Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA1860
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1860, 688 aa
1>>>pF1KSDA1860 688 - 688 aa - 688 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.2226+/-0.00115; mu= -7.0156+/- 0.069
mean_var=355.9055+/-76.716, 0's: 0 Z-trim(113.8): 678 B-trim: 192 in 1/50
Lambda= 0.067984
statistics sampled from 13674 (14420) to 13674 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.759), E-opt: 0.2 (0.443), width: 16
Scan time: 4.510
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12658.1 MARK4 gene_id:57787|Hs108|chr19 ( 688) 4596 465.1 1.5e-130
CCDS56097.1 MARK4 gene_id:57787|Hs108|chr19 ( 752) 4194 425.7 1.2e-118
CCDS45166.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 744) 2730 282.1 1.9e-75
CCDS45165.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 753) 2715 280.7 5.4e-75
CCDS41993.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 729) 2709 280.1 8e-75
CCDS73033.1 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 ( 796) 2179 228.1 3.8e-59
CCDS73034.1 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 ( 780) 2167 226.9 8.4e-59
CCDS31029.2 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 ( 795) 2167 226.9 8.6e-59
CCDS55947.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 713) 2023 212.8 1.4e-54
CCDS53651.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 709) 2013 211.8 2.8e-54
CCDS8051.2 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 724) 2013 211.8 2.8e-54
CCDS53649.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 788) 2006 211.2 4.8e-54
CCDS53650.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 719) 2002 210.7 5.9e-54
CCDS41665.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 745) 1991 209.7 1.3e-53
CCDS65789.1 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 ( 758) 1569 168.3 3.7e-41
CCDS8379.2 SIK3 gene_id:23387|Hs108|chr11 (1321) 1253 137.5 1.2e-31
CCDS60974.1 SIK3 gene_id:23387|Hs108|chr11 (1261) 1215 133.7 1.6e-30
CCDS82645.1 LOC102724428 gene_id:102724428|Hs108|c ( 783) 1201 132.2 2.8e-30
CCDS33575.1 SIK1 gene_id:150094|Hs108|chr21 ( 783) 1201 132.2 2.8e-30
CCDS8347.1 SIK2 gene_id:23235|Hs108|chr11 ( 926) 1174 129.6 2e-29
CCDS12921.1 BRSK1 gene_id:84446|Hs108|chr19 ( 778) 990 111.5 4.8e-24
CCDS41590.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 ( 668) 946 107.1 8.4e-23
CCDS58106.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 ( 674) 946 107.1 8.5e-23
CCDS45167.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 659) 945 107.0 8.9e-23
CCDS58107.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 ( 736) 946 107.2 9.1e-23
CCDS31892.1 NUAK1 gene_id:9891|Hs108|chr12 ( 661) 924 105.0 3.7e-22
CCDS1453.2 NUAK2 gene_id:81788|Hs108|chr1 ( 672) 914 104.0 7.5e-22
CCDS43075.1 SNRK gene_id:54861|Hs108|chr3 ( 765) 904 103.1 1.6e-21
CCDS58108.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 ( 766) 894 102.1 3.2e-21
CCDS3943.1 NIM1K gene_id:167359|Hs108|chr5 ( 436) 853 97.9 3.4e-20
CCDS605.1 PRKAA2 gene_id:5563|Hs108|chr1 ( 552) 851 97.7 4.6e-20
CCDS59123.1 MELK gene_id:9833|Hs108|chr9 ( 610) 840 96.7 1.1e-19
CCDS6606.1 MELK gene_id:9833|Hs108|chr9 ( 651) 840 96.7 1.1e-19
CCDS3932.2 PRKAA1 gene_id:5562|Hs108|chr5 ( 559) 838 96.5 1.1e-19
CCDS60696.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 ( 614) 814 94.2 6.2e-19
CCDS13610.1 HUNK gene_id:30811|Hs108|chr21 ( 714) 732 86.2 1.8e-16
CCDS59126.1 MELK gene_id:9833|Hs108|chr9 ( 619) 708 83.8 8.5e-16
CCDS4112.1 TSSK1B gene_id:83942|Hs108|chr5 ( 367) 631 76.0 1.1e-13
CCDS362.1 TSSK3 gene_id:81629|Hs108|chr1 ( 268) 624 75.2 1.3e-13
CCDS13755.1 TSSK2 gene_id:23617|Hs108|chr22 ( 358) 619 74.8 2.4e-13
CCDS12403.1 TSSK6 gene_id:83983|Hs108|chr19 ( 273) 613 74.2 2.9e-13
CCDS59127.1 MELK gene_id:9833|Hs108|chr9 ( 580) 615 74.6 4.5e-13
CCDS46206.1 AURKC gene_id:6795|Hs108|chr19 ( 275) 589 71.8 1.5e-12
CCDS46205.1 AURKC gene_id:6795|Hs108|chr19 ( 290) 589 71.8 1.5e-12
CCDS33128.1 AURKC gene_id:6795|Hs108|chr19 ( 309) 589 71.9 1.6e-12
CCDS12304.1 PRKACA gene_id:5566|Hs108|chr19 ( 351) 584 71.4 2.5e-12
CCDS7091.1 CAMK1D gene_id:57118|Hs108|chr10 ( 385) 584 71.4 2.7e-12
CCDS7092.1 CAMK1D gene_id:57118|Hs108|chr10 ( 357) 581 71.1 3.1e-12
CCDS12305.1 PRKACA gene_id:5566|Hs108|chr19 ( 343) 580 71.0 3.2e-12
CCDS3933.2 PRKAA1 gene_id:5562|Hs108|chr5 ( 574) 584 71.6 3.7e-12
>>CCDS12658.1 MARK4 gene_id:57787|Hs108|chr19 (688 aa)
initn: 4596 init1: 4596 opt: 4596 Z-score: 2457.4 bits: 465.1 E(32554): 1.5e-130
Smith-Waterman score: 4596; 100.0% identity (100.0% similar) in 688 aa overlap (1-688:1-688)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSSRTVLAPGNDRNSDTHGTLGSGRSSDKGPSWSSRSLGARCRNSIASCPEEQPHVGNYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MSSRTVLAPGNDRNSDTHGTLGSGRSSDKGPSWSSRSLGARCRNSIASCPEEQPHVGNYR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LLRTIGKGNFAKVKLARHILTGREVAIKIIDKTQLNPSSLQKLFREVRIMKGLNHPNIVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LLRTIGKGNFAKVKLARHILTGREVAIKIIDKTQLNPSSLQKLFREVRIMKGLNHPNIVK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LFEVIETEKTLYLVMEYASAGEVFDYLVSHGRMKEKEARAKFRQIVSAVHYCHQKNIVHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LFEVIETEKTLYLVMEYASAGEVFDYLVSHGRMKEKEARAKFRQIVSAVHYCHQKNIVHR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD DLKAENLLLDAEANIKIADFGFSNEFTLGSKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDIW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DLKAENLLLDAEANIKIADFGFSNEFTLGSKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDIW
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD SLGVILYTLVSGSLPFDGHNLKELRERVLRGKYRVPFYMSTDCESILRRFLVLNPAKRCT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SLGVILYTLVSGSLPFDGHNLKELRERVLRGKYRVPFYMSTDCESILRRFLVLNPAKRCT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD LEQIMKDKWINIGYEGEELKPYTEPEEDFGDTKRIEVMVGMGYTREEIKESLTSQKYNEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LEQIMKDKWINIGYEGEELKPYTEPEEDFGDTKRIEVMVGMGYTREEIKESLTSQKYNEV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD TATYLLLGRKTEEGGDRGAPGLALARVRAPSDTTNGTSSSKGTSHSKGQRSSSSTYHRQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TATYLLLGRKTEEGGDRGAPGLALARVRAPSDTTNGTSSSKGTSHSKGQRSSSSTYHRQR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD RHSDFCGPSPAPLHPKRSPTSTGEAELKEERLPGRKASCSTAGSGSRGLPPSSPMVSSAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RHSDFCGPSPAPLHPKRSPTSTGEAELKEERLPGRKASCSTAGSGSRGLPPSSPMVSSAH
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD NPNKAEIPERRKDSTSTPNNLPPSMMTRRNTYVCTERPGAERPSLLPNGKENSSGTPRVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 NPNKAEIPERRKDSTSTPNNLPPSMMTRRNTYVCTERPGAERPSLLPNGKENSSGTPRVP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD PASPSSHSLAPPSGERSRLARGSTIRSTFHGGQVRDRRAGGGGGGGVQNGPPASPTLAHE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PASPSSHSLAPPSGERSRLARGSTIRSTFHGGQVRDRRAGGGGGGGVQNGPPASPTLAHE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD AAPLPAGRPRPTTNLFTKLTSKLTRRVTLDPSKRQNSNRCVSGASLPQGSKIRSQTNLRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 AAPLPAGRPRPTTNLFTKLTSKLTRRVTLDPSKRQNSNRCVSGASLPQGSKIRSQTNLRE
610 620 630 640 650 660
670 680
pF1KSD SGDLRSQVAIYLGIKRKPPPGCSDSPGV
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SGDLRSQVAIYLGIKRKPPPGCSDSPGV
670 680
>>CCDS56097.1 MARK4 gene_id:57787|Hs108|chr19 (752 aa)
initn: 4265 init1: 4194 opt: 4194 Z-score: 2243.8 bits: 425.7 E(32554): 1.2e-118
Smith-Waterman score: 4194; 99.2% identity (99.7% similar) in 633 aa overlap (1-633:1-633)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSSRTVLAPGNDRNSDTHGTLGSGRSSDKGPSWSSRSLGARCRNSIASCPEEQPHVGNYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 MSSRTVLAPGNDRNSDTHGTLGSGRSSDKGPSWSSRSLGARCRNSIASCPEEQPHVGNYR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LLRTIGKGNFAKVKLARHILTGREVAIKIIDKTQLNPSSLQKLFREVRIMKGLNHPNIVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 LLRTIGKGNFAKVKLARHILTGREVAIKIIDKTQLNPSSLQKLFREVRIMKGLNHPNIVK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LFEVIETEKTLYLVMEYASAGEVFDYLVSHGRMKEKEARAKFRQIVSAVHYCHQKNIVHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 LFEVIETEKTLYLVMEYASAGEVFDYLVSHGRMKEKEARAKFRQIVSAVHYCHQKNIVHR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD DLKAENLLLDAEANIKIADFGFSNEFTLGSKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDIW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 DLKAENLLLDAEANIKIADFGFSNEFTLGSKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDIW
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD SLGVILYTLVSGSLPFDGHNLKELRERVLRGKYRVPFYMSTDCESILRRFLVLNPAKRCT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 SLGVILYTLVSGSLPFDGHNLKELRERVLRGKYRVPFYMSTDCESILRRFLVLNPAKRCT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD LEQIMKDKWINIGYEGEELKPYTEPEEDFGDTKRIEVMVGMGYTREEIKESLTSQKYNEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 LEQIMKDKWINIGYEGEELKPYTEPEEDFGDTKRIEVMVGMGYTREEIKESLTSQKYNEV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD TATYLLLGRKTEEGGDRGAPGLALARVRAPSDTTNGTSSSKGTSHSKGQRSSSSTYHRQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 TATYLLLGRKTEEGGDRGAPGLALARVRAPSDTTNGTSSSKGTSHSKGQRSSSSTYHRQR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD RHSDFCGPSPAPLHPKRSPTSTGEAELKEERLPGRKASCSTAGSGSRGLPPSSPMVSSAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 RHSDFCGPSPAPLHPKRSPTSTGEAELKEERLPGRKASCSTAGSGSRGLPPSSPMVSSAH
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD NPNKAEIPERRKDSTSTPNNLPPSMMTRRNTYVCTERPGAERPSLLPNGKENSSGTPRVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 NPNKAEIPERRKDSTSTPNNLPPSMMTRRNTYVCTERPGAERPSLLPNGKENSSGTPRVP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD PASPSSHSLAPPSGERSRLARGSTIRSTFHGGQVRDRRAGGGGGGGVQNGPPASPTLAHE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 PASPSSHSLAPPSGERSRLARGSTIRSTFHGGQVRDRRAGGGGGGGVQNGPPASPTLAHE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD AAPLPAGRPRPTTNLFTKLTSKLTRRVTLDPSKRQNSNRCVSGASLPQGSKIRSQTNLRE
:::::::::::::::::::::::::::. .: .
CCDS56 AAPLPAGRPRPTTNLFTKLTSKLTRRVADEPERIGGPEVTSCHLPWDQTETAPRLLRFPW
610 620 630 640 650 660
670 680
pF1KSD SGDLRSQVAIYLGIKRKPPPGCSDSPGV
CCDS56 SVKLTSSRPPEALMAALRQATAAARCRCRQPQPFLLACLHGGAGGPEPLSHFEVEVCQLP
670 680 690 700 710 720
>>CCDS45166.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 (744 aa)
initn: 2299 init1: 2001 opt: 2730 Z-score: 1467.8 bits: 282.1 E(32554): 1.9e-75
Smith-Waterman score: 2730; 63.8% identity (83.7% similar) in 682 aa overlap (1-673:1-664)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSSRTVLAPGNDRNSDTHGTLGSGRSSDKGPSWSSRSLGARCRNSIASCPEEQPHVGNYR
::.:: : :.:....: . :.::. . : .::: ::::::::::: .::::.::::
CCDS45 MSTRTPLPTVNERDTENHTSHGDGRQ--EVTSRTSRS-GARCRNSIASCADEQPHIGNYR
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LLRTIGKGNFAKVKLARHILTGREVAIKIIDKTQLNPSSLQKLFREVRIMKGLNHPNIVK
::.::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::: ::::::::
CCDS45 LLKTIGKGNFAKVKLARHILTGREVAIKIIDKTQLNPTSLQKLFREVRIMKILNHPNIVK
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LFEVIETEKTLYLVMEYASAGEVFDYLVSHGRMKEKEARAKFRQIVSAVHYCHQKNIVHR
:::::::::::::.:::::.::::::::.::::::::::.:::::::::.::::: ::::
CCDS45 LFEVIETEKTLYLIMEYASGGEVFDYLVAHGRMKEKEARSKFRQIVSAVQYCHQKRIVHR
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KSD DLKAENLLLDAEANIKIADFGFSNEFTLGSKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDIW
:::::::::::. ::::::::::::::.:.::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS45 DLKAENLLLDADMNIKIADFGFSNEFTVGGKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDVW
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KSD SLGVILYTLVSGSLPFDGHNLKELRERVLRGKYRVPFYMSTDCESILRRFLVLNPAKRCT
::::::::::::::::::.:::::::::::::::.:::::::::..:.::::::: :: :
CCDS45 SLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKRFLVLNPIKRGT
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KSD LEQIMKDKWINIGYEGEELKPYTEPEEDFGDTKRIEVMVGMGYTREEIKESLTSQKYNEV
:::::::.::: :.: .::::..::: :..: :::..::::::..:::.:::...::.:.
CCDS45 LEQIMKDRWINAGHEEDELKPFVEPELDISDQKRIDIMVGMGYSQEEIQESLSKMKYDEI
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410
pF1KSD TATYLLLGRKTEE---GGDRGAPGLALARVRAPSDTTNGTSSSKGTSHSKGQRSSSSTYH
::::::::::. : . . .. .:.::.:: :: .:.:..: : : ::: ::. .
CCDS45 TATYLLLGRKSSELDASDSSSSSNLSLAKVRPSSDLNNSTGQSP---HHKVQRSVSSS-Q
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KSD RQRRHSDFCGPS-PAPL-HPKRSPTSTGEAELKEERLPGRKASCSTAGSGSRGLPPSSPM
.:::.:: ::. :. . .:::: :::....:::. . .::.: :..:. .:. :.:::
CCDS45 KQRRYSDHAGPAIPSVVAYPKRSQTSTADSDLKEDGISSRKSSGSAVGG--KGIAPASPM
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KSD VSSAHNPNKAEIPERRKDSTSTPNNLPPSMMTRRNTYVCTERPGAERPSLLPNGKENSSG
...: :::::.::::.:.:: .: . :::::::::.:: :.: :.. ::::::.
CCDS45 LGNASNPNKADIPERKKSSTVPSSNTASGGMTRRNTYVCSERTTADRHSVIQNGKENSTI
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KSD TPRVPPASPSSHSLAPP-SGERSRLARGSTIRSTFHGGQVRDRRAGGGGGGGVQNGPPAS
. :.. :.::.. . .: :. ::.. :::::: : :.::.. . ::::::
CCDS45 PDQRTPVA-STHSISSAATPDRIRFPRGTASRSTFHG-QPRERRTA------TYNGPPAS
540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KSD PTLAHEAAPLPAGRPRPTTNLFTKLTSKLTRRVTLD---PSKRQNSNRCVSGASLPQGSK
:.:.:::.:: : : .::::.:::::::::. . .. ..:.: ::. . ....
CCDS45 PSLSHEATPLSQTRSRGSTNLFSKLTSKLTRRLPTEYERNGRYEGSSRNVSAEQKDENKE
590 600 610 620 630 640
660 670 680
pF1KSD IRSQTNLRESGDLRSQVAIYLGIKRKPPPGCSDSPGV
. .. :: . .... .. :
CCDS45 AKPRS-LRFTWSMKTTSSMDPGDMMREIRKVLDANNCDYEQRERFLLFCVHGDGHAENLV
650 660 670 680 690 700
>>CCDS45165.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 (753 aa)
initn: 2173 init1: 2001 opt: 2715 Z-score: 1459.8 bits: 280.7 E(32554): 5.4e-75
Smith-Waterman score: 2715; 67.7% identity (85.6% similar) in 632 aa overlap (1-626:1-615)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSSRTVLAPGNDRNSDTHGTLGSGRSSDKGPSWSSRSLGARCRNSIASCPEEQPHVGNYR
::.:: : :.:....: . :.::. . : .::: ::::::::::: .::::.::::
CCDS45 MSTRTPLPTVNERDTENHTSHGDGRQ--EVTSRTSRS-GARCRNSIASCADEQPHIGNYR
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LLRTIGKGNFAKVKLARHILTGREVAIKIIDKTQLNPSSLQKLFREVRIMKGLNHPNIVK
::.::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::: ::::::::
CCDS45 LLKTIGKGNFAKVKLARHILTGREVAIKIIDKTQLNPTSLQKLFREVRIMKILNHPNIVK
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LFEVIETEKTLYLVMEYASAGEVFDYLVSHGRMKEKEARAKFRQIVSAVHYCHQKNIVHR
:::::::::::::.:::::.::::::::.::::::::::.:::::::::.::::: ::::
CCDS45 LFEVIETEKTLYLIMEYASGGEVFDYLVAHGRMKEKEARSKFRQIVSAVQYCHQKRIVHR
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KSD DLKAENLLLDAEANIKIADFGFSNEFTLGSKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDIW
:::::::::::. ::::::::::::::.:.::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS45 DLKAENLLLDADMNIKIADFGFSNEFTVGGKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDVW
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KSD SLGVILYTLVSGSLPFDGHNLKELRERVLRGKYRVPFYMSTDCESILRRFLVLNPAKRCT
::::::::::::::::::.:::::::::::::::.:::::::::..:.::::::: :: :
CCDS45 SLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKRFLVLNPIKRGT
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KSD LEQIMKDKWINIGYEGEELKPYTEPEEDFGDTKRIEVMVGMGYTREEIKESLTSQKYNEV
:::::::.::: :.: .::::..::: :..: :::..::::::..:::.:::...::.:.
CCDS45 LEQIMKDRWINAGHEEDELKPFVEPELDISDQKRIDIMVGMGYSQEEIQESLSKMKYDEI
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410
pF1KSD TATYLLLGRKTEE---GGDRGAPGLALARVRAPSDTTNGTSSSKGTSHSKGQRSSSSTYH
::::::::::. : . . .. .:.::.:: :: .:.:..: : : ::: ::. .
CCDS45 TATYLLLGRKSSELDASDSSSSSNLSLAKVRPSSDLNNSTGQSP---HHKVQRSVSSS-Q
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KSD RQRRHSDFCGPS-PAPL-HPKRSPTSTGEAELKEERLPGRKASCSTAGSGSRGLPPSSPM
.:::.:: ::. :. . .:::: :::....:::. . .::.: :..:. .:. :.:::
CCDS45 KQRRYSDHAGPAIPSVVAYPKRSQTSTADSDLKEDGISSRKSSGSAVGG--KGIAPASPM
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KSD VSSAHNPNKAEIPERRKDSTSTPNNLPPSMMTRRNTYVCTERPGAERPSLLPNGKENSSG
...: :::::.::::.:.:: .: . :::::::::.:: :.: :.. ::::::.
CCDS45 LGNASNPNKADIPERKKSSTVPSSNTASGGMTRRNTYVCSERTTADRHSVIQNGKENSTI
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KSD TPRVPPASPSSHSLAPP-SGERSRLARGSTIRSTFHGGQVRDRRAGGGGGGGVQNGPPAS
. :.. :.::.. . .: :. ::.. :::::: : :.::.. . ::::::
CCDS45 PDQRTPVA-STHSISSAATPDRIRFPRGTASRSTFHG-QPRERRTA------TYNGPPAS
540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KSD PTLAHEAAPLPAGRPRPTTNLFTKLTSKLTRRVTLDPSKRQNSNRCVSGASLPQGSKIRS
:.:.:::.:: : : .::::.:::::::::
CCDS45 PSLSHEATPLSQTRSRGSTNLFSKLTSKLTRRNMSFRFIKRLPTEYERNGRYEGSSRNVS
590 600 610 620 630 640
660 670 680
pF1KSD QTNLRESGDLRSQVAIYLGIKRKPPPGCSDSPGV
CCDS45 AEQKDENKEAKPRSLRFTWSMKTTSSMDPGDMMREIRKVLDANNCDYEQRERFLLFCVHG
650 660 670 680 690 700
>>CCDS41993.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 (729 aa)
initn: 2291 init1: 2001 opt: 2709 Z-score: 1456.8 bits: 280.1 E(32554): 8e-75
Smith-Waterman score: 2722; 64.1% identity (84.1% similar) in 674 aa overlap (1-668:1-655)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSSRTVLAPGNDRNSDTHGTLGSGRSSDKGPSWSSRSLGARCRNSIASCPEEQPHVGNYR
::.:: : :.:....: . :.:: .. : .::: ::::::::::: .::::.::::
CCDS41 MSTRTPLPTVNERDTENHTSHGDGR--QEVTSRTSRS-GARCRNSIASCADEQPHIGNYR
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LLRTIGKGNFAKVKLARHILTGREVAIKIIDKTQLNPSSLQKLFREVRIMKGLNHPNIVK
::.::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::: ::::::::
CCDS41 LLKTIGKGNFAKVKLARHILTGREVAIKIIDKTQLNPTSLQKLFREVRIMKILNHPNIVK
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LFEVIETEKTLYLVMEYASAGEVFDYLVSHGRMKEKEARAKFRQIVSAVHYCHQKNIVHR
:::::::::::::.:::::.::::::::.::::::::::.:::::::::.::::: ::::
CCDS41 LFEVIETEKTLYLIMEYASGGEVFDYLVAHGRMKEKEARSKFRQIVSAVQYCHQKRIVHR
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KSD DLKAENLLLDAEANIKIADFGFSNEFTLGSKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDIW
:::::::::::. ::::::::::::::.:.::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS41 DLKAENLLLDADMNIKIADFGFSNEFTVGGKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDVW
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KSD SLGVILYTLVSGSLPFDGHNLKELRERVLRGKYRVPFYMSTDCESILRRFLVLNPAKRCT
::::::::::::::::::.:::::::::::::::.:::::::::..:.::::::: :: :
CCDS41 SLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKRFLVLNPIKRGT
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KSD LEQIMKDKWINIGYEGEELKPYTEPEEDFGDTKRIEVMVGMGYTREEIKESLTSQKYNEV
:::::::.::: :.: .::::..::: :..: :::..::::::..:::.:::...::.:.
CCDS41 LEQIMKDRWINAGHEEDELKPFVEPELDISDQKRIDIMVGMGYSQEEIQESLSKMKYDEI
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410
pF1KSD TATYLLLGRKTEE---GGDRGAPGLALARVRAPSDTTNGTSSSKGTSHSKGQRSSSSTYH
::::::::::. : . . .. .:.::.:: :: .:.:..: : : ::: ::. .
CCDS41 TATYLLLGRKSSELDASDSSSSSNLSLAKVRPSSDLNNSTGQSP---HHKVQRSVSSS-Q
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KSD RQRRHSDFCGPS-PAPL-HPKRSPTSTGEAELKEERLPGRKASCSTAGSGSRGLPPSSPM
.:::.:: ::. :. . .:::: :::....:::. . .::.: :..:. .:. :.:::
CCDS41 KQRRYSDHAGPAIPSVVAYPKRSQTSTADSDLKEDGISSRKSSGSAVGG--KGIAPASPM
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KSD VSSAHNPNKAEIPERRKDSTSTPNNLPPSMMTRRNTYVCTERPGAERPSLLPNGKENSSG
...: :::::.::::.:.:: .: . :::::::::.:: :.: :.. ::::::.
CCDS41 LGNASNPNKADIPERKKSSTVPSSNTASGGMTRRNTYVCSERTTADRHSVIQNGKENSTI
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KSD TPRVPPASPSSHSLAPP-SGERSRLARGSTIRSTFHGGQVRDRRAGGGGGGGVQNGPPAS
. :.. :.::.. . .: :. ::.. :::::: : :.::.. . ::::::
CCDS41 PDQRTPVA-STHSISSAATPDRIRFPRGTASRSTFHG-QPRERRTA------TYNGPPAS
540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KSD PTLAHEAAPLPAGRPRPTTNLFTKLTSKLTRRVTLDPSKRQNSNRCVSGASLPQGSKIRS
:.:.:::.:: : : .::::.:::::::: ... ..... :. .. :: ....
CCDS41 PSLSHEATPLSQTRSRGSTNLFSKLTSKLTRSRNVS-AEQKDENKEAKPRSLRFTWSMKT
590 600 610 620 630 640
660 670 680
pF1KSD QTNLRESGDLRSQVAIYLGIKRKPPPGCSDSPGV
... . ::. ..
CCDS41 TSSM-DPGDMMREIRKVLDANNCDYEQRERFLLFCVHGDGHAENLVQWEMEVCKLPRLSL
650 660 670 680 690 700
>>CCDS73033.1 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 (796 aa)
initn: 2227 init1: 1921 opt: 2179 Z-score: 1175.4 bits: 228.1 E(32554): 3.8e-59
Smith-Waterman score: 2355; 56.8% identity (73.6% similar) in 723 aa overlap (1-661:1-696)
10 20 30 40 50
pF1KSD MSSRTVLAPGNDRNSDTHGTLGSGRSSDKGPSWSS-RSLGARCRNSIASCPEEQPHVGNY
::.:: : :.:....: .. . :. :: :. ::::::.: .::::.:::
CCDS73 MSARTPLPTVNERDTENHTSVDGYTEPHIQPTKSSSRQNIPRCRNSITSATDEQPHIGNY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD RLLRTIGKGNFAKVKLARHILTGREVAIKIIDKTQLNPSSLQKLFREVRIMKGLNHPNIV
:: .:::::::::::::::.:::::::.::::::::::.::::::::::::: :::::::
CCDS73 RLQKTIGKGNFAKVKLARHVLTGREVAVKIIDKTQLNPTSLQKLFREVRIMKILNHPNIV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KSD KLFEVIETEKTLYLVMEYASAGEVFDYLVSHGRMKEKEARAKFRQIVSAVHYCHQKNIVH
::::::::::::::::::::.::::::::.::::::::::::::::::::.::::: :::
CCDS73 KLFEVIETEKTLYLVMEYASGGEVFDYLVAHGRMKEKEARAKFRQIVSAVQYCHQKYIVH
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KSD RDLKAENLLLDAEANIKIADFGFSNEFTLGSKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDI
:::::::::::.. ::::::::::::::.:.::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS73 RDLKAENLLLDGDMNIKIADFGFSNEFTVGNKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KSD WSLGVILYTLVSGSLPFDGHNLKELRERVLRGKYRVPFYMSTDCESILRRFLVLNPAKRC
:::::::::::::::::::.:::::::::::::::.:::::::::..:...::::: ::
CCDS73 WSLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKKLLVLNPIKRG
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KSD TLEQIMKDKWINIGYEGEELKPYTEPEEDFGDTKRIEVMVGMGYTREEIKESLTSQKYNE
.:::::::.:.:.:.: :::::::::. ::.:::::..:: ::..:.::...: .:::.:
CCDS73 SLEQIMKDRWMNVGHEEEELKPYTEPDPDFNDTKRIDIMVTMGFARDEINDALINQKYDE
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KSD VTATYLLLGRKTEE--GGDRGAPGLALARVRAPSDTTNGTSSSKGTSHSKGQRSSSSTYH
: :::.::::: : ::. . : : : :: .:.: .: .: : ::: :.. .
CCDS73 VMATYILLGRKPPEFEGGESLSSGNLCQRSRPSSDLNNSTLQSP--AHLKVQRSISAN-Q
370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KSD RQRRHSDFCGPS--PAPLHPKRSPTSTGEAELKEE--RLPGRKASCSTAGSGSRGLPPSS
.::: :: ::: :: . :: ... :.: ::: . .:: . .:.:: :. .:
CCDS73 KQRRFSDHAGPSIPPAVSYTKRPQANSVESEQKEEWDKDVARKLGSTTVGSKSEMT--AS
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510
pF1KSD PMVSSAHNPNKAEIPERRKDSTSTPNNL-PPSMMTRRNTYVC---TER------------
:.:. :::.:.:: ::. . :.::::::: :.:
CCDS73 PLVG----------PERKKSSTIPSNNVYSGGSMARRNTYVCERTTDRYVALQNGKDSSL
480 490 500 510 520
520 530
pF1KSD -------------------PGAERP----SL----------LPNGKENS------SGTPR
:.: :: :. ::. :..: : : :
CCDS73 TEMSVSSISSAGSSVASAVPSA-RPRHQKSMSTSGHPIKVTLPTIKDGSEAYRPGSTTQR
530 540 550 560 570 580
540 550 560 570 580 590
pF1KSD VPPASPSSHSLAPPSGERSRLARGSTIRSTFHGGQVRDRRAGGGGGGGVQNGPPASPTLA
:: ::::.::.. . .:.:. :::. :::::: :.:.::. . :::::::.
CCDS73 VPAASPSAHSISTATPDRTRFPRGSSSRSTFHGEQLRERRSVA------YNGPPASPS--
590 600 610 620 630
600 610 620 630 640 650
pF1KSD HEAAPLPAGRPRPTTNLFTKLTSKLTRRVTLDPSKRQNSNRCVSGASLPQGSKIRSQTNL
::.. . .: .:....:.:::..:: :::. . :.: .. : : :.. .
CCDS73 HETGAFAHARRGTSTGIISKITSKFVRR---DPSEGEASGRTDTSRSTSGEPKERDKEEG
640 650 660 670 680 690
660 670 680
pF1KSD RESGDLRSQVAIYLGIKRKPPPGCSDSPGV
..:
CCDS73 KDSKPRSLRFTWSMKTTSSMDPNDMMREIRKVLDANNCDYEQKERFLLFCVHGDARQDSL
700 710 720 730 740 750
>>CCDS73034.1 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 (780 aa)
initn: 2224 init1: 1921 opt: 2167 Z-score: 1169.1 bits: 226.9 E(32554): 8.4e-59
Smith-Waterman score: 2338; 57.8% identity (73.9% similar) in 697 aa overlap (1-634:1-672)
10 20 30 40 50
pF1KSD MSSRTVLAPGNDRNSDTHGTLGSGRSSDKGPSWSS-RSLGARCRNSIASCPEEQPHVGNY
::.:: : :.:....: .. . :. :: :. ::::::.: .::::.:::
CCDS73 MSARTPLPTVNERDTENHTSVDGYTEPHIQPTKSSSRQNIPRCRNSITSATDEQPHIGNY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD RLLRTIGKGNFAKVKLARHILTGREVAIKIIDKTQLNPSSLQKLFREVRIMKGLNHPNIV
:: .:::::::::::::::.:::::::.::::::::::.::::::::::::: :::::::
CCDS73 RLQKTIGKGNFAKVKLARHVLTGREVAVKIIDKTQLNPTSLQKLFREVRIMKILNHPNIV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KSD KLFEVIETEKTLYLVMEYASAGEVFDYLVSHGRMKEKEARAKFRQIVSAVHYCHQKNIVH
::::::::::::::::::::.::::::::.::::::::::::::::::::.::::: :::
CCDS73 KLFEVIETEKTLYLVMEYASGGEVFDYLVAHGRMKEKEARAKFRQIVSAVQYCHQKYIVH
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KSD RDLKAENLLLDAEANIKIADFGFSNEFTLGSKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDI
:::::::::::.. ::::::::::::::.:.::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS73 RDLKAENLLLDGDMNIKIADFGFSNEFTVGNKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KSD WSLGVILYTLVSGSLPFDGHNLKELRERVLRGKYRVPFYMSTDCESILRRFLVLNPAKRC
:::::::::::::::::::.:::::::::::::::.:::::::::..:...::::: ::
CCDS73 WSLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKKLLVLNPIKRG
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KSD TLEQIMKDKWINIGYEGEELKPYTEPEEDFGDTKRIEVMVGMGYTREEIKESLTSQKYNE
.:::::::.:.:.:.: :::::::::. ::.:::::..:: ::..:.::...: .:::.:
CCDS73 SLEQIMKDRWMNVGHEEEELKPYTEPDPDFNDTKRIDIMVTMGFARDEINDALINQKYDE
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KSD VTATYLLLGRKTEE--GGDRGAPGLALARVRAPSDTTNGTSSSKGTSHSKGQRSSSSTYH
: :::.::::: : ::. . : : : :: .:.: .: .: : ::: :.. .
CCDS73 VMATYILLGRKPPEFEGGESLSSGNLCQRSRPSSDLNNSTLQS--PAHLKVQRSISAN-Q
370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KSD RQRRHSDFCGPS--PAPLHPKRSPTSTGEAELKEE--RLPGRKASCSTAGSGSRGLPPSS
.::: :: ::: :: . :: ... :.: ::: . .:: . .:.:: :. .:
CCDS73 KQRRFSDHAGPSIPPAVSYTKRPQANSVESEQKEEWDKDVARKLGSTTVGSKSEM--TAS
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KSD PMVSSAHNPNKAEIPERRKDSTSTPNNL-PPSMMTRRNTYVCTERPGAERPSLLPNGKEN
:.:. :::.:.:: ::. . :.::::::: :: ..: : :::..
CCDS73 PLVG----------PERKKSSTIPSNNVYSGGSMARRNTYVC-ERT-TDRYVALQNGKDS
480 490 500 510 520
pF1KSD S---------------------------------SGTP---------------------R
: :: : :
CCDS73 SLTEMSVSSISSAGSSVASAVPSARPRHQKSMSTSGHPIKVTLPTIKDGSEAYRPGTTQR
530 540 550 560 570 580
540 550 560 570 580 590
pF1KSD VPPASPSSHSLAPPSGERSRLARGSTIRSTFHGGQVRDRRAGGGGGGGVQNGPPASPTLA
:: ::::.::.. . .:.:. :::. :::::: :.:.::. . :::::::.
CCDS73 VPAASPSAHSISTATPDRTRFPRGSSSRSTFHGEQLRERRSVA------YNGPPASPS--
590 600 610 620 630
600 610 620 630 640 650
pF1KSD HEAAPLPAGRPRPTTNLFTKLTSKLTRRVTL-DPSKRQNSNRCVSGASLPQGSKIRSQTN
::.. . .: .:....:.:::..:: : .:..:
CCDS73 HETGAFAHARRGTSTGIISKITSKFVRRSTSGEPKERDKEEGKDSKPRSLRFTWSMKTTS
640 650 660 670 680 690
660 670 680
pF1KSD LRESGDLRSQVAIYLGIKRKPPPGCSDSPGV
CCDS73 SMDPNDMMREIRKVLDANNCDYEQKERFLLFCVHGDARQDSLVQWEMEVCKLPRLSLNGV
700 710 720 730 740 750
>>CCDS31029.2 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 (795 aa)
initn: 2224 init1: 1921 opt: 2167 Z-score: 1169.0 bits: 226.9 E(32554): 8.6e-59
Smith-Waterman score: 2356; 56.6% identity (73.0% similar) in 723 aa overlap (1-661:1-695)
10 20 30 40 50
pF1KSD MSSRTVLAPGNDRNSDTHGTLGSGRSSDKGPSWSS-RSLGARCRNSIASCPEEQPHVGNY
::.:: : :.:....: .. . :. :: :. ::::::.: .::::.:::
CCDS31 MSARTPLPTVNERDTENHTSVDGYTEPHIQPTKSSSRQNIPRCRNSITSATDEQPHIGNY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD RLLRTIGKGNFAKVKLARHILTGREVAIKIIDKTQLNPSSLQKLFREVRIMKGLNHPNIV
:: .:::::::::::::::.:::::::.::::::::::.::::::::::::: :::::::
CCDS31 RLQKTIGKGNFAKVKLARHVLTGREVAVKIIDKTQLNPTSLQKLFREVRIMKILNHPNIV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KSD KLFEVIETEKTLYLVMEYASAGEVFDYLVSHGRMKEKEARAKFRQIVSAVHYCHQKNIVH
::::::::::::::::::::.::::::::.::::::::::::::::::::.::::: :::
CCDS31 KLFEVIETEKTLYLVMEYASGGEVFDYLVAHGRMKEKEARAKFRQIVSAVQYCHQKYIVH
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KSD RDLKAENLLLDAEANIKIADFGFSNEFTLGSKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDI
:::::::::::.. ::::::::::::::.:.::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS31 RDLKAENLLLDGDMNIKIADFGFSNEFTVGNKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KSD WSLGVILYTLVSGSLPFDGHNLKELRERVLRGKYRVPFYMSTDCESILRRFLVLNPAKRC
:::::::::::::::::::.:::::::::::::::.:::::::::..:...::::: ::
CCDS31 WSLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKKLLVLNPIKRG
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KSD TLEQIMKDKWINIGYEGEELKPYTEPEEDFGDTKRIEVMVGMGYTREEIKESLTSQKYNE
.:::::::.:.:.:.: :::::::::. ::.:::::..:: ::..:.::...: .:::.:
CCDS31 SLEQIMKDRWMNVGHEEEELKPYTEPDPDFNDTKRIDIMVTMGFARDEINDALINQKYDE
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KSD VTATYLLLGRKTEE--GGDRGAPGLALARVRAPSDTTNGTSSSKGTSHSKGQRSSSSTYH
: :::.::::: : ::. . : : : :: .:.: .: .: : ::: :.. .
CCDS31 VMATYILLGRKPPEFEGGESLSSGNLCQRSRPSSDLNNSTLQSP--AHLKVQRSISAN-Q
370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KSD RQRRHSDFCGPS--PAPLHPKRSPTSTGEAELKEE--RLPGRKASCSTAGSGSRGLPPSS
.::: :: ::: :: . :: ... :.: ::: . .:: . .:.:: :. .:
CCDS31 KQRRFSDHAGPSIPPAVSYTKRPQANSVESEQKEEWDKDVARKLGSTTVGSKSEMT--AS
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KSD PMVSSAHNPNKAEIPERRKDSTSTPNNL-PPSMMTRRNTYVCTERPGAERPSLLPNGKEN
:.:. :::.:.:: ::. . :.::::::: :: ..: : :::..
CCDS31 PLVG----------PERKKSSTIPSNNVYSGGSMARRNTYVC-ERT-TDRYVALQNGKDS
480 490 500 510 520
pF1KSD S---------------------------------SGTP---------------------R
: :: : :
CCDS31 SLTEMSVSSISSAGSSVASAVPSARPRHQKSMSTSGHPIKVTLPTIKDGSEAYRPGTTQR
530 540 550 560 570 580
540 550 560 570 580 590
pF1KSD VPPASPSSHSLAPPSGERSRLARGSTIRSTFHGGQVRDRRAGGGGGGGVQNGPPASPTLA
:: ::::.::.. . .:.:. :::. :::::: :.:.::. . :::::::.
CCDS31 VPAASPSAHSISTATPDRTRFPRGSSSRSTFHGEQLRERRSVA------YNGPPASPS--
590 600 610 620 630
600 610 620 630 640 650
pF1KSD HEAAPLPAGRPRPTTNLFTKLTSKLTRRVTLDPSKRQNSNRCVSGASLPQGSKIRSQTNL
::.. . .: .:....:.:::..:: :::. . :.: .. : : :.. .
CCDS31 HETGAFAHARRGTSTGIISKITSKFVRR---DPSEGEASGRTDTSRSTSGEPKERDKEEG
640 650 660 670 680 690
660 670 680
pF1KSD RESGDLRSQVAIYLGIKRKPPPGCSDSPGV
..:
CCDS31 KDSKPRSLRFTWSMKTTSSMDPNDMMREIRKVLDANNCDYEQKERFLLFCVHGDARQDSL
700 710 720 730 740 750
>>CCDS55947.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 (713 aa)
initn: 2493 init1: 1958 opt: 2023 Z-score: 1093.3 bits: 212.8 E(32554): 1.4e-54
Smith-Waterman score: 2685; 63.9% identity (83.0% similar) in 671 aa overlap (1-668:1-639)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSSRTVLAPGNDRNSDTHGTLGSGRSSDKGPSWSSRSLGARCRNSIASCPEEQPHVGNYR
::.:: : :.:....: . :.:: .. : .::: ::::::::::: .::::.::::
CCDS55 MSTRTPLPTVNERDTENHTSHGDGR--QEVTSRTSRS-GARCRNSIASCADEQPHIGNYR
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LLRTIGKGNFAKVKLARHILTGREVAIKIIDKTQLNPSSLQKLFREVRIMKGLNHPNIVK
::.::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::: ::::::::
CCDS55 LLKTIGKGNFAKVKLARHILTGREVAIKIIDKTQLNPTSLQKLFREVRIMKILNHPNIVK
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LFEVIETEKTLYLVMEYASAGEVFDYLVSHGRMKEKEARAKFRQIVSAVHYCHQKNIVHR
:::::::::::::.:::::.::::::::.::::::::::.:::::::::.::::: ::::
CCDS55 LFEVIETEKTLYLIMEYASGGEVFDYLVAHGRMKEKEARSKFRQIVSAVQYCHQKRIVHR
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KSD DLKAENLLLDAEANIKIADFGFSNEFTLGSKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDIW
:::::::::::. ::::::::::::::.:.::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS55 DLKAENLLLDADMNIKIADFGFSNEFTVGGKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDVW
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KSD SLGVILYTLVSGSLPFDGHNLKELRERVLRGKYRVPFYMSTDCESILRRFLVLNPAKRCT
::::::::::::::::::.:::::::::::::::.:::::::::..:.::::::: :: :
CCDS55 SLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKRFLVLNPIKRGT
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KSD LEQIMKDKWINIGYEGEELKPYTEPEEDFGDTKRIEVMVGMGYTREEIKESLTSQKYNEV
:::::::.::: :.: .::::..::: :..: :::..::::::..:::.:::...::.:.
CCDS55 LEQIMKDRWINAGHEEDELKPFVEPELDISDQKRIDIMVGMGYSQEEIQESLSKMKYDEI
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KSD TATYLLLGRKTEEGGDRGAPGLALARVRAPSDTTNGTSSSKGTSHSKGQRSSSSTYHRQR
::::::::::. : :: :: .:.:..: : : ::: ::. ..::
CCDS55 TATYLLLGRKSSE-------------VRPSSDLNNSTGQSP---HHKVQRSVSSS-QKQR
360 370 380 390 400
430 440 450 460 470
pF1KSD RHSDFCGPS-PAPL-HPKRSPTSTGEAELKEERLPGRKASCSTAGSGSRGLPPSSPMVSS
:.:: ::. :. . .:::: :::....:::. . .::.: :..:. .:. :.:::...
CCDS55 RYSDHAGPAIPSVVAYPKRSQTSTADSDLKEDGISSRKSSGSAVGG--KGIAPASPMLGN
410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KSD AHNPNKAEIPERRKDSTSTPNNLPPSMMTRRNTYVCTERPGAERPSLLPNGKENSSGTPR
: :::::.::::.:.:: .: . :::::::::.:: :.: :.. ::::::. .
CCDS55 ASNPNKADIPERKKSSTVPSSNTASGGMTRRNTYVCSERTTADRHSVIQNGKENSTIPDQ
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KSD VPPASPSSHSLAPP-SGERSRLARGSTIRSTFHGGQVRDRRAGGGGGGGVQNGPPASPTL
:.. :.::.. . .: :. ::.. :::::: : :.::.. . :::::::.:
CCDS55 RTPVA-STHSISSAATPDRIRFPRGTASRSTFHG-QPRERRTA------TYNGPPASPSL
520 530 540 550 560 570
600 610 620 630 640 650
pF1KSD AHEAAPLPAGRPRPTTNLFTKLTSKLTRRVTLDPSKRQNSNRCVSGASLPQGSKIRSQTN
.:::.:: : : .::::.:::::::: ... ..... :. .. :: .... ..
CCDS55 SHEATPLSQTRSRGSTNLFSKLTSKLTRSRNVS-AEQKDENKEAKPRSLRFTWSMKTTSS
580 590 600 610 620
660 670 680
pF1KSD LRESGDLRSQVAIYLGIKRKPPPGCSDSPGV
. . ::. ..
CCDS55 M-DPGDMMREIRKVLDANNCDYEQRERFLLFCVHGDGHAENLVQWEMEVCKLPRLSLNGV
630 640 650 660 670 680
>>CCDS53651.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 (709 aa)
initn: 2037 init1: 1850 opt: 2013 Z-score: 1088.1 bits: 211.8 E(32554): 2.8e-54
Smith-Waterman score: 2190; 60.8% identity (76.1% similar) in 635 aa overlap (2-626:3-590)
10 20 30 40 50
pF1KSD MSSRTVLAPGNDRNSDTHGTLGSGRSSDKGPSWSSRSLGARCRNSIASCPEEQPHVGNY
:.:: : :.:... . ::: :. :: :.: : ::: :. .::::.:::
CCDS53 MSSARTPLPTLNERDTE-QPTLG---HLDSKPS--SKSNMIRGRNS-ATSADEQPHIGNY
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD RLLRTIGKGNFAKVKLARHILTGREVAIKIIDKTQLNPSSLQKLFREVRIMKGLNHPNIV
:::.:::::::::::::::::::.:::.::::::::: :::::::::::::: :::::::
CCDS53 RLLKTIGKGNFAKVKLARHILTGKEVAVKIIDKTQLNSSSLQKLFREVRIMKVLNHPNIV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD KLFEVIETEKTLYLVMEYASAGEVFDYLVSHGRMKEKEARAKFRQIVSAVHYCHQKNIVH
::::::::::::::::::::.::::::::.::::::::::::::::::::.::::: :::
CCDS53 KLFEVIETEKTLYLVMEYASGGEVFDYLVAHGRMKEKEARAKFRQIVSAVQYCHQKFIVH
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD RDLKAENLLLDAEANIKIADFGFSNEFTLGSKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDI
::::::::::::. ::::::::::::::.:.::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS53 RDLKAENLLLDADMNIKIADFGFSNEFTFGNKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD WSLGVILYTLVSGSLPFDGHNLKELRERVLRGKYRVPFYMSTDCESILRRFLVLNPAKRC
:::::::::::::::::::.:::::::::::::::.:::::::::..:..::.:::.::
CCDS53 WSLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKKFLILNPSKRG
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD TLEQIMKDKWINIGYEGEELKPYTEPEEDFGDTKRIEVMVGMGYTREEIKESLTSQKYNE
::::::::.:.:.:.: .:::::.:: :. : .: :.::.::::::::..::..:.:::
CCDS53 TLEQIMKDRWMNVGHEDDELKPYVEPLPDYKDPRRTELMVSMGYTREEIQDSLVGQRYNE
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD VTATYLLLGRKTEE-GGDRGAPGLALARVRAPSDTTNGTSSSKGTSHSKGQRSSSSTYHR
: ::::::: :. : :: ..: . : .: :: ::. . :: : ::: :.. .
CCDS53 VMATYLLLGYKSSELEGDT----ITL-KPRPSADLTN--SSAPSPSH-KVQRSVSAN-PK
360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KSD QRRHSDFCGPSPAPLHPKRSPTSTGEAELK---EERLPGRKASCSTAGSGSRGLPPSSPM
::: :: ::. . . :....:: : :.: ::::: ::: :.::.
CCDS53 QRRFSDQAGPAIPTSNSYSKKTQSNNAENKRPEEDRESGRKAS-STAKV------PASPL
410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KSD VSSAHNPNKAEIPERRKDSTSTPNNLPPSMMTRRNTYVCTERPGAERPSL----LPNGKE
:. ::.: . . .: : : :. . : :: :: . :::.
CCDS53 ------PGL----ERKKTTPTPSTNSVLSTSTNRSR----NSPLLERASLGQASIQNGKD
460 470 480 490 500
540 550 560 570 580
pF1KSD NSSGTPRVPPASPSSHSLAPPSG--ERSRLARGSTIRSTFHGGQVRDRRAGGGGGGGVQN
:.. ::: ::::.:... .: .:. . :: . :::::.::.:. : . ::
CCDS53 -STAPQRVPVASPSAHNISSSGGAPDRTNFPRGVSSRSTFHAGQLRQVRDQQNLPYGVT-
510 520 530 540 550 560
590 600 610 620 630 640
pF1KSD GPPASPTLAHEAAPLPAGRPRPTTNLFTKLTSKLTRRVTLDPSKRQNSNRCVSGASLPQG
::::. .: :: . ..:.:.:::..::
CCDS53 --PASPS-GHSQ-----GRRGASGSIFSKFTSKFVRRPHVVGSGGNDKEKEEFREAKPRS
570 580 590 600 610
650 660 670 680
pF1KSD SKIRSQTNLRESGDLRSQVAIYLGIKRKPPPGCSDSPGV
CCDS53 LRFTWSMKTTSSMEPNEMMREIRKVLDANSCQSELHEKYMLLCMHGTPGHEDFVQWEMEV
620 630 640 650 660 670
688 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 07:32:05 2016 done: Thu Nov 3 07:32:06 2016
Total Scan time: 4.510 Total Display time: 0.210
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]