Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA1969
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1969, 576 aa
1>>>pF1KSDA1969 576 - 576 aa - 576 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4266+/-0.00245; mu= 15.6174+/- 0.147
mean_var=292.0033+/-56.345, 0's: 0 Z-trim(102.0): 993 B-trim: 34 in 1/49
Lambda= 0.075055
statistics sampled from 5700 (6776) to 5700 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.501), E-opt: 0.2 (0.208), width: 16
Scan time: 2.340
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32979.1 ZNF431 gene_id:170959|Hs108|chr19 ( 576) 4058 454.7 1.4e-127
CCDS32978.1 ZNF430 gene_id:80264|Hs108|chr19 ( 570) 3165 358.0 1.8e-98
CCDS54239.1 ZNF714 gene_id:148206|Hs108|chr19 ( 555) 3032 343.6 3.8e-94
CCDS42538.1 ZNF100 gene_id:163227|Hs108|chr19 ( 542) 2880 327.1 3.4e-89
CCDS34646.1 ZNF92 gene_id:168374|Hs108|chr7 ( 586) 2795 318.0 2.1e-86
CCDS32977.1 ZNF85 gene_id:7639|Hs108|chr19 ( 595) 2779 316.3 7e-86
CCDS46031.1 ZNF98 gene_id:148198|Hs108|chr19 ( 572) 2758 314.0 3.3e-85
CCDS32980.1 ZNF708 gene_id:7562|Hs108|chr19 ( 563) 2740 312.0 1.3e-84
CCDS32983.1 ZNF254 gene_id:9534|Hs108|chr19 ( 659) 2710 308.9 1.3e-83
CCDS42537.1 ZNF429 gene_id:353088|Hs108|chr19 ( 674) 2702 308.0 2.4e-83
CCDS75605.1 ZNF107 gene_id:51427|Hs108|chr7 ( 852) 2694 307.3 4.9e-83
CCDS59372.1 ZNF726 gene_id:730087|Hs108|chr19 ( 616) 2685 306.1 8.2e-83
CCDS54238.1 ZNF737 gene_id:100129842|Hs108|chr19 ( 536) 2684 305.9 8.3e-83
CCDS5528.2 ZNF273 gene_id:10793|Hs108|chr7 ( 569) 2666 304.0 3.3e-82
CCDS46030.1 ZNF257 gene_id:113835|Hs108|chr19 ( 563) 2653 302.6 8.7e-82
CCDS42541.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1191) 2655 303.4 1.1e-81
CCDS34644.1 ZNF680 gene_id:340252|Hs108|chr7 ( 530) 2629 299.9 5.1e-81
CCDS32973.1 ZNF93 gene_id:81931|Hs108|chr19 ( 620) 2619 299.0 1.2e-80
CCDS46032.1 ZNF492 gene_id:57615|Hs108|chr19 ( 531) 2617 298.6 1.3e-80
CCDS32981.1 ZNF675 gene_id:171392|Hs108|chr19 ( 568) 2611 298.0 2e-80
CCDS42535.1 ZNF626 gene_id:199777|Hs108|chr19 ( 528) 2605 297.3 3.1e-80
CCDS59371.1 ZNF730 gene_id:100129543|Hs108|chr19 ( 503) 2604 297.2 3.3e-80
CCDS74321.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 818) 2589 295.9 1.3e-79
CCDS12413.2 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 809) 2588 295.8 1.4e-79
CCDS12414.2 ZNF681 gene_id:148213|Hs108|chr19 ( 645) 2584 295.2 1.6e-79
CCDS59367.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 803) 2572 294.1 4.5e-79
CCDS59369.1 ZNF99 gene_id:7652|Hs108|chr19 ( 864) 2562 293.0 9.9e-79
CCDS74323.1 ZNF254 gene_id:9534|Hs108|chr19 ( 618) 2552 291.7 1.8e-78
CCDS42539.1 ZNF676 gene_id:163223|Hs108|chr19 ( 588) 2528 289.1 1.1e-77
CCDS54240.1 ZNF208 gene_id:7757|Hs108|chr19 (1280) 2464 282.7 1.9e-75
CCDS43590.1 ZNF479 gene_id:90827|Hs108|chr7 ( 524) 2454 281.0 2.6e-75
CCDS47596.1 ZNF92 gene_id:168374|Hs108|chr7 ( 517) 2446 280.1 4.7e-75
CCDS75608.1 ZNF92 gene_id:168374|Hs108|chr7 ( 554) 2417 277.0 4.2e-74
CCDS75609.1 ZNF92 gene_id:168374|Hs108|chr7 ( 510) 2416 276.8 4.4e-74
CCDS46028.1 ZNF90 gene_id:7643|Hs108|chr19 ( 601) 2412 276.5 6.4e-74
CCDS74324.1 ZNF254 gene_id:9534|Hs108|chr19 ( 586) 2374 272.4 1.1e-72
CCDS42532.1 ZNF253 gene_id:56242|Hs108|chr19 ( 499) 2351 269.8 5.7e-72
CCDS55112.1 ZNF716 gene_id:441234|Hs108|chr7 ( 495) 2339 268.5 1.4e-71
CCDS5527.1 ZNF107 gene_id:51427|Hs108|chr7 ( 783) 2332 268.1 3e-71
CCDS43593.1 ZNF117 gene_id:51351|Hs108|chr7 ( 483) 2303 264.6 2.1e-70
CCDS75606.1 ZNF107 gene_id:51427|Hs108|chr7 ( 820) 2301 264.7 3.1e-70
CCDS62623.1 ZNF254 gene_id:9534|Hs108|chr19 ( 574) 2292 263.5 5.1e-70
CCDS74322.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1159) 2282 262.9 1.5e-69
CCDS42533.1 ZNF682 gene_id:91120|Hs108|chr19 ( 498) 2261 260.0 4.9e-69
CCDS75078.1 ZNF718 gene_id:255403|Hs108|chr4 ( 478) 2144 247.3 3.1e-65
CCDS46029.1 ZNF486 gene_id:90649|Hs108|chr19 ( 463) 2126 245.4 1.2e-64
CCDS42534.1 ZNF682 gene_id:91120|Hs108|chr19 ( 466) 2100 242.6 8.4e-64
CCDS42531.1 ZNF506 gene_id:440515|Hs108|chr19 ( 444) 2069 239.2 8.4e-63
CCDS75079.1 ZNF718 gene_id:255403|Hs108|chr4 ( 446) 1993 230.9 2.5e-60
CCDS46991.1 ZNF721 gene_id:170960|Hs108|chr4 ( 923) 1996 231.8 2.9e-60
>>CCDS32979.1 ZNF431 gene_id:170959|Hs108|chr19 (576 aa)
initn: 4058 init1: 4058 opt: 4058 Z-score: 2403.9 bits: 454.7 E(32554): 1.4e-127
Smith-Waterman score: 4058; 100.0% identity (100.0% similar) in 576 aa overlap (1-576:1-576)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MDDLKYGVYPLKEASGCPGAERNLLVYSYFEKETLTFRDVAIEFSLEEWECLNPAQQNLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MDDLKYGVYPLKEASGCPGAERNLLVYSYFEKETLTFRDVAIEFSLEEWECLNPAQQNLY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD MNVMLENYKNLVFLGVAVSKQDPVTCLEQEKEPWNMKRHEMVDEPPAMCSYFTKDLWPEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MNVMLENYKNLVFLGVAVSKQDPVTCLEQEKEPWNMKRHEMVDEPPAMCSYFTKDLWPEQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD DIKDSFQQVILRRYGKCEHENLQLRKGSASVDEYKVHKEGYNELNQCLTTTQSKIFPCDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DIKDSFQQVILRRYGKCEHENLQLRKGSASVDEYKVHKEGYNELNQCLTTTQSKIFPCDK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD YVKVFHKFLNANRHKTRHTGKKPFKCKKCGKSFCMLLHLSQHKRIHIRENSYQCEECGKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 YVKVFHKFLNANRHKTRHTGKKPFKCKKCGKSFCMLLHLSQHKRIHIRENSYQCEECGKA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD FKWFSTLTRHKRIHTGEKPFKCEECGKAFKQSSTLTTHKIIHTGEKPYRCEECGKAFNRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FKWFSTLTRHKRIHTGEKPFKCEECGKAFKQSSTLTTHKIIHTGEKPYRCEECGKAFNRS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD SHLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLSTHKFIHAGEKPYKCEECDKAFNRFSYLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SHLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLSTHKFIHAGEKPYKCEECDKAFNRFSYLT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD KHKIIHTGEKSYKCEECGKGFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEVCGKAFNESSNLTTHKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KHKIIHTGEKSYKCEECGKGFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEVCGKAFNESSNLTTHKM
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD IHTGEKPYKCEECGKAFNRSPQLTAHKIIHTGEKPYKCEECGKAFSQSSILTTHKRIHTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 IHTGEKPYKCEECGKAFNRSPQLTAHKIIHTGEKPYKCEECGKAFSQSSILTTHKRIHTG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD EKPYKCEECGKAFNRSSNLTKHKIIHTGEKSYKCEECGKAFNQSSTLTKHRKIHTRQKPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EKPYKCEECGKAFNRSSNLTKHKIIHTGEKSYKCEECGKAFNQSSTLTKHRKIHTRQKPY
490 500 510 520 530 540
550 560 570
pF1KSD NCEECDNTFNQSSNLIKQNNSYWRETLQMSRMWESL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NCEECDNTFNQSSNLIKQNNSYWRETLQMSRMWESL
550 560 570
>>CCDS32978.1 ZNF430 gene_id:80264|Hs108|chr19 (570 aa)
initn: 2772 init1: 2772 opt: 3165 Z-score: 1881.4 bits: 358.0 E(32554): 1.8e-98
Smith-Waterman score: 3165; 79.3% identity (89.8% similar) in 570 aa overlap (1-569:1-570)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MDDLKYGVYPLKEASGCPGAERNLLVYSYFEKETLTFRDVAIEFSLEEWECLNPAQQNLY
:..:: ::::::::::::::.:::::::..:: :::::::::::::::.::. :::.::
CCDS32 MENLKSGVYPLKEASGCPGADRNLLVYSFYEKGPLTFRDVAIEFSLEEWQCLDTAQQDLY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KSD MNVMLENYKNLVFL-GVAVSKQDPVTCLEQEKEPWNMKRHEMVDEPPAMCSYFTKDLWPE
.::::::.::::: :.:::: : .::::: ::::::::: :::.::. :.:..:::::
CCDS32 RKVMLENYRNLVFLAGIAVSKPDLITCLEQGKEPWNMKRHAMVDQPPVTYSHFAQDLWPE
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KSD QDIKDSFQQVILRRYGKCEHENLQLRKGSASVDEYKVHKEGYNELNQCLTTTQSKIFPCD
: ::::::.::::::::: ::.:::: : :::: ..::: :.:::::::::::.:: :
CCDS32 QGIKDSFQEVILRRYGKCGHEDLQLRTGCKSVDECNLHKECYDELNQCLTTTQSEIFQYD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KSD KYVKVFHKFLNANRHKTRHTGKKPFKCKKCGKSFCMLLHLSQHKRIHIRENSYQCEECGK
:::.::.:: : : .: ::::::::::::: :::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS32 KYVNVFYKFSNPNIQKIRHTGKKPFKCKKCDKSFCMLLHLTQHKRIHIRENSYQCEECGK
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KSD AFKWFSTLTRHKRIHTGEKPFKCEECGKAFKQSSTLTTHKIIHTGEKPYRCEECGKAFNR
.:.::::::::.::::::::.:::.:::::::::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS32 VFNWFSTLTRHRRIHTGEKPYKCEQCGKAFKQSSTLTTHKIIHTGEKPYRCEECGKTFNR
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KSD SSHLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLSTHKFIHAGEKPYKCEECDKAFNRFSYL
:::::::: ::::::::.:::::.:::.:: :.:::.::.:::::::::: ::::. : :
CCDS32 SSHLTTHKRIHTGEKPYRCEECGRAFNRSSHLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTL
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KSD TKHKIIHTGEKSYKCEECGKGFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEVCGKAFNESSNLTTHK
: :::::.::: ::::::::.: : ::::: :::::: :::: :::.:: ::.:: ::
CCDS32 TTHKIIHAGEKPYKCEECGKAFYRFSYLTKHKIIHTGEKFYKCEECGKGFNWSSTLTKHK
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KSD MIHTGEKPYKCEECGKAFNRSPQLTAHKIIHTGEKPYKCEECGKAFSQSSILTTHKRIHT
:::::::::::.::::::.: .:::::::::::::::::::::::..: ::.:: ::.
CCDS32 RIHTGEKPYKCEQCGKAFNESSNLTAHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSPKLTAHKVIHS
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KSD GEKPYKCEECGKAFNRSSNLTKHKIIHTGEKSYKCEECGKAFNQSSTLTKHRKIHTRQKP
:::::::::::::::. :::::::: : :. ::: :: :::.::::::::. ::: .::
CCDS32 GEKPYKCEECGKAFNQFSNLTKHKITHIGDTSYKYLECDKAFSQSSTLTKHKVIHTGEKP
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570
pF1KSD YNCEECDNTFNQSSNLIKQNNSYWRETLQMSRMWESL
::::: ..::::::::.:.::::::::::
CCDS32 YNCEEYGKAFNQSSNLIEQSNSYWRETLQM
550 560 570
>>CCDS54239.1 ZNF714 gene_id:148206|Hs108|chr19 (555 aa)
initn: 6180 init1: 2944 opt: 3032 Z-score: 1803.7 bits: 343.6 E(32554): 3.8e-94
Smith-Waterman score: 3032; 86.0% identity (93.6% similar) in 499 aa overlap (61-558:1-499)
40 50 60 70 80
pF1KSD EKETLTFRDVAIEFSLEEWECLNPAQQNLYMNVMLENYKNLVFL-GVAVSKQDPVTCLEQ
:::::::::::::: :.:::::::.: :::
CCDS54 MNVMLENYKNLVFLAGIAVSKQDPITSLEQ
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KSD EKEPWNMKRHEMVDEPPAMCSYFTKDLWPEQDIKDSFQQVILRRYGKCEHENLQLRKGSA
:::::::: ::::: ::::: ::.:::::::::::::::::::.:::::::::::::::
CCDS54 EKEPWNMKICEMVDESPAMCSSFTRDLWPEQDIKDSFQQVILRRHGKCEHENLQLRKGSA
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KSD SVDEYKVHKEGYNELNQCLTTTQSKIFPCDKYVKVFHKFLNANRHKTRHTGKKPFKCKKC
.: : ::.:.::::::::::::::::::::::.:::::..:.:::::::::.::::::::
CCDS54 NVVECKVYKKGYNELNQCLTTTQSKIFPCDKYIKVFHKIFNSNRHKTRHTGEKPFKCKKC
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KSD GKSFCMLLHLSQHKRIHIRENSYQCEECGKAFKWFSTLTRHKRIHTGEKPFKCEECGKAF
.:::::::: ::::::::::::::::: :.:: :::::::::.::::::::::::::::
CCDS54 DESFCMLLHLHQHKRIHIRENSYQCEECDKVFKRFSTLTRHKRVHTGEKPFKCEECGKAF
160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310 320
pF1KSD KQSSTLTTHKIIHTGEKPYRCEECGKAFNRSSHLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSS
:.::::::::.::::::::::::::::: .::::::::.:::::::.::::::::::. :
CCDS54 KHSSTLTTHKMIHTGEKPYRCEECGKAFYHSSHLTTHKVIHTGEKPFKCEECGKAFNHPS
220 230 240 250 260 270
330 340 350 360 370 380
pF1KSD TLSTHKFIHAGEKPYKCEECDKAFNRFSYLTKHKIIHTGEKSYKCEECGKGFNWSSTLTK
.:.::::::. ::::::::::::::::::::::::::.::::::::.:::::::::::::
CCDS54 ALTTHKFIHVKEKPYKCEECDKAFNRFSYLTKHKIIHSGEKSYKCEQCGKGFNWSSTLTK
280 290 300 310 320 330
390 400 410 420 430 440
pF1KSD HKRIHTGEKPYKCEVCGKAFNESSNLTTHKMIHTGEKPYKCEECGKAFNRSPQLTAHKII
:::::::::::::: :::::: ::.::::::::::::::::::::::::.: .:: ::::
CCDS54 HKRIHTGEKPYKCEECGKAFNVSSHLTTHKMIHTGEKPYKCEECGKAFNHSSKLTIHKII
340 350 360 370 380 390
450 460 470 480 490 500
pF1KSD HTGEKPYKCEECGKAFSQSSILTTHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSNLTKHKIIHTGE
::::::::::::::::.::: :: :: :::::: ::::::::::::::::: :: :::::
CCDS54 HTGEKPYKCEECGKAFNQSSNLTKHKIIHTGEKLYKCEECGKAFNRSSNLTTHKRIHTGE
400 410 420 430 440 450
510 520 530 540 550 560
pF1KSD KSYKCEECGKAFNQSSTLTKHRKIHTRQKPYNCEECDNTFNQSSNLIKQNNSYWRETLQM
: :::::::::::.::.:::: ::: .: :.:::: ..:::::.: :.
CCDS54 KPYKCEECGKAFNRSSNLTKHNIIHTGEKSYKCEECGKAFNQSSTLTKHRKIQQGMVAHA
460 470 480 490 500 510
570
pF1KSD SRMWESL
CCDS54 CNPNTLRGLGEQIARSGVQDQPGQHGKTPSLLKIQKFAGCGGRRL
520 530 540 550
>>CCDS42538.1 ZNF100 gene_id:163227|Hs108|chr19 (542 aa)
initn: 5579 init1: 2469 opt: 2880 Z-score: 1714.8 bits: 327.1 E(32554): 3.4e-89
Smith-Waterman score: 2901; 74.2% identity (84.0% similar) in 570 aa overlap (1-569:1-542)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MDDLKYGVYPLKEASGCPGAERNLLVYSYFEKETLTFRDVAIEFSLEEWECLNPAQQNLY
::: .::. ::: :::::::::.::: ::::: :::::::::::::::.::. :::.::
CCDS42 MDDPRYGMCPLKGASGCPGAERSLLVQSYFEKGPLTFRDVAIEFSLEEWQCLDSAQQGLY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KSD MNVMLENYKNLVFL-GVAVSKQDPVTCLEQEKEPWNMKRHEMVDEPPAMCSYFTKDLWPE
.::::::.::::: :.:..: : .::::: :::::.:::::: .::..::.: .::: :
CCDS42 RKVMLENYRNLVFLAGIALTKPDLITCLEQGKEPWNIKRHEMVAKPPVICSHFPQDLWAE
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KSD QDIKDSFQQVILRRYGKCEHENLQLRKGSASVDEYKVHKEGYNELNQCLTTTQSKIFPCD
::::::::..::..::: :.::::.:: :::: ::::: :.::::: ::::.:: ::
CCDS42 QDIKDSFQEAILKKYGKYGHDNLQLQKGCKSVDECKVHKEHDNKLNQCLITTQSNIFQCD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KSD KYVKVFHKFLNANRHKTRHTGKKPFKCKKCGKSFCMLLHLSQHKRIHIRENSYQCEECGK
.:::: : :.:::: ::: ::::::::: :::::::::.::::.:: ::::::..:::
CCDS42 PSAKVFHTFSNSNRHKIRHTRKKPFKCKKCEKSFCMLLHLTQHKRFHITENSYQCKDCGK
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KSD AFKWFSTLTRHKRIHTGEKPFKCEECGKAFKQSSTLTTHKIIHTGEKPYRCEECGKAFNR
::.:::::: :.::::::::.:::::::::..:: :::::::::::::::::::::::::
CCDS42 AFNWFSTLTTHRRIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSHLTTHKIIHTGEKPYRCEECGKAFNR
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KSD SSHLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLSTHKFIHAGEKPYKCEECDKAFNRFSYL
:::::::: :::: ::::: :::::::.:: :.::..::.:::::::::: ::::. : :
CCDS42 SSHLTTHKRIHTGVKPYKCTECGKAFNRSSHLTTHRIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTL
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KSD TKHKIIHTGEKSYKCEECGKGFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEVCGKAFNESSNLTTHK
: ::: :.::: ::::::::.: : ::::: ::::: :::: :::.:: :: :: ::
CCDS42 TTHKITHAGEKPYKCEECGKAFYRFSYLTKHKTSHTGEKFYKCEECGKGFNWSSALTKHK
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KSD MIHTGEKPYKCEECGKAFNRSPQLTAHKIIHTGEKPYKCEECGKAFSQSSILTTHKRIHT
::::::::::::::::::.: .::.::.::::::::::.::::::..:: ::.:: :::
CCDS42 RIHTGEKPYKCEECGKAFNESSNLTTHKMIHTGEKPYKCDECGKAFNRSSQLTAHKMIHT
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KSD GEKPYKCEECGKAFNRSSNLTKHKIIHTGEKSYKCEECGKAFNQSSTLTKHRKIHTRQKP
::::::::::::::::::.:::::: :::::::: ::::: :::: .:
CCDS42 GEKPYKCEECGKAFNRSSTLTKHKITHTGEKSYKWEECGKDFNQSLSL------------
490 500 510 520
540 550 560 570
pF1KSD YNCEECDNTFNQSSNLIKQNNSYWRETLQMSRMWESL
::::::::::::::
CCDS42 ----------------IKQNNSYWRETLQM
530 540
>>CCDS34646.1 ZNF92 gene_id:168374|Hs108|chr7 (586 aa)
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Smith-Waterman score: 2795; 75.9% identity (86.4% similar) in 528 aa overlap (35-562:4-531)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD KYGVYPLKEASGCPGAERNLLVYSYFEKETLTFRDVAIEFSLEEWECLNPAQQNLYMNVM
:::::: ::::::::.::. ::.::: .::
CCDS34 MGPLTFRDVKIEFSLEEWQCLDTAQRNLYRDVM
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LENYKNLVFLGVAVSKQDPVTCLEQEKEPWNMKRHEMVDEPPAMCSYFTKDLWPEQDIKD
::::.::::::.:::: : .: ::: :::::.:::::::. :.:::.:..:.:::..:::
CCDS34 LENYRNLVFLGIAVSKPDLITWLEQGKEPWNLKRHEMVDKTPVMCSHFAQDVWPEHSIKD
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KSD SFQQVILRRYGKCEHENLQLRKGSASVDEYKVHKEGYNELNQCLTTTQSKIFPCDKYVKV
:::.:::: ::: :::::::: ::: ::.: ::: ::::::::.:::: :::::::
CCDS34 SFQKVILRTYGKYGHENLQLRKDHKSVDACKVYKGGYNGLNQCLTTTDSKIFQCDKYVKV
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KSD FHKFLNANRHKTRHTGKKPFKCKKCGKSFCMLLHLSQHKRIHIRENSYQCEECGKAFKWF
:::: :.::.: :::::::::::. ::::::: .:.:::.:: :: ::.::::::::.:
CCDS34 FHKFPNVNRNKIRHTGKKPFKCKNRGKSFCMLSQLTQHKKIHTREYSYKCEECGKAFNWS
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KSD STLTRHKRIHTGEKPFKCEECGKAFKQSSTLTTHKIIHTGEKPYRCEECGKAFNRSSHLT
::::.:: :::::::.:::::::::..::.:: :::::::::::.:::::::::::: ::
CCDS34 STLTKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSNLTKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSTLT
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KSD THKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLSTHKFIHAGEKPYKCEECDKAFNRFSYLTKHKI
:: ::: ::::::::::::::: : :. :: :: .:::::::: ::: :: : ::::
CCDS34 KHKRIHTEEKPYKCEECGKAFNQFSILNKHKRIHMEDKPYKCEECGKAFRVFSILKKHKI
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KSD IHTGEKSYKCEECGKGFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEVCGKAFNESSNLTTHKMIHTG
:::::: ::::::::.:: :.::::: ::::::::::. ::::::.::.:: :: ::::
CCDS34 IHTGEKPYKCEECGKAFNQFSNLTKHKIIHTGEKPYKCDECGKAFNQSSTLTKHKRIHTG
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KSD EKPYKCEECGKAFNRSPQLTAHKIIHTGEKPYKCEECGKAFSQSSILTTHKRIHTGEKPY
:::::::::::::..: :: ::::::::::::::.:::::: :: .: ::: : .:::
CCDS34 EKPYKCEECGKAFKQSSTLTEHKIIHTGEKPYKCEKCGKAFSWSSAFTKHKRNHMEDKPY
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KSD KCEECGKAFNRSSNLTKHKIIHTGEKSYKCEECGKAFNQSSTLTKHRKIHTRQKPYNCEE
:::::::::. :.::::::::: :: :::::::::::::: .:::. :::. : :.::.
CCDS34 KCEECGKAFSVFSTLTKHKIIHTREKPYKCEECGKAFNQSSIFTKHKIIHTEGKSYKCEK
460 470 480 490 500 510
550 560 570
pF1KSD CDNTFNQSSNLIKQNNSYWRETLQMSRMWESL
: :.::::::: .. :
CCDS34 CGNAFNQSSNLTARKIIYTGEKPYKYEECDKAFNKFSTLITHQIIYTGEKPCKHECGRAF
520 530 540 550 560 570
>>CCDS32977.1 ZNF85 gene_id:7639|Hs108|chr19 (595 aa)
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Smith-Waterman score: 2785; 72.5% identity (84.4% similar) in 553 aa overlap (35-558:4-556)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD KYGVYPLKEASGCPGAERNLLVYSYFEKETLTFRDVAIEFSLEEWECLNPAQQNLYMNVM
::::::::::::.::.::. ::.::: :::
CCDS32 MGPLTFRDVAIEFSLKEWQCLDTAQRNLYRNVM
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LENYKNLVFLGVAVSKQDPVTCLEQEKEPWNMKRHE-MVDEPPAMCSYFTKDLWPEQDIK
::::.::::::..::: : .::::: :: :.::::: :: .: .:::.:..::::::.::
CCDS32 LENYRNLVFLGITVSKPDLITCLEQGKEAWSMKRHEIMVAKPTVMCSHFAQDLWPEQNIK
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KSD DSFQQVILRRYGKCEHENLQLRKGSASVDEYKVHKEGYNELNQCLTTTQSKIFPCDKYVK
::::.: :.:::::.:::: :::: :.:: :.:: : : ::::::.:::::: ::::::
CCDS32 DSFQKVTLKRYGKCRHENLPLRKGCESMDECKMHKGGCNGLNQCLTATQSKIFQCDKYVK
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KSD VFHKFLNANRHKTRHTGKKPFKCKKCGKSFCMLLHLSQHKRIHIRENSYQCEECGKAFKW
: ::: :.:::. ::: :::::: :::::: :. :..:.::: : : :.::::::::.:
CCDS32 VAHKFSNSNRHEIRHTKKKPFKCTKCGKSFGMISCLTEHSRIHTRVNFYKCEECGKAFNW
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KSD FSTLTRHKRIHTGEKPFKCEECGKAFKQSSTLTTHKIIHTGEKPYRCEECGKAFNRSSHL
::::.::::::::::.:::::::::.:::.: :: ::::::::.::::::.::: : :
CCDS32 SSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSNLIKHKKIHTGEKPYKCEECGKTFNRFSTL
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KSD TTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLSTHKFIHAGEKPYKCEECDKAFNRFSYLTKHK
:::::::::::::::.:::::::.::::.::. ::.:::::::::: :::.. : :: ::
CCDS32 TTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNRSSTLTTHRKIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSNLTTHK
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KSD IIHTGEKSYKCEECGKGFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEVCGKAFNESSNLTTHKMIHT
::::::: :::..:::.:: :. :: :. ::::::::::: ::::::. :.:::::.:::
CCDS32 IIHTGEKPYKCKKCGKAFNQSAHLTTHEVIHTGEKPYKCEKCGKAFNHFSHLTTHKIIHT
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KSD GEKPYKCEECGKAFNRSPQLTAHKIIHTGEKPYKCEECGKAFSQSSILTTHKRIHTGEKP
:::::::.::::::..: :: :::::::::::::.:: :::.::: :: ::.:::::::
CCDS32 GEKPYKCKECGKAFKHSSTLTKHKIIHTGEKPYKCKECEKAFNQSSKLTEHKKIHTGEKP
400 410 420 430 440 450
490 500 510
pF1KSD YKCEECGKAFNRSSNLTKHK----------------------------IIHTGEKSYKCE
:.::.::::::.:::::.:: ::::::: ::::
CCDS32 YECEKCGKAFNQSSNLTRHKKSHTEEKPYKCEECGKGFKWPSTLTIHKIIHTGEKPYKCE
460 470 480 490 500 510
520 530 540 550 560 570
pF1KSD ECGKAFNQSSTLTKHRKIHTRQKPYNCEECDNTFNQSSNLIKQNNSYWRETLQMSRMWES
:::::::::: ::::.:::: .:::.:::: ..::::::: :.
CCDS32 ECGKAFNQSSKLTKHKKIHTGEKPYTCEECGKAFNQSSNLTKHKRIHTGEKPYKCEECDK
520 530 540 550 560 570
pF1KSD L
CCDS32 AFKWSSVLTKHKIIHTGEKLQI
580 590
>>CCDS46031.1 ZNF98 gene_id:148198|Hs108|chr19 (572 aa)
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Smith-Waterman score: 2758; 73.4% identity (87.0% similar) in 538 aa overlap (30-567:8-545)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MDDLKYGVYPLKEASGCPGAERNLLVYSYFEKETLTFRDVAIEFSLEEWECLNPAQQNLY
.: .:::::::.:::::::.::. ::::::
CCDS46 MPGPLGSLEMGVLTFRDVALEFSLEEWQCLDTAQQNLY
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KSD MNVMLENYKNLVFLGVAVSKQDPVTCLEQEKEPWNMKRHEMVDEPPAMCSYFTKDLWPEQ
:::::::.::::.:.:.:: : .::::: :::::.:::::: :::.. :::..::::.:
CCDS46 RNVMLENYRNLVFVGIAASKPDLITCLEQGKEPWNVKRHEMVTEPPVVYSYFAQDLWPKQ
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KSD DIKDSFQQVILRRYGKCEHENLQLRKGSASVDEYKVHKEGYNELNQCLTTTQSKIFPCDK
:. ::.:::: : :: .::::::: :.:: ::::: :: :::::::::.::: ::
CCDS46 GKKNYFQKVILRTYKKCGRENLQLRKYCKSMDECKVHKECYNGLNQCLTTTQNKIFQYDK
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KSD YVKVFHKFLNANRHKTRHTGKKPFKCKKCGKSFCMLLHLSQHKRIHIRENSYQCEECGKA
:::::::: :.:::: ::::: ::::.: :::::: ::.:::::: :. :.:.:::::
CCDS46 YVKVFHKFSNSNRHKIGHTGKKSFKCKECEKSFCMLSHLAQHKRIHSGEKPYKCKECGKA
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KSD FKWFSTLTRHKRIHTGEKPFKCEECGKAFKQSSTLTTHKIIHTGEKPYRCEECGKAFNRS
.. :.:. :::::::.::.:::::::::.. : ::::::::::.:::.:::::::::.:
CCDS46 YNEASNLSTHKRIHTGKKPYKCEECGKAFNRLSHLTTHKIIHTGKKPYKCEECGKAFNQS
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KSD SHLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLSTHKFIHAGEKPYKCEECDKAFNRFSYLT
..::::: ::::::::::::::.::.:::::..::.::::::::::::: :::.. : ::
CCDS46 ANLTTHKRIHTGEKPYKCEECGRAFSQSSTLTAHKIIHAGEKPYKCEECGKAFSQSSTLT
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KSD KHKIIHTGEKSYKCEECGKGFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEVCGKAFNESSNLTTHKM
::::::::: ::::::::.:. : :: :::::.:::::::: :::::..::.:::::
CCDS46 THKIIHTGEKFYKCEECGKAFSRLSHLTTHKRIHSGEKPYKCEECGKAFKQSSTLTTHKR
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KSD IHTGEKPYKCEECGKAFNRSPQLTAHKIIHTGEKPYKCEECGKAFSQSSILTTHKRIHTG
::.::: :::: :.:::.: .::.:: :::::::::::::::::. :: ::::: ::::
CCDS46 IHAGEKFYKCEVCSKAFSRFSHLTTHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNLSSQLTTHKIIHTG
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KSD EKPYKCEECGKAFNRSSNLTKHKIIHTGEKSYKCEECGKAFNQSSTLTKHRKIHTRQKPY
::::::::::::::.::.:.:::.:::::: :::::::::::::: :: :. ::: .:::
CCDS46 EKPYKCEECGKAFNQSSTLSKHKVIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSHLTTHKMIHTGEKPY
460 470 480 490 500 510
550 560 570
pF1KSD NCEECDNTFNQSSNLIKQNNSYWRETLQMSRMWESL
.:::: ..::.:: : ... . : :
CCDS46 KCEECGKAFNNSSILNRHKMIHTGEKLYKPESCNNACDNIAKISKYKRNCAGEK
520 530 540 550 560 570
>>CCDS32980.1 ZNF708 gene_id:7562|Hs108|chr19 (563 aa)
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Smith-Waterman score: 2740; 75.0% identity (87.4% similar) in 524 aa overlap (35-558:4-522)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD KYGVYPLKEASGCPGAERNLLVYSYFEKETLTFRDVAIEFSLEEWECLNPAQQNLYMNVM
::: :::::::::::.::. :::::: :::
CCDS32 MGPLTFMDVAIEFSLEEWQCLDTAQQNLYRNVM
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LENYKNLVFLGVAVSKQDPVTCLEQEKEPWNMKRHEMVDEPPAMCSYFTKDLWPEQDIKD
::::.::::::.:::. : .::::: :::::::::::. .::::::.:.::: ::: ::.
CCDS32 LENYRNLVFLGIAVSNLDLITCLEQGKEPWNMKRHEMAAKPPAMCSHFAKDLRPEQYIKN
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KSD SFQQVILRRYGKCEHENLQLRKGSASVDEYKVHKEGYNELNQCLTTTQSKIFPCDKYVKV
::::::::::::: .. :: ::::.:.:: :.. ::.:.::::::: :::::::
CCDS32 SFQQVILRRYGKCGYQ-----KGCKSVDEHKLHKGGHKGLNRCVTTTQSKIVQCDKYVKV
100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KSD FHKFLNANRHKTRHTGKKPFKCKKCGKSFCMLLHLSQHKRIHIRENSYQCEECGKAFKWF
:::. ::.::: :::::.:::::.:::::::: .:.::. :: :. :.:::::::::
CCDS32 FHKYSNAKRHKIRHTGKNPFKCKECGKSFCMLSQLTQHEIIHTGEKPYKCEECGKAFKKS
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KSD STLTRHKRIHTGEKPFKCEECGKAFKQSSTLTTHKIIHTGEKPYRCEECGKAFNRSSHLT
:.:: :: :::::::.:::::::::.:::::: ::::::::: :.::::::::::::.::
CCDS32 SNLTNHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLTRHKIIHTGEKLYKCEECGKAFNRSSNLT
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KSD THKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLSTHKFIHAGEKPYKCEECDKAFNRFSYLTKHKI
:::.::::::::::::::::.:::.:..:: ::.::::::: :: :::. :.:: ::
CCDS32 KHKIVHTGEKPYKCEECGKAFKQSSNLTNHKKIHTGEKPYKCGECGKAFTLSSHLTTHKR
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KSD IHTGEKSYKCEECGKGFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEVCGKAFNESSNLTTHKMIHTG
:::::: ::::::::.:. ::::::: ::: ::::::: ::::::.::.::.::.::::
CCDS32 IHTGEKPYKCEECGKAFSVFSTLTKHKIIHTEEKPYKCEECGKAFNRSSHLTNHKVIHTG
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470 480
pF1KSD EKPYKCEECGKAFNRSPQLTAHKIIHTGEKPYKCEECGKAFSQSSILTTHKRIHTGEKPY
:::::::::::::..: :: ::.::::.::::::::::::: :::: :: ::: .:::
CCDS32 EKPYKCEECGKAFTKSSTLTYHKVIHTGKKPYKCEECGKAFSIFSILTKHKVIHTEDKPY
390 400 410 420 430 440
490 500 510 520 530 540
pF1KSD KCEECGKAFNRSSNLTKHKIIHTGEKSYKCEECGKAFNQSSTLTKHRKIHTRQKPYNCEE
:::::::.:: :::.:.:: :::::: ::::::::.: :: :: :. ::: .:::.:.:
CCDS32 KCEECGKTFNYSSNFTNHKKIHTGEKPYKCEECGKSFILSSHLTTHKIIHTGEKPYKCKE
450 460 470 480 490 500
550 560 570
pF1KSD CDNTFNQSSNLIKQNNSYWRETLQMSRMWESL
: ..:::::.:.:.
CCDS32 CGKAFNQSSTLMKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSPNLTKHKRIHTKEKPYKCK
510 520 530 540 550 560
>>CCDS32983.1 ZNF254 gene_id:9534|Hs108|chr19 (659 aa)
initn: 13056 init1: 2703 opt: 2710 Z-score: 1614.6 bits: 308.9 E(32554): 1.3e-83
Smith-Waterman score: 2710; 73.0% identity (85.4% similar) in 541 aa overlap (18-558:2-536)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MDDLKYGVYPLKEASGCPGAERNLLVYSYFEKETLTFRDVAIEFSLEEWECLNPAQQNLY
:: :.: : :::::::::::::::. :. ::::::
CCDS32 MPGPPRSL------EMGLLTFRDVAIEFSLEEWQHLDIAQQNLY
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KSD MNVMLENYKNLVFLGVAVSKQDPVTCLEQEKEPWNMKRHEMVDEPPAMCSYFTKDLWPEQ
:::::::.::.:::.:::: : .::::: ::::::::::::::::.:: .:..::::::
CCDS32 RNVMLENYRNLAFLGIAVSKPDLITCLEQGKEPWNMKRHEMVDEPPGMCPHFAQDLWPEQ
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KSD DIKDSFQQVILRRYGKCEHENLQLRKGSASVDEYKVHKEGYNELNQCLTTTQSKIFPCDK
..::::..::::::: ::::::::: :::::::.::::: ::::.::.:::.: :::
CCDS32 GMEDSFQKAILRRYGKYGHENLQLRKGCKSVDEYKVNKEGYNGLNQCFTTAQSKVFQCDK
100 110 120 130 140 150
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CCDS42 SALTNHKRIYVGEKHYRCEECGKAFNHYSTLTNHKRIHTGEKPYKCKECGKAFSRYSTLT
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]