FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDB0033, 1063 aa
1>>>pF1KSDB0033 1063 - 1063 aa - 1063 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9620+/-0.00112; mu= 18.0253+/- 0.067
mean_var=74.1789+/-14.967, 0's: 0 Z-trim(102.9): 76 B-trim: 59 in 1/48
Lambda= 0.148914
statistics sampled from 7070 (7146) to 7070 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.58), E-opt: 0.2 (0.22), width: 16
Scan time: 3.230
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS42226.1 MYO1C gene_id:4641|Hs108|chr17 (1063) 6999 1514.0 0
CCDS45562.1 MYO1C gene_id:4641|Hs108|chr17 (1044) 6827 1477.0 0
CCDS11003.1 MYO1C gene_id:4641|Hs108|chr17 (1028) 6766 1463.9 0
CCDS53826.1 MYO1H gene_id:283446|Hs108|chr12 (1022) 4295 933.0 0
CCDS2311.1 MYO1B gene_id:4430|Hs108|chr2 (1078) 2478 542.7 1.6e-153
CCDS82546.1 MYO1B gene_id:4430|Hs108|chr2 (1107) 2478 542.7 1.6e-153
CCDS46477.1 MYO1B gene_id:4430|Hs108|chr2 (1136) 2478 542.7 1.7e-153
CCDS8929.1 MYO1A gene_id:4640|Hs108|chr12 (1043) 2300 504.5 5e-142
CCDS76991.1 MYO1D gene_id:4642|Hs108|chr17 ( 961) 2264 496.7 1e-139
CCDS32615.1 MYO1D gene_id:4642|Hs108|chr17 (1006) 2264 496.7 1e-139
CCDS53685.1 MYO7A gene_id:4647|Hs108|chr11 (1178) 1584 350.6 1.1e-95
CCDS53684.1 MYO7A gene_id:4647|Hs108|chr11 (2175) 1584 350.7 2e-95
CCDS53683.1 MYO7A gene_id:4647|Hs108|chr11 (2215) 1584 350.7 2e-95
CCDS42036.1 MYO5C gene_id:55930|Hs108|chr15 (1742) 1563 346.2 3.7e-94
CCDS42494.1 MYO1F gene_id:4542|Hs108|chr19 (1098) 1445 320.8 1e-86
CCDS9601.1 MYH7 gene_id:4625|Hs108|chr14 (1935) 1446 321.1 1.5e-86
CCDS32254.1 MYO1E gene_id:4643|Hs108|chr15 (1108) 1442 320.1 1.6e-86
CCDS42271.1 MYO15A gene_id:51168|Hs108|chr17 (3530) 1429 317.5 3.2e-85
CCDS76992.1 MYO1D gene_id:4642|Hs108|chr17 ( 436) 1399 310.7 4.3e-84
CCDS11157.1 MYH3 gene_id:4621|Hs108|chr17 (1940) 1381 307.1 2.4e-82
CCDS34629.1 MYO1G gene_id:64005|Hs108|chr7 (1018) 1350 300.4 1.4e-80
CCDS11153.1 MYH8 gene_id:4626|Hs108|chr17 (1937) 1346 299.6 4.4e-80
CCDS43127.1 MYH15 gene_id:22989|Hs108|chr3 (1946) 1338 297.9 1.4e-79
CCDS10566.1 MYH11 gene_id:4629|Hs108|chr16 (1938) 1245 277.9 1.5e-73
CCDS10565.1 MYH11 gene_id:4629|Hs108|chr16 (1972) 1245 277.9 1.5e-73
CCDS59411.1 MYH14 gene_id:79784|Hs108|chr19 (1995) 1239 276.6 3.7e-73
CCDS13927.1 MYH9 gene_id:4627|Hs108|chr22 (1960) 1237 276.2 4.9e-73
CCDS54112.1 MYO19 gene_id:80179|Hs108|chr17 ( 970) 1218 272.0 4.5e-72
CCDS42436.1 MYO5B gene_id:4645|Hs108|chr18 (1848) 1191 266.3 4.4e-70
CCDS11144.1 MYH10 gene_id:4628|Hs108|chr17 (1976) 1177 263.3 3.8e-69
CCDS7148.1 MYO3A gene_id:53904|Hs108|chr10 (1616) 1164 260.5 2.2e-68
CCDS45262.1 MYO5A gene_id:4644|Hs108|chr15 (1828) 1157 259.0 6.9e-68
CCDS42037.1 MYO5A gene_id:4644|Hs108|chr15 (1855) 1157 259.0 7e-68
CCDS46446.1 MYO3B gene_id:140469|Hs108|chr2 (1314) 1151 257.6 1.3e-67
CCDS42773.1 MYO3B gene_id:140469|Hs108|chr2 (1341) 1151 257.6 1.3e-67
CCDS9600.1 MYH6 gene_id:4624|Hs108|chr14 (1939) 1115 250.0 3.8e-65
CCDS42869.1 MYH7B gene_id:57644|Hs108|chr20 (1983) 1112 249.3 6e-65
CCDS46010.1 MYO9B gene_id:4650|Hs108|chr19 (2022) 1106 248.0 1.5e-64
CCDS11156.1 MYH2 gene_id:4620|Hs108|chr17 (1941) 1067 239.7 4.8e-62
CCDS11154.1 MYH4 gene_id:4622|Hs108|chr17 (1939) 1057 237.5 2.1e-61
CCDS11155.1 MYH1 gene_id:4619|Hs108|chr17 (1939) 1046 235.1 1.1e-60
CCDS45613.1 MYH13 gene_id:8735|Hs108|chr17 (1938) 1039 233.6 3.1e-60
CCDS54834.1 MYO10 gene_id:4651|Hs108|chr5 (2058) 991 223.3 4.2e-57
CCDS75481.1 MYO6 gene_id:4646|Hs108|chr6 (1262) 875 198.3 8.6e-50
CCDS34487.1 MYO6 gene_id:4646|Hs108|chr6 (1285) 875 198.3 8.7e-50
CCDS73984.1 MYH10 gene_id:4628|Hs108|chr17 (1985) 871 197.6 2.3e-49
CCDS58515.1 MYH10 gene_id:4628|Hs108|chr17 (2007) 871 197.6 2.4e-49
CCDS45654.1 MYO19 gene_id:80179|Hs108|chr17 ( 770) 732 167.5 9.8e-41
CCDS10239.1 MYO9A gene_id:4649|Hs108|chr15 (2548) 611 141.7 1.9e-32
CCDS45424.1 MYH11 gene_id:4629|Hs108|chr16 (1945) 554 129.4 7.3e-29
>>CCDS42226.1 MYO1C gene_id:4641|Hs108|chr17 (1063 aa)
initn: 6999 init1: 6999 opt: 6999 Z-score: 8119.0 bits: 1514.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6999; 99.8% identity (100.0% similar) in 1063 aa overlap (1-1063:1-1063)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MALQVELVPTGEIIRVVHPHRPCKLALGSDGVRVTMESALTARDRVGVQDFVLLENFTSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MALQVELVPTGEIIRVVHPHRPCKLALGSDGVRVTMESALTARDRVGVQDFVLLENFTSE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD AAFIENLRRRFRENLIYTYIGPVLVSVNPYRDLQIYSRQHMERYRGVSFYEVPPHLFAVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 AAFIENLRRRFRENLIYTYIGPVLVSVNPYRDLQIYSRQHMERYRGVSFYEVPPHLFAVA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD DTVYRALRTERRDQAVMISGESGAGKTEATKRLLQFYAETCPAPERGGAVRDRLLQSNPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 DTVYRALRTERRDQAVMISGESGAGKTEATKRLLQFYAETCPAPERGGAVRDRLLQSNPV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD LEAFGNAKTLRNDNSSRFGKYMDVQFDFKGAPVGGHILSYLLEKSRVVHQNHGERNFHIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LEAFGNAKTLRNDNSSRFGKYMDVQFDFKGAPVGGHILSYLLEKSRVVHQNHGERNFHIF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 YQLLEGGEEETLRRLGLERNPQSYLYLVKGQCAKVSSINDKSDWKVVRKALTVIDFTEDE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 VEDLLSIVASVLHLGNIHFAANEESNAQVTTENQLKYLTRLLSVEGSTLREALTHRKIIA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD KGEELLSPLNLEQAAYARDALAKAVYSRTFTWLVGKINRSLASKDVESPSWRSTTVLGLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KGEELLSPLNLEQAAYARDALAKAVYSRTFTWLVGKINRSLASKDVESPSWRSTTVLGLL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD DIYGFEVFQHNSFEQFCINYCNEKLQQLFIELTLKSEQEEYEAEGIAWEPVQYFNNKIIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 DIYGFEVFQHNSFEQFCINYCNEKLQQLFIELTLKSEQEEYEAEGIAWEPVQYFNNKIIC
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490 500 510 520 530 540
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 DLVEEKFKGIISILDEECLRPGEATDLTFLEKLEDTVKHHPHFLTHKLADQRTRKSLGRG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD EFRLLHYAGEVTYSVTGFLDKNNDLLFRNLKETMCSSKNPIMSQCFDRSELSDKKRPETV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EFRLLHYAGEVTYSVTGFLDKNNDLLFRNLKETMCSSKNPIMSQCFDRSELSDKKRPETV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD ATQFKMSLLQLVEILQSKEPAYVRCIKPNDAKQPGRFDEVLIRHQVKYLGLLENLRVRRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ATQFKMSLLQLVEILQSKEPAYVRCIKPNDAKQPGRFDEVLIRHQVKYLGLLENLRVRRA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GFAYRRKYEAFLQRYKSLCPETWPTWAGRPQDGVAVLVRHLGYKPEEYKMGRTKIFIRFP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD KTLFATEDALEVRRQSLATKIQAAWRGFHWRQKFLRVKRSAICIQSWWRGTLGRRKAAKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KTLFATEDALEVRRQSLATKIQAAWRGFHWRQKFLRVKRSAICIQSWWRGTLGRRKAAKR
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD KWAAQTIRRLIRGFILRHAPRCPENAFFLDHVRTSFLLNLRRQLPRNVLDTSWPTPPPAL
::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::
CCDS42 KWAAQTIRRLIRGFVLRHAPRCPENAFFLDHVRTSFLLNLRRQLPQNVLDTSWPTPPPAL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD REASELLRELCIKNMVWKYCRSISPEWKQQLQQKAVASEIFKGKKDNYPQSVPRLFISTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 REASELLRELCIKNMVWKYCRSISPEWKQQLQQKAVASEIFKGKKDNYPQSVPRLFISTR
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD LGTDEISPRVLQALGSEPIQYAVPVVKYDRKGYKPRSRQLLLTPNAVVIVEDAKVKQRID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LGTDEISPRVLQALGSEPIQYAVPVVKYDRKGYKPRSRQLLLTPNAVVIVEDAKVKQRID
910 920 930 940 950 960
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pF1KSD YANLTGISVSSLSDSLFVLHVQRADNKQKGDVVLQSDHVIETLTKTALSANRVNSININQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 YANLTGISVSSLSDSLFVLHVQRADNKQKGDVVLQSDHVIETLTKTALSANRVNSININQ
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060
pF1KSD GSITFAGGPGRDGTIDFTPGSELLITKAKNGHLAVVAPRLNSR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GSITFAGGPGRDGTIDFTPGSELLITKAKNGHLAVVAPRLNSR
1030 1040 1050 1060
>>CCDS45562.1 MYO1C gene_id:4641|Hs108|chr17 (1044 aa)
initn: 6827 init1: 6827 opt: 6827 Z-score: 7919.4 bits: 1477.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6827; 99.8% identity (100.0% similar) in 1038 aa overlap (26-1063:7-1044)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MALQVELVPTGEIIRVVHPHRPCKLALGSDGVRVTMESALTARDRVGVQDFVLLENFTSE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MRYRASALGSDGVRVTMESALTARDRVGVQDFVLLENFTSE
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 AAFIENLRRRFRENLIYTYIGPVLVSVNPYRDLQIYSRQHMERYRGVSFYEVPPHLFAVA
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KSD DTVYRALRTERRDQAVMISGESGAGKTEATKRLLQFYAETCPAPERGGAVRDRLLQSNPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DTVYRALRTERRDQAVMISGESGAGKTEATKRLLQFYAETCPAPERGGAVRDRLLQSNPV
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KSD LEAFGNAKTLRNDNSSRFGKYMDVQFDFKGAPVGGHILSYLLEKSRVVHQNHGERNFHIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LEAFGNAKTLRNDNSSRFGKYMDVQFDFKGAPVGGHILSYLLEKSRVVHQNHGERNFHIF
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KSD YQLLEGGEEETLRRLGLERNPQSYLYLVKGQCAKVSSINDKSDWKVVRKALTVIDFTEDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 YQLLEGGEEETLRRLGLERNPQSYLYLVKGQCAKVSSINDKSDWKVVRKALTVIDFTEDE
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KSD VEDLLSIVASVLHLGNIHFAANEESNAQVTTENQLKYLTRLLSVEGSTLREALTHRKIIA
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CCDS45 VEDLLSIVASVLHLGNIHFAANEESNAQVTTENQLKYLTRLLSVEGSTLREALTHRKIIA
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pF1KSD KGEELLSPLNLEQAAYARDALAKAVYSRTFTWLVGKINRSLASKDVESPSWRSTTVLGLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KGEELLSPLNLEQAAYARDALAKAVYSRTFTWLVGKINRSLASKDVESPSWRSTTVLGLL
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pF1KSD DIYGFEVFQHNSFEQFCINYCNEKLQQLFIELTLKSEQEEYEAEGIAWEPVQYFNNKIIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DIYGFEVFQHNSFEQFCINYCNEKLQQLFIELTLKSEQEEYEAEGIAWEPVQYFNNKIIC
410 420 430 440 450 460
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pF1KSD DLVEEKFKGIISILDEECLRPGEATDLTFLEKLEDTVKHHPHFLTHKLADQRTRKSLGRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DLVEEKFKGIISILDEECLRPGEATDLTFLEKLEDTVKHHPHFLTHKLADQRTRKSLGRG
470 480 490 500 510 520
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pF1KSD EFRLLHYAGEVTYSVTGFLDKNNDLLFRNLKETMCSSKNPIMSQCFDRSELSDKKRPETV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EFRLLHYAGEVTYSVTGFLDKNNDLLFRNLKETMCSSKNPIMSQCFDRSELSDKKRPETV
530 540 550 560 570 580
610 620 630 640 650 660
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ATQFKMSLLQLVEILQSKEPAYVRCIKPNDAKQPGRFDEVLIRHQVKYLGLLENLRVRRA
590 600 610 620 630 640
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pF1KSD GFAYRRKYEAFLQRYKSLCPETWPTWAGRPQDGVAVLVRHLGYKPEEYKMGRTKIFIRFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GFAYRRKYEAFLQRYKSLCPETWPTWAGRPQDGVAVLVRHLGYKPEEYKMGRTKIFIRFP
650 660 670 680 690 700
730 740 750 760 770 780
pF1KSD KTLFATEDALEVRRQSLATKIQAAWRGFHWRQKFLRVKRSAICIQSWWRGTLGRRKAAKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KTLFATEDALEVRRQSLATKIQAAWRGFHWRQKFLRVKRSAICIQSWWRGTLGRRKAAKR
710 720 730 740 750 760
790 800 810 820 830 840
pF1KSD KWAAQTIRRLIRGFILRHAPRCPENAFFLDHVRTSFLLNLRRQLPRNVLDTSWPTPPPAL
::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::
CCDS45 KWAAQTIRRLIRGFVLRHAPRCPENAFFLDHVRTSFLLNLRRQLPQNVLDTSWPTPPPAL
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850 860 870 880 890 900
pF1KSD REASELLRELCIKNMVWKYCRSISPEWKQQLQQKAVASEIFKGKKDNYPQSVPRLFISTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 REASELLRELCIKNMVWKYCRSISPEWKQQLQQKAVASEIFKGKKDNYPQSVPRLFISTR
830 840 850 860 870 880
910 920 930 940 950 960
pF1KSD LGTDEISPRVLQALGSEPIQYAVPVVKYDRKGYKPRSRQLLLTPNAVVIVEDAKVKQRID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LGTDEISPRVLQALGSEPIQYAVPVVKYDRKGYKPRSRQLLLTPNAVVIVEDAKVKQRID
890 900 910 920 930 940
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD YANLTGISVSSLSDSLFVLHVQRADNKQKGDVVLQSDHVIETLTKTALSANRVNSININQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 YANLTGISVSSLSDSLFVLHVQRADNKQKGDVVLQSDHVIETLTKTALSANRVNSININQ
950 960 970 980 990 1000
1030 1040 1050 1060
pF1KSD GSITFAGGPGRDGTIDFTPGSELLITKAKNGHLAVVAPRLNSR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GSITFAGGPGRDGTIDFTPGSELLITKAKNGHLAVVAPRLNSR
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10 20 30 40 50 60
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CCDS11 MESALTARDRVGVQDFVLLENFTSEAAFIE
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CCDS11 NLRRRFRENLIYTYIGPVLVSVNPYRDLQIYSRQHMERYRGVSFYEVPPHLFAVADTVYR
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CCDS11 ALRTERRDQAVMISGESGAGKTEATKRLLQFYAETCPAPERGGAVRDRLLQSNPVLEAFG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NAKTLRNDNSSRFGKYMDVQFDFKGAPVGGHILSYLLEKSRVVHQNHGERNFHIFYQLLE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GGEEETLRRLGLERNPQSYLYLVKGQCAKVSSINDKSDWKVVRKALTVIDFTEDEVEDLL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SIVASVLHLGNIHFAANEESNAQVTTENQLKYLTRLLSVEGSTLREALTHRKIIAKGEEL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LSPLNLEQAAYARDALAKAVYSRTFTWLVGKINRSLASKDVESPSWRSTTVLGLLDIYGF
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CCDS11 EVFQHNSFEQFCINYCNEKLQQLFIELTLKSEQEEYEAEGIAWEPVQYFNNKIICDLVEE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KFKGIISILDEECLRPGEATDLTFLEKLEDTVKHHPHFLTHKLADQRTRKSLGRGEFRLL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 HYAGEVTYSVTGFLDKNNDLLFRNLKETMCSSKNPIMSQCFDRSELSDKKRPETVATQFK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MSLLQLVEILQSKEPAYVRCIKPNDAKQPGRFDEVLIRHQVKYLGLLENLRVRRAGFAYR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RKYEAFLQRYKSLCPETWPTWAGRPQDGVAVLVRHLGYKPEEYKMGRTKIFIRFPKTLFA
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pF1KSD TEDALEVRRQSLATKIQAAWRGFHWRQKFLRVKRSAICIQSWWRGTLGRRKAAKRKWAAQ
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CCDS11 TEDALEVRRQSLATKIQAAWRGFHWRQKFLRVKRSAICIQSWWRGTLGRRKAAKRKWAAQ
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CCDS11 TIRRLIRGFVLRHAPRCPENAFFLDHVRTSFLLNLRRQLPQNVLDTSWPTPPPALREASE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LLRELCIKNMVWKYCRSISPEWKQQLQQKAVASEIFKGKKDNYPQSVPRLFISTRLGTDE
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pF1KSD ISPRVLQALGSEPIQYAVPVVKYDRKGYKPRSRQLLLTPNAVVIVEDAKVKQRIDYANLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ISPRVLQALGSEPIQYAVPVVKYDRKGYKPRSRQLLLTPNAVVIVEDAKVKQRIDYANLT
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970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD GISVSSLSDSLFVLHVQRADNKQKGDVVLQSDHVIETLTKTALSANRVNSININQGSITF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GISVSSLSDSLFVLHVQRADNKQKGDVVLQSDHVIETLTKTALSANRVNSININQGSITF
940 950 960 970 980 990
1030 1040 1050 1060
pF1KSD AGGPGRDGTIDFTPGSELLITKAKNGHLAVVAPRLNSR
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CCDS11 AGGPGRDGTIDFTPGSELLITKAKNGHLAVVAPRLNSR
1000 1010 1020
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10 20 30 40 50 60
pF1KSD ELVPTGEIIRVVHPHRPCKLALGSDGVRVTMESALTARDRVGVQDFVLLENFTSEAAFIE
::.::::::.:::::::::. .:::.::..
CCDS53 MEGALTARDKVGVQDFVLLDAYTSESAFVD
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KSD NLRRRFRENLIYTYIGPVLVSVNPYRDLQIYSRQHMERYRGVSFYEVPPHLFAVADTVYR
:::.:: ::::::::: .:::::::..: ::. ..:: :.::.:.:.:::..:.::..::
CCDS53 NLRKRFSENLIYTYIGTLLVSVNPYQELGIYTVSQMELYQGVNFFELPPHVYAIADNAYR
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KSD ALRTERRDQAVMISGESGAGKTEATKRLLQFYAETCPAPERGGAVRDRLLQSNPVLEAFG
. .: .. ..::::::::::::.:..:...: ::: . .::::: :::::::::
CCDS53 MMCAELNNHFILISGESGAGKTEASKKILEYFAVTCPMTQSLQIARDRLLFSNPVLEAFG
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
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::.:::::::::::::::.::::.: ::::::.:::.::::::.::.::::::::::::
CCDS53 NARTLRNDNSSRFGKYMDIQFDFQGIPVGGHIISYLIEKSRVVYQNEGERNFHIFYQLLA
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250 260 270 280 290 300
pF1KSD GGEEETLRRLGLERNPQSYLYLVKGQCAKVSSINDKSDWKVVRKALTVIDFTEDEVEDLL
::::: : :::::.:: : :: .:.::: :::.::.:::.: .:..:::::: ..:.:.
CCDS53 GGEEERLSYLGLERDPQLYKYLSQGHCAKESSISDKNDWKTVSNAFSVIDFTEADLENLF
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KSD SIVASVLHLGNIHFAANEESNAQVTTENQLKYLTRLLSVEGSTLREALTHRKIIAKGEEL
.:.::::::::: : .... : . ...:....::.:. :.: :::::::: :: ::.
CCDS53 GIIASVLHLGNIGFEEDDQGCATIPDTHEIKWIAKLLGVHPSVLLEALTHRKIEAKTEEV
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KSD LSPLNLEQAAYARDALAKAVYSRTFTWLVGKINRSLASKDVESPSWRSTTVLGLLDIYGF
. ::.:: ..:::::.:::::.:::::::.::: ::..:: . ::.::::::::
CCDS53 ICPLTLELSVYARDAMAKAVYGRTFTWLVNKINSSLVNKD-----FTRKTVIGLLDIYGF
340 350 360 370 380
430 440 450 460 470 480
pF1KSD EVFQHNSFEQFCINYCNEKLQQLFIELTLKSEQEEYEAEGIAWEPVQYFNNKIICDLVEE
:::..:.::::::::::::::::.:: :::.:: ::: ::: :::..:::::::::::::
CCDS53 EVFDKNGFEQFCINYCNEKLQQLLIERTLKAEQAEYEMEGIEWEPIKYFNNKIICDLVEE
390 400 410 420 430 440
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pF1KSD KFKGIISILDEECLRPGEATDLTFLEKLEDTVKHHPHFLTHKLADQRTRKSLGRGEFRLL
. :::::::::::.::: ::::.::::::. : .: :: :.::: . :: .: :::::
CCDS53 RHKGIISILDEECIRPGPATDLSFLEKLEEKVGKHAHFETRKLAGPKGRKRIGWMEFRLL
450 460 470 480 490 500
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pF1KSD HYAGEVTYSVTGFLDKNNDLLFRNLKETMCSSKNPIMSQCFDRSELSDKKRPETVATQFK
:::::::: . :::.::::::.:.:::..:.::: :. .:: .:: ...:: ::.::::
CCDS53 HYAGEVTYCTKGFLEKNNDLLYRHLKEVLCKSKNIILRECFLLAELENRRRPPTVGTQFK
510 520 530 540 550 560
610 620 630 640 650 660
pF1KSD MSLLQLVEILQSKEPAYVRCIKPNDAKQPGRFDEVLIRHQVKYLGLLENLRVRRAGFAYR
:: .:.: : ::::.:.::::::: :.:..::. :::::.:::::.:.:::::::::::
CCDS53 NSLSSLLETLISKEPSYIRCIKPNDRKEPSKFDDFLIRHQIKYLGLMEHLRVRRAGFAYR
570 580 590 600 610 620
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pF1KSD RKYEAFLQRYKSLCPETWPTWAGRPQDGVAVLVRHLGYKPEEYKMGRTKIFIRFPKTLFA
:::: ::::::::::.::: : : : .:: :....::::::::.:.::::::::.::::
CCDS53 RKYEHFLQRYKSLCPDTWPHWHGPPAEGVERLIKYIGYKPEEYKLGKTKIFIRFPRTLFA
630 640 650 660 670 680
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pF1KSD TEDALEVRRQSLATKIQAAWRGFHWRQKFLRVKRSAICIQSWWRGTLGRRKAAKRKWAAQ
::::.: ...:...:::... :..... ...:: ... :::.:.:. .::::..
CCDS53 TEDAFEFSKHQLVARIQATYKRCLGRREYVKKRQAAIKLEAHWRGALARKAIQRRKWAVR
690 700 710 720 730 740
790 800 810 820 830 840
pF1KSD TIRRLIRGFILRHAPRCPENAFFLDHVRTSFLLNLRRQLPRNVLDTSWPTPPPALREASE
::..:.::: :. : ::.: :. :: ...:::: .::..::: :: :: :..::.
CCDS53 IIRKFIKGFISRNKPLCPDNEEFIVFVRKNYILNLRYHLPKTVLDKSWLRPPGILENASD
750 760 770 780 790 800
850 860 870 880 890 900
pF1KSD LLRELCIKNMVWKYCRSISPEWKQQLQQKAVASEIFKGKKDNYPQSVPRLFISTRLGTDE
:::..:..:.: ::::.:. : : ..:::.:.::::.:.::.: .:. . :...:. .
CCDS53 LLRKMCVRNLVQKYCRGITAERKAMMQQKVVTSEIFRGRKDGYTESLNQPFVNSRIDEGD
810 820 830 840 850 860
910 920 930 940 950 960
pF1KSD ISPRVLQALGSEPIQYAVPVVKYDRKGYKPRSRQLLLTPNAVVIVEDAKVKQRIDYANLT
:.:.::: .. : :::.:::.::::::.: :.:::.:: .:. .:: ::.::.:.:. :
CCDS53 INPKVLQLISHEKIQYGVPVIKYDRKGFKARQRQLILTQKAAYVVELAKIKQKIEYSALK
870 880 890 900 910 920
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD GISVSSLSDSLFVLHVQRADNKQKGDVVLQSDHVIETLTKTALSANRVNSININQGSITF
:.:.:.:::...:.::. :.:::::.::: ::.:..:: .. ... : .:. :::. :
CCDS53 GVSTSNLSDGILVIHVSPEDSKQKGDAVLQCGHVFEAVTKLVMLVKKENIVNVVQGSLQF
930 940 950 960 970 980
1030 1040 1050 1060
pF1KSD AGGPGRDGTIDFTPGSELLITKAKNGHLAVVAPRLNSR
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CCDS53 FISPGKEGTIVFDTGLEEQVYKNKNGQLTVVSVRRKS
990 1000 1010 1020
>>CCDS2311.1 MYO1B gene_id:4430|Hs108|chr2 (1078 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KSD ELVPTGEIIRVVHPHRPCKLALGSDGVRVTMESALTARDR-VGVQDFVLLENFTSEAAFI
:: . : .:: :.:::: . .: .::
CCDS23 MAKMEVKTSLLDNMIGVGDMVLLEPL-NEETFI
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KSD ENLRRRFRENLIYTYIGPVLVSVNPYRDLQIYSRQHMERYRGVSFYEVPPHLFAVADTVY
.::..:: .. :::::: :..::::::.: ::: ...:.::. .:::. ::.::..: .:
CCDS23 NNLKKRFDHSEIYTYIGSVVISVNPYRSLPIYSPEKVEEYRNRNFYELSPHIFALSDEAY
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KSD RALRTERRDQAVMISGESGAGKTEATKRLLQFYAETCPAPERGGAVRDRLLQSNPVLEAF
:.:: . .:: ..:.::::::::::.: .... : .: . . :...:::::::::::
CCDS23 RSLRDQDKDQCILITGESGAGKTEASKLVMSYVAAVCGKGAEVNQVKEQLLQSNPVLEAF
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KSD GNAKTLRNDNSSRFGKYMDVQFDFKGAPVGGHILSYLLEKSRVVHQNHGERNFHIFYQLL
:::::.:::::::::::::..::::: :.:: : .:::::::::.: .::::::.:::::
CCDS23 GNAKTVRNDNSSRFGKYMDIEFDFKGDPLGGVISNYLLEKSRVVKQPRGERNFHVFYQLL
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KSD EGGEEETLRRLGLERNPQSYLYLVKGQCAKVSSINDKSDWKVVRKALTVIDFTEDEVEDL
:. :: : .: :::. . : :: . . :::....: .....::.:. .. : . :.:..
CCDS23 SGASEELLNKLKLERDFSRYNYL-SLDSAKVNGVDDAANFRTVRNAMQIVGFMDHEAESV
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KSD LSIVASVLHLGNIHFAANEESN----AQVTTENQLKYLTRLLSVEGSTLREALTHRKIIA
:..::.::.::::.: . . : ... .:.:: . .: ... :.:..:.. : . :
CCDS23 LAVVAAVLKLGNIEFKPESRVNGLDESKIKDKNELKEICELTGIDQSVLERAFSFRTVEA
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KSD KGEELLSPLNLEQAAYARDALAKAVYSRTFTWLVGKINRSLASKDVESPSWRSTTVLGLL
: :.. . ::. :: :::::::: .::: :.:::..::.: ... . :.:.:
CCDS23 KQEKVSTTLNVAQAYYARDALAKNLYSRLFSWLVNRINES-----IKAQTKVRKKVMGVL
340 350 360 370 380
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pF1KSD DIYGFEVFQHNSFEQFCINYCNEKLQQLFIELTLKSEQEEYEAEGIAWEPVQYFNNKIIC
::::::.:. :::::: ::::::::::.::::::: ::::: : : : ..:::: :::
CCDS23 DIYGFEIFEDNSFEQFIINYCNEKLQQIFIELTLKEEQEEYIREDIEWTHIDYFNNAIIC
390 400 410 420 430 440
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pF1KSD DLVEEKFKGIISILDEECLRPGEATDLTFLEKLEDTVKHHPHFLTHKLADQR--TRKSLG
::.:.. .::...::::::::: .:: ::::::... : :: .. .: . ::
CCDS23 DLIENNTNGILAMLDEECLRPGTVTDETFLEKLNQVCATHQHFESRMSKCSRFLNDTSLP
450 460 470 480 490 500
540 550 560 570 580 590
pF1KSD RGEFRLLHYAGEVTYSVTGFLDKNNDLLFRNLKETMCSSKNPIMSQCFDRSELS--DKKR
.. ::. ::::.: :.: ::.:::::::.:.:...: .... .... : ... . . ::
CCDS23 HSCFRIQHYAGKVLYQVEGFVDKNNDLLYRDLSQAMWKASHALIKSLFPEGNPAKINLKR
510 520 530 540 550 560
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pF1KSD PETVATQFKMSLLQLVEILQSKEPAYVRCIKPNDAKQPGRFDEVLIRHQVKYLGLLENLR
: :...::: :. :.. ::.:.: :.::::::: : :.:.:. ::..:::::::.:
CCDS23 PPTAGSQFKASVATLMKNLQTKNPNYIRCIKPNDKKAAHIFNEALVCHQIRYLGLLENVR
570 580 590 600 610 620
660 670 680 690 700 710
pF1KSD VRRAGFAYRRKYEAFLQRYKSLCPETWPTWAGRPQDGVAVLVRHLGYKPEEYKMGRTKIF
:::::.:.:. :: :.::: :: .::: : : ..:: :: .: :::..::.:::
CCDS23 VRRAGYAFRQAYEPCLERYKMLCKQTWPHWKGPARSGVEVLFNELEIPVEEYSFGRSKIF
630 640 650 660 670 680
720 730 740 750 760 770
pF1KSD IRFPKTLFATEDALEVRRQSLATKIQAAWRGFHWRQKFLRVKRSAICIQSWWRGTLGRRK
:: :.::: :: . : ..::: :: .::.. : .:: .:.: : : .:.: ...
CCDS23 IRNPRTLFKLEDLRKQRLEDLATLIQKIYRGWKCRTHFLLMKKSQIVIAAWYRRYAQQKR
690 700 710 720 730 740
780 790 800
pF1KSD AAKRKWAAQTIRRLIRGF----ILR---HAPRCPE------------------------N
. : .: .:. :::. ::: : :: : :
CCDS23 YQQTKSSALVIQSYIRGWKARKILRELKHQKRCKEAVTTIAAYWHGTQVRREYRKFFRAN
750 760 770 780 790 800
810 820 830 840 850
pF1KSD A------FFLDHVRTSFLLNLRRQLPR-NVLDTSWPTPPPALREASELLRELCIKNMVWK
: : :... ...:... ..: . .: .::. : . .... .:: .:.
CCDS23 AGKKIYEFTLQRIVQKYFLEMKNKMPSLSPIDKNWPSRPYLFLDSTH--KELKRIFHLWR
810 820 830 840 850 860
860 870 880 890 900 910
pF1KSD YCRSISPEW--KQQL--QQKAVASEIFKGKKDNYPQSVPRLFISTRLGTDEISPRV--LQ
:.. .. .:.: ..: :::.:: :: ::.:: . : .. : .. .:. :.
CCDS23 -CKKYRDQFTDQQKLIYEEKLEASELFKDKKALYPSSVGQPFQGAYLEINK-NPKYKKLK
870 880 890 900 910 920
920 930 940 950 960 970
pF1KSD ALGSEPIQYAVPVVKYDRKGYKPRSRQLLLTPNAVVIVED--AKVKQRIDYANLTGISVS
: : : : : .: . : :: .::: : ...... ...:... ...: .:.:
CCDS23 DAIEEKIIIAEVVNKINRANGKSTSRIFLLTNNNLLLADQKSGQIKSEVPLVDVTKVSMS
930 940 950 960 970 980
980 990 1000 1010 1020
pF1KSD SLSDSLFVLHVQR-ADNKQKGDVVLQSDHVIETLTK---TALSANRVNSININQGSITFA
: .:..:..:... .. .::: ...:::.:: :: :.:: .. ...::
CCDS23 SQNDGFFAVHLKEGSEAASKGDFLFSSDHLIEMATKLYRTTLSQTK-QKLNIEISDEFLV
990 1000 1010 1020 1030 1040
1030 1040 1050 1060
pF1KSD GGPGRDGTIDFTPGSELLITKAKNGHLAVVAPRLNSR
CCDS23 QFRQDKVCVKFIQGNQKNGSVPTCKRKNNRLLEVAVP
1050 1060 1070
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CCDS82 EMATKLYRTTLSQTK-QKLNIEISDEFLVQFRQDKVCVKFIQGNQKNGSVPTCKRKNNRL
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CCDS46 IEEKIIIAEVVNKINRANGKSTSRIFLLTNNNLLLADQKSGQIKSEVPLVDVTKVSMSSQ
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CCDS46 NDGFFAVHLKEGSEAASKGDFLFSSDHLIEMATKLYRTTLSQTKQKLNIEISDEFLVQFR
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CCDS89 SFEQFVINYCNEKLQQVFIEMTLKEEQEEYKREGIPWTKVDYFDNGIICKLIEHNQRGIL
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CCDS89 AMLDEECLRPGVVSDSTFLAKLNQLFSKHGHYESKVTQNAQRQYDHTMGLSCFRICHYAG
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CCDS89 KVTYNVTSFIDKNNDLLFRDLLQAMWKAQHPLLRSLFPEGNPKQASLKRPPTAGAQFKSS
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CCDS89 VAILMKNLYSKSPNYIRCIKPNEHQQRGQFSSDLVATQARYLGLLENVRVRRAGYAHRQG
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CCDS89 YGPFLERYRLLSRSTWPHWNGGDREGVEKVLGELSMSSGELAFGKTKIFIRSPKTLFYLE
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CCDS89 EQRRLRLQQLATLIQKIYRGWRCRTHYQLMRKSQILISSWFRGNMQKKCYGKIKASVLLI
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CCDS89 QAFVRGWKARKNYRKYFRSEAALTLADFIYKSMVQKFLLGLKNNLPSTNVLDKTWPAAPY
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