FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1623, 1232 aa
1>>>pF1KSDA1623 1232 - 1232 aa - 1232 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.7760+/-0.00043; mu= -2.8049+/- 0.027
mean_var=559.3636+/-114.165, 0's: 0 Z-trim(125.0): 88 B-trim: 0 in 0/62
Lambda= 0.054228
statistics sampled from 47682 (47779) to 47682 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.804), E-opt: 0.2 (0.56), width: 16
Scan time: 20.830
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_066010 (OMIM: 610216) anoctamin-8 [Homo sapiens (1232) 8462 677.9 1.1e-193
XP_016882537 (OMIM: 610216) PREDICTED: anoctamin-8 (1114) 7507 603.1 3.2e-171
XP_011532187 (OMIM: 613726,613728) PREDICTED: anoc ( 678) 782 76.7 5.7e-13
NP_001191763 (OMIM: 613726,613728) anoctamin-10 is ( 470) 453 50.8 2.5e-05
NP_001191762 (OMIM: 613726,613728) anoctamin-10 is ( 549) 453 50.9 2.8e-05
NP_001333395 (OMIM: 613726,613728) anoctamin-10 is ( 594) 453 50.9 2.9e-05
NP_001333398 (OMIM: 613726,613728) anoctamin-10 is ( 594) 453 50.9 2.9e-05
XP_016862211 (OMIM: 613726,613728) PREDICTED: anoc ( 594) 453 50.9 2.9e-05
NP_001191761 (OMIM: 613726,613728) anoctamin-10 is ( 594) 453 50.9 2.9e-05
NP_001333397 (OMIM: 613726,613728) anoctamin-10 is ( 660) 453 51.0 3.1e-05
NP_060545 (OMIM: 613726,613728) anoctamin-10 isofo ( 660) 453 51.0 3.1e-05
NP_001333394 (OMIM: 613726,613728) anoctamin-10 is ( 621) 361 43.8 0.0044
XP_016862207 (OMIM: 613726,613728) PREDICTED: anoc ( 639) 358 43.5 0.0053
NP_001191760 (OMIM: 613726,613728) anoctamin-10 is ( 627) 354 43.2 0.0065
>>NP_066010 (OMIM: 610216) anoctamin-8 [Homo sapiens] (1232 aa)
initn: 8462 init1: 8462 opt: 8462 Z-score: 3598.2 bits: 677.9 E(85289): 1.1e-193
Smith-Waterman score: 8462; 100.0% identity (100.0% similar) in 1232 aa overlap (1-1232:1-1232)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAEAASGAGGTSLEGERGKRPPPEGEPAAPASGVLDKLFGKRLLQAGRYLVSHKAWMKTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 PTENCDVLMTFPDTTDDHTLLWLLNHIRVGIPELIVQVRHHRHTRAYAFFVTATYESLLR
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130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 GEALHNVRFLEDQPIIPELAARGIIQQVFPVHEQRILNRLMKSWVQAVCENQPLDDICDY
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 EWKRRGAELAYKWGTLDSPGEAVEEPRPQFRGVRRISPITRAEEFYYPPWKRLLFQLLVS
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370 380 390 400 410 420
pF1KSD LPLCLACLVCVFLLMLGCFQLQELVLSVKGLPRLARFLPKVMLALLVSVSAEGYKKLAIW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 LPLCLACLVCVFLLMLGCFQLQELVLSVKGLPRLARFLPKVMLALLVSVSAEGYKKLAIW
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430 440 450 460 470 480
pF1KSD LNDMENYRLESAYEKHLIIKVVLFQFVNSYLSLFYIGFYLKDMERLKEMLATLLITRQFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 LNDMENYRLESAYEKHLIIKVVLFQFVNSYLSLFYIGFYLKDMERLKEMLATLLITRQFL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD QNVREVLQPHLYRRLGRGELGLRAVWELARALLGLLSLRRPAPRRLEPQADEGGGGGSGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 QNVREVLQPHLYRRLGRGELGLRAVWELARALLGLLSLRRPAPRRLEPQADEGGGGGSGG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 EGEEGGLLDCGLRLKKVSFAERGAGRRRPGPSPEALLEEGSPTMVEKGLEPGVFTLAEED
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 DEAEGAPGSPEREPPAILFRRAGGEGRDQGPDGGPDPEPGSNSDSTRRQRRQNRSSWIDP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 PEEEHSPQLTQAELESCMKKYEDTFQDYQEMFVQFGYVVLFSSAFPLAALCALVNNLIEI
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pF1KSD RSDAFKLCTGLQRPFGQRVESIGQWQKVMEAMGVLAIVVNCYLIGQCGQLQRLFPWLSPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 AAIVSVVVLEHFALLLKYLIHVAIPDIPGWVAEEMAKLEYQRREAFKRHERQAQHRYQQQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 ERPKRPGSLLAPNNVMKLKQIIPLQGKFLSSGATSSLAAAGAGATTRPPPAQSPTGSDTR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KSD PPTPPAGCWQWDGPWGCGGEGAAPRQALAAAECPPCAMAGPPPAPQPLPGDASFYSLPPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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1210 1220 1230
pF1KSD PLPPTSDPLETPAPSPSPSPSPQAVCWPSGWH
::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 PLPPTSDPLETPAPSPSPSPSPQAVCWPSGWH
1210 1220 1230
>>XP_016882537 (OMIM: 610216) PREDICTED: anoctamin-8 iso (1114 aa)
initn: 7683 init1: 7507 opt: 7507 Z-score: 3194.9 bits: 603.1 E(85289): 3.2e-171
Smith-Waterman score: 7507; 99.8% identity (99.8% similar) in 1114 aa overlap (1-1114:1-1114)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAEAASGAGGTSLEGERGKRPPPEGEPAAPASGVLDKLFGKRLLQAGRYLVSHKAWMKTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MAEAASGAGGTSLEGERGKRPPPEGEPAAPASGVLDKLFGKRLLQAGRYLVSHKAWMKTV
10 20 30 40 50 60
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pF1KSD PTENCDVLMTFPDTTDDHTLLWLLNHIRVGIPELIVQVRHHRHTRAYAFFVTATYESLLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PTENCDVLMTFPDTTDDHTLLWLLNHIRVGIPELIVQVRHHRHTRAYAFFVTATYESLLR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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190 200 210 220 230 240
pF1KSD GEALHNVRFLEDQPIIPELAARGIIQQVFPVHEQRILNRLMKSWVQAVCENQPLDDICDY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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XP_016 EGEEGGLLDCGLRLKKVSFAERGAGRRRPGPSPEALLEEGSPTMVEKGLEPGVFTLAEED
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PEEEHSPQLTQAELESCMKKYEDTFQDYQEMFVQFGYVVLFSSAFPLAALCALVNNLIEI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AAIVSVVVLEHFALLLKYLIHVAIPDIPGWVAEEMAKLEYQRREAFKRHERQAQHRYQQQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QRRRREEEERQRHAEHHARREHDSGGREEARAEGSGLDPATSSEKASAKAKGSTAGGHGP
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970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD ERPKRPGSLLAPNNVMKLKQIIPLQGKFLSSGATSSLAAAGAGATTRPPPAQSPTGSDTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ERPKRPGSLLAPNNVMKLKQIIPLQGKFLSSGATSSLAAAGAGATTRPPPAQSPTGSDTR
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD LPAFLSFKFLKSPETRRDSERSHSPPKAFHAGKLFPFGGTRAEPGSNGAGGQARPDGTPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LPAFLSFKFLKSPETRRDSERSHSPPKAFHAGKLFPFGGTRAEPGSNGAGGQARPDGTPS
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD SGSSRVQRSGPVDEALAEELEAPRPEEEGSGTALAPVGAPALRTRRSRSPAPPPPMPLPR
::::::::::::::::::::::::::::::: :
XP_016 SGSSRVQRSGPVDEALAEELEAPRPEEEGSGHKL
1090 1100 1110
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD PPTPPAGCWQWDGPWGCGGEGAAPRQALAAAECPPCAMAGPPPAPQPLPGDASFYSLPPP
>>XP_011532187 (OMIM: 613726,613728) PREDICTED: anoctami (678 aa)
initn: 1006 init1: 264 opt: 782 Z-score: 353.9 bits: 76.7 E(85289): 5.7e-13
Smith-Waterman score: 782; 37.3% identity (65.7% similar) in 399 aa overlap (109-496:70-460)
80 90 100 110 120 130
pF1KSD TLLWLLNHIRVGIPELIVQVRHHRHTRAYAFFVTATYESLLRGADELGLRKAVKAEFGGG
..: :. .: ::. .:: :: .
XP_011 IAKKKDGGAQLLFRPLLNKYEQETLENQNLYLVGASKIRMLLGAEAVGL---VKECNDNT
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KSD TRGFSCEEDFIYENVE-SELRFFTSQERQSIIRFWLQNLRAKQGEALHN---VRFLEDQP
:.:. . ... . .. :.: : : ::. :.:::::. . . . ... .
XP_011 MRAFTYRTRQNFKGFDDNNDDFLTMAECQFIIKHELENLRAKDEKMIPGYPQAKLYPGKS
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KSD IIPELAARGIIQQVFPVHEQRILNRLMKSW-VQAVCENQPLDDICDYFGVKIAMYFAWLG
.. .: . ::. ::::.:... :..: .: .. . . ::.:.: ::: ::.::..:
XP_011 LLRRLLTSGIVIQVFPLHDSEALKKLEDTWYTRFALKYQPIDSIRGYFGETIALYFGFLE
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KSD FYTSAMVYPAVFGSVLYTFTEADQTSRDVSCVVFALFNVIWSTLFLEEWKRRGAELAYKW
..: :.. ::.: : :. : . :.:: ::.::::..:: ::: :...:.:
XP_011 YFTFALIPMAVIGLPYYLFVWEDYDKY----VIFASFNLIWSTVILELWKRGCANMTYRW
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KSD GTLDSPGEAVEEPRPQFRGVRRISPITRAEEFYYPPWKRLLFQLLVSLPLCLACLVCVFL
::: . ::::: :.:: :. :: :: :: .:: : :::::. :: .
XP_011 GTLLMK-RKFEEPRPGFHGVLGINSITGKEEPLYPSYKRQLRIYLVSLPFVCLCLYFSLY
280 290 300 310 320 330
380 390 400 410 420
pF1KSD LMLGCFQLQELVLSVK---G--LPRLARFLPKVMLALLVSVSAEGYKKLAIWLNDMENYR
.:. :... .:... : . ..:... :... . . :. : .:.. ::.:
XP_011 VMMIYFDMEVWALGLHENSGSEWTSVLLYVPSIIYAIVIEIMNRLYRYAAEFLTSWENHR
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KSD LESAYEKHLIIKVVLFQFVNSYLSLFYIGFYLKDMERLKEMLATLLITRQFLQNVREVLQ
:::::..:::.::..:.:.: . :::::.: ::::. :.. ::::::: :.:... : .
XP_011 LESAYQNHLILKVLVFNFLNCFASLFYIAFVLKDMKLLRQSLATLLITSQILNQIMESFL
400 410 420 430 440 450
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:
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.:: :: ..:.:.:...:.:: :::. :.. .:: : :. ::..:: : ::
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... :::: : . ..:.::.. ::.:...
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..:..
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..:..
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:.:.:. . .:: . . :. :
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pF1KSD IRSDAFKLCTGLQRPFGQRVESIGQWQKVMEAMGVLAIVVNCYLIGQCGQLQRLFPWLSP
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NP_001 VNSDALKMCRVFKRPFSEPSANIGVWQLAFETMSVISVVTNCALIGMSPQVNAVFPE-SK
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pF1KSD EAAIVSVVVLEHFALLLKYLIHVAIPDIPGWVAEEMAKLEYQRREAFKRHERQAQHRYQQ
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NP_001 ADLILIVVAVEHALLALKFILAFAIPDKPRHIQMKLARLEFESLEALKQQQMKLVTENLK
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pF1KSD QQRRRREEEERQRHAEHHARREHDSGGREEARAEGSGLDPATSSEKASAKAKGSTAGGHG
NP_001 EEPMESGKEKAT
590
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XP_016 QAKLYPGKSLLRRLLTSGIVIQVFPLHDSEALKKLEDTWYTRFALKYQPIDSIRGYFGET
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pF1KSD IAMYFAWLGFYTSAMVYPAVFGSVLYTFTEADQTSRDVSCVVFALFNVIWSTLFLEEWKR
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XP_016 IALYFGFLEYFTFALIPMAVIGLPYYLFVWEDYDKY----VIFASFNLIWSTVILELWKR
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pF1KSD RGAELAYKWGTLDSPGEAVEEPRPQFRGVRRISPITRAEEFYYPPWKRLLFQLLVSLPLC
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XP_016 GCANMTYRWGTLLMK-RKFEEPRPGFHGVLGINSITGKEEPLYPSYKRQLRIYLVSLPFV
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..:..
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NP_001 KAT
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1232 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]