Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDB0029
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDB0029, 570 aa
1>>>pF1KSDB0029 570 - 570 aa - 570 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1616+/-0.00094; mu= 14.8036+/- 0.057
mean_var=77.1038+/-15.763, 0's: 0 Z-trim(106.5): 23 B-trim: 279 in 1/49
Lambda= 0.146062
statistics sampled from 9012 (9028) to 9012 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.648), E-opt: 0.2 (0.277), width: 16
Scan time: 2.910
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS43381.1 DPYSL3 gene_id:1809|Hs108|chr5 ( 570) 3795 809.3 0
CCDS56387.1 DPYSL3 gene_id:1809|Hs108|chr5 ( 684) 3717 792.9 0
CCDS6051.1 DPYSL2 gene_id:1808|Hs108|chr8 ( 572) 3062 654.9 7.8e-188
CCDS83268.1 DPYSL2 gene_id:1808|Hs108|chr8 ( 677) 2981 637.8 1.2e-182
CCDS43207.1 CRMP1 gene_id:1400|Hs108|chr4 ( 572) 2931 627.3 1.6e-179
CCDS75102.1 CRMP1 gene_id:1400|Hs108|chr4 ( 570) 2858 611.9 6.8e-175
CCDS33950.1 CRMP1 gene_id:1400|Hs108|chr4 ( 686) 2858 611.9 8e-175
CCDS59096.1 DPYSL2 gene_id:1808|Hs108|chr8 ( 536) 2829 605.8 4.4e-173
CCDS7665.1 DPYSL4 gene_id:10570|Hs108|chr10 ( 572) 2818 603.5 2.3e-172
CCDS6302.1 DPYS gene_id:1807|Hs108|chr8 ( 519) 2106 453.4 3.1e-127
CCDS1730.1 DPYSL5 gene_id:56896|Hs108|chr2 ( 564) 1936 417.6 2.1e-116
>>CCDS43381.1 DPYSL3 gene_id:1809|Hs108|chr5 (570 aa)
initn: 3795 init1: 3795 opt: 3795 Z-score: 4320.5 bits: 809.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3795; 100.0% identity (100.0% similar) in 570 aa overlap (1-570:1-570)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSYQGKKNIPRITSDRLLIKGGRIVNDDQSFYADIYMEDGLIKQIGDNLIVPGGVKTIEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MSYQGKKNIPRITSDRLLIKGGRIVNDDQSFYADIYMEDGLIKQIGDNLIVPGGVKTIEA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD NGKMVIPGGIDVHTHFQMPYKGMTTVDDFFQGTKAALAGGTTMIIDHVVPEPESSLTEAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NGKMVIPGGIDVHTHFQMPYKGMTTVDDFFQGTKAALAGGTTMIIDHVVPEPESSLTEAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD EKWREWADGKSCCDYALHVDITHWNDSVKQEVQNLIKDKGVNSFMVYMAYKDLYQVSNTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 EKWREWADGKSCCDYALHVDITHWNDSVKQEVQNLIKDKGVNSFMVYMAYKDLYQVSNTE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD LYEIFTCLGELGAIAQVHAENGDIIAQEQTRMLEMGITGPEGHVLSRPEELEAEAVFRAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LYEIFTCLGELGAIAQVHAENGDIIAQEQTRMLEMGITGPEGHVLSRPEELEAEAVFRAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD TIASQTNCPLYVTKVMSKSAADLISQARKKGNVVFGEPITASLGIDGTHYWSKNWAKAAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TIASQTNCPLYVTKVMSKSAADLISQARKKGNVVFGEPITASLGIDGTHYWSKNWAKAAA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD FVTSPPLSPDPTTPDYINSLLASGDLQLSGSAHCTFSTAQKAIGKDNFTAIPEGTNGVEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 FVTSPPLSPDPTTPDYINSLLASGDLQLSGSAHCTFSTAQKAIGKDNFTAIPEGTNGVEE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD RMSVIWDKAVATGKMDENQFVAVTSTNAAKIFNLYPRKGRISVGSDSDLVIWDPDAVKIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RMSVIWDKAVATGKMDENQFVAVTSTNAAKIFNLYPRKGRISVGSDSDLVIWDPDAVKIV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD SAKNHQSAAEYNIFEGMELRGAPLVVICQGKIMLEDGNLHVTQGAGRFIPCSPFSDYVYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SAKNHQSAAEYNIFEGMELRGAPLVVICQGKIMLEDGNLHVTQGAGRFIPCSPFSDYVYK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD RIKARRKMADLHAVPRGMYDGPVFDLTTTPKGGTPAGSARGSPTRPNPPVRNLHQSGFSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RIKARRKMADLHAVPRGMYDGPVFDLTTTPKGGTPAGSARGSPTRPNPPVRNLHQSGFSL
490 500 510 520 530 540
550 560 570
pF1KSD SGTQVDEGVRSASKRIVAPPGGRSNITSLS
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SGTQVDEGVRSASKRIVAPPGGRSNITSLS
550 560 570
>>CCDS56387.1 DPYSL3 gene_id:1809|Hs108|chr5 (684 aa)
initn: 3709 init1: 3709 opt: 3717 Z-score: 4230.4 bits: 792.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3717; 99.5% identity (99.6% similar) in 561 aa overlap (10-570:124-684)
10 20 30
pF1KSD MSYQGKKNIPRITSDRLLIKGGRIVNDDQSFYADIYMED
:. ::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 ESREPAPASPAPAGVEIRSATGKEVLQNLGPKDKSDRLLIKGGRIVNDDQSFYADIYMED
100 110 120 130 140 150
40 50 60 70 80 90
pF1KSD GLIKQIGDNLIVPGGVKTIEANGKMVIPGGIDVHTHFQMPYKGMTTVDDFFQGTKAALAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 GLIKQIGDNLIVPGGVKTIEANGKMVIPGGIDVHTHFQMPYKGMTTVDDFFQGTKAALAG
160 170 180 190 200 210
100 110 120 130 140 150
pF1KSD GTTMIIDHVVPEPESSLTEAYEKWREWADGKSCCDYALHVDITHWNDSVKQEVQNLIKDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 GTTMIIDHVVPEPESSLTEAYEKWREWADGKSCCDYALHVDITHWNDSVKQEVQNLIKDK
220 230 240 250 260 270
160 170 180 190 200 210
pF1KSD GVNSFMVYMAYKDLYQVSNTELYEIFTCLGELGAIAQVHAENGDIIAQEQTRMLEMGITG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 GVNSFMVYMAYKDLYQVSNTELYEIFTCLGELGAIAQVHAENGDIIAQEQTRMLEMGITG
280 290 300 310 320 330
220 230 240 250 260 270
pF1KSD PEGHVLSRPEELEAEAVFRAITIASQTNCPLYVTKVMSKSAADLISQARKKGNVVFGEPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 PEGHVLSRPEELEAEAVFRAITIASQTNCPLYVTKVMSKSAADLISQARKKGNVVFGEPI
340 350 360 370 380 390
280 290 300 310 320 330
pF1KSD TASLGIDGTHYWSKNWAKAAAFVTSPPLSPDPTTPDYINSLLASGDLQLSGSAHCTFSTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 TASLGIDGTHYWSKNWAKAAAFVTSPPLSPDPTTPDYINSLLASGDLQLSGSAHCTFSTA
400 410 420 430 440 450
340 350 360 370 380 390
pF1KSD QKAIGKDNFTAIPEGTNGVEERMSVIWDKAVATGKMDENQFVAVTSTNAAKIFNLYPRKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 QKAIGKDNFTAIPEGTNGVEERMSVIWDKAVATGKMDENQFVAVTSTNAAKIFNLYPRKG
460 470 480 490 500 510
400 410 420 430 440 450
pF1KSD RISVGSDSDLVIWDPDAVKIVSAKNHQSAAEYNIFEGMELRGAPLVVICQGKIMLEDGNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 RISVGSDSDLVIWDPDAVKIVSAKNHQSAAEYNIFEGMELRGAPLVVICQGKIMLEDGNL
520 530 540 550 560 570
460 470 480 490 500 510
pF1KSD HVTQGAGRFIPCSPFSDYVYKRIKARRKMADLHAVPRGMYDGPVFDLTTTPKGGTPAGSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 HVTQGAGRFIPCSPFSDYVYKRIKARRKMADLHAVPRGMYDGPVFDLTTTPKGGTPAGSA
580 590 600 610 620 630
520 530 540 550 560 570
pF1KSD RGSPTRPNPPVRNLHQSGFSLSGTQVDEGVRSASKRIVAPPGGRSNITSLS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 RGSPTRPNPPVRNLHQSGFSLSGTQVDEGVRSASKRIVAPPGGRSNITSLS
640 650 660 670 680
>>CCDS6051.1 DPYSL2 gene_id:1808|Hs108|chr8 (572 aa)
initn: 3095 init1: 2862 opt: 3062 Z-score: 3485.7 bits: 654.9 E(32554): 7.8e-188
Smith-Waterman score: 3062; 76.7% identity (94.7% similar) in 571 aa overlap (1-569:1-571)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSYQGKKNIPRITSDRLLIKGGRIVNDDQSFYADIYMEDGLIKQIGDNLIVPGGVKTIEA
::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS60 MSYQGKKNIPRITSDRLLIKGGKIVNDDQSFYADIYMEDGLIKQIGENLIVPGGVKTIEA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD NGKMVIPGGIDVHTHFQMPYKGMTTVDDFFQGTKAALAGGTTMIIDHVVPEPESSLTEAY
...:::::::::::.:::: .:::..:::::::::::::::::::::::::: .:: :.
CCDS60 HSRMVIPGGIDVHTRFQMPDQGMTSADDFFQGTKAALAGGTTMIIDHVVPEPGTSLLAAF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD EKWREWADGKSCCDYALHVDITHWNDSVKQEVQNLIKDKGVNSFMVYMAYKDLYQVSNTE
..::::::.::::::.:::::..:. ....:.. :.::.:::::.::::.:: .:... .
CCDS60 DQWREWADSKSCCDYSLHVDISEWHKGIQEEMEALVKDHGVNSFLVYMAFKDRFQLTDCQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD LYEIFTCLGELGAIAQVHAENGDIIAQEQTRMLEMGITGPEGHVLSRPEELEAEAVFRAI
.::... . ..:::::::::::::::.:: :.:..:::::::::::::::.::::: :::
CCDS60 IYEVLSVIRDIGAIAQVHAENGDIIAEEQQRILDLGITGPEGHVLSRPEEVEAEAVNRAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD TIASQTNCPLYVTKVMSKSAADLISQARKKGNVVFGEPITASLGIDGTHYWSKNWAKAAA
:::.:::::::.:::::::.:..:.::::::.::.::::::::: ::.::::::::::::
CCDS60 TIANQTNCPLYITKVMSKSSAEVIAQARKKGTVVYGEPITASLGTDGSHYWSKNWAKAAA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD FVTSPPLSPDPTTPDYINSLLASGDLQLSGSAHCTFSTAQKAIGKDNFTAIPEGTNGVEE
:::::::::::::::..::::. ::::..:::::::.:::::.:::::: :::::::.::
CCDS60 FVTSPPLSPDPTTPDFLNSLLSCGDLQVTGSAHCTFNTAQKAVGKDNFTLIPEGTNGTEE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD RMSVIWDKAVATGKMDENQFVAVTSTNAAKIFNLYPRKGRISVGSDSDLVIWDPDAVKIV
::::::::::.:::::::::::::::::::.::::::::::.::::.::::::::.:: .
CCDS60 RMSVIWDKAVVTGKMDENQFVAVTSTNAAKVFNLYPRKGRIAVGSDADLVIWDPDSVKTI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD SAKNHQSAAEYNIFEGMELRGAPLVVICQGKIMLEDGNLHVTQGAGRFIPCSPFSDYVYK
:::.:.:. ::::::::: ::.::::: ::::.::::.::::.:.::.:: .:: :.:::
CCDS60 SAKTHNSSLEYNIFEGMECRGSPLVVISQGKIVLEDGTLHVTEGSGRYIPRKPFPDFVYK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KSD RIKARRKMADLHAVPRGMYDGPVFDLTTTPKGGTPAGSARGSPTRPN-PPVRNLHQSGFS
::::: ..:.:..::::.::::: ....::: :::.::. ::.. . ::::::::::::
CCDS60 RIKARSRLAELRGVPRGLYDGPVCEVSVTPKTVTPASSAKTSPAKQQAPPVRNLHQSGFS
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570
pF1KSD LSGTQVDEGV-RSASKRIVAPPGGRSNITSLS
:::.:.:... : ...:::::::::.:::::
CCDS60 LSGAQIDDNIPRRTTQRIVAPPGGRANITSLG
550 560 570
>>CCDS83268.1 DPYSL2 gene_id:1808|Hs108|chr8 (677 aa)
initn: 3017 init1: 2776 opt: 2981 Z-score: 3392.3 bits: 637.8 E(32554): 1.2e-182
Smith-Waterman score: 2981; 75.2% identity (93.8% similar) in 569 aa overlap (5-569:108-676)
10 20 30
pF1KSD MSYQGKKNIPRIT--SDRLLIKGGRIVNDDQSFY
::. . :. :::::::::.:::::::::
CCDS83 PQPPYSRQGRRAGGEPSVESGRKVEIRRASGKEALQNINDQSDRLLIKGGKIVNDDQSFY
80 90 100 110 120 130
40 50 60 70 80 90
pF1KSD ADIYMEDGLIKQIGDNLIVPGGVKTIEANGKMVIPGGIDVHTHFQMPYKGMTTVDDFFQG
::::::::::::::.:::::::::::::...:::::::::::.:::: .:::..::::::
CCDS83 ADIYMEDGLIKQIGENLIVPGGVKTIEAHSRMVIPGGIDVHTRFQMPDQGMTSADDFFQG
140 150 160 170 180 190
100 110 120 130 140 150
pF1KSD TKAALAGGTTMIIDHVVPEPESSLTEAYEKWREWADGKSCCDYALHVDITHWNDSVKQEV
:::::::::::::::::::: .:: :...::::::.::::::.:::::..:. ....:.
CCDS83 TKAALAGGTTMIIDHVVPEPGTSLLAAFDQWREWADSKSCCDYSLHVDISEWHKGIQEEM
200 210 220 230 240 250
160 170 180 190 200 210
pF1KSD QNLIKDKGVNSFMVYMAYKDLYQVSNTELYEIFTCLGELGAIAQVHAENGDIIAQEQTRM
. :.::.:::::.::::.:: .:... ..::... . ..:::::::::::::::.:: :.
CCDS83 EALVKDHGVNSFLVYMAFKDRFQLTDCQIYEVLSVIRDIGAIAQVHAENGDIIAEEQQRI
260 270 280 290 300 310
220 230 240 250 260 270
pF1KSD LEMGITGPEGHVLSRPEELEAEAVFRAITIASQTNCPLYVTKVMSKSAADLISQARKKGN
:..:::::::::::::::.::::: ::::::.:::::::.:::::::.:..:.::::::.
CCDS83 LDLGITGPEGHVLSRPEEVEAEAVNRAITIANQTNCPLYITKVMSKSSAEVIAQARKKGT
320 330 340 350 360 370
280 290 300 310 320 330
pF1KSD VVFGEPITASLGIDGTHYWSKNWAKAAAFVTSPPLSPDPTTPDYINSLLASGDLQLSGSA
::.::::::::: ::.:::::::::::::::::::::::::::..::::. ::::..:::
CCDS83 VVYGEPITASLGTDGSHYWSKNWAKAAAFVTSPPLSPDPTTPDFLNSLLSCGDLQVTGSA
380 390 400 410 420 430
340 350 360 370 380 390
pF1KSD HCTFSTAQKAIGKDNFTAIPEGTNGVEERMSVIWDKAVATGKMDENQFVAVTSTNAAKIF
::::.:::::.:::::: :::::::.::::::::::::.:::::::::::::::::::.:
CCDS83 HCTFNTAQKAVGKDNFTLIPEGTNGTEERMSVIWDKAVVTGKMDENQFVAVTSTNAAKVF
440 450 460 470 480 490
400 410 420 430 440 450
pF1KSD NLYPRKGRISVGSDSDLVIWDPDAVKIVSAKNHQSAAEYNIFEGMELRGAPLVVICQGKI
:::::::::.::::.::::::::.:: .:::.:.:. ::::::::: ::.::::: ::::
CCDS83 NLYPRKGRIAVGSDADLVIWDPDSVKTISAKTHNSSLEYNIFEGMECRGSPLVVISQGKI
500 510 520 530 540 550
460 470 480 490 500 510
pF1KSD MLEDGNLHVTQGAGRFIPCSPFSDYVYKRIKARRKMADLHAVPRGMYDGPVFDLTTTPKG
.::::.::::.:.::.:: .:: :.:::::::: ..:.:..::::.::::: ....:::
CCDS83 VLEDGTLHVTEGSGRYIPRKPFPDFVYKRIKARSRLAELRGVPRGLYDGPVCEVSVTPKT
560 570 580 590 600 610
520 530 540 550 560 570
pF1KSD GTPAGSARGSPTRPN-PPVRNLHQSGFSLSGTQVDEGV-RSASKRIVAPPGGRSNITSLS
:::.::. ::.. . :::::::::::::::.:.:... : ...:::::::::.:::::
CCDS83 VTPASSAKTSPAKQQAPPVRNLHQSGFSLSGAQIDDNIPRRTTQRIVAPPGGRANITSLG
620 630 640 650 660 670
>>CCDS43207.1 CRMP1 gene_id:1400|Hs108|chr4 (572 aa)
initn: 2955 init1: 2758 opt: 2931 Z-score: 3336.5 bits: 627.3 E(32554): 1.6e-179
Smith-Waterman score: 2931; 74.4% identity (92.1% similar) in 571 aa overlap (1-569:1-571)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSYQGKKNIPRITSDRLLIKGGRIVNDDQSFYADIYMEDGLIKQIGDNLIVPGGVKTIEA
:::::::.::.:::::::::::::.:::::.:::.:.:::::::::.:::::::::::::
CCDS43 MSYQGKKSIPHITSDRLLIKGGRIINDDQSLYADVYLEDGLIKQIGENLIVPGGVKTIEA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD NGKMVIPGGIDVHTHFQMPYKGMTTVDDFFQGTKAALAGGTTMIIDHVVPEPESSLTEAY
::.:::::::::.:..: : .:::..:::::::.:::.:::::::::::::: ::: ..
CCDS43 NGRMVIPGGIDVNTYLQKPSQGMTAADDFFQGTRAALVGGTTMIIDHVVPEPGSSLLTSF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD EKWREWADGKSCCDYALHVDITHWNDSVKQEVQNLIKDKGVNSFMVYMAYKDLYQVSNTE
:::.: :: ::::::.:::::: : :.:..:.. :..:::::::.:::::::.::.:...
CCDS43 EKWHEAADTKSCCDYSLHVDITSWYDGVREELEVLVQDKGVNSFQVYMAYKDVYQMSDSQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD LYEIFTCLGELGAIAQVHAENGDIIAQEQTRMLEMGITGPEGHVLSRPEELEAEAVFRAI
::: :: : :::. :::::::.::::: :.:::::::::::.::::::::::::::::
CCDS43 LYEAFTFLKGLGAVILVHAENGDLIAQEQKRILEMGITGPEGHALSRPEELEAEAVFRAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD TIASQTNCPLYVTKVMSKSAADLISQARKKGNVVFGEPITASLGIDGTHYWSKNWAKAAA
:::.. :::.:.::::::::::.:. ::::: .::::::.:::: :::::::::::::::
CCDS43 TIAGRINCPVYITKVMSKSAADIIALARKKGPLVFGEPIAASLGTDGTHYWSKNWAKAAA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD FVTSPPLSPDPTTPDYINSLLASGDLQLSGSAHCTFSTAQKAIGKDNFTAIPEGTNGVEE
::::::::::::::::..:::: ::::..::.:: .::::::.:::::: ::::.::.::
CCDS43 FVTSPPLSPDPTTPDYLTSLLACGDLQVTGSGHCPYSTAQKAVGKDNFTLIPEGVNGIEE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD RMSVIWDKAVATGKMDENQFVAVTSTNAAKIFNLYPRKGRISVGSDSDLVIWDPDAVKIV
::.:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.:.:::::: .: .
CCDS43 RMTVVWDKAVATGKMDENQFVAVTSTNAAKIFNLYPRKGRIAVGSDADVVIWDPDKLKTI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD SAKNHQSAAEYNIFEGMELRGAPLVVICQGKIMLEDGNLHVTQGAGRFIPCSPFSDYVYK
.::.:.::.::::::::: .:.::::: ::::..::::..:..: ::::: . : ...:.
CCDS43 TAKSHKSAVEYNIFEGMECHGSPLVVISQGKIVFEDGNINVNKGMGRFIPRKAFPEHLYQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KSD RIKARRKMADLHAVPRGMYDGPVFDLTTTPKGGTPAGSARGSPTRPNPP-VRNLHQSGFS
:.: : :. :..: ::::::::... .::: .::: ::..::.. .:: .::::::.::
CCDS43 RVKIRNKVFGLQGVSRGMYDGPVYEVPATPKYATPAPSAKSSPSKHQPPPIRNLHQSNFS
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570
pF1KSD LSGTQVDEGV-RSASKRIVAPPGGRSNITSLS
:::.:.:.. : ...:::::::::::::::
CCDS43 LSGAQIDDNNPRRTGHRIVAPPGGRSNITSLG
550 560 570
>>CCDS75102.1 CRMP1 gene_id:1400|Hs108|chr4 (570 aa)
initn: 2882 init1: 2685 opt: 2858 Z-score: 3253.4 bits: 611.9 E(32554): 6.8e-175
Smith-Waterman score: 2858; 74.2% identity (91.9% similar) in 558 aa overlap (14-569:12-569)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSYQGKKNIPRITSDRLLIKGGRIVNDDQSFYADIYMEDGLIKQIGDNLIVPGGVKTIEA
:::::::::::.:::::.:::.:.:::::::::.:::::::::::::
CCDS75 MQKMNNEVVDKSDRLLIKGGRIINDDQSLYADVYLEDGLIKQIGENLIVPGGVKTIEA
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD NGKMVIPGGIDVHTHFQMPYKGMTTVDDFFQGTKAALAGGTTMIIDHVVPEPESSLTEAY
::.:::::::::.:..: : .:::..:::::::.:::.:::::::::::::: ::: ..
CCDS75 NGRMVIPGGIDVNTYLQKPSQGMTAADDFFQGTRAALVGGTTMIIDHVVPEPGSSLLTSF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KSD EKWREWADGKSCCDYALHVDITHWNDSVKQEVQNLIKDKGVNSFMVYMAYKDLYQVSNTE
:::.: :: ::::::.:::::: : :.:..:.. :..:::::::.:::::::.::.:...
CCDS75 EKWHEAADTKSCCDYSLHVDITSWYDGVREELEVLVQDKGVNSFQVYMAYKDVYQMSDSQ
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KSD LYEIFTCLGELGAIAQVHAENGDIIAQEQTRMLEMGITGPEGHVLSRPEELEAEAVFRAI
::: :: : :::. :::::::.::::: :.:::::::::::.::::::::::::::::
CCDS75 LYEAFTFLKGLGAVILVHAENGDLIAQEQKRILEMGITGPEGHALSRPEELEAEAVFRAI
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KSD TIASQTNCPLYVTKVMSKSAADLISQARKKGNVVFGEPITASLGIDGTHYWSKNWAKAAA
:::.. :::.:.::::::::::.:. ::::: .::::::.:::: :::::::::::::::
CCDS75 TIAGRINCPVYITKVMSKSAADIIALARKKGPLVFGEPIAASLGTDGTHYWSKNWAKAAA
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KSD FVTSPPLSPDPTTPDYINSLLASGDLQLSGSAHCTFSTAQKAIGKDNFTAIPEGTNGVEE
::::::::::::::::..:::: ::::..::.:: .::::::.:::::: ::::.::.::
CCDS75 FVTSPPLSPDPTTPDYLTSLLACGDLQVTGSGHCPYSTAQKAVGKDNFTLIPEGVNGIEE
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KSD RMSVIWDKAVATGKMDENQFVAVTSTNAAKIFNLYPRKGRISVGSDSDLVIWDPDAVKIV
::.:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.:.:::::: .: .
CCDS75 RMTVVWDKAVATGKMDENQFVAVTSTNAAKIFNLYPRKGRIAVGSDADVVIWDPDKLKTI
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KSD SAKNHQSAAEYNIFEGMELRGAPLVVICQGKIMLEDGNLHVTQGAGRFIPCSPFSDYVYK
.::.:.::.::::::::: .:.::::: ::::..::::..:..: ::::: . : ...:.
CCDS75 TAKSHKSAVEYNIFEGMECHGSPLVVISQGKIVFEDGNINVNKGMGRFIPRKAFPEHLYQ
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530
pF1KSD RIKARRKMADLHAVPRGMYDGPVFDLTTTPKGGTPAGSARGSPTRPNPP-VRNLHQSGFS
:.: : :. :..: ::::::::... .::: .::: ::..::.. .:: .::::::.::
CCDS75 RVKIRNKVFGLQGVSRGMYDGPVYEVPATPKYATPAPSAKSSPSKHQPPPIRNLHQSNFS
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570
pF1KSD LSGTQVDEGV-RSASKRIVAPPGGRSNITSLS
:::.:.:.. : ...:::::::::::::::
CCDS75 LSGAQIDDNNPRRTGHRIVAPPGGRSNITSLG
540 550 560 570
>>CCDS33950.1 CRMP1 gene_id:1400|Hs108|chr4 (686 aa)
initn: 2882 init1: 2685 opt: 2858 Z-score: 3252.1 bits: 611.9 E(32554): 8e-175
Smith-Waterman score: 2858; 74.2% identity (91.9% similar) in 558 aa overlap (14-569:128-685)
10 20 30 40
pF1KSD MSYQGKKNIPRITSDRLLIKGGRIVNDDQSFYADIYMEDGLIK
:::::::::::.:::::.:::.:.::::::
CCDS33 SPGERDERPPTLRIRRPAPRDLPLGRDNGQSDRLLIKGGRIINDDQSLYADVYLEDGLIK
100 110 120 130 140 150
50 60 70 80 90 100
pF1KSD QIGDNLIVPGGVKTIEANGKMVIPGGIDVHTHFQMPYKGMTTVDDFFQGTKAALAGGTTM
:::.:::::::::::::::.:::::::::.:..: : .:::..:::::::.:::.:::::
CCDS33 QIGENLIVPGGVKTIEANGRMVIPGGIDVNTYLQKPSQGMTAADDFFQGTRAALVGGTTM
160 170 180 190 200 210
110 120 130 140 150 160
pF1KSD IIDHVVPEPESSLTEAYEKWREWADGKSCCDYALHVDITHWNDSVKQEVQNLIKDKGVNS
::::::::: ::: ..:::.: :: ::::::.:::::: : :.:..:.. :..::::::
CCDS33 IIDHVVPEPGSSLLTSFEKWHEAADTKSCCDYSLHVDITSWYDGVREELEVLVQDKGVNS
220 230 240 250 260 270
170 180 190 200 210 220
pF1KSD FMVYMAYKDLYQVSNTELYEIFTCLGELGAIAQVHAENGDIIAQEQTRMLEMGITGPEGH
:.:::::::.::.:...::: :: : :::. :::::::.::::: :.:::::::::::
CCDS33 FQVYMAYKDVYQMSDSQLYEAFTFLKGLGAVILVHAENGDLIAQEQKRILEMGITGPEGH
280 290 300 310 320 330
230 240 250 260 270 280
pF1KSD VLSRPEELEAEAVFRAITIASQTNCPLYVTKVMSKSAADLISQARKKGNVVFGEPITASL
.:::::::::::::::::::.. :::.:.::::::::::.:. ::::: .::::::.:::
CCDS33 ALSRPEELEAEAVFRAITIAGRINCPVYITKVMSKSAADIIALARKKGPLVFGEPIAASL
340 350 360 370 380 390
290 300 310 320 330 340
pF1KSD GIDGTHYWSKNWAKAAAFVTSPPLSPDPTTPDYINSLLASGDLQLSGSAHCTFSTAQKAI
: :::::::::::::::::::::::::::::::..:::: ::::..::.:: .::::::.
CCDS33 GTDGTHYWSKNWAKAAAFVTSPPLSPDPTTPDYLTSLLACGDLQVTGSGHCPYSTAQKAV
400 410 420 430 440 450
350 360 370 380 390 400
pF1KSD GKDNFTAIPEGTNGVEERMSVIWDKAVATGKMDENQFVAVTSTNAAKIFNLYPRKGRISV
:::::: ::::.::.::::.:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS33 GKDNFTLIPEGVNGIEERMTVVWDKAVATGKMDENQFVAVTSTNAAKIFNLYPRKGRIAV
460 470 480 490 500 510
410 420 430 440 450 460
pF1KSD GSDSDLVIWDPDAVKIVSAKNHQSAAEYNIFEGMELRGAPLVVICQGKIMLEDGNLHVTQ
:::.:.:::::: .: ..::.:.::.::::::::: .:.::::: ::::..::::..:..
CCDS33 GSDADVVIWDPDKLKTITAKSHKSAVEYNIFEGMECHGSPLVVISQGKIVFEDGNINVNK
520 530 540 550 560 570
470 480 490 500 510 520
pF1KSD GAGRFIPCSPFSDYVYKRIKARRKMADLHAVPRGMYDGPVFDLTTTPKGGTPAGSARGSP
: ::::: . : ...:.:.: : :. :..: ::::::::... .::: .::: ::..::
CCDS33 GMGRFIPRKAFPEHLYQRVKIRNKVFGLQGVSRGMYDGPVYEVPATPKYATPAPSAKSSP
580 590 600 610 620 630
530 540 550 560 570
pF1KSD TRPNPP-VRNLHQSGFSLSGTQVDEGV-RSASKRIVAPPGGRSNITSLS
.. .:: .::::::.:::::.:.:.. : ...:::::::::::::::
CCDS33 SKHQPPPIRNLHQSNFSLSGAQIDDNNPRRTGHRIVAPPGGRSNITSLG
640 650 660 670 680
>>CCDS59096.1 DPYSL2 gene_id:1808|Hs108|chr8 (536 aa)
initn: 2858 init1: 2629 opt: 2829 Z-score: 3220.8 bits: 605.8 E(32554): 4.4e-173
Smith-Waterman score: 2829; 75.3% identity (94.4% similar) in 535 aa overlap (37-569:1-535)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD KNIPRITSDRLLIKGGRIVNDDQSFYADIYMEDGLIKQIGDNLIVPGGVKTIEANGKMVI
::::::::::.:::::::::::::...:::
CCDS59 MEDGLIKQIGENLIVPGGVKTIEAHSRMVI
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KSD PGGIDVHTHFQMPYKGMTTVDDFFQGTKAALAGGTTMIIDHVVPEPESSLTEAYEKWREW
::::::::.:::: .:::..:::::::::::::::::::::::::: .:: :...::::
CCDS59 PGGIDVHTRFQMPDQGMTSADDFFQGTKAALAGGTTMIIDHVVPEPGTSLLAAFDQWREW
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KSD ADGKSCCDYALHVDITHWNDSVKQEVQNLIKDKGVNSFMVYMAYKDLYQVSNTELYEIFT
::.::::::.:::::..:. ....:.. :.::.:::::.::::.:: .:... ..::...
CCDS59 ADSKSCCDYSLHVDISEWHKGIQEEMEALVKDHGVNSFLVYMAFKDRFQLTDCQIYEVLS
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KSD CLGELGAIAQVHAENGDIIAQEQTRMLEMGITGPEGHVLSRPEELEAEAVFRAITIASQT
. ..:::::::::::::::.:: :.:..:::::::::::::::.::::: ::::::.::
CCDS59 VIRDIGAIAQVHAENGDIIAEEQQRILDLGITGPEGHVLSRPEEVEAEAVNRAITIANQT
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KSD NCPLYVTKVMSKSAADLISQARKKGNVVFGEPITASLGIDGTHYWSKNWAKAAAFVTSPP
:::::.:::::::.:..:.::::::.::.::::::::: ::.::::::::::::::::::
CCDS59 NCPLYITKVMSKSSAEVIAQARKKGTVVYGEPITASLGTDGSHYWSKNWAKAAAFVTSPP
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KSD LSPDPTTPDYINSLLASGDLQLSGSAHCTFSTAQKAIGKDNFTAIPEGTNGVEERMSVIW
:::::::::..::::. ::::..:::::::.:::::.:::::: :::::::.::::::::
CCDS59 LSPDPTTPDFLNSLLSCGDLQVTGSAHCTFNTAQKAVGKDNFTLIPEGTNGTEERMSVIW
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KSD DKAVATGKMDENQFVAVTSTNAAKIFNLYPRKGRISVGSDSDLVIWDPDAVKIVSAKNHQ
::::.:::::::::::::::::::.::::::::::.::::.::::::::.:: .:::.:.
CCDS59 DKAVVTGKMDENQFVAVTSTNAAKVFNLYPRKGRIAVGSDADLVIWDPDSVKTISAKTHN
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KSD SAAEYNIFEGMELRGAPLVVICQGKIMLEDGNLHVTQGAGRFIPCSPFSDYVYKRIKARR
:. ::::::::: ::.::::: ::::.::::.::::.:.::.:: .:: :.::::::::
CCDS59 SSLEYNIFEGMECRGSPLVVISQGKIVLEDGTLHVTEGSGRYIPRKPFPDFVYKRIKARS
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KSD KMADLHAVPRGMYDGPVFDLTTTPKGGTPAGSARGSPTRPN-PPVRNLHQSGFSLSGTQV
..:.:..::::.::::: ....::: :::.::. ::.. . :::::::::::::::.:.
CCDS59 RLAELRGVPRGLYDGPVCEVSVTPKTVTPASSAKTSPAKQQAPPVRNLHQSGFSLSGAQI
460 470 480 490 500 510
550 560 570
pF1KSD DEGV-RSASKRIVAPPGGRSNITSLS
:... : ...:::::::::.:::::
CCDS59 DDNIPRRTTQRIVAPPGGRANITSLG
520 530
>>CCDS7665.1 DPYSL4 gene_id:10570|Hs108|chr10 (572 aa)
initn: 2750 init1: 2610 opt: 2818 Z-score: 3207.8 bits: 603.5 E(32554): 2.3e-172
Smith-Waterman score: 2818; 70.1% identity (90.0% similar) in 572 aa overlap (1-570:1-572)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSYQGKKNIPRITSDRLLIKGGRIVNDDQSFYADIYMEDGLIKQIGDNLIVPGGVKTIEA
::.::::.:::::::::::.::::::::::::::...:::::::::.:::::::.:::.:
CCDS76 MSFQGKKSIPRITSDRLLIRGGRIVNDDQSFYADVHVEDGLIKQIGENLIVPGGIKTIDA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD NGKMVIPGGIDVHTHFQMPYKGMTTVDDFFQGTKAALAGGTTMIIDHVVPEPESSLTEAY
.: ::.:::.::::..::: ::: .::: ::::::::::::::.::: :. :: ::
CCDS76 HGLMVLPGGVDVHTRLQMPVLGMTPADDFCQGTKAALAGGTTMILDHVFPDTGVSLLAAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD EKWREWADGKSCCDYALHVDITHWNDSVKQEVQNLIKDKGVNSFMVYMAYKDLYQVSNTE
:.::: ::. .::::.::::::.:..:.:.:.. :.:.::::::.:.::::: : :...
CCDS76 EQWRERADSAACCDYSLHVDITRWHESIKEELEALVKEKGVNSFLVFMAYKDRCQCSDSQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD LYEIFTCLGELGAIAQVHAENGDIIAQEQTRMLEMGITGPEGHVLSRPEELEAEAVFRAI
.::::. . .:::.::::::::::. .:: :.::.:::::::::::.:::.:::::.::.
CCDS76 MYEIFSIIRDLGALAQVHAENGDIVEEEQKRLLELGITGPEGHVLSHPEEVEAEAVYRAV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD TIASQTNCPLYVTKVMSKSAADLISQARKKGNVVFGEPITASLGIDGTHYWSKNWAKAAA
:::.:.::::::::::::.::: :.::...: :::::::::::: ::.::::::::::::
CCDS76 TIAKQANCPLYVTKVMSKGAADAIAQAKRRGVVVFGEPITASLGTDGSHYWSKNWAKAAA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD FVTSPPLSPDPTTPDYINSLLASGDLQLSGSAHCTFSTAQKAIGKDNFTAIPEGTNGVEE
::::::..::::: :... ::.:::::..:::::::.:::::.:::::. :::::::.::
CCDS76 FVTSPPVNPDPTTADHLTCLLSSGDLQVTGSAHCTFTTAQKAVGKDNFALIPEGTNGIEE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD RMSVIWDKAVATGKMDENQFVAVTSTNAAKIFNLYPRKGRISVGSDSDLVIWDPDAVKIV
:::..:.: ::.::::::.::::::::::::::.::::::..::::.:::::.: :.::.
CCDS76 RMSMVWEKCVASGKMDENEFVAVTSTNAAKIFNFYPRKGRVAVGSDADLVIWNPKATKII
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD SAKNHQSAAEYNIFEGMELRGAPLVVICQGKIMLEDGNLHVTQGAGRFIPCSPFSDYVYK
:::.:. .:::::::.: :::: ::: ::.. ::::.. :: :::::.: . : :.:::
CCDS76 SAKTHNLNVEYNIFEGVECRGAPAVVISQGRVALEDGKMFVTPGAGRFVPRKTFPDFVYK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KSD RIKARRKMADLHAVPRGMYDGPVFDLTTTPKGGTPAGSARGSPTRPN-PPVRNLHQSGFS
::::: ..:..:.::::.::::: .. . : :. : . . : . . ::::::::::::
CCDS76 RIKARNRLAEIHGVPRGLYDGPVHEVMVPAKPGSGAPARASCPGKISVPPVRNLHQSGFS
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570
pF1KSD LSGTQVDEGV-RSASKRIVAPPGGRSNITSLS
:::.:.:. . : ....:.:::::::::::::
CCDS76 LSGSQADDHIARRTAQKIMAPPGGRSNITSLS
550 560 570
>>CCDS6302.1 DPYS gene_id:1807|Hs108|chr8 (519 aa)
initn: 2127 init1: 1925 opt: 2106 Z-score: 2397.7 bits: 453.4 E(32554): 3.1e-127
Smith-Waterman score: 2106; 59.4% identity (82.4% similar) in 510 aa overlap (16-520:6-515)
10 20 30 40 50
pF1KSD MSYQGKKNIPRITSDRLLIKGGRIVNDDQSFYADIYMEDGLIKQIGDNLIVPGG----VK
::::.:::.:::: : ::. .:::... .: .:. ::: ..
CCDS63 MAAPSRLLIRGGRVVNDDFSEVADVLVEDGVVRALGHDLLPPGGAPAGLR
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD TIEANGKMVIPGGIDVHTHFQMPYKGMTTVDDFFQGTKAALAGGTTMIIDHVVPEPESSL
...: ::.:.:::::.:::.:.:. : ..::: :::::::.:::::::: ..:. .::
CCDS63 VLDAAGKLVLPGGIDTHTHMQFPFMGSRSIDDFHQGTKAALSGGTTMIIDFAIPQKGGSL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD TEAYEKWREWADGKSCCDYALHVDITHWNDSVKQEVQNLIKDKGVNSFMVYMAYKDLYQV
::.: :: ::: : ::::.::: .: :.:.::.:.. :..::::::: ..:::::::.:
CCDS63 IEAFETWRSWADPKVCCDYSLHVAVTWWSDQVKEEMKILVQDKGVNSFKMFMAYKDLYMV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD SNTELYEIFTCLGELGAIAQVHAENGDIIAQEQTRMLEMGITGPEGHVLSRPEELEAEAV
.. :::: :. :.::::::::::::.::. .:: .:::::::: : ::: .::::.
CCDS63 TDLELYEAFSRCKEIGAIAQVHAENGDLIAEGAKKMLALGITGPEGHELCRPEAVEAEAT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD FRAITIASQTNCPLYVTKVMSKSAADLISQARKKGNVVFGEPITASLGIDGTHYWSKNWA
.::::::: .:::::...::::::: .:..::. :.::.::::.:::: ::::::.:.:
CCDS63 LRAITIASAVNCPLYIVHVMSKSAAKVIADARRDGKVVYGEPIAASLGTDGTHYWNKEWH
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD KAAAFVTSPPLSPDPTTPDYINSLLASGDLQLSGSAHCTFSTAQKAIGKDNFTAIPEGTN
.:: : .::: :::.:::.. .:::. :: .:. .:::.: :::.:::.:: ::.:.:
CCDS63 HAAHHVMGPPLRPDPSTPDFLMNLLANDDLTTTGTDNCTFNTCQKALGKDDFTKIPNGVN
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD GVEERMSVIWDKAVATGKMDENQFVAVTSTNAAKIFNLYPRKGRISVGSDSDLVIWDPDA
:::.::::::.:.: .::::::.::::::::::::::::::::::.::::.:.::::: .
CCDS63 GVEDRMSVIWEKGVHSGKMDENRFVAVTSTNAAKIFNLYPRKGRIAVGSDADIVIWDPKG
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KSD VKIVSAKNHQSAAEYNIFEGMELRGAPLVVICQGKIMLEDGNLHVTQGAGRFIPCSPFSD
.. .:::.:..:...:::::: .:.:::.: .::.. : : . :: : :.::: .::..
CCDS63 TRTISAKTHHQAVNFNIFEGMVCHGVPLVTISRGKVVYEAGVFSVTAGDGKFIPRKPFAE
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KSD YVYKRIKARRKMADLHAVPRGMYDGPVFDLTT-TPKGGTPAGSARGSPTRPNPPVRNLHQ
:.::::: : . : :. : : : : . . : . ::. .
CCDS63 YIYKRIKQRDRTCTPTPVERAPYKGEVATLKSRVTKEDATAGTRKQAHP
480 490 500 510
540 550 560 570
pF1KSD SGFSLSGTQVDEGVRSASKRIVAPPGGRSNITSLS
570 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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