Result of FASTA (omim) for
pF1KSDA1798
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1798, 780 aa
1>>>pF1KSDA1798 780 - 780 aa - 780 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9176+/-0.000334; mu= 14.6784+/- 0.021
mean_var=141.0398+/-27.708, 0's: 0 Z-trim(119.8): 111 B-trim: 0 in 0/55
Lambda= 0.107995
statistics sampled from 34140 (34257) to 34140 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.741), E-opt: 0.2 (0.402), width: 16
Scan time: 11.240
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001317488 (OMIM: 617135) lethal(3)malignant bra ( 614) 2190 353.0 2.2e-96
XP_011524062 (OMIM: 617135) PREDICTED: lethal(3)ma ( 642) 1984 320.9 1e-86
NP_056293 (OMIM: 608802) lethal(3)malignant brain ( 772) 1926 312.0 6.3e-84
NP_115479 (OMIM: 608802) lethal(3)malignant brain ( 840) 1926 312.0 6.7e-84
XP_006722427 (OMIM: 617135) PREDICTED: lethal(3)ma ( 485) 1789 290.5 1.2e-77
XP_016881564 (OMIM: 617135) PREDICTED: lethal(3)ma ( 488) 1789 290.5 1.2e-77
XP_016881565 (OMIM: 617135) PREDICTED: lethal(3)ma ( 488) 1789 290.5 1.2e-77
XP_011524067 (OMIM: 617135) PREDICTED: lethal(3)ma ( 497) 1789 290.5 1.2e-77
XP_011524065 (OMIM: 617135) PREDICTED: lethal(3)ma ( 521) 1789 290.5 1.2e-77
XP_011524064 (OMIM: 617135) PREDICTED: lethal(3)ma ( 567) 1789 290.5 1.3e-77
XP_016881563 (OMIM: 617135) PREDICTED: lethal(3)ma ( 574) 1789 290.5 1.3e-77
NP_775735 (OMIM: 617135) lethal(3)malignant brain ( 623) 1789 290.6 1.4e-77
XP_011524063 (OMIM: 617135) PREDICTED: lethal(3)ma ( 623) 1789 290.6 1.4e-77
XP_011524061 (OMIM: 617135) PREDICTED: lethal(3)ma ( 651) 1789 290.6 1.5e-77
XP_011524060 (OMIM: 617135) PREDICTED: lethal(3)ma ( 651) 1789 290.6 1.5e-77
XP_011524059 (OMIM: 617135) PREDICTED: lethal(3)ma ( 651) 1789 290.6 1.5e-77
XP_016881566 (OMIM: 617135) PREDICTED: lethal(3)ma ( 370) 1619 263.9 9.1e-70
XP_016884468 (OMIM: 611865) PREDICTED: lethal(3)ma ( 495) 666 115.5 5.6e-25
XP_016884467 (OMIM: 611865) PREDICTED: lethal(3)ma ( 495) 666 115.5 5.6e-25
XP_016884466 (OMIM: 611865) PREDICTED: lethal(3)ma ( 595) 666 115.6 6.4e-25
XP_011528723 (OMIM: 611865) PREDICTED: lethal(3)ma ( 614) 666 115.6 6.6e-25
XP_016884465 (OMIM: 611865) PREDICTED: lethal(3)ma ( 621) 666 115.6 6.6e-25
XP_011528722 (OMIM: 611865) PREDICTED: lethal(3)ma ( 687) 666 115.6 7.2e-25
NP_113676 (OMIM: 611865) lethal(3)malignant brain ( 705) 666 115.6 7.3e-25
XP_016884469 (OMIM: 611865) PREDICTED: lethal(3)ma ( 408) 660 114.5 9.3e-25
XP_016884710 (OMIM: 300208) PREDICTED: sex comb on ( 609) 605 106.1 4.8e-22
XP_006724521 (OMIM: 300208) PREDICTED: sex comb on ( 609) 605 106.1 4.8e-22
XP_016884709 (OMIM: 300208) PREDICTED: sex comb on ( 700) 605 106.1 5.3e-22
NP_006080 (OMIM: 300208) sex comb on midleg-like p ( 700) 605 106.1 5.3e-22
XP_016884708 (OMIM: 300208) PREDICTED: sex comb on ( 700) 605 106.1 5.3e-22
XP_011524069 (OMIM: 617135) PREDICTED: lethal(3)ma ( 362) 592 103.9 1.3e-21
XP_011539342 (OMIM: 616396) PREDICTED: polycomb pr ( 523) 575 101.3 1.1e-20
XP_016856187 (OMIM: 616396) PREDICTED: polycomb pr ( 618) 576 101.6 1.1e-20
XP_011539341 (OMIM: 616396) PREDICTED: polycomb pr ( 550) 575 101.4 1.1e-20
XP_011539335 (OMIM: 616396) PREDICTED: polycomb pr ( 660) 576 101.6 1.2e-20
NP_001026864 (OMIM: 616396) polycomb protein SCMH1 ( 660) 576 101.6 1.2e-20
XP_011539336 (OMIM: 616396) PREDICTED: polycomb pr ( 621) 575 101.4 1.2e-20
NP_001165690 (OMIM: 616396) polycomb protein SCMH1 ( 648) 575 101.4 1.3e-20
XP_011539334 (OMIM: 616396) PREDICTED: polycomb pr ( 670) 575 101.4 1.3e-20
XP_006710525 (OMIM: 616396) PREDICTED: polycomb pr ( 670) 575 101.4 1.3e-20
XP_016856189 (OMIM: 616396) PREDICTED: polycomb pr ( 564) 533 94.8 1.1e-18
NP_036368 (OMIM: 616396) polycomb protein SCMH1 is ( 591) 533 94.8 1.1e-18
XP_011539337 (OMIM: 616396) PREDICTED: polycomb pr ( 613) 533 94.9 1.1e-18
XP_016856200 (OMIM: 616396) PREDICTED: polycomb pr ( 457) 505 90.4 1.9e-17
XP_016856201 (OMIM: 616396) PREDICTED: polycomb pr ( 457) 505 90.4 1.9e-17
XP_016856197 (OMIM: 616396) PREDICTED: polycomb pr ( 479) 505 90.4 1.9e-17
NP_001165691 (OMIM: 616396) polycomb protein SCMH1 ( 577) 501 89.8 3.4e-17
NP_001165689 (OMIM: 616396) polycomb protein SCMH1 ( 577) 501 89.8 3.4e-17
XP_016856188 (OMIM: 616396) PREDICTED: polycomb pr ( 599) 501 89.9 3.5e-17
XP_011539338 (OMIM: 616396) PREDICTED: polycomb pr ( 599) 501 89.9 3.5e-17
>>NP_001317488 (OMIM: 617135) lethal(3)malignant brain t (614 aa)
initn: 2182 init1: 1101 opt: 2190 Z-score: 1851.4 bits: 353.0 E(85289): 2.2e-96
Smith-Waterman score: 2191; 52.1% identity (76.8% similar) in 620 aa overlap (179-774:1-600)
150 160 170 180 190 200
pF1KSD DKDQKEERDVEEDNEEEDPKCSRKKKPKLSLKADNKEDGEERDDEMENKQDVRILRGSQR
.: :.. . :.. . :: :. :
NP_001 MKQPNRKRKLNMDSKERLDQDGRL---EQA
10 20
210 220 230 240 250 260
pF1KSD ARRKRRGDSAVLKQGLPPKGKK-AWCWASYLEEEKAVAVPAKLFKEHQSFPYNKNGFKVG
..:. ::.. . .: . . :: : ::.:.::::.:..::.. :::: ..:::..:
NP_001 EEEKKPKDSTTPLSHVPSAAAQGAWSWEWYLKEQKAVAAPVELFSKDQSFPEHENGFQIG
30 40 50 60 70 80
270 280 290 300 310 320
pF1KSD MKLEGVDPEHQSVYCVLTVAEVCGYRIKLHFDGYSDCYDFWVNADALDIHPVGWCEKTGH
:.:::.::.: ::.:::.::::::::..:::::: .:::::.:: . ::::::::::: :
NP_001 MRLEGIDPRHPSVFCVLSVAEVCGYRLRLHFDGYLSCYDFWTNAGSPDIHPVGWCEKTKH
90 100 110 120 130 140
330 340 350 360 370 380
pF1KSD KLHPPKGYKEEEFNWQTYLKTCKAQAAPKSLFENQNITVIPSG-----FRVGMKLEAVDK
.:: ::::....: :. :::.:: : :::.::.:.. :.: :.:::::::::.
NP_001 ELHIPKGYRKDKFVWMDYLKACKLQNAPKKLFRNRS----PNGPMSKEFQVGMKLEAVDR
150 160 170 180 190 200
390 400 410 420 430 440
pF1KSD KNPSFICVATVTDMVDNRFLVHFDNWDESYDYWCEASSPHIHPVGWCKEHRRTLITPPGY
::::..::::..:.:..:.::::::::.::::::...::...:::::.:. ::::.: ::
NP_001 KNPSLVCVATIADIVEDRLLVHFDNWDDSYDYWCDVNSPYVQPVGWCQENGRTLIAPQGY
210 220 230 240 250 260
450 460 470 480 490 500
pF1KSD PNVKHFSWDKYLEETNSLPAPARAFKVKPPHGFQKKMKLEVVDKRNPMFIRVATVADTDD
:: ..::: .::: :.. .::..::.. :::: .::::::::::: .:::::..:.::
NP_001 PNPENFSWTEYLEATQTNAVPAKVFKMRLPHGFLPNMKLEVVDKRNPRLIRVATIVDVDD
270 280 290 300 310 320
510 520 530 540 550 560
pF1KSD HRVKVHFDGWNNCYDYWIDADSPDIHPVGWCSKTGHPLQPPLSPLELMEASEHGGCSTPG
.:::::::::.. ::::..::::::::.:::. :::::. : .: .. : :::
NP_001 QRVKVHFDGWDHKYDYWVEADSPDIHPIGWCDVTGHPLEVPQRTNDLKILPGQAVCPTPG
330 340 350 360 370 380
570 580 590 600 610 620
pF1KSD CKGIGHFKRARHLGPHSAANCPYSEINLNKDRIFPDRLSGEMPPASPSFPRNKRTDANES
:.::::.. :. : ::: .::::..::.:. . ::: ..:.::
NP_001 CRGIGHIRGPRYSGHHSAFGCPYSDMNLKKEATLHDRLR-------------EQTQANLE
390 400 410 420 430
630 640 650 660
pF1KSD SSSPEIRDQHADDVKEDFE-ERTESEMRTSHEAR-----GARE--------EPTVQQAQR
:.: . ... ... . . :...:. : ..:. : .. : .:.:::.
NP_001 SDSSHSKSKSLCSLNFNGKHEKVNSQPRLVQQAKCLKIKGKEDIDLDNLFREYSVEQAQQ
440 450 460 470 480 490
670 680 690 700 710 720
pF1KSD --RSAVFLSFKSPIPC--LPLRWEQQSKLLPTVAGIPASKVSKWSTDEVSEFIQSLPGCE
...: .: : : ::: ::. :::: :: : ::.:..:..:::.::.::: :::
NP_001 VLHQSVSMSTVSAHPFRDLPLGREQHCKLLPGVADIRASQVARWTVDEVAEFVQSLLGCE
500 510 520 530 540 550
730 740 750 760 770 780
pF1KSD EHGKVFKDEQIDGEAFLLMTQTDIVKIMSIKLGPALKIFNSILMFKAAEKNSHNEL
::.: :: :::::.::::.:::::::.:.:::::::::.::::::. ...
NP_001 EHAKCFKKEQIDGKAFLLLTQTDIVKVMKIKLGPALKIYNSILMFRHSQELPEEDIASGQ
560 570 580 590 600 610
NP_001 EVRG
>>XP_011524062 (OMIM: 617135) PREDICTED: lethal(3)malign (642 aa)
initn: 1976 init1: 1101 opt: 1984 Z-score: 1677.7 bits: 320.9 E(85289): 1e-86
Smith-Waterman score: 1985; 50.3% identity (75.3% similar) in 580 aa overlap (179-734:1-560)
150 160 170 180 190 200
pF1KSD DKDQKEERDVEEDNEEEDPKCSRKKKPKLSLKADNKEDGEERDDEMENKQDVRILRGSQR
.: :.. . :.. . :: :. :
XP_011 MKQPNRKRKLNMDSKERLDQDGRL---EQA
10 20
210 220 230 240 250 260
pF1KSD ARRKRRGDSAVLKQGLPPKGKK-AWCWASYLEEEKAVAVPAKLFKEHQSFPYNKNGFKVG
..:. ::.. . .: . . :: : ::.:.::::.:..::.. :::: ..:::..:
XP_011 EEEKKPKDSTTPLSHVPSAAAQGAWSWEWYLKEQKAVAAPVELFSKDQSFPEHENGFQIG
30 40 50 60 70 80
270 280 290 300 310 320
pF1KSD MKLEGVDPEHQSVYCVLTVAEVCGYRIKLHFDGYSDCYDFWVNADALDIHPVGWCEKTGH
:.:::.::.: ::.:::.::::::::..:::::: .:::::.:: . ::::::::::: :
XP_011 MRLEGIDPRHPSVFCVLSVAEVCGYRLRLHFDGYLSCYDFWTNAGSPDIHPVGWCEKTKH
90 100 110 120 130 140
330 340 350 360 370 380
pF1KSD KLHPPKGYKEEEFNWQTYLKTCKAQAAPKSLFENQNITVIPSG-----FRVGMKLEAVDK
.:: ::::....: :. :::.:: : :::.::.:.. :.: :.:::::::::.
XP_011 ELHIPKGYRKDKFVWMDYLKACKLQNAPKKLFRNRS----PNGPMSKEFQVGMKLEAVDR
150 160 170 180 190 200
390 400 410 420 430 440
pF1KSD KNPSFICVATVTDMVDNRFLVHFDNWDESYDYWCEASSPHIHPVGWCKEHRRTLITPPGY
::::..::::..:.:..:.::::::::.::::::...::...:::::.:. ::::.: ::
XP_011 KNPSLVCVATIADIVEDRLLVHFDNWDDSYDYWCDVNSPYVQPVGWCQENGRTLIAPQGY
210 220 230 240 250 260
450 460 470 480 490 500
pF1KSD PNVKHFSWDKYLEETNSLPAPARAFKVKPPHGFQKKMKLEVVDKRNPMFIRVATVADTDD
:: ..::: .::: :.. .::..::.. :::: .::::::::::: .:::::..:.::
XP_011 PNPENFSWTEYLEATQTNAVPAKVFKMRLPHGFLPNMKLEVVDKRNPRLIRVATIVDVDD
270 280 290 300 310 320
510 520 530 540 550 560
pF1KSD HRVKVHFDGWNNCYDYWIDADSPDIHPVGWCSKTGHPLQPPLSPLELMEASEHGGCSTPG
.:::::::::.. ::::..::::::::.:::. :::::. : .: .. : :::
XP_011 QRVKVHFDGWDHKYDYWVEADSPDIHPIGWCDVTGHPLEVPQRTNDLKILPGQAVCPTPG
330 340 350 360 370 380
570 580 590 600 610 620
pF1KSD CKGIGHFKRARHLGPHSAANCPYSEINLNKDRIFPDRLSGEMPPASPSFPRNKRTDANES
:.::::.. :. : ::: .::::..::.:. . ::: ..:.::
XP_011 CRGIGHIRGPRYSGHHSAFGCPYSDMNLKKEATLHDRLR-------------EQTQANLE
390 400 410 420 430
630 640 650 660
pF1KSD SSSPEIRDQHADDVKEDFE-ERTESEMRTSHEAR-----GARE--------EPTVQQAQR
:.: . ... ... . . :...:. : ..:. : .. : .:.:::.
XP_011 SDSSHSKSKSLCSLNFNGKHEKVNSQPRLVQQAKCLKIKGKEDIDLDNLFREYSVEQAQQ
440 450 460 470 480 490
670 680 690 700 710 720
pF1KSD --RSAVFLSFKSPIPC--LPLRWEQQSKLLPTVAGIPASKVSKWSTDEVSEFIQSLPGCE
...: .: : : ::: ::. :::: :: : ::.:..:..:::.::.::: :::
XP_011 VLHQSVSMSTVSAHPFRDLPLGREQHCKLLPGVADIRASQVARWTVDEVAEFVQSLLGCE
500 510 520 530 540 550
730 740 750 760 770 780
pF1KSD EHGKVFKDEQIDGEAFLLMTQTDIVKIMSIKLGPALKIFNSILMFKAAEKNSHNEL
::.: :: :.
XP_011 EHAKCFKKEESSEPGCVNQRRCSSPWSCAEVTGASRSWGKQPTRWPLPSSDRWQSLPASD
560 570 580 590 600 610
>>NP_056293 (OMIM: 608802) lethal(3)malignant brain tumo (772 aa)
initn: 2191 init1: 1669 opt: 1926 Z-score: 1627.8 bits: 312.0 E(85289): 6.3e-84
Smith-Waterman score: 1945; 42.9% identity (65.5% similar) in 725 aa overlap (33-733:29-708)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD ESASSTSGQEFDVFSVMDWKDGVGTLPGSDLKFRVNEFGALEVITDENEMENVKKATATT
:.::..:. :.. :. . ..:
NP_056 MRRREGHGTDSEMGQGPVRESQSSDPPALQFRISEYKPLNMAGVEQPPSPELRQEGVT
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD TWMVPTAQEAPTSPPSSRPVFPPAYWTSPPGCPTVFSEKTGMPFRLKDPVKVEGLQFCEN
. ::.. . : . .:: :. .:: . .. :.
NP_056 EY---EDGGAPAGDGEAGPQQAEDHPQNPPEDPN------------QDPPEDDSTCQCQA
60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KSD CCQYGNVDECLSGGNYCSQNCARHIKDKDQKEERDVEEDNEEEDPKCSRKKKPKLSLKAD
: . . :...: ..: . ..... : . . : : .:.: . ..
NP_056 CGPHQAAGPDLGSSN---DGCPQLFQERSVIVENSSGSTSASELLKPMKKRKRR-EYQSP
110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KSD NKEDGEERDDEMENKQDVRILRGSQRARRKRRGDSAVLKQGLPPKGKKA--WCWASYLEE
..:..: . ::.... . .:. : .: ... : :.: : : :::::
NP_056 SEEESE--PEAMEKQEEGKDPEGQPTASTP---ESEEWSSSQPATGEKKECWSWESYLEE
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KSD EKAVAVPAKLFKEHQSFPYNKNGFKVGMKLEGVDPEHQSVYCVLTVAEVCGYRIKLHFDG
.::...:..::.. :. .::::::.::::::.::.: :.: .::::::::::..:::::
NP_056 QKAITAPVSLFQDSQAVTHNKNGFKLGMKLEGIDPQHPSMYFILTVAEVCGYRLRLHFDG
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KSD YSDCYDFWVNADALDIHPVGWCEKTGHKLHPPKGYKEEEFNWQTYLKTCKAQAAPKSLFE
::.:.::::::.. ::::.:: :::::::.::::::::::.:. ::.. .:::::: ::
NP_056 YSECHDFWVNANSPDIHPAGWFEKTGHKLQPPKGYKEEEFSWSQYLRSTRAQAAPKHLFV
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KSD NQNITVIPSGFRVGMKLEAVDKKNPSFICVATVTDMVDNRFLVHFDNWDESYDYWCEASS
.:. . : ::.:::::::::. :::..:::.:::.::.::::::::::..:::::. ::
NP_056 SQSHSPPPLGFQVGMKLEAVDRMNPSLVCVASVTDVVDSRFLVHFDNWDDTYDYWCDPSS
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KSD PHIHPVGWCKEHRRTLITPPGYPNVKHFSWDKYLEETNSLPAPARAFKVKPPHGFQKKMK
:.:::::::... . : : ::. .: :.::::::.. .:. ::::.:::.: .::
NP_056 PYIHPVGWCQKQGKPLTPPQDYPDPDNFCWEKYLEETGASAVPTWAFKVRPPHSFLVNMK
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KSD LEVVDKRNPMFIRVATVADTDDHRVKVHFDGWNNCYDYWIDADSPDIHPVGWCSKTGHPL
::.::.::: .::::.: :..:::.:.:::::.. ::.::::: :::::.::::::::::
NP_056 LEAVDRRNPALIRVASVEDVEDHRIKIHFDGWSHGYDFWIDADHPDIHPAGWCSKTGHPL
460 470 480 490 500 510
550 560 570
pF1KSD QPPLSPLELMEAS----------------------EHGGCSTPGCKGIGHFKRARHLGPH
::::.: : :: .: : :::: : :: .. . :
NP_056 QPPLGPREPSSASPGGCPPLSYRSLPHTRTSKYSFHHRKCPTPGCDGSGHVT-GKFTAHH
520 530 540 550 560 570
580 590 600 610 620 630
pF1KSD SAANCPYSEINLNKDRIFPDRLSGEMPPASPSFPRNKRTDANESSSSPEIRDQHADDVKE
..:: .: : . ::..:. . : :.: : :. ::. . .: .
NP_056 CLSGCPLAERNQS-------RLKAELSDSEAS-ARKK----NLSGFSPRKKPRHHGRIG-
580 590 600 610 620
640 650 660 670 680 690
pF1KSD DFEERTESEMRTSHEARGAREEPTVQQAQRRSAVFLSFKSPIPCLPLRWEQQSKLLPTVA
: . . .: . .:.:. :: :: : : . :::. :::: ::
NP_056 ----RPPKYRKIPQEDFQTLTPDVVHQSLFMSA--LS-AHPDRSLSVCWEQHCKLLPGVA
630 640 650 660 670
700 710 720 730 740 750
pF1KSD GIPASKVSKWSTDEVSEFIQSLPGCEEHGKVFKDEQIDGEAFLLMTQTDIVKIMSIKLGP
:: :: :.::. ::: :.:.: :::.....::::
NP_056 GISASTVAKWTIDEVFGFVQTLTGCEDQARLFKDEARIVRVTHVSGKTLVWTVAQLGDLV
680 690 700 710 720 730
760 770 780
pF1KSD ALKIFNSILMFKAAEKNSHNEL
NP_056 CSDHLQEGKGILETGVHSLLCSLPTHLLAKLSFASDSQY
740 750 760 770
>>NP_115479 (OMIM: 608802) lethal(3)malignant brain tumo (840 aa)
initn: 2422 init1: 1669 opt: 1926 Z-score: 1627.3 bits: 312.0 E(85289): 6.7e-84
Smith-Waterman score: 1981; 42.2% identity (65.6% similar) in 754 aa overlap (4-733:69-776)
10 20 30
pF1KSD MTESASSTSGQEFDVFSVMDWKDGVGTLPGSDL
::. .:.. : ...: .... ::. :
NP_115 SCFPREPIHVGAPEQVAGCEPVSATVLPQLSAGPASSSTSTV-RLLEWTEAAAPPPGGGL
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80 90
pF1KSD KFRVNEFGALEVITDENEMENVKKATATTTWMVPTAQEAPTSPPSSRPVFPPAYWTSPPG
.::..:. :.. :. . ..: . ::.. . : . .::
NP_115 RFRISEYKPLNMAGVEQPPSPELRQEGVTEY---EDGGAPAGDGEAGPQQAEDHPQNPPE
100 110 120 130 140 150
100 110 120 130 140 150
pF1KSD CPTVFSEKTGMPFRLKDPVKVEGLQFCENCCQYGNVDECLSGGNYCSQNCARHIKDKDQK
:. .:: . .. :. : . . :...: ..: . .....
NP_115 DPN------------QDPPEDDSTCQCQACGPHQAAGPDLGSSN---DGCPQLFQERSVI
160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KSD EERDVEEDNEEEDPKCSRKKKPKLSLKADNKEDGEERDDEMENKQDVRILRGSQRARRKR
: . . : : .:.: . .. ..:..: . ::.... . .:. :
NP_115 VENSSGSTSASELLKPMKKRKRR-EYQSPSEEESE--PEAMEKQEEGKDPEGQPTASTP-
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KSD RGDSAVLKQGLPPKGKKA--WCWASYLEEEKAVAVPAKLFKEHQSFPYNKNGFKVGMKLE
.: ... : :.: : : :::::.::...:..::.. :. .::::::.:::::
NP_115 --ESEEWSSSQPATGEKKECWSWESYLEEQKAITAPVSLFQDSQAVTHNKNGFKLGMKLE
260 270 280 290 300 310
280 290 300 310 320 330
pF1KSD GVDPEHQSVYCVLTVAEVCGYRIKLHFDGYSDCYDFWVNADALDIHPVGWCEKTGHKLHP
:.::.: :.: .::::::::::..:::::::.:.::::::.. ::::.:: :::::::.:
NP_115 GIDPQHPSMYFILTVAEVCGYRLRLHFDGYSECHDFWVNANSPDIHPAGWFEKTGHKLQP
320 330 340 350 360 370
340 350 360 370 380 390
pF1KSD PKGYKEEEFNWQTYLKTCKAQAAPKSLFENQNITVIPSGFRVGMKLEAVDKKNPSFICVA
:::::::::.:. ::.. .:::::: :: .:. . : ::.:::::::::. :::..:::
NP_115 PKGYKEEEFSWSQYLRSTRAQAAPKHLFVSQSHSPPPLGFQVGMKLEAVDRMNPSLVCVA
380 390 400 410 420 430
400 410 420 430 440 450
pF1KSD TVTDMVDNRFLVHFDNWDESYDYWCEASSPHIHPVGWCKEHRRTLITPPGYPNVKHFSWD
.:::.::.::::::::::..:::::. :::.:::::::... . : : ::. .: :.
NP_115 SVTDVVDSRFLVHFDNWDDTYDYWCDPSSPYIHPVGWCQKQGKPLTPPQDYPDPDNFCWE
440 450 460 470 480 490
460 470 480 490 500 510
pF1KSD KYLEETNSLPAPARAFKVKPPHGFQKKMKLEVVDKRNPMFIRVATVADTDDHRVKVHFDG
::::::.. .:. ::::.:::.: .::::.::.::: .::::.: :..:::.:.::::
NP_115 KYLEETGASAVPTWAFKVRPPHSFLVNMKLEAVDRRNPALIRVASVEDVEDHRIKIHFDG
500 510 520 530 540 550
520 530 540 550
pF1KSD WNNCYDYWIDADSPDIHPVGWCSKTGHPLQPPLSPLELMEAS------------------
:.. ::.::::: :::::.::::::::::::::.: : ::
NP_115 WSHGYDFWIDADHPDIHPAGWCSKTGHPLQPPLGPREPSSASPGGCPPLSYRSLPHTRTS
560 570 580 590 600 610
560 570 580 590 600
pF1KSD ----EHGGCSTPGCKGIGHFKRARHLGPHSAANCPYSEINLNKDRIFPDRLSGEMPPASP
.: : :::: : :: .. . : ..:: .: : . ::..:. .
NP_115 KYSFHHRKCPTPGCDGSGHVT-GKFTAHHCLSGCPLAERNQS-------RLKAELSDSEA
620 630 640 650 660
610 620 630 640 650 660
pF1KSD SFPRNKRTDANESSSSPEIRDQHADDVKEDFEERTESEMRTSHEARGAREEPTVQQAQRR
: :.: : :. ::. . .: . . . : . .: . .:.:.
NP_115 S-ARKK----NLSGFSPRKKPRHHGRIGRPPKYR-----KIPQEDFQTLTPDVVHQSLFM
670 680 690 700 710
670 680 690 700 710 720
pF1KSD SAVFLSFKSPIPCLPLRWEQQSKLLPTVAGIPASKVSKWSTDEVSEFIQSLPGCEEHGKV
:: :: : : . :::. :::: :::: :: :.::. ::: :.:.: :::.....
NP_115 SA--LS-AHPDRSLSVCWEQHCKLLPGVAGISASTVAKWTIDEVFGFVQTLTGCEDQARL
720 730 740 750 760 770
730 740 750 760 770 780
pF1KSD FKDEQIDGEAFLLMTQTDIVKIMSIKLGPALKIFNSILMFKAAEKNSHNEL
::::
NP_115 FKDEARIVRVTHVSGKTLVWTVAQLGDLVCSDHLQEGKGILETGVHSLLCSLPTHLLAKL
780 790 800 810 820 830
>>XP_006722427 (OMIM: 617135) PREDICTED: lethal(3)malign (485 aa)
initn: 1824 init1: 1101 opt: 1789 Z-score: 1515.1 bits: 290.5 E(85289): 1.2e-77
Smith-Waterman score: 1789; 56.1% identity (80.8% similar) in 428 aa overlap (179-600:1-421)
150 160 170 180 190 200
pF1KSD DKDQKEERDVEEDNEEEDPKCSRKKKPKLSLKADNKEDGEERDDEMENKQDVRILRGSQR
.: :.. . :.. . :: :. :
XP_006 MKQPNRKRKLNMDSKERLDQDGRL---EQA
10 20
210 220 230 240 250 260
pF1KSD ARRKRRGDSAVLKQGLPPKGKK-AWCWASYLEEEKAVAVPAKLFKEHQSFPYNKNGFKVG
..:. ::.. . .: . . :: : ::.:.::::.:..::.. :::: ..:::..:
XP_006 EEEKKPKDSTTPLSHVPSAAAQGAWSWEWYLKEQKAVAAPVELFSKDQSFPEHENGFQIG
30 40 50 60 70 80
270 280 290 300 310 320
pF1KSD MKLEGVDPEHQSVYCVLTVAEVCGYRIKLHFDGYSDCYDFWVNADALDIHPVGWCEKTGH
:.:::.::.: ::.:::.::::::::..:::::: .:::::.:: . ::::::::::: :
XP_006 MRLEGIDPRHPSVFCVLSVAEVCGYRLRLHFDGYLSCYDFWTNAGSPDIHPVGWCEKTKH
90 100 110 120 130 140
330 340 350 360 370 380
pF1KSD KLHPPKGYKEEEFNWQTYLKTCKAQAAPKSLFENQNITVIPSG-----FRVGMKLEAVDK
.:: ::::....: :. :::.:: : :::.::.:.. :.: :.:::::::::.
XP_006 ELHIPKGYRKDKFVWMDYLKACKLQNAPKKLFRNRS----PNGPMSKEFQVGMKLEAVDR
150 160 170 180 190 200
390 400 410 420 430 440
pF1KSD KNPSFICVATVTDMVDNRFLVHFDNWDESYDYWCEASSPHIHPVGWCKEHRRTLITPPGY
::::..::::..:.:..:.::::::::.::::::...::...:::::.:. ::::.: ::
XP_006 KNPSLVCVATIADIVEDRLLVHFDNWDDSYDYWCDVNSPYVQPVGWCQENGRTLIAPQGY
210 220 230 240 250 260
450 460 470 480 490 500
pF1KSD PNVKHFSWDKYLEETNSLPAPARAFKVKPPHGFQKKMKLEVVDKRNPMFIRVATVADTDD
:: ..::: .::: :.. .::..::.. :::: .::::::::::: .:::::..:.::
XP_006 PNPENFSWTEYLEATQTNAVPAKVFKMRLPHGFLPNMKLEVVDKRNPRLIRVATIVDVDD
270 280 290 300 310 320
510 520 530 540 550 560
pF1KSD HRVKVHFDGWNNCYDYWIDADSPDIHPVGWCSKTGHPLQPPLSPLELMEASEHGGCSTPG
.:::::::::.. ::::..::::::::.:::. :::::. : .: .. : :::
XP_006 QRVKVHFDGWDHKYDYWVEADSPDIHPIGWCDVTGHPLEVPQRTNDLKILPGQAVCPTPG
330 340 350 360 370 380
570 580 590 600 610 620
pF1KSD CKGIGHFKRARHLGPHSAANCPYSEINLNKDRIFPDRLSGEMPPASPSFPRNKRTDANES
:.::::.. :. : ::: .::::..::.:. . :::
XP_006 CRGIGHIRGPRYSGHHSAFGCPYSDMNLKKEATLHDRLREQTQANLESDSSHSKSKSLCS
390 400 410 420 430 440
630 640 650 660 670 680
pF1KSD SSSPEIRDQHADDVKEDFEERTESEMRTSHEARGAREEPTVQQAQRRSAVFLSFKSPIPC
XP_006 LNFNGKHEKVNSQPRLVQQAKCLKIKGKEDIDLDNLFRDGTV
450 460 470 480
>>XP_016881564 (OMIM: 617135) PREDICTED: lethal(3)malign (488 aa)
initn: 1824 init1: 1101 opt: 1789 Z-score: 1515.1 bits: 290.5 E(85289): 1.2e-77
Smith-Waterman score: 1789; 56.1% identity (80.8% similar) in 428 aa overlap (179-600:1-421)
150 160 170 180 190 200
pF1KSD DKDQKEERDVEEDNEEEDPKCSRKKKPKLSLKADNKEDGEERDDEMENKQDVRILRGSQR
.: :.. . :.. . :: :. :
XP_016 MKQPNRKRKLNMDSKERLDQDGRL---EQA
10 20
210 220 230 240 250 260
pF1KSD ARRKRRGDSAVLKQGLPPKGKK-AWCWASYLEEEKAVAVPAKLFKEHQSFPYNKNGFKVG
..:. ::.. . .: . . :: : ::.:.::::.:..::.. :::: ..:::..:
XP_016 EEEKKPKDSTTPLSHVPSAAAQGAWSWEWYLKEQKAVAAPVELFSKDQSFPEHENGFQIG
30 40 50 60 70 80
270 280 290 300 310 320
pF1KSD MKLEGVDPEHQSVYCVLTVAEVCGYRIKLHFDGYSDCYDFWVNADALDIHPVGWCEKTGH
:.:::.::.: ::.:::.::::::::..:::::: .:::::.:: . ::::::::::: :
XP_016 MRLEGIDPRHPSVFCVLSVAEVCGYRLRLHFDGYLSCYDFWTNAGSPDIHPVGWCEKTKH
90 100 110 120 130 140
330 340 350 360 370 380
pF1KSD KLHPPKGYKEEEFNWQTYLKTCKAQAAPKSLFENQNITVIPSG-----FRVGMKLEAVDK
.:: ::::....: :. :::.:: : :::.::.:.. :.: :.:::::::::.
XP_016 ELHIPKGYRKDKFVWMDYLKACKLQNAPKKLFRNRS----PNGPMSKEFQVGMKLEAVDR
150 160 170 180 190 200
390 400 410 420 430 440
pF1KSD KNPSFICVATVTDMVDNRFLVHFDNWDESYDYWCEASSPHIHPVGWCKEHRRTLITPPGY
::::..::::..:.:..:.::::::::.::::::...::...:::::.:. ::::.: ::
XP_016 KNPSLVCVATIADIVEDRLLVHFDNWDDSYDYWCDVNSPYVQPVGWCQENGRTLIAPQGY
210 220 230 240 250 260
450 460 470 480 490 500
pF1KSD PNVKHFSWDKYLEETNSLPAPARAFKVKPPHGFQKKMKLEVVDKRNPMFIRVATVADTDD
:: ..::: .::: :.. .::..::.. :::: .::::::::::: .:::::..:.::
XP_016 PNPENFSWTEYLEATQTNAVPAKVFKMRLPHGFLPNMKLEVVDKRNPRLIRVATIVDVDD
270 280 290 300 310 320
510 520 530 540 550 560
pF1KSD HRVKVHFDGWNNCYDYWIDADSPDIHPVGWCSKTGHPLQPPLSPLELMEASEHGGCSTPG
.:::::::::.. ::::..::::::::.:::. :::::. : .: .. : :::
XP_016 QRVKVHFDGWDHKYDYWVEADSPDIHPIGWCDVTGHPLEVPQRTNDLKILPGQAVCPTPG
330 340 350 360 370 380
570 580 590 600 610 620
pF1KSD CKGIGHFKRARHLGPHSAANCPYSEINLNKDRIFPDRLSGEMPPASPSFPRNKRTDANES
:.::::.. :. : ::: .::::..::.:. . :::
XP_016 CRGIGHIRGPRYSGHHSAFGCPYSDMNLKKEATLHDRLREQTQANLESDSSHSKSKSLCS
390 400 410 420 430 440
630 640 650 660 670 680
pF1KSD SSSPEIRDQHADDVKEDFEERTESEMRTSHEARGAREEPTVQQAQRRSAVFLSFKSPIPC
XP_016 LNFNGKHEKVNSQPRWLSLYSLFWAVKSMPSALRKSRSMAKPSCF
450 460 470 480
>>XP_016881565 (OMIM: 617135) PREDICTED: lethal(3)malign (488 aa)
initn: 1824 init1: 1101 opt: 1789 Z-score: 1515.1 bits: 290.5 E(85289): 1.2e-77
Smith-Waterman score: 1789; 56.1% identity (80.8% similar) in 428 aa overlap (179-600:1-421)
150 160 170 180 190 200
pF1KSD DKDQKEERDVEEDNEEEDPKCSRKKKPKLSLKADNKEDGEERDDEMENKQDVRILRGSQR
.: :.. . :.. . :: :. :
XP_016 MKQPNRKRKLNMDSKERLDQDGRL---EQA
10 20
210 220 230 240 250 260
pF1KSD ARRKRRGDSAVLKQGLPPKGKK-AWCWASYLEEEKAVAVPAKLFKEHQSFPYNKNGFKVG
..:. ::.. . .: . . :: : ::.:.::::.:..::.. :::: ..:::..:
XP_016 EEEKKPKDSTTPLSHVPSAAAQGAWSWEWYLKEQKAVAAPVELFSKDQSFPEHENGFQIG
30 40 50 60 70 80
270 280 290 300 310 320
pF1KSD MKLEGVDPEHQSVYCVLTVAEVCGYRIKLHFDGYSDCYDFWVNADALDIHPVGWCEKTGH
:.:::.::.: ::.:::.::::::::..:::::: .:::::.:: . ::::::::::: :
XP_016 MRLEGIDPRHPSVFCVLSVAEVCGYRLRLHFDGYLSCYDFWTNAGSPDIHPVGWCEKTKH
90 100 110 120 130 140
330 340 350 360 370 380
pF1KSD KLHPPKGYKEEEFNWQTYLKTCKAQAAPKSLFENQNITVIPSG-----FRVGMKLEAVDK
.:: ::::....: :. :::.:: : :::.::.:.. :.: :.:::::::::.
XP_016 ELHIPKGYRKDKFVWMDYLKACKLQNAPKKLFRNRS----PNGPMSKEFQVGMKLEAVDR
150 160 170 180 190 200
390 400 410 420 430 440
pF1KSD KNPSFICVATVTDMVDNRFLVHFDNWDESYDYWCEASSPHIHPVGWCKEHRRTLITPPGY
::::..::::..:.:..:.::::::::.::::::...::...:::::.:. ::::.: ::
XP_016 KNPSLVCVATIADIVEDRLLVHFDNWDDSYDYWCDVNSPYVQPVGWCQENGRTLIAPQGY
210 220 230 240 250 260
450 460 470 480 490 500
pF1KSD PNVKHFSWDKYLEETNSLPAPARAFKVKPPHGFQKKMKLEVVDKRNPMFIRVATVADTDD
:: ..::: .::: :.. .::..::.. :::: .::::::::::: .:::::..:.::
XP_016 PNPENFSWTEYLEATQTNAVPAKVFKMRLPHGFLPNMKLEVVDKRNPRLIRVATIVDVDD
270 280 290 300 310 320
510 520 530 540 550 560
pF1KSD HRVKVHFDGWNNCYDYWIDADSPDIHPVGWCSKTGHPLQPPLSPLELMEASEHGGCSTPG
.:::::::::.. ::::..::::::::.:::. :::::. : .: .. : :::
XP_016 QRVKVHFDGWDHKYDYWVEADSPDIHPIGWCDVTGHPLEVPQRTNDLKILPGQAVCPTPG
330 340 350 360 370 380
570 580 590 600 610 620
pF1KSD CKGIGHFKRARHLGPHSAANCPYSEINLNKDRIFPDRLSGEMPPASPSFPRNKRTDANES
:.::::.. :. : ::: .::::..::.:. . :::
XP_016 CRGIGHIRGPRYSGHHSAFGCPYSDMNLKKEATLHDRLREQTQANLESDSSHSKSKSLCS
390 400 410 420 430 440
630 640 650 660 670 680
pF1KSD SSSPEIRDQHADDVKEDFEERTESEMRTSHEARGAREEPTVQQAQRRSAVFLSFKSPIPC
XP_016 LNFNGKHEKVNSQPRWLSLYSLFWAVKSMPSALRKSRSMAKPSCF
450 460 470 480
>>XP_011524067 (OMIM: 617135) PREDICTED: lethal(3)malign (497 aa)
initn: 1824 init1: 1101 opt: 1789 Z-score: 1515.0 bits: 290.5 E(85289): 1.2e-77
Smith-Waterman score: 1789; 56.1% identity (80.8% similar) in 428 aa overlap (179-600:1-421)
150 160 170 180 190 200
pF1KSD DKDQKEERDVEEDNEEEDPKCSRKKKPKLSLKADNKEDGEERDDEMENKQDVRILRGSQR
.: :.. . :.. . :: :. :
XP_011 MKQPNRKRKLNMDSKERLDQDGRL---EQA
10 20
210 220 230 240 250 260
pF1KSD ARRKRRGDSAVLKQGLPPKGKK-AWCWASYLEEEKAVAVPAKLFKEHQSFPYNKNGFKVG
..:. ::.. . .: . . :: : ::.:.::::.:..::.. :::: ..:::..:
XP_011 EEEKKPKDSTTPLSHVPSAAAQGAWSWEWYLKEQKAVAAPVELFSKDQSFPEHENGFQIG
30 40 50 60 70 80
270 280 290 300 310 320
pF1KSD MKLEGVDPEHQSVYCVLTVAEVCGYRIKLHFDGYSDCYDFWVNADALDIHPVGWCEKTGH
:.:::.::.: ::.:::.::::::::..:::::: .:::::.:: . ::::::::::: :
XP_011 MRLEGIDPRHPSVFCVLSVAEVCGYRLRLHFDGYLSCYDFWTNAGSPDIHPVGWCEKTKH
90 100 110 120 130 140
330 340 350 360 370 380
pF1KSD KLHPPKGYKEEEFNWQTYLKTCKAQAAPKSLFENQNITVIPSG-----FRVGMKLEAVDK
.:: ::::....: :. :::.:: : :::.::.:.. :.: :.:::::::::.
XP_011 ELHIPKGYRKDKFVWMDYLKACKLQNAPKKLFRNRS----PNGPMSKEFQVGMKLEAVDR
150 160 170 180 190 200
390 400 410 420 430 440
pF1KSD KNPSFICVATVTDMVDNRFLVHFDNWDESYDYWCEASSPHIHPVGWCKEHRRTLITPPGY
::::..::::..:.:..:.::::::::.::::::...::...:::::.:. ::::.: ::
XP_011 KNPSLVCVATIADIVEDRLLVHFDNWDDSYDYWCDVNSPYVQPVGWCQENGRTLIAPQGY
210 220 230 240 250 260
450 460 470 480 490 500
pF1KSD PNVKHFSWDKYLEETNSLPAPARAFKVKPPHGFQKKMKLEVVDKRNPMFIRVATVADTDD
:: ..::: .::: :.. .::..::.. :::: .::::::::::: .:::::..:.::
XP_011 PNPENFSWTEYLEATQTNAVPAKVFKMRLPHGFLPNMKLEVVDKRNPRLIRVATIVDVDD
270 280 290 300 310 320
510 520 530 540 550 560
pF1KSD HRVKVHFDGWNNCYDYWIDADSPDIHPVGWCSKTGHPLQPPLSPLELMEASEHGGCSTPG
.:::::::::.. ::::..::::::::.:::. :::::. : .: .. : :::
XP_011 QRVKVHFDGWDHKYDYWVEADSPDIHPIGWCDVTGHPLEVPQRTNDLKILPGQAVCPTPG
330 340 350 360 370 380
570 580 590 600 610 620
pF1KSD CKGIGHFKRARHLGPHSAANCPYSEINLNKDRIFPDRLSGEMPPASPSFPRNKRTDANES
:.::::.. :. : ::: .::::..::.:. . :::
XP_011 CRGIGHIRGPRYSGHHSAFGCPYSDMNLKKEATLHDRLREQTQANLESDSSHSKSKSLCS
390 400 410 420 430 440
630 640 650 660 670 680
pF1KSD SSSPEIRDQHADDVKEDFEERTESEMRTSHEARGAREEPTVQQAQRRSAVFLSFKSPIPC
XP_011 LNFNGKHEKVNSQPRLVQQAKCLKIKGKEDIDLDNLFRGNGRKSLTRSQKRLVF
450 460 470 480 490
>>XP_011524065 (OMIM: 617135) PREDICTED: lethal(3)malign (521 aa)
initn: 1824 init1: 1101 opt: 1789 Z-score: 1514.7 bits: 290.5 E(85289): 1.2e-77
Smith-Waterman score: 1789; 56.1% identity (80.8% similar) in 428 aa overlap (179-600:1-421)
150 160 170 180 190 200
pF1KSD DKDQKEERDVEEDNEEEDPKCSRKKKPKLSLKADNKEDGEERDDEMENKQDVRILRGSQR
.: :.. . :.. . :: :. :
XP_011 MKQPNRKRKLNMDSKERLDQDGRL---EQA
10 20
210 220 230 240 250 260
pF1KSD ARRKRRGDSAVLKQGLPPKGKK-AWCWASYLEEEKAVAVPAKLFKEHQSFPYNKNGFKVG
..:. ::.. . .: . . :: : ::.:.::::.:..::.. :::: ..:::..:
XP_011 EEEKKPKDSTTPLSHVPSAAAQGAWSWEWYLKEQKAVAAPVELFSKDQSFPEHENGFQIG
30 40 50 60 70 80
270 280 290 300 310 320
pF1KSD MKLEGVDPEHQSVYCVLTVAEVCGYRIKLHFDGYSDCYDFWVNADALDIHPVGWCEKTGH
:.:::.::.: ::.:::.::::::::..:::::: .:::::.:: . ::::::::::: :
XP_011 MRLEGIDPRHPSVFCVLSVAEVCGYRLRLHFDGYLSCYDFWTNAGSPDIHPVGWCEKTKH
90 100 110 120 130 140
330 340 350 360 370 380
pF1KSD KLHPPKGYKEEEFNWQTYLKTCKAQAAPKSLFENQNITVIPSG-----FRVGMKLEAVDK
.:: ::::....: :. :::.:: : :::.::.:.. :.: :.:::::::::.
XP_011 ELHIPKGYRKDKFVWMDYLKACKLQNAPKKLFRNRS----PNGPMSKEFQVGMKLEAVDR
150 160 170 180 190 200
390 400 410 420 430 440
pF1KSD KNPSFICVATVTDMVDNRFLVHFDNWDESYDYWCEASSPHIHPVGWCKEHRRTLITPPGY
::::..::::..:.:..:.::::::::.::::::...::...:::::.:. ::::.: ::
XP_011 KNPSLVCVATIADIVEDRLLVHFDNWDDSYDYWCDVNSPYVQPVGWCQENGRTLIAPQGY
210 220 230 240 250 260
450 460 470 480 490 500
pF1KSD PNVKHFSWDKYLEETNSLPAPARAFKVKPPHGFQKKMKLEVVDKRNPMFIRVATVADTDD
:: ..::: .::: :.. .::..::.. :::: .::::::::::: .:::::..:.::
XP_011 PNPENFSWTEYLEATQTNAVPAKVFKMRLPHGFLPNMKLEVVDKRNPRLIRVATIVDVDD
270 280 290 300 310 320
510 520 530 540 550 560
pF1KSD HRVKVHFDGWNNCYDYWIDADSPDIHPVGWCSKTGHPLQPPLSPLELMEASEHGGCSTPG
.:::::::::.. ::::..::::::::.:::. :::::. : .: .. : :::
XP_011 QRVKVHFDGWDHKYDYWVEADSPDIHPIGWCDVTGHPLEVPQRTNDLKILPGQAVCPTPG
330 340 350 360 370 380
570 580 590 600 610 620
pF1KSD CKGIGHFKRARHLGPHSAANCPYSEINLNKDRIFPDRLSGEMPPASPSFPRNKRTDANES
:.::::.. :. : ::: .::::..::.:. . :::
XP_011 CRGIGHIRGPRYSGHHSAFGCPYSDMNLKKEATLHDRLREQTQANLESDSSHSKSKSLCS
390 400 410 420 430 440
630 640 650 660 670 680
pF1KSD SSSPEIRDQHADDVKEDFEERTESEMRTSHEARGAREEPTVQQAQRRSAVFLSFKSPIPC
XP_011 LNFNGKHEKVNSQPRLVQQAKCLKIKGKEDIDLDNLFRAHLQPWQLCTFVSPGRCRRSVC
450 460 470 480 490 500
>>XP_011524064 (OMIM: 617135) PREDICTED: lethal(3)malign (567 aa)
initn: 1824 init1: 1101 opt: 1789 Z-score: 1514.2 bits: 290.5 E(85289): 1.3e-77
Smith-Waterman score: 1789; 56.1% identity (80.8% similar) in 428 aa overlap (179-600:1-421)
150 160 170 180 190 200
pF1KSD DKDQKEERDVEEDNEEEDPKCSRKKKPKLSLKADNKEDGEERDDEMENKQDVRILRGSQR
.: :.. . :.. . :: :. :
XP_011 MKQPNRKRKLNMDSKERLDQDGRL---EQA
10 20
210 220 230 240 250 260
pF1KSD ARRKRRGDSAVLKQGLPPKGKK-AWCWASYLEEEKAVAVPAKLFKEHQSFPYNKNGFKVG
..:. ::.. . .: . . :: : ::.:.::::.:..::.. :::: ..:::..:
XP_011 EEEKKPKDSTTPLSHVPSAAAQGAWSWEWYLKEQKAVAAPVELFSKDQSFPEHENGFQIG
30 40 50 60 70 80
270 280 290 300 310 320
pF1KSD MKLEGVDPEHQSVYCVLTVAEVCGYRIKLHFDGYSDCYDFWVNADALDIHPVGWCEKTGH
:.:::.::.: ::.:::.::::::::..:::::: .:::::.:: . ::::::::::: :
XP_011 MRLEGIDPRHPSVFCVLSVAEVCGYRLRLHFDGYLSCYDFWTNAGSPDIHPVGWCEKTKH
90 100 110 120 130 140
330 340 350 360 370 380
pF1KSD KLHPPKGYKEEEFNWQTYLKTCKAQAAPKSLFENQNITVIPSG-----FRVGMKLEAVDK
.:: ::::....: :. :::.:: : :::.::.:.. :.: :.:::::::::.
XP_011 ELHIPKGYRKDKFVWMDYLKACKLQNAPKKLFRNRS----PNGPMSKEFQVGMKLEAVDR
150 160 170 180 190 200
390 400 410 420 430 440
pF1KSD KNPSFICVATVTDMVDNRFLVHFDNWDESYDYWCEASSPHIHPVGWCKEHRRTLITPPGY
::::..::::..:.:..:.::::::::.::::::...::...:::::.:. ::::.: ::
XP_011 KNPSLVCVATIADIVEDRLLVHFDNWDDSYDYWCDVNSPYVQPVGWCQENGRTLIAPQGY
210 220 230 240 250 260
450 460 470 480 490 500
pF1KSD PNVKHFSWDKYLEETNSLPAPARAFKVKPPHGFQKKMKLEVVDKRNPMFIRVATVADTDD
:: ..::: .::: :.. .::..::.. :::: .::::::::::: .:::::..:.::
XP_011 PNPENFSWTEYLEATQTNAVPAKVFKMRLPHGFLPNMKLEVVDKRNPRLIRVATIVDVDD
270 280 290 300 310 320
510 520 530 540 550 560
pF1KSD HRVKVHFDGWNNCYDYWIDADSPDIHPVGWCSKTGHPLQPPLSPLELMEASEHGGCSTPG
.:::::::::.. ::::..::::::::.:::. :::::. : .: .. : :::
XP_011 QRVKVHFDGWDHKYDYWVEADSPDIHPIGWCDVTGHPLEVPQRTNDLKILPGQAVCPTPG
330 340 350 360 370 380
570 580 590 600 610 620
pF1KSD CKGIGHFKRARHLGPHSAANCPYSEINLNKDRIFPDRLSGEMPPASPSFPRNKRTDANES
:.::::.. :. : ::: .::::..::.:. . :::
XP_011 CRGIGHIRGPRYSGHHSAFGCPYSDMNLKKEATLHDRLREQTQANLESDSSHSKSKSLCS
390 400 410 420 430 440
630 640 650 660 670 680
pF1KSD SSSPEIRDQHADDVKEDFEERTESEMRTSHEARGAREEPTVQQAQRRSAVFLSFKSPIPC
XP_011 LNFNGKHEKVNSQPRLVQQAKCLKIKGKEDIDLDNLFRGTRLEGVTTLNTTFHSNKSGAC
450 460 470 480 490 500
780 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 07:22:16 2016 done: Thu Nov 3 07:22:18 2016
Total Scan time: 11.240 Total Display time: 0.110
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]