Result of FASTA (omim) for
pF1KSDA1542
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1542, 1649 aa
1>>>pF1KSDA1542 1649 - 1649 aa - 1649 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.1570+/-0.000448; mu= -5.6571+/- 0.028
mean_var=506.6981+/-102.805, 0's: 0 Z-trim(123.2): 207 B-trim: 577 in 1/61
Lambda= 0.056977
statistics sampled from 42293 (42588) to 42293 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.778), E-opt: 0.2 (0.499), width: 16
Scan time: 22.540
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001273510 (OMIM: 611780) PHD and RING finger do (1649) 11098 928.5 0
NP_065952 (OMIM: 611780) PHD and RING finger domai (1648) 11081 927.1 0
XP_005253082 (OMIM: 611780) PREDICTED: PHD and RIN (1648) 11080 927.1 0
XP_011518538 (OMIM: 611780) PREDICTED: PHD and RIN (1647) 11073 926.5 0
NP_001273511 (OMIM: 611780) PHD and RING finger do (1647) 11063 925.7 0
XP_005253084 (OMIM: 611780) PREDICTED: PHD and RIN (1646) 11058 925.2 0
NP_001273512 (OMIM: 611780) PHD and RING finger do (1645) 11050 924.6 0
XP_011518539 (OMIM: 611780) PREDICTED: PHD and RIN (1609) 10613 888.7 0
XP_016875712 (OMIM: 603668) PREDICTED: protein SCA (1411) 525 59.4 2.7e-07
XP_016875711 (OMIM: 603668) PREDICTED: protein SCA (1418) 525 59.4 2.7e-07
XP_016875710 (OMIM: 603668) PREDICTED: protein SCA (1428) 525 59.4 2.7e-07
NP_004710 (OMIM: 603668) protein SCAF11 [Homo sapi (1463) 525 59.4 2.8e-07
XP_011537287 (OMIM: 603668) PREDICTED: protein SCA (1463) 525 59.4 2.8e-07
XP_005269287 (OMIM: 603668) PREDICTED: protein SCA (1463) 525 59.4 2.8e-07
XP_016875706 (OMIM: 603668) PREDICTED: protein SCA (1473) 525 59.4 2.8e-07
XP_016875708 (OMIM: 603668) PREDICTED: protein SCA (1473) 525 59.4 2.8e-07
XP_011537286 (OMIM: 603668) PREDICTED: protein SCA (1479) 525 59.4 2.8e-07
XP_016875709 (OMIM: 603668) PREDICTED: protein SCA (1400) 516 58.6 4.5e-07
XP_016875707 (OMIM: 603668) PREDICTED: protein SCA (1436) 349 44.9 0.0062
XP_016855519 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 804) 337 43.7 0.0082
XP_016855520 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 804) 337 43.7 0.0082
XP_016855506 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 848) 337 43.7 0.0085
XP_016855509 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 887) 337 43.7 0.0087
XP_016855513 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 832) 336 43.6 0.0089
XP_016855501 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 876) 336 43.6 0.0092
XP_016855512 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 834) 335 43.5 0.0094
XP_005245777 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 915) 336 43.6 0.0095
XP_016855500 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 878) 335 43.5 0.0097
>>NP_001273510 (OMIM: 611780) PHD and RING finger domain (1649 aa)
initn: 11098 init1: 11098 opt: 11098 Z-score: 4948.2 bits: 928.5 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 11098; 99.9% identity (100.0% similar) in 1649 aa overlap (1-1649:1-1649)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MDDDSLDELVARSPGPDGHPQVGPADPAGDFEESSVGSSGDSGDDSDSEHGDGTDGEDEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MDDDSLDELVARSPGPDGHPQVGPADPAGDFEESSVGSSGDSGDDSDSEHGDGTDGEDEG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD ASEEEDLEDRSGSEDSEDDGETLLEVAGTQGKLEAAGSFNSDDDAESCPICLNAFRDQAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ASEEEDLEDRSGSEDSEDDGETLLEVAGTQGKLEAAGSFNSDDDAESCPICLNAFRDQAV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD GTPENCAHYFCLDCIVEWSKNANSCPVDRTLFKCICIRAQFGGKILKKIPVENTKASEEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
NP_001 GTPENCAHYFCLDCIVEWSKNANSCPVDRTLFKCICIRAQFGGKILRKIPVENTKASEEE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD EDPTFCEVCGRSDREDRLLLCDGCDAGYHMECLDPPLQEVPVDEWFCPECAAPGVVLAAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EDPTFCEVCGRSDREDRLLLCDGCDAGYHMECLDPPLQEVPVDEWFCPECAAPGVVLAAD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD AGPVSEEEVSLLLADVVPTTSRLRPRAGRTRAIARTRQSERVRATVNRNRISTARRVQHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AGPVSEEEVSLLLADVVPTTSRLRPRAGRTRAIARTRQSERVRATVNRNRISTARRVQHT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD PGRLGSSLLDEAIEAVATGLSTAVYQRPLTPRTPARRKRKTRRRKKVPGRKKTPSGPSAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PGRLGSSLLDEAIEAVATGLSTAVYQRPLTPRTPARRKRKTRRRKKVPGRKKTPSGPSAK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD SKSSATRSKKRQHRVKKRRGKKVKSEATTRSRIARTLGLRRPVHSSCIPSVLKPVEPSLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SKSSATRSKKRQHRVKKRRGKKVKSEATTRSRIARTLGLRRPVHSSCIPSVLKPVEPSLG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD LLRADIGAASLSLFGDPYELDPFDSSEELSANPLSPLSAKRRALSRSALQSHQPVARPVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LLRADIGAASLSLFGDPYELDPFDSSEELSANPLSPLSAKRRALSRSALQSHQPVARPVS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD VGLSRRRLPAAVPEPDLEEEPVPDLLGSILSGQSLLMLGSSDVIIHRDGSLSAKRAAPVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VGLSRRRLPAAVPEPDLEEEPVPDLLGSILSGQSLLMLGSSDVIIHRDGSLSAKRAAPVS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD FQRNSGSLSRGEEGFKGCLQPRALPSGSPAQGPSGNRPQSTGLSCQGRSRTPARTAGAPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FQRNSGSLSRGEEGFKGCLQPRALPSGSPAQGPSGNRPQSTGLSCQGRSRTPARTAGAPV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD RLDLPAAPGAVQARNLSNGSVPGFRQSHSPWFNGTNKHTLPLASAASKISSRDSKPPCRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RLDLPAAPGAVQARNLSNGSVPGFRQSHSPWFNGTNKHTLPLASAASKISSRDSKPPCRS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD VVPGPPLKPAPRRTDISELPRIPKIRRDDGGGRRDAAPAHGQSIEIPSACISRLTGREGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VVPGPPLKPAPRRTDISELPRIPKIRRDDGGGRRDAAPAHGQSIEIPSACISRLTGREGT
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD GQPGRGTRAESEASSRVPREPGVHTGSSRPPAPSSHGSLAPLGPSRGKGVGSTFESFRIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GQPGRGTRAESEASSRVPREPGVHTGSSRPPAPSSHGSLAPLGPSRGKGVGSTFESFRIN
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD IPGNMAHSSQLSSPGFCNTFRPVDDKEQRKENPSPLFSIKKTKQLRSEVYDPSDPTGSDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IPGNMAHSSQLSSPGFCNTFRPVDDKEQRKENPSPLFSIKKTKQLRSEVYDPSDPTGSDS
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD SAPGSSPERSGPGLLPSEITRTISINSPKAQTVQAVRCVTSYTVESIFGTEPEPPLGPSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SAPGSSPERSGPGLLPSEITRTISINSPKAQTVQAVRCVTSYTVESIFGTEPEPPLGPSS
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD AMSKLRGAVAAEGASDTEREEPTESQGLAARLRRPSPPEPWDEEDGASCSTFFGSEERTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AMSKLRGAVAAEGASDTEREEPTESQGLAARLRRPSPPEPWDEEDGASCSTFFGSEERTV
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD TCVTVVEPEAPPSPDVLQAATHRVVELRPPSRSRSTSSSRSRKKAKRKRVSREHGRTRSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TCVTVVEPEAPPSPDVLQAATHRVVELRPPSRSRSTSSSRSRKKAKRKRVSREHGRTRSG
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD TRSESRDRSSRSASPSVGEERPRRQRSKAKSRRSSSDRSSSRERAKRKKAKDKSREHRRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TRSESRDRSSRSASPSVGEERPRRQRSKAKSRRSSSDRSSSRERAKRKKAKDKSREHRRG
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD PWGHSRRTSRSRSGSPGSSSYEHYESRKKKKRRSASRPRGRECSPTSSLERLCRHKHQRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PWGHSRRTSRSRSGSPGSSSYEHYESRKKKKRRSASRPRGRECSPTSSLERLCRHKHQRE
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD RSHERPDRKESVAWPRDRRKRRSRSPSSEHRAREHRRPRSREKWPQTRSHSPERKGAVRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RSHERPDRKESVAWPRDRRKRRSRSPSSEHRAREHRRPRSREKWPQTRSHSPERKGAVRE
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD ASPAPLAQGEPGREDLPTRLPALGEAHVSPEVATADKAPLQAPPVLEVAAECEPDDLDLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ASPAPLAQGEPGREDLPTRLPALGEAHVSPEVATADKAPLQAPPVLEVAAECEPDDLDLD
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD YGDSVEAGHVFDDFSSDAVFIQLDDMSSPPSPESTDSSPERDFPLKPALPPASLAVAAIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YGDSVEAGHVFDDFSSDAVFIQLDDMSSPPSPESTDSSPERDFPLKPALPPASLAVAAIQ
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD REVSLMHDEDPSQPPPLPEGTQEPHLLRPDAAEKAEAPSSPDVAPAGKEDSPSASGRVQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 REVSLMHDEDPSQPPPLPEGTQEPHLLRPDAAEKAEAPSSPDVAPAGKEDSPSASGRVQE
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KSD AARPEEVVSQTPLLRSRALVKRVTWNLQESESSAPAEDRAPRAPLHRPQKPREGAWDMED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AARPEEVVSQTPLLRSRALVKRVTWNLQESESSAPAEDRAPRAPLHRPQKPREGAWDMED
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KSD VAPTGVRQAFSELPFPSHVLPEPGFPDTDPSQVYSPGLPPAPAQPSSIPPCALVSQPTVQ
::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VAPTGVRQVFSELPFPSHVLPEPGFPDTDPSQVYSPGLPPAPAQPSSIPPCALVSQPTVQ
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KSD FILQGSLPLVGCGAAQTLAPVPAALTPASEPASQATAASNSEEKTPAPRLAAEKTKKEEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FILQGSLPLVGCGAAQTLAPVPAALTPASEPASQATAASNSEEKTPAPRLAAEKTKKEEY
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KSD MKKLHMQERAVEEVKLAIKPFYQKREVTKEEYKDILRKAVQKICHSKSGEINPVKVANLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MKKLHMQERAVEEVKLAIKPFYQKREVTKEEYKDILRKAVQKICHSKSGEINPVKVANLV
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640
pF1KSD KAYVDKYRHMRRHKKPEAGEEPPTQGAEG
:::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KAYVDKYRHMRRHKKPEAGEEPPTQGAEG
1630 1640
>>NP_065952 (OMIM: 611780) PHD and RING finger domain-co (1648 aa)
initn: 8091 init1: 8091 opt: 11081 Z-score: 4940.6 bits: 927.1 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 11081; 99.8% identity (99.9% similar) in 1649 aa overlap (1-1649:1-1648)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MDDDSLDELVARSPGPDGHPQVGPADPAGDFEESSVGSSGDSGDDSDSEHGDGTDGEDEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 MDDDSLDELVARSPGPDGHPQVGPADPAGDFEESSVGSSGDSGDDSDSEHGDGTDGEDEG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD ASEEEDLEDRSGSEDSEDDGETLLEVAGTQGKLEAAGSFNSDDDAESCPICLNAFRDQAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 ASEEEDLEDRSGSEDSEDDGETLLEVAGTQGKLEAAGSFNSDDDAESCPICLNAFRDQAV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD GTPENCAHYFCLDCIVEWSKNANSCPVDRTLFKCICIRAQFGGKILKKIPVENTKASEEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
NP_065 GTPENCAHYFCLDCIVEWSKNANSCPVDRTLFKCICIRAQFGGKILRKIPVENTKASEEE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD EDPTFCEVCGRSDREDRLLLCDGCDAGYHMECLDPPLQEVPVDEWFCPECAAPGVVLAAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 EDPTFCEVCGRSDREDRLLLCDGCDAGYHMECLDPPLQEVPVDEWFCPECAAPGVVLAAD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD AGPVSEEEVSLLLADVVPTTSRLRPRAGRTRAIARTRQSERVRATVNRNRISTARRVQHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 AGPVSEEEVSLLLADVVPTTSRLRPRAGRTRAIARTRQSERVRATVNRNRISTARRVQHT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD PGRLGSSLLDEAIEAVATGLSTAVYQRPLTPRTPARRKRKTRRRKKVPGRKKTPSGPSAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 PGRLGSSLLDEAIEAVATGLSTAVYQRPLTPRTPARRKRKTRRRKKVPGRKKTPSGPSAK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD SKSSATRSKKRQHRVKKRRGKKVKSEATTRSRIARTLGLRRPVHSSCIPSVLKPVEPSLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 SKSSATRSKKRQHRVKKRRGKKVKSEATTRSRIARTLGLRRPVHSSCIPSVLKPVEPSLG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD LLRADIGAASLSLFGDPYELDPFDSSEELSANPLSPLSAKRRALSRSALQSHQPVARPVS
::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 LLRADIGAASLSLFGDPYELDPFDS-EELSANPLSPLSAKRRALSRSALQSHQPVARPVS
430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KSD VGLSRRRLPAAVPEPDLEEEPVPDLLGSILSGQSLLMLGSSDVIIHRDGSLSAKRAAPVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 VGLSRRRLPAAVPEPDLEEEPVPDLLGSILSGQSLLMLGSSDVIIHRDGSLSAKRAAPVS
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KSD FQRNSGSLSRGEEGFKGCLQPRALPSGSPAQGPSGNRPQSTGLSCQGRSRTPARTAGAPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 FQRNSGSLSRGEEGFKGCLQPRALPSGSPAQGPSGNRPQSTGLSCQGRSRTPARTAGAPV
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KSD RLDLPAAPGAVQARNLSNGSVPGFRQSHSPWFNGTNKHTLPLASAASKISSRDSKPPCRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 RLDLPAAPGAVQARNLSNGSVPGFRQSHSPWFNGTNKHTLPLASAASKISSRDSKPPCRS
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KSD VVPGPPLKPAPRRTDISELPRIPKIRRDDGGGRRDAAPAHGQSIEIPSACISRLTGREGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 VVPGPPLKPAPRRTDISELPRIPKIRRDDGGGRRDAAPAHGQSIEIPSACISRLTGREGT
660 670 680 690 700 710
730 740 750 760 770 780
pF1KSD GQPGRGTRAESEASSRVPREPGVHTGSSRPPAPSSHGSLAPLGPSRGKGVGSTFESFRIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 GQPGRGTRAESEASSRVPREPGVHTGSSRPPAPSSHGSLAPLGPSRGKGVGSTFESFRIN
720 730 740 750 760 770
790 800 810 820 830 840
pF1KSD IPGNMAHSSQLSSPGFCNTFRPVDDKEQRKENPSPLFSIKKTKQLRSEVYDPSDPTGSDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 IPGNMAHSSQLSSPGFCNTFRPVDDKEQRKENPSPLFSIKKTKQLRSEVYDPSDPTGSDS
780 790 800 810 820 830
850 860 870 880 890 900
pF1KSD SAPGSSPERSGPGLLPSEITRTISINSPKAQTVQAVRCVTSYTVESIFGTEPEPPLGPSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 SAPGSSPERSGPGLLPSEITRTISINSPKAQTVQAVRCVTSYTVESIFGTEPEPPLGPSS
840 850 860 870 880 890
910 920 930 940 950 960
pF1KSD AMSKLRGAVAAEGASDTEREEPTESQGLAARLRRPSPPEPWDEEDGASCSTFFGSEERTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 AMSKLRGAVAAEGASDTEREEPTESQGLAARLRRPSPPEPWDEEDGASCSTFFGSEERTV
900 910 920 930 940 950
970 980 990 1000 1010 1020
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NP_065 TCVTVVEPEAPPSPDVLQAATHRVVELRPPSRSRSTSSSRSRKKAKRKRVSREHGRTRSG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 PWGHSRRTSRSRSGSPGSSSYEHYESRKKKKRRSASRPRGRECSPTSSLERLCRHKHQRE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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NP_065 YGDSVEAGHVFDDFSSDAVFIQLDDMSSPPSPESTDSSPERDFPLKPALPPASLAVAAIQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 REVSLMHDEDPSQPPPLPEGTQEPHLLRPDAAEKAEAPSSPDVAPAGKEDSPSASGRVQE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 AARPEEVVSQTPLLRSRALVKRVTWNLQESESSAPAEDRAPRAPLHRPQKPREGAWDMED
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 FILQGSLPLVGCGAAQTLAPVPAALTPASEPASQATAASNSEEKTPAPRLAAEKTKKEEY
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 MKKLHMQERAVEEVKLAIKPFYQKREVTKEEYKDILRKAVQKICHSKSGEINPVKVANLV
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NP_065 KAYVDKYRHMRRHKKPEAGEEPPTQGAEG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PWGHSRRTSRSRSGSPGSSSYEHYESRKKKKRRSASRPRGRECSPTSSLERLCRHKHQRE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ASPAPLAQGEPGREDLPTRLPALGEAHVSPEVATADKAPLQAPPVLEVAAECEPDDLDLD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 REVSLMHDEDPSQPPPLPEGTQEPHLLRPDAAEKAEAPSSPDVAPAGKEDSPSASGRVQE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 AARPEEVVSQTPLLRSRALVKRVTWNLQESESSAPAEDRAPRAPLHRPQKPREGAWDMED
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::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VAPTGVRQVFSELPFPSHVLPEPGFPDTDPSQVYSPGLPPAPAQPSSIPPCALVSQPTVQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 FILQGSLPLVGCGAAQTLAPVPAALTPASEPASQATAASNSEEKTPAPRLAAEKTKKEEY
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MKKLHMQERAVEEVKLAIKPFYQKREVTKEEYKDILRKAVQKICHSKSGEINPVKVANLV
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:::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KAYVDKYRHMRRHKKPEAGEEPPTQGAEG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MDDDSLDELVARSPGPDGHPQVGPADPAGDFEESSVGSSGDSGDDSDSEHGDGTDGEDEG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ASEEEDLEDRSGSEDSEDDGETLLEVAGTQGKLEAAGSFNSDDDAESCPICLNAFRDQAV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
XP_011 GTPENCAHYFCLDCIVEWSKNANSCPVDRTLFKCICIRAQFGGKILRKIPVENTKASEEE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EDPTFCEVCGRSDREDRLLLCDGCDAGYHMECLDPPLQEVPVDEWFCPECAAPGVVLAAD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AGPVSEEEVSLLLADVVPTTSRLRPRAGRTRAIARTRQSERVRATVNRNRISTARRVQHT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PGRLGSSLLDEAIEAVATGLSTAVYQRPLTPRTPARRKRKTRRRKKVPGRKKTPSGPSAK
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pF1KSD SKSSATRSKKRQHRVKKRRGKKVKSEATTRSRIARTLGLRRPVHSSCIPSVLKPVEPSLG
:::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SKSSATRSKKRQHRVKKRRGKK--SEATTRSRIARTLGLRRPVHSSCIPSVLKPVEPSLG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LLRADIGAASLSLFGDPYELDPFDSSEELSANPLSPLSAKRRALSRSALQSHQPVARPVS
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pF1KSD VGLSRRRLPAAVPEPDLEEEPVPDLLGSILSGQSLLMLGSSDVIIHRDGSLSAKRAAPVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VGLSRRRLPAAVPEPDLEEEPVPDLLGSILSGQSLLMLGSSDVIIHRDGSLSAKRAAPVS
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pF1KSD FQRNSGSLSRGEEGFKGCLQPRALPSGSPAQGPSGNRPQSTGLSCQGRSRTPARTAGAPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FQRNSGSLSRGEEGFKGCLQPRALPSGSPAQGPSGNRPQSTGLSCQGRSRTPARTAGAPV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RLDLPAAPGAVQARNLSNGSVPGFRQSHSPWFNGTNKHTLPLASAASKISSRDSKPPCRS
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pF1KSD VVPGPPLKPAPRRTDISELPRIPKIRRDDGGGRRDAAPAHGQSIEIPSACISRLTGREGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VVPGPPLKPAPRRTDISELPRIPKIRRDDGGGRRDAAPAHGQSIEIPSACISRLTGREGT
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pF1KSD GQPGRGTRAESEASSRVPREPGVHTGSSRPPAPSSHGSLAPLGPSRGKGVGSTFESFRIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GQPGRGTRAESEASSRVPREPGVHTGSSRPPAPSSHGSLAPLGPSRGKGVGSTFESFRIN
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pF1KSD IPGNMAHSSQLSSPGFCNTFRPVDDKEQRKENPSPLFSIKKTKQLRSEVYDPSDPTGSDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IPGNMAHSSQLSSPGFCNTFRPVDDKEQRKENPSPLFSIKKTKQLRSEVYDPSDPTGSDS
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pF1KSD SAPGSSPERSGPGLLPSEITRTISINSPKAQTVQAVRCVTSYTVESIFGTEPEPPLGPSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SAPGSSPERSGPGLLPSEITRTISINSPKAQTVQAVRCVTSYTVESIFGTEPEPPLGPSS
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pF1KSD AMSKLRGAVAAEGASDTEREEPTESQGLAARLRRPSPPEPWDEEDGASCSTFFGSEERTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AMSKLRGAVAAEGASDTEREEPTESQGLAARLRRPSPPEPWDEEDGASCSTFFGSEERTV
900 910 920 930 940 950
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pF1KSD TCVTVVEPEAPPSPDVLQAATHRVVELRPPSRSRSTSSSRSRKKAKRKRVSREHGRTRSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TCVTVVEPEAPPSPDVLQAATHRVVELRPPSRSRSTSSSRSRKKAKRKRVSREHGRTRSG
960 970 980 990 1000 1010
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pF1KSD TRSESRDRSSRSASPSVGEERPRRQRSKAKSRRSSSDRSSSRERAKRKKAKDKSREHRRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TRSESRDRSSRSASPSVGEERPRRQRSKAKSRRSSSDRSSSRERAKRKKAKDKSREHRRG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PWGHSRRTSRSRSGSPGSSSYEHYESRKKKKRRSASRPRGRECSPTSSLERLCRHKHQRE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RSHERPDRKESVAWPRDRRKRRSRSPSSEHRAREHRRPRSREKWPQTRSHSPERKGAVRE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ASPAPLAQGEPGREDLPTRLPALGEAHVSPEVATADKAPLQAPPVLEVAAECEPDDLDLD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YGDSVEAGHVFDDFSSDAVFIQLDDMSSPPSPESTDSSPERDFPLKPALPPASLAVAAIQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 REVSLMHDEDPSQPPPLPEGTQEPHLLRPDAAEKAEAPSSPDVAPAGKEDSPSASGRVQE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AARPEEVVSQTPLLRSRALVKRVTWNLQESESSAPAEDRAPRAPLHRPQKPREGAWDMED
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::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VAPTGVRQVFSELPFPSHVLPEPGFPDTDPSQVYSPGLPPAPAQPSSIPPCALVSQPTVQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FILQGSLPLVGCGAAQTLAPVPAALTPASEPASQATAASNSEEKTPAPRLAAEKTKKEEY
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MKKLHMQERAVEEVKLAIKPFYQKREVTKEEYKDILRKAVQKICHSKSGEINPVKVANLV
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:::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KAYVDKYRHMRRHKKPEAGEEPPTQGAEG
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Smith-Waterman score: 11063; 99.8% identity (99.9% similar) in 1649 aa overlap (1-1649:1-1647)
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NP_001 ASEEEDLEDRSGSEDSEDDGETLLEVAGTQGKLEAAGSFNSDDDAESCPICLNAFRDQAV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EDPTFCEVCGRSDREDRLLLCDGCDAGYHMECLDPPLQEVPVDEWFCPECAAPGVVLAAD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AGPVSEEEVSLLLADVVPTTSRLRPRAGRTRAIARTRQSERVRATVNRNRISTARRVQHT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PGRLGSSLLDEAIEAVATGLSTAVYQRPLTPRTPARRKRKTRRRKKVPGRKKTPSGPSAK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VVPGPPLKPAPRRTDISELPRIPKIRRDDGGGRRDAAPAHGQSIEIPSACISRLTGREGT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IPGNMAHSSQLSSPGFCNTFRPVDDKEQRKENPSPLFSIKKTKQLRSEVYDPSDPTGSDS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AMSKLRGAVAAEGASDTEREEPTESQGLAARLRRPSPPEPWDEEDGASCSTFFGSEERTV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TCVTVVEPEAPPSPDVLQAATHRVVELRPPSRSRSTSSSRSRKKAKRKRVSREHGRTRSG
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pF1KSD TRSESRDRSSRSASPSVGEERPRRQRSKAKSRRSSSDRSSSRERAKRKKAKDKSREHRRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TRSESRDRSSRSASPSVGEERPRRQRSKAKSRRSSSDRSSSRERAKRKKAKDKSREHRRG
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pF1KSD PWGHSRRTSRSRSGSPGSSSYEHYESRKKKKRRSASRPRGRECSPTSSLERLCRHKHQRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PWGHSRRTSRSRSGSPGSSSYEHYESRKKKKRRSASRPRGRECSPTSSLERLCRHKHQRE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RSHERPDRKESVAWPRDRRKRRSRSPSSEHRAREHRRPRSREKWPQTRSHSPERKGAVRE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ASPAPLAQGEPGREDLPTRLPALGEAHVSPEVATADKAPLQAPPVLEVAAECEPDDLDLD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YGDSVEAGHVFDDFSSDAVFIQLDDMSSPPSPESTDSSPERDFPLKPALPPASLAVAAIQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 REVSLMHDEDPSQPPPLPEGTQEPHLLRPDAAEKAEAPSSPDVAPAGKEDSPSASGRVQE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AARPEEVVSQTPLLRSRALVKRVTWNLQESESSAPAEDRAPRAPLHRPQKPREGAWDMED
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pF1KSD VAPTGVRQAFSELPFPSHVLPEPGFPDTDPSQVYSPGLPPAPAQPSSIPPCALVSQPTVQ
::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VAPTGVRQVFSELPFPSHVLPEPGFPDTDPSQVYSPGLPPAPAQPSSIPPCALVSQPTVQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FILQGSLPLVGCGAAQTLAPVPAALTPASEPASQATAASNSEEKTPAPRLAAEKTKKEEY
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pF1KSD MKKLHMQERAVEEVKLAIKPFYQKREVTKEEYKDILRKAVQKICHSKSGEINPVKVANLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MKKLHMQERAVEEVKLAIKPFYQKREVTKEEYKDILRKAVQKICHSKSGEINPVKVANLV
1560 1570 1580 1590 1600 1610
1630 1640
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:::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KAYVDKYRHMRRHKKPEAGEEPPTQGAEG
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Smith-Waterman score: 11058; 99.7% identity (99.8% similar) in 1649 aa overlap (1-1649:1-1646)
10 20 30 40 50 60
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:::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MDDDSLDELVARSPGPDGHPQVGPADPA---EESSVGSSGDSGDDSDSEHGDGTDGEDEG
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pF1KSD ASEEEDLEDRSGSEDSEDDGETLLEVAGTQGKLEAAGSFNSDDDAESCPICLNAFRDQAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ASEEEDLEDRSGSEDSEDDGETLLEVAGTQGKLEAAGSFNSDDDAESCPICLNAFRDQAV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
XP_005 GTPENCAHYFCLDCIVEWSKNANSCPVDRTLFKCICIRAQFGGKILRKIPVENTKASEEE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EDPTFCEVCGRSDREDRLLLCDGCDAGYHMECLDPPLQEVPVDEWFCPECAAPGVVLAAD
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pF1KSD AGPVSEEEVSLLLADVVPTTSRLRPRAGRTRAIARTRQSERVRATVNRNRISTARRVQHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 AGPVSEEEVSLLLADVVPTTSRLRPRAGRTRAIARTRQSERVRATVNRNRISTARRVQHT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PGRLGSSLLDEAIEAVATGLSTAVYQRPLTPRTPARRKRKTRRRKKVPGRKKTPSGPSAK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SKSSATRSKKRQHRVKKRRGKKVKSEATTRSRIARTLGLRRPVHSSCIPSVLKPVEPSLG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LLRADIGAASLSLFGDPYELDPFDSSEELSANPLSPLSAKRRALSRSALQSHQPVARPVS
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pF1KSD VGLSRRRLPAAVPEPDLEEEPVPDLLGSILSGQSLLMLGSSDVIIHRDGSLSAKRAAPVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VGLSRRRLPAAVPEPDLEEEPVPDLLGSILSGQSLLMLGSSDVIIHRDGSLSAKRAAPVS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 FQRNSGSLSRGEEGFKGCLQPRALPSGSPAQGPSGNRPQSTGLSCQGRSRTPARTAGAPV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RLDLPAAPGAVQARNLSNGSVPGFRQSHSPWFNGTNKHTLPLASAASKISSRDSKPPCRS
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pF1KSD VVPGPPLKPAPRRTDISELPRIPKIRRDDGGGRRDAAPAHGQSIEIPSACISRLTGREGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VVPGPPLKPAPRRTDISELPRIPKIRRDDGGGRRDAAPAHGQSIEIPSACISRLTGREGT
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pF1KSD GQPGRGTRAESEASSRVPREPGVHTGSSRPPAPSSHGSLAPLGPSRGKGVGSTFESFRIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GQPGRGTRAESEASSRVPREPGVHTGSSRPPAPSSHGSLAPLGPSRGKGVGSTFESFRIN
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pF1KSD IPGNMAHSSQLSSPGFCNTFRPVDDKEQRKENPSPLFSIKKTKQLRSEVYDPSDPTGSDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 IPGNMAHSSQLSSPGFCNTFRPVDDKEQRKENPSPLFSIKKTKQLRSEVYDPSDPTGSDS
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pF1KSD SAPGSSPERSGPGLLPSEITRTISINSPKAQTVQAVRCVTSYTVESIFGTEPEPPLGPSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SAPGSSPERSGPGLLPSEITRTISINSPKAQTVQAVRCVTSYTVESIFGTEPEPPLGPSS
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pF1KSD AMSKLRGAVAAEGASDTEREEPTESQGLAARLRRPSPPEPWDEEDGASCSTFFGSEERTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 AMSKLRGAVAAEGASDTEREEPTESQGLAARLRRPSPPEPWDEEDGASCSTFFGSEERTV
900 910 920 930 940 950
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pF1KSD TCVTVVEPEAPPSPDVLQAATHRVVELRPPSRSRSTSSSRSRKKAKRKRVSREHGRTRSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TCVTVVEPEAPPSPDVLQAATHRVVELRPPSRSRSTSSSRSRKKAKRKRVSREHGRTRSG
960 970 980 990 1000 1010
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pF1KSD TRSESRDRSSRSASPSVGEERPRRQRSKAKSRRSSSDRSSSRERAKRKKAKDKSREHRRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TRSESRDRSSRSASPSVGEERPRRQRSKAKSRRSSSDRSSSRERAKRKKAKDKSREHRRG
1020 1030 1040 1050 1060 1070
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pF1KSD PWGHSRRTSRSRSGSPGSSSYEHYESRKKKKRRSASRPRGRECSPTSSLERLCRHKHQRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PWGHSRRTSRSRSGSPGSSSYEHYESRKKKKRRSASRPRGRECSPTSSLERLCRHKHQRE
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD RSHERPDRKESVAWPRDRRKRRSRSPSSEHRAREHRRPRSREKWPQTRSHSPERKGAVRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RSHERPDRKESVAWPRDRRKRRSRSPSSEHRAREHRRPRSREKWPQTRSHSPERKGAVRE
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1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD ASPAPLAQGEPGREDLPTRLPALGEAHVSPEVATADKAPLQAPPVLEVAAECEPDDLDLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ASPAPLAQGEPGREDLPTRLPALGEAHVSPEVATADKAPLQAPPVLEVAAECEPDDLDLD
1200 1210 1220 1230 1240 1250
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 YGDSVEAGHVFDDFSSDAVFIQLDDMSSPPSPESTDSSPERDFPLKPALPPASLAVAAIQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 REVSLMHDEDPSQPPPLPEGTQEPHLLRPDAAEKAEAPSSPDVAPAGKEDSPSASGRVQE
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pF1KSD AARPEEVVSQTPLLRSRALVKRVTWNLQESESSAPAEDRAPRAPLHRPQKPREGAWDMED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 AARPEEVVSQTPLLRSRALVKRVTWNLQESESSAPAEDRAPRAPLHRPQKPREGAWDMED
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::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VAPTGVRQVFSELPFPSHVLPEPGFPDTDPSQVYSPGLPPAPAQPSSIPPCALVSQPTVQ
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pF1KSD FILQGSLPLVGCGAAQTLAPVPAALTPASEPASQATAASNSEEKTPAPRLAAEKTKKEEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 FILQGSLPLVGCGAAQTLAPVPAALTPASEPASQATAASNSEEKTPAPRLAAEKTKKEEY
1500 1510 1520 1530 1540 1550
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MKKLHMQERAVEEVKLAIKPFYQKREVTKEEYKDILRKAVQKICHSKSGEINPVKVANLV
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1630 1640
pF1KSD KAYVDKYRHMRRHKKPEAGEEPPTQGAEG
:::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KAYVDKYRHMRRHKKPEAGEEPPTQGAEG
1620 1630 1640
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Smith-Waterman score: 11050; 99.6% identity (99.8% similar) in 1649 aa overlap (1-1649:1-1645)
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:::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MDDDSLDELVARSPGPDGHPQVGPADPA----ESSVGSSGDSGDDSDSEHGDGTDGEDEG
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pF1KSD ASEEEDLEDRSGSEDSEDDGETLLEVAGTQGKLEAAGSFNSDDDAESCPICLNAFRDQAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ASEEEDLEDRSGSEDSEDDGETLLEVAGTQGKLEAAGSFNSDDDAESCPICLNAFRDQAV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
NP_001 GTPENCAHYFCLDCIVEWSKNANSCPVDRTLFKCICIRAQFGGKILRKIPVENTKASEEE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EDPTFCEVCGRSDREDRLLLCDGCDAGYHMECLDPPLQEVPVDEWFCPECAAPGVVLAAD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AGPVSEEEVSLLLADVVPTTSRLRPRAGRTRAIARTRQSERVRATVNRNRISTARRVQHT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PGRLGSSLLDEAIEAVATGLSTAVYQRPLTPRTPARRKRKTRRRKKVPGRKKTPSGPSAK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SKSSATRSKKRQHRVKKRRGKKVKSEATTRSRIARTLGLRRPVHSSCIPSVLKPVEPSLG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LLRADIGAASLSLFGDPYELDPFDSSEELSANPLSPLSAKRRALSRSALQSHQPVARPVS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VGLSRRRLPAAVPEPDLEEEPVPDLLGSILSGQSLLMLGSSDVIIHRDGSLSAKRAAPVS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FQRNSGSLSRGEEGFKGCLQPRALPSGSPAQGPSGNRPQSTGLSCQGRSRTPARTAGAPV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RLDLPAAPGAVQARNLSNGSVPGFRQSHSPWFNGTNKHTLPLASAASKISSRDSKPPCRS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VVPGPPLKPAPRRTDISELPRIPKIRRDDGGGRRDAAPAHGQSIEIPSACISRLTGREGT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GQPGRGTRAESEASSRVPREPGVHTGSSRPPAPSSHGSLAPLGPSRGKGVGSTFESFRIN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IPGNMAHSSQLSSPGFCNTFRPVDDKEQRKENPSPLFSIKKTKQLRSEVYDPSDPTGSDS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SAPGSSPERSGPGLLPSEITRTISINSPKAQTVQAVRCVTSYTVESIFGTEPEPPLGPSS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AMSKLRGAVAAEGASDTEREEPTESQGLAARLRRPSPPEPWDEEDGASCSTFFGSEERTV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TCVTVVEPEAPPSPDVLQAATHRVVELRPPSRSRSTSSSRSRKKAKRKRVSREHGRTRSG
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pF1KSD TRSESRDRSSRSASPSVGEERPRRQRSKAKSRRSSSDRSSSRERAKRKKAKDKSREHRRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TRSESRDRSSRSASPSVGEERPRRQRSKAKSRRSSSDRSSSRERAKRKKAKDKSREHRRG
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pF1KSD PWGHSRRTSRSRSGSPGSSSYEHYESRKKKKRRSASRPRGRECSPTSSLERLCRHKHQRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PWGHSRRTSRSRSGSPGSSSYEHYESRKKKKRRSASRPRGRECSPTSSLERLCRHKHQRE
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pF1KSD RSHERPDRKESVAWPRDRRKRRSRSPSSEHRAREHRRPRSREKWPQTRSHSPERKGAVRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RSHERPDRKESVAWPRDRRKRRSRSPSSEHRAREHRRPRSREKWPQTRSHSPERKGAVRE
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pF1KSD ASPAPLAQGEPGREDLPTRLPALGEAHVSPEVATADKAPLQAPPVLEVAAECEPDDLDLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ASPAPLAQGEPGREDLPTRLPALGEAHVSPEVATADKAPLQAPPVLEVAAECEPDDLDLD
1200 1210 1220 1230 1240 1250
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pF1KSD YGDSVEAGHVFDDFSSDAVFIQLDDMSSPPSPESTDSSPERDFPLKPALPPASLAVAAIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YGDSVEAGHVFDDFSSDAVFIQLDDMSSPPSPESTDSSPERDFPLKPALPPASLAVAAIQ
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pF1KSD REVSLMHDEDPSQPPPLPEGTQEPHLLRPDAAEKAEAPSSPDVAPAGKEDSPSASGRVQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 REVSLMHDEDPSQPPPLPEGTQEPHLLRPDAAEKAEAPSSPDVAPAGKEDSPSASGRVQE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AARPEEVVSQTPLLRSRALVKRVTWNLQESESSAPAEDRAPRAPLHRPQKPREGAWDMED
1380 1390 1400 1410 1420 1430
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pF1KSD VAPTGVRQAFSELPFPSHVLPEPGFPDTDPSQVYSPGLPPAPAQPSSIPPCALVSQPTVQ
::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VAPTGVRQVFSELPFPSHVLPEPGFPDTDPSQVYSPGLPPAPAQPSSIPPCALVSQPTVQ
1440 1450 1460 1470 1480 1490
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pF1KSD FILQGSLPLVGCGAAQTLAPVPAALTPASEPASQATAASNSEEKTPAPRLAAEKTKKEEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FILQGSLPLVGCGAAQTLAPVPAALTPASEPASQATAASNSEEKTPAPRLAAEKTKKEEY
1500 1510 1520 1530 1540 1550
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KSD MKKLHMQERAVEEVKLAIKPFYQKREVTKEEYKDILRKAVQKICHSKSGEINPVKVANLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MKKLHMQERAVEEVKLAIKPFYQKREVTKEEYKDILRKAVQKICHSKSGEINPVKVANLV
1560 1570 1580 1590 1600 1610
1630 1640
pF1KSD KAYVDKYRHMRRHKKPEAGEEPPTQGAEG
:::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KAYVDKYRHMRRHKKPEAGEEPPTQGAEG
1620 1630 1640
>>XP_011518539 (OMIM: 611780) PREDICTED: PHD and RING fi (1609 aa)
initn: 10606 init1: 10606 opt: 10613 Z-score: 4732.9 bits: 888.7 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 10744; 97.5% identity (97.6% similar) in 1649 aa overlap (1-1649:1-1609)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MDDDSLDELVARSPGPDGHPQVGPADPAGDFEESSVGSSGDSGDDSDSEHGDGTDGEDEG
:::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MDDDSLDELVARSPGPDGHPQVGPADPAGDF-----------------------------
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KSD ASEEEDLEDRSGSEDSEDDGETLLEVAGTQGKLEAAGSFNSDDDAESCPICLNAFRDQAV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 -----------GSEDSEDDGETLLEVAGTQGKLEAAGSFNSDDDAESCPICLNAFRDQAV
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pF1KSD GTPENCAHYFCLDCIVEWSKNANSCPVDRTLFKCICIRAQFGGKILKKIPVENTKASEEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
XP_011 GTPENCAHYFCLDCIVEWSKNANSCPVDRTLFKCICIRAQFGGKILRKIPVENTKASEEE
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pF1KSD EDPTFCEVCGRSDREDRLLLCDGCDAGYHMECLDPPLQEVPVDEWFCPECAAPGVVLAAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EDPTFCEVCGRSDREDRLLLCDGCDAGYHMECLDPPLQEVPVDEWFCPECAAPGVVLAAD
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pF1KSD AGPVSEEEVSLLLADVVPTTSRLRPRAGRTRAIARTRQSERVRATVNRNRISTARRVQHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AGPVSEEEVSLLLADVVPTTSRLRPRAGRTRAIARTRQSERVRATVNRNRISTARRVQHT
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pF1KSD PGRLGSSLLDEAIEAVATGLSTAVYQRPLTPRTPARRKRKTRRRKKVPGRKKTPSGPSAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PGRLGSSLLDEAIEAVATGLSTAVYQRPLTPRTPARRKRKTRRRKKVPGRKKTPSGPSAK
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pF1KSD SKSSATRSKKRQHRVKKRRGKKVKSEATTRSRIARTLGLRRPVHSSCIPSVLKPVEPSLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SKSSATRSKKRQHRVKKRRGKKVKSEATTRSRIARTLGLRRPVHSSCIPSVLKPVEPSLG
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pF1KSD LLRADIGAASLSLFGDPYELDPFDSSEELSANPLSPLSAKRRALSRSALQSHQPVARPVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LLRADIGAASLSLFGDPYELDPFDSSEELSANPLSPLSAKRRALSRSALQSHQPVARPVS
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pF1KSD VGLSRRRLPAAVPEPDLEEEPVPDLLGSILSGQSLLMLGSSDVIIHRDGSLSAKRAAPVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VGLSRRRLPAAVPEPDLEEEPVPDLLGSILSGQSLLMLGSSDVIIHRDGSLSAKRAAPVS
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pF1KSD FQRNSGSLSRGEEGFKGCLQPRALPSGSPAQGPSGNRPQSTGLSCQGRSRTPARTAGAPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FQRNSGSLSRGEEGFKGCLQPRALPSGSPAQGPSGNRPQSTGLSCQGRSRTPARTAGAPV
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pF1KSD RLDLPAAPGAVQARNLSNGSVPGFRQSHSPWFNGTNKHTLPLASAASKISSRDSKPPCRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RLDLPAAPGAVQARNLSNGSVPGFRQSHSPWFNGTNKHTLPLASAASKISSRDSKPPCRS
570 580 590 600 610 620
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pF1KSD VVPGPPLKPAPRRTDISELPRIPKIRRDDGGGRRDAAPAHGQSIEIPSACISRLTGREGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VVPGPPLKPAPRRTDISELPRIPKIRRDDGGGRRDAAPAHGQSIEIPSACISRLTGREGT
630 640 650 660 670 680
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pF1KSD GQPGRGTRAESEASSRVPREPGVHTGSSRPPAPSSHGSLAPLGPSRGKGVGSTFESFRIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GQPGRGTRAESEASSRVPREPGVHTGSSRPPAPSSHGSLAPLGPSRGKGVGSTFESFRIN
690 700 710 720 730 740
790 800 810 820 830 840
pF1KSD IPGNMAHSSQLSSPGFCNTFRPVDDKEQRKENPSPLFSIKKTKQLRSEVYDPSDPTGSDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IPGNMAHSSQLSSPGFCNTFRPVDDKEQRKENPSPLFSIKKTKQLRSEVYDPSDPTGSDS
750 760 770 780 790 800
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pF1KSD SAPGSSPERSGPGLLPSEITRTISINSPKAQTVQAVRCVTSYTVESIFGTEPEPPLGPSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SAPGSSPERSGPGLLPSEITRTISINSPKAQTVQAVRCVTSYTVESIFGTEPEPPLGPSS
810 820 830 840 850 860
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pF1KSD AMSKLRGAVAAEGASDTEREEPTESQGLAARLRRPSPPEPWDEEDGASCSTFFGSEERTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AMSKLRGAVAAEGASDTEREEPTESQGLAARLRRPSPPEPWDEEDGASCSTFFGSEERTV
870 880 890 900 910 920
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pF1KSD TCVTVVEPEAPPSPDVLQAATHRVVELRPPSRSRSTSSSRSRKKAKRKRVSREHGRTRSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TCVTVVEPEAPPSPDVLQAATHRVVELRPPSRSRSTSSSRSRKKAKRKRVSREHGRTRSG
930 940 950 960 970 980
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD TRSESRDRSSRSASPSVGEERPRRQRSKAKSRRSSSDRSSSRERAKRKKAKDKSREHRRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TRSESRDRSSRSASPSVGEERPRRQRSKAKSRRSSSDRSSSRERAKRKKAKDKSREHRRG
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pF1KSD PWGHSRRTSRSRSGSPGSSSYEHYESRKKKKRRSASRPRGRECSPTSSLERLCRHKHQRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PWGHSRRTSRSRSGSPGSSSYEHYESRKKKKRRSASRPRGRECSPTSSLERLCRHKHQRE
1050 1060 1070 1080 1090 1100
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD RSHERPDRKESVAWPRDRRKRRSRSPSSEHRAREHRRPRSREKWPQTRSHSPERKGAVRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RSHERPDRKESVAWPRDRRKRRSRSPSSEHRAREHRRPRSREKWPQTRSHSPERKGAVRE
1110 1120 1130 1140 1150 1160
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD ASPAPLAQGEPGREDLPTRLPALGEAHVSPEVATADKAPLQAPPVLEVAAECEPDDLDLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ASPAPLAQGEPGREDLPTRLPALGEAHVSPEVATADKAPLQAPPVLEVAAECEPDDLDLD
1170 1180 1190 1200 1210 1220
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XP_011 YGDSVEAGHVFDDFSSDAVFIQLDDMSSPPSPESTDSSPERDFPLKPALPPASLAVAAIQ
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XP_011 REVSLMHDEDPSQPPPLPEGTQEPHLLRPDAAEKAEAPSSPDVAPAGKEDSPSASGRVQE
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XP_011 AARPEEVVSQTPLLRSRALVKRVTWNLQESESSAPAEDRAPRAPLHRPQKPREGAWDMED
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XP_011 VAPTGVRQVFSELPFPSHVLPEPGFPDTDPSQVYSPGLPPAPAQPSSIPPCALVSQPTVQ
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XP_011 FILQGSLPLVGCGAAQTLAPVPAALTPASEPASQATAASNSEEKTPAPRLAAEKTKKEEY
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XP_011 MKKLHMQERAVEEVKLAIKPFYQKREVTKEEYKDILRKAVQKICHSKSGEINPVKVANLV
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XP_011 KAYVDKYRHMRRHKKPEAGEEPPTQGAEG
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..: .. :.. .: : :..: .
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: : . : :.. :. . .: : . : .:. : :: .:.. .: :
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:: . :: :. : ..: . ::.: . . ....: : : :: : . : :
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: ..: ...: ::: .: ...: :.. : .. : :. .. :.. : :: .::.:
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:.: . : :: :.: :: . :. ...:: :.:: .. :: . .
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:.... . ...: .... : :.: . :: : :: : :. :: . .:
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. . : .: : . : :.: :.. .. :. . . .::: . :
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. . :: . .... .: .. . .. ...: . . .:
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. .:.: : : . ... : . :.. .... .. . :.: : :.
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:: . :::. . . . : .: . . . : :: :.: . .:..
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. :.. : :. .. ... : :.::. . .. :: : :
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: . : : . :..: : :::: : : :: : ::: . ::: :
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:. . . . :.:.: .:.. :.: :..:. :. .. : .:: :..
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pF1KSD --KEEYMKKLHMQERAVEEVKLAIKPFYQKREVTKEEYKDILRKAVQKICHSKSGEINPV
. . :::..::.:..:::::::::::....::::::.:.::::.:.:::::::.: .
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XP_016 KVANLVKAYVDKYKYSRKGSQKKTLEEPVSTEKNIG
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>>XP_016875711 (OMIM: 603668) PREDICTED: protein SCAF11 (1418 aa)
initn: 519 init1: 374 opt: 525 Z-score: 252.0 bits: 59.4 E(85289): 2.7e-07
Smith-Waterman score: 614; 26.6% identity (51.6% similar) in 958 aa overlap (780-1642:504-1410)
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pF1KSD PPAPSSHGSLAPLGPSRGKGVGSTFESFRINIPGNMAHSSQLSSPGFCNTFRPVDDKEQR
..: .. :.. .: : :..: .
XP_016 GGDPLEKQDQISGLSQSEVKTDVCTVHLPNDFPTCLTSESKVYQPVSC----PLSDLSEN
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pF1KSD KENPSPLFSIKKTKQLRSEVYDPSDPTGSDSSAPGSSPERSGPGLLPSEITRTISINSPK
: : . : :.. :. . .: : . : .:. : :: .:.. .: :
XP_016 VE--SVVNEEKITESSLVEITEHKDFTLKTEELIESPKLESSEG----EIIQTVDRQSVK
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pF1KSD AQTVQAVRCVTSYTVESI-----FGTEP-------EPPLGPSSAM-SKLRGAVAAEGASD
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XP_016 SPEVQLLGHVETEDVEIIATCDTFGNEDFNNIQDSENNLLKNNLLNTKLEKSLEEKNESL
590 600 610 620 630 640
920 930 940 950 960
pF1KSD TEREEPTESQGLAARLRRPSPPEPWDEEDGASCSTFFGSE-----ERTVTC---------
::. . :: . . : .: :..: ... : .:.
XP_016 TEHPRSTELPKTHIEQIQKHFSEDNNEMIPMECDSFCSDQNESEVEPSVNADLKQMNENS
650 660 670 680 690 700
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD VTVVEPEAPPSPDVLQAATHRVVELRPPSRSRSTSSSRSRKKAKRKRVSREHGRTRSGTR
:: . :: :. : ..: . ::.: . . ....: : : :: : . : :
XP_016 VTHCSENNMPSSDL---ADEKVETVSQPSESPKDTIDKTKK--PRTRRSRFH--SPSTTW
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pF1KSD SESRD---RSSRSASPSVGEERPRRQR-SKAKSRRSSSDRSSSRERAKRKKAKDKSREHR
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XP_016 SPNKDTPQEKKRPQSPSPRRETGKESRKSQSPSPKNESARGRKKSRSQSPK-KDIARERR
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XP_016 RERESDRDGQRRERERRTRKWSRSRSHSRSPSRCRTKSKSSSFGRIDRDSYSPRWKGRWA
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XP_016 NDGWRCP--RGNDRYRKNDPEKQNENTRKEK-------NDIHLDADDPNSADKHRNDCPN
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pF1KSD VLEVAAECEPDDLDLDYGDSVEAGHVFDDFSSDAVFIQLDDMSSPPSPESTDSSPERDFP
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XP_016 WITEKINSGPDPRTRN-PEKLKESHWEENRNENSGNSWNKNFGSGWVSNRGRGRGNRGR-
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XP_016 -PADRSGWTSASSWAVRKTLPADVQNYYSRRGRNSSGPQSGWMKQEEETSGQDSSLKDQT
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pF1KSD PRA------PLHRPQKPREGAWDMEDVA----------PTGVRQAFSEL---PFPSHV-L
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XP_016 NQQVDGSQLPINMMQ-PQMNVMQQQMNAQHQPMNIFPYPVGVHAPLMNIQRNPFNIHPQL
1150 1160 1170 1180 1190 1200
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XP_016 PLHLHTGVPLMQVATPTSV-SQGLPPPPPPP---PPSQQVNYIASQPDGK-QLQGIPSSS
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1510 1520 1530 1540 1550
pF1KSD LVGCGAAQTLAPVPAALTPASE-----PASQATAASN-SEEKTPAPRLAAEKTK------
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XP_016 HVSNNMSTPVLPAPTA-APGNTGMVQGPSSGNTSSSSHSKASNAAVKLAESKVSVAVEAS
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1560 1570 1580 1590 1600 1610
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XP_016 ADSSKTDKKLQIQEKAAQEVKLAIKPFYQNKDITKEEYKEIVRKAVDKVCHSKSGEVNST
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]