Result of FASTA (omim) for
pF1KSDA1559
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1559, 533 aa
1>>>pF1KSDA1559 533 - 533 aa - 533 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0200+/-0.00075; mu= 18.2405+/- 0.046
mean_var=351.8729+/-73.343, 0's: 0 Z-trim(110.0): 2047 B-trim: 80 in 1/53
Lambda= 0.068372
statistics sampled from 15963 (18294) to 15963 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.523), E-opt: 0.2 (0.214), width: 16
Scan time: 8.800
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_011524816 (OMIM: 614275) PREDICTED: zinc finger ( 499) 2139 226.6 1.4e-58
NP_001035939 (OMIM: 614275) zinc finger protein 56 ( 499) 2139 226.6 1.4e-58
NP_689690 (OMIM: 614275) zinc finger protein 565 [ ( 499) 2139 226.6 1.4e-58
XP_016881830 (OMIM: 614275) PREDICTED: zinc finger ( 499) 2139 226.6 1.4e-58
XP_011524814 (OMIM: 614275) PREDICTED: zinc finger ( 499) 2139 226.6 1.4e-58
XP_016881832 (OMIM: 614275) PREDICTED: zinc finger ( 434) 1862 199.1 2.2e-50
XP_016881831 (OMIM: 614275) PREDICTED: zinc finger ( 434) 1862 199.1 2.2e-50
NP_653291 (OMIM: 615600) zinc finger protein 582 i ( 517) 1858 198.9 3.2e-50
NP_001307300 (OMIM: 615600) zinc finger protein 58 ( 548) 1858 198.9 3.2e-50
NP_001152765 (OMIM: 603984) zinc finger protein 73 ( 536) 1853 198.4 4.5e-50
NP_001092096 (OMIM: 603980) zinc finger protein 98 ( 572) 1850 198.2 5.7e-50
XP_011525900 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 551) 1836 196.8 1.5e-49
XP_005259754 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 551) 1836 196.8 1.5e-49
XP_006722660 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 550) 1833 196.5 1.8e-49
XP_011525901 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 550) 1833 196.5 1.8e-49
NP_001276331 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 616) 1751 188.5 5.1e-47
XP_016882731 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 621) 1751 188.5 5.1e-47
XP_016882730 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 628) 1751 188.5 5.1e-47
NP_001276330 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 658) 1751 188.5 5.2e-47
XP_016882729 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 658) 1751 188.5 5.2e-47
XP_006723426 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1751 188.6 5.3e-47
XP_005259268 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1751 188.6 5.3e-47
XP_006723425 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1751 188.6 5.3e-47
NP_003427 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 670) 1751 188.6 5.3e-47
NP_009065 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 682) 1751 188.6 5.3e-47
XP_016867177 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 569) 1711 184.5 7.6e-46
NP_066971 (OMIM: 604756) zinc finger protein 273 [ ( 569) 1711 184.5 7.6e-46
XP_016881605 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 504) 1710 184.3 7.7e-46
XP_011526007 (OMIM: 603980) PREDICTED: zinc finger ( 531) 1708 184.1 9.1e-46
NP_001291423 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 ( 585) 1694 182.8 2.5e-45
NP_001291422 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 ( 585) 1694 182.8 2.5e-45
NP_666016 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 is ( 643) 1694 182.9 2.6e-45
NP_001291421 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 ( 643) 1694 182.9 2.6e-45
NP_001309066 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 1680 181.7 7.2e-45
NP_001309068 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 1680 181.7 7.2e-45
NP_001309067 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 1680 181.7 7.2e-45
XP_011513163 (OMIM: 602277) PREDICTED: zinc finger ( 675) 1679 181.5 7.3e-45
NP_001305822 (OMIM: 602277) zinc finger protein 18 ( 675) 1679 181.5 7.3e-45
NP_001309057 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1680 181.7 7.4e-45
NP_001096073 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1680 181.7 7.4e-45
NP_001309059 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1680 181.7 7.4e-45
NP_001309061 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1680 181.7 7.4e-45
NP_001309062 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1680 181.7 7.4e-45
NP_150630 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 i ( 818) 1680 181.7 7.4e-45
NP_001309063 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1680 181.7 7.4e-45
NP_001309060 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1680 181.7 7.4e-45
XP_016882935 (OMIM: 600398) PREDICTED: zinc finger ( 818) 1680 181.7 7.4e-45
NP_001309064 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1680 181.7 7.4e-45
NP_001309065 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1680 181.7 7.4e-45
NP_001309058 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1680 181.7 7.4e-45
>>XP_011524816 (OMIM: 614275) PREDICTED: zinc finger pro (499 aa)
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Smith-Waterman score: 2139; 60.3% identity (79.4% similar) in 504 aa overlap (1-504:1-499)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAHGSVTFRDVAIDFSQEEWEFLDPAQRDLYRDVMWENYSNFISLGPSISKPDVITLLDE
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XP_011 MAQGLVTFRDVAIEFSLEEWKCLEPAQRDLYREVTLENFGHLASLGLSISKPDVVSLL-E
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pF1KSD ERKEPGMVVREGTRRYCPDLESRYRTNTLSPEKDIYEIYSFQWDIMERIKSYSLQGSIFR
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XP_011 QGKEPWMIANDVTGPWCPDLESRCEKFL---QKDIFEIGAFNWEIMESLKCSDLEGSDFR
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pF1KSD NDWECKSKIEGEKEQQEGYFGQVKITSEKMTTYKRHNFLTEYQIVHNGEKVYECKECRKT
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pF1KSD ECKECGKAFRLYSFLTQHQRIHTGEKPYKCKECKKAFRQHSHLTQHQKIHNGI
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XP_011 ECRECGQAFILGSQLIEHYRIHTG
480 490
>>NP_001035939 (OMIM: 614275) zinc finger protein 565 [H (499 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAHGSVTFRDVAIDFSQEEWEFLDPAQRDLYRDVMWENYSNFISLGPSISKPDVITLLDE
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NP_001 MAQGLVTFRDVAIEFSLEEWKCLEPAQRDLYREVTLENFGHLASLGLSISKPDVVSLL-E
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pF1KSD ERKEPGMVVREGTRRYCPDLESRYRTNTLSPEKDIYEIYSFQWDIMERIKSYSLQGSIFR
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pF1KSD NDWECKSKIEGEKEQQEGYFGQVKITSEKMTTYKRHNFLTEYQIVHNGEKVYECKECRKT
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NP_001 ADWECEGQFE-RQVNEECYFKQVNVTYGHMPVFQHHTSHTVRQSRETGEKLMECHECGKA
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pF1KSD FIRRSTLSQHLRIHTGEKPYKCKECGQAFRQRAHLIRHHKLHTGEKPYECKECGKAFTVL
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NP_001 DKPYECKECGKAFIRVSQLTHHQRIHTCEKPYECRECGMAFIRSSQLTEHQRIHPGIKPY
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pF1KSD ECKECGKAFRLYSFLTQHQRIHTGEKPYKCKECKKAFRQHSHLTQHQKIHNGI
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NP_001 ECRECGQAFILGSQLIEHYRIHTG
480 490
>>NP_689690 (OMIM: 614275) zinc finger protein 565 [Homo (499 aa)
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Smith-Waterman score: 2139; 60.3% identity (79.4% similar) in 504 aa overlap (1-504:1-499)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAHGSVTFRDVAIDFSQEEWEFLDPAQRDLYRDVMWENYSNFISLGPSISKPDVITLLDE
::.: ::::::::.:: :::. :.::::::::.: ::.... ::: :::::::..:: :
NP_689 MAQGLVTFRDVAIEFSLEEWKCLEPAQRDLYREVTLENFGHLASLGLSISKPDVVSLL-E
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pF1KSD ERKEPGMVVREGTRRYCPDLESRYRTNTLSPEKDIYEIYSFQWDIMERIKSYSLQGSIFR
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pF1KSD NDWECKSKIEGEKEQQEGYFGQVKITSEKMTTYKRHNFLTEYQIVHNGEKVYECKECRKT
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pF1KSD FIRRSTLSQHLRIHTGEKPYKCKECGQAFRQRAHLIRHHKLHTGEKPYECKECGKAFTVL
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NP_689 FSRGSHLIQHQKIHTGEKPFGCKECGKAFSRASHLVQHQRIHTGEKPYDCKDCGKAFGRT
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pF1KSD ECKECGKAFRLYSFLTQHQRIHTGEKPYKCKECKKAFRQHSHLTQHQKIHNGI
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NP_689 ECRECGQAFILGSQLIEHYRIHTG
480 490
>>XP_016881830 (OMIM: 614275) PREDICTED: zinc finger pro (499 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAHGSVTFRDVAIDFSQEEWEFLDPAQRDLYRDVMWENYSNFISLGPSISKPDVITLLDE
::.: ::::::::.:: :::. :.::::::::.: ::.... ::: :::::::..:: :
XP_016 MAQGLVTFRDVAIEFSLEEWKCLEPAQRDLYREVTLENFGHLASLGLSISKPDVVSLL-E
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pF1KSD ERKEPGMVVREGTRRYCPDLESRYRTNTLSPEKDIYEIYSFQWDIMERIKSYSLQGSIFR
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XP_016 QGKEPWMIANDVTGPWCPDLESRCEKFL---QKDIFEIGAFNWEIMESLKCSDLEGSDFR
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pF1KSD NDWECKSKIEGEKEQQEGYFGQVKITSEKMTTYKRHNFLTEYQIVHNGEKVYECKECRKT
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XP_016 ADWECEGQFE-RQVNEECYFKQVNVTYGHMPVFQHHTSHTVRQSRETGEKLMECHECGKA
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KSD FIRRSTLSQHLRIHTGEKPYKCKECGQAFRQRAHLIRHHKLHTGEKPYECKECGKAFTVL
: : : : :: .:::::::. :::::.:: . .::..:...:::::::.::.:::::
XP_016 FSRGSHLIQHQKIHTGEKPFGCKECGKAFSRASHLVQHQRIHTGEKPYDCKDCGKAFGRT
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KSD QELTQHQRLHTGEKPYECKECGKAFRVHQQLARHQRIHTGEKPYECKDCGKTFRQCTHLT
.:: ::::::: ::::::::::.:: :.:: ::: ::::::: ::::::.: . ..::
XP_016 SELILHQRLHTGVKPYECKECGKTFRQHSQLILHQRTHTGEKPYVCKDCGKAFIRGSQLT
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KSD RHQRLHTAEKLYECKECGKAFVCGPDLRVHQKIHFGEKPYECKECGKAFRICQQLTVHQS
:.:.::. . :::::::::: .: :::.:: ::::::::::::.: ...: ::
XP_016 VHRRIHTGARPYECKECGKAFRQHSQLTVHQRIHTGEKPYECKECGKGFIHSSEVTRHQR
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KSD IHTGEKPYECKECGKTFRLRQQLVRHQRIHTREKPYECMECWKTFSSYSQLISHQSIHIG
::.::::::::::::.:: . ::.::::.:: ..:::: .: :.:: : ::.:: :: :
XP_016 IHSGEKPYECKECGKAFRQHAQLTRHQRVHTGDRPYECKDCGKAFSRSSYLIQHQRIHTG
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KSD ERPYECEECGKAFRLLSQLTQHQSIHTGEKPYECKECRKPFRLLSQLTQHQSIHTGEKPY
..::::.:::::: .::::.:: ::: ::::::.:: : ::::.:: :: : :::
XP_016 DKPYECKECGKAFIRVSQLTHHQRIHTCEKPYECRECGMAFIRSSQLTEHQRIHPGIKPY
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530
pF1KSD ECKECGKAFRLYSFLTQHQRIHTGEKPYKCKECKKAFRQHSHLTQHQKIHNGI
::.:::.:: : : : .: :::::
XP_016 ECRECGQAFILGSQLIEHYRIHTG
480 490
>>XP_011524814 (OMIM: 614275) PREDICTED: zinc finger pro (499 aa)
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Smith-Waterman score: 2139; 60.3% identity (79.4% similar) in 504 aa overlap (1-504:1-499)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAHGSVTFRDVAIDFSQEEWEFLDPAQRDLYRDVMWENYSNFISLGPSISKPDVITLLDE
::.: ::::::::.:: :::. :.::::::::.: ::.... ::: :::::::..:: :
XP_011 MAQGLVTFRDVAIEFSLEEWKCLEPAQRDLYREVTLENFGHLASLGLSISKPDVVSLL-E
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD ERKEPGMVVREGTRRYCPDLESRYRTNTLSPEKDIYEIYSFQWDIMERIKSYSLQGSIFR
. ::: :.. . : .::::::: . .:::.:: .:.:.::: .: .:.:: ::
XP_011 QGKEPWMIANDVTGPWCPDLESRCEKFL---QKDIFEIGAFNWEIMESLKCSDLEGSDFR
60 70 80 90 100 110
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pF1KSD NDWECKSKIEGEKEQQEGYFGQVKITSEKMTTYKRHNFLTEYQIVHNGEKVYECKECRKT
::::....: .. ..: :: ::..: .: ....:. : : ..:::..::.:: :.
XP_011 ADWECEGQFE-RQVNEECYFKQVNVTYGHMPVFQHHTSHTVRQSRETGEKLMECHECGKA
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KSD FIRRSTLSQHLRIHTGEKPYKCKECGQAFRQRAHLIRHHKLHTGEKPYECKECGKAFTVL
: : : : :: .:::::::. :::::.:: . .::..:...:::::::.::.:::::
XP_011 FSRGSHLIQHQKIHTGEKPFGCKECGKAFSRASHLVQHQRIHTGEKPYDCKDCGKAFGRT
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KSD QELTQHQRLHTGEKPYECKECGKAFRVHQQLARHQRIHTGEKPYECKDCGKTFRQCTHLT
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XP_011 SELILHQRLHTGVKPYECKECGKTFRQHSQLILHQRTHTGEKPYVCKDCGKAFIRGSQLT
240 250 260 270 280 290
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pF1KSD RHQRLHTAEKLYECKECGKAFVCGPDLRVHQKIHFGEKPYECKECGKAFRICQQLTVHQS
:.:.::. . :::::::::: .: :::.:: ::::::::::::.: ...: ::
XP_011 VHRRIHTGARPYECKECGKAFRQHSQLTVHQRIHTGEKPYECKECGKGFIHSSEVTRHQR
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pF1KSD IHTGEKPYECKECGKTFRLRQQLVRHQRIHTREKPYECMECWKTFSSYSQLISHQSIHIG
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XP_011 IHSGEKPYECKECGKAFRQHAQLTRHQRVHTGDRPYECKDCGKAFSRSSYLIQHQRIHTG
360 370 380 390 400 410
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pF1KSD ERPYECEECGKAFRLLSQLTQHQSIHTGEKPYECKECRKPFRLLSQLTQHQSIHTGEKPY
..::::.:::::: .::::.:: ::: ::::::.:: : ::::.:: :: : :::
XP_011 DKPYECKECGKAFIRVSQLTHHQRIHTCEKPYECRECGMAFIRSSQLTEHQRIHPGIKPY
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530
pF1KSD ECKECGKAFRLYSFLTQHQRIHTGEKPYKCKECKKAFRQHSHLTQHQKIHNGI
::.:::.:: : : : .: :::::
XP_011 ECRECGQAFILGSQLIEHYRIHTG
480 490
>>XP_016881832 (OMIM: 614275) PREDICTED: zinc finger pro (434 aa)
initn: 1675 init1: 1675 opt: 1862 Z-score: 1025.4 bits: 199.1 E(85289): 2.2e-50
Smith-Waterman score: 1862; 59.4% identity (78.5% similar) in 438 aa overlap (67-504:1-434)
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pF1KSD ENYSNFISLGPSISKPDVITLLDEERKEPGMVVREGTRRYCPDLESRYRTNTLSPEKDIY
:.. . : .::::::: . .:::.
XP_016 MIANDVTGPWCPDLESRCEKFL---QKDIF
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100 110 120 130 140 150
pF1KSD EIYSFQWDIMERIKSYSLQGSIFRNDWECKSKIEGEKEQQEGYFGQVKITSEKMTTYKRH
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XP_016 EIGAFNWEIMESLKCSDLEGSDFRADWECEGQFE-RQVNEECYFKQVNVTYGHMPVFQHH
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160 170 180 190 200 210
pF1KSD NFLTEYQIVHNGEKVYECKECRKTFIRRSTLSQHLRIHTGEKPYKCKECGQAFRQRAHLI
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XP_016 TSHTVRQSRETGEKLMECHECGKAFSRGSHLIQHQKIHTGEKPFGCKECGKAFSRASHLV
90 100 110 120 130 140
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pF1KSD RHHKLHTGEKPYECKECGKAFTVLQELTQHQRLHTGEKPYECKECGKAFRVHQQLARHQR
.:...:::::::.::.::::: .:: ::::::: ::::::::::.:: :.:: :::
XP_016 QHQRIHTGEKPYDCKDCGKAFGRTSELILHQRLHTGVKPYECKECGKTFRQHSQLILHQR
150 160 170 180 190 200
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pF1KSD IHTGEKPYECKDCGKTFRQCTHLTRHQRLHTAEKLYECKECGKAFVCGPDLRVHQKIHFG
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XP_016 THTGEKPYVCKDCGKAFIRGSQLTVHRRIHTGARPYECKECGKAFRQHSQLTVHQRIHTG
210 220 230 240 250 260
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pF1KSD EKPYECKECGKAFRICQQLTVHQSIHTGEKPYECKECGKTFRLRQQLVRHQRIHTREKPY
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XP_016 EKPYECKECGKGFIHSSEVTRHQRIHSGEKPYECKECGKAFRQHAQLTRHQRVHTGDRPY
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pF1KSD ECMECWKTFSSYSQLISHQSIHIGERPYECEECGKAFRLLSQLTQHQSIHTGEKPYECKE
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XP_016 ECKDCGKAFSRSSYLIQHQRIHTGDKPYECKECGKAFIRVSQLTHHQRIHTCEKPYECRE
330 340 350 360 370 380
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pF1KSD CRKPFRLLSQLTQHQSIHTGEKPYECKECGKAFRLYSFLTQHQRIHTGEKPYKCKECKKA
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XP_016 CGMAFIRSSQLTEHQRIHPGIKPYECRECGQAFILGSQLIEHYRIHTG
390 400 410 420 430
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pF1KSD FRQHSHLTQHQKIHNGI
>>XP_016881831 (OMIM: 614275) PREDICTED: zinc finger pro (434 aa)
initn: 1675 init1: 1675 opt: 1862 Z-score: 1025.4 bits: 199.1 E(85289): 2.2e-50
Smith-Waterman score: 1862; 59.4% identity (78.5% similar) in 438 aa overlap (67-504:1-434)
40 50 60 70 80 90
pF1KSD ENYSNFISLGPSISKPDVITLLDEERKEPGMVVREGTRRYCPDLESRYRTNTLSPEKDIY
:.. . : .::::::: . .:::.
XP_016 MIANDVTGPWCPDLESRCEKFL---QKDIF
10 20
100 110 120 130 140 150
pF1KSD EIYSFQWDIMERIKSYSLQGSIFRNDWECKSKIEGEKEQQEGYFGQVKITSEKMTTYKRH
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XP_016 EIGAFNWEIMESLKCSDLEGSDFRADWECEGQFE-RQVNEECYFKQVNVTYGHMPVFQHH
30 40 50 60 70 80
160 170 180 190 200 210
pF1KSD NFLTEYQIVHNGEKVYECKECRKTFIRRSTLSQHLRIHTGEKPYKCKECGQAFRQRAHLI
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XP_016 TSHTVRQSRETGEKLMECHECGKAFSRGSHLIQHQKIHTGEKPFGCKECGKAFSRASHLV
90 100 110 120 130 140
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pF1KSD RHHKLHTGEKPYECKECGKAFTVLQELTQHQRLHTGEKPYECKECGKAFRVHQQLARHQR
.:...:::::::.::.::::: .:: ::::::: ::::::::::.:: :.:: :::
XP_016 QHQRIHTGEKPYDCKDCGKAFGRTSELILHQRLHTGVKPYECKECGKTFRQHSQLILHQR
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pF1KSD IHTGEKPYECKDCGKTFRQCTHLTRHQRLHTAEKLYECKECGKAFVCGPDLRVHQKIHFG
::::::: ::::::.: . ..:: :.:.::. . :::::::::: .: :::.:: :
XP_016 THTGEKPYVCKDCGKAFIRGSQLTVHRRIHTGARPYECKECGKAFRQHSQLTVHQRIHTG
210 220 230 240 250 260
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pF1KSD EKPYECKECGKAFRICQQLTVHQSIHTGEKPYECKECGKTFRLRQQLVRHQRIHTREKPY
:::::::::::.: ...: :: ::.::::::::::::.:: . ::.::::.:: ..::
XP_016 EKPYECKECGKGFIHSSEVTRHQRIHSGEKPYECKECGKAFRQHAQLTRHQRVHTGDRPY
270 280 290 300 310 320
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pF1KSD ECMECWKTFSSYSQLISHQSIHIGERPYECEECGKAFRLLSQLTQHQSIHTGEKPYECKE
:: .: :.:: : ::.:: :: :..::::.:::::: .::::.:: ::: ::::::.:
XP_016 ECKDCGKAFSRSSYLIQHQRIHTGDKPYECKECGKAFIRVSQLTHHQRIHTCEKPYECRE
330 340 350 360 370 380
460 470 480 490 500 510
pF1KSD CRKPFRLLSQLTQHQSIHTGEKPYECKECGKAFRLYSFLTQHQRIHTGEKPYKCKECKKA
: : ::::.:: :: : :::::.:::.:: : : : .: :::::
XP_016 CGMAFIRSSQLTEHQRIHPGIKPYECRECGQAFILGSQLIEHYRIHTG
390 400 410 420 430
520 530
pF1KSD FRQHSHLTQHQKIHNGI
>>NP_653291 (OMIM: 615600) zinc finger protein 582 isofo (517 aa)
initn: 2902 init1: 1571 opt: 1858 Z-score: 1022.7 bits: 198.9 E(85289): 3.2e-50
Smith-Waterman score: 1860; 52.9% identity (73.1% similar) in 516 aa overlap (1-507:1-515)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAHGSVTFRDVAIDFSQEEWEFLDPAQRDLYRDVMWENYSNFISLGPSISKPDVITLLDE
:. :: :::::: ::::::..: ::::::::::: :.:::..::: ..::::::..: :
NP_653 MSLGSELFRDVAIVFSQEEWQWLAPAQRDLYRDVMLETYSNLVSLGLAVSKPDVISFL-E
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD ERKEPGMVVREGTRRYCPDLESRYRTNTLSPEKDIYEIYSFQWDIMERIKSYSLQGSIFR
. ::: :: : . :: ::::: :. : :.. .::. : ::.::: . ::.:. : :.
NP_653 QGKEPWMVERVVSGGLCPVLESRYDTKELFPKQHVYEVESPQWEIMESLTSYGLECSSFQ
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KSD NDWECKSKIEGEKEQQEGYFGQVKITSEKMTTYKRHNFLTEYQIVHNGEKVYECKECRKT
.::::..... .. . . .: :. : :.: :. .: :: :: .:. :: . ..:::
NP_653 DDWECRNQFDRQQGNPDRHFHQMIIRHEEMPTFDQHASLTFYQKIHTREKPFGYNKCRKD
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KSD FIRRSTLSQHLRIHTGEKPYKCKECGQAFRQRAHLIRHHKLHTGEKPYECKECGKAFTVL
: .. : .: :.:.::::::::::.::. ..::.:...:.:.::::::::::::.
NP_653 FWQKELLINHQGIYTNEKPYKCKECGKAFKYGSRLIQHENIHSGKKPYECKECGKAFNSG
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KSD QELTQHQRLHTGEKPYECKECGKAFRVHQQLARHQRIHTGEKPYECKDCGKTFRQCTHLT
... ::::.::::::::::.: ::: .:: .::: :::::::.::.:::.: . .::
NP_653 SNFIQHQRVHTGEKPYECKDCEKAFSRSSQLIEHQRTHTGEKPYQCKECGKAFNRISHLK
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KSD RHQRLHTAEKLYECKECGKAFVCGPDLRVHQKIHFGEKPYECKECGKAFRICQQLTVHQS
: :.::.:: : ::::::.: .: :: .: :.: :::::::::: . : ::
NP_653 VHYRIHTGEKPYACKECGKTFSHRSQLIQHQTVHTGRKLYECKECGKAFNQGSTLIRHQR
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KSD IHTGEKPYECKECGKTFRLRQQLVRHQRIHTREKPYECMECWKTFSSYSQLISHQSIHIG
::::::::::: :::.::. .:: .:::::: ::::.: : ..:. :.: : :: :
NP_653 IHTGEKPYECKVCGKAFRVSSQLKQHQRIHTGEKPYQCKVCGRAFKRVSHLTVHYRIHTG
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470
pF1KSD ERPYECEECGKAFRLLSQLTQHQSIHTGEKPYECKECRKPFRLLSQLTQHQSIHTGE---
:.::::.:::::: ::: .:: ::: .:::: :::.: . : .: : .:. :
NP_653 EKPYECKECGKAFSHCSQLIHHQVIHTEKKPYEYKECEKTLSHDSTTVQPQRMHNRETHV
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KSD ------KPYECKECGKAFRLYSFLTQHQRIHTGEKPYKCKECKKAFRQHSHLTQHQKIHN
:: . .: . . ..:. .::.:
NP_653 NIINVEKPSISSYPLLIIREFMLASNHMNGSNGESPLA
480 490 500 510
pF1KSD GI
>>NP_001307300 (OMIM: 615600) zinc finger protein 582 is (548 aa)
initn: 2902 init1: 1571 opt: 1858 Z-score: 1022.5 bits: 198.9 E(85289): 3.2e-50
Smith-Waterman score: 1860; 52.9% identity (73.1% similar) in 516 aa overlap (1-507:32-546)
10 20 30
pF1KSD MAHGSVTFRDVAIDFSQEEWEFLDPAQRDL
:. :: :::::: ::::::..: ::::::
NP_001 DPLALPSQDSALPQERNQKEDLSALEILKVMSLGSELFRDVAIVFSQEEWQWLAPAQRDL
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KSD YRDVMWENYSNFISLGPSISKPDVITLLDEERKEPGMVVREGTRRYCPDLESRYRTNTLS
::::: :.:::..::: ..::::::..: :. ::: :: : . :: ::::: :. :
NP_001 YRDVMLETYSNLVSLGLAVSKPDVISFL-EQGKEPWMVERVVSGGLCPVLESRYDTKELF
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KSD PEKDIYEIYSFQWDIMERIKSYSLQGSIFRNDWECKSKIEGEKEQQEGYFGQVKITSEKM
:.. .::. : ::.::: . ::.:. : :..::::..... .. . . .: :. : :.:
NP_001 PKQHVYEVESPQWEIMESLTSYGLECSSFQDDWECRNQFDRQQGNPDRHFHQMIIRHEEM
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KSD TTYKRHNFLTEYQIVHNGEKVYECKECRKTFIRRSTLSQHLRIHTGEKPYKCKECGQAFR
:. .: :: :: .:. :: . ..::: : .. : .: :.:.::::::::::.::.
NP_001 PTFDQHASLTFYQKIHTREKPFGYNKCRKDFWQKELLINHQGIYTNEKPYKCKECGKAFK
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KSD QRAHLIRHHKLHTGEKPYECKECGKAFTVLQELTQHQRLHTGEKPYECKECGKAFRVHQQ
..::.:...:.:.::::::::::::. ... ::::.::::::::::.: ::: .:
NP_001 YGSRLIQHENIHSGKKPYECKECGKAFNSGSNFIQHQRVHTGEKPYECKDCEKAFSRSSQ
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KSD LARHQRIHTGEKPYECKDCGKTFRQCTHLTRHQRLHTAEKLYECKECGKAFVCGPDLRVH
: .::: :::::::.::.:::.: . .:: : :.::.:: : ::::::.: .: :
NP_001 LIEHQRTHTGEKPYQCKECGKAFNRISHLKVHYRIHTGEKPYACKECGKTFSHRSQLIQH
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KSD QKIHFGEKPYECKECGKAFRICQQLTVHQSIHTGEKPYECKECGKTFRLRQQLVRHQRIH
: .: :.: :::::::::: . : :: ::::::::::: :::.::. .:: .:::::
NP_001 QTVHTGRKLYECKECGKAFNQGSTLIRHQRIHTGEKPYECKVCGKAFRVSSQLKQHQRIH
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KSD TREKPYECMECWKTFSSYSQLISHQSIHIGERPYECEECGKAFRLLSQLTQHQSIHTGEK
: ::::.: : ..:. :.: : :: ::.::::.:::::: ::: .:: ::: .:
NP_001 TGEKPYQCKVCGRAFKRVSHLTVHYRIHTGEKPYECKECGKAFSHCSQLIHHQVIHTEKK
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490 500
pF1KSD PYECKECRKPFRLLSQLTQHQSIHTGE---------KPYECKECGKAFRLYSFLTQHQRI
::: :::.: . : .: : .:. : :: . .: . . ..:.
NP_001 PYEYKECEKTLSHDSTTVQPQRMHNRETHVNIINVEKPSISSYPLLIIREFMLASNHMNG
490 500 510 520 530 540
510 520 530
pF1KSD HTGEKPYKCKECKKAFRQHSHLTQHQKIHNGI
.::.:
NP_001 SNGESPLA
>>NP_001152765 (OMIM: 603984) zinc finger protein 737 [H (536 aa)
initn: 3021 init1: 1553 opt: 1853 Z-score: 1019.9 bits: 198.4 E(85289): 4.5e-50
Smith-Waterman score: 1860; 49.5% identity (75.5% similar) in 539 aa overlap (4-532:2-533)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAHGSVTFRDVAIDFSQEEWEFLDPAQRDLYRDVMWENYSNFISLGPSISKPDVITLLDE
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