Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA1387
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1387, 849 aa
1>>>pF1KSDA1387 849 - 849 aa - 849 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0866+/-0.00106; mu= 12.7079+/- 0.064
mean_var=102.0249+/-20.147, 0's: 0 Z-trim(106.1): 14 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.126976
statistics sampled from 8802 (8808) to 8802 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.615), E-opt: 0.2 (0.271), width: 16
Scan time: 4.000
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS46289.1 PPP4R3B gene_id:57223|Hs108|chr2 ( 849) 5529 1023.9 0
CCDS1855.1 PPP4R3B gene_id:57223|Hs108|chr2 ( 764) 3183 594.2 2.9e-169
CCDS62913.1 PPP4R3B gene_id:57223|Hs108|chr2 ( 817) 3183 594.2 3.1e-169
CCDS9895.1 PPP4R3A gene_id:55671|Hs108|chr14 ( 820) 2806 525.1 1.9e-148
CCDS61532.1 PPP4R3A gene_id:55671|Hs108|chr14 ( 594) 1153 222.3 2e-57
>>CCDS46289.1 PPP4R3B gene_id:57223|Hs108|chr2 (849 aa)
initn: 5529 init1: 5529 opt: 5529 Z-score: 5474.2 bits: 1023.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5529; 99.9% identity (100.0% similar) in 849 aa overlap (1-849:1-849)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSDTRRRVKVYTLNEDRQWDDRGTGHVSSTYVEELKGMSLLVRAESDGSLLLESKINPNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MSDTRRRVKVYTLNEDRQWDDRGTGHVSSTYVEELKGMSLLVRAESDGSLLLESKINPNT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD AYQKQQDTLIVWSEAENYDLALSFQEKAGCDEIWEKICQVQGKDPSVEVTQDLIDESEEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 AYQKQQDTLIVWSEAENYDLALSFQEKAGCDEIWEKICQVQGKDPSVEVTQDLIDESEEE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD RFEEMPETSHLIDLPTCELNKLEEIADLVTSVLSSPIRREKLALALENEGYIKKLLQLFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RFEEMPETSHLIDLPTCELNKLEEIADLVTSVLSSPIRREKLALALENEGYIKKLLQLFQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD ACENLENTEGLHHLYEIIRGILFLNKATLFEVMFSDECIMDVVGCLEYDPALAQPKRHRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ACENLENTEGLHHLYEIIRGILFLNKATLFEVMFSDECIMDVVGCLEYDPALAQPKRHRE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD FLTKTAKFKEVIPITDSELRQKIHQTYRVQYIQDIILPTPSVFEENFLSTLTSFIFFNKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 FLTKTAKFKEVIPITDSELRQKIHQTYRVQYIQDIILPTPSVFEENFLSTLTSFIFFNKV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD EIVSMLQEDEKFLSEVFAQLTDEATDDDKRRELVNFFKEFCAFSQTLQPQNRDAFFKTLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EIVSMLQEDEKFLSEVFAQLTDEATDDDKRRELVNFFKEFCAFSQTLQPQNRDAFFKTLA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD KLGILPALEIVMGMDDLQVRSAATDIFSYLVEFSPSMVREFVMQEAQQSDDDILLINVVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KLGILPALEIVMGMDDLQVRSAATDIFSYLVEFSPSMVREFVMQEAQQSDDDILLINVVI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD EQMICDTDPELGGAVQLMGLLRTLIDPENMLATTNKTEKSEFLNFFYNHCMHVLTAPLLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EQMICDTDPELGGAVQLMGLLRTLIDPENMLATTNKTEKSEFLNFFYNHCMHVLTAPLLT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD NTSEDKCEKDFFLKHYRYSWSFVCTPSHSHSHSTPSSSISQDNIVGSNKNNTICPDNYQT
::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 NTSEDKCEKDFFLKHYRYSWSFICTPSHSHSHSTPSSSISQDNIVGSNKNNTICPDNYQT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD AQLLALILELLTFCVEHHTYHIKNYIMNKDLLRRVLVLMNSKHTFLALCALRFMRRIIGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 AQLLALILELLTFCVEHHTYHIKNYIMNKDLLRRVLVLMNSKHTFLALCALRFMRRIIGL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD KDEFYNRYITKGNLFEPVINALLDNGTRYNLLNSAVIELFEFIRVEDIKSLTAHIVENFY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KDEFYNRYITKGNLFEPVINALLDNGTRYNLLNSAVIELFEFIRVEDIKSLTAHIVENFY
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD KALESIEYVQTFKGLKTKYEQEKDRQNQKLNSVPSILRSNRFRRDAKALEEDEEMWFNED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KALESIEYVQTFKGLKTKYEQEKDRQNQKLNSVPSILRSNRFRRDAKALEEDEEMWFNED
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD EEEEGKAVVAPVEKPKPEDDFPDNYEKFMETKKAKESEDKENLPKRTSPGGFKFTFSHSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EEEEGKAVVAPVEKPKPEDDFPDNYEKFMETKKAKESEDKENLPKRTSPGGFKFTFSHSA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD SAANGTNSKSVVAQIPPATSNGSSSKTTNLPTSVTATKGSLVGLVDYPDDEEEDEEEESS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SAANGTNSKSVVAQIPPATSNGSSSKTTNLPTSVTATKGSLVGLVDYPDDEEEDEEEESS
790 800 810 820 830 840
pF1KSD PRKRPRLGS
:::::::::
CCDS46 PRKRPRLGS
>>CCDS1855.1 PPP4R3B gene_id:57223|Hs108|chr2 (764 aa)
initn: 4843 init1: 3183 opt: 3183 Z-score: 3152.3 bits: 594.2 E(32554): 2.9e-169
Smith-Waterman score: 4756; 89.9% identity (89.9% similar) in 849 aa overlap (1-849:1-764)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSDTRRRVKVYTLNEDRQWDDRGTGHVSSTYVEELKGMSLLVRAESDGSLLLESKINPNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 MSDTRRRVKVYTLNEDRQWDDRGTGHVSSTYVEELKGMSLLVRAESDGSLLLESKINPNT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD AYQKQQDTLIVWSEAENYDLALSFQEKAGCDEIWEKICQVQGKDPSVEVTQDLIDESEEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 AYQKQQDTLIVWSEAENYDLALSFQEKAGCDEIWEKICQVQGKDPSVEVTQDLIDESEEE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD RFEEMPETSHLIDLPTCELNKLEEIADLVTSVLSSPIRREKLALALENEGYIKKLLQLFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 RFEEMPETSHLIDLPTCELNKLEEIADLVTSVLSSPIRREKLALALENEGYIKKLLQLFQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD ACENLENTEGLHHLYEIIRGILFLNKATLFEVMFSDECIMDVVGCLEYDPALAQPKRHRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 ACENLENTEGLHHLYEIIRGILFLNKATLFEVMFSDECIMDVVGCLEYDPALAQPKRHRE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD FLTKTAKFKEVIPITDSELRQKIHQTYRVQYIQDIILPTPSVFEENFLSTLTSFIFFNKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 FLTKTAKFKEVIPITDSELRQKIHQTYRVQYIQDIILPTPSVFEENFLSTLTSFIFFNKV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD EIVSMLQEDEKFLSEVFAQLTDEATDDDKRRELVNFFKEFCAFSQTLQPQNRDAFFKTLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 EIVSMLQEDEKFLSEVFAQLTDEATDDDKRRELVNFFKEFCAFSQTLQPQNRDAFFKTLA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD KLGILPALEIVMGMDDLQVRSAATDIFSYLVEFSPSMVREFVMQEAQQSDDDILLINVVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 KLGILPALEIVMGMDDLQVRSAATDIFSYLVEFSPSMVREFVMQEAQQSDDDILLINVVI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD EQMICDTDPELGGAVQLMGLLRTLIDPENMLATTNKTEKSEFLNFFYNHCMHVLTAPLLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 EQMICDTDPELGGAVQLMGLLRTLIDPENMLATTNKTEKSEFLNFFYNHCMHVLTAPLLT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD NTSEDKCEKDFFLKHYRYSWSFVCTPSHSHSHSTPSSSISQDNIVGSNKNNTICPDNYQT
:::::::::: :::::::::::::
CCDS18 NTSEDKCEKD--------------------------------NIVGSNKNNTICPG----
490 500
550 560 570 580 590 600
pF1KSD AQLLALILELLTFCVEHHTYHIKNYIMNKDLLRRVLVLMNSKHTFLALCALRFMRRIIGL
:::::::::::
CCDS18 -------------------------------------------------ALRFMRRIIGL
510
610 620 630 640 650 660
pF1KSD KDEFYNRYITKGNLFEPVINALLDNGTRYNLLNSAVIELFEFIRVEDIKSLTAHIVENFY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 KDEFYNRYITKGNLFEPVINALLDNGTRYNLLNSAVIELFEFIRVEDIKSLTAHIVENFY
520 530 540 550 560 570
670 680 690 700 710 720
pF1KSD KALESIEYVQTFKGLKTKYEQEKDRQNQKLNSVPSILRSNRFRRDAKALEEDEEMWFNED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 KALESIEYVQTFKGLKTKYEQEKDRQNQKLNSVPSILRSNRFRRDAKALEEDEEMWFNED
580 590 600 610 620 630
730 740 750 760 770 780
pF1KSD EEEEGKAVVAPVEKPKPEDDFPDNYEKFMETKKAKESEDKENLPKRTSPGGFKFTFSHSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 EEEEGKAVVAPVEKPKPEDDFPDNYEKFMETKKAKESEDKENLPKRTSPGGFKFTFSHSA
640 650 660 670 680 690
790 800 810 820 830 840
pF1KSD SAANGTNSKSVVAQIPPATSNGSSSKTTNLPTSVTATKGSLVGLVDYPDDEEEDEEEESS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 SAANGTNSKSVVAQIPPATSNGSSSKTTNLPTSVTATKGSLVGLVDYPDDEEEDEEEESS
700 710 720 730 740 750
pF1KSD PRKRPRLGS
:::::::::
CCDS18 PRKRPRLGS
760
>>CCDS62913.1 PPP4R3B gene_id:57223|Hs108|chr2 (817 aa)
initn: 3217 init1: 3183 opt: 3183 Z-score: 3151.8 bits: 594.2 E(32554): 3.1e-169
Smith-Waterman score: 5225; 96.2% identity (96.2% similar) in 849 aa overlap (1-849:1-817)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSDTRRRVKVYTLNEDRQWDDRGTGHVSSTYVEELKGMSLLVRAESDGSLLLESKINPNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 MSDTRRRVKVYTLNEDRQWDDRGTGHVSSTYVEELKGMSLLVRAESDGSLLLESKINPNT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD AYQKQQDTLIVWSEAENYDLALSFQEKAGCDEIWEKICQVQGKDPSVEVTQDLIDESEEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 AYQKQQDTLIVWSEAENYDLALSFQEKAGCDEIWEKICQVQGKDPSVEVTQDLIDESEEE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD RFEEMPETSHLIDLPTCELNKLEEIADLVTSVLSSPIRREKLALALENEGYIKKLLQLFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 RFEEMPETSHLIDLPTCELNKLEEIADLVTSVLSSPIRREKLALALENEGYIKKLLQLFQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD ACENLENTEGLHHLYEIIRGILFLNKATLFEVMFSDECIMDVVGCLEYDPALAQPKRHRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 ACENLENTEGLHHLYEIIRGILFLNKATLFEVMFSDECIMDVVGCLEYDPALAQPKRHRE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD FLTKTAKFKEVIPITDSELRQKIHQTYRVQYIQDIILPTPSVFEENFLSTLTSFIFFNKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 FLTKTAKFKEVIPITDSELRQKIHQTYRVQYIQDIILPTPSVFEENFLSTLTSFIFFNKV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD EIVSMLQEDEKFLSEVFAQLTDEATDDDKRRELVNFFKEFCAFSQTLQPQNRDAFFKTLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 EIVSMLQEDEKFLSEVFAQLTDEATDDDKRRELVNFFKEFCAFSQTLQPQNRDAFFKTLA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD KLGILPALEIVMGMDDLQVRSAATDIFSYLVEFSPSMVREFVMQEAQQSDDDILLINVVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 KLGILPALEIVMGMDDLQVRSAATDIFSYLVEFSPSMVREFVMQEAQQSDDDILLINVVI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD EQMICDTDPELGGAVQLMGLLRTLIDPENMLATTNKTEKSEFLNFFYNHCMHVLTAPLLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 EQMICDTDPELGGAVQLMGLLRTLIDPENMLATTNKTEKSEFLNFFYNHCMHVLTAPLLT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD NTSEDKCEKDFFLKHYRYSWSFVCTPSHSHSHSTPSSSISQDNIVGSNKNNTICPDNYQT
:::::::::: ::::::::::::::::::
CCDS62 NTSEDKCEKD--------------------------------NIVGSNKNNTICPDNYQT
490 500
550 560 570 580 590 600
pF1KSD AQLLALILELLTFCVEHHTYHIKNYIMNKDLLRRVLVLMNSKHTFLALCALRFMRRIIGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 AQLLALILELLTFCVEHHTYHIKNYIMNKDLLRRVLVLMNSKHTFLALCALRFMRRIIGL
510 520 530 540 550 560
610 620 630 640 650 660
pF1KSD KDEFYNRYITKGNLFEPVINALLDNGTRYNLLNSAVIELFEFIRVEDIKSLTAHIVENFY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 KDEFYNRYITKGNLFEPVINALLDNGTRYNLLNSAVIELFEFIRVEDIKSLTAHIVENFY
570 580 590 600 610 620
670 680 690 700 710 720
pF1KSD KALESIEYVQTFKGLKTKYEQEKDRQNQKLNSVPSILRSNRFRRDAKALEEDEEMWFNED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 KALESIEYVQTFKGLKTKYEQEKDRQNQKLNSVPSILRSNRFRRDAKALEEDEEMWFNED
630 640 650 660 670 680
730 740 750 760 770 780
pF1KSD EEEEGKAVVAPVEKPKPEDDFPDNYEKFMETKKAKESEDKENLPKRTSPGGFKFTFSHSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 EEEEGKAVVAPVEKPKPEDDFPDNYEKFMETKKAKESEDKENLPKRTSPGGFKFTFSHSA
690 700 710 720 730 740
790 800 810 820 830 840
pF1KSD SAANGTNSKSVVAQIPPATSNGSSSKTTNLPTSVTATKGSLVGLVDYPDDEEEDEEEESS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 SAANGTNSKSVVAQIPPATSNGSSSKTTNLPTSVTATKGSLVGLVDYPDDEEEDEEEESS
750 760 770 780 790 800
pF1KSD PRKRPRLGS
:::::::::
CCDS62 PRKRPRLGS
810
>>CCDS9895.1 PPP4R3A gene_id:55671|Hs108|chr14 (820 aa)
initn: 3206 init1: 2023 opt: 2806 Z-score: 2778.6 bits: 525.1 E(32554): 1.9e-148
Smith-Waterman score: 3956; 71.8% identity (87.4% similar) in 862 aa overlap (1-845:1-811)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSDTRRRVKVYTLNEDRQWDDRGTGHVSSTYVEELKGMSLLVRAESDGSLLLESKINPNT
:.::::::::::::::::::::::::::: :::.::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 MTDTRRRVKVYTLNEDRQWDDRGTGHVSSGYVERLKGMSLLVRAESDGSLLLESKINPNT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD AYQKQQDTLIVWSEAENYDLALSFQEKAGCDEIWEKICQVQGKDPSVEVTQDLIDESEEE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..::::.::::::
CCDS98 AYQKQQDTLIVWSEAENYDLALSFQEKAGCDEIWEKICQVQGKDPSVDITQDLVDESEEE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD RFEEMPETSHLIDLPTCELNKLEEIADLVTSVLSSPIRREKLALALENEGYIKKLLQLFQ
::..: .: ..::.:::..:::::.::.: : ::.:::::::::::::::::::.::.
CCDS98 RFDDM--SSPGLELPSCELSRLEEIAELVASSLPSPLRREKLALALENEGYIKKLLELFH
130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KSD ACENLENTEGLHHLYEIIRGILFLNKATLFEVMFSDECIMDVVGCLEYDPALAQPKRHRE
.::.::: ::::::::::.::..::...:::::::.::::::.:::::::::.::..:::
CCDS98 VCEDLENIEGLHHLYEIIKGIFLLNRTALFEVMFSEECIMDVIGCLEYDPALSQPRKHRE
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KSD FLTKTAKFKEVIPITDSELRQKIHQTYRVQYIQDIILPTPSVFEENFLSTLTSFIFFNKV
::::::::::::::.: ::.::::::::::::::..::::::::::.:::: ::::::::
CCDS98 FLTKTAKFKEVIPISDPELKQKIHQTYRVQYIQDMVLPTPSVFEENMLSTLHSFIFFNKV
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KSD EIVSMLQEDEKFLSEVFAQLTDEATDDDKRRELVNFFKEFCAFSQTLQPQNRDAFFKTLA
:::.:::::::::...::::::::::..::.:::::.::::::::::::::::::::::.
CCDS98 EIVGMLQEDEKFLTDLFAQLTDEATDEEKRQELVNFLKEFCAFSQTLQPQNRDAFFKTLS
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KSD KLGILPALEIVMGMDDLQVRSAATDIFSYLVEFSPSMVREFVMQEAQQSDDDILLINVVI
..:::::::...:::: :::::::::::::::..::::::::::::::.::::::::..:
CCDS98 NMGILPALEVILGMDDTQVRSAATDIFSYLVEYNPSMVREFVMQEAQQNDDDILLINLII
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KSD EQMICDTDPELGGAVQLMGLLRTLIDPENMLATTNKTEKSEFLNFFYNHCMHVLTAPLLT
:.::::::::::::::::::::::.::::::::.:::::.:::.:::.:::::::::::.
CCDS98 EHMICDTDPELGGAVQLMGLLRTLVDPENMLATANKTEKTEFLGFFYKHCMHVLTAPLLA
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KSD NTSEDKCEKDFFLKHYRYSWSFVCTPSHSHSHSTPSSSISQDNIVGSNKNNTICPDNYQT
::.::: ::. :..::
CCDS98 NTTEDK-------------------PSK---------------------------DDFQT
480 490
550 560 570 580 590 600
pF1KSD AQLLALILELLTFCVEHHTYHIKNYIMNKDLLRRVLVLMNSKHTFLALCALRFMRRIIGL
::::::.:::::::::::::::::::.:::.:::::::: :::.::::::::: :.::::
CCDS98 AQLLALVLELLTFCVEHHTYHIKNYIINKDILRRVLVLMASKHAFLALCALRFKRKIIGL
500 510 520 530 540 550
610 620 630 640 650 660
pF1KSD KDEFYNRYITKGNLFEPVINALLDNGTRYNLLNSAVIELFEFIRVEDIKSLTAHIVENFY
::::::::: :. :::::..:.:.::.::::.:::.::.:::::::::::::::..::..
CCDS98 KDEFYNRYIMKSFLFEPVVKAFLNNGSRYNLMNSAIIEMFEFIRVEDIKSLTAHVIENYW
560 570 580 590 600 610
670 680 690 700 710
pF1KSD KALESIEYVQTFKGLKTKYEQEKDRQ-NQKLNSVPSILRSNRFRRDAKALEEDEEMWFNE
::::...::::::::: ..::...:: : ::.:. ::::..:.::::..::..::::::
CCDS98 KALEDVDYVQTFKGLKLRFEQQRERQDNPKLDSMRSILRNHRYRRDARTLEDEEEMWFNT
620 630 640 650 660 670
720 730 740 750 760 770
pF1KSD DEE--EEGKAVVAPVEKPKPEDDFPDNYEKFMETKKAKESEDKE-----NLPKRTSPGGF
::. :.:.:::.: .: : .::. : :::: :: ::::.:: :: : ::. :
CCDS98 DEDDMEDGEAVVSPSDKTKNDDDIMDPISKFMERKKLKESEEKEVLLKTNLSGRQSPS-F
680 690 700 710 720 730
780 790 800 810 820
pF1KSD KFTFSHSASAANGTNSKSVVAQIP--PAT--SNGSSSKTTNLP--TSVTA---TKGSLVG
:...: :.. .: : :.: ....: :.. : :: .. ..: :: :: :::.:::
CCDS98 KLSLS-SGTKTNLT-SQSSTTNLPGSPGSPGSPGSPGSPGSVPKNTSQTAAITTKGGLVG
740 750 760 770 780
830 840
pF1KSD LVDYPDDEEEDEEEESSPRKRPRLGS
:::::::.:.:.:.:.. :
CCDS98 LVDYPDDDEDDDEDEDKEDTLPLSKKAKFDS
790 800 810 820
>>CCDS61532.1 PPP4R3A gene_id:55671|Hs108|chr14 (594 aa)
initn: 1657 init1: 834 opt: 1153 Z-score: 1144.3 bits: 222.3 E(32554): 2e-57
Smith-Waterman score: 2177; 63.3% identity (80.3% similar) in 569 aa overlap (307-845:66-585)
280 290 300 310 320 330
pF1KSD LPTPSVFEENFLSTLTSFIFFNKVEIVSMLQEDEKFLSEVFAQLTDEATDDDKRRELVNF
:::::::...::::::::::..::.:::::
CCDS61 KGMSLLVRAESDGSLLLESKINPNTAYQKQQEDEKFLTDLFAQLTDEATDEEKRQELVNF
40 50 60 70 80 90
340 350 360 370 380 390
pF1KSD FKEFCAFSQTLQPQNRDAFFKTLAKLGILPALEIVMGMDDLQVRSAATDIFSYLVEFSPS
.::::::::::::::::::::::...:::::::...:::: :::::::::::::::..::
CCDS61 LKEFCAFSQTLQPQNRDAFFKTLSNMGILPALEVILGMDDTQVRSAATDIFSYLVEYNPS
100 110 120 130 140 150
400 410 420 430 440
pF1KSD MVREFVMQEAQQSDD-------------DILLINVVIEQMICDTDPELGGAVQLMGLLRT
::::::::::::.:: ::::::..::.:::::::::::::::::::::
CCDS61 MVREFVMQEAQQNDDVSKKLTEQKITSKDILLINLIIEHMICDTDPELGGAVQLMGLLRT
160 170 180 190 200 210
450 460 470 480 490 500
pF1KSD LIDPENMLATTNKTEKSEFLNFFYNHCMHVLTAPLLTNTSEDKCEKDFFLKHYRYSWSFV
:.::::::::.:::::.:::.:::.:::::::::::.::.:::
CCDS61 LVDPENMLATANKTEKTEFLGFFYKHCMHVLTAPLLANTTEDK-----------------
220 230 240 250
510 520 530 540 550 560
pF1KSD CTPSHSHSHSTPSSSISQDNIVGSNKNNTICPDNYQTAQLLALILELLTFCVEHHTYHIK
::. :..::::::::.::::::::::::::::
CCDS61 --PSK---------------------------DDFQTAQLLALVLELLTFCVEHHTYHIK
260 270 280
570 580 590 600 610 620
pF1KSD NYIMNKDLLRRVLVLMNSKHTFLALCALRFMRRIIGLKDEFYNRYITKGNLFEPVINALL
:::.:::.:::::::: :::.::::::::: :.::::::::::::: :. :::::..:.:
CCDS61 NYIINKDILRRVLVLMASKHAFLALCALRFKRKIIGLKDEFYNRYIMKSFLFEPVVKAFL
290 300 310 320 330 340
630 640 650 660 670 680
pF1KSD DNGTRYNLLNSAVIELFEFIRVEDIKSLTAHIVENFYKALESIEYVQTFKGLKTKYEQEK
.::.::::.:::.::.:::::::::::::::..::..::::...::::::::: ..::..
CCDS61 NNGSRYNLMNSAIIEMFEFIRVEDIKSLTAHVIENYWKALEDVDYVQTFKGLKLRFEQQR
350 360 370 380 390 400
690 700 710 720 730 740
pF1KSD DRQ-NQKLNSVPSILRSNRFRRDAKALEEDEEMWFNEDEE--EEGKAVVAPVEKPKPEDD
.:: : ::.:. ::::..:.::::..::..:::::: ::. :.:.:::.: .: : .::
CCDS61 ERQDNPKLDSMRSILRNHRYRRDARTLEDEEEMWFNTDEDDMEDGEAVVSPSDKTKNDDD
410 420 430 440 450 460
750 760 770 780 790
pF1KSD FPDNYEKFMETKKAKESEDKE-----NLPKRTSPGGFKFTFSHSASAANGTNSKSVVAQI
. : :::: :: ::::.:: :: : ::. ::...: :.. .: : :.: ....
CCDS61 IMDPISKFMERKKLKESEEKEVLLKTNLSGRQSPS-FKLSLS-SGTKTNLT-SQSSTTNL
470 480 490 500 510 520
800 810 820 830 840
pF1KSD P--PAT--SNGSSSKTTNLP--TSVTA---TKGSLVGLVDYPDDEEEDEEEESSPRKRPR
: :.. : :: .. ..: :: :: :::.::::::::::.:.:.:.:.. :
CCDS61 PGSPGSPGSPGSPGSPGSVPKNTSQTAAITTKGGLVGLVDYPDDDEDDDEDEDKEDTLPL
530 540 550 560 570 580
pF1KSD LGS
CCDS61 SKKAKFDS
590
>--
initn: 402 init1: 402 opt: 402 Z-score: 400.8 bits: 84.7 E(32554): 5.3e-16
Smith-Waterman score: 402; 95.4% identity (98.5% similar) in 65 aa overlap (1-65:1-65)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSDTRRRVKVYTLNEDRQWDDRGTGHVSSTYVEELKGMSLLVRAESDGSLLLESKINPNT
:.::::::::::::::::::::::::::: :::.::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 MTDTRRRVKVYTLNEDRQWDDRGTGHVSSGYVERLKGMSLLVRAESDGSLLLESKINPNT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD AYQKQQDTLIVWSEAENYDLALSFQEKAGCDEIWEKICQVQGKDPSVEVTQDLIDESEEE
:::::
CCDS61 AYQKQQEDEKFLTDLFAQLTDEATDEEKRQELVNFLKEFCAFSQTLQPQNRDAFFKTLSN
70 80 90 100 110 120
849 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 06:04:17 2016 done: Thu Nov 3 06:04:18 2016
Total Scan time: 4.000 Total Display time: 0.140
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]