Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA1431
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1431, 868 aa
1>>>pF1KSDA1431 868 - 868 aa - 868 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.8096+/-0.00171; mu= 11.7448+/- 0.103
mean_var=290.7040+/-55.594, 0's: 0 Z-trim(108.2): 988 B-trim: 30 in 1/48
Lambda= 0.075223
statistics sampled from 9005 (10082) to 9005 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.63), E-opt: 0.2 (0.31), width: 16
Scan time: 4.150
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12946.1 ZFP28 gene_id:140612|Hs108|chr19 ( 868) 6079 674.8 1.9e-193
CCDS33122.1 ZNF470 gene_id:388566|Hs108|chr19 ( 717) 2143 247.5 6.4e-65
CCDS12945.1 ZNF471 gene_id:57573|Hs108|chr19 ( 626) 2128 245.8 1.8e-64
CCDS77363.1 ZFP28 gene_id:140612|Hs108|chr19 ( 349) 2049 236.9 4.9e-62
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 1997 231.6 3.7e-60
CCDS32440.1 ZNF267 gene_id:10308|Hs108|chr16 ( 743) 1975 229.3 2e-59
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 1960 227.6 5.9e-59
CCDS77297.1 ZNF546 gene_id:339327|Hs108|chr19 ( 810) 1948 226.4 1.6e-58
CCDS12548.1 ZNF546 gene_id:339327|Hs108|chr19 ( 836) 1948 226.4 1.6e-58
CCDS33097.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 839) 1937 225.2 3.8e-58
CCDS54314.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 840) 1937 225.2 3.8e-58
CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 782) 1935 225.0 4.2e-58
CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 818) 1935 225.0 4.3e-58
CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 1935 225.1 5e-58
CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 1935 225.2 5.1e-58
CCDS75846.1 ZNF658 gene_id:26149|Hs108|chr9 (1059) 1904 221.8 5.2e-57
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 1891 220.2 1.1e-56
CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 527) 1886 219.4 1.3e-56
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 1888 219.8 1.4e-56
CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 686) 1886 219.6 1.5e-56
CCDS11180.1 ZNF624 gene_id:57547|Hs108|chr17 ( 865) 1845 215.3 3.9e-55
CCDS7198.1 ZNF33B gene_id:7582|Hs108|chr10 ( 778) 1841 214.8 4.9e-55
CCDS46162.1 ZNF836 gene_id:162962|Hs108|chr19 ( 936) 1837 214.4 7.4e-55
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 1832 213.7 9e-55
CCDS73089.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 699) 1831 213.6 9.8e-55
CCDS31182.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 810) 1831 213.7 1.1e-54
CCDS44372.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 811) 1831 213.7 1.1e-54
CCDS60514.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 817) 1831 213.7 1.1e-54
CCDS73088.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 829) 1831 213.7 1.1e-54
CCDS33090.1 ZNF616 gene_id:90317|Hs108|chr19 ( 781) 1826 213.1 1.5e-54
CCDS54259.1 ZNF607 gene_id:84775|Hs108|chr19 ( 695) 1819 212.3 2.4e-54
CCDS32983.1 ZNF254 gene_id:9534|Hs108|chr19 ( 659) 1817 212.1 2.7e-54
CCDS33006.1 ZNF607 gene_id:84775|Hs108|chr19 ( 696) 1814 211.8 3.5e-54
CCDS42539.1 ZNF676 gene_id:163223|Hs108|chr19 ( 588) 1811 211.3 4e-54
CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 580) 1810 211.2 4.3e-54
CCDS46097.1 ZNF283 gene_id:284349|Hs108|chr19 ( 679) 1811 211.4 4.3e-54
CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 644) 1810 211.3 4.5e-54
CCDS74387.1 ZNF283 gene_id:284349|Hs108|chr19 ( 540) 1806 210.7 5.5e-54
CCDS33093.2 ZNF28 gene_id:7576|Hs108|chr19 ( 718) 1804 210.7 7.6e-54
CCDS46045.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 ( 623) 1802 210.4 8.1e-54
CCDS46044.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 ( 624) 1802 210.4 8.1e-54
CCDS35067.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 816) 1803 210.7 8.8e-54
CCDS35066.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 852) 1803 210.7 9e-54
CCDS59136.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 854) 1803 210.7 9.1e-54
CCDS75076.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 616) 1789 209.0 2.1e-53
CCDS75075.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 648) 1789 209.0 2.2e-53
CCDS59367.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 803) 1790 209.2 2.3e-53
CCDS12413.2 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 809) 1790 209.3 2.3e-53
CCDS74321.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 818) 1790 209.3 2.3e-53
CCDS46100.1 ZNF225 gene_id:7768|Hs108|chr19 ( 706) 1777 207.8 5.7e-53
>>CCDS12946.1 ZFP28 gene_id:140612|Hs108|chr19 (868 aa)
initn: 6079 init1: 6079 opt: 6079 Z-score: 3586.6 bits: 674.8 E(32554): 1.9e-193
Smith-Waterman score: 6079; 99.9% identity (99.9% similar) in 868 aa overlap (1-868:1-868)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MRGAASASVREPTPLPGRGAPRTKPRAGRGPTVGTPATLALPARGRPRSRNGLASKGQRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MRGAASASVREPTPLPGRGAPRTKPRAGRGPTVGTPATLALPARGRPRSRNGLASKGQRG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD AAPTGPGHRALPSRDTALPQERNKKLEAVGTGIEPKAMSQGLVTFGDVAVDFSQEEWEWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 AAPTGPGHRALPSRDTALPQERNKKLEAVGTGIEPKAMSQGLVTFGDVAVDFSQEEWEWL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD NPIQRNLYRKVMLENYRNLASLGLCVSKPDVISSLEQGKEPWTVKRKMTRAWCPDLKAVW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 NPIQRNLYRKVMLENYRNLASLGLCVSKPDVISSLEQGKEPWTVKRKMTRAWCPDLKAVW
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD KIKELPLKKDFCEGKLSQAVITERLTSYNLEYSLLGEHWDYDALFETQPGLVTIKNLAVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KIKELPLKKDFCEGKLSQAVITERLTSYNLEYSLLGEHWDYDALFETQPGLVTIKNLAVD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD FRQQLHPAQKNFCKNGIWENNSDLGSAGHCVAKPDLVSLLEQEKEPWMVKRELTGSLFSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 FRQQLHPAQKNFCKNGIWENNSDLGSAGHCVAKPDLVSLLEQEKEPWMVKRELTGSLFSG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD QRSVHETQELFPKQDSYAEGVTDRTSNTKLDCSSFRENWDSDYVFGRKLAVGQETQFRQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 QRSVHETQELFPKQDSYAEGVTDRTSNTKLDCSSFRENWDSDYVFGRKLAVGQETQFRQE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD PITHNKTLSKERERTYNKSGRWSYLDDSEEKVHNRDSIKNFQKSSVVIKQTGIYAGKKLF
:::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PITHNKTLSKERERTYNKSGRWFYLDDSEEKVHNRDSIKNFQKSSVVIKQTGIYAGKKLF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD KCNECKKTFTQSSSLTVHQRIHTGEKPYKCNECGKAFSDGSSFARHQRCHTGKKPYECIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KCNECKKTFTQSSSLTVHQRIHTGEKPYKCNECGKAFSDGSSFARHQRCHTGKKPYECIE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD CGKAFIQNTSLIRHWRYYHTGEKPFDCIDCGKAFSDHIGLNQHRRIHTGEKPYKCDVCHK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 CGKAFIQNTSLIRHWRYYHTGEKPFDCIDCGKAFSDHIGLNQHRRIHTGEKPYKCDVCHK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD SFRYGSSLTVHQRIHTGEKPYECDVCRKAFSHHASLTQHQRVHSGEKPFKCKECGKAFRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SFRYGSSLTVHQRIHTGEKPYECDVCRKAFSHHASLTQHQRVHSGEKPFKCKECGKAFRQ
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD NIHLASHLRIHTGEKPFECAECGKSFSISSQLATHQRIHTGEKPYECKVCSKAFTQKAHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 NIHLASHLRIHTGEKPFECAECGKSFSISSQLATHQRIHTGEKPYECKVCSKAFTQKAHL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD AQHQKTHTGEKPYECKECGKAFSQTTHLIQHQRVHTGEKPYKCMECGKAFGDNSSCTQHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 AQHQKTHTGEKPYECKECGKAFSQTTHLIQHQRVHTGEKPYKCMECGKAFGDNSSCTQHQ
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD RLHTGQRPYECIECGKAFKTKSSLICHRRSHTGEKPYECSVCGKAFSHRQSLSVHQRIHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RLHTGQRPYECIECGKAFKTKSSLICHRRSHTGEKPYECSVCGKAFSHRQSLSVHQRIHS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD GKKPYECKECRKTFIQIGHLNQHKRVHTGERSYNYKKSRKVFRQTAHLAHHQRIHTGESS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GKKPYECKECRKTFIQIGHLNQHKRVHTGERSYNYKKSRKVFRQTAHLAHHQRIHTGESS
790 800 810 820 830 840
850 860
pF1KSD TCPSLPSTSNPVDLFPKFLWNPSSLPSP
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TCPSLPSTSNPVDLFPKFLWNPSSLPSP
850 860
>>CCDS33122.1 ZNF470 gene_id:388566|Hs108|chr19 (717 aa)
initn: 3990 init1: 2050 opt: 2143 Z-score: 1279.0 bits: 247.5 E(32554): 6.4e-65
Smith-Waterman score: 2797; 55.2% identity (75.7% similar) in 762 aa overlap (84-840:5-704)
60 70 80 90 100 110
pF1KSD ASKGQRGAAPTGPGHRALPSRDTALPQERNKKLEAVGTGIEPKAMSQGLVTFGDVAVDFS
...:..: . :::: : ::: :::.:::
CCDS33 MKSQEEVEVAGIKLC-KAMSLGSVTFTDVAIDFS
10 20 30
120 130 140 150 160 170
pF1KSD QEEWEWLNPIQRNLYRKVMLENYRNLASLGLCVSKPDVISSLEQGKEPWTVKRKMTRAWC
:.:::::: ::.::.::::::::::.:.:::.::::::: ::: :.::..: :.:. :
CCDS33 QDEWEWLNLAQRSLYKKVMLENYRNLVSVGLCISKPDVISLLEQEKDPWVIKGGMNRGLC
40 50 60 70 80 90
180 190 200 210 220 230
pF1KSD PDLKAVWKIKELPLKKDFCEGKLSQAVITERLTSYNLEYSLLGEHWDYDALFETQPGLVT
:::. :: : : :..:. : :: :.: ::: ::.:: : ::..: . ::: . ::
CCDS33 PDLECVWVTKSLSLNQDIYEEKLPPAIIMERLKSYDLECSTLGKNWKCEDLFERE--LV-
100 110 120 130 140 150
240 250 260 270 280 290
pF1KSD IKNLAVDFRQQLHPAQKNFCKNGIWENNSDLGSAGHCVAKPDLVSLLEQEKEPWMVKREL
: . :::. .. .. :.: :.. : . .: ..: : : .: .
CCDS33 --NQKTHFRQETITHIDTLIEKRDHSNKS--GTVFHL----NTLSYIKQ-IFP-MEERIF
160 170 180 190 200
300 310 320 330 340 350
pF1KSD TGSLFSGQRSVHETQELFPKQDSYAEGVTDRTSNTKLDCSSFRENWDSDYVFGR--KLAV
.. . ..:. .:. . :. . :: . : :. : . .:.. :..
CCDS33 --NFHTDKKSL-KTHSVVKKHKQ------DRGEKKLLKCN------DCEKIFSKISTLTL
210 220 230 240
360 370 380 390 400
pF1KSD GQETQFRQEP---ITHNKTLSKERERTYNKSGRWSYLDDSEEKVHNRDSIKNFQKSSVVI
:. . ..: : .:..:. . . .. . .:. . . : :.... ..
CCDS33 HQRIHTGEKPYECIECGKAFSQSAHLAQHQR-----IHTGEKPFECTECGKAFSQNAHLV
250 260 270 280 290 300
410 420 430 440 450 460
pF1KSD KQTGIYAGKKLFKCNECKKTFTQSSSLTVHQRIHTGEKPYKCNECGKAFSDGSSFARHQR
.. ...:.: ..:..:.:.:.: . :. :::.:::::::.: :::::::: ::.:.:.:
CCDS33 QHQRVHTGEKPYQCKQCNKAFSQLAHLAQHQRVHTGEKPYECIECGKAFSDCSSLAHHRR
310 320 330 340 350 360
470 480 490 500 510 520
pF1KSD CHTGKKPYECIECGKAFIQNTSLIRHWRYYHTGEKPFDCIDCGKAFSDHIGLNQHRRIHT
::::.:::::.::::: ::.::::: :::::::::::::::::::.::::: ::.: ::
CCDS33 IHTGKRPYECIDCGKAFRQNASLIRHRRYYHTGEKPFDCIDCGKAFTDHIGLIQHKRTHT
370 380 390 400 410 420
530 540 550 560 570 580
pF1KSD GEKPYKCDVCHKSFRYGSSLTVHQRIHTGEKPYECDVCRKAFSHHASLTQHQRVHSGEKP
::.::::.:: :.: .:::::::::::::::::::..:.:::::..::: :::::.::::
CCDS33 GERPYKCNVCGKAFSHGSSLTVHQRIHTGEKPYECNICEKAFSHRGSLTLHQRVHTGEKP
430 440 450 460 470 480
590 600 610 620 630 640
pF1KSD FKCKECGKAFRQNIHLASHLRIHTGEKPFECAECGKSFSISSQLATHQRIHTGEKPYECK
..::::::::::. ::: : ::::::::::::::
CCDS33 YECKECGKAFRQSTHLA-H---------------------------HQRIHTGEKPYECK
490 500 510
650 660 670 680 690 700
pF1KSD VCSKAFTQKAHLAQHQKTHTGEKPYECKECGKAFSQTTHLIQHQRVHTGEKPYKCMECGK
:::.:.:.:::::::: :::::::::::::::::: .::.::::::::::::.:.::::
CCDS33 ECSKTFSQNAHLAQHQKIHTGEKPYECKECGKAFSQIAHLVQHQRVHTGEKPYECIECGK
520 530 540 550 560 570
710 720 730 740 750 760
pF1KSD AFGDNSSCTQHQRLHTGQRPYECIECGKAFKTKSSLICHRRSHTGEKPYECSVCGKAFSH
::.:.: .::::::.:.:::::.::::::. ..:::::.: :::::::::.::::::::
CCDS33 AFSDGSYLVQHQRLHSGKRPYECLECGKAFRQRASLICHQRCHTGEKPYECNVCGKAFSH
580 590 600 610 620 630
770 780 790 800 810 820
pF1KSD RQSLSVHQRIHSGKKPYECKECRKTFIQIGHLNQHKRVHTGERSYNYKKSRKVFRQTAHL
:.::..:::::.:.:::::::: :.: :..::. :::.::::: :. :. :.:::..::
CCDS33 RKSLTLHQRIHTGEKPYECKECSKAFSQVAHLTLHKRIHTGERPYECKECGKAFRQSVHL
640 650 660 670 680 690
830 840 850 860
pF1KSD AHHQRIHTGESSTCPSLPSTSNPVDLFPKFLWNPSSLPSP
::::::::::::
CCDS33 AHHQRIHTGESSVILSSALPYHQVL
700 710
>>CCDS12945.1 ZNF471 gene_id:57573|Hs108|chr19 (626 aa)
initn: 2082 init1: 2082 opt: 2128 Z-score: 1270.8 bits: 245.8 E(32554): 1.8e-64
Smith-Waterman score: 2526; 57.3% identity (75.9% similar) in 663 aa overlap (96-756:7-626)
70 80 90 100 110 120
pF1KSD PGHRALPSRDTALPQERNKKLEAVGTGIEPKAMSQGLVTFGDVAVDFSQEEWEWLNPIQR
:.: : :::: :::.:::::::.:.:: :.
CCDS12 MNVEVVKVMPQDLVTFKDVAIDFSQEEWQWMNPAQK
10 20 30
130 140 150 160 170 180
pF1KSD NLYRKVMLENYRNLASLGLCVSKPDVISSLEQGKEPWTVKRKMTRAWCPDLKAVWKIKEL
:::..:::::..:.:::::.::: ::: ::::.::: . .:::. : .... .::
CCDS12 RLYRSMMLENYQSLVSLGLCISKPYVISLLEQGREPWEMTSEMTRSPFSDWESIYVTQEL
40 50 60 70 80 90
190 200 210 220 230 240
pF1KSD PLKKDFCEGKLSQAVITERLTSYNLEYSLLGEHWDYDALFETQPGLVTIKNLAVDFRQQL
:::. : . . . : .:::.:: : . :.: .. ::: : : . . ....
CCDS12 PLKQ-F----MYDDACMEGITSYGLECSTFEENWKWEDLFEKQMGSHEMFS-----KKEI
100 110 120 130 140
250 260 270 280 290 300
pF1KSD HPAQKNFCKNGIWENNSDLGSAGHCVAKPDLVSLLEQEKEPWMVKRELT-GSLFSGQRSV
.... : :.. . :.:. : .. :. . :. .. .:. ...:
CCDS12 ITHKETITK----ETEFKYTKFGKCI---HLENIEESIYNHTSDKKSFSKNSMVIKHKKV
150 160 170 180 190
310 320 330 340 350 360
pF1KSD HETQELFPKQDSYAEGVTDRTSNTKLDCSSFR-ENWDSDYVFGRKLAVGQETQFRQEPIT
. ..:: : . . : .: : :: .. .. :. . :. . ::.
CCDS12 YVGKKLF-KCNECDKTFTHSSSLT----VHFRIHTGEKPYACEE---CGKAFKQRQHLAQ
200 210 220 230 240 250
370 380 390 400 410 420
pF1KSD HNKTLSKERERTYNKSGRWSYLDDSEEKVHNRDSIKNFQKSSVVIKQTGIYAGKKLFKCN
:..: ..: :. . .. : :..: .:.. :..:.: .::.
CCDS12 HHRT----------HTG--------EKLFECKECRKAFKQSEHLIQHQRIHTGEKPYKCK
260 270 280 290
430 440 450 460 470 480
pF1KSD ECKKTFTQSSSLTVHQRIHTGEKPYKCNECGKAFSDGSSFARHQRCHTGKKPYECIECGK
::.:.: : . :. :::::::::::.:.::::::::::::::::::::::.:::::::::
CCDS12 ECRKAFRQPAHLAQHQRIHTGEKPYECKECGKAFSDGSSFARHQRCHTGKRPYECIECGK
300 310 320 330 340 350
490 500 510 520 530 540
pF1KSD AFIQNTSLIRHWRYYHTGEKPFDCIDCGKAFSDHIGLNQHRRIHTGEKPYKCDVCHKSFR
:: :::.::::: ::::::::.::::::::: :::: ::::::::::::: :: :.:
CCDS12 AFRYNTSFIRHWRSYHTGEKPFNCIDCGKAFSVHIGLILHRRIHTGEKPYKCGVCGKTFS
360 370 380 390 400 410
550 560 570 580 590 600
pF1KSD YGSSLTVHQRIHTGEKPYECDVCRKAFSHHASLTQHQRVHSGEKPFKCKECGKAFRQNIH
::: ::::::::::::::::.: : :::::::::::::::::::..:::::::::::.:
CCDS12 SGSSRTVHQRIHTGEKPYECDICGKDFSHHASLTQHQRVHSGEKPYECKECGKAFRQNVH
420 430 440 450 460 470
610 620 630 640 650 660
pF1KSD LASHLRIHTGEKPFECAECGKSFSISSQLATHQRIHTGEKPYECKVCSKAFTQKAHLAQH
:.:::::::::::.:: ::::.: :::::::::::::::::::: :..:: :..:::::
CCDS12 LVSHLRIHTGEKPYECKECGKAFRISSQLATHQRIHTGEKPYECIECGNAFKQRSHLAQH
480 490 500 510 520 530
670 680 690 700 710 720
pF1KSD QKTHTGEKPYECKECGKAFSQTTHLIQHQRVHTGEKPYKCMECGKAFGDNSSCTQHQRLH
::::::::::::.:::::::::..: ::::.::::::::: ::::::.:.:::.::::::
CCDS12 QKTHTGEKPYECNECGKAFSQTSNLTQHQRIHTGEKPYKCTECGKAFSDSSSCAQHQRLH
540 550 560 570 580 590
730 740 750 760 770 780
pF1KSD TGQRPYECIECGKAFKTKSSLICHRRSHTGEKPYECSVCGKAFSHRQSLSVHQRIHSGKK
::::::.:.::::::. : :::::.::::::.:
CCDS12 TGQRPYQCFECGKAFRRKLSLICHQRSHTGEEP
600 610 620
790 800 810 820 830 840
pF1KSD PYECKECRKTFIQIGHLNQHKRVHTGERSYNYKKSRKVFRQTAHLAHHQRIHTGESSTCP
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10 20 30 40 50 60
pF1KSD MRGAASASVREPTPLPGRGAPRTKPRAGRGPTVGTPATLALPARGRPRSRNGLASKGQRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 MRGAASASVREPTPLPGRGAPRTKPRAGRGPTVGTPATLALPARGRPRSRNGLASKGQRG
10 20 30 40 50 60
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pF1KSD AAPTGPGHRALPSRDTALPQERNKKLEAVGTGIEPKAMSQGLVTFGDVAVDFSQEEWEWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 AAPTGPGHRALPSRDTALPQERNKKLEAVGTGIEPKAMSQGLVTFGDVAVDFSQEEWEWL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD NPIQRNLYRKVMLENYRNLASLGLCVSKPDVISSLEQGKEPWTVKRKMTRAWCPDLKAVW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 NPIQRNLYRKVMLENYRNLASLGLCVSKPDVISSLEQGKEPWTVKRKMTRAWCPDLKAVW
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD KIKELPLKKDFCEGKLSQAVITERLTSYNLEYSLLGEHWDYDALFETQPGLVTIKNLAVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 KIKELPLKKDFCEGKLSQAVITERLTSYNLEYSLLGEHWDYDALFETQPGLVTIKNLAVD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD FRQQLHPAQKNFCKNGIWENNSDLGSAGHCVAKPDLVSLLEQEKEPWMVKRELTGSLFSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 FRQQLHPAQKNFCKNGIWENNSDLGSAGHCVAKPDLVSLLEQEKEPWMVKRELTGSLFSG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD QRSVHETQELFPKQDSYAEGVTDRTSNTKLDCSSFRENWDSDYVFGRKLAVGQETQFRQE
.
CCDS77 ECRRAWCGKSTARESGAFTKKAASSLIYSRKLYPGSLGLERKLNSGSSK
310 320 330 340
>>CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 (688 aa)
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70 80 90 100 110 120
pF1KSD HRALPSRDTALPQERNKKLEAVGTGIEPKAMSQGLVTFGDVAVDFSQEEWEWLNPIQRNL
:.. :: : :::.:::::::: :. ::.:
CCDS12 MARKLVMFRDVAIDFSQEEWECLDSAQRDL
10 20 30
130 140 150 160 170 180
pF1KSD YRKVMLENYRNLASLGLCVSKPDVISSLEQGKEPWTVKRKMTRAWCPDLKAVWKIKELPL
:: :::::: ::.:: : :. .: :.:
CCDS12 YRDVMLENYSNLVSLDL----PSRCAS----------------------------KDLSP
40 50
190 200 210 220 230 240
pF1KSD KKDFCEGKLSQAVITERLTSYNLEYSLLGEHWDYDALFETQPGLVTIKNLAVDFRQQLHP
.:. : .::: ...:: . .:: : .. . . .: : .: ::: .
CCDS12 EKNTYETELSQWEMSDRLENCDLEESNSRDYLEAKGKMEKQQ-----ENQKEYFRQGM--
60 70 80 90 100 110
250 260 270 280 290 300
pF1KSD AQKNFCKNGIWENNSDLGSAGHCVAKPDLVSLLEQEKEPWMVKRELTGSLFSGQRSVHET
. : .:..... :.. ..: .. ..:. :. :. : .:. : :
CCDS12 --IIYDKMSIFNQHTYLSQHSRC----------HSTEKPYKCKE--CGKAF--RRASHLT
120 130 140 150
310 320 330 340 350 360
pF1KSD QELFPKQDSYAEGVTDRTSNTKLDCSSFRENWDSDYVFGRKLAVGQETQFRQEPITHNKT
:. :. . :.. .:.. . .. : .:.. :. . ..: .
CCDS12 QH----QSIH-------TGEKPYECKQCGKAFSRD----SQLSLHQRLHTGEKPYA----
160 170 180 190
370 380 390 400 410 420
pF1KSD LSKERERTYNKSGRW---SYLDDSEEKVHNRDSIKNFQKSSVVIKQTGIYAGKKLFKCNE
:: .....:.. . .:. . .. : : .:: . .. ...:.: ..:.:
CCDS12 -CKECGKAFTQSSQLILHHRIHTGEKPYKCEECGKAFIRSSQLTRHQKVHTGEKPYECKE
200 210 220 230 240 250
430 440 450 460 470 480
pF1KSD CKKTFTQSSSLTVHQRIHTGEKPYKCNECGKAFSDGSSFARHQRCHTGKKPYECIECGKA
: :.:::.:.::.:::.::::: :.:.:: :.:.. :.. :.: :::.::::: :::::
CCDS12 CGKAFTQNSQLTLHQRLHTGEKLYECKECRKVFTQLSQLILHKRIHTGEKPYECKECGKA
260 270 280 290 300 310
490 500 510 520 530 540
pF1KSD FIQNTSLIRHWRYYHTGEKPFDCIDCGKAFSDHIGLNQHRRIHTGEKPYKCDVCHKSFRY
:: ...: .: . :.::::..: .::.:: : ::.:::::::::::. : :.:
CCDS12 FICGSQLSQHQKI-HNGEKPYECKECGRAFIRGSLLMQHQRIHTGEKPYKCEECGKAFIR
320 330 340 350 360 370
550 560 570 580 590 600
pF1KSD GSSLTVHQRIHTGEKPYECDVCRKAFSHHASLTQHQRVHSGEKPFKCKECGKAFRQNIHL
::.:: ::::::.:::::: : : ::: ..::::::.:.::::..:::::::: .. :
CCDS12 GSQLTQHQRIHTNEKPYECKECGKMFSHGSQLTQHQRIHTGEKPYQCKECGKAFNRGSLL
380 390 400 410 420 430
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pF1KSD ASHLRIHTGEKPFECAECGKSFSISSQLATHQRIHTGEKPYECKVCSKAFTQKAHLAQHQ
. : ::::::::.:: ::::.:: .:.:. :.:::::::::::: :.:.: . ..:.:::
CCDS12 TRHQRIHTGEKPYECKECGKTFSRGSELTQHERIHTGEKPYECKECGKSFIRGSQLTQHQ
440 450 460 470 480 490
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pF1KSD KTHTGEKPYECKECGKAFSQTTHLIQHQRVHTGEKPYKCMECGKAFGDNSSCTQHQRLHT
. :::::::::::: ::.:..:: ::::.::::::: : ::::::. . ::::.::
CCDS12 RIHTGEKPYECKECRMAFTQSSHLSQHQRLHTGEKPYVCNECGKAFARGLLLIQHQRIHT
500 510 520 530 540 550
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pF1KSD GQRPYECIECGKAFKTKSSLICHRRSHTGEKPYECSVCGKAFSHRQSLSVHQRIHSGKKP
:..::.: :::::: :.: :.: :::::::::. ::::::: ..:..:::::.:.::
CCDS12 GEKPYQCKECGKAFIRGSQLTQHQRIHTGEKPYECKECGKAFSHGSQLTLHQRIHTGEKP
560 570 580 590 600 610
790 800 810 820 830 840
pF1KSD YECKECRKTFIQIGHLNQHKRVHTGERSYNYKKSRKVFRQTAHLAHHQRIHTGESSTCPS
:::.::::.: : .::..:.:.::::. :. :. :.: . ..:..::::: .:.:
CCDS12 YECRECRKAFTQSSHLSRHQRIHTGEKPYQCKECGKAFTRGSQLTQHQRIHISEKSFEYK
620 630 640 650 660 670
850 860
pF1KSD LPSTSNPVDLFPKFLWNPSSLPSP
CCDS12 ECGIDFSHGSQVYM
680
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pF1KSD LPSRDTALPQERNKKLEAVGTGIEPKAMSQGLVTFGDVAVDFSQEEWEWLNPIQRNLYRK
::.:: ::::.:: :::: :.: :.:::.
CCDS32 MGLLTFRDVAVEFSLEEWEHLEPAQKNLYQD
10 20 30
140 150 160 170 180 190
pF1KSD VMLENYRNLASLGLCVSKPDVISSLEQGKEPWTVKRKMTRAWCPDLKAVWKIKELPLKKD
:::::::::.:::: :::::.:. ::: ::::.:: . : : :: :.. . : .
CCDS32 VMLENYRNLVSLGLVVSKPDLITFLEQRKEPWNVKSEETVAIQPD---VFSHYNKDLLTE
40 50 60 70 80
200 210 220 230 240 250
pF1KSD FCEGKLSQAVITERLTSYNLEYSLLGEHWDYDALFETQPGLVTIKNLAVDFRQQLHPAQK
: : ::..: : .:: : ..: . : . : :.. : : . . .
CCDS32 HCTEASFQKVISRRHGSCDLENLHLRKRWKREEC-EGHNGCYDEKTFKYD--QFDESSVE
90 100 110 120 130 140
260 270 280 290 300
pF1KSD NFCKNGIWENNSDLGSAGHCVAKPDLVSLLEQEKEP--WMVKR--ELTGSLFSGQRSVHE
.. .. : . . . . :::.:..: : .. . :. :: ...
CCDS32 SLFHQQILSSCAKSYNFDQYRKVFTHSSLLNQQEEIDIWGKHHIYDKTSVLFRQVSTLNS
150 160 170 180 190 200
310 320 330 340 350
pF1KSD TQELFPKQDSYAEGVTDRTSNTKLDCSSFRENW--DSDY-------VFGRKLAVGQETQF
...: . .: . ...: : . . .. .::. ...: :: ... ::: :
CCDS32 YRNVFIGEKNYHCNNSEKTLNQSSSPKNHQENYFLEKQYKCKEFEEVFLQSMH-GQEKQE
210 220 230 240 250 260
360 370 380 390 400
pF1KSD RQ--------------EPITHNKTLSKERERTYNKSGRWSYLDDSEEK--VHNRDSIKNF
.. . : :. .: .::: . ... .: .::... .
CCDS32 QSYKCNKCVEVCTQSLKHIQHQTIHIRENSYSYNKYDKDLSQSSNLRKQIIHNEEKPYKC
270 280 290 300 310 320
410 420 430 440 450
pF1KSD QKS------SVVIKQTGIYAGK-KLFKCNECKKTFTQSSSL--TVHQRIHTGEKPYKCNE
.: :. . : : . : : .:: :.:. . :: : .:.: :::. :::.
CCDS32 EKCGDSLNHSLHLTQHQIIPTEEKPCKWKECGKVFNLNCSLYLTKQQQIDTGENLYKCKA
330 340 350 360 370 380
460 470 480 490 500 510
pF1KSD CGKAFSDGSSFARHQRCHTGKKPYECIECGKAFIQNTSLIRHWRYYHTGEKPFDCIDCGK
:.:.:. .:.. ::: :::.:::.: :::::: .. : .: : ::::::. : .:::
CCDS32 CSKSFTRSSNLIVHQRIHTGEKPYKCKECGKAFRCSSYLTKHKRI-HTGEKPYKCKECGK
390 400 410 420 430 440
520 530 540 550 560 570
pF1KSD AFSDHIGLNQHRRIHTGEKPYKCDVCHKSFRYGSSLTVHQRIHTGEKPYECDVCRKAFSH
::. :.::. ::::: ::: :: ::. .:.: .:::.:::::::.: : :.::.
CCDS32 AFNRSSCLTQHQTTHTGEKLYKCKVCSKSYARSSNLIMHQRVHTGEKPYKCKECGKVFSR
450 460 470 480 490 500
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pF1KSD HASLTQHQRVHSGEKPFKCKECGKAFRQNIHLASHLRIHTGEKPFECAECGKSFSISSQL
. ::::...:.::. .::: :.: : .: : ::::::::..: ::::.: ::.:
CCDS32 SSCLTQHRKIHTGENLYKCKVCAKPFTCFSNLIVHERIHTGEKPYKCKECGKAFPYSSHL
510 520 530 540 550 560
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pF1KSD ATHQRIHTGEKPYECKVCSKAFTQKAHLAQHQKTHTGEKPYECKECGKAFSQTTHLIQHQ
:.:::::::::.::.:::.:.... :. :..:::::::: ::::::::: .. .:::.
CCDS32 IRHHRIHTGEKPYKCKACSKSFSDSSGLTVHRRTHTGEKPYTCKECGKAFSYSSDVIQHR
570 580 590 600 610 620
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pF1KSD RVHTGEKPYKCMECGKAFGDNSSCTQHQRLHTGQRPYECIECGKAFKTKSSLICHRRSHT
:.:::..:::: ::::::. : : ::: :::.:::.: ::::::...: : ::: ::
CCDS32 RIHTGQRPYKCEECGKAFNYRSYLTTHQRSHTGERPYKCEECGKAFNSRSYLTTHRRRHT
630 640 650 660 670 680
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pF1KSD GEKPYECSVCGKAFSHRQSLSVHQRIHSGKKPYECKECRKTFIQIGHLNQHKRVHTGERS
::.::.:. ::::::.:. :..:.: :::..::.:.:: :.: . ..: :.: :: :.
CCDS32 GERPYKCDECGKAFSYRSYLTTHRRSHSGERPYKCEECGKAFNSRSYLIAHQRSHTREKL
690 700 710 720 730 740
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pF1KSD YNYKKSRKVFRQTAHLAHHQRIHTGESSTCPSLPSTSNPVDLFPKFLWNPSSLPSP
>>CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 (678 aa)
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70 80 90 100 110 120
pF1KSD GHRALPSRDTALPQERNKKLEAVGTGIEPKAMSQGLVTFGDVAVDFSQEEWEWLNPIQRN
:. :: .:: :::..:::::: :.: :..
CCDS46 MALPQGQLTFKDVAIEFSQEEWTCLDPAQKT
10 20 30
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LYRKVMLENYRNLASLGLCVSKPDVISSLEQGKEPWTVKRKMTRAWCPDLKAVWKIKELP
::: :::::::::.:: :. . : : . .::
CCDS46 LYRDVMLENYRNLVSL-------DI-----------SCK-------CVNT-------DLP
40 50
190 200 210 220 230 240
pF1KSD LKKDFCEGKLSQAVITERLTSYNLEYSLLGEHWDYDALFETQPGLVTIKNLAVDFRQQLH
: :. .: ::: : . .: .. :.: :: . ::.
CCDS46 PKGKNNMGEAFYTVKLERLESCDT----VGLSFQ-----EVQ------KN-TYDFE----
60 70 80 90
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pF1KSD PAQKNFCKNGIWENNSDLGSAGHCVAKPDLVSLLEQEKEPWMVKRELTGSLFSGQRSVHE
:. :.. : :. : .:..:. : :.:.
CCDS46 ------CQ---WKD--DEGNY-------KTVLMLQKENLP-------------GRRA---
100 110 120
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pF1KSD TQELFPKQDSYAEGVTDRTSNTKLDCSSFRENWDSDYVFGRKLAVGQETQFRQEPITHNK
..: : : .: ...: : :. . : .. . . .: .. : ...:
CCDS46 ------QRDRRAAG--NRHIENQLGVS-FQSHLPELQQFQHEGKIYEYNQVEKSPNNRGK
130 140 150 160 170
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pF1KSD TLS-KERERTYNKSGRWS---YLDDSEEKVHNRDSIKNFQ-KSSVVIKQTGIYAGKKLFK
. : .......: . . .:. . : : .:...:.:. :..:.: .:
CCDS46 HYKCDECGKVFSQNSRLTSHKRIHTGEKPYQCNKCGKAFTVRSNLTIHQV-IHTGEKPYK
180 190 200 210 220 230
430 440 450 460 470 480
pF1KSD CNECKKTFTQSSSLTVHQRIHTGEKPYKCNECGKAFSDGSSFARHQRCHTGKKPYECIEC
:::: :.:.: :.:. :::::::::::::::::::: :... :: :::.:::.: ::
CCDS46 CNECGKVFSQPSNLAGHQRIHTGEKPYKCNECGKAFRAHSKLTTHQVIHTGEKPYKCKEC
240 250 260 270 280 290
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pF1KSD GKAFIQNTSLIRHWRYYHTGEKPFDCIDCGKAFSDHIGLNQHRRIHTGEKPYKCDVCHKS
:: : ::. : : : ::::::. : .:::::: . .:. :. ::::::::::. : :
CCDS46 GKCFTQNSHLASH-RRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSSLTTHQTIHTGEKPYKCNECGKV
300 310 320 330 340 350
550 560 570 580 590 600
pF1KSD FRYGSSLTVHQRIHTGEKPYECDVCRKAFSHHASLTQHQRVHSGEKPFKCKECGKAFRQN
::..: :. :.:::::::::.:. : :::: :..::.:: .:.:::::::.:: :.: :
CCDS46 FRHNSYLAKHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLTKHQIIHTGEKPFKCNECVKVFTQY
360 370 380 390 400 410
610 620 630 640 650 660
pF1KSD IHLASHLRIHTGEKPFECAECGKSFSISSQLATHQRIHTGEKPYECKVCSKAFTQKAHLA
:::.: ::::::::..: ::::.::. :.:.::: ::::::::.:. :.:.:::..:::
CCDS46 SHLANHRRIHTGEKPYRCDECGKAFSVRSSLTTHQAIHTGEKPYKCNDCGKVFTQNSHLA
420 430 440 450 460 470
670 680 690 700 710 720
pF1KSD QHQKTHTGEKPYECKECGKAFSQTTHLIQHQRVHTGEKPYKCMECGKAFGDNSSCTQHQR
.:. :.:::::.: :::::::::..: .: ::::::::::: ::::::. .:: : ::
CCDS46 SHRGIHSGEKPYKCDECGKAFSQTSQLARHWRVHTGEKPYKCNECGKAFSVHSSLTIHQT
480 490 500 510 520 530
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pF1KSD LHTGQRPYECIECGKAFKTKSSLICHRRSHTGEKPYECSVCGKAFSHRQSLSVHQRIHSG
.::::.::.: .:::.:. .: : :.: :::::::.:. :::::: ...:..:: ::.:
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770 780 790 800 810 820
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CCDS12 H----------------QMG----CVSQ-------------MLIQKQISHPL---HPKIH
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CCDS12 A------REKSY-------------ECKECRKA------------------FRQQSYLIQ
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CCDS12 PYKCTECGKAFIRSTHLTQHHRIHTGEKPYECTECGKTFSRHYHLTQHHRGHTGEKPYIC
640 650 660 670 680 690
850 860
pF1KSD SLPSTSNPVDLFPKFLWNPSSLPSP
CCDS12 NECGNAFICSYRLTLHQRIHTGELPYECKECGKTFSRRYHLTQHFRLHTGEKPYSCKECG
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CCDS12 GEKPYECTECGKTFSRHYHLTQHHRGHTGEKPYICNECGNAFICSYRLTLHQRIHTGELP
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pF1KSD YECKVCSKAFTQKAHLAQHQKTHTGEKPYECKECGKAFSQTTHLIQHQRVHTGEKPYKCM
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CCDS12 YECKECGKTFSRRYHLTQHFRLHTGEKPYSCKECGNAFRLQAELTRHHIVHTGEKPYKCK
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CCDS12 ECGKAFSVNSELTRHHRIHTGEKPYQCKECGKAFIRSDQLTLHQRNHISEEVLCIM
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pF1KSD AFSHRQSLSVHQRIHSGKKPYECKECRKTFIQIGHLNQHKRVHTGERSYNYKKSRKVFRQ
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CCDS33 LYRDVMLENYRNLASLGISCFDLSIISMLEQGKEPFTLESQVQIAGNPDGWEWIKAVITA
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CCDS33 LSSEFVMKDLLHKGKSNTGEVFQTVMLERQESQDIEGCSFREVQKNTHGLEYQCRDAEGN
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CCDS33 SNGCGMVFPQNSHLASHQRSHTKEKPYKCYECGKAFRTRS-NLTTH-QVIHTGEKRYKCN
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:: ::.: :: :.:.:::.: ::::.: ::. : ::: ::::::. : .:::::.
CCDS33 AFRARSSLAIHQATHSGEKPYKCNECGKVFTQNSHLTNHWRI-HTGEKPYKCNECGKAFG
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. .: : :::::::::: : : :: .: :. :: ::::::::.:. : ::: :..
CCDS33 VRSSLAIHLVIHTGEKPYKCHECGKVFRRNSHLARHQLIHTGEKPYKCNECGKAFRAHSN
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CCDS33 TGEKPYKYNEYGKAFSEHSNLTTHQVIHTGEKPYKCNECGKVFTQNSHLARHRRVHTGGK
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CCDS33 PYQCNECGKAFSQTSKLARHQRVHTGEKPYECNQCGKAFSVRSSLTTHQAIHTGKKPYKC
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.:: :.: : .:: .:. .::::. :. .. :.: ::..::.::::::::.
CCDS33 NECGKVFTQNSHLARHRGIHTGEKPYKCNECGKAFSQTSKLARHQRIHTGEKPYECGKPF
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pF1KSD STCPSLPSTSNPVDLFPKFLWNPSSLPSP
: : :: .
CCDS33 SICSSLTTHQTIHTGGKPYKCNVWKVLKSEFKPCKPSQNS
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]