Result of FASTA (omim) for
pF1KSDB0028
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDB0028, 555 aa
1>>>pF1KSDB0028 555 - 555 aa - 555 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.2080+/-0.000404; mu= -12.8519+/- 0.025
mean_var=363.7689+/-76.320, 0's: 0 Z-trim(122.6): 42 B-trim: 395 in 2/55
Lambda= 0.067245
statistics sampled from 40961 (41016) to 40961 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.779), E-opt: 0.2 (0.481), width: 16
Scan time: 12.730
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_066566 (OMIM: 603448) disabled homolog 1 [Homo ( 555) 3726 375.4 2.7e-103
NP_001231800 (OMIM: 601236) disabled homolog 2 iso ( 749) 753 87.0 2.3e-16
NP_001334 (OMIM: 601236) disabled homolog 2 isofor ( 770) 746 86.3 3.7e-16
XP_016859793 (OMIM: 608165) PREDICTED: PTB domain- ( 366) 283 41.2 0.0067
XP_016859794 (OMIM: 608165) PREDICTED: PTB domain- ( 366) 283 41.2 0.0067
XP_016859792 (OMIM: 608165) PREDICTED: PTB domain- ( 366) 283 41.2 0.0067
XP_011509631 (OMIM: 608165) PREDICTED: PTB domain- ( 376) 283 41.2 0.0069
XP_006712645 (OMIM: 608165) PREDICTED: PTB domain- ( 379) 283 41.2 0.0069
XP_006712646 (OMIM: 608165) PREDICTED: PTB domain- ( 379) 283 41.2 0.0069
XP_006712647 (OMIM: 608165) PREDICTED: PTB domain- ( 379) 283 41.2 0.0069
XP_006712644 (OMIM: 608165) PREDICTED: PTB domain- ( 379) 283 41.2 0.0069
XP_006712648 (OMIM: 608165) PREDICTED: PTB domain- ( 379) 283 41.2 0.0069
XP_006712643 (OMIM: 608165) PREDICTED: PTB domain- ( 379) 283 41.2 0.0069
>>NP_066566 (OMIM: 603448) disabled homolog 1 [Homo sapi (555 aa)
initn: 3726 init1: 3726 opt: 3726 Z-score: 1975.6 bits: 375.4 E(85289): 2.7e-103
Smith-Waterman score: 3726; 100.0% identity (100.0% similar) in 555 aa overlap (1-555:1-555)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSTETELQVAVKTSAKKDSRKKGQDRSEATLIKRFKGEGVRYKAKLIGIDEVSAARGDKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 MSTETELQVAVKTSAKKDSRKKGQDRSEATLIKRFKGEGVRYKAKLIGIDEVSAARGDKL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD CQDSMMKLKGVVAGARSKGEHKQKIFLTISFGGIKIFDEKTGALQHHHAVHEISYIAKDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 CQDSMMKLKGVVAGARSKGEHKQKIFLTISFGGIKIFDEKTGALQHHHAVHEISYIAKDI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD TDHRAFGYVCGKEGNHRFVAIKTAQAAEPVILDLRDLFQLIYELKQREELEKKAQKDKQC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 TDHRAFGYVCGKEGNHRFVAIKTAQAAEPVILDLRDLFQLIYELKQREELEKKAQKDKQC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD EQAVYQTILEEDVEDPVYQYIVFEAGHEPIRDPETEENIYQVPTSQKKEGVYDVPKSQPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 EQAVYQTILEEDVEDPVYQYIVFEAGHEPIRDPETEENIYQVPTSQKKEGVYDVPKSQPV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD SAVTQLELFGDMSTPPDITSPPTPATPGDAFIPSSSQTLPASADVFSSVPFGTAAVPSGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 SAVTQLELFGDMSTPPDITSPPTPATPGDAFIPSSSQTLPASADVFSSVPFGTAAVPSGY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD VAMGAVLPSFWGQQPLVQQQMVMGAQPPVAQVMPGAQPIAWGQPGLFPATQQPWPTVAGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 VAMGAVLPSFWGQQPLVQQQMVMGAQPPVAQVMPGAQPIAWGQPGLFPATQQPWPTVAGQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD FPPAAFMPTQTVMPLPAAMFQGPLTPLATVPGTSDSTRSSPQTDKPRQKMGKETFKDFQM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 FPPAAFMPTQTVMPLPAAMFQGPLTPLATVPGTSDSTRSSPQTDKPRQKMGKETFKDFQM
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD AQPPPVPSRKPDQPSLTCTSEAFSSYFNKVGVAQDTDDCDDFDISQLNLTPVTSTTPSTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 AQPPPVPSRKPDQPSLTCTSEAFSSYFNKVGVAQDTDDCDDFDISQLNLTPVTSTTPSTN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD SPPTPAPRQSSPSKSSASHASDPTTDDIFEEGFESPSKSEEQEAPDGSQASSNSDPFGEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 SPPTPAPRQSSPSKSSASHASDPTTDDIFEEGFESPSKSEEQEAPDGSQASSNSDPFGEP
490 500 510 520 530 540
550
pF1KSD SGEPSGDNISPQAGS
:::::::::::::::
NP_066 SGEPSGDNISPQAGS
550
>>NP_001231800 (OMIM: 601236) disabled homolog 2 isoform (749 aa)
initn: 964 init1: 701 opt: 753 Z-score: 414.9 bits: 87.0 E(85289): 2.3e-16
Smith-Waterman score: 764; 31.5% identity (58.2% similar) in 596 aa overlap (4-551:13-579)
10 20 30 40 50
pF1KSD MSTETELQVAVKTSAKKDSRKKGQDRSEATLIKRFKGEGVRYKAKLIGIDE
. . :.: :. .::. .::: .... :. ::::.::.:::::::::.
NP_001 MSNEVETSATNGQPDQQAAPKAPSKKE-KKKGPEKTDEYLLARFKGDGVKYKAKLIGIDD
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD VSAARGDKLCQDSMMKLKGVVAGARSKGEHKQKIFLTISFGGIKIFDEKTGALQHHHAVH
: :::::. :::::::::..:..::.:.:::.:...::..::::.:::::...:.: :.
NP_001 VPDARGDKMSQDSMMKLKGMAAAGRSQGQHKQRIWVNISLSGIKIIDEKTGVIEHEHPVN
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD EISYIAKDITDHRAFGYVCGKEGNHRFVAIKTAQAAEPVILDLRDLFQLIYELKQREELE
.::.::.:.::.:::::::: ::.:.: ::::.: :::...::.::::.::..:..:: .
NP_001 KISFIARDVTDNRAFGYVCGGEGQHQFFAIKTGQQAEPLVVDLKDLFQVIYNVKKKEEEK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KSD KKAQK-DKQCEQAVYQTILEEDVEDPVYQYIVFEAGHEPIRDPETEENIYQVPTSQKK--
:: .. .: :.. .. .: . . . :. . : ..: . : ..
NP_001 KKIEEASKAVENGSEALMILDDQTNKLKS----ESKDILLVDLNSEIDTNQNSLRENPFL
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KSD -EGVYD--VPKSQPVSAVTQLELFG-DMSTPPDITSPP---TPATPGDAFIPSSSQTLPA
.:. . .:. : .. . :. ... : . : : : : ::: ..: .
NP_001 TNGITSCSLPRPTPQASFLPENAFSANLNFFPTPNPDPFRDDPFTQPDQSTPSSFDSLKS
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330
pF1KSD SADVFSSVPFGTAAVPSGYVAMGAVLPSFWGQQPLVQQQMVMGAQPPVAQVMP----GAQ
. . ... . .: . : : ...::: . : . : : : : .:
NP_001 PDQKKENSSSSSTPLSNGPLN-GDV--DYFGQQ-FDQISNRTGKQEAQAGPWPFSSSQTQ
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KSD PIAWGQPGL-------FPATQQPWPTVAGQFPPAAFMPTQTVMPLPAAMFQGPLTPLATV
: . : :. : . ..: : : :. : . . . . . : ... ..: .: .
NP_001 PAVRTQNGVSEREQNGFSVKSSPNPFV-GSPPKGLSIQNGVKQDLESSVQSSPHDSIAII
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440
pF1KSD PGTSDSTRSSPQTDKPRQ--KMGKETFKDFQMAQ--PPPVPSRKPDQPSLTCTSEAFSSY
: ::. :: . . .: . .:. .. ::: :. : : : :..
NP_001 P--------PPQSTKPGRGRRTAKSSANDLLASDIFAPPV-SEPSGQASPTGQPTALQP-
420 430 440 450 460
450 460 470 480 490
pF1KSD FNKVGVAQDTDDCDDFDISQL-NLTPVTSTTPST----------NSPPTPAPRQ---SSP
: . . . . .. : .: :: : :.. :. :. :: ..:
NP_001 -NPLDLFKTSAPAP---VGPLVGLGGVTVTLPQAGPWNTASLVFNQSPSMAPGAMMGGQP
470 480 490 500 510
500 510 520 530 540
pF1KSD SKSSAS--HASDPTTDDIFEEGFESPSKSEEQEAPD-----GSQASSNSDPFGE--PSGE
: : ...:... :...:: . : : .:: . .. : :.
NP_001 SGFSQPVIFGTSPAVS-----GWNQPSPFAASTPPPVPVVWGPSASVAPNAWSTTSPLGN
520 530 540 550 560 570
550
pF1KSD PSGDNISPQAGS
: .:: :
NP_001 PFQSNIFPAPAVSTQPPSMHSSLLVTPPQPPPRAGPPKDISSDAFTALDPLGDKEIKDVK
580 590 600 610 620 630
>>NP_001334 (OMIM: 601236) disabled homolog 2 isoform 1 (770 aa)
initn: 1062 init1: 701 opt: 746 Z-score: 411.0 bits: 86.3 E(85289): 3.7e-16
Smith-Waterman score: 808; 32.7% identity (57.0% similar) in 575 aa overlap (4-554:13-512)
10 20 30 40 50
pF1KSD MSTETELQVAVKTSAKKDSRKKGQDRSEATLIKRFKGEGVRYKAKLIGIDE
. . :.: :. .::. .::: .... :. ::::.::.:::::::::.
NP_001 MSNEVETSATNGQPDQQAAPKAPSKKE-KKKGPEKTDEYLLARFKGDGVKYKAKLIGIDD
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD VSAARGDKLCQDSMMKLKGVVAGARSKGEHKQKIFLTISFGGIKIFDEKTGALQHHHAVH
: :::::. :::::::::..:..::.:.:::.:...::..::::.:::::...:.: :.
NP_001 VPDARGDKMSQDSMMKLKGMAAAGRSQGQHKQRIWVNISLSGIKIIDEKTGVIEHEHPVN
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD EISYIAKDITDHRAFGYVCGKEGNHRFVAIKTAQAAEPVILDLRDLFQLIYELKQREELE
.::.::.:.::.:::::::: ::.:.: ::::.: :::...::.::::.::..:..:: .
NP_001 KISFIARDVTDNRAFGYVCGGEGQHQFFAIKTGQQAEPLVVDLKDLFQVIYNVKKKEEEK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD KKAQKDKQCEQAVYQTILEEDVEDPVYQYIVFEAGHEPIRDPETEENIYQVPTSQKKEGV
:: . . .:: : : : . : . :.. : ::
NP_001 KKIE---EASKAV-------------------ENGSEAL-------MILDDQTNKLKSGV
180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KSD YDVPKSQPVSAVTQLELFGDMSTPPDITSPPTPATPGDAFIPSSSQTLPASADVFSSVPF
:..::::::::::..:: . : .. . .. . .. . . ::
NP_001 ------------DQMDLFGDMSTPPDLNSP---TESKDILLVDLNSEIDTNQNSLRENPF
220 230 240 250
300 310 320 330 340 350
pF1KSD GTAAVPSGYVAMGAVLPSFWGQQPLVQQQMVMGAQPPVAQVMPGAQPIAWGQPGLFPATQ
: .. : :: .: : ... : : .:. . :. : .
NP_001 LTNGITS------CSLP-----RPTPQASFL----PENA---FSANLNFFPTPNPDPFRD
260 270 280 290
360 370 380 390 400 410
pF1KSD QPWPTVAGQFPPAAFMPTQTVMP-LPAAMFQGPLTPLATVPGTSDSTRSSPQTDKPRQKM
.:. : : :..: .. : .. :::.. : ..: . : :. ..
NP_001 DPF-TQPDQSTPSSFDSLKS--PDQKKENSSSSSTPLSNGPLNGDVDYFGQQFDQISNRT
300 310 320 330 340 350
420 430 440 450 460
pF1KSD GKETFKDFQMAQPPPVP-SRKPDQPSLTCTSEAFSSYFNKVGVAQDTDDC-----DDFDI
:: : :: : : : . ::.. . . : .: .. . ..:
NP_001 GK------QEAQAGPWPFSSSQTQPAVRTQNGVSEREQNGFSVKSSPNPFVGSPPKGLSI
360 370 380 390 400
470 480 490 500 510
pF1KSD S---QLNLTPVTSTTPSTNSPPTPAPRQSSPSK---SSASHASDPTTDDIFEEGFESPSK
. . .: ....: . : :....:.. .. : :.: ..::: ::
NP_001 QNGVKQDLESSVQSSPHDSIAIIPPPQSTKPGRGRRTAKSSANDLLASDIFAPPVSEPSG
410 420 430 440 450 460
520 530 540 550
pF1KSD SEEQEAPDGSQASSNSDP---FGEPSGEPSGDNIS--------PQAGS
: .: :. .. . .: : . : : .. ::::
NP_001 ---QASPTGQPTALQPNPLDLFKTSAPAPVGPLVGLGGVTVTLPQAGPWNTASLVFNQSP
470 480 490 500 510 520
NP_001 SMAPGAMMGGQPSGFSQPVIFGTSPAVSGWNQPSPFAASTPPPVPVVWGPSASVAPNAWS
530 540 550 560 570 580
>--
initn: 251 init1: 198 opt: 371 Z-score: 214.4 bits: 50.0 E(85289): 3.3e-05
Smith-Waterman score: 377; 37.6% identity (54.9% similar) in 266 aa overlap (311-540:521-768)
290 300 310 320 330
pF1KSD ASADVFSSVPFGTAAVPSGYVAMGAVLPSFWGQQPLVQQQMVMGAQPP-VAQ-VMPGAQP
..:.: . .::.:: .: :. :..:
NP_001 APAPVGPLVGLGGVTVTLPQAGPWNTASLVFNQSPSMAPGAMMGGQPSGFSQPVIFGTSP
500 510 520 530 540 550
340 350 360 370 380
pF1KSD IA--WGQPGLFPA-TQQPWPTVAG---QFPPAAFM-------PTQT-VMPLPAAMFQGP-
. :.::. : : : : :.: : . : :. : :. ..: ::. : :
NP_001 AVSGWNQPSPFAASTPPPVPVVWGPSASVAPNAWSTTSPLGNPFQSNIFPAPAVSTQPPS
560 570 580 590 600 610
390 400 410 420
pF1KSD ------LTPLATVP--G-----TSDS-TRSSPQTDKPRQKMGKETFKDFQMAQPPPVPSR
.:: : : .::. : .: :: . . :: :::::. ::: ::.:
NP_001 MHSSLLVTPPQPPPRAGPPKDISSDAFTALDPLGDKEIKDV-KEMFKDFQLRQPPAVPAR
620 630 640 650 660
430 440 450 460 470 480
pF1KSD KPDQPSLTCTSEAFSSYFN-KVGVAQDTDDCDDFDISQLNLTPVTSTTPSTNSPPTPAPR
: .: : . : ::.:::: :::. :.. : :::: .:: :. . : :: ::::
NP_001 KGEQTS-SGTLSAFASYFNSKVGIPQENADHDDFDANQL-LNKI-------NEPPKPAPR
670 680 690 700 710 720
490 500 510 520 530 540
pF1KSD QSS-PSKSSASHASDPTTDDIFEEGFESPSKSEEQEAPDGSQASSNS---DPFGEPSGEP
: : : .: ::. ::. : . : . : . .:: :. ::::.:
NP_001 QVSLPVTKS--------TDNAFENPFFKDSFGSSQASVASSQPVSSEMYRDPFGNPFA
730 740 750 760 770
550
pF1KSD SGDNISPQAGS
>>XP_016859793 (OMIM: 608165) PREDICTED: PTB domain-cont (366 aa)
initn: 284 init1: 208 opt: 283 Z-score: 173.0 bits: 41.2 E(85289): 0.0067
Smith-Waterman score: 316; 25.2% identity (52.6% similar) in 369 aa overlap (19-363:6-346)
10 20 30 40 50
pF1KSD MSTETELQVAVKTSAKKDSRKKGQD--RSEATLIKRFKGEGVRYKAKLIGIDEVSAARGD
:::: . .. .: :.: . :.::..: :: .:
XP_016 MNRAFSRKKDKTWMHTPEALSKHF----IPYNAKFLGSTEVEQPKGT
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KSD KLCQDSMMKLKGVVAGARSKGEHKQKIFLTISFGGIKIFDEKTGALQHHHAVHEISYIAK
.. .:.. ::: . .:.:.. :. : ::. :.::.. :: .::. .:.::. :
XP_016 EVVRDAVRKLKFARHIKKSEGQKIPKVELQISIYGVKILEPKTKEVQHNCQLHRISFCAD
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KSD DITDHRAFGYVC-GKEGN-HRFVAIKTAQAAEPVILDLRDLFQLIYELKQREELEKKAQK
: ::.: : ..: .:.: : .. . . :: . : . . :.: :. : : : ..
XP_016 DKTDKRIFTFICKDSESNKHLCYVFDSEKCAEEITLTIGQAFDLAYR-KFLESGGKDVET
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220
pF1KSD DKQCE--QAVYQTI------LEEDVEDPVYQYIVFEAGHEPIRD--PETEENIYQVPTSQ
:: : : . :.. :.: : . ... :. . :....: .:.
XP_016 RKQIAGLQKRIQDLETENMELKNKVQDLENQLRITQVSAPPLLHNMSDHEQHVFQRCSSS
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270
pF1KSD KKEGVYDVPKSQPVSAVTQLEL--------FGDMSTPPDITSPPTPATPGDAFIPSSSQT
.. : .:... . .: . ::. . : :.. .. : ...
XP_016 FWRSNGDSSPCLNISSISVTPINSPDSRLSLGLLIPPPSKCGFPKPVSESSIPRPHAGSM
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KSD LPAS--ADVFSSVPFGTAAVPSGYVAMGAVLPSFWGQQPLVQQQMVMGAQPPVAQVMPGA
: : .:.:. .::. : .. . .:. : :: : . . . . . ::
XP_016 TPKSPSTDIFDMIPFS----P---ISHQSSMPTRNGTQP----PPVPSRSTEIKRDLFGA
290 300 310 320 330
340 350 360 370 380 390
pF1KSD QPIAWGQPGLFPATQQPWPTVAGQFPPAAFMPTQTVMPLPAAMFQGPLTPLATVPGTSDS
.:. .:. :..:::
XP_016 EPF------------DPFNCGAADFPPDIQSKLDEMQRQRWRGSKWD
340 350 360
>>XP_016859794 (OMIM: 608165) PREDICTED: PTB domain-cont (366 aa)
initn: 284 init1: 208 opt: 283 Z-score: 173.0 bits: 41.2 E(85289): 0.0067
Smith-Waterman score: 316; 25.2% identity (52.6% similar) in 369 aa overlap (19-363:6-346)
10 20 30 40 50
pF1KSD MSTETELQVAVKTSAKKDSRKKGQD--RSEATLIKRFKGEGVRYKAKLIGIDEVSAARGD
:::: . .. .: :.: . :.::..: :: .:
XP_016 MNRAFSRKKDKTWMHTPEALSKHF----IPYNAKFLGSTEVEQPKGT
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KSD KLCQDSMMKLKGVVAGARSKGEHKQKIFLTISFGGIKIFDEKTGALQHHHAVHEISYIAK
.. .:.. ::: . .:.:.. :. : ::. :.::.. :: .::. .:.::. :
XP_016 EVVRDAVRKLKFARHIKKSEGQKIPKVELQISIYGVKILEPKTKEVQHNCQLHRISFCAD
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KSD DITDHRAFGYVC-GKEGN-HRFVAIKTAQAAEPVILDLRDLFQLIYELKQREELEKKAQK
: ::.: : ..: .:.: : .. . . :: . : . . :.: :. : : : ..
XP_016 DKTDKRIFTFICKDSESNKHLCYVFDSEKCAEEITLTIGQAFDLAYR-KFLESGGKDVET
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220
pF1KSD DKQCE--QAVYQTI------LEEDVEDPVYQYIVFEAGHEPIRD--PETEENIYQVPTSQ
:: : : . :.. :.: : . ... :. . :....: .:.
XP_016 RKQIAGLQKRIQDLETENMELKNKVQDLENQLRITQVSAPPLLHNMSDHEQHVFQRCSSS
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270
pF1KSD KKEGVYDVPKSQPVSAVTQLEL--------FGDMSTPPDITSPPTPATPGDAFIPSSSQT
.. : .:... . .: . ::. . : :.. .. : ...
XP_016 FWRSNGDSSPCLNISSISVTPINSPDSRLSLGLLIPPPSKCGFPKPVSESSIPRPHAGSM
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KSD LPAS--ADVFSSVPFGTAAVPSGYVAMGAVLPSFWGQQPLVQQQMVMGAQPPVAQVMPGA
: : .:.:. .::. : .. . .:. : :: : . . . . . ::
XP_016 TPKSPSTDIFDMIPFS----P---ISHQSSMPTRNGTQP----PPVPSRSTEIKRDLFGA
290 300 310 320 330
340 350 360 370 380 390
pF1KSD QPIAWGQPGLFPATQQPWPTVAGQFPPAAFMPTQTVMPLPAAMFQGPLTPLATVPGTSDS
.:. .:. :..:::
XP_016 EPF------------DPFNCGAADFPPDIQSKLDEMQRQRWRGSKWD
340 350 360
>>XP_016859792 (OMIM: 608165) PREDICTED: PTB domain-cont (366 aa)
initn: 284 init1: 208 opt: 283 Z-score: 173.0 bits: 41.2 E(85289): 0.0067
Smith-Waterman score: 316; 25.2% identity (52.6% similar) in 369 aa overlap (19-363:6-346)
10 20 30 40 50
pF1KSD MSTETELQVAVKTSAKKDSRKKGQD--RSEATLIKRFKGEGVRYKAKLIGIDEVSAARGD
:::: . .. .: :.: . :.::..: :: .:
XP_016 MNRAFSRKKDKTWMHTPEALSKHF----IPYNAKFLGSTEVEQPKGT
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KSD KLCQDSMMKLKGVVAGARSKGEHKQKIFLTISFGGIKIFDEKTGALQHHHAVHEISYIAK
.. .:.. ::: . .:.:.. :. : ::. :.::.. :: .::. .:.::. :
XP_016 EVVRDAVRKLKFARHIKKSEGQKIPKVELQISIYGVKILEPKTKEVQHNCQLHRISFCAD
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KSD DITDHRAFGYVC-GKEGN-HRFVAIKTAQAAEPVILDLRDLFQLIYELKQREELEKKAQK
: ::.: : ..: .:.: : .. . . :: . : . . :.: :. : : : ..
XP_016 DKTDKRIFTFICKDSESNKHLCYVFDSEKCAEEITLTIGQAFDLAYR-KFLESGGKDVET
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220
pF1KSD DKQCE--QAVYQTI------LEEDVEDPVYQYIVFEAGHEPIRD--PETEENIYQVPTSQ
:: : : . :.. :.: : . ... :. . :....: .:.
XP_016 RKQIAGLQKRIQDLETENMELKNKVQDLENQLRITQVSAPPLLHNMSDHEQHVFQRCSSS
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270
pF1KSD KKEGVYDVPKSQPVSAVTQLEL--------FGDMSTPPDITSPPTPATPGDAFIPSSSQT
.. : .:... . .: . ::. . : :.. .. : ...
XP_016 FWRSNGDSSPCLNISSISVTPINSPDSRLSLGLLIPPPSKCGFPKPVSESSIPRPHAGSM
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KSD LPAS--ADVFSSVPFGTAAVPSGYVAMGAVLPSFWGQQPLVQQQMVMGAQPPVAQVMPGA
: : .:.:. .::. : .. . .:. : :: : . . . . . ::
XP_016 TPKSPSTDIFDMIPFS----P---ISHQSSMPTRNGTQP----PPVPSRSTEIKRDLFGA
290 300 310 320 330
340 350 360 370 380 390
pF1KSD QPIAWGQPGLFPATQQPWPTVAGQFPPAAFMPTQTVMPLPAAMFQGPLTPLATVPGTSDS
.:. .:. :..:::
XP_016 EPF------------DPFNCGAADFPPDIQSKLDEMQRQRWRGSKWD
340 350 360
>>XP_011509631 (OMIM: 608165) PREDICTED: PTB domain-cont (376 aa)
initn: 284 init1: 208 opt: 283 Z-score: 172.9 bits: 41.2 E(85289): 0.0069
Smith-Waterman score: 316; 25.2% identity (52.6% similar) in 369 aa overlap (19-363:6-346)
10 20 30 40 50
pF1KSD MSTETELQVAVKTSAKKDSRKKGQD--RSEATLIKRFKGEGVRYKAKLIGIDEVSAARGD
:::: . .. .: :.: . :.::..: :: .:
XP_011 MNRAFSRKKDKTWMHTPEALSKHF----IPYNAKFLGSTEVEQPKGT
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KSD KLCQDSMMKLKGVVAGARSKGEHKQKIFLTISFGGIKIFDEKTGALQHHHAVHEISYIAK
.. .:.. ::: . .:.:.. :. : ::. :.::.. :: .::. .:.::. :
XP_011 EVVRDAVRKLKFARHIKKSEGQKIPKVELQISIYGVKILEPKTKEVQHNCQLHRISFCAD
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KSD DITDHRAFGYVC-GKEGN-HRFVAIKTAQAAEPVILDLRDLFQLIYELKQREELEKKAQK
: ::.: : ..: .:.: : .. . . :: . : . . :.: :. : : : ..
XP_011 DKTDKRIFTFICKDSESNKHLCYVFDSEKCAEEITLTIGQAFDLAYR-KFLESGGKDVET
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220
pF1KSD DKQCE--QAVYQTI------LEEDVEDPVYQYIVFEAGHEPIRD--PETEENIYQVPTSQ
:: : : . :.. :.: : . ... :. . :....: .:.
XP_011 RKQIAGLQKRIQDLETENMELKNKVQDLENQLRITQVSAPPLLHNMSDHEQHVFQRCSSS
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270
pF1KSD KKEGVYDVPKSQPVSAVTQLEL--------FGDMSTPPDITSPPTPATPGDAFIPSSSQT
.. : .:... . .: . ::. . : :.. .. : ...
XP_011 FWRSNGDSSPCLNISSISVTPINSPDSRLSLGLLIPPPSKCGFPKPVSESSIPRPHAGSM
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KSD LPAS--ADVFSSVPFGTAAVPSGYVAMGAVLPSFWGQQPLVQQQMVMGAQPPVAQVMPGA
: : .:.:. .::. : .. . .:. : :: : . . . . . ::
XP_011 TPKSPSTDIFDMIPFS----P---ISHQSSMPTRNGTQP----PPVPSRSTEIKRDLFGA
290 300 310 320 330
340 350 360 370 380 390
pF1KSD QPIAWGQPGLFPATQQPWPTVAGQFPPAAFMPTQTVMPLPAAMFQGPLTPLATVPGTSDS
.:. .:. :..:::
XP_011 EPF------------DPFNCGAADFPPDIQSKLDEMQFIYGRIQTDTNYMKLIEKRQ
340 350 360 370
>>XP_006712645 (OMIM: 608165) PREDICTED: PTB domain-cont (379 aa)
initn: 284 init1: 208 opt: 283 Z-score: 172.8 bits: 41.2 E(85289): 0.0069
Smith-Waterman score: 316; 25.2% identity (52.6% similar) in 369 aa overlap (19-363:6-346)
10 20 30 40 50
pF1KSD MSTETELQVAVKTSAKKDSRKKGQD--RSEATLIKRFKGEGVRYKAKLIGIDEVSAARGD
:::: . .. .: :.: . :.::..: :: .:
XP_006 MNRAFSRKKDKTWMHTPEALSKHF----IPYNAKFLGSTEVEQPKGT
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KSD KLCQDSMMKLKGVVAGARSKGEHKQKIFLTISFGGIKIFDEKTGALQHHHAVHEISYIAK
.. .:.. ::: . .:.:.. :. : ::. :.::.. :: .::. .:.::. :
XP_006 EVVRDAVRKLKFARHIKKSEGQKIPKVELQISIYGVKILEPKTKEVQHNCQLHRISFCAD
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KSD DITDHRAFGYVC-GKEGN-HRFVAIKTAQAAEPVILDLRDLFQLIYELKQREELEKKAQK
: ::.: : ..: .:.: : .. . . :: . : . . :.: :. : : : ..
XP_006 DKTDKRIFTFICKDSESNKHLCYVFDSEKCAEEITLTIGQAFDLAYR-KFLESGGKDVET
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220
pF1KSD DKQCE--QAVYQTI------LEEDVEDPVYQYIVFEAGHEPIRD--PETEENIYQVPTSQ
:: : : . :.. :.: : . ... :. . :....: .:.
XP_006 RKQIAGLQKRIQDLETENMELKNKVQDLENQLRITQVSAPPLLHNMSDHEQHVFQRCSSS
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270
pF1KSD KKEGVYDVPKSQPVSAVTQLEL--------FGDMSTPPDITSPPTPATPGDAFIPSSSQT
.. : .:... . .: . ::. . : :.. .. : ...
XP_006 FWRSNGDSSPCLNISSISVTPINSPDSRLSLGLLIPPPSKCGFPKPVSESSIPRPHAGSM
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KSD LPAS--ADVFSSVPFGTAAVPSGYVAMGAVLPSFWGQQPLVQQQMVMGAQPPVAQVMPGA
: : .:.:. .::. : .. . .:. : :: : . . . . . ::
XP_006 TPKSPSTDIFDMIPFS----P---ISHQSSMPTRNGTQP----PPVPSRSTEIKRDLFGA
290 300 310 320 330
340 350 360 370 380 390
pF1KSD QPIAWGQPGLFPATQQPWPTVAGQFPPAAFMPTQTVMPLPAAMFQGPLTPLATVPGTSDS
.:. .:. :..:::
XP_006 EPF------------DPFNCGAADFPPDIQSKLDEMQEGFKMGLTLEGTVFCLDPLDSRC
340 350 360 370
>>XP_006712646 (OMIM: 608165) PREDICTED: PTB domain-cont (379 aa)
initn: 284 init1: 208 opt: 283 Z-score: 172.8 bits: 41.2 E(85289): 0.0069
Smith-Waterman score: 316; 25.2% identity (52.6% similar) in 369 aa overlap (19-363:6-346)
10 20 30 40 50
pF1KSD MSTETELQVAVKTSAKKDSRKKGQD--RSEATLIKRFKGEGVRYKAKLIGIDEVSAARGD
:::: . .. .: :.: . :.::..: :: .:
XP_006 MNRAFSRKKDKTWMHTPEALSKHF----IPYNAKFLGSTEVEQPKGT
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KSD KLCQDSMMKLKGVVAGARSKGEHKQKIFLTISFGGIKIFDEKTGALQHHHAVHEISYIAK
.. .:.. ::: . .:.:.. :. : ::. :.::.. :: .::. .:.::. :
XP_006 EVVRDAVRKLKFARHIKKSEGQKIPKVELQISIYGVKILEPKTKEVQHNCQLHRISFCAD
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KSD DITDHRAFGYVC-GKEGN-HRFVAIKTAQAAEPVILDLRDLFQLIYELKQREELEKKAQK
: ::.: : ..: .:.: : .. . . :: . : . . :.: :. : : : ..
XP_006 DKTDKRIFTFICKDSESNKHLCYVFDSEKCAEEITLTIGQAFDLAYR-KFLESGGKDVET
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220
pF1KSD DKQCE--QAVYQTI------LEEDVEDPVYQYIVFEAGHEPIRD--PETEENIYQVPTSQ
:: : : . :.. :.: : . ... :. . :....: .:.
XP_006 RKQIAGLQKRIQDLETENMELKNKVQDLENQLRITQVSAPPLLHNMSDHEQHVFQRCSSS
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270
pF1KSD KKEGVYDVPKSQPVSAVTQLEL--------FGDMSTPPDITSPPTPATPGDAFIPSSSQT
.. : .:... . .: . ::. . : :.. .. : ...
XP_006 FWRSNGDSSPCLNISSISVTPINSPDSRLSLGLLIPPPSKCGFPKPVSESSIPRPHAGSM
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KSD LPAS--ADVFSSVPFGTAAVPSGYVAMGAVLPSFWGQQPLVQQQMVMGAQPPVAQVMPGA
: : .:.:. .::. : .. . .:. : :: : . . . . . ::
XP_006 TPKSPSTDIFDMIPFS----P---ISHQSSMPTRNGTQP----PPVPSRSTEIKRDLFGA
290 300 310 320 330
340 350 360 370 380 390
pF1KSD QPIAWGQPGLFPATQQPWPTVAGQFPPAAFMPTQTVMPLPAAMFQGPLTPLATVPGTSDS
.:. .:. :..:::
XP_006 EPF------------DPFNCGAADFPPDIQSKLDEMQEGFKMGLTLEGTVFCLDPLDSRC
340 350 360 370
>>XP_006712647 (OMIM: 608165) PREDICTED: PTB domain-cont (379 aa)
initn: 284 init1: 208 opt: 283 Z-score: 172.8 bits: 41.2 E(85289): 0.0069
Smith-Waterman score: 316; 25.2% identity (52.6% similar) in 369 aa overlap (19-363:6-346)
10 20 30 40 50
pF1KSD MSTETELQVAVKTSAKKDSRKKGQD--RSEATLIKRFKGEGVRYKAKLIGIDEVSAARGD
:::: . .. .: :.: . :.::..: :: .:
XP_006 MNRAFSRKKDKTWMHTPEALSKHF----IPYNAKFLGSTEVEQPKGT
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KSD KLCQDSMMKLKGVVAGARSKGEHKQKIFLTISFGGIKIFDEKTGALQHHHAVHEISYIAK
.. .:.. ::: . .:.:.. :. : ::. :.::.. :: .::. .:.::. :
XP_006 EVVRDAVRKLKFARHIKKSEGQKIPKVELQISIYGVKILEPKTKEVQHNCQLHRISFCAD
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KSD DITDHRAFGYVC-GKEGN-HRFVAIKTAQAAEPVILDLRDLFQLIYELKQREELEKKAQK
: ::.: : ..: .:.: : .. . . :: . : . . :.: :. : : : ..
XP_006 DKTDKRIFTFICKDSESNKHLCYVFDSEKCAEEITLTIGQAFDLAYR-KFLESGGKDVET
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220
pF1KSD DKQCE--QAVYQTI------LEEDVEDPVYQYIVFEAGHEPIRD--PETEENIYQVPTSQ
:: : : . :.. :.: : . ... :. . :....: .:.
XP_006 RKQIAGLQKRIQDLETENMELKNKVQDLENQLRITQVSAPPLLHNMSDHEQHVFQRCSSS
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270
pF1KSD KKEGVYDVPKSQPVSAVTQLEL--------FGDMSTPPDITSPPTPATPGDAFIPSSSQT
.. : .:... . .: . ::. . : :.. .. : ...
XP_006 FWRSNGDSSPCLNISSISVTPINSPDSRLSLGLLIPPPSKCGFPKPVSESSIPRPHAGSM
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KSD LPAS--ADVFSSVPFGTAAVPSGYVAMGAVLPSFWGQQPLVQQQMVMGAQPPVAQVMPGA
: : .:.:. .::. : .. . .:. : :: : . . . . . ::
XP_006 TPKSPSTDIFDMIPFS----P---ISHQSSMPTRNGTQP----PPVPSRSTEIKRDLFGA
290 300 310 320 330
340 350 360 370 380 390
pF1KSD QPIAWGQPGLFPATQQPWPTVAGQFPPAAFMPTQTVMPLPAAMFQGPLTPLATVPGTSDS
.:. .:. :..:::
XP_006 EPF------------DPFNCGAADFPPDIQSKLDEMQEGFKMGLTLEGTVFCLDPLDSRC
340 350 360 370
555 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 08:09:55 2016 done: Thu Nov 3 08:09:57 2016
Total Scan time: 12.730 Total Display time: 0.080
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]