Result of FASTA (omim) for
pF1KSDA1723
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1723, 1528 aa
1>>>pF1KSDA1723 1528 - 1528 aa - 1528 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.4119+/-0.000417; mu= 8.4388+/- 0.026
mean_var=153.5246+/-32.036, 0's: 0 Z-trim(115.8): 355 B-trim: 826 in 1/56
Lambda= 0.103511
statistics sampled from 26041 (26440) to 26041 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.649), E-opt: 0.2 (0.31), width: 16
Scan time: 19.100
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_872584 (OMIM: 114500,604258) rho GTPase-activat (1528) 10125 1525.2 0
XP_016868440 (OMIM: 114500,604258) PREDICTED: rho (1528) 10125 1525.2 0
XP_005273431 (OMIM: 114500,604258) PREDICTED: rho (1528) 10125 1525.2 0
NP_001303597 (OMIM: 114500,604258) rho GTPase-acti (1125) 7188 1086.6 0
NP_006085 (OMIM: 114500,604258) rho GTPase-activat (1091) 7174 1084.5 0
NP_001157743 (OMIM: 114500,604258) rho GTPase-acti (1017) 6753 1021.6 0
XP_016868441 (OMIM: 114500,604258) PREDICTED: rho (1017) 6753 1021.6 0
NP_443083 (OMIM: 609866) stAR-related lipid transf ( 995) 3238 496.7 4e-139
XP_011533601 (OMIM: 609866) PREDICTED: stAR-relate (1078) 3238 496.7 4.3e-139
XP_016876324 (OMIM: 609866) PREDICTED: stAR-relate (1078) 3238 496.7 4.3e-139
NP_001230405 (OMIM: 609866) stAR-related lipid tra (1078) 3238 496.7 4.3e-139
XP_016876323 (OMIM: 609866) PREDICTED: stAR-relate (1098) 3238 496.7 4.3e-139
NP_821075 (OMIM: 609866) stAR-related lipid transf (1105) 3238 496.7 4.4e-139
NP_821074 (OMIM: 609866) stAR-related lipid transf (1113) 3238 496.7 4.4e-139
NP_079043 (OMIM: 114500,604258) rho GTPase-activat ( 463) 2947 453.1 2.5e-126
NP_001135975 (OMIM: 300689) stAR-related lipid tra (1103) 2598 401.1 2.6e-110
XP_005262371 (OMIM: 300689) PREDICTED: stAR-relate (1107) 2580 398.4 1.7e-109
NP_001135976 (OMIM: 300689) stAR-related lipid tra (1023) 2333 361.5 2e-98
XP_011529371 (OMIM: 300689) PREDICTED: stAR-relate (1023) 2333 361.5 2e-98
NP_055540 (OMIM: 300689) stAR-related lipid transf (1023) 2333 361.5 2e-98
XP_005262372 (OMIM: 300689) PREDICTED: stAR-relate (1027) 2315 358.8 1.3e-97
XP_011529372 (OMIM: 300689) PREDICTED: stAR-relate (1027) 2315 358.8 1.3e-97
NP_001230403 (OMIM: 609866) stAR-related lipid tra ( 646) 1754 275.0 1.4e-72
NP_001230395 (OMIM: 609866) stAR-related lipid tra ( 687) 1402 222.4 9.9e-57
XP_005267270 (OMIM: 613351) PREDICTED: rho GTPase- ( 585) 338 63.5 5.8e-09
XP_016866983 (OMIM: 613351) PREDICTED: rho GTPase- ( 635) 338 63.5 6.3e-09
NP_277050 (OMIM: 613351) rho GTPase-activating pro ( 663) 338 63.5 6.5e-09
XP_005267269 (OMIM: 613351) PREDICTED: rho GTPase- ( 713) 338 63.5 6.9e-09
NP_001010000 (OMIM: 610592) rho GTPase-activating ( 570) 294 56.9 5.4e-07
XP_005258202 (OMIM: 610592) PREDICTED: rho GTPase- ( 740) 294 57.0 6.8e-07
XP_005258201 (OMIM: 610592) PREDICTED: rho GTPase- ( 747) 294 57.0 6.9e-07
NP_001034930 (OMIM: 616310) rho GTPase-activating ( 267) 283 55.1 8.7e-07
NP_006779 (OMIM: 605801) ralA-binding protein 1 [H ( 655) 290 56.4 9.3e-07
NP_001657 (OMIM: 300023) rho GTPase-activating pro ( 946) 293 56.9 9.3e-07
NP_001158213 (OMIM: 300023) rho GTPase-activating ( 986) 293 56.9 9.7e-07
NP_006116 (OMIM: 300118) rho GTPase-activating pro ( 765) 290 56.4 1.1e-06
NP_038267 (OMIM: 300118) rho GTPase-activating pro ( 771) 290 56.4 1.1e-06
NP_001274171 (OMIM: 300118) rho GTPase-activating ( 794) 290 56.4 1.1e-06
NP_060524 (OMIM: 608293) rho GTPase-activating pro ( 803) 290 56.4 1.1e-06
NP_001006635 (OMIM: 608293) rho GTPase-activating ( 881) 290 56.4 1.2e-06
NP_038286 (OMIM: 300118) rho GTPase-activating pro ( 974) 290 56.4 1.3e-06
XP_016878879 (OMIM: 608293) PREDICTED: rho GTPase- ( 794) 287 55.9 1.5e-06
XP_011544180 (OMIM: 608293) PREDICTED: rho GTPase- ( 835) 287 56.0 1.6e-06
XP_011544179 (OMIM: 608293) PREDICTED: rho GTPase- ( 836) 287 56.0 1.6e-06
XP_011544178 (OMIM: 608293) PREDICTED: rho GTPase- ( 872) 287 56.0 1.6e-06
XP_011544177 (OMIM: 608293) PREDICTED: rho GTPase- ( 885) 287 56.0 1.6e-06
XP_011544176 (OMIM: 608293) PREDICTED: rho GTPase- ( 912) 287 56.0 1.7e-06
XP_011544175 (OMIM: 608293) PREDICTED: rho GTPase- ( 913) 287 56.0 1.7e-06
XP_011529582 (OMIM: 300937) PREDICTED: rho GTPase- ( 411) 278 54.5 2.1e-06
NP_001317580 (OMIM: 300937) rho GTPase-activating ( 411) 278 54.5 2.1e-06
>>NP_872584 (OMIM: 114500,604258) rho GTPase-activating (1528 aa)
initn: 10125 init1: 10125 opt: 10125 Z-score: 8174.1 bits: 1525.2 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 10125; 99.7% identity (99.9% similar) in 1528 aa overlap (1-1528:1-1528)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSVAIRKRSWEEHVTHWMGQPFNSDDRNTACHHGLVADSLQASMEKDATLNVDRKEKCVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_872 MSVAIRKRSWEEHVTHWMGQPFNSDDRNTACHHGLVADSLQASMEKDATLNVDRKEKCVS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LPDCCHGSELRDFPGRPMGHLSKDVDENDSHEGEDQFLSLEASTETLVHVSDEDNNADLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_872 LPDCCHGSELRDFPGRPMGHLSKDVDENDSHEGEDQFLSLEASTETLVHVSDEDNNADLC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LTDDKQVLNTQGQKTSGQHMIQGAGSLEKALPIIQSNQVSSNSWGIAGETELALVKESGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_872 LTDDKQVLNTQGQKTSGQHMIQGAGSLEKALPIIQSNQVSSNSWGIAGETELALVKESGE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD RKVTDSISKSLELCNEISLSEIKDAPKVNAVDTLNVKDIAPEKQLLNSAVIAQQRRKPDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_872 RKVTDSISKSLELCNEISLSEIKDAPKVNAVDTLNVKDIAPEKQLLNSAVIAQQRRKPDP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD PKDENERSTCNVVHDEFLDIPCTNRGLPLLKTDFGSCLLQPPSCPNGMSAENGLEKSGFS
:::::::::::::..:::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_872 PKDENERSTCNVVQNEFLDTPCTNRGLPLLKTDFGSCLLQPPSCPNGMSAENGLEKSGFS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD QHQNKSPPKVKAEDGMQCLQLKETLATQEPTDNQVRLRKRKEIREDRDRARLDSMVLLIM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_872 QHQNKSPPKVKAEDGMQCLQLKETLATQEPTDNQVRLRKRKEIREDRDRARLDSMVLLIM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD KLDQLDQDIENALSTSSSPSGTPTNLRRHVPDLESGSESGADTISVNQTRVNLSSDTEST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_872 KLDQLDQDIENALSTSSSPSGTPTNLRRHVPDLESGSESGADTISVNQTRVNLSSDTEST
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD DLPSSTPVANSGTKPKTTAIQGISEKEKAEIEAKEACDWLRATGFPQYAQLYEDFLFPID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_872 DLPSSTPVANSGTKPKTTAIQGISEKEKAEIEAKEACDWLRATGFPQYAQLYEDFLFPID
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD ISLVKREHDFLDRDAIEALCRRLNTLNKCAVMKLEISPHRKRSDDSDEDEPCAISGKWTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_872 ISLVKREHDFLDRDAIEALCRRLNTLNKCAVMKLEISPHRKRSDDSDEDEPCAISGKWTF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD QRDSKRWSRLEEFDVFSPKQDLVPGSPDDSLPKDGPSPGGTLMDLSERQEVSSVRSLSST
:::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::
NP_872 QRDSKRWSRLEEFDVFSPKQDLVPGSPDDSHPKDGPSPGGTLMDLSERQEVSSVRSLSST
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD GSLPSHAPPSEDAATPRTNSVISVCSSSNLAGNDDSFGSLPSPKELSSFSFSMKGHEKTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_872 GSLPSHAPPSEDAATPRTNSVISVCSSSNLAGNDDSFGSLPSPKELSSFSFSMKGHEKTA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD KSKTRSLLKRMESLKLKSSHHSKHKAPSKLGLIISGPILQEGMDEEKLKQLNCVEISALN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_872 KSKTRSLLKRMESLKLKSSHHSKHKAPSKLGLIISGPILQEGMDEEKLKQLNCVEISALN
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD GNRINVPMVRKRSVSNSTQTSSSSSQSETSSAVSTPSPVTRTRSLSACNKRVGMYLEGFD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_872 GNRINVPMVRKRSVSNSTQTSSSSSQSETSSAVSTPSPVTRTRSLSACNKRVGMYLEGFD
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD PFNQSTFNNVMEQNFKNRESYPEDTVFYIPEDHKPGTFPKALTNGSFSPSGNNGSVNWRT
::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_872 PFNQSTFNNVVEQNFKNRESYPEDTVFYIPEDHKPGTFPKALTNGSFSPSGNNGSVNWRT
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD GSFHGPGHISLRRENSSDSPKELKRRNSSSSMSSRLSIYDNVPGSILYSSSGDLADLENE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_872 GSFHGPGHISLRRENSSDSPKELKRRNSSSSMSSRLSIYDNVPGSILYSSSGDLADLENE
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD DIFPELDDILYHVKGMQRIVNQWSEKFSDEGDSDSALDSVSPCPSSPKQIHLDVDNDRTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_872 DIFPELDDILYHVKGMQRIVNQWSEKFSDEGDSDSALDSVSPCPSSPKQIHLDVDNDRTT
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD PSDLDSTGNSLNEPEEPSEIPERRDSGVGASLTRSNRHRLRWHSFQSSHRPSLNSVSLQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_872 PSDLDSTGNSLNEPEEPSEIPERRDSGVGASLTRSNRHRLRWHSFQSSHRPSLNSVSLQI
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD NCQSVAQMNLLQKYSLLKLTALLEKYTPSNKHGFSWAVPKFMKRIKVPDYKDRSVFGVPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_872 NCQSVAQMNLLQKYSLLKLTALLEKYTPSNKHGFSWAVPKFMKRIKVPDYKDRSVFGVPL
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD TVNVQRTGQPLPQSIQQAMRYLRNHCLDQVGLFRKSGVKSRIQALRQMNEGAIDCVNYEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_872 TVNVQRTGQPLPQSIQQAMRYLRNHCLDQVGLFRKSGVKSRIQALRQMNEGAIDCVNYEG
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD QSAYDVADMLKQYFRDLPEPLMTNKLSETFLQIYQYVPKDQRLQAIKAAIMLLPDENREV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_872 QSAYDVADMLKQYFRDLPEPLMTNKLSETFLQIYQYVPKDQRLQAIKAAIMLLPDENREV
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD LQTLLYFLSDVTAAVKENQMTPTNLAVCLAPSLFHLNTLKRENSSPRVMQRKQSLGKPDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_872 LQTLLYFLSDVTAAVKENQMTPTNLAVCLAPSLFHLNTLKRENSSPRVMQRKQSLGKPDQ
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD KDLNENLAATQGLAHMIAECKKLFQVPEEMSRCRNSYTEQELKPLTLEALGHLGNDDSAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_872 KDLNENLAATQGLAHMIAECKKLFQVPEEMSRCRNSYTEQELKPLTLEALGHLGNDDSAD
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD YQHFLQDCVDGLFKEVKEKFKGWVSYSTSEQAELSYKKVSEGPPLRLWRSVIEVPAVPEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_872 YQHFLQDCVDGLFKEVKEKFKGWVSYSTSEQAELSYKKVSEGPPLRLWRSVIEVPAVPEE
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KSD ILKRLLKEQHLWDVDLLDSKVIEILDSQTEIYQYVQNSMAPHPARDYVVLRTWRTNLPKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_872 ILKRLLKEQHLWDVDLLDSKVIEILDSQTEIYQYVQNSMAPHPARDYVVLRTWRTNLPKG
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KSD ACALLLTSVDHDRAPVVGVRVNVLLSRYLIEPCGPGKSKLTYMCRVDLRGHMPEWYTKSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_872 ACALLLTSVDHDRAPVVGVRVNVLLSRYLIEPCGPGKSKLTYMCRVDLRGHMPEWYTKSF
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520
pF1KSD GHLCAAEVVKIRDSFSNQNTETKDTKSR
::::::::::::::::::::::::::::
NP_872 GHLCAAEVVKIRDSFSNQNTETKDTKSR
1510 1520
>>XP_016868440 (OMIM: 114500,604258) PREDICTED: rho GTPa (1528 aa)
initn: 10125 init1: 10125 opt: 10125 Z-score: 8174.1 bits: 1525.2 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 10125; 99.7% identity (99.9% similar) in 1528 aa overlap (1-1528:1-1528)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSVAIRKRSWEEHVTHWMGQPFNSDDRNTACHHGLVADSLQASMEKDATLNVDRKEKCVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MSVAIRKRSWEEHVTHWMGQPFNSDDRNTACHHGLVADSLQASMEKDATLNVDRKEKCVS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LPDCCHGSELRDFPGRPMGHLSKDVDENDSHEGEDQFLSLEASTETLVHVSDEDNNADLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LPDCCHGSELRDFPGRPMGHLSKDVDENDSHEGEDQFLSLEASTETLVHVSDEDNNADLC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LTDDKQVLNTQGQKTSGQHMIQGAGSLEKALPIIQSNQVSSNSWGIAGETELALVKESGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LTDDKQVLNTQGQKTSGQHMIQGAGSLEKALPIIQSNQVSSNSWGIAGETELALVKESGE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD RKVTDSISKSLELCNEISLSEIKDAPKVNAVDTLNVKDIAPEKQLLNSAVIAQQRRKPDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RKVTDSISKSLELCNEISLSEIKDAPKVNAVDTLNVKDIAPEKQLLNSAVIAQQRRKPDP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD PKDENERSTCNVVHDEFLDIPCTNRGLPLLKTDFGSCLLQPPSCPNGMSAENGLEKSGFS
:::::::::::::..:::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PKDENERSTCNVVQNEFLDTPCTNRGLPLLKTDFGSCLLQPPSCPNGMSAENGLEKSGFS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD QHQNKSPPKVKAEDGMQCLQLKETLATQEPTDNQVRLRKRKEIREDRDRARLDSMVLLIM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QHQNKSPPKVKAEDGMQCLQLKETLATQEPTDNQVRLRKRKEIREDRDRARLDSMVLLIM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD KLDQLDQDIENALSTSSSPSGTPTNLRRHVPDLESGSESGADTISVNQTRVNLSSDTEST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KLDQLDQDIENALSTSSSPSGTPTNLRRHVPDLESGSESGADTISVNQTRVNLSSDTEST
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD DLPSSTPVANSGTKPKTTAIQGISEKEKAEIEAKEACDWLRATGFPQYAQLYEDFLFPID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DLPSSTPVANSGTKPKTTAIQGISEKEKAEIEAKEACDWLRATGFPQYAQLYEDFLFPID
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD ISLVKREHDFLDRDAIEALCRRLNTLNKCAVMKLEISPHRKRSDDSDEDEPCAISGKWTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ISLVKREHDFLDRDAIEALCRRLNTLNKCAVMKLEISPHRKRSDDSDEDEPCAISGKWTF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD QRDSKRWSRLEEFDVFSPKQDLVPGSPDDSLPKDGPSPGGTLMDLSERQEVSSVRSLSST
:::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QRDSKRWSRLEEFDVFSPKQDLVPGSPDDSHPKDGPSPGGTLMDLSERQEVSSVRSLSST
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD GSLPSHAPPSEDAATPRTNSVISVCSSSNLAGNDDSFGSLPSPKELSSFSFSMKGHEKTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GSLPSHAPPSEDAATPRTNSVISVCSSSNLAGNDDSFGSLPSPKELSSFSFSMKGHEKTA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD KSKTRSLLKRMESLKLKSSHHSKHKAPSKLGLIISGPILQEGMDEEKLKQLNCVEISALN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KSKTRSLLKRMESLKLKSSHHSKHKAPSKLGLIISGPILQEGMDEEKLKQLNCVEISALN
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD GNRINVPMVRKRSVSNSTQTSSSSSQSETSSAVSTPSPVTRTRSLSACNKRVGMYLEGFD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GNRINVPMVRKRSVSNSTQTSSSSSQSETSSAVSTPSPVTRTRSLSACNKRVGMYLEGFD
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD PFNQSTFNNVMEQNFKNRESYPEDTVFYIPEDHKPGTFPKALTNGSFSPSGNNGSVNWRT
::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PFNQSTFNNVVEQNFKNRESYPEDTVFYIPEDHKPGTFPKALTNGSFSPSGNNGSVNWRT
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD GSFHGPGHISLRRENSSDSPKELKRRNSSSSMSSRLSIYDNVPGSILYSSSGDLADLENE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GSFHGPGHISLRRENSSDSPKELKRRNSSSSMSSRLSIYDNVPGSILYSSSGDLADLENE
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD DIFPELDDILYHVKGMQRIVNQWSEKFSDEGDSDSALDSVSPCPSSPKQIHLDVDNDRTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DIFPELDDILYHVKGMQRIVNQWSEKFSDEGDSDSALDSVSPCPSSPKQIHLDVDNDRTT
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD PSDLDSTGNSLNEPEEPSEIPERRDSGVGASLTRSNRHRLRWHSFQSSHRPSLNSVSLQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PSDLDSTGNSLNEPEEPSEIPERRDSGVGASLTRSNRHRLRWHSFQSSHRPSLNSVSLQI
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD NCQSVAQMNLLQKYSLLKLTALLEKYTPSNKHGFSWAVPKFMKRIKVPDYKDRSVFGVPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NCQSVAQMNLLQKYSLLKLTALLEKYTPSNKHGFSWAVPKFMKRIKVPDYKDRSVFGVPL
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD TVNVQRTGQPLPQSIQQAMRYLRNHCLDQVGLFRKSGVKSRIQALRQMNEGAIDCVNYEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TVNVQRTGQPLPQSIQQAMRYLRNHCLDQVGLFRKSGVKSRIQALRQMNEGAIDCVNYEG
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD QSAYDVADMLKQYFRDLPEPLMTNKLSETFLQIYQYVPKDQRLQAIKAAIMLLPDENREV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QSAYDVADMLKQYFRDLPEPLMTNKLSETFLQIYQYVPKDQRLQAIKAAIMLLPDENREV
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD LQTLLYFLSDVTAAVKENQMTPTNLAVCLAPSLFHLNTLKRENSSPRVMQRKQSLGKPDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LQTLLYFLSDVTAAVKENQMTPTNLAVCLAPSLFHLNTLKRENSSPRVMQRKQSLGKPDQ
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD KDLNENLAATQGLAHMIAECKKLFQVPEEMSRCRNSYTEQELKPLTLEALGHLGNDDSAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KDLNENLAATQGLAHMIAECKKLFQVPEEMSRCRNSYTEQELKPLTLEALGHLGNDDSAD
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD YQHFLQDCVDGLFKEVKEKFKGWVSYSTSEQAELSYKKVSEGPPLRLWRSVIEVPAVPEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YQHFLQDCVDGLFKEVKEKFKGWVSYSTSEQAELSYKKVSEGPPLRLWRSVIEVPAVPEE
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KSD ILKRLLKEQHLWDVDLLDSKVIEILDSQTEIYQYVQNSMAPHPARDYVVLRTWRTNLPKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ILKRLLKEQHLWDVDLLDSKVIEILDSQTEIYQYVQNSMAPHPARDYVVLRTWRTNLPKG
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KSD ACALLLTSVDHDRAPVVGVRVNVLLSRYLIEPCGPGKSKLTYMCRVDLRGHMPEWYTKSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ACALLLTSVDHDRAPVVGVRVNVLLSRYLIEPCGPGKSKLTYMCRVDLRGHMPEWYTKSF
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520
pF1KSD GHLCAAEVVKIRDSFSNQNTETKDTKSR
::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GHLCAAEVVKIRDSFSNQNTETKDTKSR
1510 1520
>>XP_005273431 (OMIM: 114500,604258) PREDICTED: rho GTPa (1528 aa)
initn: 10125 init1: 10125 opt: 10125 Z-score: 8174.1 bits: 1525.2 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 10125; 99.7% identity (99.9% similar) in 1528 aa overlap (1-1528:1-1528)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSVAIRKRSWEEHVTHWMGQPFNSDDRNTACHHGLVADSLQASMEKDATLNVDRKEKCVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MSVAIRKRSWEEHVTHWMGQPFNSDDRNTACHHGLVADSLQASMEKDATLNVDRKEKCVS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LPDCCHGSELRDFPGRPMGHLSKDVDENDSHEGEDQFLSLEASTETLVHVSDEDNNADLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LPDCCHGSELRDFPGRPMGHLSKDVDENDSHEGEDQFLSLEASTETLVHVSDEDNNADLC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LTDDKQVLNTQGQKTSGQHMIQGAGSLEKALPIIQSNQVSSNSWGIAGETELALVKESGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LTDDKQVLNTQGQKTSGQHMIQGAGSLEKALPIIQSNQVSSNSWGIAGETELALVKESGE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD RKVTDSISKSLELCNEISLSEIKDAPKVNAVDTLNVKDIAPEKQLLNSAVIAQQRRKPDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RKVTDSISKSLELCNEISLSEIKDAPKVNAVDTLNVKDIAPEKQLLNSAVIAQQRRKPDP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD PKDENERSTCNVVHDEFLDIPCTNRGLPLLKTDFGSCLLQPPSCPNGMSAENGLEKSGFS
:::::::::::::..:::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PKDENERSTCNVVQNEFLDTPCTNRGLPLLKTDFGSCLLQPPSCPNGMSAENGLEKSGFS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD QHQNKSPPKVKAEDGMQCLQLKETLATQEPTDNQVRLRKRKEIREDRDRARLDSMVLLIM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QHQNKSPPKVKAEDGMQCLQLKETLATQEPTDNQVRLRKRKEIREDRDRARLDSMVLLIM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD KLDQLDQDIENALSTSSSPSGTPTNLRRHVPDLESGSESGADTISVNQTRVNLSSDTEST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KLDQLDQDIENALSTSSSPSGTPTNLRRHVPDLESGSESGADTISVNQTRVNLSSDTEST
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD DLPSSTPVANSGTKPKTTAIQGISEKEKAEIEAKEACDWLRATGFPQYAQLYEDFLFPID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DLPSSTPVANSGTKPKTTAIQGISEKEKAEIEAKEACDWLRATGFPQYAQLYEDFLFPID
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD ISLVKREHDFLDRDAIEALCRRLNTLNKCAVMKLEISPHRKRSDDSDEDEPCAISGKWTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ISLVKREHDFLDRDAIEALCRRLNTLNKCAVMKLEISPHRKRSDDSDEDEPCAISGKWTF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD QRDSKRWSRLEEFDVFSPKQDLVPGSPDDSLPKDGPSPGGTLMDLSERQEVSSVRSLSST
:::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QRDSKRWSRLEEFDVFSPKQDLVPGSPDDSHPKDGPSPGGTLMDLSERQEVSSVRSLSST
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD GSLPSHAPPSEDAATPRTNSVISVCSSSNLAGNDDSFGSLPSPKELSSFSFSMKGHEKTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GSLPSHAPPSEDAATPRTNSVISVCSSSNLAGNDDSFGSLPSPKELSSFSFSMKGHEKTA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD KSKTRSLLKRMESLKLKSSHHSKHKAPSKLGLIISGPILQEGMDEEKLKQLNCVEISALN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KSKTRSLLKRMESLKLKSSHHSKHKAPSKLGLIISGPILQEGMDEEKLKQLNCVEISALN
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD GNRINVPMVRKRSVSNSTQTSSSSSQSETSSAVSTPSPVTRTRSLSACNKRVGMYLEGFD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GNRINVPMVRKRSVSNSTQTSSSSSQSETSSAVSTPSPVTRTRSLSACNKRVGMYLEGFD
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD PFNQSTFNNVMEQNFKNRESYPEDTVFYIPEDHKPGTFPKALTNGSFSPSGNNGSVNWRT
::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PFNQSTFNNVVEQNFKNRESYPEDTVFYIPEDHKPGTFPKALTNGSFSPSGNNGSVNWRT
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD GSFHGPGHISLRRENSSDSPKELKRRNSSSSMSSRLSIYDNVPGSILYSSSGDLADLENE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GSFHGPGHISLRRENSSDSPKELKRRNSSSSMSSRLSIYDNVPGSILYSSSGDLADLENE
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD DIFPELDDILYHVKGMQRIVNQWSEKFSDEGDSDSALDSVSPCPSSPKQIHLDVDNDRTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DIFPELDDILYHVKGMQRIVNQWSEKFSDEGDSDSALDSVSPCPSSPKQIHLDVDNDRTT
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD PSDLDSTGNSLNEPEEPSEIPERRDSGVGASLTRSNRHRLRWHSFQSSHRPSLNSVSLQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PSDLDSTGNSLNEPEEPSEIPERRDSGVGASLTRSNRHRLRWHSFQSSHRPSLNSVSLQI
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD NCQSVAQMNLLQKYSLLKLTALLEKYTPSNKHGFSWAVPKFMKRIKVPDYKDRSVFGVPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 NCQSVAQMNLLQKYSLLKLTALLEKYTPSNKHGFSWAVPKFMKRIKVPDYKDRSVFGVPL
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD TVNVQRTGQPLPQSIQQAMRYLRNHCLDQVGLFRKSGVKSRIQALRQMNEGAIDCVNYEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TVNVQRTGQPLPQSIQQAMRYLRNHCLDQVGLFRKSGVKSRIQALRQMNEGAIDCVNYEG
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD QSAYDVADMLKQYFRDLPEPLMTNKLSETFLQIYQYVPKDQRLQAIKAAIMLLPDENREV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QSAYDVADMLKQYFRDLPEPLMTNKLSETFLQIYQYVPKDQRLQAIKAAIMLLPDENREV
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD LQTLLYFLSDVTAAVKENQMTPTNLAVCLAPSLFHLNTLKRENSSPRVMQRKQSLGKPDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LQTLLYFLSDVTAAVKENQMTPTNLAVCLAPSLFHLNTLKRENSSPRVMQRKQSLGKPDQ
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD KDLNENLAATQGLAHMIAECKKLFQVPEEMSRCRNSYTEQELKPLTLEALGHLGNDDSAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KDLNENLAATQGLAHMIAECKKLFQVPEEMSRCRNSYTEQELKPLTLEALGHLGNDDSAD
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD YQHFLQDCVDGLFKEVKEKFKGWVSYSTSEQAELSYKKVSEGPPLRLWRSVIEVPAVPEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 YQHFLQDCVDGLFKEVKEKFKGWVSYSTSEQAELSYKKVSEGPPLRLWRSVIEVPAVPEE
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KSD ILKRLLKEQHLWDVDLLDSKVIEILDSQTEIYQYVQNSMAPHPARDYVVLRTWRTNLPKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ILKRLLKEQHLWDVDLLDSKVIEILDSQTEIYQYVQNSMAPHPARDYVVLRTWRTNLPKG
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KSD ACALLLTSVDHDRAPVVGVRVNVLLSRYLIEPCGPGKSKLTYMCRVDLRGHMPEWYTKSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ACALLLTSVDHDRAPVVGVRVNVLLSRYLIEPCGPGKSKLTYMCRVDLRGHMPEWYTKSF
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520
pF1KSD GHLCAAEVVKIRDSFSNQNTETKDTKSR
::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GHLCAAEVVKIRDSFSNQNTETKDTKSR
1510 1520
>>NP_001303597 (OMIM: 114500,604258) rho GTPase-activati (1125 aa)
initn: 7185 init1: 7185 opt: 7188 Z-score: 5805.8 bits: 1086.6 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 7188; 97.8% identity (98.8% similar) in 1104 aa overlap (425-1528:22-1125)
400 410 420 430 440 450
pF1KSD SGSESGADTISVNQTRVNLSSDTESTDLPSSTPVANSGTKPKTTAIQGISEKEKAEIEAK
: . .: .. . .. ... ::::::
NP_001 MGDPKAHVMARPLRAPLRRSFSDHIRDSTARALDVIWKNTRDRRLAEIEAK
10 20 30 40 50
460 470 480 490 500 510
pF1KSD EACDWLRATGFPQYAQLYEDFLFPIDISLVKREHDFLDRDAIEALCRRLNTLNKCAVMKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EACDWLRATGFPQYAQLYEDFLFPIDISLVKREHDFLDRDAIEALCRRLNTLNKCAVMKL
60 70 80 90 100 110
520 530 540 550 560 570
pF1KSD EISPHRKRSDDSDEDEPCAISGKWTFQRDSKRWSRLEEFDVFSPKQDLVPGSPDDSLPKD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::
NP_001 EISPHRKRSDDSDEDEPCAISGKWTFQRDSKRWSRLEEFDVFSPKQDLVPGSPDDSHPKD
120 130 140 150 160 170
580 590 600 610 620 630
pF1KSD GPSPGGTLMDLSERQEVSSVRSLSSTGSLPSHAPPSEDAATPRTNSVISVCSSSNLAGND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GPSPGGTLMDLSERQEVSSVRSLSSTGSLPSHAPPSEDAATPRTNSVISVCSSSNLAGND
180 190 200 210 220 230
640 650 660 670 680 690
pF1KSD DSFGSLPSPKELSSFSFSMKGHEKTAKSKTRSLLKRMESLKLKSSHHSKHKAPSKLGLII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DSFGSLPSPKELSSFSFSMKGHEKTAKSKTRSLLKRMESLKLKSSHHSKHKAPSKLGLII
240 250 260 270 280 290
700 710 720 730 740 750
pF1KSD SGPILQEGMDEEKLKQLNCVEISALNGNRINVPMVRKRSVSNSTQTSSSSSQSETSSAVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SGPILQEGMDEEKLKQLNCVEISALNGNRINVPMVRKRSVSNSTQTSSSSSQSETSSAVS
300 310 320 330 340 350
760 770 780 790 800 810
pF1KSD TPSPVTRTRSLSACNKRVGMYLEGFDPFNQSTFNNVMEQNFKNRESYPEDTVFYIPEDHK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::
NP_001 TPSPVTRTRSLSACNKRVGMYLEGFDPFNQSTFNNVVEQNFKNRESYPEDTVFYIPEDHK
360 370 380 390 400 410
820 830 840 850 860 870
pF1KSD PGTFPKALTNGSFSPSGNNGSVNWRTGSFHGPGHISLRRENSSDSPKELKRRNSSSSMSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PGTFPKALTNGSFSPSGNNGSVNWRTGSFHGPGHISLRRENSSDSPKELKRRNSSSSMSS
420 430 440 450 460 470
880 890 900 910 920 930
pF1KSD RLSIYDNVPGSILYSSSGDLADLENEDIFPELDDILYHVKGMQRIVNQWSEKFSDEGDSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RLSIYDNVPGSILYSSSGDLADLENEDIFPELDDILYHVKGMQRIVNQWSEKFSDEGDSD
480 490 500 510 520 530
940 950 960 970 980 990
pF1KSD SALDSVSPCPSSPKQIHLDVDNDRTTPSDLDSTGNSLNEPEEPSEIPERRDSGVGASLTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SALDSVSPCPSSPKQIHLDVDNDRTTPSDLDSTGNSLNEPEEPSEIPERRDSGVGASLTR
540 550 560 570 580 590
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KSD SNRHRLRWHSFQSSHRPSLNSVSLQINCQSVAQMNLLQKYSLLKLTALLEKYTPSNKHGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SNRHRLRWHSFQSSHRPSLNSVSLQINCQSVAQMNLLQKYSLLKLTALLEKYTPSNKHGF
600 610 620 630 640 650
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KSD SWAVPKFMKRIKVPDYKDRSVFGVPLTVNVQRTGQPLPQSIQQAMRYLRNHCLDQVGLFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SWAVPKFMKRIKVPDYKDRSVFGVPLTVNVQRTGQPLPQSIQQAMRYLRNHCLDQVGLFR
660 670 680 690 700 710
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KSD KSGVKSRIQALRQMNEGAIDCVNYEGQSAYDVADMLKQYFRDLPEPLMTNKLSETFLQIY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KSGVKSRIQALRQMNEGAIDCVNYEGQSAYDVADMLKQYFRDLPEPLMTNKLSETFLQIY
720 730 740 750 760 770
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KSD QYVPKDQRLQAIKAAIMLLPDENREVLQTLLYFLSDVTAAVKENQMTPTNLAVCLAPSLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QYVPKDQRLQAIKAAIMLLPDENREVLQTLLYFLSDVTAAVKENQMTPTNLAVCLAPSLF
780 790 800 810 820 830
1240 1250 1260 1270 1280 1290
pF1KSD HLNTLKRENSSPRVMQRKQSLGKPDQKDLNENLAATQGLAHMIAECKKLFQVPEEMSRCR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HLNTLKRENSSPRVMQRKQSLGKPDQKDLNENLAATQGLAHMIAECKKLFQVPEEMSRCR
840 850 860 870 880 890
1300 1310 1320 1330 1340 1350
pF1KSD NSYTEQELKPLTLEALGHLGNDDSADYQHFLQDCVDGLFKEVKEKFKGWVSYSTSEQAEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NSYTEQELKPLTLEALGHLGNDDSADYQHFLQDCVDGLFKEVKEKFKGWVSYSTSEQAEL
900 910 920 930 940 950
1360 1370 1380 1390 1400 1410
pF1KSD SYKKVSEGPPLRLWRSVIEVPAVPEEILKRLLKEQHLWDVDLLDSKVIEILDSQTEIYQY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SYKKVSEGPPLRLWRSVIEVPAVPEEILKRLLKEQHLWDVDLLDSKVIEILDSQTEIYQY
960 970 980 990 1000 1010
1420 1430 1440 1450 1460 1470
pF1KSD VQNSMAPHPARDYVVLRTWRTNLPKGACALLLTSVDHDRAPVVGVRVNVLLSRYLIEPCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VQNSMAPHPARDYVVLRTWRTNLPKGACALLLTSVDHDRAPVVGVRVNVLLSRYLIEPCG
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1480 1490 1500 1510 1520
pF1KSD PGKSKLTYMCRVDLRGHMPEWYTKSFGHLCAAEVVKIRDSFSNQNTETKDTKSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PGKSKLTYMCRVDLRGHMPEWYTKSFGHLCAAEVVKIRDSFSNQNTETKDTKSR
1080 1090 1100 1110 1120
>>NP_006085 (OMIM: 114500,604258) rho GTPase-activating (1091 aa)
initn: 7174 init1: 7174 opt: 7174 Z-score: 5794.7 bits: 1084.5 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 7174; 99.7% identity (99.9% similar) in 1079 aa overlap (450-1528:13-1091)
420 430 440 450 460 470
pF1KSD TDLPSSTPVANSGTKPKTTAIQGISEKEKAEIEAKEACDWLRATGFPQYAQLYEDFLFPI
.:::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 MCRKKPDTMILTQIEAKEACDWLRATGFPQYAQLYEDFLFPI
10 20 30 40
480 490 500 510 520 530
pF1KSD DISLVKREHDFLDRDAIEALCRRLNTLNKCAVMKLEISPHRKRSDDSDEDEPCAISGKWT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 DISLVKREHDFLDRDAIEALCRRLNTLNKCAVMKLEISPHRKRSDDSDEDEPCAISGKWT
50 60 70 80 90 100
540 550 560 570 580 590
pF1KSD FQRDSKRWSRLEEFDVFSPKQDLVPGSPDDSLPKDGPSPGGTLMDLSERQEVSSVRSLSS
::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 FQRDSKRWSRLEEFDVFSPKQDLVPGSPDDSHPKDGPSPGGTLMDLSERQEVSSVRSLSS
110 120 130 140 150 160
600 610 620 630 640 650
pF1KSD TGSLPSHAPPSEDAATPRTNSVISVCSSSNLAGNDDSFGSLPSPKELSSFSFSMKGHEKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 TGSLPSHAPPSEDAATPRTNSVISVCSSSNLAGNDDSFGSLPSPKELSSFSFSMKGHEKT
170 180 190 200 210 220
660 670 680 690 700 710
pF1KSD AKSKTRSLLKRMESLKLKSSHHSKHKAPSKLGLIISGPILQEGMDEEKLKQLNCVEISAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 AKSKTRSLLKRMESLKLKSSHHSKHKAPSKLGLIISGPILQEGMDEEKLKQLNCVEISAL
230 240 250 260 270 280
720 730 740 750 760 770
pF1KSD NGNRINVPMVRKRSVSNSTQTSSSSSQSETSSAVSTPSPVTRTRSLSACNKRVGMYLEGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 NGNRINVPMVRKRSVSNSTQTSSSSSQSETSSAVSTPSPVTRTRSLSACNKRVGMYLEGF
290 300 310 320 330 340
780 790 800 810 820 830
pF1KSD DPFNQSTFNNVMEQNFKNRESYPEDTVFYIPEDHKPGTFPKALTNGSFSPSGNNGSVNWR
:::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 DPFNQSTFNNVVEQNFKNRESYPEDTVFYIPEDHKPGTFPKALTNGSFSPSGNNGSVNWR
350 360 370 380 390 400
840 850 860 870 880 890
pF1KSD TGSFHGPGHISLRRENSSDSPKELKRRNSSSSMSSRLSIYDNVPGSILYSSSGDLADLEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 TGSFHGPGHISLRRENSSDSPKELKRRNSSSSMSSRLSIYDNVPGSILYSSSGDLADLEN
410 420 430 440 450 460
900 910 920 930 940 950
pF1KSD EDIFPELDDILYHVKGMQRIVNQWSEKFSDEGDSDSALDSVSPCPSSPKQIHLDVDNDRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 EDIFPELDDILYHVKGMQRIVNQWSEKFSDEGDSDSALDSVSPCPSSPKQIHLDVDNDRT
470 480 490 500 510 520
960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD TPSDLDSTGNSLNEPEEPSEIPERRDSGVGASLTRSNRHRLRWHSFQSSHRPSLNSVSLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 TPSDLDSTGNSLNEPEEPSEIPERRDSGVGASLTRSNRHRLRWHSFQSSHRPSLNSVSLQ
530 540 550 560 570 580
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KSD INCQSVAQMNLLQKYSLLKLTALLEKYTPSNKHGFSWAVPKFMKRIKVPDYKDRSVFGVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 INCQSVAQMNLLQKYSLLKLTALLEKYTPSNKHGFSWAVPKFMKRIKVPDYKDRSVFGVP
590 600 610 620 630 640
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KSD LTVNVQRTGQPLPQSIQQAMRYLRNHCLDQVGLFRKSGVKSRIQALRQMNEGAIDCVNYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 LTVNVQRTGQPLPQSIQQAMRYLRNHCLDQVGLFRKSGVKSRIQALRQMNEGAIDCVNYE
650 660 670 680 690 700
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KSD GQSAYDVADMLKQYFRDLPEPLMTNKLSETFLQIYQYVPKDQRLQAIKAAIMLLPDENRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 GQSAYDVADMLKQYFRDLPEPLMTNKLSETFLQIYQYVPKDQRLQAIKAAIMLLPDENRE
710 720 730 740 750 760
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KSD VLQTLLYFLSDVTAAVKENQMTPTNLAVCLAPSLFHLNTLKRENSSPRVMQRKQSLGKPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 VLQTLLYFLSDVTAAVKENQMTPTNLAVCLAPSLFHLNTLKRENSSPRVMQRKQSLGKPD
770 780 790 800 810 820
1260 1270 1280 1290 1300 1310
pF1KSD QKDLNENLAATQGLAHMIAECKKLFQVPEEMSRCRNSYTEQELKPLTLEALGHLGNDDSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 QKDLNENLAATQGLAHMIAECKKLFQVPEEMSRCRNSYTEQELKPLTLEALGHLGNDDSA
830 840 850 860 870 880
1320 1330 1340 1350 1360 1370
pF1KSD DYQHFLQDCVDGLFKEVKEKFKGWVSYSTSEQAELSYKKVSEGPPLRLWRSVIEVPAVPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 DYQHFLQDCVDGLFKEVKEKFKGWVSYSTSEQAELSYKKVSEGPPLRLWRSVIEVPAVPE
890 900 910 920 930 940
1380 1390 1400 1410 1420 1430
pF1KSD EILKRLLKEQHLWDVDLLDSKVIEILDSQTEIYQYVQNSMAPHPARDYVVLRTWRTNLPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 EILKRLLKEQHLWDVDLLDSKVIEILDSQTEIYQYVQNSMAPHPARDYVVLRTWRTNLPK
950 960 970 980 990 1000
1440 1450 1460 1470 1480 1490
pF1KSD GACALLLTSVDHDRAPVVGVRVNVLLSRYLIEPCGPGKSKLTYMCRVDLRGHMPEWYTKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 GACALLLTSVDHDRAPVVGVRVNVLLSRYLIEPCGPGKSKLTYMCRVDLRGHMPEWYTKS
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1500 1510 1520
pF1KSD FGHLCAAEVVKIRDSFSNQNTETKDTKSR
:::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 FGHLCAAEVVKIRDSFSNQNTETKDTKSR
1070 1080 1090
>>NP_001157743 (OMIM: 114500,604258) rho GTPase-activati (1017 aa)
initn: 6753 init1: 6753 opt: 6753 Z-score: 5455.5 bits: 1021.6 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6753; 99.8% identity (99.9% similar) in 1017 aa overlap (512-1528:1-1017)
490 500 510 520 530 540
pF1KSD SLVKREHDFLDRDAIEALCRRLNTLNKCAVMKLEISPHRKRSDDSDEDEPCAISGKWTFQ
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MKLEISPHRKRSDDSDEDEPCAISGKWTFQ
10 20 30
550 560 570 580 590 600
pF1KSD RDSKRWSRLEEFDVFSPKQDLVPGSPDDSLPKDGPSPGGTLMDLSERQEVSSVRSLSSTG
::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RDSKRWSRLEEFDVFSPKQDLVPGSPDDSHPKDGPSPGGTLMDLSERQEVSSVRSLSSTG
40 50 60 70 80 90
610 620 630 640 650 660
pF1KSD SLPSHAPPSEDAATPRTNSVISVCSSSNLAGNDDSFGSLPSPKELSSFSFSMKGHEKTAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SLPSHAPPSEDAATPRTNSVISVCSSSNLAGNDDSFGSLPSPKELSSFSFSMKGHEKTAK
100 110 120 130 140 150
670 680 690 700 710 720
pF1KSD SKTRSLLKRMESLKLKSSHHSKHKAPSKLGLIISGPILQEGMDEEKLKQLNCVEISALNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SKTRSLLKRMESLKLKSSHHSKHKAPSKLGLIISGPILQEGMDEEKLKQLNCVEISALNG
160 170 180 190 200 210
730 740 750 760 770 780
pF1KSD NRINVPMVRKRSVSNSTQTSSSSSQSETSSAVSTPSPVTRTRSLSACNKRVGMYLEGFDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NRINVPMVRKRSVSNSTQTSSSSSQSETSSAVSTPSPVTRTRSLSACNKRVGMYLEGFDP
220 230 240 250 260 270
790 800 810 820 830 840
pF1KSD FNQSTFNNVMEQNFKNRESYPEDTVFYIPEDHKPGTFPKALTNGSFSPSGNNGSVNWRTG
:::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FNQSTFNNVVEQNFKNRESYPEDTVFYIPEDHKPGTFPKALTNGSFSPSGNNGSVNWRTG
280 290 300 310 320 330
850 860 870 880 890 900
pF1KSD SFHGPGHISLRRENSSDSPKELKRRNSSSSMSSRLSIYDNVPGSILYSSSGDLADLENED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SFHGPGHISLRRENSSDSPKELKRRNSSSSMSSRLSIYDNVPGSILYSSSGDLADLENED
340 350 360 370 380 390
910 920 930 940 950 960
pF1KSD IFPELDDILYHVKGMQRIVNQWSEKFSDEGDSDSALDSVSPCPSSPKQIHLDVDNDRTTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IFPELDDILYHVKGMQRIVNQWSEKFSDEGDSDSALDSVSPCPSSPKQIHLDVDNDRTTP
400 410 420 430 440 450
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD SDLDSTGNSLNEPEEPSEIPERRDSGVGASLTRSNRHRLRWHSFQSSHRPSLNSVSLQIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SDLDSTGNSLNEPEEPSEIPERRDSGVGASLTRSNRHRLRWHSFQSSHRPSLNSVSLQIN
460 470 480 490 500 510
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD CQSVAQMNLLQKYSLLKLTALLEKYTPSNKHGFSWAVPKFMKRIKVPDYKDRSVFGVPLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CQSVAQMNLLQKYSLLKLTALLEKYTPSNKHGFSWAVPKFMKRIKVPDYKDRSVFGVPLT
520 530 540 550 560 570
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD VNVQRTGQPLPQSIQQAMRYLRNHCLDQVGLFRKSGVKSRIQALRQMNEGAIDCVNYEGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VNVQRTGQPLPQSIQQAMRYLRNHCLDQVGLFRKSGVKSRIQALRQMNEGAIDCVNYEGQ
580 590 600 610 620 630
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD SAYDVADMLKQYFRDLPEPLMTNKLSETFLQIYQYVPKDQRLQAIKAAIMLLPDENREVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SAYDVADMLKQYFRDLPEPLMTNKLSETFLQIYQYVPKDQRLQAIKAAIMLLPDENREVL
640 650 660 670 680 690
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD QTLLYFLSDVTAAVKENQMTPTNLAVCLAPSLFHLNTLKRENSSPRVMQRKQSLGKPDQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QTLLYFLSDVTAAVKENQMTPTNLAVCLAPSLFHLNTLKRENSSPRVMQRKQSLGKPDQK
700 710 720 730 740 750
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD DLNENLAATQGLAHMIAECKKLFQVPEEMSRCRNSYTEQELKPLTLEALGHLGNDDSADY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DLNENLAATQGLAHMIAECKKLFQVPEEMSRCRNSYTEQELKPLTLEALGHLGNDDSADY
760 770 780 790 800 810
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD QHFLQDCVDGLFKEVKEKFKGWVSYSTSEQAELSYKKVSEGPPLRLWRSVIEVPAVPEEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QHFLQDCVDGLFKEVKEKFKGWVSYSTSEQAELSYKKVSEGPPLRLWRSVIEVPAVPEEI
820 830 840 850 860 870
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KSD LKRLLKEQHLWDVDLLDSKVIEILDSQTEIYQYVQNSMAPHPARDYVVLRTWRTNLPKGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LKRLLKEQHLWDVDLLDSKVIEILDSQTEIYQYVQNSMAPHPARDYVVLRTWRTNLPKGA
880 890 900 910 920 930
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KSD CALLLTSVDHDRAPVVGVRVNVLLSRYLIEPCGPGKSKLTYMCRVDLRGHMPEWYTKSFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CALLLTSVDHDRAPVVGVRVNVLLSRYLIEPCGPGKSKLTYMCRVDLRGHMPEWYTKSFG
940 950 960 970 980 990
1510 1520
pF1KSD HLCAAEVVKIRDSFSNQNTETKDTKSR
:::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HLCAAEVVKIRDSFSNQNTETKDTKSR
1000 1010
>>XP_016868441 (OMIM: 114500,604258) PREDICTED: rho GTPa (1017 aa)
initn: 6753 init1: 6753 opt: 6753 Z-score: 5455.5 bits: 1021.6 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6753; 99.8% identity (99.9% similar) in 1017 aa overlap (512-1528:1-1017)
490 500 510 520 530 540
pF1KSD SLVKREHDFLDRDAIEALCRRLNTLNKCAVMKLEISPHRKRSDDSDEDEPCAISGKWTFQ
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MKLEISPHRKRSDDSDEDEPCAISGKWTFQ
10 20 30
550 560 570 580 590 600
pF1KSD RDSKRWSRLEEFDVFSPKQDLVPGSPDDSLPKDGPSPGGTLMDLSERQEVSSVRSLSSTG
::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RDSKRWSRLEEFDVFSPKQDLVPGSPDDSHPKDGPSPGGTLMDLSERQEVSSVRSLSSTG
40 50 60 70 80 90
610 620 630 640 650 660
pF1KSD SLPSHAPPSEDAATPRTNSVISVCSSSNLAGNDDSFGSLPSPKELSSFSFSMKGHEKTAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SLPSHAPPSEDAATPRTNSVISVCSSSNLAGNDDSFGSLPSPKELSSFSFSMKGHEKTAK
100 110 120 130 140 150
670 680 690 700 710 720
pF1KSD SKTRSLLKRMESLKLKSSHHSKHKAPSKLGLIISGPILQEGMDEEKLKQLNCVEISALNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SKTRSLLKRMESLKLKSSHHSKHKAPSKLGLIISGPILQEGMDEEKLKQLNCVEISALNG
160 170 180 190 200 210
730 740 750 760 770 780
pF1KSD NRINVPMVRKRSVSNSTQTSSSSSQSETSSAVSTPSPVTRTRSLSACNKRVGMYLEGFDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NRINVPMVRKRSVSNSTQTSSSSSQSETSSAVSTPSPVTRTRSLSACNKRVGMYLEGFDP
220 230 240 250 260 270
790 800 810 820 830 840
pF1KSD FNQSTFNNVMEQNFKNRESYPEDTVFYIPEDHKPGTFPKALTNGSFSPSGNNGSVNWRTG
:::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FNQSTFNNVVEQNFKNRESYPEDTVFYIPEDHKPGTFPKALTNGSFSPSGNNGSVNWRTG
280 290 300 310 320 330
850 860 870 880 890 900
pF1KSD SFHGPGHISLRRENSSDSPKELKRRNSSSSMSSRLSIYDNVPGSILYSSSGDLADLENED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SFHGPGHISLRRENSSDSPKELKRRNSSSSMSSRLSIYDNVPGSILYSSSGDLADLENED
340 350 360 370 380 390
910 920 930 940 950 960
pF1KSD IFPELDDILYHVKGMQRIVNQWSEKFSDEGDSDSALDSVSPCPSSPKQIHLDVDNDRTTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IFPELDDILYHVKGMQRIVNQWSEKFSDEGDSDSALDSVSPCPSSPKQIHLDVDNDRTTP
400 410 420 430 440 450
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD SDLDSTGNSLNEPEEPSEIPERRDSGVGASLTRSNRHRLRWHSFQSSHRPSLNSVSLQIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SDLDSTGNSLNEPEEPSEIPERRDSGVGASLTRSNRHRLRWHSFQSSHRPSLNSVSLQIN
460 470 480 490 500 510
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD CQSVAQMNLLQKYSLLKLTALLEKYTPSNKHGFSWAVPKFMKRIKVPDYKDRSVFGVPLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CQSVAQMNLLQKYSLLKLTALLEKYTPSNKHGFSWAVPKFMKRIKVPDYKDRSVFGVPLT
520 530 540 550 560 570
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD VNVQRTGQPLPQSIQQAMRYLRNHCLDQVGLFRKSGVKSRIQALRQMNEGAIDCVNYEGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VNVQRTGQPLPQSIQQAMRYLRNHCLDQVGLFRKSGVKSRIQALRQMNEGAIDCVNYEGQ
580 590 600 610 620 630
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD SAYDVADMLKQYFRDLPEPLMTNKLSETFLQIYQYVPKDQRLQAIKAAIMLLPDENREVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SAYDVADMLKQYFRDLPEPLMTNKLSETFLQIYQYVPKDQRLQAIKAAIMLLPDENREVL
640 650 660 670 680 690
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD QTLLYFLSDVTAAVKENQMTPTNLAVCLAPSLFHLNTLKRENSSPRVMQRKQSLGKPDQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QTLLYFLSDVTAAVKENQMTPTNLAVCLAPSLFHLNTLKRENSSPRVMQRKQSLGKPDQK
700 710 720 730 740 750
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD DLNENLAATQGLAHMIAECKKLFQVPEEMSRCRNSYTEQELKPLTLEALGHLGNDDSADY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DLNENLAATQGLAHMIAECKKLFQVPEEMSRCRNSYTEQELKPLTLEALGHLGNDDSADY
760 770 780 790 800 810
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD QHFLQDCVDGLFKEVKEKFKGWVSYSTSEQAELSYKKVSEGPPLRLWRSVIEVPAVPEEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QHFLQDCVDGLFKEVKEKFKGWVSYSTSEQAELSYKKVSEGPPLRLWRSVIEVPAVPEEI
820 830 840 850 860 870
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KSD LKRLLKEQHLWDVDLLDSKVIEILDSQTEIYQYVQNSMAPHPARDYVVLRTWRTNLPKGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LKRLLKEQHLWDVDLLDSKVIEILDSQTEIYQYVQNSMAPHPARDYVVLRTWRTNLPKGA
880 890 900 910 920 930
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KSD CALLLTSVDHDRAPVVGVRVNVLLSRYLIEPCGPGKSKLTYMCRVDLRGHMPEWYTKSFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CALLLTSVDHDRAPVVGVRVNVLLSRYLIEPCGPGKSKLTYMCRVDLRGHMPEWYTKSFG
940 950 960 970 980 990
1510 1520
pF1KSD HLCAAEVVKIRDSFSNQNTETKDTKSR
:::::::::::::::::::::::::::
XP_016 HLCAAEVVKIRDSFSNQNTETKDTKSR
1000 1010
>>NP_443083 (OMIM: 609866) stAR-related lipid transfer p (995 aa)
initn: 3244 init1: 1828 opt: 3238 Z-score: 2618.7 bits: 496.7 E(85289): 4e-139
Smith-Waterman score: 3453; 54.2% identity (78.5% similar) in 1031 aa overlap (512-1526:1-994)
490 500 510 520 530 540
pF1KSD SLVKREHDFLDRDAIEALCRRLNTLNKCAVMKLEISPHRKRSDDSDEDEPCAISGKWTFQ
:::... .::..:::::.. : ::.:::::
NP_443 MKLDVNFQRKKGDDSDEEDLC-ISNKWTFQ
10 20
550 560 570 580 590 600
pF1KSD RDSKRWSRLEEFDVFSPKQDLVPGSPDDSLPKDGPSPGGTLMDLSERQEVSSVRSLSSTG
: :.::::.... .. :. : ::: . .. : ..: :::: :: :..: :: :
NP_443 RTSRRWSRVDDLYTLLPRGDR-NGSPGGTGMRNTTSSESVLTDLSE-PEVCSIHSESSGG
30 40 50 60 70 80
610 620 630 640 650
pF1KSD SLPSHAPPSEDAATPRTNSVISVCSSSNLAGNDDSF--GSLPSP-KELSSFSFSMKGHEK
: :.. :.. : ..: . : . .:::.: ... . : : .::
NP_443 S-DSRSQPGQ-------------CCTDNPVMLDAPLVSSSLPQPPRDVLNHPFHPK-NEK
90 100 110 120 130
660 670 680 690 700 710
pF1KSD TAKSKTRSLLKRMESLKLKSSHHSKHKAPSKLG-LIISGPILQEGMDEEKLKQLNCVEIS
......:.:::::.:. :..: ..::. .. : :.::::.::. . :..: ..:..:
NP_443 PTRARAKSFLKRMETLRGKGAH-GRHKGSGRTGGLVISGPMLQQ--EPESFKAMQCIQIP
140 150 160 170 180
720 730 740 750 760 770
pF1KSD ALNGNRINVPM-VRKRSVSNSTQTSSSSSQSE-TSSAVSTPSPVTRTRSLSACNKRVGMY
::. : : . .... : ..:. :: :: .::.:::: . :. ::: :::
NP_443 --NGDLQNSPPPACRKGLPCSGKSSGESSPSEHSSSGVSTP--CLKERKCHEANKRGGMY
190 200 210 220 230 240
780 790 800 810 820 830
pF1KSD LEGFDPFNQSTFNNVMEQNFKNRESYPEDTVFYIPEDHKPGTFPKALTNGSFSPSGNNGS
:: .: . ... .. .:. .. :. : .::.:::::::::::. :.::. ....
NP_443 LEDLDVLAGTALPDAGDQSRMHEFHSQENLVVHIPKDHKPGTFPKALSIESLSPTDSSNG
250 260 270 280 290 300
840 850 860 870 880 890
pF1KSD VNWRTGSFHGPGHISLRRENSSDSPKELKRRNSSSSMSSRLSIYDNVPGSILYSSSGDLA
::::::: ::: ::. . .: : .: .::.::::::::: ::.:.:::
NP_443 VNWRTGS------ISLGREQVPGA-RE-PRLMASCHRASRVSIYDNVPGSHLYASTGDLL
310 320 330 340 350
900 910 920 930 940 950
pF1KSD DLENEDIFPELDDILYHVKGMQRIVNQWSEKFSDEGDSDSAL---DSVSPCPSSPKQIHL
:::..:.::.::::: ::.:.:..:..::. : .. ..: ..: :: :.:: :
NP_443 DLEKDDLFPHLDDILQHVNGLQEVVDDWSKDVLPELQTHDTLVGEPGLSTFPS-PNQITL
360 370 380 390 400 410
960 970 980 990 1000
pF1KSD D-----VDNDRTTPSDLDSTGNSLNEPEEPSEIPERRDSGVGASLTRSNRHRLRWHSFQS
: :.. ::::::.. .:::: : :. . .:::::::::::: :: ::::.:::
NP_443 DFEGNSVSEGRTTPSDVERDVTSLNESEPPG-VRDRRDSGVGASLTRPNR-RLRWNSFQL
420 430 440 450 460 470
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KSD SHRPSLNSVSLQINCQSVAQMNLLQKYSLLKLTALLEKYTPSNKHGFSWAVPKFMKRIKV
::.: .: .:. :...:..:::..:::.:::..::.. :::::..:.:::::::.::
NP_443 SHQPRPAPASPHISSQTASQLSLLQRFSLLRLTAIMEKHSMSNKHGWTWSVPKFMKRMKV
480 490 500 510 520 530
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KSD PDYKDRSVFGVPLTVNVQRTGQPLPQSIQQAMRYLRNHCLDQVGLFRKSGVKSRIQALRQ
:::::..:::::: :.:::::::::::::::.::::..:::::::::::::::::.::::
NP_443 PDYKDKAVFGVPLIVHVQRTGQPLPQSIQQALRYLRSNCLDQVGLFRKSGVKSRIHALRQ
540 550 560 570 580 590
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KSD MNEGAIDCVNYEGQSAYDVADMLKQYFRDLPEPLMTNKLSETFLQIYQYVPKDQRLQAIK
:::. . :::: :::::::::.::.::::::::.:::::::::.::::: :.:::::..
NP_443 MNENFPENVNYEDQSAYDVADMVKQFFRDLPEPLFTNKLSETFLHIYQYVSKEQRLQAVQ
600 610 620 630 640 650
1190 1200 1210 1220 1230 1240
pF1KSD AAIMLLPDENREVLQTLLYFLSDVTAAVKENQMTPTNLAVCLAPSLFHLNTLKRENSSPR
:::.:: ::::::::::: ::.::. :.:::::: :::::::::::::: ::.: ::::
NP_443 AAILLLADENREVLQTLLCFLNDVVNLVEENQMTPMNLAVCLAPSLFHLNLLKKE-SSPR
660 670 680 690 700 710
1250 1260 1270 1280 1290 1300
pF1KSD VMQRKQSLGKPDQKDLNENLAATQGLAHMIAECKKLFQVPEEM-SRCRNSYTEQELKPLT
:.:.: . ::::::::::::::.::::::: :: .::.::.:. .. ::::.: :.. :
NP_443 VIQKKYATGKPDQKDLNENLAAAQGLAHMIMECDRLFEVPHELVAQSRNSYVEAEIHVPT
720 730 740 750 760 770
1310 1320 1330 1340 1350 1360
pF1KSD LEALGHLGNDDSADYQHFLQDCVDGLFKEVKEKFKGWVSYSTSEQAELSYKKVSEGPPLR
:: :: ....: .. .:. ..:: ::.::::::::. :......:..:::..: ::.
NP_443 LEELGTQLEESGATFHTYLNHLIQGLQKEAKEKFKGWVTCSSTDNTDLAFKKVGDGNPLK
780 790 800 810 820 830
1370 1380 1390 1400 1410 1420
pF1KSD LWRSVIEVPAVPEEILKRLLKEQHLWDVDLLDSKVIEILDSQTEIYQYVQNSMAPHPARD
::.. .:: : : .:.:.:.:.:::: :... ::.: :: :::::::: :::::::.::
NP_443 LWKASVEVEAPPSVVLNRVLRERHLWDEDFVQWKVVETLDRQTEIYQYVLNSMAPHPSRD
840 850 860 870 880 890
1430 1440 1450 1460 1470 1480
pF1KSD YVVLRTWRTNLPKGACALLLTSVDHDRAPVVG-VRVNVLLSRYLIEPCGPGKSKLTYMCR
.::::::.:.:::: :.:. ::.:..: ..: ::. :. :.::::::: :::.::..::
NP_443 FVVLRTWKTDLPKGMCTLVSLSVEHEEAQLLGGVRAVVMDSQYLIEPCGSGKSRLTHICR
900 910 920 930 940 950
1490 1500 1510 1520
pF1KSD VDLRGHMPEWYTKSFGHLCAAEVVKIRDSFSNQNTETKDTKSR
.::.:: ::::.:.:::::::::..::.::. .: .::
NP_443 IDLKGHSPEWYSKGFGHLCAAEVARIRNSFQPLIAEGPETKI
960 970 980 990
>>XP_011533601 (OMIM: 609866) PREDICTED: stAR-related li (1078 aa)
initn: 3632 init1: 1828 opt: 3238 Z-score: 2618.2 bits: 496.7 E(85289): 4.3e-139
Smith-Waterman score: 3841; 55.2% identity (78.9% similar) in 1113 aa overlap (430-1526:2-1077)
400 410 420 430 440 450
pF1KSD GADTISVNQTRVNLSSDTESTDLPSSTPVANSGTKPKTTAIQGISEKEKAEIEAKEACDW
..::.::: ... ::..::::::::::
XP_011 MSTGTQPKTKVLSDNRPKERVEIEAKEACDW
10 20 30
460 470 480 490 500 510
pF1KSD LRATGFPQYAQLYEDFLFPIDISLVKREHDFLDRDAIEALCRRLNTLNKCAVMKLEISPH
:::.::::::::::: :::.: :: .::::..: .: :::::::::::: :::... .
XP_011 LRAAGFPQYAQLYEDSQFPINIVAVKNDHDFLEKDLVEPLCRRLNTLNKCASMKLDVNFQ
40 50 60 70 80 90
520 530 540 550 560 570
pF1KSD RKRSDDSDEDEPCAISGKWTFQRDSKRWSRLEEFDVFSPKQDLVPGSPDDSLPKDGPSPG
::..:::::.. : ::.:::::: :.::::.... .. :. : ::: . .. :
XP_011 RKKGDDSDEEDLC-ISNKWTFQRTSRRWSRVDDLYTLLPRGDR-NGSPGGTGMRNTTSSE
100 110 120 130 140
580 590 600 610 620 630
pF1KSD GTLMDLSERQEVSSVRSLSSTGSLPSHAPPSEDAATPRTNSVISVCSSSNLAGNDDSF--
..: :::: :: :..: :: :: :.. :.. : ..: . : .
XP_011 SVLTDLSE-PEVCSIHSESSGGS-DSRSQPGQ-------------CCTDNPVMLDAPLVS
150 160 170 180 190
640 650 660 670 680 690
pF1KSD GSLPSP-KELSSFSFSMKGHEKTAKSKTRSLLKRMESLKLKSSHHSKHKAPSKLG-LIIS
.:::.: ... . : : .:: ......:.:::::.:. :..: ..::. .. : :.::
XP_011 SSLPQPPRDVLNHPFHPK-NEKPTRARAKSFLKRMETLRGKGAH-GRHKGSGRTGGLVIS
200 210 220 230 240 250
700 710 720 730 740 750
pF1KSD GPILQEGMDEEKLKQLNCVEISALNGNRINVPM-VRKRSVSNSTQTSSSSSQSE-TSSAV
::.::. . :..: ..:..: ::. : : . .... : ..:. :: :: .::.:
XP_011 GPMLQQ--EPESFKAMQCIQIP--NGDLQNSPPPACRKGLPCSGKSSGESSPSEHSSSGV
260 270 280 290 300
760 770 780 790 800 810
pF1KSD STPSPVTRTRSLSACNKRVGMYLEGFDPFNQSTFNNVMEQNFKNRESYPEDTVFYIPEDH
::: . :. ::: ::::: .: . ... .. .:. .. :. : .::.::
XP_011 STP--CLKERKCHEANKRGGMYLEDLDVLAGTALPDAGDQSRMHEFHSQENLVVHIPKDH
310 320 330 340 350 360
820 830 840 850 860 870
pF1KSD KPGTFPKALTNGSFSPSGNNGSVNWRTGSFHGPGHISLRRENSSDSPKELKRRNSSSSMS
:::::::::. :.::. ....::::::: ::: ::. . .: : .: .
XP_011 KPGTFPKALSIESLSPTDSSNGVNWRTGS------ISLGREQVPGA-RE-PRLMASCHRA
370 380 390 400 410
880 890 900 910 920 930
pF1KSD SRLSIYDNVPGSILYSSSGDLADLENEDIFPELDDILYHVKGMQRIVNQWSEKFSDEGDS
::.::::::::: ::.:.::: :::..:.::.::::: ::.:.:..:..::. : ..
XP_011 SRVSIYDNVPGSHLYASTGDLLDLEKDDLFPHLDDILQHVNGLQEVVDDWSKDVLPELQT
420 430 440 450 460 470
940 950 960 970 980
pF1KSD DSAL---DSVSPCPSSPKQIHLD-----VDNDRTTPSDLDSTGNSLNEPEEPSEIPERRD
..: ..: :: :.:: :: :.. ::::::.. .:::: : :. . .:::
XP_011 HDTLVGEPGLSTFPS-PNQITLDFEGNSVSEGRTTPSDVERDVTSLNESEPPG-VRDRRD
480 490 500 510 520 530
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KSD SGVGASLTRSNRHRLRWHSFQSSHRPSLNSVSLQINCQSVAQMNLLQKYSLLKLTALLEK
::::::::: :: ::::.::: ::.: .: .:. :...:..:::..:::.:::..::
XP_011 SGVGASLTRPNR-RLRWNSFQLSHQPRPAPASPHISSQTASQLSLLQRFSLLRLTAIMEK
540 550 560 570 580 590
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KSD YTPSNKHGFSWAVPKFMKRIKVPDYKDRSVFGVPLTVNVQRTGQPLPQSIQQAMRYLRNH
.. :::::..:.:::::::.:::::::..:::::: :.:::::::::::::::.::::..
XP_011 HSMSNKHGWTWSVPKFMKRMKVPDYKDKAVFGVPLIVHVQRTGQPLPQSIQQALRYLRSN
600 610 620 630 640 650
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KSD CLDQVGLFRKSGVKSRIQALRQMNEGAIDCVNYEGQSAYDVADMLKQYFRDLPEPLMTNK
:::::::::::::::::.:::::::. . :::: :::::::::.::.::::::::.:::
XP_011 CLDQVGLFRKSGVKSRIHALRQMNENFPENVNYEDQSAYDVADMVKQFFRDLPEPLFTNK
660 670 680 690 700 710
1170 1180 1190 1200 1210 1220
pF1KSD LSETFLQIYQYVPKDQRLQAIKAAIMLLPDENREVLQTLLYFLSDVTAAVKENQMTPTNL
::::::.::::: :.:::::..:::.:: ::::::::::: ::.::. :.:::::: ::
XP_011 LSETFLHIYQYVSKEQRLQAVQAAILLLADENREVLQTLLCFLNDVVNLVEENQMTPMNL
720 730 740 750 760 770
1230 1240 1250 1260 1270 1280
pF1KSD AVCLAPSLFHLNTLKRENSSPRVMQRKQSLGKPDQKDLNENLAATQGLAHMIAECKKLFQ
:::::::::::: ::.: :::::.:.: . ::::::::::::::.::::::: :: .::.
XP_011 AVCLAPSLFHLNLLKKE-SSPRVIQKKYATGKPDQKDLNENLAAAQGLAHMIMECDRLFE
780 790 800 810 820 830
1290 1300 1310 1320 1330 1340
pF1KSD VPEEM-SRCRNSYTEQELKPLTLEALGHLGNDDSADYQHFLQDCVDGLFKEVKEKFKGWV
::.:. .. ::::.: :.. ::: :: ....: .. .:. ..:: ::.::::::::
XP_011 VPHELVAQSRNSYVEAEIHVPTLEELGTQLEESGATFHTYLNHLIQGLQKEAKEKFKGWV
840 850 860 870 880 890
1350 1360 1370 1380 1390 1400
pF1KSD SYSTSEQAELSYKKVSEGPPLRLWRSVIEVPAVPEEILKRLLKEQHLWDVDLLDSKVIEI
. :......:..:::..: ::.::.. .:: : : .:.:.:.:.:::: :... ::.:
XP_011 TCSSTDNTDLAFKKVGDGNPLKLWKASVEVEAPPSVVLNRVLRERHLWDEDFVQWKVVET
900 910 920 930 940 950
1410 1420 1430 1440 1450 1460
pF1KSD LDSQTEIYQYVQNSMAPHPARDYVVLRTWRTNLPKGACALLLTSVDHDRAPVVG-VRVNV
:: :::::::: :::::::.::.::::::.:.:::: :.:. ::.:..: ..: ::. :
XP_011 LDRQTEIYQYVLNSMAPHPSRDFVVLRTWKTDLPKGMCTLVSLSVEHEEAQLLGGVRAVV
960 970 980 990 1000 1010
1470 1480 1490 1500 1510 1520
pF1KSD LLSRYLIEPCGPGKSKLTYMCRVDLRGHMPEWYTKSFGHLCAAEVVKIRDSFSNQNTETK
. :.::::::: :::.::..::.::.:: ::::.:.:::::::::..::.::. .:
XP_011 MDSQYLIEPCGSGKSRLTHICRIDLKGHSPEWYSKGFGHLCAAEVARIRNSFQPLIAEGP
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KSD DTKSR
.::
XP_011 ETKI
>>XP_016876324 (OMIM: 609866) PREDICTED: stAR-related li (1078 aa)
initn: 3632 init1: 1828 opt: 3238 Z-score: 2618.2 bits: 496.7 E(85289): 4.3e-139
Smith-Waterman score: 3841; 55.2% identity (78.9% similar) in 1113 aa overlap (430-1526:2-1077)
400 410 420 430 440 450
pF1KSD GADTISVNQTRVNLSSDTESTDLPSSTPVANSGTKPKTTAIQGISEKEKAEIEAKEACDW
..::.::: ... ::..::::::::::
XP_016 MSTGTQPKTKVLSDNRPKERVEIEAKEACDW
10 20 30
460 470 480 490 500 510
pF1KSD LRATGFPQYAQLYEDFLFPIDISLVKREHDFLDRDAIEALCRRLNTLNKCAVMKLEISPH
:::.::::::::::: :::.: :: .::::..: .: :::::::::::: :::... .
XP_016 LRAAGFPQYAQLYEDSQFPINIVAVKNDHDFLEKDLVEPLCRRLNTLNKCASMKLDVNFQ
40 50 60 70 80 90
520 530 540 550 560 570
pF1KSD RKRSDDSDEDEPCAISGKWTFQRDSKRWSRLEEFDVFSPKQDLVPGSPDDSLPKDGPSPG
::..:::::.. : ::.:::::: :.::::.... .. :. : ::: . .. :
XP_016 RKKGDDSDEEDLC-ISNKWTFQRTSRRWSRVDDLYTLLPRGDR-NGSPGGTGMRNTTSSE
100 110 120 130 140
580 590 600 610 620 630
pF1KSD GTLMDLSERQEVSSVRSLSSTGSLPSHAPPSEDAATPRTNSVISVCSSSNLAGNDDSF--
..: :::: :: :..: :: :: :.. :.. : ..: . : .
XP_016 SVLTDLSE-PEVCSIHSESSGGS-DSRSQPGQ-------------CCTDNPVMLDAPLVS
150 160 170 180 190
640 650 660 670 680 690
pF1KSD GSLPSP-KELSSFSFSMKGHEKTAKSKTRSLLKRMESLKLKSSHHSKHKAPSKLG-LIIS
.:::.: ... . : : .:: ......:.:::::.:. :..: ..::. .. : :.::
XP_016 SSLPQPPRDVLNHPFHPK-NEKPTRARAKSFLKRMETLRGKGAH-GRHKGSGRTGGLVIS
200 210 220 230 240 250
700 710 720 730 740 750
pF1KSD GPILQEGMDEEKLKQLNCVEISALNGNRINVPM-VRKRSVSNSTQTSSSSSQSE-TSSAV
::.::. . :..: ..:..: ::. : : . .... : ..:. :: :: .::.:
XP_016 GPMLQQ--EPESFKAMQCIQIP--NGDLQNSPPPACRKGLPCSGKSSGESSPSEHSSSGV
260 270 280 290 300
760 770 780 790 800 810
pF1KSD STPSPVTRTRSLSACNKRVGMYLEGFDPFNQSTFNNVMEQNFKNRESYPEDTVFYIPEDH
::: . :. ::: ::::: .: . ... .. .:. .. :. : .::.::
XP_016 STP--CLKERKCHEANKRGGMYLEDLDVLAGTALPDAGDQSRMHEFHSQENLVVHIPKDH
310 320 330 340 350 360
820 830 840 850 860 870
pF1KSD KPGTFPKALTNGSFSPSGNNGSVNWRTGSFHGPGHISLRRENSSDSPKELKRRNSSSSMS
:::::::::. :.::. ....::::::: ::: ::. . .: : .: .
XP_016 KPGTFPKALSIESLSPTDSSNGVNWRTGS------ISLGREQVPGA-RE-PRLMASCHRA
370 380 390 400 410
880 890 900 910 920 930
pF1KSD SRLSIYDNVPGSILYSSSGDLADLENEDIFPELDDILYHVKGMQRIVNQWSEKFSDEGDS
::.::::::::: ::.:.::: :::..:.::.::::: ::.:.:..:..::. : ..
XP_016 SRVSIYDNVPGSHLYASTGDLLDLEKDDLFPHLDDILQHVNGLQEVVDDWSKDVLPELQT
420 430 440 450 460 470
940 950 960 970 980
pF1KSD DSAL---DSVSPCPSSPKQIHLD-----VDNDRTTPSDLDSTGNSLNEPEEPSEIPERRD
..: ..: :: :.:: :: :.. ::::::.. .:::: : :. . .:::
XP_016 HDTLVGEPGLSTFPS-PNQITLDFEGNSVSEGRTTPSDVERDVTSLNESEPPG-VRDRRD
480 490 500 510 520 530
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KSD SGVGASLTRSNRHRLRWHSFQSSHRPSLNSVSLQINCQSVAQMNLLQKYSLLKLTALLEK
::::::::: :: ::::.::: ::.: .: .:. :...:..:::..:::.:::..::
XP_016 SGVGASLTRPNR-RLRWNSFQLSHQPRPAPASPHISSQTASQLSLLQRFSLLRLTAIMEK
540 550 560 570 580 590
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KSD YTPSNKHGFSWAVPKFMKRIKVPDYKDRSVFGVPLTVNVQRTGQPLPQSIQQAMRYLRNH
.. :::::..:.:::::::.:::::::..:::::: :.:::::::::::::::.::::..
XP_016 HSMSNKHGWTWSVPKFMKRMKVPDYKDKAVFGVPLIVHVQRTGQPLPQSIQQALRYLRSN
600 610 620 630 640 650
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KSD CLDQVGLFRKSGVKSRIQALRQMNEGAIDCVNYEGQSAYDVADMLKQYFRDLPEPLMTNK
:::::::::::::::::.:::::::. . :::: :::::::::.::.::::::::.:::
XP_016 CLDQVGLFRKSGVKSRIHALRQMNENFPENVNYEDQSAYDVADMVKQFFRDLPEPLFTNK
660 670 680 690 700 710
1170 1180 1190 1200 1210 1220
pF1KSD LSETFLQIYQYVPKDQRLQAIKAAIMLLPDENREVLQTLLYFLSDVTAAVKENQMTPTNL
::::::.::::: :.:::::..:::.:: ::::::::::: ::.::. :.:::::: ::
XP_016 LSETFLHIYQYVSKEQRLQAVQAAILLLADENREVLQTLLCFLNDVVNLVEENQMTPMNL
720 730 740 750 760 770
1230 1240 1250 1260 1270 1280
pF1KSD AVCLAPSLFHLNTLKRENSSPRVMQRKQSLGKPDQKDLNENLAATQGLAHMIAECKKLFQ
:::::::::::: ::.: :::::.:.: . ::::::::::::::.::::::: :: .::.
XP_016 AVCLAPSLFHLNLLKKE-SSPRVIQKKYATGKPDQKDLNENLAAAQGLAHMIMECDRLFE
780 790 800 810 820 830
1290 1300 1310 1320 1330 1340
pF1KSD VPEEM-SRCRNSYTEQELKPLTLEALGHLGNDDSADYQHFLQDCVDGLFKEVKEKFKGWV
::.:. .. ::::.: :.. ::: :: ....: .. .:. ..:: ::.::::::::
XP_016 VPHELVAQSRNSYVEAEIHVPTLEELGTQLEESGATFHTYLNHLIQGLQKEAKEKFKGWV
840 850 860 870 880 890
1350 1360 1370 1380 1390 1400
pF1KSD SYSTSEQAELSYKKVSEGPPLRLWRSVIEVPAVPEEILKRLLKEQHLWDVDLLDSKVIEI
. :......:..:::..: ::.::.. .:: : : .:.:.:.:.:::: :... ::.:
XP_016 TCSSTDNTDLAFKKVGDGNPLKLWKASVEVEAPPSVVLNRVLRERHLWDEDFVQWKVVET
900 910 920 930 940 950
1410 1420 1430 1440 1450 1460
pF1KSD LDSQTEIYQYVQNSMAPHPARDYVVLRTWRTNLPKGACALLLTSVDHDRAPVVG-VRVNV
:: :::::::: :::::::.::.::::::.:.:::: :.:. ::.:..: ..: ::. :
XP_016 LDRQTEIYQYVLNSMAPHPSRDFVVLRTWKTDLPKGMCTLVSLSVEHEEAQLLGGVRAVV
960 970 980 990 1000 1010
1470 1480 1490 1500 1510 1520
pF1KSD LLSRYLIEPCGPGKSKLTYMCRVDLRGHMPEWYTKSFGHLCAAEVVKIRDSFSNQNTETK
. :.::::::: :::.::..::.::.:: ::::.:.:::::::::..::.::. .:
XP_016 MDSQYLIEPCGSGKSRLTHICRIDLKGHSPEWYSKGFGHLCAAEVARIRNSFQPLIAEGP
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KSD DTKSR
.::
XP_016 ETKI
1528 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 07:07:20 2016 done: Thu Nov 3 07:07:22 2016
Total Scan time: 19.100 Total Display time: 0.440
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]