Result of FASTA (omim) for
pF1KSDA1691
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1691, 523 aa
1>>>pF1KSDA1691 523 - 523 aa - 523 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5796+/-0.000333; mu= 17.7643+/- 0.021
mean_var=85.0069+/-17.012, 0's: 0 Z-trim(116.8): 14 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.139106
statistics sampled from 28287 (28299) to 28287 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.699), E-opt: 0.2 (0.332), width: 16
Scan time: 10.990
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_079526 (OMIM: 608919) protein tweety homolog 3 ( 523) 3535 719.3 6.7e-207
XP_011513837 (OMIM: 608919) PREDICTED: protein twe ( 526) 3393 690.8 2.5e-198
XP_016868145 (OMIM: 608919) PREDICTED: protein twe ( 491) 1895 390.2 7.6e-108
XP_016868144 (OMIM: 608919) PREDICTED: protein twe ( 494) 1753 361.7 2.9e-99
NP_116035 (OMIM: 608855) protein tweety homolog 2 ( 534) 1385 287.9 5.2e-77
NP_001317382 (OMIM: 608855) protein tweety homolog ( 513) 1246 260.0 1.3e-68
NP_065710 (OMIM: 605784) protein tweety homolog 1 ( 450) 1032 217.0 9.7e-56
NP_001188390 (OMIM: 605784) protein tweety homolog ( 451) 1030 216.6 1.3e-55
NP_001005367 (OMIM: 605784) protein tweety homolog ( 460) 1022 215.0 4e-55
XP_016882515 (OMIM: 605784) PREDICTED: protein twe ( 365) 855 181.4 4.1e-45
XP_016882514 (OMIM: 605784) PREDICTED: protein twe ( 375) 845 179.4 1.7e-44
NP_443101 (OMIM: 608855) protein tweety homolog 2 ( 213) 583 126.6 7.3e-29
>>NP_079526 (OMIM: 608919) protein tweety homolog 3 [Hom (523 aa)
initn: 3535 init1: 3535 opt: 3535 Z-score: 3835.5 bits: 719.3 E(85289): 6.7e-207
Smith-Waterman score: 3535; 100.0% identity (100.0% similar) in 523 aa overlap (1-523:1-523)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAGVSYAAPWWVSLLHRLPHFDLSWEATSSQFRPEDTDYQQALLLLGAAALACLALDLLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 MAGVSYAAPWWVSLLHRLPHFDLSWEATSSQFRPEDTDYQQALLLLGAAALACLALDLLF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LLFYSFWLCCRRRKSEEHLDADCCCTAWCVIIATLVCSAGIAVGFYGNGETSDGIHRATY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 LLFYSFWLCCRRRKSEEHLDADCCCTAWCVIIATLVCSAGIAVGFYGNGETSDGIHRATY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD SLRHANRTVAGVQDRVWDTAVGLNHTAEPSLQTLERQLAGRPEPLRAVQRLQGLLETLLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 SLRHANRTVAGVQDRVWDTAVGLNHTAEPSLQTLERQLAGRPEPLRAVQRLQGLLETLLG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD YTAAIPFWRNTAVSLEVLAEQVDLYDWYRWLGYLGLLLLDVIICLLVLVGLIRSSKGILV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 YTAAIPFWRNTAVSLEVLAEQVDLYDWYRWLGYLGLLLLDVIICLLVLVGLIRSSKGILV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD GVCLLGVLALVISWGALGLELAVSVGSSDFCVDPDAYVTKMVEEYSVLSGDILQYYLACS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 GVCLLGVLALVISWGALGLELAVSVGSSDFCVDPDAYVTKMVEEYSVLSGDILQYYLACS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD PRAANPFQQKLSGSHKALVEMQDVVAELLRTVPWEQPATKDPLLRVQEVLNGTEVNLQHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 PRAANPFQQKLSGSHKALVEMQDVVAELLRTVPWEQPATKDPLLRVQEVLNGTEVNLQHL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD TALVDCRSLHLDYVQALTGFCYDGVEGLIYLALFSFVTALMFSSIVCSVPHTWQQKRGPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 TALVDCRSLHLDYVQALTGFCYDGVEGLIYLALFSFVTALMFSSIVCSVPHTWQQKRGPD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD EDGEEEAAPGPRQAHDSLYRVHMPSLYSCGSSYGSETSIPAAAHTVSNAPVTEYMSQNAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 EDGEEEAAPGPRQAHDSLYRVHMPSLYSCGSSYGSETSIPAAAHTVSNAPVTEYMSQNAN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520
pF1KSD FQNPRCENTPLIGRESPPPSYTSSMRAKYLATSQPRPDSSGSH
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 FQNPRCENTPLIGRESPPPSYTSSMRAKYLATSQPRPDSSGSH
490 500 510 520
>>XP_011513837 (OMIM: 608919) PREDICTED: protein tweety (526 aa)
initn: 3384 init1: 3384 opt: 3393 Z-score: 3681.5 bits: 690.8 E(85289): 2.5e-198
Smith-Waterman score: 3393; 96.9% identity (98.1% similar) in 522 aa overlap (1-520:1-522)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAGVSYAAPWWVSLLHRLPHFDLSWEATSSQFRPEDTDYQQALLLLGAAALACLALDLLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MAGVSYAAPWWVSLLHRLPHFDLSWEATSSQFRPEDTDYQQALLLLGAAALACLALDLLF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LLFYSFWLCCRRRKSEEHLDADCCCTAWCVIIATLVCSAGIAVGFYGNGETSDGIHRATY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LLFYSFWLCCRRRKSEEHLDADCCCTAWCVIIATLVCSAGIAVGFYGNGETSDGIHRATY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD SLRHANRTVAGVQDRVWDTAVGLNHTAEPSLQTLERQLAGRPEPLRAVQRLQGLLETLLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SLRHANRTVAGVQDRVWDTAVGLNHTAEPSLQTLERQLAGRPEPLRAVQRLQGLLETLLG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD YTAAIPFWRNTAVSLEVLAEQVDLYDWYRWLGYLGLLLLDVIICLLVLVGLIRSSKGILV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YTAAIPFWRNTAVSLEVLAEQVDLYDWYRWLGYLGLLLLDVIICLLVLVGLIRSSKGILV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD GVCLLGVLALVISWGALGLELAVSVGSSDFCVDPDAYVTKMVEEYSVLSGDILQYYLACS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GVCLLGVLALVISWGALGLELAVSVGSSDFCVDPDAYVTKMVEEYSVLSGDILQYYLACS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD PRAANPFQQKLSGSHKALVEMQDVVAELLRTVPWEQPATKDPLLRVQEVLNGTEVNLQHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PRAANPFQQKLSGSHKALVEMQDVVAELLRTVPWEQPATKDPLLRVQEVLNGTEVNLQHL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD TALVDCRSLHLDYVQALTGFCYDGVEGLIYLALFSFVTALMFSSIVCSVPHTWQQKRGPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TALVDCRSLHLDYVQALTGFCYDGVEGLIYLALFSFVTALMFSSIVCSVPHTWQQKRGPD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD EDGEEEAAPGPRQAHDSLYRVHMPSLYSCGSSYGSETSIPAAAHTVSNAPVTEYMSQNAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EDGEEEAAPGPRQAHDSLYRVHMPSLYSCGSSYGSETSIPAAAHTVSNAPVTEYMSQNAN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520
pF1KSD FQNPRCENTPLIGRESPPPS-YTSSMRAKYLATSQPRP-DSSGSH
:::::::::::::::::::: : ... . : : .: ::.
XP_011 FQNPRCENTPLIGRESPPPSRYLAALDSGSHAGWQFKPMDSARTLW
490 500 510 520
>>XP_016868145 (OMIM: 608919) PREDICTED: protein tweety (491 aa)
initn: 3319 init1: 1895 opt: 1895 Z-score: 2057.2 bits: 390.2 E(85289): 7.6e-108
Smith-Waterman score: 3259; 93.9% identity (93.9% similar) in 523 aa overlap (1-523:1-491)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAGVSYAAPWWVSLLHRLPHFDLSWEATSSQFRPEDTDYQQALLLLGAAALACLALDLLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MAGVSYAAPWWVSLLHRLPHFDLSWEATSSQFRPEDTDYQQALLLLGAAALACLALDLLF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LLFYSFWLCCRRRKSEEHLDADCCCTAWCVIIATLVCSAGIAVGFYGNGETSDGIHRATY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LLFYSFWLCCRRRKSEEHLDADCCCTAWCVIIATLVCSAGIAVGFYGNGETSDGIHRATY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD SLRHANRTVAGVQDRVWDTAVGLNHTAEPSLQTLERQLAGRPEPLRAVQRLQGLLETLLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SLRHANRTVAGVQDRVWDTAVGLNHTAEPSLQTLERQLAGRPEPLRAVQRLQGLLETLLG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD YTAAIPFWRNTAVSLEVLAEQVDLYDWYRWLGYLGLLLLDVIICLLVLVGLIRSSKGILV
:::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YTAAIPFWRNTAVSLEVLAEQVDLYDWYR-------------------------------
190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KSD GVCLLGVLALVISWGALGLELAVSVGSSDFCVDPDAYVTKMVEEYSVLSGDILQYYLACS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 -VCLLGVLALVISWGALGLELAVSVGSSDFCVDPDAYVTKMVEEYSVLSGDILQYYLACS
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KSD PRAANPFQQKLSGSHKALVEMQDVVAELLRTVPWEQPATKDPLLRVQEVLNGTEVNLQHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PRAANPFQQKLSGSHKALVEMQDVVAELLRTVPWEQPATKDPLLRVQEVLNGTEVNLQHL
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KSD TALVDCRSLHLDYVQALTGFCYDGVEGLIYLALFSFVTALMFSSIVCSVPHTWQQKRGPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TALVDCRSLHLDYVQALTGFCYDGVEGLIYLALFSFVTALMFSSIVCSVPHTWQQKRGPD
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470 480
pF1KSD EDGEEEAAPGPRQAHDSLYRVHMPSLYSCGSSYGSETSIPAAAHTVSNAPVTEYMSQNAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EDGEEEAAPGPRQAHDSLYRVHMPSLYSCGSSYGSETSIPAAAHTVSNAPVTEYMSQNAN
390 400 410 420 430 440
490 500 510 520
pF1KSD FQNPRCENTPLIGRESPPPSYTSSMRAKYLATSQPRPDSSGSH
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FQNPRCENTPLIGRESPPPSYTSSMRAKYLATSQPRPDSSGSH
450 460 470 480 490
>>XP_016868144 (OMIM: 608919) PREDICTED: protein tweety (494 aa)
initn: 3168 init1: 1744 opt: 1753 Z-score: 1903.1 bits: 361.7 E(85289): 2.9e-99
Smith-Waterman score: 3117; 90.8% identity (92.0% similar) in 522 aa overlap (1-520:1-490)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAGVSYAAPWWVSLLHRLPHFDLSWEATSSQFRPEDTDYQQALLLLGAAALACLALDLLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MAGVSYAAPWWVSLLHRLPHFDLSWEATSSQFRPEDTDYQQALLLLGAAALACLALDLLF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LLFYSFWLCCRRRKSEEHLDADCCCTAWCVIIATLVCSAGIAVGFYGNGETSDGIHRATY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LLFYSFWLCCRRRKSEEHLDADCCCTAWCVIIATLVCSAGIAVGFYGNGETSDGIHRATY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD SLRHANRTVAGVQDRVWDTAVGLNHTAEPSLQTLERQLAGRPEPLRAVQRLQGLLETLLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SLRHANRTVAGVQDRVWDTAVGLNHTAEPSLQTLERQLAGRPEPLRAVQRLQGLLETLLG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD YTAAIPFWRNTAVSLEVLAEQVDLYDWYRWLGYLGLLLLDVIICLLVLVGLIRSSKGILV
:::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YTAAIPFWRNTAVSLEVLAEQVDLYDWYR-------------------------------
190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KSD GVCLLGVLALVISWGALGLELAVSVGSSDFCVDPDAYVTKMVEEYSVLSGDILQYYLACS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 -VCLLGVLALVISWGALGLELAVSVGSSDFCVDPDAYVTKMVEEYSVLSGDILQYYLACS
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KSD PRAANPFQQKLSGSHKALVEMQDVVAELLRTVPWEQPATKDPLLRVQEVLNGTEVNLQHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PRAANPFQQKLSGSHKALVEMQDVVAELLRTVPWEQPATKDPLLRVQEVLNGTEVNLQHL
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KSD TALVDCRSLHLDYVQALTGFCYDGVEGLIYLALFSFVTALMFSSIVCSVPHTWQQKRGPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TALVDCRSLHLDYVQALTGFCYDGVEGLIYLALFSFVTALMFSSIVCSVPHTWQQKRGPD
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470 480
pF1KSD EDGEEEAAPGPRQAHDSLYRVHMPSLYSCGSSYGSETSIPAAAHTVSNAPVTEYMSQNAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EDGEEEAAPGPRQAHDSLYRVHMPSLYSCGSSYGSETSIPAAAHTVSNAPVTEYMSQNAN
390 400 410 420 430 440
490 500 510 520
pF1KSD FQNPRCENTPLIGRESPPPS-YTSSMRAKYLATSQPRP-DSSGSH
:::::::::::::::::::: : ... . : : .: ::.
XP_016 FQNPRCENTPLIGRESPPPSRYLAALDSGSHAGWQFKPMDSARTLW
450 460 470 480 490
>>NP_116035 (OMIM: 608855) protein tweety homolog 2 isof (534 aa)
initn: 1144 init1: 519 opt: 1385 Z-score: 1503.5 bits: 287.9 E(85289): 5.2e-77
Smith-Waterman score: 1385; 41.8% identity (72.6% similar) in 521 aa overlap (2-513:4-521)
10 20 30 40 50
pF1KSD MAGVSYAAPWWVSLLHRLPHFDLSWEATSSQFRPEDTDYQQALLLLGAAALACLALDL
: :.: ::::: :: .:: : . ..: : : : .::..::.:: .: .::.:.:
NP_116 MQAARVDYIAPWWVVWLHSVPHVGLRLQPVNSTFSPGDESYQESLLFLGLVAAVCLGLNL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD LFLLFYSFWLC-CRRRKSEEHLDADCCCTAWCVIIATLVCSAGIAVGFYGNGETSDGIHR
.::. : : ::: . . . :: .: ...: :.: :...::::::.::.:: ..
NP_116 IFLVAYLVCACHCRRDDAVQTKQHHSCCITWTAVVAGLICCAAVGVGFYGNSETNDGAYQ
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KSD ATYSLRHANRTVAGVQDRVWDTAVGLNHTAEPSLQTLERQLAGRPEPLRAVQRLQGLLET
::: ::.: .:.. : :. .. : : : . .:.: . :.... .: . .
NP_116 LMYSLDDANHTFSGIDALVSGTTQKMKVDLEQHLARLSEIFAARGDYLQTLKFIQQMAGS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KSD LLGYTAAIPFWRNTAVSLEVLAEQVDLYDWYRWLGYLGLLLLDVIICLLVLVGLIRSSKG
.. ...: ::.... : :..:. ..::::.:: :..::..:::.. .:: . ::
NP_116 VVVQLSGLPVWREVTMELTKLSDQTGYVEYYRWLSYLLLFILDLVICLIACLGLAKRSKC
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KSD ILVGVCLLGVLALVISWGALGLELAVSVGSSDFCVDPDAYVTKMVEEYSVLSGDILQYYL
.:... :.:.:..::..:. . ...:..::::: ::... ...: . .: .. .:::
NP_116 LLASMLCCGALSLLLSWASLAADGSAAVATSDFCVAPDTFILNVTE--GQISTEVTRYYL
250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD ACSPRAANPFQQKLSGSHKALVEMQDVVAELLR-TVPWEQPATKDPLLRVQEVLNGTEVN
:: ...:::: :. ..::. :: :: ::. .:: . : .: :: .: .::..: .
NP_116 YCSQSGSSPFQQTLTTFQRALTTMQIQVAGLLQFAVPLFSTAEED-LLAIQLLLNSSESS
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD LQHLTALVDCRSLHLDYVQALTGFCYDGVEGLIYLALFSFVTALMFSSIVCSVPHTWQQ-
:..:::.::::.:: ::..::.:.::::..::.::.::::..:: ::...:. :..:..
NP_116 LHQLTAMVDCRGLHKDYLDALAGICYDGLQGLLYLGLFSFLAALAFSTMICAGPRAWKHF
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KSD -KRGPDEDGEEEAAP-GP---RQAHDSLYRVHMPSLYSCGSSYGSETSIPAAAHTVSNAP
:. : : .. : .: :.: : : .. :. : .:. ::.::. :.:.::::
NP_116 TTRNRDYDDIDDDDPFNPQAWRMAAHSPPRGQLHSFCSYSSGLGSQTSLQPPAQTISNAP
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520
pF1KSD VTEYMSQNANF-QNPRCENTPLIGRESPPPSYTSSMRAKYLATSQPRPDSSGSH
:.:::.: : .::: ::.::::: ::::.:. :::: ::...
NP_116 VSEYMNQAMLFGRNPRYENVPLIGRASPPPTYSPSMRATYLSVADEHLRHYGNQFPA
480 490 500 510 520 530
>>NP_001317382 (OMIM: 608855) protein tweety homolog 2 i (513 aa)
initn: 1144 init1: 519 opt: 1246 Z-score: 1353.0 bits: 260.0 E(85289): 1.3e-68
Smith-Waterman score: 1246; 41.4% identity (73.2% similar) in 481 aa overlap (42-513:23-500)
20 30 40 50 60 70
pF1KSD VSLLHRLPHFDLSWEATSSQFRPEDTDYQQALLLLGAAALACLALDLLFLLFYSFWLC-C
.::.:: .: .::.:.:.::. : : :
NP_001 MSVVGQDRKSGSGCYLRWLLFLSLLFLGLVAAVCLGLNLIFLVAYLVCACHC
10 20 30 40 50
80 90 100 110 120 130
pF1KSD RRRKSEEHLDADCCCTAWCVIIATLVCSAGIAVGFYGNGETSDGIHRATYSLRHANRTVA
:: . . . :: .: ...: :.: :...::::::.::.:: .. ::: ::.: .
NP_001 RRDDAVQTKQHHSCCITWTAVVAGLICCAAVGVGFYGNSETNDGAYQLMYSLDDANHTFS
60 70 80 90 100 110
140 150 160 170 180 190
pF1KSD GVQDRVWDTAVGLNHTAEPSLQTLERQLAGRPEPLRAVQRLQGLLETLLGYTAAIPFWRN
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NP_001 GIDALVSGTTQKMKVDLEQHLARLSEIFAARGDYLQTLKFIQQMAGSVVVQLSGLPVWRE
120 130 140 150 160 170
200 210 220 230 240 250
pF1KSD TAVSLEVLAEQVDLYDWYRWLGYLGLLLLDVIICLLVLVGLIRSSKGILVGVCLLGVLAL
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NP_001 VTMELTKLSDQTGYVEYYRWLSYLLLFILDLVICLIACLGLAKRSKCLLASMLCCGALSL
180 190 200 210 220 230
260 270 280 290 300 310
pF1KSD VISWGALGLELAVSVGSSDFCVDPDAYVTKMVEEYSVLSGDILQYYLACSPRAANPFQQK
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NP_001 LLSWASLAADGSAAVATSDFCVAPDTFILNVTE--GQISTEVTRYYLYCSQSGSSPFQQT
240 250 260 270 280 290
320 330 340 350 360
pF1KSD LSGSHKALVEMQDVVAELLR-TVPWEQPATKDPLLRVQEVLNGTEVNLQHLTALVDCRSL
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NP_001 LTTFQRALTTMQIQVAGLLQFAVPLFSTAEED-LLAIQLLLNSSESSLHQLTAMVDCRGL
300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KSD HLDYVQALTGFCYDGVEGLIYLALFSFVTALMFSSIVCSVPHTWQQ--KRGPDEDGEEEA
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NP_001 HKDYLDALAGICYDGLQGLLYLGLFSFLAALAFSTMICAGPRAWKHFTTRNRDYDDIDDD
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KSD AP-GP---RQAHDSLYRVHMPSLYSCGSSYGSETSIPAAAHTVSNAPVTEYMSQNANF-Q
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NP_001 DPFNPQAWRMAAHSPPRGQLHSFCSYSSGLGSQTSLQPPAQTISNAPVSEYMNQAMLFGR
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pF1KSD NPRCENTPLIGRESPPPSYTSSMRAKYLATSQPRPDSSGSH
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NP_001 NPRYENVPLIGRASPPPTYSPSMRATYLSVADEHLRHYGNQFPA
470 480 490 500 510
>>NP_065710 (OMIM: 605784) protein tweety homolog 1 isof (450 aa)
initn: 1039 init1: 838 opt: 1032 Z-score: 1121.7 bits: 217.0 E(85289): 9.7e-56
Smith-Waterman score: 1032; 38.1% identity (69.8% similar) in 443 aa overlap (6-445:7-448)
10 20 30 40 50
pF1KSD MAGVSYAAPWWVSLLHRLPHFDLSWEATSSQFRPEDTDYQQALLLLGAAALACLALDLL
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60 70 80 90 100 110
pF1KSD FLLFYSFWLCCRRRKSEEHLDADC---CCTAWCVIIATLVCSAGIAVGFYGNGETSDGIH
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NP_065 FIAVYLIRFCCCRPPEPPGSKIPSPGGGCVTWSCIVALLAGCTGIGIGFYGNSETSDGVS
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pF1KSD RATYSLRHANRTVAGVQDRVWDTAVGLNHTAEPSLQTLERQLAGRPEPLRAVQRLQGLLE
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NP_065 QLSSALLHANHTLSTIDHLVLETVERLGEAVRTELTTLEEVLEPRTELVAAARGARRQAE
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180 190 200 210 220 230
pF1KSD TLLGYTAAIPFWRNTAVSLEVLAEQVDLYDWYRWLGYLGLLLLDVIICLLVLVGLIRSSK
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NP_065 AAAQQLQGLAFWQGVPLSPLQVAENVSFVEEYRWLAYVLLLLLELLVCLFTLLGLAKQSK
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240 250 260 270 280 290
pF1KSD GILVGVCLLGVLALVISWGALGLELAVSVGSSDFCVDPDAYVTKMVEEYSVLSGDILQYY
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NP_065 WLVIVMTVMSLLVLVLSWGSMGLEAATAVGLSDFCSNPDPYVLNLTQEETGLSSDILSYY
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300 310 320 330 340 350
pF1KSD LACSPRAANPFQQKLSGSHKALVEMQDVVAELLRTVPWEQPATKDPLLRVQEVLNGTEVN
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NP_065 LLCNRAVSNPFQQRLTLSQRALANIHSQLLGLEREAVPQFPSAQKPLLSLEETLNVTEGN
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360 370 380 390 400 410
pF1KSD LQHLTALVDCRSLHLDYVQALTGFCYDGVEGLIYLALFSFVTALMFSSIVCSVPHTWQQK
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NP_065 FHQLVALLHCRSLHKDYGAALRGLCEDALEGLLFLLLFSLLSAGALATALCSLPRAWAL-
370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KSD RGPDEDGEEEAAPGPRQAHDSLYRVHMPSLYSCGSSYGSETSIPAAAHTVSNAPVTEYMS
:..: .. : . ..: :. :
NP_065 FPPSDDYDDTDDDDPFNPQESKRFVQWQSSI
420 430 440 450
>>NP_001188390 (OMIM: 605784) protein tweety homolog 1 i (451 aa)
initn: 1039 init1: 838 opt: 1030 Z-score: 1119.5 bits: 216.6 E(85289): 1.3e-55
Smith-Waterman score: 1030; 38.8% identity (70.4% similar) in 433 aa overlap (6-433:7-439)
10 20 30 40 50
pF1KSD MAGVSYAAPWWVSLLHRLPHFDLSWEATSSQFRPEDTDYQQALLLLGAAALACLALDLL
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NP_001 MGAPPGYRPSAWVHLLHQLPRADFQLRPVPSVFAPQEQEYQQALLLVAALAGLGLGLSLI
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pF1KSD FLLFYSFWLCCRRRKSEEHLDADC---CCTAWCVIIATLVCSAGIAVGFYGNGETSDGIH
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NP_001 FIAVYLIRFCCCRPPEPPGSKIPSPGGGCVTWSCIVALLAGCTGIGIGFYGNSETSDGVS
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pF1KSD RATYSLRHANRTVAGVQDRVWDTAVGLNHTAEPSLQTLERQLAGRPEPLRAVQRLQGLLE
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NP_001 QLSSALLHANHTLSTIDHLVLETVERLGEAVRTELTTLEEVLEPRTELVAAARGARRQAE
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pF1KSD TLLGYTAAIPFWRNTAVSLEVLAEQVDLYDWYRWLGYLGLLLLDVIICLLVLVGLIRSSK
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NP_001 AAAQQLQGLAFWQGVPLSPLQVAENVSFVEEYRWLAYVLLLLLELLVCLFTLLGLAKQSK
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KSD GILVGVCLLGVLALVISWGALGLELAVSVGSSDFCVDPDAYVTKMVEEYSVLSGDILQYY
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NP_001 WLVIVMTVMSLLVLVLSWGSMGLEAATAVGLSDFCSNPDPYVLNLTQEETGLSSDILSYY
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pF1KSD LACSPRAANPFQQKLSGSHKALVEMQDVVAELLRTVPWEQPATKDPLLRVQEVLNGTEVN
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NP_001 LLCNRAVSNPFQQRLTLSQRALANIHSQLLGLEREAVPQFPSAQKPLLSLEETLNVTEGN
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360 370 380 390 400 410
pF1KSD LQHLTALVDCRSLHLDYVQALTGFCYDGVEGLIYLALFSFVTALMFSSIVCSVPHTWQQ-
...:.::. ::::: :: :: :.: :..:::..: :::...: ... .::.:..:
NP_001 FHQLVALLHCRSLHKDYGAALRGLCEDALEGLLFLLLFSLLSAGALATALCSLPRAWALF
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pF1KSD KRGPDEDGEEEAAP-GPRQAHDSLYRVHMPSLYSCGSSYGSETSIPAAAHTVSNAPVTEY
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NP_001 PPSDDYDDTDDDDPFNPQQESKRFVQWQSSI
430 440 450
>>NP_001005367 (OMIM: 605784) protein tweety homolog 1 i (460 aa)
initn: 1039 init1: 838 opt: 1022 Z-score: 1110.7 bits: 215.0 E(85289): 4e-55
Smith-Waterman score: 1022; 39.7% identity (71.8% similar) in 411 aa overlap (6-413:7-417)
10 20 30 40 50
pF1KSD MAGVSYAAPWWVSLLHRLPHFDLSWEATSSQFRPEDTDYQQALLLLGAAALACLALDLL
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NP_001 MGAPPGYRPSAWVHLLHQLPRADFQLRPVPSVFAPQEQEYQQALLLVAALAGLGLGLSLI
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD FLLFYSFWLCCRRRKSEEHLDADC---CCTAWCVIIATLVCSAGIAVGFYGNGETSDGIH
:. : . .:: : :..: :.: :. .::..:::::.:::::.
NP_001 FIAVYLIRFCCCRPPEPPGSKIPSPGGGCVTWSCIVALLAGCTGIGIGFYGNSETSDGVS
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KSD RATYSLRHANRTVAGVQDRVWDTAVGLNHTAEPSLQTLERQLAGRPEPLRAVQRLQGLLE
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NP_001 QLSSALLHANHTLSTIDHLVLETVERLGEAVRTELTTLEEVLEPRTELVAAARGARRQAE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KSD TLLGYTAAIPFWRNTAVSLEVLAEQVDLYDWYRWLGYLGLLLLDVIICLLVLVGLIRSSK
. .. ::... .: .::.:.. . ::::.:. ::::....::..:.:: ..::
NP_001 AAAQQLQGLAFWQGVPLSPLQVAENVSFVEEYRWLAYVLLLLLELLVCLFTLLGLAKQSK
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KSD GILVGVCLLGVLALVISWGALGLELAVSVGSSDFCVDPDAYVTKMVEEYSVLSGDILQYY
... . ....:.::.:::..::: :..:: :::: .:: :: ....: . ::.:::.::
NP_001 WLVIVMTVMSLLVLVLSWGSMGLEAATAVGLSDFCSNPDPYVLNLTQEETGLSSDILSYY
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KSD LACSPRAANPFQQKLSGSHKALVEMQDVVAELLRTVPWEQPATKDPLLRVQEVLNGTEVN
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NP_001 LLCNRAVSNPFQQRLTLSQRALANIHSQLLGLEREAVPQFPSAQKPLLSLEETLNVTEGN
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KSD LQHLTALVDCRSLHLDYVQALTGFCYDGVEGLIYLALFSFVTALMFSSIVCSVPHTWQQK
...:.::. ::::: :: :: :.: :..:::..: :::...: ... .::.:..:
NP_001 FHQLVALLHCRSLHKDYGAALRGLCEDALEGLLFLLLFSLLSAGALATALCSLPRAWALF
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KSD RGPDEDGEEEAAPGPRQAHDSLYRVHMPSLYSCGSSYGSETSIPAAAHTVSNAPVTEYMS
NP_001 PPRNPSALCSGSRLSEPLLPAGLEPGSPLRSFPGCRRRPH
430 440 450 460
>>XP_016882515 (OMIM: 605784) PREDICTED: protein tweety (365 aa)
initn: 875 init1: 838 opt: 855 Z-score: 931.0 bits: 181.4 E(85289): 4.1e-45
Smith-Waterman score: 855; 38.9% identity (73.1% similar) in 350 aa overlap (96-445:16-363)
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pF1KSD FWLCCRRRKSEEHLDADCCCTAWCVIIATLVCSAGIAVGFYGNGETSDGIHRATYSLRHA
.:. ::..:::::.:::::. . . .: ::
XP_016 MEKVRLWRGSESRAAICT-GIGIGFYGNSETSDGVSQLSSALLHA
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130 140 150 160 170 180
pF1KSD NRTVAGVQDRVWDTAVGLNHTAEPSLQTLERQLAGRPEPLRAVQRLQGLLETLLGYTAAI
:.:.. .. : .:. :..... : :::. : : : . :.. . :. ..
XP_016 NHTLSTIDHLVLETVERLGEAVRTELTTLEEVLEPRTELVAAARGARRQAEAAAQQLQGL
50 60 70 80 90 100
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pF1KSD PFWRNTAVSLEVLAEQVDLYDWYRWLGYLGLLLLDVIICLLVLVGLIRSSKGILVGVCLL
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XP_016 AFWQGVPLSPLQVAENVSFVEEYRWLAYVLLLLLELLVCLFTLLGLAKQSKWLVIVMTVM
110 120 130 140 150 160
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pF1KSD GVLALVISWGALGLELAVSVGSSDFCVDPDAYVTKMVEEYSVLSGDILQYYLACSPRAAN
..:.::.:::..::: :..:: :::: .:: :: ....: . ::.:::.::: :. ..:
XP_016 SLLVLVLSWGSMGLEAATAVGLSDFCSNPDPYVLNLTQEETGLSSDILSYYLLCNRAVSN
170 180 190 200 210 220
310 320 330 340 350 360
pF1KSD PFQQKLSGSHKALVEMQDVVAELLRTVPWEQPATKDPLLRVQEVLNGTEVNLQHLTALVD
::::.:. :..::..... . : : . . :... ::: ..:.:: :: :...:.::.
XP_016 PFQQRLTLSQRALANIHSQLLGLEREAVPQFPSAQKPLLSLEETLNVTEGNFHQLVALLH
230 240 250 260 270 280
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pF1KSD CRSLHLDYVQALTGFCYDGVEGLIYLALFSFVTALMFSSIVCSVPHTWQQKRGPDEDGEE
::::: :: :: :.: :..:::..: :::...: ... .::.:..: :..: ..
XP_016 CRSLHKDYGAALRGLCEDALEGLLFLLLFSLLSAGALATALCSLPRAWAL-FPPSDDYDD
290 300 310 320 330 340
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pF1KSD EAAPGPRQAHDSLYRVHMPSLYSCGSSYGSETSIPAAAHTVSNAPVTEYMSQNANFQNPR
: . ..: :. :
XP_016 TDDDDPFNPQESKRFVQWQSSI
350 360
523 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 06:56:17 2016 done: Thu Nov 3 06:56:19 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]