Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA1563
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1563, 1657 aa
1>>>pF1KSDA1563 1657 - 1657 aa - 1657 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1543+/-0.00111; mu= 19.5150+/- 0.067
mean_var=81.1532+/-16.005, 0's: 0 Z-trim(104.0): 62 B-trim: 62 in 1/50
Lambda= 0.142371
statistics sampled from 7628 (7690) to 7628 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.589), E-opt: 0.2 (0.236), width: 16
Scan time: 5.200
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS42800.1 ALS2 gene_id:57679|Hs108|chr2 (1657) 11064 2283.4 0
CCDS46492.1 ALS2 gene_id:57679|Hs108|chr2 ( 396) 2456 515.1 1.8e-145
CCDS2743.1 ALS2CL gene_id:259173|Hs108|chr3 ( 953) 1213 260.0 2.8e-68
CCDS34598.1 RSPH10B gene_id:222967|Hs108|chr7 ( 870) 348 82.3 7.9e-15
CCDS43552.1 RSPH10B2 gene_id:728194|Hs108|chr7 ( 870) 348 82.3 7.9e-15
CCDS82939.1 HERC3 gene_id:8916|Hs108|chr4 ( 368) 298 71.9 4.6e-12
CCDS34028.1 HERC3 gene_id:8916|Hs108|chr4 (1050) 298 72.1 1.2e-11
CCDS72688.1 MORN1 gene_id:79906|Hs108|chr1 ( 350) 287 69.6 2.1e-11
CCDS40.1 MORN1 gene_id:79906|Hs108|chr1 ( 497) 287 69.7 2.9e-11
CCDS10021.1 HERC2 gene_id:8924|Hs108|chr15 (4834) 301 72.9 2.9e-11
>>CCDS42800.1 ALS2 gene_id:57679|Hs108|chr2 (1657 aa)
initn: 11064 init1: 11064 opt: 11064 Z-score: 12270.7 bits: 2283.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 11064; 99.9% identity (100.0% similar) in 1657 aa overlap (1-1657:1-1657)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MDSKKRSSTEAEGSKERGLVHIWQAGSFPITPERLPGWGGKTVLQAALGVKHGVLLTEDG
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CCDS42 MDSKKRSSTEAEGSKERGLVHIWQAGSFPITPERLPGWGGKTVLQAALGVKHGVLLTEDG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD EVYSFGTLPWRSGPVEICPSSPILENALVGQYVITVATGSFHSGAVTDNGVAYMWGENSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EVYSFGTLPWRSGPVEICPSSPILENALVGQYVITVATGSFHSGAVTDNGVAYMWGENSA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD GQCAVANQQYVPEPNPVSIADSEASPLLAVRILQLACGEEHTLALSISREIWAWGTGCQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GQCAVANQQYVPEPNPVSIADSEASPLLAVRILQLACGEEHTLALSISREIWAWGTGCQL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD GLITTAFPVTKPQKVEHLAGRVVLQVACGAFHSLALVQCLPSQDLKPVPERCNQCSQLLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GLITTAFPVTKPQKVEHLAGRVVLQVACGAFHSLALVQCLPSQDLKPVPERCNQCSQLLI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD TMTDKEDHVIISDSHCCPLGVTLTESQAENHASTALSPSTETLDRQEEVFENTLVANDQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 TMTDKEDHVIISDSHCCPLGVTLTESQAENHASTALSPSTETLDRQEEVFENTLVANDQS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD VATELNAVSAQITSSDAMSSQQNVMGTTEISSARNIPSYPDTQAVNEYLRKLSDHSVRED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 VATELNAVSAQITSSDAMSSQQNVMGTTEISSARNIPSYPDTQAVNEYLRKLSDHSVRED
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD SEHGEKPMPSQPLLEEAIPNLHSPPTTSTSALNSLVVSCASAVGVRVAATYEAGALSLKK
:::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SEHGEKPVPSQPLLEEAIPNLHSPPTTSTSALNSLVVSCASAVGVRVAATYEAGALSLKK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD VMNFYSTTPCETGAQAGSSAIGPEGLKDSREEQVKQESMQGKKSSSLVDIREEETEGGSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 VMNFYSTTPCETGAQAGSSAIGPEGLKDSREEQVKQESMQGKKSSSLVDIREEETEGGSR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD RLSLPGLLSQVSPRLLRKAARVKTRTVVLTPTYSGEADALLPSLRTEVWTWGKGKEGQLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 RLSLPGLLSQVSPRLLRKAARVKTRTVVLTPTYSGEADALLPSLRTEVWTWGKGKEGQLG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD HGDVLPRLQPLCVKCLDGKEVIHLEAGGYHSLALTAKSQVYSWGSNTFGQLGHSDFPTTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 HGDVLPRLQPLCVKCLDGKEVIHLEAGGYHSLALTAKSQVYSWGSNTFGQLGHSDFPTTV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD PRLAKISSENGVWSIAAGRDYSLFLVDTEDFQPGLYYSGRQDPTEGDNLPENHSGSKTPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PRLAKISSENGVWSIAAGRDYSLFLVDTEDFQPGLYYSGRQDPTEGDNLPENHSGSKTPV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD LLSCSKLGYISRVTAGKDSYLALVDKNIMGYIASLHELATTERRFYSKLSDIKSQILRPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LLSCSKLGYISRVTAGKDSYLALVDKNIMGYIASLHELATTERRFYSKLSDIKSQILRPL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD LSLENLGTTTTVQLLQEVASRFSKLCYLIGQHGASLSSFLHGVKEARSLVILKHSSLFLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LSLENLGTTTTVQLLQEVASRFSKLCYLIGQHGASLSSFLHGVKEARSLVILKHSSLFLD
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD SYTEYCTSITNFLVMGGFQLLAKPAIDFLNKNQELLQDLSEVNDENTQLMEILNTLFFLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SYTEYCTSITNFLVMGGFQLLAKPAIDFLNKNQELLQDLSEVNDENTQLMEILNTLFFLP
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD IRRLHNYAKVLLKLATCFEVASPEYQKLQDSSSCYECLALHLGRKRKEAEYTLGFWKTFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 IRRLHNYAKVLLKLATCFEVASPEYQKLQDSSSCYECLALHLGRKRKEAEYTLGFWKTFP
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD GKMTDSLRKPERRLLCESSNRALSLQHAGRFSVNWFILFNDALVHAQFSTHHVFPLATLW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GKMTDSLRKPERRLLCESSNRALSLQHAGRFSVNWFILFNDALVHAQFSTHHVFPLATLW
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD AEPLSEEAGGVNGLKITTPEEQFTLISSTPQEKTKWLRAISQAVDQALRGMSDLPPYGSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 AEPLSEEAGGVNGLKITTPEEQFTLISSTPQEKTKWLRAISQAVDQALRGMSDLPPYGSG
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD SSVQRQEPPISRSAKYTFYKDPRLKDATYDGRWLSGKPHGRGVLKWPDGKMYSGMFRNGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SSVQRQEPPISRSAKYTFYKDPRLKDATYDGRWLSGKPHGRGVLKWPDGKMYSGMFRNGL
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD EDGYGEYRIPNKAMNKEDHYVGHWKEGKMCGQGVYSYASGEVFEGCFQDNMRHGHGLLRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EDGYGEYRIPNKAMNKEDHYVGHWKEGKMCGQGVYSYASGEVFEGCFQDNMRHGHGLLRS
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD GKLTSSSPSMFIGQWVMDKKAGYGVFDDITRGEKYMGMWQDDVCQGNGVVVTQFGLYYEG
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CCDS42 GKLTSSSPSMFIGQWVMDKKAGYGVFDDITRGEKYMGMWQDDVCQGNGVVVTQFGLYYEG
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD NFHLNKMMGNGVLLSEDDTIYEGEFSDDWTLSGKGTLTMPNGDYIEGYFSGEWGSGIKIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 NFHLNKMMGNGVLLSEDDTIYEGEFSDDWTLSGKGTLTMPNGDYIEGYFSGEWGSGIKIT
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD GTYFKPSLYESDKDRPKVFRKLGNLAVPADEKWKAVFDECWRQLGCEGPGQGEVWKAWDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GTYFKPSLYESDKDRPKVFRKLGNLAVPADEKWKAVFDECWRQLGCEGPGQGEVWKAWDN
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD IAVALTTSRRQHRDSPEILSRSQTQTLESLEFIPQHVGAFSVEKYDDIRKYLIKACDTPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 IAVALTTSRRQHRDSPEILSRSQTQTLESLEFIPQHVGAFSVEKYDDIRKYLIKACDTPL
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KSD HPLGRLVETLVAVYRMTYVGVGANRRLLQEAVKEIKSYLKRIFQLVRFLFPELPEEGSTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 HPLGRLVETLVAVYRMTYVGVGANRRLLQEAVKEIKSYLKRIFQLVRFLFPELPEEGSTI
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KSD PLSAPLPTERKSFCTGKSDSRSESPEPGYVVTSSGLLLPVLLPRLYPPLFMLYALDNDRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PLSAPLPTERKSFCTGKSDSRSESPEPGYVVTSSGLLLPVLLPRLYPPLFMLYALDNDRE
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KSD EDIYWECVLRLNKQPDIALLGFLGVQRKFWPATLSILGESKKVLPTTKDACFASAVECLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EDIYWECVLRLNKQPDIALLGFLGVQRKFWPATLSILGESKKVLPTTKDACFASAVECLQ
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KSD QISTTFTPSDKLKVIQQTFEEISQSVLASLHEDFLWSMDDLFPVFLYVVLRARIRNLGSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 QISTTFTPSDKLKVIQQTFEEISQSVLASLHEDFLWSMDDLFPVFLYVVLRARIRNLGSE
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650
pF1KSD VHLIEDLMDPYLQHGEQGIMFTTLKACYYQIQREKLN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 VHLIEDLMDPYLQHGEQGIMFTTLKACYYQIQREKLN
1630 1640 1650
>>CCDS46492.1 ALS2 gene_id:57679|Hs108|chr2 (396 aa)
initn: 2456 init1: 2456 opt: 2456 Z-score: 2725.0 bits: 515.1 E(32554): 1.8e-145
Smith-Waterman score: 2456; 99.7% identity (100.0% similar) in 371 aa overlap (1-371:1-371)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MDSKKRSSTEAEGSKERGLVHIWQAGSFPITPERLPGWGGKTVLQAALGVKHGVLLTEDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MDSKKRSSTEAEGSKERGLVHIWQAGSFPITPERLPGWGGKTVLQAALGVKHGVLLTEDG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD EVYSFGTLPWRSGPVEICPSSPILENALVGQYVITVATGSFHSGAVTDNGVAYMWGENSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EVYSFGTLPWRSGPVEICPSSPILENALVGQYVITVATGSFHSGAVTDNGVAYMWGENSA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD GQCAVANQQYVPEPNPVSIADSEASPLLAVRILQLACGEEHTLALSISREIWAWGTGCQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GQCAVANQQYVPEPNPVSIADSEASPLLAVRILQLACGEEHTLALSISREIWAWGTGCQL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD GLITTAFPVTKPQKVEHLAGRVVLQVACGAFHSLALVQCLPSQDLKPVPERCNQCSQLLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GLITTAFPVTKPQKVEHLAGRVVLQVACGAFHSLALVQCLPSQDLKPVPERCNQCSQLLI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD TMTDKEDHVIISDSHCCPLGVTLTESQAENHASTALSPSTETLDRQEEVFENTLVANDQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 TMTDKEDHVIISDSHCCPLGVTLTESQAENHASTALSPSTETLDRQEEVFENTLVANDQS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD VATELNAVSAQITSSDAMSSQQNVMGTTEISSARNIPSYPDTQAVNEYLRKLSDHSVRED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VATELNAVSAQITSSDAMSSQQNVMGTTEISSARNIPSYPDTQAVNEYLRKLSDHSVRED
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD SEHGEKPMPSQPLLEEAIPNLHSPPTTSTSALNSLVVSCASAVGVRVAATYEAGALSLKK
:::::::.:::
CCDS46 SEHGEKPVPSQVPAQFYKIKVCLELNCMGFSLETLK
370 380 390
>>CCDS2743.1 ALS2CL gene_id:259173|Hs108|chr3 (953 aa)
initn: 1424 init1: 450 opt: 1213 Z-score: 1339.2 bits: 260.0 E(32554): 2.8e-68
Smith-Waterman score: 1779; 34.3% identity (63.6% similar) in 973 aa overlap (698-1656:9-938)
670 680 690 700 710 720
pF1KSD GYISRVTAGKDSYLALVDKNIMGYIASLHELATTERRFYSKLSDIKSQILRPLLSLENLG
: :. : . :. ..: .:.:::
CCDS27 MCNPEEAALLRLEEVFSATLAHVNSLVLQPLLPAAPDP
10 20 30
730 740 750 760 770 780
pF1KSD TTT----TVQLLQEVASRFSKLCYLIGQHGASLSSFLHGVKEA--RSLVILKHSSLFLDS
. ..:::.. . ..: . . ::. :. . .::..:. .. :..
CCDS27 SDPWGRECLRLLQQLHKSSQQLWEVTEESLHSLQERLRYPDSTGLESLLLLRGADRVLQA
40 50 60 70 80 90
790 800 810 820 830 840
pF1KSD YTEYCTSITNFLVMGGFQLLAKPAIDFL-NKNQELLQDLSEVNDENTQLMEILNTLFFLP
. :: : :. .:. .:: :: .. .. . : : :: :..:.. . :. . :
CCDS27 HIEYIESYTSCMVVQAFQKAAKRRSEYWRGQRKALRQLLSGVSSEGS-VGASLGQALHQP
100 110 120 130 140 150
850 860 870 880 890
pF1KSD I-RRLHNYAKVLLKLATCFEVASPEYQKLQDSSSCYECLALHLGRKRKEAEYTLGFWKTF
. .....:. .::.:. . : . . .. . . : . .. .: : ..:.:.
CCDS27 LAHHVQQYVLLLLSLGDTIGEHHPTRELVVNAVTLFGNLQSFMKQELDQAVATQALWHTL
160 170 180 190 200 210
900 910 920 930 940 950
pF1KSD PGKMTDSLRKPERRLLCESSNRALSLQHAGRFSVNWFILFNDALVHAQFSTHHVFPLATL
:.. : : : .::: .:.. ... . . .. .::.:::: : . :.: : .
CCDS27 RGRLRDVLCTPAHRLLQDSQDVPVTV---APLRAERVLLFDDALVLLQGHNVHTFDLKLV
220 230 240 250 260 270
960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD WAEPLSEEAGGVNG--LKITTPEEQFTLISSTPQEKTKWLRAISQAVDQALRGMSDLPPY
:..: : .: ... ::::.:.. .. : .. : .. :: :::.: .:.:
CCDS27 WVDP------GQDGCTFHLLTPEEEFSFCAKDSQGQAVWQWKVTWAVHQALHGKKDFPVL
280 290 300 310 320
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KSD GSGSSVQRQEPPISRSAKYTFYKDPRLKDATYDGRWLSGKPHGRGVLKWPDGKMYSGMFR
:.: .. ..:: : :.::: . :: .:::.:.: :.:::.:.::::::. . : :
CCDS27 GAG--LEPSQPPDCRCAEYTFQAEGRLCQATYEGEWCRGRPHGKGTLKWPDGRNHVGNFC
330 340 350 360 370 380
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KSD NGLEDGYGEYRIPNKAMNKEDHYVGHWKEGKMCGQGVYSYASGEVFEGCFQDNMRHGHGL
.::: :.: .:. . .: : : ::.::.::: :. :.. ::..: ::...::: :.
CCDS27 QGLEHGFGIRLLPQASEDKFDCYKCHWREGSMCGYGICEYSTDEVYKGYFQEGLRHGFGV
390 400 410 420 430 440
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KSD LRSGKLTSSSPSMFIGQWVMDKKAGYGVFDDITRGEKYMGMWQDDVCQGNGVVVTQFGLY
:.:: . .: . :.: ...:::. .: :::.:.:::: .: ::.::: :.
CCDS27 LESGP-QAPQPFRYTGHWERGQRSGYGIEEDGDRGERYIGMWQAGQRHGPGVMVTQAGVC
450 460 470 480 490 500
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KSD YEGNFHLNKMMGNGVLLSEDDTIYEGEFSDDWTLSGKGTLTMPNGDYIEGYFSGEWGSGI
:.:.:. .: .: :.::::::..::: :. : :: ::: .:.::: .:: :.. : :.
CCDS27 YQGTFQADKTVGPGILLSEDDSLYEGTFTRDLTLMGKGKVTFPNGFTLEGSFGSGAGRGL
510 520 530 540 550 560
1260 1270 1280 1290 1300 1310
pF1KSD KITGTYFKPSLYESDKDRPKVFRKLGNLAVPADEKWKAVFDECWRQLGCEGPGQGEVWKA
. :. .: . .. : :.:: : :.. .:..:.. .:.. : : . .. .:
CCDS27 HTQGVLDTAALPPDPSSTCK--RQLGVGAFPVESRWQGVYSP-FRDFVCAGCPR-DLQEA
570 580 590 600 610 620
1320 1330 1340 1350 1360 1370
pF1KSD WDNIAVALTTSRRQHRDSPEILSRSQTQ---TLESLEFIPQHVGAFSVEKYDDIRKYLIK
.. : : :. : : . :: .:. .. :.: : ... : .. :: :
CCDS27 LLGFDV---QSSRELRRSQDYLSCERTHPEDSVGSMEDILEELLQHREPKA--LQLYLRK
630 640 650 660 670
1380 1390 1400 1410 1420 1430
pF1KSD ACDTPLHPLGRLVETLVAVYRMTYVGVGANRRLLQEAVKEIKSYLKRIFQLVRFLFPELP
: .. :::::.:..::. ... ::.:::::..: . : .:.:.. .... : :
CCDS27 ALSNSLHPLGKLLRTLMLTFQATYAGVGANKHLQELAQEEVKQHAQELWAAYRGL-----
680 690 700 710 720 730
1440 1450 1460 1470 1480 1490
pF1KSD EEGSTIPLSAPLPTERKSFCTGKSDSRSESPEPGYVVTSSGLLLPVLLPRLYPPLFMLYA
: . : ::: :.. ..:. : . ::.::..:: .: :: ::
CCDS27 -------LRVAL--ERK----GQALEEDEDTET-RDLQVHGLVLPLMLPSFYSELFTLYL
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CCDS27 SATECLQKIMTTVDPREKLEVLERTYGEIEGTVSRVLGREYKLPMDDLLPLLIYVVSRAR
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CCDS43 I-RCYK----SGNIYEGQWEDNMRHGEGRMRWLTTNEEYTGRWERGIQNGFGTHTWFLKR
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CCDS43 IRSSQYPLRNEYIGEFVNGYRHGRGKFYYASGAMYDGEWVSN-KKHGMGRLTFKNGRVYE
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CCDS43 GAFSNDHIAGFPDLEVEFISCLDLSSGVAPRLSRSAELIRKLDGSESHSVLGSSIELDLN
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CCDS43 LLLDMYPETVQPEEKKQVEYAVLRNITELRRIYSFYSSLGCGHSLDNTFLMTKLHFWRFL
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CCDS40 SFFRYEGEWKAGRKHGHGKLLFKDGSYYEGAFVDGEITGEGRRHWAWSG----DTFSGQF
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CCDS40 VLGEPQGYGVMEYKAGGCYEGEVSHGMREGHGFLVDRDGQVYQGSFHDNKRHGPGQMLFQ
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CCDS40 NGDKYDGDWVRDRRQGHGVLR-CADGSTYKGQWHSDVFSGLGSMAHCSGVTYYGLWINGH
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CCDS10 LATLRPVQLIGGEQTLFAVTADGKLYATGYGAGGRLGIGGTESVSTPTLLESIQHVFIKK
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CCDS10 VAVN---SGGKHCLALSSEGEVYSWGEAEDGKLGHGNRSPCDRPRVIESLRGIEVVDVAA
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CCDS10 GGAHSACVTAAGDLYTWGKGRYGRLGHSDSEDQLKPKLVEALQGHRVVDIACGSGDAQTL
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pF1KSD VDTEDFQPGLYYSGRQDPTEGDNLPENHSGSKTPVLL-SCSKLGYISRVTAGKDSYLALV
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CCDS10 CLTDD--DTVWSWG--DGDYGKLGRGGSDGCKVPMKIDSLTGLGVV-KVECGSQFSVALT
4160 4170 4180 4190 4200 4210
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]