Result of FASTA (omim) for
pF1KSDA1874
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1874, 521 aa
1>>>pF1KSDA1874 521 - 521 aa - 521 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9444+/-0.000886; mu= 12.7254+/- 0.055
mean_var=317.4633+/-61.643, 0's: 0 Z-trim(111.6): 2097 B-trim: 159 in 2/48
Lambda= 0.071983
statistics sampled from 17879 (20251) to 17879 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.562), E-opt: 0.2 (0.237), width: 16
Scan time: 9.530
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_056209 (OMIM: 194538) zinc finger protein 10 [H ( 573) 1514 172.4 3.2e-42
NP_653285 (OMIM: 613910) zinc finger protein 480 i ( 535) 1491 170.0 1.6e-41
XP_011524767 (OMIM: 613910) PREDICTED: zinc finger ( 535) 1491 170.0 1.6e-41
NP_001276331 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 616) 1466 167.5 1e-40
XP_016882731 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 621) 1466 167.5 1e-40
XP_016882730 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 628) 1466 167.5 1.1e-40
XP_016882729 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 658) 1466 167.5 1.1e-40
NP_001276330 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 658) 1466 167.5 1.1e-40
XP_005259268 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1466 167.5 1.1e-40
XP_006723425 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1466 167.5 1.1e-40
XP_006723426 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1466 167.5 1.1e-40
NP_003427 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 670) 1466 167.5 1.1e-40
NP_009065 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 682) 1466 167.6 1.1e-40
NP_001152765 (OMIM: 603984) zinc finger protein 73 ( 536) 1438 164.5 7.3e-40
XP_006722660 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 550) 1438 164.5 7.4e-40
XP_011525901 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 550) 1438 164.5 7.4e-40
XP_005259754 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 551) 1438 164.5 7.4e-40
XP_011525900 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 551) 1438 164.5 7.4e-40
NP_775802 (OMIM: 603982) zinc finger protein 100 [ ( 542) 1425 163.1 1.9e-39
XP_016882741 (OMIM: 606740) PREDICTED: zinc finger ( 349) 1411 161.4 4.1e-39
XP_016882740 (OMIM: 606740) PREDICTED: zinc finger ( 349) 1411 161.4 4.1e-39
NP_001275691 (OMIM: 606740) zinc finger protein 18 ( 349) 1411 161.4 4.1e-39
XP_016882739 (OMIM: 606740) PREDICTED: zinc finger ( 349) 1411 161.4 4.1e-39
NP_001275689 (OMIM: 606740) zinc finger protein 18 ( 349) 1411 161.4 4.1e-39
XP_016882743 (OMIM: 606740) PREDICTED: zinc finger ( 349) 1411 161.4 4.1e-39
NP_001275690 (OMIM: 606740) zinc finger protein 18 ( 349) 1411 161.4 4.1e-39
XP_016882742 (OMIM: 606740) PREDICTED: zinc finger ( 349) 1411 161.4 4.1e-39
XP_016882745 (OMIM: 606740) PREDICTED: zinc finger ( 349) 1411 161.4 4.1e-39
XP_016882744 (OMIM: 606740) PREDICTED: zinc finger ( 349) 1411 161.4 4.1e-39
NP_001265438 (OMIM: 606740) zinc finger protein 18 ( 665) 1411 161.8 5.7e-39
NP_001278562 (OMIM: 606740) zinc finger protein 18 ( 665) 1411 161.8 5.7e-39
NP_001265437 (OMIM: 606740) zinc finger protein 18 ( 667) 1411 161.8 5.7e-39
NP_001275688 (OMIM: 606740) zinc finger protein 18 ( 691) 1411 161.9 5.8e-39
NP_037388 (OMIM: 606740) zinc finger protein 180 i ( 692) 1411 161.9 5.8e-39
XP_011525582 (OMIM: 606740) PREDICTED: zinc finger ( 734) 1411 161.9 6e-39
NP_001291968 (OMIM: 194522) zinc finger protein 33 ( 666) 1408 161.5 7.1e-39
NP_001291967 (OMIM: 194522) zinc finger protein 33 ( 666) 1408 161.5 7.1e-39
NP_001291964 (OMIM: 194522) zinc finger protein 33 ( 666) 1408 161.5 7.1e-39
NP_001291969 (OMIM: 194522) zinc finger protein 33 ( 666) 1408 161.5 7.1e-39
NP_001291965 (OMIM: 194522) zinc finger protein 33 ( 666) 1408 161.5 7.1e-39
NP_001291966 (OMIM: 194522) zinc finger protein 33 ( 666) 1408 161.5 7.1e-39
NP_008886 (OMIM: 194522) zinc finger protein 33B i ( 778) 1408 161.6 7.6e-39
NP_001291962 (OMIM: 194522) zinc finger protein 33 ( 785) 1408 161.6 7.7e-39
XP_011515618 (OMIM: 194526) PREDICTED: zinc finger ( 539) 1390 159.5 2.3e-38
XP_011515617 (OMIM: 194526) PREDICTED: zinc finger ( 539) 1390 159.5 2.3e-38
XP_016869364 (OMIM: 194526) PREDICTED: zinc finger ( 539) 1390 159.5 2.3e-38
XP_011515620 (OMIM: 194526) PREDICTED: zinc finger ( 539) 1390 159.5 2.3e-38
NP_001273698 (OMIM: 194526) zinc finger protein 34 ( 539) 1390 159.5 2.3e-38
XP_016869362 (OMIM: 194526) PREDICTED: zinc finger ( 560) 1390 159.5 2.4e-38
XP_016869363 (OMIM: 194526) PREDICTED: zinc finger ( 560) 1390 159.5 2.4e-38
>>NP_056209 (OMIM: 194538) zinc finger protein 10 [Homo (573 aa)
initn: 4809 init1: 1171 opt: 1514 Z-score: 879.0 bits: 172.4 E(85289): 3.2e-42
Smith-Waterman score: 1534; 46.9% identity (69.9% similar) in 518 aa overlap (34-520:3-515)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD DLAEMPEKGALSSQDSPHFQEKSTEEGEVAALRLTARSQETVTFKDVAMDFTPEEWGKLD
: ::: :. :::::: .::: ::: ::
NP_056 MDAKSLTAWSRTLVTFKDVFVDFTREEWKLLD
10 20 30
70 80 90 100 110
pF1KSD PAQ----RDVMLENYRNLVSLWLPVSKPES-HNLENGKEPLKLERKAPKSSYSDMETRPQ
:: :.::::::.::::: ..::. ::.:.:: .::. . .. : :: .
NP_056 TAQQIVYRNVMLENYKNLVSLGYQLTKPDVILRLEKGEEPWLVEREIHQETHPDSETAFE
40 50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KSD SKDSTSVQD-FSKAESCKVAIIDRLTRNSVYDSNLEAALECENWLENQQGNQERHLREM-
:.:.: .. :. .:: . . . ..::... .:: . .:.. :.. : : :::::..
NP_056 IKSSVSSRSIFKDKQSCDIKM-EGMARNDLWYLSLEEVWKCRDQLDKYQENPERHLRQVA
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210
pF1KSD FTHMNSLSEETD----------------------HKHDVYWKSFNQKSVLIT-EDRVPKG
::. . :..: ::.: . ::... :: .: ..
NP_056 FTQKKVLTQERVSESGKYGGNCLLPAQLVLREYFHKRDSHTKSLKHDLVLNGHQDSCASN
160 170 180 190 200 210
220 230 240 250 260 270
pF1KSD SYAFHTLEKSLKQKSNLMKKQRTYKEKKPHKCNDCGELFTYHSVLIRHQRVHTGEKPYTC
: . ... :. .:.. ::. : .:: : . .:. : : . .: :::: :
NP_056 S---NECGQTFCQNIHLIQFARTHTGDKSYKCPDNDNSLTHGSSLGISKGIHR-EKPYEC
220 230 240 250 260
280 290 300 310 320 330
pF1KSD NECGKSFSHRANLTKHQRTHT-RILFECSECKKTFTESSSLATHQRIHVGERPYECNECG
.:::: :: :.:::.:: :: . .::.:: :.:..:: : ::. :.::.::::.:::
NP_056 KECGKFFSWRSNLTRHQLIHTGEKPYECKECGKSFSRSSHLIGHQKTHTGEEPYECKECG
270 280 290 300 310 320
340 350 360 370 380 390
pF1KSD KGFNRSTHLVQHQLIHTGVKPYECNECDKAFIHSSALIKHQRTHTGEKPYKCQECGKAFS
:.:. .::: :: ::: : : ::.: :.:.::: ::.:::::::::::.: ::::.:
NP_056 KSFSWFSHLVTHQRTHTGDKLYTCNQCGKSFVHSSRLIRHQRTHTGEKPYECPECGKSFR
330 340 350 360 370 380
400 410 420 430 440 450
pF1KSD HCSSLTKHQRVHTGEKPYECSECGKTFSQSTHLVQHQRIHTGEKPYECNECGKTFSRSSN
. . : :::.:. .::::.::::..:: .::: :.::::: ::.::..::: :::::.
NP_056 QSTHLILHQRTHVRVRPYECNECGKSYSQRSHLVVHHRIHTGLKPFECKDCGKCFSRSSH
390 400 410 420 430 440
460 470 480 490 500 510
pF1KSD FAKHQRIHIGKKPYKCSECGKAFIHSSALIQHQRTHTGEKPFRCNECGKSFKCSSSLIRH
. .::: : :.:::.: .:::.: .::::: ::: ::::::..: .:::.: ...::.:
NP_056 LYSHQRTHTGEKPYECHDCGKSFSQSSALIVHQRIHTGEKPYECCQCGKAFIRKNDLIKH
450 460 470 480 490 500
520
pF1KSD QRVHTEEQP
::.:. :.
NP_056 QRIHVGEETYKCNQCGIIFSQNSPFIVHQIAHTGEQFLTCNQCGTALVNTSNLIGYQTNH
510 520 530 540 550 560
>>NP_653285 (OMIM: 613910) zinc finger protein 480 isofo (535 aa)
initn: 6398 init1: 1055 opt: 1491 Z-score: 866.4 bits: 170.0 E(85289): 1.6e-41
Smith-Waterman score: 1491; 45.7% identity (72.0% similar) in 497 aa overlap (39-521:21-510)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD PEKGALSSQDSPHFQEKSTEEGEVAALRLTARSQETVTFKDVAMDFTPEEWGKLDPAQR-
: : .::.:::..:. :: ::::::
NP_653 MLCDEKAQKRRKRKAKESGMALPQGHLTFRDVAIEFSQAEWKCLDPAQRA
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD ---DVMLENYRNLVSLWLPVSKPESHNLENGKEPLKLERKAPKSSYSDMETRPQSKDSTS
::::::::::::: .: :. :... : .:. : :. :... .:
NP_653 LYKDVMLENYRNLVSL--GISLPDL-NINSMLE----QRREPWSGESEVKIAKNSDGREC
60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KSD VQDFSKAESCKVA--IIDRLTRNSVYDSNLEAALECENWLENQQGNQERHLREMFTHMNS
.. . . : .. :. .... : : : . ... : .......: .:
NP_653 IKGVNTGSSYALGSNAEDKPIKKQLGVSFHLHLSELELFPDERVINGCNQVENFINHSSS
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230
pF1KSD LS--EETDH--KHDVYWKS-FNQKSVLITEDRVP--KGSYAFHTLEKSLKQKSNLMKKQR
.: .: . : .. .. :...: : :..: . : . : .. .:.: :.:
NP_653 VSCLQEMSSSVKTPIFNRNDFDDSSFLPQEQKVHLREKPYECNEHSKVFRVSSSLTKHQV
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KSD TYKEKKPHKCNDCGELFTYHSVLIRHQRVHTGEKPYTCNECGKSFSHRANLTKHQRTHTR
. .::.:::.::..:. .: : .: :.::::::: :: ::: ::. .:...::: :::
NP_653 IHTVEKPYKCNSCGKVFSRNSHLAEHCRIHTGEKPYKCNVCGKVFSYNSNFARHQRIHTR
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KSD IL-FECSECKKTFTESSSLATHQRIHVGERPYECNECGKGFNRSTHLVQHQLIHTGVKPY
.::.:: :.:...: :: :::::. :.::.::::::::.... :..: :.:: :::
NP_653 EKPYECNECGKVFSNNSYLARHQRIHAEEKPYKCNECGKGFSHKSSLANHWRIYTGEKPY
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KSD ECNECDKAFIHSSALIKHQRTHTGEKPYKCQECGKAFSHCSSLTKHQRVHTGEKPYECSE
.:.:: ::: . . :..::. :::::::::.::::.: . : :..: :.:::::::.:.:
NP_653 KCDECGKAFYRIALLVRHQKIHTGEKPYKCNECGKVFIQNSHLAQHWRIHTGEKPYKCNE
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KSD CGKTFSQSTHLVQHQRIHTGEKPYECNECGKTFSRSSNFAKHQRIHIGKKPYKCSECGKA
:::.:.: ..:..:.:::::::::.::::::.::. :... : :: :.:::::::::::
NP_653 CGKVFNQLSNLARHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSEYSGLSAHLVIHTGEKPYKCSECGKA
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520
pF1KSD FIHSSALIQHQRTHTGEKPFRCNECGKSFKCSSSLIRHQRVHTEEQP
: :. .: .::: ::::.:..:::::: :. . : ::...:: :.:
NP_653 FRHKLSLTNHQRIHTGERPYKCNECGKVFNRIAHLARHRKIHTGEKPYKCNECGKAFSRI
470 480 490 500 510 520
NP_653 SYLAQHWTIHMG
530
>>XP_011524767 (OMIM: 613910) PREDICTED: zinc finger pro (535 aa)
initn: 6398 init1: 1055 opt: 1491 Z-score: 866.4 bits: 170.0 E(85289): 1.6e-41
Smith-Waterman score: 1491; 45.7% identity (72.0% similar) in 497 aa overlap (39-521:21-510)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD PEKGALSSQDSPHFQEKSTEEGEVAALRLTARSQETVTFKDVAMDFTPEEWGKLDPAQR-
: : .::.:::..:. :: ::::::
XP_011 MLCDEKAQKRRKRKAKESGMALPQGHLTFRDVAIEFSQAEWKCLDPAQRA
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD ---DVMLENYRNLVSLWLPVSKPESHNLENGKEPLKLERKAPKSSYSDMETRPQSKDSTS
::::::::::::: .: :. :... : .:. : :. :... .:
XP_011 LYKDVMLENYRNLVSL--GISLPDL-NINSMLE----QRREPWSGESEVKIAKNSDGREC
60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KSD VQDFSKAESCKVA--IIDRLTRNSVYDSNLEAALECENWLENQQGNQERHLREMFTHMNS
.. . . : .. :. .... : : : . ... : .......: .:
XP_011 IKGVNTGSSYALGSNAEDKPIKKQLGVSFHLHLSELELFPDERVINGCNQVENFINHSSS
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230
pF1KSD LS--EETDH--KHDVYWKS-FNQKSVLITEDRVP--KGSYAFHTLEKSLKQKSNLMKKQR
.: .: . : .. .. :...: : :..: . : . : .. .:.: :.:
XP_011 VSCLQEMSSSVKTPIFNRNDFDDSSFLPQEQKVHLREKPYECNEHSKVFRVSSSLTKHQV
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KSD TYKEKKPHKCNDCGELFTYHSVLIRHQRVHTGEKPYTCNECGKSFSHRANLTKHQRTHTR
. .::.:::.::..:. .: : .: :.::::::: :: ::: ::. .:...::: :::
XP_011 IHTVEKPYKCNSCGKVFSRNSHLAEHCRIHTGEKPYKCNVCGKVFSYNSNFARHQRIHTR
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KSD IL-FECSECKKTFTESSSLATHQRIHVGERPYECNECGKGFNRSTHLVQHQLIHTGVKPY
.::.:: :.:...: :: :::::. :.::.::::::::.... :..: :.:: :::
XP_011 EKPYECNECGKVFSNNSYLARHQRIHAEEKPYKCNECGKGFSHKSSLANHWRIYTGEKPY
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KSD ECNECDKAFIHSSALIKHQRTHTGEKPYKCQECGKAFSHCSSLTKHQRVHTGEKPYECSE
.:.:: ::: . . :..::. :::::::::.::::.: . : :..: :.:::::::.:.:
XP_011 KCDECGKAFYRIALLVRHQKIHTGEKPYKCNECGKVFIQNSHLAQHWRIHTGEKPYKCNE
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KSD CGKTFSQSTHLVQHQRIHTGEKPYECNECGKTFSRSSNFAKHQRIHIGKKPYKCSECGKA
:::.:.: ..:..:.:::::::::.::::::.::. :... : :: :.:::::::::::
XP_011 CGKVFNQLSNLARHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSEYSGLSAHLVIHTGEKPYKCSECGKA
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520
pF1KSD FIHSSALIQHQRTHTGEKPFRCNECGKSFKCSSSLIRHQRVHTEEQP
: :. .: .::: ::::.:..:::::: :. . : ::...:: :.:
XP_011 FRHKLSLTNHQRIHTGERPYKCNECGKVFNRIAHLARHRKIHTGEKPYKCNECGKAFSRI
470 480 490 500 510 520
XP_011 SYLAQHWTIHMG
530
>>NP_001276331 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 is (616 aa)
initn: 9800 init1: 1159 opt: 1466 Z-score: 851.8 bits: 167.5 E(85289): 1e-40
Smith-Waterman score: 1504; 46.9% identity (72.0% similar) in 482 aa overlap (70-521:1-479)
40 50 60 70 80 90
pF1KSD RSQETVTFKDVAMDFTPEEWGKLDPAQRDVMLENYRNLVSL--WLPVSKPESHNL-ENGK
::...: :::. ::: ::. .: :.
NP_001 MLDTFRLLVSVGHWLP--KPNVISLLEQEA
10 20
100 110 120 130 140 150
pF1KSD EPLKLERKAPKSSYSDMETRPQSKDSTSVQDFSKAESCKVAIIDRLTRNSVY-----DSN
: .: . :.. : :.::::. : :. : .:. : .: ...:. .... :..
NP_001 ELWAVESRLPQGVYPDLETRPKVKLSVLKQGISEEISNSVILVERFLWDGLWYCRGEDTE
30 40 50 60 70 80
160 170 180 190
pF1KSD LEAALECENWLEN----------QQGNQERHLREMFTHMNSLSEETDHKHDV-------Y
. ::. ::. . :. :. : . ::. . :. .
NP_001 GHWEWSCES-LESLAVPVAFTPVKTPVLEQWQRNGFGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHT
90 100 110 120 130 140
200 210 220 230 240 250
pF1KSD WKSFNQKSV----LITEDRVPKGSYAFHTLEKSLKQKSNLMKKQRTYKEKKPHKCNDCGE
: . ... .. . : . : . :.....: :....::. ..:..:..: .
NP_001 WGTRGKREKPDLNVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLK
150 160 170 180 190 200
260 270 280 290 300
pF1KSD LFTYHSVLIRHQRVHTGEKPYTCNECGKSFSHRANLTKHQRTHT-RILFECSECKKTFTE
: :.: .:::.::::::: :..::..:.. : : .:::::: . .::::: :.:.
NP_001 GFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSF
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KSD SSSLATHQRIHVGERPYECNECGKGFNRSTHLVQHQLIHTGVKPYECNECDKAFIHSSAL
::.. :.: :.::.::::.::::.: .: ::.:: :::: :::.:.:: ::: :::.:
NP_001 RSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSL
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KSD IKHQRTHTGEKPYKCQECGKAFSHCSSLTKHQRVHTGEKPYECSECGKTFSQSTHLVQHQ
:::: :::::::.:.::::::.. . : .:::.:::::::::.::::.::::: :..:.
NP_001 TKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHR
330 340 350 360 370 380
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pF1KSD RIHTGEKPYECNECGKTFSRSSNFAKHQRIHIGKKPYKCSECGKAFIHSSALIQHQRTHT
::::::::: :::::::::.::....:.: : :.:::.::.::::: .:. : :::: ::
NP_001 RIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHT
390 400 410 420 430 440
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pF1KSD GEKPFRCNECGKSFKCSSSLIRHQRVHTEEQP
::::..::.:::.:. :::: .:::.:: :.:
NP_001 GEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKP
450 460 470 480 490 500
NP_001 YECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECH
510 520 530 540 550 560
>--
initn: 1260 init1: 720 opt: 720 Z-score: 433.1 bits: 90.0 E(85289): 2.2e-17
Smith-Waterman score: 720; 67.2% identity (87.6% similar) in 137 aa overlap (326-462:480-616)
300 310 320 330 340 350
pF1KSD ILFECSECKKTFTESSSLATHQRIHVGERPYECNECGKGFNRSTHLVQHQLIHTGVKPYE
::::.::..:.. . :.::: :::: ::::
NP_001 KPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYE
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360 370 380 390 400 410
pF1KSD CNECDKAFIHSSALIKHQRTHTGEKPYKCQECGKAFSHCSSLTKHQRVHTGEKPYECSEC
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NP_001 CNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDC
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pF1KSD GKTFSQSTHLVQHQRIHTGEKPYECNECGKTFSRSSNFAKHQRIHIGKKPYKCSECGKAF
::.: :::::.::.::::::::: : .:::.:..::...:::: : :
NP_001 GKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
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pF1KSD IHSSALIQHQRTHTGEKPFRCNECGKSFKCSSSLIRHQRVHTEEQP
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pF1KSD AIIDRLTRNSVYDSNLEAALECENWLENQQGNQERHLREMFTHMNSLSEETDHKHDVYWK
:. : .. : . . : .. :
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200 210 220 230 240 250
pF1KSD SFNQKSVLITEDRVPKGSYAFHTLE--KSLKQKSNLMKKQRTYKEKKPHKCNDCGELFTY
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XP_016 GFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSF
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260 270 280 290 300 310
pF1KSD HSVLIRHQRVHTGEKPYTCNECGKSFSHRANLTKHQRTHT-RILFECSECKKTFTESSSL
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XP_016 RSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSL
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XP_016 TKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHR
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pF1KSD RTHTGEKPYKCQECGKAFSHCSSLTKHQRVHTGEKPYECSECGKTFSQSTHLVQHQRIHT
: ::::::: :.::::.::: :::..:.:.::::::::::.:::.: :::::.:::::::
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XP_016 GEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKP
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500 510 520
pF1KSD FRCNECGKSFKCSSSLIRHQRVHTEEQP
..::.::..:. :: ::.:::.::.:.:
XP_016 YECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECH
520 530 540 550 560 570
>--
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Smith-Waterman score: 445; 69.1% identity (90.1% similar) in 81 aa overlap (382-462:541-621)
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: :.::::.::: :::..:.:.::::::::
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pF1KSD CSECGKTFSQSTHLVQHQRIHTGEKPYECNECGKTFSRSSNFAKHQRIHIGKKPYKCSEC
: .:::.: :::::.::.::::::::: : .:::.:..::...:::: : :
XP_016 CHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
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pF1KSD GKAFIHSSALIQHQRTHTGEKPFRCNECGKSFKCSSSLIRHQRVHTEEQP
>>XP_016882730 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger pro (628 aa)
initn: 9800 init1: 1159 opt: 1466 Z-score: 851.7 bits: 167.5 E(85289): 1.1e-40
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pF1KSD RSQETVTFKDVAMDFTPEEWGKLDPAQRDVMLENYRNLVSL--WLPVSKPESHNL-ENGK
::...: :::. ::: ::. .: :.
XP_016 MLDTFRLLVSVGHWLP--KPNVISLLEQEA
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100 110 120 130 140
pF1KSD EPLKLERKAPKSSY------------SDMETRPQSKDSTSVQDFSKAESCKVAIIDRLTR
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XP_016 ELWAVESRLPQGVYPEIKGHFQFLLLSDLETRPKVKLSVLKQGISEEISNSVILVERFLW
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pF1KSD NSVY-----DSNLEAALECENWLEN----------QQGNQERHLREMFTHMNSLSEETDH
.... :.. . ::. ::. . :. :. : . ::. . :
XP_016 DGLWYCRGEDTEGHWEWSCES-LESLAVPVAFTPVKTPVLEQWQRNGFGENISLNPDLPH
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pF1KSD KHDV-------YWKSFNQKSV----LITEDRVPKGSYAFHTLEKSLKQKSNLMKKQRTYK
. . : . ... .. . : . : . :.....: :....::.
XP_016 QPMTPERQSPHTWGTRGKREKPDLNVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHT
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XP_016 GERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKP
210 220 230 240 250 260
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pF1KSD FECSECKKTFTESSSLATHQRIHVGERPYECNECGKGFNRSTHLVQHQLIHTGVKPYECN
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:: ::: :::.: :::: :::::::.:.::::::.. . : .:::.:::::::::.::::
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XP_016 AFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQ
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pF1KSD SSALIQHQRTHTGEKPFRCNECGKSFKCSSSLIRHQRVHTEEQP
:. : :::: ::::::..::.:::.:. :::: .:::.:: :.:
XP_016 STHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPL
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>--
initn: 1260 init1: 720 opt: 720 Z-score: 433.1 bits: 90.0 E(85289): 2.2e-17
Smith-Waterman score: 720; 67.2% identity (87.6% similar) in 137 aa overlap (326-462:492-628)
300 310 320 330 340 350
pF1KSD ILFECSECKKTFTESSSLATHQRIHVGERPYECNECGKGFNRSTHLVQHQLIHTGVKPYE
::::.::..:.. . :.::: :::: ::::
XP_016 KPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYE
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pF1KSD CNECDKAFIHSSALIKHQRTHTGEKPYKCQECGKAFSHCSSLTKHQRVHTGEKPYECSEC
::.: .:: .:: ::.::: :: :::: :.::::.::: :::..:.:.::::::::: .:
XP_016 CNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDC
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::.: :::::.::.::::::::: : .:::.:..::...:::: : :
XP_016 GKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
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pF1KSD IHSSALIQHQRTHTGEKPFRCNECGKSFKCSSSLIRHQRVHTEEQP
>>XP_016882729 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger pro (658 aa)
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pF1KSD TEEGEVAALRLTARSQETVTFKDVAMDFTPEEWGKLDPAQR----DVMLENYRNLVSL--
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pF1KSD WLPVSKPESHNL-ENGKEPLKLERKAPKSSYSDMETRPQSKDSTSVQDFSKAESCKVAII
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XP_016 WLP--KPNVISLLEQEAELWAVESRLPQGVYPDLETRPKVKLSVLKQGISEEISNSVILV
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pF1KSD DRLTRNSVY-----DSNLEAALECENWLEN----------QQGNQERHLREMFTHMNSLS
.:. .... :.. . ::. ::. . :. :. : . ::.
XP_016 ERFLWDGLWYCRGEDTEGHWEWSCES-LESLAVPVAFTPVKTPVLEQWQRNGFGENISLN
120 130 140 150 160 170
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pF1KSD EETDHKHDV-------YWKSFNQKSV----LITEDRVPKGSYAFHTLEKSLKQKSNLMKK
. :. . : . ... .. . : . : . :.....: :...
XP_016 PDLPHQPMTPERQSPHTWGTRGKREKPDLNVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSALIEH
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pF1KSD T-RILFECSECKKTFTESSSLATHQRIHVGERPYECNECGKGFNRSTHLVQHQLIHTGVK
: . .::::: :.:. ::.. :.: :.::.::::.::::.: .: ::.:: :::: :
XP_016 TGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEK
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::.:.:: ::: :::.: :::: :::::::.:.::::::.. . : .:::.:::::::::
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pF1KSD SECGKTFSQSTHLVQHQRIHTGEKPYECNECGKTFSRSSNFAKHQRIHIGKKPYKCSECG
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XP_016 KAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFS
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initn: 1260 init1: 720 opt: 720 Z-score: 432.9 bits: 90.1 E(85289): 2.3e-17
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300 310 320 330 340 350
pF1KSD ILFECSECKKTFTESSSLATHQRIHVGERPYECNECGKGFNRSTHLVQHQLIHTGVKPYE
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pF1KSD CNECDKAFIHSSALIKHQRTHTGEKPYKCQECGKAFSHCSSLTKHQRVHTGEKPYECSEC
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XP_016 CNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDC
560 570 580 590 600 610
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pF1KSD GKTFSQSTHLVQHQRIHTGEKPYECNECGKTFSRSSNFAKHQRIHIGKKPYKCSECGKAF
::.: :::::.::.::::::::: : .:::.:..::...:::: : :
XP_016 GKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
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pF1KSD IHSSALIQHQRTHTGEKPFRCNECGKSFKCSSSLIRHQRVHTEEQP
>>NP_001276330 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 is (658 aa)
initn: 9800 init1: 1159 opt: 1466 Z-score: 851.6 bits: 167.5 E(85289): 1.1e-40
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pF1KSD TEEGEVAALRLTARSQETVTFKDVAMDFTPEEWGKLDPAQR----DVMLENYRNLVSL--
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pF1KSD DRLTRNSVY-----DSNLEAALECENWLEN----------QQGNQERHLREMFTHMNSLS
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NP_001 ERFLWDGLWYCRGEDTEGHWEWSCES-LESLAVPVAFTPVKTPVLEQWQRNGFGENISLN
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pF1KSD EETDHKHDV-------YWKSFNQKSV----LITEDRVPKGSYAFHTLEKSLKQKSNLMKK
. :. . : . ... .. . : . : . :.....: :...
NP_001 PDLPHQPMTPERQSPHTWGTRGKREKPDLNVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSALIEH
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD QRTYKEKKPHKCNDCGELFTYHSVLIRHQRVHTGEKPYTCNECGKSFSHRANLTKHQRTH
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NP_001 HRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTH
240 250 260 270 280 290
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pF1KSD T-RILFECSECKKTFTESSSLATHQRIHVGERPYECNECGKGFNRSTHLVQHQLIHTGVK
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NP_001 TGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEK
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pF1KSD PYECNECDKAFIHSSALIKHQRTHTGEKPYKCQECGKAFSHCSSLTKHQRVHTGEKPYEC
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NP_001 PYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYEC
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pF1KSD SECGKTFSQSTHLVQHQRIHTGEKPYECNECGKTFSRSSNFAKHQRIHIGKKPYKCSECG
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NP_001 GECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCG
420 430 440 450 460 470
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pF1KSD KAFIHSSALIQHQRTHTGEKPFRCNECGKSFKCSSSLIRHQRVHTEEQP
::: .:. : :::: ::::::..::.:::.:. :::: .:::.:: :.:
NP_001 KAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFS
480 490 500 510 520 530
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>--
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::::.::..:.. . :.::: :::: ::::
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pF1KSD GKTFSQSTHLVQHQRIHTGEKPYECNECGKTFSRSSNFAKHQRIHIGKKPYKCSECGKAF
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NP_001 GKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
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pF1KSD IHSSALIQHQRTHTGEKPFRCNECGKSFKCSSSLIRHQRVHTEEQP
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.:. .... :.. . ::. ::. . :. :. : . ::.
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pF1KSD EETDHKHDV-------YWKSFNQKSV----LITEDRVPKGSYAFHTLEKSLKQKSNLMKK
. :. . : . ... .. . : . : . :.....: :...
XP_005 PDLPHQPMTPERQSPHTWGTRGKREKPDLNVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSALIEH
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: . .::::: :.:. ::.. :.: :.::.::::.::::.: .: ::.:: :::: :
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XP_005 PYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYEC
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pF1KSD SECGKTFSQSTHLVQHQRIHTGEKPYECNECGKTFSRSSNFAKHQRIHIGKKPYKCSECG
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XP_005 GECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCG
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::: .:. : :::: ::::::..::.:::.:. :::: .:::.:: :.:
XP_005 KAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFS
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300 310 320 330 340 350
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pF1KSD CNECDKAFIHSSALIKHQRTHTGEKPYKCQECGKAFSHCSSLTKHQRVHTGEKPYECSEC
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XP_005 CNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDC
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pF1KSD GKTFSQSTHLVQHQRIHTGEKPYECNECGKTFSRSSNFAKHQRIHIGKKPYKCSECGKAF
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pF1KSD IHSSALIQHQRTHTGEKPFRCNECGKSFKCSSSLIRHQRVHTEEQP
>>XP_006723425 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger pro (670 aa)
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190 200 210 220 230 240
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pF1KSD TYKEKKPHKCNDCGELFTYHSVLIRHQRVHTGEKPYTCNECGKSFSHRANLTKHQRTHT-
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pF1KSD FIHSSALIQHQRTHTGEKPFRCNECGKSFKCSSSLIRHQRVHTEEQP
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initn: 1260 init1: 720 opt: 720 Z-score: 432.8 bits: 90.1 E(85289): 2.3e-17
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pF1KSD ILFECSECKKTFTESSSLATHQRIHVGERPYECNECGKGFNRSTHLVQHQLIHTGVKPYE
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pF1KSD CNECDKAFIHSSALIKHQRTHTGEKPYKCQECGKAFSHCSSLTKHQRVHTGEKPYECSEC
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XP_006 CNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDC
570 580 590 600 610 620
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pF1KSD GKTFSQSTHLVQHQRIHTGEKPYECNECGKTFSRSSNFAKHQRIHIGKKPYKCSECGKAF
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XP_006 GKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]