Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA1874
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1874, 521 aa
1>>>pF1KSDA1874 521 - 521 aa - 521 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0695+/-0.00208; mu= 11.7328+/- 0.124
mean_var=300.9489+/-54.466, 0's: 0 Z-trim(105.0): 962 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.073931
statistics sampled from 7123 (8189) to 7123 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.571), E-opt: 0.2 (0.252), width: 16
Scan time: 3.240
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11172.1 ZNF286A gene_id:57335|Hs108|chr17 ( 521) 3597 398.6 9.3e-111
CCDS73997.1 ZNF286A gene_id:57335|Hs108|chr17 ( 511) 3526 391.0 1.7e-108
CCDS58523.1 ZNF286B gene_id:729288|Hs108|chr17 ( 522) 3034 338.5 1.1e-92
CCDS12943.1 ZNF583 gene_id:147949|Hs108|chr19 ( 569) 1598 185.4 1.5e-46
CCDS9283.1 ZNF10 gene_id:7556|Hs108|chr12 ( 573) 1514 176.5 7.4e-44
CCDS42535.1 ZNF626 gene_id:199777|Hs108|chr19 ( 528) 1492 174.1 3.6e-43
CCDS12850.2 ZNF480 gene_id:147657|Hs108|chr19 ( 535) 1491 174.0 3.9e-43
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1466 171.4 2.7e-42
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1466 171.4 2.8e-42
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1466 171.4 2.8e-42
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1466 171.5 2.8e-42
CCDS43590.1 ZNF479 gene_id:90827|Hs108|chr7 ( 524) 1440 168.5 1.7e-41
CCDS54238.1 ZNF737 gene_id:100129842|Hs108|chr19 ( 536) 1438 168.3 2e-41
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 1430 167.6 4.1e-41
CCDS12959.2 ZNF551 gene_id:90233|Hs108|chr19 ( 670) 1427 167.3 5e-41
CCDS42538.1 ZNF100 gene_id:163227|Hs108|chr19 ( 542) 1425 166.9 5.2e-41
CCDS62707.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 665) 1411 165.6 1.6e-40
CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 667) 1411 165.6 1.6e-40
CCDS12639.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 692) 1411 165.6 1.7e-40
CCDS7198.1 ZNF33B gene_id:7582|Hs108|chr10 ( 778) 1408 165.4 2.2e-40
CCDS69562.1 ZNF34 gene_id:80778|Hs108|chr8 ( 539) 1390 163.2 6.9e-40
CCDS47945.1 ZNF34 gene_id:80778|Hs108|chr8 ( 560) 1390 163.2 7e-40
CCDS58688.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 503) 1389 163.0 7.1e-40
CCDS58687.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 555) 1389 163.1 7.5e-40
CCDS12957.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 564) 1389 163.1 7.6e-40
CCDS12956.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 577) 1389 163.1 7.7e-40
CCDS74468.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 616) 1389 163.2 7.9e-40
CCDS58686.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 629) 1389 163.2 8e-40
CCDS73089.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 699) 1386 162.9 1.1e-39
CCDS31182.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 810) 1386 163.0 1.1e-39
CCDS44372.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 811) 1386 163.0 1.1e-39
CCDS60514.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 817) 1386 163.0 1.1e-39
CCDS73088.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 829) 1386 163.1 1.2e-39
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 1383 162.7 1.4e-39
CCDS12499.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 714) 1381 162.4 1.5e-39
CCDS74353.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 769) 1381 162.5 1.6e-39
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 1379 162.2 1.8e-39
CCDS10329.2 ZSCAN2 gene_id:54993|Hs108|chr15 ( 614) 1378 162.0 1.8e-39
CCDS55112.1 ZNF716 gene_id:441234|Hs108|chr7 ( 495) 1375 161.5 2e-39
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 1375 161.8 2.5e-39
CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 585) 1372 161.3 2.7e-39
CCDS75846.1 ZNF658 gene_id:26149|Hs108|chr9 (1059) 1376 162.2 2.8e-39
CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 643) 1372 161.4 2.9e-39
CCDS42559.1 ZNF527 gene_id:84503|Hs108|chr19 ( 609) 1369 161.0 3.5e-39
CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 580) 1368 160.9 3.6e-39
CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 644) 1368 161.0 3.8e-39
CCDS12972.1 ZNF329 gene_id:79673|Hs108|chr19 ( 541) 1365 160.5 4.4e-39
CCDS12854.1 ZNF83 gene_id:55769|Hs108|chr19 ( 516) 1360 160.0 6.2e-39
CCDS12968.1 ZNF606 gene_id:80095|Hs108|chr19 ( 792) 1363 160.6 6.2e-39
CCDS33097.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 839) 1360 160.3 8e-39
>>CCDS11172.1 ZNF286A gene_id:57335|Hs108|chr17 (521 aa)
initn: 3597 init1: 3597 opt: 3597 Z-score: 2102.0 bits: 398.6 E(32554): 9.3e-111
Smith-Waterman score: 3597; 99.8% identity (100.0% similar) in 521 aa overlap (1-521:1-521)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD METDLAEMPEKGALSSQDSPHFQEKSTEEGEVAALRLTARSQETVTFKDVAMDFTPEEWG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 METDLAEMPEKGALSSQDSPHFQEKSTEEGEVAALRLTARSQETVTFKDVAMDFTPEEWG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD KLDPAQRDVMLENYRNLVSLWLPVSKPESHNLENGKEPLKLERKAPKSSYSDMETRPQSK
:::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KLDPAQRDVMLENYRNLVSLWLPVSKPESYNLENGKEPLKLERKAPKSSYSDMETRPQSK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD DSTSVQDFSKAESCKVAIIDRLTRNSVYDSNLEAALECENWLENQQGNQERHLREMFTHM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DSTSVQDFSKAESCKVAIIDRLTRNSVYDSNLEAALECENWLENQQGNQERHLREMFTHM
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD NSLSEETDHKHDVYWKSFNQKSVLITEDRVPKGSYAFHTLEKSLKQKSNLMKKQRTYKEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NSLSEETDHKHDVYWKSFNQKSVLITEDRVPKGSYAFHTLEKSLKQKSNLMKKQRTYKEK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD KPHKCNDCGELFTYHSVLIRHQRVHTGEKPYTCNECGKSFSHRANLTKHQRTHTRILFEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KPHKCNDCGELFTYHSVLIRHQRVHTGEKPYTCNECGKSFSHRANLTKHQRTHTRILFEC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD SECKKTFTESSSLATHQRIHVGERPYECNECGKGFNRSTHLVQHQLIHTGVKPYECNECD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SECKKTFTESSSLATHQRIHVGERPYECNECGKGFNRSTHLVQHQLIHTGVKPYECNECD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD KAFIHSSALIKHQRTHTGEKPYKCQECGKAFSHCSSLTKHQRVHTGEKPYECSECGKTFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KAFIHSSALIKHQRTHTGEKPYKCQECGKAFSHCSSLTKHQRVHTGEKPYECSECGKTFS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD QSTHLVQHQRIHTGEKPYECNECGKTFSRSSNFAKHQRIHIGKKPYKCSECGKAFIHSSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QSTHLVQHQRIHTGEKPYECNECGKTFSRSSNFAKHQRIHIGKKPYKCSECGKAFIHSSA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520
pF1KSD LIQHQRTHTGEKPFRCNECGKSFKCSSSLIRHQRVHTEEQP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LIQHQRTHTGEKPFRCNECGKSFKCSSSLIRHQRVHTEEQP
490 500 510 520
>>CCDS73997.1 ZNF286A gene_id:57335|Hs108|chr17 (511 aa)
initn: 3526 init1: 3526 opt: 3526 Z-score: 2061.1 bits: 391.0 E(32554): 1.7e-108
Smith-Waterman score: 3526; 99.8% identity (100.0% similar) in 510 aa overlap (12-521:2-511)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD METDLAEMPEKGALSSQDSPHFQEKSTEEGEVAALRLTARSQETVTFKDVAMDFTPEEWG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MGALSSQDSPHFQEKSTEEGEVAALRLTARSQETVTFKDVAMDFTPEEWG
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD KLDPAQRDVMLENYRNLVSLWLPVSKPESHNLENGKEPLKLERKAPKSSYSDMETRPQSK
:::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 KLDPAQRDVMLENYRNLVSLWLPVSKPESYNLENGKEPLKLERKAPKSSYSDMETRPQSK
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KSD DSTSVQDFSKAESCKVAIIDRLTRNSVYDSNLEAALECENWLENQQGNQERHLREMFTHM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 DSTSVQDFSKAESCKVAIIDRLTRNSVYDSNLEAALECENWLENQQGNQERHLREMFTHM
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KSD NSLSEETDHKHDVYWKSFNQKSVLITEDRVPKGSYAFHTLEKSLKQKSNLMKKQRTYKEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 NSLSEETDHKHDVYWKSFNQKSVLITEDRVPKGSYAFHTLEKSLKQKSNLMKKQRTYKEK
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KSD KPHKCNDCGELFTYHSVLIRHQRVHTGEKPYTCNECGKSFSHRANLTKHQRTHTRILFEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 KPHKCNDCGELFTYHSVLIRHQRVHTGEKPYTCNECGKSFSHRANLTKHQRTHTRILFEC
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KSD SECKKTFTESSSLATHQRIHVGERPYECNECGKGFNRSTHLVQHQLIHTGVKPYECNECD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 SECKKTFTESSSLATHQRIHVGERPYECNECGKGFNRSTHLVQHQLIHTGVKPYECNECD
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KSD KAFIHSSALIKHQRTHTGEKPYKCQECGKAFSHCSSLTKHQRVHTGEKPYECSECGKTFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 KAFIHSSALIKHQRTHTGEKPYKCQECGKAFSHCSSLTKHQRVHTGEKPYECSECGKTFS
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KSD QSTHLVQHQRIHTGEKPYECNECGKTFSRSSNFAKHQRIHIGKKPYKCSECGKAFIHSSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 QSTHLVQHQRIHTGEKPYECNECGKTFSRSSNFAKHQRIHIGKKPYKCSECGKAFIHSSA
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520
pF1KSD LIQHQRTHTGEKPFRCNECGKSFKCSSSLIRHQRVHTEEQP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LIQHQRTHTGEKPFRCNECGKSFKCSSSLIRHQRVHTEEQP
480 490 500 510
>>CCDS58523.1 ZNF286B gene_id:729288|Hs108|chr17 (522 aa)
initn: 2818 init1: 2818 opt: 3034 Z-score: 1777.4 bits: 338.5 E(32554): 1.1e-92
Smith-Waterman score: 3034; 85.6% identity (91.5% similar) in 527 aa overlap (1-521:1-522)
10 20 30 40 50
pF1KSD METDLAEMPEKGALSSQDSPHFQEKSTEEGEVAALRLTARSQETVTF-----KDVAMDFT
::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::: ... ... .
CCDS58 METDLAEMPEKGVLSSQDSPHFQEKSTEEGEVAALRLTARSQAAAAAAAPGSRSLRGVHV
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD PEEWGKLDPAQRDVMLE-NYRNLVSLWLPVSKPESHNLENGKEPLKLERKAPKSSYSDME
: ::.... . . :: : .. .. : . .. .:. . : ::.:
CCDS58 PPPLHPA-PAREEIKSTCSLKACFSLSLTLTYYRTAFLLSTENEGNLHFQCP----SDVE
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD TRPQSKDSTSVQDFSKAESCKVAIIDRLTRNSVYDSNLEAALECENWLENQQGNQERHLR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::
CCDS58 TRPQSKDSTSVQDFSKAESCKVAIIDRLTRNSVYDSNLEAALECENWLEKQQGNQERHLR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD EMFTHMNSLSEETDHKHDVYWKSFNQKSVLITEDRVPKGSYAFHTLEKSLKQKSNLMKKQ
:::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EMFTHMNSLSEETDHEHDVYWKSFNQKSVLITEDRVPKGSYAFHTLEKSLKQKSNLMKKQ
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD RTYKEKKPHKCNDCGELFTYHSVLIRHQRVHTGEKPYTCNECGKSFSHRANLTKHQRTHT
::::::::::::::::::: ::: :.::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RTYKEKKPHKCNDCGELFTCHSVHIQHQRVHTGEKPYTCNECGKSFSHRANLTKHQRTHT
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD RILFECSECKKTFTESSSLATHQRIHVGERPYECNECGKGFNRSTHLVQHQLIHTGVKPY
:::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::
CCDS58 RILFECRECKKTFTESSSLATHQRIHVGERPYECNECGKGFNRSTHLVQHQLIHTGVRPY
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD ECNECDKAFIHSSALIKHQRTHTGEKPYKCQECGKAFSHCSSLTKHQRVHTGEKPYECSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ECNECDKAFIHSSALIKHQRTHTGEKPYKCQECGKAFSHCSSLTKHQRVHTGEKPYECSE
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KSD CGKTFSQSTHLVQHQRIHTGEKPYECNECGKTFSRSSNFAKHQRIHIGKKPYKCSECGKA
::::::::::::::::::::::::::.:::::::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS58 CGKTFSQSTHLVQHQRIHTGEKPYECSECGKTFSQSSNFAKHQRIHIGKKPYKCSECGKA
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520
pF1KSD FIHSSALIQHQRTHTGEKPFRCNECGKSFKCSSSLIRHQRVHTEEQP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 FIHSSALIQHQRTHTGEKPFRCNECGKSFKCSSSLIRHQRVHTEEQP
480 490 500 510 520
>>CCDS12943.1 ZNF583 gene_id:147949|Hs108|chr19 (569 aa)
initn: 7531 init1: 1066 opt: 1598 Z-score: 949.3 bits: 185.4 E(32554): 1.5e-46
Smith-Waterman score: 1687; 49.3% identity (75.6% similar) in 491 aa overlap (41-521:2-491)
20 30 40 50 60
pF1KSD KGALSSQDSPHFQEKSTEEGEVAALRLTARSQETVTFKDVAMDFTPEEWGKLDPAQRD--
:.. ::: :::..:. ::: :.::::.
CCDS12 MSKDLVTFGDVAVNFSQEEWEWLNPAQRNLY
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KSD --VMLENYRNLVSLWLPVSKPESHNL-ENGKEPLKLERKAPKSSYSDMETRPQSKDSTSV
:::::::.:::: . ::::. .: :.:::: ..... .. : : .... .:
CCDS12 RKVMLENYRSLVSLGVSVSKPDVISLLEQGKEPWMVKKEGTRGPCPDWEYVFKNSEFSSK
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KSD QDFSKAESCKVAIID-RLTRNSVYDSNLEAALECENWLENQQGNQERHLREMF-THMNSL
:. . :: ::. . : :. .:. . :.: .:: :.:: :: ... :: . :
CCDS12 QE-TYEESSKVVTVGARHLSYSLDYPSLREDCQSEDWYKNQLGSQEVHLSQLIITHKEIL
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KSD SEETDHKHDVYWKSFNQKSVLITEDRVP--KGSYAFHTLEKSLKQKSNLMKKQRTYKEKK
: ..... :..:.: ... .. : . .. . .:: ..:: ::....: :::
CCDS12 PEVQNKEYNKSWQTFHQDTIFDIQQSFPTKEKAHKHEPQKKSYRKKSVEMKHRKVYVEKK
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KSD PHKCNDCGELFTYHSVLIRHQRVHTGEKPYTCNECGKSFSHRANLTKHQRTHT-RILFEC
::::: ..:. : : :::.:::::::.: ::::.::. :::..:.: :: . .::
CCDS12 LLKCNDCEKVFNQSSSLTLHQRIHTGEKPYACVECGKTFSQSANLAQHKRIHTGEKPYEC
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KSD SECKKTFTESSSLATHQRIHVGERPYECNECGKGFNRSTHLVQHQLIHTGVKPYECNECD
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CCDS12 KECRKAFSQNAHLAQHQRVHTGEKPYQCKECKKAFSQIAHLTQHQRVHTGERPFECIECG
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KSD KAFIHSSALIKHQRTHTGEKPYKCQECGKAFSHCSSLTKHQRVHTGEKPYECSECGKTFS
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CCDS12 KAFSNGSFLAQHQRIHTGEKPYVCNVCGKAFSHRGYLIVHQRIHTGERPYECKECRKAFS
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KSD QSTHLVQHQRIHTGEKPYECNECGKTFSRSSNFAKHQRIHIGKKPYKCSECGKAFIHSSA
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CCDS12 QYAHLAQHQRVHTGEKPYECKVCRKAFSQIAYLDQHQRVHTGEKPYECIECGKAFSNSSS
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520
pF1KSD LIQHQRTHTGEKPFRCNECGKSFKCSSSLIRHQRVHTEEQP
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CCDS12 LAQHQRSHTGEKPYMCKECRKTFSQNAGLAQHQRIHTGEKPYECNVCGKAFSYSGSLTLH
460 470 480 490 500 510
CCDS12 QRIHTGERPYECKDCRKSFRQRAHLAHHERIHTMESFLTLSSPSPSTSNQLPRPVGFIS
520 530 540 550 560
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: ::: :. :::::: .::: ::: ::
CCDS92 MDAKSLTAWSRTLVTFKDVFVDFTREEWKLLD
10 20 30
70 80 90 100 110
pF1KSD PAQ----RDVMLENYRNLVSLWLPVSKPES-HNLENGKEPLKLERKAPKSSYSDMETRPQ
:: :.::::::.::::: ..::. ::.:.:: .::. . .. : :: .
CCDS92 TAQQIVYRNVMLENYKNLVSLGYQLTKPDVILRLEKGEEPWLVEREIHQETHPDSETAFE
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pF1KSD SKDSTSVQD-FSKAESCKVAIIDRLTRNSVYDSNLEAALECENWLENQQGNQERHLREM-
:.:.: .. :. .:: . . . ..::... .:: . .:.. :.. : : :::::..
CCDS92 IKSSVSSRSIFKDKQSCDIKM-EGMARNDLWYLSLEEVWKCRDQLDKYQENPERHLRQVA
100 110 120 130 140 150
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pF1KSD FTHMNSLSEETD----------------------HKHDVYWKSFNQKSVLIT-EDRVPKG
::. . :..: ::.: . ::... :: .: ..
CCDS92 FTQKKVLTQERVSESGKYGGNCLLPAQLVLREYFHKRDSHTKSLKHDLVLNGHQDSCASN
160 170 180 190 200 210
220 230 240 250 260 270
pF1KSD SYAFHTLEKSLKQKSNLMKKQRTYKEKKPHKCNDCGELFTYHSVLIRHQRVHTGEKPYTC
: . ... :. .:.. ::. : .:: : . .:. : : . .: :::: :
CCDS92 S---NECGQTFCQNIHLIQFARTHTGDKSYKCPDNDNSLTHGSSLGISKGIHR-EKPYEC
220 230 240 250 260
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pF1KSD NECGKSFSHRANLTKHQRTHT-RILFECSECKKTFTESSSLATHQRIHVGERPYECNECG
.:::: :: :.:::.:: :: . .::.:: :.:..:: : ::. :.::.::::.:::
CCDS92 KECGKFFSWRSNLTRHQLIHTGEKPYECKECGKSFSRSSHLIGHQKTHTGEEPYECKECG
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pF1KSD KGFNRSTHLVQHQLIHTGVKPYECNECDKAFIHSSALIKHQRTHTGEKPYKCQECGKAFS
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CCDS92 KSFSWFSHLVTHQRTHTGDKLYTCNQCGKSFVHSSRLIRHQRTHTGEKPYECPECGKSFR
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pF1KSD HCSSLTKHQRVHTGEKPYECSECGKTFSQSTHLVQHQRIHTGEKPYECNECGKTFSRSSN
. . : :::.:. .::::.::::..:: .::: :.::::: ::.::..::: :::::.
CCDS92 QSTHLILHQRTHVRVRPYECNECGKSYSQRSHLVVHHRIHTGLKPFECKDCGKCFSRSSH
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pF1KSD FAKHQRIHIGKKPYKCSECGKAFIHSSALIQHQRTHTGEKPFRCNECGKSFKCSSSLIRH
. .::: : :.:::.: .:::.: .::::: ::: ::::::..: .:::.: ...::.:
CCDS92 LYSHQRTHTGEKPYECHDCGKSFSQSSALIVHQRIHTGEKPYECCQCGKAFIRKNDLIKH
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520
pF1KSD QRVHTEEQP
::.:. :.
CCDS92 QRIHVGEETYKCNQCGIIFSQNSPFIVHQIAHTGEQFLTCNQCGTALVNTSNLIGYQTNH
510 520 530 540 550 560
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CCDS42 MGPLQFRDVAIEFSLEEWHCLDTAQRNLYRNVMLE
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80 90 100 110 120 130
pF1KSD NYRNLVSLWLPVSKPESHN-LENGKEPLKLERKAPKSSYSDMETRPQSKDSTSVQDFSKA
:: ::: : . ::::. . ::.:..:: ..: ..: ..:. : .::.
CCDS42 NYSNLVFLGITVSKPDLITCLEQGRKPLTMKR-------NEMIAKPSVMCSHFAQDLWPE
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pF1KSD ESCKVA---IIDRLTRNSVYDSNLEAALECENWLENQQGNQERHLREMFTHMNSLSEETD
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CCDS42 QSMKDSFQKVVLRRYEKCEHD-NLQLKKGCISVDECKV-----H-KEGYNELNQCLTTTP
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CCDS42 RKICQCDKYVKVLHQFPNSNGQKRGHTGKKPFKYIECGKAFKQFSTLTTHKKIHTGGKPY
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pF1KSD KCNDCGELFTYHSVLIRHQRVHTGEKPYTCNECGKSFSHRANLTKHQRTHT-RILFECSE
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CCDS42 KCEECGKAFNHSCSLTRHKKIHTGEKPYKCEECGKAFKHSSTLTTHKRNHTGEKPYKCDK
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pF1KSD CKKTFTESSSLATHQRIHVGERPYECNECGKGFNRSTHLVQHQLIHTGVKPYECNECDKA
: :.: ::.:. :. ::. ..::.:.::::.::::. :. :..:::: :::.:.:::::
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: .: .: :.: :: .:::::.::::::.. :.:: :.:.:::::::.: ::::.:..:
CCDS42 FKYSYTLTTHKRIHTEDKPYKCEECGKAFKYSSTLTTHKRIHTGEKPYKCEECGKAFKRS
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CCDS42 SDLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFKYSSNLTTHKKIHTGERPYKCEECGKAFNQSSILT
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:.: ::::: ..:.::::.:::::.: :...:: :.:
CCDS42 THRRIHTGEKFYKCEECGKAFKCSSNLTTHKKIHTGERPYKCEECGKAFNQSSILTTHER
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CCDS42 IILERNSTNVKNVAKPSSGPHTLLHIR
510 520
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CCDS12 LYKDVMLENYRNLVSL--GISLPDL-NINSMLE----QRREPWSGESEVKIAKNSDGREC
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pF1KSD VQDFSKAESCKVA--IIDRLTRNSVYDSNLEAALECENWLENQQGNQERHLREMFTHMNS
.. . . : .. :. .... : : : . ... : .......: .:
CCDS12 IKGVNTGSSYALGSNAEDKPIKKQLGVSFHLHLSELELFPDERVINGCNQVENFINHSSS
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pF1KSD LS--EETDH--KHDVYWKS-FNQKSVLITEDRVP--KGSYAFHTLEKSLKQKSNLMKKQR
.: .: . : .. .. :...: : :..: . : . : .. .:.: :.:
CCDS12 VSCLQEMSSSVKTPIFNRNDFDDSSFLPQEQKVHLREKPYECNEHSKVFRVSSSLTKHQV
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pF1KSD TYKEKKPHKCNDCGELFTYHSVLIRHQRVHTGEKPYTCNECGKSFSHRANLTKHQRTHTR
. .::.:::.::..:. .: : .: :.::::::: :: ::: ::. .:...::: :::
CCDS12 IHTVEKPYKCNSCGKVFSRNSHLAEHCRIHTGEKPYKCNVCGKVFSYNSNFARHQRIHTR
230 240 250 260 270 280
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pF1KSD IL-FECSECKKTFTESSSLATHQRIHVGERPYECNECGKGFNRSTHLVQHQLIHTGVKPY
.::.:: :.:...: :: :::::. :.::.::::::::.... :..: :.:: :::
CCDS12 EKPYECNECGKVFSNNSYLARHQRIHAEEKPYKCNECGKGFSHKSSLANHWRIYTGEKPY
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pF1KSD ECNECDKAFIHSSALIKHQRTHTGEKPYKCQECGKAFSHCSSLTKHQRVHTGEKPYECSE
.:.:: ::: . . :..::. :::::::::.::::.: . : :..: :.:::::::.:.:
CCDS12 KCDECGKAFYRIALLVRHQKIHTGEKPYKCNECGKVFIQNSHLAQHWRIHTGEKPYKCNE
350 360 370 380 390 400
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pF1KSD CGKTFSQSTHLVQHQRIHTGEKPYECNECGKTFSRSSNFAKHQRIHIGKKPYKCSECGKA
:::.:.: ..:..:.:::::::::.::::::.::. :... : :: :.:::::::::::
CCDS12 CGKVFNQLSNLARHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSEYSGLSAHLVIHTGEKPYKCSECGKA
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CCDS12 FRHKLSLTNHQRIHTGERPYKCNECGKVFNRIAHLARHRKIHTGEKPYKCNECGKAFSRI
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CCDS12 SYLAQHWTIHMG
530
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CCDS74 MLDTFRLLVSVGHWLP--KPNVISLLEQEA
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CCDS74 ELWAVESRLPQGVYPDLETRPKVKLSVLKQGISEEISNSVILVERFLWDGLWYCRGEDTE
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pF1KSD LEAALECENWLEN----------QQGNQERHLREMFTHMNSLSEETDHKHDV-------Y
. ::. ::. . :. :. : . ::. . :. .
CCDS74 GHWEWSCES-LESLAVPVAFTPVKTPVLEQWQRNGFGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHT
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: . ... .. . : . : . :.....: :....::. ..:..:..: .
CCDS74 WGTRGKREKPDLNVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLK
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: :.: .:::.::::::: :..::..:.. : : .:::::: . .::::: :.:.
CCDS74 GFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSF
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CCDS74 RSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSL
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:::: :::::::.:.::::::.. . : .:::.:::::::::.::::.::::: :..:.
CCDS74 TKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHR
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::::::::: :::::::::.::....:.: : :.:::.::.::::: .:. : :::: ::
CCDS74 RIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHT
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::::..::.:::.:. :::: .:::.:: :.:
CCDS74 GEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKP
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CCDS74 YECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECH
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CCDS74 KPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYE
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::.: .:: .:: ::.::: :: :::: :.::::.::: :::..:.:.::::::::: .:
CCDS74 CNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDC
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CCDS74 GKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
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pF1KSD TEEGEVAALRLTARSQETVTFKDVAMDFTPEEWGKLDPAQR----DVMLENYRNLVSL--
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CCDS74 MTPGVRVSTDPEQVTFEDVVVGFSQEEWGQLKPAQRTLYRDVMLDTFRLLVSVGH
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CCDS74 WLP--KPNVISLLEQEAELWAVESRLPQGVYPDLETRPKVKLSVLKQGISEEISNSVILV
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.:. .... :.. . ::. ::. . :. :. : . ::.
CCDS74 ERFLWDGLWYCRGEDTEGHWEWSCES-LESLAVPVAFTPVKTPVLEQWQRNGFGENISLN
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pF1KSD EETDHKHDV-------YWKSFNQKSV----LITEDRVPKGSYAFHTLEKSLKQKSNLMKK
. :. . : . ... .. . : . : . :.....: :...
CCDS74 PDLPHQPMTPERQSPHTWGTRGKREKPDLNVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSALIEH
180 190 200 210 220 230
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CCDS74 HRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTH
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pF1KSD T-RILFECSECKKTFTESSSLATHQRIHVGERPYECNECGKGFNRSTHLVQHQLIHTGVK
: . .::::: :.:. ::.. :.: :.::.::::.::::.: .: ::.:: :::: :
CCDS74 TGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEK
300 310 320 330 340 350
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::.:.:: ::: :::.: :::: :::::::.:.::::::.. . : .:::.:::::::::
CCDS74 PYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYEC
360 370 380 390 400 410
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.::::.::::: :..:.::::::::: :::::::::.::....:.: : :.:::.::.::
CCDS74 GECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCG
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::: .:. : :::: ::::::..::.:::.:. :::: .:::.:: :.:
CCDS74 KAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFS
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>--
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. .... :.. . ::. ::. . :. :. : . ::. .
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300 310 320 330 340 350
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CCDS12 KPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYE
510 520 530 540 550 560
360 370 380 390 400 410
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570 580 590 600 610 620
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]