Result of FASTA (omim) for
pF1KSDB0037
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDB0037, 471 aa
1>>>pF1KSDB0037 471 - 471 aa - 471 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0995+/-0.000434; mu= 19.6175+/- 0.027
mean_var=71.2862+/-15.147, 0's: 0 Z-trim(110.2): 55 B-trim: 2038 in 3/52
Lambda= 0.151905
statistics sampled from 18482 (18537) to 18482 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.577), E-opt: 0.2 (0.217), width: 16
Scan time: 9.340
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_008879 (OMIM: 601100) heat shock 70 kDa protein ( 471) 3013 669.9 4.1e-192
NP_005518 (OMIM: 140559) heat shock 70 kDa protein ( 641) 747 173.4 1.6e-42
NP_002146 (OMIM: 140555) heat shock 70 kDa protein ( 643) 736 171.0 8.5e-42
NP_005337 (OMIM: 603012) heat shock 70 kDa protein ( 641) 734 170.6 1.2e-41
NP_005336 (OMIM: 140550) heat shock 70 kDa protein ( 641) 734 170.6 1.2e-41
NP_005338 (OMIM: 138120) 78 kDa glucose-regulated ( 654) 718 167.1 1.3e-40
NP_694881 (OMIM: 600816) heat shock cognate 71 kDa ( 493) 714 166.1 2e-40
NP_006588 (OMIM: 600816) heat shock cognate 71 kDa ( 646) 714 166.2 2.4e-40
XP_011541100 (OMIM: 600816) PREDICTED: heat shock ( 646) 714 166.2 2.4e-40
NP_068814 (OMIM: 140560) heat shock-related 70 kDa ( 639) 709 165.1 5.1e-40
NP_004125 (OMIM: 182170,600548,616854) stress-70 p ( 679) 649 152.0 4.9e-36
NP_057383 (OMIM: 610369) heat shock 70 kDa protein ( 509) 455 109.4 2.5e-23
NP_002145 (OMIM: 601113) heat shock 70 kDa protein ( 840) 422 102.3 5.5e-21
XP_016872585 (OMIM: 601746) PREDICTED: hypoxia up- ( 999) 331 82.4 6.3e-15
XP_016872586 (OMIM: 601746) PREDICTED: hypoxia up- ( 999) 331 82.4 6.3e-15
NP_001124463 (OMIM: 601746) hypoxia up-regulated p ( 999) 331 82.4 6.3e-15
NP_006380 (OMIM: 601746) hypoxia up-regulated prot ( 999) 331 82.4 6.3e-15
XP_005271450 (OMIM: 601746) PREDICTED: hypoxia up- (1000) 331 82.4 6.3e-15
XP_005271449 (OMIM: 601746) PREDICTED: hypoxia up- (1000) 331 82.4 6.3e-15
XP_016872584 (OMIM: 601746) PREDICTED: hypoxia up- (1000) 331 82.4 6.3e-15
XP_005271451 (OMIM: 601746) PREDICTED: hypoxia up- (1000) 331 82.4 6.3e-15
XP_016875853 (OMIM: 610703) PREDICTED: heat shock ( 736) 229 59.9 2.7e-08
XP_011533190 (OMIM: 610703) PREDICTED: heat shock ( 780) 229 60.0 2.8e-08
NP_001273434 (OMIM: 610703) heat shock protein 105 ( 782) 229 60.0 2.8e-08
XP_016875852 (OMIM: 610703) PREDICTED: heat shock ( 807) 229 60.0 2.9e-08
XP_016875851 (OMIM: 610703) PREDICTED: heat shock ( 809) 229 60.0 2.9e-08
NP_001273432 (OMIM: 610703) heat shock protein 105 ( 814) 229 60.0 2.9e-08
XP_005266293 (OMIM: 610703) PREDICTED: heat shock ( 816) 229 60.0 2.9e-08
XP_016875850 (OMIM: 610703) PREDICTED: heat shock ( 851) 229 60.0 3e-08
XP_011533189 (OMIM: 610703) PREDICTED: heat shock ( 853) 229 60.0 3e-08
NP_006635 (OMIM: 610703) heat shock protein 105 kD ( 858) 229 60.0 3e-08
NP_001273433 (OMIM: 610703) heat shock protein 105 ( 860) 229 60.0 3e-08
>>NP_008879 (OMIM: 601100) heat shock 70 kDa protein 13 (471 aa)
initn: 3013 init1: 3013 opt: 3013 Z-score: 3570.1 bits: 669.9 E(85289): 4.1e-192
Smith-Waterman score: 3013; 100.0% identity (100.0% similar) in 471 aa overlap (1-471:1-471)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAREMTILGSAVLTLLLAGYLAQQYLPLPTPKVIGIDLGTTYCSVGVFFPGTGKVKVIPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 MAREMTILGSAVLTLLLAGYLAQQYLPLPTPKVIGIDLGTTYCSVGVFFPGTGKVKVIPD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD ENGHISIPSMVSFTDNDVYVGYESVELADSNPQNTIYDAKRFIGKIFTAEELEAEIGRYP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 ENGHISIPSMVSFTDNDVYVGYESVELADSNPQNTIYDAKRFIGKIFTAEELEAEIGRYP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD FKVLNKNGMVEFSVTSNETITVSPEYVGSRLLLKLKEMAEAYLGMPVANAVISVPAEFDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 FKVLNKNGMVEFSVTSNETITVSPEYVGSRLLLKLKEMAEAYLGMPVANAVISVPAEFDL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD KQRNSTIEAANLAGLKILRVINEPTAAAMAYGLHKADVFHVLVIDLGGGTLDVSLLNKQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 KQRNSTIEAANLAGLKILRVINEPTAAAMAYGLHKADVFHVLVIDLGGGTLDVSLLNKQG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD GMFLTRAMSGNNKLGGQDFNQRLLQYLYKQIYQTYGFVPSRKEEIHRLRQAVEMVKLNLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 GMFLTRAMSGNNKLGGQDFNQRLLQYLYKQIYQTYGFVPSRKEEIHRLRQAVEMVKLNLT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD LHQSAQLSVLLTVEEQDRKEPHSSDTELPKDKLSSADDHRVNSGFGRGLSDKKSGESQVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 LHQSAQLSVLLTVEEQDRKEPHSSDTELPKDKLSSADDHRVNSGFGRGLSDKKSGESQVL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD FETEISRKLFDTLNEDLFQKILVPIQQVLKEGHLEKTEIDEVVLVGGSTRIPRIRQVIQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 FETEISRKLFDTLNEDLFQKILVPIQQVLKEGHLEKTEIDEVVLVGGSTRIPRIRQVIQE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KSD FFGKDPNTSVDPDLAVVTGVAIQAGIDGGSWPLQVSALEIPNKHLQKTNFN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 FFGKDPNTSVDPDLAVVTGVAIQAGIDGGSWPLQVSALEIPNKHLQKTNFN
430 440 450 460 470
>>NP_005518 (OMIM: 140559) heat shock 70 kDa protein 1-l (641 aa)
initn: 849 init1: 285 opt: 747 Z-score: 884.4 bits: 173.4 E(85289): 1.6e-42
Smith-Waterman score: 934; 39.3% identity (68.6% similar) in 430 aa overlap (34-458:9-393)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD EMTILGSAVLTLLLAGYLAQQYLPLPTPKVIGIDLGTTYCSVGVFFPGTGKVKVIPDENG
::::::::: :::: :::..: ...:
NP_005 MATAKGIAIGIDLGTTYSCVGVF--QHGKVEIIANDQG
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KSD HISIPSMVSFTDNDVYVGYESVELADSNPQNTIYDAKRFIGKIFTAEELEAEIGRYPFKV
. . ::.:.:::.. .: . . . :::::..::::.::. :. ..:.. .::.:
NP_005 NRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPQNTVFDAKRLIGRKFNDPVVQADMKLWPFQV
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LNKNGMVEFSVT-SNETITVSPEYVGSRLLLKLKEMAEAYLGMPVANAVISVPAEFDLKQ
.:..: . :. ..:. . :: ..: .: :::: :::.:: ::.::::.::: :. .:
NP_005 INEGGKPKVLVSYKGENKAFYPEEISSMVLTKLKETAEAFLGHPVTNAVITVPAYFNDSQ
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KSD RNSTIEAANLAGLKILRVINEPTAAAMAYGLHKADV--FHVLVIDLGGGTLDVSLLNKQG
:..: .:. .:::..::.::::::::.:::: :. :::..::::::.:::.:. .
NP_005 RQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKGGQGERHVLIFDLGGGTFDVSILTIDD
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290
pF1KSD GMFLTRAMSGNNKLGGQDFNQRLLQYLYKQIYQTYGF-VPSRKEEIHRLRQAVEMVKLNL
:.: ..: .:...:::.::..::.... ... . . . . :. ..::: : : .: .:
NP_005 GIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVSHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTL
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KSD TLHQSAQLSVLLTVEEQDRKEPHSSDTELPKDKLSSADDHRVNSGFGRGLSDKKSGESQV
. .:.: . :.: . :
NP_005 SSSTQANLEI---------------------DSLYEGID---------------------
280 290
360 370 380 390 400 410
pF1KSD LFETEISRKLFDTLNEDLFQKILVPIQQVLKEGHLEKTEIDEVVLVGGSTRIPRIRQVIQ
: : :.: :. : :::. : :....:......:..: ..::::::::::......:
NP_005 -FYTSITRARFEELCADLFRGTLEPVEKALRDAKMDKAKIHDIVLVGGSTRIPKVQRLLQ
300 310 320 330 340 350
420 430 440 450 460 470
pF1KSD EFF-GKDPNTSVDPDLAVVTGVAIQAGIDGGSWPLQVSALEIPNKHLQKTNFN
..: :.: : :..:: ::. :.:.::.: :. .:. :
NP_005 DYFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMGDKSEKVQDLLLLDVAPLSLGLETAGGVMT
360 370 380 390 400 410
NP_005 ALIKRNSTIPTKQTQIFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNNLLGRFDLTGIPPAPRGV
420 430 440 450 460 470
>>NP_002146 (OMIM: 140555) heat shock 70 kDa protein 6 [ (643 aa)
initn: 970 init1: 282 opt: 736 Z-score: 871.3 bits: 171.0 E(85289): 8.5e-42
Smith-Waterman score: 926; 39.0% identity (68.5% similar) in 426 aa overlap (29-449:4-384)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAREMTILGSAVLTLLLAGYLAQQYLPLPTPKVIGIDLGTTYCSVGVFFPGTGKVKVIPD
: ..:::::::: :::: :.:... .
NP_002 MQAPRELAVGIDLGTTYSCVGVF--QQGRVEILAN
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KSD ENGHISIPSMVSFTDNDVYVGYESVELADSNPQNTIYDAKRFIGKIFTAEELEAEIGRYP
..:. . ::.:.:::.. :: . : ::.::..::::.::. :. ..... ..:
NP_002 DQGNRTTPSYVAFTDTERLVGDAAKSQAALNPHNTVFDAKRLIGRKFADTTVQSDMKHWP
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170
pF1KSD FKVLNKNGMVEFSVT-SNETITVSPEYVGSRLLLKLKEMAEAYLGMPVANAVISVPAEFD
:.:....: . : .: : :: ..: .: :.:: ::::::.:: .:::.::: :.
NP_002 FRVVSEGGKPKVRVCYRGEDKTFYPEEISSMVLSKMKETAEAYLGQPVKHAVITVPAYFN
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KSD LKQRNSTIEAANLAGLKILRVINEPTAAAMAYGLHK--ADVFHVLVIDLGGGTLDVSLLN
.::..: .:. .:::..::.::::::::.:::: . : .::..::::::.:::.:.
NP_002 DSQRQATKDAGAIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRRGAGERNVLIFDLGGGTFDVSVLS
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KSD KQGGMFLTRAMSGNNKLGGQDFNQRLLQYLYKQIYQTYGF-VPSRKEEIHRLRQAVEMVK
..:.: ..: .:...:::.::..::........ . .: . . :. ..::: : : .:
NP_002 IDAGVFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFMEEFRRKHGKDLSGNKRALRRLRTACERAK
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KSD LNLTLHQSAQLSVLLTVEEQDRKEPHSSDTELPKDKLSSADDHRVNSGFGRGLSDKKSGE
.:. .: : . :.: . :
NP_002 RTLSSSTQATLEI---------------------DSLFEGVD------------------
280 290
360 370 380 390 400 410
pF1KSD SQVLFETEISRKLFDTLNEDLFQKILVPIQQVLKEGHLEKTEIDEVVLVGGSTRIPRIRQ
: : :.: :. : :::.. : :....:....:.:..: .:::::::::::....
NP_002 ----FYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDVVLVGGSTRIPKVQK
300 310 320 330 340 350
420 430 440 450 460 470
pF1KSD VIQEFF-GKDPNTSVDPDLAVVTGVAIQAGIDGGSWPLQVSALEIPNKHLQKTNFN
..:.:: ::. : :..:: ::. :.:.::.. :
NP_002 LLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAVLMGDKCEKVQDLLLLDVAPLSLGLETAGG
360 370 380 390 400 410
NP_002 VMTTLIQRNATIPTKQTQTFTTYSDNQPGVFIQVYEGERAMTKDNNLLGRFELSGIPPAP
420 430 440 450 460 470
>>NP_005337 (OMIM: 603012) heat shock 70 kDa protein 1B (641 aa)
initn: 872 init1: 293 opt: 734 Z-score: 869.0 bits: 170.6 E(85289): 1.2e-41
Smith-Waterman score: 927; 39.5% identity (70.0% similar) in 430 aa overlap (34-458:7-391)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD EMTILGSAVLTLLLAGYLAQQYLPLPTPKVIGIDLGTTYCSVGVFFPGTGKVKVIPDENG
::::::::: :::: :::..: ...:
NP_005 MAKAAAIGIDLGTTYSCVGVF--QHGKVEIIANDQG
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KSD HISIPSMVSFTDNDVYVGYESVELADSNPQNTIYDAKRFIGKIFTAEELEAEIGRYPFKV
. . ::.:.:::.. .: . . . :::::..::::.::. : ..... ..::.:
NP_005 NRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQV
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LNKNGMVEFSVT-SNETITVSPEYVGSRLLLKLKEMAEAYLGMPVANAVISVPAEFDLKQ
.: . . .:. ..:: . :: ..: .: :.::.::::::.::.::::.::: :. .:
NP_005 INDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQ
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KSD RNSTIEAANLAGLKILRVINEPTAAAMAYGLHKADV--FHVLVIDLGGGTLDVSLLNKQG
:..: .:. .:::..::.::::::::.:::: .. .::..::::::.:::.:. .
NP_005 RQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDD
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290
pF1KSD GMFLTRAMSGNNKLGGQDFNQRLLQYLYKQIYQTYGF-VPSRKEEIHRLRQAVEMVKLNL
:.: ..: .:...:::.::..::.... ... . . . . :. ..::: : : .:
NP_005 GIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKR--
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KSD TLHQSAQLSVLLTVEEQDRKEPHSSDTELPKDKLSSADDHRVNSGFGRGLSDKKSGESQV
:: .:.: :. ...: : .:..
NP_005 TLSSSTQASL------------------------------EIDSLF-EGID---------
280 290
360 370 380 390 400 410
pF1KSD LFETEISRKLFDTLNEDLFQKILVPIQQVLKEGHLEKTEIDEVVLVGGSTRIPRIRQVIQ
: : :.: :. : :::.. : :....:....:.:..: ..::::::::::......:
NP_005 -FYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQ
300 310 320 330 340 350
420 430 440 450 460 470
pF1KSD EFF-GKDPNTSVDPDLAVVTGVAIQAGIDGGSWPLQVSALEIPNKHLQKTNFN
.:: :.: : :..:: ::. :.:.::.: :. .:. :
NP_005 DFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMGDKSENVQDLLLLDVAPLSLGLETAGGVMT
360 370 380 390 400 410
NP_005 ALIKRNSTIPTKQTQIFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNNLLGRFELSGIPPAPRGV
420 430 440 450 460 470
>>NP_005336 (OMIM: 140550) heat shock 70 kDa protein 1A (641 aa)
initn: 872 init1: 293 opt: 734 Z-score: 869.0 bits: 170.6 E(85289): 1.2e-41
Smith-Waterman score: 927; 39.5% identity (70.0% similar) in 430 aa overlap (34-458:7-391)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD EMTILGSAVLTLLLAGYLAQQYLPLPTPKVIGIDLGTTYCSVGVFFPGTGKVKVIPDENG
::::::::: :::: :::..: ...:
NP_005 MAKAAAIGIDLGTTYSCVGVF--QHGKVEIIANDQG
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KSD HISIPSMVSFTDNDVYVGYESVELADSNPQNTIYDAKRFIGKIFTAEELEAEIGRYPFKV
. . ::.:.:::.. .: . . . :::::..::::.::. : ..... ..::.:
NP_005 NRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQV
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LNKNGMVEFSVT-SNETITVSPEYVGSRLLLKLKEMAEAYLGMPVANAVISVPAEFDLKQ
.: . . .:. ..:: . :: ..: .: :.::.::::::.::.::::.::: :. .:
NP_005 INDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQ
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KSD RNSTIEAANLAGLKILRVINEPTAAAMAYGLHKADV--FHVLVIDLGGGTLDVSLLNKQG
:..: .:. .:::..::.::::::::.:::: .. .::..::::::.:::.:. .
NP_005 RQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDD
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290
pF1KSD GMFLTRAMSGNNKLGGQDFNQRLLQYLYKQIYQTYGF-VPSRKEEIHRLRQAVEMVKLNL
:.: ..: .:...:::.::..::.... ... . . . . :. ..::: : : .:
NP_005 GIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKR--
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KSD TLHQSAQLSVLLTVEEQDRKEPHSSDTELPKDKLSSADDHRVNSGFGRGLSDKKSGESQV
:: .:.: :. ...: : .:..
NP_005 TLSSSTQASL------------------------------EIDSLF-EGID---------
280 290
360 370 380 390 400 410
pF1KSD LFETEISRKLFDTLNEDLFQKILVPIQQVLKEGHLEKTEIDEVVLVGGSTRIPRIRQVIQ
: : :.: :. : :::.. : :....:....:.:..: ..::::::::::......:
NP_005 -FYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQ
300 310 320 330 340 350
420 430 440 450 460 470
pF1KSD EFF-GKDPNTSVDPDLAVVTGVAIQAGIDGGSWPLQVSALEIPNKHLQKTNFN
.:: :.: : :..:: ::. :.:.::.: :. .:. :
NP_005 DFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMGDKSENVQDLLLLDVAPLSLGLETAGGVMT
360 370 380 390 400 410
NP_005 ALIKRNSTIPTKQTQIFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNNLLGRFELSGIPPAPRGV
420 430 440 450 460 470
>>NP_005338 (OMIM: 138120) 78 kDa glucose-regulated prot (654 aa)
initn: 931 init1: 280 opt: 718 Z-score: 849.9 bits: 167.1 E(85289): 1.3e-40
Smith-Waterman score: 941; 37.9% identity (67.7% similar) in 449 aa overlap (8-449:5-407)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAREMTILGSAVLTLLLAGYLAQQYLPLPTPKVIGIDLGTTYCSVGVFFPGTGKVKVIPD
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NP_005 MKLSLVAAMLLLLSAARAEEEDKKEDVGTVVGIDLGTTYSCVGVF--KNGRVEIIAN
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KSD ENGHISIPSMVSFT-DNDVYVGYESVELADSNPQNTIYDAKRFIGKIFTAEELEAEIGRY
..:. ::.:.:: ... .: . . :::.::..::::.::. .. .. .:
NP_005 DQGNRITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD PFKVLNKNG--MVEFSVTSNETITVSPEYVGSRLLLKLKEMAEAYLGMPVANAVISVPAE
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NP_005 PFKVVEKKTKPYIQVDIGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAY
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD FDLKQRNSTIEAANLAGLKILRVINEPTAAAMAYGLHKADVF-HVLVIDLGGGTLDVSLL
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NP_005 FNDAQRQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREGEKNILVFDLGGGTFDVSLL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD NKQGGMFLTRAMSGNNKLGGQDFNQRLLQYLYKQIYQTYGFVPSRKEE--IHRLRQAVEM
. ..:.: . : .:...:::.::.::..... : .:. ::.. ...::. ::
NP_005 TIDNGVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIK-LYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEK
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD VKLNLTLHQSAQLSVLLTVEEQDRKEPHSSDTELPKDKLSSADDHRVNSGFGRGLSDKKS
.: :. ...:.. . : .:
NP_005 AKRALSSQHQARIEIESFYEGED-------------------------------------
300 310
360 370 380 390 400 410
pF1KSD GESQVLFETEISRKLFDTLNEDLFQKILVPIQQVLKEGHLEKTEIDEVVLVGGSTRIPRI
: ..: :. :: :::.. . :.:.::... :.:..:::.::::::::::.:
NP_005 ------FSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEIVLVGGSTRIPKI
320 330 340 350 360 370
420 430 440 450 460 470
pF1KSD RQVIQEFF-GKDPNTSVDPDLAVVTGVAIQAGIDGGSWPLQVSALEIPNKHLQKTNFN
.:...::: ::.:. ...:: ::. :.:.:::. .:
NP_005 QQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLSGDQDTGDLVLLDVCPLTLGIETVGG
380 390 400 410 420 430
NP_005 VMTKLIPRNTVVPTKKSQIFSTASDNQPTVTIKVYEGERPLTKDNHLLGTFDLTGIPPAP
440 450 460 470 480 490
>>NP_694881 (OMIM: 600816) heat shock cognate 71 kDa pro (493 aa)
initn: 966 init1: 288 opt: 714 Z-score: 846.9 bits: 166.1 E(85289): 2e-40
Smith-Waterman score: 919; 39.3% identity (68.1% similar) in 430 aa overlap (34-458:7-391)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD EMTILGSAVLTLLLAGYLAQQYLPLPTPKVIGIDLGTTYCSVGVFFPGTGKVKVIPDENG
.:::::::: :::: :::..: ...:
NP_694 MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVF--QHGKVEIIANDQG
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KSD HISIPSMVSFTDNDVYVGYESVELADSNPQNTIYDAKRFIGKIFTAEELEAEIGRYPFKV
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NP_694 NRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMV
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LNKNGMVEFSVT-SNETITVSPEYVGSRLLLKLKEMAEAYLGMPVANAVISVPAEFDLKQ
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NP_694 VNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQ
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KSD RNSTIEAANLAGLKILRVINEPTAAAMAYGLHK--ADVFHVLVIDLGGGTLDVSLLNKQG
:..: .:...:::..::.::::::::.:::: : . .::..::::::.:::.:. .
NP_694 RQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIED
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290
pF1KSD GMFLTRAMSGNNKLGGQDFNQRLLQYLYKQIYQTYGF-VPSRKEEIHRLRQAVEMVKLNL
:.: ... .:...:::.::..:..... .. . . . :. ..::: : : .:
NP_694 GIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKR--
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KSD TLHQSAQLSVLLTVEEQDRKEPHSSDTELPKDKLSSADDHRVNSGFGRGLSDKKSGESQV
:: .:.: :. . :.: . :
NP_694 TLSSSTQASIEI-------------------DSLYEGID---------------------
280 290
360 370 380 390 400 410
pF1KSD LFETEISRKLFDTLNEDLFQKILVPIQQVLKEGHLEKTEIDEVVLVGGSTRIPRIRQVIQ
: : :.: :. :: :::. : :....:....:.:..: ..::::::::::.:....:
NP_694 -FYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQ
300 310 320 330 340 350
420 430 440 450 460 470
pF1KSD EFF-GKDPNTSVDPDLAVVTGVAIQAGIDGGSWPLQVSALEIPNKHLQKTNFN
.:: ::. : :..:: ::. :.:.::.: .:. .:. :
NP_694 DFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMT
360 370 380 390 400 410
NP_694 VLIKRNTTIPTKQTQTFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNNLLGKFELTGMPGGMPGG
420 430 440 450 460 470
>>NP_006588 (OMIM: 600816) heat shock cognate 71 kDa pro (646 aa)
initn: 966 init1: 288 opt: 714 Z-score: 845.2 bits: 166.2 E(85289): 2.4e-40
Smith-Waterman score: 919; 39.3% identity (68.1% similar) in 430 aa overlap (34-458:7-391)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD EMTILGSAVLTLLLAGYLAQQYLPLPTPKVIGIDLGTTYCSVGVFFPGTGKVKVIPDENG
.:::::::: :::: :::..: ...:
NP_006 MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVF--QHGKVEIIANDQG
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KSD HISIPSMVSFTDNDVYVGYESVELADSNPQNTIYDAKRFIGKIFTAEELEAEIGRYPFKV
. . ::.:.:::.. .: . . . :: ::..::::.::. : ..... ..:: :
NP_006 NRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMV
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LNKNGMVEFSVT-SNETITVSPEYVGSRLLLKLKEMAEAYLGMPVANAVISVPAEFDLKQ
.: : . .: ..:: . :: :.: .: :.::.:::::: :.:::..::: :. .:
NP_006 VNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQ
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KSD RNSTIEAANLAGLKILRVINEPTAAAMAYGLHK--ADVFHVLVIDLGGGTLDVSLLNKQG
:..: .:...:::..::.::::::::.:::: : . .::..::::::.:::.:. .
NP_006 RQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIED
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290
pF1KSD GMFLTRAMSGNNKLGGQDFNQRLLQYLYKQIYQTYGF-VPSRKEEIHRLRQAVEMVKLNL
:.: ... .:...:::.::..:..... .. . . . :. ..::: : : .:
NP_006 GIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKR--
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KSD TLHQSAQLSVLLTVEEQDRKEPHSSDTELPKDKLSSADDHRVNSGFGRGLSDKKSGESQV
:: .:.: :. . :.: . :
NP_006 TLSSSTQASIEI-------------------DSLYEGID---------------------
280 290
360 370 380 390 400 410
pF1KSD LFETEISRKLFDTLNEDLFQKILVPIQQVLKEGHLEKTEIDEVVLVGGSTRIPRIRQVIQ
: : :.: :. :: :::. : :....:....:.:..: ..::::::::::.:....:
NP_006 -FYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQ
300 310 320 330 340 350
420 430 440 450 460 470
pF1KSD EFF-GKDPNTSVDPDLAVVTGVAIQAGIDGGSWPLQVSALEIPNKHLQKTNFN
.:: ::. : :..:: ::. :.:.::.: .:. .:. :
NP_006 DFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMT
360 370 380 390 400 410
NP_006 VLIKRNTTIPTKQTQTFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNNLLGKFELTGIPPAPRGV
420 430 440 450 460 470
>>XP_011541100 (OMIM: 600816) PREDICTED: heat shock cogn (646 aa)
initn: 966 init1: 288 opt: 714 Z-score: 845.2 bits: 166.2 E(85289): 2.4e-40
Smith-Waterman score: 919; 39.3% identity (68.1% similar) in 430 aa overlap (34-458:7-391)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD EMTILGSAVLTLLLAGYLAQQYLPLPTPKVIGIDLGTTYCSVGVFFPGTGKVKVIPDENG
.:::::::: :::: :::..: ...:
XP_011 MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVF--QHGKVEIIANDQG
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KSD HISIPSMVSFTDNDVYVGYESVELADSNPQNTIYDAKRFIGKIFTAEELEAEIGRYPFKV
. . ::.:.:::.. .: . . . :: ::..::::.::. : ..... ..:: :
XP_011 NRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMV
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LNKNGMVEFSVT-SNETITVSPEYVGSRLLLKLKEMAEAYLGMPVANAVISVPAEFDLKQ
.: : . .: ..:: . :: :.: .: :.::.:::::: :.:::..::: :. .:
XP_011 VNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQ
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KSD RNSTIEAANLAGLKILRVINEPTAAAMAYGLHK--ADVFHVLVIDLGGGTLDVSLLNKQG
:..: .:...:::..::.::::::::.:::: : . .::..::::::.:::.:. .
XP_011 RQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIED
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290
pF1KSD GMFLTRAMSGNNKLGGQDFNQRLLQYLYKQIYQTYGF-VPSRKEEIHRLRQAVEMVKLNL
:.: ... .:...:::.::..:..... .. . . . :. ..::: : : .:
XP_011 GIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKR--
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KSD TLHQSAQLSVLLTVEEQDRKEPHSSDTELPKDKLSSADDHRVNSGFGRGLSDKKSGESQV
:: .:.: :. . :.: . :
XP_011 TLSSSTQASIEI-------------------DSLYEGID---------------------
280 290
360 370 380 390 400 410
pF1KSD LFETEISRKLFDTLNEDLFQKILVPIQQVLKEGHLEKTEIDEVVLVGGSTRIPRIRQVIQ
: : :.: :. :: :::. : :....:....:.:..: ..::::::::::.:....:
XP_011 -FYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQ
300 310 320 330 340 350
420 430 440 450 460 470
pF1KSD EFF-GKDPNTSVDPDLAVVTGVAIQAGIDGGSWPLQVSALEIPNKHLQKTNFN
.:: ::. : :..:: ::. :.:.::.: .:. .:. :
XP_011 DFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMT
360 370 380 390 400 410
XP_011 VLIKRNTTIPTKQTQTFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNNLLGKFELTGIPPAPRGV
420 430 440 450 460 470
>>NP_068814 (OMIM: 140560) heat shock-related 70 kDa pro (639 aa)
initn: 990 init1: 276 opt: 709 Z-score: 839.4 bits: 165.1 E(85289): 5.1e-40
Smith-Waterman score: 914; 39.6% identity (68.1% similar) in 432 aa overlap (34-458:8-394)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD EMTILGSAVLTLLLAGYLAQQYLPLPTPKVIGIDLGTTYCSVGVFFPGTGKVKVIPDENG
::::::::: :::: :::..: ...:
NP_068 MSARGPAIGIDLGTTYSCVGVF--QHGKVEIIANDQG
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KSD HISIPSMVSFTDNDVYVGYESVELADSNPQNTIYDAKRFIGKIFTAEELEAEIGRYPFKV
. . ::.:.:::.. .: . . . :: :::.::::.::. : ..... ..::.:
NP_068 NRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRV
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LNKNGMVEFSVT-SNETITVSPEYVGSRLLLKLKEMAEAYLGMPVANAVISVPAEFDLKQ
....: . .: ..:: : :: ..: .: :.::.:::::: : .:::.::: :. .:
NP_068 VSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQ
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230
pF1KSD RNSTIEAANLAGLKILRVINEPTAAAMAYGLHKADVF----HVLVIDLGGGTLDVSLLNK
:..: .:....::..::.::::::::.:::: : .::..::::::.:::.:.
NP_068 RQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKGCAGGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTI
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KSD QGGMFLTRAMSGNNKLGGQDFNQRLLQYLYKQIYQTYGF-VPSRKEEIHRLRQAVEMVKL
. :.: ... .:...:::.::..:....: ... . . . :. ..::: : : .:
NP_068 EDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKR
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KSD NLTLHQSAQLSVLLTVEEQDRKEPHSSDTELPKDKLSSADDHRVNSGFGRGLSDKKSGES
:: .:.: :. . :.: . :
NP_068 --TLSSSTQASIEI-------------------DSLYEGVD-------------------
280 290
360 370 380 390 400 410
pF1KSD QVLFETEISRKLFDTLNEDLFQKILVPIQQVLKEGHLEKTEIDEVVLVGGSTRIPRIRQV
: : :.: :. :: :::. : :....:....:.: .:.:.::::::::::.:...
NP_068 ---FYTSITRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKL
300 310 320 330 340 350
420 430 440 450 460 470
pF1KSD IQEFF-GKDPNTSVDPDLAVVTGVAIQAGIDGGSWPLQVSALEIPNKHLQKTNFN
.:.:: ::. : :..:: ::. :.:.::.: :. .:. :
NP_068 LQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGV
360 370 380 390 400 410
NP_068 MTPLIKRNTTIPTKQTQTFTTYSDNQSSVLVQVYEGERAMTKDNNLLGKFDLTGIPPAPR
420 430 440 450 460 470
471 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 08:16:10 2016 done: Thu Nov 3 08:16:11 2016
Total Scan time: 9.340 Total Display time: 0.080
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]