FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1820, 1640 aa
1>>>pF1KSDA1820 1640 - 1640 aa - 1640 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.2197+/-0.000441; mu= -18.4729+/- 0.027
mean_var=483.9105+/-98.639, 0's: 0 Z-trim(123.1): 24 B-trim: 0 in 0/60
Lambda= 0.058303
statistics sampled from 42202 (42236) to 42202 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.773), E-opt: 0.2 (0.495), width: 16
Scan time: 20.520
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_109590 (OMIM: 182290,607642) retinoic acid-indu (1906) 10906 933.3 0
XP_016879516 (OMIM: 182290,607642) PREDICTED: reti (1967) 10906 933.3 0
XP_016879515 (OMIM: 182290,607642) PREDICTED: reti (1967) 10906 933.3 0
XP_016879517 (OMIM: 182290,607642) PREDICTED: reti (1967) 10906 933.3 0
XP_016879514 (OMIM: 182290,607642) PREDICTED: reti (1967) 10906 933.3 0
XP_011528656 (OMIM: 603107) PREDICTED: transcripti (1938) 793 82.6 3.6e-14
NP_852469 (OMIM: 603107) transcription factor 20 i (1938) 793 82.6 3.6e-14
XP_011528655 (OMIM: 603107) PREDICTED: transcripti (1949) 793 82.7 3.6e-14
XP_006724376 (OMIM: 603107) PREDICTED: transcripti (1960) 793 82.7 3.6e-14
XP_005261779 (OMIM: 603107) PREDICTED: transcripti (1960) 793 82.7 3.6e-14
NP_005641 (OMIM: 603107) transcription factor 20 i (1960) 793 82.7 3.6e-14
>>NP_109590 (OMIM: 182290,607642) retinoic acid-induced (1906 aa)
initn: 10906 init1: 10906 opt: 10906 Z-score: 4972.8 bits: 933.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 10906; 99.9% identity (100.0% similar) in 1598 aa overlap (1-1598:1-1598)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MQSFRERCGFHGKQQNYQQTSQETSRLENYRQPSQAGLSCDRQRLLAKDYYNPQPYPSYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_109 MQSFRERCGFHGKQQNYQQTSQETSRLENYRQPSQAGLSCDRQRLLAKDYYNPQPYPSYE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD GGAGTPSGTAAAVAADKYHRGSKALPTQQGLQGRPAFPGYGVQDSSPYPGRYAGEESLQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_109 GGAGTPSGTAAAVAADKYHRGSKALPTQQGLQGRPAFPGYGVQDSSPYPGRYAGEESLQA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD WGAPQPPPPQPQPLPAGVAKYDENLMKKTAVPPSRQYAEQGAQVPFRTHSLHVQQPPPPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_109 WGAPQPPPPQPQPLPAGVAKYDENLMKKTAVPPSRQYAEQGAQVPFRTHSLHVQQPPPPQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD QPLAYPKLQRQKLQNDIASPLPFPQGTHFPQHSQSFPTSSTYSSSVQGGGQGAHSYKSCT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_109 QPLAYPKLQRQKLQNDIASPLPFPQGTHFPQHSQSFPTSSTYSSSVQGGGQGAHSYKSCT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD APTAQPHDRPLTASSSLAPGQRVQNLHAYQSGRLSYDQQQQQQQQQQQQQQALQSRHHAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_109 APTAQPHDRPLTASSSLAPGQRVQNLHAYQSGRLSYDQQQQQQQQQQQQQQALQSRHHAQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD ETLHYQNLAKYQHYGQQGQGYCQPDAAVRTPEQYYQTFSPSSSHSPARSVGRSPSYSSTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_109 ETLHYQNLAKYQHYGQQGQGYCQPDAAVRTPEQYYQTFSPSSSHSPARSVGRSPSYSSTP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD SPLMPNLENFPYSQQPLSTGAFPAGITDHSHFMPLLNPSPTDATSSVDTQAGNCKPLQKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_109 SPLMPNLENFPYSQQPLSTGAFPAGITDHSHFMPLLNPSPTDATSSVDTQAGNCKPLQKD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD KLPENLLSDLSLQSLTALTSQVENISNTVQQLLLSKAAVPQKKGVKNLVSRTPEQHKSQH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_109 KLPENLLSDLSLQSLTALTSQVENISNTVQQLLLSKAAVPQKKGVKNLVSRTPEQHKSQH
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD CSPEGSGYSAEPAGTPLSEPPSSTPQSTHAEPQEADYLSGSEDPLERSFLYCNQARGSPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_109 CSPEGSGYSAEPAGTPLSEPPSSTPQSTHAEPQEADYLSGSEDPLERSFLYCNQARGSPA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD RVNSNSKAKPESVSTCSVTSPDDMSTKSDDSFQSLHGSLPLDSFSKFVAGERDCPRLLLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_109 RVNSNSKAKPESVSTCSVTSPDDMSTKSDDSFQSLHGSLPLDSFSKFVAGERDCPRLLLS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD ALAQEDLASEILGLQEAIGEKADKAWAEAPSLVKDSSKPPFSLENHSACLDSVAKSAWPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_109 ALAQEDLASEILGLQEAIGEKADKAWAEAPSLVKDSSKPPFSLENHSACLDSVAKSAWPR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD PGEPEALPDSLQLDKGGNAKDFSPGLFEDPSVAFATPDPKKTTGPLSFGTKPTLGVPAPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_109 PGEPEALPDSLQLDKGGNAKDFSPGLFEDPSVAFATPDPKKTTGPLSFGTKPTLGVPAPD
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD PTTAAFDCFPDTTAASSADSANPFAWPEENLGDACPRWGLHPGELTKGLEQGGKASDGIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_109 PTTAAFDCFPDTTAASSADSANPFAWPEENLGDACPRWGLHPGELTKGLEQGGKASDGIS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD KGDTHEASACLGFQEEDPPGEKVASLPGDFKQEEVGGVKEEAGGLLQCPEVAKADRWLED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_109 KGDTHEASACLGFQEEDPPGEKVASLPGDFKQEEVGGVKEEAGGLLQCPEVAKADRWLED
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD SRHCCSTADFGDLPLLPPTSRKEDLEAEEEYSSLCELLGSPEQRPGMQDPLSPKAPLICT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_109 SRHCCSTADFGDLPLLPPTSRKEDLEAEEEYSSLCELLGSPEQRPGMQDPLSPKAPLICT
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD KEEVEEVLDSKAGWGSPCHLSGESVILLGPTVGTESKVQSWFESSLSHMKPGEEGPDGER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_109 KEEVEEVLDSKAGWGSPCHLSGESVILLGPTVGTESKVQSWFESSLSHMKPGEEGPDGER
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD APGDSTTSDASLAQKPNKPAVPEAPIAKKEPVPRGKSLRSRRVHRGLPEAEDSPCRAPVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_109 APGDSTTSDASLAQKPNKPAVPEAPIAKKEPVPRGKSLRSRRVHRGLPEAEDSPCRAPVL
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD PKDLLLPESCTGPPQGQMEGAGAPGRGASEGLPRMCTRSLTALSEPRTPGPPGLTTTPAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_109 PKDLLLPESCTGPPQGQMEGAGAPGRGASEGLPRMCTRSLTALSEPRTPGPPGLTTTPAP
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD PDKLGGKQRAAFKSGKRVGKPSPKAASSPSNPAALPVASDSSPMGSKTKETDSPSTPGKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_109 PDKLGGKQRAAFKSGKRVGKPSPKAASSPSNPAALPVASDSSPMGSKTKETDSPSTPGKD
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD QRSMILRSRTKTQEIFHSKRRRPSEGRLPNCRATKKLLDNSHLPATFKVSSSPQKEGRVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_109 QRSMILRSRTKTQEIFHSKRRRPSEGRLPNCRATKKLLDNSHLPATFKVSSSPQKEGRVS
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD QRARVPKPGAGSKLSDRPLHALKRKSAFMAPVPTKKRNLVLRSRSSSSSNASGNGGDGKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_109 QRARVPKPGAGSKLSDRPLHALKRKSAFMAPVPTKKRNLVLRSRSSSSSNASGNGGDGKE
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD ERPEGSPTLFKRMSSPKKAKPTKGNGEPATKLPPPETPDACLKLASRAAFQGAMKTKVLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_109 ERPEGSPTLFKRMSSPKKAKPTKGNGEPATKLPPPETPDACLKLASRAAFQGAMKTKVLP
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD PRKGRGLKLEAIVQKITSPSLKKFACKAPGASPGNPLSPSLSDKDRGLKGAGGSPVGVEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_109 PRKGRGLKLEAIVQKITSPSLKKFACKAPGASPGNPLSPSLSDKDRGLKGAGGSPVGVEE
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KSD GLVNVGTGQKLPTSGADPLCRNPTNRSLKGKLMNSKKLSSTDCFKTEAFTSPEALQPGGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_109 GLVNVGTGQKLPTSGADPLCRNPTNRSLKGKLMNSKKLSSTDCFKTEAFTSPEALQPGGT
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KSD ALAPKKRSRKGRAGAHGLSKGPLEKRPYLGPALLLTPRDRASGTQGASEDNSGGGGKKPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_109 ALAPKKRSRKGRAGAHGLSKGPLEKRPYLGPALLLTPRDRASGTQGASEDNSGGGGKKPK
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KSD MEELGLASQPPEGRPCQPQTRAQKQPGHTNYSSYSKRKRLTRGRAKNTTSSPCKGRAKRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_109 MEELGLASQPPEGRPCQPQTRAQKQPGHTNYSSYSKRKRLTRGRAKNTTSSPCKGRAKRR
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KSD RQQQVLPLDPAEPEIRLKYISSCKRLRSDSRTPAFSPLEPSLGAQNPRSGQNAPPAPADA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
NP_109 RQQQVLPLDPAEPEIRLKYISSCKRLRSDSRTPAFSPFVRVEKRDAFTTICTVVNSPGDA
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640
pF1KSD RPLCTTRDRRAYSAREQGQR
NP_109 PKPHRKPSSSASSSSSSSSFSLDAAGASLATLPGGSILQPRPSLPLSSTMHLGPVVSKAL
1630 1640 1650 1660 1670 1680
>>XP_016879516 (OMIM: 182290,607642) PREDICTED: retinoic (1967 aa)
initn: 10906 init1: 10906 opt: 10906 Z-score: 4972.6 bits: 933.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 10906; 99.9% identity (100.0% similar) in 1598 aa overlap (1-1598:1-1598)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MQSFRERCGFHGKQQNYQQTSQETSRLENYRQPSQAGLSCDRQRLLAKDYYNPQPYPSYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MQSFRERCGFHGKQQNYQQTSQETSRLENYRQPSQAGLSCDRQRLLAKDYYNPQPYPSYE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD GGAGTPSGTAAAVAADKYHRGSKALPTQQGLQGRPAFPGYGVQDSSPYPGRYAGEESLQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GGAGTPSGTAAAVAADKYHRGSKALPTQQGLQGRPAFPGYGVQDSSPYPGRYAGEESLQA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD WGAPQPPPPQPQPLPAGVAKYDENLMKKTAVPPSRQYAEQGAQVPFRTHSLHVQQPPPPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 WGAPQPPPPQPQPLPAGVAKYDENLMKKTAVPPSRQYAEQGAQVPFRTHSLHVQQPPPPQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD QPLAYPKLQRQKLQNDIASPLPFPQGTHFPQHSQSFPTSSTYSSSVQGGGQGAHSYKSCT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QPLAYPKLQRQKLQNDIASPLPFPQGTHFPQHSQSFPTSSTYSSSVQGGGQGAHSYKSCT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD APTAQPHDRPLTASSSLAPGQRVQNLHAYQSGRLSYDQQQQQQQQQQQQQQALQSRHHAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 APTAQPHDRPLTASSSLAPGQRVQNLHAYQSGRLSYDQQQQQQQQQQQQQQALQSRHHAQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD ETLHYQNLAKYQHYGQQGQGYCQPDAAVRTPEQYYQTFSPSSSHSPARSVGRSPSYSSTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ETLHYQNLAKYQHYGQQGQGYCQPDAAVRTPEQYYQTFSPSSSHSPARSVGRSPSYSSTP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD SPLMPNLENFPYSQQPLSTGAFPAGITDHSHFMPLLNPSPTDATSSVDTQAGNCKPLQKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SPLMPNLENFPYSQQPLSTGAFPAGITDHSHFMPLLNPSPTDATSSVDTQAGNCKPLQKD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD KLPENLLSDLSLQSLTALTSQVENISNTVQQLLLSKAAVPQKKGVKNLVSRTPEQHKSQH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KLPENLLSDLSLQSLTALTSQVENISNTVQQLLLSKAAVPQKKGVKNLVSRTPEQHKSQH
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD CSPEGSGYSAEPAGTPLSEPPSSTPQSTHAEPQEADYLSGSEDPLERSFLYCNQARGSPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CSPEGSGYSAEPAGTPLSEPPSSTPQSTHAEPQEADYLSGSEDPLERSFLYCNQARGSPA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD RVNSNSKAKPESVSTCSVTSPDDMSTKSDDSFQSLHGSLPLDSFSKFVAGERDCPRLLLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RVNSNSKAKPESVSTCSVTSPDDMSTKSDDSFQSLHGSLPLDSFSKFVAGERDCPRLLLS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD ALAQEDLASEILGLQEAIGEKADKAWAEAPSLVKDSSKPPFSLENHSACLDSVAKSAWPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ALAQEDLASEILGLQEAIGEKADKAWAEAPSLVKDSSKPPFSLENHSACLDSVAKSAWPR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD PGEPEALPDSLQLDKGGNAKDFSPGLFEDPSVAFATPDPKKTTGPLSFGTKPTLGVPAPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PGEPEALPDSLQLDKGGNAKDFSPGLFEDPSVAFATPDPKKTTGPLSFGTKPTLGVPAPD
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD PTTAAFDCFPDTTAASSADSANPFAWPEENLGDACPRWGLHPGELTKGLEQGGKASDGIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PTTAAFDCFPDTTAASSADSANPFAWPEENLGDACPRWGLHPGELTKGLEQGGKASDGIS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD KGDTHEASACLGFQEEDPPGEKVASLPGDFKQEEVGGVKEEAGGLLQCPEVAKADRWLED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KGDTHEASACLGFQEEDPPGEKVASLPGDFKQEEVGGVKEEAGGLLQCPEVAKADRWLED
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD SRHCCSTADFGDLPLLPPTSRKEDLEAEEEYSSLCELLGSPEQRPGMQDPLSPKAPLICT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SRHCCSTADFGDLPLLPPTSRKEDLEAEEEYSSLCELLGSPEQRPGMQDPLSPKAPLICT
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD KEEVEEVLDSKAGWGSPCHLSGESVILLGPTVGTESKVQSWFESSLSHMKPGEEGPDGER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KEEVEEVLDSKAGWGSPCHLSGESVILLGPTVGTESKVQSWFESSLSHMKPGEEGPDGER
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD APGDSTTSDASLAQKPNKPAVPEAPIAKKEPVPRGKSLRSRRVHRGLPEAEDSPCRAPVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 APGDSTTSDASLAQKPNKPAVPEAPIAKKEPVPRGKSLRSRRVHRGLPEAEDSPCRAPVL
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD PKDLLLPESCTGPPQGQMEGAGAPGRGASEGLPRMCTRSLTALSEPRTPGPPGLTTTPAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PKDLLLPESCTGPPQGQMEGAGAPGRGASEGLPRMCTRSLTALSEPRTPGPPGLTTTPAP
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD PDKLGGKQRAAFKSGKRVGKPSPKAASSPSNPAALPVASDSSPMGSKTKETDSPSTPGKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PDKLGGKQRAAFKSGKRVGKPSPKAASSPSNPAALPVASDSSPMGSKTKETDSPSTPGKD
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD QRSMILRSRTKTQEIFHSKRRRPSEGRLPNCRATKKLLDNSHLPATFKVSSSPQKEGRVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QRSMILRSRTKTQEIFHSKRRRPSEGRLPNCRATKKLLDNSHLPATFKVSSSPQKEGRVS
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD QRARVPKPGAGSKLSDRPLHALKRKSAFMAPVPTKKRNLVLRSRSSSSSNASGNGGDGKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QRARVPKPGAGSKLSDRPLHALKRKSAFMAPVPTKKRNLVLRSRSSSSSNASGNGGDGKE
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD ERPEGSPTLFKRMSSPKKAKPTKGNGEPATKLPPPETPDACLKLASRAAFQGAMKTKVLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ERPEGSPTLFKRMSSPKKAKPTKGNGEPATKLPPPETPDACLKLASRAAFQGAMKTKVLP
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD PRKGRGLKLEAIVQKITSPSLKKFACKAPGASPGNPLSPSLSDKDRGLKGAGGSPVGVEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PRKGRGLKLEAIVQKITSPSLKKFACKAPGASPGNPLSPSLSDKDRGLKGAGGSPVGVEE
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KSD GLVNVGTGQKLPTSGADPLCRNPTNRSLKGKLMNSKKLSSTDCFKTEAFTSPEALQPGGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GLVNVGTGQKLPTSGADPLCRNPTNRSLKGKLMNSKKLSSTDCFKTEAFTSPEALQPGGT
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KSD ALAPKKRSRKGRAGAHGLSKGPLEKRPYLGPALLLTPRDRASGTQGASEDNSGGGGKKPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ALAPKKRSRKGRAGAHGLSKGPLEKRPYLGPALLLTPRDRASGTQGASEDNSGGGGKKPK
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KSD MEELGLASQPPEGRPCQPQTRAQKQPGHTNYSSYSKRKRLTRGRAKNTTSSPCKGRAKRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MEELGLASQPPEGRPCQPQTRAQKQPGHTNYSSYSKRKRLTRGRAKNTTSSPCKGRAKRR
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KSD RQQQVLPLDPAEPEIRLKYISSCKRLRSDSRTPAFSPLEPSLGAQNPRSGQNAPPAPADA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
XP_016 RQQQVLPLDPAEPEIRLKYISSCKRLRSDSRTPAFSPFVRVEKRDAFTTICTVVNSPGDA
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640
pF1KSD RPLCTTRDRRAYSAREQGQR
XP_016 PKPHRKPSSSASSSSSSSSFSLDAAGASLATLPGGSILQPRPSLPLSSTMHLGPVVSKAL
1630 1640 1650 1660 1670 1680
>>XP_016879515 (OMIM: 182290,607642) PREDICTED: retinoic (1967 aa)
initn: 10906 init1: 10906 opt: 10906 Z-score: 4972.6 bits: 933.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 10906; 99.9% identity (100.0% similar) in 1598 aa overlap (1-1598:1-1598)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MQSFRERCGFHGKQQNYQQTSQETSRLENYRQPSQAGLSCDRQRLLAKDYYNPQPYPSYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MQSFRERCGFHGKQQNYQQTSQETSRLENYRQPSQAGLSCDRQRLLAKDYYNPQPYPSYE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD GGAGTPSGTAAAVAADKYHRGSKALPTQQGLQGRPAFPGYGVQDSSPYPGRYAGEESLQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GGAGTPSGTAAAVAADKYHRGSKALPTQQGLQGRPAFPGYGVQDSSPYPGRYAGEESLQA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD WGAPQPPPPQPQPLPAGVAKYDENLMKKTAVPPSRQYAEQGAQVPFRTHSLHVQQPPPPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 WGAPQPPPPQPQPLPAGVAKYDENLMKKTAVPPSRQYAEQGAQVPFRTHSLHVQQPPPPQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD QPLAYPKLQRQKLQNDIASPLPFPQGTHFPQHSQSFPTSSTYSSSVQGGGQGAHSYKSCT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QPLAYPKLQRQKLQNDIASPLPFPQGTHFPQHSQSFPTSSTYSSSVQGGGQGAHSYKSCT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD APTAQPHDRPLTASSSLAPGQRVQNLHAYQSGRLSYDQQQQQQQQQQQQQQALQSRHHAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 APTAQPHDRPLTASSSLAPGQRVQNLHAYQSGRLSYDQQQQQQQQQQQQQQALQSRHHAQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD ETLHYQNLAKYQHYGQQGQGYCQPDAAVRTPEQYYQTFSPSSSHSPARSVGRSPSYSSTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ETLHYQNLAKYQHYGQQGQGYCQPDAAVRTPEQYYQTFSPSSSHSPARSVGRSPSYSSTP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD SPLMPNLENFPYSQQPLSTGAFPAGITDHSHFMPLLNPSPTDATSSVDTQAGNCKPLQKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SPLMPNLENFPYSQQPLSTGAFPAGITDHSHFMPLLNPSPTDATSSVDTQAGNCKPLQKD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD KLPENLLSDLSLQSLTALTSQVENISNTVQQLLLSKAAVPQKKGVKNLVSRTPEQHKSQH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KLPENLLSDLSLQSLTALTSQVENISNTVQQLLLSKAAVPQKKGVKNLVSRTPEQHKSQH
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD CSPEGSGYSAEPAGTPLSEPPSSTPQSTHAEPQEADYLSGSEDPLERSFLYCNQARGSPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CSPEGSGYSAEPAGTPLSEPPSSTPQSTHAEPQEADYLSGSEDPLERSFLYCNQARGSPA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD RVNSNSKAKPESVSTCSVTSPDDMSTKSDDSFQSLHGSLPLDSFSKFVAGERDCPRLLLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RVNSNSKAKPESVSTCSVTSPDDMSTKSDDSFQSLHGSLPLDSFSKFVAGERDCPRLLLS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD ALAQEDLASEILGLQEAIGEKADKAWAEAPSLVKDSSKPPFSLENHSACLDSVAKSAWPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ALAQEDLASEILGLQEAIGEKADKAWAEAPSLVKDSSKPPFSLENHSACLDSVAKSAWPR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD PGEPEALPDSLQLDKGGNAKDFSPGLFEDPSVAFATPDPKKTTGPLSFGTKPTLGVPAPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PGEPEALPDSLQLDKGGNAKDFSPGLFEDPSVAFATPDPKKTTGPLSFGTKPTLGVPAPD
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD PTTAAFDCFPDTTAASSADSANPFAWPEENLGDACPRWGLHPGELTKGLEQGGKASDGIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PTTAAFDCFPDTTAASSADSANPFAWPEENLGDACPRWGLHPGELTKGLEQGGKASDGIS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD KGDTHEASACLGFQEEDPPGEKVASLPGDFKQEEVGGVKEEAGGLLQCPEVAKADRWLED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KGDTHEASACLGFQEEDPPGEKVASLPGDFKQEEVGGVKEEAGGLLQCPEVAKADRWLED
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD SRHCCSTADFGDLPLLPPTSRKEDLEAEEEYSSLCELLGSPEQRPGMQDPLSPKAPLICT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SRHCCSTADFGDLPLLPPTSRKEDLEAEEEYSSLCELLGSPEQRPGMQDPLSPKAPLICT
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD KEEVEEVLDSKAGWGSPCHLSGESVILLGPTVGTESKVQSWFESSLSHMKPGEEGPDGER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KEEVEEVLDSKAGWGSPCHLSGESVILLGPTVGTESKVQSWFESSLSHMKPGEEGPDGER
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD APGDSTTSDASLAQKPNKPAVPEAPIAKKEPVPRGKSLRSRRVHRGLPEAEDSPCRAPVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 APGDSTTSDASLAQKPNKPAVPEAPIAKKEPVPRGKSLRSRRVHRGLPEAEDSPCRAPVL
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD PKDLLLPESCTGPPQGQMEGAGAPGRGASEGLPRMCTRSLTALSEPRTPGPPGLTTTPAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PKDLLLPESCTGPPQGQMEGAGAPGRGASEGLPRMCTRSLTALSEPRTPGPPGLTTTPAP
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD PDKLGGKQRAAFKSGKRVGKPSPKAASSPSNPAALPVASDSSPMGSKTKETDSPSTPGKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PDKLGGKQRAAFKSGKRVGKPSPKAASSPSNPAALPVASDSSPMGSKTKETDSPSTPGKD
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD QRSMILRSRTKTQEIFHSKRRRPSEGRLPNCRATKKLLDNSHLPATFKVSSSPQKEGRVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QRSMILRSRTKTQEIFHSKRRRPSEGRLPNCRATKKLLDNSHLPATFKVSSSPQKEGRVS
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD QRARVPKPGAGSKLSDRPLHALKRKSAFMAPVPTKKRNLVLRSRSSSSSNASGNGGDGKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QRARVPKPGAGSKLSDRPLHALKRKSAFMAPVPTKKRNLVLRSRSSSSSNASGNGGDGKE
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD ERPEGSPTLFKRMSSPKKAKPTKGNGEPATKLPPPETPDACLKLASRAAFQGAMKTKVLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ERPEGSPTLFKRMSSPKKAKPTKGNGEPATKLPPPETPDACLKLASRAAFQGAMKTKVLP
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD PRKGRGLKLEAIVQKITSPSLKKFACKAPGASPGNPLSPSLSDKDRGLKGAGGSPVGVEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PRKGRGLKLEAIVQKITSPSLKKFACKAPGASPGNPLSPSLSDKDRGLKGAGGSPVGVEE
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KSD GLVNVGTGQKLPTSGADPLCRNPTNRSLKGKLMNSKKLSSTDCFKTEAFTSPEALQPGGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GLVNVGTGQKLPTSGADPLCRNPTNRSLKGKLMNSKKLSSTDCFKTEAFTSPEALQPGGT
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KSD ALAPKKRSRKGRAGAHGLSKGPLEKRPYLGPALLLTPRDRASGTQGASEDNSGGGGKKPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ALAPKKRSRKGRAGAHGLSKGPLEKRPYLGPALLLTPRDRASGTQGASEDNSGGGGKKPK
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KSD MEELGLASQPPEGRPCQPQTRAQKQPGHTNYSSYSKRKRLTRGRAKNTTSSPCKGRAKRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MEELGLASQPPEGRPCQPQTRAQKQPGHTNYSSYSKRKRLTRGRAKNTTSSPCKGRAKRR
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KSD RQQQVLPLDPAEPEIRLKYISSCKRLRSDSRTPAFSPLEPSLGAQNPRSGQNAPPAPADA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
XP_016 RQQQVLPLDPAEPEIRLKYISSCKRLRSDSRTPAFSPFVRVEKRDAFTTICTVVNSPGDA
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640
pF1KSD RPLCTTRDRRAYSAREQGQR
XP_016 PKPHRKPSSSASSSSSSSSFSLDAAGASLATLPGGSILQPRPSLPLSSTMHLGPVVSKAL
1630 1640 1650 1660 1670 1680
>>XP_016879517 (OMIM: 182290,607642) PREDICTED: retinoic (1967 aa)
initn: 10906 init1: 10906 opt: 10906 Z-score: 4972.6 bits: 933.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 10906; 99.9% identity (100.0% similar) in 1598 aa overlap (1-1598:1-1598)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MQSFRERCGFHGKQQNYQQTSQETSRLENYRQPSQAGLSCDRQRLLAKDYYNPQPYPSYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MQSFRERCGFHGKQQNYQQTSQETSRLENYRQPSQAGLSCDRQRLLAKDYYNPQPYPSYE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD GGAGTPSGTAAAVAADKYHRGSKALPTQQGLQGRPAFPGYGVQDSSPYPGRYAGEESLQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GGAGTPSGTAAAVAADKYHRGSKALPTQQGLQGRPAFPGYGVQDSSPYPGRYAGEESLQA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD WGAPQPPPPQPQPLPAGVAKYDENLMKKTAVPPSRQYAEQGAQVPFRTHSLHVQQPPPPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 WGAPQPPPPQPQPLPAGVAKYDENLMKKTAVPPSRQYAEQGAQVPFRTHSLHVQQPPPPQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD QPLAYPKLQRQKLQNDIASPLPFPQGTHFPQHSQSFPTSSTYSSSVQGGGQGAHSYKSCT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QPLAYPKLQRQKLQNDIASPLPFPQGTHFPQHSQSFPTSSTYSSSVQGGGQGAHSYKSCT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD APTAQPHDRPLTASSSLAPGQRVQNLHAYQSGRLSYDQQQQQQQQQQQQQQALQSRHHAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 APTAQPHDRPLTASSSLAPGQRVQNLHAYQSGRLSYDQQQQQQQQQQQQQQALQSRHHAQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD ETLHYQNLAKYQHYGQQGQGYCQPDAAVRTPEQYYQTFSPSSSHSPARSVGRSPSYSSTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ETLHYQNLAKYQHYGQQGQGYCQPDAAVRTPEQYYQTFSPSSSHSPARSVGRSPSYSSTP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD SPLMPNLENFPYSQQPLSTGAFPAGITDHSHFMPLLNPSPTDATSSVDTQAGNCKPLQKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SPLMPNLENFPYSQQPLSTGAFPAGITDHSHFMPLLNPSPTDATSSVDTQAGNCKPLQKD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD KLPENLLSDLSLQSLTALTSQVENISNTVQQLLLSKAAVPQKKGVKNLVSRTPEQHKSQH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KLPENLLSDLSLQSLTALTSQVENISNTVQQLLLSKAAVPQKKGVKNLVSRTPEQHKSQH
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD CSPEGSGYSAEPAGTPLSEPPSSTPQSTHAEPQEADYLSGSEDPLERSFLYCNQARGSPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CSPEGSGYSAEPAGTPLSEPPSSTPQSTHAEPQEADYLSGSEDPLERSFLYCNQARGSPA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD RVNSNSKAKPESVSTCSVTSPDDMSTKSDDSFQSLHGSLPLDSFSKFVAGERDCPRLLLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RVNSNSKAKPESVSTCSVTSPDDMSTKSDDSFQSLHGSLPLDSFSKFVAGERDCPRLLLS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD ALAQEDLASEILGLQEAIGEKADKAWAEAPSLVKDSSKPPFSLENHSACLDSVAKSAWPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ALAQEDLASEILGLQEAIGEKADKAWAEAPSLVKDSSKPPFSLENHSACLDSVAKSAWPR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD PGEPEALPDSLQLDKGGNAKDFSPGLFEDPSVAFATPDPKKTTGPLSFGTKPTLGVPAPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PGEPEALPDSLQLDKGGNAKDFSPGLFEDPSVAFATPDPKKTTGPLSFGTKPTLGVPAPD
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD PTTAAFDCFPDTTAASSADSANPFAWPEENLGDACPRWGLHPGELTKGLEQGGKASDGIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PTTAAFDCFPDTTAASSADSANPFAWPEENLGDACPRWGLHPGELTKGLEQGGKASDGIS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD KGDTHEASACLGFQEEDPPGEKVASLPGDFKQEEVGGVKEEAGGLLQCPEVAKADRWLED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KGDTHEASACLGFQEEDPPGEKVASLPGDFKQEEVGGVKEEAGGLLQCPEVAKADRWLED
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD SRHCCSTADFGDLPLLPPTSRKEDLEAEEEYSSLCELLGSPEQRPGMQDPLSPKAPLICT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SRHCCSTADFGDLPLLPPTSRKEDLEAEEEYSSLCELLGSPEQRPGMQDPLSPKAPLICT
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD KEEVEEVLDSKAGWGSPCHLSGESVILLGPTVGTESKVQSWFESSLSHMKPGEEGPDGER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KEEVEEVLDSKAGWGSPCHLSGESVILLGPTVGTESKVQSWFESSLSHMKPGEEGPDGER
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD APGDSTTSDASLAQKPNKPAVPEAPIAKKEPVPRGKSLRSRRVHRGLPEAEDSPCRAPVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 APGDSTTSDASLAQKPNKPAVPEAPIAKKEPVPRGKSLRSRRVHRGLPEAEDSPCRAPVL
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD PKDLLLPESCTGPPQGQMEGAGAPGRGASEGLPRMCTRSLTALSEPRTPGPPGLTTTPAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PKDLLLPESCTGPPQGQMEGAGAPGRGASEGLPRMCTRSLTALSEPRTPGPPGLTTTPAP
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD PDKLGGKQRAAFKSGKRVGKPSPKAASSPSNPAALPVASDSSPMGSKTKETDSPSTPGKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PDKLGGKQRAAFKSGKRVGKPSPKAASSPSNPAALPVASDSSPMGSKTKETDSPSTPGKD
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD QRSMILRSRTKTQEIFHSKRRRPSEGRLPNCRATKKLLDNSHLPATFKVSSSPQKEGRVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QRSMILRSRTKTQEIFHSKRRRPSEGRLPNCRATKKLLDNSHLPATFKVSSSPQKEGRVS
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD QRARVPKPGAGSKLSDRPLHALKRKSAFMAPVPTKKRNLVLRSRSSSSSNASGNGGDGKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QRARVPKPGAGSKLSDRPLHALKRKSAFMAPVPTKKRNLVLRSRSSSSSNASGNGGDGKE
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD ERPEGSPTLFKRMSSPKKAKPTKGNGEPATKLPPPETPDACLKLASRAAFQGAMKTKVLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ERPEGSPTLFKRMSSPKKAKPTKGNGEPATKLPPPETPDACLKLASRAAFQGAMKTKVLP
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD PRKGRGLKLEAIVQKITSPSLKKFACKAPGASPGNPLSPSLSDKDRGLKGAGGSPVGVEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PRKGRGLKLEAIVQKITSPSLKKFACKAPGASPGNPLSPSLSDKDRGLKGAGGSPVGVEE
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KSD GLVNVGTGQKLPTSGADPLCRNPTNRSLKGKLMNSKKLSSTDCFKTEAFTSPEALQPGGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GLVNVGTGQKLPTSGADPLCRNPTNRSLKGKLMNSKKLSSTDCFKTEAFTSPEALQPGGT
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KSD ALAPKKRSRKGRAGAHGLSKGPLEKRPYLGPALLLTPRDRASGTQGASEDNSGGGGKKPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ALAPKKRSRKGRAGAHGLSKGPLEKRPYLGPALLLTPRDRASGTQGASEDNSGGGGKKPK
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KSD MEELGLASQPPEGRPCQPQTRAQKQPGHTNYSSYSKRKRLTRGRAKNTTSSPCKGRAKRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MEELGLASQPPEGRPCQPQTRAQKQPGHTNYSSYSKRKRLTRGRAKNTTSSPCKGRAKRR
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KSD RQQQVLPLDPAEPEIRLKYISSCKRLRSDSRTPAFSPLEPSLGAQNPRSGQNAPPAPADA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
XP_016 RQQQVLPLDPAEPEIRLKYISSCKRLRSDSRTPAFSPFVRVEKRDAFTTICTVVNSPGDA
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640
pF1KSD RPLCTTRDRRAYSAREQGQR
XP_016 PKPHRKPSSSASSSSSSSSFSLDAAGASLATLPGGSILQPRPSLPLSSTMHLGPVVSKAL
1630 1640 1650 1660 1670 1680
>>XP_016879514 (OMIM: 182290,607642) PREDICTED: retinoic (1967 aa)
initn: 10906 init1: 10906 opt: 10906 Z-score: 4972.6 bits: 933.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 10906; 99.9% identity (100.0% similar) in 1598 aa overlap (1-1598:1-1598)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MQSFRERCGFHGKQQNYQQTSQETSRLENYRQPSQAGLSCDRQRLLAKDYYNPQPYPSYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MQSFRERCGFHGKQQNYQQTSQETSRLENYRQPSQAGLSCDRQRLLAKDYYNPQPYPSYE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD GGAGTPSGTAAAVAADKYHRGSKALPTQQGLQGRPAFPGYGVQDSSPYPGRYAGEESLQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GGAGTPSGTAAAVAADKYHRGSKALPTQQGLQGRPAFPGYGVQDSSPYPGRYAGEESLQA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD WGAPQPPPPQPQPLPAGVAKYDENLMKKTAVPPSRQYAEQGAQVPFRTHSLHVQQPPPPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 WGAPQPPPPQPQPLPAGVAKYDENLMKKTAVPPSRQYAEQGAQVPFRTHSLHVQQPPPPQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD QPLAYPKLQRQKLQNDIASPLPFPQGTHFPQHSQSFPTSSTYSSSVQGGGQGAHSYKSCT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QPLAYPKLQRQKLQNDIASPLPFPQGTHFPQHSQSFPTSSTYSSSVQGGGQGAHSYKSCT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD APTAQPHDRPLTASSSLAPGQRVQNLHAYQSGRLSYDQQQQQQQQQQQQQQALQSRHHAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 APTAQPHDRPLTASSSLAPGQRVQNLHAYQSGRLSYDQQQQQQQQQQQQQQALQSRHHAQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD ETLHYQNLAKYQHYGQQGQGYCQPDAAVRTPEQYYQTFSPSSSHSPARSVGRSPSYSSTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ETLHYQNLAKYQHYGQQGQGYCQPDAAVRTPEQYYQTFSPSSSHSPARSVGRSPSYSSTP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD SPLMPNLENFPYSQQPLSTGAFPAGITDHSHFMPLLNPSPTDATSSVDTQAGNCKPLQKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SPLMPNLENFPYSQQPLSTGAFPAGITDHSHFMPLLNPSPTDATSSVDTQAGNCKPLQKD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD KLPENLLSDLSLQSLTALTSQVENISNTVQQLLLSKAAVPQKKGVKNLVSRTPEQHKSQH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KLPENLLSDLSLQSLTALTSQVENISNTVQQLLLSKAAVPQKKGVKNLVSRTPEQHKSQH
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD CSPEGSGYSAEPAGTPLSEPPSSTPQSTHAEPQEADYLSGSEDPLERSFLYCNQARGSPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CSPEGSGYSAEPAGTPLSEPPSSTPQSTHAEPQEADYLSGSEDPLERSFLYCNQARGSPA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD RVNSNSKAKPESVSTCSVTSPDDMSTKSDDSFQSLHGSLPLDSFSKFVAGERDCPRLLLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RVNSNSKAKPESVSTCSVTSPDDMSTKSDDSFQSLHGSLPLDSFSKFVAGERDCPRLLLS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD ALAQEDLASEILGLQEAIGEKADKAWAEAPSLVKDSSKPPFSLENHSACLDSVAKSAWPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ALAQEDLASEILGLQEAIGEKADKAWAEAPSLVKDSSKPPFSLENHSACLDSVAKSAWPR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD PGEPEALPDSLQLDKGGNAKDFSPGLFEDPSVAFATPDPKKTTGPLSFGTKPTLGVPAPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PGEPEALPDSLQLDKGGNAKDFSPGLFEDPSVAFATPDPKKTTGPLSFGTKPTLGVPAPD
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD PTTAAFDCFPDTTAASSADSANPFAWPEENLGDACPRWGLHPGELTKGLEQGGKASDGIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PTTAAFDCFPDTTAASSADSANPFAWPEENLGDACPRWGLHPGELTKGLEQGGKASDGIS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD KGDTHEASACLGFQEEDPPGEKVASLPGDFKQEEVGGVKEEAGGLLQCPEVAKADRWLED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KGDTHEASACLGFQEEDPPGEKVASLPGDFKQEEVGGVKEEAGGLLQCPEVAKADRWLED
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD SRHCCSTADFGDLPLLPPTSRKEDLEAEEEYSSLCELLGSPEQRPGMQDPLSPKAPLICT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SRHCCSTADFGDLPLLPPTSRKEDLEAEEEYSSLCELLGSPEQRPGMQDPLSPKAPLICT
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD KEEVEEVLDSKAGWGSPCHLSGESVILLGPTVGTESKVQSWFESSLSHMKPGEEGPDGER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KEEVEEVLDSKAGWGSPCHLSGESVILLGPTVGTESKVQSWFESSLSHMKPGEEGPDGER
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD APGDSTTSDASLAQKPNKPAVPEAPIAKKEPVPRGKSLRSRRVHRGLPEAEDSPCRAPVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 APGDSTTSDASLAQKPNKPAVPEAPIAKKEPVPRGKSLRSRRVHRGLPEAEDSPCRAPVL
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD PKDLLLPESCTGPPQGQMEGAGAPGRGASEGLPRMCTRSLTALSEPRTPGPPGLTTTPAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PKDLLLPESCTGPPQGQMEGAGAPGRGASEGLPRMCTRSLTALSEPRTPGPPGLTTTPAP
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD PDKLGGKQRAAFKSGKRVGKPSPKAASSPSNPAALPVASDSSPMGSKTKETDSPSTPGKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PDKLGGKQRAAFKSGKRVGKPSPKAASSPSNPAALPVASDSSPMGSKTKETDSPSTPGKD
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD QRSMILRSRTKTQEIFHSKRRRPSEGRLPNCRATKKLLDNSHLPATFKVSSSPQKEGRVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QRSMILRSRTKTQEIFHSKRRRPSEGRLPNCRATKKLLDNSHLPATFKVSSSPQKEGRVS
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD QRARVPKPGAGSKLSDRPLHALKRKSAFMAPVPTKKRNLVLRSRSSSSSNASGNGGDGKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QRARVPKPGAGSKLSDRPLHALKRKSAFMAPVPTKKRNLVLRSRSSSSSNASGNGGDGKE
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD ERPEGSPTLFKRMSSPKKAKPTKGNGEPATKLPPPETPDACLKLASRAAFQGAMKTKVLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ERPEGSPTLFKRMSSPKKAKPTKGNGEPATKLPPPETPDACLKLASRAAFQGAMKTKVLP
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD PRKGRGLKLEAIVQKITSPSLKKFACKAPGASPGNPLSPSLSDKDRGLKGAGGSPVGVEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PRKGRGLKLEAIVQKITSPSLKKFACKAPGASPGNPLSPSLSDKDRGLKGAGGSPVGVEE
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KSD GLVNVGTGQKLPTSGADPLCRNPTNRSLKGKLMNSKKLSSTDCFKTEAFTSPEALQPGGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GLVNVGTGQKLPTSGADPLCRNPTNRSLKGKLMNSKKLSSTDCFKTEAFTSPEALQPGGT
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KSD ALAPKKRSRKGRAGAHGLSKGPLEKRPYLGPALLLTPRDRASGTQGASEDNSGGGGKKPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ALAPKKRSRKGRAGAHGLSKGPLEKRPYLGPALLLTPRDRASGTQGASEDNSGGGGKKPK
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KSD MEELGLASQPPEGRPCQPQTRAQKQPGHTNYSSYSKRKRLTRGRAKNTTSSPCKGRAKRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MEELGLASQPPEGRPCQPQTRAQKQPGHTNYSSYSKRKRLTRGRAKNTTSSPCKGRAKRR
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KSD RQQQVLPLDPAEPEIRLKYISSCKRLRSDSRTPAFSPLEPSLGAQNPRSGQNAPPAPADA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
XP_016 RQQQVLPLDPAEPEIRLKYISSCKRLRSDSRTPAFSPFVRVEKRDAFTTICTVVNSPGDA
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640
pF1KSD RPLCTTRDRRAYSAREQGQR
XP_016 PKPHRKPSSSASSSSSSSSFSLDAAGASLATLPGGSILQPRPSLPLSSTMHLGPVVSKAL
1630 1640 1650 1660 1670 1680
>>XP_011528656 (OMIM: 603107) PREDICTED: transcription f (1938 aa)
initn: 579 init1: 296 opt: 793 Z-score: 375.4 bits: 82.6 E(85289): 3.6e-14
Smith-Waterman score: 1072; 25.6% identity (51.9% similar) in 1745 aa overlap (1-1597:1-1633)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MQSFRERCGFHGKQQNYQQTSQETSRLENYRQPSQAGLSCDRQRLLAKDYYNPQPYPSYE
::::::. ..::.::.: : . .::::.. .: :: : . . . :
XP_011 MQSFREQSSYHGNQQSYPQEVHGSSRLEEF-SPRQA------QMFQNFGGTGGSSGSSGS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KSD GGAGTPSGTAAAVAA----DKYHRGSKALPTQQGLQGRPAFPGYGVQDSSPYPGRYAGEE
:..: :.:::.:: . :.: ... . : : : ..: : .
XP_011 GSGGGRRGAAAAAAAMASETSGHQGYQGFRKEAGDFYYMAGNKDPVTTGTPQPPQRRPSG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KSD SLQAWGAPQPPP-----------PQPQPLPAG---VAKYDENLMKKTAVPPSRQYAEQGA
.:..: :: : : .: :..:... . : : :: .:..
XP_011 PVQSYGPPQGSSFGNQYGSEGHVGQFQAQHSGLGGVSHYQQDYTGPFS-PGSAQYQQQAS
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200
pF1KSD ------QVPFRTHSLHVQQPPPPQQPLAYPKLQRQKLQNDIASPLPFPQGT--------H
:: ..:. .. : :: . : . ..:: . : .:... .
XP_011 SQQQQQQVQQLRQQLYQSHQPLPQAT-GQPASSSSHLQ-PMQRPSTLPSSAAGYQLRVGQ
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KSD FPQHSQSFPTSSTYSS--SVQGGGQGAHSYK-SCTAPTAQPHDRPLTASSSLAPGQRVQN
: :: :: .::. :: : : .:...:: : .. ... .. ..:.. : : .:.
XP_011 FGQHYQSSASSSSSSSFPSPQRFSQSGQSYDGSYNVNAGSQYEGHNVGSNAQAYG--TQS
240 250 260 270 280
270 280 290 300 310 320
pF1KSD LHAYQSGRL-SYDQQQ--QQQQQQQQQQQALQSRHHAQETLHYQNLA-KYQHYGQQGQGY
..:: . ...: . : :: ::::: :..: .:....: : : : .: :: :
XP_011 NYSYQPQSMKNFEQAKIPQGTQQGQQQQQPQQQQHPSQHVMQYTNAATKLPLQSQVGQ-Y
290 300 310 320 330 340
330 340 350 360 370 380
pF1KSD CQPDAAVRTPEQYYQTFSPSSSHSPARSVGRSPSYSSTPSPLMPNLENFPYSQQPLSTGA
::.. ::.: :..:.::: :. ::: :: .::: :::::::: . ::. .: :.
XP_011 NQPEVPVRSPMQFHQNFSPISNPSPAASVVQSPSCSSTPSPLMQTGENLQCGQ-----GS
350 360 370 380 390 400
390 400 410 420 430 440
pF1KSD FPAGITDHS-HFMPLLNPSPTDATSSVDTQAGNCKPLQKDKLPENLLSDLSLQSLTALTS
: : .. ..:: :.:.:. : ...:.. : . . .::. :.: .:.::.::..
XP_011 VPMGSRNRILQLMPQLSPTPS-MMPSPNSHAAGFKGFGLEGVPEKRLTDPGLSSLSALST
410 420 430 440 450 460
450 460 470 480 490
pF1KSD QVENISNTVQQLLLSKAAVPQKKGVKNLVSRTPEQHKSQHCS-PEGSGYSAEPAGTPLSE
:: :. ::::..::: : .:::: : : ..:.. :. :::. : .:..:
XP_011 QVANLPNTVQHMLLSDALTPQKKTSK----RPSSSKKADSCTNSEGSSQPEEQLKSPMAE
470 480 490 500 510
500 510 520 530 540 550
pF1KSD P-PSSTPQSTHAEPQEADYLSGSEDPLERSFL--YCNQARGSPARVNSNSKAKPESVSTC
.. .:.. . ... :::. . .. ..: .:::. ... .: ...
XP_011 SLDGGCSSSSEDQGERVRQLSGQSTSSDTTYKGGASEKAGSSPAQ---GAQNEPPRLNAS
520 530 540 550 560 570
560 570 580 590 600 610
pF1KSD SVTSPDDMSTKSDDSFQSLHGSLPLDSFSKFVAGERDCPRLLLSALAQEDLASEILGLQE
.. . : . : .::.: .. ..:. .. ..: ..... :
XP_011 PAAREEATSPGAKD--------MPLSSDGNPKVNEKTVGVIV----SREAMTGRV----E
580 590 600 610
620 630 640 650 660 670
pF1KSD AIGEKADKAWAEAPSLVKDSSKPPFSLENHSACLDSVAKSAWPRPGEPEALPDSLQLDKG
: . . . :. ...:: : .: : :. :.: . . . :..
XP_011 KPGGQDKGSQEDDPAA---TQRPP---SNGGAKETSHASLPQPEPPGGGGSKGNKNGDNN
620 630 640 650 660 670
680 690 700 710 720 730
pF1KSD GNAKDFSPGLFEDPSVA--FAT-PDPKKTTGPLSFGTKPTLGVPAPDPTTAAFDCFPDTT
.: . . : ... :.. .:.:. : : .. : ..: .: ....: .: :
XP_011 SNHNGEGNGQSGHSAAGPGFTSRTEPSKSPGSLRYSYKDSFGSAVPR-NVSGFPQYP--T
680 690 700 710 720
740 750 760 770 780 790
pF1KSD AASSADSANPFAWPEENLGDACPRWGLHPGELTKGLEQGGKASDGISKGDTHEASACLGF
. ..: :. : : : :. : . :. . : . .:.: .. :
XP_011 GQEKGD----FTGHGERKG----RNEKFPSLLQEVLQGYHHHPDRRYSRSTQEHQGMAGS
730 740 750 760 770 780
800 810 820 830 840 850
pF1KSD QEEDPPGEKVASLPGDFKQEEVGGVKEEAGGLLQCPEVAKADRWLEDSRHCCSTA-DFGD
: . ..: ... .. : ... :.::. :. : :. ::: .. .
XP_011 LEGTTRPNVLVSQTNELASR--GLLNKSIGSLLENPH------WGPWERKSSSTAPEMKQ
790 800 810 820 830
860 870 880 890 900
pF1KSD LPLLP-PTSRKEDLEAEEEYSSLCELLGSPEQRPGMQDPLSPKAPLICTKEEVEEVL---
. : : :: ..: . :: : :: .: .. .:: .. .. . :
XP_011 INLTDYPIPRKFEIEPQ---SSAHEPGGSLSERRSVICDISPLRQIV--RDPGAHSLGHM
840 850 860 870 880
910 920 930 940
pF1KSD --DSKAGWGSPCHLS-GESVILLGPTVGTESKVQSW--------FESSLS----------
:.. : .. . . ..:::: : :. :.:..: ::.: :
XP_011 SADTRIGRNDRLNPTLSQSVILPGGLVSMETKLKSQSGQIKEEDFEQSKSQASFNNKKSG
890 900 910 920 930 940
950 960 970 980 990
pF1KSD -HMKPG---EEGPDGERAPGDSTTSDAS-LAQKPNKPA-VPEAP--IAKKEPVPRGKSLR
: .: .:. :. .:: .: .. : . . ..:. . ..: .. .: . ::.:
XP_011 DHCHPPSIKHESYRGNASPGAATHDSLSDYGPQDSRPTPMRRVPGRVGGREGM-RGRS--
950 960 970 980 990 1000
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KSD SRRVHRGLPEAEDSP--CRAPVLPKDLLLPESCTGPPQGQMEGAGAPGRGASEGLPRMCT
. : . . :: :.: . :. : ... . .: :: : .
XP_011 PSQYHDFAEKLKMSPGRSRGPGGDPHHMNPHM-TFSERANRSSLHTPFSPNSETL----A
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1060 1070 1080 1090 1100
pF1KSD RSLTALSEPRTPGPP--GLTTTPAPPDKLGGKQRAAFK---SGKRVG--------KPSPK
. : .. .. : : ::.. .. .: .: ::. : . .:.
XP_011 SAYHANTRAHAYGDPNAGLNSQLHYKRQMYQQQPEEYKDWSSGSAQGVIAAAQHRQEGPR
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1110 1120 1130 1140
pF1KSD AASSPSNPAAL-----PVASDSSPM--GSKTKETDSPS----------TPGKDQRSMILR
.:: . : :. .:.. : : . .:: . : ...: :.
XP_011 --KSPRQQQFLDRVRSPLKNDKDGMMYGPPVGTYHDPSAQEAGRCLMSSDGLPNKGMELK
1130 1140 1150 1160 1170
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD SRT-KTQEIFH--SKRRRPSEGRLPNCRATKKLLDNSHLPATFKVSSSPQ--KEGRVSQR
. : :: :.. :... : ...: : .. . : : : : :
XP_011 HGSQKLQESCWDLSRQTSPAKSSGPPGMSSQKRYGPPHETDGHGLAEATQSSKPGSVMLR
1180 1190 1200 1210 1220 1230
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD ARVPKPGAGSKLSDRPLHALKRKSAFMAPVPTKKRNLVLRSRSSSSSNASGNGGDGKEER
:: .. :. :: .: .:..:.:.:... ... ::.. .: ...:
XP_011 L----PGQEDHSSQNPLIMRRRVRSFISPIPSKRQSQDVKN---SSTEDKGRLLHSSKEG
1240 1250 1260 1270 1280 1290
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD PEGSPTLFKRMSSPKKAKPTKGNGEPATKLPPPETPDACLKLASRAAFQGAMKTKVLPPR
. . . . ..: . : . . . . :: :.. . : ... . :::.::::
XP_011 ADKAFNSYAHLSHSQDIK-SIPKRDSSKDLPSPDSRN-C----PAVTLTSPAKTKILPPR
1300 1310 1320 1330 1340
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD KGRGLKLEAIVQKITSPSLKKFACKAPGASPGNPLSPSLSDKDRGLKGAGGSPVGVEEGL
:::::::::::::::::.... : . . . :. . .:.: :. .: : : :
XP_011 KGRGLKLEAIVQKITSPNIRRSASSNSAEAGGDTV--TLDDI---LSLKSGPPEG---GS
1350 1360 1370 1380 1390
1390 1400 1410 1420 1430
pF1KSD VNVGTGQKLPTSG--ADPLCRNPTNRSL--KGKLMNSK---KLSSTDCFKTE--AFTSPE
: : .. .: :. : .:.:. : . : :. . : : ::: : :
XP_011 VAVQDADIEKRKGEVASDLV-SPANQELHVEKPLPRSSEEWRGSVDDKVKTETHAETVTA
1400 1410 1420 1430 1440 1450
1440 1450 1460 1470 1480
pF1KSD ALQPGG---TALAPKKRSRKGRAGAHGLSKGPL--EKRPYLGPALLLTPR------DRAS
. .: : .. . : : .:: . . .:: . :. .:.:. .. .
XP_011 GKEPPGAMTSTTSQKPGSNQGRPDGSLGGTAPLIFPDSKNVPPVGILAPEANPKAEEKEN
1460 1470 1480 1490 1500 1510
1490 1500 1510 1520 1530
pF1KSD GTQGASEDNSG----G---GGKKPKMEELG-LASQPPEGRPCQPQTRAQKQP-GHTNYSS
: : . : : .::: : . .: . .: . .: : . . : : ..
XP_011 DTVTISPKQEGFPPKGYFPSGKK-KGRPIGSVNKQKKQQQPPPPPPQPPQIPEGSADGEP
1520 1530 1540 1550 1560 1570
1540 1550 1560 1570 1580 1590
pF1KSD YSKRKRLTRGRAKNTTSSPCKGRAKRRRQQQVLPL-DPAEPEIRLKYISSCKRLRSDSRT
:..: : : : ..: ..:. .:..:. .: ::::.::: .. ..:...
XP_011 KPKKQRQRRERRK-PGAQP-----RKRKTKQAVPIVEPQEPEIKLKYATQ-PLDKTDAKN
1580 1590 1600 1610 1620
1600 1610 1620 1630 1640
pF1KSD PAFSPLEPSLGAQNPRSGQNAPPAPADARPLCTTRDRRAYSAREQGQR
.: :
XP_011 KSFYPYIHVVNKCELGAVCTIINAEEEEQTKLVRGRKGQRSLTPPPSSTESKALPASSFM
1630 1640 1650 1660 1670 1680
>>NP_852469 (OMIM: 603107) transcription factor 20 isofo (1938 aa)
initn: 579 init1: 296 opt: 793 Z-score: 375.4 bits: 82.6 E(85289): 3.6e-14
Smith-Waterman score: 1072; 25.6% identity (51.9% similar) in 1745 aa overlap (1-1597:1-1633)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MQSFRERCGFHGKQQNYQQTSQETSRLENYRQPSQAGLSCDRQRLLAKDYYNPQPYPSYE
::::::. ..::.::.: : . .::::.. .: :: : . . . :
NP_852 MQSFREQSSYHGNQQSYPQEVHGSSRLEEF-SPRQA------QMFQNFGGTGGSSGSSGS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KSD GGAGTPSGTAAAVAA----DKYHRGSKALPTQQGLQGRPAFPGYGVQDSSPYPGRYAGEE
:..: :.:::.:: . :.: ... . : : : ..: : .
NP_852 GSGGGRRGAAAAAAAMASETSGHQGYQGFRKEAGDFYYMAGNKDPVTTGTPQPPQRRPSG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KSD SLQAWGAPQPPP-----------PQPQPLPAG---VAKYDENLMKKTAVPPSRQYAEQGA
.:..: :: : : .: :..:... . : : :: .:..
NP_852 PVQSYGPPQGSSFGNQYGSEGHVGQFQAQHSGLGGVSHYQQDYTGPFS-PGSAQYQQQAS
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200
pF1KSD ------QVPFRTHSLHVQQPPPPQQPLAYPKLQRQKLQNDIASPLPFPQGT--------H
:: ..:. .. : :: . : . ..:: . : .:... .
NP_852 SQQQQQQVQQLRQQLYQSHQPLPQAT-GQPASSSSHLQ-PMQRPSTLPSSAAGYQLRVGQ
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KSD FPQHSQSFPTSSTYSS--SVQGGGQGAHSYK-SCTAPTAQPHDRPLTASSSLAPGQRVQN
: :: :: .::. :: : : .:...:: : .. ... .. ..:.. : : .:.
NP_852 FGQHYQSSASSSSSSSFPSPQRFSQSGQSYDGSYNVNAGSQYEGHNVGSNAQAYG--TQS
240 250 260 270 280
270 280 290 300 310 320
pF1KSD LHAYQSGRL-SYDQQQ--QQQQQQQQQQQALQSRHHAQETLHYQNLA-KYQHYGQQGQGY
..:: . ...: . : :: ::::: :..: .:....: : : : .: :: :
NP_852 NYSYQPQSMKNFEQAKIPQGTQQGQQQQQPQQQQHPSQHVMQYTNAATKLPLQSQVGQ-Y
290 300 310 320 330 340
330 340 350 360 370 380
pF1KSD CQPDAAVRTPEQYYQTFSPSSSHSPARSVGRSPSYSSTPSPLMPNLENFPYSQQPLSTGA
::.. ::.: :..:.::: :. ::: :: .::: :::::::: . ::. .: :.
NP_852 NQPEVPVRSPMQFHQNFSPISNPSPAASVVQSPSCSSTPSPLMQTGENLQCGQ-----GS
350 360 370 380 390 400
390 400 410 420 430 440
pF1KSD FPAGITDHS-HFMPLLNPSPTDATSSVDTQAGNCKPLQKDKLPENLLSDLSLQSLTALTS
: : .. ..:: :.:.:. : ...:.. : . . .::. :.: .:.::.::..
NP_852 VPMGSRNRILQLMPQLSPTPS-MMPSPNSHAAGFKGFGLEGVPEKRLTDPGLSSLSALST
410 420 430 440 450 460
450 460 470 480 490
pF1KSD QVENISNTVQQLLLSKAAVPQKKGVKNLVSRTPEQHKSQHCS-PEGSGYSAEPAGTPLSE
:: :. ::::..::: : .:::: : : ..:.. :. :::. : .:..:
NP_852 QVANLPNTVQHMLLSDALTPQKKTSK----RPSSSKKADSCTNSEGSSQPEEQLKSPMAE
470 480 490 500 510
500 510 520 530 540 550
pF1KSD P-PSSTPQSTHAEPQEADYLSGSEDPLERSFL--YCNQARGSPARVNSNSKAKPESVSTC
.. .:.. . ... :::. . .. ..: .:::. ... .: ...
NP_852 SLDGGCSSSSEDQGERVRQLSGQSTSSDTTYKGGASEKAGSSPAQ---GAQNEPPRLNAS
520 530 540 550 560 570
560 570 580 590 600 610
pF1KSD SVTSPDDMSTKSDDSFQSLHGSLPLDSFSKFVAGERDCPRLLLSALAQEDLASEILGLQE
.. . : . : .::.: .. ..:. .. ..: ..... :
NP_852 PAAREEATSPGAKD--------MPLSSDGNPKVNEKTVGVIV----SREAMTGRV----E
580 590 600 610
620 630 640 650 660 670
pF1KSD AIGEKADKAWAEAPSLVKDSSKPPFSLENHSACLDSVAKSAWPRPGEPEALPDSLQLDKG
: . . . :. ...:: : .: : :. :.: . . . :..
NP_852 KPGGQDKGSQEDDPAA---TQRPP---SNGGAKETSHASLPQPEPPGGGGSKGNKNGDNN
620 630 640 650 660 670
680 690 700 710 720 730
pF1KSD GNAKDFSPGLFEDPSVA--FAT-PDPKKTTGPLSFGTKPTLGVPAPDPTTAAFDCFPDTT
.: . . : ... :.. .:.:. : : .. : ..: .: ....: .: :
NP_852 SNHNGEGNGQSGHSAAGPGFTSRTEPSKSPGSLRYSYKDSFGSAVPR-NVSGFPQYP--T
680 690 700 710 720
740 750 760 770 780 790
pF1KSD AASSADSANPFAWPEENLGDACPRWGLHPGELTKGLEQGGKASDGISKGDTHEASACLGF
. ..: :. : : : :. : . :. . : . .:.: .. :
NP_852 GQEKGD----FTGHGERKG----RNEKFPSLLQEVLQGYHHHPDRRYSRSTQEHQGMAGS
730 740 750 760 770 780
800 810 820 830 840 850
pF1KSD QEEDPPGEKVASLPGDFKQEEVGGVKEEAGGLLQCPEVAKADRWLEDSRHCCSTA-DFGD
: . ..: ... .. : ... :.::. :. : :. ::: .. .
NP_852 LEGTTRPNVLVSQTNELASR--GLLNKSIGSLLENPH------WGPWERKSSSTAPEMKQ
790 800 810 820 830
860 870 880 890 900
pF1KSD LPLLP-PTSRKEDLEAEEEYSSLCELLGSPEQRPGMQDPLSPKAPLICTKEEVEEVL---
. : : :: ..: . :: : :: .: .. .:: .. .. . :
NP_852 INLTDYPIPRKFEIEPQ---SSAHEPGGSLSERRSVICDISPLRQIV--RDPGAHSLGHM
840 850 860 870 880
910 920 930 940
pF1KSD --DSKAGWGSPCHLS-GESVILLGPTVGTESKVQSW--------FESSLS----------
:.. : .. . . ..:::: : :. :.:..: ::.: :
NP_852 SADTRIGRNDRLNPTLSQSVILPGGLVSMETKLKSQSGQIKEEDFEQSKSQASFNNKKSG
890 900 910 920 930 940
950 960 970 980 990
pF1KSD -HMKPG---EEGPDGERAPGDSTTSDAS-LAQKPNKPA-VPEAP--IAKKEPVPRGKSLR
: .: .:. :. .:: .: .. : . . ..:. . ..: .. .: . ::.:
NP_852 DHCHPPSIKHESYRGNASPGAATHDSLSDYGPQDSRPTPMRRVPGRVGGREGM-RGRS--
950 960 970 980 990 1000
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KSD SRRVHRGLPEAEDSP--CRAPVLPKDLLLPESCTGPPQGQMEGAGAPGRGASEGLPRMCT
. : . . :: :.: . :. : ... . .: :: : .
NP_852 PSQYHDFAEKLKMSPGRSRGPGGDPHHMNPHM-TFSERANRSSLHTPFSPNSETL----A
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1060 1070 1080 1090 1100
pF1KSD RSLTALSEPRTPGPP--GLTTTPAPPDKLGGKQRAAFK---SGKRVG--------KPSPK
. : .. .. : : ::.. .. .: .: ::. : . .:.
NP_852 SAYHANTRAHAYGDPNAGLNSQLHYKRQMYQQQPEEYKDWSSGSAQGVIAAAQHRQEGPR
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1110 1120 1130 1140
pF1KSD AASSPSNPAAL-----PVASDSSPM--GSKTKETDSPS----------TPGKDQRSMILR
.:: . : :. .:.. : : . .:: . : ...: :.
NP_852 --KSPRQQQFLDRVRSPLKNDKDGMMYGPPVGTYHDPSAQEAGRCLMSSDGLPNKGMELK
1130 1140 1150 1160 1170
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD SRT-KTQEIFH--SKRRRPSEGRLPNCRATKKLLDNSHLPATFKVSSSPQ--KEGRVSQR
. : :: :.. :... : ...: : .. . : : : : :
NP_852 HGSQKLQESCWDLSRQTSPAKSSGPPGMSSQKRYGPPHETDGHGLAEATQSSKPGSVMLR
1180 1190 1200 1210 1220 1230
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD ARVPKPGAGSKLSDRPLHALKRKSAFMAPVPTKKRNLVLRSRSSSSSNASGNGGDGKEER
:: .. :. :: .: .:..:.:.:... ... ::.. .: ...:
NP_852 L----PGQEDHSSQNPLIMRRRVRSFISPIPSKRQSQDVKN---SSTEDKGRLLHSSKEG
1240 1250 1260 1270 1280 1290
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD PEGSPTLFKRMSSPKKAKPTKGNGEPATKLPPPETPDACLKLASRAAFQGAMKTKVLPPR
. . . . ..: . : . . . . :: :.. . : ... . :::.::::
NP_852 ADKAFNSYAHLSHSQDIK-SIPKRDSSKDLPSPDSRN-C----PAVTLTSPAKTKILPPR
1300 1310 1320 1330 1340
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD KGRGLKLEAIVQKITSPSLKKFACKAPGASPGNPLSPSLSDKDRGLKGAGGSPVGVEEGL
:::::::::::::::::.... : . . . :. . .:.: :. .: : : :
NP_852 KGRGLKLEAIVQKITSPNIRRSASSNSAEAGGDTV--TLDDI---LSLKSGPPEG---GS
1350 1360 1370 1380 1390
1390 1400 1410 1420 1430
pF1KSD VNVGTGQKLPTSG--ADPLCRNPTNRSL--KGKLMNSK---KLSSTDCFKTE--AFTSPE
: : .. .: :. : .:.:. : . : :. . : : ::: : :
NP_852 VAVQDADIEKRKGEVASDLV-SPANQELHVEKPLPRSSEEWRGSVDDKVKTETHAETVTA
1400 1410 1420 1430 1440 1450
1440 1450 1460 1470 1480
pF1KSD ALQPGG---TALAPKKRSRKGRAGAHGLSKGPL--EKRPYLGPALLLTPR------DRAS
. .: : .. . : : .:: . . .:: . :. .:.:. .. .
NP_852 GKEPPGAMTSTTSQKPGSNQGRPDGSLGGTAPLIFPDSKNVPPVGILAPEANPKAEEKEN
1460 1470 1480 1490 1500 1510
1490 1500 1510 1520 1530
pF1KSD GTQGASEDNSG----G---GGKKPKMEELG-LASQPPEGRPCQPQTRAQKQP-GHTNYSS
: : . : : .::: : . .: . .: . .: : . . : : ..
NP_852 DTVTISPKQEGFPPKGYFPSGKK-KGRPIGSVNKQKKQQQPPPPPPQPPQIPEGSADGEP
1520 1530 1540 1550 1560 1570
1540 1550 1560 1570 1580 1590
pF1KSD YSKRKRLTRGRAKNTTSSPCKGRAKRRRQQQVLPL-DPAEPEIRLKYISSCKRLRSDSRT
:..: : : : ..: ..:. .:..:. .: ::::.::: .. ..:...
NP_852 KPKKQRQRRERRK-PGAQP-----RKRKTKQAVPIVEPQEPEIKLKYATQ-PLDKTDAKN
1580 1590 1600 1610 1620
1600 1610 1620 1630 1640
pF1KSD PAFSPLEPSLGAQNPRSGQNAPPAPADARPLCTTRDRRAYSAREQGQR
.: :
NP_852 KSFYPYIHVVNKCELGAVCTIINAEEEEQTKLVRGRKGQRSLTPPPSSTESKALPASSFM
1630 1640 1650 1660 1670 1680
>>XP_011528655 (OMIM: 603107) PREDICTED: transcription f (1949 aa)
initn: 579 init1: 296 opt: 793 Z-score: 375.4 bits: 82.7 E(85289): 3.6e-14
Smith-Waterman score: 1072; 25.6% identity (51.9% similar) in 1745 aa overlap (1-1597:1-1633)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MQSFRERCGFHGKQQNYQQTSQETSRLENYRQPSQAGLSCDRQRLLAKDYYNPQPYPSYE
::::::. ..::.::.: : . .::::.. .: :: : . . . :
XP_011 MQSFREQSSYHGNQQSYPQEVHGSSRLEEF-SPRQA------QMFQNFGGTGGSSGSSGS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KSD GGAGTPSGTAAAVAA----DKYHRGSKALPTQQGLQGRPAFPGYGVQDSSPYPGRYAGEE
:..: :.:::.:: . :.: ... . : : : ..: : .
XP_011 GSGGGRRGAAAAAAAMASETSGHQGYQGFRKEAGDFYYMAGNKDPVTTGTPQPPQRRPSG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KSD SLQAWGAPQPPP-----------PQPQPLPAG---VAKYDENLMKKTAVPPSRQYAEQGA
.:..: :: : : .: :..:... . : : :: .:..
XP_011 PVQSYGPPQGSSFGNQYGSEGHVGQFQAQHSGLGGVSHYQQDYTGPFS-PGSAQYQQQAS
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200
pF1KSD ------QVPFRTHSLHVQQPPPPQQPLAYPKLQRQKLQNDIASPLPFPQGT--------H
:: ..:. .. : :: . : . ..:: . : .:... .
XP_011 SQQQQQQVQQLRQQLYQSHQPLPQAT-GQPASSSSHLQ-PMQRPSTLPSSAAGYQLRVGQ
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KSD FPQHSQSFPTSSTYSS--SVQGGGQGAHSYK-SCTAPTAQPHDRPLTASSSLAPGQRVQN
: :: :: .::. :: : : .:...:: : .. ... .. ..:.. : : .:.
XP_011 FGQHYQSSASSSSSSSFPSPQRFSQSGQSYDGSYNVNAGSQYEGHNVGSNAQAYG--TQS
240 250 260 270 280
270 280 290 300 310 320
pF1KSD LHAYQSGRL-SYDQQQ--QQQQQQQQQQQALQSRHHAQETLHYQNLA-KYQHYGQQGQGY
..:: . ...: . : :: ::::: :..: .:....: : : : .: :: :
XP_011 NYSYQPQSMKNFEQAKIPQGTQQGQQQQQPQQQQHPSQHVMQYTNAATKLPLQSQVGQ-Y
290 300 310 320 330 340
330 340 350 360 370 380
pF1KSD CQPDAAVRTPEQYYQTFSPSSSHSPARSVGRSPSYSSTPSPLMPNLENFPYSQQPLSTGA
::.. ::.: :..:.::: :. ::: :: .::: :::::::: . ::. .: :.
XP_011 NQPEVPVRSPMQFHQNFSPISNPSPAASVVQSPSCSSTPSPLMQTGENLQCGQ-----GS
350 360 370 380 390 400
390 400 410 420 430 440
pF1KSD FPAGITDHS-HFMPLLNPSPTDATSSVDTQAGNCKPLQKDKLPENLLSDLSLQSLTALTS
: : .. ..:: :.:.:. : ...:.. : . . .::. :.: .:.::.::..
XP_011 VPMGSRNRILQLMPQLSPTPS-MMPSPNSHAAGFKGFGLEGVPEKRLTDPGLSSLSALST
410 420 430 440 450 460
450 460 470 480 490
pF1KSD QVENISNTVQQLLLSKAAVPQKKGVKNLVSRTPEQHKSQHCS-PEGSGYSAEPAGTPLSE
:: :. ::::..::: : .:::: : : ..:.. :. :::. : .:..:
XP_011 QVANLPNTVQHMLLSDALTPQKKTSK----RPSSSKKADSCTNSEGSSQPEEQLKSPMAE
470 480 490 500 510
500 510 520 530 540 550
pF1KSD P-PSSTPQSTHAEPQEADYLSGSEDPLERSFL--YCNQARGSPARVNSNSKAKPESVSTC
.. .:.. . ... :::. . .. ..: .:::. ... .: ...
XP_011 SLDGGCSSSSEDQGERVRQLSGQSTSSDTTYKGGASEKAGSSPAQ---GAQNEPPRLNAS
520 530 540 550 560 570
560 570 580 590 600 610
pF1KSD SVTSPDDMSTKSDDSFQSLHGSLPLDSFSKFVAGERDCPRLLLSALAQEDLASEILGLQE
.. . : . : .::.: .. ..:. .. ..: ..... :
XP_011 PAAREEATSPGAKD--------MPLSSDGNPKVNEKTVGVIV----SREAMTGRV----E
580 590 600 610
620 630 640 650 660 670
pF1KSD AIGEKADKAWAEAPSLVKDSSKPPFSLENHSACLDSVAKSAWPRPGEPEALPDSLQLDKG
: . . . :. ...:: : .: : :. :.: . . . :..
XP_011 KPGGQDKGSQEDDPAA---TQRPP---SNGGAKETSHASLPQPEPPGGGGSKGNKNGDNN
620 630 640 650 660 670
680 690 700 710 720 730
pF1KSD GNAKDFSPGLFEDPSVA--FAT-PDPKKTTGPLSFGTKPTLGVPAPDPTTAAFDCFPDTT
.: . . : ... :.. .:.:. : : .. : ..: .: ....: .: :
XP_011 SNHNGEGNGQSGHSAAGPGFTSRTEPSKSPGSLRYSYKDSFGSAVPR-NVSGFPQYP--T
680 690 700 710 720
740 750 760 770 780 790
pF1KSD AASSADSANPFAWPEENLGDACPRWGLHPGELTKGLEQGGKASDGISKGDTHEASACLGF
. ..: :. : : : :. : . :. . : . .:.: .. :
XP_011 GQEKGD----FTGHGERKG----RNEKFPSLLQEVLQGYHHHPDRRYSRSTQEHQGMAGS
730 740 750 760 770 780
800 810 820 830 840 850
pF1KSD QEEDPPGEKVASLPGDFKQEEVGGVKEEAGGLLQCPEVAKADRWLEDSRHCCSTA-DFGD
: . ..: ... .. : ... :.::. :. : :. ::: .. .
XP_011 LEGTTRPNVLVSQTNELASR--GLLNKSIGSLLENPH------WGPWERKSSSTAPEMKQ
790 800 810 820 830
860 870 880 890 900
pF1KSD LPLLP-PTSRKEDLEAEEEYSSLCELLGSPEQRPGMQDPLSPKAPLICTKEEVEEVL---
. : : :: ..: . :: : :: .: .. .:: .. .. . :
XP_011 INLTDYPIPRKFEIEPQ---SSAHEPGGSLSERRSVICDISPLRQIV--RDPGAHSLGHM
840 850 860 870 880
910 920 930 940
pF1KSD --DSKAGWGSPCHLS-GESVILLGPTVGTESKVQSW--------FESSLS----------
:.. : .. . . ..:::: : :. :.:..: ::.: :
XP_011 SADTRIGRNDRLNPTLSQSVILPGGLVSMETKLKSQSGQIKEEDFEQSKSQASFNNKKSG
890 900 910 920 930 940
950 960 970 980 990
pF1KSD -HMKPG---EEGPDGERAPGDSTTSDAS-LAQKPNKPA-VPEAP--IAKKEPVPRGKSLR
: .: .:. :. .:: .: .. : . . ..:. . ..: .. .: . ::.:
XP_011 DHCHPPSIKHESYRGNASPGAATHDSLSDYGPQDSRPTPMRRVPGRVGGREGM-RGRS--
950 960 970 980 990 1000
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KSD SRRVHRGLPEAEDSP--CRAPVLPKDLLLPESCTGPPQGQMEGAGAPGRGASEGLPRMCT
. : . . :: :.: . :. : ... . .: :: : .
XP_011 PSQYHDFAEKLKMSPGRSRGPGGDPHHMNPHM-TFSERANRSSLHTPFSPNSETL----A
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1060 1070 1080 1090 1100
pF1KSD RSLTALSEPRTPGPP--GLTTTPAPPDKLGGKQRAAFK---SGKRVG--------KPSPK
. : .. .. : : ::.. .. .: .: ::. : . .:.
XP_011 SAYHANTRAHAYGDPNAGLNSQLHYKRQMYQQQPEEYKDWSSGSAQGVIAAAQHRQEGPR
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1110 1120 1130 1140
pF1KSD AASSPSNPAAL-----PVASDSSPM--GSKTKETDSPS----------TPGKDQRSMILR
.:: . : :. .:.. : : . .:: . : ...: :.
XP_011 --KSPRQQQFLDRVRSPLKNDKDGMMYGPPVGTYHDPSAQEAGRCLMSSDGLPNKGMELK
1130 1140 1150 1160 1170
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD SRT-KTQEIFH--SKRRRPSEGRLPNCRATKKLLDNSHLPATFKVSSSPQ--KEGRVSQR
. : :: :.. :... : ...: : .. . : : : : :
XP_011 HGSQKLQESCWDLSRQTSPAKSSGPPGMSSQKRYGPPHETDGHGLAEATQSSKPGSVMLR
1180 1190 1200 1210 1220 1230
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD ARVPKPGAGSKLSDRPLHALKRKSAFMAPVPTKKRNLVLRSRSSSSSNASGNGGDGKEER
:: .. :. :: .: .:..:.:.:... ... ::.. .: ...:
XP_011 L----PGQEDHSSQNPLIMRRRVRSFISPIPSKRQSQDVKN---SSTEDKGRLLHSSKEG
1240 1250 1260 1270 1280 1290
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD PEGSPTLFKRMSSPKKAKPTKGNGEPATKLPPPETPDACLKLASRAAFQGAMKTKVLPPR
. . . . ..: . : . . . . :: :.. . : ... . :::.::::
XP_011 ADKAFNSYAHLSHSQDIK-SIPKRDSSKDLPSPDSRN-C----PAVTLTSPAKTKILPPR
1300 1310 1320 1330 1340
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD KGRGLKLEAIVQKITSPSLKKFACKAPGASPGNPLSPSLSDKDRGLKGAGGSPVGVEEGL
:::::::::::::::::.... : . . . :. . .:.: :. .: : : :
XP_011 KGRGLKLEAIVQKITSPNIRRSASSNSAEAGGDTV--TLDDI---LSLKSGPPEG---GS
1350 1360 1370 1380 1390
1390 1400 1410 1420 1430
pF1KSD VNVGTGQKLPTSG--ADPLCRNPTNRSL--KGKLMNSK---KLSSTDCFKTE--AFTSPE
: : .. .: :. : .:.:. : . : :. . : : ::: : :
XP_011 VAVQDADIEKRKGEVASDLV-SPANQELHVEKPLPRSSEEWRGSVDDKVKTETHAETVTA
1400 1410 1420 1430 1440 1450
1440 1450 1460 1470 1480
pF1KSD ALQPGG---TALAPKKRSRKGRAGAHGLSKGPL--EKRPYLGPALLLTPR------DRAS
. .: : .. . : : .:: . . .:: . :. .:.:. .. .
XP_011 GKEPPGAMTSTTSQKPGSNQGRPDGSLGGTAPLIFPDSKNVPPVGILAPEANPKAEEKEN
1460 1470 1480 1490 1500 1510
1490 1500 1510 1520 1530
pF1KSD GTQGASEDNSG----G---GGKKPKMEELG-LASQPPEGRPCQPQTRAQKQP-GHTNYSS
: : . : : .::: : . .: . .: . .: : . . : : ..
XP_011 DTVTISPKQEGFPPKGYFPSGKK-KGRPIGSVNKQKKQQQPPPPPPQPPQIPEGSADGEP
1520 1530 1540 1550 1560 1570
1540 1550 1560 1570 1580 1590
pF1KSD YSKRKRLTRGRAKNTTSSPCKGRAKRRRQQQVLPL-DPAEPEIRLKYISSCKRLRSDSRT
:..: : : : ..: ..:. .:..:. .: ::::.::: .. ..:...
XP_011 KPKKQRQRRERRK-PGAQP-----RKRKTKQAVPIVEPQEPEIKLKYATQ-PLDKTDAKN
1580 1590 1600 1610 1620
1600 1610 1620 1630 1640
pF1KSD PAFSPLEPSLGAQNPRSGQNAPPAPADARPLCTTRDRRAYSAREQGQR
.: :
XP_011 KSFYPYIHVVNKCELGAVCTIINAEEEEQTKLVRGRKGQRSLTPPPSSTESKALPASSFM
1630 1640 1650 1660 1670 1680
>>XP_006724376 (OMIM: 603107) PREDICTED: transcription f (1960 aa)
initn: 579 init1: 296 opt: 793 Z-score: 375.4 bits: 82.7 E(85289): 3.6e-14
Smith-Waterman score: 1072; 25.6% identity (51.9% similar) in 1745 aa overlap (1-1597:1-1633)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MQSFRERCGFHGKQQNYQQTSQETSRLENYRQPSQAGLSCDRQRLLAKDYYNPQPYPSYE
::::::. ..::.::.: : . .::::.. .: :: : . . . :
XP_006 MQSFREQSSYHGNQQSYPQEVHGSSRLEEF-SPRQA------QMFQNFGGTGGSSGSSGS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KSD GGAGTPSGTAAAVAA----DKYHRGSKALPTQQGLQGRPAFPGYGVQDSSPYPGRYAGEE
:..: :.:::.:: . :.: ... . : : : ..: : .
XP_006 GSGGGRRGAAAAAAAMASETSGHQGYQGFRKEAGDFYYMAGNKDPVTTGTPQPPQRRPSG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KSD SLQAWGAPQPPP-----------PQPQPLPAG---VAKYDENLMKKTAVPPSRQYAEQGA
.:..: :: : : .: :..:... . : : :: .:..
XP_006 PVQSYGPPQGSSFGNQYGSEGHVGQFQAQHSGLGGVSHYQQDYTGPFS-PGSAQYQQQAS
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200
pF1KSD ------QVPFRTHSLHVQQPPPPQQPLAYPKLQRQKLQNDIASPLPFPQGT--------H
:: ..:. .. : :: . : . ..:: . : .:... .
XP_006 SQQQQQQVQQLRQQLYQSHQPLPQAT-GQPASSSSHLQ-PMQRPSTLPSSAAGYQLRVGQ
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KSD FPQHSQSFPTSSTYSS--SVQGGGQGAHSYK-SCTAPTAQPHDRPLTASSSLAPGQRVQN
: :: :: .::. :: : : .:...:: : .. ... .. ..:.. : : .:.
XP_006 FGQHYQSSASSSSSSSFPSPQRFSQSGQSYDGSYNVNAGSQYEGHNVGSNAQAYG--TQS
240 250 260 270 280
270 280 290 300 310 320
pF1KSD LHAYQSGRL-SYDQQQ--QQQQQQQQQQQALQSRHHAQETLHYQNLA-KYQHYGQQGQGY
..:: . ...: . : :: ::::: :..: .:....: : : : .: :: :
XP_006 NYSYQPQSMKNFEQAKIPQGTQQGQQQQQPQQQQHPSQHVMQYTNAATKLPLQSQVGQ-Y
290 300 310 320 330 340
330 340 350 360 370 380
pF1KSD CQPDAAVRTPEQYYQTFSPSSSHSPARSVGRSPSYSSTPSPLMPNLENFPYSQQPLSTGA
::.. ::.: :..:.::: :. ::: :: .::: :::::::: . ::. .: :.
XP_006 NQPEVPVRSPMQFHQNFSPISNPSPAASVVQSPSCSSTPSPLMQTGENLQCGQ-----GS
350 360 370 380 390 400
390 400 410 420 430 440
pF1KSD FPAGITDHS-HFMPLLNPSPTDATSSVDTQAGNCKPLQKDKLPENLLSDLSLQSLTALTS
: : .. ..:: :.:.:. : ...:.. : . . .::. :.: .:.::.::..
XP_006 VPMGSRNRILQLMPQLSPTPS-MMPSPNSHAAGFKGFGLEGVPEKRLTDPGLSSLSALST
410 420 430 440 450 460
450 460 470 480 490
pF1KSD QVENISNTVQQLLLSKAAVPQKKGVKNLVSRTPEQHKSQHCS-PEGSGYSAEPAGTPLSE
:: :. ::::..::: : .:::: : : ..:.. :. :::. : .:..:
XP_006 QVANLPNTVQHMLLSDALTPQKKTSK----RPSSSKKADSCTNSEGSSQPEEQLKSPMAE
470 480 490 500 510
500 510 520 530 540 550
pF1KSD P-PSSTPQSTHAEPQEADYLSGSEDPLERSFL--YCNQARGSPARVNSNSKAKPESVSTC
.. .:.. . ... :::. . .. ..: .:::. ... .: ...
XP_006 SLDGGCSSSSEDQGERVRQLSGQSTSSDTTYKGGASEKAGSSPAQ---GAQNEPPRLNAS
520 530 540 550 560 570
560 570 580 590 600 610
pF1KSD SVTSPDDMSTKSDDSFQSLHGSLPLDSFSKFVAGERDCPRLLLSALAQEDLASEILGLQE
.. . : . : .::.: .. ..:. .. ..: ..... :
XP_006 PAAREEATSPGAKD--------MPLSSDGNPKVNEKTVGVIV----SREAMTGRV----E
580 590 600 610
620 630 640 650 660 670
pF1KSD AIGEKADKAWAEAPSLVKDSSKPPFSLENHSACLDSVAKSAWPRPGEPEALPDSLQLDKG
: . . . :. ...:: : .: : :. :.: . . . :..
XP_006 KPGGQDKGSQEDDPAA---TQRPP---SNGGAKETSHASLPQPEPPGGGGSKGNKNGDNN
620 630 640 650 660 670
680 690 700 710 720 730
pF1KSD GNAKDFSPGLFEDPSVA--FAT-PDPKKTTGPLSFGTKPTLGVPAPDPTTAAFDCFPDTT
.: . . : ... :.. .:.:. : : .. : ..: .: ....: .: :
XP_006 SNHNGEGNGQSGHSAAGPGFTSRTEPSKSPGSLRYSYKDSFGSAVPR-NVSGFPQYP--T
680 690 700 710 720
740 750 760 770 780 790
pF1KSD AASSADSANPFAWPEENLGDACPRWGLHPGELTKGLEQGGKASDGISKGDTHEASACLGF
. ..: :. : : : :. : . :. . : . .:.: .. :
XP_006 GQEKGD----FTGHGERKG----RNEKFPSLLQEVLQGYHHHPDRRYSRSTQEHQGMAGS
730 740 750 760 770 780
800 810 820 830 840 850
pF1KSD QEEDPPGEKVASLPGDFKQEEVGGVKEEAGGLLQCPEVAKADRWLEDSRHCCSTA-DFGD
: . ..: ... .. : ... :.::. :. : :. ::: .. .
XP_006 LEGTTRPNVLVSQTNELASR--GLLNKSIGSLLENPH------WGPWERKSSSTAPEMKQ
790 800 810 820 830
860 870 880 890 900
pF1KSD LPLLP-PTSRKEDLEAEEEYSSLCELLGSPEQRPGMQDPLSPKAPLICTKEEVEEVL---
. : : :: ..: . :: : :: .: .. .:: .. .. . :
XP_006 INLTDYPIPRKFEIEPQ---SSAHEPGGSLSERRSVICDISPLRQIV--RDPGAHSLGHM
840 850 860 870 880
910 920 930 940
pF1KSD --DSKAGWGSPCHLS-GESVILLGPTVGTESKVQSW--------FESSLS----------
:.. : .. . . ..:::: : :. :.:..: ::.: :
XP_006 SADTRIGRNDRLNPTLSQSVILPGGLVSMETKLKSQSGQIKEEDFEQSKSQASFNNKKSG
890 900 910 920 930 940
950 960 970 980 990
pF1KSD -HMKPG---EEGPDGERAPGDSTTSDAS-LAQKPNKPA-VPEAP--IAKKEPVPRGKSLR
: .: .:. :. .:: .: .. : . . ..:. . ..: .. .: . ::.:
XP_006 DHCHPPSIKHESYRGNASPGAATHDSLSDYGPQDSRPTPMRRVPGRVGGREGM-RGRS--
950 960 970 980 990 1000
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KSD SRRVHRGLPEAEDSP--CRAPVLPKDLLLPESCTGPPQGQMEGAGAPGRGASEGLPRMCT
. : . . :: :.: . :. : ... . .: :: : .
XP_006 PSQYHDFAEKLKMSPGRSRGPGGDPHHMNPHM-TFSERANRSSLHTPFSPNSETL----A
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1060 1070 1080 1090 1100
pF1KSD RSLTALSEPRTPGPP--GLTTTPAPPDKLGGKQRAAFK---SGKRVG--------KPSPK
. : .. .. : : ::.. .. .: .: ::. : . .:.
XP_006 SAYHANTRAHAYGDPNAGLNSQLHYKRQMYQQQPEEYKDWSSGSAQGVIAAAQHRQEGPR
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1110 1120 1130 1140
pF1KSD AASSPSNPAAL-----PVASDSSPM--GSKTKETDSPS----------TPGKDQRSMILR
.:: . : :. .:.. : : . .:: . : ...: :.
XP_006 --KSPRQQQFLDRVRSPLKNDKDGMMYGPPVGTYHDPSAQEAGRCLMSSDGLPNKGMELK
1130 1140 1150 1160 1170
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD SRT-KTQEIFH--SKRRRPSEGRLPNCRATKKLLDNSHLPATFKVSSSPQ--KEGRVSQR
. : :: :.. :... : ...: : .. . : : : : :
XP_006 HGSQKLQESCWDLSRQTSPAKSSGPPGMSSQKRYGPPHETDGHGLAEATQSSKPGSVMLR
1180 1190 1200 1210 1220 1230
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD ARVPKPGAGSKLSDRPLHALKRKSAFMAPVPTKKRNLVLRSRSSSSSNASGNGGDGKEER
:: .. :. :: .: .:..:.:.:... ... ::.. .: ...:
XP_006 L----PGQEDHSSQNPLIMRRRVRSFISPIPSKRQSQDVKN---SSTEDKGRLLHSSKEG
1240 1250 1260 1270 1280 1290
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD PEGSPTLFKRMSSPKKAKPTKGNGEPATKLPPPETPDACLKLASRAAFQGAMKTKVLPPR
. . . . ..: . : . . . . :: :.. . : ... . :::.::::
XP_006 ADKAFNSYAHLSHSQDIK-SIPKRDSSKDLPSPDSRN-C----PAVTLTSPAKTKILPPR
1300 1310 1320 1330 1340
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD KGRGLKLEAIVQKITSPSLKKFACKAPGASPGNPLSPSLSDKDRGLKGAGGSPVGVEEGL
:::::::::::::::::.... : . . . :. . .:.: :. .: : : :
XP_006 KGRGLKLEAIVQKITSPNIRRSASSNSAEAGGDTV--TLDDI---LSLKSGPPEG---GS
1350 1360 1370 1380 1390
1390 1400 1410 1420 1430
pF1KSD VNVGTGQKLPTSG--ADPLCRNPTNRSL--KGKLMNSK---KLSSTDCFKTE--AFTSPE
: : .. .: :. : .:.:. : . : :. . : : ::: : :
XP_006 VAVQDADIEKRKGEVASDLV-SPANQELHVEKPLPRSSEEWRGSVDDKVKTETHAETVTA
1400 1410 1420 1430 1440 1450
1440 1450 1460 1470 1480
pF1KSD ALQPGG---TALAPKKRSRKGRAGAHGLSKGPL--EKRPYLGPALLLTPR------DRAS
. .: : .. . : : .:: . . .:: . :. .:.:. .. .
XP_006 GKEPPGAMTSTTSQKPGSNQGRPDGSLGGTAPLIFPDSKNVPPVGILAPEANPKAEEKEN
1460 1470 1480 1490 1500 1510
1490 1500 1510 1520 1530
pF1KSD GTQGASEDNSG----G---GGKKPKMEELG-LASQPPEGRPCQPQTRAQKQP-GHTNYSS
: : . : : .::: : . .: . .: . .: : . . : : ..
XP_006 DTVTISPKQEGFPPKGYFPSGKK-KGRPIGSVNKQKKQQQPPPPPPQPPQIPEGSADGEP
1520 1530 1540 1550 1560 1570
1540 1550 1560 1570 1580 1590
pF1KSD YSKRKRLTRGRAKNTTSSPCKGRAKRRRQQQVLPL-DPAEPEIRLKYISSCKRLRSDSRT
:..: : : : ..: ..:. .:..:. .: ::::.::: .. ..:...
XP_006 KPKKQRQRRERRK-PGAQP-----RKRKTKQAVPIVEPQEPEIKLKYATQ-PLDKTDAKN
1580 1590 1600 1610 1620
1600 1610 1620 1630 1640
pF1KSD PAFSPLEPSLGAQNPRSGQNAPPAPADARPLCTTRDRRAYSAREQGQR
.: :
XP_006 KSFYPYIHVVNKCELGAVCTIINAEEEEQTKLVRGRKGQRSLTPPPSSTESKALPASSFM
1630 1640 1650 1660 1670 1680
>>XP_005261779 (OMIM: 603107) PREDICTED: transcription f (1960 aa)
initn: 579 init1: 296 opt: 793 Z-score: 375.4 bits: 82.7 E(85289): 3.6e-14
Smith-Waterman score: 1072; 25.6% identity (51.9% similar) in 1745 aa overlap (1-1597:1-1633)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MQSFRERCGFHGKQQNYQQTSQETSRLENYRQPSQAGLSCDRQRLLAKDYYNPQPYPSYE
::::::. ..::.::.: : . .::::.. .: :: : . . . :
XP_005 MQSFREQSSYHGNQQSYPQEVHGSSRLEEF-SPRQA------QMFQNFGGTGGSSGSSGS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KSD GGAGTPSGTAAAVAA----DKYHRGSKALPTQQGLQGRPAFPGYGVQDSSPYPGRYAGEE
:..: :.:::.:: . :.: ... . : : : ..: : .
XP_005 GSGGGRRGAAAAAAAMASETSGHQGYQGFRKEAGDFYYMAGNKDPVTTGTPQPPQRRPSG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KSD SLQAWGAPQPPP-----------PQPQPLPAG---VAKYDENLMKKTAVPPSRQYAEQGA
.:..: :: : : .: :..:... . : : :: .:..
XP_005 PVQSYGPPQGSSFGNQYGSEGHVGQFQAQHSGLGGVSHYQQDYTGPFS-PGSAQYQQQAS
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200
pF1KSD ------QVPFRTHSLHVQQPPPPQQPLAYPKLQRQKLQNDIASPLPFPQGT--------H
:: ..:. .. : :: . : . ..:: . : .:... .
XP_005 SQQQQQQVQQLRQQLYQSHQPLPQAT-GQPASSSSHLQ-PMQRPSTLPSSAAGYQLRVGQ
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KSD FPQHSQSFPTSSTYSS--SVQGGGQGAHSYK-SCTAPTAQPHDRPLTASSSLAPGQRVQN
: :: :: .::. :: : : .:...:: : .. ... .. ..:.. : : .:.
XP_005 FGQHYQSSASSSSSSSFPSPQRFSQSGQSYDGSYNVNAGSQYEGHNVGSNAQAYG--TQS
240 250 260 270 280
270 280 290 300 310 320
pF1KSD LHAYQSGRL-SYDQQQ--QQQQQQQQQQQALQSRHHAQETLHYQNLA-KYQHYGQQGQGY
..:: . ...: . : :: ::::: :..: .:....: : : : .: :: :
XP_005 NYSYQPQSMKNFEQAKIPQGTQQGQQQQQPQQQQHPSQHVMQYTNAATKLPLQSQVGQ-Y
290 300 310 320 330 340
330 340 350 360 370 380
pF1KSD CQPDAAVRTPEQYYQTFSPSSSHSPARSVGRSPSYSSTPSPLMPNLENFPYSQQPLSTGA
::.. ::.: :..:.::: :. ::: :: .::: :::::::: . ::. .: :.
XP_005 NQPEVPVRSPMQFHQNFSPISNPSPAASVVQSPSCSSTPSPLMQTGENLQCGQ-----GS
350 360 370 380 390 400
390 400 410 420 430 440
pF1KSD FPAGITDHS-HFMPLLNPSPTDATSSVDTQAGNCKPLQKDKLPENLLSDLSLQSLTALTS
: : .. ..:: :.:.:. : ...:.. : . . .::. :.: .:.::.::..
XP_005 VPMGSRNRILQLMPQLSPTPS-MMPSPNSHAAGFKGFGLEGVPEKRLTDPGLSSLSALST
410 420 430 440 450 460
450 460 470 480 490
pF1KSD QVENISNTVQQLLLSKAAVPQKKGVKNLVSRTPEQHKSQHCS-PEGSGYSAEPAGTPLSE
:: :. ::::..::: : .:::: : : ..:.. :. :::. : .:..:
XP_005 QVANLPNTVQHMLLSDALTPQKKTSK----RPSSSKKADSCTNSEGSSQPEEQLKSPMAE
470 480 490 500 510
500 510 520 530 540 550
pF1KSD P-PSSTPQSTHAEPQEADYLSGSEDPLERSFL--YCNQARGSPARVNSNSKAKPESVSTC
.. .:.. . ... :::. . .. ..: .:::. ... .: ...
XP_005 SLDGGCSSSSEDQGERVRQLSGQSTSSDTTYKGGASEKAGSSPAQ---GAQNEPPRLNAS
520 530 540 550 560 570
560 570 580 590 600 610
pF1KSD SVTSPDDMSTKSDDSFQSLHGSLPLDSFSKFVAGERDCPRLLLSALAQEDLASEILGLQE
.. . : . : .::.: .. ..:. .. ..: ..... :
XP_005 PAAREEATSPGAKD--------MPLSSDGNPKVNEKTVGVIV----SREAMTGRV----E
580 590 600 610
620 630 640 650 660 670
pF1KSD AIGEKADKAWAEAPSLVKDSSKPPFSLENHSACLDSVAKSAWPRPGEPEALPDSLQLDKG
: . . . :. ...:: : .: : :. :.: . . . :..
XP_005 KPGGQDKGSQEDDPAA---TQRPP---SNGGAKETSHASLPQPEPPGGGGSKGNKNGDNN
620 630 640 650 660 670
680 690 700 710 720 730
pF1KSD GNAKDFSPGLFEDPSVA--FAT-PDPKKTTGPLSFGTKPTLGVPAPDPTTAAFDCFPDTT
.: . . : ... :.. .:.:. : : .. : ..: .: ....: .: :
XP_005 SNHNGEGNGQSGHSAAGPGFTSRTEPSKSPGSLRYSYKDSFGSAVPR-NVSGFPQYP--T
680 690 700 710 720
740 750 760 770 780 790
pF1KSD AASSADSANPFAWPEENLGDACPRWGLHPGELTKGLEQGGKASDGISKGDTHEASACLGF
. ..: :. : : : :. : . :. . : . .:.: .. :
XP_005 GQEKGD----FTGHGERKG----RNEKFPSLLQEVLQGYHHHPDRRYSRSTQEHQGMAGS
730 740 750 760 770 780
800 810 820 830 840 850
pF1KSD QEEDPPGEKVASLPGDFKQEEVGGVKEEAGGLLQCPEVAKADRWLEDSRHCCSTA-DFGD
: . ..: ... .. : ... :.::. :. : :. ::: .. .
XP_005 LEGTTRPNVLVSQTNELASR--GLLNKSIGSLLENPH------WGPWERKSSSTAPEMKQ
790 800 810 820 830
860 870 880 890 900
pF1KSD LPLLP-PTSRKEDLEAEEEYSSLCELLGSPEQRPGMQDPLSPKAPLICTKEEVEEVL---
. : : :: ..: . :: : :: .: .. .:: .. .. . :
XP_005 INLTDYPIPRKFEIEPQ---SSAHEPGGSLSERRSVICDISPLRQIV--RDPGAHSLGHM
840 850 860 870 880
910 920 930 940
pF1KSD --DSKAGWGSPCHLS-GESVILLGPTVGTESKVQSW--------FESSLS----------
:.. : .. . . ..:::: : :. :.:..: ::.: :
XP_005 SADTRIGRNDRLNPTLSQSVILPGGLVSMETKLKSQSGQIKEEDFEQSKSQASFNNKKSG
890 900 910 920 930 940
950 960 970 980 990
pF1KSD -HMKPG---EEGPDGERAPGDSTTSDAS-LAQKPNKPA-VPEAP--IAKKEPVPRGKSLR
: .: .:. :. .:: .: .. : . . ..:. . ..: .. .: . ::.:
XP_005 DHCHPPSIKHESYRGNASPGAATHDSLSDYGPQDSRPTPMRRVPGRVGGREGM-RGRS--
950 960 970 980 990 1000
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KSD SRRVHRGLPEAEDSP--CRAPVLPKDLLLPESCTGPPQGQMEGAGAPGRGASEGLPRMCT
. : . . :: :.: . :. : ... . .: :: : .
XP_005 PSQYHDFAEKLKMSPGRSRGPGGDPHHMNPHM-TFSERANRSSLHTPFSPNSETL----A
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1060 1070 1080 1090 1100
pF1KSD RSLTALSEPRTPGPP--GLTTTPAPPDKLGGKQRAAFK---SGKRVG--------KPSPK
. : .. .. : : ::.. .. .: .: ::. : . .:.
XP_005 SAYHANTRAHAYGDPNAGLNSQLHYKRQMYQQQPEEYKDWSSGSAQGVIAAAQHRQEGPR
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1110 1120 1130 1140
pF1KSD AASSPSNPAAL-----PVASDSSPM--GSKTKETDSPS----------TPGKDQRSMILR
.:: . : :. .:.. : : . .:: . : ...: :.
XP_005 --KSPRQQQFLDRVRSPLKNDKDGMMYGPPVGTYHDPSAQEAGRCLMSSDGLPNKGMELK
1130 1140 1150 1160 1170
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD SRT-KTQEIFH--SKRRRPSEGRLPNCRATKKLLDNSHLPATFKVSSSPQ--KEGRVSQR
. : :: :.. :... : ...: : .. . : : : : :
XP_005 HGSQKLQESCWDLSRQTSPAKSSGPPGMSSQKRYGPPHETDGHGLAEATQSSKPGSVMLR
1180 1190 1200 1210 1220 1230
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD ARVPKPGAGSKLSDRPLHALKRKSAFMAPVPTKKRNLVLRSRSSSSSNASGNGGDGKEER
:: .. :. :: .: .:..:.:.:... ... ::.. .: ...:
XP_005 L----PGQEDHSSQNPLIMRRRVRSFISPIPSKRQSQDVKN---SSTEDKGRLLHSSKEG
1240 1250 1260 1270 1280 1290
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD PEGSPTLFKRMSSPKKAKPTKGNGEPATKLPPPETPDACLKLASRAAFQGAMKTKVLPPR
. . . . ..: . : . . . . :: :.. . : ... . :::.::::
XP_005 ADKAFNSYAHLSHSQDIK-SIPKRDSSKDLPSPDSRN-C----PAVTLTSPAKTKILPPR
1300 1310 1320 1330 1340
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD KGRGLKLEAIVQKITSPSLKKFACKAPGASPGNPLSPSLSDKDRGLKGAGGSPVGVEEGL
:::::::::::::::::.... : . . . :. . .:.: :. .: : : :
XP_005 KGRGLKLEAIVQKITSPNIRRSASSNSAEAGGDTV--TLDDI---LSLKSGPPEG---GS
1350 1360 1370 1380 1390
1390 1400 1410 1420 1430
pF1KSD VNVGTGQKLPTSG--ADPLCRNPTNRSL--KGKLMNSK---KLSSTDCFKTE--AFTSPE
: : .. .: :. : .:.:. : . : :. . : : ::: : :
XP_005 VAVQDADIEKRKGEVASDLV-SPANQELHVEKPLPRSSEEWRGSVDDKVKTETHAETVTA
1400 1410 1420 1430 1440 1450
1440 1450 1460 1470 1480
pF1KSD ALQPGG---TALAPKKRSRKGRAGAHGLSKGPL--EKRPYLGPALLLTPR------DRAS
. .: : .. . : : .:: . . .:: . :. .:.:. .. .
XP_005 GKEPPGAMTSTTSQKPGSNQGRPDGSLGGTAPLIFPDSKNVPPVGILAPEANPKAEEKEN
1460 1470 1480 1490 1500 1510
1490 1500 1510 1520 1530
pF1KSD GTQGASEDNSG----G---GGKKPKMEELG-LASQPPEGRPCQPQTRAQKQP-GHTNYSS
: : . : : .::: : . .: . .: . .: : . . : : ..
XP_005 DTVTISPKQEGFPPKGYFPSGKK-KGRPIGSVNKQKKQQQPPPPPPQPPQIPEGSADGEP
1520 1530 1540 1550 1560 1570
1540 1550 1560 1570 1580 1590
pF1KSD YSKRKRLTRGRAKNTTSSPCKGRAKRRRQQQVLPL-DPAEPEIRLKYISSCKRLRSDSRT
:..: : : : ..: ..:. .:..:. .: ::::.::: .. ..:...
XP_005 KPKKQRQRRERRK-PGAQP-----RKRKTKQAVPIVEPQEPEIKLKYATQ-PLDKTDAKN
1580 1590 1600 1610 1620
1600 1610 1620 1630 1640
pF1KSD PAFSPLEPSLGAQNPRSGQNAPPAPADARPLCTTRDRRAYSAREQGQR
.: :
XP_005 KSFYPYIHVVNKCELGAVCTIINAEEEEQTKLVRGRKGQRSLTPPPSSTESKALPASSFM
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1640 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 19:11:51 2016 done: Thu Nov 3 19:11:54 2016
Total Scan time: 20.520 Total Display time: 1.090
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]