Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA1759
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1759, 972 aa
1>>>pF1KSDA1759 972 - 972 aa - 972 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.6304+/-0.000871; mu= 7.5362+/- 0.053
mean_var=191.6604+/-38.156, 0's: 0 Z-trim(114.7): 18 B-trim: 224 in 1/50
Lambda= 0.092642
statistics sampled from 15200 (15214) to 15200 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.77), E-opt: 0.2 (0.467), width: 16
Scan time: 4.680
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS44530.1 FAM160A2 gene_id:84067|Hs108|chr11 ( 972) 6569 890.8 0
CCDS7760.1 FAM160A2 gene_id:84067|Hs108|chr11 ( 986) 3333 458.3 3.4e-128
CCDS47146.1 FAM160A1 gene_id:729830|Hs108|chr4 (1040) 1577 223.6 1.6e-57
>>CCDS44530.1 FAM160A2 gene_id:84067|Hs108|chr11 (972 aa)
initn: 6569 init1: 6569 opt: 6569 Z-score: 4752.6 bits: 890.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6569; 99.9% identity (99.9% similar) in 972 aa overlap (1-972:1-972)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MERMNWLSRLASRGPGHRIPQGANLQTPVMADPETCLMVFKNHWSQVVRILERQGPRAAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MERMNWLSRLASRGPGHRIPQGANLQTPVMADPETCLMVFKNHWSQVVRILERQGPRAAP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD GGADDLSAVRNHTYQMLTLLAEDRAVPSAPTGPGPLLEFALHEDLLTRVLTWQLQWDELG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GGADDLSAVRNHTYQMLTLLAEDRAVPSAPTGPGPLLEFALHEDLLTRVLTWQLQWDELG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD DGVEERRAEQLKLFEMLVSEARQPLLRHGPVREALLTLLDACGRPVPSSPALDEGLVLLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DGVEERRAEQLKLFEMLVSEARQPLLRHGPVREALLTLLDACGRPVPSSPALDEGLVLLL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD SQLCVCVAQEPSLLEFFLQPPPEPGAAPRLLLFSRLVPFVHREGTLGQQARDALLLLMAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SQLCVCVAQEPSLLEFFLQPPPEPGAAPRLLLFSRLVPFVHREGTLGQQARDALLLLMAL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD SAGSPTVGRYIADHSYFCPVLATGLSALYSSLPRKIEVPGDDWHCLRREDWLGVPALALF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SAGSPTVGRYIADHSYFCPVLATGLSALYSSLPRKIEVPGDDWHCLRREDWLGVPALALF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD MSSLEFCNAVIQVAHPLVQKQLVDYIHNGFLVPVMGPALHKTSVEEMIASTAYLELFLRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MSSLEFCNAVIQVAHPLVQKQLVDYIHNGFLVPVMGPALHKTSVEEMIASTAYLELFLRS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD ISEPALLRTFLRFLLLHRHDTHTILDTLVARIGSNSRLCMVSLSLFRTLLNLSCEDVLLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ISEPALLRTFLRFLLLHRHDTHTILDTLVARIGSNSRLCMVSLSLFRTLLNLSCEDVLLQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD LVLRYLVPCNHVMLSQKPAVRDVDLYGRAADKFLSLIPRCCRHHAPSPPRPEHASWARGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LVLRYLVPCNHVMLSQKPAVRDVDLYGRAADKFLSLIPRCCRHHAPSPPRPEHASWARGP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD GSPSVDSSSVMTVPRPSTPSRLALFLRQQSLGGSESPGPAPCSPGLSASPASSPGRRPTP
:::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GSPSVDSSSVTTVPRPSTPSRLALFLRQQSLGGSESPGPAPCSPGLSASPASSPGRRPTP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD AEEPGELEDNYLEYLREARRGVDRCVRACRTWSAPYDGERPSPEPSPFGSRTKKRSLLPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 AEEPGELEDNYLEYLREARRGVDRCVRACRTWSAPYDGERPSPEPSPFGSRTKKRSLLPE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD EDRNNVGEGEEEELGRRGRAGGAGEGPGHLPPPQLNGVPGSWPEGAKKVRLVPKEGAGEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EDRNNVGEGEEEELGRRGRAGGAGEGPGHLPPPQLNGVPGSWPEGAKKVRLVPKEGAGEL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD LEGISEGMAGLEGFGQELRELEVALSNGGTGSESPLEPPLPLEEEEAYESFTCPPEPPGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LEGISEGMAGLEGFGQELRELEVALSNGGTGSESPLEPPLPLEEEEAYESFTCPPEPPGP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD FLSSPLRTLNQLPSQPFTGPFMAVLFAKLENMLQNSVYVNFLLTGLVAQLACHPQPLLRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 FLSSPLRTLNQLPSQPFTGPFMAVLFAKLENMLQNSVYVNFLLTGLVAQLACHPQPLLRS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD FLLNTNMVFQPSVKSLLQVLGSVKNKIENFAASQEDFPALLSKAKKYLIARGKLDWAEGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 FLLNTNMVFQPSVKSLLQVLGSVKNKIENFAASQEDFPALLSKAKKYLIARGKLDWAEGP
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD AAGPAPRRSDPLVKSRRPSLGELLLRHAHSPTRARQAAQLVLQPGRDGAGLGLSGGSPGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 AAGPAPRRSDPLVKSRRPSLGELLLRHAHSPTRARQAAQLVLQPGRDGAGLGLSGGSPGA
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD STPVLLTRGGAPERQGEALRVKNAVYCAVIFPEFLKELAAISQAHAVTSPFLLETSEEGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 STPVLLTRGGAPERQGEALRVKNAVYCAVIFPEFLKELAAISQAHAVTSPFLLETSEEGS
910 920 930 940 950 960
970
pF1KSD GPLISGCGPLNP
::::::::::::
CCDS44 GPLISGCGPLNP
970
>>CCDS7760.1 FAM160A2 gene_id:84067|Hs108|chr11 (986 aa)
initn: 3333 init1: 3333 opt: 3333 Z-score: 2415.0 bits: 458.3 E(32554): 3.4e-128
Smith-Waterman score: 6531; 98.5% identity (98.5% similar) in 986 aa overlap (1-972:1-986)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MERMNWLSRLASRGPGHRIPQGANLQTPVMADPETCLMVFKNHWSQVVRILERQGPRAAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 MERMNWLSRLASRGPGHRIPQGANLQTPVMADPETCLMVFKNHWSQVVRILERQGPRAAP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD GGADDLSAVRNHTYQMLTLLAEDRAVPSAPTGPGPLLEFALHEDLLTRVLTWQLQWDELG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 GGADDLSAVRNHTYQMLTLLAEDRAVPSAPTGPGPLLEFALHEDLLTRVLTWQLQWDELG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD DGVEERRAEQLKLFEMLVSEARQPLLRHGPVREALLTLLDACGRPVPSSPALDEGLVLLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 DGVEERRAEQLKLFEMLVSEARQPLLRHGPVREALLTLLDACGRPVPSSPALDEGLVLLL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD SQLCVCVAQEPSLLEFFLQPPPEPGAAPRLLLFSRLVPFVHREGTLGQQARDALLLLMAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 SQLCVCVAQEPSLLEFFLQPPPEPGAAPRLLLFSRLVPFVHREGTLGQQARDALLLLMAL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD SAGSPTVGRYIADHSYFCPVLATGLSALYSSLPRKIEVPGDDWHCLRREDWLGVPALALF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 SAGSPTVGRYIADHSYFCPVLATGLSALYSSLPRKIEVPGDDWHCLRREDWLGVPALALF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD MSSLEFCNAVIQVAHPLVQKQLVDYIHNGFLVPVMGPALHKTSVEEMIASTAYLELFLRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 MSSLEFCNAVIQVAHPLVQKQLVDYIHNGFLVPVMGPALHKTSVEEMIASTAYLELFLRS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD ISEPALLRTFLRFLLLHRHDTHTILDTLVARIGSNSRLCMVSLSLFRTLLNLSCEDVLLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 ISEPALLRTFLRFLLLHRHDTHTILDTLVARIGSNSRLCMVSLSLFRTLLNLSCEDVLLQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KSD LVLRYLVPCNHVMLSQKPAVRDVDLYGRAADKFLSLIPRCCRHHAPSPPRPEHASWARG-
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 LVLRYLVPCNHVMLSQKPAVRDVDLYGRAADKFLSLIPRCCRHHAPSPPRPEHASWARGG
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520
pF1KSD -------------PGSPSVDSSSVMTVPRPSTPSRLALFLRQQSLGGSESPGPAPCSPGL
::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 PSRETGRREDITGPGSPSVDSSSVTTVPRPSTPSRLALFLRQQSLGGSESPGPAPCSPGL
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560 570 580
pF1KSD SASPASSPGRRPTPAEEPGELEDNYLEYLREARRGVDRCVRACRTWSAPYDGERPSPEPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 SASPASSPGRRPTPAEEPGELEDNYLEYLREARRGVDRCVRACRTWSAPYDGERPSPEPS
550 560 570 580 590 600
590 600 610 620 630 640
pF1KSD PFGSRTKKRSLLPEEDRNNVGEGEEEELGRRGRAGGAGEGPGHLPPPQLNGVPGSWPEGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 PFGSRTKKRSLLPEEDRNNVGEGEEEELGRRGRAGGAGEGPGHLPPPQLNGVPGSWPEGA
610 620 630 640 650 660
650 660 670 680 690 700
pF1KSD KKVRLVPKEGAGELLEGISEGMAGLEGFGQELRELEVALSNGGTGSESPLEPPLPLEEEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 KKVRLVPKEGAGELLEGISEGMAGLEGFGQELRELEVALSNGGTGSESPLEPPLPLEEEE
670 680 690 700 710 720
710 720 730 740 750 760
pF1KSD AYESFTCPPEPPGPFLSSPLRTLNQLPSQPFTGPFMAVLFAKLENMLQNSVYVNFLLTGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 AYESFTCPPEPPGPFLSSPLRTLNQLPSQPFTGPFMAVLFAKLENMLQNSVYVNFLLTGL
730 740 750 760 770 780
770 780 790 800 810 820
pF1KSD VAQLACHPQPLLRSFLLNTNMVFQPSVKSLLQVLGSVKNKIENFAASQEDFPALLSKAKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 VAQLACHPQPLLRSFLLNTNMVFQPSVKSLLQVLGSVKNKIENFAASQEDFPALLSKAKK
790 800 810 820 830 840
830 840 850 860 870 880
pF1KSD YLIARGKLDWAEGPAAGPAPRRSDPLVKSRRPSLGELLLRHAHSPTRARQAAQLVLQPGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 YLIARGKLDWAEGPAAGPAPRRSDPLVKSRRPSLGELLLRHAHSPTRARQAAQLVLQPGR
850 860 870 880 890 900
890 900 910 920 930 940
pF1KSD DGAGLGLSGGSPGASTPVLLTRGGAPERQGEALRVKNAVYCAVIFPEFLKELAAISQAHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 DGAGLGLSGGSPGASTPVLLTRGGAPERQGEALRVKNAVYCAVIFPEFLKELAAISQAHA
910 920 930 940 950 960
950 960 970
pF1KSD VTSPFLLETSEEGSGPLISGCGPLNP
::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 VTSPFLLETSEEGSGPLISGCGPLNP
970 980
>>CCDS47146.1 FAM160A1 gene_id:729830|Hs108|chr4 (1040 aa)
initn: 2081 init1: 1167 opt: 1577 Z-score: 1146.3 bits: 223.6 E(32554): 1.6e-57
Smith-Waterman score: 1991; 39.4% identity (63.8% similar) in 1007 aa overlap (10-876:2-980)
10 20 30 40 50
pF1KSD MERMNWLSRLASRGPGHRIPQGANLQTPVMADPETCLMVFKNHWSQVVRILERQGP----
..: . .. :...:: .:::::..::::::.:::.:::.. :
CCDS47 MMSSVSTESKLQQAVSLQG---VDPETCMIVFKNHWAQVVKILEKHDPLKNT
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KSD RAAPGGA--DDLSAVRNHTYQMLTLLAEDRAVPSAPTGPGPLLEFALHEDLLTRVLTWQL
.: :. :. :::.:.. .:: :: :..: .: ::.:::.. :... ... :.:
CCDS47 QAKYGSIPPDEASAVQNYVEHMLFLLIEEQAKDAAM---GPILEFVVSENIMEKLFLWSL
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KSD QWDELGDGVEERRAEQLKLFEMLVSEARQPLLRHGPVREALLTLLDACGRPVPSSPALDE
. :. : : . ::::..::::....::::.: :. . :. ::..:. ..:...:
CCDS47 R-REFTD---ETKIEQLKMYEMLVTQSHQPLLHHKPILKPLMMLLSSCSGT--TTPTVEE
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KSD GLVLLLSQLCVCVAQEPSLLEFFLQPPPEPGAAPRLLLFSRLVPFVHREGTLGQQARDAL
::.::.::: .:..::.::.:.. . ::: .:.:: :.::.::::..::::::::
CCDS47 KLVVLLNQLCSILAKDPSILELFFHTSEDQGAA-NFLIFSLLIPFIHREGSVGQQARDAL
170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KSD LLLMALSAGSPTVGRYIADHSYFCPVLATGLSALYSSLPRKIEVPGDDWHCLRREDWLGV
:..:.::: . :...:....:::::::::::.:::::: :.: :..:::: ..::: .
CCDS47 LFIMSLSAENTMVAHHIVENTYFCPVLATGLSGLYSSLPTKLEEKGEEWHCLLKDDWLLL
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KSD PALALFMSSLEFCNAVIQVAHPLVQKQLVDYIHNGFLVPVMGPALHKTSVEEMIASTAYL
:.:. ::.:::::::::::::::...:::.::.:::::::..:::::..:::....::::
CCDS47 PSLVQFMNSLEFCNAVIQVAHPLIRNQLVNYIYNGFLVPVLAPALHKVTVEEVMTTTAYL
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KSD ELFLRSISEPALLRTFLRFLLLHRHDTHTILDTLVARIGSNSRLCMVSLSLFRTLLNLSC
.::::::::::::. ::::.:::.:.. :::::..::.. :::.:::.:::::..: :
CCDS47 DLFLRSISEPALLEIFLRFILLHQHENVHILDTLTSRINTPFRLCVVSLALFRTLIGLHC
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KSD EDVLLQLVLRYLVPCNHVMLSQKPAVRDVDLYGRAADKFLSLIPRCCRHHAP---SPPRP
:::.::::::::.::::.::::. ::.. : :. .: :.:.: : :: . .
CCDS47 EDVMLQLVLRYLIPCNHMMLSQRWAVKERDCYSVSAAKLLALTPVCCSSGITLTLGNQER
400 410 420 430 440 450
480 490 500
pF1KSD EHASWAR------GPGS---PSV--DSSSVMTVPRPSTPSRLALF-------LR------
.. :.. :: : . .:. .. . : : . ::
CCDS47 DYILWSKCMHDTSGPVERPFPEAFSESACIVEYGKALDISYLQYLWEAHTNILRCMRDCR
460 470 480 490 500 510
510 520 530 540 550
pF1KSD -QQSLGGSESPGPAPCSPGL-------SASPASS-PGRRPT---PAEEP-GELEDNYLEY
..: ..:: : .: :: :. . : . : : : . .. ::.
CCDS47 VWSALYDGDSPDPEMFLQSLTEEGSVSSACPVFGLPQQLPRKTGPQLAPRKDKSQTELEW
520 530 540 550 560 570
560 570 580 590
pF1KSD LREARRGVDRCVRACRTWSAPYDGERPSPEPSPFG-----SRTKKRSLL-----------
:.. . . .::: . : :.:. .. :: .::
CCDS47 DDSYDTGISSGADVGSP--GPYDDLEVSGPPAPIDPPKHIQEMKKNALLLFKGSYIEESD
580 590 600 610 620 630
600 610 620
pF1KSD -----------PEEDRNNVGEGEEEE---------------------LGRRGRAGGAGE-
:.: ... ...:: :. . .. . :
CCDS47 FQDDVMVYRLCAEKDSEDMKDSQEEAARPPAEAQAEVQSVPINNGPLLSTQPETDSEEEW
640 650 660 670 680 690
630 640 650 660 670
pF1KSD -----GPGHLPP--PQLNGVPGSWPEGAKKVRL-VPK-EGAGELLEGISEGMAGLEGFGQ
: : : :. . : . ::. ... .:. : ...: . :. . . :
CCDS47 NRDNSDPFHSEPKEPKQEREPEAAPESNSELASPAPEAEHSSNLTAAHPESEELIAQYDQ
700 710 720 730 740 750
680 690 700 710
pF1KSD ELRELEVALSNGGTGSESPLEPPLPL-----------------------EEEEAYESFTC
..::. . ..: .. : :: : .::. ..::
CCDS47 IIKELDSG-AEGLMEQNYPTPDPLLLTKEEEGKEESKGEKEKEGKKELEDEEDDFDSFIA
760 770 780 790 800 810
720 730 740 750 760
pF1KSD P-PEP---PGPFLSS---------PLRTLNQLPSQPFTGPFMAVLFAKLENMLQNSVYVN
: :.::.. :.:: : ::::::..:...::::::.::..::
CCDS47 EMPAVETVPSPFVGRDEAAFASRHPVRT----QSTPFTGPFISVVLSKLENMLENSLHVN
820 830 840 850 860 870
770 780 790 800 810 820
pF1KSD FLLTGLVAQLACHPQPLLRSFLLNTNMVFQPSVKSLLQVLGSVKNKIENFAASQEDFPAL
.:: :...::: .::::::::::::::::::::.:: :::.:::::::.::. ..:::.:
CCDS47 LLLIGIITQLASYPQPLLRSFLLNTNMVFQPSVRSLYQVLASVKNKIEQFASVERDFPGL
880 890 900 910 920 930
830 840 850 860 870 880
pF1KSD LSKAKKYLIARGKLDWAEGPAAGPAPRRSDPLVKSRRPSLGELLLRHAHSPTRARQAAQL
: .:..::. : .: .. :: .::. .. : . :. :: .: :. :
CCDS47 LIQAQQYLLFR--VDMSD---MTPAALTKDPIQEASRTGSGKNLL---DGPPRVLQPFLT
940 950 960 970 980
890 900 910 920 930 940
pF1KSD VLQPGRDGAGLGLSGGSPGASTPVLLTRGGAPERQGEALRVKNAVYCAVIFPEFLKELAA
CCDS47 HRTKVAEAPPNLPLPVRNPMLAAALFPEFLKELAALAQEHSILCYKILGDFEDSCC
990 1000 1010 1020 1030 1040
972 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 07:15:51 2016 done: Thu Nov 3 07:15:52 2016
Total Scan time: 4.680 Total Display time: 0.090
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]