Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA1479
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1479, 1011 aa
1>>>pF1KSDA1479 1011 - 1011 aa - 1011 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.7693+/-0.00109; mu= 5.3142+/- 0.065
mean_var=172.5085+/-34.638, 0's: 0 Z-trim(109.4): 61 B-trim: 174 in 1/51
Lambda= 0.097649
statistics sampled from 10808 (10865) to 10808 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.68), E-opt: 0.2 (0.334), width: 16
Scan time: 3.460
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32224.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 (1011) 6882 982.6 0
CCDS32226.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 (1017) 6617 945.3 0
CCDS32228.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 ( 597) 3747 540.8 3e-153
CCDS32227.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 ( 998) 3746 540.8 5.2e-153
CCDS32225.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 (1073) 3742 540.3 8.2e-153
CCDS32229.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 ( 476) 3220 466.6 5.6e-131
CCDS47256.1 SEMA6A gene_id:57556|Hs108|chr5 (1030) 2434 356.0 2.3e-97
CCDS75288.1 SEMA6A gene_id:57556|Hs108|chr5 (1047) 2434 356.0 2.4e-97
CCDS984.1 SEMA6C gene_id:10500|Hs108|chr1 ( 930) 2147 315.5 3.2e-85
CCDS12131.1 SEMA6B gene_id:10501|Hs108|chr19 ( 888) 2014 296.8 1.3e-79
CCDS53364.1 SEMA6C gene_id:10500|Hs108|chr1 ( 962) 2001 295.0 5.1e-79
CCDS53363.1 SEMA6C gene_id:10500|Hs108|chr1 ( 922) 1308 197.3 1.2e-49
CCDS5599.1 SEMA3A gene_id:10371|Hs108|chr7 ( 771) 923 143.1 2.2e-33
CCDS74941.1 SEMA3B gene_id:7869|Hs108|chr3 ( 749) 879 136.9 1.6e-31
CCDS74995.1 SEMA5B gene_id:54437|Hs108|chr3 (1057) 879 136.9 2.1e-31
CCDS35491.1 SEMA5B gene_id:54437|Hs108|chr3 (1151) 879 136.9 2.3e-31
CCDS58848.1 SEMA5B gene_id:54437|Hs108|chr3 (1205) 879 137.0 2.4e-31
CCDS77744.1 SEMA3B gene_id:7869|Hs108|chr3 ( 748) 870 135.6 3.8e-31
CCDS55121.1 SEMA3E gene_id:9723|Hs108|chr7 ( 715) 859 134.0 1.1e-30
CCDS34674.1 SEMA3E gene_id:9723|Hs108|chr7 ( 775) 859 134.0 1.1e-30
CCDS3875.1 SEMA5A gene_id:9037|Hs108|chr5 (1074) 852 133.1 3e-30
CCDS47991.1 SEMA4D gene_id:10507|Hs108|chr9 ( 738) 822 128.8 4e-29
CCDS6685.1 SEMA4D gene_id:10507|Hs108|chr9 ( 862) 823 129.0 4.2e-29
CCDS82780.1 SEMA3F gene_id:6405|Hs108|chr3 ( 686) 768 121.2 7.4e-27
CCDS82779.1 SEMA3F gene_id:6405|Hs108|chr3 ( 754) 768 121.2 8e-27
CCDS2811.1 SEMA3F gene_id:6405|Hs108|chr3 ( 785) 768 121.2 8.3e-27
CCDS5596.1 SEMA3C gene_id:10512|Hs108|chr7 ( 751) 735 116.6 2e-25
CCDS77743.1 SEMA3B gene_id:7869|Hs108|chr3 ( 754) 722 114.7 7.2e-25
CCDS1132.1 SEMA4A gene_id:64218|Hs108|chr1 ( 761) 667 107.0 1.6e-22
CCDS34676.1 SEMA3D gene_id:223117|Hs108|chr7 ( 777) 656 105.4 4.6e-22
CCDS2029.1 SEMA4C gene_id:54910|Hs108|chr2 ( 833) 649 104.5 9.7e-22
CCDS2856.1 SEMA3G gene_id:56920|Hs108|chr3 ( 782) 603 98.0 8.2e-20
CCDS53378.1 SEMA4A gene_id:64218|Hs108|chr1 ( 629) 506 84.3 8.9e-16
CCDS45347.1 SEMA4B gene_id:10509|Hs108|chr15 ( 837) 483 81.1 1.1e-14
CCDS74529.1 SEMA4F gene_id:10505|Hs108|chr2 ( 737) 456 77.3 1.3e-13
CCDS77745.1 SEMA3B gene_id:7869|Hs108|chr3 ( 406) 444 75.4 2.6e-13
>>CCDS32224.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 (1011 aa)
initn: 6882 init1: 6882 opt: 6882 Z-score: 5248.1 bits: 982.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6882; 100.0% identity (100.0% similar) in 1011 aa overlap (1-1011:1-1011)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MRVFLLCAYILLLMVSQLRAVSFPEDDEPLNTVDYHYSRQYPVFRGRPSGNESQHRLDFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MRVFLLCAYILLLMVSQLRAVSFPEDDEPLNTVDYHYSRQYPVFRGRPSGNESQHRLDFQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LMLKIRDTLYIAGRDQVYTVNLNEMPKTEVIPNKKLTWRSRQQDRENCAMKGKHKDECHN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LMLKIRDTLYIAGRDQVYTVNLNEMPKTEVIPNKKLTWRSRQQDRENCAMKGKHKDECHN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD FIKVFVPRNDEMVFVCGTNAFNPMCRYYRLSTLEYDGEEISGLARCPFDARQTNVALFAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FIKVFVPRNDEMVFVCGTNAFNPMCRYYRLSTLEYDGEEISGLARCPFDARQTNVALFAD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD GKLYSATVADFLASDAVIYRSMGDGSALRTIKYDSKWIKEPHFLHAIEYGNYVYFFFREI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GKLYSATVADFLASDAVIYRSMGDGSALRTIKYDSKWIKEPHFLHAIEYGNYVYFFFREI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD AVEHNNLGKAVYSRVARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLKARLNCSVPGDSFFYFDVLQSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 AVEHNNLGKAVYSRVARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLKARLNCSVPGDSFFYFDVLQSI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD TDIIQINGIPTVVGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQKTPDSVWTAVPED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TDIIQINGIPTVVGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQKTPDSVWTAVPED
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD KVPKPRPGCCAKHGLAEAYKTSIDFPDETLSFIKSHPLMDSAVPPIADEPWFTKTRVRYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KVPKPRPGCCAKHGLAEAYKTSIDFPDETLSFIKSHPLMDSAVPPIADEPWFTKTRVRYR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD LTAISVDHSAGPYQNYTVIFVGSEAGMVLKVLAKTSPFSLNDSVLLEEIEAYNHAKCSAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LTAISVDHSAGPYQNYTVIFVGSEAGMVLKVLAKTSPFSLNDSVLLEEIEAYNHAKCSAE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD NEEDKKVISLQLDKDHHALYVAFSSCIIRIPLSRCERYGSCKKSCIASRDPYCGWLSQGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NEEDKKVISLQLDKDHHALYVAFSSCIIRIPLSRCERYGSCKKSCIASRDPYCGWLSQGS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD CGRVTPGMLLLTEDFFAFHNHSAEGYEQDTEFGNTAHLGDCHGVRWEVQSGESNQMVHMN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 CGRVTPGMLLLTEDFFAFHNHSAEGYEQDTEFGNTAHLGDCHGVRWEVQSGESNQMVHMN
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD VLITCVFAAFVLGAFIAGVAVYCYRDMFVRKNRKIHKDAESAQSCTDSSGSFAKLNGLFD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VLITCVFAAFVLGAFIAGVAVYCYRDMFVRKNRKIHKDAESAQSCTDSSGSFAKLNGLFD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD SPVKEYQQNIDSPKLYSNLLTSRKELPPNGDTKSMVMDHRGQPPELAALPTPESTPVLHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SPVKEYQQNIDSPKLYSNLLTSRKELPPNGDTKSMVMDHRGQPPELAALPTPESTPVLHQ
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD KTLQAMKSHSEKAHGHGASRKETPQFFPSSPPPHSPLSHGHIPSAIVLPNATHDYNTSFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KTLQAMKSHSEKAHGHGASRKETPQFFPSSPPPHSPLSHGHIPSAIVLPNATHDYNTSFS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD NSNAHKAEKKLQNIDHPLTKSSSKRDHRRSVDSRNTLNDLLKHLNDPNSNPKAIMGDIQM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NSNAHKAEKKLQNIDHPLTKSSSKRDHRRSVDSRNTLNDLLKHLNDPNSNPKAIMGDIQM
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD AHQNLMLDPMGSMSEVPPKVPNREASLYSPPSTLPRNSPTKRVDVPTTPGVPMTSLERQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 AHQNLMLDPMGSMSEVPPKVPNREASLYSPPSTLPRNSPTKRVDVPTTPGVPMTSLERQR
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910 920 930 940 950 960
pF1KSD GYHKNSSQRHSISAMPKNLNSPNGVLLSRQPSMNRGGYMPTPTGAKVDYIQGTPVSVHLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GYHKNSSQRHSISAMPKNLNSPNGVLLSRQPSMNRGGYMPTPTGAKVDYIQGTPVSVHLQ
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010
pF1KSD PSLSRQSSYTSNGTLPRTGLKRTPSLKPDVPPKPSFVPQTPSVRPLNKYTY
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PSLSRQSSYTSNGTLPRTGLKRTPSLKPDVPPKPSFVPQTPSVRPLNKYTY
970 980 990 1000 1010
>>CCDS32226.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 (1017 aa)
initn: 6637 init1: 3742 opt: 6617 Z-score: 5046.3 bits: 945.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6708; 96.9% identity (96.9% similar) in 1030 aa overlap (1-1011:1-1017)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MRVFLLCAYILLLMVSQLRAVSFPEDDEPLNTVDYHYSRQYPVFRGRPSGNESQHRLDFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MRVFLLCAYILLLMVSQLRAVSFPEDDEPLNTVDYHYSRQYPVFRGRPSGNESQHRLDFQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LMLKIRDTLYIAGRDQVYTVNLNEMPKTEVIPNKKLTWRSRQQDRENCAMKGKHKDECHN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LMLKIRDTLYIAGRDQVYTVNLNEMPKTEVIPNKKLTWRSRQQDRENCAMKGKHKDECHN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD FIKVFVPRNDEMVFVCGTNAFNPMCRYYRLSTLEYDGEEISGLARCPFDARQTNVALFAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FIKVFVPRNDEMVFVCGTNAFNPMCRYYRLSTLEYDGEEISGLARCPFDARQTNVALFAD
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190 200 210 220 230 240
pF1KSD GKLYSATVADFLASDAVIYRSMGDGSALRTIKYDSKWIKEPHFLHAIEYGNYVYFFFREI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GKLYSATVADFLASDAVIYRSMGDGSALRTIKYDSKWIKEPHFLHAIEYGNYVYFFFREI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD AVEHNNLGKAVYSRVARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLKARLNCSVPGDSFFYFDVLQSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 AVEHNNLGKAVYSRVARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLKARLNCSVPGDSFFYFDVLQSI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD TDIIQINGIPTVVGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQKTPDSVWTAVPED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TDIIQINGIPTVVGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQKTPDSVWTAVPED
310 320 330 340 350 360
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pF1KSD KVPKPRPGCCAKHGLAEAYKTSIDFPDETLSFIKSHPLMDSAVPPIADEPWFTKTRVRYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KVPKPRPGCCAKHGLAEAYKTSIDFPDETLSFIKSHPLMDSAVPPIADEPWFTKTRVRYR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD LTAISVDHSAGPYQNYTVIFVGSEAGMVLKVLAKTSPFSLNDSVLLEEIEAYNHAKCSAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LTAISVDHSAGPYQNYTVIFVGSEAGMVLKVLAKTSPFSLNDSVLLEEIEAYNHAKCSAE
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pF1KSD NEEDKKVISLQLDKDHHALYVAFSSCIIRIPLSRCERYGSCKKSCIASRDPYCGWLSQGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NEEDKKVISLQLDKDHHALYVAFSSCIIRIPLSRCERYGSCKKSCIASRDPYCGWLSQGS
490 500 510 520 530 540
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pF1KSD CGRVTPGMLLLTEDFFAFHNHSAEGYEQDTEFGNTAHLGDCH------------------
::::::::: ::::::::::::::::::::
CCDS32 CGRVTPGML-------------AEGYEQDTEFGNTAHLGDCHEILPTSTTPDYKIFGGPT
550 560 570 580
590 600 610 620 630 640
pF1KSD -GVRWEVQSGESNQMVHMNVLITCVFAAFVLGAFIAGVAVYCYRDMFVRKNRKIHKDAES
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SGVRWEVQSGESNQMVHMNVLITCVFAAFVLGAFIAGVAVYCYRDMFVRKNRKIHKDAES
590 600 610 620 630 640
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pF1KSD AQSCTDSSGSFAKLNGLFDSPVKEYQQNIDSPKLYSNLLTSRKELPPNGDTKSMVMDHRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 AQSCTDSSGSFAKLNGLFDSPVKEYQQNIDSPKLYSNLLTSRKELPPNGDTKSMVMDHRG
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710 720 730 740 750 760
pF1KSD QPPELAALPTPESTPVLHQKTLQAMKSHSEKAHGHGASRKETPQFFPSSPPPHSPLSHGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QPPELAALPTPESTPVLHQKTLQAMKSHSEKAHGHGASRKETPQFFPSSPPPHSPLSHGH
710 720 730 740 750 760
770 780 790 800 810 820
pF1KSD IPSAIVLPNATHDYNTSFSNSNAHKAEKKLQNIDHPLTKSSSKRDHRRSVDSRNTLNDLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 IPSAIVLPNATHDYNTSFSNSNAHKAEKKLQNIDHPLTKSSSKRDHRRSVDSRNTLNDLL
770 780 790 800 810 820
830 840 850 860 870 880
pF1KSD KHLNDPNSNPKAIMGDIQMAHQNLMLDPMGSMSEVPPKVPNREASLYSPPSTLPRNSPTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KHLNDPNSNPKAIMGDIQMAHQNLMLDPMGSMSEVPPKVPNREASLYSPPSTLPRNSPTK
830 840 850 860 870 880
890 900 910 920 930 940
pF1KSD RVDVPTTPGVPMTSLERQRGYHKNSSQRHSISAMPKNLNSPNGVLLSRQPSMNRGGYMPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RVDVPTTPGVPMTSLERQRGYHKNSSQRHSISAMPKNLNSPNGVLLSRQPSMNRGGYMPT
890 900 910 920 930 940
950 960 970 980 990 1000
pF1KSD PTGAKVDYIQGTPVSVHLQPSLSRQSSYTSNGTLPRTGLKRTPSLKPDVPPKPSFVPQTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PTGAKVDYIQGTPVSVHLQPSLSRQSSYTSNGTLPRTGLKRTPSLKPDVPPKPSFVPQTP
950 960 970 980 990 1000
1010
pF1KSD SVRPLNKYTY
::::::::::
CCDS32 SVRPLNKYTY
1010
>>CCDS32228.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 (597 aa)
initn: 3874 init1: 3742 opt: 3747 Z-score: 2864.7 bits: 540.8 E(32554): 3e-153
Smith-Waterman score: 3864; 96.0% identity (96.8% similar) in 598 aa overlap (1-598:1-583)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MRVFLLCAYILLLMVSQLRAVSFPEDDEPLNTVDYHYSRQYPVFRGRPSGNESQHRLDFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MRVFLLCAYILLLMVSQLRAVSFPEDDEPLNTVDYHYSRQYPVFRGRPSGNESQHRLDFQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LMLKIRDTLYIAGRDQVYTVNLNEMPKTEVIPNKKLTWRSRQQDRENCAMKGKHKDECHN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LMLKIRDTLYIAGRDQVYTVNLNEMPKTEVIPNKKLTWRSRQQDRENCAMKGKHKDECHN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD FIKVFVPRNDEMVFVCGTNAFNPMCRYYRLSTLEYDGEEISGLARCPFDARQTNVALFAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FIKVFVPRNDEMVFVCGTNAFNPMCRYYRLSTLEYDGEEISGLARCPFDARQTNVALFAD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD GKLYSATVADFLASDAVIYRSMGDGSALRTIKYDSKWIKEPHFLHAIEYGNYVYFFFREI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GKLYSATVADFLASDAVIYRSMGDGSALRTIKYDSKWIKEPHFLHAIEYGNYVYFFFREI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD AVEHNNLGKAVYSRVARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLKARLNCSVPGDSFFYFDVLQSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 AVEHNNLGKAVYSRVARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLKARLNCSVPGDSFFYFDVLQSI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD TDIIQINGIPTVVGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQKTPDSVWTAVPED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TDIIQINGIPTVVGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQKTPDSVWTAVPED
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370 380 390 400 410 420
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KVPKPRPGCCAKHGLAEAYKTSIDFPDETLSFIKSHPLMDSAVPPIADEPWFTKTRVRYR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LTAISVDHSAGPYQNYTVIFVGSEAGMVLKVLAKTSPFSLNDSVLLEEIEAYNHAKCSAE
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490 500 510 520 530 540
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NEEDKKVISLQLDKDHHALYVAFSSCIIRIPLSRCERYGSCKKSCIASRDPYCGWLSQGS
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::::::::: :::::::::::::::::::: . ::.:. . ::.
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610 620 630 640 650 660
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CCDS32 KSSLESPTRWST
590
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MRVFLLCAYILLLMVSQLRAVSFPEDDEPLNTVDYHYSRQYPVFRGRPSGNESQHRLDFQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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CCDS32 TDIIQINGIPTVVGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQKTPDSVWTAVPED
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CCDS32 KVPKPRPGCCAKHGLAEAYKTSIDFPDETLSFIKSHPLMDSAVPPIADEPWFTKTRVRYR
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CCDS32 LTAISVDHSAGPYQNYTVIFVGSEAGMVLKVLAKTSPFSLNDSVLLEEIEAYNHAKCSAE
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CCDS32 NEEDKKVISLQLDKDHHALYVAFSSCIIRIPLSRCERYGSCKKSCIASRDPYCGWLSQGS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KTLQAMKSHSEKAHGHGASRKETPQFFPSSPPPHSPLSHGHIPSAIVLPNATHDYNTSFS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NSNAHKAEKKLQNIDHPLTKSSSKRDHRRSVDSRNTLNDLLKHLNDPNSNPKAIMGDIQM
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PSLSRQSSYTSNGTLPRTGLKRTPSLKPDVPPKPSFVPQTPSVRPLNKYTY
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CCDS32 TDIIQINGIPTVVGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQKTPDSVWTAVPED
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KVPKPRPGCCAKHGLAEAYKTSIDFPDETLSFIKSHPLMDSAVPPIADEPWFTKTRVRYR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LTAISVDHSAGPYQNYTVIFVGSEAGMVLKVLAKTSPFSLNDSVLLEEIEAYNHAKCSAE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NEEDKKVISLQLDKDHHALYVAFSSCIIRIPLSRCERYGSCKKSCIASRDPYCGWLSQGS
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::::::::: ::::::::::::::::::::
CCDS32 CGRVTPGML-------------AEGYEQDTEFGNTAHLGDCHEILPTSTTPDYKIFGGPT
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pF1KSD ---------------------------------------------------------GVR
:::
CCDS32 SDMEVSSSSVTTMASIPEITPKVIDTWRPKLTSSRKFVVQDDPNTSDFTDPLSGIPKGVR
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590 600 610 620 630 640
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 WEVQSGESNQMVHMNVLITCVFAAFVLGAFIAGVAVYCYRDMFVRKNRKIHKDAESAQSC
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650 660 670 680 690 700
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TDSSGSFAKLNGLFDSPVKEYQQNIDSPKLYSNLLTSRKELPPNGDTKSMVMDHRGQPPE
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710 720 730 740 750 760
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LAALPTPESTPVLHQKTLQAMKSHSEKAHGHGASRKETPQFFPSSPPPHSPLSHGHIPSA
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770 780 790 800 810 820
pF1KSD IVLPNATHDYNTSFSNSNAHKAEKKLQNIDHPLTKSSSKRDHRRSVDSRNTLNDLLKHLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 IVLPNATHDYNTSFSNSNAHKAEKKLQNIDHPLTKSSSKRDHRRSVDSRNTLNDLLKHLN
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830 840 850 860 870 880
pF1KSD DPNSNPKAIMGDIQMAHQNLMLDPMGSMSEVPPKVPNREASLYSPPSTLPRNSPTKRVDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DPNSNPKAIMGDIQMAHQNLMLDPMGSMSEVPPKVPNREASLYSPPSTLPRNSPTKRVDV
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890 900 910 920 930 940
pF1KSD PTTPGVPMTSLERQRGYHKNSSQRHSISAMPKNLNSPNGVLLSRQPSMNRGGYMPTPTGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PTTPGVPMTSLERQRGYHKNSSQRHSISAMPKNLNSPNGVLLSRQPSMNRGGYMPTPTGA
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950 960 970 980 990 1000
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KVDYIQGTPVSVHLQPSLSRQSSYTSNGTLPRTGLKRTPSLKPDVPPKPSFVPQTPSVRP
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1010
pF1KSD LNKYTY
CCDS32 LNKYTY
1070
>>CCDS32229.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 (476 aa)
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CCDS32 MRVFLLCAYILLLMVSQLRAVSFPEDDEPLNTVDYHYSRQYPVFRGRPSGNESQHRLDFQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LMLKIRDTLYIAGRDQVYTVNLNEMPKTEVIPNKKLTWRSRQQDRENCAMKGKHKDECHN
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pF1KSD FIKVFVPRNDEMVFVCGTNAFNPMCRYYRLSTLEYDGEEISGLARCPFDARQTNVALFAD
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CCDS32 FIKVFVPRNDEMVFVCGTNAFNPMCRYYRLSTLEYDGEEISGLARCPFDARQTNVALFAD
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pF1KSD GKLYSATVADFLASDAVIYRSMGDGSALRTIKYDSKWIKEPHFLHAIEYGNYVYFFFREI
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CCDS32 GKLYSATVADFLASDAVIYRSMGDGSALRTIKYDSKWIKEPHFLHAIEYGNYVYFFFREI
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pF1KSD AVEHNNLGKAVYSRVARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLKARLNCSVPGDSFFYFDVLQSI
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CCDS32 AVEHNNLGKAVYSRVARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLKARLNCSVPGDSFFYFDVLQSI
250 260 270 280 290 300
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pF1KSD TDIIQINGIPTVVGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQKTPDSVWTAVPED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TDIIQINGIPTVVGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQKTPDSVWTAVPED
310 320 330 340 350 360
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pF1KSD KVPKPRPGCCAKHGLAEAYKTSIDFPDETLSFIKSHPLMDSAVPPIADEPWFTKTRVRYR
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CCDS32 KVPKPRPGCCAKHGLAEAYKTSIDFPDETLSFIKSHPLMDSAVPPIADEPWFTKTRVRYR
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pF1KSD LTAISVDHSAGPYQNYTVIFVGSEAGMVLKVLAKTSPFSLNDSVLLEEIEAYNHAKCSAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LTAISVDHSAGPYQNYTVIFVGSEAGMVLKVLAKTSPFSLNDSVLLEEIEAYNHAK
430 440 450 460 470
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pF1KSD NEEDKKVISLQLDKDHHALYVAFSSCIIRIPLSRCERYGSCKKSCIASRDPYCGWLSQGS
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10 20 30 40 50
pF1KSD MRVFLLCAYILLLMVSQLRAVSFPEDDEPLNTVDYHYSRQYPVFRG-RPSGNESQ-HRLD
:: : :. :: .. ...::::.::.. .:..::::: : .:. : .: ::::
CCDS47 MRSEALLLYFTLL---HFAGAGFPEDSEPISISHGNYTKQYPVFVGHKPGRNTTQRHRLD
10 20 30 40 50
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pF1KSD FQLMLKIRDTLYIAGRDQVYTVNLNEMPKTEVIPNKKLTWRSRQQDRENCAMKGKHKDEC
.:... . :::::.::..:::... :. .:::::.::: : ..: :::::::::
CCDS47 IQMIMIMNGTLYIAARDHIYTVDIDTSHTEEIYCSKKLTWKSRQADVDTCRMKGKHKDEC
60 70 80 90 100 110
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pF1KSD HNFIKVFVPRNDEMVFVCGTNAFNPMCRYYRLSTLEYDGEEISGLARCPFDARQTNVALF
::::::.. .::. .:::::::::: :: :...::: :.:.::.::::.::...:::::
CCDS47 HNFIKVLLKKNDDALFVCGTNAFNPSCRNYKMDTLEPFGDEFSGMARCPYDAKHANVALF
120 130 140 150 160 170
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pF1KSD ADGKLYSATVADFLASDAVIYRSMGDGSALRTIKYDSKWIKEPHFLHAIEYGNYVYFFFR
::::::::::.:::: :::::::.:.. .:::.:.::::.:::.:..:..::.:.:::::
CCDS47 ADGKLYSATVTDFLAIDAVIYRSLGESPTLRTVKHDSKWLKEPYFVQAVDYGDYIYFFFR
180 190 200 210 220 230
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pF1KSD EIAVEHNNLGKAVYSRVARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLKARLNCSVPGDSFFYFDVLQ
:::::.:..::.:. :::..::::::::::::::.::::::::::::::::: :::..::
CCDS47 EIAVEYNTMGKVVFPRVAQVCKNDMGGSQRVLEKQWTSFLKARLNCSVPGDSHFYFNILQ
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD SITDIIQINGIPTVVGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQKTPDSVWTAVP
..::.:.::: .:...:.: ::::::::::..: :: .:: :::::::.:::.:: ::
CCDS47 AVTDVIRINGRDVVLATFSTPYNSIPGSAVCAYDMLDIASVFTGRFKEQKSPDSTWTPVP
300 310 320 330 340 350
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pF1KSD EDKVPKPRPGCCAKHGLAEAYKTSIDFPDETLSFIKSHPLMDSAVPPIADEPWFTKTRVR
...:::::::::: . : : :: .:::.::.:::.::::: ::: : ..::: .: ::
CCDS47 DERVPKPRPGCCAGSSSLERYATSNEFPDDTLNFIKTHPLMDEAVPSIFNRPWFLRTMVR
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KSD YRLTAISVDHSAGPYQNYTVIFVGSEAGMVLKVLAK--TSPFSLNDSVLLEEIEAYNHAK
:::: :.:: .::::::.::.:.::: :..:: ::. .: : ::::..:::. .:: :
CCDS47 YRLTKIAVDTAAGPYQNHTVVFLGSEKGIILKFLARIGNSGF-LNDSLFLEEMSVYNSEK
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KSD CSAENEEDKKVISLQLDKDHHALYVAFSSCIIRIPLSRCERYGSCKKSCIASRDPYCGWL
:: .. :::.....:::. .::::::.:.:..::.::::.:.:::.:::::::::::.
CCDS47 CSYDGVEDKRIMGMQLDRASSSLYVAFSTCVIKVPLGRCERHGKCKKTCIASRDPYCGWI
480 490 500 510 520 530
540 550 560
pF1KSD SQG-SCGRVTPGMLLLTED----------------FFAFHNHSA--------------EG
..: .:....:. : :. : :...::. ::
CCDS47 KEGGACSHLSPNSRLTFEQDIERGNTDGLGDCHNSFVALNGHSSSLLPSTTTSDSTAQEG
540 550 560 570 580 590
570 580 590 600
pF1KSD YEQDTEFGNTAHLGDC------------H------GVRWEVQSGESNQMVHMNVLITCVF
::. . . :: : : :: : .:.: ...: :.
CCDS47 YESRGGMLDWKHLLDSPDSTDPLGAVSSHNHQDKKGVIRESYLKGHDQLVPVTLLAIAVI
600 610 620 630 640 650
610 620 630 640 650 660
pF1KSD AAFVLGAFIAGVAVYCYRDMFVRKNRKI--HKDAESAQSCTDSSGSFAKLNGLF-DSPVK
:::.:: ..:..::: : ::. . .:. : ..: : .: .::.::: :. :
CCDS47 LAFVMGAVFSGITVYCVCDHR-RKDVAVVQRKEKELTHSRRGSMSSVTKLSGLFGDTQSK
660 670 680 690 700 710
670 680 690 700 710 720
pF1KSD EYQ-QNIDSPKLYSNLLTSRKELPPNGDTKSMVMDHRGQPPELAALPTPESTPVLHQKTL
. . . : .: .... :.. : :.: .:.. . .:.:::::::::.:.::
CCDS47 DPKPEAILTPLMHNGKLAT----P--GNTAKMLIKADQHHLDLTALPTPESTPTLQQKRK
720 730 740 750 760
730 740 750 760 770
pF1KSD QAMKSHSEKAHGH--GASRKETPQFFPSSPPPHSPL--SHGHIPSAIVLPNATHDYNTSF
. :. . . . .: :. : . : :: : .::::..::: . . :. .
CCDS47 PSRGSREWERNQNLINACTKDMPPMGSPVIPTDLPLRASPSHIPSVVVLPITQQGYQHEY
770 780 790 800 810 820
780 790 800 810 820 830
pF1KSD SNSNAHKAEKKLQNIDHPLTKSSSKRDHRRSVDSRNTLNDLLKHLNDPNSNPKAIMGDIQ
. . :.... . .... . ... .::.. . :
CCDS47 VD------QPKMSEVAQMALEDQAATLEYKTIK---------EHLSSKSPN---------
830 840 850 860
840 850 860 870 880 890
pF1KSD MAHQNLMLDPMGSMSEVPPKVPNREASLYSPPSTLPRNSPTKRVDVPTTPGVPMTSLERQ
: ... . :. :::::.::::: : ..: ... .::... . . ... .
CCDS47 --HGVNLVENLDSL---PPKVPQREASLGPPGASLSQTGLSKRLEMHHSSSY---GVDYK
870 880 890 900 910
900 910 920 930 940 950
pF1KSD RGYHKNSSQR-HSISAMPKN-LNSPNGVLLSRQPSMNRGGYMPTPTGAKVDYIQGTPVSV
:.: :: : :. ... .: :: :. :::. :..:: : :. .:: :: :
CCDS47 RSYPTNSLTRSHQATTLKRNNTNSSNSSHLSRNQSFGRGDN-PPPAPQRVDSIQ-----V
920 930 940 950 960 970
960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD HL-QPS-----LSRQSSYTSNGTLPRTGLKRTPSLKPDVPPKPSFVPQTPSVRPLNKYTY
: ::: .::: : .. ..: :.::::::::::::::::::.: . :..:
CCDS47 HSSQPSGQAVTVSRQPSLNAYNSLTRSGLKRTPSLKPDVPPKPSFAPLSTSMKPNDACT
980 990 1000 1010 1020 1030
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10 20 30 40 50
pF1KSD MRVFLLCAYILLLMVSQLRAVSFPEDDEPLNTVDYHYSRQYPVFRG-RPSGNESQ-HRLD
:: : :. :: .. ...::::.::.. .:..::::: : .:. : .: ::::
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10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD FQLMLKIRDTLYIAGRDQVYTVNLNEMPKTEVIPNKKLTWRSRQQDRENCAMKGKHKDEC
.:... . :::::.::..:::... :. .:::::.::: : ..: :::::::::
CCDS75 IQMIMIMNGTLYIAARDHIYTVDIDTSHTEEIYCSKKLTWKSRQADVDTCRMKGKHKDEC
60 70 80 90 100 110
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pF1KSD HNFIKVFVPRNDEMVFVCGTNAFNPMCRYYRLSTLEYDGEEISGLARCPFDARQTNVALF
::::::.. .::. .:::::::::: :: :...::: :.:.::.::::.::...:::::
CCDS75 HNFIKVLLKKNDDALFVCGTNAFNPSCRNYKMDTLEPFGDEFSGMARCPYDAKHANVALF
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pF1KSD ADGKLYSATVADFLASDAVIYRSMGDGSALRTIKYDSKWIKEPHFLHAIEYGNYVYFFFR
::::::::::.:::: :::::::.:.. .:::.:.::::.:::.:..:..::.:.:::::
CCDS75 ADGKLYSATVTDFLAIDAVIYRSLGESPTLRTVKHDSKWLKEPYFVQAVDYGDYIYFFFR
180 190 200 210 220 230
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pF1KSD EIAVEHNNLGKAVYSRVARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLKARLNCSVPGDSFFYFDVLQ
:::::.:..::.:. :::..::::::::::::::.::::::::::::::::: :::..::
CCDS75 EIAVEYNTMGKVVFPRVAQVCKNDMGGSQRVLEKQWTSFLKARLNCSVPGDSHFYFNILQ
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pF1KSD SITDIIQINGIPTVVGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQKTPDSVWTAVP
..::.:.::: .:...:.: ::::::::::..: :: .:: :::::::.:::.:: ::
CCDS75 AVTDVIRINGRDVVLATFSTPYNSIPGSAVCAYDMLDIASVFTGRFKEQKSPDSTWTPVP
300 310 320 330 340 350
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pF1KSD EDKVPKPRPGCCAKHGLAEAYKTSIDFPDETLSFIKSHPLMDSAVPPIADEPWFTKTRVR
...:::::::::: . : : :: .:::.::.:::.::::: ::: : ..::: .: ::
CCDS75 DERVPKPRPGCCAGSSSLERYATSNEFPDDTLNFIKTHPLMDEAVPSIFNRPWFLRTMVR
360 370 380 390 400 410
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pF1KSD YRLTAISVDHSAGPYQNYTVIFVGSEAGMVLKVLAK--TSPFSLNDSVLLEEIEAYNHAK
:::: :.:: .::::::.::.:.::: :..:: ::. .: : ::::..:::. .:: :
CCDS75 YRLTKIAVDTAAGPYQNHTVVFLGSEKGIILKFLARIGNSGF-LNDSLFLEEMSVYNSEK
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pF1KSD CSAENEEDKKVISLQLDKDHHALYVAFSSCIIRIPLSRCERYGSCKKSCIASRDPYCGWL
:: .. :::.....:::. .::::::.:.:..::.::::.:.:::.:::::::::::.
CCDS75 CSYDGVEDKRIMGMQLDRASSSLYVAFSTCVIKVPLGRCERHGKCKKTCIASRDPYCGWI
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pF1KSD SQG-SCGRVTPGMLLLTED----------------FFAFHN-----------------HS
..: .:....:. : :. : :... ::
CCDS75 KEGGACSHLSPNSRLTFEQDIERGNTDGLGDCHNSFVALNDISTPLPDNEMSYNTVYGHS
540 550 560 570 580 590
570 580 590
pF1KSD A--------------EGYEQDTEFGNTAHLGDC------------H------GVRWEVQS
. ::::. . . :: : : :: :
CCDS75 SSLLPSTTTSDSTAQEGYESRGGMLDWKHLLDSPDSTDPLGAVSSHNHQDKKGVIRESYL
600 610 620 630 640 650
600 610 620 630 640
pF1KSD GESNQMVHMNVLITCVFAAFVLGAFIAGVAVYCYRDMFVRKNRKI--HKDAESAQSCTDS
.:.: ...: :. :::.:: ..:..::: : ::. . .:. : ..: :
CCDS75 KGHDQLVPVTLLAIAVILAFVMGAVFSGITVYCVCDHR-RKDVAVVQRKEKELTHSRRGS
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650 660 670 680 690 700
pF1KSD SGSFAKLNGLF-DSPVKEYQ-QNIDSPKLYSNLLTSRKELPPNGDTKSMVMDHRGQPPEL
.: .::.::: :. :. . . : .: .... :.. : :.: .:.. . .:
CCDS75 MSSVTKLSGLFGDTQSKDPKPEAILTPLMHNGKLAT----P--GNTAKMLIKADQHHLDL
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pF1KSD AALPTPESTPVLHQKTLQAMKSHSEKAHGH--GASRKETPQFFPSSPPPHSPL--SHGHI
.:::::::::.:.:: . :. . . . .: :. : . : :: : .::
CCDS75 TALPTPESTPTLQQKRKPSRGSREWERNQNLINACTKDMPPMGSPVIPTDLPLRASPSHI
770 780 790 800 810 820
770 780 790 800 810 820
pF1KSD PSAIVLPNATHDYNTSFSNSNAHKAEKKLQNIDHPLTKSSSKRDHRRSVDSRNTLNDLLK
::..::: . . :. . . . :.... . .... . ... .
CCDS75 PSVVVLPITQQGYQHEYVD------QPKMSEVAQMALEDQAATLEYKTIK---------E
830 840 850 860 870
830 840 850 860 870 880
pF1KSD HLNDPNSNPKAIMGDIQMAHQNLMLDPMGSMSEVPPKVPNREASLYSPPSTLPRNSPTKR
::.. . : : ... . :. :::::.::::: : ..: ... .::
CCDS75 HLSSKSPN-----------HGVNLVENLDSL---PPKVPQREASLGPPGASLSQTGLSKR
880 890 900 910 920
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pF1KSD VDVPTTPGVPMTSLERQRGYHKNSSQR-HSISAMPKN-LNSPNGVLLSRQPSMNRGGYMP
... . . ... .:.: :: : :. ... .: :: :. :::. :..:: :
CCDS75 LEMHHSSSY---GVDYKRSYPTNSLTRSHQATTLKRNNTNSSNSSHLSRNQSFGRGDN-P
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pF1KSD TPTGAKVDYIQGTPVSVHL-QPS-----LSRQSSYTSNGTLPRTGLKRTPSLKPDVPPKP
:. .:: :: :: ::: .::: : .. ..: :.::::::::::::::::
CCDS75 PPAPQRVDSIQ-----VHSSQPSGQAVTVSRQPSLNAYNSLTRSGLKRTPSLKPDVPPKP
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1000 1010
pF1KSD SFVPQTPSVRPLNKYTY
::.: . :..:
CCDS75 SFAPLSTSMKPNDACT
1040
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10 20 30 40 50
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CCDS98 MPRAPHFMPLLLLLLLLSLPHTQAAFPQDPLPLLISDLQGTSPLSWFRGLEDDAVAAELG
10 20 30 40 50 60
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pF1KSD LDFQLMLKIRDTLYIAGRDQVYTVNLNEMPKTE-VIPNKKLTWRSRQQDRENCAMKGKHK
:::: .: . :: .:.::.:.. .:. . : ..::: ::::: :: ::::..::
CCDS98 LDFQRFLTLNRTLLVAARDHVFSFDLQAEEEGEGLVPNKYLTWRS--QDVENCAVRGKLT
70 80 90 100 110
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pF1KSD DECHNFIKVFVPRNDEMVFVCGTNAFNPMCRYYRLSTLEYDGEEISGLARCPFDARQTNV
:::.:.:.:.:: ... ...::::.:.:.:: : ...:. .:::.:: ::::::: :.::
CCDS98 DECYNYIRVLVPWDSQTLLACGTNSFSPVCRSYGITSLQQEGEELSGQARCPFDATQSNV
120 130 140 150 160 170
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pF1KSD ALFADGKLYSATVADFLASDAVIYRSMGDGSALRTIKYDSKWIKEPHFLHAIEYGNYVYF
:.::.:.:::::.::: :::::.:::.: ::. ::::::..::::..:.:.:..:::
CCDS98 AIFAEGSLYSATAADFQASDAVVYRSLGPQPPLRSAKYDSKWLREPHFVQALEHGDHVYF
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pF1KSD FFREIAVEHNNLGKAVYSRVARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLKARLNCSVPGDSFFYFD
::::..:: ::.. .:::::.:: ::::: :.:..::::::: :::::::::: ::::
CCDS98 FFREVSVEDARLGRVQFSRVARVCKRDMGGSPRALDRHWTSFLKLRLNCSVPGDSTFYFD
240 250 260 270 280 290
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pF1KSD VLQSITDIIQINGIPTVVGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQKTPDSVWT
:::..: ....: .. :::::: ::::::::::: .:.::. :.:.::::.. :..::
CCDS98 VLQALTGPVNLHGRSALFGVFTTQTNSIPGSAVCAFYLDEIERGFEGKFKEQRSLDGAWT
300 310 320 330 340 350
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pF1KSD AVPEDKVPKPRPGCCAKHGLAEAYKTSIDFPDETLSFIKSHPLMDSAVPPIADEPWFTKT
: ::.::.:::: :: : : ...: :.::..:.:::.:::.: ::::.. .: .: :
CCDS98 PVSEDRVPSPRPGSCAGVGGAALFSSSRDLPDDVLTFIKAHPLLDPAVPPVTHQPLLTLT
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KSD RVRYRLTAISVDHSAGPYQNYTVIFVGSEAGMVLKVLAKTSPFSLNDSVLLEEIEAYNHA
: :: ..:: :::..: ::.:.::. : :::::. . . . .:::::.::. :
CCDS98 S-RALLTQVAVDGMAGPHSNITVMFLGSNDGTVLKVLTPGGRSGGPEPILLEEIDAYSPA
420 430 440 450 460 470
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pF1KSD KCSAEN--EEDKKVISLQLDKDHHALYVAFSSCIIRIPLSRCERYGSCKKSCIASRDPYC
.::.. . ...:.:.:: . : :.::::.::. .::::: :.:.:..::.::.::::
CCDS98 RCSGKRTAQTARRIIGLELDTEGHRLFVAFSGCIVYLPLSRCARHGACQRSCLASQDPYC
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KSD GWLSQGSCGRVTPGMLLLTEDFFAFHNHSAEGYEQDTEFGNTAHLGDC-HGVRWEVQSGE
:: :. .: . : : . .. .: :: :. . :: .::: .. .
CCDS98 GWHSSRGCVDIR-GSGGTDVDQAGNQESMEHGDCQDGATGSQSGPGDSAYGVRRDLPPAS
540 550 560 570 580 590
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pF1KSD SNQMVHMNVLITCVFAAFVLGAFIAGVAVYCYRDMFVRKNRKIHKDAESAQSCTDSS-GS
... : . .:.. : :::.::: ..:. : : : .:. :: :. : :
CCDS98 ASRSVPIPLLLASVAAAFALGASVSGLLVSC---ACRRAHRRRGKDIETPGLPRPLSLRS
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700
pF1KSD FAKLNGLFDSPVKEYQQN--IDSPKLYSNLLTSRKELPPNGDTKSMVMDHRGQPPELAAL
.:.:.: : ... ...:.::...: ::.: ::::: :
CCDS98 LARLHGGGPEPPPPSKDGDAVQTPQLYTTFLP-----PPEGVP----------PPELACL
660 670 680 690
710 720 730 740 750
pF1KSD PTPESTPVLHQKTLQAM-------KSHSEKAHGHGASRK------ETPQFFPSSPPPHSP
::::::: : : :.: ..... .: : :: .:. . ::: :
CCDS98 PTPESTPELPVKHLRAAGDPWEWNQNRNNAKEGPGRSRGGHAAGGPAPRVLVRPPPPGCP
700 710 720 730 740 750
760 770 780 790 800 810
pF1KSD LSHGHIPSAIVLPNATHDYNTSFSNSNAHKAEKKLQNIDHPLTKSSSKRDHRRSVDSRNT
CCDS98 GQAVEVTTLEELLRYLHGPQPPRKGAEPPAPLTSRALPPEPAPALLGGPSPRPHECASPL
760 770 780 790 800 810
>>CCDS12131.1 SEMA6B gene_id:10501|Hs108|chr19 (888 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KSD MRVFLLCAYILLLMVSQLRAVSFPEDDEPLNTVDYHYSRQYPVFRGRPSGN----
.:::... ... :::. ::... : .:::: : :
CCDS12 MQTPRASPPRPALLLLLLLLGGAHGL-FPEEPPPLSVAPRDYLNHYPVFVGSGPGRLTPA
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD ESQHRLDFQLMLKIRDTLYIAGRDQVYTVNLNEMPKTEVIPNKKLTWRSRQQDRENCAMK
:. :..: .:.. ::.:. ::..: :.:. .::. ..:::::: .: . : ::
CCDS12 EGADDLNIQRVLRVNRTLFIGDRDNLYRVELEPPTSTELRYQRKLTWRSNPSDINVCRMK
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD GKHKDECHNFIKVFVPRNDEMVFVCGTNAFNPMCRYYRLSTLEYDGEEISGLARCPFDAR
::.. ::.::.::.. :.. .::::.:::::.: : ..::. :..:::.::::.: .
CCDS12 GKQEGECRNFVKVLLLRDESTLFVCGSNAFNPVCANYSIDTLQPVGDNISGMARCPYDPK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD QTNVALFADGKLYSATVADFLASDAVIYRSMGDGSALRTIKYDSKWIKEPHFLHAIEYGN
..:::::.:: :..:::.:::: :::::::.:: .:::.:.::::.:::.:.::.:.:.
CCDS12 HANVALFSDGMLFTATVTDFLAIDAVIYRSLGDRPTLRTVKHDSKWFKEPYFVHAVEWGS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD YVYFFFREIAVEHNNLGKAVYSRVARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLKARLNCSVPGDSF
.:::::::::.: : : :.: :::::.::::.::: :::::.:::::::::::::::::
CCDS12 HVYFFFREIAMEFNYLEKVVVSRVARVCKNDVGGSPRVLEKQWTSFLKARLNCSVPGDSH
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD FYFDVLQSITDIIQINGIPTVVGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQKTPD
:::.:::..: .....: :.:..::.: :::::::::::.. .. ::.:::.:::.:.
CCDS12 FYFNVLQAVTGVVSLGGRPVVLAVFSTPSNSIPGSAVCAFDLTQVAAVFEGRFREQKSPE
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD SVWTAVPEDKVPKPRPGCCAKHGLAEAYKTSIDFPDETLSFIKSHPLMDSAVPPIADEPW
:.:: ::::.::.::::::: :. :..: .::. :.:.:.::::: ::: .. ::
CCDS12 SIWTPVPEDQVPRPRPGCCAAPGMQ--YNASSALPDDILNFVKTHPLMDEAVPSLGHAPW
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460
pF1KSD FTKTRVRYRLTAISVDHSAGPYQNYTVIFVGSEAGMVLKVL----AKTSPFSLNDSVLLE
. .: .:..:: ..:: .:::. : ::.:.::::: ::: : :.:: : . ::.::
CCDS12 ILRTLMRHQLTRVAVDVGAGPWGNQTVVFLGSEAGTVLKFLVRPNASTSGTS-GLSVFLE
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KSD EIEAYNHAKCSAEN--EEDKKVISLQLDKDHHALYVAFSSCIIRIPLSRCERYGSCKKSC
:.:.: .:. . : ....::.:: .: .:: :..:.:..::..:..: :.:
CCDS12 EFETYRPDRCGRPGGGETGQRLLSLELDAASGGLLAAFPRCVVRVPVARCQQYSGCMKNC
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KSD IASRDPYCGWLSQGSCGRVTPGMLLLTEDFFAFHNHSAEGYEQDTEFGNTAHLGDCHGVR
:.:.:::::: .::: ..:: . ..:::. ..:. :::: :.
CCDS12 IGSQDPYCGWAPDGSCIFLSPG--------------TRAAFEQDVSGASTSGLGDCTGLL
540 550 560 570 580
590 600 610 620 630 640
pF1KSD WEVQSGESNQMVHMNVLITCVFAAFVLGAFIAGVAVYCYRDMFVRKNRKIHKDAES--AQ
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CCDS12 RASLSEDRAGLVSVNLLVTSSVAAFVVGAVVSGFSVGWFVGLRERRELARRKDKEAILAH
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