Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA1711
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1711, 1031 aa
1>>>pF1KSDA1711 1031 - 1031 aa - 1031 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.5257+/-0.00118; mu= 7.1213+/- 0.071
mean_var=188.1893+/-36.995, 0's: 0 Z-trim(108.5): 43 B-trim: 67 in 1/51
Lambda= 0.093493
statistics sampled from 10224 (10249) to 10224 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.658), E-opt: 0.2 (0.315), width: 16
Scan time: 4.410
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS35057.1 ZCCHC6 gene_id:79670|Hs108|chr9 (1495) 6936 949.2 0
CCDS83383.1 ZCCHC6 gene_id:79670|Hs108|chr9 ( 784) 5313 730.1 4.3e-210
CCDS55323.1 ZCCHC6 gene_id:79670|Hs108|chr9 (1259) 3119 434.3 7.6e-121
CCDS30716.1 ZCCHC11 gene_id:23318|Hs108|chr1 (1644) 2037 288.5 8e-77
CCDS30715.1 ZCCHC11 gene_id:23318|Hs108|chr1 (1645) 2025 286.9 2.5e-76
CCDS75266.1 PAPD4 gene_id:167153|Hs108|chr5 ( 480) 549 87.4 7.9e-17
CCDS4048.1 PAPD4 gene_id:167153|Hs108|chr5 ( 484) 548 87.3 8.7e-17
>>CCDS35057.1 ZCCHC6 gene_id:79670|Hs108|chr9 (1495 aa)
initn: 6936 init1: 6936 opt: 6936 Z-score: 5064.4 bits: 949.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6936; 100.0% identity (100.0% similar) in 1031 aa overlap (1-1031:465-1495)
10 20 30
pF1KSD MAIFFLQQRKEPLLPVYLGSWIEGFSLSKL
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 PLVIAFRYWAKLCSIDRPEEGGLPPYVFALMAIFFLQQRKEPLLPVYLGSWIEGFSLSKL
440 450 460 470 480 490
40 50 60 70 80 90
pF1KSD GNFNLQDIEKDVVIWEHTDSAAGDTGITKEEAPRETPIKRGQVSLILDVKHQPSVPVGQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 GNFNLQDIEKDVVIWEHTDSAAGDTGITKEEAPRETPIKRGQVSLILDVKHQPSVPVGQL
500 510 520 530 540 550
100 110 120 130 140 150
pF1KSD WVELLRFYALEFNLADLVISIRVKELVSRELKDWPKKRIAIEDPYSVKRNVARTLNSQPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 WVELLRFYALEFNLADLVISIRVKELVSRELKDWPKKRIAIEDPYSVKRNVARTLNSQPV
560 570 580 590 600 610
160 170 180 190 200 210
pF1KSD FEYILHCLRTTYKYFALPHKITKSSLLKPLNAITCISEHSKEVINHHPDVQTKDDKLKNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 FEYILHCLRTTYKYFALPHKITKSSLLKPLNAITCISEHSKEVINHHPDVQTKDDKLKNS
620 630 640 650 660 670
220 230 240 250 260 270
pF1KSD VLAQGPGATSSAANTCKVQPLTLKETAESFGSPPKEEMGNEHISVHPENSDCIQADVNSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 VLAQGPGATSSAANTCKVQPLTLKETAESFGSPPKEEMGNEHISVHPENSDCIQADVNSD
680 690 700 710 720 730
280 290 300 310 320 330
pF1KSD DYKGDKVYHPETGRKNEKEKVGRKGKHLLTVDQKRGEHVVCGSTRNNESESTLDLEGFQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 DYKGDKVYHPETGRKNEKEKVGRKGKHLLTVDQKRGEHVVCGSTRNNESESTLDLEGFQN
740 750 760 770 780 790
340 350 360 370 380 390
pF1KSD PTAKECEGLATLDNKADLDGESTEGTEELEDSLNHFTHSVQGQTSEMIPSDEEEEDDEEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 PTAKECEGLATLDNKADLDGESTEGTEELEDSLNHFTHSVQGQTSEMIPSDEEEEDDEEE
800 810 820 830 840 850
400 410 420 430 440 450
pF1KSD EEEEEPRLTINQREDEDGMANEDELDNTYTGSGDEDALSEEDDELGEAAKYEDVKECGKH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 EEEEEPRLTINQREDEDGMANEDELDNTYTGSGDEDALSEEDDELGEAAKYEDVKECGKH
860 870 880 890 900 910
460 470 480 490 500 510
pF1KSD VERALLVELNKISLKEENVCEEKNSPVDQSDFFYEFSKLIFTKGKSPTVVCSLCKREGHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 VERALLVELNKISLKEENVCEEKNSPVDQSDFFYEFSKLIFTKGKSPTVVCSLCKREGHL
920 930 940 950 960 970
520 530 540 550 560 570
pF1KSD KKDCPEDFKRIQLEPLPPLTPKFLNILDQVCIQCYKDFSPTIIEDQAREHIRQNLESFIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 KKDCPEDFKRIQLEPLPPLTPKFLNILDQVCIQCYKDFSPTIIEDQAREHIRQNLESFIR
980 990 1000 1010 1020 1030
580 590 600 610 620 630
pF1KSD QDFPGTKLSLFGSSKNGFGFKQSDLDVCMTINGLETAEGLDCVRTIEELARVLRKHSGLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 QDFPGTKLSLFGSSKNGFGFKQSDLDVCMTINGLETAEGLDCVRTIEELARVLRKHSGLR
1040 1050 1060 1070 1080 1090
640 650 660 670 680 690
pF1KSD NILPITTAKVPIVKFFHLRSGLEVDISLYNTLALHNTRLLSAYSAIDPRVKYLCYTMKVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 NILPITTAKVPIVKFFHLRSGLEVDISLYNTLALHNTRLLSAYSAIDPRVKYLCYTMKVF
1100 1110 1120 1130 1140 1150
700 710 720 730 740 750
pF1KSD TKMCDIGDASRGSLSSYAYTLMVLYFLQQRNPPVIPVLQEIYKGEKKPEIFVDGWNIYFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 TKMCDIGDASRGSLSSYAYTLMVLYFLQQRNPPVIPVLQEIYKGEKKPEIFVDGWNIYFF
1160 1170 1180 1190 1200 1210
760 770 780 790 800 810
pF1KSD DQIDELPTYWSECGKNTESVGQLWLGLLRFYTEEFDFKEHVISIRRKSLLTTFKKQWTSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 DQIDELPTYWSECGKNTESVGQLWLGLLRFYTEEFDFKEHVISIRRKSLLTTFKKQWTSK
1220 1230 1240 1250 1260 1270
820 830 840 850 860 870
pF1KSD YIVIEDPFDLNHNLGAGLSRKMTNFIMKAFINGRRVFGIPVKGFPKDYPSKMEYFFDPDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 YIVIEDPFDLNHNLGAGLSRKMTNFIMKAFINGRRVFGIPVKGFPKDYPSKMEYFFDPDV
1280 1290 1300 1310 1320 1330
880 890 900 910 920 930
pF1KSD LTEGELAPNDRCCRICGKIGHFMKDCPMRRKVRRRRDQEDALNQRYPENKEKRSKEDKEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 LTEGELAPNDRCCRICGKIGHFMKDCPMRRKVRRRRDQEDALNQRYPENKEKRSKEDKEI
1340 1350 1360 1370 1380 1390
940 950 960 970 980 990
pF1KSD HNKYTEREVSTKEDKPIQCTPQKAKPMRAAADLGREKILRPPVEKWKRQDDKDLREKRCF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 HNKYTEREVSTKEDKPIQCTPQKAKPMRAAADLGREKILRPPVEKWKRQDDKDLREKRCF
1400 1410 1420 1430 1440 1450
1000 1010 1020 1030
pF1KSD ICGREGHIKKECPQFKGSSGSLSSKYMTQGKASAKRTQQES
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 ICGREGHIKKECPQFKGSSGSLSSKYMTQGKASAKRTQQES
1460 1470 1480 1490
>>CCDS83383.1 ZCCHC6 gene_id:79670|Hs108|chr9 (784 aa)
initn: 5313 init1: 5313 opt: 5313 Z-score: 3885.4 bits: 730.1 E(32554): 4.3e-210
Smith-Waterman score: 5313; 100.0% identity (100.0% similar) in 784 aa overlap (248-1031:1-784)
220 230 240 250 260 270
pF1KSD ATSSAANTCKVQPLTLKETAESFGSPPKEEMGNEHISVHPENSDCIQADVNSDDYKGDKV
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 MGNEHISVHPENSDCIQADVNSDDYKGDKV
10 20 30
280 290 300 310 320 330
pF1KSD YHPETGRKNEKEKVGRKGKHLLTVDQKRGEHVVCGSTRNNESESTLDLEGFQNPTAKECE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 YHPETGRKNEKEKVGRKGKHLLTVDQKRGEHVVCGSTRNNESESTLDLEGFQNPTAKECE
40 50 60 70 80 90
340 350 360 370 380 390
pF1KSD GLATLDNKADLDGESTEGTEELEDSLNHFTHSVQGQTSEMIPSDEEEEDDEEEEEEEEPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 GLATLDNKADLDGESTEGTEELEDSLNHFTHSVQGQTSEMIPSDEEEEDDEEEEEEEEPR
100 110 120 130 140 150
400 410 420 430 440 450
pF1KSD LTINQREDEDGMANEDELDNTYTGSGDEDALSEEDDELGEAAKYEDVKECGKHVERALLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 LTINQREDEDGMANEDELDNTYTGSGDEDALSEEDDELGEAAKYEDVKECGKHVERALLV
160 170 180 190 200 210
460 470 480 490 500 510
pF1KSD ELNKISLKEENVCEEKNSPVDQSDFFYEFSKLIFTKGKSPTVVCSLCKREGHLKKDCPED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 ELNKISLKEENVCEEKNSPVDQSDFFYEFSKLIFTKGKSPTVVCSLCKREGHLKKDCPED
220 230 240 250 260 270
520 530 540 550 560 570
pF1KSD FKRIQLEPLPPLTPKFLNILDQVCIQCYKDFSPTIIEDQAREHIRQNLESFIRQDFPGTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 FKRIQLEPLPPLTPKFLNILDQVCIQCYKDFSPTIIEDQAREHIRQNLESFIRQDFPGTK
280 290 300 310 320 330
580 590 600 610 620 630
pF1KSD LSLFGSSKNGFGFKQSDLDVCMTINGLETAEGLDCVRTIEELARVLRKHSGLRNILPITT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 LSLFGSSKNGFGFKQSDLDVCMTINGLETAEGLDCVRTIEELARVLRKHSGLRNILPITT
340 350 360 370 380 390
640 650 660 670 680 690
pF1KSD AKVPIVKFFHLRSGLEVDISLYNTLALHNTRLLSAYSAIDPRVKYLCYTMKVFTKMCDIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 AKVPIVKFFHLRSGLEVDISLYNTLALHNTRLLSAYSAIDPRVKYLCYTMKVFTKMCDIG
400 410 420 430 440 450
700 710 720 730 740 750
pF1KSD DASRGSLSSYAYTLMVLYFLQQRNPPVIPVLQEIYKGEKKPEIFVDGWNIYFFDQIDELP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 DASRGSLSSYAYTLMVLYFLQQRNPPVIPVLQEIYKGEKKPEIFVDGWNIYFFDQIDELP
460 470 480 490 500 510
760 770 780 790 800 810
pF1KSD TYWSECGKNTESVGQLWLGLLRFYTEEFDFKEHVISIRRKSLLTTFKKQWTSKYIVIEDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 TYWSECGKNTESVGQLWLGLLRFYTEEFDFKEHVISIRRKSLLTTFKKQWTSKYIVIEDP
520 530 540 550 560 570
820 830 840 850 860 870
pF1KSD FDLNHNLGAGLSRKMTNFIMKAFINGRRVFGIPVKGFPKDYPSKMEYFFDPDVLTEGELA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 FDLNHNLGAGLSRKMTNFIMKAFINGRRVFGIPVKGFPKDYPSKMEYFFDPDVLTEGELA
580 590 600 610 620 630
880 890 900 910 920 930
pF1KSD PNDRCCRICGKIGHFMKDCPMRRKVRRRRDQEDALNQRYPENKEKRSKEDKEIHNKYTER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 PNDRCCRICGKIGHFMKDCPMRRKVRRRRDQEDALNQRYPENKEKRSKEDKEIHNKYTER
640 650 660 670 680 690
940 950 960 970 980 990
pF1KSD EVSTKEDKPIQCTPQKAKPMRAAADLGREKILRPPVEKWKRQDDKDLREKRCFICGREGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 EVSTKEDKPIQCTPQKAKPMRAAADLGREKILRPPVEKWKRQDDKDLREKRCFICGREGH
700 710 720 730 740 750
1000 1010 1020 1030
pF1KSD IKKECPQFKGSSGSLSSKYMTQGKASAKRTQQES
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 IKKECPQFKGSSGSLSSKYMTQGKASAKRTQQES
760 770 780
>>CCDS55323.1 ZCCHC6 gene_id:79670|Hs108|chr9 (1259 aa)
initn: 3188 init1: 3119 opt: 3119 Z-score: 2283.1 bits: 434.3 E(32554): 7.6e-121
Smith-Waterman score: 5771; 88.1% identity (88.5% similar) in 1018 aa overlap (14-1031:355-1259)
10 20 30 40
pF1KSD MAIFFLQQRKEPLLPVYLGSWIEGFSLSKLGNFNLQDIEKDVV
. . . . ::::::::::::::::::::::
CCDS55 NVFQHKLPDCSLRLYGSSCSRLGFKNSDVNIDIQFPAIIEGFSLSKLGNFNLQDIEKDVV
330 340 350 360 370 380
50 60 70 80 90 100
pF1KSD IWEHTDSAAGDTGITKEEAPRETPIKRGQVSLILDVKHQPSVPVGQLWVELLRFYALEFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 IWEHTDSAAGDTGITKEEAPRETPIKRGQVSLILDVKHQPSVPVGQLWVELLRFYALEFN
390 400 410 420 430 440
110 120 130 140 150 160
pF1KSD LADLVISIRVKELVSRELKDWPKKRIAIEDPYSVKRNVARTLNSQPVFEYILHCLRTTYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LADLVISIRVKELVSRELKDWPKKRIAIEDPYSVKRNVARTLNSQPVFEYILHCLRTTYK
450 460 470 480 490 500
170 180 190 200 210 220
pF1KSD YFALPHKITKSSLLKPLNAITCISEHSKEVINHHPDVQTKDDKLKNSVLAQGPGATSSAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 YFALPHKITKSSLLKPLNAITCISEHSKEVINHHPDVQTKDDKLKNSVLAQGPGATSSAA
510 520 530 540 550 560
230 240 250 260 270 280
pF1KSD NTCKVQPLTLKETAESFGSPPKEEMGNEHISVHPENSDCIQADVNSDDYKGDKVYHPETG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NTCKVQPLTLKETAESFGSPPKEEMGNEHISVHPENSDCIQADVNSDDYKGDKVYHPETG
570 580 590 600 610 620
290 300 310 320 330 340
pF1KSD RKNEKEKVGRKGKHLLTVDQKRGEHVVCGSTRNNESESTLDLEGFQNPTAKECEGLATLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RKNEKEKVGRKGKHLLTVDQKRGEHVVCGSTRNNESESTLDLEGFQNPTAKECEGLATLD
630 640 650 660 670 680
350 360 370 380 390 400
pF1KSD NKADLDGESTEGTEELEDSLNHFTHSVQGQTSEMIPSDEEEEDDEEEEEEEEPRLTINQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NKADLDGESTEGTEELEDSLNHFTHSVQGQTSEMIPSDEEEEDDEEEEEEEEPRLTINQR
690 700 710 720 730 740
410 420 430 440 450 460
pF1KSD EDEDGMANEDELDNTYTGSGDEDALSEEDDELGEAAKYEDVKECGKHVERALLVELNKIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EDEDGMANEDELDNTYTGSGDEDALSEEDDELGEAAKYEDVKECGKHVERALLVELNKIS
750 760 770 780 790 800
470 480 490 500 510 520
pF1KSD LKEENVCEEKNSPVDQSDFFYEFSKLIFTKGKSPTVVCSLCKREGHLKKDCPEDFKRIQL
::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LKEENVCEEKNSPVDQSDFFYEFSKLIFTKGK----------------------------
810 820 830
530 540 550 560 570 580
pF1KSD EPLPPLTPKFLNILDQVCIQCYKDFSPTIIEDQAREHIRQNLESFIRQDFPGTKLSLFGS
CCDS55 ------------------------------------------------------------
590 600 610 620 630 640
pF1KSD SKNGFGFKQSDLDVCMTINGLETAEGLDCVRTIEELARVLRKHSGLRNILPITTAKVPIV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 -------------------------GLDCVRTIEELARVLRKHSGLRNILPITTAKVPIV
840 850 860 870
650 660 670 680 690 700
pF1KSD KFFHLRSGLEVDISLYNTLALHNTRLLSAYSAIDPRVKYLCYTMKVFTKMCDIGDASRGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KFFHLRSGLEVDISLYNTLALHNTRLLSAYSAIDPRVKYLCYTMKVFTKMCDIGDASRGS
880 890 900 910 920 930
710 720 730 740 750 760
pF1KSD LSSYAYTLMVLYFLQQRNPPVIPVLQEIYKGEKKPEIFVDGWNIYFFDQIDELPTYWSEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LSSYAYTLMVLYFLQQRNPPVIPVLQEIYKGEKKPEIFVDGWNIYFFDQIDELPTYWSEC
940 950 960 970 980 990
770 780 790 800 810 820
pF1KSD GKNTESVGQLWLGLLRFYTEEFDFKEHVISIRRKSLLTTFKKQWTSKYIVIEDPFDLNHN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 GKNTESVGQLWLGLLRFYTEEFDFKEHVISIRRKSLLTTFKKQWTSKYIVIEDPFDLNHN
1000 1010 1020 1030 1040 1050
830 840 850 860 870 880
pF1KSD LGAGLSRKMTNFIMKAFINGRRVFGIPVKGFPKDYPSKMEYFFDPDVLTEGELAPNDRCC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LGAGLSRKMTNFIMKAFINGRRVFGIPVKGFPKDYPSKMEYFFDPDVLTEGELAPNDRCC
1060 1070 1080 1090 1100 1110
890 900 910 920 930 940
pF1KSD RICGKIGHFMKDCPMRRKVRRRRDQEDALNQRYPENKEKRSKEDKEIHNKYTEREVSTKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RICGKIGHFMKDCPMRRKVRRRRDQEDALNQRYPENKEKRSKEDKEIHNKYTEREVSTKE
1120 1130 1140 1150 1160 1170
950 960 970 980 990 1000
pF1KSD DKPIQCTPQKAKPMRAAADLGREKILRPPVEKWKRQDDKDLREKRCFICGREGHIKKECP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DKPIQCTPQKAKPMRAAADLGREKILRPPVEKWKRQDDKDLREKRCFICGREGHIKKECP
1180 1190 1200 1210 1220 1230
1010 1020 1030
pF1KSD QFKGSSGSLSSKYMTQGKASAKRTQQES
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QFKGSSGSLSSKYMTQGKASAKRTQQES
1240 1250
>>CCDS30716.1 ZCCHC11 gene_id:23318|Hs108|chr1 (1644 aa)
initn: 2494 init1: 1400 opt: 2037 Z-score: 1492.7 bits: 288.5 E(32554): 8e-77
Smith-Waterman score: 2442; 43.7% identity (64.2% similar) in 1026 aa overlap (1-1006:525-1376)
10 20 30
pF1KSD MAIFFLQQRKEPLLPVYLGSWIEGFSLSKL
:..::::::: :::: ::::::::. ...
CCDS30 PLVLAFRYWAKLCYIDSQTDGGIPSYCFALMVMFFLQQRKPPLLPCLLGSWIEGFDPKRM
500 510 520 530 540 550
40 50 60 70 80
pF1KSD GNFNLQDI-EKDVVIWEHTDSAAGDTGITKEE--APRETP---IKRGQV---SLILDVKH
.:.:. : :. : :: ..:.: . . :: : . : :. .. : . ::
CCDS30 DDFQLKGIVEEKFVKWECNSSSATEKNSIAEENKAKADQPKDDTKKTETDNQSNAMKEKH
560 570 580 590 600 610
90 100 110 120 130
pF1KSD QPS---------VPVGQLWVELLRFYALEFNLADLVISIRVKELVSRELKDWPKKRIAIE
: : .::::.:::.::.:.: : . :: .:......:: :.:::.:::::
CCDS30 GKSPLALETPNRVSLGQLWLELLKFYTLDFALEEYVICVRIQDILTRENKNWPKRRIAIE
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140 150 160 170 180 190
pF1KSD DPYSVKRNVARTLNSQPVFEYILHCLRTTYKYFALPHKITKSSLLKPLNAITCISEHSKE
::.::::::::.:::: :.::... .:..:.::: :. ::.. .:
CCDS30 DPFSVKRNVARSLNSQLVYEYVVERFRAAYRYFACPQ--TKGG--------------NKS
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200 210 220 230 240 250
pF1KSD VINHHPDVQTKDDKLKNSVLAQGPGATSS-AANTCKVQPLTLKETAESFGSPPKEEMGNE
.. : . .. :... . : ... :.: : . : ::.:.... .:.
CCDS30 TV----DFKKRE---KGKISNKKPVKSNNMATNGC----ILLGETTEKINAE-REQ----
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:. .. :: ..:. :
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:: . ::. :. : .. :: . :.: .:..
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. ... :: : ..: . . ... : : .. : .: : :. ... ..
CCDS30 -KQDDLAPS----ETCLKKELSQCNCIDLSKSPDPDKSTGTDCRSNLETESSHQSVCTDT
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pF1KSD DDELGEAAKYEDVKECGKHVERALLVELNKISLKEENVCEEKNSPVDQSDFFYEFSKLIF
. . ::... :: .. : :... ..: :.:.:.
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:.:: ::.:::.::..:: :.::::::..:.:.::::.: .: .::: :: .:. ..::
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pF1KSD IIEDQAREHIRQNLESFIRQDFP-GTKLSLFGSSKNGFGFKQSDLDVCMTINGLETAEGL
:.. ::.: .::.::.... ..: :::::::::::..::::.:::..: :.:: :
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pF1KSD DCVRTIEELARVLRKHSGLRNILPITTAKVPIVKFFHLRSGLEVDISLYNTLALHNTRLL
.: . ::.::..:..: :::::::::::::::::: : ::::: ::::::::: ::::.:
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pF1KSD SAYSAIDPRVKYLCYTMKVFTKMCDIGDASRGSLSSYAYTLMVLYFLQQRNPPVIPVLQE
..:.::::::.:: ::::::.: :::::::::::::::: ::::::::::.:::::::::
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pF1KSD IYKGEKKPEIFVDGWNIYFFDQIDELPTYWSECGKNTESVGQLWLGLLRFYTEEFDFKEH
:. :.. :. .::::: .:::. .:: ::::::.:.:::::::::::::::::.
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pF1KSD VISIRRKSLLTTFKKQWTSKYIVIEDPFDLNHNLGAGLSRKMTNFIMKAFINGRRVFGIP
:::::.:.:::::.:::::: :.::::::::::::::.::::::::::::::::..:: :
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pF1KSD VKGFPKDYPSKMEYFFDPDVLTEGELAPNDRCCRICGKIGHFMKDCPMRRKVRRRRDQED
.: . ::::: :::.:::::::::::.::::::.::::: :... :
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pF1KSD ALNQRYPENKEKRSKEDKEIHNKYTEREVSTKEDKPIQCTPQKAKPMRAAADLGREKILR
:.: :.:.:: ...:.: : . :
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pF1KSD PPVEKWKRQDDKDLREKRCFICGREGHIKKECPQFKGSSGSLSSKYMTQGKASAKRTQQE
: . .: .: :. :::::: ::...:::. :
CCDS30 -PRDLHDTRDFRDPRDLRCFICGDAGHVRRECPEVKLARQRNSSVAAAQLVRNLVNAQQV
1350 1360 1370 1380 1390 1400
pF1KSD S
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10 20 30
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140 150 160 170 180 190
pF1KSD DPYSVKRNVARTLNSQPVFEYILHCLRTTYKYFALPHKITKSSLLKPLNAITCISEHSKE
::.::::::::.:::: :.::... .:..:.::: :. ::.. .:
CCDS30 DPFSVKRNVARSLNSQLVYEYVVERFRAAYRYFACPQ--TKGG--------------NKS
680 690 700 710
200 210 220 230 240 250
pF1KSD VINHHPDVQTKDDKLKNSVLAQGPGATSS-AANTCKVQPLTLKETAESFGSPPKEEMGNE
.. : . .. :... . : ... :.: : . : ::.:.... .:.
CCDS30 TV----DFKKRE---KGKISNKKPVKSNNMATNGC----ILLGETTEKINAE-REQ----
720 730 740 750 760
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pF1KSD HISVHPENSDCIQADVNSDDYKGDKVYHPETGRKNEKEKVGRKGKHLLTVDQKRGEHVVC
:. .. :: ..:. :
CCDS30 --PVQCDEMDC--------------------------------------TSQR------C
770
320 330 340 350 360 370
pF1KSD GSTRNNESESTLDLEGFQNPTAKECEGLATLDNKADLDGESTEGTEELEDSLNHFTHSVQ
:: . ::. :. : .. :: . :.: .:..
CCDS30 IIDNNNLLVNELDFA----------------DHGQDSSSLSTSKSSEIEPKLDK------
780 790 800 810
380 390 400 410 420 430
pF1KSD GQTSEMIPSDEEEEDDEEEEEEEEPRLTINQREDEDGMANEDELDNTYTGSGDEDALSEE
. ... :: : ..: . . ... : : .. : .: : :. ... ..
CCDS30 -KQDDLAPS----ETCLKKELSQCNCIDLSKSPDPDKSTGTDCRSNLETESSHQSVCTDT
820 830 840 850 860
440 450 460 470 480 490
pF1KSD DDELGEAAKYEDVKECGKHVERALLVELNKISLKEENVCEEKNSPVDQSDFFYEFSKLIF
. . ::... :: .. : :... ..: :.:.:.
CCDS30 SATSCNCKATEDASD------------LN----------DDDNLPTQE--LYYVFDKFIL
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CCDS30 TSGKPPTIVCSICKKDGHSKNDCPEDFRKIDLKPLPPMTNRFREILDLVCKRCFDELSPP
910 920 930 940 950 960
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CCDS30 NCKEIIENLAKILKRHPGLRNILPITTAKVPIVKFEHRRSGLEGDISLYNTLAQHNTRML
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pF1KSD SAYSAIDPRVKYLCYTMKVFTKMCDIGDASRGSLSSYAYTLMVLYFLQQRNPPVIPVLQE
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CCDS30 ATYAAIDPRVQYLGYTMKVFAKRCDIGDASRGSLSSYAYILMVLYFLQQRKPPVIPVLQE
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pF1KSD IYKGEKKPEIFVDGWNIYFFDQIDELPTYWSECGKNTESVGQLWLGLLRFYTEEFDFKEH
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CCDS30 IFDGKQIPQRMVDGWNAFFFDKTEELKKRLPSLGKNTESLGELWLGLLRFYTEEFDFKEY
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CCDS30 VISIRQKKLLTTFEKQWTSKCIAIEDPFDLNHNLGAGVSRKMTNFIMKAFINGRKLFGTP
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CCDS30 F--YPL-IGREAEYFFDSRVLTDGELAPNDRCCRVCGKIGHYMKDCPKRKS---------
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pF1KSD ALNQRYPENKEKRSKEDKEIHNKYTEREVSTKEDKPIQCTPQKAKPMRAAADLGREKILR
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CCDS30 SLLFRL---KKKDSEEEKE----------GNEEEKD----------SRDVLD--------
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pF1KSD PPVEKWKRQDDKDLREKRCFICGREGHIKKECPQFKGSSGSLSSKYMTQGKASAKRTQQE
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CCDS30 -PRDLHDTRDFRDPRDLRCFICGDAGHVRRECPEVKLARQRNSSVAAAQLVRNLVNAQQV
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pF1KSD S
CCDS30 AGSAQQQGDQSIRTRQSSECSESPSYSPQPQPFPQNSSQSAAITQPSSQPGSQPKLGPPQ
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CCDS75 VVNQIVPLSGERRYSMPPLFHTHYVPDIVRCVPPFREIAFLEPREITLPEAKDKLSQQIL
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pF1KSD LLRFYTEEFDFKEHVISIRR-KSLLTTFKKQWTSKYIVIEDPFDLNHNLGAGLSRKMTNF
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pF1KSD IMKAFINGRRVFGIPVKGFPKDYPSKMEYFFDPDVLTEGELAPNDRCCRICGKIGHFMKD
: :.
CCDS75 IKDQFLKSWHRLKNKRDLNSILPVRAAVLKR
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490 500 510 520 530 540
pF1KSD YEFSKLIFTKGKSPTVVCSLCKREGHLKKDCPEDFKRIQ-LEPLPPLTPKFLNILDQVCI
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CCDS40 VVNQIVPLSGERRYSMPPLFHTHYVPDIVRCVPPFREIAFLEPREITLPEAKDKLSQQIL
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CCDS40 ELFETCQQQISDLKKKELCRTQLQREIQLLFPQSRLFLVGSSLNGFGTRSSDGDLCLVVK
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CCDS40 EEPCFFQVNQKTEARHILTLVHKHFCTRLSGYIERPQLIRAKVPIVKFRDKVSCVEFDLN
230 240 250 260 270 280
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CCDS40 VNNIVGIRNTFLLRTYAYLENRVRPLVLVIKKWASHHQINDASRGTLSSYSLVLMVLHYL
290 300 310 320 330 340
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CCDS40 QTLPEPILPSLQKIY-----PESFSPAIQLHLVHQAPCNVPPYLS---KNESNLGDLLLG
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CCDS40 FLKYYATEFDWNSQMISVREAKAIPRPDGIEWRNKYICVEEPFDGTNTARAVHEKQKFDM
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: :.
CCDS40 IKDQFLKSWHRLKNKRDLNSILPVRAAVLKR
460 470 480
1031 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 07:00:35 2016 done: Thu Nov 3 07:00:36 2016
Total Scan time: 4.410 Total Display time: 0.250
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]