FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1748, 715 aa
1>>>pF1KSDA1748 715 - 715 aa - 715 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.1369+/-0.000882; mu= -1.6648+/- 0.053
mean_var=252.0532+/-50.109, 0's: 0 Z-trim(115.2): 49 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.080785
statistics sampled from 15723 (15769) to 15723 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.786), E-opt: 0.2 (0.484), width: 16
Scan time: 4.670
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7965.1 ZDHHC5 gene_id:25921|Hs108|chr11 ( 715) 4832 576.4 5e-164
CCDS13776.1 ZDHHC8 gene_id:29801|Hs108|chr22 ( 765) 1977 243.7 7.7e-64
CCDS54502.1 ZDHHC8 gene_id:29801|Hs108|chr22 ( 778) 1977 243.7 7.8e-64
CCDS35395.1 ZDHHC9 gene_id:51114|Hs108|chrX ( 364) 559 78.2 2.4e-14
CCDS43190.1 ZDHHC19 gene_id:131540|Hs108|chr3 ( 309) 494 70.6 3.9e-12
CCDS5252.1 ZDHHC14 gene_id:79683|Hs108|chr6 ( 488) 494 70.7 5.7e-12
CCDS47510.1 ZDHHC14 gene_id:79683|Hs108|chr6 ( 473) 481 69.2 1.6e-11
CCDS30650.1 ZDHHC18 gene_id:84243|Hs108|chr1 ( 388) 459 66.6 8e-11
>>CCDS7965.1 ZDHHC5 gene_id:25921|Hs108|chr11 (715 aa)
initn: 4832 init1: 4832 opt: 4832 Z-score: 3058.3 bits: 576.4 E(32554): 5e-164
Smith-Waterman score: 4832; 100.0% identity (100.0% similar) in 715 aa overlap (1-715:1-715)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MPAESGKRFKPSKYVPVSAAAIFLVGATTLFFAFTCPGLSLYVSPAVPIYNAIMFLFVLA
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CCDS79 MPAESGKRFKPSKYVPVSAAAIFLVGATTLFFAFTCPGLSLYVSPAVPIYNAIMFLFVLA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD NFSMATFMDPGIFPRAEEDEDKEDDFRAPLYKTVEIKGIQVRMKWCATCRFYRPPRCSHC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 NFSMATFMDPGIFPRAEEDEDKEDDFRAPLYKTVEIKGIQVRMKWCATCRFYRPPRCSHC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD SVCDNCVEEFDHHCPWVNNCIGRRNYRYFFLFLLSLTAHIMGVFGFGLLYVLYHIEELSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 SVCDNCVEEFDHHCPWVNNCIGRRNYRYFFLFLLSLTAHIMGVFGFGLLYVLYHIEELSG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD VRTAVTMAVMCVAGLFFIPVAGLTGFHVVLVARGRTTNEQVTGKFRGGVNPFTNGCCNNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 VRTAVTMAVMCVAGLFFIPVAGLTGFHVVLVARGRTTNEQVTGKFRGGVNPFTNGCCNNV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD SRVLCSSPAPRYLGRPKKEKTIVIRPPFLRPEVSDGQITVKIMDNGIQGELRRTKSKGSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 SRVLCSSPAPRYLGRPKKEKTIVIRPPFLRPEVSDGQITVKIMDNGIQGELRRTKSKGSL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD EITESQSADAEPPPPPKPDLSRYTGLRTHLGLATNEDSSLLAKDSPPTPTMYKYRPGYSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 EITESQSADAEPPPPPKPDLSRYTGLRTHLGLATNEDSSLLAKDSPPTPTMYKYRPGYSS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD SSTSAAMPHSSSAKLSRGDSLKEPTSIAESSRHPSYRSEPSLEPESFRSPTFGKSFHFDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 SSTSAAMPHSSSAKLSRGDSLKEPTSIAESSRHPSYRSEPSLEPESFRSPTFGKSFHFDP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD LSSGSRSSSLKSAQGTGFELGQLQSIRSEGTTSTSYKSLANQTRNGSLSYDSLLTPSDSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 LSSGSRSSSLKSAQGTGFELGQLQSIRSEGTTSTSYKSLANQTRNGSLSYDSLLTPSDSP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD DFESVQAGPEPDPPLGYTSPFLSARLAQQREAERHPRLVPTGPTHREPSPVRYDNLSRHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 DFESVQAGPEPDPPLGYTSPFLSARLAQQREAERHPRLVPTGPTHREPSPVRYDNLSRHI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD VASLQEREKLLRQSPPLPGREEEPGLGDSGIQSTPGSGHAPRTSSSSDDSKRSPLGKTPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 VASLQEREKLLRQSPPLPGREEEPGLGDSGIQSTPGSGHAPRTSSSSDDSKRSPLGKTPL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD GRPAVPRFGKPDGLRGRGVGSPEPGPTAPYLGRSMSYSSQKAQPGVSETEEVALQPLLTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 GRPAVPRFGKPDGLRGRGVGSPEPGPTAPYLGRSMSYSSQKAQPGVSETEEVALQPLLTP
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710
pF1KSD KDEVQLKTTYSKSNGQPKSLGSASPGPGQPPLSSPTRGGVKKVSGVGGTTYEISV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 KDEVQLKTTYSKSNGQPKSLGSASPGPGQPPLSSPTRGGVKKVSGVGGTTYEISV
670 680 690 700 710
>>CCDS13776.1 ZDHHC8 gene_id:29801|Hs108|chr22 (765 aa)
initn: 2009 init1: 1479 opt: 1977 Z-score: 1259.6 bits: 243.7 E(32554): 7.7e-64
Smith-Waterman score: 2098; 49.5% identity (68.5% similar) in 761 aa overlap (1-697:1-746)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MPAESGKRFKPSKYVPVSAAAIFLVGATTLFFAFTCPGLSLYVSPAVPIYNAIMFLFVLA
:: : :.::.::.::..:: .:::..::::.:::: :. ::::::.::.:.::::::
CCDS13 MPRSPGTRLKPAKYIPVATAAALLVGSSTLFFVFTCPWLTRAVSPAVPVYNGIIFLFVLA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD NFSMATFMDPGIFPRAEEDEDKEDDFRAPLYKTVEIKGIQVRMKWCATCRFYRPPRCSHC
:::::::::::.::::.:::::::::::::::.:...::::::::::::.::::::::::
CCDS13 NFSMATFMDPGVFPRADEDEDKEDDFRAPLYKNVDVRGIQVRMKWCATCHFYRPPRCSHC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD SVCDNCVEEFDHHCPWVNNCIGRRNYRYFFLFLLSLTAHIMGVFGFGLLYVLYHIEELSG
::::::::.:::::::::::::::::::::::::::.::..:: .:::.::: : : :..
CCDS13 SVCDNCVEDFDHHCPWVNNCIGRRNYRYFFLFLLSLSAHMVGVVAFGLVYVLNHAEGLGA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD VRTAVTMAVMCVAGLFFIPVAGLTGFHVVLVARGRTTNEQVTGKFRGGVNPFTNGCCNNV
..:..::::::::::::::: ::::::::::.::::::::::::::::::::: :::.::
CCDS13 AHTTITMAVMCVAGLFFIPVIGLTGFHVVLVTRGRTTNEQVTGKFRGGVNPFTRGCCGNV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KSD SRVLCSSPAPRYLGRPKKEKTIV-IRPPFLRPEVSD--GQITVKIMDNGIQGELRRTKSK
.:::: ::::. .: . : ..:::::::. : . . ::. :::... : :.:::
CCDS13 EHVLCSPLAPRYVVEPPRLPLAVSLKPPFLRPELLDRAAPLKVKLSDNGLKAGLGRSKSK
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KSD GSLEITESQSADAEPPPPPKPDLSRYTG-LRTHLGLATNEDSSLLAKDSPPTPTMYKYRP
:::. . . : :: ::: . . ... :.: .. :.. . . :::::.:::.::
CCDS13 GSLDRLDEKPLDLGPPLPPKIEAGTFSSDLQTPRP-GSAESALSVQRTSPPTPAMYKFRP
310 320 330 340 350
360 370 380 390 400
pF1KSD GYSSSSTSAAMPHSSSAKLSRG-DSLKEPTSIAESSRHPSYRSEPSLE-----PESFR--
.. :. .: . .. : ::: : .: : .. :::::. : ...
CCDS13 AFP---TGPKVPFCGPGEQVPGPDSL---TLGDDSIRSLDFVSEPSLDLPDYGPGGLHAA
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KSD ---SPTFGKSFHFDPLSSGSRSSSLKSAQGTGFELGQLQSIRSEGTTSTSYKSL----AN
:: .. : : .:.. :: :::... : . :: .:::: : ..:. :
CCDS13 YPPSPPLSAS---DAFSGALRSLSLKASSRRGGDHVALQPLRSEGGPPTPHRSIFAPHAL
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KSD QTRNGSLSYDSLLTPSDSPDFESVQAGPEPDPPLGYTSPFLSARLAQQREAERHPR-LVP
.:::::::::::.:. :: .. : : :: ::.: : . :: . :
CCDS13 PNRNGSLSYDSLLNPG-SPGGHACPAHPAVGVA-GYHSPYLHPG-ATGDPPRPLPRSFSP
480 490 500 510 520
530 540 550 560 570
pF1KSD T-GPTHREPSPVRYDNLSRHIVASLQEREKLLRQSPPLPGREEEPGLGDSGIQSTPGS--
. :: ::::::::::::: :.::.::: : .. : . . .::::. ..:.:
CCDS13 VLGPRPREPSPVRYDNLSRTIMASIQER-KDREERERLLRSQADSLFGDSGVYDAPSSYS
530 540 550 560 570 580
580 590 600 610
pF1KSD -------GHAPRTSS----SSDD--------SKRSPLGKTPLGR--PAVPRFGKPDG--L
...:: . : :: . :.: .: :. .: : . .. :
CCDS13 LQQASVLSEGPRGPALRYGSRDDLVAGPGFGGARNPALQTSLSSLSSSVSRAPRTSSSSL
590 600 610 620 630 640
620 630 640 650
pF1KSD RGRGVGSPEPGPTAPYLG--RSMSYSSQKAQPGVSET------EEVAL--------QPLL
.. ..: ::: : : :: . .. . ::. .. . ::. : :
CCDS13 QADQASSNAPGPR-PSSGSHRSPARQGLPSPPGTPHSPSYAGPKAVAFIHTDLPEPPPSL
650 660 670 680 690 700
660 670 680 690 700 710
pF1KSD T-PKDEVQLKTTYSKSNGQPKSLGSASPGPGQP-PLSSPTRGGVKKVSGVGGTTYEISV
: .:. :::: :: ::: .:. .:. : : : .::::
CCDS13 TVQRDHPQLKTPPSKLNGQSPGLARLGPATGPPGPSASPTRHTLVKKVSGVGGTTYEISV
710 720 730 740 750 760
>>CCDS54502.1 ZDHHC8 gene_id:29801|Hs108|chr22 (778 aa)
initn: 1944 init1: 1479 opt: 1977 Z-score: 1259.5 bits: 243.7 E(32554): 7.8e-64
Smith-Waterman score: 2084; 50.7% identity (69.6% similar) in 726 aa overlap (1-704:1-692)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MPAESGKRFKPSKYVPVSAAAIFLVGATTLFFAFTCPGLSLYVSPAVPIYNAIMFLFVLA
:: : :.::.::.::..:: .:::..::::.:::: :. ::::::.::.:.::::::
CCDS54 MPRSPGTRLKPAKYIPVATAAALLVGSSTLFFVFTCPWLTRAVSPAVPVYNGIIFLFVLA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD NFSMATFMDPGIFPRAEEDEDKEDDFRAPLYKTVEIKGIQVRMKWCATCRFYRPPRCSHC
:::::::::::.::::.:::::::::::::::.:...::::::::::::.::::::::::
CCDS54 NFSMATFMDPGVFPRADEDEDKEDDFRAPLYKNVDVRGIQVRMKWCATCHFYRPPRCSHC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD SVCDNCVEEFDHHCPWVNNCIGRRNYRYFFLFLLSLTAHIMGVFGFGLLYVLYHIEELSG
::::::::.:::::::::::::::::::::::::::.::..:: .:::.::: : : :..
CCDS54 SVCDNCVEDFDHHCPWVNNCIGRRNYRYFFLFLLSLSAHMVGVVAFGLVYVLNHAEGLGA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD VRTAVTMAVMCVAGLFFIPVAGLTGFHVVLVARGRTTNEQVTGKFRGGVNPFTNGCCNNV
..:..::::::::::::::: ::::::::::.::::::::::::::::::::: :::.::
CCDS54 AHTTITMAVMCVAGLFFIPVIGLTGFHVVLVTRGRTTNEQVTGKFRGGVNPFTRGCCGNV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KSD SRVLCSSPAPRYLGRPKKEKTIV-IRPPFLRPEVSD--GQITVKIMDNGIQGELRRTKSK
.:::: ::::. .: . : ..:::::::. : . . ::. :::... : :.:::
CCDS54 EHVLCSPLAPRYVVEPPRLPLAVSLKPPFLRPELLDRAAPLKVKLSDNGLKAGLGRSKSK
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KSD GSLEITESQSADAEPPPPPKPDLSRYTG-LRTHLGLATNEDSSLLAKDSPPTPTMYKYRP
:::. . . : :: ::: . . ... :.: .. :.. . . :::::.:::.::
CCDS54 GSLDRLDEKPLDLGPPLPPKIEAGTFSSDLQTPRP-GSAESALSVQRTSPPTPAMYKFRP
310 320 330 340 350
360 370 380 390 400
pF1KSD GYSSSSTSAAMPHSSSAKLSRG-DSLKEPTSIAESSRHPSYRSEPSLE-----PESFR--
.. :. .: . .. : ::: : .: : .. :::::. : ...
CCDS54 AFP---TGPKVPFCGPGEQVPGPDSL---TLGDDSIRSLDFVSEPSLDLPDYGPGGLHAA
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KSD ---SPTFGKSFHFDPLSSGSRSSSLKSAQGTGFELGQLQSIRSEGTTSTSYKSL----AN
:: .. : : .:.. :: :::... : . :: .:::: : ..:. :
CCDS54 YPPSPPLSAS---DAFSGALRSLSLKASSRRGGDHVALQPLRSEGGPPTPHRSIFAPHAL
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KSD QTRNGSLSYDSLLTPSDSPDFESVQAGPEPDPPLGYTSPFLSARLAQQREAERHPR-LVP
.:::::::::::.:. :: .. : : :: ::.: : . :: . :
CCDS54 PNRNGSLSYDSLLNPG-SPGGHACPAHPAVGVA-GYHSPYLHPG-ATGDPPRPLPRSFSP
480 490 500 510 520
530 540 550 560 570
pF1KSD T-GPTHREPSPVRYDNLSRHIVASLQEREKLLRQSPPLPGREEEPGLGDSGIQSTPGSGH
. :: ::::::::::::: :.::.::: : .. : . . .::::. ..:
CCDS54 VLGPRPREPSPVRYDNLSRTIMASIQER-KDREERERLLRSQADSLFGDSGVYDAP----
530 540 550 560 570 580
580 590 600 610 620 630
pF1KSD APRTSSSSDDSKRSPLGKTPLGRPAVPRFGKPDGL-RGRGVGSPEPGPTAPYLGRSMSYS
:: . .. : :.. : : ::. :.:. : : : : : : : : :.:
CCDS54 -----SSYSLQQASVLSEGPRG-PAL-RYGSRDDLVAGPGFG----GARNPALQTSLSSL
590 600 610 620 630
640 650 660 670 680 690
pF1KSD SQKAQPGVSETEEVALQPLLTPKDEVQLKTTYSKSNGQPKSLGSASPGPGQPPLSSPTRG
:.... . .: .:: . .. . . : :. .: : :: :: : ::. .
CCDS54 SSSVSRA-PRTSSSSLQADQASSNAPGPRPS-SGSHRSPARQGLPSP-PGTP--HSPSYA
640 650 660 670 680
700 710
pF1KSD GVKKVSGVGGTTYEISV
: : :.
CCDS54 GPKAVAFIHTDLPEPPPSLTVQRGRIGTCTRGWGRRGQPWVPPGLHLCHLGRPEDRPPLR
690 700 710 720 730 740
>>CCDS35395.1 ZDHHC9 gene_id:51114|Hs108|chrX (364 aa)
initn: 560 init1: 402 opt: 559 Z-score: 371.1 bits: 78.2 E(32554): 2.4e-14
Smith-Waterman score: 732; 38.8% identity (64.2% similar) in 327 aa overlap (22-319:42-354)
10 20 30 40 50
pF1KSD MPAESGKRFKPSKYVPVSAAAIFLV-GATTLFFAFTCPGLSLYVSPAVPIY
.::. :. :::::: : :.. .:::.:..
CCDS35 RKWEKLPGRNTFCCDGRVMMARQKGIFYLTLFLILGTCTLFFAFECRYLAVQLSPAIPVF
20 30 40 50 60 70
60 70 80 90
pF1KSD NAIMFLFVLANFSMATFMDPGIFPRAEEDEDK--EDDFRA------------PLYKTVEI
:..::: .:.. ..: :::..::: :: : ...: : :. .:
CCDS35 AAMLFLFSMATLLRTSFSDPGVIPRALPDEAAFIEMEIEATNGAVPQGQRPPPRIKNFQI
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KSD KGIQVRMKWCATCRFYRPPRCSHCSVCDNCVEEFDHHCPWVNNCIGRRNYRYFFLFLLSL
.. :..:.: ::...:::: ::::.::::::.::::::::.::.:.::::::.::.:::
CCDS35 NNQIVKLKYCYTCKIFRPPRASHCSICDNCVERFDHHCPWVGNCVGKRNYRYFYLFILSL
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KSD TAHIMGVFGFGLLYV------LYHIEELSGVRTAVTMAVMCVAGLFFIPVAGLTGFHVVL
. . ::.:...:: . .: :. . .: ...: :. :.::::::. :
CCDS35 SLLTIYVFAFNIVYVALKSLKIGFLETLKETPGTVLEVLICFFTLW--SVVGLTGFHTFL
200 210 220 230 240
220 230 240 250 260
pF1KSD VARGRTTNEQVTGKFRGGV---NPFTNGC-CNNVSRVLCSSPAPRYLGR----PKKEKTI
:: ..::::.. :.. : ::...: .: .:::. : : : : .:.
CCDS35 VALNQTTNEDIKGSWTGKNRVQNPYSHGNIVKNCCEVLCGPLPPSVLDRRGILPLEESGS
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KSD VIRPPFLRPEVSDGQITVKIMDNGIQGELRRTKSKGSLEITESQSADAEPPPPPKPDLSR
::: : . . ... .. :. .: :. :..:. : ::: :.
CCDS35 --RPP------STQETSSSLLPQSPAP----TEHLNSNEMPEDSSTPEEMPPPEPPEPPQ
310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KSD YTGLRTHLGLATNEDSSLLAKDSPPTPTMYKYRPGYSSSSTSAAMPHSSSAKLSRGDSLK
CCDS35 EAAEAEK
360
>>CCDS43190.1 ZDHHC19 gene_id:131540|Hs108|chr3 (309 aa)
initn: 456 init1: 312 opt: 494 Z-score: 331.3 bits: 70.6 E(32554): 3.9e-12
Smith-Waterman score: 494; 33.2% identity (61.4% similar) in 277 aa overlap (9-274:25-285)
10 20 30 40
pF1KSD MPAESGKRFKPSKYVPVSAAAIFLVGATTLFFAFTCPGLSLYVS
: :: .. . ...:: . ::::: : :.
CCDS43 MTLLTDATPLVKEPHPLPLVPRPWFLPSLFAAFN--VVLLVFFSGLFFAFPCRWLAQNGE
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KSD PAVPIYNAIMFLFVLANFSMAT--FMDPGIFPRAEEDEDKEDDFRAPL-YKTVEIKGIQV
: :. .. ::::. ::... : ::::. .. .. .:: ..: ..
CCDS43 WAFPVITGS--LFVLTFFSLVSLNFSDPGILHQGSAEQ-------GPLTVHVVWVNHGAF
60 70 80 90 100
110 120 130 140 150 160
pF1KSD RMKWCATCRFYRPPRCSHCSVCDNCVEEFDHHCPWVNNCIGRRNYRYFFLFLLSLTAHIM
:..:: : :.:::: :: :. :::.::::: :::::::.::.:.:.:..::: .
CCDS43 RLQWCPKCCFHRPPRTYHCPWCNICVEDFDHHCKWVNNCIGHRNFRFFMLLVLSLCLYSG
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210
pF1KSD GVFGFGLLYVLY--HIEELSGVRTAVTMAVMCVAGLFFIPVAGLTGFHVVLVARGRTTNE
... :.... :. . :...:: .:::. .:.. : .... :. ....
CCDS43 AMLVTCLIFLVRTTHLPFSTDKAIAIVVAV-SAAGLL-VPLSLLLLIQALSVS---SADR
170 180 190 200 210 220
220 230 240 250 260 270
pF1KSD QVTGKFRG--GVNPFTNGCCNNVSRVLCSSPAPRYLGRPKKEKTIV----IRPPFLRPEV
:: : : ::: .:: .: ..:. .:.:... . . .: : :.: .
CCDS43 TYKGKCRHLQGYNPFDQGCASNWYLTICAPLGPKYMAEAVQLQRVVGPDWTSMPNLHPPM
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KSD SDGQITVKIMDNGIQGELRRTKSKGSLEITESQSADAEPPPPPKPDLSRYTGLRTHLGLA
:
CCDS43 SPSALNPPAPTSGSLQSREGTPGAW
290 300
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.... .. ::::: :: :.. ..::.:
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60 70 80 90
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.:.:.::.... ..: :::..::: :: ... : .: : : : :.
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100 110 120 130 140 150
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: :..:.: ::...:::: ::::.::::::.::::::::.::.:.::::.:..:.:::.
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160 170 180 190 200 210
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. .:.: . .:. . .. :.... ..: ::.: ... ..::.:::. :.
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220 230 240 250 260
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. ..::::.. :.. :: . ::.. : .: .::. .: . : :.
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270 280 290 300 310 320
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: .: . .. :: : .. :.. . .. :. .: : : .:.: :
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330 340 350 360 370
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: . ::.: : : .:::: :. . .. . .:: : . :. .
CCDS52 LHLPGKPGLGTPCASLTL---GPPTPPASM--PNLAEATLADVMPRKDEHMGHQFLTPDE
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380 390 400 410 420 430
pF1KSD SLKEPTSIAESSRHPSYRSEPSLEPESFRSPTFGKSFHFDPLSSGSRSSSLKSAQGTGFE
. . : .: .:
CCDS52 APSPPRLLAAGSPLAHSRTMHVLGLASQDSLHEDSVRGLVKLSSV
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>>CCDS47510.1 ZDHHC14 gene_id:79683|Hs108|chr6 (473 aa)
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.... .. ::::: :: :.. ..::.:
CCDS47 KWEVFPGRNKFFCNGRIMMARQTGVFYLTLVLILVTSGLFFAFDCPYLAVKITPAIPAVA
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60 70 80 90
pF1KSD AIMFLFVLANFSMATFMDPGIFPRAEEDE----DKEDD---------FRAPLY-KTVEIK
.:.:.::.... ..: :::..::: :: ... : .: : : : :.
CCDS47 GILFFFVMGTLLRTSFSDPGVLPRATPDEAADLERQIDIANGTSSGGYRPPPRTKEVIIN
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100 110 120 130 140 150
pF1KSD GIQVRMKWCATCRFYRPPRCSHCSVCDNCVEEFDHHCPWVNNCIGRRNYRYFFLFLLSLT
: :..:.: ::...:::: ::::.::::::.::::::::.::.:.::::.:..:.:::.
CCDS47 GQTVKLKYCFTCKIFRPPRASHCSLCDNCVERFDHHCPWVGNCVGKRNYRFFYMFILSLS
160 170 180 190 200 210
160 170 180 190 200 210
pF1KSD AHIMGVFGFGLLYVLYHIEE---LSGVR---TAVTMAVMCVAGLFFIPVAGLTGFHVVLV
. .:.: . .:. . .. :.... ..: ::.: ... ..::.:::. :.
CCDS47 FLTVFIFAFVITHVILRSQQTGFLNALKDSPASVLEAVVCFFSVW--SIVGLSGFHTYLI
220 230 240 250 260 270
220 230 240 250 260
pF1KSD ARGRTTNEQVTGKF---RG--GVNPFTNGCC-NNVSRVLCSSPAPRYLGRPKKEKTIVIR
. ..::::.. :.. :: . ::.. : .: .::. .: . : :.
CCDS47 SSNQTTNEDIKGSWSNKRGKENYNPYSYGNIFTNCCVALCGPISPSLIDRRG-----YIQ
280 290 300 310 320 330
270 280 290 300 310 320
pF1KSD PPFLRPEVSDGQITVKIMDNGIQGELRRTKSKGSLEITESQSADAEPPPPPKPDLSRYTG
: .: . .. :: : .. :.. . . :. : ..: : : ::
CCDS47 PDTPQPAAPSNGIT---MYGATQSQSDMAAATPLLQSEPSLTSD-ELHLPGKP-------
340 350 360 370 380
330 340 350 360 370 380
pF1KSD LRTHLGLATNEDSSLLAKDSPPTPTMYKYRPGYSSSSTSAAMP----HSSSAKLSRGDSL
::.: : : .:::: :. . .. . .:: : . :. ..
CCDS47 -----GLGTPCASLTL---GPPTPPASM--PNLAEATLADVMPRKDEHMGHQFLTPDEAP
390 400 410 420 430
390 400 410 420 430 440
pF1KSD KEPTSIAESSRHPSYRSEPSLEPESFRSPTFGKSFHFDPLSSGSRSSSLKSAQGTGFELG
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CCDS47 SPPRLLAAGSPLAHSRTMHVLGLASQDSLHEDSVRGLVKLSSV
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>>CCDS30650.1 ZDHHC18 gene_id:84243|Hs108|chr1 (388 aa)
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10 20 30
pF1KSD MPAESGKRFKPSKYVPVSAAAIFLVGATT-LFFAF
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CCDS30 GSGSGSGSGSLGRRPRRKWEVFPGRNRFYCGGRLMLAGHGGVFALTLLLILTTTGLFFVF
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40 50 60 70 80
pF1KSD TCPGLSLYVSPAVPIYNAIMFLFVLANFSMATFMDPGIFPRAEEDE----DKEDD-----
:: :. .. :.:: ::.:.::.. . ...: ::::.::: : .:. :
CCDS30 DCPYLARKLTLAIPIIAAILFFFVMSCLLQTSFTDPGILPRATVCEAAALEKQIDNTGSS
120 130 140 150 160 170
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pF1KSD -FRAPLY-KTVEIKGIQVRMKWCATCRFYRPPRCSHCSVCDNCVEEFDHHCPWVNNCIGR
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CCDS30 TYRPPPRTREVLINGQMVKLKYCFTCKMFRPPRTSHCSVCDNCVERFDHHCPWVGNCVGR
180 190 200 210 220 230
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CCDS30 RNYRFFYAFILSLSFLTAFIFACVVTHLTLRAQGSNFLSTLKETPASVLELVICFFSIWS
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CCDS30 ILGLSGFHTYLVASNLTTNEDIKGSWSSKRGGEASVNPYSHKSIITNCCA----VLCGPL
300 310 320 330 340
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]