FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA1572, 441 aa
  1>>>pF1KSDA1572 441 - 441 aa - 441 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.4727+/-0.00131; mu= 2.8543+/- 0.076
 mean_var=267.2253+/-57.515, 0's: 0 Z-trim(108.5): 864  B-trim: 415 in 1/50
 Lambda= 0.078458
 statistics sampled from 9288 (10277) to 9288 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.672), E-opt: 0.2 (0.316), width:  16
 Scan time:  3.130

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS6847.1 ZBTB26 gene_id:57684|Hs108|chr9         ( 441) 3022 356.0 4.4e-98
CCDS6846.1 ZBTB6 gene_id:10773|Hs108|chr9          ( 424)  672 89.9 5.1e-18
CCDS4727.1 ZBTB12 gene_id:221527|Hs108|chr6        ( 459)  472 67.3 3.5e-11


>>CCDS6847.1 ZBTB26 gene_id:57684|Hs108|chr9              (441 aa)
 initn: 3022 init1: 3022 opt: 3022  Z-score: 1874.3  bits: 356.0 E(32554): 4.4e-98
Smith-Waterman score: 3022; 100.0% identity (100.0% similar) in 441 aa overlap (1-441:1-441)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MSERSDLLHFKFENYGDSMLQKMNKLREENKFCDVTVLIDDIEVQGHKIVFAAGSPFLRD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 MSERSDLLHFKFENYGDSMLQKMNKLREENKFCDVTVLIDDIEVQGHKIVFAAGSPFLRD
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD QFLLNDSREVKISILQSSEVGRQLLLSCYSGVLEFPEMELVNYLTAASFLQMSHIVERCT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 QFLLNDSREVKISILQSSEVGRQLLLSCYSGVLEFPEMELVNYLTAASFLQMSHIVERCT
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD QALWKFIKPKQPMDSKEGCEPQSASPQSKEQQGDARGSPKQDSPCIHPSEDSMDMEDSDI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 QALWKFIKPKQPMDSKEGCEPQSASPQSKEQQGDARGSPKQDSPCIHPSEDSMDMEDSDI
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD QIVKVESIGDVSEVRSKKDQNQFISSEPTALHSSEPQHSLINSTVENRVSEIEQNHLHNY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 QIVKVESIGDVSEVRSKKDQNQFISSEPTALHSSEPQHSLINSTVENRVSEIEQNHLHNY
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD ALSYTGSDNIIMASKDVFGPNIRGVDKGLQWHHQCPKCTRVFRHLENYANHLKMHKLFMC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 ALSYTGSDNIIMASKDVFGPNIRGVDKGLQWHHQCPKCTRVFRHLENYANHLKMHKLFMC
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD LLCGKTFTQKGNLHRHMRVHAGIKPFQCKICGKTFSQKCSLQDHLNLHSGDKPHKCNYCD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 LLCGKTFTQKGNLHRHMRVHAGIKPFQCKICGKTFSQKCSLQDHLNLHSGDKPHKCNYCD
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD MVFAHKPVLRKHLKQLHGKNSFDNANERNVQDLTVDFDSFACTTVTDSKGCQPQPDATQV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 MVFAHKPVLRKHLKQLHGKNSFDNANERNVQDLTVDFDSFACTTVTDSKGCQPQPDATQV
              370       380       390       400       410       420

              430       440 
pF1KSD LDAGKLAQAVLNLRNDSTCVN
       :::::::::::::::::::::
CCDS68 LDAGKLAQAVLNLRNDSTCVN
              430       440 

>>CCDS6846.1 ZBTB6 gene_id:10773|Hs108|chr9               (424 aa)
 initn: 1391 init1: 570 opt: 672  Z-score: 437.0  bits: 89.9 E(32554): 5.1e-18
Smith-Waterman score: 1178; 46.0% identity (70.0% similar) in 420 aa overlap (1-381:1-409)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MSERSDLLHFKFENYGDSMLQKMNKLREENKFCDVTVLIDDIEVQGHKIVFAAGSPFLRD
       :. .::.:::.::. :: .::::: ::..: ::::.. :.: : ::::...:: : :.::
CCDS68 MAAESDVLHFQFEQQGDVVLQKMNLLRQQNLFCDVSIYINDTEFQGHKVILAACSTFMRD
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD QFLLNDSREVKISILQSSEVGRQLLLSCYSGVLEFPEMELVNYLTAASFLQMSHIVERCT
       ::::..:..:.:.::::.::::.::::::.:.::  . ::..::::::.::: ::::.::
CCDS68 QFLLTQSKHVRITILQSAEVGRKLLLSCYTGALEVKRKELLKYLTAASYLQMVHIVEKCT
               70        80        90       100       110       120

              130                             140               150
pF1KSD QALWKFIKPKQPM----------------------DSKEGCE--------PQSASPQSKE
       .:: :...    :                      .: . ::        : . . . ::
CCDS68 EALSKYLEIDLSMKNNNQHTDLCQSSDPDVKNEDENSDKDCEIIEISEDSPVNIDFHVKE
              130       140       150       160       170       180

                   160       170         180       190       200   
pF1KSD QQGDARGSP-----KQDSPCIHPSEDSMDM--EDSDIQIVKVESIGDVSEVRSKKDQ-NQ
       ....:  :      .. .    :  ...:.  .:..: :..::::   : .  .. : .:
CCDS68 EESNALQSTVESLTSERKEMKSPELSTVDIGFKDNEICILHVESI---STAGVENGQFSQ
              190       200       210       220          230       

            210       220       230        240       250       260 
pF1KSD FISSEPTALHSSEPQHSLINSTVENRVSEIEQNHLHN-YALSYTGSDNIIMASKDVFGPN
         .:  .... :: ::::::::::.::.:.  :. .. .  .  :: . .         .
CCDS68 PCTSSKASMYFSETQHSLINSTVESRVAEVPGNQDQGLFCENTEGSYGTV--------SE
       240       250       260       270       280                 

             270       280       290       300       310       320 
pF1KSD IRGVDKGLQWHHQCPKCTRVFRHLENYANHLKMHKLFMCLLCGKTFTQKGNLHRHMRVHA
       :.....: . .::::.: : : :.:::  ::::::::.:: :::::::: ::.::.: : 
CCDS68 IQNLEEGYSLRHQCPRCPRGFLHVENYLRHLKMHKLFLCLQCGKTFTQKKNLNRHIRGHM
     290       300       310       320       330       340         

             330       340       350       360       370       380 
pF1KSD GIKPFQCKICGKTFSQKCSLQDHLNLHSGDKPHKCNYCDMVFAHKPVLRKHLKQLHGKNS
       ::.:::: .: :::. : .::::::.::::.:.::. ::: : :: .:.::: ..::..:
CCDS68 GIRPFQCTVCLKTFTAKSTLQDHLNIHSGDRPYKCHCCDMDFKHKSALKKHLTSVHGRSS
     350       360       370       380       390       400         

             390       400       410       420       430       440 
pF1KSD FDNANERNVQDLTVDFDSFACTTVTDSKGCQPQPDATQVLDAGKLAQAVLNLRNDSTCVN
                                                                   
CCDS68 GEKLSRPDLKRQSLL                                             
     410       420                                                 

>>CCDS4727.1 ZBTB12 gene_id:221527|Hs108|chr6             (459 aa)
 initn: 1134 init1: 455 opt: 472  Z-score: 314.2  bits: 67.3 E(32554): 3.5e-11
Smith-Waterman score: 871; 36.0% identity (62.0% similar) in 458 aa overlap (1-395:1-456)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MSERSDLLHFKFENYGDSMLQKMNKLREENKFCDVTVLIDDIEVQGHKIVFAAGSPFLRD
       :.   ..:.:.. ..  . :..::.:: :..:::::.. :... .:::...:: ::::::
CCDS47 MASGVEVLRFQLPGHEAATLRNMNQLRAEERFCDVTIVADSLKFRGHKVILAACSPFLRD
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD QFLLNDSREVKISILQSSEVGRQLLLSCYSGVLEFPEMELVNYLTAASFLQMSHIVERCT
       ::::: : :...:...:...  .::::::.:.:::   ..::::::::.::: :.::.: 
CCDS47 QFLLNPSSELQVSLMHSARIVADLLLSCYTGALEFAVRDIVNYLTAASYLQMEHVVEKCR
               70        80        90       100       110       120

              130       140                 150       160          
pF1KSD QALWKFIKPKQPMDSKEGCEP----------QSASPQSKEQQGDARGSPKQD--SPCIHP
       .:: .::.::  . ...:             .:  : ..  .   .  :      : ..:
CCDS47 NALSQFIEPKIGL-KEDGVSEASLVSSISATKSLLPPARTPKPAPKPPPPPPLPPPLLRP
              130        140       150       160       170         

                      170        180       190       200           
pF1KSD ----------------SEDSMDMED-SDIQIVKVESIGDVSEVRSKKDQNQ--------F
                        ::  . :: ::: ::::::  .:.. : :   .          
CCDS47 VKLEFPLDEDLELKAEEEDEDEDEDVSDICIVKVESALEVAH-RLKPPGGLGGGLGIGGS
     180       190       200       210       220        230        

           210        220         230       240       250          
pF1KSD ISSEPTAL-HSSEPQHSLI--NSTVENRVSEIEQNHLHNYALSYTGSDNI----------
       ....   : .:: :  ..   ...:.   :  :. . ..  :   :  ..          
CCDS47 VGGHLGELAQSSVPPSTVAPPQGVVKACYSLSEDAEGEGLLLIPGGRASVGATSGLVEAA
      240       250       260       270       280       290        

                         260       270        280       290        
pF1KSD --IMASKDV---------FGPNIRGVDKGLQWHH-QCPKCTRVFRHLENYANHLK-MHKL
          ::.. .          ::   : . :   .. .: :: .::. .:. . :.. .: .
CCDS47 AVAMAARGAGGSLGAGGSRGPLPGGFSGGNPLKNIKCTKCPEVFQGVEKLVFHMRAQHFI
      300       310       320       330       340       350        

       300       310       320       330       340       350       
pF1KSD FMCLLCGKTFTQKGNLHRHMRVHAGIKPFQCKICGKTFSQKCSLQDHLNLHSGDKPHKCN
       :::  ::: :....::.::: :: :.:  .: :::: :.:: .:.:::::::: .:..:.
CCDS47 FMCPRCGKQFNHSSNLNRHMNVHRGVKSHSCGICGKCFTQKSTLHDHLNLHSGARPYRCS
      360       370       380       390       400       410        

       360       370       380       390       400       410       
pF1KSD YCDMVFAHKPVLRKHLKQLHGKNSFDNANERNVQDLTVDFDSFACTTVTDSKGCQPQPDA
       :::. :::::..:.:::. :::.. .:. : .: ...:                      
CCDS47 YCDVRFAHKPAIRRHLKEQHGKTTAENVLEASVAEINVLIR                   
      420       430       440       450                            

       420       430       440 
pF1KSD TQVLDAGKLAQAVLNLRNDSTCVN




441 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Thu Nov  3 06:41:01 2016 done: Thu Nov  3 06:41:02 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]