Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA1391
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1391, 1191 aa
1>>>pF1KSDA1391 1191 - 1191 aa - 1191 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.9413+/-0.000965; mu= 10.2236+/- 0.058
mean_var=135.5402+/-28.095, 0's: 0 Z-trim(109.4): 105 B-trim: 318 in 2/51
Lambda= 0.110164
statistics sampled from 10734 (10841) to 10734 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.678), E-opt: 0.2 (0.333), width: 16
Scan time: 3.800
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31673.1 ARHGAP20 gene_id:57569|Hs108|chr11 (1191) 7922 1271.4 0
CCDS58177.1 ARHGAP20 gene_id:57569|Hs108|chr11 (1168) 7705 1236.9 0
CCDS58176.1 ARHGAP20 gene_id:57569|Hs108|chr11 (1165) 7699 1235.9 0
CCDS58175.1 ARHGAP20 gene_id:57569|Hs108|chr11 (1155) 7687 1234.0 0
CCDS5261.1 TAGAP gene_id:117289|Hs108|chr6 ( 731) 642 114.2 1.2e-24
CCDS5263.1 TAGAP gene_id:117289|Hs108|chr6 ( 266) 518 94.3 4.1e-19
CCDS14736.1 ARHGAP4 gene_id:393|Hs108|chrX ( 946) 375 71.8 8.6e-12
CCDS55540.1 ARHGAP4 gene_id:393|Hs108|chrX ( 986) 375 71.9 8.9e-12
CCDS7922.1 ARHGAP1 gene_id:392|Hs108|chr11 ( 439) 367 70.4 1.1e-11
>>CCDS31673.1 ARHGAP20 gene_id:57569|Hs108|chr11 (1191 aa)
initn: 7922 init1: 7922 opt: 7922 Z-score: 6806.1 bits: 1271.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7922; 100.0% identity (100.0% similar) in 1191 aa overlap (1-1191:1-1191)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MEAMSPQQETLGGQPGRSSSLTGVSRLAGGSCTKKKMKTLAERRRSAPSLILDKALQKRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MEAMSPQQETLGGQPGRSSSLTGVSRLAGGSCTKKKMKTLAERRRSAPSLILDKALQKRP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD TTRDSPSASVDTCTFLSSLVCSNRTLLIDGRAELKRGLQRQERHLFLFNDLFVVAKIKYN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TTRDSPSASVDTCTFLSSLVCSNRTLLIDGRAELKRGLQRQERHLFLFNDLFVVAKIKYN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD NNFKIKNKIKLTDMWTASCVDEVGEGNTNAMKSFVLGWPTVNFVATFSSPEQKDKWLSLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NNFKIKNKIKLTDMWTASCVDEVGEGNTNAMKSFVLGWPTVNFVATFSSPEQKDKWLSLL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD QRYINLEKEKDYPKSIPLKIFAKDIGNCAYSKTITVMNSDTANEVINMSLPMLGITGSER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 QRYINLEKEKDYPKSIPLKIFAKDIGNCAYSKTITVMNSDTANEVINMSLPMLGITGSER
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD DYQLWVNSGKEEAPYPLIGHEYPYGIKMSHLRDSALLTPGSKDSTTPFNLQEPFLMEQLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DYQLWVNSGKEEAPYPLIGHEYPYGIKMSHLRDSALLTPGSKDSTTPFNLQEPFLMEQLP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD REMQCQFILKPSRLAAAQQLSDSGHKTFKRRRSIINWAFWRGSSTHLDNLPSSPTSPMPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 REMQCQFILKPSRLAAAQQLSDSGHKTFKRRRSIINWAFWRGSSTHLDNLPSSPTSPMPG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD QLFGISLPNICENDNLPKPVLDMLFFLNQKGPLTKGIFRQSANVKSCRELKEKLNSGVEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 QLFGISLPNICENDNLPKPVLDMLFFLNQKGPLTKGIFRQSANVKSCRELKEKLNSGVEV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD HLDCESIFVIASVLKDFLRNIPGSIFSSDLYDHWVSVMDQGNDEEKINTVQRLLDQLPRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 HLDCESIFVIASVLKDFLRNIPGSIFSSDLYDHWVSVMDQGNDEEKINTVQRLLDQLPRA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD NVVLLRYLFGVLHNIEQHSSSNQMTAFNLAVCVAPSILWPPASSSPELENEFTKKVSLLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NVVLLRYLFGVLHNIEQHSSSNQMTAFNLAVCVAPSILWPPASSSPELENEFTKKVSLLI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD QFLIENCLRIFGEEITSLFREVSVRCDTRENASDISCFQLNDSSYDSLENELNEDVDAPC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 QFLIENCLRIFGEEITSLFREVSVRCDTRENASDISCFQLNDSSYDSLENELNEDVDAPC
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD SDLVKKLGQGSRSMDSVLTLSDYDLDQPEVEGLLTLSDFDLAHSKDEDVQMKRPLESKPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SDLVKKLGQGSRSMDSVLTLSDYDLDQPEVEGLLTLSDFDLAHSKDEDVQMKRPLESKPV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD NILVYTKIPLRDHARAPSAMCTPSYLSTAAANAAKSLRRHRRCSEPSIDYLDSKLSYLRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NILVYTKIPLRDHARAPSAMCTPSYLSTAAANAAKSLRRHRRCSEPSIDYLDSKLSYLRE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD FYQKKLRKSSCDAILSQKDEDYLKQNQPLQEEGKTCFKQSLVTGTDVSKKNATTQNTKKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FYQKKLRKSSCDAILSQKDEDYLKQNQPLQEEGKTCFKQSLVTGTDVSKKNATTQNTKKK
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD SLSGSEGNHVKLFPKSKPVAISVASYSPMSSQDHSKNQPFDVNTSGYSPPHTADALKGPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SLSGSEGNHVKLFPKSKPVAISVASYSPMSSQDHSKNQPFDVNTSGYSPPHTADALKGPR
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD THRRCSEPNIEDQNRKLTYLRGIYSKKQHKTSCEAGLLHGEEDYLKRHKSLQMEGQKLIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 THRRCSEPNIEDQNRKLTYLRGIYSKKQHKTSCEAGLLHGEEDYLKRHKSLQMEGQKLIN
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD QSLVMGIEVGKSSATNQNTEKVLPPRLNLCPRTSYSSLSSPGTSPSGSSVSSQDSAFSQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 QSLVMGIEVGKSSATNQNTEKVLPPRLNLCPRTSYSSLSSPGTSPSGSSVSSQDSAFSQI
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD SEHSVFTPTETSSPIDCTFQAQRKREDLSPDFSNASHVSGMPGPSSGQACSRPAYTKKDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SEHSVFTPTETSSPIDCTFQAQRKREDLSPDFSNASHVSGMPGPSSGQACSRPAYTKKDT
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD MEWHSQMHSVTLHPSTWLRNGVASLKNWSLKKKAKAARPEEEKIASPKGPLEPPPHASGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MEWHSQMHSVTLHPSTWLRNGVASLKNWSLKKKAKAARPEEEKIASPKGPLEPPPHASGV
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD PEANSLQEEQKDLPLRAAEGLSPVQSAQRCSSSPFQDSERHCSSPFSLVESRLKLCMKSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PEANSLQEEQKDLPLRAAEGLSPVQSAQRCSSSPFQDSERHCSSPFSLVESRLKLCMKSH
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190
pF1KSD EEIEPGSQSSSGSLPWERASASSWTLEDATSPDSGPTVVCDIEDRYLTKDI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 EEIEPGSQSSSGSLPWERASASSWTLEDATSPDSGPTVVCDIEDRYLTKDI
1150 1160 1170 1180 1190
>>CCDS58177.1 ARHGAP20 gene_id:57569|Hs108|chr11 (1168 aa)
initn: 7705 init1: 7705 opt: 7705 Z-score: 6619.8 bits: 1236.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7705; 100.0% identity (100.0% similar) in 1158 aa overlap (34-1191:11-1168)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSPQQETLGGQPGRSSSLTGVSRLAGGSCTKKKMKTLAERRRSAPSLILDKALQKRPTTR
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MSARERQPALKKKMKTLAERRRSAPSLILDKALQKRPTTR
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KSD DSPSASVDTCTFLSSLVCSNRTLLIDGRAELKRGLQRQERHLFLFNDLFVVAKIKYNNNF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DSPSASVDTCTFLSSLVCSNRTLLIDGRAELKRGLQRQERHLFLFNDLFVVAKIKYNNNF
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KSD KIKNKIKLTDMWTASCVDEVGEGNTNAMKSFVLGWPTVNFVATFSSPEQKDKWLSLLQRY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KIKNKIKLTDMWTASCVDEVGEGNTNAMKSFVLGWPTVNFVATFSSPEQKDKWLSLLQRY
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KSD INLEKEKDYPKSIPLKIFAKDIGNCAYSKTITVMNSDTANEVINMSLPMLGITGSERDYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 INLEKEKDYPKSIPLKIFAKDIGNCAYSKTITVMNSDTANEVINMSLPMLGITGSERDYQ
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KSD LWVNSGKEEAPYPLIGHEYPYGIKMSHLRDSALLTPGSKDSTTPFNLQEPFLMEQLPREM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LWVNSGKEEAPYPLIGHEYPYGIKMSHLRDSALLTPGSKDSTTPFNLQEPFLMEQLPREM
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KSD QCQFILKPSRLAAAQQLSDSGHKTFKRRRSIINWAFWRGSSTHLDNLPSSPTSPMPGQLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 QCQFILKPSRLAAAQQLSDSGHKTFKRRRSIINWAFWRGSSTHLDNLPSSPTSPMPGQLF
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KSD GISLPNICENDNLPKPVLDMLFFLNQKGPLTKGIFRQSANVKSCRELKEKLNSGVEVHLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GISLPNICENDNLPKPVLDMLFFLNQKGPLTKGIFRQSANVKSCRELKEKLNSGVEVHLD
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KSD CESIFVIASVLKDFLRNIPGSIFSSDLYDHWVSVMDQGNDEEKINTVQRLLDQLPRANVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 CESIFVIASVLKDFLRNIPGSIFSSDLYDHWVSVMDQGNDEEKINTVQRLLDQLPRANVV
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KSD LLRYLFGVLHNIEQHSSSNQMTAFNLAVCVAPSILWPPASSSPELENEFTKKVSLLIQFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LLRYLFGVLHNIEQHSSSNQMTAFNLAVCVAPSILWPPASSSPELENEFTKKVSLLIQFL
470 480 490 500 510 520
550 560 570 580 590 600
pF1KSD IENCLRIFGEEITSLFREVSVRCDTRENASDISCFQLNDSSYDSLENELNEDVDAPCSDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 IENCLRIFGEEITSLFREVSVRCDTRENASDISCFQLNDSSYDSLENELNEDVDAPCSDL
530 540 550 560 570 580
610 620 630 640 650 660
pF1KSD VKKLGQGSRSMDSVLTLSDYDLDQPEVEGLLTLSDFDLAHSKDEDVQMKRPLESKPVNIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VKKLGQGSRSMDSVLTLSDYDLDQPEVEGLLTLSDFDLAHSKDEDVQMKRPLESKPVNIL
590 600 610 620 630 640
670 680 690 700 710 720
pF1KSD VYTKIPLRDHARAPSAMCTPSYLSTAAANAAKSLRRHRRCSEPSIDYLDSKLSYLREFYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VYTKIPLRDHARAPSAMCTPSYLSTAAANAAKSLRRHRRCSEPSIDYLDSKLSYLREFYQ
650 660 670 680 690 700
730 740 750 760 770 780
pF1KSD KKLRKSSCDAILSQKDEDYLKQNQPLQEEGKTCFKQSLVTGTDVSKKNATTQNTKKKSLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KKLRKSSCDAILSQKDEDYLKQNQPLQEEGKTCFKQSLVTGTDVSKKNATTQNTKKKSLS
710 720 730 740 750 760
790 800 810 820 830 840
pF1KSD GSEGNHVKLFPKSKPVAISVASYSPMSSQDHSKNQPFDVNTSGYSPPHTADALKGPRTHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GSEGNHVKLFPKSKPVAISVASYSPMSSQDHSKNQPFDVNTSGYSPPHTADALKGPRTHR
770 780 790 800 810 820
850 860 870 880 890 900
pF1KSD RCSEPNIEDQNRKLTYLRGIYSKKQHKTSCEAGLLHGEEDYLKRHKSLQMEGQKLINQSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RCSEPNIEDQNRKLTYLRGIYSKKQHKTSCEAGLLHGEEDYLKRHKSLQMEGQKLINQSL
830 840 850 860 870 880
910 920 930 940 950 960
pF1KSD VMGIEVGKSSATNQNTEKVLPPRLNLCPRTSYSSLSSPGTSPSGSSVSSQDSAFSQISEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VMGIEVGKSSATNQNTEKVLPPRLNLCPRTSYSSLSSPGTSPSGSSVSSQDSAFSQISEH
890 900 910 920 930 940
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD SVFTPTETSSPIDCTFQAQRKREDLSPDFSNASHVSGMPGPSSGQACSRPAYTKKDTMEW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SVFTPTETSSPIDCTFQAQRKREDLSPDFSNASHVSGMPGPSSGQACSRPAYTKKDTMEW
950 960 970 980 990 1000
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD HSQMHSVTLHPSTWLRNGVASLKNWSLKKKAKAARPEEEKIASPKGPLEPPPHASGVPEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 HSQMHSVTLHPSTWLRNGVASLKNWSLKKKAKAARPEEEKIASPKGPLEPPPHASGVPEA
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD NSLQEEQKDLPLRAAEGLSPVQSAQRCSSSPFQDSERHCSSPFSLVESRLKLCMKSHEEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NSLQEEQKDLPLRAAEGLSPVQSAQRCSSSPFQDSERHCSSPFSLVESRLKLCMKSHEEI
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1150 1160 1170 1180 1190
pF1KSD EPGSQSSSGSLPWERASASSWTLEDATSPDSGPTVVCDIEDRYLTKDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EPGSQSSSGSLPWERASASSWTLEDATSPDSGPTVVCDIEDRYLTKDI
1130 1140 1150 1160
>>CCDS58176.1 ARHGAP20 gene_id:57569|Hs108|chr11 (1165 aa)
initn: 7699 init1: 7699 opt: 7699 Z-score: 6614.7 bits: 1235.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7699; 100.0% identity (100.0% similar) in 1157 aa overlap (35-1191:9-1165)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD SPQQETLGGQPGRSSSLTGVSRLAGGSCTKKKMKTLAERRRSAPSLILDKALQKRPTTRD
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MTFWIIINKKMKTLAERRRSAPSLILDKALQKRPTTRD
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KSD SPSASVDTCTFLSSLVCSNRTLLIDGRAELKRGLQRQERHLFLFNDLFVVAKIKYNNNFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SPSASVDTCTFLSSLVCSNRTLLIDGRAELKRGLQRQERHLFLFNDLFVVAKIKYNNNFK
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KSD IKNKIKLTDMWTASCVDEVGEGNTNAMKSFVLGWPTVNFVATFSSPEQKDKWLSLLQRYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 IKNKIKLTDMWTASCVDEVGEGNTNAMKSFVLGWPTVNFVATFSSPEQKDKWLSLLQRYI
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KSD NLEKEKDYPKSIPLKIFAKDIGNCAYSKTITVMNSDTANEVINMSLPMLGITGSERDYQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NLEKEKDYPKSIPLKIFAKDIGNCAYSKTITVMNSDTANEVINMSLPMLGITGSERDYQL
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KSD WVNSGKEEAPYPLIGHEYPYGIKMSHLRDSALLTPGSKDSTTPFNLQEPFLMEQLPREMQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 WVNSGKEEAPYPLIGHEYPYGIKMSHLRDSALLTPGSKDSTTPFNLQEPFLMEQLPREMQ
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KSD CQFILKPSRLAAAQQLSDSGHKTFKRRRSIINWAFWRGSSTHLDNLPSSPTSPMPGQLFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 CQFILKPSRLAAAQQLSDSGHKTFKRRRSIINWAFWRGSSTHLDNLPSSPTSPMPGQLFG
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KSD ISLPNICENDNLPKPVLDMLFFLNQKGPLTKGIFRQSANVKSCRELKEKLNSGVEVHLDC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ISLPNICENDNLPKPVLDMLFFLNQKGPLTKGIFRQSANVKSCRELKEKLNSGVEVHLDC
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KSD ESIFVIASVLKDFLRNIPGSIFSSDLYDHWVSVMDQGNDEEKINTVQRLLDQLPRANVVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ESIFVIASVLKDFLRNIPGSIFSSDLYDHWVSVMDQGNDEEKINTVQRLLDQLPRANVVL
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KSD LRYLFGVLHNIEQHSSSNQMTAFNLAVCVAPSILWPPASSSPELENEFTKKVSLLIQFLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LRYLFGVLHNIEQHSSSNQMTAFNLAVCVAPSILWPPASSSPELENEFTKKVSLLIQFLI
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KSD ENCLRIFGEEITSLFREVSVRCDTRENASDISCFQLNDSSYDSLENELNEDVDAPCSDLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ENCLRIFGEEITSLFREVSVRCDTRENASDISCFQLNDSSYDSLENELNEDVDAPCSDLV
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640 650 660
pF1KSD KKLGQGSRSMDSVLTLSDYDLDQPEVEGLLTLSDFDLAHSKDEDVQMKRPLESKPVNILV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KKLGQGSRSMDSVLTLSDYDLDQPEVEGLLTLSDFDLAHSKDEDVQMKRPLESKPVNILV
580 590 600 610 620 630
670 680 690 700 710 720
pF1KSD YTKIPLRDHARAPSAMCTPSYLSTAAANAAKSLRRHRRCSEPSIDYLDSKLSYLREFYQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 YTKIPLRDHARAPSAMCTPSYLSTAAANAAKSLRRHRRCSEPSIDYLDSKLSYLREFYQK
640 650 660 670 680 690
730 740 750 760 770 780
pF1KSD KLRKSSCDAILSQKDEDYLKQNQPLQEEGKTCFKQSLVTGTDVSKKNATTQNTKKKSLSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KLRKSSCDAILSQKDEDYLKQNQPLQEEGKTCFKQSLVTGTDVSKKNATTQNTKKKSLSG
700 710 720 730 740 750
790 800 810 820 830 840
pF1KSD SEGNHVKLFPKSKPVAISVASYSPMSSQDHSKNQPFDVNTSGYSPPHTADALKGPRTHRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SEGNHVKLFPKSKPVAISVASYSPMSSQDHSKNQPFDVNTSGYSPPHTADALKGPRTHRR
760 770 780 790 800 810
850 860 870 880 890 900
pF1KSD CSEPNIEDQNRKLTYLRGIYSKKQHKTSCEAGLLHGEEDYLKRHKSLQMEGQKLINQSLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 CSEPNIEDQNRKLTYLRGIYSKKQHKTSCEAGLLHGEEDYLKRHKSLQMEGQKLINQSLV
820 830 840 850 860 870
910 920 930 940 950 960
pF1KSD MGIEVGKSSATNQNTEKVLPPRLNLCPRTSYSSLSSPGTSPSGSSVSSQDSAFSQISEHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MGIEVGKSSATNQNTEKVLPPRLNLCPRTSYSSLSSPGTSPSGSSVSSQDSAFSQISEHS
880 890 900 910 920 930
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD VFTPTETSSPIDCTFQAQRKREDLSPDFSNASHVSGMPGPSSGQACSRPAYTKKDTMEWH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VFTPTETSSPIDCTFQAQRKREDLSPDFSNASHVSGMPGPSSGQACSRPAYTKKDTMEWH
940 950 960 970 980 990
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD SQMHSVTLHPSTWLRNGVASLKNWSLKKKAKAARPEEEKIASPKGPLEPPPHASGVPEAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SQMHSVTLHPSTWLRNGVASLKNWSLKKKAKAARPEEEKIASPKGPLEPPPHASGVPEAN
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD SLQEEQKDLPLRAAEGLSPVQSAQRCSSSPFQDSERHCSSPFSLVESRLKLCMKSHEEIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SLQEEQKDLPLRAAEGLSPVQSAQRCSSSPFQDSERHCSSPFSLVESRLKLCMKSHEEIE
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1150 1160 1170 1180 1190
pF1KSD PGSQSSSGSLPWERASASSWTLEDATSPDSGPTVVCDIEDRYLTKDI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PGSQSSSGSLPWERASASSWTLEDATSPDSGPTVVCDIEDRYLTKDI
1120 1130 1140 1150 1160
>>CCDS58175.1 ARHGAP20 gene_id:57569|Hs108|chr11 (1155 aa)
initn: 7687 init1: 7687 opt: 7687 Z-score: 6604.4 bits: 1234.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7687; 100.0% identity (100.0% similar) in 1155 aa overlap (37-1191:1-1155)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD QQETLGGQPGRSSSLTGVSRLAGGSCTKKKMKTLAERRRSAPSLILDKALQKRPTTRDSP
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MKTLAERRRSAPSLILDKALQKRPTTRDSP
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KSD SASVDTCTFLSSLVCSNRTLLIDGRAELKRGLQRQERHLFLFNDLFVVAKIKYNNNFKIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SASVDTCTFLSSLVCSNRTLLIDGRAELKRGLQRQERHLFLFNDLFVVAKIKYNNNFKIK
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KSD NKIKLTDMWTASCVDEVGEGNTNAMKSFVLGWPTVNFVATFSSPEQKDKWLSLLQRYINL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NKIKLTDMWTASCVDEVGEGNTNAMKSFVLGWPTVNFVATFSSPEQKDKWLSLLQRYINL
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KSD EKEKDYPKSIPLKIFAKDIGNCAYSKTITVMNSDTANEVINMSLPMLGITGSERDYQLWV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EKEKDYPKSIPLKIFAKDIGNCAYSKTITVMNSDTANEVINMSLPMLGITGSERDYQLWV
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KSD NSGKEEAPYPLIGHEYPYGIKMSHLRDSALLTPGSKDSTTPFNLQEPFLMEQLPREMQCQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NSGKEEAPYPLIGHEYPYGIKMSHLRDSALLTPGSKDSTTPFNLQEPFLMEQLPREMQCQ
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KSD FILKPSRLAAAQQLSDSGHKTFKRRRSIINWAFWRGSSTHLDNLPSSPTSPMPGQLFGIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 FILKPSRLAAAQQLSDSGHKTFKRRRSIINWAFWRGSSTHLDNLPSSPTSPMPGQLFGIS
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KSD LPNICENDNLPKPVLDMLFFLNQKGPLTKGIFRQSANVKSCRELKEKLNSGVEVHLDCES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LPNICENDNLPKPVLDMLFFLNQKGPLTKGIFRQSANVKSCRELKEKLNSGVEVHLDCES
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KSD IFVIASVLKDFLRNIPGSIFSSDLYDHWVSVMDQGNDEEKINTVQRLLDQLPRANVVLLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 IFVIASVLKDFLRNIPGSIFSSDLYDHWVSVMDQGNDEEKINTVQRLLDQLPRANVVLLR
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KSD YLFGVLHNIEQHSSSNQMTAFNLAVCVAPSILWPPASSSPELENEFTKKVSLLIQFLIEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 YLFGVLHNIEQHSSSNQMTAFNLAVCVAPSILWPPASSSPELENEFTKKVSLLIQFLIEN
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KSD CLRIFGEEITSLFREVSVRCDTRENASDISCFQLNDSSYDSLENELNEDVDAPCSDLVKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 CLRIFGEEITSLFREVSVRCDTRENASDISCFQLNDSSYDSLENELNEDVDAPCSDLVKK
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640 650 660
pF1KSD LGQGSRSMDSVLTLSDYDLDQPEVEGLLTLSDFDLAHSKDEDVQMKRPLESKPVNILVYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LGQGSRSMDSVLTLSDYDLDQPEVEGLLTLSDFDLAHSKDEDVQMKRPLESKPVNILVYT
580 590 600 610 620 630
670 680 690 700 710 720
pF1KSD KIPLRDHARAPSAMCTPSYLSTAAANAAKSLRRHRRCSEPSIDYLDSKLSYLREFYQKKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KIPLRDHARAPSAMCTPSYLSTAAANAAKSLRRHRRCSEPSIDYLDSKLSYLREFYQKKL
640 650 660 670 680 690
730 740 750 760 770 780
pF1KSD RKSSCDAILSQKDEDYLKQNQPLQEEGKTCFKQSLVTGTDVSKKNATTQNTKKKSLSGSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RKSSCDAILSQKDEDYLKQNQPLQEEGKTCFKQSLVTGTDVSKKNATTQNTKKKSLSGSE
700 710 720 730 740 750
790 800 810 820 830 840
pF1KSD GNHVKLFPKSKPVAISVASYSPMSSQDHSKNQPFDVNTSGYSPPHTADALKGPRTHRRCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GNHVKLFPKSKPVAISVASYSPMSSQDHSKNQPFDVNTSGYSPPHTADALKGPRTHRRCS
760 770 780 790 800 810
850 860 870 880 890 900
pF1KSD EPNIEDQNRKLTYLRGIYSKKQHKTSCEAGLLHGEEDYLKRHKSLQMEGQKLINQSLVMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EPNIEDQNRKLTYLRGIYSKKQHKTSCEAGLLHGEEDYLKRHKSLQMEGQKLINQSLVMG
820 830 840 850 860 870
910 920 930 940 950 960
pF1KSD IEVGKSSATNQNTEKVLPPRLNLCPRTSYSSLSSPGTSPSGSSVSSQDSAFSQISEHSVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 IEVGKSSATNQNTEKVLPPRLNLCPRTSYSSLSSPGTSPSGSSVSSQDSAFSQISEHSVF
880 890 900 910 920 930
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD TPTETSSPIDCTFQAQRKREDLSPDFSNASHVSGMPGPSSGQACSRPAYTKKDTMEWHSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TPTETSSPIDCTFQAQRKREDLSPDFSNASHVSGMPGPSSGQACSRPAYTKKDTMEWHSQ
940 950 960 970 980 990
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD MHSVTLHPSTWLRNGVASLKNWSLKKKAKAARPEEEKIASPKGPLEPPPHASGVPEANSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MHSVTLHPSTWLRNGVASLKNWSLKKKAKAARPEEEKIASPKGPLEPPPHASGVPEANSL
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD QEEQKDLPLRAAEGLSPVQSAQRCSSSPFQDSERHCSSPFSLVESRLKLCMKSHEEIEPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 QEEQKDLPLRAAEGLSPVQSAQRCSSSPFQDSERHCSSPFSLVESRLKLCMKSHEEIEPG
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1150 1160 1170 1180 1190
pF1KSD SQSSSGSLPWERASASSWTLEDATSPDSGPTVVCDIEDRYLTKDI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SQSSSGSLPWERASASSWTLEDATSPDSGPTVVCDIEDRYLTKDI
1120 1130 1140 1150
>>CCDS5261.1 TAGAP gene_id:117289|Hs108|chr6 (731 aa)
initn: 590 init1: 459 opt: 642 Z-score: 556.3 bits: 114.2 E(32554): 1.2e-24
Smith-Waterman score: 643; 28.6% identity (61.5% similar) in 538 aa overlap (296-818:18-538)
270 280 290 300 310 320
pF1KSD IKMSHLRDSALLTPGSKDSTTPFNLQEPFLMEQLPREMQCQFILKPSRLAAAQQLSDSGH
:: : : : . .: : :. . ::
CCDS52 MKLRSSHNASKTLNANNMETLI-ECQSEGDIKEHPLLASCESEDSIC
10 20 30 40
330 340 350 360 370 380
pF1KSD KTF--KRRRSIINWAFWRGSSTHLDNLPSSPTSPMPGQLFGISLPNIC-ENDNLPKPVLD
. . :.:.....: : . ... .. . . ..:: : :: ..:.::.:. :
CCDS52 QLIEVKKRKKVLSWPFLMRRLSPASDFSGALETDLKASLFDQPLSIICGDSDTLPRPIQD
50 60 70 80 90 100
390 400 410 420 430 440
pF1KSD MLFFLNQKGPLTKGIFRQSANVKSCRELKEKLNSGVEVHLDCESIFVIASVLKDFLRNIP
.: .: ::: :.::::..:: :. .::::.:::: : :. . ..: :.:::::.::
CCDS52 ILTILCLKGPSTEGIFRRAANEKARKELKEELNSGDAVDLERLPVHLLAVVFKDFLRSIP
110 120 130 140 150 160
450 460 470 480 490 500
pF1KSD GSIFSSDLYDHWVSVMDQGNDEEKINTVQRLLDQLPRANVVLLRYLFGVLHNIEQHSSSN
...::::...:...... ..:..:...... :.::: :..::..: ::: : ..: :
CCDS52 RKLLSSDLFEEWMGALEMQDEEDRIEALKQVADKLPRPNLLLLKHLVYVLHLISKNSEVN
170 180 190 200 210 220
510 520 530 540 550 560
pF1KSD QMTAFNLAVCVAPSILW--PPASSSPELENEFTKKVSLLIQFLIENCLRIFGEEITSLFR
.: . :::.:..:..: : : : ......::. :..:::.::..::::.:
CCDS52 RMDSSNLAICIGPNMLTLENDQSLSFEAQKDLNNKVKTLVEFLIDNCFEIFGENIPVHSS
230 240 250 260 270 280
570 580 590 600 610
pF1KSD EVSVRCDTRENASDISCFQLNDSSYDS----LENELNEDVDAPCSDLVKKLGQGSRSMDS
.: . ..::.: .: :::.::: .:.. . ...: . .. .. ..::
CCDS52 ITSDDSLEHTDSSDVSTLQ-NDSAYDSNDPDVESNSSSGISSPSRQPQVPMATAA-GLDS
290 300 310 320 330 340
620 630 640 650 660 670
pF1KSD VLTLSDYDLD-QPEVEGLL----TLSDFDLAHSKDEDVQMKRPLESKPVNILVYTKIPLR
. . ... .: : . .:.. : .:. . .. :::. .: . .
CCDS52 AGPQDAREVSPEPIVSTVARLKSSLAQPDRRYSEPSMPSSQECLESRVTNQTLTKSEGDF
350 360 370 380 390 400
680 690 700 710 720 730
pF1KSD DHARAPSAMCTPSYLSTAAANAAKSLR-RHRRCSEPSIDYLDSKLSYLREFYQKKLRKSS
:. : . . . .. ... . .: . .: : : . : . .::
CCDS52 PVPRVGSRLESEEAEDPFPEEVFPAVQGKTKRPVDLKIKNLAPGSVLPRALVLKAFSSSS
410 420 430 440 450 460
740 750 760 770 780 790
pF1KSD CDAILSQKDEDYLKQNQPLQEEGKTCFKQSLVTGTDVSKKNATTQNTKKKSLSGSEGNHV
:: :. . . ..: ... .::..: :. :. ... ::.:.: . . :
CCDS52 LDA--SSDSSPVASPSSP--KRNFFSRHQSFTTKTE---KGKPSREIKKHSMSFTFAPHK
470 480 490 500 510
800 810 820 830 840 850
pF1KSD KLFPKSKPVAISVASYSPMSSQDHSKNQPFDVNTSGYSPPHTADALKGPRTHRRCSEPNI
:.. :. .:..: .::: ....
CCDS52 KVLTKN----LSAGSG---KSQDFTRDHVPRGVRKESQLAGRIVQENGCETHNQTARGFC
520 530 540 550 560 570
>>CCDS5263.1 TAGAP gene_id:117289|Hs108|chr6 (266 aa)
initn: 488 init1: 448 opt: 518 Z-score: 456.6 bits: 94.3 E(32554): 4.1e-19
Smith-Waterman score: 518; 36.2% identity (69.9% similar) in 246 aa overlap (296-536:18-262)
270 280 290 300 310 320
pF1KSD IKMSHLRDSALLTPGSKDSTTPFNLQEPFLMEQLPREMQCQFILKPSRLAAAQQLSDSGH
:: : : : . .: : :. . ::
CCDS52 MKLRSSHNASKTLNANNMETLI-ECQSEGDIKEHPLLASCESEDSIC
10 20 30 40
330 340 350 360 370 380
pF1KSD KTF--KRRRSIINWAFWRGSSTHLDNLPSSPTSPMPGQLFGISLPNIC-ENDNLPKPVLD
. . :.:.....: : . ... .. . . ..:: : :: ..:.::.:. :
CCDS52 QLIEVKKRKKVLSWPFLMRRLSPASDFSGALETDLKASLFDQPLSIICGDSDTLPRPIQD
50 60 70 80 90 100
390 400 410 420 430 440
pF1KSD MLFFLNQKGPLTKGIFRQSANVKSCRELKEKLNSGVEVHLDCESIFVIASVLKDFLRNIP
.: .: ::: :.::::..:: :. .::::.:::: : :. . ..: :.:::::.::
CCDS52 ILTILCLKGPSTEGIFRRAANEKARKELKEELNSGDAVDLERLPVHLLAVVFKDFLRSIP
110 120 130 140 150 160
450 460 470 480 490 500
pF1KSD GSIFSSDLYDHWVSVMDQGNDEEKINTVQRLLDQLPRANVVLLRYLFGVLHNIEQHSSSN
...::::...:...... ..:..:...... :.::: :..::..: ::: : ..: :
CCDS52 RKLLSSDLFEEWMGALEMQDEEDRIEALKQVADKLPRPNLLLLKHLVYVLHLISKNSEVN
170 180 190 200 210 220
510 520 530 540 550 560
pF1KSD QMTAFNLAVCVAPSILW--PPASSSPELENEFTKKVSLLIQFLIENCLRIFGEEITSLFR
.: . :::.:..:..: : : : ......::
CCDS52 RMDSSNLAICIGPNMLTLENDQSLSFEAQKDLNNKVCSAY
230 240 250 260
570 580 590 600 610 620
pF1KSD EVSVRCDTRENASDISCFQLNDSSYDSLENELNEDVDAPCSDLVKKLGQGSRSMDSVLTL
>>CCDS14736.1 ARHGAP4 gene_id:393|Hs108|chrX (946 aa)
initn: 252 init1: 220 opt: 375 Z-score: 325.2 bits: 71.8 E(32554): 8.6e-12
Smith-Waterman score: 375; 27.0% identity (59.8% similar) in 333 aa overlap (279-603:421-745)
250 260 270 280 290 300
pF1KSD GKEEAPYPLIGHEYPYGIKMSHLRDSALLTPGSKDSTTPFNLQ---EPFLMEQLPREMQC
:::... . : : : . .: . ..
CCDS14 LEVVASDDGDVLDSFQTSPSTESLKSTSSDPGSRQAGRRRGQQQETETFYLTKLQEYLSG
400 410 420 430 440 450
310 320 330 340 350 360
pF1KSD QFILKPSRLAAAQQLSDSGHKTFKRRRSIINWAFWRGSSTHLDNLPSSPTSPMPGQLFGI
. :: ..: : .. . . . .... ..:. . . . . : :.: . .:::
CCDS14 RSIL--AKLQAKHEKLQEALQRGDKEEQEVSWTQYTQRKFQKSRQPR-PSSQYNQRLFGG
460 470 480 490 500
370 380 390 400 410 420
pF1KSD SLPNICENDNLPKPVL--DMLFFLNQKGPLTKGIFRQSANVKSCRELKEKLNSGVEVHLD
.. .. .... : :.. . . :.: .: .:::: :. :... .. : . ..
CCDS14 DMEKFIQSSGQPVPLVVESCIRFINLNGLQHEGIFRVSGAQLRVSEIRDAFERGEDPLVE
510 520 530 540 550 560
430 440 450 460 470 480
pF1KSD -CES--IFVIASVLKDFLRNIPGSIFSSDLYDHWVSVMDQGNDEEKINTVQRLLDQLPRA
: . . .:.::: ..:.. .: ::. . .. . :... :.::: .::
CCDS14 GCTAHDLDSVAGVLKLYFRSLEPPLFPPDLFGELLASSELEATAERVEHVSRLLWRLPAP
570 580 590 600 610 620
490 500 510 520 530 540
pF1KSD NVVLLRYLFGVLHNIEQHSSSNQMTAFNLAVCVAPSILWPPASSSPELENEFTKKVSLLI
.:.::::: :... :.:. :.: .::::: .:..: ::...: . .:. :.
CCDS14 VLVVLRYLFTFLNHLAQYSDENMMDPYNLAVCFGPTLLPVPAGQDPV---ALQGRVNQLV
630 640 650 660 670 680
550 560 570 580 590 600
pF1KSD QFLIENCLRIFGEEITSLFREVSVRCDTRENASDISCFQLNDSSYDSLENELNEDVDAPC
: :: . :.: .::: : .: . .:: .. ::.. . :. : ::. .. :
CCDS14 QTLIVQPDRVF-PPLTSLPGPVYEKCMAPPSASCLGDAQLESLGADN-EPELEAEMPAQE
690 700 710 720 730 740
610 620 630 640 650 660
pF1KSD SDLVKKLGQGSRSMDSVLTLSDYDLDQPEVEGLLTLSDFDLAHSKDEDVQMKRPLESKPV
.::
CCDS14 DDLEGVVEAVACFAYTGRTAQELSFRRGDVLRLHERASSDWWRGEHNGMRGLIPHKYITL
750 760 770 780 790 800
>>CCDS55540.1 ARHGAP4 gene_id:393|Hs108|chrX (986 aa)
initn: 220 init1: 220 opt: 375 Z-score: 324.9 bits: 71.9 E(32554): 8.9e-12
Smith-Waterman score: 375; 27.0% identity (59.8% similar) in 333 aa overlap (279-603:461-785)
250 260 270 280 290 300
pF1KSD GKEEAPYPLIGHEYPYGIKMSHLRDSALLTPGSKDSTTPFNLQ---EPFLMEQLPREMQC
:::... . : : : . .: . ..
CCDS55 LEVVASDDGDVLDSFQTSPSTESLKSTSSDPGSRQAGRRRGQQQETETFYLTKLQEYLSG
440 450 460 470 480 490
310 320 330 340 350 360
pF1KSD QFILKPSRLAAAQQLSDSGHKTFKRRRSIINWAFWRGSSTHLDNLPSSPTSPMPGQLFGI
. :: ..: : .. . . . .... ..:. . . . . : :.: . .:::
CCDS55 RSIL--AKLQAKHEKLQEALQRGDKEEQEVSWTQYTQRKFQKSRQPR-PSSQYNQRLFGG
500 510 520 530 540
370 380 390 400 410 420
pF1KSD SLPNICENDNLPKPVL--DMLFFLNQKGPLTKGIFRQSANVKSCRELKEKLNSGVEVHLD
.. .. .... : :.. . . :.: .: .:::: :. :... .. : . ..
CCDS55 DMEKFIQSSGQPVPLVVESCIRFINLNGLQHEGIFRVSGAQLRVSEIRDAFERGEDPLVE
550 560 570 580 590 600
430 440 450 460 470 480
pF1KSD -CES--IFVIASVLKDFLRNIPGSIFSSDLYDHWVSVMDQGNDEEKINTVQRLLDQLPRA
: . . .:.::: ..:.. .: ::. . .. . :... :.::: .::
CCDS55 GCTAHDLDSVAGVLKLYFRSLEPPLFPPDLFGELLASSELEATAERVEHVSRLLWRLPAP
610 620 630 640 650 660
490 500 510 520 530 540
pF1KSD NVVLLRYLFGVLHNIEQHSSSNQMTAFNLAVCVAPSILWPPASSSPELENEFTKKVSLLI
.:.::::: :... :.:. :.: .::::: .:..: ::...: . .:. :.
CCDS55 VLVVLRYLFTFLNHLAQYSDENMMDPYNLAVCFGPTLLPVPAGQDPV---ALQGRVNQLV
670 680 690 700 710 720
550 560 570 580 590 600
pF1KSD QFLIENCLRIFGEEITSLFREVSVRCDTRENASDISCFQLNDSSYDSLENELNEDVDAPC
: :: . :.: .::: : .: . .:: .. ::.. . :. : ::. .. :
CCDS55 QTLIVQPDRVF-PPLTSLPGPVYEKCMAPPSASCLGDAQLESLGADN-EPELEAEMPAQE
730 740 750 760 770 780
610 620 630 640 650 660
pF1KSD SDLVKKLGQGSRSMDSVLTLSDYDLDQPEVEGLLTLSDFDLAHSKDEDVQMKRPLESKPV
.::
CCDS55 DDLEGVVEAVACFAYTGRTAQELSFRRGDVLRLHERASSDWWRGEHNGMRGLIPHKYITL
790 800 810 820 830 840
>>CCDS7922.1 ARHGAP1 gene_id:392|Hs108|chr11 (439 aa)
initn: 188 init1: 188 opt: 367 Z-score: 323.5 bits: 70.4 E(32554): 1.1e-11
Smith-Waterman score: 367; 31.1% identity (66.5% similar) in 206 aa overlap (351-551:230-431)
330 340 350 360 370
pF1KSD SDSGHKTFKRRRSIINWAFWRGSSTHLDNLPSSPTSPMPGQLFGISLPNICEND--NLPK
: : :.:.: ::.:: .. :.. . :
CCDS79 KLEQLGIPRQVLKYDDFLKSTQKSPATAPKPMPPRPPLPNQQFGVSLQHLQEKNPEQEPI
200 210 220 230 240 250
380 390 400 410 420 430
pF1KSD PVL--DMLFFLNQKGPLTKGIFRQSANVKSCRELKEKLNSGVEVHLDCES-IFVIASVLK
:.. . . .:. .. :.::::.:::.. ::...: : :. : .: . . . : .::
CCDS79 PIVLRETVAYLQAHALTTEGIFRRSANTQVVREVQQKYNMGLPVDFDQYNELHLPAVILK
260 270 280 290 300 310
440 450 460 470 480 490
pF1KSD DFLRNIPGSIFSSDLYDHWVSVMDQGNDEEKINTVQRLLDQLPRANVVLLRYLFGVLHNI
:::..: ... ::: : :. .. .. ... .. ..:. ::. : .::.: . : .:
CCDS79 TFLRELPEPLLTFDLYPHVVGFLNI-DESQRVPATLQVLQTLPEENYQVLRFLTAFLVQI
320 330 340 350 360 370
500 510 520 530 540 550
pF1KSD EQHSSSNQMTAFNLAVCVAPSILWPPASSSPELENEFTKKVSLLIQFLIENCLRIFGEEI
::..:.:: :::: .:..:: ... . . . .. . .::... ..:
CCDS79 SAHSDQNKMTNTNLAVVFGPNLLW---AKDAAITLKAINPINTFTKFLLDHQGELFPSPD
380 390 400 410 420 430
560 570 580 590 600 610
pF1KSD TSLFREVSVRCDTRENASDISCFQLNDSSYDSLENELNEDVDAPCSDLVKKLGQGSRSMD
CCDS79 PSGL
1191 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 06:05:47 2016 done: Thu Nov 3 06:05:47 2016
Total Scan time: 3.800 Total Display time: 0.250
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]