Result of FASTA (omim) for
pF1KSDA1716
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1716, 759 aa
1>>>pF1KSDA1716 759 - 759 aa - 759 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2584+/-0.000511; mu= 17.6454+/- 0.032
mean_var=314.3710+/-66.762, 0's: 0 Z-trim(116.0): 299 B-trim: 376 in 2/55
Lambda= 0.072336
statistics sampled from 26326 (26781) to 26326 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.669), E-opt: 0.2 (0.314), width: 16
Scan time: 13.010
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_011510905 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP wit ( 813) 2868 314.8 8.9e-85
XP_016861536 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP wit ( 841) 2718 299.2 4.7e-80
XP_011510908 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP wit ( 776) 2277 253.1 3.2e-66
XP_011510907 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP wit ( 776) 2277 253.1 3.2e-66
XP_011510906 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP wit ( 776) 2277 253.1 3.2e-66
XP_011510904 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP wit ( 820) 2277 253.2 3.3e-66
NP_036419 (OMIM: 607766) arf-GAP with coiled-coil, ( 778) 2260 251.3 1.1e-65
XP_006713620 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP wit ( 785) 2167 241.6 9.2e-63
XP_016861535 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP wit ( 848) 2127 237.5 1.7e-61
XP_016861538 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP wit ( 806) 2110 235.7 5.8e-61
XP_016861537 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP wit ( 813) 2017 226.0 4.8e-58
NP_055531 (OMIM: 607763) arf-GAP with coiled-coil, ( 740) 1676 190.4 2.4e-47
XP_016857175 (OMIM: 616594) PREDICTED: arf-GAP wit ( 905) 592 77.4 3e-13
XP_011540057 (OMIM: 616594) PREDICTED: arf-GAP wit ( 926) 592 77.4 3e-13
XP_016857176 (OMIM: 616594) PREDICTED: arf-GAP wit ( 883) 590 77.2 3.4e-13
NP_060177 (OMIM: 616594) arf-GAP with SH3 domain, ( 903) 590 77.2 3.4e-13
XP_016857174 (OMIM: 616594) PREDICTED: arf-GAP wit ( 924) 590 77.2 3.5e-13
XP_016857178 (OMIM: 616594) PREDICTED: arf-GAP wit ( 774) 574 75.4 1e-12
XP_016857177 (OMIM: 616594) PREDICTED: arf-GAP wit ( 793) 572 75.2 1.2e-12
NP_001137250 (OMIM: 616594) arf-GAP with SH3 domai ( 894) 560 74.0 3e-12
XP_016867224 (OMIM: 616813) PREDICTED: arf-GAP wit ( 462) 443 61.3 1e-08
XP_016867222 (OMIM: 616813) PREDICTED: arf-GAP wit ( 527) 443 61.4 1.1e-08
XP_005250000 (OMIM: 616813) PREDICTED: arf-GAP wit ( 565) 443 61.5 1.1e-08
NP_001268229 (OMIM: 616813) arf-GAP with GTPase, A ( 580) 443 61.5 1.2e-08
XP_016867223 (OMIM: 616813) PREDICTED: arf-GAP wit ( 580) 443 61.5 1.2e-08
XP_016867221 (OMIM: 616813) PREDICTED: arf-GAP wit ( 630) 443 61.6 1.2e-08
XP_011514082 (OMIM: 616813) PREDICTED: arf-GAP wit ( 683) 443 61.6 1.3e-08
NP_114152 (OMIM: 616813) arf-GAP with GTPase, ANK ( 911) 443 61.8 1.4e-08
NP_055729 (OMIM: 608651) arf-GAP with GTPase, ANK ( 804) 434 60.8 2.6e-08
XP_005246116 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit ( 808) 434 60.8 2.6e-08
NP_001032208 (OMIM: 608651) arf-GAP with GTPase, A ( 857) 434 60.9 2.7e-08
XP_006712298 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit ( 882) 434 60.9 2.7e-08
XP_006712297 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit ( 886) 434 60.9 2.7e-08
XP_011508851 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit (1073) 434 61.0 2.9e-08
XP_011508850 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit (1098) 434 61.1 3e-08
XP_016858771 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit (1106) 434 61.1 3e-08
XP_011508849 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit (1126) 434 61.1 3e-08
XP_006712300 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit (1147) 434 61.1 3e-08
XP_006712302 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit (1151) 434 61.1 3e-08
NP_055585 (OMIM: 605476) arf-GAP with GTPase, ANK ( 836) 429 60.3 3.8e-08
XP_005268683 (OMIM: 605476) PREDICTED: arf-GAP wit ( 856) 429 60.3 3.8e-08
XP_005268682 (OMIM: 605476) PREDICTED: arf-GAP wit (1172) 429 60.6 4.4e-08
XP_016874261 (OMIM: 605476) PREDICTED: arf-GAP wit (1192) 429 60.6 4.4e-08
NP_001116244 (OMIM: 605476) arf-GAP with GTPase, A (1192) 429 60.6 4.4e-08
NP_001128663 (OMIM: 603817) arf-GAP with SH3 domai ( 961) 393 56.7 5.4e-07
NP_003878 (OMIM: 603817) arf-GAP with SH3 domain, (1006) 393 56.7 5.6e-07
XP_011508706 (OMIM: 603817) PREDICTED: arf-GAP wit (1017) 393 56.7 5.6e-07
XP_011508710 (OMIM: 603817) PREDICTED: arf-GAP wit ( 959) 390 56.4 6.8e-07
XP_006711965 (OMIM: 603817) PREDICTED: arf-GAP wit ( 964) 390 56.4 6.8e-07
XP_006711964 (OMIM: 603817) PREDICTED: arf-GAP wit ( 970) 390 56.4 6.8e-07
>>XP_011510905 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP with co (813 aa)
initn: 2341 init1: 866 opt: 2868 Z-score: 1643.0 bits: 314.8 E(85289): 8.9e-85
Smith-Waterman score: 2972; 61.0% identity (81.8% similar) in 749 aa overlap (1-733:45-781)
10 20 30
pF1KSD MVEAGKAYVSTSRLFVSGVRDLSQQCQGDT
:...:::. ... :..:.:::.: ..:.
XP_011 PRFRAALEEVEGDVAELELKLDKLVKLCIAMIDTGKAFCVANKQFMNGIRDLAQYSSNDA
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KSD VISECLQRFADSLQEVVNYHMILFDQAQRSVRQQLQSFVKEDVRKFKETKKQFDKVREDL
:. : .:.:::::..:.: :::::.:::.. :::.:::::.::::..::::.:: :.
XP_011 VVETSLTKFSDSLQEMINFHTILFDQTQRSIKAQLQNFVKEDLRKFKDAKKQFEKVSEEK
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KSD ELSLVRNAQAPRHRPHEVEEATGALTLTRKCFRHLALDYVLQINVLQAKKKFEILDSMLS
: .::.:::. :.. :::::::. :: :::::::.::::::::::::.:.. ::: ::::
XP_011 ENALVKNAQVQRNKQHEVEEATNILTATRKCFRHIALDYVLQINVLQSKRRSEILKSMLS
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KSD FMHAQSSFFQQGYSLLHQLDPYMKKLAAELDQLVIDSAVEKREMERKHAAIQQRTLLQDF
::.:. .::.:::.:. .: :::: :.:.::.::.:.: ::::::.::..:::. ::
XP_011 FMYAHLAFFHQGYDLFSELGPYMKDLGAQLDRLVVDAAKEKREMEQKHSTIQQK----DF
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KSD SYDESKVEFDVDAPSGVVMEGYLFKRASNAFKTWNRRWFSIQNSQLVYQKKLKDALTVVV
: :.::.:..::: .:.::::::::::::::::::::::::::.:::::::.:: ::::
XP_011 SSDDSKLEYNVDAANGIVMEGYLFKRASNAFKTWNRRWFSIQNNQLVYQKKFKDNPTVVV
260 270 280 290 300 310
280 290 300 310 320 330
pF1KSD DDLRLCSVKPCEDIERRFCFEVLSPTKSCMLQADSEKLRQAWVQAVQASIASAYRESPDS
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XP_011 EDLRLCTVKHCEDIERRFCFEVVSPTKSCMLQADSEKLRQAWIKAVQTSIATAYREKGDE
320 330 340 350 360 370
340 350 360 370 380 390
pF1KSD CYSERLDRTASPSTSSIDSATDTRERGVKGESVLQRVQSVAGNSQCGDCGQPDPRWASIN
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XP_011 --SEKLDKKSSPSTGSLDSGNESKEKLLKGESALQRVQCIPGNASCCDCGLADPRWASIN
380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KSD LGVLLCIECSGIHRSLGVHCSKVRSLTLDSWEPELLKLMCELGNSAVNQIYEAQCEGAGS
::. ::::::::::::::: :::::::::.::::::::::::::...:..:::. : :
XP_011 LGITLCIECSGIHRSLGVHFSKVRSLTLDTWEPELLKLMCELGNDVINRVYEANVEKMGI
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490 500 510
pF1KSD RKPTASSSRQDKEAWIKDKYVEKKFLRKAPMAPALEAPRRWRVQKCLRPHSSPRAPTARR
.:: .. ::.:::.:. ::::.::. : .. : :.. :: . .:: . .
XP_011 KKPQPGQ-RQEKEAYIRAKYVERKFVDKYSIS--LSPPEQ---QKKFVSKSSEEKRLSIS
490 500 510 520 530 540
520 530 540 550 560
pF1KSD KVRLEPVLPCVAALSSVGTLDRKFRRDSLFCPDELDSLFSYFDAGAAGAGPRK-------
: . : : ... . . ::.::::::::::::::::... . :.
XP_011 KFGPGDQVRASAQSSVIAVNSDEARRESLFCPDELDSLFSYFDTSSKLRSIRSNDSGIQQ
550 560 570 580 590 600
570 580 590 600 610
pF1KSD ----GAESEESSGEADGDTEAEAWG-----LADVRELHPGLLAHRAARARDLPALAAALA
: :: :. :.. : :. . : ..:.::: .::. ..:: .: :::
XP_011 SSDDGRESLPSTVSANSLYEPEGERQDSSMFLDSKHLNPGLQLYRASYEKNLPKMAEALA
610 620 630 640 650 660
620 630 640 650 660 670
pF1KSD HGAEVNWADAEDEGKTPLVQAVLGGSLIVCEFLLQNGADVNQRDSRGRAPLHHATLLGRT
:::.::::..:.. :::.::::::::..:::::::::.::::: .::.::::::.::.:
XP_011 HGADVNWANSEENKATPLIQAVLGGSLVTCEFLLQNGANVNQRDVQGRGPLHHATVLGHT
670 680 690 700 710 720
680 690 700 710 720 730
pF1KSD GQVCLFLKRGADQHALDQEQRDPLAIAVQAANADIVTLLRLARMAEEMREAEAAPGPPGA
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XP_011 GQVCLFLKRGANQHATDEEGKDPLSIAVEAANADIVTLLRLARMNEEMRESEGLYGQPGD
730 740 750 760 770 780
740 750
pF1KSD LAGSPTELQFRRCIQEFISLHLEES
XP_011 ETYQDIFRDFSQMASNNPEKLNRFQQDSQKF
790 800 810
>>XP_016861536 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP with co (841 aa)
initn: 2310 init1: 716 opt: 2718 Z-score: 1558.3 bits: 299.2 E(85289): 4.7e-80
Smith-Waterman score: 2914; 58.9% identity (79.0% similar) in 777 aa overlap (1-733:45-809)
10 20 30
pF1KSD MVEAGKAYVSTSRLFVSGVRDLSQQCQGDT
:...:::. ... :..:.:::.: ..:.
XP_016 PRFRAALEEVEGDVAELELKLDKLVKLCIAMIDTGKAFCVANKQFMNGIRDLAQYSSNDA
20 30 40 50 60 70
40 50 60
pF1KSD VISECLQRFADSLQEVVNYH----------------------------MILFDQAQRSVR
:. : .:.:::::..:.: ::::::.:::..
XP_016 VVETSLTKFSDSLQEMINFHTRQGLPLSLRLECRGMIIALLWESSHLRMILFDQTQRSIK
80 90 100 110 120 130
70 80 90 100 110 120
pF1KSD QQLQSFVKEDVRKFKETKKQFDKVREDLELSLVRNAQAPRHRPHEVEEATGALTLTRKCF
:::.:::::.::::..::::.:: :. : .::.:::. :.. :::::::. :: :::::
XP_016 AQLQNFVKEDLRKFKDAKKQFEKVSEEKENALVKNAQVQRNKQHEVEEATNILTATRKCF
140 150 160 170 180 190
130 140 150 160 170 180
pF1KSD RHLALDYVLQINVLQAKKKFEILDSMLSFMHAQSSFFQQGYSLLHQLDPYMKKLAAELDQ
::.::::::::::::.:.. ::: ::::::.:. .::.:::.:. .: :::: :.:.::.
XP_016 RHIALDYVLQINVLQSKRRSEILKSMLSFMYAHLAFFHQGYDLFSELGPYMKDLGAQLDR
200 210 220 230 240 250
190 200 210 220 230 240
pF1KSD LVIDSAVEKREMERKHAAIQQRTLLQDFSYDESKVEFDVDAPSGVVMEGYLFKRASNAFK
::.:.: ::::::.::..:::. ::: :.::.:..::: .:.:::::::::::::::
XP_016 LVVDAAKEKREMEQKHSTIQQK----DFSSDDSKLEYNVDAANGIVMEGYLFKRASNAFK
260 270 280 290 300 310
250 260 270 280 290 300
pF1KSD TWNRRWFSIQNSQLVYQKKLKDALTVVVDDLRLCSVKPCEDIERRFCFEVLSPTKSCMLQ
:::::::::::.:::::::.:: ::::.:::::.:: ::::::::::::.:::::::::
XP_016 TWNRRWFSIQNNQLVYQKKFKDNPTVVVEDLRLCTVKHCEDIERRFCFEVVSPTKSCMLQ
320 330 340 350 360 370
310 320 330 340 350 360
pF1KSD ADSEKLRQAWVQAVQASIASAYRESPDSCYSERLDRTASPSTSSIDSATDTRERGVKGES
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XP_016 ADSEKLRQAWIKAVQTSIATAYREKGDE--SEKLDKKSSPSTGSLDSGNESKEKLLKGES
380 390 400 410 420
370 380 390 400 410 420
pF1KSD VLQRVQSVAGNSQCGDCGQPDPRWASINLGVLLCIECSGIHRSLGVHCSKVRSLTLDSWE
.::::: . ::..: ::: ::::::::::. ::::::::::::::: :::::::::.::
XP_016 ALQRVQCIPGNASCCDCGLADPRWASINLGITLCIECSGIHRSLGVHFSKVRSLTLDTWE
430 440 450 460 470 480
430 440 450 460 470 480
pF1KSD PELLKLMCELGNSAVNQIYEAQCEGAGSRKPTASSSRQDKEAWIKDKYVEKKFLRKAPMA
::::::::::::...:..:::. : : .:: .. ::.:::.:. ::::.::. : ..
XP_016 PELLKLMCELGNDVINRVYEANVEKMGIKKPQPGQ-RQEKEAYIRAKYVERKFVDKYSIS
490 500 510 520 530 540
490 500 510 520 530 540
pF1KSD PALEAPRRWRVQKCLRPHSSPRAPTARRKVRLEPVLPCVAALSSVGTLDRKFRRDSLFCP
: :.. :: . .:: . . : . : : ... . . ::.:::::
XP_016 --LSPPEQ---QKKFVSKSSEEKRLSISKFGPGDQVRASAQSSVIAVNSDEARRESLFCP
550 560 570 580 590 600
550 560 570 580
pF1KSD DELDSLFSYFDAGAAGAGPRK-----------GAESEESSGEADGDTEAEAWG-----LA
:::::::::::... . :. : :: :. :.. : :. .
XP_016 DELDSLFSYFDTSSKLRSIRSNDSGIQQSSDDGRESLPSTVSANSLYEPEGERQDSSMFL
610 620 630 640 650 660
590 600 610 620 630 640
pF1KSD DVRELHPGLLAHRAARARDLPALAAALAHGAEVNWADAEDEGKTPLVQAVLGGSLIVCEF
: ..:.::: .::. ..:: .: ::::::.::::..:.. :::.::::::::..:::
XP_016 DSKHLNPGLQLYRASYEKNLPKMAEALAHGADVNWANSEENKATPLIQAVLGGSLVTCEF
670 680 690 700 710 720
650 660 670 680 690 700
pF1KSD LLQNGADVNQRDSRGRAPLHHATLLGRTGQVCLFLKRGADQHALDQEQRDPLAIAVQAAN
::::::.::::: .::.::::::.::.::::::::::::.::: :.: .:::.:::.:::
XP_016 LLQNGANVNQRDVQGRGPLHHATVLGHTGQVCLFLKRGANQHATDEEGKDPLSIAVEAAN
730 740 750 760 770 780
710 720 730 740 750
pF1KSD ADIVTLLRLARMAEEMREAEAAPGPPGALAGSPTELQFRRCIQEFISLHLEES
:::::::::::: :::::.:. : ::
XP_016 ADIVTLLRLARMNEEMRESEGLYGQPGDETYQDIFRDFSQMASNNPEKLNRFQQDSQKF
790 800 810 820 830 840
>>XP_011510908 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP with co (776 aa)
initn: 2737 init1: 866 opt: 2277 Z-score: 1309.8 bits: 253.1 E(85289): 3.2e-66
Smith-Waterman score: 2948; 60.4% identity (81.1% similar) in 756 aa overlap (1-733:1-744)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MVEAGKAYVSTSRLFVSGVRDLSQQCQGDTVISECLQRFADSLQEVVNYHMILFDQAQRS
:...:::. ... :..:.:::.: ..:.:. : .:.:::::..:.: :::::.:::
XP_011 MIDTGKAFCVANKQFMNGIRDLAQYSSNDAVVETSLTKFSDSLQEMINFHTILFDQTQRS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD VRQQLQSFVKEDVRKFKETKKQFDKVREDLELSLVRNAQAPRHRPHEVEEATGALTLTRK
.. :::.:::::.::::..::::.:: :. : .::.:::. :.. :::::::. :: :::
XP_011 IKAQLQNFVKEDLRKFKDAKKQFEKVSEEKENALVKNAQVQRNKQHEVEEATNILTATRK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD CFRHLALDYVLQINVLQAKKKFEILDSMLSFMHAQSSFFQQGYSLLHQLDPYMKKLAAEL
::::.::::::::::::.:.. ::: ::::::.:. .::.:::.:. .: :::: :.:.:
XP_011 CFRHIALDYVLQINVLQSKRRSEILKSMLSFMYAHLAFFHQGYDLFSELGPYMKDLGAQL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD DQLVIDSAVEKREMERKHAAIQQRTLLQDFSYDESKVEFDVDAPSGVVMEGYLFKRASNA
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XP_011 FQQDSQKF
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XP_011 FQQDSQKF
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pF1KSD -----------GAESEESSGEADGDTEAEAWG-----LADVRELHPGLLAHRAARARDLP
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: ::
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pF1KSD ELSLVRNAQAPRHRPHEVEEATGALTLTRKCFRHLALDYVLQINVLQAKKKFEILDSMLS
: .::.:::. :.. :::::::. :: :::::::.::::::::::::.:.. ::: ::::
NP_036 ENALVKNAQVQRNKQHEVEEATNILTATRKCFRHIALDYVLQINVLQSKRRSEILKSMLS
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KSD FMHAQSSFFQQGYSLLHQLDPYMKKLAAELDQLVIDSAVEKREMERKHAAIQQRTLLQDF
::.:. .::.:::.:. .: :::: :.:.::.::.:.: ::::::.::..:::. ::
NP_036 FMYAHLAFFHQGYDLFSELGPYMKDLGAQLDRLVVDAAKEKREMEQKHSTIQQK----DF
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KSD SYDESKVEFDVDAPSGVVMEGYLFKRASNAFKTWNRRWFSIQNSQLVYQKKLKDALTVVV
: :.::.:..::: .:.::::::::::::::::::::::::::.:::::::.:: ::::
NP_036 SSDDSKLEYNVDAANGIVMEGYLFKRASNAFKTWNRRWFSIQNNQLVYQKKFKDNPTVVV
260 270 280 290 300 310
280 290 300 310 320 330
pF1KSD DDLRLCSVKPCEDIERRFCFEVLSPTKSCMLQADSEKLRQAWVQAVQASIASAYRESPDS
.:::::.:: ::::::::::::.:::::::::::::::::::..:::.:::.::::. :
NP_036 EDLRLCTVKHCEDIERRFCFEVVSPTKSCMLQADSEKLRQAWIKAVQTSIATAYREKGDE
320 330 340 350 360 370
340 350 360 370 380 390
pF1KSD CYSERLDRTASPSTSSIDSATDTRERGVKGESVLQRVQSVAGNSQCGDCGQPDPRWASIN
::.::. .::::.:.::.....:. .::::.::::: . ::..: ::: ::::::::
NP_036 --SEKLDKKSSPSTGSLDSGNESKEKLLKGESALQRVQCIPGNASCCDCGLADPRWASIN
380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KSD LGVLLCIECSGIHRSLGVHCSKVRSLTLDSWEPELLKLMCELGNSAVNQIYEAQCEGAGS
::. ::::::::::::::: :::::::::.::::::::::::::...:..:::. : :
NP_036 LGITLCIECSGIHRSLGVHFSKVRSLTLDTWEPELLKLMCELGNDVINRVYEANVEKMGI
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490 500 510
pF1KSD RKPTASSSRQDKEAWIKDKYVEKKFLRKAPMAPALEAPRRWRVQKCLRPHSSPRAPTARR
.:: .. ::.:::.:. ::::.::. : .. : :.. :: . .:: ..
NP_036 KKPQPGQ-RQEKEAYIRAKYVERKFVDKYSIS--LSPPEQ---QKKFVSKSSE-----EK
490 500 510 520 530
520 530 540 550 560
pF1KSD KVRLEPVLPC----VAALSSVGTLDRKFRRDSLFCPDELDSLFSYFDAGAAGAGPRKGAE
.. . : ..: ::: . : ....: : .:: : .:.
NP_036 RLSISKFGPGDQVRASAQSSVRSNDSGIQQSS---DDGRESLPSTVSAN-----------
540 550 560 570 580
570 580 590 600 610 620
pF1KSD SEESSGEADGDTEAEAWGLADVRELHPGLLAHRAARARDLPALAAALAHGAEVNWADAED
: : .:. . . : : ..:.::: .::. ..:: .: ::::::.::::..:.
NP_036 ---SLYEPEGERQDSSMFL-DSKHLNPGLQLYRASYEKNLPKMAEALAHGADVNWANSEE
590 600 610 620 630
630 640 650 660 670 680
pF1KSD EGKTPLVQAVLGGSLIVCEFLLQNGADVNQRDSRGRAPLHHATLLGRTGQVCLFLKRGAD
. :::.::::::::..:::::::::.::::: .::.::::::.::.::::::::::::.
NP_036 NKATPLIQAVLGGSLVTCEFLLQNGANVNQRDVQGRGPLHHATVLGHTGQVCLFLKRGAN
640 650 660 670 680 690
690 700 710 720 730 740
pF1KSD QHALDQEQRDPLAIAVQAANADIVTLLRLARMAEEMREAEAAPGPPGALAGSPTELQFRR
::: :.: .:::.:::.::::::::::::::: :::::.:. : ::
NP_036 QHATDEEGKDPLSIAVEAANADIVTLLRLARMNEEMRESEGLYGQPGDETYQDIFRDFSQ
700 710 720 730 740 750
750
pF1KSD CIQEFISLHLEES
NP_036 MASNNPEKLNRFQQDSQKF
760 770
>>XP_006713620 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP with co (785 aa)
initn: 2619 init1: 866 opt: 2167 Z-score: 1247.7 bits: 241.6 E(85289): 9.2e-63
Smith-Waterman score: 2835; 59.7% identity (80.6% similar) in 744 aa overlap (1-733:45-753)
10 20 30
pF1KSD MVEAGKAYVSTSRLFVSGVRDLSQQCQGDT
:...:::. ... :..:.:::.: ..:.
XP_006 PRFRAALEEVEGDVAELELKLDKLVKLCIAMIDTGKAFCVANKQFMNGIRDLAQYSSNDA
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KSD VISECLQRFADSLQEVVNYHMILFDQAQRSVRQQLQSFVKEDVRKFKETKKQFDKVREDL
:. : .:.:::::..:.: :::::.:::.. :::.:::::.::::..::::.:: :.
XP_006 VVETSLTKFSDSLQEMINFHTILFDQTQRSIKAQLQNFVKEDLRKFKDAKKQFEKVSEEK
80 90 100 110 120 130
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pF1KSD ELSLVRNAQAPRHRPHEVEEATGALTLTRKCFRHLALDYVLQINVLQAKKKFEILDSMLS
: .::.:::. :.. :::::::. :: :::::::.::::::::::::.:.. ::: ::::
XP_006 ENALVKNAQVQRNKQHEVEEATNILTATRKCFRHIALDYVLQINVLQSKRRSEILKSMLS
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KSD FMHAQSSFFQQGYSLLHQLDPYMKKLAAELDQLVIDSAVEKREMERKHAAIQQRTLLQDF
::.:. .::.:::.:. .: :::: :.:.::.::.:.: ::::::.::..:::. ::
XP_006 FMYAHLAFFHQGYDLFSELGPYMKDLGAQLDRLVVDAAKEKREMEQKHSTIQQK----DF
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260
pF1KSD SYDESKVEFDVDAPSGVVMEGYLFKRASNAFKTWNR-------RWFSIQNSQLVYQKKLK
: :.::.:..::: .:.::::::::::::::::::: :::::::.:::::::.:
XP_006 SSDDSKLEYNVDAANGIVMEGYLFKRASNAFKTWNRKKPDHIRRWFSIQNNQLVYQKKFK
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270 280 290 300 310 320
pF1KSD DALTVVVDDLRLCSVKPCEDIERRFCFEVLSPTKSCMLQADSEKLRQAWVQAVQASIASA
: ::::.:::::.:: ::::::::::::.:::::::::::::::::::..:::.:::.:
XP_006 DNPTVVVEDLRLCTVKHCEDIERRFCFEVVSPTKSCMLQADSEKLRQAWIKAVQTSIATA
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pF1KSD YRESPDSCYSERLDRTASPSTSSIDSATDTRERGVKGESVLQRVQSVAGNSQCGDCGQPD
:::. : ::.::. .::::.:.::.....:. .::::.::::: . ::..: ::: :
XP_006 YREKGDE--SEKLDKKSSPSTGSLDSGNESKEKLLKGESALQRVQCIPGNASCCDCGLAD
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390 400 410 420 430 440
pF1KSD PRWASINLGVLLCIECSGIHRSLGVHCSKVRSLTLDSWEPELLKLMCELGNSAVNQIYEA
:::::::::. ::::::::::::::: :::::::::.::::::::::::::...:..:::
XP_006 PRWASINLGITLCIECSGIHRSLGVHFSKVRSLTLDTWEPELLKLMCELGNDVINRVYEA
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450 460 470 480 490 500
pF1KSD QCEGAGSRKPTASSSRQDKEAWIKDKYVEKKFLRKAPMAPALEAPRRWRVQKCLRPHSSP
. : : .:: .. ::.:::.:. ::::.::. : .. : :.. :: . .::
XP_006 NVEKMGIKKPQPGQ-RQEKEAYIRAKYVERKFVDKYSIS--LSPPEQ---QKKFVSKSSE
490 500 510 520 530 540
510 520 530 540 550
pF1KSD RAPTARRKVRLEPVLPC----VAALSSVGTLDRKFRRDSLFCPDELDSLFSYFDAGAAGA
.... . : ..: ::: . : ....: : .:: : .:.
XP_006 -----EKRLSISKFGPGDQVRASAQSSVRSNDSGIQQSS---DDGRESLPSTVSAN----
550 560 570 580 590
560 570 580 590 600 610
pF1KSD GPRKGAESEESSGEADGDTEAEAWGLADVRELHPGLLAHRAARARDLPALAAALAHGAEV
: : .:. . . : : ..:.::: .::. ..:: .: ::::::.:
XP_006 ----------SLYEPEGERQDSSMFL-DSKHLNPGLQLYRASYEKNLPKMAEALAHGADV
600 610 620 630
620 630 640 650 660 670
pF1KSD NWADAEDEGKTPLVQAVLGGSLIVCEFLLQNGADVNQRDSRGRAPLHHATLLGRTGQVCL
:::..:.. :::.::::::::..:::::::::.::::: .::.::::::.::.::::::
XP_006 NWANSEENKATPLIQAVLGGSLVTCEFLLQNGANVNQRDVQGRGPLHHATVLGHTGQVCL
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680 690 700 710 720 730
pF1KSD FLKRGADQHALDQEQRDPLAIAVQAANADIVTLLRLARMAEEMREAEAAPGPPGALAGSP
::::::.::: :.: .:::.:::.::::::::::::::: :::::.:. : ::
XP_006 FLKRGANQHATDEEGKDPLSIAVEAANADIVTLLRLARMNEEMRESEGLYGQPGDETYQD
700 710 720 730 740 750
740 750
pF1KSD TELQFRRCIQEFISLHLEES
XP_006 IFRDFSQMASNNPEKLNRFQQDSQKF
760 770 780
>>XP_016861535 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP with co (848 aa)
initn: 2587 init1: 716 opt: 2127 Z-score: 1224.9 bits: 237.5 E(85289): 1.7e-61
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10 20 30
pF1KSD MVEAGKAYVSTSRLFVSGVRDLSQQCQGDT
:...:::. ... :..:.:::.: ..:.
XP_016 PRFRAALEEVEGDVAELELKLDKLVKLCIAMIDTGKAFCVANKQFMNGIRDLAQYSSNDA
20 30 40 50 60 70
40 50 60
pF1KSD VISECLQRFADSLQEVVNYH----------------------------MILFDQAQRSVR
:. : .:.:::::..:.: ::::::.:::..
XP_016 VVETSLTKFSDSLQEMINFHTRQGLPLSLRLECRGMIIALLWESSHLRMILFDQTQRSIK
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pF1KSD QQLQSFVKEDVRKFKETKKQFDKVREDLELSLVRNAQAPRHRPHEVEEATGALTLTRKCF
:::.:::::.::::..::::.:: :. : .::.:::. :.. :::::::. :: :::::
XP_016 AQLQNFVKEDLRKFKDAKKQFEKVSEEKENALVKNAQVQRNKQHEVEEATNILTATRKCF
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pF1KSD RHLALDYVLQINVLQAKKKFEILDSMLSFMHAQSSFFQQGYSLLHQLDPYMKKLAAELDQ
::.::::::::::::.:.. ::: ::::::.:. .::.:::.:. .: :::: :.:.::.
XP_016 RHIALDYVLQINVLQSKRRSEILKSMLSFMYAHLAFFHQGYDLFSELGPYMKDLGAQLDR
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pF1KSD LVIDSAVEKREMERKHAAIQQRTLLQDFSYDESKVEFDVDAPSGVVMEGYLFKRASNAFK
::.:.: ::::::.::..:::. ::: :.::.:..::: .:.:::::::::::::::
XP_016 LVVDAAKEKREMEQKHSTIQQK----DFSSDDSKLEYNVDAANGIVMEGYLFKRASNAFK
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250 260 270 280 290
pF1KSD TWNR-------RWFSIQNSQLVYQKKLKDALTVVVDDLRLCSVKPCEDIERRFCFEVLSP
:::: :::::::.:::::::.:: ::::.:::::.:: ::::::::::::.::
XP_016 TWNRKKPDHIRRWFSIQNNQLVYQKKFKDNPTVVVEDLRLCTVKHCEDIERRFCFEVVSP
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300 310 320 330 340 350
pF1KSD TKSCMLQADSEKLRQAWVQAVQASIASAYRESPDSCYSERLDRTASPSTSSIDSATDTRE
:::::::::::::::::..:::.:::.::::. : ::.::. .::::.:.::.....:
XP_016 TKSCMLQADSEKLRQAWIKAVQTSIATAYREKGDE--SEKLDKKSSPSTGSLDSGNESKE
380 390 400 410 420
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pF1KSD RGVKGESVLQRVQSVAGNSQCGDCGQPDPRWASINLGVLLCIECSGIHRSLGVHCSKVRS
. .::::.::::: . ::..: ::: ::::::::::. ::::::::::::::: :::::
XP_016 KLLKGESALQRVQCIPGNASCCDCGLADPRWASINLGITLCIECSGIHRSLGVHFSKVRS
430 440 450 460 470 480
420 430 440 450 460 470
pF1KSD LTLDSWEPELLKLMCELGNSAVNQIYEAQCEGAGSRKPTASSSRQDKEAWIKDKYVEKKF
::::.::::::::::::::...:..:::. : : .:: .. ::.:::.:. ::::.::
XP_016 LTLDTWEPELLKLMCELGNDVINRVYEANVEKMGIKKPQPGQ-RQEKEAYIRAKYVERKF
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pF1KSD LRKAPMAPALEAPRRWRVQKCLRPHSSPRAPTARRKVRLEPVLPCVAALSSVGTLDRKFR
. : .. : :.. :: . .:: . . : . : : ... . . :
XP_016 VDKYSIS--LSPPEQ---QKKFVSKSSEEKRLSISKFGPGDQVRASAQSSVIAVNSDEAR
550 560 570 580 590 600
540 550 560 570 580
pF1KSD RDSLFCPDELDSLFSYFDAGAAGAGPRK-----------GAESEESSGEADGDTEAEAWG
:.::::::::::::::::... . :. : :: :. :.. : :.
XP_016 RESLFCPDELDSLFSYFDTSSKLRSIRSNDSGIQQSSDDGRESLPSTVSANSLYEPEGER
610 620 630 640 650 660
590 600 610 620 630
pF1KSD -----LADVRELHPGLLAHRAARARDLPALAAALAHGAEVNWADAEDEGKTPLVQAVLGG
. : ..:.::: .::. ..:: .: ::::::.::::..:.. :::.::::::
XP_016 QDSSMFLDSKHLNPGLQLYRASYEKNLPKMAEALAHGADVNWANSEENKATPLIQAVLGG
670 680 690 700 710 720
640 650 660 670 680 690
pF1KSD SLIVCEFLLQNGADVNQRDSRGRAPLHHATLLGRTGQVCLFLKRGADQHALDQEQRDPLA
::..:::::::::.::::: .::.::::::.::.::::::::::::.::: :.: .:::.
XP_016 SLVTCEFLLQNGANVNQRDVQGRGPLHHATVLGHTGQVCLFLKRGANQHATDEEGKDPLS
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pF1KSD IAVQAANADIVTLLRLARMAEEMREAEAAPGPPGALAGSPTELQFRRCIQEFISLHLEES
:::.::::::::::::::: :::::.:. : ::
XP_016 IAVEAANADIVTLLRLARMNEEMRESEGLYGQPGDETYQDIFRDFSQMASNNPEKLNRFQ
790 800 810 820 830 840
XP_016 QDSQKF
>>XP_016861538 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP with co (806 aa)
initn: 2675 init1: 716 opt: 2110 Z-score: 1215.5 bits: 235.7 E(85289): 5.8e-61
Smith-Waterman score: 2801; 58.2% identity (78.6% similar) in 765 aa overlap (1-733:45-774)
10 20 30
pF1KSD MVEAGKAYVSTSRLFVSGVRDLSQQCQGDT
:...:::. ... :..:.:::.: ..:.
XP_016 PRFRAALEEVEGDVAELELKLDKLVKLCIAMIDTGKAFCVANKQFMNGIRDLAQYSSNDA
20 30 40 50 60 70
40 50 60
pF1KSD VISECLQRFADSLQEVVNYH----------------------------MILFDQAQRSVR
:. : .:.:::::..:.: ::::::.:::..
XP_016 VVETSLTKFSDSLQEMINFHTRQGLPLSLRLECRGMIIALLWESSHLRMILFDQTQRSIK
80 90 100 110 120 130
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pF1KSD QQLQSFVKEDVRKFKETKKQFDKVREDLELSLVRNAQAPRHRPHEVEEATGALTLTRKCF
:::.:::::.::::..::::.:: :. : .::.:::. :.. :::::::. :: :::::
XP_016 AQLQNFVKEDLRKFKDAKKQFEKVSEEKENALVKNAQVQRNKQHEVEEATNILTATRKCF
140 150 160 170 180 190
130 140 150 160 170 180
pF1KSD RHLALDYVLQINVLQAKKKFEILDSMLSFMHAQSSFFQQGYSLLHQLDPYMKKLAAELDQ
::.::::::::::::.:.. ::: ::::::.:. .::.:::.:. .: :::: :.:.::.
XP_016 RHIALDYVLQINVLQSKRRSEILKSMLSFMYAHLAFFHQGYDLFSELGPYMKDLGAQLDR
200 210 220 230 240 250
190 200 210 220 230 240
pF1KSD LVIDSAVEKREMERKHAAIQQRTLLQDFSYDESKVEFDVDAPSGVVMEGYLFKRASNAFK
::.:.: ::::::.::..:::. ::: :.::.:..::: .:.:::::::::::::::
XP_016 LVVDAAKEKREMEQKHSTIQQK----DFSSDDSKLEYNVDAANGIVMEGYLFKRASNAFK
260 270 280 290 300 310
250 260 270 280 290 300
pF1KSD TWNRRWFSIQNSQLVYQKKLKDALTVVVDDLRLCSVKPCEDIERRFCFEVLSPTKSCMLQ
:::::::::::.:::::::.:: ::::.:::::.:: ::::::::::::.:::::::::
XP_016 TWNRRWFSIQNNQLVYQKKFKDNPTVVVEDLRLCTVKHCEDIERRFCFEVVSPTKSCMLQ
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pF1KSD ADSEKLRQAWVQAVQASIASAYRESPDSCYSERLDRTASPSTSSIDSATDTRERGVKGES
::::::::::..:::.:::.::::. : ::.::. .::::.:.::.....:. .::::
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380 390 400 410 420
370 380 390 400 410 420
pF1KSD VLQRVQSVAGNSQCGDCGQPDPRWASINLGVLLCIECSGIHRSLGVHCSKVRSLTLDSWE
.::::: . ::..: ::: ::::::::::. ::::::::::::::: :::::::::.::
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430 440 450 460 470 480
pF1KSD PELLKLMCELGNSAVNQIYEAQCEGAGSRKPTASSSRQDKEAWIKDKYVEKKFLRKAPMA
::::::::::::...:..:::. : : .:: .. ::.:::.:. ::::.::. : ..
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490 500 510 520 530
pF1KSD PALEAPRRWRVQKCLRPHSSPRAPTARRKVRLEPVLPC----VAALSSVGTLDRKFRRDS
: :.. :: . .:: .... . : ..: ::: . : ....:
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pF1KSD LFCPDELDSLFSYFDAGAAGAGPRKGAESEESSGEADGDTEAEAWGLADVRELHPGLLAH
: .:: : .:. : : .:. . . : : ..:.::: .
XP_016 ---DDGRESLPSTVSAN--------------SLYEPEGERQDSSMFL-DSKHLNPGLQLY
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pF1KSD RAARARDLPALAAALAHGAEVNWADAEDEGKTPLVQAVLGGSLIVCEFLLQNGADVNQRD
::. ..:: .: ::::::.::::..:.. :::.::::::::..:::::::::.:::::
XP_016 RASYEKNLPKMAEALAHGADVNWANSEENKATPLIQAVLGGSLVTCEFLLQNGANVNQRD
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pF1KSD SRGRAPLHHATLLGRTGQVCLFLKRGADQHALDQEQRDPLAIAVQAANADIVTLLRLARM
.::.::::::.::.::::::::::::.::: :.: .:::.:::.:::::::::::::::
XP_016 VQGRGPLHHATVLGHTGQVCLFLKRGANQHATDEEGKDPLSIAVEAANADIVTLLRLARM
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pF1KSD AEEMREAEAAPGPPGALAGSPTELQFRRCIQEFISLHLEES
:::::.:. : ::
XP_016 NEEMRESEGLYGQPGDETYQDIFRDFSQMASNNPEKLNRFQQDSQKF
760 770 780 790 800
759 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 07:02:31 2016 done: Thu Nov 3 07:02:33 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]