Result of FASTA (omim) for pF1KSDA1538
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA1538, 1013 aa
  1>>>pF1KSDA1538 1013 - 1013 aa - 1013 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.7595+/-0.000414; mu= -11.1592+/- 0.026
 mean_var=760.3102+/-173.833, 0's: 0 Z-trim(126.9): 33  B-trim: 3078 in 1/61
 Lambda= 0.046513
 statistics sampled from 53822 (53872) to 53822 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.843), E-opt: 0.2 (0.632), width:  16
 Scan time: 19.240

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
XP_006721626 (OMIM: 612308) PREDICTED: zinc finger (1013) 6997 485.4 6.8e-136
XP_006721627 (OMIM: 612308) PREDICTED: zinc finger (1013) 6997 485.4 6.8e-136
NP_065950 (OMIM: 612308) zinc finger and BTB domai (1013) 6997 485.4 6.8e-136
NP_001122305 (OMIM: 612308) zinc finger and BTB do (1013) 6997 485.4 6.8e-136
XP_011522274 (OMIM: 612308) PREDICTED: zinc finger (1013) 6997 485.4 6.8e-136
XP_005247315 (OMIM: 612218) PREDICTED: zinc finger (1195)  689 62.1   2e-08
XP_016861544 (OMIM: 612218) PREDICTED: zinc finger (1195)  689 62.1   2e-08
XP_011510913 (OMIM: 612218) PREDICTED: zinc finger (1195)  689 62.1   2e-08
XP_016861541 (OMIM: 612218) PREDICTED: zinc finger (1195)  689 62.1   2e-08
XP_016861547 (OMIM: 612218) PREDICTED: zinc finger (1195)  689 62.1   2e-08
XP_016861542 (OMIM: 612218) PREDICTED: zinc finger (1195)  689 62.1   2e-08
XP_016861543 (OMIM: 612218) PREDICTED: zinc finger (1195)  689 62.1   2e-08
XP_016861550 (OMIM: 612218) PREDICTED: zinc finger (1195)  689 62.1   2e-08
XP_005247318 (OMIM: 612218) PREDICTED: zinc finger (1195)  689 62.1   2e-08
XP_005247314 (OMIM: 612218) PREDICTED: zinc finger (1195)  689 62.1   2e-08
XP_016861546 (OMIM: 612218) PREDICTED: zinc finger (1195)  689 62.1   2e-08
NP_001073881 (OMIM: 612218) zinc finger and BTB do (1195)  689 62.1   2e-08
XP_016861549 (OMIM: 612218) PREDICTED: zinc finger (1195)  689 62.1   2e-08
XP_016861545 (OMIM: 612218) PREDICTED: zinc finger (1195)  689 62.1   2e-08
XP_016861548 (OMIM: 612218) PREDICTED: zinc finger (1195)  689 62.1   2e-08
XP_005247313 (OMIM: 612218) PREDICTED: zinc finger (1196)  689 62.1   2e-08
XP_011510910 (OMIM: 612218) PREDICTED: zinc finger (1221)  689 62.2 2.1e-08
XP_016861540 (OMIM: 612218) PREDICTED: zinc finger (1221)  689 62.2 2.1e-08
XP_016861539 (OMIM: 612218) PREDICTED: zinc finger (1221)  689 62.2 2.1e-08
XP_011510909 (OMIM: 612218) PREDICTED: zinc finger (1221)  689 62.2 2.1e-08
NP_001171671 (OMIM: 300329) transcriptional regula ( 672)  443 45.3  0.0013
NP_006768 (OMIM: 300329) transcriptional regulator ( 672)  443 45.3  0.0013


>>XP_006721626 (OMIM: 612308) PREDICTED: zinc finger and  (1013 aa)
 initn: 6997 init1: 6997 opt: 6997  Z-score: 2560.7  bits: 485.4 E(85289): 6.8e-136
Smith-Waterman score: 6997; 100.0% identity (100.0% similar) in 1013 aa overlap (1-1013:1-1013)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MPPPAEVTDPSHAPAVLRQLNEQRLRGLFCDVTLIAGDTKFPAHRSVLAASSPFFREALL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 MPPPAEVTDPSHAPAVLRQLNEQRLRGLFCDVTLIAGDTKFPAHRSVLAASSPFFREALL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD TSAPLPLPPATGGAAPNPATTTAASSSSSSSSSSSSSSSSASSSSSSSSSSPPPASPPAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 TSAPLPLPPATGGAAPNPATTTAASSSSSSSSSSSSSSSSASSSSSSSSSSPPPASPPAS
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD SPPRVLELPGVPAAAFSDVLNFIYSARLALPGGGGDGAAVAEIGALGRRLGISRLQGLGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 SPPRVLELPGVPAAAFSDVLNFIYSARLALPGGGGDGAAVAEIGALGRRLGISRLQGLGE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD GGDAWVPPTPAPMATSQPEEDSFGPGPRPAGEWEGDRAEAQAPDLQCSLPRRPLPCPQCG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 GGDAWVPPTPAPMATSQPEEDSFGPGPRPAGEWEGDRAEAQAPDLQCSLPRRPLPCPQCG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD KSFIHPKRLQTHEAQCRRGASTRGSTGLGAGGAGPGGPAGVDASALPPPVGFRGGPEHVV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 KSFIHPKRLQTHEAQCRRGASTRGSTGLGAGGAGPGGPAGVDASALPPPVGFRGGPEHVV
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD KVVGGHVLYVCAACERSYVTLSSLKRHSNVHSWRRKYPCRYCEKVFALAEYRTKHEVWHT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 KVVGGHVLYVCAACERSYVTLSSLKRHSNVHSWRRKYPCRYCEKVFALAEYRTKHEVWHT
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD GERRYQCIFCWETFVTYYNLKTHQRAFHGISPGLLASEKTPNGGYKPKLNTLKLYRLLPM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 GERRYQCIFCWETFVTYYNLKTHQRAFHGISPGLLASEKTPNGGYKPKLNTLKLYRLLPM
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD RAAKRPYKTYSQGAPEAPLSPTLNTPAPVAMPASPPPGPPPAPEPGPPPSVITFAHPAPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 RAAKRPYKTYSQGAPEAPLSPTLNTPAPVAMPASPPPGPPPAPEPGPPPSVITFAHPAPS
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD VIVHGGSSSGGGGSGTASTGGSQAASVITYTAPPRPPKKREYPPPPPEPAATPTSPATAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 VIVHGGSSSGGGGSGTASTGGSQAASVITYTAPPRPPKKREYPPPPPEPAATPTSPATAV
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD SPATAAGPAMATTTEEAKGRNPRAGRTLTYTAKPVGGIGGGGGPPTGAGRGPSQLQAPPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 SPATAAGPAMATTTEEAKGRNPRAGRTLTYTAKPVGGIGGGGGPPTGAGRGPSQLQAPPP
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD LCQITVRIGEEAIVKRRISETDLRPGELSGEEMEESEEDEEEEDEEEEEEDEEESKAGGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LCQITVRIGEEAIVKRRISETDLRPGELSGEEMEESEEDEEEEDEEEEEEDEEESKAGGE
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD DQLWRPYYSYKPKRKAGAAGGASVGGSGLPRGRRPPRWRQKLERRSWEETPAAESPAGRA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 DQLWRPYYSYKPKRKAGAAGGASVGGSGLPRGRRPPRWRQKLERRSWEETPAAESPAGRA
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD RTERRHRCGDCAQTFTTLRKLRKHQEAHGGGSHSSRAGRRPSTRFTCPHCAKVCKTAAAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 RTERRHRCGDCAQTFTTLRKLRKHQEAHGGGSHSSRAGRRPSTRFTCPHCAKVCKTAAAL
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KSD SRHGQRHAAERPGGTPTPVIAYSKGSAGTRPGDVKEEAPQEMQVSSSSGEAGGGSTAAEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 SRHGQRHAAERPGGTPTPVIAYSKGSAGTRPGDVKEEAPQEMQVSSSSGEAGGGSTAAEE
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KSD ASETASLQDPIISGGEEPPVVASGGSYVYPPVQEFPLALIGGGREPGGGRGKSGSEGPVG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 ASETASLQDPIISGGEEPPVVASGGSYVYPPVQEFPLALIGGGREPGGGRGKSGSEGPVG
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KSD AGEGDRMEGIGAAKVTFYPEPYPLVYGPQLLAAYPYNFSNLAALPVALNMVLPDEKGAGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 AGEGDRMEGIGAAKVTFYPEPYPLVYGPQLLAAYPYNFSNLAALPVALNMVLPDEKGAGA
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010   
pF1KSD LPFLPGVFGYAVNPQAAPPAPPTPPPPTLPPPIPPKGEGERAGVERTQKGDVG
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LPFLPGVFGYAVNPQAAPPAPPTPPPPTLPPPIPPKGEGERAGVERTQKGDVG
              970       980       990      1000      1010   

>>XP_006721627 (OMIM: 612308) PREDICTED: zinc finger and  (1013 aa)
 initn: 6997 init1: 6997 opt: 6997  Z-score: 2560.7  bits: 485.4 E(85289): 6.8e-136
Smith-Waterman score: 6997; 100.0% identity (100.0% similar) in 1013 aa overlap (1-1013:1-1013)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MPPPAEVTDPSHAPAVLRQLNEQRLRGLFCDVTLIAGDTKFPAHRSVLAASSPFFREALL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 MPPPAEVTDPSHAPAVLRQLNEQRLRGLFCDVTLIAGDTKFPAHRSVLAASSPFFREALL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD TSAPLPLPPATGGAAPNPATTTAASSSSSSSSSSSSSSSSASSSSSSSSSSPPPASPPAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 TSAPLPLPPATGGAAPNPATTTAASSSSSSSSSSSSSSSSASSSSSSSSSSPPPASPPAS
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD SPPRVLELPGVPAAAFSDVLNFIYSARLALPGGGGDGAAVAEIGALGRRLGISRLQGLGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 SPPRVLELPGVPAAAFSDVLNFIYSARLALPGGGGDGAAVAEIGALGRRLGISRLQGLGE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD GGDAWVPPTPAPMATSQPEEDSFGPGPRPAGEWEGDRAEAQAPDLQCSLPRRPLPCPQCG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 GGDAWVPPTPAPMATSQPEEDSFGPGPRPAGEWEGDRAEAQAPDLQCSLPRRPLPCPQCG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD KSFIHPKRLQTHEAQCRRGASTRGSTGLGAGGAGPGGPAGVDASALPPPVGFRGGPEHVV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 KSFIHPKRLQTHEAQCRRGASTRGSTGLGAGGAGPGGPAGVDASALPPPVGFRGGPEHVV
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD KVVGGHVLYVCAACERSYVTLSSLKRHSNVHSWRRKYPCRYCEKVFALAEYRTKHEVWHT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 KVVGGHVLYVCAACERSYVTLSSLKRHSNVHSWRRKYPCRYCEKVFALAEYRTKHEVWHT
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD GERRYQCIFCWETFVTYYNLKTHQRAFHGISPGLLASEKTPNGGYKPKLNTLKLYRLLPM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 GERRYQCIFCWETFVTYYNLKTHQRAFHGISPGLLASEKTPNGGYKPKLNTLKLYRLLPM
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD RAAKRPYKTYSQGAPEAPLSPTLNTPAPVAMPASPPPGPPPAPEPGPPPSVITFAHPAPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 RAAKRPYKTYSQGAPEAPLSPTLNTPAPVAMPASPPPGPPPAPEPGPPPSVITFAHPAPS
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD VIVHGGSSSGGGGSGTASTGGSQAASVITYTAPPRPPKKREYPPPPPEPAATPTSPATAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 VIVHGGSSSGGGGSGTASTGGSQAASVITYTAPPRPPKKREYPPPPPEPAATPTSPATAV
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD SPATAAGPAMATTTEEAKGRNPRAGRTLTYTAKPVGGIGGGGGPPTGAGRGPSQLQAPPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 SPATAAGPAMATTTEEAKGRNPRAGRTLTYTAKPVGGIGGGGGPPTGAGRGPSQLQAPPP
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pF1KSD LCQITVRIGEEAIVKRRISETDLRPGELSGEEMEESEEDEEEEDEEEEEEDEEESKAGGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LCQITVRIGEEAIVKRRISETDLRPGELSGEEMEESEEDEEEEDEEEEEEDEEESKAGGE
              610       620       630       640       650       660

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pF1KSD DQLWRPYYSYKPKRKAGAAGGASVGGSGLPRGRRPPRWRQKLERRSWEETPAAESPAGRA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 DQLWRPYYSYKPKRKAGAAGGASVGGSGLPRGRRPPRWRQKLERRSWEETPAAESPAGRA
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pF1KSD RTERRHRCGDCAQTFTTLRKLRKHQEAHGGGSHSSRAGRRPSTRFTCPHCAKVCKTAAAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 RTERRHRCGDCAQTFTTLRKLRKHQEAHGGGSHSSRAGRRPSTRFTCPHCAKVCKTAAAL
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pF1KSD SRHGQRHAAERPGGTPTPVIAYSKGSAGTRPGDVKEEAPQEMQVSSSSGEAGGGSTAAEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 SRHGQRHAAERPGGTPTPVIAYSKGSAGTRPGDVKEEAPQEMQVSSSSGEAGGGSTAAEE
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pF1KSD ASETASLQDPIISGGEEPPVVASGGSYVYPPVQEFPLALIGGGREPGGGRGKSGSEGPVG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 ASETASLQDPIISGGEEPPVVASGGSYVYPPVQEFPLALIGGGREPGGGRGKSGSEGPVG
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pF1KSD AGEGDRMEGIGAAKVTFYPEPYPLVYGPQLLAAYPYNFSNLAALPVALNMVLPDEKGAGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 AGEGDRMEGIGAAKVTFYPEPYPLVYGPQLLAAYPYNFSNLAALPVALNMVLPDEKGAGA
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              970       980       990      1000      1010   
pF1KSD LPFLPGVFGYAVNPQAAPPAPPTPPPPTLPPPIPPKGEGERAGVERTQKGDVG
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LPFLPGVFGYAVNPQAAPPAPPTPPPPTLPPPIPPKGEGERAGVERTQKGDVG
              970       980       990      1000      1010   

>>NP_065950 (OMIM: 612308) zinc finger and BTB domain-co  (1013 aa)
 initn: 6997 init1: 6997 opt: 6997  Z-score: 2560.7  bits: 485.4 E(85289): 6.8e-136
Smith-Waterman score: 6997; 100.0% identity (100.0% similar) in 1013 aa overlap (1-1013:1-1013)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MPPPAEVTDPSHAPAVLRQLNEQRLRGLFCDVTLIAGDTKFPAHRSVLAASSPFFREALL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 MPPPAEVTDPSHAPAVLRQLNEQRLRGLFCDVTLIAGDTKFPAHRSVLAASSPFFREALL
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pF1KSD TSAPLPLPPATGGAAPNPATTTAASSSSSSSSSSSSSSSSASSSSSSSSSSPPPASPPAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 TSAPLPLPPATGGAAPNPATTTAASSSSSSSSSSSSSSSSASSSSSSSSSSPPPASPPAS
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 SPPRVLELPGVPAAAFSDVLNFIYSARLALPGGGGDGAAVAEIGALGRRLGISRLQGLGE
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 GGDAWVPPTPAPMATSQPEEDSFGPGPRPAGEWEGDRAEAQAPDLQCSLPRRPLPCPQCG
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pF1KSD KSFIHPKRLQTHEAQCRRGASTRGSTGLGAGGAGPGGPAGVDASALPPPVGFRGGPEHVV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 KSFIHPKRLQTHEAQCRRGASTRGSTGLGAGGAGPGGPAGVDASALPPPVGFRGGPEHVV
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 KVVGGHVLYVCAACERSYVTLSSLKRHSNVHSWRRKYPCRYCEKVFALAEYRTKHEVWHT
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pF1KSD GERRYQCIFCWETFVTYYNLKTHQRAFHGISPGLLASEKTPNGGYKPKLNTLKLYRLLPM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 GERRYQCIFCWETFVTYYNLKTHQRAFHGISPGLLASEKTPNGGYKPKLNTLKLYRLLPM
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pF1KSD RAAKRPYKTYSQGAPEAPLSPTLNTPAPVAMPASPPPGPPPAPEPGPPPSVITFAHPAPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 RAAKRPYKTYSQGAPEAPLSPTLNTPAPVAMPASPPPGPPPAPEPGPPPSVITFAHPAPS
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pF1KSD VIVHGGSSSGGGGSGTASTGGSQAASVITYTAPPRPPKKREYPPPPPEPAATPTSPATAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 VIVHGGSSSGGGGSGTASTGGSQAASVITYTAPPRPPKKREYPPPPPEPAATPTSPATAV
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 SPATAAGPAMATTTEEAKGRNPRAGRTLTYTAKPVGGIGGGGGPPTGAGRGPSQLQAPPP
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pF1KSD LCQITVRIGEEAIVKRRISETDLRPGELSGEEMEESEEDEEEEDEEEEEEDEEESKAGGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 LCQITVRIGEEAIVKRRISETDLRPGELSGEEMEESEEDEEEEDEEEEEEDEEESKAGGE
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pF1KSD DQLWRPYYSYKPKRKAGAAGGASVGGSGLPRGRRPPRWRQKLERRSWEETPAAESPAGRA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 DQLWRPYYSYKPKRKAGAAGGASVGGSGLPRGRRPPRWRQKLERRSWEETPAAESPAGRA
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pF1KSD RTERRHRCGDCAQTFTTLRKLRKHQEAHGGGSHSSRAGRRPSTRFTCPHCAKVCKTAAAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 RTERRHRCGDCAQTFTTLRKLRKHQEAHGGGSHSSRAGRRPSTRFTCPHCAKVCKTAAAL
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pF1KSD SRHGQRHAAERPGGTPTPVIAYSKGSAGTRPGDVKEEAPQEMQVSSSSGEAGGGSTAAEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 SRHGQRHAAERPGGTPTPVIAYSKGSAGTRPGDVKEEAPQEMQVSSSSGEAGGGSTAAEE
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pF1KSD ASETASLQDPIISGGEEPPVVASGGSYVYPPVQEFPLALIGGGREPGGGRGKSGSEGPVG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 ASETASLQDPIISGGEEPPVVASGGSYVYPPVQEFPLALIGGGREPGGGRGKSGSEGPVG
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pF1KSD AGEGDRMEGIGAAKVTFYPEPYPLVYGPQLLAAYPYNFSNLAALPVALNMVLPDEKGAGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 AGEGDRMEGIGAAKVTFYPEPYPLVYGPQLLAAYPYNFSNLAALPVALNMVLPDEKGAGA
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pF1KSD LPFLPGVFGYAVNPQAAPPAPPTPPPPTLPPPIPPKGEGERAGVERTQKGDVG
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 LPFLPGVFGYAVNPQAAPPAPPTPPPPTLPPPIPPKGEGERAGVERTQKGDVG
              970       980       990      1000      1010   

>>NP_001122305 (OMIM: 612308) zinc finger and BTB domain  (1013 aa)
 initn: 6997 init1: 6997 opt: 6997  Z-score: 2560.7  bits: 485.4 E(85289): 6.8e-136
Smith-Waterman score: 6997; 100.0% identity (100.0% similar) in 1013 aa overlap (1-1013:1-1013)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MPPPAEVTDPSHAPAVLRQLNEQRLRGLFCDVTLIAGDTKFPAHRSVLAASSPFFREALL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MPPPAEVTDPSHAPAVLRQLNEQRLRGLFCDVTLIAGDTKFPAHRSVLAASSPFFREALL
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pF1KSD TSAPLPLPPATGGAAPNPATTTAASSSSSSSSSSSSSSSSASSSSSSSSSSPPPASPPAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TSAPLPLPPATGGAAPNPATTTAASSSSSSSSSSSSSSSSASSSSSSSSSSPPPASPPAS
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pF1KSD SPPRVLELPGVPAAAFSDVLNFIYSARLALPGGGGDGAAVAEIGALGRRLGISRLQGLGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SPPRVLELPGVPAAAFSDVLNFIYSARLALPGGGGDGAAVAEIGALGRRLGISRLQGLGE
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pF1KSD GGDAWVPPTPAPMATSQPEEDSFGPGPRPAGEWEGDRAEAQAPDLQCSLPRRPLPCPQCG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GGDAWVPPTPAPMATSQPEEDSFGPGPRPAGEWEGDRAEAQAPDLQCSLPRRPLPCPQCG
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pF1KSD KSFIHPKRLQTHEAQCRRGASTRGSTGLGAGGAGPGGPAGVDASALPPPVGFRGGPEHVV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KSFIHPKRLQTHEAQCRRGASTRGSTGLGAGGAGPGGPAGVDASALPPPVGFRGGPEHVV
              250       260       270       280       290       300

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pF1KSD KVVGGHVLYVCAACERSYVTLSSLKRHSNVHSWRRKYPCRYCEKVFALAEYRTKHEVWHT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KVVGGHVLYVCAACERSYVTLSSLKRHSNVHSWRRKYPCRYCEKVFALAEYRTKHEVWHT
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pF1KSD GERRYQCIFCWETFVTYYNLKTHQRAFHGISPGLLASEKTPNGGYKPKLNTLKLYRLLPM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GERRYQCIFCWETFVTYYNLKTHQRAFHGISPGLLASEKTPNGGYKPKLNTLKLYRLLPM
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pF1KSD RAAKRPYKTYSQGAPEAPLSPTLNTPAPVAMPASPPPGPPPAPEPGPPPSVITFAHPAPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RAAKRPYKTYSQGAPEAPLSPTLNTPAPVAMPASPPPGPPPAPEPGPPPSVITFAHPAPS
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pF1KSD VIVHGGSSSGGGGSGTASTGGSQAASVITYTAPPRPPKKREYPPPPPEPAATPTSPATAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VIVHGGSSSGGGGSGTASTGGSQAASVITYTAPPRPPKKREYPPPPPEPAATPTSPATAV
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pF1KSD SPATAAGPAMATTTEEAKGRNPRAGRTLTYTAKPVGGIGGGGGPPTGAGRGPSQLQAPPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SPATAAGPAMATTTEEAKGRNPRAGRTLTYTAKPVGGIGGGGGPPTGAGRGPSQLQAPPP
              550       560       570       580       590       600

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pF1KSD LCQITVRIGEEAIVKRRISETDLRPGELSGEEMEESEEDEEEEDEEEEEEDEEESKAGGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LCQITVRIGEEAIVKRRISETDLRPGELSGEEMEESEEDEEEEDEEEEEEDEEESKAGGE
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD DQLWRPYYSYKPKRKAGAAGGASVGGSGLPRGRRPPRWRQKLERRSWEETPAAESPAGRA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DQLWRPYYSYKPKRKAGAAGGASVGGSGLPRGRRPPRWRQKLERRSWEETPAAESPAGRA
              670       680       690       700       710       720

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pF1KSD RTERRHRCGDCAQTFTTLRKLRKHQEAHGGGSHSSRAGRRPSTRFTCPHCAKVCKTAAAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RTERRHRCGDCAQTFTTLRKLRKHQEAHGGGSHSSRAGRRPSTRFTCPHCAKVCKTAAAL
              730       740       750       760       770       780

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pF1KSD SRHGQRHAAERPGGTPTPVIAYSKGSAGTRPGDVKEEAPQEMQVSSSSGEAGGGSTAAEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SRHGQRHAAERPGGTPTPVIAYSKGSAGTRPGDVKEEAPQEMQVSSSSGEAGGGSTAAEE
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pF1KSD ASETASLQDPIISGGEEPPVVASGGSYVYPPVQEFPLALIGGGREPGGGRGKSGSEGPVG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ASETASLQDPIISGGEEPPVVASGGSYVYPPVQEFPLALIGGGREPGGGRGKSGSEGPVG
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pF1KSD AGEGDRMEGIGAAKVTFYPEPYPLVYGPQLLAAYPYNFSNLAALPVALNMVLPDEKGAGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AGEGDRMEGIGAAKVTFYPEPYPLVYGPQLLAAYPYNFSNLAALPVALNMVLPDEKGAGA
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010   
pF1KSD LPFLPGVFGYAVNPQAAPPAPPTPPPPTLPPPIPPKGEGERAGVERTQKGDVG
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LPFLPGVFGYAVNPQAAPPAPPTPPPPTLPPPIPPKGEGERAGVERTQKGDVG
              970       980       990      1000      1010   

>>XP_011522274 (OMIM: 612308) PREDICTED: zinc finger and  (1013 aa)
 initn: 6997 init1: 6997 opt: 6997  Z-score: 2560.7  bits: 485.4 E(85289): 6.8e-136
Smith-Waterman score: 6997; 100.0% identity (100.0% similar) in 1013 aa overlap (1-1013:1-1013)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MPPPAEVTDPSHAPAVLRQLNEQRLRGLFCDVTLIAGDTKFPAHRSVLAASSPFFREALL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MPPPAEVTDPSHAPAVLRQLNEQRLRGLFCDVTLIAGDTKFPAHRSVLAASSPFFREALL
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pF1KSD TSAPLPLPPATGGAAPNPATTTAASSSSSSSSSSSSSSSSASSSSSSSSSSPPPASPPAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TSAPLPLPPATGGAAPNPATTTAASSSSSSSSSSSSSSSSASSSSSSSSSSPPPASPPAS
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SPPRVLELPGVPAAAFSDVLNFIYSARLALPGGGGDGAAVAEIGALGRRLGISRLQGLGE
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pF1KSD GGDAWVPPTPAPMATSQPEEDSFGPGPRPAGEWEGDRAEAQAPDLQCSLPRRPLPCPQCG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GGDAWVPPTPAPMATSQPEEDSFGPGPRPAGEWEGDRAEAQAPDLQCSLPRRPLPCPQCG
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pF1KSD KSFIHPKRLQTHEAQCRRGASTRGSTGLGAGGAGPGGPAGVDASALPPPVGFRGGPEHVV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KSFIHPKRLQTHEAQCRRGASTRGSTGLGAGGAGPGGPAGVDASALPPPVGFRGGPEHVV
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pF1KSD KVVGGHVLYVCAACERSYVTLSSLKRHSNVHSWRRKYPCRYCEKVFALAEYRTKHEVWHT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KVVGGHVLYVCAACERSYVTLSSLKRHSNVHSWRRKYPCRYCEKVFALAEYRTKHEVWHT
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pF1KSD GERRYQCIFCWETFVTYYNLKTHQRAFHGISPGLLASEKTPNGGYKPKLNTLKLYRLLPM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GERRYQCIFCWETFVTYYNLKTHQRAFHGISPGLLASEKTPNGGYKPKLNTLKLYRLLPM
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pF1KSD RAAKRPYKTYSQGAPEAPLSPTLNTPAPVAMPASPPPGPPPAPEPGPPPSVITFAHPAPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RAAKRPYKTYSQGAPEAPLSPTLNTPAPVAMPASPPPGPPPAPEPGPPPSVITFAHPAPS
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pF1KSD VIVHGGSSSGGGGSGTASTGGSQAASVITYTAPPRPPKKREYPPPPPEPAATPTSPATAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VIVHGGSSSGGGGSGTASTGGSQAASVITYTAPPRPPKKREYPPPPPEPAATPTSPATAV
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SPATAAGPAMATTTEEAKGRNPRAGRTLTYTAKPVGGIGGGGGPPTGAGRGPSQLQAPPP
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pF1KSD LCQITVRIGEEAIVKRRISETDLRPGELSGEEMEESEEDEEEEDEEEEEEDEEESKAGGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LCQITVRIGEEAIVKRRISETDLRPGELSGEEMEESEEDEEEEDEEEEEEDEEESKAGGE
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pF1KSD DQLWRPYYSYKPKRKAGAAGGASVGGSGLPRGRRPPRWRQKLERRSWEETPAAESPAGRA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DQLWRPYYSYKPKRKAGAAGGASVGGSGLPRGRRPPRWRQKLERRSWEETPAAESPAGRA
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RTERRHRCGDCAQTFTTLRKLRKHQEAHGGGSHSSRAGRRPSTRFTCPHCAKVCKTAAAL
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pF1KSD SRHGQRHAAERPGGTPTPVIAYSKGSAGTRPGDVKEEAPQEMQVSSSSGEAGGGSTAAEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SRHGQRHAAERPGGTPTPVIAYSKGSAGTRPGDVKEEAPQEMQVSSSSGEAGGGSTAAEE
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pF1KSD ASETASLQDPIISGGEEPPVVASGGSYVYPPVQEFPLALIGGGREPGGGRGKSGSEGPVG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ASETASLQDPIISGGEEPPVVASGGSYVYPPVQEFPLALIGGGREPGGGRGKSGSEGPVG
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pF1KSD AGEGDRMEGIGAAKVTFYPEPYPLVYGPQLLAAYPYNFSNLAALPVALNMVLPDEKGAGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AGEGDRMEGIGAAKVTFYPEPYPLVYGPQLLAAYPYNFSNLAALPVALNMVLPDEKGAGA
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010   
pF1KSD LPFLPGVFGYAVNPQAAPPAPPTPPPPTLPPPIPPKGEGERAGVERTQKGDVG
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LPFLPGVFGYAVNPQAAPPAPPTPPPPTLPPPIPPKGEGERAGVERTQKGDVG
              970       980       990      1000      1010   

>>XP_005247315 (OMIM: 612218) PREDICTED: zinc finger and  (1195 aa)
 initn: 1195 init1: 666 opt: 689  Z-score: 272.1  bits: 62.1 E(85289): 2e-08
Smith-Waterman score: 873; 32.2% identity (53.0% similar) in 698 aa overlap (216-792:352-1037)

         190       200       210       220       230        240    
pF1KSD VPPTPAPMATSQPEEDSFGPGPRPAGEWEGDRAEAQAPDLQCSLP-RRPLPCPQCGKSFI
                                     : .   .  .:   : ..:: :  :.:.: 
XP_005 DENQSSDVPGPPAAEVPPLVYNCSCCSKAFDSSTLLSAHMQLHKPTQEPLVCKYCNKQFT
             330       340       350       360       370       380 

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pF1KSD HPKRLQTHEAQCRR-------GASTR---GSTGLGAGGAGPGGPAGVDASALPPPVGFRG
         .::. ::  : :       :.. :   .   .: .:..  ::  . .       .  :
XP_005 TLNRLDRHEQICMRSSHMPIPGGNQRFLENYPTIGQNGGSFTGPEPLLSENRIGEFSSTG
             390       400       410       420       430       440 

              300       310       320       330       340       350
pF1KSD G--PE--HVVKVVGGHVLYVCAACERSYVTLSSLKRHSNVHSWRRKYPCRYCEKVFALAE
       .  :.  :.:: :.:..:: :..:.:::::::::.::.::::::: :::.::.:::::::
XP_005 STLPDTDHMVKFVNGQMLYSCVVCKRSYVTLSSLRRHANVHSWRRTYPCHYCNKVFALAE
             450       460       470       480       490       500 

              360       370       380       390       400       410
pF1KSD YRTKHEVWHTGERRYQCIFCWETFVTYYNLKTHQRAFHGISPGLLASEKTPNGGYKPKLN
       :::.::.::::::::::::: :::.::: ::.::..::.:.  :  :.:: ::: ::.. 
XP_005 YRTRHEIWHTGERRYQCIFCLETFMTYYILKNHQKSFHAIDHRLSISKKTANGGLKPSVY
             510       520       530       540       550       560 

              420       430                          440           
pF1KSD TLKLYRLLPMRAAKRPYKTY--------------SQGAP-----EAPLS---PTLNTPAP
         ::::::::.  . :::.:              ...::     . : :   ::::    
XP_005 PYKLYRLLPMKCKRAPYKSYRNSSYENARENSQMNESAPGTYVVQNPHSSELPTLNFQDT
             570       580       590       600       610       620 

       450        460       470                          480       
pF1KSD V-AMPASPP-PGPPPAPEPGPPPSVI-------------------TFAHPAPSVIVHGGS
       : ..  ::  :    : .  :  . .                   .:     ::    ..
XP_005 VNTLTNSPAIPLETSACQDIPTSANVQNAEGTKWGEEALKMDLDNNFYSTEVSVSSTENA
             630       640       650       660       670       680 

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pF1KSD SSGGGGSG-----TASTGGSQAASVITYT--APPRPPKKREYPP---PPPEPAATPTSPA
        :.   .:     . :... .:::::.:.  ::    .. ..          ::  .:  
XP_005 VSSDLRAGDVPVLSLSNSSENAASVISYSGSAPSVIVHSSQFSSVIMHSNAIAAMTSSNH
             690       700       710       720       730       740 

       540        550        560              570              580 
pF1KSD TAVS-PATAAGPAMATTTEEAK-GR---NPRA----GRTLTYT-------AKPVGGIGGG
        : : ::.. .    .  :  : ::    :..     .: ..:       .. :.  ::.
XP_005 RAFSDPAVSQSLKDDSKPEPDKVGRFASRPKSIKEKKKTTSHTRGEIPEESNYVADPGGS
             750       760       770       780       790       800 

             590                      600       610       620      
pF1KSD GGPPTGAGRGPSQLQ---APP------------PLCQITVRIGEEAIVKRRISETDL---
        .  :. ..  :...   : :            :::::::.::.::::::.:  . :   
XP_005 LSKTTNIAEETSKIETYIAKPALPGTSTNSNVAPLCQITVKIGNEAIVKRHILGSKLFYK
             810       820       830       840       850       860 

               630       640                 650       660         
pF1KSD ---RPG-ELSGEEMEESEEDEEEEDE----------EEEEEDEEESKAGGEDQLWRPYYS
          ::  ... : . .... :   :           :  :  .. :   . :. :::::.
XP_005 RGRRPKYQMQEEPLPQGNDPEPSGDSPLGLCQSECMEMSEVFDDASDQDSTDKPWRPYYN
             870       880       890       900       910       920 

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pF1KSD YKPKRKAGAAGGASVGGSGLPRGRRPPRWRQKLERRSWEET---PAA-ESPAGRARTERR
       ::::.:.            : . :.   ::..   ::  .    ::  .  .:.:  .. 
XP_005 YKPKKKS----------RQLKKMRKV-NWRKEHGNRSPSHKCKYPAELDCAVGKAPQDKP
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        .  .  .      .:   ..: :.:... :  :. ..: ..:  :::  .. ..:. : 
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       . :..:.:                                                    
XP_005 RCHTGEKPYQCKTCGRCFSVQGNLQKHERIHLGLKEFVCQYCNKAFTLNETLKIHERIHT
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         .::. ::  : :       :.. :   .   .: .:..  ::  . .       .  :
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       .  :.  :.:: :.:..:: :..:.:::::::::.::.::::::: :::.::.:::::::
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       :::.::.::::::::::::: :::.::: ::.::..::.:.  :  :.:: ::: ::.. 
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         ::::::::.  . :::.:              ...::     . : :   ::::    
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       : ..  ::  :    : .  :  . .                   .:     ::    ..
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        :.   .:     . :... .:::::.:.  ::    .. ..          ::  .:  
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        : : ::.. .    .  :  : ::    :..     .: ..:       .. :.  ::.
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        .  :. ..  :...   : :            :::::::.::.::::::.:  . :   
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          ::  ... : . .... :   :           :  :  .. :   . :. :::::.
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pF1KSD HRCGDCAQTFTTLRKLRKHQEAHGGGSHSSRAGRRPSTR-FTCPHCAKVCKTAAALSRHG
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XP_016 FEEEETKEMPKLQCELCDGDKAVGAGNQG-RPHRHLTSRPYACELCAKQFQSPSTLKMHM
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       . :..:.:                                                    
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XP_016 DENQSSDVPGPPAAEVPPLVYNCSCCSKAFDSSTLLSAHMQLHKPTQEPLVCKYCNKQFT
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         .::. ::  : :       :.. :   .   .: .:..  ::  . .       .  :
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pF1KSD G--PE--HVVKVVGGHVLYVCAACERSYVTLSSLKRHSNVHSWRRKYPCRYCEKVFALAE
       .  :.  :.:: :.:..:: :..:.:::::::::.::.::::::: :::.::.:::::::
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       :::.::.::::::::::::: :::.::: ::.::..::.:.  :  :.:: ::: ::.. 
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         ::::::::.  . :::.:              ...::     . : :   ::::    
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       : ..  ::  :    : .  :  . .                   .:     ::    ..
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        :.   .:     . :... .:::::.:.  ::    .. ..          ::  .:  
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pF1KSD TAVS-PATAAGPAMATTTEEAK-GR---NPRA----GRTLTYT-------AKPVGGIGGG
        : : ::.. .    .  :  : ::    :..     .: ..:       .. :.  ::.
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pF1KSD GGPPTGAGRGPSQLQ---APP------------PLCQITVRIGEEAIVKRRISETDL---
        .  :. ..  :...   : :            :::::::.::.::::::.:  . :   
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pF1KSD ---RPG-ELSGEEMEESEEDEEEEDE----------EEEEEDEEESKAGGEDQLWRPYYS
          ::  ... : . .... :   :           :  :  .. :   . :. :::::.
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pF1KSD YKPKRKAGAAGGASVGGSGLPRGRRPPRWRQKLERRSWEET---PAA-ESPAGRARTERR
       ::::.:.            : . :.   ::..   ::  .    ::  .  .:.:  .. 
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pF1KSD HRCGDCAQTFTTLRKLRKHQEAHGGGSHSSRAGRRPSTR-FTCPHCAKVCKTAAALSRHG
        .  .  .      .:   ..: :.:... :  :. ..: ..:  :::  .. ..:. : 
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pF1KSD QRHAAERPGGTPTPVIAYSKGSAGTRPGDVKEEAPQEMQVSSSSGEAGGGSTAAEEASET
       . :..:.:                                                    
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>>XP_016861547 (OMIM: 612218) PREDICTED: zinc finger and  (1195 aa)
 initn: 1195 init1: 666 opt: 689  Z-score: 272.1  bits: 62.1 E(85289): 2e-08
Smith-Waterman score: 873; 32.2% identity (53.0% similar) in 698 aa overlap (216-792:352-1037)

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                                     : .   .  .:   : ..:: :  :.:.: 
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         .::. ::  : :       :.. :   .   .: .:..  ::  . .       .  :
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        :.   .:     . :... .:::::.:.  ::    .. ..          ::  .:  
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1013 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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