Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA1859
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1859, 741 aa
1>>>pF1KSDA1859 741 - 741 aa - 741 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.5235+/-0.00102; mu= 1.8661+/- 0.061
mean_var=231.7451+/-46.380, 0's: 0 Z-trim(112.0): 71 B-trim: 11 in 1/52
Lambda= 0.084250
statistics sampled from 12734 (12796) to 12734 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.708), E-opt: 0.2 (0.393), width: 16
Scan time: 4.440
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14338.1 MAGED4B gene_id:81557|Hs108|chrX ( 741) 4911 610.3 3.4e-174
CCDS35281.1 MAGED4B gene_id:81557|Hs108|chrX ( 739) 4894 608.2 1.4e-173
CCDS48116.1 MAGED4 gene_id:728239|Hs108|chrX ( 739) 4894 608.2 1.4e-173
CCDS65261.1 MAGED4 gene_id:728239|Hs108|chrX ( 757) 3643 456.2 8.7e-128
CCDS56602.1 MAGED4B gene_id:81557|Hs108|chrX ( 757) 3643 456.2 8.7e-128
CCDS14337.1 MAGED1 gene_id:9500|Hs108|chrX ( 778) 1493 194.9 4.1e-49
CCDS35279.1 MAGED1 gene_id:9500|Hs108|chrX ( 834) 1493 194.9 4.4e-49
CCDS43959.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX (1431) 1330 175.2 6.2e-43
CCDS59528.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX (1034) 1274 168.3 5.4e-41
CCDS43958.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX ( 706) 1114 148.8 2.8e-35
CCDS59529.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX ( 962) 1099 147.0 1.3e-34
CCDS14362.1 MAGED2 gene_id:10916|Hs108|chrX ( 606) 1073 143.7 7.9e-34
CCDS59527.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX ( 309) 1058 141.7 1.6e-33
CCDS10023.1 NSMCE3 gene_id:56160|Hs108|chr15 ( 304) 671 94.7 2.3e-19
CCDS73700.1 MAGEL2 gene_id:54551|Hs108|chr15 (1249) 658 93.5 2.2e-18
CCDS14433.1 MAGEE1 gene_id:57692|Hs108|chrX ( 957) 634 90.5 1.3e-17
CCDS3269.1 MAGEF1 gene_id:64110|Hs108|chr3 ( 307) 619 88.4 1.9e-17
CCDS35221.1 MAGEB10 gene_id:139422|Hs108|chrX ( 347) 592 85.1 2e-16
CCDS43927.1 MAGEB16 gene_id:139604|Hs108|chrX ( 324) 578 83.4 6.2e-16
CCDS59524.1 MAGEB17 gene_id:645864|Hs108|chrX ( 336) 577 83.3 6.9e-16
CCDS14216.1 MAGEB18 gene_id:286514|Hs108|chrX ( 343) 570 82.4 1.3e-15
CCDS14705.1 MAGEA10 gene_id:4109|Hs108|chrX ( 369) 570 82.5 1.3e-15
CCDS14220.1 MAGEB3 gene_id:4114|Hs108|chrX ( 346) 560 81.2 3e-15
CCDS14221.1 MAGEB4 gene_id:4115|Hs108|chrX ( 346) 559 81.1 3.2e-15
CCDS14219.1 MAGEB2 gene_id:4113|Hs108|chrX ( 319) 548 79.7 7.6e-15
CCDS10014.1 NDN gene_id:4692|Hs108|chr15 ( 321) 541 78.9 1.4e-14
CCDS35417.1 MAGEC1 gene_id:9947|Hs108|chrX (1142) 553 80.7 1.4e-14
CCDS14692.1 MAGEA8 gene_id:4107|Hs108|chrX ( 318) 540 78.8 1.5e-14
CCDS48180.1 MAGEA11 gene_id:4110|Hs108|chrX ( 429) 539 78.7 2.1e-14
CCDS14217.1 MAGEB6 gene_id:158809|Hs108|chrX ( 407) 537 78.5 2.3e-14
CCDS14222.1 MAGEB1 gene_id:4112|Hs108|chrX ( 347) 533 77.9 2.9e-14
CCDS14691.1 MAGEA9 gene_id:4108|Hs108|chrX ( 315) 511 75.2 1.7e-13
CCDS35423.1 MAGEA9B gene_id:728269|Hs108|chrX ( 315) 511 75.2 1.7e-13
CCDS76051.1 MAGEA1 gene_id:4100|Hs108|chrX ( 309) 491 72.8 9.1e-13
CCDS14702.1 MAGEA4 gene_id:4103|Hs108|chrX ( 317) 482 71.7 2e-12
CCDS14677.1 MAGEC3 gene_id:139081|Hs108|chrX ( 346) 479 71.4 2.7e-12
CCDS14678.1 MAGEC2 gene_id:51438|Hs108|chrX ( 373) 465 69.7 9.4e-12
CCDS14431.1 MAGEE2 gene_id:139599|Hs108|chrX ( 523) 451 68.1 4e-11
CCDS76045.1 MAGEA3 gene_id:4102|Hs108|chrX ( 314) 438 66.4 8e-11
>>CCDS14338.1 MAGED4B gene_id:81557|Hs108|chrX (741 aa)
initn: 4911 init1: 4911 opt: 4911 Z-score: 3240.7 bits: 610.3 E(32554): 3.4e-174
Smith-Waterman score: 4911; 100.0% identity (100.0% similar) in 741 aa overlap (1-741:1-741)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAEGSFSVQSESYSVEDMDEGSDEVGEEEMVEGNDYEEFGAFGGYGTLTSFDIHILRAFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MAEGSFSVQSESYSVEDMDEGSDEVGEEEMVEGNDYEEFGAFGGYGTLTSFDIHILRAFG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD SLGPGLRILSNEPWELENPVLAQTLVEALQLDPETLANETAARAANVARAAASNRAARAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SLGPGLRILSNEPWELENPVLAQTLVEALQLDPETLANETAARAANVARAAASNRAARAA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD AAAARTAFSQVVASHRVATPQVSGEDTQPTTYAAEAQGPTPEPPLASPQTSQMLVTSKMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 AAAARTAFSQVVASHRVATPQVSGEDTQPTTYAAEAQGPTPEPPLASPQTSQMLVTSKMA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD APEAPATSAQSQTGSPAQEAATEGPSSACAFSQAPCAREVDANRPSTAFLGQNDVFDFTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 APEAPATSAQSQTGSPAQEAATEGPSSACAFSQAPCAREVDANRPSTAFLGQNDVFDFTQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD PAGVSGMAFPRPKRPAPAQEAATEGPSAASGVPQTGPGREVAATRPKTTKSGKALAKTRW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PAGVSGMAFPRPKRPAPAQEAATEGPSAASGVPQTGPGREVAATRPKTTKSGKALAKTRW
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD VEPQNVVAAAAAKAKMATSIPEPEGAAAATAQHSAEPWARMGGKRTKKSKHLDDEYESSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VEPQNVVAAAAAKAKMATSIPEPEGAAAATAQHSAEPWARMGGKRTKKSKHLDDEYESSE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD EERETPAVPPTWRASQPSLTVRAQLAPRPPMAPRSQIPSRHVLCLPPRNVTLLQERANKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EERETPAVPPTWRASQPSLTVRAQLAPRPPMAPRSQIPSRHVLCLPPRNVTLLQERANKL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD VKYLMIKDYKKIPIKRADMLKDVIREYDEHFPEIIERATYTLEKKFGIHLKEIDKEEHLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VKYLMIKDYKKIPIKRADMLKDVIREYDEHFPEIIERATYTLEKKFGIHLKEIDKEEHLY
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD ILVCTRDSSARLLGKTKDTPRLSLLLVILGVIFMNGNRASEAVLWEALRKMGLRPGVRHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ILVCTRDSSARLLGKTKDTPRLSLLLVILGVIFMNGNRASEAVLWEALRKMGLRPGVRHP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD FLGDLRKLITDDFVKQKYLEYKKIPNSNPPEYEFLWGLRARHETSKMRVLRFIAQNQNRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 FLGDLRKLITDDFVKQKYLEYKKIPNSNPPEYEFLWGLRARHETSKMRVLRFIAQNQNRD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD PREWKAHFLEAVDDAFKTMDVDMAEEHARAQMRAQMNIGDEALIGRWSWDDIQVELLTWD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PREWKAHFLEAVDDAFKTMDVDMAEEHARAQMRAQMNIGDEALIGRWSWDDIQVELLTWD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD EDGDFGDAWARIPFAFWARYHQYILNSNRANRRATWRAGVSSGTNGGASTSVLDGPSTSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EDGDFGDAWARIPFAFWARYHQYILNSNRANRRATWRAGVSSGTNGGASTSVLDGPSTSS
670 680 690 700 710 720
730 740
pF1KSD TIRTRNAARAGASFFSWIQHR
:::::::::::::::::::::
CCDS14 TIRTRNAARAGASFFSWIQHR
730 740
>>CCDS35281.1 MAGED4B gene_id:81557|Hs108|chrX (739 aa)
initn: 4894 init1: 4894 opt: 4894 Z-score: 3229.6 bits: 608.2 E(32554): 1.4e-173
Smith-Waterman score: 4894; 100.0% identity (100.0% similar) in 739 aa overlap (1-739:1-739)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAEGSFSVQSESYSVEDMDEGSDEVGEEEMVEGNDYEEFGAFGGYGTLTSFDIHILRAFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MAEGSFSVQSESYSVEDMDEGSDEVGEEEMVEGNDYEEFGAFGGYGTLTSFDIHILRAFG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD SLGPGLRILSNEPWELENPVLAQTLVEALQLDPETLANETAARAANVARAAASNRAARAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 SLGPGLRILSNEPWELENPVLAQTLVEALQLDPETLANETAARAANVARAAASNRAARAA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD AAAARTAFSQVVASHRVATPQVSGEDTQPTTYAAEAQGPTPEPPLASPQTSQMLVTSKMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 AAAARTAFSQVVASHRVATPQVSGEDTQPTTYAAEAQGPTPEPPLASPQTSQMLVTSKMA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD APEAPATSAQSQTGSPAQEAATEGPSSACAFSQAPCAREVDANRPSTAFLGQNDVFDFTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 APEAPATSAQSQTGSPAQEAATEGPSSACAFSQAPCAREVDANRPSTAFLGQNDVFDFTQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD PAGVSGMAFPRPKRPAPAQEAATEGPSAASGVPQTGPGREVAATRPKTTKSGKALAKTRW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 PAGVSGMAFPRPKRPAPAQEAATEGPSAASGVPQTGPGREVAATRPKTTKSGKALAKTRW
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD VEPQNVVAAAAAKAKMATSIPEPEGAAAATAQHSAEPWARMGGKRTKKSKHLDDEYESSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 VEPQNVVAAAAAKAKMATSIPEPEGAAAATAQHSAEPWARMGGKRTKKSKHLDDEYESSE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD EERETPAVPPTWRASQPSLTVRAQLAPRPPMAPRSQIPSRHVLCLPPRNVTLLQERANKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 EERETPAVPPTWRASQPSLTVRAQLAPRPPMAPRSQIPSRHVLCLPPRNVTLLQERANKL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD VKYLMIKDYKKIPIKRADMLKDVIREYDEHFPEIIERATYTLEKKFGIHLKEIDKEEHLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 VKYLMIKDYKKIPIKRADMLKDVIREYDEHFPEIIERATYTLEKKFGIHLKEIDKEEHLY
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD ILVCTRDSSARLLGKTKDTPRLSLLLVILGVIFMNGNRASEAVLWEALRKMGLRPGVRHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 ILVCTRDSSARLLGKTKDTPRLSLLLVILGVIFMNGNRASEAVLWEALRKMGLRPGVRHP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD FLGDLRKLITDDFVKQKYLEYKKIPNSNPPEYEFLWGLRARHETSKMRVLRFIAQNQNRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 FLGDLRKLITDDFVKQKYLEYKKIPNSNPPEYEFLWGLRARHETSKMRVLRFIAQNQNRD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD PREWKAHFLEAVDDAFKTMDVDMAEEHARAQMRAQMNIGDEALIGRWSWDDIQVELLTWD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 PREWKAHFLEAVDDAFKTMDVDMAEEHARAQMRAQMNIGDEALIGRWSWDDIQVELLTWD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD EDGDFGDAWARIPFAFWARYHQYILNSNRANRRATWRAGVSSGTNGGASTSVLDGPSTSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 EDGDFGDAWARIPFAFWARYHQYILNSNRANRRATWRAGVSSGTNGGASTSVLDGPSTSS
670 680 690 700 710 720
730 740
pF1KSD TIRTRNAARAGASFFSWIQHR
:::::::::::::::::::
CCDS35 TIRTRNAARAGASFFSWIQ
730
>>CCDS48116.1 MAGED4 gene_id:728239|Hs108|chrX (739 aa)
initn: 4894 init1: 4894 opt: 4894 Z-score: 3229.6 bits: 608.2 E(32554): 1.4e-173
Smith-Waterman score: 4894; 100.0% identity (100.0% similar) in 739 aa overlap (1-739:1-739)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAEGSFSVQSESYSVEDMDEGSDEVGEEEMVEGNDYEEFGAFGGYGTLTSFDIHILRAFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 MAEGSFSVQSESYSVEDMDEGSDEVGEEEMVEGNDYEEFGAFGGYGTLTSFDIHILRAFG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD SLGPGLRILSNEPWELENPVLAQTLVEALQLDPETLANETAARAANVARAAASNRAARAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 SLGPGLRILSNEPWELENPVLAQTLVEALQLDPETLANETAARAANVARAAASNRAARAA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD AAAARTAFSQVVASHRVATPQVSGEDTQPTTYAAEAQGPTPEPPLASPQTSQMLVTSKMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 AAAARTAFSQVVASHRVATPQVSGEDTQPTTYAAEAQGPTPEPPLASPQTSQMLVTSKMA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD APEAPATSAQSQTGSPAQEAATEGPSSACAFSQAPCAREVDANRPSTAFLGQNDVFDFTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 APEAPATSAQSQTGSPAQEAATEGPSSACAFSQAPCAREVDANRPSTAFLGQNDVFDFTQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD PAGVSGMAFPRPKRPAPAQEAATEGPSAASGVPQTGPGREVAATRPKTTKSGKALAKTRW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 PAGVSGMAFPRPKRPAPAQEAATEGPSAASGVPQTGPGREVAATRPKTTKSGKALAKTRW
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD VEPQNVVAAAAAKAKMATSIPEPEGAAAATAQHSAEPWARMGGKRTKKSKHLDDEYESSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 VEPQNVVAAAAAKAKMATSIPEPEGAAAATAQHSAEPWARMGGKRTKKSKHLDDEYESSE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD EERETPAVPPTWRASQPSLTVRAQLAPRPPMAPRSQIPSRHVLCLPPRNVTLLQERANKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 EERETPAVPPTWRASQPSLTVRAQLAPRPPMAPRSQIPSRHVLCLPPRNVTLLQERANKL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD VKYLMIKDYKKIPIKRADMLKDVIREYDEHFPEIIERATYTLEKKFGIHLKEIDKEEHLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 VKYLMIKDYKKIPIKRADMLKDVIREYDEHFPEIIERATYTLEKKFGIHLKEIDKEEHLY
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD ILVCTRDSSARLLGKTKDTPRLSLLLVILGVIFMNGNRASEAVLWEALRKMGLRPGVRHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 ILVCTRDSSARLLGKTKDTPRLSLLLVILGVIFMNGNRASEAVLWEALRKMGLRPGVRHP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD FLGDLRKLITDDFVKQKYLEYKKIPNSNPPEYEFLWGLRARHETSKMRVLRFIAQNQNRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 FLGDLRKLITDDFVKQKYLEYKKIPNSNPPEYEFLWGLRARHETSKMRVLRFIAQNQNRD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD PREWKAHFLEAVDDAFKTMDVDMAEEHARAQMRAQMNIGDEALIGRWSWDDIQVELLTWD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 PREWKAHFLEAVDDAFKTMDVDMAEEHARAQMRAQMNIGDEALIGRWSWDDIQVELLTWD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD EDGDFGDAWARIPFAFWARYHQYILNSNRANRRATWRAGVSSGTNGGASTSVLDGPSTSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 EDGDFGDAWARIPFAFWARYHQYILNSNRANRRATWRAGVSSGTNGGASTSVLDGPSTSS
670 680 690 700 710 720
730 740
pF1KSD TIRTRNAARAGASFFSWIQHR
:::::::::::::::::::
CCDS48 TIRTRNAARAGASFFSWIQ
730
>>CCDS65261.1 MAGED4 gene_id:728239|Hs108|chrX (757 aa)
initn: 3634 init1: 3634 opt: 3643 Z-score: 2407.6 bits: 456.2 E(32554): 8.7e-128
Smith-Waterman score: 4869; 97.9% identity (97.9% similar) in 757 aa overlap (1-741:1-757)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAEGSFSVQSESYSVEDMDEGSDEVGEEEMVEGNDYEEFGAFGGYGTLTSFDIHILRAFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 MAEGSFSVQSESYSVEDMDEGSDEVGEEEMVEGNDYEEFGAFGGYGTLTSFDIHILRAFG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 SLGPGLRILSNEPWELENPVLAQTLVEALQLDPETLANETAARAANVARAAASNRAARAA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 AAAARTAFSQVVASHRVATPQVSGEDTQPTTYAAEAQGPTPEPPLASPQTSQMLVTSKMA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 APEAPATSAQSQTGSPAQEAATEGPSSACAFSQAPCAREVDANRPSTAFLGQNDVFDFTQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 PAGVSGMAFPRPKRPAPAQEAATEGPSAASGVPQTGPGREVAATRPKTTKSGKALAKTRW
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 VEPQNVVAAAAAKAKMATSIPEPEGAAAATAQHSAEPWARMGGKRTKKSKHLDDEYESSE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 EERETPAVPPTWRASQPSLTVRAQLAPRPPMAPRSQIPSRHVLCLPPRNVTLLQERANKL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 VKYLMIKDYKKIPIKRADMLKDVIREYDEHFPEIIERATYTLEKKFGIHLKEIDKEEHLY
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 ILVCTRDSSARLLGKTKDTPRLSLLLVILGVIFMNGNRASEAVLWEALRKMGLRPGVRHP
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::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 FLGDLRKLITDDFVKQKNPELREETPLSMAPSWYLEYKKIPNSNPPEYEFLWGLRARHET
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 GRWSWDDIQVELLTWDEDGDFGDAWARIPFAFWARYHQYILNSNRANRRATWRAGVSSGT
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CCDS65 NGGASTSVLDGPSTSSTIRTRNAARAGASFFSWIQHR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 SLGPGLRILSNEPWELENPVLAQTLVEALQLDPETLANETAARAANVARAAASNRAARAA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 AAAARTAFSQVVASHRVATPQVSGEDTQPTTYAAEAQGPTPEPPLASPQTSQMLVTSKMA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 APEAPATSAQSQTGSPAQEAATEGPSSACAFSQAPCAREVDANRPSTAFLGQNDVFDFTQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 PAGVSGMAFPRPKRPAPAQEAATEGPSAASGVPQTGPGREVAATRPKTTKSGKALAKTRW
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 VKYLMIKDYKKIPIKRADMLKDVIREYDEHFPEIIERATYTLEKKFGIHLKEIDKEEHLY
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 SKMRVLRFIAQNQNRDPREWKAHFLEAVDDAFKTMDVDMAEEHARAQMRAQMNIGDEALI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 GRWSWDDIQVELLTWDEDGDFGDAWARIPFAFWARYHQYILNSNRANRRATWRAGVSSGT
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CCDS56 NGGASTSVLDGPSTSSTIRTRNAARAGASFFSWIQHR
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130 140 150 160 170 180
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::: . .. .:. :.. . . :: : :. : . :. ::: . . . :
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...:: : :: :: :. : .: . . .. : : : .: ..
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240 250 260 270 280
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: .: :. .. . : . :. : ..: . : : .. : :: :. . ::
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290 300 310 320 330 340
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: . . .. .. . :. .: . . . .: : . . .. : .
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350 360 370 380 390 400
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. : .. . . : .:: : :. : .: : : . : .. :.
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410 420 430 440 450 460
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. ::.:.::::::::::::::.::: :.::::..::.:.:::: . .::::::: .
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470 480 490 500 510 520
pF1KSD TLEKKFGIHLKEIDKEEHLYILVCTRDSSARLLGKTKDTPRLSLLLVILGVIFMNGNRAS
.:::::::.:::::::::::::. : .: : .:: :::::.:.:::::::::::::::::
CCDS14 VLEKKFGIQLKEIDKEEHLYILISTPESLAGILGTTKDTPKLGLLLVILGVIFMNGNRAS
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530 540 550 560 570 580
pF1KSD EAVLWEALRKMGLRPGVRHPFLGDLRKLITDDFVKQKYLEYKKIPNSNPPEYEFLWGLRA
::::::::::::::::::::.:::::::.: .:::::::.:...:::::::::::::::.
CCDS14 EAVLWEALRKMGLRPGVRHPLLGDLRKLLTYEFVKQKYLDYRRVPNSNPPEYEFLWGLRS
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590 600 610 620 630 640
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::::::.::::::. :.::::.: :.:.::.:.:. ..:. :: .:::. :..:.:::
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650 660 670 680 690 700
pF1KSD EALIGRWSWDDIQVELLTWDEDGDFGDAWARIPFAFWARYHQYILNSNRANRRATWRAGV
::. : ::::::. :::::::.::::: :.::::.::::::: : .: ::
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710 720 730 740
pF1KSD SSGTNGGASTSVLDGPSTSSTIRTRNAARAGASFFSWIQHR
: .: ::..
CCDS14 IIGPGGTASANFAANFGAIGFFWVE
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: :. ::: .. : .. :. .. :
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pF1KSD TAFSQVVASHRVAT--PQVSGEDTQPTTYAAEAQGPTPEPPLASPQTSQMLVTSKMAAPE
::: . .. .:. :.. . . :: : :. : . :. ::: . . . :
CCDS35 YNFSQSLNANDLANSRPKTPFKAWNDTTKAPTADTQTQNVNQAKMATSQADIETDPGISE
220 230 240 250 260 270
190 200 210 220 230
pF1KSD APATSAQ-SQTGSPAQ--EAAT--EGPSSACAFS-QAPCAREVDANR-PSTAFLGQNDVF
...:: : :: :: :. : .: . . .. : : : .: ..
CCDS35 PDGATAQTSADGSQAQNLESRTIIRGKRTRKINNLNVEENSSGDQRRAPLAAGTWRSAPV
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pF1KSD DFT--QPAGVS-GMAFPRP---KRPAPAQ-EAATEGPSAASGVP--QTGPGRE--VAATR
: .: :. .. . : . :. : ..: . : : .. : :: :. . ::
CCDS35 PVTTQNPPGAPPNVLWQTPLAWQNPSGWQNQTARQTPPARQSPPARQTPPAWQNPVAWQN
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290 300 310 320 330 340
pF1KSD PKTTKSGKALAKTRWVEPQNVVAAAAAKAKMATSIPEPEGAAAATAQHSAEPWARMGGKR
: . . .. .. . :. .: . . . .: : . . .. : .
CCDS35 P-VIWPNPVIWQNPVIWPNPIVWPGPVVWPNPLAWQNPPGWQTPPGWQTPPGWQGPPDWQ
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350 360 370 380 390 400
pF1KSD TKKSKHLDDEYESSEE---ERETPAVPPTW-RASQPSLTVRAQLAPRPPMAPR-SQIPSR
. : .. . . : .:: : :. : .: : : . : .. :.
CCDS35 GPPDWPLPPDWPLPPDWPLPTDWP-LPPDWIPADWPIPPDWQNLRPSPNLRPSPNSRASQ
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pF1KSD HVLCLPPRNVTLLQERANKLVKYLMIKDYKKIPIKRADMLKDVIREYDEHFPEIIERATY
. ::.:.::::::::::::::.::: :.::::..::.:.:::: . .::::::: .
CCDS35 NPGAAQPRDVALLQERANKLVKYLMLKDYTKVPIKRSEMLRDIIREYTDVYPEIIERACF
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pF1KSD TLEKKFGIHLKEIDKEEHLYILVCTRDSSARLLGKTKDTPRLSLLLVILGVIFMNGNRAS
.:::::::.:::::::::::::. : .: : .:: :::::.:.:::::::::::::::::
CCDS35 VLEKKFGIQLKEIDKEEHLYILISTPESLAGILGTTKDTPKLGLLLVILGVIFMNGNRAS
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pF1KSD EAVLWEALRKMGLRPGVRHPFLGDLRKLITDDFVKQKYLEYKKIPNSNPPEYEFLWGLRA
::::::::::::::::::::.:::::::.: .:::::::.:...:::::::::::::::.
CCDS35 EAVLWEALRKMGLRPGVRHPLLGDLRKLLTYEFVKQKYLDYRRVPNSNPPEYEFLWGLRS
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pF1KSD RHETSKMRVLRFIAQNQNRDPREWKAHFLEAVDDAFKTMDVDMAEEHARAQMRAQMNIGD
::::::.::::::. :.::::.: :.:.::.:.:. ..:. :: .:::. :..:.:::
CCDS35 YHETSKMKVLRFIAEVQKRDPRDWTAQFMEAADEALDALDAAAAEAEARAEARTRMGIGD
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650 660 670 680 690 700
pF1KSD EALIGRWSWDDIQVELLTWDEDGDFGDAWARIPFAFWARYHQYILNSNRANRRATWRAGV
::. : ::::::. :::::::.::::: :.::::.::::::: : .: ::
CCDS35 EAVSGPWSWDDIEFELLTWDEEGDFGDPWSRIPFTFWARYHQ-----NARSRFPQTFAGP
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pF1KSD SSGTNGGASTSVLDGPSTSSTIRTRNAARAGASFFSWIQHR
: .: ::..
CCDS35 IIGPGGTASANFAANFGAIGFFWVE
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40 50 60 70 80 90
pF1KSD EFGAFGGYGTLTSFDIHILRAFGSLGPGLRILSNEP---WELEN-PVLAQTLVEALQLDP
: .:.: :. : ::..: . .:: :
CCDS43 RPKKSKTKKAPIKTITKAAPAAPPVPAANEIATNKPKITWQALNLPVITQ-ISQAL---P
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KSD ETLANETAARAANVARAAASNRAARAAAAAARTAFSQVVASHRVATPQVSGEDTQPTTYA
: ...: : ... :. .:. :..: ::. :: ..:. .: :... :
CCDS43 TTEVTNTQASSVT-AQPKKANKMKRVTAKAAQG--SQSPTGHEGGTIQLKSP-LQVLKLP
130 140 150 160 170
160 170 180 190 200
pF1KSD AEAQGPTPEPPLASPQ-TSQMLVTS---------KMAAPEAPATSAQ-SQTGSPAQEAAT
. .:. . :.:. . .:: :.:: : :: .: :.... : ... .. :.:
CCDS43 VISQN--IHAPIANESASSQALITSIKPKKASKAKKAANKAIASATEVSLAATATHTATT
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240
pF1KSD EGP---SSACAFSQAPCAREVDAN--RPSTAFLGQNDV-----FDFTQPAGV---SGMAF
.: .: . : : :. : . : . ..:. .. :. : ....
CCDS43 QGQITNETASIHTTAASIRTKKASKARKTIAKVINTDTEHIEALNVTDAATRQIEASVVA
240 250 260 270 280 290
250 260 270 280 290 300
pF1KSD PRPKRPAPAQEAATEGPSAASGV---P---QTGPGREVAAT-RPKT-TKSGKALAKTRWV
:::. . ...::..::...: . : : .. .::: : : ... :: .:.: .
CCDS43 IRPKK-SKGKKAASRGPNSVSEISEAPLATQIVTNQALAATLRVKRGSRARKAATKARAT
300 310 320 330 340 350
310 320 330 340
pF1KSD EPQNVVAAAAAKAKMAT-----SIPEPEGAAAATA-------QHSAEPWARMGGKRTKKS
: :. : .:.::.:. : : . :::. : : : :: .: :::..::
CCDS43 ESQTPNADQGAQAKIASAQTNVSALETQVAAAVQALADDYLAQLSLEPTTRTRGKRNRKS
360 370 380 390 400 410
350 360 370 380 390 400
pF1KSD KHLDDEYESSEEERETPAVPPTWRASQPSLTVRAQLAPRPPMAPRSQIPSRHVLCLPPRN
:::. . .:. . :. : : . :: :::.
CCDS43 KHLNGDERSGSNYRRIP-----W-------------GRRPA---------------PPRD
420 430 440
410 420 430 440 450 460
pF1KSD VTLLQERANKLVKYLMIKDYKKIPIKRADMLKDVIREYDEHFPEIIERATYTLEKKFGIH
:..::::::::::::..:: ::::::.:::.:::.::::.::::::::.::::: : ..
CCDS43 VAILQERANKLVKYLLVKDQTKIPIKRSDMLRDVIQEYDEYFPEIIERASYTLEKMFRVN
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470 480 490 500 510 520
pF1KSD LKEIDKEEHLYILVCTRDSSARLLGKTKDTPRLSLLLVILGVIFMNGNRASEAVLWEALR
::::::. ::::. :..::: .:: :::::.:.::.:::.:::::::.:::::.::.::
CCDS43 LKEIDKQSSLYILISTQESSAGILGTTKDTPKLGLLMVILSVIFMNGNKASEAVIWEVLR
510 520 530 540 550 560
530 540 550 560 570 580
pF1KSD KMGLRPGVRHPFLGDLRKLITDDFVKQKYLEYKKIPNSNPPEYEFLWGLRARHETSKMRV
:.:::::::: ..:..::::::.::::::::::..::: ::::::.::::. ::::::.:
CCDS43 KLGLRPGVRHSLFGEVRKLITDEFVKQKYLEYKRVPNSRPPEYEFFWGLRSYHETSKMKV
570 580 590 600 610 620
590 600 610 620 630 640
pF1KSD LRFIAQNQNRDPREWKAHFLEAVDDAFKTMDVDMAEEHARAQMRAQMNIGDEALIGRWSW
:.: . :..::..: ... :::. .. : .:: .:::. ::::.::.::. : :.:
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650 660 670 680 690 700
pF1KSD DDIQVELLTWDEDGDFGDAWARIPFAFWARYHQYILNSNRAN--RRATWRAGVSSGT---
::.... :: .: :: ..::.:. : . :: .. :. .: : :. ::: :.:.
CCDS43 DDMDIDCLTREELGDDAQAWSRFSFEIEARAQENADASTNVNFSRGASTRAGFSDGASIS
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710 720 730 740
pF1KSD -NGGASTSVLDGPSTSSTIRTRNAARAGASFFSWIQHR
::. :.: : : . : : ..:::
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CCDS43 HSTSTSFSSEASISFGGMPCTSASFSGGVSSSFSGPLSTSATFSGGASSGFGGTLSTTAG
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pF1KSD RADMLKDVIREYDEHFPEIIERATYTLEKKFGIHLKEIDKEEHLYILVCTRDSSARLLGK
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:::::.:.::.:::.:::::::.:::::.::.:::.:::::::: ..:..::::::.:::
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. :: .. :. .: : :. ::: :.:. ::. :.: : : . : :
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pF1KSD AGASFFSWIQHR
..:::
CCDS59 TSASFSNTASISFGGTLSTSSSFSSAASISFGCAHSTSTSFSSEASISFGGMPCTSASFS
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>>CCDS43958.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX (706 aa)
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CCDS43 RPKKSKTKKAPIKTITKAAPAAPPVPAANEIATNKPKITWQALNLPVITQ-ISQAL---P
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CCDS43 TTEVTNTQASSVT-AQPKKANKMKRVTAKAAQG--SQSPTGHEGGTIQLKSP-LQVLKLP
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160 170 180 190 200
pF1KSD AEAQGPTPEPPLASPQ-TSQMLVTS---------KMAAPEAPATSAQ-SQTGSPAQEAAT
. .:. . :.:. . .:: :.:: : :: .: :.... : ... .. :.:
CCDS43 VISQN--IHAPIANESASSQALITSIKPKKASKAKKAANKAIASATEVSLAATATHTATT
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240
pF1KSD EGP---SSACAFSQAPCAREVDAN--RPSTAFLGQNDV-----FDFTQPAGV---SGMAF
.: .: . : : :. : . : . ..:. .. :. : ....
CCDS43 QGQITNETASIHTTAASIRTKKASKARKTIAKVINTDTEHIEALNVTDAATRQIEASVVA
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250 260 270 280 290 300
pF1KSD PRPKRPAPAQEAATEGPSAASGV---P---QTGPGREVAAT-RPKT-TKSGKALAKTRWV
:::. . ...::..::...: . : : .. .::: : : ... :: .:.: .
CCDS43 IRPKK-SKGKKAASRGPNSVSEISEAPLATQIVTNQALAATLRVKRGSRARKAATKARAT
300 310 320 330 340 350
310 320 330 340
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CCDS43 ESQTPNADQGAQAKIASAQTNVSALETQVAAAVQALADDYLAQLSLEPTTRTRGKRNRKS
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:::. . .:. . :. : : . :: :::.
CCDS43 KHLNGDERSGSNYRRIP-----W-------------GRRPA---------------PPRD
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CCDS43 VAILQERANKLVKYLLVKDQTKIPIKRSDMLRDVIQEYDEYFPEIIERASYTLEKMFRVN
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]