Result of FASTA (omim) for
pF1KSDB0033
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDB0033, 1063 aa
1>>>pF1KSDB0033 1063 - 1063 aa - 1063 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2439+/-0.000466; mu= 22.4164+/- 0.029
mean_var=78.1205+/-15.675, 0's: 0 Z-trim(109.8): 206 B-trim: 277 in 1/53
Lambda= 0.145108
statistics sampled from 17772 (17990) to 17772 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.568), E-opt: 0.2 (0.211), width: 16
Scan time: 14.420
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001074248 (OMIM: 606538) unconventional myosin- (1063) 6999 1476.1 0
NP_001074419 (OMIM: 606538) unconventional myosin- (1044) 6827 1440.0 0
NP_203693 (OMIM: 606538) unconventional myosin-Ic (1028) 6766 1427.3 0
XP_016874696 (OMIM: 614636) PREDICTED: unconventio (1027) 4299 910.8 0
NP_001094891 (OMIM: 614636) unconventional myosin- (1022) 4295 910.0 0
XP_011536525 (OMIM: 614636) PREDICTED: unconventio (1044) 2920 622.1 5e-177
NP_036355 (OMIM: 606537) unconventional myosin-Ib (1078) 2478 529.6 3.6e-149
NP_001317167 (OMIM: 606537) unconventional myosin- (1107) 2478 529.6 3.7e-149
NP_001317166 (OMIM: 606537) unconventional myosin- (1107) 2478 529.6 3.7e-149
NP_001123630 (OMIM: 606537) unconventional myosin- (1136) 2478 529.6 3.8e-149
NP_001155291 (OMIM: 606537) unconventional myosin- (1136) 2478 529.6 3.8e-149
XP_005246629 (OMIM: 606537) PREDICTED: unconventio (1136) 2478 529.6 3.8e-149
XP_011536675 (OMIM: 601478,607841) PREDICTED: unco ( 866) 2300 492.3 5.1e-138
NP_005370 (OMIM: 601478,607841) unconventional myo (1043) 2300 492.3 5.9e-138
NP_001242970 (OMIM: 601478,607841) unconventional (1043) 2300 492.3 5.9e-138
XP_016880174 (OMIM: 606539) PREDICTED: unconventio ( 955) 2264 484.8 1e-135
NP_001290208 (OMIM: 606539) unconventional myosin- ( 961) 2264 484.8 1e-135
NP_056009 (OMIM: 606539) unconventional myosin-Id (1006) 2264 484.8 1.1e-135
XP_016859647 (OMIM: 606537) PREDICTED: unconventio (1015) 2087 447.7 1.5e-124
XP_011543352 (OMIM: 276900,276903,600060,601317) P (2140) 1630 352.3 1.7e-95
NP_001120651 (OMIM: 276900,276903,600060,601317) u (1178) 1584 342.5 8.5e-93
XP_016873276 (OMIM: 276900,276903,600060,601317) P (1451) 1584 342.6 1e-92
XP_016873275 (OMIM: 276900,276903,600060,601317) P (2154) 1584 342.7 1.3e-92
NP_001120652 (OMIM: 276900,276903,600060,601317) u (2175) 1584 342.7 1.4e-92
XP_016873273 (OMIM: 276900,276903,600060,601317) P (2206) 1584 342.7 1.4e-92
XP_016873277 (OMIM: 276900,276903,600060,601317) P (2207) 1584 342.7 1.4e-92
NP_000251 (OMIM: 276900,276903,600060,601317) unco (2215) 1584 342.7 1.4e-92
XP_016873272 (OMIM: 276900,276903,600060,601317) P (2219) 1584 342.7 1.4e-92
XP_016873271 (OMIM: 276900,276903,600060,601317) P (2220) 1584 342.7 1.4e-92
XP_016873270 (OMIM: 276900,276903,600060,601317) P (2226) 1584 342.7 1.4e-92
XP_011543346 (OMIM: 276900,276903,600060,601317) P (2228) 1584 342.7 1.4e-92
XP_016873269 (OMIM: 276900,276903,600060,601317) P (2245) 1584 342.7 1.4e-92
XP_016873268 (OMIM: 276900,276903,600060,601317) P (2255) 1584 342.7 1.4e-92
XP_016873267 (OMIM: 276900,276903,600060,601317) P (2256) 1584 342.7 1.4e-92
XP_011543348 (OMIM: 276900,276903,600060,601317) P (2258) 1584 342.7 1.4e-92
NP_061198 (OMIM: 610022) unconventional myosin-Vc (1742) 1563 338.2 2.4e-91
XP_011520083 (OMIM: 610022) PREDICTED: unconventio (1714) 1531 331.5 2.5e-89
XP_016880204 (OMIM: 600316,602666) PREDICTED: unco (3531) 1482 321.5 5.3e-86
XP_011526330 (OMIM: 601480) PREDICTED: unconventio ( 573) 1445 313.1 2.8e-84
XP_011526329 (OMIM: 601480) PREDICTED: unconventio (1074) 1445 313.4 4.6e-84
NP_036467 (OMIM: 601480) unconventional myosin-If (1098) 1445 313.4 4.6e-84
XP_011526326 (OMIM: 601480) PREDICTED: unconventio (1119) 1445 313.4 4.7e-84
XP_016876829 (OMIM: 160500,160760,181430,192600,25 (1935) 1446 313.8 6.2e-84
NP_000248 (OMIM: 160500,160760,181430,192600,25516 (1935) 1446 313.8 6.2e-84
NP_004989 (OMIM: 601479,614131) unconventional myo (1108) 1442 312.7 7.2e-84
NP_057323 (OMIM: 600316,602666) unconventional myo (3530) 1429 310.4 1.2e-82
NP_001290209 (OMIM: 606539) unconventional myosin- ( 436) 1399 303.4 1.8e-81
XP_011522172 (OMIM: 160720,178110,193700,601680) P (1940) 1381 300.2 7.7e-80
NP_002461 (OMIM: 160720,178110,193700,601680) myos (1940) 1381 300.2 7.7e-80
XP_011522173 (OMIM: 160720,178110,193700,601680) P (1940) 1381 300.2 7.7e-80
>>NP_001074248 (OMIM: 606538) unconventional myosin-Ic i (1063 aa)
initn: 6999 init1: 6999 opt: 6999 Z-score: 7914.1 bits: 1476.1 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6999; 99.8% identity (100.0% similar) in 1063 aa overlap (1-1063:1-1063)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MALQVELVPTGEIIRVVHPHRPCKLALGSDGVRVTMESALTARDRVGVQDFVLLENFTSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MALQVELVPTGEIIRVVHPHRPCKLALGSDGVRVTMESALTARDRVGVQDFVLLENFTSE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD AAFIENLRRRFRENLIYTYIGPVLVSVNPYRDLQIYSRQHMERYRGVSFYEVPPHLFAVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AAFIENLRRRFRENLIYTYIGPVLVSVNPYRDLQIYSRQHMERYRGVSFYEVPPHLFAVA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD DTVYRALRTERRDQAVMISGESGAGKTEATKRLLQFYAETCPAPERGGAVRDRLLQSNPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DTVYRALRTERRDQAVMISGESGAGKTEATKRLLQFYAETCPAPERGGAVRDRLLQSNPV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD LEAFGNAKTLRNDNSSRFGKYMDVQFDFKGAPVGGHILSYLLEKSRVVHQNHGERNFHIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LEAFGNAKTLRNDNSSRFGKYMDVQFDFKGAPVGGHILSYLLEKSRVVHQNHGERNFHIF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD YQLLEGGEEETLRRLGLERNPQSYLYLVKGQCAKVSSINDKSDWKVVRKALTVIDFTEDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YQLLEGGEEETLRRLGLERNPQSYLYLVKGQCAKVSSINDKSDWKVVRKALTVIDFTEDE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD VEDLLSIVASVLHLGNIHFAANEESNAQVTTENQLKYLTRLLSVEGSTLREALTHRKIIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VEDLLSIVASVLHLGNIHFAANEESNAQVTTENQLKYLTRLLSVEGSTLREALTHRKIIA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD KGEELLSPLNLEQAAYARDALAKAVYSRTFTWLVGKINRSLASKDVESPSWRSTTVLGLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KGEELLSPLNLEQAAYARDALAKAVYSRTFTWLVGKINRSLASKDVESPSWRSTTVLGLL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD DIYGFEVFQHNSFEQFCINYCNEKLQQLFIELTLKSEQEEYEAEGIAWEPVQYFNNKIIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DIYGFEVFQHNSFEQFCINYCNEKLQQLFIELTLKSEQEEYEAEGIAWEPVQYFNNKIIC
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD DLVEEKFKGIISILDEECLRPGEATDLTFLEKLEDTVKHHPHFLTHKLADQRTRKSLGRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DLVEEKFKGIISILDEECLRPGEATDLTFLEKLEDTVKHHPHFLTHKLADQRTRKSLGRG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD EFRLLHYAGEVTYSVTGFLDKNNDLLFRNLKETMCSSKNPIMSQCFDRSELSDKKRPETV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EFRLLHYAGEVTYSVTGFLDKNNDLLFRNLKETMCSSKNPIMSQCFDRSELSDKKRPETV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD ATQFKMSLLQLVEILQSKEPAYVRCIKPNDAKQPGRFDEVLIRHQVKYLGLLENLRVRRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ATQFKMSLLQLVEILQSKEPAYVRCIKPNDAKQPGRFDEVLIRHQVKYLGLLENLRVRRA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD GFAYRRKYEAFLQRYKSLCPETWPTWAGRPQDGVAVLVRHLGYKPEEYKMGRTKIFIRFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GFAYRRKYEAFLQRYKSLCPETWPTWAGRPQDGVAVLVRHLGYKPEEYKMGRTKIFIRFP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD KTLFATEDALEVRRQSLATKIQAAWRGFHWRQKFLRVKRSAICIQSWWRGTLGRRKAAKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KTLFATEDALEVRRQSLATKIQAAWRGFHWRQKFLRVKRSAICIQSWWRGTLGRRKAAKR
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD KWAAQTIRRLIRGFILRHAPRCPENAFFLDHVRTSFLLNLRRQLPRNVLDTSWPTPPPAL
::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::
NP_001 KWAAQTIRRLIRGFVLRHAPRCPENAFFLDHVRTSFLLNLRRQLPQNVLDTSWPTPPPAL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD REASELLRELCIKNMVWKYCRSISPEWKQQLQQKAVASEIFKGKKDNYPQSVPRLFISTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 REASELLRELCIKNMVWKYCRSISPEWKQQLQQKAVASEIFKGKKDNYPQSVPRLFISTR
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD LGTDEISPRVLQALGSEPIQYAVPVVKYDRKGYKPRSRQLLLTPNAVVIVEDAKVKQRID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LGTDEISPRVLQALGSEPIQYAVPVVKYDRKGYKPRSRQLLLTPNAVVIVEDAKVKQRID
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD YANLTGISVSSLSDSLFVLHVQRADNKQKGDVVLQSDHVIETLTKTALSANRVNSININQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YANLTGISVSSLSDSLFVLHVQRADNKQKGDVVLQSDHVIETLTKTALSANRVNSININQ
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060
pF1KSD GSITFAGGPGRDGTIDFTPGSELLITKAKNGHLAVVAPRLNSR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GSITFAGGPGRDGTIDFTPGSELLITKAKNGHLAVVAPRLNSR
1030 1040 1050 1060
>>NP_001074419 (OMIM: 606538) unconventional myosin-Ic i (1044 aa)
initn: 6827 init1: 6827 opt: 6827 Z-score: 7719.6 bits: 1440.0 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6827; 99.8% identity (100.0% similar) in 1038 aa overlap (26-1063:7-1044)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MALQVELVPTGEIIRVVHPHRPCKLALGSDGVRVTMESALTARDRVGVQDFVLLENFTSE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MRYRASALGSDGVRVTMESALTARDRVGVQDFVLLENFTSE
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KSD AAFIENLRRRFRENLIYTYIGPVLVSVNPYRDLQIYSRQHMERYRGVSFYEVPPHLFAVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AAFIENLRRRFRENLIYTYIGPVLVSVNPYRDLQIYSRQHMERYRGVSFYEVPPHLFAVA
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KSD DTVYRALRTERRDQAVMISGESGAGKTEATKRLLQFYAETCPAPERGGAVRDRLLQSNPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DTVYRALRTERRDQAVMISGESGAGKTEATKRLLQFYAETCPAPERGGAVRDRLLQSNPV
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KSD LEAFGNAKTLRNDNSSRFGKYMDVQFDFKGAPVGGHILSYLLEKSRVVHQNHGERNFHIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LEAFGNAKTLRNDNSSRFGKYMDVQFDFKGAPVGGHILSYLLEKSRVVHQNHGERNFHIF
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KSD YQLLEGGEEETLRRLGLERNPQSYLYLVKGQCAKVSSINDKSDWKVVRKALTVIDFTEDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YQLLEGGEEETLRRLGLERNPQSYLYLVKGQCAKVSSINDKSDWKVVRKALTVIDFTEDE
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KSD VEDLLSIVASVLHLGNIHFAANEESNAQVTTENQLKYLTRLLSVEGSTLREALTHRKIIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VEDLLSIVASVLHLGNIHFAANEESNAQVTTENQLKYLTRLLSVEGSTLREALTHRKIIA
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KSD KGEELLSPLNLEQAAYARDALAKAVYSRTFTWLVGKINRSLASKDVESPSWRSTTVLGLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KGEELLSPLNLEQAAYARDALAKAVYSRTFTWLVGKINRSLASKDVESPSWRSTTVLGLL
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KSD DIYGFEVFQHNSFEQFCINYCNEKLQQLFIELTLKSEQEEYEAEGIAWEPVQYFNNKIIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DIYGFEVFQHNSFEQFCINYCNEKLQQLFIELTLKSEQEEYEAEGIAWEPVQYFNNKIIC
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KSD DLVEEKFKGIISILDEECLRPGEATDLTFLEKLEDTVKHHPHFLTHKLADQRTRKSLGRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DLVEEKFKGIISILDEECLRPGEATDLTFLEKLEDTVKHHPHFLTHKLADQRTRKSLGRG
470 480 490 500 510 520
550 560 570 580 590 600
pF1KSD EFRLLHYAGEVTYSVTGFLDKNNDLLFRNLKETMCSSKNPIMSQCFDRSELSDKKRPETV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EFRLLHYAGEVTYSVTGFLDKNNDLLFRNLKETMCSSKNPIMSQCFDRSELSDKKRPETV
530 540 550 560 570 580
610 620 630 640 650 660
pF1KSD ATQFKMSLLQLVEILQSKEPAYVRCIKPNDAKQPGRFDEVLIRHQVKYLGLLENLRVRRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ATQFKMSLLQLVEILQSKEPAYVRCIKPNDAKQPGRFDEVLIRHQVKYLGLLENLRVRRA
590 600 610 620 630 640
670 680 690 700 710 720
pF1KSD GFAYRRKYEAFLQRYKSLCPETWPTWAGRPQDGVAVLVRHLGYKPEEYKMGRTKIFIRFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GFAYRRKYEAFLQRYKSLCPETWPTWAGRPQDGVAVLVRHLGYKPEEYKMGRTKIFIRFP
650 660 670 680 690 700
730 740 750 760 770 780
pF1KSD KTLFATEDALEVRRQSLATKIQAAWRGFHWRQKFLRVKRSAICIQSWWRGTLGRRKAAKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KTLFATEDALEVRRQSLATKIQAAWRGFHWRQKFLRVKRSAICIQSWWRGTLGRRKAAKR
710 720 730 740 750 760
790 800 810 820 830 840
pF1KSD KWAAQTIRRLIRGFILRHAPRCPENAFFLDHVRTSFLLNLRRQLPRNVLDTSWPTPPPAL
::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::
NP_001 KWAAQTIRRLIRGFVLRHAPRCPENAFFLDHVRTSFLLNLRRQLPQNVLDTSWPTPPPAL
770 780 790 800 810 820
850 860 870 880 890 900
pF1KSD REASELLRELCIKNMVWKYCRSISPEWKQQLQQKAVASEIFKGKKDNYPQSVPRLFISTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 REASELLRELCIKNMVWKYCRSISPEWKQQLQQKAVASEIFKGKKDNYPQSVPRLFISTR
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910 920 930 940 950 960
pF1KSD LGTDEISPRVLQALGSEPIQYAVPVVKYDRKGYKPRSRQLLLTPNAVVIVEDAKVKQRID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LGTDEISPRVLQALGSEPIQYAVPVVKYDRKGYKPRSRQLLLTPNAVVIVEDAKVKQRID
890 900 910 920 930 940
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD YANLTGISVSSLSDSLFVLHVQRADNKQKGDVVLQSDHVIETLTKTALSANRVNSININQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YANLTGISVSSLSDSLFVLHVQRADNKQKGDVVLQSDHVIETLTKTALSANRVNSININQ
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1030 1040 1050 1060
pF1KSD GSITFAGGPGRDGTIDFTPGSELLITKAKNGHLAVVAPRLNSR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GSITFAGGPGRDGTIDFTPGSELLITKAKNGHLAVVAPRLNSR
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>>NP_203693 (OMIM: 606538) unconventional myosin-Ic isof (1028 aa)
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Smith-Waterman score: 6766; 99.8% identity (100.0% similar) in 1028 aa overlap (36-1063:1-1028)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD ELVPTGEIIRVVHPHRPCKLALGSDGVRVTMESALTARDRVGVQDFVLLENFTSEAAFIE
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_203 MESALTARDRVGVQDFVLLENFTSEAAFIE
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KSD NLRRRFRENLIYTYIGPVLVSVNPYRDLQIYSRQHMERYRGVSFYEVPPHLFAVADTVYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_203 NLRRRFRENLIYTYIGPVLVSVNPYRDLQIYSRQHMERYRGVSFYEVPPHLFAVADTVYR
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KSD ALRTERRDQAVMISGESGAGKTEATKRLLQFYAETCPAPERGGAVRDRLLQSNPVLEAFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_203 ALRTERRDQAVMISGESGAGKTEATKRLLQFYAETCPAPERGGAVRDRLLQSNPVLEAFG
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pF1KSD NAKTLRNDNSSRFGKYMDVQFDFKGAPVGGHILSYLLEKSRVVHQNHGERNFHIFYQLLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_203 NAKTLRNDNSSRFGKYMDVQFDFKGAPVGGHILSYLLEKSRVVHQNHGERNFHIFYQLLE
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250 260 270 280 290 300
pF1KSD GGEEETLRRLGLERNPQSYLYLVKGQCAKVSSINDKSDWKVVRKALTVIDFTEDEVEDLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_203 GGEEETLRRLGLERNPQSYLYLVKGQCAKVSSINDKSDWKVVRKALTVIDFTEDEVEDLL
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KSD SIVASVLHLGNIHFAANEESNAQVTTENQLKYLTRLLSVEGSTLREALTHRKIIAKGEEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_203 SIVASVLHLGNIHFAANEESNAQVTTENQLKYLTRLLSVEGSTLREALTHRKIIAKGEEL
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KSD LSPLNLEQAAYARDALAKAVYSRTFTWLVGKINRSLASKDVESPSWRSTTVLGLLDIYGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_203 LSPLNLEQAAYARDALAKAVYSRTFTWLVGKINRSLASKDVESPSWRSTTVLGLLDIYGF
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pF1KSD EVFQHNSFEQFCINYCNEKLQQLFIELTLKSEQEEYEAEGIAWEPVQYFNNKIICDLVEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_203 EVFQHNSFEQFCINYCNEKLQQLFIELTLKSEQEEYEAEGIAWEPVQYFNNKIICDLVEE
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KSD KFKGIISILDEECLRPGEATDLTFLEKLEDTVKHHPHFLTHKLADQRTRKSLGRGEFRLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_203 KFKGIISILDEECLRPGEATDLTFLEKLEDTVKHHPHFLTHKLADQRTRKSLGRGEFRLL
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KSD HYAGEVTYSVTGFLDKNNDLLFRNLKETMCSSKNPIMSQCFDRSELSDKKRPETVATQFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_203 HYAGEVTYSVTGFLDKNNDLLFRNLKETMCSSKNPIMSQCFDRSELSDKKRPETVATQFK
520 530 540 550 560 570
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pF1KSD MSLLQLVEILQSKEPAYVRCIKPNDAKQPGRFDEVLIRHQVKYLGLLENLRVRRAGFAYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_203 MSLLQLVEILQSKEPAYVRCIKPNDAKQPGRFDEVLIRHQVKYLGLLENLRVRRAGFAYR
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pF1KSD RKYEAFLQRYKSLCPETWPTWAGRPQDGVAVLVRHLGYKPEEYKMGRTKIFIRFPKTLFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_203 RKYEAFLQRYKSLCPETWPTWAGRPQDGVAVLVRHLGYKPEEYKMGRTKIFIRFPKTLFA
640 650 660 670 680 690
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pF1KSD TEDALEVRRQSLATKIQAAWRGFHWRQKFLRVKRSAICIQSWWRGTLGRRKAAKRKWAAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_203 TEDALEVRRQSLATKIQAAWRGFHWRQKFLRVKRSAICIQSWWRGTLGRRKAAKRKWAAQ
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790 800 810 820 830 840
pF1KSD TIRRLIRGFILRHAPRCPENAFFLDHVRTSFLLNLRRQLPRNVLDTSWPTPPPALREASE
:::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::
NP_203 TIRRLIRGFVLRHAPRCPENAFFLDHVRTSFLLNLRRQLPQNVLDTSWPTPPPALREASE
760 770 780 790 800 810
850 860 870 880 890 900
pF1KSD LLRELCIKNMVWKYCRSISPEWKQQLQQKAVASEIFKGKKDNYPQSVPRLFISTRLGTDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_203 LLRELCIKNMVWKYCRSISPEWKQQLQQKAVASEIFKGKKDNYPQSVPRLFISTRLGTDE
820 830 840 850 860 870
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pF1KSD ISPRVLQALGSEPIQYAVPVVKYDRKGYKPRSRQLLLTPNAVVIVEDAKVKQRIDYANLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_203 ISPRVLQALGSEPIQYAVPVVKYDRKGYKPRSRQLLLTPNAVVIVEDAKVKQRIDYANLT
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970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD GISVSSLSDSLFVLHVQRADNKQKGDVVLQSDHVIETLTKTALSANRVNSININQGSITF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_203 GISVSSLSDSLFVLHVQRADNKQKGDVVLQSDHVIETLTKTALSANRVNSININQGSITF
940 950 960 970 980 990
1030 1040 1050 1060
pF1KSD AGGPGRDGTIDFTPGSELLITKAKNGHLAVVAPRLNSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_203 AGGPGRDGTIDFTPGSELLITKAKNGHLAVVAPRLNSR
1000 1010 1020
>>XP_016874696 (OMIM: 614636) PREDICTED: unconventional (1027 aa)
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Smith-Waterman score: 4299; 61.0% identity (84.7% similar) in 1025 aa overlap (36-1060:1-1020)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD ELVPTGEIIRVVHPHRPCKLALGSDGVRVTMESALTARDRVGVQDFVLLENFTSEAAFIE
::.::::::.:::::::::. .:::.::..
XP_016 MEGALTARDKVGVQDFVLLDAYTSESAFVD
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KSD NLRRRFRENLIYTYIGPVLVSVNPYRDLQIYSRQHMERYRGVSFYEVPPHLFAVADTVYR
:::.:: ::::::::: .:::::::..: ::. ..:: :.::.:.:.:::..:.::..::
XP_016 NLRKRFSENLIYTYIGTLLVSVNPYQELGIYTVSQMELYQGVNFFELPPHVYAIADNAYR
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pF1KSD ALRTERRDQAVMISGESGAGKTEATKRLLQFYAETCPAPERGGAVRDRLLQSNPVLEAFG
. .: .. ..::::::::::::.:..:...: ::: . .::::: :::::::::
XP_016 MMCAELNNHFILISGESGAGKTEASKKILEYFAVTCPMTQSLQIARDRLLFSNPVLEAFG
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190 200 210 220 230 240
pF1KSD NAKTLRNDNSSRFGKYMDVQFDFKGAPVGGHILSYLLEKSRVVHQNHGERNFHIFYQLLE
::.:::::::::::::::.::::.: ::::::.:::.::::::.::.::::::::::::
XP_016 NARTLRNDNSSRFGKYMDIQFDFQGIPVGGHIISYLIEKSRVVYQNEGERNFHIFYQLLA
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pF1KSD GGEEETLRRLGLERNPQSYLYLVKGQCAKVSSINDKSDWKVVRKALTVIDFTEDEVEDLL
::::: : :::::.:: : :: .:.::: :::.::.:::.: .:..:::::: ..:.:.
XP_016 GGEEERLSYLGLERDPQLYKYLSQGHCAKESSISDKNDWKTVSNAFSVIDFTEADLENLF
220 230 240 250 260 270
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pF1KSD SIVASVLHLGNIHFAANEESNAQVTTENQLKYLTRLLSVEGSTLREALTHRKIIAKGEEL
.:.::::::::: : .... : . ...:....::.:. :.: :::::::: :: ::.
XP_016 GIIASVLHLGNIGFEEDDQGCATIPDTHEIKWIAKLLGVHPSVLLEALTHRKIEAKTEEV
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pF1KSD LSPLNLEQAAYARDALAKAVYSRTFTWLVGKINRSLASKDVESPSWRSTTVLGLLDIYGF
. ::.:: ..:::::.:::::.:::::::.::: ::..:: . ::.::::::::
XP_016 ICPLTLELSVYARDAMAKAVYGRTFTWLVNKINSSLVNKD-----FTRKTVIGLLDIYGF
340 350 360 370 380
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pF1KSD EVFQHNSFEQFCINYCNEKLQQLFIELTLKSEQEEYEAEGIAWEPVQYFNNKIICDLVEE
:::..:.::::::::::::::::.:: :::.:: ::: ::: :::..:::::::::::::
XP_016 EVFDKNGFEQFCINYCNEKLQQLLIERTLKAEQAEYEMEGIEWEPIKYFNNKIICDLVEE
390 400 410 420 430 440
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pF1KSD KFKGIISILDEECLRPGEATDLTFLEKLEDTVKHHPHFLTHKLADQRTRKSLGRGEFRLL
. :::::::::::.::: ::::.::::::. : .: :: :.::: . :: .: :::::
XP_016 RHKGIISILDEECIRPGPATDLSFLEKLEEKVGKHAHFETRKLAGPKGRKRIGWMEFRLL
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pF1KSD HYAGEVTYSVTGFLDKNNDLLFRNLKETMCSSKNPIMSQCFDRSELSDKKRPETVATQFK
:::::::: . :::.::::::.:.:::..:.::: :. .:: .:: ...:: ::.::::
XP_016 HYAGEVTYCTKGFLEKNNDLLYRHLKEVLCKSKNIILRECFLLAELENRRRPPTVGTQFK
510 520 530 540 550 560
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pF1KSD MSLLQLVEILQSKEPAYVRCIKPNDAKQPGRFDEVLIRHQVKYLGLLENLRVRRAGFAYR
:: .:.: : ::::.:.::::::: :.:..::. :::::.:::::.:.:::::::::::
XP_016 NSLSSLLETLISKEPSYIRCIKPNDRKEPSKFDDFLIRHQIKYLGLMEHLRVRRAGFAYR
570 580 590 600 610 620
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pF1KSD RKYEAFLQRYKSLCPETWPTWAGRPQDGVAVLVRHLGYKPEEYKMGRTKIFIRFPKTLFA
:::: ::::::::::.::: : : : .:: :....::::::::.:.::::::::.::::
XP_016 RKYEHFLQRYKSLCPDTWPHWHGPPAEGVERLIKYIGYKPEEYKLGKTKIFIRFPRTLFA
630 640 650 660 670 680
730 740 750 760 770 780
pF1KSD TEDALEVRRQSLATKIQAAWRGFHWRQKFLRVKRSAICIQSWWRGTLGRRKAAKRKWAAQ
::::.: ...:...:::... :..... ...:: ... :::.:.:. .::::..
XP_016 TEDAFEFSKHQLVARIQATYKRCLGRREYVKKRQAAIKLEAHWRGALARKAIQRRKWAVR
690 700 710 720 730 740
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pF1KSD TIRRLIRGFILRHAPRCPENAFFLDHVRTSFLLNLRRQLPRNVLDTSWPTPPPALREASE
::..:.::: :. : ::.: :. :: ...:::: .::..::: :: :: :..::.
XP_016 IIRKFIKGFISRNKPLCPDNEEFIVFVRKNYILNLRYHLPKTVLDKSWLRPPGILENASD
750 760 770 780 790 800
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pF1KSD LLRELCIKNMVWKYCRSISPEWKQQLQQKAVASEIFKGKKDNYPQSVPRLFISTRLGTDE
:::..:..:.: ::::.:. : : ..:::.:.::::.:.::.: .:. . :...:. .
XP_016 LLRKMCVRNLVQKYCRGITAERKAMMQQKVVTSEIFRGRKDGYTESLNQPFVNSRIDEGD
810 820 830 840 850 860
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pF1KSD ISPRVLQALGSEPIQYAVPVVKYDRKGYKPRSRQLLLTPNAVVIVEDAKVKQRIDYANLT
:.:.::: .. : :::.:::.::::::.: :.:::.:: .:. .:: ::.::.:.:. :
XP_016 INPKVLQLISHEKIQYGVPVIKYDRKGFKARQRQLILTQKAAYVVELAKIKQKIEYSALK
870 880 890 900 910 920
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pF1KSD GISVSSLSDSLFVLHVQRADNKQKGDVVLQSDHVIETLTKTALSANRVNSININQGSITF
:.:.:.:::...:.::. :.:::::.::: ::.:..:: .. ... : .:. :::. :
XP_016 GVSTSNLSDGILVIHVSPEDSKQKGDAVLQCGHVFEAVTKLVMLVKKENIVNVVQGSLQF
930 940 950 960 970 980
1030 1040 1050 1060
pF1KSD AGGPGRDGTIDFTPGSELLITKAKNGHLAVVAPRLNSR
.::..::: : : : . : :::.:.::. ::
XP_016 FISPGKEGTIVFDTGLEEQVYKNKNGQLTVVSGRLWEGSKPF
990 1000 1010 1020
>>NP_001094891 (OMIM: 614636) unconventional myosin-Ih [ (1022 aa)
initn: 4361 init1: 2691 opt: 4295 Z-score: 4855.0 bits: 910.0 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4295; 60.9% identity (84.6% similar) in 1027 aa overlap (36-1062:1-1022)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD ELVPTGEIIRVVHPHRPCKLALGSDGVRVTMESALTARDRVGVQDFVLLENFTSEAAFIE
::.::::::.:::::::::. .:::.::..
NP_001 MEGALTARDKVGVQDFVLLDAYTSESAFVD
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KSD NLRRRFRENLIYTYIGPVLVSVNPYRDLQIYSRQHMERYRGVSFYEVPPHLFAVADTVYR
:::.:: ::::::::: .:::::::..: ::. ..:: :.::.:.:.:::..:.::..::
NP_001 NLRKRFSENLIYTYIGTLLVSVNPYQELGIYTVSQMELYQGVNFFELPPHVYAIADNAYR
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KSD ALRTERRDQAVMISGESGAGKTEATKRLLQFYAETCPAPERGGAVRDRLLQSNPVLEAFG
. .: .. ..::::::::::::.:..:...: ::: . .::::: :::::::::
NP_001 MMCAELNNHFILISGESGAGKTEASKKILEYFAVTCPMTQSLQIARDRLLFSNPVLEAFG
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KSD NAKTLRNDNSSRFGKYMDVQFDFKGAPVGGHILSYLLEKSRVVHQNHGERNFHIFYQLLE
::.:::::::::::::::.::::.: ::::::.:::.::::::.::.::::::::::::
NP_001 NARTLRNDNSSRFGKYMDIQFDFQGIPVGGHIISYLIEKSRVVYQNEGERNFHIFYQLLA
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KSD GGEEETLRRLGLERNPQSYLYLVKGQCAKVSSINDKSDWKVVRKALTVIDFTEDEVEDLL
::::: : :::::.:: : :: .:.::: :::.::.:::.: .:..:::::: ..:.:.
NP_001 GGEEERLSYLGLERDPQLYKYLSQGHCAKESSISDKNDWKTVSNAFSVIDFTEADLENLF
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pF1KSD SIVASVLHLGNIHFAANEESNAQVTTENQLKYLTRLLSVEGSTLREALTHRKIIAKGEEL
.:.::::::::: : .... : . ...:....::.:. :.: :::::::: :: ::.
NP_001 GIIASVLHLGNIGFEEDDQGCATIPDTHEIKWIAKLLGVHPSVLLEALTHRKIEAKTEEV
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pF1KSD LSPLNLEQAAYARDALAKAVYSRTFTWLVGKINRSLASKDVESPSWRSTTVLGLLDIYGF
. ::.:: ..:::::.:::::.:::::::.::: ::..:: . ::.::::::::
NP_001 ICPLTLELSVYARDAMAKAVYGRTFTWLVNKINSSLVNKD-----FTRKTVIGLLDIYGF
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pF1KSD EVFQHNSFEQFCINYCNEKLQQLFIELTLKSEQEEYEAEGIAWEPVQYFNNKIICDLVEE
:::..:.::::::::::::::::.:: :::.:: ::: ::: :::..:::::::::::::
NP_001 EVFDKNGFEQFCINYCNEKLQQLLIERTLKAEQAEYEMEGIEWEPIKYFNNKIICDLVEE
390 400 410 420 430 440
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pF1KSD KFKGIISILDEECLRPGEATDLTFLEKLEDTVKHHPHFLTHKLADQRTRKSLGRGEFRLL
. :::::::::::.::: ::::.::::::. : .: :: :.::: . :: .: :::::
NP_001 RHKGIISILDEECIRPGPATDLSFLEKLEEKVGKHAHFETRKLAGPKGRKRIGWMEFRLL
450 460 470 480 490 500
550 560 570 580 590 600
pF1KSD HYAGEVTYSVTGFLDKNNDLLFRNLKETMCSSKNPIMSQCFDRSELSDKKRPETVATQFK
:::::::: . :::.::::::.:.:::..:.::: :. .:: .:: ...:: ::.::::
NP_001 HYAGEVTYCTKGFLEKNNDLLYRHLKEVLCKSKNIILRECFLLAELENRRRPPTVGTQFK
510 520 530 540 550 560
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pF1KSD MSLLQLVEILQSKEPAYVRCIKPNDAKQPGRFDEVLIRHQVKYLGLLENLRVRRAGFAYR
:: .:.: : ::::.:.::::::: :.:..::. :::::.:::::.:.:::::::::::
NP_001 NSLSSLLETLISKEPSYIRCIKPNDRKEPSKFDDFLIRHQIKYLGLMEHLRVRRAGFAYR
570 580 590 600 610 620
670 680 690 700 710 720
pF1KSD RKYEAFLQRYKSLCPETWPTWAGRPQDGVAVLVRHLGYKPEEYKMGRTKIFIRFPKTLFA
:::: ::::::::::.::: : : : .:: :....::::::::.:.::::::::.::::
NP_001 RKYEHFLQRYKSLCPDTWPHWHGPPAEGVERLIKYIGYKPEEYKLGKTKIFIRFPRTLFA
630 640 650 660 670 680
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pF1KSD TEDALEVRRQSLATKIQAAWRGFHWRQKFLRVKRSAICIQSWWRGTLGRRKAAKRKWAAQ
::::.: ...:...:::... :..... ...:: ... :::.:.:. .::::..
NP_001 TEDAFEFSKHQLVARIQATYKRCLGRREYVKKRQAAIKLEAHWRGALARKAIQRRKWAVR
690 700 710 720 730 740
790 800 810 820 830 840
pF1KSD TIRRLIRGFILRHAPRCPENAFFLDHVRTSFLLNLRRQLPRNVLDTSWPTPPPALREASE
::..:.::: :. : ::.: :. :: ...:::: .::..::: :: :: :..::.
NP_001 IIRKFIKGFISRNKPLCPDNEEFIVFVRKNYILNLRYHLPKTVLDKSWLRPPGILENASD
750 760 770 780 790 800
850 860 870 880 890 900
pF1KSD LLRELCIKNMVWKYCRSISPEWKQQLQQKAVASEIFKGKKDNYPQSVPRLFISTRLGTDE
:::..:..:.: ::::.:. : : ..:::.:.::::.:.::.: .:. . :...:. .
NP_001 LLRKMCVRNLVQKYCRGITAERKAMMQQKVVTSEIFRGRKDGYTESLNQPFVNSRIDEGD
810 820 830 840 850 860
910 920 930 940 950 960
pF1KSD ISPRVLQALGSEPIQYAVPVVKYDRKGYKPRSRQLLLTPNAVVIVEDAKVKQRIDYANLT
:.:.::: .. : :::.:::.::::::.: :.:::.:: .:. .:: ::.::.:.:. :
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pF1KSD LPRNVLDTSWPTPPPALREASELLRELCIKNMVWKYCRSISPEWKQQLQQKAVASEIFKG
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pF1KSD KKDNYPQSVPRLFISTRLGTDEISPRVLQALGSEPIQYAVPVVKYDRKGYKPRSRQLLLT
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XP_011 RKDGYTESLNQPFVNSRIDEGDINPKVLQLISHEKIQYGVPVIKYDRKGFKARQRQLILT
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pF1KSD TKTALSANRVNSININQGSITFAGGPGRDGTIDFTPGSELLITKAKNGHLAVVAPRLNSR
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. : .: .:. :::. ::: : :: : :
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NP_036 -CKKYRDQFTDQQKLIYEEKLEASELFKDKKALYPSSVGQPFQGAYLEINK-NPKYKKLK
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1010 1020 1030 1040 1050
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]