.9 1.3e-15
CCDS3306.1 LRRC15 gene_id:131578|Hs108|chr3 ( 581) 511 82.5 1.8e-15
CCDS46984.1 LRRC15 gene_id:131578|Hs108|chr3 ( 587) 511 82.5 1.8e-15
CCDS5799.1 LRRC4 gene_id:64101|Hs108|chr7 ( 653) 505 81.7 3.4e-15
CCDS42595.1 LRRC4B gene_id:94030|Hs108|chr19 ( 713) 496 80.5 8.4e-15
CCDS3426.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4 (1529) 477 78.2 8.8e-14
CCDS75111.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4 (1521) 475 78.0 1.1e-13
CCDS3307.1 GP5 gene_id:2814|Hs108|chr3 ( 560) 465 76.3 1.3e-13
CCDS9000.1 LGR5 gene_id:8549|Hs108|chr12 ( 907) 461 75.9 2.6e-13
CCDS4369.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5 (1523) 451 74.7 9.9e-13
CCDS64311.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5 (1530) 451 74.7 9.9e-13
CCDS33685.1 LRRN1 gene_id:57633|Hs108|chr3 ( 716) 432 71.9 3.3e-12
CCDS7453.1 SLIT1 gene_id:6585|Hs108|chr10 (1534) 430 71.9 7e-12
CCDS61194.1 LGR5 gene_id:8549|Hs108|chr12 ( 883) 417 70.0 1.6e-11
CCDS47272.1 LRRTM2 gene_id:26045|Hs108|chr5 ( 516) 412 69.1 1.7e-11
CCDS10446.1 IGFALS gene_id:3483|Hs108|chr16 ( 605) 404 68.1 3.9e-11
CCDS53982.1 IGFALS gene_id:3483|Hs108|chr16 ( 643) 404 68.1 4.1e-11
CCDS46715.1 CHADL gene_id:150356|Hs108|chr22 ( 762) 399 67.5 7.5e-11
CCDS30971.1 LGR6 gene_id:59352|Hs108|chr1 ( 967) 399 67.6 9e-11
>>CCDS45313.1 LINGO1 gene_id:84894|Hs108|chr15 (620 aa)
initn: 4149 init1: 4149 opt: 4149 Z-score: 3037.4 bits: 572.2 E(32554): 7.2e-163
Smith-Waterman score: 4149; 100.0% identity (100.0% similar) in 620 aa overlap (1-620:1-620)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MQVSKRMLAGGVRSMPSPLLACWQPILLLVLGSVLSGSATGCPPRCECSAQDRAVLCHRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MQVSKRMLAGGVRSMPSPLLACWQPILLLVLGSVLSGSATGCPPRCECSAQDRAVLCHRK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD RFVAVPEGIPTETRLLDLGKNRIKTLNQDEFASFPHLEELELNENIVSAVEPGAFNNLFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RFVAVPEGIPTETRLLDLGKNRIKTLNQDEFASFPHLEELELNENIVSAVEPGAFNNLFN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LRTLGLRSNRLKLIPLGVFTGLSNLTKLDISENKIVILLDYMFQDLYNLKSLEVGDNDLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LRTLGLRSNRLKLIPLGVFTGLSNLTKLDISENKIVILLDYMFQDLYNLKSLEVGDNDLV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD YISHRAFSGLNSLEQLTLEKCNLTSIPTEALSHLHGLIVLRLRHLNINAIRDYSFKRLYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 YISHRAFSGLNSLEQLTLEKCNLTSIPTEALSHLHGLIVLRLRHLNINAIRDYSFKRLYR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD LKVLEISHWPYLDTMTPNCLYGLNLTSLSITHCNLTAVPYLAVRHLVYLRFLNLSYNPIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LKVLEISHWPYLDTMTPNCLYGLNLTSLSITHCNLTAVPYLAVRHLVYLRFLNLSYNPIS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD TIEGSMLHELLRLQEIQLVGGQLAVVEPYAFRGLNYLRVLNVSGNQLTTLEESVFHSVGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TIEGSMLHELLRLQEIQLVGGQLAVVEPYAFRGLNYLRVLNVSGNQLTTLEESVFHSVGN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD LETLILDSNPLACDCRLLWVFRRRWRLNFNRQQPTCATPEFVQGKEFKDFPDVLLPNYFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LETLILDSNPLACDCRLLWVFRRRWRLNFNRQQPTCATPEFVQGKEFKDFPDVLLPNYFT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD CRRARIRDRKAQQVFVDEGHTVQFVCRADGDPPPAILWLSPRKHLVSAKSNGRLTVFPDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 CRRARIRDRKAQQVFVDEGHTVQFVCRADGDPPPAILWLSPRKHLVSAKSNGRLTVFPDG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD TLEVRYAQVQDNGTYLCIAANAGGNDSMPAHLHVRSYSPDWPHQPNKTFAFISNQPGEGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TLEVRYAQVQDNGTYLCIAANAGGNDSMPAHLHVRSYSPDWPHQPNKTFAFISNQPGEGE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD ANSTRATVPFPFDIKTLIIATTMGFISFLGVVLFCLVLLFLWSRGKGNTKHNIEIEYVPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ANSTRATVPFPFDIKTLIIATTMGFISFLGVVLFCLVLLFLWSRGKGNTKHNIEIEYVPR
550 560 570 580 590 600
610 620
pF1KSD KSDAGISSADAPRKFNMKMI
::::::::::::::::::::
CCDS45 KSDAGISSADAPRKFNMKMI
610 620
>>CCDS73766.1 LINGO1 gene_id:84894|Hs108|chr15 (614 aa)
initn: 4112 init1: 4112 opt: 4112 Z-score: 3010.6 bits: 567.2 E(32554): 2.3e-161
Smith-Waterman score: 4112; 100.0% identity (100.0% similar) in 614 aa overlap (7-620:1-614)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MQVSKRMLAGGVRSMPSPLLACWQPILLLVLGSVLSGSATGCPPRCECSAQDRAVLCHRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MLAGGVRSMPSPLLACWQPILLLVLGSVLSGSATGCPPRCECSAQDRAVLCHRK
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD RFVAVPEGIPTETRLLDLGKNRIKTLNQDEFASFPHLEELELNENIVSAVEPGAFNNLFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 RFVAVPEGIPTETRLLDLGKNRIKTLNQDEFASFPHLEELELNENIVSAVEPGAFNNLFN
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LRTLGLRSNRLKLIPLGVFTGLSNLTKLDISENKIVILLDYMFQDLYNLKSLEVGDNDLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LRTLGLRSNRLKLIPLGVFTGLSNLTKLDISENKIVILLDYMFQDLYNLKSLEVGDNDLV
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KSD YISHRAFSGLNSLEQLTLEKCNLTSIPTEALSHLHGLIVLRLRHLNINAIRDYSFKRLYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 YISHRAFSGLNSLEQLTLEKCNLTSIPTEALSHLHGLIVLRLRHLNINAIRDYSFKRLYR
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KSD LKVLEISHWPYLDTMTPNCLYGLNLTSLSITHCNLTAVPYLAVRHLVYLRFLNLSYNPIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LKVLEISHWPYLDTMTPNCLYGLNLTSLSITHCNLTAVPYLAVRHLVYLRFLNLSYNPIS
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KSD TIEGSMLHELLRLQEIQLVGGQLAVVEPYAFRGLNYLRVLNVSGNQLTTLEESVFHSVGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 TIEGSMLHELLRLQEIQLVGGQLAVVEPYAFRGLNYLRVLNVSGNQLTTLEESVFHSVGN
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KSD LETLILDSNPLACDCRLLWVFRRRWRLNFNRQQPTCATPEFVQGKEFKDFPDVLLPNYFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LETLILDSNPLACDCRLLWVFRRRWRLNFNRQQPTCATPEFVQGKEFKDFPDVLLPNYFT
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KSD CRRARIRDRKAQQVFVDEGHTVQFVCRADGDPPPAILWLSPRKHLVSAKSNGRLTVFPDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 CRRARIRDRKAQQVFVDEGHTVQFVCRADGDPPPAILWLSPRKHLVSAKSNGRLTVFPDG
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KSD TLEVRYAQVQDNGTYLCIAANAGGNDSMPAHLHVRSYSPDWPHQPNKTFAFISNQPGEGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 TLEVRYAQVQDNGTYLCIAANAGGNDSMPAHLHVRSYSPDWPHQPNKTFAFISNQPGEGE
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KSD ANSTRATVPFPFDIKTLIIATTMGFISFLGVVLFCLVLLFLWSRGKGNTKHNIEIEYVPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 ANSTRATVPFPFDIKTLIIATTMGFISFLGVVLFCLVLLFLWSRGKGNTKHNIEIEYVPR
540 550 560 570 580 590
610 620
pF1KSD KSDAGISSADAPRKFNMKMI
::::::::::::::::::::
CCDS73 KSDAGISSADAPRKFNMKMI
600 610
>>CCDS6524.1 LINGO2 gene_id:158038|Hs108|chr9 (606 aa)
initn: 2267 init1: 2267 opt: 2519 Z-score: 1851.8 bits: 352.8 E(32554): 7.9e-97
Smith-Waterman score: 2519; 60.5% identity (86.1% similar) in 603 aa overlap (20-620:6-606)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MQVSKRMLAGGVRSMPSPLLACWQPILLLVLGSVLSGSATGCPPRCECSAQDRAVLCHRK
..::::.: :.. .. ::. ::: :::::::...: :::.
CCDS65 MLHTAISCWQPFLGLAVVLIFMGSTIGCPARCECSAQNKSVSCHRR
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KSD RFVAVPEGIPTETRLLDLGKNRIKTLNQDEFASFPHLEELELNENIVSAVEPGAFNNLFN
:..:.::::: ::..:::.:::.:..: .:: :.: :::..:..::.. :::::::::::
CCDS65 RLIAIPEGIPIETKILDLSKNRLKSVNPEEFISYPLLEEIDLSDNIIANVEPGAFNNLFN
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LRTLGLRSNRLKLIPLGVFTGLSNLTKLDISENKIVILLDYMFQDLYNLKSLEVGDNDLV
::.: :..:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS65 LRSLRLKGNRLKLVPLGVFTGLSNLTKLDISENKIVILLDYMFQDLHNLKSLEVGDNDLV
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KSD YISHRAFSGLNSLEQLTLEKCNLTSIPTEALSHLHGLIVLRLRHLNINAIRDYSFKRLYR
:::::::::: :::::::::::::..::::::::..:: :.:.::::: . :.::::..
CCDS65 YISHRAFSGLLSLEQLTLEKCNLTAVPTEALSHLRSLISLHLKHLNINNMPVYAFKRLFH
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KSD LKVLEISHWPYLDTMTPNCLYGLNLTSLSITHCNLTAVPYLAVRHLVYLRFLNLSYNPIS
:: :::..:: :: : : ::::::::::.:. ::..::.:: .::::: :::::::::
CCDS65 LKHLEIDYWPLLDMMPANSLYGLNLTSLSVTNTNLSTVPFLAFKHLVYLTHLNLSYNPIS
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KSD TIEGSMLHELLRLQEIQLVGGQLAVVEPYAFRGLNYLRVLNVSGNQLTTLEESVFHSVGN
:::..:. .:.::::...::.:: ..::..:.:: .::::::: : : ::::.:: :
CCDS65 TIEAGMFSDLIRLQELHIVGAQLRTIEPHSFQGLRFLRVLNVSQNLLETLEENVFSSPRA
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KSD LETLILDSNPLACDCRLLWVFRRRWRLNFNRQQPTCATPEFVQGKEFKDFPDVLLPNYFT
::.: ...:::::::::::...:. :.:. ::: :: :. .. . :::: .. : :::
CCDS65 LEVLSINNNPLACDCRLLWILQRQPTLQFGGQQPMCAGPDTIRERSFKDFHSTALSFYFT
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KSD CRRARIRDRKAQQVFVDEGHTVQFVCRADGDPPPAILWLSPRKHLVSAKSNGRLTVFPDG
:.. .::..: :...::::.:::. : ::::: :.: :..::......::::: ::. ::
CCDS65 CKKPKIREKKLQHLLVDEGQTVQLECSADGDPQPVISWVTPRRRFITTKSNGRATVLGDG
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KSD TLEVRYAQVQDNGTYLCIAANAGGNDSMPAHLHVRSYSPDWPHQPNKTFAFISNQPGEGE
:::.:.:: ::.: :.:::.::.:::.. : : :.... : :.: ..... ..
CCDS65 TLEIRFAQDQDSGMYVCIASNAAGNDTFTASLTVKGFASDRFLYANRTPMYMTDS-NDTI
470 480 490 500 510 520
550 560 570 580 590 600
pF1KSD ANSTRATVPFPFDIKTLIIATTMGFISFLGVVLFCLVLLFLWSRGKGNTKHNIEIEYVPR
.:.: :.. : .:.::....:.:: ..::::::::..:::.::::::. :..:..:::::
CCDS65 SNGTNANT-FSLDLKTILVSTAMGCFTFLGVVLFCFLLLFVWSRGKGKHKNSIDLEYVPR
530 540 550 560 570 580
610 620
pF1KSD KSDAGISSADA--PRKFNMKMI
:..... ... ::.::::::
CCDS65 KNNGAVVEGEVAGPRRFNMKMI
590 600
>>CCDS45905.1 LINGO3 gene_id:645191|Hs108|chr19 (592 aa)
initn: 2018 init1: 1838 opt: 1857 Z-score: 1370.4 bits: 263.6 E(32554): 5.2e-70
Smith-Waterman score: 2116; 54.2% identity (79.2% similar) in 605 aa overlap (20-620:1-592)
10 20 30 40 50
pF1KSD MQVSKRMLAGGVRSMPSPLLACWQPILLL--VLGSVLSGSATGCPPRCECSAQDRAVLCH
..:: .: : .: . : ::: ::::..: ::: :
CCDS45 MTCWLCVLSLPLLLLPAAPPPAGGCPARCECTVQTRAVACT
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KSD RKRFVAVPEGIPTETRLLDLGKNRIKTLNQDEFASFPHLEELELNENIVSAVEPGAFNNL
:.:..:::.:::.:::::.:..:::. :: ..:..: ::::.:.:: .. :::::: ::
CCDS45 RRRLTAVPDGIPAETRLLELSRNRIRCLNPGDLAALPALEELDLSENAIAHVEPGAFANL
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KSD FNLRTLGLRSNRLKLIPLGVFTGLSNLTKLDISENKIVILLDYMFQDLYNLKSLEVGDND
::.: ::.:.::::: :::: :.::: ::.::::.:::::: ::::..:. :::::::
CCDS45 PRLRVLRLRGNQLKLIPPGVFTRLDNLTLLDLSENKLVILLDYTFQDLHSLRRLEVGDND
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KSD LVYISHRAFSGLNSLEQLTLEKCNLTSIPTEALSHLHGLIVLRLRHLNINAIRDYSFKRL
::..:.:::.:: .::.::::.::::.. :.:.::..: .:::::: : ...: .:.::
CCDS45 LVFVSRRAFAGLLALEELTLERCNLTALSGESLGHLRSLGALRLRHLAIASLEDQNFRRL
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KSD YRLKVLEISHWPYLDTMTPNCLYGLNLTSLSITHCNLTAVPYLAVRHLVYLRFLNLSYNP
: :::..:: :. .. . : ::::::::.:: :.:::: :.:: ..: ::::.::
CCDS45 PGLLHLEIDNWPLLEEVAAGSLRGLNLTSLSVTHTNITAVPAAALRHQAHLTCLNLSHNP
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KSD ISTIEGSMLHELLRLQEIQLVGGQLAVVEPYAFRGLNYLRVLNVSGNQLTTLEESVFHSV
:::. . ...:.::.:..:.:. :::::: :: :: .:.::.:.: :.:::::.::::
CCDS45 ISTVPRGSFRDLVRLRELHLAGALLAVVEPQAFLGLRQIRLLNLSNNLLSTLEESTFHSV
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KSD GNLETLILDSNPLACDCRLLWVFRRRWRLNFNRQQPTCATPEFVQGKEFKDFPDVLLPNY
..:::: .:.:::::::::::. .:: :::. . :.:::: :.: ....:: .: .:
CCDS45 NTLETLRVDGNPLACDCRLLWIVQRRKTLNFDGRLPACATPAEVRGDALRNLPDSVLFEY
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KSD FTCRRARIRDRKAQQVFVDEGHTVQFVCRADGDPPPAILWLSPRKHLVSAKSNGRLTVFP
:.::. .::.:. :.: . :. :.:.:::.:.: :.. :..:... :.: : :: :.:
CCDS45 FVCRKPKIRERRLQRVTATAGEDVRFLCRAEGEPAPTVAWVTPQHRPVTATSAGRARVLP
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KSD DGTLEVRYAQVQDNGTYLCIAANAGGNDSMPAHLHVRSYSPDWPHQPNKTFAFISNQPGE
::::.. :. ::.::: :.:.::::::.. : : :: :. : :.: :::
CCDS45 GGTLEIQDARPQDSGTYTCVASNAGGNDTYFATLTVR---PE-P-AANRT-------PGE
470 480 490 500
540 550 560 570 580 590
pF1KSD GEANSTRATVPFPFDIKTLIIATTMGFISFLGVVLFCLVLLFLWSRGKGNTKHNIEIEYV
.. : : :.. :.:. :....:.:: :.::::::::.::::.::::.:. :.:. .::
CCDS45 AH-NETLAALRAPLDLTTILVSTAMGCITFLGVVLFCFVLLFVWSRGRGQHKNNFSVEYS
510 520 530 540 550 560
600 610 620
pF1KSD PRKSDAGISSAD--APRKFNMKMI
:: :. ..: . ::::::::
CCDS45 FRKVDGPAAAAGQGGARKFNMKMI
570 580 590
>>CCDS30855.1 LINGO4 gene_id:339398|Hs108|chr1 (593 aa)
initn: 1608 init1: 1326 opt: 1491 Z-score: 1104.2 bits: 214.4 E(32554): 3.5e-55
Smith-Waterman score: 1621; 43.8% identity (72.1% similar) in 592 aa overlap (14-602:5-578)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MQVSKRMLAGGVRSMPSPLLACWQPILLLVLGSVLSGSATGCPPRCECSAQDRAVLCHRK
. :. : :.:.:.: . .::. .:: :.:..: .:::: ..
CCDS30 MDAATAPKQAWPPWPPLLFLLL--LPGGSGGSCPAVCDCTSQPQAVLCGHR
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KSD RFVAVPEGIPTETRLLDLGKNRIKTLNQDEFASFPHLEELELNENIVSAVEPGAFNNLFN
.. ::: :.: .:.::::. ::. :.: .. . :.::.:. : .:..:::::..: .
CCDS30 QLEAVPGGLPLDTELLDLSGNRLWGLQQGMLSRLSLLQELDLSYNQLSTLEPGAFHGLQS
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LRTLGLRSNRLKLIPLGVFTGLSNLTKLDISENKIVILLDYMFQDLYNLKSLEVGDNDLV
: :: :..:::... :::.::: :: ::. :.::..:: : .: .:..:::::: ::
CCDS30 LLTLRLQGNRLRIMGPGVFSGLSALTLLDLRLNQIVLFLDGAFGELGSLQKLEVGDNHLV
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KSD YISHRAFSGLNSLEQLTLEKCNLTSIPTEALSHLHGLIVLRLRHLNINAIRDYSFKRLYR
... ::.:: .: ::::.:::...: ::..: .:..::::.:.:. . ... : .
CCDS30 FVAPGAFAGLAKLSTLTLERCNLSTVPGLALARLPALVALRLRELDIGRLPAGALRGLGQ
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KSD LKVLEISHWPYLDTMTPNCLYGLNLTSLSITHCNLTAVPYLAVRHLVYLRFLNLSYNPIS
:: ::: :: :... :. : ::::.::.::.:::..::. :. :: .:: :.:: ::::
CCDS30 LKELEIHLWPSLEALDPGSLVGLNLSSLAITRCNLSSVPFQALYHLSFLRVLDLSQNPIS
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KSD TIEGSMLHELLRLQEIQLVGGQLAVVEPYAFRGLNYLRVLNVSGNQLTTLEESVFHSVGN
.: . : :.::::..: :. :. . .::.::. ...:.:. : : ::::..: : .
CCDS30 AIPARRLSPLVRLQELRLSGACLTSIAAHAFHGLTAFHLLDVADNALQTLEETAFPSPDK
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KSD LETLILDSNPLACDCRLLWVFRRRWRLNFNRQQPTCATPEFVQGKEFKDFPDVLLPNYFT
: :: :..:::.:::::::..: : .:.:. . :.:: :. :::: .:.: :.: :..::
CCDS30 LVTLRLSGNPLTCDCRLLWLLRLRRHLDFGMSPPACAGPHHVQGKSLKEFSDILPPGHFT
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KSD CRRARIRDRKAQQVFVDEGHTVQFVCRADGDPPPAILWLSPRKHLVSAKSNGRLTVFPDG
:. : :: . :...:: . : : .:::: :.. :. : : . ::. :. ::
CCDS30 CKPALIRKSGPRWVIAEEGGHAVFSCSGDGDPAPTVSWMRP--HGAWLGRAGRVRVLEDG
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KSD TLEVRYAQVQDNGTYLCIAANAGGNDSMPAHLHVRSYSPDWPHQPNKTFAFISNQPGEGE
:::.: .:..: :.:.:...:..::::. . :.: . : :: :.. .
CCDS30 TLEIRSVQLRDRGAYVCVVSNVAGNDSLRTWLEVIQVEP-----PNGTLS---------D
470 480 490 500 510
550 560 570 580 590
pF1KSD ANSTRATVPFPF--DIKTLIIATTMGFISFLGVVLFCLVLLFLWSRGKGNTKHNIEIEYV
: : .: :: : . . .. ..::. :: : .:. :. :::.::: .::.. ...:
CCDS30 PNITVPGIPGPFFLDSRGVAMVLAVGFLPFLTSVTLCFGLIALWSKGKGRVKHHMTFDFV
520 530 540 550 560 570
600 610 620
pF1KSD -PRKSDAGISSADAPRKFNMKMI
:: :
CCDS30 APRPSGDKNSGGNRVTAKLF
580 590
>>CCDS31449.1 LGR4 gene_id:55366|Hs108|chr11 (951 aa)
initn: 726 init1: 392 opt: 533 Z-score: 404.5 bits: 85.6 E(32554): 3.3e-16
Smith-Waterman score: 533; 31.9% identity (64.7% similar) in 360 aa overlap (15-369:1-353)
10 20 30 40 50
pF1KSD MQVSKRMLAGGVRSMPSPL-LACWQPILLLVLGSVLSGSATGCPPRCE--CSAQ-DRAVL
::.:: : :. . : .::: .: . . :: : :: . :: :
CCDS31 MPGPLGLLCF--LALGLLGS--AGPSGAAPPLCAAPCSCDGDRRVD
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KSD CHRKRFVAVPEGIPTETRLLDLGKNRIKTLNQDEFASFPHLEELELNENIVSAVEPGAFN
: : ..:::::. . :. ::.. : : : .: : .:: ::::.: : .: ..: :..
CCDS31 CSGKGLTAVPEGLSAFTQALDISMNNITQLPEDAFKNFPFLEELQLAGNDLSFIHPKALS
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KSD NLFNLRTLGLRSNRLKLIPLGVFTGLSNLTKLDISENKIVILLDYMFQDLYNLKSLEVGD
.: .:..: :..:.:: .: .. ::: : .: .. :.:. . . :. : .:. : . :
CCDS31 GLKELKVLTLQNNQLKTVPSEAIRGLSALQSLRLDANHITSVPEDSFEGLVQLRHLWLDD
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KSD NDLVYISHRAFSGLNSLEQLTLEKCNLTSIPTEALSHLHGLIVLRLRHLNINAIRDYSFK
:.:. . . .:.: .:. ::: ...::: :...: .:.::.:.. .: .. .. :
CCDS31 NSLTEVPVHPLSNLPTLQALTLALNKISSIPDFAFTNLSSLVVLHLHNNKIRSLSQHCFD
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KSD RLYRLKVLEISHWPYLDTMTPNCLYGL-NLTSLSITHCNLTAVPYLAVRHLVYLRFLNLS
: :..:.... : . :. . .: .: :.. .....: : :: ..:
CCDS31 GLDNLETLDLNY-NNLGEF-PQAIKALPSLKELGFHSNSISVIPDGAFDGNPLLRTIHLY
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KSD YNPISTIEGSMLHELLRLQEIQLVGGQLAVVEPYAFRGLNYLRVLNVSGNQLTTLEESVF
::.: . .: .:.: :. . . :.... : . : .:. :...:...... ...
CCDS31 DNPLSFVGNSAFHNLSDLHSLVIRGASMVQQFP-NLTGTVHLESLTLTGTKISSIPNNLC
290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KSD HSVGNLETLILDSNPLACDCRLLWVFRRRWRLNFNRQQPTCATPEFVQGKEFKDFPDVLL
. :.:: :. :
CCDS31 QEQKMLRTLDLSYNNIRDLPSFNGCHALEEISLQRNQIYQIKEGTFQGLISLRILDLSRN
340 350 360 370 380 390
>>CCDS31464.1 LRRC4C gene_id:57689|Hs108|chr11 (640 aa)
initn: 783 init1: 346 opt: 529 Z-score: 403.9 bits: 84.9 E(32554): 3.5e-16
Smith-Waterman score: 694; 30.0% identity (54.8% similar) in 560 aa overlap (13-563:20-493)
10 20 30 40 50
pF1KSD MQVSKRMLAGGVRSMPSPLLACWQPILLLVLGSVLSGSATGCPPRCECSAQDR
:.. .:::. . :::..... : :: : :: :
CCDS31 MLNKMTLHPQQIMIGPRFNRALFDPLLVVLLALQLLVVAGLV--RAQTCPSVCSCSNQFS
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD AVLCHRKRFVAVPEGIPTETRLLDLGKNRIKTLNQDEFASFPHLEELELNENIVSAVEPG
:.: :: . ::.:: :.::::.: .:.:. .. . : . ::: :.:..: . ..: :
CCDS31 KVICVRKNLREVPDGISTNTRLLNLHENQIQIIKVNSFKHLRHLEILQLSRNHIRTIEIG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD AFNNLFNLRTLGLRSNRLKLIPLGVFTGLSNLTKLDISENKIVILLDYMFQDLYNLKSLE
:::.: :: :: : .::: :: :.:. ::.: .: . .: : . .: :. . .:. :.
CCDS31 AFNGLANLNTLELFDNRLTTIPNGAFVYLSKLKELWLRNNPIESIPSYAFNRIPSLRRLD
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD VGD-NDLVYISHRAFSGLNSLEQLTLEKCNLTSIPTEALSHLHGLIVLRLRHLNINAIRD
.:. . : :::. :: ::..:. :.: ::: ::.
CCDS31 LGELKRLSYISEGAFEGLSNLRYLNLAMCNLREIPN------------------------
180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KSD YSFKRLYRLKVLEISHWPYLDTMTPNCLYGLNLTSLSITHCNLTAVPYLAVRHLVYLRFL
.:: :. : :
CCDS31 ----------------------LTP----------------------------LIKLDEL
220
300 310 320 330 340 350
pF1KSD NLSYNPISTIEGSMLHELLRLQEIQLVGGQLAVVEPYAFRGLNYLRVLNVSGNQLTTLEE
.:: : .:.:. . .. :..::.. .. .:. :.: :: .:. : .:.. :.:: : .
CCDS31 DLSGNHLSAIRPGSFQGLMHLQKLWMIQSQIQVIERNAFDNLQSLVEINLAHNNLTLLPH
230 240 250 260 270 280
360 370 380 390 400
pF1KSD SVFHSVGNLETLILDSNPLACDCRLLWVFRRRWRLNFNRQQPT-----CATPEFVQGKEF
..: . .:: . : :: :.: .::. : .. . : : :: ..:. .
CCDS31 DLFTPLHHLERIHLHHNPWNCNCDILWL---SWWIKDMAPSNTACCARCNTPPNLKGRYI
290 300 310 320 330 340
410 420 430 440 450 460
pF1KSD KDFPDVLLPNYFTCRRARIRDRKAQQVFVDEGHTVQFVCRADGDPPPAILWLSPRKHLVS
.. . ::::: : . :. . : :: .... :::. .. :..: ...
CCDS31 GELDQ----NYFTCYAPVIVEPPAD-LNVTEGMAAELKCRAS-TSLTSVSWITPNGTVMT
350 360 370 380 390
470 480 490 500 510 520
pF1KSD AKSNG-RLTVFPDGTLEVRYAQVQDNGTYLCIAANAGGNDSMPAHLHVRSYSPDWPHQPN
. :..:. ::::. . :::.: : :...:. :: . : :.: . . : .
CCDS31 HGAYKVRIAVLSDGTLNFTNVTVQDTGMYTCMVSNSVGNTTASATLNVTAATTT-PFSYF
400 410 420 430 440 450
530 540 550 560 570 580
pF1KSD KTFAFISNQPGEGEANSTRATV-PFPF-DIKTLIIATTMGFISFLGVVLFCLVLLFLWSR
.: . . .:.. :: .: .: : : : .: ..:..
CCDS31 STVTVETMEPSQDEARTTDNNVGPTPVVDWETTNVTTSLTPQSTRSTEKTFTIPVTDINS
460 470 480 490 500 510
590 600 610 620
pF1KSD GKGNTKHNIEIEYVPRKSDAGISSADAPRKFNMKMI
CCDS31 GIPGIDEVMKTTKIIIGCFVAITLMAAVMLVIFYKMRKQHHRQNHHAPTRTVEIINVDDE
520 530 540 550 560 570
>>CCDS33920.1 CPN2 gene_id:1370|Hs108|chr3 (545 aa)
initn: 532 init1: 255 opt: 522 Z-score: 399.8 bits: 83.9 E(32554): 6e-16
Smith-Waterman score: 532; 29.4% identity (58.4% similar) in 445 aa overlap (15-405:2-433)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MQVSKRMLAGGVRSMPSPLLACWQPILLLVLGSVLSGSATGCPPRCECSAQDRAVLCHRK
.:. : : .::: . : :: :.: .:. :.: .
CCDS33 MLPGAWLL-WTSLLLL------ARPAQPCPMGCDCFVQE--VFCSDE
10 20 30
70 80 90
pF1KSD RFVAVPEGIP--------TETRLLDL-----GKN----RIKTLNQ-------DEFASFPH
....:: :: .:: . : :.: .. :: : :...:.
CCDS33 ELATVPLDIPPYTKNIIFVETSFTTLETRAFGSNPNLTKVVFLNTQLCQFRPDAFGGLPR
40 50 60 70 80 90
100 110 120 130
pF1KSD LEELE------------------------LNENIVSAVEPGAFNNLFNLRTLGLRSNRLK
::.:: :: :.. :. : :..: :..: :..:.:.
CCDS33 LEDLEVTGSSFLNLSTNIFSNLTSLGKLTLNFNMLEALPEGLFQHLAALESLHLQGNQLQ
100 110 120 130 140 150
140 150 160 170 180 190
pF1KSD LIPLGVFTGLSNLTKLDISENKIVILLDYMFQDLYNLKSLEVGDNDLVYISHRAFSGLNS
.: .: :..: :....: .. : . .:. : .:..:....: : . . .:. :.:
CCDS33 ALPRRLFQPLTHLKTLNLAQNLLAQLPEELFHPLTSLQTLKLSNNALSGLPQGVFGKLGS
160 170 180 190 200 210
200 210 220 230 240 250
pF1KSD LEQLTLEKCNLTSIPTEALSHLHGLIVLRLRHLNINAIRDYSFKRLYRLKVLEISHWPYL
:..: :.. :.. .: ...:.: : : :.. :. . : : : : . .: .:
CCDS33 LQELFLDSNNISELPPQVFSQLFCLERLWLQRNAITHLPLSIFASLGNLTFLSL-QWNML
220 230 240 250 260 270
260 270 280 290 300 310
pF1KSD DTMTPNCLYGLN--LTSLSITHCNLTAVPYLAVRHLVYLRFLNLSYNPISTIEGSMLHEL
.. : :.. . :..::.:: .: .: . :: :: : :::: :. . ......:
CCDS33 RVL-PAGLFAHTPCLVGLSLTHNQLETVAEGTFAHLSNLRSLMLSYNAITHLPAGIFRDL
280 290 300 310 320 330
320 330 340 350 360 370
pF1KSD LRLQEIQLVGGQLAVVEPYAFRGLNYLRVLNVSGNQLTTLEESVFHSVGNLETLILDSNP
.: .. : ...:....: :..:. :..:..: :::::: :..: . :: .: : .::
CCDS33 EELVKLYLGSNNLTALHPALFQNLSKLELLSLSKNQLTTLPEGIFDTNYNLFNLALHGNP
340 350 360 370 380 390
380 390 400 410 420
pF1KSD LACDCRLLWVFRRRWRLNFNRQ----QPTCATPEFVQGKEFKDFPDVLLPNYFTCRRARI
:::.: ..: : ... . : :: : ...:.
CCDS33 WQCDCHLAYLF--NWLQQYTDRLLNIQTYCAGPAYLKGQVVPALNEKQLVCPVTRDHLGF
400 410 420 430 440 450
430 440 450 460 470 480
pF1KSD RDRKAQQVFVDEGHTVQFVCRADGDPPPAILWLSPRKHLVSAKSNGRLTVFPDGTLEVRY
CCDS33 QVTWPDESKAGGSWDLAVQERAARSQCTYSNPEGTVVLACDQAQCRWLNVQLSPQQGSLG
460 470 480 490 500 510
>>CCDS44933.1 LRIG3 gene_id:121227|Hs108|chr12 (1059 aa)
initn: 333 init1: 199 opt: 520 Z-score: 394.4 bits: 83.9 E(32554): 1.2e-15
Smith-Waterman score: 552; 29.7% identity (59.3% similar) in 491 aa overlap (61-525:72-549)
40 50 60 70 80
pF1KSD LGSVLSGSATGCPPRCECSAQDRAVLCHRKRFVAV-PEGIPTETRL--LDLGKNRIKTLN
:.: . :: . : :::..: :. :
CCDS44 EVKLNNNELETIPNLGPVSANITLLSLAGNRIVEILPEHLKEFQSLETLDLSSNNISEL-
50 60 70 80 90 100
90 100 110 120 130 140
pF1KSD QDEFASFPHLEELELNENIVSAVEPGAFNNLFN-LRTLGLRSNRLKLIPLGVFTGLSNLT
: : .. .:. : :: : :...::: :.:: : : .: : ::.. :: .: : .:
CCDS44 QTAFPAL-QLKYLYLNSNRVTSMEPGYFDNLANTLLVLKLNRNRISAIPPKMFK-LPQLQ
110 120 130 140 150
150 160 170 180 190 200
pF1KSD KLDISENKIVILLDYMFQDLYNLKSLEVGDNDLVYISHRAFSGLNSLEQLTLEKCNLTSI
.:....::: . :: : ::::.. : .. . :: ::...: : :.. ::: :
CCDS44 HLELNRNKIKNVDGLTFQGLGALKSLKMQRNGVTKLMDGAFWGLSNMEILQLDHNNLTEI
160 170 180 190 200 210
210 220 230 240 250 260
pF1KSD PTEALSHLHGLIVLRLRHLNINAIRDYS---FKRLYRLKVLEISHWPYLDTMTPNCLYGL
. :.::..:. ::. ::: : .. .:. :... . .:. . . . ::
CCDS44 TK---GWLYGLLMLQELHLSQNAINRISPDAWEFCQKLSELDLT-FNHLSRLDDSSFLGL
220 230 240 250 260 270
270 280 290 300 310
pF1KSD NL-TSLSITHCNLTAVPYLAVRHLVYLRFLNLSYNPIS-TIE--GSMLHELLRLQEIQLV
.: ..: : . .. . : : : :. :.:. : :: ::: .. . : .:... :
CCDS44 SLLNTLHIGNNRVSYIADCAFRGLSSLKTLDLKNNEISWTIEDMNGAFSGLDKLRRLILQ
280 290 300 310 320 330
320 330 340 350 360 370
pF1KSD GGQLAVVEPYAFRGLNYLRVLNVSGNQLTTLEESVFHSVGNLETLILDSNPLACDCRLLW
:... . :: ::. :. :..: : . .:. ..: .. .:. : :... : :::.: :
CCDS44 GNRIRSITKKAFTGLDALEHLDLSDNAIMSLQGNAFSQMKKLQQLHLNTSSLLCDCQLKW
340 350 360 370 380 390
380 390 400 410 420 430
pF1KSD VFRRRWRLNFNRQQ---PTCATPEFVQGKE-FKDFPDVLLPNYFTCRRARIRDRKAQQVF
. .: . : :. .:: :....:. : :: .. . : . .. . . .
CCDS44 L--PQWVAENNFQSFVNASCAHPQLLKGRSIFAVSPDGFVCDDFPKPQITVQPETQSAI-
400 410 420 430 440 450
440 450 460 470 480
pF1KSD VDEGHTVQFVCRA--DGDPPPAILWLSPRKHLVSAKSNGRLTVFPDG--------TLEVR
.: ...:.: : ..: : .. : . . : .:. .. . .: :..:
CCDS44 --KGSNLSFICSAASSSDSPMTFAWKKDNELLHDAEMENYAHLRAQGGEVMEYTTILRLR
460 470 480 490 500
490 500 510 520 530 540
pF1KSD YAQVQDNGTYLCIAANA-GGNDSMPAHLHVRSYSPDWPHQPNKTFAFISNQPGEGEANST
.. ..: : :. .: :.. :. :.: : .. :.. . :
CCDS44 EVEFASEGKYQCVISNHFGSSYSVKAKLTV-NMLPSFTKTPMDLTIRAGAMARLECAAVG
510 520 530 540 550 560
550 560 570 580 590 600
pF1KSD RATVPFPFDIKTLIIATTMGFISFLGVVLFCLVLLFLWSRGKGNTKHNIEIEYVPRKSDA
CCDS44 HPAPQIAWQKDGGTDFPAARERRMHVMPEDDVFFIVDVKIEDIGVYSCTAQNSAGSISAN
570 580 590 600 610 620
>>CCDS8960.1 LRIG3 gene_id:121227|Hs108|chr12 (1119 aa)
initn: 333 init1: 199 opt: 520 Z-score: 394.1 bits: 83.9 E(32554): 1.3e-15
Smith-Waterman score: 552; 29.7% identity (59.3% similar) in 491 aa overlap (61-525:132-609)
40 50 60 70 80
pF1KSD LGSVLSGSATGCPPRCECSAQDRAVLCHRKRFVAV-PEGIPTETRL--LDLGKNRIKTLN
:.: . :: . : :::..: :. :
CCDS89 EVKLNNNELETIPNLGPVSANITLLSLAGNRIVEILPEHLKEFQSLETLDLSSNNISEL-
110 120 130 140 150 160
90 100 110 120 130 140
pF1KSD QDEFASFPHLEELELNENIVSAVEPGAFNNLFN-LRTLGLRSNRLKLIPLGVFTGLSNLT
: : .. .:. : :: : :...::: :.:: : : .: : ::.. :: .: : .:
CCDS89 QTAFPAL-QLKYLYLNSNRVTSMEPGYFDNLANTLLVLKLNRNRISAIPPKMFK-LPQLQ
170 180 190 200 210
150 160 170 180 190 200
pF1KSD KLDISENKIVILLDYMFQDLYNLKSLEVGDNDLVYISHRAFSGLNSLEQLTLEKCNLTSI
.:....::: . :: : ::::.. : .. . :: ::...: : :.. ::: :
CCDS89 HLELNRNKIKNVDGLTFQGLGALKSLKMQRNGVTKLMDGAFWGLSNMEILQLDHNNLTEI
220 230 240 250 260 270
210 220 230 240 250 260
pF1KSD PTEALSHLHGLIVLRLRHLNINAIRDYS---FKRLYRLKVLEISHWPYLDTMTPNCLYGL
. :.::..:. ::. ::: : .. .:. :... . .:. . . . ::
CCDS89 TK---GWLYGLLMLQELHLSQNAINRISPDAWEFCQKLSELDLT-FNHLSRLDDSSFLGL
280 290 300 310 320 330
270 280 290 300 310
pF1KSD NL-TSLSITHCNLTAVPYLAVRHLVYLRFLNLSYNPIS-TIE--GSMLHELLRLQEIQLV
.: ..: : . .. . : : : :. :.:. : :: ::: .. . : .:... :
CCDS89 SLLNTLHIGNNRVSYIADCAFRGLSSLKTLDLKNNEISWTIEDMNGAFSGLDKLRRLILQ
340 350 360 370 380 390
320 330 340 350 360 370
pF1KSD GGQLAVVEPYAFRGLNYLRVLNVSGNQLTTLEESVFHSVGNLETLILDSNPLACDCRLLW
:... . :: ::. :. :..: : . .:. ..: .. .:. : :... : :::.: :
CCDS89 GNRIRSITKKAFTGLDALEHLDLSDNAIMSLQGNAFSQMKKLQQLHLNTSSLLCDCQLKW
400 410 420 430 440 450
380 390 400 410 420 430
pF1KSD VFRRRWRLNFNRQQ---PTCATPEFVQGKE-FKDFPDVLLPNYFTCRRARIRDRKAQQVF
. .: . : :. .:: :....:. : :: .. . : . .. . . .
CCDS89 L--PQWVAENNFQSFVNASCAHPQLLKGRSIFAVSPDGFVCDDFPKPQITVQPETQSAI-
460 470 480 490 500 510
440 450 460 470 480
pF1KSD VDEGHTVQFVCRA--DGDPPPAILWLSPRKHLVSAKSNGRLTVFPDG--------TLEVR
.: ...:.: : ..: : .. : . . : .:. .. . .: :..:
CCDS89 --KGSNLSFICSAASSSDSPMTFAWKKDNELLHDAEMENYAHLRAQGGEVMEYTTILRLR
520 530 540 550 560
490 500 510 520 530 540
pF1KSD YAQVQDNGTYLCIAANA-GGNDSMPAHLHVRSYSPDWPHQPNKTFAFISNQPGEGEANST
.. ..: : :. .: :.. :. :.: : .. :.. . :
CCDS89 EVEFASEGKYQCVISNHFGSSYSVKAKLTV-NMLPSFTKTPMDLTIRAGAMARLECAAVG
570 580 590 600 610 620
550 560 570 580 590 600
pF1KSD RATVPFPFDIKTLIIATTMGFISFLGVVLFCLVLLFLWSRGKGNTKHNIEIEYVPRKSDA
CCDS89 HPAPQIAWQKDGGTDFPAARERRMHVMPEDDVFFIVDVKIEDIGVYSCTAQNSAGSISAN
630 640 650 660 670 680
620 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 08:16:46 2016 done: Thu Nov 3 08:16:46 2016
Total Scan time: 3.300 Total Display time: 0.130
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]