Result of FASTA (omim) for
pF1KSDB0018
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDB0018, 880 aa
1>>>pF1KSDB0018 880 - 880 aa - 880 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.1237+/-0.000339; mu= -0.4530+/- 0.021
mean_var=276.1390+/-55.475, 0's: 0 Z-trim(123.9): 112 B-trim: 92 in 1/55
Lambda= 0.077181
statistics sampled from 44399 (44544) to 44399 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.794), E-opt: 0.2 (0.522), width: 16
Scan time: 16.070
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_644814 (OMIM: 611398) GAS2-like protein 2 [Homo ( 880) 6109 694.0 8.2e-199
XP_011528127 (OMIM: 602128) PREDICTED: GAS2-like p ( 681) 788 101.4 1.5e-20
XP_011528126 (OMIM: 602128) PREDICTED: GAS2-like p ( 681) 788 101.4 1.5e-20
XP_016884022 (OMIM: 602128) PREDICTED: GAS2-like p ( 681) 788 101.4 1.5e-20
NP_689422 (OMIM: 602128) GAS2-like protein 1 isofo ( 681) 788 101.4 1.5e-20
NP_006469 (OMIM: 602128) GAS2-like protein 1 isofo ( 681) 788 101.4 1.5e-20
NP_001265659 (OMIM: 602128) GAS2-like protein 1 is ( 454) 755 97.6 1.4e-19
NP_808221 (OMIM: 602835) growth arrest-specific pr ( 313) 697 91.0 9.3e-18
XP_016873019 (OMIM: 602835) PREDICTED: growth arre ( 313) 697 91.0 9.3e-18
XP_016873018 (OMIM: 602835) PREDICTED: growth arre ( 313) 697 91.0 9.3e-18
NP_001137302 (OMIM: 602835) growth arrest-specific ( 313) 697 91.0 9.3e-18
XP_016873020 (OMIM: 602835) PREDICTED: growth arre ( 313) 697 91.0 9.3e-18
XP_016873017 (OMIM: 602835) PREDICTED: growth arre ( 313) 697 91.0 9.3e-18
NP_005247 (OMIM: 602835) growth arrest-specific pr ( 313) 697 91.0 9.3e-18
XP_011518274 (OMIM: 602835) PREDICTED: growth arre ( 331) 557 75.5 4.8e-13
XP_011518273 (OMIM: 602835) PREDICTED: growth arre ( 331) 557 75.5 4.8e-13
XP_011518277 (OMIM: 602835) PREDICTED: growth arre ( 247) 540 73.5 1.4e-12
XP_011518280 (OMIM: 602835) PREDICTED: growth arre ( 243) 539 73.4 1.5e-12
XP_016873021 (OMIM: 602835) PREDICTED: growth arre ( 280) 538 73.3 1.8e-12
NP_036222 (OMIM: 608271) microtubule-actin cross-l (5430) 288 46.4 0.0044
XP_016856371 (OMIM: 608271) PREDICTED: microtubule (5569) 288 46.4 0.0045
XP_016856363 (OMIM: 608271) PREDICTED: microtubule (7654) 288 46.5 0.0058
XP_006710585 (OMIM: 608271) PREDICTED: microtubule (7657) 288 46.5 0.0058
>>NP_644814 (OMIM: 611398) GAS2-like protein 2 [Homo sap (880 aa)
initn: 6109 init1: 6109 opt: 6109 Z-score: 3690.3 bits: 694.0 E(85289): 8.2e-199
Smith-Waterman score: 6109; 100.0% identity (100.0% similar) in 880 aa overlap (1-880:1-880)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSQPAGGRRKPRTLGPPVCSIRPFKSSEQYLEAMKEDLAEWLRDLYGLDIDAANFLQVLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_644 MSQPAGGRRKPRTLGPPVCSIRPFKSSEQYLEAMKEDLAEWLRDLYGLDIDAANFLQVLE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD TGLVLCQHANVVTDAALAFLAEAPAQAQKIPMPRVGVSCNGAAQPGTFQARDNVSNFIQW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_644 TGLVLCQHANVVTDAALAFLAEAPAQAQKIPMPRVGVSCNGAAQPGTFQARDNVSNFIQW
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD CRKEMGIQEVLMFETEDLVLRKNVKNVVLCLLELGRRAWRFGVAAPTLVQLEEEIEEEVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_644 CRKEMGIQEVLMFETEDLVLRKNVKNVVLCLLELGRRAWRFGVAAPTLVQLEEEIEEEVR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD RELALPPPDPSPPAPPRRQPCHFRNLDQMVQSLVSHCTCPVQFSMVKVSEGKYRVGDSNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_644 RELALPPPDPSPPAPPRRQPCHFRNLDQMVQSLVSHCTCPVQFSMVKVSEGKYRVGDSNT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD LIFIRILRNHVMVRVGGGWDTLGHYLDKHDPCRCTSLSHKPGSFLKPPAPPVQHEVRVQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_644 LIFIRILRNHVMVRVGGGWDTLGHYLDKHDPCRCTSLSHKPGSFLKPPAPPVQHEVRVQD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD GPSQTQPTMTISRSQSPPPPVDWKTYTSSDRRLRPPTPSSPRPRRERGAGTGASREMAPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_644 GPSQTQPTMTISRSQSPPPPVDWKTYTSSDRRLRPPTPSSPRPRRERGAGTGASREMAPF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD LRCQERSLIPSWRQPTAGDSPPSPQSSSTQKGRDPQCTSSGKREERYPPELPRGRIPTSW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_644 LRCQERSLIPSWRQPTAGDSPPSPQSSSTQKGRDPQCTSSGKREERYPPELPRGRIPTSW
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD VHEETDSWGTDAGNPTPQRLRAIEATTKGISARGPSPLPRSFGPAECLGLRLPLRDEAKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_644 VHEETDSWGTDAGNPTPQRLRAIEATTKGISARGPSPLPRSFGPAECLGLRLPLRDEAKG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD AFFQFREPESVRSPTPVQGLTKIPIRLPPARPPTPGRSFPGATSGSPRTELGRDPIPLRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_644 AFFQFREPESVRSPTPVQGLTKIPIRLPPARPPTPGRSFPGATSGSPRTELGRDPIPLRA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD VTVDLAGSTHGDCSVEVRQEDQQLDIQVMAEARESWDLGLQEQEGRYTPLPLGGNKEQAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_644 VTVDLAGSTHGDCSVEVRQEDQQLDIQVMAEARESWDLGLQEQEGRYTPLPLGGNKEQAI
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD YCSLEEEILGNMKLLEVRSACPQGTRSGVIPRSGVYIPRLAGQWPEPGGPYDKAIQELAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_644 YCSLEEEILGNMKLLEVRSACPQGTRSGVIPRSGVYIPRLAGQWPEPGGPYDKAIQELAQ
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD GSPSLLKVDLEAWKAAPTGSPKPAVTPGPGSLKGKLGARQSGPRTKASLSAKGTHMRKVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_644 GSPSLLKVDLEAWKAAPTGSPKPAVTPGPGSLKGKLGARQSGPRTKASLSAKGTHMRKVP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD PQGGQDCSASTVSASPEAPTPSPLDPNSDKAKACLSKGRRTLRKPKRVPSIYKLKLRPRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_644 PQGGQDCSASTVSASPEAPTPSPLDPNSDKAKACLSKGRRTLRKPKRVPSIYKLKLRPRI
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD RPRRDHRPEKQPSRIPRPLAYVFLGPARQPPKDRLLRAVLGSKGGEASRVDGASVGEEEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_644 RPRRDHRPEKQPSRIPRPLAYVFLGPARQPPKDRLLRAVLGSKGGEASRVDGASVGEEEE
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880
pF1KSD EGKEEKEPAAPLESSPQPPEGLQPHWLNQAPLPPEEESWV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_644 EGKEEKEPAAPLESSPQPPEGLQPHWLNQAPLPPEEESWV
850 860 870 880
>>XP_011528127 (OMIM: 602128) PREDICTED: GAS2-like prote (681 aa)
initn: 1196 init1: 469 opt: 788 Z-score: 489.8 bits: 101.4 E(85289): 1.5e-20
Smith-Waterman score: 1187; 37.4% identity (54.6% similar) in 815 aa overlap (1-788:1-659)
10 20 30 40 50
pF1KSD MSQPAGGRRKPRTLGPPVCSIRPFKSSEQYLEAMKEDLAEWLRDLYGLDIDAAN--FLQV
:..:..: : . :.:::.::: :.::::::::::: :::: . ... ::
XP_011 MADPVAG-----IAGSAAKSVRPFRSSEAYVEAMKEDLAEWLNALYGLGLPGGGDGFLTG
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD LETGLVLCQHANVVTDAALAFLAEAPAQAQKIPMPRVGVSCNG-AAQPGTFQARDNVSNF
: :: .::::::.::.:: :. : ::. ::. .. .. ::.:.:::::..:
XP_011 LATGTTLCQHANAVTEAARALAAARPAR---------GVAFQAHSVVPGSFMARDNVATF
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KSD IQWCRKEMGIQEVLMFETEDLVLRKNVKNVVLCLLELGRRAWRFGVAAPTLVQLEEEIEE
: ::: :.:. ::::::::::::::: :.:::::::..::. :.:. :: :::.:.:::.
XP_011 IGWCRVELGVPEVLMFETEDLVLRKNEKSVVLCLLEVARRGARLGLLAPRLVQFEQEIER
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220
pF1KSD EVRRELALPPPDPSP----------PAP------PRRQPCHFRNLDQMVQSLVSHCTCPV
:.: : :: .: ::: :: : .::::..:. ....::::
XP_011 ELR---AAPPAPNAPAAGEDTTETAPAPGTPARGPRMTPSDLRNLDELVREILGRCTCPD
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KSD QFSMVKVSEGKYRVGDSNTLIFIRILRNHVMVRVGGGWDTLGHYLDKHDPCRCTSLSHKP
:: :.::::::::::::. :::.:.::.::::::::::::: :::::::::::.: .:.:
XP_011 QFPMIKVSEGKYRVGDSSLLIFVRVLRSHVMVRVGGGWDTLEHYLDKHDPCRCSSTAHRP
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330
pF1KSD GSFLKPPAPPVQHEVRVQDGPSQTQPTMTISRSQSPPPPVDWKTYTSSDRR-LRPP-TPS
: : : .:....:: : : :: : .:.:: :: ::
XP_011 ------PQPRV-----CTFSPQRVSPT-TSPRPASPVP--------GSERRGSRPEMTPV
290 300 310 320
340 350 360 370 380 390
pF1KSD SPRPRRERGAGTGASREMAPFLRCQERSLIPSWRQPT-AGDSPPSPQSSSTQK-GRDPQC
: : .: : : : : : : : :. .::: : .:... : .
XP_011 SLRSTKE---GP----ETPPRPRDQ---LPPHPRSRRYSGDSDSSASSAQSGPLGTRSDD
330 340 350 360 370
400 410 420 430 440 450
pF1KSD TSSGKREERYPPELPRGRIPTSWVHEETDSWGTDAGNPTPQRLRAIEATTKGISARGPSP
:..: :.:: : :. : :: : .:.: :... .. ::
XP_011 TGTGPRRER-----PSRRLTT----------GTPA---SPRRPPALRSQSRDRLDRGR--
380 390 400 410
460 470 480 490 500 510
pF1KSD LPRSFGPAECLGLRLPLRDEAKGAFFQFREPESV---RSPTPVQGLTKIPIRLPPARPPT
:: : : .: . . :. : : :: ..: : : . .: :
XP_011 -PR--GAPGGRGAQLSVPSPARRARSQSREEQAVLLVRRDRDGQH-SWVP------R---
420 430 440 450 460
520 530 540 550 560 570
pF1KSD PGRSFPGATSGSPRTELGRDPIPLRAVTVDLAGSTHGDCSVEVRQEDQQLDIQVMAEARE
::. :. ..:.: .:.: : : .
XP_011 -GRGSGGSGRSTPQTPRARSPAAPRLSRV----------------------------SSP
470 480 490
580 590 600 610 620 630
pF1KSD SWDLGLQEQEGRYTPLPLGGNKEQAIYCSLEEEILGNMKLLE-VRSACPQGTRSGVIPRS
: .:: ::: : ..:: .. ::::.:.: . :: : :. : .: :
XP_011 SPELGTTPASIFRTPLQLDPQQEQQLFRRLEEEFLANARALEAVASVTP----TGPAPD-
500 510 520 530 540
640 650 660 670 680 690
pF1KSD GVYIPRLAGQWPEPGGPYDKAIQELAQGSPSLLKVDLEAWKAAPTGSPKPAVTPGPGSLK
: : :.: .: :.: ...: :: . .. :.: :. .
XP_011 ----PARA---PDPPAP-DSAYCSSSSSSSSLSVL------GGKCGQP--------GD-S
550 560 570 580
700 710 720 730 740 750
pF1KSD GKLGARQSGPRTKASLSAKGTHMRKVPPQGGQDCSASTVSASPEAPTPSPLDPNSDKAKA
:. . :::..: ::... . : .:: . .:: : : .:. :..
XP_011 GRTANGLPGPRSQA-LSSSSDEGSPCPGMGGP----LDAPGSPLACT----EPSRTWARG
590 600 610 620 630
760 770 780 790 800 810
pF1KSD CLSKGRRTLRKPKRVPSIYKLKLRPRIRPRRDHRPEKQPSRIPRPLAYVFLGPARQPPKD
.. . :::.:.:. :: ::: :
XP_011 RMDT--QPDRKPSRIPT-------PR-GPRRPSGPAELGTWHALHSVTPRAEPDSWM
640 650 660 670 680
820 830 840 850 860 870
pF1KSD RLLRAVLGSKGGEASRVDGASVGEEEEEGKEEKEPAAPLESSPQPPEGLQPHWLNQAPLP
>>XP_011528126 (OMIM: 602128) PREDICTED: GAS2-like prote (681 aa)
initn: 1196 init1: 469 opt: 788 Z-score: 489.8 bits: 101.4 E(85289): 1.5e-20
Smith-Waterman score: 1187; 37.4% identity (54.6% similar) in 815 aa overlap (1-788:1-659)
10 20 30 40 50
pF1KSD MSQPAGGRRKPRTLGPPVCSIRPFKSSEQYLEAMKEDLAEWLRDLYGLDIDAAN--FLQV
:..:..: : . :.:::.::: :.::::::::::: :::: . ... ::
XP_011 MADPVAG-----IAGSAAKSVRPFRSSEAYVEAMKEDLAEWLNALYGLGLPGGGDGFLTG
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD LETGLVLCQHANVVTDAALAFLAEAPAQAQKIPMPRVGVSCNG-AAQPGTFQARDNVSNF
: :: .::::::.::.:: :. : ::. ::. .. .. ::.:.:::::..:
XP_011 LATGTTLCQHANAVTEAARALAAARPAR---------GVAFQAHSVVPGSFMARDNVATF
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KSD IQWCRKEMGIQEVLMFETEDLVLRKNVKNVVLCLLELGRRAWRFGVAAPTLVQLEEEIEE
: ::: :.:. ::::::::::::::: :.:::::::..::. :.:. :: :::.:.:::.
XP_011 IGWCRVELGVPEVLMFETEDLVLRKNEKSVVLCLLEVARRGARLGLLAPRLVQFEQEIER
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220
pF1KSD EVRRELALPPPDPSP----------PAP------PRRQPCHFRNLDQMVQSLVSHCTCPV
:.: : :: .: ::: :: : .::::..:. ....::::
XP_011 ELR---AAPPAPNAPAAGEDTTETAPAPGTPARGPRMTPSDLRNLDELVREILGRCTCPD
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KSD QFSMVKVSEGKYRVGDSNTLIFIRILRNHVMVRVGGGWDTLGHYLDKHDPCRCTSLSHKP
:: :.::::::::::::. :::.:.::.::::::::::::: :::::::::::.: .:.:
XP_011 QFPMIKVSEGKYRVGDSSLLIFVRVLRSHVMVRVGGGWDTLEHYLDKHDPCRCSSTAHRP
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330
pF1KSD GSFLKPPAPPVQHEVRVQDGPSQTQPTMTISRSQSPPPPVDWKTYTSSDRR-LRPP-TPS
: : : .:....:: : : :: : .:.:: :: ::
XP_011 ------PQPRV-----CTFSPQRVSPT-TSPRPASPVP--------GSERRGSRPEMTPV
290 300 310 320
340 350 360 370 380 390
pF1KSD SPRPRRERGAGTGASREMAPFLRCQERSLIPSWRQPT-AGDSPPSPQSSSTQK-GRDPQC
: : .: : : : : : : : :. .::: : .:... : .
XP_011 SLRSTKE---GP----ETPPRPRDQ---LPPHPRSRRYSGDSDSSASSAQSGPLGTRSDD
330 340 350 360 370
400 410 420 430 440 450
pF1KSD TSSGKREERYPPELPRGRIPTSWVHEETDSWGTDAGNPTPQRLRAIEATTKGISARGPSP
:..: :.:: : :. : :: : .:.: :... .. ::
XP_011 TGTGPRRER-----PSRRLTT----------GTPA---SPRRPPALRSQSRDRLDRGR--
380 390 400 410
460 470 480 490 500 510
pF1KSD LPRSFGPAECLGLRLPLRDEAKGAFFQFREPESV---RSPTPVQGLTKIPIRLPPARPPT
:: : : .: . . :. : : :: ..: : : . .: :
XP_011 -PR--GAPGGRGAQLSVPSPARRARSQSREEQAVLLVRRDRDGQH-SWVP------R---
420 430 440 450 460
520 530 540 550 560 570
pF1KSD PGRSFPGATSGSPRTELGRDPIPLRAVTVDLAGSTHGDCSVEVRQEDQQLDIQVMAEARE
::. :. ..:.: .:.: : : .
XP_011 -GRGSGGSGRSTPQTPRARSPAAPRLSRV----------------------------SSP
470 480 490
580 590 600 610 620 630
pF1KSD SWDLGLQEQEGRYTPLPLGGNKEQAIYCSLEEEILGNMKLLE-VRSACPQGTRSGVIPRS
: .:: ::: : ..:: .. ::::.:.: . :: : :. : .: :
XP_011 SPELGTTPASIFRTPLQLDPQQEQQLFRRLEEEFLANARALEAVASVTP----TGPAPD-
500 510 520 530 540
640 650 660 670 680 690
pF1KSD GVYIPRLAGQWPEPGGPYDKAIQELAQGSPSLLKVDLEAWKAAPTGSPKPAVTPGPGSLK
: : :.: .: :.: ...: :: . .. :.: :. .
XP_011 ----PARA---PDPPAP-DSAYCSSSSSSSSLSVL------GGKCGQP--------GD-S
550 560 570 580
700 710 720 730 740 750
pF1KSD GKLGARQSGPRTKASLSAKGTHMRKVPPQGGQDCSASTVSASPEAPTPSPLDPNSDKAKA
:. . :::..: ::... . : .:: . .:: : : .:. :..
XP_011 GRTANGLPGPRSQA-LSSSSDEGSPCPGMGGP----LDAPGSPLACT----EPSRTWARG
590 600 610 620 630
760 770 780 790 800 810
pF1KSD CLSKGRRTLRKPKRVPSIYKLKLRPRIRPRRDHRPEKQPSRIPRPLAYVFLGPARQPPKD
.. . :::.:.:. :: ::: :
XP_011 RMDT--QPDRKPSRIPT-------PR-GPRRPSGPAELGTWHALHSVTPRAEPDSWM
640 650 660 670 680
820 830 840 850 860 870
pF1KSD RLLRAVLGSKGGEASRVDGASVGEEEEEGKEEKEPAAPLESSPQPPEGLQPHWLNQAPLP
>>XP_016884022 (OMIM: 602128) PREDICTED: GAS2-like prote (681 aa)
initn: 1196 init1: 469 opt: 788 Z-score: 489.8 bits: 101.4 E(85289): 1.5e-20
Smith-Waterman score: 1187; 37.4% identity (54.6% similar) in 815 aa overlap (1-788:1-659)
10 20 30 40 50
pF1KSD MSQPAGGRRKPRTLGPPVCSIRPFKSSEQYLEAMKEDLAEWLRDLYGLDIDAAN--FLQV
:..:..: : . :.:::.::: :.::::::::::: :::: . ... ::
XP_016 MADPVAG-----IAGSAAKSVRPFRSSEAYVEAMKEDLAEWLNALYGLGLPGGGDGFLTG
10 20 30 40 50
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pF1KSD LETGLVLCQHANVVTDAALAFLAEAPAQAQKIPMPRVGVSCNG-AAQPGTFQARDNVSNF
: :: .::::::.::.:: :. : ::. ::. .. .. ::.:.:::::..:
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pF1KSD IQWCRKEMGIQEVLMFETEDLVLRKNVKNVVLCLLELGRRAWRFGVAAPTLVQLEEEIEE
: ::: :.:. ::::::::::::::: :.:::::::..::. :.:. :: :::.:.:::.
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:.: : :: .: ::: :: : .::::..:. ....::::
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170 180 190 200 210 220
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:: :.::::::::::::. :::.:.::.::::::::::::: :::::::::::.: .:.:
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230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330
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: : : .:....:: : : :: : .:.:: :: ::
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: : .: : : : : : : : :. .::: : .:... : .
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:..: :.:: : :. : :: : .:.: :... .. ::
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:: : : .: . . :. : : :: ..: : : . .: :
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::. :. ..:.: .:.: : : .
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: .:: ::: : ..:: .. ::::.:.: . :: : :. : .: :
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: : :.: .: :.: ...: :: . .. :.: :. .
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:. . :::..: ::... . : .:: . .:: : : .:. :..
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pF1KSD CLSKGRRTLRKPKRVPSIYKLKLRPRIRPRRDHRPEKQPSRIPRPLAYVFLGPARQPPKD
.. . :::.:.:. :: ::: :
XP_016 RMDT--QPDRKPSRIPT-------PR-GPRRPSGPAELGTWHALHSVTPRAEPDSWM
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>>NP_689422 (OMIM: 602128) GAS2-like protein 1 isoform a (681 aa)
initn: 1196 init1: 469 opt: 788 Z-score: 489.8 bits: 101.4 E(85289): 1.5e-20
Smith-Waterman score: 1187; 37.4% identity (54.6% similar) in 815 aa overlap (1-788:1-659)
10 20 30 40 50
pF1KSD MSQPAGGRRKPRTLGPPVCSIRPFKSSEQYLEAMKEDLAEWLRDLYGLDIDAAN--FLQV
:..:..: : . :.:::.::: :.::::::::::: :::: . ... ::
NP_689 MADPVAG-----IAGSAAKSVRPFRSSEAYVEAMKEDLAEWLNALYGLGLPGGGDGFLTG
10 20 30 40 50
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pF1KSD LETGLVLCQHANVVTDAALAFLAEAPAQAQKIPMPRVGVSCNG-AAQPGTFQARDNVSNF
: :: .::::::.::.:: :. : ::. ::. .. .. ::.:.:::::..:
NP_689 LATGTTLCQHANAVTEAARALAAARPAR---------GVAFQAHSVVPGSFMARDNVATF
60 70 80 90 100
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pF1KSD IQWCRKEMGIQEVLMFETEDLVLRKNVKNVVLCLLELGRRAWRFGVAAPTLVQLEEEIEE
: ::: :.:. ::::::::::::::: :.:::::::..::. :.:. :: :::.:.:::.
NP_689 IGWCRVELGVPEVLMFETEDLVLRKNEKSVVLCLLEVARRGARLGLLAPRLVQFEQEIER
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180 190 200 210 220
pF1KSD EVRRELALPPPDPSP----------PAP------PRRQPCHFRNLDQMVQSLVSHCTCPV
:.: : :: .: ::: :: : .::::..:. ....::::
NP_689 ELR---AAPPAPNAPAAGEDTTETAPAPGTPARGPRMTPSDLRNLDELVREILGRCTCPD
170 180 190 200 210 220
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pF1KSD QFSMVKVSEGKYRVGDSNTLIFIRILRNHVMVRVGGGWDTLGHYLDKHDPCRCTSLSHKP
:: :.::::::::::::. :::.:.::.::::::::::::: :::::::::::.: .:.:
NP_689 QFPMIKVSEGKYRVGDSSLLIFVRVLRSHVMVRVGGGWDTLEHYLDKHDPCRCSSTAHRP
230 240 250 260 270 280
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pF1KSD GSFLKPPAPPVQHEVRVQDGPSQTQPTMTISRSQSPPPPVDWKTYTSSDRR-LRPP-TPS
: : : .:....:: : : :: : .:.:: :: ::
NP_689 ------PQPRV-----CTFSPQRVSPT-TSPRPASPVP--------GSERRGSRPEMTPV
290 300 310 320
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pF1KSD SPRPRRERGAGTGASREMAPFLRCQERSLIPSWRQPT-AGDSPPSPQSSSTQK-GRDPQC
: : .: : : : : : : : :. .::: : .:... : .
NP_689 SLRSTKE---GP----ETPPRPRDQ---LPPHPRSRRYSGDSDSSASSAQSGPLGTRSDD
330 340 350 360 370
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pF1KSD TSSGKREERYPPELPRGRIPTSWVHEETDSWGTDAGNPTPQRLRAIEATTKGISARGPSP
:..: :.:: : :. : :: : .:.: :... .. ::
NP_689 TGTGPRRER-----PSRRLTT----------GTPA---SPRRPPALRSQSRDRLDRGR--
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pF1KSD LPRSFGPAECLGLRLPLRDEAKGAFFQFREPESV---RSPTPVQGLTKIPIRLPPARPPT
:: : : .: . . :. : : :: ..: : : . .: :
NP_689 -PR--GAPGGRGAQLSVPSPARRARSQSREEQAVLLVRRDRDGQH-SWVP------R---
420 430 440 450 460
520 530 540 550 560 570
pF1KSD PGRSFPGATSGSPRTELGRDPIPLRAVTVDLAGSTHGDCSVEVRQEDQQLDIQVMAEARE
::. :. ..:.: .:.: : : .
NP_689 -GRGSGGSGRSTPQTPRARSPAAPRLSRV----------------------------SSP
470 480 490
580 590 600 610 620 630
pF1KSD SWDLGLQEQEGRYTPLPLGGNKEQAIYCSLEEEILGNMKLLE-VRSACPQGTRSGVIPRS
: .:: ::: : ..:: .. ::::.:.: . :: : :. : .: :
NP_689 SPELGTTPASIFRTPLQLDPQQEQQLFRRLEEEFLANARALEAVASVTP----TGPAPD-
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pF1KSD GVYIPRLAGQWPEPGGPYDKAIQELAQGSPSLLKVDLEAWKAAPTGSPKPAVTPGPGSLK
: : :.: .: :.: ...: :: . .. :.: :. .
NP_689 ----PARA---PDPPAP-DSAYCSSSSSSSSLSVL------GGKCGQP--------GD-S
550 560 570 580
700 710 720 730 740 750
pF1KSD GKLGARQSGPRTKASLSAKGTHMRKVPPQGGQDCSASTVSASPEAPTPSPLDPNSDKAKA
:. . :::..: ::... . : .:: . .:: : : .:. :..
NP_689 GRTANGLPGPRSQA-LSSSSDEGSPCPGMGGP----LDAPGSPLACT----EPSRTWARG
590 600 610 620 630
760 770 780 790 800 810
pF1KSD CLSKGRRTLRKPKRVPSIYKLKLRPRIRPRRDHRPEKQPSRIPRPLAYVFLGPARQPPKD
.. . :::.:.:. :: ::: :
NP_689 RMDT--QPDRKPSRIPT-------PR-GPRRPSGPAELGTWHALHSVTPRAEPDSWM
640 650 660 670 680
820 830 840 850 860 870
pF1KSD RLLRAVLGSKGGEASRVDGASVGEEEEEGKEEKEPAAPLESSPQPPEGLQPHWLNQAPLP
>>NP_006469 (OMIM: 602128) GAS2-like protein 1 isoform a (681 aa)
initn: 1196 init1: 469 opt: 788 Z-score: 489.8 bits: 101.4 E(85289): 1.5e-20
Smith-Waterman score: 1187; 37.4% identity (54.6% similar) in 815 aa overlap (1-788:1-659)
10 20 30 40 50
pF1KSD MSQPAGGRRKPRTLGPPVCSIRPFKSSEQYLEAMKEDLAEWLRDLYGLDIDAAN--FLQV
:..:..: : . :.:::.::: :.::::::::::: :::: . ... ::
NP_006 MADPVAG-----IAGSAAKSVRPFRSSEAYVEAMKEDLAEWLNALYGLGLPGGGDGFLTG
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD LETGLVLCQHANVVTDAALAFLAEAPAQAQKIPMPRVGVSCNG-AAQPGTFQARDNVSNF
: :: .::::::.::.:: :. : ::. ::. .. .. ::.:.:::::..:
NP_006 LATGTTLCQHANAVTEAARALAAARPAR---------GVAFQAHSVVPGSFMARDNVATF
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KSD IQWCRKEMGIQEVLMFETEDLVLRKNVKNVVLCLLELGRRAWRFGVAAPTLVQLEEEIEE
: ::: :.:. ::::::::::::::: :.:::::::..::. :.:. :: :::.:.:::.
NP_006 IGWCRVELGVPEVLMFETEDLVLRKNEKSVVLCLLEVARRGARLGLLAPRLVQFEQEIER
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220
pF1KSD EVRRELALPPPDPSP----------PAP------PRRQPCHFRNLDQMVQSLVSHCTCPV
:.: : :: .: ::: :: : .::::..:. ....::::
NP_006 ELR---AAPPAPNAPAAGEDTTETAPAPGTPARGPRMTPSDLRNLDELVREILGRCTCPD
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KSD QFSMVKVSEGKYRVGDSNTLIFIRILRNHVMVRVGGGWDTLGHYLDKHDPCRCTSLSHKP
:: :.::::::::::::. :::.:.::.::::::::::::: :::::::::::.: .:.:
NP_006 QFPMIKVSEGKYRVGDSSLLIFVRVLRSHVMVRVGGGWDTLEHYLDKHDPCRCSSTAHRP
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330
pF1KSD GSFLKPPAPPVQHEVRVQDGPSQTQPTMTISRSQSPPPPVDWKTYTSSDRR-LRPP-TPS
: : : .:....:: : : :: : .:.:: :: ::
NP_006 ------PQPRV-----CTFSPQRVSPT-TSPRPASPVP--------GSERRGSRPEMTPV
290 300 310 320
340 350 360 370 380 390
pF1KSD SPRPRRERGAGTGASREMAPFLRCQERSLIPSWRQPT-AGDSPPSPQSSSTQK-GRDPQC
: : .: : : : : : : : :. .::: : .:... : .
NP_006 SLRSTKE---GP----ETPPRPRDQ---LPPHPRSRRYSGDSDSSASSAQSGPLGTRSDD
330 340 350 360 370
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pF1KSD TSSGKREERYPPELPRGRIPTSWVHEETDSWGTDAGNPTPQRLRAIEATTKGISARGPSP
:..: :.:: : :. : :: : .:.: :... .. ::
NP_006 TGTGPRRER-----PSRRLTT----------GTPA---SPRRPPALRSQSRDRLDRGR--
380 390 400 410
460 470 480 490 500 510
pF1KSD LPRSFGPAECLGLRLPLRDEAKGAFFQFREPESV---RSPTPVQGLTKIPIRLPPARPPT
:: : : .: . . :. : : :: ..: : : . .: :
NP_006 -PR--GAPGGRGAQLSVPSPARRARSQSREEQAVLLVRRDRDGQH-SWVP------R---
420 430 440 450 460
520 530 540 550 560 570
pF1KSD PGRSFPGATSGSPRTELGRDPIPLRAVTVDLAGSTHGDCSVEVRQEDQQLDIQVMAEARE
::. :. ..:.: .:.: : : .
NP_006 -GRGSGGSGRSTPQTPRARSPAAPRLSRV----------------------------SSP
470 480 490
580 590 600 610 620 630
pF1KSD SWDLGLQEQEGRYTPLPLGGNKEQAIYCSLEEEILGNMKLLE-VRSACPQGTRSGVIPRS
: .:: ::: : ..:: .. ::::.:.: . :: : :. : .: :
NP_006 SPELGTTPASIFRTPLQLDPQQEQQLFRRLEEEFLANARALEAVASVTP----TGPAPD-
500 510 520 530 540
640 650 660 670 680 690
pF1KSD GVYIPRLAGQWPEPGGPYDKAIQELAQGSPSLLKVDLEAWKAAPTGSPKPAVTPGPGSLK
: : :.: .: :.: ...: :: . .. :.: :. .
NP_006 ----PARA---PDPPAP-DSAYCSSSSSSSSLSVL------GGKCGQP--------GD-S
550 560 570 580
700 710 720 730 740 750
pF1KSD GKLGARQSGPRTKASLSAKGTHMRKVPPQGGQDCSASTVSASPEAPTPSPLDPNSDKAKA
:. . :::..: ::... . : .:: . .:: : : .:. :..
NP_006 GRTANGLPGPRSQA-LSSSSDEGSPCPGMGGP----LDAPGSPLACT----EPSRTWARG
590 600 610 620 630
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pF1KSD CLSKGRRTLRKPKRVPSIYKLKLRPRIRPRRDHRPEKQPSRIPRPLAYVFLGPARQPPKD
.. . :::.:.:. :: ::: :
NP_006 RMDT--QPDRKPSRIPT-------PR-GPRRPSGPAELGTWHALHSVTPRAEPDSWM
640 650 660 670 680
820 830 840 850 860 870
pF1KSD RLLRAVLGSKGGEASRVDGASVGEEEEEGKEEKEPAAPLESSPQPPEGLQPHWLNQAPLP
>>NP_001265659 (OMIM: 602128) GAS2-like protein 1 isofor (454 aa)
initn: 1115 init1: 469 opt: 755 Z-score: 472.4 bits: 97.6 E(85289): 1.4e-19
Smith-Waterman score: 1114; 44.2% identity (61.7% similar) in 491 aa overlap (1-469:1-436)
10 20 30 40 50
pF1KSD MSQPAGGRRKPRTLGPPVCSIRPFKSSEQYLEAMKEDLAEWLRDLYGLDIDAAN--FLQV
:..:..: : . :.:::.::: :.::::::::::: :::: . ... ::
NP_001 MADPVAG-----IAGSAAKSVRPFRSSEAYVEAMKEDLAEWLNALYGLGLPGGGDGFLTG
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD LETGLVLCQHANVVTDAALAFLAEAPAQAQKIPMPRVGVSCNG-AAQPGTFQARDNVSNF
: :: .::::::.::.:: :. : ::. ::. .. .. ::.:.:::::..:
NP_001 LATGTTLCQHANAVTEAARALAAARPAR---------GVAFQAHSVVPGSFMARDNVATF
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KSD IQWCRKEMGIQEVLMFETEDLVLRKNVKNVVLCLLELGRRAWRFGVAAPTLVQLEEEIEE
: ::: :.:. ::::::::::::::: :.:::::::..::. :.:. :: :::.:.:::.
NP_001 IGWCRVELGVPEVLMFETEDLVLRKNEKSVVLCLLEVARRGARLGLLAPRLVQFEQEIER
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220
pF1KSD EVRRELALPPPDPSP----------PAP------PRRQPCHFRNLDQMVQSLVSHCTCPV
:.: : :: .: ::: :: : .::::..:. ....::::
NP_001 ELR---AAPPAPNAPAAGEDTTETAPAPGTPARGPRMTPSDLRNLDELVREILGRCTCPD
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KSD QFSMVKVSEGKYRVGDSNTLIFIRILRNHVMVRVGGGWDTLGHYLDKHDPCRCTSLSHKP
:: :.::::::::::::. :::.:.::.::::::::::::: :::::::::::.: .:.:
NP_001 QFPMIKVSEGKYRVGDSSLLIFVRVLRSHVMVRVGGGWDTLEHYLDKHDPCRCSSTAHRP
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330
pF1KSD GSFLKPPAPPVQHEVRVQDGPSQTQPTMTISRSQSPPPPVDWKTYTSSDRR-LRPP-TPS
: : : .:....:: : : :: : .:.:: :: ::
NP_001 ------PQPRV-----CTFSPQRVSPT-TSPRPASPVP--------GSERRGSRPEMTPV
290 300 310 320
340 350 360 370 380 390
pF1KSD SPRPRRERGAGTGASREMAPFLRCQERSLIPSWRQPTAGDSP-PSPQSSSTQKGRDPQCT
: : .: : : : . . . :. ::. : : :. :... . :
NP_001 SLRSTKE-GPETPPSSSSSSLSVLGGKCGQPGDSGRTANGLPGPRSQALSSSSDEGSPCP
330 340 350 360 370 380
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pF1KSD SSGKREERYPPELPRGRIPTSWVHEETDSWGTDAGNPTPQRLRAIEATTKGISARGPSPL
. : : . : . . . : . .:. . :.: .. . :::
NP_001 GMGG-----PLDAPGSPLACT---EPSRTWARGRMDTQPDR-----KPSRIPTPRGPR--
390 400 410 420
460 470 480 490 500 510
pF1KSD PRSFGPAECLGLRLPLRDEAKGAFFQFREPESVRSPTPVQGLTKIPIRLPPARPPTPGRS
: :::: ::
NP_001 -RPSGPAE-LGTWHALHSVTPRAEPDSWM
430 440 450
>>NP_808221 (OMIM: 602835) growth arrest-specific protei (313 aa)
initn: 547 init1: 293 opt: 697 Z-score: 439.8 bits: 91.0 E(85289): 9.3e-18
Smith-Waterman score: 697; 41.7% identity (69.4% similar) in 271 aa overlap (28-293:30-292)
10 20 30 40 50
pF1KSD MSQPAGGRRKPRTLGPPVCSIRPFKSSEQYLEAMKEDLAEWLRDLYGLDIDAANFLQV
: : :::::: :: .: : .: : .:..
NP_808 MCTALSPKVRSGPGLSDMHQYSQWLASRHEANLLPMKEDLALWLTNLLGKEITAETFMEK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD LETGLVLCQHANVVTDAALAFLAEAPAQAQKIPMPRVGVSCNGAAQPGTFQARDNVSNFI
:..: .::: :... . . .: ....:. .. :. .: :.: ::::..::.
NP_808 LDNGALLCQLAETMQEK-FKESMDANKPTKNLPLKKI--PCKTSAPSGSFFARDNTANFL
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD QWCRKEMGIQEVLMFETEDLVLRKNVKNVVLCLLELGRRAWRFGVAAPTLVQLEEEIEEE
.::: ..:..:. .::.: :::.:. ..: :::::::: : :.:: : :..::.:::.:
NP_808 SWCR-DLGVDETCLFESEGLVLHKQPREVCLCLLELGRIAARYGVEPPGLIKLEKEIEQE
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]