Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA1798
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1798, 780 aa
1>>>pF1KSDA1798 780 - 780 aa - 780 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0024+/-0.000847; mu= 14.2007+/- 0.052
mean_var=133.3502+/-26.071, 0's: 0 Z-trim(112.0): 35 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.111065
statistics sampled from 12829 (12864) to 12829 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.735), E-opt: 0.2 (0.395), width: 16
Scan time: 4.450
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34537.1 L3MBTL3 gene_id:84456|Hs108|chr6 ( 780) 5478 889.4 0
CCDS34538.1 L3MBTL3 gene_id:84456|Hs108|chr6 ( 755) 4827 785.1 0
CCDS82238.1 L3MBTL4 gene_id:91133|Hs108|chr18 ( 614) 2190 362.5 1.2e-99
CCDS13319.1 L3MBTL1 gene_id:26013|Hs108|chr20 ( 772) 1926 320.2 7.7e-87
CCDS46602.2 L3MBTL1 gene_id:26013|Hs108|chr20 ( 840) 1926 320.3 8.3e-87
CCDS11839.2 L3MBTL4 gene_id:91133|Hs108|chr18 ( 623) 1789 298.2 2.7e-80
CCDS14011.1 L3MBTL2 gene_id:83746|Hs108|chr22 ( 705) 666 118.3 4.3e-26
CCDS11581.2 MBTD1 gene_id:54799|Hs108|chr17 ( 628) 643 114.6 5.1e-25
CCDS14185.1 SCML2 gene_id:10389|Hs108|chrX ( 700) 605 108.5 3.8e-23
CCDS30688.1 SCMH1 gene_id:22955|Hs108|chr1 ( 660) 576 103.9 9e-22
CCDS53304.1 SCMH1 gene_id:22955|Hs108|chr1 ( 648) 575 103.7 9.9e-22
CCDS461.1 SCMH1 gene_id:22955|Hs108|chr1 ( 591) 533 97.0 9.8e-20
CCDS53301.1 SCMH1 gene_id:22955|Hs108|chr1 ( 577) 501 91.8 3.4e-18
CCDS53302.1 SCMH1 gene_id:22955|Hs108|chr1 ( 599) 501 91.8 3.5e-18
CCDS31138.1 SFMBT2 gene_id:57713|Hs108|chr10 ( 894) 363 69.8 2.1e-11
>>CCDS34537.1 L3MBTL3 gene_id:84456|Hs108|chr6 (780 aa)
initn: 5478 init1: 5478 opt: 5478 Z-score: 4748.3 bits: 889.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5478; 99.9% identity (100.0% similar) in 780 aa overlap (1-780:1-780)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MTESASSTSGQEFDVFSVMDWKDGVGTLPGSDLKFRVNEFGALEVITDENEMENVKKATA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MTESASSTSGQEFDVFSVMDWKDGVGTLPGSDLKFRVNEFGALEVITDENEMENVKKATA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD TTTWMVPTAQEAPTSPPSSRPVFPPAYWTSPPGCPTVFSEKTGMPFRLKDPVKVEGLQFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TTTWMVPTAQEAPTSPPSSRPVFPPAYWTSPPGCPTVFSEKTGMPFRLKDPVKVEGLQFC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD ENCCQYGNVDECLSGGNYCSQNCARHIKDKDQKEERDVEEDNEEEDPKCSRKKKPKLSLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ENCCQYGNVDECLSGGNYCSQNCARHIKDKDQKEERDVEEDNEEEDPKCSRKKKPKLSLK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD ADNKEDGEERDDEMENKQDVRILRGSQRARRKRRGDSAVLKQGLPPKGKKAWCWASYLEE
::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ADTKEDGEERDDEMENKQDVRILRGSQRARRKRRGDSAVLKQGLPPKGKKAWCWASYLEE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD EKAVAVPAKLFKEHQSFPYNKNGFKVGMKLEGVDPEHQSVYCVLTVAEVCGYRIKLHFDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EKAVAVPAKLFKEHQSFPYNKNGFKVGMKLEGVDPEHQSVYCVLTVAEVCGYRIKLHFDG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD YSDCYDFWVNADALDIHPVGWCEKTGHKLHPPKGYKEEEFNWQTYLKTCKAQAAPKSLFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 YSDCYDFWVNADALDIHPVGWCEKTGHKLHPPKGYKEEEFNWQTYLKTCKAQAAPKSLFE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD NQNITVIPSGFRVGMKLEAVDKKNPSFICVATVTDMVDNRFLVHFDNWDESYDYWCEASS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NQNITVIPSGFRVGMKLEAVDKKNPSFICVATVTDMVDNRFLVHFDNWDESYDYWCEASS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD PHIHPVGWCKEHRRTLITPPGYPNVKHFSWDKYLEETNSLPAPARAFKVKPPHGFQKKMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PHIHPVGWCKEHRRTLITPPGYPNVKHFSWDKYLEETNSLPAPARAFKVKPPHGFQKKMK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD LEVVDKRNPMFIRVATVADTDDHRVKVHFDGWNNCYDYWIDADSPDIHPVGWCSKTGHPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LEVVDKRNPMFIRVATVADTDDHRVKVHFDGWNNCYDYWIDADSPDIHPVGWCSKTGHPL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD QPPLSPLELMEASEHGGCSTPGCKGIGHFKRARHLGPHSAANCPYSEINLNKDRIFPDRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QPPLSPLELMEASEHGGCSTPGCKGIGHFKRARHLGPHSAANCPYSEINLNKDRIFPDRL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD SGEMPPASPSFPRNKRTDANESSSSPEIRDQHADDVKEDFEERTESEMRTSHEARGAREE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SGEMPPASPSFPRNKRTDANESSSSPEIRDQHADDVKEDFEERTESEMRTSHEARGAREE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD PTVQQAQRRSAVFLSFKSPIPCLPLRWEQQSKLLPTVAGIPASKVSKWSTDEVSEFIQSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PTVQQAQRRSAVFLSFKSPIPCLPLRWEQQSKLLPTVAGIPASKVSKWSTDEVSEFIQSL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD PGCEEHGKVFKDEQIDGEAFLLMTQTDIVKIMSIKLGPALKIFNSILMFKAAEKNSHNEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PGCEEHGKVFKDEQIDGEAFLLMTQTDIVKIMSIKLGPALKIFNSILMFKAAEKNSHNEL
730 740 750 760 770 780
>>CCDS34538.1 L3MBTL3 gene_id:84456|Hs108|chr6 (755 aa)
initn: 5265 init1: 4820 opt: 4827 Z-score: 4184.8 bits: 785.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5219; 96.7% identity (96.8% similar) in 780 aa overlap (1-780:1-755)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MTESASSTSGQEFDVFSVMDWKDGVGTLPGSDLKFRVNEFGALEVITDENEMENVKKATA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MTESASSTSGQEFDVFSVMDWKDGVGTLPGSDLKFRVNEFGALEVITDENEMENVKKATA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD TTTWMVPTAQEAPTSPPSSRPVFPPAYWTSPPGCPTVFSEKTGMPFRLKDPVKVEGLQFC
::::::::::: ::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TTTWMVPTAQE-------------------------VFSEKTGMPFRLKDPVKVEGLQFC
70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KSD ENCCQYGNVDECLSGGNYCSQNCARHIKDKDQKEERDVEEDNEEEDPKCSRKKKPKLSLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ENCCQYGNVDECLSGGNYCSQNCARHIKDKDQKEERDVEEDNEEEDPKCSRKKKPKLSLK
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KSD ADNKEDGEERDDEMENKQDVRILRGSQRARRKRRGDSAVLKQGLPPKGKKAWCWASYLEE
::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ADTKEDGEERDDEMENKQDVRILRGSQRARRKRRGDSAVLKQGLPPKGKKAWCWASYLEE
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KSD EKAVAVPAKLFKEHQSFPYNKNGFKVGMKLEGVDPEHQSVYCVLTVAEVCGYRIKLHFDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EKAVAVPAKLFKEHQSFPYNKNGFKVGMKLEGVDPEHQSVYCVLTVAEVCGYRIKLHFDG
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KSD YSDCYDFWVNADALDIHPVGWCEKTGHKLHPPKGYKEEEFNWQTYLKTCKAQAAPKSLFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 YSDCYDFWVNADALDIHPVGWCEKTGHKLHPPKGYKEEEFNWQTYLKTCKAQAAPKSLFE
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KSD NQNITVIPSGFRVGMKLEAVDKKNPSFICVATVTDMVDNRFLVHFDNWDESYDYWCEASS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NQNITVIPSGFRVGMKLEAVDKKNPSFICVATVTDMVDNRFLVHFDNWDESYDYWCEASS
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KSD PHIHPVGWCKEHRRTLITPPGYPNVKHFSWDKYLEETNSLPAPARAFKVKPPHGFQKKMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PHIHPVGWCKEHRRTLITPPGYPNVKHFSWDKYLEETNSLPAPARAFKVKPPHGFQKKMK
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KSD LEVVDKRNPMFIRVATVADTDDHRVKVHFDGWNNCYDYWIDADSPDIHPVGWCSKTGHPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LEVVDKRNPMFIRVATVADTDDHRVKVHFDGWNNCYDYWIDADSPDIHPVGWCSKTGHPL
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KSD QPPLSPLELMEASEHGGCSTPGCKGIGHFKRARHLGPHSAANCPYSEINLNKDRIFPDRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QPPLSPLELMEASEHGGCSTPGCKGIGHFKRARHLGPHSAANCPYSEINLNKDRIFPDRL
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640 650 660
pF1KSD SGEMPPASPSFPRNKRTDANESSSSPEIRDQHADDVKEDFEERTESEMRTSHEARGAREE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SGEMPPASPSFPRNKRTDANESSSSPEIRDQHADDVKEDFEERTESEMRTSHEARGAREE
580 590 600 610 620 630
670 680 690 700 710 720
pF1KSD PTVQQAQRRSAVFLSFKSPIPCLPLRWEQQSKLLPTVAGIPASKVSKWSTDEVSEFIQSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PTVQQAQRRSAVFLSFKSPIPCLPLRWEQQSKLLPTVAGIPASKVSKWSTDEVSEFIQSL
640 650 660 670 680 690
730 740 750 760 770 780
pF1KSD PGCEEHGKVFKDEQIDGEAFLLMTQTDIVKIMSIKLGPALKIFNSILMFKAAEKNSHNEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PGCEEHGKVFKDEQIDGEAFLLMTQTDIVKIMSIKLGPALKIFNSILMFKAAEKNSHNEL
700 710 720 730 740 750
>>CCDS82238.1 L3MBTL4 gene_id:91133|Hs108|chr18 (614 aa)
initn: 2182 init1: 1101 opt: 2190 Z-score: 1902.5 bits: 362.5 E(32554): 1.2e-99
Smith-Waterman score: 2191; 52.1% identity (76.8% similar) in 620 aa overlap (179-774:1-600)
150 160 170 180 190 200
pF1KSD DKDQKEERDVEEDNEEEDPKCSRKKKPKLSLKADNKEDGEERDDEMENKQDVRILRGSQR
.: :.. . :.. . :: :. :
CCDS82 MKQPNRKRKLNMDSKERLDQDGRL---EQA
10 20
210 220 230 240 250 260
pF1KSD ARRKRRGDSAVLKQGLPPKGKK-AWCWASYLEEEKAVAVPAKLFKEHQSFPYNKNGFKVG
..:. ::.. . .: . . :: : ::.:.::::.:..::.. :::: ..:::..:
CCDS82 EEEKKPKDSTTPLSHVPSAAAQGAWSWEWYLKEQKAVAAPVELFSKDQSFPEHENGFQIG
30 40 50 60 70 80
270 280 290 300 310 320
pF1KSD MKLEGVDPEHQSVYCVLTVAEVCGYRIKLHFDGYSDCYDFWVNADALDIHPVGWCEKTGH
:.:::.::.: ::.:::.::::::::..:::::: .:::::.:: . ::::::::::: :
CCDS82 MRLEGIDPRHPSVFCVLSVAEVCGYRLRLHFDGYLSCYDFWTNAGSPDIHPVGWCEKTKH
90 100 110 120 130 140
330 340 350 360 370 380
pF1KSD KLHPPKGYKEEEFNWQTYLKTCKAQAAPKSLFENQNITVIPSG-----FRVGMKLEAVDK
.:: ::::....: :. :::.:: : :::.::.:.. :.: :.:::::::::.
CCDS82 ELHIPKGYRKDKFVWMDYLKACKLQNAPKKLFRNRS----PNGPMSKEFQVGMKLEAVDR
150 160 170 180 190 200
390 400 410 420 430 440
pF1KSD KNPSFICVATVTDMVDNRFLVHFDNWDESYDYWCEASSPHIHPVGWCKEHRRTLITPPGY
::::..::::..:.:..:.::::::::.::::::...::...:::::.:. ::::.: ::
CCDS82 KNPSLVCVATIADIVEDRLLVHFDNWDDSYDYWCDVNSPYVQPVGWCQENGRTLIAPQGY
210 220 230 240 250 260
450 460 470 480 490 500
pF1KSD PNVKHFSWDKYLEETNSLPAPARAFKVKPPHGFQKKMKLEVVDKRNPMFIRVATVADTDD
:: ..::: .::: :.. .::..::.. :::: .::::::::::: .:::::..:.::
CCDS82 PNPENFSWTEYLEATQTNAVPAKVFKMRLPHGFLPNMKLEVVDKRNPRLIRVATIVDVDD
270 280 290 300 310 320
510 520 530 540 550 560
pF1KSD HRVKVHFDGWNNCYDYWIDADSPDIHPVGWCSKTGHPLQPPLSPLELMEASEHGGCSTPG
.:::::::::.. ::::..::::::::.:::. :::::. : .: .. : :::
CCDS82 QRVKVHFDGWDHKYDYWVEADSPDIHPIGWCDVTGHPLEVPQRTNDLKILPGQAVCPTPG
330 340 350 360 370 380
570 580 590 600 610 620
pF1KSD CKGIGHFKRARHLGPHSAANCPYSEINLNKDRIFPDRLSGEMPPASPSFPRNKRTDANES
:.::::.. :. : ::: .::::..::.:. . ::: ..:.::
CCDS82 CRGIGHIRGPRYSGHHSAFGCPYSDMNLKKEATLHDRLR-------------EQTQANLE
390 400 410 420 430
630 640 650 660
pF1KSD SSSPEIRDQHADDVKEDFE-ERTESEMRTSHEAR-----GARE--------EPTVQQAQR
:.: . ... ... . . :...:. : ..:. : .. : .:.:::.
CCDS82 SDSSHSKSKSLCSLNFNGKHEKVNSQPRLVQQAKCLKIKGKEDIDLDNLFREYSVEQAQQ
440 450 460 470 480 490
670 680 690 700 710 720
pF1KSD --RSAVFLSFKSPIPC--LPLRWEQQSKLLPTVAGIPASKVSKWSTDEVSEFIQSLPGCE
...: .: : : ::: ::. :::: :: : ::.:..:..:::.::.::: :::
CCDS82 VLHQSVSMSTVSAHPFRDLPLGREQHCKLLPGVADIRASQVARWTVDEVAEFVQSLLGCE
500 510 520 530 540 550
730 740 750 760 770 780
pF1KSD EHGKVFKDEQIDGEAFLLMTQTDIVKIMSIKLGPALKIFNSILMFKAAEKNSHNEL
::.: :: :::::.::::.:::::::.:.:::::::::.::::::. ...
CCDS82 EHAKCFKKEQIDGKAFLLLTQTDIVKVMKIKLGPALKIYNSILMFRHSQELPEEDIASGQ
560 570 580 590 600 610
CCDS82 EVRG
>>CCDS13319.1 L3MBTL1 gene_id:26013|Hs108|chr20 (772 aa)
initn: 2191 init1: 1669 opt: 1926 Z-score: 1672.5 bits: 320.2 E(32554): 7.7e-87
Smith-Waterman score: 1945; 42.9% identity (65.5% similar) in 725 aa overlap (33-733:29-708)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD ESASSTSGQEFDVFSVMDWKDGVGTLPGSDLKFRVNEFGALEVITDENEMENVKKATATT
:.::..:. :.. :. . ..:
CCDS13 MRRREGHGTDSEMGQGPVRESQSSDPPALQFRISEYKPLNMAGVEQPPSPELRQEGVT
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD TWMVPTAQEAPTSPPSSRPVFPPAYWTSPPGCPTVFSEKTGMPFRLKDPVKVEGLQFCEN
. ::.. . : . .:: :. .:: . .. :.
CCDS13 EY---EDGGAPAGDGEAGPQQAEDHPQNPPEDPN------------QDPPEDDSTCQCQA
60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KSD CCQYGNVDECLSGGNYCSQNCARHIKDKDQKEERDVEEDNEEEDPKCSRKKKPKLSLKAD
: . . :...: ..: . ..... : . . : : .:.: . ..
CCDS13 CGPHQAAGPDLGSSN---DGCPQLFQERSVIVENSSGSTSASELLKPMKKRKRR-EYQSP
110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KSD NKEDGEERDDEMENKQDVRILRGSQRARRKRRGDSAVLKQGLPPKGKKA--WCWASYLEE
..:..: . ::.... . .:. : .: ... : :.: : : :::::
CCDS13 SEEESE--PEAMEKQEEGKDPEGQPTASTP---ESEEWSSSQPATGEKKECWSWESYLEE
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KSD EKAVAVPAKLFKEHQSFPYNKNGFKVGMKLEGVDPEHQSVYCVLTVAEVCGYRIKLHFDG
.::...:..::.. :. .::::::.::::::.::.: :.: .::::::::::..:::::
CCDS13 QKAITAPVSLFQDSQAVTHNKNGFKLGMKLEGIDPQHPSMYFILTVAEVCGYRLRLHFDG
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KSD YSDCYDFWVNADALDIHPVGWCEKTGHKLHPPKGYKEEEFNWQTYLKTCKAQAAPKSLFE
::.:.::::::.. ::::.:: :::::::.::::::::::.:. ::.. .:::::: ::
CCDS13 YSECHDFWVNANSPDIHPAGWFEKTGHKLQPPKGYKEEEFSWSQYLRSTRAQAAPKHLFV
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KSD NQNITVIPSGFRVGMKLEAVDKKNPSFICVATVTDMVDNRFLVHFDNWDESYDYWCEASS
.:. . : ::.:::::::::. :::..:::.:::.::.::::::::::..:::::. ::
CCDS13 SQSHSPPPLGFQVGMKLEAVDRMNPSLVCVASVTDVVDSRFLVHFDNWDDTYDYWCDPSS
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KSD PHIHPVGWCKEHRRTLITPPGYPNVKHFSWDKYLEETNSLPAPARAFKVKPPHGFQKKMK
:.:::::::... . : : ::. .: :.::::::.. .:. ::::.:::.: .::
CCDS13 PYIHPVGWCQKQGKPLTPPQDYPDPDNFCWEKYLEETGASAVPTWAFKVRPPHSFLVNMK
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KSD LEVVDKRNPMFIRVATVADTDDHRVKVHFDGWNNCYDYWIDADSPDIHPVGWCSKTGHPL
::.::.::: .::::.: :..:::.:.:::::.. ::.::::: :::::.::::::::::
CCDS13 LEAVDRRNPALIRVASVEDVEDHRIKIHFDGWSHGYDFWIDADHPDIHPAGWCSKTGHPL
460 470 480 490 500 510
550 560 570
pF1KSD QPPLSPLELMEAS----------------------EHGGCSTPGCKGIGHFKRARHLGPH
::::.: : :: .: : :::: : :: .. . :
CCDS13 QPPLGPREPSSASPGGCPPLSYRSLPHTRTSKYSFHHRKCPTPGCDGSGHVT-GKFTAHH
520 530 540 550 560 570
580 590 600 610 620 630
pF1KSD SAANCPYSEINLNKDRIFPDRLSGEMPPASPSFPRNKRTDANESSSSPEIRDQHADDVKE
..:: .: : . ::..:. . : :.: : :. ::. . .: .
CCDS13 CLSGCPLAERNQS-------RLKAELSDSEAS-ARKK----NLSGFSPRKKPRHHGRIG-
580 590 600 610 620
640 650 660 670 680 690
pF1KSD DFEERTESEMRTSHEARGAREEPTVQQAQRRSAVFLSFKSPIPCLPLRWEQQSKLLPTVA
: . . .: . .:.:. :: :: : : . :::. :::: ::
CCDS13 ----RPPKYRKIPQEDFQTLTPDVVHQSLFMSA--LS-AHPDRSLSVCWEQHCKLLPGVA
630 640 650 660 670
700 710 720 730 740 750
pF1KSD GIPASKVSKWSTDEVSEFIQSLPGCEEHGKVFKDEQIDGEAFLLMTQTDIVKIMSIKLGP
:: :: :.::. ::: :.:.: :::.....::::
CCDS13 GISASTVAKWTIDEVFGFVQTLTGCEDQARLFKDEARIVRVTHVSGKTLVWTVAQLGDLV
680 690 700 710 720 730
760 770 780
pF1KSD ALKIFNSILMFKAAEKNSHNEL
CCDS13 CSDHLQEGKGILETGVHSLLCSLPTHLLAKLSFASDSQY
740 750 760 770
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10 20 30
pF1KSD MTESASSTSGQEFDVFSVMDWKDGVGTLPGSDL
::. .:.. : ...: .... ::. :
CCDS46 SCFPREPIHVGAPEQVAGCEPVSATVLPQLSAGPASSSTSTV-RLLEWTEAAAPPPGGGL
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40 50 60 70 80 90
pF1KSD KFRVNEFGALEVITDENEMENVKKATATTTWMVPTAQEAPTSPPSSRPVFPPAYWTSPPG
.::..:. :.. :. . ..: . ::.. . : . .::
CCDS46 RFRISEYKPLNMAGVEQPPSPELRQEGVTEY---EDGGAPAGDGEAGPQQAEDHPQNPPE
100 110 120 130 140 150
100 110 120 130 140 150
pF1KSD CPTVFSEKTGMPFRLKDPVKVEGLQFCENCCQYGNVDECLSGGNYCSQNCARHIKDKDQK
:. .:: . .. :. : . . :...: ..: . .....
CCDS46 DPN------------QDPPEDDSTCQCQACGPHQAAGPDLGSSN---DGCPQLFQERSVI
160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KSD EERDVEEDNEEEDPKCSRKKKPKLSLKADNKEDGEERDDEMENKQDVRILRGSQRARRKR
: . . : : .:.: . .. ..:..: . ::.... . .:. :
CCDS46 VENSSGSTSASELLKPMKKRKRR-EYQSPSEEESE--PEAMEKQEEGKDPEGQPTASTP-
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KSD RGDSAVLKQGLPPKGKKA--WCWASYLEEEKAVAVPAKLFKEHQSFPYNKNGFKVGMKLE
.: ... : :.: : : :::::.::...:..::.. :. .::::::.:::::
CCDS46 --ESEEWSSSQPATGEKKECWSWESYLEEQKAITAPVSLFQDSQAVTHNKNGFKLGMKLE
260 270 280 290 300 310
280 290 300 310 320 330
pF1KSD GVDPEHQSVYCVLTVAEVCGYRIKLHFDGYSDCYDFWVNADALDIHPVGWCEKTGHKLHP
:.::.: :.: .::::::::::..:::::::.:.::::::.. ::::.:: :::::::.:
CCDS46 GIDPQHPSMYFILTVAEVCGYRLRLHFDGYSECHDFWVNANSPDIHPAGWFEKTGHKLQP
320 330 340 350 360 370
340 350 360 370 380 390
pF1KSD PKGYKEEEFNWQTYLKTCKAQAAPKSLFENQNITVIPSGFRVGMKLEAVDKKNPSFICVA
:::::::::.:. ::.. .:::::: :: .:. . : ::.:::::::::. :::..:::
CCDS46 PKGYKEEEFSWSQYLRSTRAQAAPKHLFVSQSHSPPPLGFQVGMKLEAVDRMNPSLVCVA
380 390 400 410 420 430
400 410 420 430 440 450
pF1KSD TVTDMVDNRFLVHFDNWDESYDYWCEASSPHIHPVGWCKEHRRTLITPPGYPNVKHFSWD
.:::.::.::::::::::..:::::. :::.:::::::... . : : ::. .: :.
CCDS46 SVTDVVDSRFLVHFDNWDDTYDYWCDPSSPYIHPVGWCQKQGKPLTPPQDYPDPDNFCWE
440 450 460 470 480 490
460 470 480 490 500 510
pF1KSD KYLEETNSLPAPARAFKVKPPHGFQKKMKLEVVDKRNPMFIRVATVADTDDHRVKVHFDG
::::::.. .:. ::::.:::.: .::::.::.::: .::::.: :..:::.:.::::
CCDS46 KYLEETGASAVPTWAFKVRPPHSFLVNMKLEAVDRRNPALIRVASVEDVEDHRIKIHFDG
500 510 520 530 540 550
520 530 540 550
pF1KSD WNNCYDYWIDADSPDIHPVGWCSKTGHPLQPPLSPLELMEAS------------------
:.. ::.::::: :::::.::::::::::::::.: : ::
CCDS46 WSHGYDFWIDADHPDIHPAGWCSKTGHPLQPPLGPREPSSASPGGCPPLSYRSLPHTRTS
560 570 580 590 600 610
560 570 580 590 600
pF1KSD ----EHGGCSTPGCKGIGHFKRARHLGPHSAANCPYSEINLNKDRIFPDRLSGEMPPASP
.: : :::: : :: .. . : ..:: .: : . ::..:. .
CCDS46 KYSFHHRKCPTPGCDGSGHVT-GKFTAHHCLSGCPLAERNQS-------RLKAELSDSEA
620 630 640 650 660
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pF1KSD SFPRNKRTDANESSSSPEIRDQHADDVKEDFEERTESEMRTSHEARGAREEPTVQQAQRR
: :.: : :. ::. . .: . . . : . .: . .:.:.
CCDS46 S-ARKK----NLSGFSPRKKPRHHGRIGRPPKYR-----KIPQEDFQTLTPDVVHQSLFM
670 680 690 700 710
670 680 690 700 710 720
pF1KSD SAVFLSFKSPIPCLPLRWEQQSKLLPTVAGIPASKVSKWSTDEVSEFIQSLPGCEEHGKV
:: :: : : . :::. :::: :::: :: :.::. ::: :.:.: :::.....
CCDS46 SA--LS-AHPDRSLSVCWEQHCKLLPGVAGISASTVAKWTIDEVFGFVQTLTGCEDQARL
720 730 740 750 760 770
730 740 750 760 770 780
pF1KSD FKDEQIDGEAFLLMTQTDIVKIMSIKLGPALKIFNSILMFKAAEKNSHNEL
::::
CCDS46 FKDEARIVRVTHVSGKTLVWTVAQLGDLVCSDHLQEGKGILETGVHSLLCSLPTHLLAKL
780 790 800 810 820 830
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150 160 170 180 190 200
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CCDS11 MKQPNRKRKLNMDSKERLDQDGRL---EQA
10 20
210 220 230 240 250 260
pF1KSD ARRKRRGDSAVLKQGLPPKGKK-AWCWASYLEEEKAVAVPAKLFKEHQSFPYNKNGFKVG
..:. ::.. . .: . . :: : ::.:.::::.:..::.. :::: ..:::..:
CCDS11 EEEKKPKDSTTPLSHVPSAAAQGAWSWEWYLKEQKAVAAPVELFSKDQSFPEHENGFQIG
30 40 50 60 70 80
270 280 290 300 310 320
pF1KSD MKLEGVDPEHQSVYCVLTVAEVCGYRIKLHFDGYSDCYDFWVNADALDIHPVGWCEKTGH
:.:::.::.: ::.:::.::::::::..:::::: .:::::.:: . ::::::::::: :
CCDS11 MRLEGIDPRHPSVFCVLSVAEVCGYRLRLHFDGYLSCYDFWTNAGSPDIHPVGWCEKTKH
90 100 110 120 130 140
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.:: ::::....: :. :::.:: : :::.::.:.. :.: :.:::::::::.
CCDS11 ELHIPKGYRKDKFVWMDYLKACKLQNAPKKLFRNRS----PNGPMSKEFQVGMKLEAVDR
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::::..::::..:.:..:.::::::::.::::::...::...:::::.:. ::::.: ::
CCDS11 KNPSLVCVATIADIVEDRLLVHFDNWDDSYDYWCDVNSPYVQPVGWCQENGRTLIAPQGY
210 220 230 240 250 260
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:: ..::: .::: :.. .::..::.. :::: .::::::::::: .:::::..:.::
CCDS11 PNPENFSWTEYLEATQTNAVPAKVFKMRLPHGFLPNMKLEVVDKRNPRLIRVATIVDVDD
270 280 290 300 310 320
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.:::::::::.. ::::..::::::::.:::. :::::. : .: .. : :::
CCDS11 QRVKVHFDGWDHKYDYWVEADSPDIHPIGWCDVTGHPLEVPQRTNDLKILPGQAVCPTPG
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:.::::.. :. : ::: .::::..::.:. . ::: . : .... .
CCDS11 CRGIGHIRGPRYSGHHSAFGCPYSDMNLKKEATLHDRLREQTQANLESDSSHSKSKSLCS
390 400 410 420 430 440
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pF1KSD -------NESSSSPEIRDQHADDVK----EDFEERTESEMRTSHEARGAREEPTVQQAQR
.. .:.:.. :.: .: ::.. . .. . : :: : .:.:::.
CCDS11 LNFNGKHEKVNSQPRLV-QQAKCLKIKGKEDIDLDNLFRVLVLHP-RGL--EYSVEQAQQ
450 460 470 480 490
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...: .: : : ::: ::. :::: :: : ::.:..:..:::.::.::: :::
CCDS11 VLHQSVSMSTVSAHPFRDLPLGREQHCKLLPGVADIRASQVARWTVDEVAEFVQSLLGCE
500 510 520 530 540 550
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::.: :: :::::.::::.:::::::.:.:::::::::.::::::. ...
CCDS11 EHAKCFKKEQIDGKAFLLLTQTDIVKVMKIKLGPALKIYNSILMFRHSQELPEEDIASGQ
560 570 580 590 600 610
CCDS11 EVRG
620
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.::. .: : .:: .. . ..:.
CCDS14 ENDASHDFWCNLGTVDVHPIGWCAINSKILVPPRTIHAKFTDWKGYLMKRLVGSRTLPVD
260 270 280 290 300 310
250 260 270 280 290 300
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. .: .:. : :. ::.:: :: . : . .: : : :..: . :: :: ::
CCDS14 FHIKMVESMKYP---FRQGMRLEVVDKSQVSRTRMAVVDTVIGGRLRLLYEDGDSD-DDF
320 330 340 350 360
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pF1KSD WVNADALDIHPVGWCEKTGHKLHPPKGYKEEEFNWQTYLKTCKAQAAPKSLFENQNITVI
: . . :::::: ...:: .. . .. .. . .. .:.: ::.. .
CCDS14 WCHMWSPLIHPVGWSRRVGHGIKMSE--RRSDMAHHPTFRKIYCDAVPY-LFKKVRAVYT
370 380 390 400 410 420
370 380 390 400 410 420
pF1KSD PSG-FRVGMKLEAVDKKNPSFICVATVTD-MVDNRFLVHFDNWD--ESYDYWCEASSPH-
.: :. ::::::.: : . :::::: ..:. ... :. .. :..: .: :
CCDS14 EGGWFEEGMKLEAIDPLNLGNICVATVCKVLLDGYLMICVDGGPSTDGLDWFCYHASSHA
430 440 450 460 470 480
430 440 450 460 470 480
pF1KSD IHPVGWCKEHRRTLITPPGYPNVKHFSWDKYLEETNSLPAPARAFKVK-PPHGFQKKMKL
: :. .:... : : :: ... :.:..:::.:.: ::.: :.. : :::. :::
CCDS14 IFPATFCQKNDIELTPPKGY-EAQTFNWENYLEKTKSKAAPSRLFNMDCPNHGFKVGMKL
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490 500 510 520 530 540
pF1KSD EVVDKRNPMFIRVATVADTDDHRVKVHFDGWNNCYDYWIDADSPDIHPVGWCSKTGHPLQ
:.:: .: .: :::: . . ...:::::.. :: :.: .::::.::::: ::. ::
CCDS14 EAVDLMEPRLICVATVKRVVHRLLSIHFDGWDSEYDQWVDCESPDIYPVGWCELTGYQLQ
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550 560 570 580 590
pF1KSD PPL-----SPLELMEASEHGGCSTPGCKGIGHFKRARHLGPHSAANCPYSEINLNKDRIF
::. .::. ::..
CCDS14 PPVAAEPATPLKAKEATKKKKKQFGKKRKRIPPTKTRPLRQGSKKPLLEDDPQGARKISS
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CCDS11 EGFENDSGLDFWCNICGSDIHPVGWCAASGKPLVPPRTIQHKYTNWKAFLVKRLTGAKTL
210 220 230 240 250 260
250 260 270 280 290 300
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: . .. .:. : :: :..: :: .: : .: : : :..: .. :
CCDS11 PPDFSQKVSESMQYP---FKPCMRVEVVDKRHLCRTRVAVVESVIGGRLRLVYEESEDRT
270 280 290 300 310 320
310 320 330 340 350 360
pF1KSD YDFWVNADALDIHPVGWCEKTGHKLHPPKGYKEEEFNWQTYLKTCKAQAAPKSLFENQNI
::: . . :: .:: .. ::... :... ...: : :: . .
CCDS11 DDFWCHMHSPLIHHIGWSRSIGHRFKRSDITKKQDGHFDT----------PPHLFAKVK-
330 340 350 360 370
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: :: :. ::::::.: : : :::::. .. . :: . .:. . .. :..: .:
CCDS11 EVDQSGEWFKEGMKLEAIDPLNLSTICVATIRKVLADGFLMIGIDGSEAADGSDWFCYHA
380 390 400 410 420 430
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CCDS11 TSPSIFPVGFCEINMIELTPPRGYTKLP-FKWFDYLRETGSIAAPVKLFNKDVPNHGFRV
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CCDS11 GMKLEAVDLMEPRLICVATVTRIIHRLLRIHFDGWEEEYDQWVDCESPDLYPVGWCQLTG
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CCDS11 YQLQPPASQSSRENQSASSKQKKKAKSQQYKGHKKMTTLQLKEELLDGEDYNFLQGASDQ
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CCDS14 VNEDSMDVKKENQEKTPQSSTSSVQRDDFHWEEYLKETGSISAPSECFRQSQIPPVND--
10 20 30 40 50 60
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pF1KSD FKVGMKLEGVDPEHQSVYCVLTVAEVCGYRIKLHFDGYSDCYDFWVNADALDIHPVGWCE
::::::::. ::.. . :. :: . : :..:..:: .. ::: .:. ::.::: ::
CCDS14 FKVGMKLEARDPRNATSVCIATVIGITGARLRLRLDGSDNRNDFWRLVDSPDIQPVGTCE
70 80 90 100 110 120
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pF1KSD KTGHKLHPPKGYKEEEFNWQTYL-KTCK-AQAAPKSLFENQNITVIPSGFRVGMKLEAVD
: : :.:: ::. . .: .: :: . .. : .::... ..:.:::::::.:
CCDS14 KEGDLLQPPLGYQMNTSSWPMFLLKTLNGSEMASATLFKKEPPKPPLNNFKVGMKLEAID
130 140 150 160 170 180
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pF1KSD KKNPSFICVATVTDMVDNRFLVHFDNWDESYDYWCEASSPHIHPVGWCKEHRRTLITPPG
:::: .:: ::. :. .. . ::.:. ..::::. .: : :.:::. .. :::
CCDS14 KKNPYLICPATIGDVKGDEVHITFDGWSGAFDYWCKYDSRDIFPAGWCRL-TGDVLQPPG
190 200 210 220 230 240
450 460 470 480 490
pF1KSD --YPNVKHFSWDKYLEETNSLPAPARAFKVKPPHGFQKKMKLEVVDKRNPMFIRVATVAD
: ::... .:.: :. : ... :.
CCDS14 TSVPIVKNIA------KTESSPSEASQHSMQSPQKTTLILPTQQVRRSSRIKPPGPTAVP
250 260 270 280 290
500 510 520 530 540 550
pF1KSD TDDHRVKVHFDGWNNCYDYWIDADSPDIHPVGWCSKTGHPLQPPLSPLELMEASEHGGCS
CCDS14 KRSSSVKNITPRKKGPNSGKKEKPLPVICSTSAASLKSLTRDRGMLYKDVASGPCKIVMS
300 310 320 330 340 350
>>CCDS30688.1 SCMH1 gene_id:22955|Hs108|chr1 (660 aa)
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pF1KSD NKQDVRILRGSQRARRKRRGDSAVLKQGLPPKGKKAWCWASYLEEEKAVAVPAKLFKEHQ
: :. . : .::.: .: .:.. :: :
CCDS30 MLVCYSVLACEILWDLPCSIMGSPLGH--FTWDKYLKETCSVPAPVHCFK--Q
10 20 30 40
260 270 280 290 300 310
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