Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA1445
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1445, 1151 aa
1>>>pF1KSDA1445 1151 - 1151 aa - 1151 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3312+/-0.000958; mu= 24.0115+/- 0.058
mean_var=116.1421+/-21.983, 0's: 0 Z-trim(109.8): 126 B-trim: 41 in 1/50
Lambda= 0.119009
statistics sampled from 11030 (11166) to 11030 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.693), E-opt: 0.2 (0.343), width: 16
Scan time: 4.600
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS35491.1 SEMA5B gene_id:54437|Hs108|chr3 (1151) 8212 1422.1 0
CCDS58848.1 SEMA5B gene_id:54437|Hs108|chr3 (1205) 8212 1422.1 0
CCDS74995.1 SEMA5B gene_id:54437|Hs108|chr3 (1057) 6033 1047.9 0
CCDS3875.1 SEMA5A gene_id:9037|Hs108|chr5 (1074) 4734 824.9 0
CCDS1132.1 SEMA4A gene_id:64218|Hs108|chr1 ( 761) 910 168.2 6.8e-41
CCDS32229.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 ( 476) 881 162.9 1.6e-39
CCDS32228.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 ( 597) 881 163.1 1.8e-39
CCDS32227.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 ( 998) 881 163.3 2.6e-39
CCDS32224.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 (1011) 881 163.3 2.6e-39
CCDS32226.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 (1017) 881 163.3 2.6e-39
CCDS32225.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 (1073) 881 163.4 2.7e-39
CCDS12131.1 SEMA6B gene_id:10501|Hs108|chr19 ( 888) 851 158.1 8.4e-38
CCDS47256.1 SEMA6A gene_id:57556|Hs108|chr5 (1030) 837 155.8 4.9e-37
CCDS75288.1 SEMA6A gene_id:57556|Hs108|chr5 (1047) 837 155.8 4.9e-37
CCDS984.1 SEMA6C gene_id:10500|Hs108|chr1 ( 930) 818 152.5 4.4e-36
CCDS53364.1 SEMA6C gene_id:10500|Hs108|chr1 ( 962) 818 152.5 4.5e-36
CCDS53378.1 SEMA4A gene_id:64218|Hs108|chr1 ( 629) 795 148.3 5.3e-35
CCDS2029.1 SEMA4C gene_id:54910|Hs108|chr2 ( 833) 615 117.6 1.3e-25
CCDS2811.1 SEMA3F gene_id:6405|Hs108|chr3 ( 785) 604 115.6 4.5e-25
CCDS30956.1 HMCN1 gene_id:83872|Hs108|chr1 (5635) 608 117.4 9.9e-25
CCDS82780.1 SEMA3F gene_id:6405|Hs108|chr3 ( 686) 595 114.0 1.2e-24
CCDS82779.1 SEMA3F gene_id:6405|Hs108|chr3 ( 754) 595 114.1 1.3e-24
CCDS5599.1 SEMA3A gene_id:10371|Hs108|chr7 ( 771) 589 113.1 2.7e-24
CCDS53363.1 SEMA6C gene_id:10500|Hs108|chr1 ( 922) 521 101.5 9.8e-21
CCDS72746.1 ADGRB2 gene_id:576|Hs108|chr1 (1551) 520 101.6 1.5e-20
CCDS72747.1 ADGRB2 gene_id:576|Hs108|chr1 (1584) 520 101.6 1.6e-20
CCDS45347.1 SEMA4B gene_id:10509|Hs108|chr15 ( 837) 503 98.3 7.9e-20
CCDS55121.1 SEMA3E gene_id:9723|Hs108|chr7 ( 715) 498 97.4 1.3e-19
CCDS34674.1 SEMA3E gene_id:9723|Hs108|chr7 ( 775) 498 97.4 1.4e-19
CCDS5596.1 SEMA3C gene_id:10512|Hs108|chr7 ( 751) 488 95.7 4.4e-19
CCDS4968.1 ADGRB3 gene_id:577|Hs108|chr6 (1522) 483 95.2 1.2e-18
CCDS55724.1 SEMA4G gene_id:57715|Hs108|chr10 ( 702) 474 93.3 2.2e-18
CCDS64985.1 ADGRB1 gene_id:575|Hs108|chr8 (1584) 476 94.0 2.9e-18
CCDS7501.1 SEMA4G gene_id:57715|Hs108|chr10 ( 843) 467 92.2 5.7e-18
CCDS32194.1 THBS1 gene_id:7057|Hs108|chr15 (1170) 460 91.1 1.6e-17
CCDS10262.1 SEMA7A gene_id:8482|Hs108|chr15 ( 666) 454 89.8 2.3e-17
CCDS53959.1 SEMA7A gene_id:8482|Hs108|chr15 ( 652) 452 89.4 2.9e-17
CCDS14282.1 CFP gene_id:5199|Hs108|chrX ( 469) 431 85.7 2.9e-16
CCDS34574.1 THBS2 gene_id:7058|Hs108|chr6 (1172) 430 86.0 5.8e-16
CCDS47991.1 SEMA4D gene_id:10507|Hs108|chr9 ( 738) 427 85.2 6.1e-16
CCDS6685.1 SEMA4D gene_id:10507|Hs108|chr9 ( 862) 415 83.2 2.8e-15
CCDS1955.1 SEMA4F gene_id:10505|Hs108|chr2 ( 770) 398 80.3 2e-14
CCDS2856.1 SEMA3G gene_id:56920|Hs108|chr3 ( 782) 398 80.3 2e-14
CCDS34676.1 SEMA3D gene_id:223117|Hs108|chr7 ( 777) 396 79.9 2.5e-14
CCDS74941.1 SEMA3B gene_id:7869|Hs108|chr3 ( 749) 392 79.2 4e-14
CCDS53958.1 SEMA7A gene_id:8482|Hs108|chr15 ( 501) 383 77.5 9e-14
CCDS77744.1 SEMA3B gene_id:7869|Hs108|chr3 ( 748) 382 77.5 1.3e-13
CCDS74529.1 SEMA4F gene_id:10505|Hs108|chr2 ( 737) 344 71.0 1.2e-11
CCDS3643.1 UNC5C gene_id:8633|Hs108|chr4 ( 931) 334 69.4 4.6e-11
CCDS7309.1 UNC5B gene_id:219699|Hs108|chr10 ( 945) 328 68.4 9.4e-11
>>CCDS35491.1 SEMA5B gene_id:54437|Hs108|chr3 (1151 aa)
initn: 8212 init1: 8212 opt: 8212 Z-score: 7621.2 bits: 1422.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8212; 99.7% identity (99.7% similar) in 1151 aa overlap (1-1151:1-1151)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MPCGFSPSPVAHHLVPGPPDTPAQQLRCGWTVGGWLLSLVRGLLPCLPPGARTAEGPIMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MPCGFSPSPVAHHLVPGPPDTPAQQLRCGWTVGGWLLSLVRGLLPCLPPGARTAEGPIMV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LAGPLAVSLLLPSLTLLVSHLSSSQDVSSEPSSEQQLCALSKHPTVAFEDLQPWVSNFTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 LAGPLAVSLLLPSLTLLVSHLSSSQDVSSEPSSEQQLCALSKHPTVAFEDLQPWVSNFTY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD PGARDFSQLALDPSGNQLIVGARNYLFRLSLANVSLLQATEWASSEDTRRSCQSKGKTEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 PGARDFSQLALDPSGNQLIVGARNYLFRLSLANVSLLQATEWASSEDTRRSCQSKGKTEE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD ECQNYVRVLIVAGRKVFMCGTNAFSPMCTSRQVGNLSRTTEKINGVARCPYDPRHNSTAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::
CCDS35 ECQNYVRVLIVAGRKVFMCGTNAFSPMCTSRQVGNLSRTIEKINGVARCPYDPRHNSTAV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD ISSQGELYAATVIDFSGRDPAIYRSLGSGPPLRTAQYNSKWLNEPNFVAAYDIGLFAYFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 ISSQGELYAATVIDFSGRDPAIYRSLGSGPPLRTAQYNSKWLNEPNFVAAYDIGLFAYFF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD LRENAVEHDCGRTVYSRVARVCKNDVGGRFLLEDTWTTFMKARLNCSRPGEVPFYYNELQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 LRENAVEHDCGRTVYSRVARVCKNDVGGRFLLEDTWTTFMKARLNCSRPGEVPFYYNELQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD SAFHLPEQDLIYGVFTTNVNSIAASAVCAFNLSAISQAFNGPFRYQENPRAAWLPIANPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 SAFHLPEQDLIYGVFTTNVNSIAASAVCAFNLSAISQAFNGPFRYQENPRAAWLPIANPI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD PNFQCGTLPETGPNENLTERSLQDAQRLFLMSEAVQPVTPEPCVTQDSVRFSHLVVDLVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 PNFQCGTLPETGPNENLTERSLQDAQRLFLMSEAVQPVTPEPCVTQDSVRFSHLVVDLVQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD AKDTLYHVLYIGTESGTILKALSTASRSLHGCYLEELHVLPPGRREPLRSLRILHSARAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 AKDTLYHVLYIGTESGTILKALSTASRSLHGCYLEELHVLPPGRREPLRSLRILHSARAL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD FVGLRDGVLRVPLERCAAYRSQGACLGARDPYCGWDGKQQRCSTLEDSSNMSLWTQNITA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 FVGLRDGVLRVPLERCAAYRSQGACLGARDPYCGWDGKQQRCSTLEDSSNMSLWTQNITA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD CPVRNVTRDGGFGPWSPWQPCEHLDGDNSGSCLCRARSCDSPRPRCGGLDCLGPAIHIAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 CPVRNVTRDGGFGPWSPWQPCEHLDGDNSGSCLCRARSCDSPRPRCGGLDCLGPAIHIAN
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD CSRNGAWTPWSSWALCSTSCGIGFQVRQRSCSNPAPRHGGRICVGKSREERFCNENTPCP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 CSRNGAWTPWSSWALCSTSCGIGFQVRQRSCSNPAPRHGGRICVGKSREERFCNENTPCP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD VPIFWASWGSWSKCSSNCGGGMQSRRRACENGNSCLGCGVEFKTCNPEGCPEVRRNTPWT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 VPIFWASWGSWSKCSSNCGGGMQSRRRACENGNSCLGCGVEFKTCNPEGCPEVRRNTPWT
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD PWLPVNVTQGGARQEQRFRFTCRAPLADPHGLQFGRRRTETRTCPADGSGSCDTDALVED
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 PWLPVNVTQGGARQEQRFRFTCRAPLADPHGLQFGRRRTETRTCPADGSGSCDTDALVEV
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD LLRSGSTSPHTVSGGWAAWGPWSSCSRDCELGFRVRKRTCTNPEPRNGGLPCVGDAAEYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 LLRSGSTSPHTVSGGWAAWGPWSSCSRDCELGFRVRKRTCTNPEPRNGGLPCVGDAAEYQ
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD DCNPQACPVRGAWSCWTSWSPCSASCGGGHYQRTRSCTSPAPSPGEDICLGLHTEEALCA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 DCNPQACPVRGAWSCWTSWSPCSASCGGGHYQRTRSCTSPAPSPGEDICLGLHTEEALCA
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD TQACPEGWSPWSEWSKCTDDGAQSRSRHCEELLPGSSACAGNSSQSRPCPYSEIPVILPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 TQACPEGWSPWSEWSKCTDDGAQSRSRHCEELLPGSSACAGNSSQSRPCPYSEIPVILPA
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD SSMEEATGCAGFNLIHLVATGISCFLGSGLLTLAVYLSCQHCQRQSQESTLVHPATPNHL
::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 SSMEEATDCAGFNLIHLVATGISCFLGSGLLTLAVYLSCQHCQRQSQESTLVHPATPNHL
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD HYKGGGTPKNEKYTPMEFKTLNKNNLIPDDRANFYPLQQTNVYTTTYYPSPLNKHSFRPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 HYKGGGTPKNEKYTPMEFKTLNKNNLIPDDRANFYPLQQTNVYTTTYYPSPLNKHSFRPE
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150
pF1KSD ASPGQRCFPNS
:::::::::::
CCDS35 ASPGQRCFPNS
1150
>>CCDS58848.1 SEMA5B gene_id:54437|Hs108|chr3 (1205 aa)
initn: 8212 init1: 8212 opt: 8212 Z-score: 7621.0 bits: 1422.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8212; 99.7% identity (99.7% similar) in 1151 aa overlap (1-1151:55-1205)
10 20 30
pF1KSD MPCGFSPSPVAHHLVPGPPDTPAQQLRCGW
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 FGRGHSTGTGKQKRRDRVSGSSWCLACVSWMPCGFSPSPVAHHLVPGPPDTPAQQLRCGW
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KSD TVGGWLLSLVRGLLPCLPPGARTAEGPIMVLAGPLAVSLLLPSLTLLVSHLSSSQDVSSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TVGGWLLSLVRGLLPCLPPGARTAEGPIMVLAGPLAVSLLLPSLTLLVSHLSSSQDVSSE
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KSD PSSEQQLCALSKHPTVAFEDLQPWVSNFTYPGARDFSQLALDPSGNQLIVGARNYLFRLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PSSEQQLCALSKHPTVAFEDLQPWVSNFTYPGARDFSQLALDPSGNQLIVGARNYLFRLS
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KSD LANVSLLQATEWASSEDTRRSCQSKGKTEEECQNYVRVLIVAGRKVFMCGTNAFSPMCTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LANVSLLQATEWASSEDTRRSCQSKGKTEEECQNYVRVLIVAGRKVFMCGTNAFSPMCTS
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250 260 270
pF1KSD RQVGNLSRTTEKINGVARCPYDPRHNSTAVISSQGELYAATVIDFSGRDPAIYRSLGSGP
::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RQVGNLSRTIEKINGVARCPYDPRHNSTAVISSQGELYAATVIDFSGRDPAIYRSLGSGP
270 280 290 300 310 320
280 290 300 310 320 330
pF1KSD PLRTAQYNSKWLNEPNFVAAYDIGLFAYFFLRENAVEHDCGRTVYSRVARVCKNDVGGRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PLRTAQYNSKWLNEPNFVAAYDIGLFAYFFLRENAVEHDCGRTVYSRVARVCKNDVGGRF
330 340 350 360 370 380
340 350 360 370 380 390
pF1KSD LLEDTWTTFMKARLNCSRPGEVPFYYNELQSAFHLPEQDLIYGVFTTNVNSIAASAVCAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LLEDTWTTFMKARLNCSRPGEVPFYYNELQSAFHLPEQDLIYGVFTTNVNSIAASAVCAF
390 400 410 420 430 440
400 410 420 430 440 450
pF1KSD NLSAISQAFNGPFRYQENPRAAWLPIANPIPNFQCGTLPETGPNENLTERSLQDAQRLFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NLSAISQAFNGPFRYQENPRAAWLPIANPIPNFQCGTLPETGPNENLTERSLQDAQRLFL
450 460 470 480 490 500
460 470 480 490 500 510
pF1KSD MSEAVQPVTPEPCVTQDSVRFSHLVVDLVQAKDTLYHVLYIGTESGTILKALSTASRSLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MSEAVQPVTPEPCVTQDSVRFSHLVVDLVQAKDTLYHVLYIGTESGTILKALSTASRSLH
510 520 530 540 550 560
520 530 540 550 560 570
pF1KSD GCYLEELHVLPPGRREPLRSLRILHSARALFVGLRDGVLRVPLERCAAYRSQGACLGARD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GCYLEELHVLPPGRREPLRSLRILHSARALFVGLRDGVLRVPLERCAAYRSQGACLGARD
570 580 590 600 610 620
580 590 600 610 620 630
pF1KSD PYCGWDGKQQRCSTLEDSSNMSLWTQNITACPVRNVTRDGGFGPWSPWQPCEHLDGDNSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PYCGWDGKQQRCSTLEDSSNMSLWTQNITACPVRNVTRDGGFGPWSPWQPCEHLDGDNSG
630 640 650 660 670 680
640 650 660 670 680 690
pF1KSD SCLCRARSCDSPRPRCGGLDCLGPAIHIANCSRNGAWTPWSSWALCSTSCGIGFQVRQRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SCLCRARSCDSPRPRCGGLDCLGPAIHIANCSRNGAWTPWSSWALCSTSCGIGFQVRQRS
690 700 710 720 730 740
700 710 720 730 740 750
pF1KSD CSNPAPRHGGRICVGKSREERFCNENTPCPVPIFWASWGSWSKCSSNCGGGMQSRRRACE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 CSNPAPRHGGRICVGKSREERFCNENTPCPVPIFWASWGSWSKCSSNCGGGMQSRRRACE
750 760 770 780 790 800
760 770 780 790 800 810
pF1KSD NGNSCLGCGVEFKTCNPEGCPEVRRNTPWTPWLPVNVTQGGARQEQRFRFTCRAPLADPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NGNSCLGCGVEFKTCNPEGCPEVRRNTPWTPWLPVNVTQGGARQEQRFRFTCRAPLADPH
810 820 830 840 850 860
820 830 840 850 860 870
pF1KSD GLQFGRRRTETRTCPADGSGSCDTDALVEDLLRSGSTSPHTVSGGWAAWGPWSSCSRDCE
::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GLQFGRRRTETRTCPADGSGSCDTDALVEVLLRSGSTSPHTVSGGWAAWGPWSSCSRDCE
870 880 890 900 910 920
880 890 900 910 920 930
pF1KSD LGFRVRKRTCTNPEPRNGGLPCVGDAAEYQDCNPQACPVRGAWSCWTSWSPCSASCGGGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LGFRVRKRTCTNPEPRNGGLPCVGDAAEYQDCNPQACPVRGAWSCWTSWSPCSASCGGGH
930 940 950 960 970 980
940 950 960 970 980 990
pF1KSD YQRTRSCTSPAPSPGEDICLGLHTEEALCATQACPEGWSPWSEWSKCTDDGAQSRSRHCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 YQRTRSCTSPAPSPGEDICLGLHTEEALCATQACPEGWSPWSEWSKCTDDGAQSRSRHCE
990 1000 1010 1020 1030 1040
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KSD ELLPGSSACAGNSSQSRPCPYSEIPVILPASSMEEATGCAGFNLIHLVATGISCFLGSGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::
CCDS58 ELLPGSSACAGNSSQSRPCPYSEIPVILPASSMEEATDCAGFNLIHLVATGISCFLGSGL
1050 1060 1070 1080 1090 1100
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KSD LTLAVYLSCQHCQRQSQESTLVHPATPNHLHYKGGGTPKNEKYTPMEFKTLNKNNLIPDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LTLAVYLSCQHCQRQSQESTLVHPATPNHLHYKGGGTPKNEKYTPMEFKTLNKNNLIPDD
1110 1120 1130 1140 1150 1160
1120 1130 1140 1150
pF1KSD RANFYPLQQTNVYTTTYYPSPLNKHSFRPEASPGQRCFPNS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RANFYPLQQTNVYTTTYYPSPLNKHSFRPEASPGQRCFPNS
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::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 MVLAGPLAVSLLLPSLTLLVSHLSSSQDVS
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90 100 110 120 130 140
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 SEPSSEQQLCALSKHPTVAFEDLQPWVSNFTYPGARDFSQLALDPSGNQLIVGARNYLFR
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 LSLANVSLLQATEWASSEDTRRSCQSKGKTEEECQNYVRVLIVAGRKVFMCGTNAFSPMC
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::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 TSRQVGNLSRTIEKINGVARCPYDPRHNSTAVISSQGELYAATVIDFSGRDPAIYRSLGS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 GPPLRTAQYNSKWLNEPNFVAAYDIGLFAYFFLRENAVEHDCGRTVYSRVARVCKNDVGG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 RFLLEDTWTTFMKARLNCSRPGEVPFYYNELQSAFHLPEQDLIYGVFTTNVNSIAASAVC
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 AFNLSAISQAFNGPFRYQENPRAAWLPIANPIPNFQCGTLPETGPNENLTERSLQDAQRL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 FLMSEAVQPVTPEPCVTQDSVRFSHLVVDLVQAKDTLYHVLYIGTESGTILKALSTASRS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 LHGCYLEELHVLPPGRREPLRSLRILHSARALFVGLRDGVLRVPLERCAAYRSQGACLGA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 RDPYCGWDGKQQRCSTLEDSSNMSLWTQNITACPVRNVTRDGGFGPWSPWQPCEHLDGDN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 SGSCLCRARSCDSPRPRCGGLDCLGPAIHIANCSRNGAWTPWSSWALCSTSCGIGFQVRQ
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pF1KSD RSCSNPAPRHGGRICVGKSREERFCNENTPCPVPIFWASWGSWSKCSSNCGGGMQSRRRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 RSCSNPAPRHGGRICVGKSREERFCNENTPCPVPIFWASWGSWSKCSSNCGGGMQSRRRA
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pF1KSD CENGNSCLGCGVEFKTCNPEGCPEVRRNTPWTPWLPVNVTQGGARQEQRFRFTCRAPLAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 CENGNSCLGCGVEFKTCNPEGCPEVRRNTPWTPWLPVNVTQGGARQEQRFRFTCRAPLAD
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pF1KSD PHGLQFGRRRTETRTCPADGSGSCDTDALVEDLLRSGSTSPHTVSGGWAAWGPWSSCSRD
::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 PHGLQFGRRRTETRTCPADGSGSCDTDALVEVLLRSGSTSPHTVSGGWAAWGPWSSCSRD
760 770 780 790 800 810
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 CELGFRVRKRTCTNPEPRNGGLPCVGDAAEYQDCNPQACP--------------------
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pF1KSD GHYQRTRSCTSPAPSPGEDICLGLHTEEALCATQACPEGWSPWSEWSKCTDDGAQSRSRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 ----------------GEDICLGLHTEEALCATQACPEGWSPWSEWSKCTDDGAQSRSRH
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::
CCDS74 CEELLPGSSACAGNSSQSRPCPYSEIPVILPASSMEEATDCAGFNLIHLVATGISCFLGS
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pF1KSD GLLTLAVYLSCQHCQRQSQESTLVHPATPNHLHYKGGGTPKNEKYTPMEFKTLNKNNLIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 GLLTLAVYLSCQHCQRQSQESTLVHPATPNHLHYKGGGTPKNEKYTPMEFKTLNKNNLIP
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pF1KSD DDRANFYPLQQTNVYTTTYYPSPLNKHSFRPEASPGQRCFPNS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 DDRANFYPLQQTNVYTTTYYPSPLNKHSFRPEASPGQRCFPNS
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: ..::....... ::. .: .: :::
CCDS38 MKGTCVIAWLFSSLGLWRLAHPEAQGTTQCQRTEHPVISYKEIGPWLREFRAKNAVDFS
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130 140 150 160 170 180
pF1KSD QLALDPSGNQLIVGARNYLFRLSLANVSLLQATEWASSEDTRRSCQSKGKTEEECQNYVR
::..::. ..:.::::::::::.: ..::.::.:: .: :...: ::::..::::::.:
CCDS38 QLTFDPGQKELVVGARNYLFRLQLEDLSLIQAVEWECDEATKKACYSKGKSKEECQNYIR
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pF1KSD VLIVAGRKVFMCGTNAFSPMCTSRQVGNLSRTTEKINGVARCPYDPRHNSTAVISSQGEL
::.:.: ..: ::::::.:.::.:...::.. ..:.:.:::::.:.:::::.... :::
CCDS38 VLLVGGDRLFTCGTNAFTPVCTNRSLSNLTEIHDQISGMARCPYSPQHNSTALLTAGGEL
120 130 140 150 160 170
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pF1KSD YAATVIDFSGRDPAIYRSLGSGPPLRTAQYNSKWLNEPNFVAAYDIGLFAYFFLRENAVE
::::..:: ::::::::::: :::::::::::::::::::..:::: :.:::.::::::
CCDS38 YAATAMDFPGRDPAIYRSLGILPPLRTAQYNSKWLNEPNFVSSYDIGNFTYFFFRENAVE
180 190 200 210 220 230
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pF1KSD HDCGRTVYSRVARVCKNDVGGRFLLEDTWTTFMKARLNCSRPGEVPFYYNELQSAFHLPE
::::.::.::.:::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::.: :::
CCDS38 HDCGKTVFSRAARVCKNDIGGRFLLEDTWTTFMKARLNCSRPGEVPFYYNELQSTFFLPE
240 250 260 270 280 290
370 380 390 400 410 420
pF1KSD QDLIYGVFTTNVNSIAASAVCAFNLSAISQAFNGPFRYQENPRAAWLPIANPIPNFQCGT
:::::.::::::::::::::.::::::.:::.:::.:::: :.:::: :: :.:::::
CCDS38 LDLIYGIFTTNVNSIAASAVCVFNLSAIAQAFSGPFKYQENSRSAWLPYPNPNPHFQCGT
300 310 320 330 340 350
430 440 450 460 470 480
pF1KSD LPETGPNENLTERSLQDAQRLFLMSEAVQPVTPEPCVTQDSVRFSHLVVDLVQAKDTLYH
. . : :::::.:::::...:: :.::::: : .:. ::::..::.::....: :
CCDS38 V-DQGLYVNLTERNLQDAQKFILMHEVVQPVTTVPSFMEDNSRFSHVAVDVVQGREALVH
360 370 380 390 400 410
490 500 510 520 530 540
pF1KSD VLYIGTESGTILKALSTASRSLHGCYLEELHVLPPGRREPLRSLRILHSARALFVGLRDG
..:..:. ::: :. ... .: :::....: ::::.:::.:::: .::::::.
CCDS38 IIYLATDYGTIKKVRVPLNQTSSSCLLEEIELFPERRREPIRSLQILHSQSVLFVGLREH
420 430 440 450 460 470
550 560 570 580 590 600
pF1KSD VLRVPLERCAAYRSQGACLGARDPYCGWDGKQQRCSTLEDSSNMSLWTQNITACPVRNVT
:...::.:: ::....:.::.::::::: ...:..::.: .:. : :.:.:::.::.:
CCDS38 VVKIPLKRCQFYRTRSTCIGAQDPYCGWDVVMKKCTSLEESLSMTQWEQSISACPTRNLT
480 490 500 510 520 530
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pF1KSD RDGGFGPWSPWQPCEHLDGDNSGSCLCRARSCDSPRPRCGGLDCLGPAIHIANCSRNGAW
:: :: :::: :: : ::. ::::::.:::::: :.::: .: ::...::::::::.:
CCDS38 VDGHFGVWSPWTPCTHTDGSAVGSCLCRTRSCDSPAPQCGGWQCEGPGMEIANCSRNGGW
540 550 560 570 580 590
670 680 690 700 710 720
pF1KSD TPWSSWALCSTSCGIGFQVRQRSCSNPAPRHGGRICVGKSREERFCNENTPCPVPIFWAS
:::.::. :::.:::::::::::::::.::::::.:::..::::.:::. :: .::..
CCDS38 TPWTSWSPCSTTCGIGFQVRQRSCSNPTPRHGGRVCVGQNREERYCNEHLLCPPHMFWTG
600 610 620 630 640 650
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pF1KSD WGSWSKCSSNCGGGMQSRRRACENGNSCLGCGVEFKTCNPEGCPEVRRNTPWTPWLPVNV
:: : .:...::::.:.::: :::: .: ::.::...:: . :::....:::::: :::.
CCDS38 WGPWERCTAQCGGGIQARRRICENGPDCAGCNVEYQSCNTNPCPELKKTTPWTPWTPVNI
660 670 680 690 700 710
790 800 810 820 830 840
pF1KSD TQGGARQEQRFRFTCRAPLADPHGLQFGRRRTETRTCPADGSGSCDTDALVEDLLRSGST
...:.. :::::.::.: ::::. :. ::.: : : : .::...:.::.: :.::.:
CCDS38 SDNGGHYEQRFRYTCKARLADPNLLEVGRQRIEMRYCSSDGTSGCSTDGLSGDFLRAGRY
720 730 740 750 760 770
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pF1KSD SPHTVSGGWAAWGPWSSCSRDCELGFRVRKRTCTNPEPRNGGLPCVGDAAEYQDCNPQAC
: :::.:.:.:: ::.::::: :.: :::.:.::::. ::.::.: . :::.:: :
CCDS38 SAHTVNGAWSAWTSWSQCSRDCSRGIRNRKRVCNNPEPKYGGMPCLGPSLEYQECNILPC
780 790 800 810 820 830
910 920 930 940 950 960
pF1KSD PVRGAWSCWTSWSPCSASCGGGHYQRTRSCTSPAPSPGEDICLGLHTEEALCATQACPEG
:: :.::::. :. :::.::::::.:::::..:::. : ::::::::::::: :: :::.
CCDS38 PVDGVWSCWSPWTKCSATCGGGHYMRTRSCSNPAPAYGGDICLGLHTEEALCNTQPCPES
840 850 860 870 880 890
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD WSPWSEWSKCTDDGAQSRSRHCEELLPGSSACAGNSSQSRPCPYSE--IPVILPA--SSM
:: ::.::.: .:.: :.:.: :.: .: :.::...:::: .. :: . : ::.
CCDS38 WSEWSDWSECEASGVQVRARQCILLFPMGSQCSGNTTESRPCVFDSNFIPEVSVARSSSV
900 910 920 930 940 950
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD EEATGCAGFNLIHLVATGISCFLGSGLLTLAVYLSCQHCQRQSQESTLVHPATPNHLHYK
:: :. ::..:..:.:.: . . :::: :: ::. :.::...:..::..: :. .
CCDS38 EEKR-CGEFNMFHMIAVGLSSSILGCLLTLLVYTYCQRYQQQSHDATVIHPVSPAPLNTS
960 970 980 990 1000 1010
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD -GGGTPKNEKYTPME-FKTLNKNNLIPDDRANFY-PLQQTNVYTTTYYPSPLNKHSFRPE
. : .:: .: .:..:::::: ..: ... : ..:...:. . ::..
CCDS38 ITNHINKLDKYDSVEAIKAFNKNNLILEERNKYFNPHLTGKTYSNAYF-TDLNNYDEY
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1150
pF1KSD ASPGQRCFPNS
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pF1KSD QDVSSEPSSEQQLCALSKHPTVAFEDLQPWVSNFTYPGARDFSQLALDPSGNQLIVGARN
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CCDS11 QLLLPTTTAGGGGQGPMPRVRYYAGDERRALSFFHQKGLQDFDTLLLSGDGNTLYVGARE
30 40 50 60 70 80
150 160 170 180 190
pF1KSD YLFRLSLANVS---LLQATEWASSEDTRRSCQSKGKTEE-ECQNYVRVLIVAG-RKVFMC
.. :.. . . : . : .:. . : : :..: .: :..:::. . ... :
CCDS11 AILALDIQDPGVPRLKNMIPWPASDRKKSECAFKKKSNETQCFNFIRVLVSYNVTHLYTC
90 100 110 120 130 140
200 210 220 230 240 250
pF1KSD GTNAFSPMCTSRQVGN---LSRTTEKI-NGVARCPYDPRHNSTAVISSQGELYAATVIDF
:: :::: :: .. . : . .:. .: .. :.:: :. :::. . : ::..:. .:
CCDS11 GTFAFSPACTFIELQDSYLLPISEDKVMEGKGQSPFDPAHKHTAVLVD-GMLYSGTMNNF
150 160 170 180 190 200
260 270 280 290 300 310
pF1KSD SGRDPAIYRSLGSGPPLRTAQYNSKWLN-EPNFVAAYDIGLFAYFFLRENAVEHDCGRTV
: .: ..:.::: : :.: .. .::. . .:::: .:::..:.: : : . .
CCDS11 LGSEPILMRTLGSQPVLKTDNF-LRWLHHDASFVAAIPSTQVVYFFFEETASEFDFFERL
210 220 230 240 250 260
320 330 340 350 360
pF1KSD Y-SRVARVCKNDVGGRFLLEDTWTTFMKARLNCSRPGEVPFYYNELQSAFHLPEQD----
. :::::::::::::. ::. ::::.::.: :..::..:: : .. : :: ..
CCDS11 HTSRVARVCKNDVGGEKLLQKKWTTFLKAQLLCTQPGQLPF--NVIRHAVLLPADSPTAP
270 280 290 300 310
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pF1KSD LIYGVFTTN--VNSIAASAVCAFNLSAISQAFNGPFRYQENPRAAWLPIANPIPNFQCGT
::.:::.. :.. .::::::.: : ..:.: .. .. . : .: : . :.
CCDS11 HIYAVFTSQWQVGGTRSSAVCAFSLLDIERVFKGKYKELNKETSRWTTYRGPETNPRPGS
320 330 340 350 360 370
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pF1KSD LPETGPNENLTERSLQDAQRLFLMSEAVQPVTPEPCVTQDSVRFSHLVVDLVQAKDTLYH
.::. ....: . :::.: :. : .....:....:.:. .:. : :
CCDS11 CS-VGPS---SDKALTFMKDHFLMDEQ---VVGTPLLVKSGVEYTRLAVETAQGLDGHSH
380 390 400 410 420 430
490 500 510 520 530 540
pF1KSD -VLYIGTESGTILKALSTASRSLHGCYLEELHVLPPGRREPLRSLRILHSARALFVGLRD
:.:.:: .:.. ::. ... : : .::....: ::.:.:.. . :.:::.
CCDS11 LVMYLGTTTGSLHKAVVSGDSSAH--LVEEIQLFPDP--EPVRNLQLAPTQGAVFVGFSG
440 450 460 470 480
550 560 570 580 590 600
pF1KSD GVLRVPLERCAAYRSQGACLGARDPYCGWDGKQQRCSTLEDSSNMSLWTQNITACPVRNV
:: ::: :..:.: :. ::::.:.:: ... : : .. :.. : :..
CCDS11 GVWRVPRANCSVYESCVDCVLARDPHCAWDPESRTCCLL-SAPNLNSWKQDMERGNPEWA
490 500 510 520 530 540
610 620 630 640 650 660
pF1KSD TRDGGFGPWSPWQPCEHLDGDNSGSCLCRARSCDSPRPRCGGLDCLGPAIHIANCSRNGA
CCDS11 CASGPMSRSLRPQSRPQIIKEVLAVPNSILELPCPHLSALASYYWSHGPAAVPEASSTVY
550 560 570 580 590 600
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70 80 90 100 110 120
pF1KSD VSLLLPSLTLLVSHLSSSQDVSSEPSSEQQLCALSKHPTVAF-EDLQPWVSNFTYPGARD
: .:. .:.: :: .: ... : .:.
CCDS32 MRVFLLCAYILLLMVSQLRAVSFPEDDEP-LNTVDYHYSRQ
10 20 30 40
130 140 150 160
pF1KSD FSQLALDPSGN--------QLIVGARNYLF-----RLSLANVSLLQATE--------WAS
. . :::: ::.. :. :. .. .:.. . :: : :
CCDS32 YPVFRGRPSGNESQHRLDFQLMLKIRDTLYIAGRDQVYTVNLNEMPKTEVIPNKKLTWRS
50 60 70 80 90 100
170 180 190 200 210 220
pF1KSD SEDTRRSCQSKGKTEEECQNYVRVLIVAGRK-VFMCGTNAFSPMCTSRQVGNLSRTTEKI
.. :..: ::: ..::.:...:.. . . ::.::::::.::: ....: :.:
CCDS32 RQQDRENCAMKGKHKDECHNFIKVFVPRNDEMVFVCGTNAFNPMCRYYRLSTLEYDGEEI
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]