Result of FASTA (omim) for
pF1KSDA1538
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1538, 1013 aa
1>>>pF1KSDA1538 1013 - 1013 aa - 1013 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.7595+/-0.000414; mu= -11.1592+/- 0.026
mean_var=760.3102+/-173.833, 0's: 0 Z-trim(126.9): 33 B-trim: 3078 in 1/61
Lambda= 0.046513
statistics sampled from 53822 (53872) to 53822 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.843), E-opt: 0.2 (0.632), width: 16
Scan time: 19.240
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_006721626 (OMIM: 612308) PREDICTED: zinc finger (1013) 6997 485.4 6.8e-136
XP_006721627 (OMIM: 612308) PREDICTED: zinc finger (1013) 6997 485.4 6.8e-136
NP_065950 (OMIM: 612308) zinc finger and BTB domai (1013) 6997 485.4 6.8e-136
NP_001122305 (OMIM: 612308) zinc finger and BTB do (1013) 6997 485.4 6.8e-136
XP_011522274 (OMIM: 612308) PREDICTED: zinc finger (1013) 6997 485.4 6.8e-136
XP_005247315 (OMIM: 612218) PREDICTED: zinc finger (1195) 689 62.1 2e-08
XP_016861544 (OMIM: 612218) PREDICTED: zinc finger (1195) 689 62.1 2e-08
XP_011510913 (OMIM: 612218) PREDICTED: zinc finger (1195) 689 62.1 2e-08
XP_016861541 (OMIM: 612218) PREDICTED: zinc finger (1195) 689 62.1 2e-08
XP_016861547 (OMIM: 612218) PREDICTED: zinc finger (1195) 689 62.1 2e-08
XP_016861542 (OMIM: 612218) PREDICTED: zinc finger (1195) 689 62.1 2e-08
XP_016861543 (OMIM: 612218) PREDICTED: zinc finger (1195) 689 62.1 2e-08
XP_016861550 (OMIM: 612218) PREDICTED: zinc finger (1195) 689 62.1 2e-08
XP_005247318 (OMIM: 612218) PREDICTED: zinc finger (1195) 689 62.1 2e-08
XP_005247314 (OMIM: 612218) PREDICTED: zinc finger (1195) 689 62.1 2e-08
XP_016861546 (OMIM: 612218) PREDICTED: zinc finger (1195) 689 62.1 2e-08
NP_001073881 (OMIM: 612218) zinc finger and BTB do (1195) 689 62.1 2e-08
XP_016861549 (OMIM: 612218) PREDICTED: zinc finger (1195) 689 62.1 2e-08
XP_016861545 (OMIM: 612218) PREDICTED: zinc finger (1195) 689 62.1 2e-08
XP_016861548 (OMIM: 612218) PREDICTED: zinc finger (1195) 689 62.1 2e-08
XP_005247313 (OMIM: 612218) PREDICTED: zinc finger (1196) 689 62.1 2e-08
XP_011510910 (OMIM: 612218) PREDICTED: zinc finger (1221) 689 62.2 2.1e-08
XP_016861540 (OMIM: 612218) PREDICTED: zinc finger (1221) 689 62.2 2.1e-08
XP_016861539 (OMIM: 612218) PREDICTED: zinc finger (1221) 689 62.2 2.1e-08
XP_011510909 (OMIM: 612218) PREDICTED: zinc finger (1221) 689 62.2 2.1e-08
NP_001171671 (OMIM: 300329) transcriptional regula ( 672) 443 45.3 0.0013
NP_006768 (OMIM: 300329) transcriptional regulator ( 672) 443 45.3 0.0013
>>XP_006721626 (OMIM: 612308) PREDICTED: zinc finger and (1013 aa)
initn: 6997 init1: 6997 opt: 6997 Z-score: 2560.7 bits: 485.4 E(85289): 6.8e-136
Smith-Waterman score: 6997; 100.0% identity (100.0% similar) in 1013 aa overlap (1-1013:1-1013)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MPPPAEVTDPSHAPAVLRQLNEQRLRGLFCDVTLIAGDTKFPAHRSVLAASSPFFREALL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 MPPPAEVTDPSHAPAVLRQLNEQRLRGLFCDVTLIAGDTKFPAHRSVLAASSPFFREALL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD TSAPLPLPPATGGAAPNPATTTAASSSSSSSSSSSSSSSSASSSSSSSSSSPPPASPPAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 TSAPLPLPPATGGAAPNPATTTAASSSSSSSSSSSSSSSSASSSSSSSSSSPPPASPPAS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD SPPRVLELPGVPAAAFSDVLNFIYSARLALPGGGGDGAAVAEIGALGRRLGISRLQGLGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 SPPRVLELPGVPAAAFSDVLNFIYSARLALPGGGGDGAAVAEIGALGRRLGISRLQGLGE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD GGDAWVPPTPAPMATSQPEEDSFGPGPRPAGEWEGDRAEAQAPDLQCSLPRRPLPCPQCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 GGDAWVPPTPAPMATSQPEEDSFGPGPRPAGEWEGDRAEAQAPDLQCSLPRRPLPCPQCG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD KSFIHPKRLQTHEAQCRRGASTRGSTGLGAGGAGPGGPAGVDASALPPPVGFRGGPEHVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 KSFIHPKRLQTHEAQCRRGASTRGSTGLGAGGAGPGGPAGVDASALPPPVGFRGGPEHVV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD KVVGGHVLYVCAACERSYVTLSSLKRHSNVHSWRRKYPCRYCEKVFALAEYRTKHEVWHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 KVVGGHVLYVCAACERSYVTLSSLKRHSNVHSWRRKYPCRYCEKVFALAEYRTKHEVWHT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD GERRYQCIFCWETFVTYYNLKTHQRAFHGISPGLLASEKTPNGGYKPKLNTLKLYRLLPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 GERRYQCIFCWETFVTYYNLKTHQRAFHGISPGLLASEKTPNGGYKPKLNTLKLYRLLPM
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430 440 450 460 470 480
pF1KSD RAAKRPYKTYSQGAPEAPLSPTLNTPAPVAMPASPPPGPPPAPEPGPPPSVITFAHPAPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 RAAKRPYKTYSQGAPEAPLSPTLNTPAPVAMPASPPPGPPPAPEPGPPPSVITFAHPAPS
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490 500 510 520 530 540
pF1KSD VIVHGGSSSGGGGSGTASTGGSQAASVITYTAPPRPPKKREYPPPPPEPAATPTSPATAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 VIVHGGSSSGGGGSGTASTGGSQAASVITYTAPPRPPKKREYPPPPPEPAATPTSPATAV
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550 560 570 580 590 600
pF1KSD SPATAAGPAMATTTEEAKGRNPRAGRTLTYTAKPVGGIGGGGGPPTGAGRGPSQLQAPPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 SPATAAGPAMATTTEEAKGRNPRAGRTLTYTAKPVGGIGGGGGPPTGAGRGPSQLQAPPP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD LCQITVRIGEEAIVKRRISETDLRPGELSGEEMEESEEDEEEEDEEEEEEDEEESKAGGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LCQITVRIGEEAIVKRRISETDLRPGELSGEEMEESEEDEEEEDEEEEEEDEEESKAGGE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD DQLWRPYYSYKPKRKAGAAGGASVGGSGLPRGRRPPRWRQKLERRSWEETPAAESPAGRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 DQLWRPYYSYKPKRKAGAAGGASVGGSGLPRGRRPPRWRQKLERRSWEETPAAESPAGRA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD RTERRHRCGDCAQTFTTLRKLRKHQEAHGGGSHSSRAGRRPSTRFTCPHCAKVCKTAAAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 RTERRHRCGDCAQTFTTLRKLRKHQEAHGGGSHSSRAGRRPSTRFTCPHCAKVCKTAAAL
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790 800 810 820 830 840
pF1KSD SRHGQRHAAERPGGTPTPVIAYSKGSAGTRPGDVKEEAPQEMQVSSSSGEAGGGSTAAEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 SRHGQRHAAERPGGTPTPVIAYSKGSAGTRPGDVKEEAPQEMQVSSSSGEAGGGSTAAEE
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD ASETASLQDPIISGGEEPPVVASGGSYVYPPVQEFPLALIGGGREPGGGRGKSGSEGPVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 ASETASLQDPIISGGEEPPVVASGGSYVYPPVQEFPLALIGGGREPGGGRGKSGSEGPVG
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910 920 930 940 950 960
pF1KSD AGEGDRMEGIGAAKVTFYPEPYPLVYGPQLLAAYPYNFSNLAALPVALNMVLPDEKGAGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 AGEGDRMEGIGAAKVTFYPEPYPLVYGPQLLAAYPYNFSNLAALPVALNMVLPDEKGAGA
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010
pF1KSD LPFLPGVFGYAVNPQAAPPAPPTPPPPTLPPPIPPKGEGERAGVERTQKGDVG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LPFLPGVFGYAVNPQAAPPAPPTPPPPTLPPPIPPKGEGERAGVERTQKGDVG
970 980 990 1000 1010
>>XP_006721627 (OMIM: 612308) PREDICTED: zinc finger and (1013 aa)
initn: 6997 init1: 6997 opt: 6997 Z-score: 2560.7 bits: 485.4 E(85289): 6.8e-136
Smith-Waterman score: 6997; 100.0% identity (100.0% similar) in 1013 aa overlap (1-1013:1-1013)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MPPPAEVTDPSHAPAVLRQLNEQRLRGLFCDVTLIAGDTKFPAHRSVLAASSPFFREALL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 MPPPAEVTDPSHAPAVLRQLNEQRLRGLFCDVTLIAGDTKFPAHRSVLAASSPFFREALL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD TSAPLPLPPATGGAAPNPATTTAASSSSSSSSSSSSSSSSASSSSSSSSSSPPPASPPAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 TSAPLPLPPATGGAAPNPATTTAASSSSSSSSSSSSSSSSASSSSSSSSSSPPPASPPAS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD SPPRVLELPGVPAAAFSDVLNFIYSARLALPGGGGDGAAVAEIGALGRRLGISRLQGLGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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190 200 210 220 230 240
pF1KSD GGDAWVPPTPAPMATSQPEEDSFGPGPRPAGEWEGDRAEAQAPDLQCSLPRRPLPCPQCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 GGDAWVPPTPAPMATSQPEEDSFGPGPRPAGEWEGDRAEAQAPDLQCSLPRRPLPCPQCG
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250 260 270 280 290 300
pF1KSD KSFIHPKRLQTHEAQCRRGASTRGSTGLGAGGAGPGGPAGVDASALPPPVGFRGGPEHVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KSD KVVGGHVLYVCAACERSYVTLSSLKRHSNVHSWRRKYPCRYCEKVFALAEYRTKHEVWHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 KVVGGHVLYVCAACERSYVTLSSLKRHSNVHSWRRKYPCRYCEKVFALAEYRTKHEVWHT
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pF1KSD GERRYQCIFCWETFVTYYNLKTHQRAFHGISPGLLASEKTPNGGYKPKLNTLKLYRLLPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 GERRYQCIFCWETFVTYYNLKTHQRAFHGISPGLLASEKTPNGGYKPKLNTLKLYRLLPM
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pF1KSD RAAKRPYKTYSQGAPEAPLSPTLNTPAPVAMPASPPPGPPPAPEPGPPPSVITFAHPAPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KSD SPATAAGPAMATTTEEAKGRNPRAGRTLTYTAKPVGGIGGGGGPPTGAGRGPSQLQAPPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 SPATAAGPAMATTTEEAKGRNPRAGRTLTYTAKPVGGIGGGGGPPTGAGRGPSQLQAPPP
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pF1KSD LCQITVRIGEEAIVKRRISETDLRPGELSGEEMEESEEDEEEEDEEEEEEDEEESKAGGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LCQITVRIGEEAIVKRRISETDLRPGELSGEEMEESEEDEEEEDEEEEEEDEEESKAGGE
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pF1KSD DQLWRPYYSYKPKRKAGAAGGASVGGSGLPRGRRPPRWRQKLERRSWEETPAAESPAGRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 DQLWRPYYSYKPKRKAGAAGGASVGGSGLPRGRRPPRWRQKLERRSWEETPAAESPAGRA
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pF1KSD RTERRHRCGDCAQTFTTLRKLRKHQEAHGGGSHSSRAGRRPSTRFTCPHCAKVCKTAAAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 RTERRHRCGDCAQTFTTLRKLRKHQEAHGGGSHSSRAGRRPSTRFTCPHCAKVCKTAAAL
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pF1KSD SRHGQRHAAERPGGTPTPVIAYSKGSAGTRPGDVKEEAPQEMQVSSSSGEAGGGSTAAEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 SRHGQRHAAERPGGTPTPVIAYSKGSAGTRPGDVKEEAPQEMQVSSSSGEAGGGSTAAEE
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pF1KSD ASETASLQDPIISGGEEPPVVASGGSYVYPPVQEFPLALIGGGREPGGGRGKSGSEGPVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 ASETASLQDPIISGGEEPPVVASGGSYVYPPVQEFPLALIGGGREPGGGRGKSGSEGPVG
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pF1KSD AGEGDRMEGIGAAKVTFYPEPYPLVYGPQLLAAYPYNFSNLAALPVALNMVLPDEKGAGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 AGEGDRMEGIGAAKVTFYPEPYPLVYGPQLLAAYPYNFSNLAALPVALNMVLPDEKGAGA
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pF1KSD LPFLPGVFGYAVNPQAAPPAPPTPPPPTLPPPIPPKGEGERAGVERTQKGDVG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LPFLPGVFGYAVNPQAAPPAPPTPPPPTLPPPIPPKGEGERAGVERTQKGDVG
970 980 990 1000 1010
>>NP_065950 (OMIM: 612308) zinc finger and BTB domain-co (1013 aa)
initn: 6997 init1: 6997 opt: 6997 Z-score: 2560.7 bits: 485.4 E(85289): 6.8e-136
Smith-Waterman score: 6997; 100.0% identity (100.0% similar) in 1013 aa overlap (1-1013:1-1013)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MPPPAEVTDPSHAPAVLRQLNEQRLRGLFCDVTLIAGDTKFPAHRSVLAASSPFFREALL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 MPPPAEVTDPSHAPAVLRQLNEQRLRGLFCDVTLIAGDTKFPAHRSVLAASSPFFREALL
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pF1KSD TSAPLPLPPATGGAAPNPATTTAASSSSSSSSSSSSSSSSASSSSSSSSSSPPPASPPAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 TSAPLPLPPATGGAAPNPATTTAASSSSSSSSSSSSSSSSASSSSSSSSSSPPPASPPAS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 SPPRVLELPGVPAAAFSDVLNFIYSARLALPGGGGDGAAVAEIGALGRRLGISRLQGLGE
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pF1KSD GGDAWVPPTPAPMATSQPEEDSFGPGPRPAGEWEGDRAEAQAPDLQCSLPRRPLPCPQCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 GGDAWVPPTPAPMATSQPEEDSFGPGPRPAGEWEGDRAEAQAPDLQCSLPRRPLPCPQCG
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pF1KSD KSFIHPKRLQTHEAQCRRGASTRGSTGLGAGGAGPGGPAGVDASALPPPVGFRGGPEHVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 KSFIHPKRLQTHEAQCRRGASTRGSTGLGAGGAGPGGPAGVDASALPPPVGFRGGPEHVV
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pF1KSD KVVGGHVLYVCAACERSYVTLSSLKRHSNVHSWRRKYPCRYCEKVFALAEYRTKHEVWHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KSD GERRYQCIFCWETFVTYYNLKTHQRAFHGISPGLLASEKTPNGGYKPKLNTLKLYRLLPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 GERRYQCIFCWETFVTYYNLKTHQRAFHGISPGLLASEKTPNGGYKPKLNTLKLYRLLPM
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 RAAKRPYKTYSQGAPEAPLSPTLNTPAPVAMPASPPPGPPPAPEPGPPPSVITFAHPAPS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 VIVHGGSSSGGGGSGTASTGGSQAASVITYTAPPRPPKKREYPPPPPEPAATPTSPATAV
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pF1KSD SPATAAGPAMATTTEEAKGRNPRAGRTLTYTAKPVGGIGGGGGPPTGAGRGPSQLQAPPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 SPATAAGPAMATTTEEAKGRNPRAGRTLTYTAKPVGGIGGGGGPPTGAGRGPSQLQAPPP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 LCQITVRIGEEAIVKRRISETDLRPGELSGEEMEESEEDEEEEDEEEEEEDEEESKAGGE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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NP_065 LPFLPGVFGYAVNPQAAPPAPPTPPPPTLPPPIPPKGEGERAGVERTQKGDVG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SRHGQRHAAERPGGTPTPVIAYSKGSAGTRPGDVKEEAPQEMQVSSSSGEAGGGSTAAEE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ASETASLQDPIISGGEEPPVVASGGSYVYPPVQEFPLALIGGGREPGGGRGKSGSEGPVG
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NP_001 AGEGDRMEGIGAAKVTFYPEPYPLVYGPQLLAAYPYNFSNLAALPVALNMVLPDEKGAGA
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NP_001 LPFLPGVFGYAVNPQAAPPAPPTPPPPTLPPPIPPKGEGERAGVERTQKGDVG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SPPRVLELPGVPAAAFSDVLNFIYSARLALPGGGGDGAAVAEIGALGRRLGISRLQGLGE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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XP_011 DQLWRPYYSYKPKRKAGAAGGASVGGSGLPRGRRPPRWRQKLERRSWEETPAAESPAGRA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RTERRHRCGDCAQTFTTLRKLRKHQEAHGGGSHSSRAGRRPSTRFTCPHCAKVCKTAAAL
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pF1KSD SRHGQRHAAERPGGTPTPVIAYSKGSAGTRPGDVKEEAPQEMQVSSSSGEAGGGSTAAEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SRHGQRHAAERPGGTPTPVIAYSKGSAGTRPGDVKEEAPQEMQVSSSSGEAGGGSTAAEE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ASETASLQDPIISGGEEPPVVASGGSYVYPPVQEFPLALIGGGREPGGGRGKSGSEGPVG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AGEGDRMEGIGAAKVTFYPEPYPLVYGPQLLAAYPYNFSNLAALPVALNMVLPDEKGAGA
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LPFLPGVFGYAVNPQAAPPAPPTPPPPTLPPPIPPKGEGERAGVERTQKGDVG
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: . . .: : ..:: : :.:.:
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.::. :: : : :.. : . .: .:.. :: . . . :
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pF1KSD G--PE--HVVKVVGGHVLYVCAACERSYVTLSSLKRHSNVHSWRRKYPCRYCEKVFALAE
. :. :.:: :.:..:: :..:.:::::::::.::.::::::: :::.::.:::::::
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pF1KSD YRTKHEVWHTGERRYQCIFCWETFVTYYNLKTHQRAFHGISPGLLASEKTPNGGYKPKLN
:::.::.::::::::::::: :::.::: ::.::..::.:. : :.:: ::: ::..
XP_005 YRTRHEIWHTGERRYQCIFCLETFMTYYILKNHQKSFHAIDHRLSISKKTANGGLKPSVY
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pF1KSD TLKLYRLLPMRAAKRPYKTY--------------SQGAP-----EAPLS---PTLNTPAP
::::::::. . :::.: ...:: . : : ::::
XP_005 PYKLYRLLPMKCKRAPYKSYRNSSYENARENSQMNESAPGTYVVQNPHSSELPTLNFQDT
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pF1KSD V-AMPASPP-PGPPPAPEPGPPPSVI-------------------TFAHPAPSVIVHGGS
: .. :: : : . : . . .: :: ..
XP_005 VNTLTNSPAIPLETSACQDIPTSANVQNAEGTKWGEEALKMDLDNNFYSTEVSVSSTENA
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pF1KSD SSGGGGSG-----TASTGGSQAASVITYT--APPRPPKKREYPP---PPPEPAATPTSPA
:. .: . :... .:::::.:. :: .. .. :: .:
XP_005 VSSDLRAGDVPVLSLSNSSENAASVISYSGSAPSVIVHSSQFSSVIMHSNAIAAMTSSNH
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pF1KSD TAVS-PATAAGPAMATTTEEAK-GR---NPRA----GRTLTYT-------AKPVGGIGGG
: : ::.. . . : : :: :.. .: ..: .. :. ::.
XP_005 RAFSDPAVSQSLKDDSKPEPDKVGRFASRPKSIKEKKKTTSHTRGEIPEESNYVADPGGS
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pF1KSD GGPPTGAGRGPSQLQ---APP------------PLCQITVRIGEEAIVKRRISETDL---
. :. .. :... : : :::::::.::.::::::.: . :
XP_005 LSKTTNIAEETSKIETYIAKPALPGTSTNSNVAPLCQITVKIGNEAIVKRHILGSKLFYK
810 820 830 840 850 860
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pF1KSD ---RPG-ELSGEEMEESEEDEEEEDE----------EEEEEDEEESKAGGEDQLWRPYYS
:: ... : . .... : : : : .. : . :. :::::.
XP_005 RGRRPKYQMQEEPLPQGNDPEPSGDSPLGLCQSECMEMSEVFDDASDQDSTDKPWRPYYN
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pF1KSD YKPKRKAGAAGGASVGGSGLPRGRRPPRWRQKLERRSWEET---PAA-ESPAGRARTERR
::::.:. : . :. ::.. :: . :: . .:.: ..
XP_005 YKPKKKS----------RQLKKMRKV-NWRKEHGNRSPSHKCKYPAELDCAVGKAPQDKP
930 940 950 960 970
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pF1KSD HRCGDCAQTFTTLRKLRKHQEAHGGGSHSSRAGRRPSTR-FTCPHCAKVCKTAAALSRHG
. . . .: ..: :.:... : :. ..: ..: ::: .. ..:. :
XP_005 FEEEETKEMPKLQCELCDGDKAVGAGNQG-RPHRHLTSRPYACELCAKQFQSPSTLKMHM
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pF1KSD QRHAAERPGGTPTPVIAYSKGSAGTRPGDVKEEAPQEMQVSSSSGEAGGGSTAAEEASET
. :..:.:
XP_005 RCHTGEKPYQCKTCGRCFSVQGNLQKHERIHLGLKEFVCQYCNKAFTLNETLKIHERIHT
1030 1040 1050 1060 1070 1080
>>XP_016861544 (OMIM: 612218) PREDICTED: zinc finger and (1195 aa)
initn: 1195 init1: 666 opt: 689 Z-score: 272.1 bits: 62.1 E(85289): 2e-08
Smith-Waterman score: 873; 32.2% identity (53.0% similar) in 698 aa overlap (216-792:352-1037)
190 200 210 220 230 240
pF1KSD VPPTPAPMATSQPEEDSFGPGPRPAGEWEGDRAEAQAPDLQCSLP-RRPLPCPQCGKSFI
: . . .: : ..:: : :.:.:
XP_016 DENQSSDVPGPPAAEVPPLVYNCSCCSKAFDSSTLLSAHMQLHKPTQEPLVCKYCNKQFT
330 340 350 360 370 380
250 260 270 280 290
pF1KSD HPKRLQTHEAQCRR-------GASTR---GSTGLGAGGAGPGGPAGVDASALPPPVGFRG
.::. :: : : :.. : . .: .:.. :: . . . :
XP_016 TLNRLDRHEQICMRSSHMPIPGGNQRFLENYPTIGQNGGSFTGPEPLLSENRIGEFSSTG
390 400 410 420 430 440
300 310 320 330 340 350
pF1KSD G--PE--HVVKVVGGHVLYVCAACERSYVTLSSLKRHSNVHSWRRKYPCRYCEKVFALAE
. :. :.:: :.:..:: :..:.:::::::::.::.::::::: :::.::.:::::::
XP_016 STLPDTDHMVKFVNGQMLYSCVVCKRSYVTLSSLRRHANVHSWRRTYPCHYCNKVFALAE
450 460 470 480 490 500
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pF1KSD YRTKHEVWHTGERRYQCIFCWETFVTYYNLKTHQRAFHGISPGLLASEKTPNGGYKPKLN
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