FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1490, 748 aa
1>>>pF1KSDA1490 748 - 748 aa - 748 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.8095+/-0.000903; mu= 8.2637+/- 0.054
mean_var=127.5083+/-26.579, 0's: 0 Z-trim(109.5): 153 B-trim: 472 in 2/52
Lambda= 0.113581
statistics sampled from 10772 (10938) to 10772 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.688), E-opt: 0.2 (0.336), width: 16
Scan time: 4.250
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS33749.1 KLHL18 gene_id:23276|Hs108|chr3 ( 574) 1456 250.2 6.6e-66
CCDS58970.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 ( 555) 1455 250.0 7.2e-66
CCDS34094.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 593) 1426 245.3 2.1e-64
CCDS54815.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 597) 1426 245.3 2.1e-64
CCDS1429.1 KLHL12 gene_id:59349|Hs108|chr1 ( 568) 1406 242.0 1.9e-63
CCDS58969.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 ( 505) 1310 226.3 9.4e-59
CCDS12239.1 KEAP1 gene_id:9817|Hs108|chr19 ( 624) 1228 212.9 1.3e-54
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CCDS76675.1 KLHL28 gene_id:54813|Hs108|chr14 ( 585) 987 173.4 9.2e-43
CCDS14571.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX ( 655) 941 165.9 1.9e-40
CCDS55481.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX ( 639) 940 165.7 2.1e-40
CCDS55479.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX ( 613) 936 165.0 3.1e-40
CCDS55480.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX ( 658) 936 165.0 3.4e-40
CCDS34609.1 KLHL7 gene_id:55975|Hs108|chr7 ( 586) 935 164.8 3.4e-40
CCDS6503.1 KLHL9 gene_id:55958|Hs108|chr9 ( 617) 926 163.4 9.9e-40
CCDS5378.2 KLHL7 gene_id:55975|Hs108|chr7 ( 538) 875 155.0 2.9e-37
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CCDS13780.1 KLHL22 gene_id:84861|Hs108|chr22 ( 634) 829 147.5 6.1e-35
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CCDS10935.1 GAN gene_id:8139|Hs108|chr16 ( 597) 766 137.2 7.5e-32
CCDS46555.2 KLHL30 gene_id:377007|Hs108|chr2 ( 578) 749 134.4 5e-31
CCDS54335.1 KLHL29 gene_id:114818|Hs108|chr2 ( 875) 731 131.5 5.6e-30
CCDS30575.1 KLHL21 gene_id:9903|Hs108|chr1 ( 597) 717 129.1 2e-29
CCDS3245.2 KLHL6 gene_id:89857|Hs108|chr3 ( 621) 709 127.8 5e-29
CCDS4021.1 ENC1 gene_id:8507|Hs108|chr5 ( 589) 673 121.9 2.9e-27
CCDS82975.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 427) 670 121.4 3e-27
CCDS82974.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 496) 670 121.4 3.4e-27
CCDS54816.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 505) 670 121.4 3.5e-27
CCDS10339.1 KLHL25 gene_id:64410|Hs108|chr15 ( 589) 666 120.8 6.3e-27
CCDS43766.1 KLHL38 gene_id:340359|Hs108|chr8 ( 581) 627 114.4 5.2e-25
CCDS75163.1 KLHL8 gene_id:57563|Hs108|chr4 ( 437) 621 113.3 8e-25
CCDS77937.1 KLHL8 gene_id:57563|Hs108|chr4 ( 544) 621 113.4 9.8e-25
CCDS3617.1 KLHL8 gene_id:57563|Hs108|chr4 ( 620) 621 113.4 1.1e-24
CCDS12384.1 KLHL26 gene_id:55295|Hs108|chr19 ( 615) 609 111.4 4.3e-24
CCDS44132.1 IPP gene_id:3652|Hs108|chr1 ( 582) 585 107.5 6.2e-23
CCDS30702.1 IPP gene_id:3652|Hs108|chr1 ( 584) 585 107.5 6.2e-23
CCDS76909.1 KLHL36 gene_id:79786|Hs108|chr16 ( 553) 582 107.0 8.3e-23
CCDS58958.1 ENC1 gene_id:8507|Hs108|chr5 ( 516) 561 103.5 8.5e-22
CCDS44685.2 KLHL35 gene_id:283212|Hs108|chr11 ( 583) 550 101.8 3.3e-21
>>CCDS9445.1 KLHL1 gene_id:57626|Hs108|chr13 (748 aa)
initn: 5101 init1: 5101 opt: 5101 Z-score: 4522.8 bits: 847.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5101; 100.0% identity (100.0% similar) in 748 aa overlap (1-748:1-748)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSGSGRKDFDVKHILRLRWKLFSHPSPSTGGPAGGGCLQQDGSGSFEHWGPSQSRLLKSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 MSGSGRKDFDVKHILRLRWKLFSHPSPSTGGPAGGGCLQQDGSGSFEHWGPSQSRLLKSQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD ERSGVSTFWKKPSSSSSSSSSPSSSSSSFNPLNGTLLPVATRLQQGAPGQGTQQPARTLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 ERSGVSTFWKKPSSSSSSSSSPSSSSSSFNPLNGTLLPVATRLQQGAPGQGTQQPARTLF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 YVESLEEEVVPGMDFPGPHEKGLVLQELKVEPDNSSQATGEGCGHRLSSTGHSMTPQSDL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 DSSSSEEFYQAVHHAEQTFRKMESYLKQQQLCDVILIVGNRKIPAHRLVLSSVSDYFAAM
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250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 FTSDVCEAKQEEIKMEGIDPNALWDLVQFAYTGCLELKEDTIENLLAAACLLQLPQVVEV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 CCHFLMKLLHPSNCLGIRAFADAQGCIELMKVAHSYTMENIMEVIRNQEFLLLPAEELHK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD LLASDDVNVPDEETIFHALMMWVKYDMQSRCNDLSMLLAFIRLPLLPPQILADLENHALF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 LLASDDVNVPDEETIFHALMMWVKYDMQSRCNDLSMLLAFIRLPLLPPQILADLENHALF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD KNDLECQKLILEAMKYHLLPERRTLMQSPRTKPRKSTVGTLYAVGGMDNNKGATTIEKYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 KNDLECQKLILEAMKYHLLPERRTLMQSPRTKPRKSTVGTLYAVGGMDNNKGATTIEKYD
430 440 450 460 470 480
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 LRTNLWIQAGMMNGRRLQFGVAVIDDKLFVIGGRDGLKTLNTVECYNPKTKTWTVLPPMS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 THRHGLGVTVLEGPIYAVGGHDGWSYLNTVERWDPQSQQWTFVASMSIARSTVGVAALNG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD KLYSVGGRDGSSCLSSMEYYDPHTNKWNMCAPMCKRRGGVGVATCDGFLYAVGGHDAPAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 KLYSVGGRDGSSCLSSMEYYDPHTNKWNMCAPMCKRRGGVGVATCDGFLYAVGGHDAPAS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD NHCSRLLDYVERYDPKTDTWTMVAPLSMPRDAVGVCLLGDRLYAVGGYDGQTYLNTMESY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 NHCSRLLDYVERYDPKTDTWTMVAPLSMPRDAVGVCLLGDRLYAVGGYDGQTYLNTMESY
670 680 690 700 710 720
730 740
pF1KSD DPQTNEWTQMASLNIGRAGACVVVIKQP
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 DPQTNEWTQMASLNIGRAGACVVVIKQP
730 740
>>CCDS73582.1 KLHL1 gene_id:57626|Hs108|chr13 (687 aa)
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Smith-Waterman score: 4568; 91.8% identity (91.8% similar) in 748 aa overlap (1-748:1-687)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSGSGRKDFDVKHILRLRWKLFSHPSPSTGGPAGGGCLQQDGSGSFEHWGPSQSRLLKSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MSGSGRKDFDVKHILRLRWKLFSHPSPSTGGPAGGGCLQQDGSGSFEHWGPSQSRLLKSQ
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pF1KSD ERSGVSTFWKKPSSSSSSSSSPSSSSSSFNPLNGTLLPVATRLQQGAPGQGTQQPARTLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 ERSGVSTFWKKPSSSSSSSSSPSSSSSSFNPLNGTLLPVATRLQQGAPGQGTQQPARTLF
70 80 90 100 110 120
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pF1KSD YVESLEEEVVPGMDFPGPHEKGLVLQELKVEPDNSSQATGEGCGHRLSSTGHSMTPQSDL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 YVESLEEEVVPGMDFPGPHEKGLVLQELKVEPDNSSQATGEGCGHRL-------------
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pF1KSD DSSSSEEFYQAVHHAEQTFRKMESYLKQQQLCDVILIVGNRKIPAHRLVLSSVSDYFAAM
::::::::::::
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170
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pF1KSD FTSDVCEAKQEEIKMEGIDPNALWDLVQFAYTGCLELKEDTIENLLAAACLLQLPQVVEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 FTSDVCEAKQEEIKMEGIDPNALWDLVQFAYTGCLELKEDTIENLLAAACLLQLPQVVEV
180 190 200 210 220 230
310 320 330 340 350 360
pF1KSD CCHFLMKLLHPSNCLGIRAFADAQGCIELMKVAHSYTMENIMEVIRNQEFLLLPAEELHK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 CCHFLMKLLHPSNCLGIRAFADAQGCIELMKVAHSYTMENIMEVIRNQEFLLLPAEELHK
240 250 260 270 280 290
370 380 390 400 410 420
pF1KSD LLASDDVNVPDEETIFHALMMWVKYDMQSRCNDLSMLLAFIRLPLLPPQILADLENHALF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LLASDDVNVPDEETIFHALMMWVKYDMQSRCNDLSMLLAFIRLPLLPPQILADLENHALF
300 310 320 330 340 350
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pF1KSD KNDLECQKLILEAMKYHLLPERRTLMQSPRTKPRKSTVGTLYAVGGMDNNKGATTIEKYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 KNDLECQKLILEAMKYHLLPERRTLMQSPRTKPRKSTVGTLYAVGGMDNNKGATTIEKYD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KSD THRHGLGVTVLEGPIYAVGGHDGWSYLNTVERWDPQSQQWTFVASMSIARSTVGVAALNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 THRHGLGVTVLEGPIYAVGGHDGWSYLNTVERWDPQSQQWTFVASMSIARSTVGVAALNG
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pF1KSD KLYSVGGRDGSSCLSSMEYYDPHTNKWNMCAPMCKRRGGVGVATCDGFLYAVGGHDAPAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 KLYSVGGRDGSSCLSSMEYYDPHTNKWNMCAPMCKRRGGVGVATCDGFLYAVGGHDAPAS
540 550 560 570 580 590
670 680 690 700 710 720
pF1KSD NHCSRLLDYVERYDPKTDTWTMVAPLSMPRDAVGVCLLGDRLYAVGGYDGQTYLNTMESY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 NHCSRLLDYVERYDPKTDTWTMVAPLSMPRDAVGVCLLGDRLYAVGGYDGQTYLNTMESY
600 610 620 630 640 650
730 740
pF1KSD DPQTNEWTQMASLNIGRAGACVVVIKQP
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 DPQTNEWTQMASLNIGRAGACVVVIKQP
660 670 680
>>CCDS33975.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 (709 aa)
initn: 3943 init1: 3067 opt: 3104 Z-score: 2754.6 bits: 520.3 E(32554): 4.1e-147
Smith-Waterman score: 3164; 64.1% identity (82.7% similar) in 746 aa overlap (1-746:1-708)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSGSGRKDFDVKHILRLRWKLFSHPSPSTGGPAGGGCLQQDGSGSFEHWGPSQSRLLKSQ
:::: ::.::::.::..::. :.: . : .. . . :.: : :. .:.
CCDS33 MSGS-RKEFDVKQILKIRWRWFGHQASSPNSTVDS----QQG----EFWNRGQTGA----
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KSD ERSGVSTFWKKPSSSSSSSSSPSSSSSSFNPLNGTLLPVATRLQQGAPGQGTQQPARTLF
.: : : . .: ::... :. :.:. .. :: :
CCDS33 --NGGRKFLDPCSLQLPLASIGYRRSSQLDFQNSPSWPMAST---------SEVPA---F
50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KSD YVESLEEEVVPGMDFPGPHEKGLVLQELKVEPDNSSQATGEGCGHRLSSTGHSMTPQSDL
. . . .: : : .: . : :.:: : : :....... .
CCDS33 EFTAEDCGGAHWLDRP---EVDDGTSEEENESDSSS------C--RTSNSSQTLSSCHTM
100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KSD DSSSSEEFYQAVHHAEQTFRKMESYLKQQQLCDVILIVGNRKIPAHRLVLSSVSDYFAAM
. .:.::.::..::::::.:::.::...:::::::..:.:.::::::::::::::::::
CCDS33 EPCTSDEFFQALNHAEQTFKKMENYLRHKQLCDVILVAGDRRIPAHRLVLSSVSDYFAAM
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KSD FTSDVCEAKQEEIKMEGIDPNALWDLVQFAYTGCLELKEDTIENLLAAACLLQLPQVVEV
::.:: ::.::::::::..::.::.:.:.:::: ::::::.:: ::..:::::: ::::.
CCDS33 FTNDVREARQEEIKMEGVEPNSLWSLIQYAYTGRLELKEDNIECLLSTACLLQLSQVVEA
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KSD CCHFLMKLLHPSNCLGIRAFADAQGCIELMKVAHSYTMENIMEVIRNQEFLLLPAEELHK
::.:::: ::::::::::.::::::: .: ::::.::::..:::::::::.:::: :. :
CCDS33 CCKFLMKQLHPSNCLGIRSFADAQGCTDLHKVAHNYTMEHFMEVIRNQEFVLLPASEIAK
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KSD LLASDDVNVPDEETIFHALMMWVKYDMQSRCNDLSMLLAFIRLPLLPPQILADLENHALF
::::::.:.:.::::..::. ::..:...: .::: :::.:::::: ::.:::.::..::
CCDS33 LLASDDMNIPNEETILNALLTWVRHDLEQRRKDLSKLLAYIRLPLLAPQFLADMENNVLF
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470 480
pF1KSD KNDLECQKLILEAMKYHLLPERRTLMQSPRTKPRKSTVGTLYAVGGMDNNKGATTIEKYD
..:.::::::.:::::::::::: ..:::::::::::::::.::::::..::::.:::::
CCDS33 RDDIECQKLIMEAMKYHLLPERRPMLQSPRTKPRKSTVGTLFAVGGMDSTKGATSIEKYD
390 400 410 420 430 440
490 500 510 520 530 540
pF1KSD LRTNLWIQAGMMNGRRLQFGVAVIDDKLFVIGGRDGLKTLNTVECYNPKTKTWTVLPPMS
::::.: .. ::::::::::::.::::.:.::::::::::::::::::::::.:.::::
CCDS33 LRTNMWTPVANMNGRRLQFGVAVLDDKLYVVGGRDGLKTLNTVECYNPKTKTWSVMPPMS
450 460 470 480 490 500
550 560 570 580 590 600
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::::::::.:::::.:::::::::::::::::::::..::.:::.:: :::::::.:.:
CCDS33 THRHGLGVAVLEGPMYAVGGHDGWSYLNTVERWDPQARQWNFVATMSTPRSTVGVAVLSG
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610 620 630 640 650 660
pF1KSD KLYSVGGRDGSSCLSSMEYYDPHTNKWNMCAPMCKRRGGVGVATCDGFLYAVGGHDAPAS
:::.::::::::::.:.: .:::::::..:: : ::::::::.: .:.:::.::::::::
CCDS33 KLYAVGGRDGSSCLKSVECFDPHTNKWTLCAQMSKRRGGVGVTTWNGLLYAIGGHDAPAS
570 580 590 600 610 620
670 680 690 700 710 720
pF1KSD NHCSRLLDYVERYDPKTDTWTMVAPLSMPRDAVGVCLLGDRLYAVGGYDGQTYLNTMESY
: ::: : ::::::::: :: :: .:. :::::::::::.::::::::::.::::.:.:
CCDS33 NLTSRLSDCVERYDPKTDMWTAVASMSISRDAVGVCLLGDKLYAVGGYDGQAYLNTVEAY
630 640 650 660 670 680
730 740
pF1KSD DPQTNEWTQMASLNIGRAGACVVVIKQP
:::::::::.: : .::::::::..:
CCDS33 DPQTNEWTQVAPLCLGRAGACVVTVKL
690 700
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10 20 30
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:::: ::.::::.::..::. :.: . : .
CCDS33 AYTSLVLVGCTNLCAVLFARCLDDHLVSLRMSGS-RKEFDVKQILKIRWRWFGHQASSPN
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40 50 60 70 80 90
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. . . :.: : :. .:. .: : : . .: ::...
CCDS33 STVDS----QQG----EFWNRGQTGA------NGGRKFLDPCSLQLPLASIGYRRSSQLD
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100 110 120 130 140 150
pF1KSD PLNGTLLPVATRLQQGAPGQGTQQPARTLFYVESLEEEVVPGMDFPGPHEKGLVLQELKV
:. :.:. .. :: : . . . .: : : .: .
CCDS33 FQNSPSWPMAST---------SEVPA---FEFTAEDCGGAHWLDRP---EVDDGTSEEEN
130 140 150 160
160 170 180 190 200 210
pF1KSD EPDNSSQATGEGCGHRLSSTGHSMTPQSDLDSSSSEEFYQAVHHAEQTFRKMESYLKQQQ
: :.:: : : :....... .. .:.::.::..::::::.:::.::...:
CCDS33 ESDSSS------C--RTSNSSQTLSSCHTMEPCTSDEFFQALNHAEQTFKKMENYLRHKQ
170 180 190 200 210
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pF1KSD LCDVILIVGNRKIPAHRLVLSSVSDYFAAMFTSDVCEAKQEEIKMEGIDPNALWDLVQFA
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CCDS33 LCDVILVAGDRRIPAHRLVLSSVSDYFAAMFTNDVREARQEEIKMEGVEPNSLWSLIQYA
220 230 240 250 260 270
280 290 300 310 320 330
pF1KSD YTGCLELKEDTIENLLAAACLLQLPQVVEVCCHFLMKLLHPSNCLGIRAFADAQGCIELM
::: ::::::.:: ::..:::::: ::::.::.:::: ::::::::::.::::::: .:
CCDS33 YTGRLELKEDNIECLLSTACLLQLSQVVEACCKFLMKQLHPSNCLGIRSFADAQGCTDLH
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::::.::::..:::::::::.:::: :. :::::::.:.:.::::..::. ::..:...:
CCDS33 KVAHNYTMEHFMEVIRNQEFVLLPASEIAKLLASDDMNIPNEETILNALLTWVRHDLEQR
340 350 360 370 380 390
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pF1KSD CNDLSMLLAFIRLPLLPPQILADLENHALFKNDLECQKLILEAMKYHLLPERRTLMQSPR
.::: :::.:::::: ::.:::.::..::..:.::::::.:::::::::::: ..::::
CCDS33 RKDLSKLLAYIRLPLLAPQFLADMENNVLFRDDIECQKLIMEAMKYHLLPERRPMLQSPR
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pF1KSD TKPRKSTVGTLYAVGGMDNNKGATTIEKYDLRTNLWIQAGMMNGRRLQFGVAVIDDKLFV
:::::::::::.::::::..::::.:::::::::.: .. ::::::::::::.::::.:
CCDS33 TKPRKSTVGTLFAVGGMDSTKGATSIEKYDLRTNMWTPVANMNGRRLQFGVAVLDDKLYV
460 470 480 490 500 510
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pF1KSD IGGRDGLKTLNTVECYNPKTKTWTVLPPMSTHRHGLGVTVLEGPIYAVGGHDGWSYLNTV
.::::::::::::::::::::::.:.::::::::::::.:::::.:::::::::::::::
CCDS33 VGGRDGLKTLNTVECYNPKTKTWSVMPPMSTHRHGLGVAVLEGPMYAVGGHDGWSYLNTV
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pF1KSD ERWDPQSQQWTFVASMSIARSTVGVAALNGKLYSVGGRDGSSCLSSMEYYDPHTNKWNMC
::::::..::.:::.:: :::::::.:.::::.::::::::::.:.: .:::::::..:
CCDS33 ERWDPQARQWNFVATMSTPRSTVGVAVLSGKLYAVGGRDGSSCLKSVECFDPHTNKWTLC
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pF1KSD APMCKRRGGVGVATCDGFLYAVGGHDAPASNHCSRLLDYVERYDPKTDTWTMVAPLSMPR
: : ::::::::.: .:.:::.::::::::: ::: : ::::::::: :: :: .:. :
CCDS33 AQMSKRRGGVGVTTWNGLLYAIGGHDAPASNLTSRLSDCVERYDPKTDMWTAVASMSISR
640 650 660 670 680 690
700 710 720 730 740
pF1KSD DAVGVCLLGDRLYAVGGYDGQTYLNTMESYDPQTNEWTQMASLNIGRAGACVVVIKQP
::::::::::.::::::::::.::::.:.::::::::::.: : .::::::::..:
CCDS33 DAVGVCLLGDKLYAVGGYDGQAYLNTVEAYDPQTNEWTQVAPLCLGRAGACVVTVKL
700 710 720 730 740 750
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.. .:.::.::..::::::.:::.::...
CCDS54 MEPCTSDEFFQALNHAEQTFKKMENYLRHK
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210 220 230 240 250 260
pF1KSD QLCDVILIVGNRKIPAHRLVLSSVSDYFAAMFTSDVCEAKQEEIKMEGIDPNALWDLVQF
:::::::..:.:.::::::::::::::::::::.:: ::.::::::::..::.::.:.:.
CCDS54 QLCDVILVAGDRRIPAHRLVLSSVSDYFAAMFTNDVREARQEEIKMEGVEPNSLWSLIQY
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:::: ::::::.:: ::..:::::: ::::.::.:::: ::::::::::.::::::: .:
CCDS54 AYTGRLELKEDNIECLLSTACLLQLSQVVEACCKFLMKQLHPSNCLGIRSFADAQGCTDL
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CCDS54 HKVAHNYTMEHFMEVIRNQEFVLLPASEIAKLLASDDMNIPNEETILNALLTWVRHDLEQ
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: .::: :::.:::::: ::.:::.::..::..:.::::::.:::::::::::: ..:::
CCDS54 RRKDLSKLLAYIRLPLLAPQFLADMENNVLFRDDIECQKLIMEAMKYHLLPERRPMLQSP
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::::::::::::.::::::..::::.:::::::::.: .. ::::::::::::.::::.
CCDS54 RTKPRKSTVGTLFAVGGMDSTKGATSIEKYDLRTNMWTPVANMNGRRLQFGVAVLDDKLY
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:.::::::::::::::::::::::.:.::::::::::::.:::::.::::::::::::::
CCDS54 VVGGRDGLKTLNTVECYNPKTKTWSVMPPMSTHRHGLGVAVLEGPMYAVGGHDGWSYLNT
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:::::::..::.:::.:: :::::::.:.::::.::::::::::.:.: .:::::::..
CCDS54 VERWDPQARQWNFVATMSTPRSTVGVAVLSGKLYAVGGRDGSSCLKSVECFDPHTNKWTL
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:: : ::::::::.: .:.:::.::::::::: ::: : ::::::::: :: :: .:.
CCDS54 CAQMSKRRGGVGVTTWNGLLYAIGGHDAPASNLTSRLSDCVERYDPKTDMWTAVASMSIS
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pF1KSD RDAVGVCLLGDRLYAVGGYDGQTYLNTMESYDPQTNEWTQMASLNIGRAGACVVVIKQP
:::::::::::.::::::::::.::::.:.::::::::::.: : .::::::::..:
CCDS54 RDAVGVCLLGDKLYAVGGYDGQAYLNTVEAYDPQTNEWTQVAPLCLGRAGACVVTVKL
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10 20 30 40 50
pF1KSD MSGSGRKDFDVKHILRLRWKLFSHPSPSTGGPAGGGCLQQDGSGSFEHWG-PSQSRLLK-
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CCDS14 MSVSGKKEFDVKQILRLRWRWFSHPF--QGSTNTGSCLQQEG---YEHRGTPVQGRLKSH
10 20 30 40 50
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:..:.:. :: :.:: . . :. : : : :... :. ::
CCDS14 SRDRNGL----KK-------SNSPVHHNI-LAPVPG---P-APAHQRAV--QNLQQHNLI
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. : .. . :: . : :: :.:.. :.. : ::. : ::
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pF1KSD QSDLDSSSSEEFYQAVHHAEQTFRKMESYLKQQQLCDVILIVGNRKIPAHRLVLSSVSDY
:.... ::: .....:::::.::::.:::..:::::.::.:. .:::::::::.::::
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pF1KSD FAAMFTSDVCEAKQEEIKMEGIDPNALWDLVQFAYTGCLELKEDTIENLLAAACLLQLPQ
::::::.:: ::::::..:::.::::: .:::.:::: :.:::::::.:::::::::: :
CCDS14 FAAMFTNDVLEAKQEEVRMEGVDPNALNSLVQYAYTGVLQLKEDTIESLLAAACLLQLTQ
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pF1KSD VVEVCCHFLMKLLHPSNCLGIRAFADAQGCIELMKVAHSYTMENIMEVIRNQEFLLLPAE
:..:: .::.: ::::::::::.:.::::: ::..:::.::::...:::.:::::::::.
CCDS14 VIDVCSNFLIKQLHPSNCLGIRSFGDAQGCTELLNVAHKYTMEHFIEVIKNQEFLLLPAN
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pF1KSD ELHKLLASDDVNVPDEETIFHALMMWVKYDMQSRCNDLSMLLAFIRLPLLPPQILADLEN
:. ::: :::.:::::::::::::.:: .:.:.: ..:.:::..:::::::::.:::::.
CCDS14 EISKLLCSDDINVPDEETIFHALMQWVGHDVQNRQGELGMLLSYIRLPLLPPQLLADLET
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pF1KSD HALFKNDLECQKLILEAMKYHLLPERRTLMQSPRTKPRKSTVGTLYAVGGMDNNKGATTI
..: .:::::::..::::::::::::..::::::::::::::.:::::::: ::.:::
CCDS14 SSMFTGDLECQKLLMEAMKYHLLPERRSMMQSPRTKPRKSTVGALYAVGGMDAMKGTTTI
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pF1KSD EKYDLRTNLWIQAGMMNGRRLQFGVAVIDDKLFVIGGRDGLKTLNTVECYNPKTKTWTVL
:::::::: :.. : ::::::::::::::.::.:.::::::::::::::.:: : :::.
CCDS14 EKYDLRTNSWLHIGTMNGRRLQFGVAVIDNKLYVVGGRDGLKTLNTVECFNPVGKIWTVM
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pF1KSD PPMSTHRHGLGVTVLEGPIYAVGGHDGWSYLNTVERWDPQSQQWTFVASMSIARSTVGVA
::::::::::::..::::.::::::::::::::::::::...::..::::: ::::::.
CCDS14 PPMSTHRHGLGVATLEGPMYAVGGHDGWSYLNTVERWDPEGRQWNYVASMSTPRSTVGVV
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pF1KSD ALNGKLYSVGGRDGSSCLSSMEYYDPHTNKWNMCAPMCKRRGGVGVATCDGFLYAVGGHD
:::.:::..:::::::::.::::.:::::::..:::: :::::::::: .::::.:::::
CCDS14 ALNNKLYAIGGRDGSSCLKSMEYFDPHTNKWSLCAPMSKRRGGVGVATYNGFLYVVGGHD
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pF1KSD APASNHCSRLLDYVERYDPKTDTWTMVAPLSMPRDAVGVCLLGDRLYAVGGYDGQTYLNT
:::::::::: : ::::::: :.:. :::::.:::::.:: :::.::.::::::.:::::
CCDS14 APASNHCSRLSDCVERYDPKGDSWSTVAPLSVPRDAVAVCPLGDKLYVVGGYDGHTYLNT
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pF1KSD MESYDPQTNEWTQMASLNIGRAGACVVVIKQP
.:::: : ::: . . .:::::::::::.: :
CCDS14 VESYDAQRNEWKEEVPVNIGRAGACVVVVKLP
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pF1KSD MSGSGRKDFDVKHILRLRWKLFSHPSPSTGGPAGGGCLQQDGSGSFEHWG-PSQSRLLK-
:: ::.:.::::.::::::. :::: :. :.::::.: .:: : : :.:: .
CCDS14 MSVSGKKEFDVKQILRLRWRWFSHPFQ--GSTNTGSCLQQEG---YEHRGTPVQGRLKSH
10 20 30 40 50
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pF1KSD SQERSGVSTFWKKPSSSSSSSSSPSSSSSSFNPLNGTLLPVATRLQQGAPGQGTQQPART
:..:.:. :: :.:: . . :. : :. .. :... :. ::
CCDS14 SRDRNGL----KK-------SNSPVHHNI-LAPVPG---PAPAH-QRAV--QNLQQHNLI
60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KSD L-FYVESLEEEVVPGMD-FPGPHEKGLVLQELKVEPDNSSQATGEGCGHRLSSTGHSMTP
. : .. . :: . : :: :.:.. :.. : ::. : ::
CCDS14 VHFQANEDTPKSVPEKNLFKEACEKR--AQDLEMMADDNI----EDSTARLD-TQHS---
100 110 120 130 140
180 190 200 210 220 230
pF1KSD QSDLDSSSSEEFYQAVHHAEQTFRKMESYLKQQQLCDVILIVGNRKIPAHRLVLSSVSDY
:.... ::: .....:::::.::::.:::..:::::.::.:. .:::::::::.::::
CCDS14 -EDMNATRSEEQFHVINHAEQTLRKMENYLKEKQLCDVLLIAGHLRIPAHRLVLSAVSDY
150 160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KSD FAAMFTSDVCEAKQEEIKMEGIDPNALWDLVQFAYTGCLELKEDTIENLLAAACLLQLPQ
::::::.:: ::::::..:::.::::: .:::.:::: :.:::::::.:::::::::: :
CCDS14 FAAMFTNDVLEAKQEEVRMEGVDPNALNSLVQYAYTGVLQLKEDTIESLLAAACLLQLTQ
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KSD VVEVCCHFLMKLLHPSNCLGIRAFADAQGCIELMKVAHSYTMENIMEVIRNQEFLLLPAE
:..:: .::.: ::::::::::.:.::::: ::..:::.::::...:::.:::::::::.
CCDS14 VIDVCSNFLIKQLHPSNCLGIRSFGDAQGCTELLNVAHKYTMEHFIEVIKNQEFLLLPAN
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KSD ELHKLLASDDVNVPDEETIFHALMMWVKYDMQSRCNDLSMLLAFIRLPLLPPQILADLEN
:. ::: :::.:::::::::::::.:: .:.:.: ..:.:::..:::::::::.:::::.
CCDS14 EISKLLCSDDINVPDEETIFHALMQWVGHDVQNRQGELGMLLSYIRLPLLPPQLLADLET
330 340 350 360 370 380
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pF1KSD HALFKNDLECQKLILEAMKYHLLPERRTLMQSPRTKPRKSTVGTLYAVGGMDNNKGATTI
..: .:::::::..::::::::::::..::::::::::::::.:::::::: ::.:::
CCDS14 SSMFTGDLECQKLLMEAMKYHLLPERRSMMQSPRTKPRKSTVGALYAVGGMDAMKGTTTI
390 400 410 420 430 440
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pF1KSD EKYDLRTNLWIQAGMMNGRRLQFGVAVIDDKLFVIGGRDGLKTLNTVECYNPKTKTWTVL
:::::::: :.. : ::::::::::::::.::.:.::::::::::::::.:: : :::.
CCDS14 EKYDLRTNSWLHIGTMNGRRLQFGVAVIDNKLYVVGGRDGLKTLNTVECFNPVGKIWTVM
450 460 470 480 490 500
540 550 560 570 580 590
pF1KSD PPMSTHRHGLGVTVLEGPIYAVGGHDGWSYLNTVERWDPQSQQWTFVASMSIARSTVGVA
::::::::::::..::::.::::::::::::::::::::...::..::::: ::::::.
CCDS14 PPMSTHRHGLGVATLEGPMYAVGGHDGWSYLNTVERWDPEGRQWNYVASMSTPRSTVGVV
510 520 530 540 550 560
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pF1KSD ALNGKLYSVGGRDGSSCLSSMEYYDPHTNKWNMCAPMCKRRGGVGVATCDGFLYAVGGHD
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CCDS14 ALNNKLYAIGGRDGSSCLKSMEYFDPHTNKWSLCAPMSKRRGGVGVATYNGFLYVVGGHD
570 580 590 600 610 620
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pF1KSD APASNHCSRLLDYVERYDPKTDTWTMVAPLSMPRDAVGVCLLGDRLYAVGGYDGQTYLNT
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CCDS14 APASNHCSRLSDCVERYDPKGDSWSTVAPLSVPRDAVAVCPLGDKLYVVGGYDGHTYLNT
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pF1KSD MESYDPQTNEWTQMASLNIGRAGACVVVIKQP
.:::: : ::: .
CCDS14 VESYDAQRNEWKESMQELLQNFYTTQKLKETLGH
690 700 710 720
>>CCDS3449.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 (694 aa)
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200 210 220 230 240 250
pF1KSD QTFRKMESYLKQQQLCDVILIVGNRKIPAHRLVLSSVSDYFAAMFTSDVCEAKQEEIKME
::::::::::::::::.:: ::.:::::::
CCDS34 EDCGGAHWLDRPEVDDGTSEEENESDSSSCRLVLSSVSDYFAAMFTNDVREARQEEIKME
150 160 170 180 190 200
260 270 280 290 300 310
pF1KSD GIDPNALWDLVQFAYTGCLELKEDTIENLLAAACLLQLPQVVEVCCHFLMKLLHPSNCLG
:..::.::.:.:.:::: ::::::.:: ::..:::::: ::::.::.:::: ::::::::
CCDS34 GVEPNSLWSLIQYAYTGRLELKEDNIECLLSTACLLQLSQVVEACCKFLMKQLHPSNCLG
210 220 230 240 250 260
320 330 340 350 360 370
pF1KSD IRAFADAQGCIELMKVAHSYTMENIMEVIRNQEFLLLPAEELHKLLASDDVNVPDEETIF
::.::::::: .: ::::.::::..:::::::::.:::: :. :::::::.:.:.::::.
CCDS34 IRSFADAQGCTDLHKVAHNYTMEHFMEVIRNQEFVLLPASEIAKLLASDDMNIPNEETIL
270 280 290 300 310 320
380 390 400 410 420 430
pF1KSD HALMMWVKYDMQSRCNDLSMLLAFIRLPLLPPQILADLENHALFKNDLECQKLILEAMKY
.::. ::..:...: .::: :::.:::::: ::.:::.::..::..:.::::::.:::::
CCDS34 NALLTWVRHDLEQRRKDLSKLLAYIRLPLLAPQFLADMENNVLFRDDIECQKLIMEAMKY
330 340 350 360 370 380
440 450 460 470 480 490
pF1KSD HLLPERRTLMQSPRTKPRKSTVGTLYAVGGMDNNKGATTIEKYDLRTNLWIQAGMMNGRR
::::::: ..:::::::::::::::.::::::..::::.:::::::::.: .. :::::
CCDS34 HLLPERRPMLQSPRTKPRKSTVGTLFAVGGMDSTKGATSIEKYDLRTNMWTPVANMNGRR
390 400 410 420 430 440
500 510 520 530 540 550
pF1KSD LQFGVAVIDDKLFVIGGRDGLKTLNTVECYNPKTKTWTVLPPMSTHRHGLGVTVLEGPIY
:::::::.::::.:.::::::::::::::::::::::.:.::::::::::::.:::::.:
CCDS34 LQFGVAVLDDKLYVVGGRDGLKTLNTVECYNPKTKTWSVMPPMSTHRHGLGVAVLEGPMY
450 460 470 480 490 500
560 570 580 590 600 610
pF1KSD AVGGHDGWSYLNTVERWDPQSQQWTFVASMSIARSTVGVAALNGKLYSVGGRDGSSCLSS
::::::::::::::::::::..::.:::.:: :::::::.:.::::.::::::::::.:
CCDS34 AVGGHDGWSYLNTVERWDPQARQWNFVATMSTPRSTVGVAVLSGKLYAVGGRDGSSCLKS
510 520 530 540 550 560
620 630 640 650 660 670
pF1KSD MEYYDPHTNKWNMCAPMCKRRGGVGVATCDGFLYAVGGHDAPASNHCSRLLDYVERYDPK
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CCDS34 VECFDPHTNKWTLCAQMSKRRGGVGVTTWNGLLYAIGGHDAPASNLTSRLSDCVERYDPK
570 580 590 600 610 620
680 690 700 710 720 730
pF1KSD TDTWTMVAPLSMPRDAVGVCLLGDRLYAVGGYDGQTYLNTMESYDPQTNEWTQMASLNIG
:: :: :: .:. :::::::::::.::::::::::.::::.:.::::::::::.: : .:
CCDS34 TDMWTAVASMSISRDAVGVCLLGDKLYAVGGYDGQAYLNTVEAYDPQTNEWTQVAPLCLG
630 640 650 660 670 680
740
pF1KSD RAGACVVVIKQP
:::::::..:
CCDS34 RAGACVVTVKL
690
>>CCDS1310.1 KLHL20 gene_id:27252|Hs108|chr1 (609 aa)
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160 170 180 190 200 210
pF1KSD TGEGCGHRLSSTGHSMTPQSDLDSSSSEEFYQAVHHAEQTFRKMESYLKQQQLCDVILIV
: . .: .::.. .. :...::::.:.:
CCDS13 GETGMDVTSRCTLGDPNKLPEGVPQPARMPYISDKHPRQTLEVINLLRKHRELCDVVLVV
20 30 40 50 60 70
220 230 240 250 260 270
pF1KSD GNRKIPAHRLVLSSVSDYFAAMFTSDVCEAKQEEIKMEGIDPNALWDLVQFAYTGCLELK
: .:: :::..::. : :: ::::... :..: :. .. :: :. :..::::. . ..
CCDS13 GAKKIYAHRVILSACSPYFRAMFTGELAESRQTEVVIRDIDERAMELLIDFAYTSQITVE
80 90 100 110 120 130
280 290 300 310 320 330
pF1KSD EDTIENLLAAACLLQLPQVVEVCCHFLMKLLHPSNCLGIRAFADAQGCIELMKVAHSYTM
: ....:: ::::::: .. :.::.:: . : ::::::::::::...: ::...: ..:.
CCDS13 EGNVQTLLPAACLLQLAEIQEACCEFLKRQLDPSNCLGIRAFADTHSCRELLRIADKFTQ
140 150 160 170 180 190
340 350 360 370 380 390
pF1KSD ENIMEVIRNQEFLLLPAEELHKLLASDDVNVPDEETIFHALMMWVKYDMQSRCNDLSMLL
.:..::....::.::::..: ...::..:: .:: .:.:.: ::::..: : .: ..:
CCDS13 HNFQEVMESEEFMLLPANQLIDIISSDELNVRSEEQVFNAVMAWVKYSIQERRPQLPQVL
200 210 220 230 240 250
400 410 420 430 440 450
pF1KSD AFIRLPLLPPQILAD-LENHALFKNDLECQKLILEAMKYHLLPERRTLMQSPRTKPRKST
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CCDS13 QHVRLPLLSPKFLVGTVGSDPLIKSDEECRDLVDEAKNYLLLPQERPLMQGPRTRPRKPI
260 270 280 290 300 310
460 470 480 490 500 510
pF1KSD -VG-TLYAVGGMDNNKGATTIEKYDLRTNLWIQAGMMNGRRLQFGVAVIDDKLFVIGGRD
: .:.:::: .. . ...:.:: .:: : ... :. :: ::.:.:: :...::.:
CCDS13 RCGEVLFAVGGWCSGDAISSVERYDPQTNEWRMVASMSKRRCGVGVSVLDDLLYAVGGHD
320 330 340 350 360 370
520 530 540 550 560 570
pF1KSD GLKTLNTVECYNPKTKTWTV-LPPMSTHRHGLGVTVLEGPIYAVGGHDGWSYLNTVERWD
: . ::.:: :.:::. :. . : :: : ..::.:: : .:::::.:: : :: :::.:
CCDS13 GSSYLNSVERYDPKTNQWSSDVAPTSTCRTSVGVAVLGGFLYAVGGQDGVSCLNIVERYD
380 390 400 410 420 430
580 590 600 610 620 630
pF1KSD PQSQQWTFVASMSIARSTVGVAALNGKLYSVGGRDGSSCLSSMEYYDPHTNKWNMCAPMC
:. ..:: ::::: : :.::.:.: ::.::: ::.: :...: :.:. :.:. :::
CCDS13 PKENKWTRVASMSTRRLGVAVAVLGGFLYAVGGSDGTSPLNTVERYNPQENRWHTIAPMG
440 450 460 470 480 490
640 650 660 670 680 690
pF1KSD KRRGGVGVATCDGFLYAVGGHDAPASNHCSRLLDYVERYDPKTDTWTMVAPLSMPRDAVG
:: .: :. . ..:::::.: . :. .:::.:.:. :. :. .. :..::
CCDS13 TRRKHLGCAVYQDMIYAVGGRDDTTE------LSSAERYNPRTNQWSPVVAMTSRRSGVG
500 510 520 530 540
700 710 720 730 740
pF1KSD VCLLGDRLYAVGGYDGQTYLNTMESYDPQTNEWTQMASLNIGRAGACVVVIKQP
. ... .:.::::.:: :::.:.: .::..: : ....: : :. : :::
CCDS13 LAVVNGQLMAVGGFDGTTYLKTIEVFDPDANTWRLYGGMNYRRLGGGVGVIKMTHCESHI
550 560 570 580 590 600
CCDS13 W
>>CCDS30550.1 KLHL17 gene_id:339451|Hs108|chr1 (642 aa)
initn: 2495 init1: 646 opt: 1527 Z-score: 1358.8 bits: 261.9 E(32554): 2.3e-69
Smith-Waterman score: 1540; 40.1% identity (71.2% similar) in 621 aa overlap (131-746:22-623)
110 120 130 140 150
pF1KSD TRLQQGAPGQGTQQPARTLFYVESLEEEVVPGMDFPGPHEKGLVLQEL-KVEPDNSSQAT
:: . : : : ...: .. :.
CCDS30 MQPRSERPAGRTQSPEHGSPGPGPEAPPPPPPQPPAPEAERTRPRQARPAA
10 20 30 40 50
160 170 180 190 200 210
pF1KSD G-EGCGHRLSSTGHSMTPQSDLDSSSSEEFYQAVHHAEQTFRKMESYLKQQQLCDVILIV
:: . :: :::.. .: .: ...: : . .. :::..: :
CCDS30 PMEGAVQLLSREGHSVAHNSK-------------RHYHDAFVAMSRMRQRGLLCDIVLHV
60 70 80 90
220 230 240 250 260 270
pF1KSD GNRKIPAHRLVLSSVSDYFAAMFTSDVCEAKQEEIKMEGIDPNALWDLVQFAYTGCLELK
. ..: ::..::.: : :: ::::... :..: .. .. :::.:: .:::::::. . .
CCDS30 AAKEIRAHKVVLASCSPYFHAMFTNEMSESRQTHVTLHDIDPQALDQLVQFAYTAEIVVG
100 110 120 130 140 150
280 290 300 310 320 330
pF1KSD EDTIENLLAAACLLQLPQVVEVCCHFLMKLLHPSNCLGIRAFADAQGCIELMKVAHSYTM
: ....:: :: :::: : ..::.::.. : ::::::::.::::..: .:.:.:: :..
CCDS30 EGNVQTLLPAASLLQLNGVRDACCKFLLSQLDPSNCLGIRGFADAHSCSDLLKAAHRYVL
160 170 180 190 200 210
340 350 360 370 380 390
pF1KSD ENIMEVIRNQEFLLLPAEELHKLLASDDVNVPDEETIFHALMMWVKYDMQSRCNDLSMLL
.....: ...::.::: ... .:..::..:::.:: ...:.. :::.:...: . . :.
CCDS30 QHFVDVAKTEEFMLLPLKQVLELVSSDSLNVPSEEEVYRAVLSWVKHDVDARRQHVPRLM
220 230 240 250 260 270
400 410 420 430 440 450
pF1KSD AFIRLPLLPPQ-ILADLENHALFKNDLECQKLILEAMKYHLLPERRTLMQSPRTKPRKST
.::::: . .:. .. ..: .. .:. :..::.:.:::::.: .. . ::.::.
CCDS30 KCVRLPLLSRDFLLGHVDAESLVRHHPDCKDLLIEALKFHLLPEQRGVLGTSRTRPRRCE
280 290 300 310 320 330
460 470 480 490 500 510
pF1KSD -VG-TLYAVGGMDNNKGATTIEKYDLRTNLWIQAGMMNGRRLQFGVAVIDDKLFVIGGRD
.: .:.:::: . : :: ::. : .. :. :: . :::.. ..:...:: :
CCDS30 GAGPVLFAVGGGSLFAIHGDCEAYDTRTDRWHVVASMSTRRARVGVAAVGNRLYAVGGYD
340 350 360 370 380 390
520 530 540 550 560 570
pF1KSD GLKTLNTVECYNPKTKTWTVLPPMSTHRHGLGVTVLEGPIYAVGGHDGWSYLNTVERWDP
: . : ::: :.: :.:: :.:.: :::..:.: .:..::.:: : ::..::.::
CCDS30 GTSDLATVESYDPVTNTWQPEVSMGTRRSCLGVAALHGLLYSAGGYDGASCLNSAERYDP
400 410 420 430 440 450
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pF1KSD QSQQWTFVASMSIARSTVGVAALNGKLYSVGGRDGSSCLSSMEYYDPHTNKWNMCAPMCK
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CCDS30 LTGTWTSVAAMSTRRRYVRVATLDGNLYAVGGYDSSSHLATVEKYEPQVNVWSPVASMLS
460 470 480 490 500 510
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CCDS30 RRSSAGVAVLEGALYVAGGNDGTS---C---LNSVERYSPKAGAWESVAPMNIRRSTHDL
520 530 540 550 560 570
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CCDS30 PTLSVSSTSL
640
748 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 06:28:30 2016 done: Thu Nov 3 06:28:31 2016
Total Scan time: 4.250 Total Display time: 0.230
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]