Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA1722
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1722, 1499 aa
1>>>pF1KSDA1722 1499 - 1499 aa - 1499 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.0529+/-0.00118; mu= 7.8591+/- 0.072
mean_var=212.5148+/-41.138, 0's: 0 Z-trim(110.4): 119 B-trim: 6 in 1/51
Lambda= 0.087979
statistics sampled from 11431 (11549) to 11431 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.674), E-opt: 0.2 (0.355), width: 16
Scan time: 5.350
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS46127.1 ARHGAP35 gene_id:2909|Hs108|chr19 (1499) 9953 1277.3 0
CCDS45095.1 ARHGAP5 gene_id:394|Hs108|chr14 (1501) 4021 524.4 1e-147
CCDS32062.1 ARHGAP5 gene_id:394|Hs108|chr14 (1502) 4021 524.4 1e-147
CCDS11498.1 ARHGAP27 gene_id:201176|Hs108|chr17 ( 548) 476 74.1 1.3e-12
CCDS74082.1 ARHGAP27 gene_id:201176|Hs108|chr17 ( 889) 476 74.3 1.9e-12
CCDS56147.1 CHN1 gene_id:1123|Hs108|chr2 ( 334) 438 69.2 2.4e-11
CCDS46454.1 CHN1 gene_id:1123|Hs108|chr2 ( 433) 438 69.3 3e-11
CCDS46455.1 CHN1 gene_id:1123|Hs108|chr2 ( 459) 438 69.3 3.1e-11
CCDS47566.1 CHN2 gene_id:1124|Hs108|chr7 ( 332) 427 67.8 6.4e-11
CCDS5420.1 CHN2 gene_id:1124|Hs108|chr7 ( 468) 427 67.9 8.4e-11
>>CCDS46127.1 ARHGAP35 gene_id:2909|Hs108|chr19 (1499 aa)
initn: 9953 init1: 9953 opt: 9953 Z-score: 6834.7 bits: 1277.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 9953; 100.0% identity (100.0% similar) in 1499 aa overlap (1-1499:1-1499)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MMMARKQDVRIPTYNISVVGLSGTEKEKGQCGIGKSCLCNRFVRPSADEFHLDHTSVLST
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CCDS46 MMMARKQDVRIPTYNISVVGLSGTEKEKGQCGIGKSCLCNRFVRPSADEFHLDHTSVLST
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD SDFGGRVVNNDHFLYWGEVSRSLEDCVECKMHIVEQTEFIDDQTFQPHRSTALQPYIKRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SDFGGRVVNNDHFLYWGEVSRSLEDCVECKMHIVEQTEFIDDQTFQPHRSTALQPYIKRA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD AATKLASAEKLMYFCTDQLGLEQDFEQKQMPDGKLLVDGFLLGIDVSRGMNRNFDDQLKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 AATKLASAEKLMYFCTDQLGLEQDFEQKQMPDGKLLVDGFLLGIDVSRGMNRNFDDQLKF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD VSNLYNQLAKTKKPIVVVLTKCDEGVERYIRDAHTFALSKKNLQVVETSARSNVNVDLAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VSNLYNQLAKTKKPIVVVLTKCDEGVERYIRDAHTFALSKKNLQVVETSARSNVNVDLAF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD STLVQLIDKSRGKTKIIPYFEALKQQSQQIATAKDKYEWLVSRIVKNHNENWLSVSRKMQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 STLVQLIDKSRGKTKIIPYFEALKQQSQQIATAKDKYEWLVSRIVKNHNENWLSVSRKMQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD ASPEYQDYVYLEGTQKAKKLFLQHIHRLKHEHIERRRKLYLAALPLAFEALIPNLDEIDH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ASPEYQDYVYLEGTQKAKKLFLQHIHRLKHEHIERRRKLYLAALPLAFEALIPNLDEIDH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD LSCIKAKKLLETKPEFLKWFVVLEETPWDATSHIDNMENERIPFDLMDTVPAEQLYEAHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LSCIKAKKLLETKPEFLKWFVVLEETPWDATSHIDNMENERIPFDLMDTVPAEQLYEAHL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD EKLRNERKRVEMRRAFKENLETSPFITPGKPWEEARSFIMNEDFYQWLEESVYMDIYGKH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EKLRNERKRVEMRRAFKENLETSPFITPGKPWEEARSFIMNEDFYQWLEESVYMDIYGKH
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD QKQIIDKAKEEFQELLLEYSELFYELELDAKPSKEKMGVIQDVLGEEQRFKALQKLQAER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QKQIIDKAKEEFQELLLEYSELFYELELDAKPSKEKMGVIQDVLGEEQRFKALQKLQAER
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD DALILKHIHFVYHPTKETCPSCPACVDAKIEHLISSRFIRPSDRNQKNSLSDPNIDRINL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DALILKHIHFVYHPTKETCPSCPACVDAKIEHLISSRFIRPSDRNQKNSLSDPNIDRINL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD VILGKDGLARELANEIRALCTNDDKYVIDGKMYELSLRPIEGNVRLPVNSFQTPTFQPHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VILGKDGLARELANEIRALCTNDDKYVIDGKMYELSLRPIEGNVRLPVNSFQTPTFQPHG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD CLCLYNSKESLSYVVESIEKSRESTLGRRDNHLVHLPLTLILVNKRGDTSGETLHSLIQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 CLCLYNSKESLSYVVESIEKSRESTLGRRDNHLVHLPLTLILVNKRGDTSGETLHSLIQQ
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD GQQIASKLQCVFLDPASAGIGYGRNINEKQISQVLKGLLDSKRNLNLVSSTASIKDLADV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GQQIASKLQCVFLDPASAGIGYGRNINEKQISQVLKGLLDSKRNLNLVSSTASIKDLADV
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD DLRIVMCLMCGDPFSADDILFPVLQSQTCKSSHCGSNNSVLLELPIGLHKKRIELSVLSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DLRIVMCLMCGDPFSADDILFPVLQSQTCKSSHCGSNNSVLLELPIGLHKKRIELSVLSY
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD HSSFSIRKSRLVHGYIVFYSAKRKASLAMLRAFLCEVQDIIPIQLVALTDGAVDVLDNDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 HSSFSIRKSRLVHGYIVFYSAKRKASLAMLRAFLCEVQDIIPIQLVALTDGAVDVLDNDL
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD SREQLTEGEEIAQEIDGRFTSIPCSQPQHKLEIFHPFFKDVVEKKNIIEATHMYDNAAEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SREQLTEGEEIAQEIDGRFTSIPCSQPQHKLEIFHPFFKDVVEKKNIIEATHMYDNAAEA
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD CSTTEEVFNSPRAGSPLCNSNLQDSEEDIEPSYSLFREDTSLPSLSKDHSKLSMELEGND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 CSTTEEVFNSPRAGSPLCNSNLQDSEEDIEPSYSLFREDTSLPSLSKDHSKLSMELEGND
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD GLSFIMSNFESKLNNKVPPPVKPKPPVHFEITKGDLSYLDQGHRDGQRKSVSSSPWLPQD
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CCDS46 GLSFIMSNFESKLNNKVPPPVKPKPPVHFEITKGDLSYLDQGHRDGQRKSVSSSPWLPQD
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD GFDPSDYAEPMDAVVKPRNEEENIYSVPHDSTQGKIITIRNINKAQSNGSGNGSDSEMDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GFDPSDYAEPMDAVVKPRNEEENIYSVPHDSTQGKIITIRNINKAQSNGSGNGSDSEMDT
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD SSLERGRKVSIVSKPVLYRTRCTRLGRFASYRTSFSVGSDDELGPIRKKEEDQASQGYKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SSLERGRKVSIVSKPVLYRTRCTRLGRFASYRTSFSVGSDDELGPIRKKEEDQASQGYKG
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD DNAVIPYETDEDPRRRNILRSLRRNTKKPKPKPRPSITKATWESNYFGVPLTTVVTPEKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DNAVIPYETDEDPRRRNILRSLRRNTKKPKPKPRPSITKATWESNYFGVPLTTVVTPEKP
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD IPIFIERCIEYIEATGLSTEGIYRVSGNKSEMESLQRQFDQDHNLDLAEKDFTVNTVAGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 IPIFIERCIEYIEATGLSTEGIYRVSGNKSEMESLQRQFDQDHNLDLAEKDFTVNTVAGA
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD MKSFFSELPDPLVPYNMQIDLVEAHKINDREQKLHALKEVLKKFPKENHEVFKYVISHLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MKSFFSELPDPLVPYNMQIDLVEAHKINDREQKLHALKEVLKKFPKENHEVFKYVISHLN
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KSD KVSHNNKVNLMTSENLSICFWPTLMRPDFSTMDALTATRTYQTIIELFIQQCPFFFYNRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KVSHNNKVNLMTSENLSICFWPTLMRPDFSTMDALTATRTYQTIIELFIQQCPFFFYNRP
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490
pF1KSD ITEPPGARPSSPSAVASTVPFLTSTPVTSQPSPPQSPPPTPQSPMQPLLPSQLQAEHTL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ITEPPGARPSSPSAVASTVPFLTSTPVTSQPSPPQSPPPTPQSPMQPLLPSQLQAEHTL
1450 1460 1470 1480 1490
>>CCDS45095.1 ARHGAP5 gene_id:394|Hs108|chr14 (1501 aa)
initn: 3325 init1: 1368 opt: 4021 Z-score: 2765.6 bits: 524.4 E(32554): 1e-147
Smith-Waterman score: 4987; 50.9% identity (78.3% similar) in 1513 aa overlap (2-1491:1-1495)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MMMARKQDVRIPTYNISVVGLSGTEKEKGQCGIGKSCLCNRFVRPSADEFHLDHTSVLST
:::.... : :.:.::.::::::::.::.::.::::::::::: .:::.. .:::::::
CCDS45 MMAKNKEPRPPSYTISIVGLSGTEKDKGNCGVGKSCLCNRFVRSKADEYYPEHTSVLST
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD SDFGGRVVNNDHFLYWGEVSRSLEDCVECKMHIVEQTEFIDDQTFQPHRSTALQPYIKRA
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CCDS45 IDFGGRVVNNDHFLYWGDIIQNSEDGVECKIHVIEQTEFIDDQTFLPHRSTNLQPYIKRA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KSD AATKLASAEKLMYFCTDQLGLEQDFEQKQMPDGKLLVDGFLLGIDVSRGMNRNFDDQLKF
::.:: :::::::.:::::::::::::::::.::: :::::: ::::.: ::.:::::::
CCDS45 AASKLQSAEKLMYICTDQLGLEQDFEQKQMPEGKLNVDGFLLCIDVSQGCNRKFDDQLKF
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KSD VSNLYNQLAKTKKPIVVVLTKCDEGVERYIRDAHTFALSKKNLQVVETSARSNVNVDLAF
:.::. ::.:.:::.... ::::: :..:.:....:: .:::: ::::::: :::.. :
CCDS45 VNNLFVQLSKSKKPVIIAATKCDECVDHYLREVQAFASNKKNLLVVETSARFNVNIETCF
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KSD STLVQLIDKSRGKTKIIPYFEALKQQSQQIATAKDKYEWLVSRIVKNHNENWLSVSRKMQ
..:::..::.:.: :::::..: : : : ..:: ::.: :: . :.... .: .:: :..
CCDS45 TALVQMLDKTRSKPKIIPYLDAYKTQRQLVVTATDKFEKLV-QTVRDYHATWKTVSNKLK
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KSD ASPEYQDYVYLEGTQKAKKLFLQHIHRLKHEHIERRRKLYLAALPLAFEALIPNLDEIDH
:.:..:. ::::.::.. : .::..::.:::..::. :. .:: ::..:.:::.::.:
CCDS45 NHPDYEEYINLEGTRKARNTFSKHIEQLKQEHIRKRREEYINTLPRAFNTLLPNLEEIEH
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KSD LSCIKAKKLLETKPEFLKWFVVLEETPWDATSHIDNMENERIPFDLMDTVPAEQLYEAHL
:. .: ::.: . .: :::::.:::: :.:::.....::::::..:. ::..:. :.
CCDS45 LNWSEALKLMEKRADFQLCFVVLEKTPWDETDHIDKINDRRIPFDLLSTLEAEKVYQNHV
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KSD EKLRNERKRVEMRRAFKENLETSPFITPGKPWEEARSFIMNEDFYQWLEESVYMDIYGKH
..: .:..::::.. ::..:: ::.::.::::. :.:... :... :. ..::.:
CCDS45 QHLISEKRRVEMKEKFKKTLEKIQFISPGQPWEEVMCFVMEDEAYKYITEADSKEVYGRH
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KSD QKQIIDKAKEEFQELLLEYSELFYELELDAKPSKEKMGVIQDVLGEEQRFKALQKLQAER
:..:..::::::::.:.:.:::::.:.:.: ::..::. :. ::.:: :.:::::: .:
CCDS45 QREIVEKAKEEFQEMLFEHSELFYDLDLNATPSSDKMSEIHTVLSEEPRYKALQKLAPDR
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KSD DALILKHIHFVYHPTKETCPSCPACVDAKIEHLISSRFIRPSDRNQKNSLSDPNIDRINL
..:.:::: :::::::::: : :.: :.:.:..: ... . . .. :::..::
CCDS45 ESLLLKHIGFVYHPTKETCLSGQNCTDIKVEQLLASSLLQLDHGRLRLYHDSTNIDKVNL
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KSD VILGKDGLARELANEIRALCTNDDKYVIDGKMYELSLRPIEGNVRLPVNSFQTPTFQPHG
::::::::.:::::::. : ::.:..:::.:::.:::.... .... : .:.:::
CCDS45 FILGKDGLAQELANEIRTQST-DDEYALDGKIYELDLRPVDAKSPYFLSQLWTAAFKPHG
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710
pF1KSD CLCLYNSKESLSYVVESIEKSR-ESTLGRRDNHLVHLPLTLILVNKRGDTSGETLHSLIQ
:.:..:: ::::.. : : : : :.. :.:.....::.::::.:.: :. ...: : .
CCDS45 CFCVFNSIESLSFIGEFIGKIRTEASQIRKDKYMANLPFTLILANQR-DSISKNLPILRH
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KSD QGQQIASKLQCVFLDPASAGIGYGRNINEKQISQVLKGLLDS-KRNLNLVSSTASIKDLA
::::.:.:::: :.: . :: : :..:: ::.:.:.:.:.: :.::..:: . :::.
CCDS45 QGQQLANKLQCPFVD-VPAGT-YPRKFNETQIKQALRGVLESVKHNLDVVSPIPANKDLS
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KSD DVDLRIVMCLMCGDPFSADDILFPVLQSQTCKSSHCGSNNSVLLELPIGLHKKRIELSVL
..::::::: :::::::.: :: : :.:..:.... :.:::..:. :: ...::....:
CCDS45 EADLRIVMCAMCGDPFSVDLILSPFLDSHSCSAAQAGQNNSLMLDKIIGEKRRRIQITIL
780 790 800 810 820 830
840 850 860 870 880 890
pF1KSD SYHSSFSIRKSRLVHGYIVFYSAKRKASLAMLRAFLCEVQDIIPIQLVALTDGAVDVLDN
:::::...::..::::::. ::::::::..:::::: :::: ::.::::.::. .: ..:
CCDS45 SYHSSIGVRKDELVHGYILVYSAKRKASMGMLRAFLSEVQDTIPVQLVAVTDSQADFFEN
840 850 860 870 880 890
900 910 920 930 940 950
pF1KSD DLSREQLTEGEEIAQEIDGRFTSI-PCSQPQHKLEIFHPFFKDVVEKKNIIEATHMYDNA
. .: .::::.:: :: ..::.. :: ... :.: ::.::.::::.:: ... ::.
CCDS45 EAIKELMTEGEHIATEITAKFTALYSLSQYHRQTEVFTLFFSDVLEKKNMIENSYLSDNT
900 910 920 930 940 950
960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD AEACSTTEEVF-NSPRAGSPLCNSNLQDSEEDIE--PSYSLFREDTSLPSLSKDHSKLSM
:. .:.:: ::: : .: ::..: : : :: . .:..: .:.:. .
CCDS45 RESTHQSEDVFLPSPRDCFPY--NNYPDSDDDTEAPPPYSPIGDDVQLLPTPSDRSRYRL
960 970 980 990 1000 1010
1020 1030 1040 1050 1060
pF1KSD ELEGNDGLSFIMSN-FESKLNNKVPPPVKPKPPV-HFEITKGD---LSYLDQGHRDGQRK
.::::. : . . :.:::::.:::: : . .. : : :. .. : . ::
CCDS45 DLEGNEYPIHSTPNCHDHERNHKVPPPIKPKPVVPKTNVKKLDPNLLKTIEAGIGKNPRK
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KSD SVSSSPWLPQDGFDPSD-YAEPMDAVVKPRNEEENIYSVPHDSTQGKIITIRN--INKAQ
..: : . .:::: ::::.:.. : .. ..:: :: :: :..: ::: .:..:
CCDS45 QTSRVPLAHPEDMDPSDNYAEPIDTIFKQKGYSDEIYVVPDDS-QNRI-KIRNSFVNNTQ
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KSD SNGSGNGSDSEMDTSSLERGRKVSIVSKPVLYRTRC--TRLGRFASYRTSFSVGSDDELG
.. .. :: . . .: : . :: .. ... : :: .:.... . :
CCDS45 GDEENGFSDRTSKSHGERRPSKYKYKSKTLFSKAKSYYRRTHSDASDDEAFTTSKTKRKG
1140 1150 1160 1170 1180 1190
1190 1200 1210 1220 1230
pF1KSD PIRKKEED---QASQGYKG--DNAVIPYETDEDPRR-RNILRSLRRNTKKPKPKPRPSIT
: .::: . . .:: :: .: . . : .. .. ...... :: : : :
CCDS45 RHRGSEEDPLLSPVETWKGGIDNPAITSDQELDDKKMKKKTHKVKEDKKKKKTKNFNPPT
1200 1210 1220 1230 1240 1250
1240 1250 1260 1270 1280 1290
pF1KSD KATWESNYFGVPLTTVVTPEKPIPIFIERCIEYIEATGLSTEGIYRVSGNKSEMESLQRQ
. .:::::::.:: .:: :::::.:.:.:.:.:: ::: :::.:::::::......:.:
CCDS45 RRNWESNYFGMPLQDLVTAEKPIPLFVEKCVEFIEDTGLCTEGLYRVSGNKTDQDNIQKQ
1260 1270 1280 1290 1300 1310
1300 1310 1320 1330 1340 1350
pF1KSD FDQDHNLDLAEKDFTVNTVAGAMKSFFSELPDPLVPYNMQIDLVEAHKINDREQKLHALK
::::::..:. . :::.::::.:.::..:::::.::... .:.:: :: :. ..:::::
CCDS45 FDQDHNINLVSMEVTVNAVAGALKAFFADLPDPLIPYSLHPELLEAAKIPDKTERLHALK
1320 1330 1340 1350 1360 1370
1360 1370 1380 1390 1400 1410
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CCDS45 EIVKKFHPVNYDVFRYVITHLNRVSQQHKINLMTADNLSICFWPTLMRPDFENREFLSTT
1380 1390 1400 1410 1420 1430
1420 1430 1440 1450 1460 1470
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. .:...: ::::: ::::: :.: . . : :: .. : :.. : : :
CCDS45 KIHQSVVETFIQQCQFFFYNGEIVETTNIVAPPPPSNPGQLVE-----PMV----PLQLP
1440 1450 1460 1470 1480
1480 1490
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:: . .:: : .
CCDS45 PPLQPQLIQPQLQTDPLGII
1490 1500
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CCDS32 IDFGGRVVNNDHFLYWGDIIQNSEDGVECKIHVIEQTEFIDDQTFLPHRSTNLQPYIKRA
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CCDS32 AASKLQSAEKLMYICTDQLGLEQDFEQKQMPEGKLNVDGFLLCIDVSQGCNRKFDDQLKF
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CCDS32 VNNLFVQLSKSKKPVIIAATKCDECVDHYLREVQAFASNKKNLLVVETSARFNVNIETCF
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CCDS32 TALVQMLDKTRSKPKIIPYLDAYKTQRQLVVTATDKFEKLV-QTVRDYHATWKTVSNKLK
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CCDS32 LNWSEALKLMEKRADFQLCFVVLEKTPWDETDHIDKINDRRIPFDLLSTLEAEKVYQNHV
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CCDS32 QREIVEKAKEEFQEMLFEHSELFYDLDLNATPSSDKMSEIHTVLSEEPRYKALQKLAPDR
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CCDS32 ESLLLKHIGFVYHPTKETCLSGQNCTDIKVEQLLASSLLQLDHGRLRLYHDSTNIDKVNL
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CCDS32 FILGKDGLAQELANEIRTQST-DDEYALDGKIYELDLRPVDAKSPYFLSQLWTAAFKPHG
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pF1KSD CLCLYNSKESLSYVVESIEKSR-ESTLGRRDNHLVHLPLTLILVNKRGDTSGETLHSLIQ
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CCDS32 CFCVFNSIESLSFIGEFIGKIRTEASQIRKDKYMANLPFTLILANQR-DSISKNLPILRH
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CCDS32 QGQQLANKLQCPFVD-VPAGT-YPRKFNETQIKQALRGVLESVKHNLDVVSPIPANKDLS
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CCDS32 EADLRIVMCAMCGDPFSVDLILSPFLDSHSCSAAQAGQNNSLMLDKIIGEKRRRIQITIL
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CCDS32 EAIKELMTEGEHIATEITAKFTALYSLSQYHRQTEVFTLFFSDVLEKKNMIENSYLSDNT
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CCDS32 RESTHQSEDVFLPSPRDCFPY--NNYPDSDDDTEAPPPYSPIGDDVQLLPTPSDRSRYRL
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CCDS32 DLEGNEYPIHSTPNCHDHERNHKVPPPIKPKPVVPKTNVKKLDPNLLKTIEAGIGKNPRK
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CCDS32 QTSRVPLAHPEDMDPSDNYAEPIDTIFKQKGYSDEIYVVPDDS-QNRI-KIRNSFVNNTQ
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CCDS32 GDEENGFSDRTSKSHGERRPSKYKYKSKTLFSKAKSYYRRTHSDASDDEAFTTSKTKRKG
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: .::: . . .:: :: .: . . : .. . .. :: : : . :
CCDS32 RHRGSEEDPLLSPVETWKGGIDNPAITSDQELDDKKMKKKTHKVKEDKKQKKKTKNFNPP
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CCDS32 -TRRNWESNYFGMPLQDLVTAEKPIPLFVEKCVEFIEDTGLCTEGLYRVSGNKTDQDNIQ
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CCDS32 KQFDQDHNINLVSMEVTVNAVAGALKAFFADLPDPLIPYSLHPELLEAAKIPDKTERLHA
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CCDS32 LKEIVKKFHPVNYDVFRYVITHLNRVSQQHKINLMTADNLSICFWPTLMRPDFENREFLS
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pF1KSD ATRTYQTIIELFIQQCPFFFYNRPITEPPG-ARPSSPSAVASTVPFLTSTPVTSQPSPPQ
.:. .:...: ::::: ::::: :.: . . : :: .. : :.. : :
CCDS32 TTKIHQSVVETFIQQCQFFFYNGEIVETTNIVAPPPPSNPGQLVE-----PMV----PLQ
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pF1KSD SPPPTPQSPMQPLLPSQLQAEHTL
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CCDS32 LPPPLQPQLIQPQLQTDPLGII
1490 1500
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CCDS11 SRVPRFVQQCIRAVEARGLDIDGLYRISGNLATIQKLRYKVDHDERLDLDDGRWEDVHVI
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pF1KSD AGAMKSFFSELPDPLVPYNMQIDLVEAHKINDREQKLHALKEVLKKFPKENHEVFKYVIS
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CCDS11 TGALKLFFRELPEPLFPFSHFRQFIAAIKLQDQARRSRCVRDLVRSLPAPNHDTLRMLFQ
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pF1KSD HLNKVSHNNKVNLMTSENLSICFWPTLMRPDFSTMDALTATRTYQT-IIELFIQQCPFFF
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CCDS11 HLCRVIEHGEQNRMSVQSVAIVFGPTLLRPEVEET-SMPMTMVFQNQVVELILQQCADIF
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pF1KSD YNRPITEPPGARPSSPSAVASTVPFLTSTPVTSQPSPPQSPPPTPQSPMQPLLPSQLQAE
CCDS11 PPH
>>CCDS74082.1 ARHGAP27 gene_id:201176|Hs108|chr17 (889 aa)
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pF1KSD TSSLERGRKVSIVSKPVLYRTRCTRLGRFASYRTSFSVGSDDELGPIRKKEEDQASQGYK
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CCDS74 DSEAIISTWHKAIAQGIQELSAELPPEESESSRVDF--GSSERLGSWQEKEEDARPNAAA
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. . :.: . :... . :.: .: . :. ... :: :... :.
CCDS74 PALGPVGLESDLSKVRHKLRKFLQR-----RPTLQSLREKGYIKDQVFGCALAALCERER
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pF1KSD P-IPIFIERCIEYIEATGLSTEGIYRVSGNKSEMESLQRQFDQDHNLDLAEKDFT-VNTV
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CCDS74 SRVPRFVQQCIRAVEARGLDIDGLYRISGNLATIQKLRYKVDHDERLDLDDGRWEDVHVI
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pF1KSD AGAMKSFFSELPDPLVPYNMQIDLVEAHKINDREQKLHALKEVLKKFPKENHEVFKYVIS
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CCDS74 TGALKLFFRELPEPLFPFSHFRQFIAAIKLQDQARRSRCVRDLVRSLPAPNHDTLRMLFQ
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pF1KSD HLNKVSHNNKVNLMTSENLSICFWPTLMRPDFSTMDALTATRTYQT-IIELFIQQCPFFF
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CCDS74 HLCRVIEHGEQNRMSVQSVAIVFGPTLLRPEVEET-SMPMTMVFQNQVVELILQQCADIF
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pF1KSD YNRPITEPPGARPSSPSAVASTVPFLTSTPVTSQPSPPQSPPPTPQSPMQPLLPSQLQAE
CCDS74 PPH
>>CCDS56147.1 CHN1 gene_id:1123|Hs108|chr2 (334 aa)
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pF1KSD SQGYKGDNAVIPYETDEDPRRRNILRSLRRNTKKPKPKPRPSITKATWE--SNYFGVPLT
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CCDS56 TFRGPHWCEYCANFMWGLIAQGVKCADCGLNVHKQCSKMVPNDCKPDLKHVKKVYSCDLT
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pF1KSD TVVTPEKPI-PIFIERCIEYIEATGLSTEGIYRVSGNKSEMESLQRQFDQD-HNLDLAEK
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CCDS56 TLVKAHTTKRPMVVDMCIREIESRGLNSEGLYRVSGFSDLIEDVKMAFDRDGEKADISVN
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pF1KSD DFT-VNTVAGAMKSFFSELPDPLVPYNMQIDLVEAHKINDREQKLHALKEVLKKFPKENH
. .: ..::.: .: .:: ::. :. ..:. :: : ...:..:.:.:: .: .
CCDS56 MYEDINIITGALKLYFRDLPIPLITYDAYPKFIESAKIMDPDEQLETLHEALKLLPPAHC
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pF1KSD EVFKYVISHLNKVSHNNKVNLMTSENLSICFWPTLMR-PDFSTMDALTATRTYQTIIELF
:...:...::..:. ..: :::..:::.: : ::::: :....: ::. : . ..::.
CCDS56 ETLRYLMAHLKRVTLHEKENLMNAENLGIVFGPTLMRSPELDAMAALNDIRYQRLVVELL
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pF1KSD IQQCPFFFYNRPITEPPGARPSSPSAVASTVPFLTSTPVTSQPSPPQSPPPTPQSPMQPL
:.. ..:
CCDS56 IKNEDILF
330
>>CCDS46454.1 CHN1 gene_id:1123|Hs108|chr2 (433 aa)
initn: 388 init1: 269 opt: 438 Z-score: 315.4 bits: 69.3 E(32554): 3e-11
Smith-Waterman score: 438; 34.9% identity (70.6% similar) in 218 aa overlap (1225-1436:216-433)
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KSD SQGYKGDNAVIPYETDEDPRRRNILRSLRRNTKKPKPKPRPSITKATWE--SNYFGVPLT
:..: : :. : . .. .. ::
CCDS46 TFRGPHWCEYCANFMWGLIAQGVKCADCGLNVHKQCSKMVPNDCKPDLKHVKKVYSCDLT
190 200 210 220 230 240
1260 1270 1280 1290 1300 1310
pF1KSD TVVTPEKPI-PIFIERCIEYIEATGLSTEGIYRVSGNKSEMESLQRQFDQD-HNLDLAEK
:.: . :. .. ::. ::. ::..::.::::: .. .:... ::.: .. :.. .
CCDS46 TLVKAHTTKRPMVVDMCIREIESRGLNSEGLYRVSGFSDLIEDVKMAFDRDGEKADISVN
250 260 270 280 290 300
1320 1330 1340 1350 1360
pF1KSD DFT-VNTVAGAMKSFFSELPDPLVPYNMQIDLVEAHKINDREQKLHALKEVLKKFPKENH
. .: ..::.: .: .:: ::. :. ..:. :: : ...:..:.:.:: .: .
CCDS46 MYEDINIITGALKLYFRDLPIPLITYDAYPKFIESAKIMDPDEQLETLHEALKLLPPAHC
310 320 330 340 350 360
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pF1KSD EVFKYVISHLNKVSHNNKVNLMTSENLSICFWPTLMR-PDFSTMDALTATRTYQTIIELF
:...:...::..:. ..: :::..:::.: : ::::: :....: ::. : . ..::.
CCDS46 ETLRYLMAHLKRVTLHEKENLMNAENLGIVFGPTLMRSPELDAMAALNDIRYQRLVVELL
370 380 390 400 410 420
1430 1440 1450 1460 1470 1480
pF1KSD IQQCPFFFYNRPITEPPGARPSSPSAVASTVPFLTSTPVTSQPSPPQSPPPTPQSPMQPL
:.. ..:
CCDS46 IKNEDILF
430
>>CCDS46455.1 CHN1 gene_id:1123|Hs108|chr2 (459 aa)
initn: 388 init1: 269 opt: 438 Z-score: 315.1 bits: 69.3 E(32554): 3.1e-11
Smith-Waterman score: 438; 34.9% identity (70.6% similar) in 218 aa overlap (1225-1436:242-459)
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KSD SQGYKGDNAVIPYETDEDPRRRNILRSLRRNTKKPKPKPRPSITKATWE--SNYFGVPLT
:..: : :. : . .. .. ::
CCDS46 TFRGPHWCEYCANFMWGLIAQGVKCADCGLNVHKQCSKMVPNDCKPDLKHVKKVYSCDLT
220 230 240 250 260 270
1260 1270 1280 1290 1300 1310
pF1KSD TVVTPEKPI-PIFIERCIEYIEATGLSTEGIYRVSGNKSEMESLQRQFDQD-HNLDLAEK
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CCDS46 TLVKAHTTKRPMVVDMCIREIESRGLNSEGLYRVSGFSDLIEDVKMAFDRDGEKADISVN
280 290 300 310 320 330
1320 1330 1340 1350 1360
pF1KSD DFT-VNTVAGAMKSFFSELPDPLVPYNMQIDLVEAHKINDREQKLHALKEVLKKFPKENH
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CCDS46 MYEDINIITGALKLYFRDLPIPLITYDAYPKFIESAKIMDPDEQLETLHEALKLLPPAHC
340 350 360 370 380 390
1370 1380 1390 1400 1410 1420
pF1KSD EVFKYVISHLNKVSHNNKVNLMTSENLSICFWPTLMR-PDFSTMDALTATRTYQTIIELF
:...:...::..:. ..: :::..:::.: : ::::: :....: ::. : . ..::.
CCDS46 ETLRYLMAHLKRVTLHEKENLMNAENLGIVFGPTLMRSPELDAMAALNDIRYQRLVVELL
400 410 420 430 440 450
1430 1440 1450 1460 1470 1480
pF1KSD IQQCPFFFYNRPITEPPGARPSSPSAVASTVPFLTSTPVTSQPSPPQSPPPTPQSPMQPL
:.. ..:
CCDS46 IKNEDILF
>>CCDS47566.1 CHN2 gene_id:1124|Hs108|chr7 (332 aa)
initn: 400 init1: 279 opt: 427 Z-score: 309.5 bits: 67.8 E(32554): 6.4e-11
Smith-Waterman score: 427; 36.8% identity (72.6% similar) in 190 aa overlap (1251-1436:143-332)
1230 1240 1250 1260 1270
pF1KSD SLRRNTKKPKPKPRPSITKATWESNYFGVPLTTVVTPEKPI-PIFIERCIEYIEATGLST
:::.: .. :. .. ::. ::: ::..
CCDS47 GLNVHKQCSKHVPNDCQPDLKRIKKVYCCDLTTLVKAHNTQRPMVVDICIREIEARGLKS
120 130 140 150 160 170
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pF1KSD EGIYRVSGNKSEMESLQRQFDQD-HNLDLAEKDFT-VNTVAGAMKSFFSELPDPLVPYNM
::.::::: ..:... ::.: .. :.. . . .: ..::.: .: .:: :.. :.
CCDS47 EGLYRVSGFTEHIEDVKMAFDRDGEKADISANVYPDINIITGALKLYFRDLPIPVITYDT
180 190 200 210 220 230
1340 1350 1360 1370 1380 1390
pF1KSD QIDLVEAHKINDREQKLHALKEVLKKFPKENHEVFKYVISHLNKVSHNNKVNLMTSENLS
...: ::.. ...:.:..::: .: ..:...:.. ::.::. :.: :.:..:::.
CCDS47 YSKFIDAAKISNADERLEAVHEVLMLLPPAHYETLRYLMIHLKKVTMNEKDNFMNAENLG
240 250 260 270 280 290
1400 1410 1420 1430 1440 1450
pF1KSD ICFWPTLMRP-DFSTMDALTATRTYQTIIELFIQQCPFFFYNRPITEPPGARPSSPSAVA
: : :::::: . ::. .: : . :....:.. .:
CCDS47 IVFGPTLMRPPEDSTLTTLHDMRYQKLIVQILIENEDVLF
300 310 320 330
1460 1470 1480 1490
pF1KSD STVPFLTSTPVTSQPSPPQSPPPTPQSPMQPLLPSQLQAEHTL
>>CCDS5420.1 CHN2 gene_id:1124|Hs108|chr7 (468 aa)
initn: 400 init1: 279 opt: 427 Z-score: 307.4 bits: 67.9 E(32554): 8.4e-11
Smith-Waterman score: 427; 36.8% identity (72.6% similar) in 190 aa overlap (1251-1436:279-468)
1230 1240 1250 1260 1270
pF1KSD SLRRNTKKPKPKPRPSITKATWESNYFGVPLTTVVTPEKPI-PIFIERCIEYIEATGLST
:::.: .. :. .. ::. ::: ::..
CCDS54 GLNVHKQCSKHVPNDCQPDLKRIKKVYCCDLTTLVKAHNTQRPMVVDICIREIEARGLKS
250 260 270 280 290 300
1280 1290 1300 1310 1320 1330
pF1KSD EGIYRVSGNKSEMESLQRQFDQD-HNLDLAEKDFT-VNTVAGAMKSFFSELPDPLVPYNM
::.::::: ..:... ::.: .. :.. . . .: ..::.: .: .:: :.. :.
CCDS54 EGLYRVSGFTEHIEDVKMAFDRDGEKADISANVYPDINIITGALKLYFRDLPIPVITYDT
310 320 330 340 350 360
1340 1350 1360 1370 1380 1390
pF1KSD QIDLVEAHKINDREQKLHALKEVLKKFPKENHEVFKYVISHLNKVSHNNKVNLMTSENLS
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CCDS54 YSKFIDAAKISNADERLEAVHEVLMLLPPAHYETLRYLMIHLKKVTMNEKDNFMNAENLG
370 380 390 400 410 420
1400 1410 1420 1430 1440 1450
pF1KSD ICFWPTLMRP-DFSTMDALTATRTYQTIIELFIQQCPFFFYNRPITEPPGARPSSPSAVA
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CCDS54 IVFGPTLMRPPEDSTLTTLHDMRYQKLIVQILIENEDVLF
430 440 450 460
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]