FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1382, 506 aa
1>>>pF1KSDA1382 506 - 506 aa - 506 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8737+/-0.000503; mu= 20.5913+/- 0.031
mean_var=69.8883+/-14.935, 0's: 0 Z-trim(107.2): 121 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.153416
statistics sampled from 15118 (15246) to 15118 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.509), E-opt: 0.2 (0.179), width: 16
Scan time: 9.400
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_061849 (OMIM: 605180) sodium-coupled neutral am ( 506) 3232 725.4 9.7e-209
NP_001294865 (OMIM: 605180) sodium-coupled neutral ( 406) 2558 576.1 6.6e-164
NP_006832 (OMIM: 604437) sodium-coupled neutral am ( 504) 1668 379.2 1.5e-104
XP_006713017 (OMIM: 604437) PREDICTED: sodium-coup ( 504) 1668 379.2 1.5e-104
NP_001137296 (OMIM: 608065) sodium-coupled neutral ( 547) 1006 232.7 2.1e-60
NP_060488 (OMIM: 608065) sodium-coupled neutral am ( 547) 1006 232.7 2.1e-60
XP_005269054 (OMIM: 608065) PREDICTED: sodium-coup ( 547) 1006 232.7 2.1e-60
XP_016875479 (OMIM: 608490) PREDICTED: sodium-coup ( 456) 786 183.9 8.4e-46
XP_011537089 (OMIM: 608490) PREDICTED: sodium-coup ( 456) 786 183.9 8.4e-46
XP_011537088 (OMIM: 608490) PREDICTED: sodium-coup ( 478) 786 184.0 8.7e-46
NP_001265316 (OMIM: 608490) sodium-coupled neutral ( 487) 786 184.0 8.8e-46
NP_001070952 (OMIM: 608490) sodium-coupled neutral ( 487) 786 184.0 8.8e-46
NP_001265318 (OMIM: 608490) sodium-coupled neutral ( 487) 786 184.0 8.8e-46
NP_109599 (OMIM: 608490) sodium-coupled neutral am ( 487) 786 184.0 8.8e-46
NP_001265317 (OMIM: 608490) sodium-coupled neutral ( 487) 786 184.0 8.8e-46
XP_011537086 (OMIM: 608490) PREDICTED: sodium-coup ( 497) 786 184.0 8.9e-46
NP_001265319 (OMIM: 608490) sodium-coupled neutral ( 503) 786 184.0 9e-46
XP_006720113 (OMIM: 616518) PREDICTED: probable so ( 255) 726 170.4 5.4e-42
NP_722518 (OMIM: 616518) probable sodium-coupled n ( 456) 726 170.7 8.3e-42
NP_277053 (OMIM: 300649) sodium-coupled neutral am ( 472) 709 166.9 1.2e-40
XP_016885450 (OMIM: 300649) PREDICTED: sodium-coup ( 472) 709 166.9 1.2e-40
XP_016885449 (OMIM: 300649) PREDICTED: sodium-coup ( 478) 709 166.9 1.2e-40
XP_005272755 (OMIM: 300649) PREDICTED: sodium-coup ( 492) 709 166.9 1.2e-40
XP_006724632 (OMIM: 300649) PREDICTED: sodium-coup ( 492) 709 166.9 1.2e-40
XP_005272754 (OMIM: 300649) PREDICTED: sodium-coup ( 498) 709 166.9 1.2e-40
XP_005272752 (OMIM: 300649) PREDICTED: sodium-coup ( 519) 709 166.9 1.2e-40
XP_005272751 (OMIM: 300649) PREDICTED: sodium-coup ( 539) 709 167.0 1.3e-40
NP_001166173 (OMIM: 616518) probable sodium-couple ( 521) 657 155.4 3.6e-37
XP_016876517 (OMIM: 616518) PREDICTED: probable so ( 258) 645 152.5 1.4e-36
XP_016876516 (OMIM: 616518) PREDICTED: probable so ( 258) 645 152.5 1.4e-36
XP_016876512 (OMIM: 616518) PREDICTED: probable so ( 435) 646 152.9 1.7e-36
XP_016876514 (OMIM: 616518) PREDICTED: probable so ( 405) 645 152.7 1.9e-36
XP_016876515 (OMIM: 616518) PREDICTED: probable so ( 405) 645 152.7 1.9e-36
XP_016876511 (OMIM: 616518) PREDICTED: probable so ( 436) 645 152.7 2e-36
XP_016876509 (OMIM: 616518) PREDICTED: probable so ( 459) 645 152.7 2.1e-36
XP_016876513 (OMIM: 616518) PREDICTED: probable so ( 419) 609 144.7 4.9e-34
XP_016876510 (OMIM: 616518) PREDICTED: probable so ( 441) 601 143.0 1.7e-33
XP_006720112 (OMIM: 616518) PREDICTED: probable so ( 309) 597 142.0 2.5e-33
XP_011534771 (OMIM: 616518) PREDICTED: probable so ( 348) 597 142.0 2.7e-33
NP_612637 (OMIM: 616525) putative sodium-coupled n ( 780) 317 80.3 2.2e-14
XP_011522592 (OMIM: 616525) PREDICTED: putative so (1045) 317 80.4 2.8e-14
NP_001033073 (OMIM: 616525) putative sodium-couple (1119) 317 80.5 2.9e-14
XP_011522591 (OMIM: 616525) PREDICTED: putative so (1126) 317 80.5 2.9e-14
XP_005257076 (OMIM: 616525) PREDICTED: putative so (1127) 317 80.5 2.9e-14
XP_011522590 (OMIM: 616525) PREDICTED: putative so (1134) 317 80.5 2.9e-14
XP_006712400 (OMIM: 616526) PREDICTED: putative so ( 408) 283 72.6 2.5e-12
XP_016858951 (OMIM: 616526) PREDICTED: putative so ( 395) 274 70.6 9.8e-12
XP_016858950 (OMIM: 616526) PREDICTED: putative so ( 397) 274 70.6 9.8e-12
XP_016858949 (OMIM: 616526) PREDICTED: putative so ( 408) 274 70.6 1e-11
XP_005246407 (OMIM: 616526) PREDICTED: putative so ( 462) 274 70.6 1.1e-11
>>NP_061849 (OMIM: 605180) sodium-coupled neutral amino (506 aa)
initn: 3232 init1: 3232 opt: 3232 Z-score: 3868.6 bits: 725.4 E(85289): 9.7e-209
Smith-Waterman score: 3232; 100.0% identity (100.0% similar) in 506 aa overlap (1-506:1-506)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MKKAEMGRFSISPDEDSSSYSSNSDFNYSYPTKQAALKSHYADVDPENQNFLLESNLGKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 MKKAEMGRFSISPDEDSSSYSSNSDFNYSYPTKQAALKSHYADVDPENQNFLLESNLGKK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD KYETEFHPGTTSFGMSVFNLSNAIVGSGILGLSYAMANTGIALFIILLTFVSIFSLYSVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 KYETEFHPGTTSFGMSVFNLSNAIVGSGILGLSYAMANTGIALFIILLTFVSIFSLYSVH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LLLKTANEGGSLLYEQLGYKAFGLVGKLAASGSITMQNIGAMSSYLFIVKYELPLVIQAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 LLLKTANEGGSLLYEQLGYKAFGLVGKLAASGSITMQNIGAMSSYLFIVKYELPLVIQAL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD TNIEDKTGLWYLNGNYLVLLVSLVVILPLSLFRNLGYLGYTSGLSLLCMVFFLIVVICKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 TNIEDKTGLWYLNGNYLVLLVSLVVILPLSLFRNLGYLGYTSGLSLLCMVFFLIVVICKK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD FQVPCPVEAALIINETINTTLTQPTALVPALSHNVTENDSCRPHYFIFNSQTVYAVPILI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 FQVPCPVEAALIINETINTTLTQPTALVPALSHNVTENDSCRPHYFIFNSQTVYAVPILI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD FSFVCHPAVLPIYEELKDRSRRRMMNVSKISFFAMFLMYLLAALFGYLTFYEHVESELLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 FSFVCHPAVLPIYEELKDRSRRRMMNVSKISFFAMFLMYLLAALFGYLTFYEHVESELLH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD TYSSILGTDILLLIVRLAVLMAVTLTVPVVIFPIRSSVTHLLCASKDFSWWRHSLITVSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 TYSSILGTDILLLIVRLAVLMAVTLTVPVVIFPIRSSVTHLLCASKDFSWWRHSLITVSI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD LAFTNLLVIFVPTIRDIFGFIGASAASMLIFILPSAFYIKLVKKEPMKSVQKIGALFFLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 LAFTNLLVIFVPTIRDIFGFIGASAASMLIFILPSAFYIKLVKKEPMKSVQKIGALFFLL
430 440 450 460 470 480
490 500
pF1KSD SGVLVMTGSMALIVLDWVHNAPGGGH
::::::::::::::::::::::::::
NP_061 SGVLVMTGSMALIVLDWVHNAPGGGH
490 500
>>NP_001294865 (OMIM: 605180) sodium-coupled neutral ami (406 aa)
initn: 2558 init1: 2558 opt: 2558 Z-score: 3063.6 bits: 576.1 E(85289): 6.6e-164
Smith-Waterman score: 2558; 99.8% identity (100.0% similar) in 402 aa overlap (105-506:5-406)
80 90 100 110 120 130
pF1KSD MSVFNLSNAIVGSGILGLSYAMANTGIALFIILLTFVSIFSLYSVHLLLKTANEGGSLLY
.:::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MKQNLILLTFVSIFSLYSVHLLLKTANEGGSLLY
10 20 30
140 150 160 170 180 190
pF1KSD EQLGYKAFGLVGKLAASGSITMQNIGAMSSYLFIVKYELPLVIQALTNIEDKTGLWYLNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EQLGYKAFGLVGKLAASGSITMQNIGAMSSYLFIVKYELPLVIQALTNIEDKTGLWYLNG
40 50 60 70 80 90
200 210 220 230 240 250
pF1KSD NYLVLLVSLVVILPLSLFRNLGYLGYTSGLSLLCMVFFLIVVICKKFQVPCPVEAALIIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NYLVLLVSLVVILPLSLFRNLGYLGYTSGLSLLCMVFFLIVVICKKFQVPCPVEAALIIN
100 110 120 130 140 150
260 270 280 290 300 310
pF1KSD ETINTTLTQPTALVPALSHNVTENDSCRPHYFIFNSQTVYAVPILIFSFVCHPAVLPIYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ETINTTLTQPTALVPALSHNVTENDSCRPHYFIFNSQTVYAVPILIFSFVCHPAVLPIYE
160 170 180 190 200 210
320 330 340 350 360 370
pF1KSD ELKDRSRRRMMNVSKISFFAMFLMYLLAALFGYLTFYEHVESELLHTYSSILGTDILLLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ELKDRSRRRMMNVSKISFFAMFLMYLLAALFGYLTFYEHVESELLHTYSSILGTDILLLI
220 230 240 250 260 270
380 390 400 410 420 430
pF1KSD VRLAVLMAVTLTVPVVIFPIRSSVTHLLCASKDFSWWRHSLITVSILAFTNLLVIFVPTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VRLAVLMAVTLTVPVVIFPIRSSVTHLLCASKDFSWWRHSLITVSILAFTNLLVIFVPTI
280 290 300 310 320 330
440 450 460 470 480 490
pF1KSD RDIFGFIGASAASMLIFILPSAFYIKLVKKEPMKSVQKIGALFFLLSGVLVMTGSMALIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RDIFGFIGASAASMLIFILPSAFYIKLVKKEPMKSVQKIGALFFLLSGVLVMTGSMALIV
340 350 360 370 380 390
500
pF1KSD LDWVHNAPGGGH
::::::::::::
NP_001 LDWVHNAPGGGH
400
>>NP_006832 (OMIM: 604437) sodium-coupled neutral amino (504 aa)
initn: 1531 init1: 826 opt: 1668 Z-score: 1997.8 bits: 379.2 E(85289): 1.5e-104
Smith-Waterman score: 1668; 56.7% identity (81.7% similar) in 464 aa overlap (47-506:44-504)
20 30 40 50 60 70
pF1KSD SSSYSSNSDFNYSYPTKQAALKSHYADVDPENQNFLLESNLGKKKYETEFHPGTTSFGMS
:...:: .: .:. . :.:. : ::::::
NP_006 PNGKHSEGLLPVITPMAGNQRVEDPARSCMEGKSFLQKSP-SKEPHFTDFE-GKTSFGMS
20 30 40 50 60 70
80 90 100 110 120 130
pF1KSD VFNLSNAIVGSGILGLSYAMANTGIALFIILLTFVSIFSLYSVHLLLKTANEGGSLLYEQ
::::::::.:::::::.:::::::: ::..::: :...: ::.:::::... : :::
NP_006 VFNLSNAIMGSGILGLAYAMANTGIILFLFLLTAVALLSSYSIHLLLKSSGVVGIRAYEQ
80 90 100 110 120 130
140 150 160 170 180 190
pF1KSD LGYKAFGLVGKLAASGSITMQNIGAMSSYLFIVKYELPLVIQALTNIEDKTGLWYLNGNY
:::.::: :::::. .::.::::::::::.:.: :::::::.. :.:.::. ::.::::
NP_006 LGYRAFGTPGKLAAALAITLQNIGAMSSYLYIIKSELPLVIQTFLNLEEKTSDWYMNGNY
140 150 160 170 180 190
200 210 220 230 240 250
pF1KSD LVLLVSLVVILPLSLFRNLGYLGYTSGLSLLCMVFFLIVVICKKFQVPCPVEAALIINET
::.:::...::::.:.:.::::::.::.:: :::::::.:: :::.::::. . : :
NP_006 LVILVSVTIILPLALMRQLGYLGYSSGFSLSCMVFFLIAVIYKKFHVPCPLPPNFN-NTT
200 210 220 230 240 250
260 270 280 290 300 310
pF1KSD INTTLTQPTALVPALSHNVTENDSCRPHYFIFNSQTVYAVPILIFSFVCHPAVLPIYEEL
: . .. . :. . . : : :: .::::.:..::. :.::::: ::::: ::
NP_006 GNFSHVEIVKEKVQLQVEPEASAFCTPSYFTLNSQTAYTIPIMAFAFVCHPEVLPIYTEL
260 270 280 290 300 310
320 330 340 350 360 370
pF1KSD KDRSRRRMMNVSKISFFAMFLMYLLAALFGYLTFYEHVESELLHTYSSILGTDILLLIVR
:: :...:...:..:. .:..::.:::::::::::. ::::::::::.. :.:.: ::
NP_006 KDPSKKKMQHISNLSIAVMYIMYFLAALFGYLTFYNGVESELLHTYSKVDPFDVLILCVR
320 330 340 350 360 370
380 390 400 410 420 430
pF1KSD LAVLMAVTLTVPVVIFPIRSSVTHLLCASKDFSWWRHSLITVSILAFTNLLVIFVPTIRD
.::: :::::::.:.::.: .. ..: ...::: :: ::.:..:. ::::::.:.:
NP_006 VAVLTAVTLTVPIVLFPVRRAIQQMLFPNQEFSWLRHVLIAVGLLTCINLLVIFAPNILG
380 390 400 410 420 430
440 450 460 470 480 490
pF1KSD IFGFIGASAASMLIFILPSAFYIKLV--KKEPMKSVQKIGALFFLLSGVLVMTGSMALIV
::: :::..: .::::.:. ::.... .::: .:. :: :: : . : :.:: :...:.
NP_006 IFGVIGATSAPFLIFIFPAIFYFRIMPTEKEPARSTPKILALCFAMLGFLLMTMSLSFII
440 450 460 470 480 490
500
pF1KSD LDWVHNAP--GGGH
.::. .. ::.:
NP_006 IDWASGTSRHGGNH
500
>>XP_006713017 (OMIM: 604437) PREDICTED: sodium-coupled (504 aa)
initn: 1531 init1: 826 opt: 1668 Z-score: 1997.8 bits: 379.2 E(85289): 1.5e-104
Smith-Waterman score: 1668; 56.7% identity (81.7% similar) in 464 aa overlap (47-506:44-504)
20 30 40 50 60 70
pF1KSD SSSYSSNSDFNYSYPTKQAALKSHYADVDPENQNFLLESNLGKKKYETEFHPGTTSFGMS
:...:: .: .:. . :.:. : ::::::
XP_006 PNGKHSEGLLPVITPMAGNQRVEDPARSCMEGKSFLQKSP-SKEPHFTDFE-GKTSFGMS
20 30 40 50 60 70
80 90 100 110 120 130
pF1KSD VFNLSNAIVGSGILGLSYAMANTGIALFIILLTFVSIFSLYSVHLLLKTANEGGSLLYEQ
::::::::.:::::::.:::::::: ::..::: :...: ::.:::::... : :::
XP_006 VFNLSNAIMGSGILGLAYAMANTGIILFLFLLTAVALLSSYSIHLLLKSSGVVGIRAYEQ
80 90 100 110 120 130
140 150 160 170 180 190
pF1KSD LGYKAFGLVGKLAASGSITMQNIGAMSSYLFIVKYELPLVIQALTNIEDKTGLWYLNGNY
:::.::: :::::. .::.::::::::::.:.: :::::::.. :.:.::. ::.::::
XP_006 LGYRAFGTPGKLAAALAITLQNIGAMSSYLYIIKSELPLVIQTFLNLEEKTSDWYMNGNY
140 150 160 170 180 190
200 210 220 230 240 250
pF1KSD LVLLVSLVVILPLSLFRNLGYLGYTSGLSLLCMVFFLIVVICKKFQVPCPVEAALIINET
::.:::...::::.:.:.::::::.::.:: :::::::.:: :::.::::. . : :
XP_006 LVILVSVTIILPLALMRQLGYLGYSSGFSLSCMVFFLIAVIYKKFHVPCPLPPNFN-NTT
200 210 220 230 240 250
260 270 280 290 300 310
pF1KSD INTTLTQPTALVPALSHNVTENDSCRPHYFIFNSQTVYAVPILIFSFVCHPAVLPIYEEL
: . .. . :. . . : : :: .::::.:..::. :.::::: ::::: ::
XP_006 GNFSHVEIVKEKVQLQVEPEASAFCTPSYFTLNSQTAYTIPIMAFAFVCHPEVLPIYTEL
260 270 280 290 300 310
320 330 340 350 360 370
pF1KSD KDRSRRRMMNVSKISFFAMFLMYLLAALFGYLTFYEHVESELLHTYSSILGTDILLLIVR
:: :...:...:..:. .:..::.:::::::::::. ::::::::::.. :.:.: ::
XP_006 KDPSKKKMQHISNLSIAVMYIMYFLAALFGYLTFYNGVESELLHTYSKVDPFDVLILCVR
320 330 340 350 360 370
380 390 400 410 420 430
pF1KSD LAVLMAVTLTVPVVIFPIRSSVTHLLCASKDFSWWRHSLITVSILAFTNLLVIFVPTIRD
.::: :::::::.:.::.: .. ..: ...::: :: ::.:..:. ::::::.:.:
XP_006 VAVLTAVTLTVPIVLFPVRRAIQQMLFPNQEFSWLRHVLIAVGLLTCINLLVIFAPNILG
380 390 400 410 420 430
440 450 460 470 480 490
pF1KSD IFGFIGASAASMLIFILPSAFYIKLV--KKEPMKSVQKIGALFFLLSGVLVMTGSMALIV
::: :::..: .::::.:. ::.... .::: .:. :: :: : . : :.:: :...:.
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500
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:.. :
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NP_060 IRAFMGLEENTGEWYLNGNYLIIFVSVGIILPLSLLKNLGYLGYTSGFSLTCMVFFVSVV
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NP_060 RRKMQTVSNISITGMLVMYLLAALFGYLTFYGEVEDELLHAYSKVYTLDIPLLMVRLAVL
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pF1KSD MAVTLTVPVVIFPIRSSVTHLLCASKDFSWWRHSLITVSILAFTNLLVIFVPTIRDIFGF
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NP_060 VAVTLTVPIVLFPIRTSVITLLFPKRPFSWIRHFLIAAVLIALNNVLVILVPTIKYIFGF
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NP_060 IGASSATMLIFILPAVFYLKLVKKETFRSPQKVGALIFLVVGIFFMIGSMALIIIDWIYD
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pF1KSD APGGGH
:.. :
NP_060 PPNSKHH
>>XP_005269054 (OMIM: 608065) PREDICTED: sodium-coupled (547 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KSD MKKAEMGRFSISPDEDSSSYSSNSDFNYSYP-TKQAALKSHYADVDPENQNFLLESNLGK
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XP_005 IRAFMGLEENTGEWYLNGNYLIIFVSVGIILPLSLLKNLGYLGYTSGFSLTCMVFFVSVV
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pF1KSD ICKKFQVPCPVEAA--LIINETINTTLTQPTALVPALSHN----------------VTEN
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XP_005 IYKKFQIPCPLPVLDHSVGNLSFNNTLPMHVVMLPNNSESSDVNFMMDYTHRNPAGLDEN
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pF1KSD ------------------DSCRPHYFIFNSQTVYAVPILIFSFVCHPAVLPIYEELKDRS
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XP_005 RRKMQTVSNISITGMLVMYLLAALFGYLTFYGEVEDELLHAYSKVYTLDIPLLMVRLAVL
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pF1KSD MAVTLTVPVVIFPIRSSVTHLLCASKDFSWWRHSLITVSILAFTNLLVIFVPTIRDIFGF
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XP_005 VAVTLTVPIVLFPIRTSVITLLFPKRPFSWIRHFLIAAVLIALNNVLVILVPTIKYIFGF
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pF1KSD IGASAASMLIFILPSAFYIKLVKKEPMKSVQKIGALFFLLSGVLVMTGSMALIVLDWVHN
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XP_005 IGASSATMLIFILPAVFYLKLVKKETFRSPQKVGALIFLVVGIFFMIGSMALIIIDWIYD
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pF1KSD APGGGH
:.. :
XP_005 PPNSKHH
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pF1KSD SLITVSILAFTNLLVIFVPTIRDIFGFIGASAASMLIFILPSAFYIKLVKKEPMKSVQKI
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XP_016 TVVTCILLVVINLLVIFIPSMKDIFGVVGVTSANMLIFILPSSLYLKITDQDGDKGTQRI
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pF1KSD GALFFLLSGVLVMTGSMALIVLDWVHNAPGGGH
XP_016 WVW
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pF1KSD MKKAEMGRFSISPDEDSSSYSSNSDFNYSYPTKQAALKSHYADVDPENQNFLL
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XP_011 MMHFKSGLELTELQNMTV-PEDDNISNDSN-DFT---EVENGQINSKFIS-DRESRRSLT
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pF1KSD ESNLGKKKYETEFHPGTTSFGMSVFNLSNAIVGSGILGLSYAMANTGIALFIILLTFVSI
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XP_011 NSHLEKKKCD-EYIPGTTSLGMSVFNLSNAIMGSGILGLAFALANTGILLFLVLLTSVTL
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XP_011 LSIYSINLLLICSKETGCMVYEKLGEQVFGTTGKFVIFGATSLQNTGAMLSYLFIVKNEL
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pF1KSD PLVIQALTNIEDKTGLWYLNGNYLVLLVSLVVILPLSLFRNLGYLGYTSGLSLLCMVFFL
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XP_011 PSAIKFLMGKEETFSAWYVDGRVLVVIVTFGIILPLCLLKNLGYLGYTSGFSLSCMVFFL
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XP_011 IVVIYKKFQIPC------IVPE-LNSTI----------SANSTNADTCTPKYVTFNSKTV
240 250 260 270
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pF1KSD YAVPILIFSFVCHPAVLPIYEELKDRSRRRMMNVSKISFFAMFLMYLLAALFGYLTFYEH
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XP_011 YALPTIAFAFVCHPSVLPIYSELKDRSQKKMQMVSNISFFAMFVMYFLTAIFGYLTFYDN
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pF1KSD VESELLHTYSSILGTDILLLIVRLAVLMAVTLTVPVVIFPIRSSVTHLLCASKDFSWWRH
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XP_011 VQSDLLHKYQS--KDDILILTVRLAVIVAVILTVPVLFFTVRSSLFELAKKTK-FNLCRH
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pF1KSD SLITVSILAFTNLLVIFVPTIRDIFGFIGASAASMLIFILPSAFYIKLVKKEPMKSVQKI
...: .:. ::::::.:...:::: .:...:.::::::::..:.:.. .. :..:.:
XP_011 TVVTCILLVVINLLVIFIPSMKDIFGVVGVTSANMLIFILPSSLYLKITDQDGDKGTQRI
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pF1KSD GALFFLLSGVLVMTGSMALIVLDWVHNAPGGGH
XP_011 WVW
>>XP_011537088 (OMIM: 608490) PREDICTED: sodium-coupled (478 aa)
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.. .:. ... :..:. : .:: ::. .... ..:.. . : :.. :
XP_011 MMHFKSGLELTELQNMTV-PEDDNISNDSN-DFT---EVENGQINSKFIS-DRESRRSLT
10 20 30 40 50
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pF1KSD ESNLGKKKYETEFHPGTTSFGMSVFNLSNAIVGSGILGLSYAMANTGIALFIILLTFVSI
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XP_011 NSHLEKKKCD-EYIPGTTSLGMSVFNLSNAIMGSGILGLAFALANTGILLFLVLLTSVTL
60 70 80 90 100 110
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pF1KSD FSLYSVHLLLKTANEGGSLLYEQLGYKAFGLVGKLAASGSITMQNIGAMSSYLFIVKYEL
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XP_011 LSIYSINLLLICSKETGCMVYEKLGEQVFGTTGKFVIFGATSLQNTGAMLSYLFIVKNEL
120 130 140 150 160 170
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XP_011 PSAIKFLMGKEETFSAWYVDGRVLVVIVTFGIILPLCLLKNLGYLGYTSGFSLSCMVFFL
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