FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KSDA1538, 1013 aa 1>>>pF1KSDA1538 1013 - 1013 aa - 1013 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.7595+/-0.000414; mu= -11.1592+/- 0.026 mean_var=760.3102+/-173.833, 0's: 0 Z-trim(126.9): 33 B-trim: 3078 in 1/61 Lambda= 0.046513 statistics sampled from 53822 (53872) to 53822 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.843), E-opt: 0.2 (0.632), width: 16 Scan time: 19.240 The best scores are: opt bits E(85289) XP_006721626 (OMIM: 612308) PREDICTED: zinc finger (1013) 6997 485.4 6.8e-136 XP_006721627 (OMIM: 612308) PREDICTED: zinc finger (1013) 6997 485.4 6.8e-136 NP_065950 (OMIM: 612308) zinc finger and BTB domai (1013) 6997 485.4 6.8e-136 NP_001122305 (OMIM: 612308) zinc finger and BTB do (1013) 6997 485.4 6.8e-136 XP_011522274 (OMIM: 612308) PREDICTED: zinc finger (1013) 6997 485.4 6.8e-136 XP_005247315 (OMIM: 612218) PREDICTED: zinc finger (1195) 689 62.1 2e-08 XP_016861544 (OMIM: 612218) PREDICTED: zinc finger (1195) 689 62.1 2e-08 XP_011510913 (OMIM: 612218) PREDICTED: zinc finger (1195) 689 62.1 2e-08 XP_016861541 (OMIM: 612218) PREDICTED: zinc finger (1195) 689 62.1 2e-08 XP_016861547 (OMIM: 612218) PREDICTED: zinc finger (1195) 689 62.1 2e-08 XP_016861542 (OMIM: 612218) PREDICTED: zinc finger (1195) 689 62.1 2e-08 XP_016861543 (OMIM: 612218) PREDICTED: zinc finger (1195) 689 62.1 2e-08 XP_016861550 (OMIM: 612218) PREDICTED: zinc finger (1195) 689 62.1 2e-08 XP_005247318 (OMIM: 612218) PREDICTED: zinc finger (1195) 689 62.1 2e-08 XP_005247314 (OMIM: 612218) PREDICTED: zinc finger (1195) 689 62.1 2e-08 XP_016861546 (OMIM: 612218) PREDICTED: zinc finger (1195) 689 62.1 2e-08 NP_001073881 (OMIM: 612218) zinc finger and BTB do (1195) 689 62.1 2e-08 XP_016861549 (OMIM: 612218) PREDICTED: zinc finger (1195) 689 62.1 2e-08 XP_016861545 (OMIM: 612218) PREDICTED: zinc finger (1195) 689 62.1 2e-08 XP_016861548 (OMIM: 612218) PREDICTED: zinc finger (1195) 689 62.1 2e-08 XP_005247313 (OMIM: 612218) PREDICTED: zinc finger (1196) 689 62.1 2e-08 XP_011510910 (OMIM: 612218) PREDICTED: zinc finger (1221) 689 62.2 2.1e-08 XP_016861540 (OMIM: 612218) PREDICTED: zinc finger (1221) 689 62.2 2.1e-08 XP_016861539 (OMIM: 612218) PREDICTED: zinc finger (1221) 689 62.2 2.1e-08 XP_011510909 (OMIM: 612218) PREDICTED: zinc finger (1221) 689 62.2 2.1e-08 NP_001171671 (OMIM: 300329) transcriptional regula ( 672) 443 45.3 0.0013 NP_006768 (OMIM: 300329) transcriptional regulator ( 672) 443 45.3 0.0013 >>XP_006721626 (OMIM: 612308) PREDICTED: zinc finger and (1013 aa) initn: 6997 init1: 6997 opt: 6997 Z-score: 2560.7 bits: 485.4 E(85289): 6.8e-136 Smith-Waterman score: 6997; 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