Result of FASTA (omim) for
pF1KSDA1852
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1852, 792 aa
1>>>pF1KSDA1852 792 - 792 aa - 792 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9310+/-0.000981; mu= 14.5830+/- 0.060
mean_var=341.2151+/-67.482, 0's: 0 Z-trim(110.0): 2107 B-trim: 107 in 1/49
Lambda= 0.069432
statistics sampled from 15943 (18287) to 15943 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.521), E-opt: 0.2 (0.214), width: 16
Scan time: 9.170
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_079303 (OMIM: 613905) zinc finger protein 606 [ ( 792) 5674 584.6 5.7e-166
XP_005259333 (OMIM: 613905) PREDICTED: zinc finger ( 792) 5674 584.6 5.7e-166
NP_008886 (OMIM: 194522) zinc finger protein 33B i ( 778) 2138 230.4 2.4e-59
NP_001291962 (OMIM: 194522) zinc finger protein 33 ( 785) 2138 230.4 2.4e-59
NP_001265099 (OMIM: 194521) zinc finger protein 33 ( 817) 2101 226.7 3.2e-58
NP_001311107 (OMIM: 194521) zinc finger protein 33 ( 818) 2098 226.4 3.9e-58
XP_016872106 (OMIM: 194521) PREDICTED: zinc finger ( 818) 2098 226.4 3.9e-58
XP_011517953 (OMIM: 194521) PREDICTED: zinc finger ( 810) 2090 225.6 6.7e-58
NP_008905 (OMIM: 194521) zinc finger protein 33A i ( 810) 2090 225.6 6.7e-58
NP_008885 (OMIM: 194521) zinc finger protein 33A i ( 811) 2087 225.3 8.3e-58
XP_011517952 (OMIM: 194521) PREDICTED: zinc finger ( 811) 2087 225.3 8.3e-58
NP_001265102 (OMIM: 194521) zinc finger protein 33 ( 829) 2087 225.3 8.4e-58
NP_001265106 (OMIM: 194521) zinc finger protein 33 ( 832) 2087 225.3 8.4e-58
XP_016881867 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 650) 2038 220.2 2.2e-56
XP_011524841 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 686) 2038 220.3 2.3e-56
NP_689697 (OMIM: 613904) zinc finger protein 569 i ( 686) 2038 220.3 2.3e-56
XP_016881866 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 686) 2038 220.3 2.3e-56
XP_016881865 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 686) 2038 220.3 2.3e-56
XP_006723109 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 710) 2038 220.3 2.3e-56
XP_006723111 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 710) 2038 220.3 2.3e-56
XP_011524840 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 710) 2038 220.3 2.3e-56
XP_006723110 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 710) 2038 220.3 2.3e-56
XP_016881868 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 527) 1981 214.3 1.1e-54
XP_016881869 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 527) 1981 214.3 1.1e-54
NP_001317411 (OMIM: 613904) zinc finger protein 56 ( 527) 1981 214.3 1.1e-54
XP_016881871 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 527) 1981 214.3 1.1e-54
NP_001243580 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 744) 1980 214.5 1.3e-54
NP_001243583 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 744) 1980 214.5 1.3e-54
XP_016882699 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1980 214.6 1.4e-54
XP_016882696 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1980 214.6 1.4e-54
NP_001243577 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 1980 214.6 1.4e-54
XP_016882698 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1980 214.6 1.4e-54
XP_016882700 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1980 214.6 1.4e-54
XP_016882703 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1980 214.6 1.4e-54
XP_011526561 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1980 214.6 1.4e-54
XP_016882701 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1980 214.6 1.4e-54
XP_016882705 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1980 214.6 1.4e-54
XP_016882702 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1980 214.6 1.4e-54
NP_001243579 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 1980 214.6 1.4e-54
NP_001243578 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 1980 214.6 1.4e-54
XP_011526559 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1980 214.6 1.4e-54
XP_016882697 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1980 214.6 1.4e-54
XP_016882704 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1980 214.6 1.4e-54
NP_003414 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 is ( 809) 1980 214.6 1.4e-54
NP_001243582 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 818) 1980 214.6 1.4e-54
NP_001159354 (OMIM: 604753) zinc finger protein 26 ( 864) 1944 211.0 1.8e-53
NP_003406 (OMIM: 604753) zinc finger protein 268 i ( 947) 1944 211.1 1.8e-53
NP_001159353 (OMIM: 604753) zinc finger protein 26 ( 947) 1944 211.1 1.8e-53
NP_001305822 (OMIM: 602277) zinc finger protein 18 ( 675) 1937 210.1 2.5e-53
XP_011513163 (OMIM: 602277) PREDICTED: zinc finger ( 675) 1937 210.1 2.5e-53
>>NP_079303 (OMIM: 613905) zinc finger protein 606 [Homo (792 aa)
initn: 5674 init1: 5674 opt: 5674 Z-score: 3100.7 bits: 584.6 E(85289): 5.7e-166
Smith-Waterman score: 5674; 100.0% identity (100.0% similar) in 792 aa overlap (1-792:1-792)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAAINPWASWGALTDQSWGMTAVDPWASWALCPQYPAWHVEGSLEEGRRATGLPAAQVQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 MAAINPWASWGALTDQSWGMTAVDPWASWALCPQYPAWHVEGSLEEGRRATGLPAAQVQE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD PVTFKDVAVDFTQEEWGQLDLVQRTLYRDVMLETYGHLLSVGNQIAKPEVISLLEQGEEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 PVTFKDVAVDFTQEEWGQLDLVQRTLYRDVMLETYGHLLSVGNQIAKPEVISLLEQGEEP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD WSVEQACPQRTCPEWVRNLESKALIPAQSIFEEEQSHGMKLERYIWDDPWFSRLEVLGCK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 WSVEQACPQRTCPEWVRNLESKALIPAQSIFEEEQSHGMKLERYIWDDPWFSRLEVLGCK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD DQLEMYHMNQSTAMRQMVFMQKQVLSQRSSEFCGLGAEFSQNLNFVPSQRVSQIEHFYKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 DQLEMYHMNQSTAMRQMVFMQKQVLSQRSSEFCGLGAEFSQNLNFVPSQRVSQIEHFYKP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD DTHAQSWRCDSAIMYADKVTCENNDYDKTVYQSIQPIYPARIQTGDNLFKCTDAVKSFNH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 DTHAQSWRCDSAIMYADKVTCENNDYDKTVYQSIQPIYPARIQTGDNLFKCTDAVKSFNH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD IIHFGDHKGIHTGEKLYEYKECHQIFNQSPSFNEHPRLHVGENQYNYKEYENIFYFSSFM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 IIHFGDHKGIHTGEKLYEYKECHQIFNQSPSFNEHPRLHVGENQYNYKEYENIFYFSSFM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD EHQKIGTVEKAYKYNEWEKVFGYDSFLTQHTSTYTAEKPYDYNECGTSFIWSSYLIQHKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 EHQKIGTVEKAYKYNEWEKVFGYDSFLTQHTSTYTAEKPYDYNECGTSFIWSSYLIQHKK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD THTGEKPYECDKCGKVFRNRSALTKHERTHTGIKPYECNKCGKAFSWNSHLIVHKRIHTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 THTGEKPYECDKCGKVFRNRSALTKHERTHTGIKPYECNKCGKAFSWNSHLIVHKRIHTG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD EKPYVCNECGKSFNWNSHLIGHQRTHTGEKPFECTECGKSFSWSSHLIAHMRMHTGEKPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 EKPYVCNECGKSFNWNSHLIGHQRTHTGEKPFECTECGKSFSWSSHLIAHMRMHTGEKPF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD KCDECEKAFRDYSALSKHERTHSGAKPYKCTECGKSFSWSSHLIAHQRTHTGEKPYNCQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 KCDECEKAFRDYSALSKHERTHSGAKPYKCTECGKSFSWSSHLIAHQRTHTGEKPYNCQE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD CGKAFRERSALTKHEIIHSGIKPYECNKCGKSCSQMAHLVRHQRTHTGEKPYECNKCGKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 CGKAFRERSALTKHEIIHSGIKPYECNKCGKSCSQMAHLVRHQRTHTGEKPYECNKCGKS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD FSQSCHLVAHRRIHTGEKPYKCNQCERSFNCSSHLIAHRRTHTGEKPYRCNECGKAFNES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 FSQSCHLVAHRRIHTGEKPYKCNQCERSFNCSSHLIAHRRTHTGEKPYRCNECGKAFNES
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD SSLIVHLRNHTGEKPYKCNHCEKAFCKNSSLIIHQRMHSGEKRFICSECGKAFSGHSALL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 SSLIVHLRNHTGEKPYKCNHCEKAFCKNSSLIIHQRMHSGEKRFICSECGKAFSGHSALL
730 740 750 760 770 780
790
pF1KSD QHQRNHSEEKLN
::::::::::::
NP_079 QHQRNHSEEKLN
790
>>XP_005259333 (OMIM: 613905) PREDICTED: zinc finger pro (792 aa)
initn: 5674 init1: 5674 opt: 5674 Z-score: 3100.7 bits: 584.6 E(85289): 5.7e-166
Smith-Waterman score: 5674; 100.0% identity (100.0% similar) in 792 aa overlap (1-792:1-792)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAAINPWASWGALTDQSWGMTAVDPWASWALCPQYPAWHVEGSLEEGRRATGLPAAQVQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MAAINPWASWGALTDQSWGMTAVDPWASWALCPQYPAWHVEGSLEEGRRATGLPAAQVQE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD PVTFKDVAVDFTQEEWGQLDLVQRTLYRDVMLETYGHLLSVGNQIAKPEVISLLEQGEEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PVTFKDVAVDFTQEEWGQLDLVQRTLYRDVMLETYGHLLSVGNQIAKPEVISLLEQGEEP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD WSVEQACPQRTCPEWVRNLESKALIPAQSIFEEEQSHGMKLERYIWDDPWFSRLEVLGCK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 WSVEQACPQRTCPEWVRNLESKALIPAQSIFEEEQSHGMKLERYIWDDPWFSRLEVLGCK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD DQLEMYHMNQSTAMRQMVFMQKQVLSQRSSEFCGLGAEFSQNLNFVPSQRVSQIEHFYKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DQLEMYHMNQSTAMRQMVFMQKQVLSQRSSEFCGLGAEFSQNLNFVPSQRVSQIEHFYKP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD DTHAQSWRCDSAIMYADKVTCENNDYDKTVYQSIQPIYPARIQTGDNLFKCTDAVKSFNH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DTHAQSWRCDSAIMYADKVTCENNDYDKTVYQSIQPIYPARIQTGDNLFKCTDAVKSFNH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD IIHFGDHKGIHTGEKLYEYKECHQIFNQSPSFNEHPRLHVGENQYNYKEYENIFYFSSFM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 IIHFGDHKGIHTGEKLYEYKECHQIFNQSPSFNEHPRLHVGENQYNYKEYENIFYFSSFM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD EHQKIGTVEKAYKYNEWEKVFGYDSFLTQHTSTYTAEKPYDYNECGTSFIWSSYLIQHKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EHQKIGTVEKAYKYNEWEKVFGYDSFLTQHTSTYTAEKPYDYNECGTSFIWSSYLIQHKK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD THTGEKPYECDKCGKVFRNRSALTKHERTHTGIKPYECNKCGKAFSWNSHLIVHKRIHTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 THTGEKPYECDKCGKVFRNRSALTKHERTHTGIKPYECNKCGKAFSWNSHLIVHKRIHTG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD EKPYVCNECGKSFNWNSHLIGHQRTHTGEKPFECTECGKSFSWSSHLIAHMRMHTGEKPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EKPYVCNECGKSFNWNSHLIGHQRTHTGEKPFECTECGKSFSWSSHLIAHMRMHTGEKPF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD KCDECEKAFRDYSALSKHERTHSGAKPYKCTECGKSFSWSSHLIAHQRTHTGEKPYNCQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KCDECEKAFRDYSALSKHERTHSGAKPYKCTECGKSFSWSSHLIAHQRTHTGEKPYNCQE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD CGKAFRERSALTKHEIIHSGIKPYECNKCGKSCSQMAHLVRHQRTHTGEKPYECNKCGKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 CGKAFRERSALTKHEIIHSGIKPYECNKCGKSCSQMAHLVRHQRTHTGEKPYECNKCGKS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD FSQSCHLVAHRRIHTGEKPYKCNQCERSFNCSSHLIAHRRTHTGEKPYRCNECGKAFNES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 FSQSCHLVAHRRIHTGEKPYKCNQCERSFNCSSHLIAHRRTHTGEKPYRCNECGKAFNES
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD SSLIVHLRNHTGEKPYKCNHCEKAFCKNSSLIIHQRMHSGEKRFICSECGKAFSGHSALL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SSLIVHLRNHTGEKPYKCNHCEKAFCKNSSLIIHQRMHSGEKRFICSECGKAFSGHSALL
730 740 750 760 770 780
790
pF1KSD QHQRNHSEEKLN
::::::::::::
XP_005 QHQRNHSEEKLN
790
>>NP_008886 (OMIM: 194522) zinc finger protein 33B isofo (778 aa)
initn: 1820 init1: 1820 opt: 2138 Z-score: 1186.6 bits: 230.4 E(85289): 2.4e-59
Smith-Waterman score: 2138; 43.3% identity (69.3% similar) in 753 aa overlap (57-790:7-747)
30 40 50 60 70 80
pF1KSD ASWALCPQYPAWHVEGSLEEGRRATGLPAAQVQEPVTFKDVAVDFTQEEWGQLDLVQRTL
. : :.::::.: :::::: .:: ::.:
NP_008 MNKVDQKFQGSVSFKDVTVGFTQEEWQHLDPSQRAL
10 20 30
90 100 110 120 130
pF1KSD YRDVMLETYGHLLSVGNQIAKPEVISLLEQGEEPWSVEQACPQRTCPE-WV------RNL
:::::::.:..:.::: ::::: :::::::: .:. :... :: :. :.
NP_008 YRDVMLENYSNLVSVGYCAHKPEVIFRLEQGEEPWRLEEEFPSQSFPEVWTADHLKERSQ
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KSD ESKA------LIPAQSIFEEEQSHGMKLERYIWDDPWFSRLEVLGCKDQLEMYHMNQSTA
:... .. . .. .::.. . . . : : ... : : . :. .:
NP_008 ENQSKHLWEVVFINNEMLTKEQGNVIGIP-FNMDVSSFPSRKMF-C--QYDSRGMSFNT-
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KSD MRQMVFMQKQVLSQRSSEFCGLGAEFSQNLNFVPSQRVSQIEHFYKPDTHAQSWRCDSAI
. ..:. . . :...:.:: . : . ::. .. .. .. . .. : : ..
NP_008 VSELVISKINYLGKKSDEFNACGKLL---LNIKHDETHTREKNEVLKNRNTLSHRENT--
160 170 180 190 200
260 270 280 290 300
pF1KSD MYADKVTCENNDYDKTVYQSI---QPIYPARIQTGDNLFKC--TDAVKSFNHIIHFGDHK
. .:. ..... .. : . .. .: . . . .: .. ..: . :.
NP_008 LQHEKIQTLDHNFEYSICQETLLEKAVFNTRKRENAEENNCDYNEFGRTFCDSSSLLFHQ
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KSD GIHTGEKLYEYKECHQIFNQSPSFNEHPRLHVGENQYNYKEYENIFYFSSFMEH-QKIGT
. .. ::...:.... . ....: . : ..:. : : : . . . ::
NP_008 IPPSKDSHYEFSDCEKFLCVKSTLSKHDGVPV--KHYDCGESGNNFRRKLCLSQLQKGDK
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KSD VEKAYKYNEWEKVFGYDSFLTQHTSTYTAEKPYDYNECGTSFIWSSYLIQHKKTHTGEKP
:: .. :: :.: : ::.: ..:.:: .. :.:: .: .: : .:...::::::
NP_008 GEKHFECNECGKAFWEKSHLTRHQRVHTGEKHFQCNQCGKTFWEKSNLTKHQRSHTGEKP
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470 480
pF1KSD YECDKCGKVFRNRSALTKHERTHTGIKPYECNKCGKAFSWNSHLIVHKRIHTGEKPYVCN
.::..:::.: ..:::: :.::::: :::.:: :::.: .: : :.: :::.::: :
NP_008 FECNECGKAFSHKSALTLHQRTHTGEKPYQCNACGKTFYQKSDLTKHQRTHTGQKPYECY
390 400 410 420 430 440
490 500 510 520 530 540
pF1KSD ECGKSFNWNSHLIGHQRTHTGEKPFECTECGKSFSWSSHLIAHMRMHTGEKPFKCDECEK
:::::: :::: ::::::::::::: :::::: .::: :.: : :.::..:. : :
NP_008 ECGKSFCMNSHLTVHQRTHTGEKPFECLECGKSFCQKSHLTQHQRTHIGDKPYECNACGK
450 460 470 480 490 500
550 560 570 580 590 600
pF1KSD AFRDYSALSKHERTHSGAKPYKCTECGKSFSWSSHLIAHQRTHTGEKPYNCQECGKAFRE
.: :.:..:. :.: :::.: ::::.: .: : ::::::::::. : :::: : .
NP_008 TFYHKSVLTRHQIIHTGLKPYECYECGKTFCLKSDLTIHQRTHTGEKPFACPECGKFFSH
510 520 530 540 550 560
610 620 630 640 650 660
pF1KSD RSALTKHEIIHSGIKPYECNKCGKSCSQMAHLVRHQRTHTGEKPYECNKCGKSFSQSCHL
.:.:..: :.: :::::..::: . ..:..:.::::::::::::.:::.: :. .:
NP_008 KSTLSQHYRTHTGEKPYECHECGKIFYNKSYLTKHNRTHTGEKPYECNECGKTFCQKSQL
570 580 590 600 610 620
670 680 690 700 710 720
pF1KSD VAHRRIHTGEKPYKCNQCERSFNCSSHLIAHRRTHTGEKPYRCNECGKAFNESSSLIVHL
. :.::: :::::.::.: ..: .: ::.:.:::: ::::.::::::.: .:.::.:
NP_008 TQHQRIHIGEKPYECNECGKAFCHKSALIVHQRTHTQEKPYKCNECGKSFCVKSGLILHE
630 640 650 660 670 680
730 740 750 760 770 780
pF1KSD RNHTGEKPYKCNHCEKAFCKNSSLIIHQRMHSGEKRFICSECGKAFSGHSALLQHQRNHS
:.:::::::.::.: :.: ..::: .:.: :.::: :.:::: : .: : .:::.:.
NP_008 RKHTGEKPYECNECGKSFSHKSSLTVHHRAHTGEKSCQCNECGKIFYRKSDLAKHQRSHT
690 700 710 720 730 740
790
pF1KSD EEKLN
::
NP_008 GEKPYECNTCRKTFSQKSNLIVHQRTHIGEKPYE
750 760 770
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30 40 50 60 70 80
pF1KSD ASWALCPQYPAWHVEGSLEEGRRATGLPAAQVQEPVTFKDVAVDFTQEEWGQLDLVQRTL
. : :.::::.: :::::: .:: ::.:
NP_001 MANATRRESEVDQKFQGSVSFKDVTVGFTQEEWQHLDPSQRAL
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90 100 110 120 130
pF1KSD YRDVMLETYGHLLSVGNQIAKPEVISLLEQGEEPWSVEQACPQRTCPE-WV------RNL
:::::::.:..:.::: ::::: :::::::: .:. :... :: :. :.
NP_001 YRDVMLENYSNLVSVGYCAHKPEVIFRLEQGEEPWRLEEEFPSQSFPEVWTADHLKERSQ
50 60 70 80 90 100
140 150 160 170 180 190
pF1KSD ESKA------LIPAQSIFEEEQSHGMKLERYIWDDPWFSRLEVLGCKDQLEMYHMNQSTA
:... .. . .. .::.. . . . : : ... : : . :. .:
NP_001 ENQSKHLWEVVFINNEMLTKEQGNVIGIP-FNMDVSSFPSRKMF-C--QYDSRGMSFNT-
110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KSD MRQMVFMQKQVLSQRSSEFCGLGAEFSQNLNFVPSQRVSQIEHFYKPDTHAQSWRCDSAI
. ..:. . . :...:.:: . : . ::. .. .. .. . .. : : ..
NP_001 VSELVISKINYLGKKSDEFNACGKLL---LNIKHDETHTREKNEVLKNRNTLSHRENT--
160 170 180 190 200 210
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pF1KSD MYADKVTCENNDYDKTVYQSI---QPIYPARIQTGDNLFKC--TDAVKSFNHIIHFGDHK
. .:. ..... .. : . .. .: . . . .: .. ..: . :.
NP_001 LQHEKIQTLDHNFEYSICQETLLEKAVFNTRKRENAEENNCDYNEFGRTFCDSSSLLFHQ
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KSD GIHTGEKLYEYKECHQIFNQSPSFNEHPRLHVGENQYNYKEYENIFYFSSFMEH-QKIGT
. .. ::...:.... . ....: . : ..:. : : : . . . ::
NP_001 IPPSKDSHYEFSDCEKFLCVKSTLSKHDGVPV--KHYDCGESGNNFRRKLCLSQLQKGDK
280 290 300 310 320 330
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pF1KSD VEKAYKYNEWEKVFGYDSFLTQHTSTYTAEKPYDYNECGTSFIWSSYLIQHKKTHTGEKP
:: .. :: :.: : ::.: ..:.:: .. :.:: .: .: : .:...::::::
NP_001 GEKHFECNECGKAFWEKSHLTRHQRVHTGEKHFQCNQCGKTFWEKSNLTKHQRSHTGEKP
340 350 360 370 380 390
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pF1KSD YECDKCGKVFRNRSALTKHERTHTGIKPYECNKCGKAFSWNSHLIVHKRIHTGEKPYVCN
.::..:::.: ..:::: :.::::: :::.:: :::.: .: : :.: :::.::: :
NP_001 FECNECGKAFSHKSALTLHQRTHTGEKPYQCNACGKTFYQKSDLTKHQRTHTGQKPYECY
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KSD ECGKSFNWNSHLIGHQRTHTGEKPFECTECGKSFSWSSHLIAHMRMHTGEKPFKCDECEK
:::::: :::: ::::::::::::: :::::: .::: :.: : :.::..:. : :
NP_001 ECGKSFCMNSHLTVHQRTHTGEKPFECLECGKSFCQKSHLTQHQRTHIGDKPYECNACGK
460 470 480 490 500 510
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pF1KSD AFRDYSALSKHERTHSGAKPYKCTECGKSFSWSSHLIAHQRTHTGEKPYNCQECGKAFRE
.: :.:..:. :.: :::.: ::::.: .: : ::::::::::. : :::: : .
NP_001 TFYHKSVLTRHQIIHTGLKPYECYECGKTFCLKSDLTIHQRTHTGEKPFACPECGKFFSH
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640 650 660
pF1KSD RSALTKHEIIHSGIKPYECNKCGKSCSQMAHLVRHQRTHTGEKPYECNKCGKSFSQSCHL
.:.:..: :.: :::::..::: . ..:..:.::::::::::::.:::.: :. .:
NP_001 KSTLSQHYRTHTGEKPYECHECGKIFYNKSYLTKHNRTHTGEKPYECNECGKTFCQKSQL
580 590 600 610 620 630
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pF1KSD VAHRRIHTGEKPYKCNQCERSFNCSSHLIAHRRTHTGEKPYRCNECGKAFNESSSLIVHL
. :.::: :::::.::.: ..: .: ::.:.:::: ::::.::::::.: .:.::.:
NP_001 TQHQRIHIGEKPYECNECGKAFCHKSALIVHQRTHTQEKPYKCNECGKSFCVKSGLILHE
640 650 660 670 680 690
730 740 750 760 770 780
pF1KSD RNHTGEKPYKCNHCEKAFCKNSSLIIHQRMHSGEKRFICSECGKAFSGHSALLQHQRNHS
:.:::::::.::.: :.: ..::: .:.: :.::: :.:::: : .: : .:::.:.
NP_001 RKHTGEKPYECNECGKSFSHKSSLTVHHRAHTGEKSCQCNECGKIFYRKSDLAKHQRSHT
700 710 720 730 740 750
790
pF1KSD EEKLN
::
NP_001 GEKPYECNTCRKTFSQKSNLIVHQRTHIGEKPYE
760 770 780
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Smith-Waterman score: 2114; 44.0% identity (68.4% similar) in 769 aa overlap (48-790:6-753)
20 30 40 50 60 70
pF1KSD WGMTAVDPWASWALCPQYPAWHVEGSLEEGRRATGLPAAQVQEPVTFKDVAVDFTQEEWG
::..:. . :: :.::::.: ::::::
NP_001 MANATRRGSGVEQ-KSQESVSFKDVTVGFTQEEWQ
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80 90 100 110 120 130
pF1KSD QLDLVQRTLYRDVMLETYGHLLSVGNQIAKPEVISLLEQGEEPWSVEQACPQRTCPEWV-
.:: ::.::::::::.:..:.::: . ::::: :.::::::. :. :... : :.
NP_001 HLDPSQRALYRDVMLENYSNLVSVGYCVHKPEVIFRLQQGEEPWKQEEEFPSQSFPVWTA
40 50 60 70 80 90
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pF1KSD -----RNLESKA------LIPAQSIFEEEQSHGMKLERYIWDDPWFSRLEVLGCKDQLEM
:. :... .. . .. .::. . . . . . :: : :. :
NP_001 DHLKERSQENQSKHLWEVVFINNEMLTKEQGDVIGIPFNVDVSSFPSRKMFCQC-DSCGM
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230
pF1KSD YHMNQSTAMRQMVFMQKQVLSQRSSEF--CG---LGAEF----SQNLNFVPSQRVSQIEH
. ... ..:. . . :...:.:: :: :. . .:. : : ..: . . :
NP_001 ----SFNTVSELVISKINYLGKKSDEFNACGKLLLNIKHDETHTQEKNEVLKNR-NTLSH
160 170 180 190 200
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pF1KSD FYKPDTHAQSWRCDSAIMYADKVTCENNDYDKTVYQSIQPIYPARIQTGD-NLFK---CT
. : . . . :. :... .:.:... : :. .. : : : :
NP_001 HEETLQHEKIQTLEHNFEYS---ICQETLLEKAVFNT-QKRENAEENNCDYNEFGRTLCD
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KSD DAVKSFNHIIHFGDHKGIHTGEKLYEYKECHQIFNQSPSFNEHPRLHVGENQYNYKEYEN
.. :..: :.. ::...:.... . .... :. :. ..:. : :
NP_001 SSSLLFHQISPSRDNH--------YEFSDCEKFLCVKSTLSK-PH-GVSMKHYDCGESGN
270 280 290 300 310
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pF1KSD IFYFSSFMEH-QKIGTVEKAYKYNEWEKVFGYDSFLTQHTSTYTAEKPYDYNECGTSFIW
: . . : :: :: .. :: :.: : ::.: ..:..::.. ::: .:
NP_001 NFRRKLCLSHLQKGDKGEKHFECNECGKAFWEKSHLTRHQRVHTGQKPFQCNECEKAFWD
320 330 340 350 360 370
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pF1KSD SSYLIQHKKTHTGEKPYECDKCGKVFRNRSALTKHERTHTGIKPYECNKCGKAFSWNSHL
.: : .:...::::::.::..:::.: ..:::: :.::::: :::.:: :::.: .: :
NP_001 KSNLTKHQRSHTGEKPFECNECGKAFSHKSALTLHQRTHTGEKPYQCNACGKTFCQKSDL
380 390 400 410 420 430
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pF1KSD IVHKRIHTGEKPYVCNECGKSFNWNSHLIGHQRTHTGEKPFECTECGKSFSWSSHLIAHM
:.: ::: ::: : :::::: .::: ::::::::::::: ::::::: .:.: :.
NP_001 TKHQRTHTGLKPYECYECGKSFRVTSHLKVHQRTHTGEKPFECLECGKSFSEKSNLTQHQ
440 450 460 470 480 490
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pF1KSD RMHTGEKPFKCDECEKAFRDYSALSKHERTHSGAKPYKCTECGKSFSWSSHLIAHQRTHT
:.: :.: ..:. : :.: : :..:. :.: :::.: ::::.: .: : .::::::
NP_001 RIHIGDKSYECNACGKTFYHKSLLTRHQIIHTGWKPYECYECGKTFCLKSDLTVHQRTHT
500 510 520 530 540 550
600 610 620 630 640 650
pF1KSD GEKPYNCQECGKAFRERSALTKHEIIHSGIKPYECNKCGKSCSQMAHLVRHQRTHTGEKP
:.::. : :::: : ..:.:..: :.: :::::..::: . ..:..:.::::::::
NP_001 GQKPFACPECGKFFSHKSTLSQHYRTHTGEKPYECHECGKIFYNKSYLTKHNRTHTGEKP
560 570 580 590 600 610
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pF1KSD YECNKCGKSFSQSCHLVAHRRIHTGEKPYKCNQCERSFNCSSHLIAHRRTHTGEKPYRCN
::::.:::.: :. .:. :.::: ::::::::.: ..: .: ::.:.:::: ::::.::
NP_001 YECNECGKAFYQKSQLTQHQRIHIGEKPYKCNECGKAFCHKSALIVHQRTHTQEKPYKCN
620 630 640 650 660 670
720 730 740 750 760 770
pF1KSD ECGKAFNESSSLIVHLRNHTGEKPYKCNHCEKAFCKNSSLIIHQRMHSGEKRFICSECGK
::::.: .:.:: : :.:::::::.::.: : : ..::: .:.: :.::: :.::::
NP_001 ECGKSFCVKSGLIFHERKHTGEKPYECNECGKFFRHKSSLTVHHRAHTGEKSCQCNECGK
680 690 700 710 720 730
780 790
pF1KSD AFSGHSALLQHQRNHSEEKLN
: .: : ::::.:. ::
NP_001 IFYRKSELAQHQRSHTGEKPYECNTCRKTFSQKSNLIVHQRRHIGENLMNEMDIRNFQPQ
740 750 760 770 780 790
>>NP_001311107 (OMIM: 194521) zinc finger protein 33A is (818 aa)
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20 30 40 50 60 70
pF1KSD WGMTAVDPWASWALCPQYPAWHVEGSLEEGRRATGLPAAQVQEPVTFKDVAVDFTQEEWG
::..:. . :: :.::::.: ::::::
NP_001 MANATRRGSGVEQ-KSQESVSFKDVTVGFTQEEWQ
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KSD QLDLVQRTLYRDVMLETYGHLLSVGNQIAKPEVISLLEQGEEPWSVEQACPQRTCPE-WV
.:: ::.::::::::.:..:.::: . ::::: :.::::::. :. :... :: :.
NP_001 HLDPSQRALYRDVMLENYSNLVSVGYCVHKPEVIFRLQQGEEPWKQEEEFPSQSFPEVWT
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180
pF1KSD ------RNLESKA------LIPAQSIFEEEQSHGMKLERYIWDDPWFSRLEVLGCKDQLE
:. :... .. . .. .::. . . . . . :: : :.
NP_001 ADHLKERSQENQSKHLWEVVFINNEMLTKEQGDVIGIPFNVDVSSFPSRKMFCQC-DSCG
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230
pF1KSD MYHMNQSTAMRQMVFMQKQVLSQRSSEF--CG---LGAEF----SQNLNFVPSQRVSQIE
: . ... ..:. . . :...:.:: :: :. . .:. : : ..: . .
NP_001 M----SFNTVSELVISKINYLGKKSDEFNACGKLLLNIKHDETHTQEKNEVLKNR-NTLS
160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KSD HFYKPDTHAQSWRCDSAIMYADKVTCENNDYDKTVYQSIQPIYPARIQTGD-NLFK---C
: . : . . . :. :... .:.:... : :. .. : : : :
NP_001 HHEETLQHEKIQTLEHNFEYS---ICQETLLEKAVFNT-QKRENAEENNCDYNEFGRTLC
210 220 230 240 250 260
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pF1KSD TDAVKSFNHIIHFGDHKGIHTGEKLYEYKECHQIFNQSPSFNEHPRLHVGENQYNYKEYE
.. :..: :.. ::...:.... . .... :. :. ..:. :
NP_001 DSSSLLFHQISPSRDNH--------YEFSDCEKFLCVKSTLSK-PH-GVSMKHYDCGESG
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pF1KSD NIFYFSSFMEH-QKIGTVEKAYKYNEWEKVFGYDSFLTQHTSTYTAEKPYDYNECGTSFI
: : . . : :: :: .. :: :.: : ::.: ..:..::.. ::: .:
NP_001 NNFRRKLCLSHLQKGDKGEKHFECNECGKAFWEKSHLTRHQRVHTGQKPFQCNECEKAFW
320 330 340 350 360 370
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pF1KSD WSSYLIQHKKTHTGEKPYECDKCGKVFRNRSALTKHERTHTGIKPYECNKCGKAFSWNSH
.: : .:...::::::.::..:::.: ..:::: :.::::: :::.:: :::.: .:
NP_001 DKSNLTKHQRSHTGEKPFECNECGKAFSHKSALTLHQRTHTGEKPYQCNACGKTFCQKSD
380 390 400 410 420 430
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pF1KSD LIVHKRIHTGEKPYVCNECGKSFNWNSHLIGHQRTHTGEKPFECTECGKSFSWSSHLIAH
: :.: ::: ::: : :::::: .::: ::::::::::::: ::::::: .:.: :
NP_001 LTKHQRTHTGLKPYECYECGKSFRVTSHLKVHQRTHTGEKPFECLECGKSFSEKSNLTQH
440 450 460 470 480 490
540 550 560 570 580 590
pF1KSD MRMHTGEKPFKCDECEKAFRDYSALSKHERTHSGAKPYKCTECGKSFSWSSHLIAHQRTH
.:.: :.: ..:. : :.: : :..:. :.: :::.: ::::.: .: : .:::::
NP_001 QRIHIGDKSYECNACGKTFYHKSLLTRHQIIHTGWKPYECYECGKTFCLKSDLTVHQRTH
500 510 520 530 540 550
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pF1KSD TGEKPYNCQECGKAFRERSALTKHEIIHSGIKPYECNKCGKSCSQMAHLVRHQRTHTGEK
::.::. : :::: : ..:.:..: :.: :::::..::: . ..:..:.:::::::
NP_001 TGQKPFACPECGKFFSHKSTLSQHYRTHTGEKPYECHECGKIFYNKSYLTKHNRTHTGEK
560 570 580 590 600 610
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pF1KSD PYECNKCGKSFSQSCHLVAHRRIHTGEKPYKCNQCERSFNCSSHLIAHRRTHTGEKPYRC
:::::.:::.: :. .:. :.::: ::::::::.: ..: .: ::.:.:::: ::::.:
NP_001 PYECNECGKAFYQKSQLTQHQRIHIGEKPYKCNECGKAFCHKSALIVHQRTHTQEKPYKC
620 630 640 650 660 670
720 730 740 750 760 770
pF1KSD NECGKAFNESSSLIVHLRNHTGEKPYKCNHCEKAFCKNSSLIIHQRMHSGEKRFICSECG
:::::.: .:.:: : :.:::::::.::.: : : ..::: .:.: :.::: :.:::
NP_001 NECGKSFCVKSGLIFHERKHTGEKPYECNECGKFFRHKSSLTVHHRAHTGEKSCQCNECG
680 690 700 710 720 730
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pF1KSD KAFSGHSALLQHQRNHSEEKLN
: : .: : ::::.:. ::
NP_001 KIFYRKSELAQHQRSHTGEKPYECNTCRKTFSQKSNLIVHQRRHIGENLMNEMDIRNFQP
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>>XP_016872106 (OMIM: 194521) PREDICTED: zinc finger pro (818 aa)
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Smith-Waterman score: 2111; 44.0% identity (68.4% similar) in 770 aa overlap (48-790:6-754)
20 30 40 50 60 70
pF1KSD WGMTAVDPWASWALCPQYPAWHVEGSLEEGRRATGLPAAQVQEPVTFKDVAVDFTQEEWG
::..:. . :: :.::::.: ::::::
XP_016 MANATRRGSGVEQ-KSQESVSFKDVTVGFTQEEWQ
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KSD QLDLVQRTLYRDVMLETYGHLLSVGNQIAKPEVISLLEQGEEPWSVEQACPQRTCPE-WV
.:: ::.::::::::.:..:.::: . ::::: :.::::::. :. :... :: :.
XP_016 HLDPSQRALYRDVMLENYSNLVSVGYCVHKPEVIFRLQQGEEPWKQEEEFPSQSFPEVWT
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180
pF1KSD ------RNLESKA------LIPAQSIFEEEQSHGMKLERYIWDDPWFSRLEVLGCKDQLE
:. :... .. . .. .::. . . . . . :: : :.
XP_016 ADHLKERSQENQSKHLWEVVFINNEMLTKEQGDVIGIPFNVDVSSFPSRKMFCQC-DSCG
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230
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NP_008 HQRSHTGEKPYECNTCRKTFSQKSNLIVHQRRHIGENLMNEMDIRNFQPQVSLHNASEYS
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792 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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