Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDB0037
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDB0037, 471 aa
1>>>pF1KSDB0037 471 - 471 aa - 471 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0449+/-0.00106; mu= 13.9387+/- 0.063
mean_var=71.0102+/-14.322, 0's: 0 Z-trim(103.3): 38 B-trim: 16 in 1/49
Lambda= 0.152200
statistics sampled from 7339 (7364) to 7339 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.589), E-opt: 0.2 (0.226), width: 16
Scan time: 2.900
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13567.1 HSPA13 gene_id:6782|Hs108|chr21 ( 471) 3013 671.1 6.9e-193
CCDS34413.1 HSPA1L gene_id:3305|Hs108|chr6 ( 641) 747 173.6 5.5e-43
CCDS1231.1 HSPA6 gene_id:3310|Hs108|chr1 ( 643) 736 171.2 3e-42
CCDS34415.1 HSPA1B gene_id:3304|Hs108|chr6 ( 641) 734 170.7 4e-42
CCDS34414.1 HSPA1A gene_id:3303|Hs108|chr6 ( 641) 734 170.7 4e-42
CCDS6863.1 HSPA5 gene_id:3309|Hs108|chr9 ( 654) 718 167.2 4.7e-41
CCDS44754.1 HSPA8 gene_id:3312|Hs108|chr11 ( 493) 714 166.3 6.6e-41
CCDS8440.1 HSPA8 gene_id:3312|Hs108|chr11 ( 646) 714 166.3 8.5e-41
CCDS9766.1 HSPA2 gene_id:3306|Hs108|chr14 ( 639) 709 165.2 1.8e-40
CCDS4208.1 HSPA9 gene_id:3313|Hs108|chr5 ( 679) 649 152.1 1.8e-36
CCDS7103.1 HSPA14 gene_id:51182|Hs108|chr10 ( 509) 455 109.4 9e-24
CCDS4166.1 HSPA4 gene_id:3308|Hs108|chr5 ( 840) 422 102.2 2.2e-21
CCDS3734.1 HSPA4L gene_id:22824|Hs108|chr4 ( 839) 381 93.2 1.1e-18
CCDS8408.1 HYOU1 gene_id:10525|Hs108|chr11 ( 999) 331 82.3 2.6e-15
CCDS82953.1 HSPA4L gene_id:22824|Hs108|chr4 ( 813) 316 79.0 2.1e-14
>>CCDS13567.1 HSPA13 gene_id:6782|Hs108|chr21 (471 aa)
initn: 3013 init1: 3013 opt: 3013 Z-score: 3576.4 bits: 671.1 E(32554): 6.9e-193
Smith-Waterman score: 3013; 100.0% identity (100.0% similar) in 471 aa overlap (1-471:1-471)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAREMTILGSAVLTLLLAGYLAQQYLPLPTPKVIGIDLGTTYCSVGVFFPGTGKVKVIPD
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CCDS13 MAREMTILGSAVLTLLLAGYLAQQYLPLPTPKVIGIDLGTTYCSVGVFFPGTGKVKVIPD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD ENGHISIPSMVSFTDNDVYVGYESVELADSNPQNTIYDAKRFIGKIFTAEELEAEIGRYP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ENGHISIPSMVSFTDNDVYVGYESVELADSNPQNTIYDAKRFIGKIFTAEELEAEIGRYP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD FKVLNKNGMVEFSVTSNETITVSPEYVGSRLLLKLKEMAEAYLGMPVANAVISVPAEFDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 FKVLNKNGMVEFSVTSNETITVSPEYVGSRLLLKLKEMAEAYLGMPVANAVISVPAEFDL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD KQRNSTIEAANLAGLKILRVINEPTAAAMAYGLHKADVFHVLVIDLGGGTLDVSLLNKQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 KQRNSTIEAANLAGLKILRVINEPTAAAMAYGLHKADVFHVLVIDLGGGTLDVSLLNKQG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD GMFLTRAMSGNNKLGGQDFNQRLLQYLYKQIYQTYGFVPSRKEEIHRLRQAVEMVKLNLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GMFLTRAMSGNNKLGGQDFNQRLLQYLYKQIYQTYGFVPSRKEEIHRLRQAVEMVKLNLT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD LHQSAQLSVLLTVEEQDRKEPHSSDTELPKDKLSSADDHRVNSGFGRGLSDKKSGESQVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LHQSAQLSVLLTVEEQDRKEPHSSDTELPKDKLSSADDHRVNSGFGRGLSDKKSGESQVL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD FETEISRKLFDTLNEDLFQKILVPIQQVLKEGHLEKTEIDEVVLVGGSTRIPRIRQVIQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 FETEISRKLFDTLNEDLFQKILVPIQQVLKEGHLEKTEIDEVVLVGGSTRIPRIRQVIQE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KSD FFGKDPNTSVDPDLAVVTGVAIQAGIDGGSWPLQVSALEIPNKHLQKTNFN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 FFGKDPNTSVDPDLAVVTGVAIQAGIDGGSWPLQVSALEIPNKHLQKTNFN
430 440 450 460 470
>>CCDS34413.1 HSPA1L gene_id:3305|Hs108|chr6 (641 aa)
initn: 849 init1: 285 opt: 747 Z-score: 885.1 bits: 173.6 E(32554): 5.5e-43
Smith-Waterman score: 934; 39.3% identity (68.6% similar) in 430 aa overlap (34-458:9-393)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD EMTILGSAVLTLLLAGYLAQQYLPLPTPKVIGIDLGTTYCSVGVFFPGTGKVKVIPDENG
::::::::: :::: :::..: ...:
CCDS34 MATAKGIAIGIDLGTTYSCVGVF--QHGKVEIIANDQG
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KSD HISIPSMVSFTDNDVYVGYESVELADSNPQNTIYDAKRFIGKIFTAEELEAEIGRYPFKV
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CCDS34 NRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPQNTVFDAKRLIGRKFNDPVVQADMKLWPFQV
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LNKNGMVEFSVT-SNETITVSPEYVGSRLLLKLKEMAEAYLGMPVANAVISVPAEFDLKQ
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CCDS34 INEGGKPKVLVSYKGENKAFYPEEISSMVLTKLKETAEAFLGHPVTNAVITVPAYFNDSQ
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KSD RNSTIEAANLAGLKILRVINEPTAAAMAYGLHKADV--FHVLVIDLGGGTLDVSLLNKQG
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CCDS34 RQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKGGQGERHVLIFDLGGGTFDVSILTIDD
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290
pF1KSD GMFLTRAMSGNNKLGGQDFNQRLLQYLYKQIYQTYGF-VPSRKEEIHRLRQAVEMVKLNL
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CCDS34 GIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVSHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTL
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KSD TLHQSAQLSVLLTVEEQDRKEPHSSDTELPKDKLSSADDHRVNSGFGRGLSDKKSGESQV
. .:.: . :.: . :
CCDS34 SSSTQANLEI---------------------DSLYEGID---------------------
280 290
360 370 380 390 400 410
pF1KSD LFETEISRKLFDTLNEDLFQKILVPIQQVLKEGHLEKTEIDEVVLVGGSTRIPRIRQVIQ
: : :.: :. : :::. : :....:......:..: ..::::::::::......:
CCDS34 -FYTSITRARFEELCADLFRGTLEPVEKALRDAKMDKAKIHDIVLVGGSTRIPKVQRLLQ
300 310 320 330 340 350
420 430 440 450 460 470
pF1KSD EFF-GKDPNTSVDPDLAVVTGVAIQAGIDGGSWPLQVSALEIPNKHLQKTNFN
..: :.: : :..:: ::. :.:.::.: :. .:. :
CCDS34 DYFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMGDKSEKVQDLLLLDVAPLSLGLETAGGVMT
360 370 380 390 400 410
CCDS34 ALIKRNSTIPTKQTQIFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNNLLGRFDLTGIPPAPRGV
420 430 440 450 460 470
>>CCDS1231.1 HSPA6 gene_id:3310|Hs108|chr1 (643 aa)
initn: 970 init1: 282 opt: 736 Z-score: 872.1 bits: 171.2 E(32554): 3e-42
Smith-Waterman score: 926; 39.0% identity (68.5% similar) in 426 aa overlap (29-449:4-384)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAREMTILGSAVLTLLLAGYLAQQYLPLPTPKVIGIDLGTTYCSVGVFFPGTGKVKVIPD
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CCDS12 MQAPRELAVGIDLGTTYSCVGVF--QQGRVEILAN
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KSD ENGHISIPSMVSFTDNDVYVGYESVELADSNPQNTIYDAKRFIGKIFTAEELEAEIGRYP
..:. . ::.:.:::.. :: . : ::.::..::::.::. :. ..... ..:
CCDS12 DQGNRTTPSYVAFTDTERLVGDAAKSQAALNPHNTVFDAKRLIGRKFADTTVQSDMKHWP
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170
pF1KSD FKVLNKNGMVEFSVT-SNETITVSPEYVGSRLLLKLKEMAEAYLGMPVANAVISVPAEFD
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CCDS12 FRVVSEGGKPKVRVCYRGEDKTFYPEEISSMVLSKMKETAEAYLGQPVKHAVITVPAYFN
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KSD LKQRNSTIEAANLAGLKILRVINEPTAAAMAYGLHK--ADVFHVLVIDLGGGTLDVSLLN
.::..: .:. .:::..::.::::::::.:::: . : .::..::::::.:::.:.
CCDS12 DSQRQATKDAGAIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRRGAGERNVLIFDLGGGTFDVSVLS
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KSD KQGGMFLTRAMSGNNKLGGQDFNQRLLQYLYKQIYQTYGF-VPSRKEEIHRLRQAVEMVK
..:.: ..: .:...:::.::..::........ . .: . . :. ..::: : : .:
CCDS12 IDAGVFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFMEEFRRKHGKDLSGNKRALRRLRTACERAK
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KSD LNLTLHQSAQLSVLLTVEEQDRKEPHSSDTELPKDKLSSADDHRVNSGFGRGLSDKKSGE
.:. .: : . :.: . :
CCDS12 RTLSSSTQATLEI---------------------DSLFEGVD------------------
280 290
360 370 380 390 400 410
pF1KSD SQVLFETEISRKLFDTLNEDLFQKILVPIQQVLKEGHLEKTEIDEVVLVGGSTRIPRIRQ
: : :.: :. : :::.. : :....:....:.:..: .:::::::::::....
CCDS12 ----FYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDVVLVGGSTRIPKVQK
300 310 320 330 340 350
420 430 440 450 460 470
pF1KSD VIQEFF-GKDPNTSVDPDLAVVTGVAIQAGIDGGSWPLQVSALEIPNKHLQKTNFN
..:.:: ::. : :..:: ::. :.:.::.. :
CCDS12 LLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAVLMGDKCEKVQDLLLLDVAPLSLGLETAGG
360 370 380 390 400 410
CCDS12 VMTTLIQRNATIPTKQTQTFTTYSDNQPGVFIQVYEGERAMTKDNNLLGRFELSGIPPAP
420 430 440 450 460 470
>>CCDS34415.1 HSPA1B gene_id:3304|Hs108|chr6 (641 aa)
initn: 872 init1: 293 opt: 734 Z-score: 869.7 bits: 170.7 E(32554): 4e-42
Smith-Waterman score: 927; 39.5% identity (70.0% similar) in 430 aa overlap (34-458:7-391)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD EMTILGSAVLTLLLAGYLAQQYLPLPTPKVIGIDLGTTYCSVGVFFPGTGKVKVIPDENG
::::::::: :::: :::..: ...:
CCDS34 MAKAAAIGIDLGTTYSCVGVF--QHGKVEIIANDQG
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KSD HISIPSMVSFTDNDVYVGYESVELADSNPQNTIYDAKRFIGKIFTAEELEAEIGRYPFKV
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CCDS34 NRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQV
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LNKNGMVEFSVT-SNETITVSPEYVGSRLLLKLKEMAEAYLGMPVANAVISVPAEFDLKQ
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CCDS34 INDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQ
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KSD RNSTIEAANLAGLKILRVINEPTAAAMAYGLHKADV--FHVLVIDLGGGTLDVSLLNKQG
:..: .:. .:::..::.::::::::.:::: .. .::..::::::.:::.:. .
CCDS34 RQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDD
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290
pF1KSD GMFLTRAMSGNNKLGGQDFNQRLLQYLYKQIYQTYGF-VPSRKEEIHRLRQAVEMVKLNL
:.: ..: .:...:::.::..::.... ... . . . . :. ..::: : : .:
CCDS34 GIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKR--
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KSD TLHQSAQLSVLLTVEEQDRKEPHSSDTELPKDKLSSADDHRVNSGFGRGLSDKKSGESQV
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CCDS34 TLSSSTQASL------------------------------EIDSLF-EGID---------
280 290
360 370 380 390 400 410
pF1KSD LFETEISRKLFDTLNEDLFQKILVPIQQVLKEGHLEKTEIDEVVLVGGSTRIPRIRQVIQ
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CCDS34 -FYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQ
300 310 320 330 340 350
420 430 440 450 460 470
pF1KSD EFF-GKDPNTSVDPDLAVVTGVAIQAGIDGGSWPLQVSALEIPNKHLQKTNFN
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CCDS34 DFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMGDKSENVQDLLLLDVAPLSLGLETAGGVMT
360 370 380 390 400 410
CCDS34 ALIKRNSTIPTKQTQIFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNNLLGRFELSGIPPAPRGV
420 430 440 450 460 470
>>CCDS34414.1 HSPA1A gene_id:3303|Hs108|chr6 (641 aa)
initn: 872 init1: 293 opt: 734 Z-score: 869.7 bits: 170.7 E(32554): 4e-42
Smith-Waterman score: 927; 39.5% identity (70.0% similar) in 430 aa overlap (34-458:7-391)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD EMTILGSAVLTLLLAGYLAQQYLPLPTPKVIGIDLGTTYCSVGVFFPGTGKVKVIPDENG
::::::::: :::: :::..: ...:
CCDS34 MAKAAAIGIDLGTTYSCVGVF--QHGKVEIIANDQG
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KSD HISIPSMVSFTDNDVYVGYESVELADSNPQNTIYDAKRFIGKIFTAEELEAEIGRYPFKV
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CCDS34 NRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQV
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LNKNGMVEFSVT-SNETITVSPEYVGSRLLLKLKEMAEAYLGMPVANAVISVPAEFDLKQ
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CCDS34 INDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQ
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KSD RNSTIEAANLAGLKILRVINEPTAAAMAYGLHKADV--FHVLVIDLGGGTLDVSLLNKQG
:..: .:. .:::..::.::::::::.:::: .. .::..::::::.:::.:. .
CCDS34 RQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDD
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290
pF1KSD GMFLTRAMSGNNKLGGQDFNQRLLQYLYKQIYQTYGF-VPSRKEEIHRLRQAVEMVKLNL
:.: ..: .:...:::.::..::.... ... . . . . :. ..::: : : .:
CCDS34 GIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKR--
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KSD TLHQSAQLSVLLTVEEQDRKEPHSSDTELPKDKLSSADDHRVNSGFGRGLSDKKSGESQV
:: .:.: :. ...: : .:..
CCDS34 TLSSSTQASL------------------------------EIDSLF-EGID---------
280 290
360 370 380 390 400 410
pF1KSD LFETEISRKLFDTLNEDLFQKILVPIQQVLKEGHLEKTEIDEVVLVGGSTRIPRIRQVIQ
: : :.: :. : :::.. : :....:....:.:..: ..::::::::::......:
CCDS34 -FYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQ
300 310 320 330 340 350
420 430 440 450 460 470
pF1KSD EFF-GKDPNTSVDPDLAVVTGVAIQAGIDGGSWPLQVSALEIPNKHLQKTNFN
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CCDS34 DFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMGDKSENVQDLLLLDVAPLSLGLETAGGVMT
360 370 380 390 400 410
CCDS34 ALIKRNSTIPTKQTQIFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNNLLGRFELSGIPPAPRGV
420 430 440 450 460 470
>>CCDS6863.1 HSPA5 gene_id:3309|Hs108|chr9 (654 aa)
initn: 931 init1: 280 opt: 718 Z-score: 850.6 bits: 167.2 E(32554): 4.7e-41
Smith-Waterman score: 941; 37.9% identity (67.7% similar) in 449 aa overlap (8-449:5-407)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAREMTILGSAVLTLLLAGYLAQQYLPLPTPKVIGIDLGTTYCSVGVFFPGTGKVKVIPD
: .:.: :: :. .. . :.:::::::: :::: .:.:..: .
CCDS68 MKLSLVAAMLLLLSAARAEEEDKKEDVGTVVGIDLGTTYSCVGVF--KNGRVEIIAN
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KSD ENGHISIPSMVSFT-DNDVYVGYESVELADSNPQNTIYDAKRFIGKIFTAEELEAEIGRY
..:. ::.:.:: ... .: . . :::.::..::::.::. .. .. .:
CCDS68 DQGNRITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD PFKVLNKNG--MVEFSVTSNETITVSPEYVGSRLLLKLKEMAEAYLGMPVANAVISVPAE
::::..:. ... .. ...: : .:: ... .: :.:: :::::: :..::..:::
CCDS68 PFKVVEKKTKPYIQVDIGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAY
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD FDLKQRNSTIEAANLAGLKILRVINEPTAAAMAYGLHKADVF-HVLVIDLGGGTLDVSLL
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.: :. ...:.. . : .:
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CCDS68 ------FSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEIVLVGGSTRIPKI
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.:...::: ::.:. ...:: ::. :.:.:::. .:
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CCDS68 VMTKLIPRNTVVPTKKSQIFSTASDNQPTVTIKVYEGERPLTKDNHLLGTFDLTGIPPAP
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CCDS84 MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVF--QHGKVEIIANDQG
10 20 30
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CCDS84 VNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQ
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pF1KSD RNSTIEAANLAGLKILRVINEPTAAAMAYGLHK--ADVFHVLVIDLGGGTLDVSLLNKQG
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CCDS84 RQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIED
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CCDS84 GIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKR--
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CCDS84 -FYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQ
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pF1KSD EFF-GKDPNTSVDPDLAVVTGVAIQAGIDGGSWPLQVSALEIPNKHLQKTNFN
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CCDS84 DFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMT
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CCDS84 VLIKRNTTIPTKQTQTFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNNLLGKFELTGIPPAPRGV
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CCDS42 EGARTTPSVVAFTADGERLVGMPAKRQAVTNPNNTFYATKRLIGRRYDDPEVQKDIKNVP
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CCDS42 DSQRQATKDAGQISGLNVLRVINEPTAAALAYGLDKSEDKVIAVYDLGGGTFDISILEIQ
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CCDS42 KGVFEVKSTNGDTFLGGEDFDQALLRHIVKEFKRETG-VDLTKDNMALQRVREAAEKAKC
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CCDS42 ELS--SSVQ-----------------TDINLPYLTMDSSGPKHLN---------------
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CCDS42 -----MKLTRAQFEGIVTDLIRRTIAPCQKAMQDAEVSKSDIGEVILVGGMTRMPKVQQT
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pF1KSD IQEFFGKDPNTSVDPDLAVVTGVAIQAGIDGGSWPLQVSALEIPNKHLQKTNFN
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CCDS42 VQDLFGRAPSKAVNPDEAVAIGAAIQGGVLAGDVTDVLLLDVTPLSLGIETLGGVFTKLI
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CCDS42 NRNTTIPTKKSQVFSTAADGQTQVEIKVCQGEREMAGDNKLLGQFTLIGIPPAPRGVPQI
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471 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 08:16:09 2016 done: Thu Nov 3 08:16:09 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]