Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA1716
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1716, 759 aa
1>>>pF1KSDA1716 759 - 759 aa - 759 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4357+/-0.00108; mu= 15.7705+/- 0.065
mean_var=180.2996+/-35.542, 0's: 0 Z-trim(109.2): 180 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.095516
statistics sampled from 10487 (10710) to 10487 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.685), E-opt: 0.2 (0.329), width: 16
Scan time: 3.620
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS19.2 ACAP3 gene_id:116983|Hs108|chr1 ( 834) 3847 543.7 4.4e-154
CCDS33924.1 ACAP2 gene_id:23527|Hs108|chr3 ( 778) 2260 325.0 2.9e-88
CCDS11101.1 ACAP1 gene_id:9744|Hs108|chr17 ( 740) 1676 244.5 4.7e-64
CCDS235.1 ASAP3 gene_id:55616|Hs108|chr1 ( 903) 590 94.9 6e-19
CCDS44087.1 ASAP3 gene_id:55616|Hs108|chr1 ( 894) 560 90.8 1e-17
CCDS64802.1 AGAP3 gene_id:116988|Hs108|chr7 ( 580) 443 74.4 5.7e-13
CCDS43681.1 AGAP3 gene_id:116988|Hs108|chr7 ( 911) 443 74.7 7.5e-13
CCDS7215.1 AGAP4 gene_id:119016|Hs108|chr10 ( 663) 436 73.5 1.2e-12
CCDS44397.1 AGAP6 gene_id:414189|Hs108|chr10 ( 686) 436 73.5 1.2e-12
CCDS2514.1 AGAP1 gene_id:116987|Hs108|chr2 ( 804) 434 73.4 1.6e-12
CCDS33408.1 AGAP1 gene_id:116987|Hs108|chr2 ( 857) 434 73.4 1.7e-12
CCDS73125.1 AGAP9 gene_id:642517|Hs108|chr10 ( 658) 432 73.0 1.8e-12
CCDS8951.1 AGAP2 gene_id:116986|Hs108|chr12 ( 836) 429 72.7 2.7e-12
CCDS44439.1 AGAP5 gene_id:729092|Hs108|chr10 ( 686) 426 72.2 3.2e-12
CCDS44932.1 AGAP2 gene_id:116986|Hs108|chr12 (1192) 429 72.9 3.4e-12
CCDS46224.1 ASAP2 gene_id:8853|Hs108|chr2 ( 961) 393 67.8 9.2e-11
CCDS1661.1 ASAP2 gene_id:8853|Hs108|chr2 (1006) 393 67.8 9.5e-11
>>CCDS19.2 ACAP3 gene_id:116983|Hs108|chr1 (834 aa)
initn: 3834 init1: 3773 opt: 3847 Z-score: 2879.7 bits: 543.7 E(32554): 4.4e-154
Smith-Waterman score: 4950; 95.7% identity (95.8% similar) in 791 aa overlap (1-758:43-833)
10 20 30
pF1KSD MVEAGKAYVSTSRLFVSGVRDLSQQCQGDT
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 PRFRATIDEVETDVVEIEAKLDKLVKLCSGMVEAGKAYVSTSRLFVSGVRDLSQQCQGDT
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KSD VISECLQRFADSLQEVVNYHMILFDQAQRSVRQQLQSFVKEDVRKFKETKKQFDKVREDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 VISECLQRFADSLQEVVNYHMILFDQAQRSVRQQLQSFVKEDVRKFKETKKQFDKVREDL
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KSD ELSLVRNAQAPRHRPHEVEEATGALTLTRKCFRHLALDYVLQINVLQAKKKFEILDSMLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 ELSLVRNAQAPRHRPHEVEEATGALTLTRKCFRHLALDYVLQINVLQAKKKFEILDSMLS
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KSD FMHAQSSFFQQGYSLLHQLDPYMKKLAAELDQLVIDSAVEKREMERKHAAIQQRTLLQDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 FMHAQSSFFQQGYSLLHQLDPYMKKLAAELDQLVIDSAVEKREMERKHAAIQQRTLLQDF
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KSD SYDESKVEFDVDAPSGVVMEGYLFKRASNAFKTWNRRWFSIQNSQLVYQKKLKDALTVVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 SYDESKVEFDVDAPSGVVMEGYLFKRASNAFKTWNRRWFSIQNSQLVYQKKLKDALTVVV
260 270 280 290 300 310
280 290 300 310 320 330
pF1KSD DDLRLCSVKPCEDIERRFCFEVLSPTKSCMLQADSEKLRQAWVQAVQASIASAYRESPDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 DDLRLCSVKPCEDIERRFCFEVLSPTKSCMLQADSEKLRQAWVQAVQASIASAYRESPDS
320 330 340 350 360 370
340 350 360 370 380 390
pF1KSD CYSERLDRTASPSTSSIDSATDTRERGVKGESVLQRVQSVAGNSQCGDCGQPDPRWASIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 CYSERLDRTASPSTSSIDSATDTRERGVKGESVLQRVQSVAGNSQCGDCGQPDPRWASIN
380 390 400 410 420 430
400 410 420 430 440 450
pF1KSD LGVLLCIECSGIHRSLGVHCSKVRSLTLDSWEPELLKLMCELGNSAVNQIYEAQCEGAGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 LGVLLCIECSGIHRSLGVHCSKVRSLTLDSWEPELLKLMCELGNSAVNQIYEAQCEGAGS
440 450 460 470 480 490
460 470 480 490 500 510
pF1KSD RKPTASSSRQDKEAWIKDKYVEKKFLRKAPMAPALEAPRRWRVQKCLRPHSSPRAPTARR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 RKPTASSSRQDKEAWIKDKYVEKKFLRKAPMAPALEAPRRWRVQKCLRPHSSPRAPTARR
500 510 520 530 540 550
520 530 540 550 560
pF1KSD KVRLEPVLPCVAALSSVGTLDRKFRRDSLFCPDELDSLFSYFDAGAAGAGPR--------
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 KVRLEPVLPCVAALSSVGTLDRKFRRDSLFCPDELDSLFSYFDAGAAGAGPRSLSSDSGL
560 570 580 590 600 610
570 580 590
pF1KSD -------------------------KGAESEESSGEADGDTEAEAWGLADVRELHPGLLA
.::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 GGSSDGSSDVLAFGSGSVVDSVTEEEGAESEESSGEADGDTEAEAWGLADVRELHPGLLA
620 630 640 650 660 670
600 610 620 630 640 650
pF1KSD HRAARARDLPALAAALAHGAEVNWADAEDEGKTPLVQAVLGGSLIVCEFLLQNGADVNQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 HRAARARDLPALAAALAHGAEVNWADAEDEGKTPLVQAVLGGSLIVCEFLLQNGADVNQR
680 690 700 710 720 730
660 670 680 690 700 710
pF1KSD DSRGRAPLHHATLLGRTGQVCLFLKRGADQHALDQEQRDPLAIAVQAANADIVTLLRLAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 DSRGRAPLHHATLLGRTGQVCLFLKRGADQHALDQEQRDPLAIAVQAANADIVTLLRLAR
740 750 760 770 780 790
720 730 740 750
pF1KSD MAEEMREAEAAPGPPGALAGSPTELQFRRCIQEFISLHLEES
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 MAEEMREAEAAPGPPGALAGSPTELQFRRCIQEFISLHLEES
800 810 820 830
>>CCDS33924.1 ACAP2 gene_id:23527|Hs108|chr3 (778 aa)
initn: 2825 init1: 866 opt: 2260 Z-score: 1698.1 bits: 325.0 E(32554): 2.9e-88
Smith-Waterman score: 2859; 60.2% identity (81.4% similar) in 737 aa overlap (1-733:45-746)
10 20 30
pF1KSD MVEAGKAYVSTSRLFVSGVRDLSQQCQGDT
:...:::. ... :..:.:::.: ..:.
CCDS33 PRFRAALEEVEGDVAELELKLDKLVKLCIAMIDTGKAFCVANKQFMNGIRDLAQYSSNDA
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KSD VISECLQRFADSLQEVVNYHMILFDQAQRSVRQQLQSFVKEDVRKFKETKKQFDKVREDL
:. : .:.:::::..:.: :::::.:::.. :::.:::::.::::..::::.:: :.
CCDS33 VVETSLTKFSDSLQEMINFHTILFDQTQRSIKAQLQNFVKEDLRKFKDAKKQFEKVSEEK
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KSD ELSLVRNAQAPRHRPHEVEEATGALTLTRKCFRHLALDYVLQINVLQAKKKFEILDSMLS
: .::.:::. :.. :::::::. :: :::::::.::::::::::::.:.. ::: ::::
CCDS33 ENALVKNAQVQRNKQHEVEEATNILTATRKCFRHIALDYVLQINVLQSKRRSEILKSMLS
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KSD FMHAQSSFFQQGYSLLHQLDPYMKKLAAELDQLVIDSAVEKREMERKHAAIQQRTLLQDF
::.:. .::.:::.:. .: :::: :.:.::.::.:.: ::::::.::..:::. ::
CCDS33 FMYAHLAFFHQGYDLFSELGPYMKDLGAQLDRLVVDAAKEKREMEQKHSTIQQK----DF
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KSD SYDESKVEFDVDAPSGVVMEGYLFKRASNAFKTWNRRWFSIQNSQLVYQKKLKDALTVVV
: :.::.:..::: .:.::::::::::::::::::::::::::.:::::::.:: ::::
CCDS33 SSDDSKLEYNVDAANGIVMEGYLFKRASNAFKTWNRRWFSIQNNQLVYQKKFKDNPTVVV
260 270 280 290 300 310
280 290 300 310 320 330
pF1KSD DDLRLCSVKPCEDIERRFCFEVLSPTKSCMLQADSEKLRQAWVQAVQASIASAYRESPDS
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CCDS33 EDLRLCTVKHCEDIERRFCFEVVSPTKSCMLQADSEKLRQAWIKAVQTSIATAYREKGDE
320 330 340 350 360 370
340 350 360 370 380 390
pF1KSD CYSERLDRTASPSTSSIDSATDTRERGVKGESVLQRVQSVAGNSQCGDCGQPDPRWASIN
::.::. .::::.:.::.....:. .::::.::::: . ::..: ::: ::::::::
CCDS33 --SEKLDKKSSPSTGSLDSGNESKEKLLKGESALQRVQCIPGNASCCDCGLADPRWASIN
380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KSD LGVLLCIECSGIHRSLGVHCSKVRSLTLDSWEPELLKLMCELGNSAVNQIYEAQCEGAGS
::. ::::::::::::::: :::::::::.::::::::::::::...:..:::. : :
CCDS33 LGITLCIECSGIHRSLGVHFSKVRSLTLDTWEPELLKLMCELGNDVINRVYEANVEKMGI
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490 500 510
pF1KSD RKPTASSSRQDKEAWIKDKYVEKKFLRKAPMAPALEAPRRWRVQKCLRPHSSPRAPTARR
.:: .. ::.:::.:. ::::.::. : .. : :.. :: . .:: ..
CCDS33 KKPQPGQ-RQEKEAYIRAKYVERKFVDKYSIS--LSPPEQ---QKKFVSKSSE-----EK
490 500 510 520 530
520 530 540 550 560
pF1KSD KVRLEPVLPC----VAALSSVGTLDRKFRRDSLFCPDELDSLFSYFDAGAAGAGPRKGAE
.. . : ..: ::: . : ....: : .:: : .:.
CCDS33 RLSISKFGPGDQVRASAQSSVRSNDSGIQQSS---DDGRESLPSTVSAN-----------
540 550 560 570 580
570 580 590 600 610 620
pF1KSD SEESSGEADGDTEAEAWGLADVRELHPGLLAHRAARARDLPALAAALAHGAEVNWADAED
: : .:. . . : : ..:.::: .::. ..:: .: ::::::.::::..:.
CCDS33 ---SLYEPEGERQDSSMFL-DSKHLNPGLQLYRASYEKNLPKMAEALAHGADVNWANSEE
590 600 610 620 630
630 640 650 660 670 680
pF1KSD EGKTPLVQAVLGGSLIVCEFLLQNGADVNQRDSRGRAPLHHATLLGRTGQVCLFLKRGAD
. :::.::::::::..:::::::::.::::: .::.::::::.::.::::::::::::.
CCDS33 NKATPLIQAVLGGSLVTCEFLLQNGANVNQRDVQGRGPLHHATVLGHTGQVCLFLKRGAN
640 650 660 670 680 690
690 700 710 720 730 740
pF1KSD QHALDQEQRDPLAIAVQAANADIVTLLRLARMAEEMREAEAAPGPPGALAGSPTELQFRR
::: :.: .:::.:::.::::::::::::::: :::::.:. : ::
CCDS33 QHATDEEGKDPLSIAVEAANADIVTLLRLARMNEEMRESEGLYGQPGDETYQDIFRDFSQ
700 710 720 730 740 750
750
pF1KSD CIQEFISLHLEES
CCDS33 MASNNPEKLNRFQQDSQKF
760 770
>>CCDS11101.1 ACAP1 gene_id:9744|Hs108|chr17 (740 aa)
initn: 1668 init1: 1000 opt: 1676 Z-score: 1263.4 bits: 244.5 E(32554): 4.7e-64
Smith-Waterman score: 2126; 49.3% identity (71.9% similar) in 740 aa overlap (1-733:45-708)
10 20 30
pF1KSD MVEAGKAYVSTSRLFVSGVRDLSQQCQGDT
..:.:. :...:: :: :. ::.. .
CCDS11 PRFRASIELVEAEVSELETRLEKLLKLGTGLLESGRHYLAASRAFVVGICDLARLGPPEP
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KSD VISECLQRFADSLQEVVNYHMILFDQAQRSVRQQLQSFVKEDVRKFKETKKQFDKVREDL
...:::..:. ::.. .. : :.: .:....::.:..::: .: :.:....: . :.:
CCDS11 MMAECLEKFTVSLNHKLDSHAELLDATQHTLQQQIQTLVKEGLRGFREARRDFWRGAESL
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KSD ELSLVRNAQAPRHRPHEVEEATGALTLTRKCFRHLALDYVLQINVLQAKKKFEILDSMLS
: .:..::..::.: .:.::: .:: .: .: ::::.:::::.. :.::.:.. .:
CCDS11 EAALTHNAEVPRRRAQEAEEAGAALRTARAGYRGRALDYALQINVIEDKRKFDIMEFVLR
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KSD FMHAQSSFFQQGYSLLHQLDPYMKKLAAELDQLVIDSAVEKREMERKHAAIQQRTLLQDF
...::.. ::::. : .:. : :.:.:.: :::..:: :::.::..:. ..:. :
CCDS11 LVEAQATHFQQGHEELSRLSQYRKELGAQLHQLVLNSAREKRDMEQRHVLLKQKEL----
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KSD SYDESKVEFDVDAPSGVVMEGYLFKRASNAFKTWNRRWFSIQNSQLVYQKKLKDALTVVV
. .: . . ..:.:.::::.::::::::::::.::::.::..::::::: :: .::::
CCDS11 GGEEPEPSLR-EGPGGLVMEGHLFKRASNAFKTWSRRWFTIQSNQLVYQKKYKDPVTVVV
260 270 280 290 300
280 290 300 310 320
pF1KSD DDLRLCSVKPCEDIERRFCFEVLSPTKSCMLQADSEKLRQAWVQAVQASIASAYRES--P
::::::.:: : : ::::::::.: .:::.::::::.: : ::.:::.:::::. ..
CCDS11 DDLRLCTVKLCPDSERRFCFEVVSTSKSCLLQADSERLLQLWVSAVQSSIASAFSQARLD
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KSD DSCYS--ERLDRTASPSTSSIDSA--TDTRERGVKGESVLQRVQSVAGNSQCGDCGQPDP
:: . . . : :.... :. . :: : :. : : :::: ::.:: :: .: :
CCDS11 DSPRGPGQGSGHLAIGSAATLGSGGMARGREPGGVGHVVAQ-VQSVDGNAQCCDCREPAP
370 380 390 400 410 420
390 400 410 420 430 440
pF1KSD RWASINLGVLLCIECSGIHRSLGVHCSKVRSLTLDSWEPELLKLMCELGNSAVNQIYEAQ
.:::::::: :::.::::::::::: :::::::::::::::.:::::::: .::::::.
CCDS11 EWASINLGVTLCIQCSGIHRSLGVHFSKVRSLTLDSWEPELVKLMCELGNVIINQIYEAR
430 440 450 460 470 480
450 460 470 480 490 500
pF1KSD CEGAGSRKPTASSSRQDKEAWIKDKYVEKKFLRKAPMAPALEAPRRWRVQKCLRPHSSPR
:. . .:: : :::.:::::. :::::::: : : . .. : ::...:
CCDS11 VEAMAVKKPGPSCSRQEKEAWIHAKYVEKKFLTKLPEIRGRRGGRG-------RPRGQPP
490 500 510 520 530 540
510 520 530 540 550 560
pF1KSD APTARRKVRLEPVLPCVAALSSVGTLDRKFRRDSLFCPDELDSLFSYFDAGAAGAGPRKG
.: . ..: .: :.: : :.
CCDS11 VPP-KPSIRPRP-----------GSLRSK---------------------------PEPP
550 560
570 580 590 600 610 620
pF1KSD AESEESSGEADGDTEAEAWGLADVRELHPGLLAHRAA-RARDLPALAAALAHGAEVNWAD
.: :. :::: : ::. . .::..: ::::::.:::..
CCDS11 SE--------------------DLGSLHPGALLFRASGHPPSLPTMADALAHGADVNWVN
570 580 590 600
630 640 650 660 670 680
pF1KSD AEDEGKTPLVQAVLGGSLIVCEFLLQNGADVNQRDSRGRAPLHHATLLGRTGQVCLFLKR
. ... :::.::. ..::..:::::::::.::: :: ::.::::::.::.:: .::::::
CCDS11 GGQDNATPLIQATAANSLLACEFLLQNGANVNQADSAGRGPLHHATILGHTGLACLFLKR
610 620 630 640 650 660
690 700 710 720 730 740
pF1KSD GADQHALDQEQRDPLAIAVQAANADIVTLLRLARMAEEMREAEAAPGPPGALAGSPTELQ
::: : :.: ::::.::...::::::::::::. ::::::: : :
CCDS11 GADLGARDSEGRDPLTIAMETANADIVTLLRLAK----MREAEAAQGQAGDETYLDIFRD
670 680 690 700 710
750
pF1KSD FRRCIQEFISLHLEES
CCDS11 FSLMASDDPEKLSRRSHDLHTL
720 730 740
>>CCDS235.1 ASAP3 gene_id:55616|Hs108|chr1 (903 aa)
initn: 610 init1: 384 opt: 590 Z-score: 453.7 bits: 94.9 E(32554): 6e-19
Smith-Waterman score: 651; 28.5% identity (60.0% similar) in 498 aa overlap (4-483:65-548)
10 20 30
pF1KSD MVEAGKAYVSTSRLFVSGVRDL--SQQCQGDTV
.: ..: . . . .:..: :. :..
CCDS23 RGAALAREEILEGDQAILQRIKKAVRAIHSSGLGHVENEEQYREAVESLGNSHLSQNSHE
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80 90
pF1KSD ISECLQRFADSLQEVVNYHMILFDQAQRSVRQQLQSFVKEDVRKFKE-TKKQFDKVREDL
.: . .: .::. :... . : :.:..: ..: .. .:::..:. .:
CCDS23 LSTGFLNLAVFTREVAALFKNLIQNLNNIVSFPLDSLMKGQLRDGRQDSKKQLEKAWKDY
100 110 120 130 140 150
100 110 120 130 140
pF1KSD ELSLVR-NAQAPRHR-----PHEVEEATGALTLTRKCFRHLALDYVLQINVLQAKKKFEI
: .... . . : : : :: . . :. :. .:.:. . : :. ..
CCDS23 EAKMAKLEKERDRARVTGGIPGEVAQD---MQRERRIFQLHMCEYLLKAGESQMKQGPDF
160 170 180 190 200 210
150 160 170 180 190 200
pF1KSD LDSMLSFMHAQSSFFQQGYSLLHQLDPYMKKLAAELDQL--VIDSAVEKREMERK--HAA
:.:...:.::: .:::.:.. ..: :...:::: . : . .. ..: . : ...
CCDS23 LQSLIKFFHAQHNFFQDGWKAAQSLFPFIEKLAASVHALHQAQEDELQKLTQLRDSLRGT
220 230 240 250 260 270
210 220 230 240 250
pF1KSD IQQRTLLQDFSYDESKVEFDV-----DAPSGVVMEGYLFKRASNAFKTWNRRWFSIQNSQ
.: .. . .: .: ... . :. :.:.:.... ..:..: ... .
CCDS23 LQLESREEHLSRKNSGCGYSIHQHQGNKQFGTEKVGFLYKKSDGIRRVWQKRKCGVKYGC
280 290 300 310 320 330
260 270 280 290 300 310
pF1KSD LVYQKKLKDALTVVVDDLRLCSVKPCEDIERRFCFEVLSPTKSCMLQADSEKLRQAWVQA
:. ... . : . : :.:.: . :.. ::.... ... .::..:. .:::..
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320 330 340 350 360 370
pF1KSD VQASIASAYRESPDSCYSERLDRTASPSTSSIDSATDTRERGVKGESVLQRVQSVAGNSQ
.: .: : : . : . .: :: : . .. .:.: ::::
CCDS23 LQ--------NSKDEALSSAFLGEPSAGPGSWGSAGHDGEPHDLTKLLIAEVKSRPGNSQ
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380 390 400 410 420 430
pF1KSD CGDCGQPDPRWASINLGVLLCIECSGIHRSLGVHCSKVRSLTLDSWEPELLKLMCELGNS
: ::: :: : : ::::: ::.:::.:: :::. :...::::: : : : ..::.
CCDS23 CCDCGAADPTWLSTNLGVLTCIQCSGVHRELGVRFSRMQSLTLDLLGPSELLLALNMGNT
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440 450 460 470 480 490
pF1KSD AVNQIYEAQCEGAGSRKPTASSSRQDKEAWIKDKYVEKKFLRKAPMAPALEAPRRWRVQK
. :...::: . :. ::.: :. .. .: ::::..: :. :
CCDS23 SFNEVMEAQLPSHGGPKPSAESDMGTRRDYIMAKYVEHRFARRCTPEPQRLWTAICNRDL
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500 510 520 530 540 550
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CCDS23 LSVLEAFANGQDFGQPLPGPDAQAPEELVLHLAVKVANQASLPLVDFIIQNGGHLDAKAA
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CCDS44 RGAALAREEILEGDQAILQRIKKAVRAIHSSGLGHVENEEQYREAVESLGNSHLSQNSHE
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40 50 60 70 80 90
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.: . .: .::. :... . : :.:..: ..: .... .. . : ::
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100 110 120 130 140 150
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: :.. : :: . . :. :. .:.:. . : :. ..:.:...:
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160 170 180 190 200
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.::: .:::.:.. ..: :...:::: . : . .. ..: . : ....: ..
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210 220 230 240 250 260
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. .: .: ... . :. :.:.:.... ..:..: ... . :. ...
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270 280 290 300 310 320
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. : . : :.:.: . :.. ::.... ... .::..:. .:::...:
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330 340 350 360 370 380
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CCDS44 ---NSKDEALSSAFLGEPSAGPGSWGSAGHDGEPHDLTKLLIAEVKSRPGNSQCCDCGAA
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:: . :. ::.: :. .. .: ::::..: :. :
CCDS44 AQLPSHGGPKPSAESDMGTRRDYIMAKYVEHRFARRCTPEPQRLWTAICNRDLLSVLEAF
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CCDS44 ANGQDFGQPLPGPDAQAPEELVLHLAVKVANQASLPLVDFIIQNGGHLDAKAADGNTALH
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CCDS64 DSIGSGRAIPIKQGILLKRSGKSLNKEWKKKYVTLCDNGLLTYHPSLHDYMQNIHGKEID
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CCDS64 LLRTTVKVPGKRLPRATPATAPGTSPRANGLSVERSNTQLGGGTEAEESFEFVVVSLTGQ
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::.: :::: .: .::. .:...:. .: :: .. :..:: ::. :: .: ::
CCDS64 LDDWPPELLAVMTAMGNALANSVWEGAL--GGYSKPGPDACREEKERWIRAKYEQKLFL-
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.::. .:...:. .: :: .. :..:: ::. :: .: :: ::. :. ..:
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: .:.:::.:::::.::::::::::::.. :.:::: ::.: :: :.: .::. .:
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CCDS44 QILASLQ----SCES-------SKSKSQLTSQSEAM--------ALQSIQNMRGNAHCVD
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CCDS44 CETQNPKWASLNLGVLMCIECSGIHRSLGPHLSRVRSLELDDWPVELRKVMSSIVNDLAN
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CCDS44 SIWEGSSQ--GQTKPSEKSTREEKERWIRSKYEEKLFL--APL-PCTELSLGQQLLRATA
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CCDS25 PPPSPHANRKKHRRKKSTSNFKADGLSGTAEEQEENFEFIIVSLTGQTWHFEATTYEERD
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CCDS25 RGNSHCVDCETQNPNWASLNLGALMCIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPVELIKVMS
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CCDS25 SIGNELANSVWEESSQG--RTKPSVDSTREEKERWIRAKYEQKLFL--APL-PCTELSLG
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CCDS25 QHLLRATADEDLRTAILLLAHGSRDEVNETCGEGDGRTALHLACRKGNVVLAQLLIWYGV
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]