Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDB0005
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDB0005, 1271 aa
1>>>pF1KSDB0005 1271 - 1271 aa - 1271 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.4102+/-0.00113; mu= 5.9881+/- 0.068
mean_var=256.9664+/-51.888, 0's: 0 Z-trim(111.3): 147 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.080008
statistics sampled from 12138 (12286) to 12138 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.701), E-opt: 0.2 (0.377), width: 16
Scan time: 5.230
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13806.1 BCR gene_id:613|Hs108|chr22 (1271) 8456 990.5 0
CCDS13807.1 BCR gene_id:613|Hs108|chr22 (1227) 6456 759.6 1.1e-218
CCDS10999.1 ABR gene_id:29|Hs108|chr17 ( 859) 3782 450.8 6.9e-126
CCDS54060.1 ABR gene_id:29|Hs108|chr17 ( 813) 3768 449.2 2e-125
CCDS11000.1 ABR gene_id:29|Hs108|chr17 ( 822) 3691 440.3 9.8e-123
CCDS73936.1 ABR gene_id:29|Hs108|chr17 ( 641) 3018 362.5 2e-99
CCDS58497.1 ABR gene_id:29|Hs108|chr17 ( 310) 1240 157.0 6.9e-38
CCDS11498.1 ARHGAP27 gene_id:201176|Hs108|chr17 ( 548) 477 69.2 3.4e-11
CCDS74082.1 ARHGAP27 gene_id:201176|Hs108|chr17 ( 889) 477 69.3 4.9e-11
>>CCDS13806.1 BCR gene_id:613|Hs108|chr22 (1271 aa)
initn: 8456 init1: 8456 opt: 8456 Z-score: 5287.0 bits: 990.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8456; 99.9% identity (100.0% similar) in 1271 aa overlap (1-1271:1-1271)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MVDPVGFAEAWKAQFPDSEPPRMELRSVGDIEQELERCKASIRRLEQEVNQERFRMIYLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MVDPVGFAEAWKAQFPDSEPPRMELRSVGDIEQELERCKASIRRLEQEVNQERFRMIYLQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD TLLAKEKKSYDRQRWGFRRAAQAPDGASEPRASASRPQPAPADGADPPPAEEPEARPDGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TLLAKEKKSYDRQRWGFRRAAQAPDGASEPRASASRPQPAPADGADPPPAEEPEARPDGE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD GSPGKARPGTARRPGAAASGERDDRGPPASVAALRSNFERIRKGHGQPGADAEKPFYVNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GSPGKARPGTARRPGAAASGERDDRGPPASVAALRSNFERIRKGHGQPGADAEKPFYVNV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD EFHHERGLVKVNDKEVSDRISSLGSQAMQMERKKSQHGAGSSVGDASRPPYRGRSSESSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 EFHHERGLVKVNDKEVSDRISSLGSQAMQMERKKSQHGAGSSVGDASRPPYRGRSSESSC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD GVDGDYEDAELNPRFLKDNLIDANGGSRPPWPPLEYQPYQSIYVGGMMEGEGKGPLLRSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GVDGDYEDAELNPRFLKDNLIDANGGSRPPWPPLEYQPYQSIYVGGMMEGEGKGPLLRSQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD STSEQEKRLTWPRRSYSPRSFEDCGGGYTPDCSSNENLTSSEEDFSSGQSSRVSPSPTTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 STSEQEKRLTWPRRSYSPRSFEDCGGGYTPDCSSNENLTSSEEDFSSGQSSRVSPSPTTY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD RMFRDKSRSPSQNSQQSFDSSSPPTPQCHKRHRHCPVVVSEATIVGVRKTGQIWPNDGEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RMFRDKSRSPSQNSQQSFDSSSPPTPQCHKRHRHCPVVVSEATIVGVRKTGQIWPNDGEG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD AFHGDADGSFGTPPGYGCAADRAEEQRRHQDGLPYIDDSPSSSPHLSSKGRGSRDALVSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AFHGDADGSFGTPPGYGCAADRAEEQRRHQDGLPYIDDSPSSSPHLSSKGRGSRDALVSG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD ALESTKASELDLEKGLEMRKWVLSGILASEETYLSHLEALLLPMKPLKAAATTSQPVLTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ALESTKASELDLEKGLEMRKWVLSGILASEETYLSHLEALLLPMKPLKAAATTSQPVLTS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD QQIETIFFKVPELYEIHKEFYDGLFPRVQQWSHQQRVGDLFQKLASQLGVYRAFVDNYGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QQIETIFFKVPELYEIHKEFYDGLFPRVQQWSHQQRVGDLFQKLASQLGVYRAFVDNYGV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD AMEMAEKCCQANAQFAEISENLRARSNKDAKDPTTKNSLETLLYKPVDRVTRSTLVLHDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AMEMAEKCCQANAQFAEISENLRARSNKDAKDPTTKNSLETLLYKPVDRVTRSTLVLHDL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD LKHTPASHPDHPLLQDALRISQNFLSSINEEITPRRQSMTVKKGEHRQLLKDSFMVELVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LKHTPASHPDHPLLQDALRISQNFLSSINEEITPRRQSMTVKKGEHRQLLKDSFMVELVE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD GARKLRHVFLFTDLLLCTKLKKQSGGKTQQYDCKWYIPLTDLSFQMVDELEAVPNIPLVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GARKLRHVFLFTDLLLCTKLKKQSGGKTQQYDCKWYIPLTDLSFQMVDELEAVPNIPLVP
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD DEELDALKIKISQIKSDIQREKRANKGSKATERLKKKLSEQESLLLLMSPSMAFRVHSRN
:::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DEELDALKIKISQIKNDIQREKRANKGSKATERLKKKLSEQESLLLLMSPSMAFRVHSRN
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD GKSYTFLISSDYERAEWRENIREQQKKCFRSFSLTSVELQMLTNSCVKLQTVHSIPLTIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GKSYTFLISSDYERAEWRENIREQQKKCFRSFSLTSVELQMLTNSCVKLQTVHSIPLTIN
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD KEDDESPGLYGFLNVIVHSATGFKQSSNLYCTLEVDSFGYFVNKAKTRVYRDTAEPNWNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 KEDDESPGLYGFLNVIVHSATGFKQSSNLYCTLEVDSFGYFVNKAKTRVYRDTAEPNWNE
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD EFEIELEGSQTLRILCYEKCYNKTKIPKEDGESTDRLMGKGQVQLDPQALQDRDWQRTVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 EFEIELEGSQTLRILCYEKCYNKTKIPKEDGESTDRLMGKGQVQLDPQALQDRDWQRTVI
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD AMNGIEVKLSVKFNSREFSLKRMPSRKQTGVFGVKIAVVTKRERSKVPYIVRQCVEEIER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AMNGIEVKLSVKFNSREFSLKRMPSRKQTGVFGVKIAVVTKRERSKVPYIVRQCVEEIER
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD RGMEEVGIYRVSGVATDIQALKAAFDVNNKDVSVMMSEMDVNAIAGTLKLYFRELPEPLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RGMEEVGIYRVSGVATDIQALKAAFDVNNKDVSVMMSEMDVNAIAGTLKLYFRELPEPLF
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD TDEFYPNFAEGIALSDPVAKESCMLNLLLSLPEANLLTFLFLLDHLKRVAEKEAVNKMSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TDEFYPNFAEGIALSDPVAKESCMLNLLLSLPEANLLTFLFLLDHLKRVAEKEAVNKMSL
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD HNLATVFGPTLLRPSEKESKLPANPSQPITMTDSWSLEVMSQVQVLLYFLQLEAIPAPDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 HNLATVFGPTLLRPSEKESKLPANPSQPITMTDSWSLEVMSQVQVLLYFLQLEAIPAPDS
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270
pF1KSD KRQSILFSTEV
:::::::::::
CCDS13 KRQSILFSTEV
1270
>>CCDS13807.1 BCR gene_id:613|Hs108|chr22 (1227 aa)
initn: 6456 init1: 6456 opt: 6456 Z-score: 4039.5 bits: 759.6 E(32554): 1.1e-218
Smith-Waterman score: 8064; 96.5% identity (96.5% similar) in 1271 aa overlap (1-1271:1-1227)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MVDPVGFAEAWKAQFPDSEPPRMELRSVGDIEQELERCKASIRRLEQEVNQERFRMIYLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MVDPVGFAEAWKAQFPDSEPPRMELRSVGDIEQELERCKASIRRLEQEVNQERFRMIYLQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD TLLAKEKKSYDRQRWGFRRAAQAPDGASEPRASASRPQPAPADGADPPPAEEPEARPDGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TLLAKEKKSYDRQRWGFRRAAQAPDGASEPRASASRPQPAPADGADPPPAEEPEARPDGE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD GSPGKARPGTARRPGAAASGERDDRGPPASVAALRSNFERIRKGHGQPGADAEKPFYVNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GSPGKARPGTARRPGAAASGERDDRGPPASVAALRSNFERIRKGHGQPGADAEKPFYVNV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD EFHHERGLVKVNDKEVSDRISSLGSQAMQMERKKSQHGAGSSVGDASRPPYRGRSSESSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 EFHHERGLVKVNDKEVSDRISSLGSQAMQMERKKSQHGAGSSVGDASRPPYRGRSSESSC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD GVDGDYEDAELNPRFLKDNLIDANGGSRPPWPPLEYQPYQSIYVGGMMEGEGKGPLLRSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GVDGDYEDAELNPRFLKDNLIDANGGSRPPWPPLEYQPYQSIYVGGMMEGEGKGPLLRSQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD STSEQEKRLTWPRRSYSPRSFEDCGGGYTPDCSSNENLTSSEEDFSSGQSSRVSPSPTTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 STSEQEKRLTWPRRSYSPRSFEDCGGGYTPDCSSNENLTSSEEDFSSGQSSRVSPSPTTY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD RMFRDKSRSPSQNSQQSFDSSSPPTPQCHKRHRHCPVVVSEATIVGVRKTGQIWPNDGEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RMFRDKSRSPSQNSQQSFDSSSPPTPQCHKRHRHCPVVVSEATIVGVRKTGQIWPNDGEG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD AFHGDADGSFGTPPGYGCAADRAEEQRRHQDGLPYIDDSPSSSPHLSSKGRGSRDALVSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AFHGDADGSFGTPPGYGCAADRAEEQRRHQDGLPYIDDSPSSSPHLSSKGRGSRDALVSG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD ALESTKASELDLEKGLEMRKWVLSGILASEETYLSHLEALLLPMKPLKAAATTSQPVLTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ALESTKASELDLEKGLEMRKWVLSGILASEETYLSHLEALLLPMKPLKAAATTSQPVLTS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD QQIETIFFKVPELYEIHKEFYDGLFPRVQQWSHQQRVGDLFQKLASQLGVYRAFVDNYGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QQIETIFFKVPELYEIHKEFYDGLFPRVQQWSHQQRVGDLFQKLASQLGVYRAFVDNYGV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD AMEMAEKCCQANAQFAEISENLRARSNKDAKDPTTKNSLETLLYKPVDRVTRSTLVLHDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AMEMAEKCCQANAQFAEISENLRARSNKDAKDPTTKNSLETLLYKPVDRVTRSTLVLHDL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD LKHTPASHPDHPLLQDALRISQNFLSSINEEITPRRQSMTVKKGEHRQLLKDSFMVELVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LKHTPASHPDHPLLQDALRISQNFLSSINEEITPRRQSMTVKKGEHRQLLKDSFMVELVE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD GARKLRHVFLFTDLLLCTKLKKQSGGKTQQYDCKWYIPLTDLSFQMVDELEAVPNIPLVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GARKLRHVFLFTDLLLCTKLKKQSGGKTQQYDCKWYIPLTDLSFQMVDELEAVPNIPLVP
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD DEELDALKIKISQIKSDIQREKRANKGSKATERLKKKLSEQESLLLLMSPSMAFRVHSRN
:::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DEELDALKIKISQIKNDIQREKRANKGSKATERLKKKLSEQESLLLLMSPSMAFRVHSRN
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD GKSYTFLISSDYERAEWRENIREQQKKCFRSFSLTSVELQMLTNSCVKLQTVHSIPLTIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GKSYTFLISSDYERAEWRENIREQQKKCFRSFSLTSVELQMLTNSCVKLQTVHSIPLTIN
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD KEDDESPGLYGFLNVIVHSATGFKQSSNLYCTLEVDSFGYFVNKAKTRVYRDTAEPNWNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 KEDDESPGLYGFLNVIVHSATGFKQSSNLYCTLEVDSFGYFVNKAKTRVYRDTAEPNWNE
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD EFEIELEGSQTLRILCYEKCYNKTKIPKEDGESTDRLMGKGQVQLDPQALQDRDWQRTVI
::::::::::::::::
CCDS13 --------------------------------------------LDPQALQDRDWQRTVI
970
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD AMNGIEVKLSVKFNSREFSLKRMPSRKQTGVFGVKIAVVTKRERSKVPYIVRQCVEEIER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AMNGIEVKLSVKFNSREFSLKRMPSRKQTGVFGVKIAVVTKRERSKVPYIVRQCVEEIER
980 990 1000 1010 1020 1030
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD RGMEEVGIYRVSGVATDIQALKAAFDVNNKDVSVMMSEMDVNAIAGTLKLYFRELPEPLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RGMEEVGIYRVSGVATDIQALKAAFDVNNKDVSVMMSEMDVNAIAGTLKLYFRELPEPLF
1040 1050 1060 1070 1080 1090
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD TDEFYPNFAEGIALSDPVAKESCMLNLLLSLPEANLLTFLFLLDHLKRVAEKEAVNKMSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TDEFYPNFAEGIALSDPVAKESCMLNLLLSLPEANLLTFLFLLDHLKRVAEKEAVNKMSL
1100 1110 1120 1130 1140 1150
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD HNLATVFGPTLLRPSEKESKLPANPSQPITMTDSWSLEVMSQVQVLLYFLQLEAIPAPDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 HNLATVFGPTLLRPSEKESKLPANPSQPITMTDSWSLEVMSQVQVLLYFLQLEAIPAPDS
1160 1170 1180 1190 1200 1210
1270
pF1KSD KRQSILFSTEV
:::::::::::
CCDS13 KRQSILFSTEV
1220
>>CCDS10999.1 ABR gene_id:29|Hs108|chr17 (859 aa)
initn: 3776 init1: 3572 opt: 3782 Z-score: 2373.5 bits: 450.8 E(32554): 6.9e-126
Smith-Waterman score: 3782; 68.2% identity (86.9% similar) in 847 aa overlap (429-1271:23-859)
400 410 420 430 440 450
pF1KSD VSEATIVGVRKTGQIWPNDGEGAFHGDADGSFGTPPGYGCAADRAEEQRRHQDG---LPY
:.:: : . :::. .: .::
CCDS10 MEPLSHRGLPRLSWIDTLYSNFSYGTDEYDG---EGNEEQKGPPEGSETMPY
10 20 30 40
460 470 480 490 500 510
pF1KSD IDDSPSSSPHLSSKGRGSRDALVSGALESTKASELDLEKGLEMRKWVLSGILASEETYLS
::.::. ::.::....:. :. :: . : .. ::::::: ::::.::::: :..
CCDS10 IDESPTMSPQLSARSQGGGDG-VSPTPPEGLAPGVEAGKGLEMRKLVLSGFLASEEIYIN
50 60 70 80 90 100
520 530 540 550 560 570
pF1KSD HLEALLLPMKPLKAAATTSQPVLTSQQIETIFFKVPELYEIHKEFYDGLFPRVQQWSHQQ
.:::::::::::::.::::::::: :::::::.:. ..:::::::::.: :.::::. :
CCDS10 QLEALLLPMKPLKATATTSQPVLTIQQIETIFYKIQDIYEIHKEFYDNLCPKVQQWDSQV
110 120 130 140 150 160
580 590 600 610 620 630
pF1KSD RVGDLFQKLASQLGVYRAFVDNYGVAMEMAEKCCQANAQFAEISENLRARSNKDAKDPTT
.: ::::::::::::.:::::: ::.: :::: :.: :: .:::.:.... ::.:: :
CCDS10 TMGHLFQKLASQLGVYKAFVDNYKVALETAEKCSQSNNQFQKISEELKVKGPKDSKDSHT
170 180 190 200 210 220
640 650 660 670 680 690
pF1KSD KNSLETLLYKPVDRVTRSTLVLHDLLKHTPASHPDHPLLQDALRISQNFLSSINEEITPR
. ..:.:::::.::::::::::::::::::..:::.:::::::::::::::::::.: ::
CCDS10 SVTMEALLYKPIDRVTRSTLVLHDLLKHTPVDHPDYPLLQDALRISQNFLSSINEDIDPR
230 240 250 260 270 280
700 710 720 730 740 750
pF1KSD RQSMTVKKGEHRQLLKDSFMVELVEGARKLRHVFLFTDLLLCTKLKKQSGGKTQQYDCKW
: ..:. ::: :::.::.:.::. :..:::::::::::.:::.:::: :.:: :::::::
CCDS10 RTAVTTPKGETRQLVKDGFLVEVSESSRKLRHVFLFTDVLLCAKLKKTSAGKHQQYDCKW
290 300 310 320 330 340
760 770 780 790 800 810
pF1KSD YIPLTDLSFQMVDELEAVPNIPLVPDEELDALKIKISQIKSDIQREKRANKG-SKATERL
::::.:: : .: :: :.. ::.::. .:.::: .::.::.:: :::: :.: :::
CCDS10 YIPLADLVFPSPEESEASPQVHPFPDHELEDMKMKISALKSEIQKEK-ANKGQSRAIERL
350 360 370 380 390 400
820 830 840 850 860 870
pF1KSD KKKLSEQESLLLLMSPSMAFRVHSRNGKSYTFLISSDYERAEWRENIREQQKKCFRSFSL
:::. :.: :::: ::.. ::.:.:::::: ::.::::::.:::: :.. ::: ...: :
CCDS10 KKKMFENEFLLLLNSPTIPFRIHNRNGKSYLFLLSSDYERSEWREAIQKLQKKDLQAFVL
410 420 430 440 450 460
880 890 900 910 920 930
pF1KSD TSVELQMLTNSCVKLQTVHSIPLTINKEDDESPGLYGFLNVIVHSATGFKQSSNLYCTLE
.:::::.::.:: ::.:::.::.: ::.:::::::::::.:::::: :::::.:::::::
CCDS10 SSVELQVLTGSCFKLRTVHNIPVTSNKDDDESPGLYGFLHVIVHSAKGFKQSANLYCTLE
470 480 490 500 510 520
940 950 960 970 980 990
pF1KSD VDSFGYFVNKAKTRVYRDTAEPNWNEEFEIELEGSQTLRILCYEKCYNKTKIPKEDGEST
::::::::.::::::.::::::.:.:::::::::::.::::::::::.:::. :...: .
CCDS10 VDSFGYFVSKAKTRVFRDTAEPKWDEEFEIELEGSQSLRILCYEKCYDKTKVNKDNNEIV
530 540 550 560 570 580
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KSD DRLMGKGQVQLDPQALQDRDWQRTVIAMNGIEVKLSVKFNSREFSLKRMPSRKQTGVFGV
:..:::::.:::::... ..:. :: ::::.:..:.::.::..:::: ::.::::::::
CCDS10 DKIMGKGQIQLDPQTVETKNWHTDVIEMNGIKVEFSMKFTSRDMSLKRTPSKKQTGVFGV
590 600 610 620 630 640
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KSD KIAVVTKRERSKVPYIVRQCVEEIERRGMEEVGIYRVSGVATDIQALKAAFDVNNKDVSV
::.::::::::::::::::::::.:.::.:::::::.::::::::::::.::.::::. .
CCDS10 KISVVTKRERSKVPYIVRQCVEEVEKRGIEEVGIYRISGVATDIQALKAVFDANNKDILL
650 660 670 680 690 700
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KSD MMSEMDVNAIAGTLKLYFRELPEPLFTDEFYPNFAEGIALSDPVAKESCMLNLLLSLPEA
:.:.::.::::::::::::::::::.::..:: : ::::::::.:::.::..:: :::.
CCDS10 MLSDMDINAIAGTLKLYFRELPEPLLTDRLYPAFMEGIALSDPAAKENCMMHLLRSLPDP
710 720 730 740 750 760
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KSD NLLTFLFLLDHLKRVAEKEAVNKMSLHNLATVFGPTLLRPSEKESKLPANPSQPITMTDS
::.::::::.::::::::: .::::::::::::::::::::: ::: .. . .:
CCDS10 NLITFLFLLEHLKRVAEKEPINKMSLHNLATVFGPTLLRPSEVESK-----AHLTSAADI
770 780 790 800 810 820
1240 1250 1260 1270
pF1KSD WSLEVMSQVQVLLYFLQLEAIPAPDSKRQSILFSTEV
:: .::.:::::::.:: : . ::... :::.:
CCDS10 WSHDVMAQVQVLLYYLQHPPISFAELKRNTLYFSTDV
830 840 850
>>CCDS54060.1 ABR gene_id:29|Hs108|chr17 (813 aa)
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Smith-Waterman score: 3768; 69.5% identity (88.3% similar) in 820 aa overlap (453-1271:1-813)
430 440 450 460 470 480
pF1KSD HGDADGSFGTPPGYGCAADRAEEQRRHQDGLPYIDDSPSSSPHLSSKGRGSRDALVSGAL
.::::.::. ::.::....:. :. :: .
CCDS54 MPYIDESPTMSPQLSARSQGGGDG-VSPTP
10 20
490 500 510 520 530 540
pF1KSD ESTKASELDLEKGLEMRKWVLSGILASEETYLSHLEALLLPMKPLKAAATTSQPVLTSQQ
: .. ::::::: ::::.::::: :...:::::::::::::.::::::::: ::
CCDS54 PEGLAPGVEAGKGLEMRKLVLSGFLASEEIYINQLEALLLPMKPLKATATTSQPVLTIQQ
30 40 50 60 70 80
550 560 570 580 590 600
pF1KSD IETIFFKVPELYEIHKEFYDGLFPRVQQWSHQQRVGDLFQKLASQLGVYRAFVDNYGVAM
:::::.:. ..:::::::::.: :.::::. : .: ::::::::::::.:::::: ::.
CCDS54 IETIFYKIQDIYEIHKEFYDNLCPKVQQWDSQVTMGHLFQKLASQLGVYKAFVDNYKVAL
90 100 110 120 130 140
610 620 630 640 650 660
pF1KSD EMAEKCCQANAQFAEISENLRARSNKDAKDPTTKNSLETLLYKPVDRVTRSTLVLHDLLK
: :::: :.: :: .:::.:.... ::.:: :. ..:.:::::.:::::::::::::::
CCDS54 ETAEKCSQSNNQFQKISEELKVKGPKDSKDSHTSVTMEALLYKPIDRVTRSTLVLHDLLK
150 160 170 180 190 200
670 680 690 700 710 720
pF1KSD HTPASHPDHPLLQDALRISQNFLSSINEEITPRRQSMTVKKGEHRQLLKDSFMVELVEGA
:::..:::.:::::::::::::::::::.: ::: ..:. ::: :::.::.:.::. :..
CCDS54 HTPVDHPDYPLLQDALRISQNFLSSINEDIDPRRTAVTTPKGETRQLVKDGFLVEVSESS
210 220 230 240 250 260
730 740 750 760 770 780
pF1KSD RKLRHVFLFTDLLLCTKLKKQSGGKTQQYDCKWYIPLTDLSFQMVDELEAVPNIPLVPDE
:::::::::::.:::.:::: :.:: :::::::::::.:: : .: :: :.. ::.
CCDS54 RKLRHVFLFTDVLLCAKLKKTSAGKHQQYDCKWYIPLADLVFPSPEESEASPQVHPFPDH
270 280 290 300 310 320
790 800 810 820 830 840
pF1KSD ELDALKIKISQIKSDIQREKRANKG-SKATERLKKKLSEQESLLLLMSPSMAFRVHSRNG
::. .:.::: .::.::.:: :::: :.: ::::::. :.: :::: ::.. ::.:.:::
CCDS54 ELEDMKMKISALKSEIQKEK-ANKGQSRAIERLKKKMFENEFLLLLNSPTIPFRIHNRNG
330 340 350 360 370 380
850 860 870 880 890 900
pF1KSD KSYTFLISSDYERAEWRENIREQQKKCFRSFSLTSVELQMLTNSCVKLQTVHSIPLTINK
::: ::.::::::.:::: :.. ::: ...: :.:::::.::.:: ::.:::.::.: ::
CCDS54 KSYLFLLSSDYERSEWREAIQKLQKKDLQAFVLSSVELQVLTGSCFKLRTVHNIPVTSNK
390 400 410 420 430 440
910 920 930 940 950 960
pF1KSD EDDESPGLYGFLNVIVHSATGFKQSSNLYCTLEVDSFGYFVNKAKTRVYRDTAEPNWNEE
.:::::::::::.:::::: :::::.:::::::::::::::.::::::.::::::.:.::
CCDS54 DDDESPGLYGFLHVIVHSAKGFKQSANLYCTLEVDSFGYFVSKAKTRVFRDTAEPKWDEE
450 460 470 480 490 500
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD FEIELEGSQTLRILCYEKCYNKTKIPKEDGESTDRLMGKGQVQLDPQALQDRDWQRTVIA
:::::::::.::::::::::.:::. :...: .:..:::::.:::::... ..:. ::
CCDS54 FEIELEGSQSLRILCYEKCYDKTKVNKDNNEIVDKIMGKGQIQLDPQTVETKNWHTDVIE
510 520 530 540 550 560
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD MNGIEVKLSVKFNSREFSLKRMPSRKQTGVFGVKIAVVTKRERSKVPYIVRQCVEEIERR
::::.:..:.::.::..:::: ::.::::::::::.::::::::::::::::::::.:.:
CCDS54 MNGIKVEFSMKFTSRDMSLKRTPSKKQTGVFGVKISVVTKRERSKVPYIVRQCVEEVEKR
570 580 590 600 610 620
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD GMEEVGIYRVSGVATDIQALKAAFDVNNKDVSVMMSEMDVNAIAGTLKLYFRELPEPLFT
:.:::::::.::::::::::::.::.::::. .:.:.::.::::::::::::::::::.:
CCDS54 GIEEVGIYRISGVATDIQALKAVFDANNKDILLMLSDMDINAIAGTLKLYFRELPEPLLT
630 640 650 660 670 680
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD DEFYPNFAEGIALSDPVAKESCMLNLLLSLPEANLLTFLFLLDHLKRVAEKEAVNKMSLH
:..:: : ::::::::.:::.::..:: :::. ::.::::::.::::::::: .::::::
CCDS54 DRLYPAFMEGIALSDPAAKENCMMHLLRSLPDPNLITFLFLLEHLKRVAEKEPINKMSLH
690 700 710 720 730 740
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD NLATVFGPTLLRPSEKESKLPANPSQPITMTDSWSLEVMSQVQVLLYFLQLEAIPAPDSK
::::::::::::::: ::: .. . .: :: .::.:::::::.:: : . :
CCDS54 NLATVFGPTLLRPSEVESK-----AHLTSAADIWSHDVMAQVQVLLYYLQHPPISFAELK
750 760 770 780 790 800
1270
pF1KSD RQSILFSTEV
:... :::.:
CCDS54 RNTLYFSTDV
810
>>CCDS11000.1 ABR gene_id:29|Hs108|chr17 (822 aa)
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Smith-Waterman score: 3691; 70.7% identity (89.1% similar) in 786 aa overlap (487-1271:43-822)
460 470 480 490 500 510
pF1KSD DDSPSSSPHLSSKGRGSRDALVSGALESTKASELDLEKGLEMRKWVLSGILASEETYLSH
: ... ::::::: ::::.::::: :...
CCDS11 KVLEDEDVFLLEECELGTPTSPGSGSPFLVAVKVEAGKGLEMRKLVLSGFLASEEIYINQ
20 30 40 50 60 70
520 530 540 550 560 570
pF1KSD LEALLLPMKPLKAAATTSQPVLTSQQIETIFFKVPELYEIHKEFYDGLFPRVQQWSHQQR
:::::::::::::.::::::::: :::::::.:. ..:::::::::.: :.::::. :
CCDS11 LEALLLPMKPLKATATTSQPVLTIQQIETIFYKIQDIYEIHKEFYDNLCPKVQQWDSQVT
80 90 100 110 120 130
580 590 600 610 620 630
pF1KSD VGDLFQKLASQLGVYRAFVDNYGVAMEMAEKCCQANAQFAEISENLRARSNKDAKDPTTK
.: ::::::::::::.:::::: ::.: :::: :.: :: .:::.:.... ::.:: :.
CCDS11 MGHLFQKLASQLGVYKAFVDNYKVALETAEKCSQSNNQFQKISEELKVKGPKDSKDSHTS
140 150 160 170 180 190
640 650 660 670 680 690
pF1KSD NSLETLLYKPVDRVTRSTLVLHDLLKHTPASHPDHPLLQDALRISQNFLSSINEEITPRR
..:.:::::.::::::::::::::::::..:::.:::::::::::::::::::.: :::
CCDS11 VTMEALLYKPIDRVTRSTLVLHDLLKHTPVDHPDYPLLQDALRISQNFLSSINEDIDPRR
200 210 220 230 240 250
700 710 720 730 740 750
pF1KSD QSMTVKKGEHRQLLKDSFMVELVEGARKLRHVFLFTDLLLCTKLKKQSGGKTQQYDCKWY
..:. ::: :::.::.:.::. :..:::::::::::.:::.:::: :.:: ::::::::
CCDS11 TAVTTPKGETRQLVKDGFLVEVSESSRKLRHVFLFTDVLLCAKLKKTSAGKHQQYDCKWY
260 270 280 290 300 310
760 770 780 790 800 810
pF1KSD IPLTDLSFQMVDELEAVPNIPLVPDEELDALKIKISQIKSDIQREKRANKG-SKATERLK
:::.:: : .: :: :.. ::.::. .:.::: .::.::.:: :::: :.: ::::
CCDS11 IPLADLVFPSPEESEASPQVHPFPDHELEDMKMKISALKSEIQKEK-ANKGQSRAIERLK
320 330 340 350 360 370
820 830 840 850 860 870
pF1KSD KKLSEQESLLLLMSPSMAFRVHSRNGKSYTFLISSDYERAEWRENIREQQKKCFRSFSLT
::. :.: :::: ::.. ::.:.:::::: ::.::::::.:::: :.. ::: ...: :.
CCDS11 KKMFENEFLLLLNSPTIPFRIHNRNGKSYLFLLSSDYERSEWREAIQKLQKKDLQAFVLS
380 390 400 410 420 430
880 890 900 910 920 930
pF1KSD SVELQMLTNSCVKLQTVHSIPLTINKEDDESPGLYGFLNVIVHSATGFKQSSNLYCTLEV
:::::.::.:: ::.:::.::.: ::.:::::::::::.:::::: :::::.::::::::
CCDS11 SVELQVLTGSCFKLRTVHNIPVTSNKDDDESPGLYGFLHVIVHSAKGFKQSANLYCTLEV
440 450 460 470 480 490
940 950 960 970 980 990
pF1KSD DSFGYFVNKAKTRVYRDTAEPNWNEEFEIELEGSQTLRILCYEKCYNKTKIPKEDGESTD
:::::::.::::::.::::::.:.:::::::::::.::::::::::.:::. :...: .:
CCDS11 DSFGYFVSKAKTRVFRDTAEPKWDEEFEIELEGSQSLRILCYEKCYDKTKVNKDNNEIVD
500 510 520 530 540 550
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KSD RLMGKGQVQLDPQALQDRDWQRTVIAMNGIEVKLSVKFNSREFSLKRMPSRKQTGVFGVK
..:::::.:::::... ..:. :: ::::.:..:.::.::..:::: ::.:::::::::
CCDS11 KIMGKGQIQLDPQTVETKNWHTDVIEMNGIKVEFSMKFTSRDMSLKRTPSKKQTGVFGVK
560 570 580 590 600 610
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KSD IAVVTKRERSKVPYIVRQCVEEIERRGMEEVGIYRVSGVATDIQALKAAFDVNNKDVSVM
:.::::::::::::::::::::.:.::.:::::::.::::::::::::.::.::::. .:
CCDS11 ISVVTKRERSKVPYIVRQCVEEVEKRGIEEVGIYRISGVATDIQALKAVFDANNKDILLM
620 630 640 650 660 670
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KSD MSEMDVNAIAGTLKLYFRELPEPLFTDEFYPNFAEGIALSDPVAKESCMLNLLLSLPEAN
.:.::.::::::::::::::::::.::..:: : ::::::::.:::.::..:: :::. :
CCDS11 LSDMDINAIAGTLKLYFRELPEPLLTDRLYPAFMEGIALSDPAAKENCMMHLLRSLPDPN
680 690 700 710 720 730
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KSD LLTFLFLLDHLKRVAEKEAVNKMSLHNLATVFGPTLLRPSEKESKLPANPSQPITMTDSW
:.::::::.::::::::: .::::::::::::::::::::: ::: .. . .: :
CCDS11 LITFLFLLEHLKRVAEKEPINKMSLHNLATVFGPTLLRPSEVESK-----AHLTSAADIW
740 750 760 770 780
1240 1250 1260 1270
pF1KSD SLEVMSQVQVLLYFLQLEAIPAPDSKRQSILFSTEV
: .::.:::::::.:: : . ::... :::.:
CCDS11 SHDVMAQVQVLLYYLQHPPISFAELKRNTLYFSTDV
790 800 810 820
>>CCDS73936.1 ABR gene_id:29|Hs108|chr17 (641 aa)
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Smith-Waterman score: 3018; 71.2% identity (89.3% similar) in 636 aa overlap (637-1271:12-641)
610 620 630 640 650 660
pF1KSD KCCQANAQFAEISENLRARSNKDAKDPTTKNSLETLLYKPVDRVTRSTLVLHDLLKHTPA
: .:::::.::::::::::::::::::.
CCDS73 MEILLIIRFCCNCTYALLYKPIDRVTRSTLVLHDLLKHTPV
10 20 30 40
670 680 690 700 710 720
pF1KSD SHPDHPLLQDALRISQNFLSSINEEITPRRQSMTVKKGEHRQLLKDSFMVELVEGARKLR
.:::.:::::::::::::::::::.: ::: ..:. ::: :::.::.:.::. :..::::
CCDS73 DHPDYPLLQDALRISQNFLSSINEDIDPRRTAVTTPKGETRQLVKDGFLVEVSESSRKLR
50 60 70 80 90 100
730 740 750 760 770 780
pF1KSD HVFLFTDLLLCTKLKKQSGGKTQQYDCKWYIPLTDLSFQMVDELEAVPNIPLVPDEELDA
:::::::.:::.:::: :.:: :::::::::::.:: : .: :: :.. ::.::.
CCDS73 HVFLFTDVLLCAKLKKTSAGKHQQYDCKWYIPLADLVFPSPEESEASPQVHPFPDHELED
110 120 130 140 150 160
790 800 810 820 830 840
pF1KSD LKIKISQIKSDIQREKRANKG-SKATERLKKKLSEQESLLLLMSPSMAFRVHSRNGKSYT
.:.::: .::.::.:: :::: :.: ::::::. :.: :::: ::.. ::.:.::::::
CCDS73 MKMKISALKSEIQKEK-ANKGQSRAIERLKKKMFENEFLLLLNSPTIPFRIHNRNGKSYL
170 180 190 200 210 220
850 860 870 880 890 900
pF1KSD FLISSDYERAEWRENIREQQKKCFRSFSLTSVELQMLTNSCVKLQTVHSIPLTINKEDDE
::.::::::.:::: :.. ::: ...: :.:::::.::.:: ::.:::.::.: ::.:::
CCDS73 FLLSSDYERSEWREAIQKLQKKDLQAFVLSSVELQVLTGSCFKLRTVHNIPVTSNKDDDE
230 240 250 260 270 280
910 920 930 940 950 960
pF1KSD SPGLYGFLNVIVHSATGFKQSSNLYCTLEVDSFGYFVNKAKTRVYRDTAEPNWNEEFEIE
::::::::.:::::: :::::.:::::::::::::::.::::::.::::::.:.::::::
CCDS73 SPGLYGFLHVIVHSAKGFKQSANLYCTLEVDSFGYFVSKAKTRVFRDTAEPKWDEEFEIE
290 300 310 320 330 340
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD LEGSQTLRILCYEKCYNKTKIPKEDGESTDRLMGKGQVQLDPQALQDRDWQRTVIAMNGI
:::::.::::::::::.:::. :...: .:..:::::.:::::... ..:. :: ::::
CCDS73 LEGSQSLRILCYEKCYDKTKVNKDNNEIVDKIMGKGQIQLDPQTVETKNWHTDVIEMNGI
350 360 370 380 390 400
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD EVKLSVKFNSREFSLKRMPSRKQTGVFGVKIAVVTKRERSKVPYIVRQCVEEIERRGMEE
.:..:.::.::..:::: ::.::::::::::.::::::::::::::::::::.:.::.::
CCDS73 KVEFSMKFTSRDMSLKRTPSKKQTGVFGVKISVVTKRERSKVPYIVRQCVEEVEKRGIEE
410 420 430 440 450 460
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD VGIYRVSGVATDIQALKAAFDVNNKDVSVMMSEMDVNAIAGTLKLYFRELPEPLFTDEFY
:::::.::::::::::::.::.::::. .:.:.::.::::::::::::::::::.::..:
CCDS73 VGIYRISGVATDIQALKAVFDANNKDILLMLSDMDINAIAGTLKLYFRELPEPLLTDRLY
470 480 490 500 510 520
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD PNFAEGIALSDPVAKESCMLNLLLSLPEANLLTFLFLLDHLKRVAEKEAVNKMSLHNLAT
: : ::::::::.:::.::..:: :::. ::.::::::.::::::::: .::::::::::
CCDS73 PAFMEGIALSDPAAKENCMMHLLRSLPDPNLITFLFLLEHLKRVAEKEPINKMSLHNLAT
530 540 550 560 570 580
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD VFGPTLLRPSEKESKLPANPSQPITMTDSWSLEVMSQVQVLLYFLQLEAIPAPDSKRQSI
::::::::::: ::: .. . .: :: .::.:::::::.:: : . ::...
CCDS73 VFGPTLLRPSEVESK-----AHLTSAADIWSHDVMAQVQVLLYYLQHPPISFAELKRNTL
590 600 610 620 630
1270
pF1KSD LFSTEV
:::.:
CCDS73 YFSTDV
640
>>CCDS58497.1 ABR gene_id:29|Hs108|chr17 (310 aa)
initn: 1243 init1: 1132 opt: 1240 Z-score: 793.7 bits: 157.0 E(32554): 6.9e-38
Smith-Waterman score: 1240; 70.1% identity (88.8% similar) in 268 aa overlap (1004-1271:48-310)
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KSD ILCYEKCYNKTKIPKEDGESTDRLMGKGQVQLDPQALQDRDWQRTVIAMNGIEVKLSVKF
.::::... ..:. :: ::::.:..:.::
CCDS58 PLALEESGSKRPPNTGARLWGRVRNKLLRNKLDPQTVETKNWHTDVIEMNGIKVEFSMKF
20 30 40 50 60 70
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KSD NSREFSLKRMPSRKQTGVFGVKIAVVTKRERSKVPYIVRQCVEEIERRGMEEVGIYRVSG
.::..:::: ::.::::::::::.::::::::::::::::::::.:.::.:::::::.::
CCDS58 TSRDMSLKRTPSKKQTGVFGVKISVVTKRERSKVPYIVRQCVEEVEKRGIEEVGIYRISG
80 90 100 110 120 130
1100 1110 1120 1130 1140 1150
pF1KSD VATDIQALKAAFDVNNKDVSVMMSEMDVNAIAGTLKLYFRELPEPLFTDEFYPNFAEGIA
::::::::::.::.::::. .:.:.::.::::::::::::::::::.::..:: : ::::
CCDS58 VATDIQALKAVFDANNKDILLMLSDMDINAIAGTLKLYFRELPEPLLTDRLYPAFMEGIA
140 150 160 170 180 190
1160 1170 1180 1190 1200 1210
pF1KSD LSDPVAKESCMLNLLLSLPEANLLTFLFLLDHLKRVAEKEAVNKMSLHNLATVFGPTLLR
::::.:::.::..:: :::. ::.::::::.::::::::: .::::::::::::::::::
CCDS58 LSDPAAKENCMMHLLRSLPDPNLITFLFLLEHLKRVAEKEPINKMSLHNLATVFGPTLLR
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