Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA1382
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1382, 506 aa
1>>>pF1KSDA1382 506 - 506 aa - 506 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4256+/-0.00123; mu= 17.5041+/- 0.074
mean_var=71.4249+/-14.762, 0's: 0 Z-trim(101.1): 37 B-trim: 0 in 0/47
Lambda= 0.151757
statistics sampled from 6351 (6381) to 6351 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.537), E-opt: 0.2 (0.196), width: 16
Scan time: 3.140
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8749.1 SLC38A2 gene_id:54407|Hs108|chr12 ( 506) 3232 717.5 8.4e-207
CCDS76551.1 SLC38A2 gene_id:54407|Hs108|chr12 ( 406) 2558 569.9 1.8e-162
CCDS74940.1 SLC38A3 gene_id:10991|Hs108|chr3 ( 504) 1668 375.1 1e-103
CCDS8750.1 SLC38A4 gene_id:55089|Hs108|chr12 ( 547) 1006 230.2 4.6e-60
CCDS41774.1 SLC38A1 gene_id:81539|Hs108|chr12 ( 487) 786 182.0 1.3e-45
CCDS61106.1 SLC38A1 gene_id:81539|Hs108|chr12 ( 503) 786 182.0 1.3e-45
CCDS9751.1 SLC38A6 gene_id:145389|Hs108|chr14 ( 456) 726 168.8 1.1e-41
CCDS14293.1 SLC38A5 gene_id:92745|Hs108|chrX ( 472) 709 165.1 1.5e-40
CCDS53900.1 SLC38A6 gene_id:145389|Hs108|chr14 ( 521) 657 153.8 4.4e-37
CCDS11780.1 SLC38A10 gene_id:124565|Hs108|chr17 ( 780) 317 79.4 1.6e-14
CCDS42397.1 SLC38A10 gene_id:124565|Hs108|chr17 (1119) 317 79.5 2.1e-14
CCDS32495.1 SLC38A8 gene_id:146167|Hs108|chr16 ( 435) 259 66.6 6.5e-11
>>CCDS8749.1 SLC38A2 gene_id:54407|Hs108|chr12 (506 aa)
initn: 3232 init1: 3232 opt: 3232 Z-score: 3826.3 bits: 717.5 E(32554): 8.4e-207
Smith-Waterman score: 3232; 100.0% identity (100.0% similar) in 506 aa overlap (1-506:1-506)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MKKAEMGRFSISPDEDSSSYSSNSDFNYSYPTKQAALKSHYADVDPENQNFLLESNLGKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 MKKAEMGRFSISPDEDSSSYSSNSDFNYSYPTKQAALKSHYADVDPENQNFLLESNLGKK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD KYETEFHPGTTSFGMSVFNLSNAIVGSGILGLSYAMANTGIALFIILLTFVSIFSLYSVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 KYETEFHPGTTSFGMSVFNLSNAIVGSGILGLSYAMANTGIALFIILLTFVSIFSLYSVH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LLLKTANEGGSLLYEQLGYKAFGLVGKLAASGSITMQNIGAMSSYLFIVKYELPLVIQAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 LLLKTANEGGSLLYEQLGYKAFGLVGKLAASGSITMQNIGAMSSYLFIVKYELPLVIQAL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD TNIEDKTGLWYLNGNYLVLLVSLVVILPLSLFRNLGYLGYTSGLSLLCMVFFLIVVICKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 TNIEDKTGLWYLNGNYLVLLVSLVVILPLSLFRNLGYLGYTSGLSLLCMVFFLIVVICKK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD FQVPCPVEAALIINETINTTLTQPTALVPALSHNVTENDSCRPHYFIFNSQTVYAVPILI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 FQVPCPVEAALIINETINTTLTQPTALVPALSHNVTENDSCRPHYFIFNSQTVYAVPILI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD FSFVCHPAVLPIYEELKDRSRRRMMNVSKISFFAMFLMYLLAALFGYLTFYEHVESELLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 FSFVCHPAVLPIYEELKDRSRRRMMNVSKISFFAMFLMYLLAALFGYLTFYEHVESELLH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD TYSSILGTDILLLIVRLAVLMAVTLTVPVVIFPIRSSVTHLLCASKDFSWWRHSLITVSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 TYSSILGTDILLLIVRLAVLMAVTLTVPVVIFPIRSSVTHLLCASKDFSWWRHSLITVSI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD LAFTNLLVIFVPTIRDIFGFIGASAASMLIFILPSAFYIKLVKKEPMKSVQKIGALFFLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 LAFTNLLVIFVPTIRDIFGFIGASAASMLIFILPSAFYIKLVKKEPMKSVQKIGALFFLL
430 440 450 460 470 480
490 500
pF1KSD SGVLVMTGSMALIVLDWVHNAPGGGH
::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 SGVLVMTGSMALIVLDWVHNAPGGGH
490 500
>>CCDS76551.1 SLC38A2 gene_id:54407|Hs108|chr12 (406 aa)
initn: 2558 init1: 2558 opt: 2558 Z-score: 3030.2 bits: 569.9 E(32554): 1.8e-162
Smith-Waterman score: 2558; 99.8% identity (100.0% similar) in 402 aa overlap (105-506:5-406)
80 90 100 110 120 130
pF1KSD MSVFNLSNAIVGSGILGLSYAMANTGIALFIILLTFVSIFSLYSVHLLLKTANEGGSLLY
.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 MKQNLILLTFVSIFSLYSVHLLLKTANEGGSLLY
10 20 30
140 150 160 170 180 190
pF1KSD EQLGYKAFGLVGKLAASGSITMQNIGAMSSYLFIVKYELPLVIQALTNIEDKTGLWYLNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 EQLGYKAFGLVGKLAASGSITMQNIGAMSSYLFIVKYELPLVIQALTNIEDKTGLWYLNG
40 50 60 70 80 90
200 210 220 230 240 250
pF1KSD NYLVLLVSLVVILPLSLFRNLGYLGYTSGLSLLCMVFFLIVVICKKFQVPCPVEAALIIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 NYLVLLVSLVVILPLSLFRNLGYLGYTSGLSLLCMVFFLIVVICKKFQVPCPVEAALIIN
100 110 120 130 140 150
260 270 280 290 300 310
pF1KSD ETINTTLTQPTALVPALSHNVTENDSCRPHYFIFNSQTVYAVPILIFSFVCHPAVLPIYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 ETINTTLTQPTALVPALSHNVTENDSCRPHYFIFNSQTVYAVPILIFSFVCHPAVLPIYE
160 170 180 190 200 210
320 330 340 350 360 370
pF1KSD ELKDRSRRRMMNVSKISFFAMFLMYLLAALFGYLTFYEHVESELLHTYSSILGTDILLLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 ELKDRSRRRMMNVSKISFFAMFLMYLLAALFGYLTFYEHVESELLHTYSSILGTDILLLI
220 230 240 250 260 270
380 390 400 410 420 430
pF1KSD VRLAVLMAVTLTVPVVIFPIRSSVTHLLCASKDFSWWRHSLITVSILAFTNLLVIFVPTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 VRLAVLMAVTLTVPVVIFPIRSSVTHLLCASKDFSWWRHSLITVSILAFTNLLVIFVPTI
280 290 300 310 320 330
440 450 460 470 480 490
pF1KSD RDIFGFIGASAASMLIFILPSAFYIKLVKKEPMKSVQKIGALFFLLSGVLVMTGSMALIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 RDIFGFIGASAASMLIFILPSAFYIKLVKKEPMKSVQKIGALFFLLSGVLVMTGSMALIV
340 350 360 370 380 390
500
pF1KSD LDWVHNAPGGGH
::::::::::::
CCDS76 LDWVHNAPGGGH
400
>>CCDS74940.1 SLC38A3 gene_id:10991|Hs108|chr3 (504 aa)
initn: 1531 init1: 826 opt: 1668 Z-score: 1975.7 bits: 375.1 E(32554): 1e-103
Smith-Waterman score: 1668; 56.7% identity (81.7% similar) in 464 aa overlap (47-506:44-504)
20 30 40 50 60 70
pF1KSD SSSYSSNSDFNYSYPTKQAALKSHYADVDPENQNFLLESNLGKKKYETEFHPGTTSFGMS
:...:: .: .:. . :.:. : ::::::
CCDS74 PNGKHSEGLLPVITPMAGNQRVEDPARSCMEGKSFLQKSP-SKEPHFTDFE-GKTSFGMS
20 30 40 50 60 70
80 90 100 110 120 130
pF1KSD VFNLSNAIVGSGILGLSYAMANTGIALFIILLTFVSIFSLYSVHLLLKTANEGGSLLYEQ
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CCDS74 VFNLSNAIMGSGILGLAYAMANTGIILFLFLLTAVALLSSYSIHLLLKSSGVVGIRAYEQ
80 90 100 110 120 130
140 150 160 170 180 190
pF1KSD LGYKAFGLVGKLAASGSITMQNIGAMSSYLFIVKYELPLVIQALTNIEDKTGLWYLNGNY
:::.::: :::::. .::.::::::::::.:.: :::::::.. :.:.::. ::.::::
CCDS74 LGYRAFGTPGKLAAALAITLQNIGAMSSYLYIIKSELPLVIQTFLNLEEKTSDWYMNGNY
140 150 160 170 180 190
200 210 220 230 240 250
pF1KSD LVLLVSLVVILPLSLFRNLGYLGYTSGLSLLCMVFFLIVVICKKFQVPCPVEAALIINET
::.:::...::::.:.:.::::::.::.:: :::::::.:: :::.::::. . : :
CCDS74 LVILVSVTIILPLALMRQLGYLGYSSGFSLSCMVFFLIAVIYKKFHVPCPLPPNFN-NTT
200 210 220 230 240 250
260 270 280 290 300 310
pF1KSD INTTLTQPTALVPALSHNVTENDSCRPHYFIFNSQTVYAVPILIFSFVCHPAVLPIYEEL
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CCDS74 GNFSHVEIVKEKVQLQVEPEASAFCTPSYFTLNSQTAYTIPIMAFAFVCHPEVLPIYTEL
260 270 280 290 300 310
320 330 340 350 360 370
pF1KSD KDRSRRRMMNVSKISFFAMFLMYLLAALFGYLTFYEHVESELLHTYSSILGTDILLLIVR
:: :...:...:..:. .:..::.:::::::::::. ::::::::::.. :.:.: ::
CCDS74 KDPSKKKMQHISNLSIAVMYIMYFLAALFGYLTFYNGVESELLHTYSKVDPFDVLILCVR
320 330 340 350 360 370
380 390 400 410 420 430
pF1KSD LAVLMAVTLTVPVVIFPIRSSVTHLLCASKDFSWWRHSLITVSILAFTNLLVIFVPTIRD
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CCDS74 VAVLTAVTLTVPIVLFPVRRAIQQMLFPNQEFSWLRHVLIAVGLLTCINLLVIFAPNILG
380 390 400 410 420 430
440 450 460 470 480 490
pF1KSD IFGFIGASAASMLIFILPSAFYIKLV--KKEPMKSVQKIGALFFLLSGVLVMTGSMALIV
::: :::..: .::::.:. ::.... .::: .:. :: :: : . : :.:: :...:.
CCDS74 IFGVIGATSAPFLIFIFPAIFYFRIMPTEKEPARSTPKILALCFAMLGFLLMTMSLSFII
440 450 460 470 480 490
500
pF1KSD LDWVHNAP--GGGH
.::. .. ::.:
CCDS74 IDWASGTSRHGGNH
500
>>CCDS8750.1 SLC38A4 gene_id:55089|Hs108|chr12 (547 aa)
initn: 1961 init1: 973 opt: 1006 Z-score: 1191.9 bits: 230.2 E(32554): 4.6e-60
Smith-Waterman score: 1956; 59.0% identity (80.1% similar) in 537 aa overlap (10-506:10-546)
10 20 30 40 50
pF1KSD MKKAEMGRFSISPDEDSSSYSSNSDFNYSYP-TKQAALKSHYADVDPENQNFLLESNLGK
.: ::..::: : : . ...::..:..:. : :.:.:: .. :::
CCDS87 MDPMELRNVNIEPDDESSSGESAPDSYIGIGNSEKAAMSSQFANEDTESQKFLTNGFLGK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD KK---YETEFHPGTTSFGMSVFNLSNAIVGSGILGLSYAMANTGIALFIILLTFVSIFSL
:: : : :::::::::: :::::::.:::::::::::::::: ::::.: :.:.::
CCDS87 KKLADYADEHHPGTTSFGMSSFNLSNAIMGSGILGLSYAMANTGIILFIIMLLAVAILSL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KSD YSVHLLLKTANEGGSLLYEQLGYKAFGLVGKLAASGSITMQNIGAMSSYLFIVKYELPLV
::::::::::.:::::.::.:: :::: ::..: ::::::::::::::::.::::: :
CCDS87 YSVHLLLKTAKEGGSLIYEKLGEKAFGWPGKIGAFVSITMQNIGAMSSYLFIIKYELPEV
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KSD IQALTNIEDKTGLWYLNGNYLVLLVSLVVILPLSLFRNLGYLGYTSGLSLLCMVFFLIVV
:.:. ..:..:: ::::::::...::. .::::::..::::::::::.:: :::::. ::
CCDS87 IRAFMGLEENTGEWYLNGNYLIIFVSVGIILPLSLLKNLGYLGYTSGFSLTCMVFFVSVV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270
pF1KSD ICKKFQVPCPVEAA--LIINETINTTLTQPTALVPALSHN----------------VTEN
: ::::.:::. . . : ..:.:: . ....: :.. . ::
CCDS87 IYKKFQIPCPLPVLDHSVGNLSFNNTLPMHVVMLPNNSESSDVNFMMDYTHRNPAGLDEN
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320
pF1KSD ------------------DSCRPHYFIFNSQTVYAVPILIFSFVCHPAVLPIYEELKDRS
:.:.:.::.:::.:.::.:::.:.::::: ::::: ::::::
CCDS87 QAKGSLHDSGVEYEAHSDDKCEPKYFVFNSRTAYAIPILVFAFVCHPEVLPIYSELKDRS
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KSD RRRMMNVSKISFFAMFLMYLLAALFGYLTFYEHVESELLHTYSSILGTDILLLIVRLAVL
::.:..::.::. .:..:::::::::::::: .::.::::.::.. :: ::.::::::
CCDS87 RRKMQTVSNISITGMLVMYLLAALFGYLTFYGEVEDELLHAYSKVYTLDIPLLMVRLAVL
370 380 390 400 410 420
390 400 410 420 430 440
pF1KSD MAVTLTVPVVIFPIRSSVTHLLCASKDFSWWRHSLITVSILAFTNLLVIFVPTIRDIFGF
.:::::::.:.::::.:: :: .. ::: :: ::.. ..:..:.:::.::::. ::::
CCDS87 VAVTLTVPIVLFPIRTSVITLLFPKRPFSWIRHFLIAAVLIALNNVLVILVPTIKYIFGF
430 440 450 460 470 480
450 460 470 480 490 500
pF1KSD IGASAASMLIFILPSAFYIKLVKKEPMKSVQKIGALFFLLSGVLVMTGSMALIVLDWVHN
::::.:.:::::::..::.:::::: ..: ::.:::.::. :.. : ::::::..::...
CCDS87 IGASSATMLIFILPAVFYLKLVKKETFRSPQKVGALIFLVVGIFFMIGSMALIIIDWIYD
490 500 510 520 530 540
pF1KSD APGGGH
:.. :
CCDS87 PPNSKHH
>>CCDS41774.1 SLC38A1 gene_id:81539|Hs108|chr12 (487 aa)
initn: 1426 init1: 737 opt: 786 Z-score: 932.3 bits: 182.0 E(32554): 1.3e-45
Smith-Waterman score: 1554; 50.5% identity (77.5% similar) in 507 aa overlap (1-506:8-487)
10 20 30 40 50
pF1KSD MKKAEMGRFSISPDEDSSSYSSNSDFNYSYPTKQAALKSHYADVDPENQNFLL
.. .:. ... :..:. : .:: ::. .... ..:.. . : :.. :
CCDS41 MMHFKSGLELTELQNMTV-PEDDNISNDSN-DFT---EVENGQINSKFIS-DRESRRSLT
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD ESNLGKKKYETEFHPGTTSFGMSVFNLSNAIVGSGILGLSYAMANTGIALFIILLTFVSI
.:.: ::: . :. :::::.:::::::::::.:::::::..:.::::: ::..::: :..
CCDS41 NSHLEKKKCD-EYIPGTTSLGMSVFNLSNAIMGSGILGLAFALANTGILLFLVLLTSVTL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD FSLYSVHLLLKTANEGGSLLYEQLGYKAFGLVGKLAASGSITMQNIGAMSSYLFIVKYEL
.:.::..::: ..: : ..::.:: ..:: .::.. :. ..:: ::: ::::::: ::
CCDS41 LSIYSINLLLICSKETGCMVYEKLGEQVFGTTGKFVIFGATSLQNTGAMLSYLFIVKNEL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD PLVIQALTNIEDKTGLWYLNGNYLVLLVSLVVILPLSLFRNLGYLGYTSGLSLLCMVFFL
: .:. : . :. . ::..: ::..:.. .:::: :..::::::::::.:: ::::::
CCDS41 PSAIKFLMGKEETFSAWYVDGRVLVVIVTFGIILPLCLLKNLGYLGYTSGFSLSCMVFFL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD IVVICKKFQVPCPVEAALIINETINTTLTQPTALVPALSHNVTENDSCRPHYFIFNSQTV
:::: ::::.:: :. : .:.:. : : :. :.: :.: :::.::
CCDS41 IVVIYKKFQIPC------IVPE-LNSTI----------SANSTNADTCTPKYVTFNSKTV
240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KSD YAVPILIFSFVCHPAVLPIYEELKDRSRRRMMNVSKISFFAMFLMYLLAALFGYLTFYEH
::.: . :.:::::.::::: ::::::...:. ::.:::::::.::.:.:.:::::::..
CCDS41 YALPTIAFAFVCHPSVLPIYSELKDRSQKKMQMVSNISFFAMFVMYFLTAIFGYLTFYDN
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KSD VESELLHTYSSILGTDILLLIVRLAVLMAVTLTVPVVIFPIRSSVTHLLCASKDFSWWRH
:.:.::: :.: :::.: :::::..:: :::::..: .:::. .: .: :. ::
CCDS41 VQSDLLHKYQS--KDDILILTVRLAVIVAVILTVPVLFFTVRSSLFELAKKTK-FNLCRH
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KSD SLITVSILAFTNLLVIFVPTIRDIFGFIGASAASMLIFILPSAFYIKLVKKEPMKSVQKI
...: .:. ::::::.:...:::: .:...:.::::::::..:.:.. .. :..:.:
CCDS41 TVVTCILLVVINLLVIFIPSMKDIFGVVGVTSANMLIFILPSSLYLKITDQDGDKGTQRI
400 410 420 430 440 450
480 490 500
pF1KSD GALFFLLSGVLVMTGSMALIVLDWVHNAPGG-GH
: .:: ::: :. :.. ::. .. . ::
CCDS41 WAALFLGLGVLFSLVSIPLVIYDWACSSSSDEGH
460 470 480
>>CCDS61106.1 SLC38A1 gene_id:81539|Hs108|chr12 (503 aa)
initn: 1486 init1: 737 opt: 786 Z-score: 932.1 bits: 182.0 E(32554): 1.3e-45
Smith-Waterman score: 1503; 51.4% identity (78.7% similar) in 479 aa overlap (1-479:8-459)
10 20 30 40 50
pF1KSD MKKAEMGRFSISPDEDSSSYSSNSDFNYSYPTKQAALKSHYADVDPENQNFLL
.. .:. ... :..:. : .:: ::. .... ..:.. . : :.. :
CCDS61 MMHFKSGLELTELQNMTV-PEDDNISNDSN-DFT---EVENGQINSKFIS-DRESRRSLT
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD ESNLGKKKYETEFHPGTTSFGMSVFNLSNAIVGSGILGLSYAMANTGIALFIILLTFVSI
.:.: ::: . :. :::::.:::::::::::.:::::::..:.::::: ::..::: :..
CCDS61 NSHLEKKKCD-EYIPGTTSLGMSVFNLSNAIMGSGILGLAFALANTGILLFLVLLTSVTL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD FSLYSVHLLLKTANEGGSLLYEQLGYKAFGLVGKLAASGSITMQNIGAMSSYLFIVKYEL
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CCDS61 LSIYSINLLLICSKETGCMVYEKLGEQVFGTTGKFVIFGATSLQNTGAMLSYLFIVKNEL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD PLVIQALTNIEDKTGLWYLNGNYLVLLVSLVVILPLSLFRNLGYLGYTSGLSLLCMVFFL
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CCDS61 PSAIKFLMGKEETFSAWYVDGRVLVVIVTFGIILPLCLLKNLGYLGYTSGFSLSCMVFFL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD IVVICKKFQVPCPVEAALIINETINTTLTQPTALVPALSHNVTENDSCRPHYFIFNSQTV
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CCDS61 IVVIYKKFQIPC------IVPE-LNSTI----------SANSTNADTCTPKYVTFNSKTV
240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KSD YAVPILIFSFVCHPAVLPIYEELKDRSRRRMMNVSKISFFAMFLMYLLAALFGYLTFYEH
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CCDS61 YALPTIAFAFVCHPSVLPIYSELKDRSQKKMQMVSNISFFAMFVMYFLTAIFGYLTFYDN
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KSD VESELLHTYSSILGTDILLLIVRLAVLMAVTLTVPVVIFPIRSSVTHLLCASKDFSWWRH
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CCDS61 VQSDLLHKYQS--KDDILILTVRLAVIVAVILTVPVLFFTVRSSLFELAKKTK-FNLCRH
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KSD SLITVSILAFTNLLVIFVPTIRDIFGFIGASAASMLIFILPSAFYIKLVKKEPMKSVQKI
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CCDS61 TVVTCILLVVINLLVIFIPSMKDIFGVVGVTSANMLIFILPSSLYLKITDQDGDKGTQRI
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480 490 500
pF1KSD GALFFLLSGVLVMTGSMALIVLDWVHNAPGGGH
..::
CCDS61 WLFLFLQFPVQPCWLSECIILLPAALSLNMLKRKELIILCSLDSGFSNLY
460 470 480 490 500
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10 20 30 40 50 60
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CCDS97 MEASWGSFNAERGWYVSVQQPEEAEAEELSPLLSNELHR
10 20 30
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pF1KSD EFHPGTTSFGMSVFNLSNAIVGSGILGLSYAMANTGIALFIILLTFVSIFSLYSVHLLLK
. ::. :::.::::: :::.:::::::.:..::::. : .:: :.... :::::::.
CCDS97 QRSPGV-SFGLSVFNLMNAIMGSGILGLAYVLANTGVFGFSFLLLTVALLASYSVHLLLS
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pF1KSD TANEGGSLLYEQLGYKAFGLVGKLAASGSITMQNIGAMSSYLFIVKYELPLVIQALTNIE
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CCDS97 MCIQTAVTSYEDLGLFAFGLPGKLVVAGTIIIQNIGAMSSYLLIIKTELPAAIAEFLT-G
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CCDS97 DYSRYWYLDGQTLLIIICVGIVFPLALLPKIGFLGYTSSLSFFFMMFFALVVIIKKWSIP
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pF1KSD CPVEAALIINETINTTLTQPTALVPALSHNVTENDSCRPHYFIFNSQTVYAVPILIFSFV
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CCDS97 CPL--------TLNY-VEKGFQI-----SNVT--DDCKPKLFHFSKESAYALPTMAFSFL
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pF1KSD CHPAVLPIYEELKDRSRRRMMNVSKISFFAMFLMYLLAALFGYLTFYEHVESELLHTYSS
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CCDS97 CHTSILPIYCELQSPSKKRMQNVTNTAIALSFLIYFISALFGYLTFYDKVESELLKGYSK
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pF1KSD ILGTDILLLIVRLAVLMAVTLTVPVVIFPIRSSVTHLLCASKDFSWWRHSLITVSILAFT
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CCDS97 YLSHDVVVMTVKLCILFAVLLTVPLIHFPARKAVTMMFFSNFPFSWIRHFLITLALNIII
330 340 350 360 370 380
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pF1KSD NLLVIFVPTIRDIFGFIGASAASMLIFILPSAFYIKLVKKEPMKSVQKIGALFFLLSGVL
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CCDS97 VLLAIYVPDIRNVFGVVGASTSTCLIFIFPGLFYLKL-SREDFLSWKKLGAFVLLIFGIL
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490 500
pF1KSD VMTGSMALIVLDWVHNAPGGGH
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CCDS97 VGNFSLALIIFDWINK
450
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pF1KSD MKKAEMGRFSISPDEDSSSYSSNSDFNYSYPTKQAALKSHYADVDPENQNFLLESNL--G
: ..:: : . : ..:: . :
CCDS14 MELQDPKMNGALPSDAVGYRQEREGFLPSRGPAPG
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pF1KSD KKKYETEFHPGTTSFGMSVFNLSNAIVGSGILGLSYAMANTGIALFIILLTFVSIFSLYS
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CCDS14 SKPVQFMDFEGKTSFGMSVFNLSNAIMGSGILGLAYAMAHTGVIFFLALLLCIALLSSYS
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pF1KSD VHLLLKTANEGGSLLYEQLGYKAFGLVGKLAASGSITMQNIGAMSSYLFIVKYELPLVIQ
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CCDS14 IHLLLTCAGIAGIRAYEQLGQRAFGPAGKVVVATVICLHNVGAMSSYLFIIKSELPLVIG
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pF1KSD ALTNIEDKTGLWYLNGNYLVLLVSLVVILPLSLFRNLGYLGYTSGLSLLCMVFFLIVVIC
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CCDS14 TFLYM-DPEGDWFLKGNLLIIIVSVLIILPLALMKHLGYLGYTSGLSLTCMLFFLVSVIY
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pF1KSD KKFQVPCPVEAALIINETINTTLTQPTALVPALSHNVTENDSCRPHYFIFNSQTVYAVPI
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CCDS14 KKFQLGCAIGH--------NETAMESEALVGLPSQGL--NSSCEAQMFTVDSQMSYTVPI
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CCDS14 MAFAFVCHPEVLPIYTELCRPSKRRMQAVANVSIGAMFCMYGLTATFGYLTFYSSVKAEM
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pF1KSD LHTYSSILGTDILLLIVRLAVLMAVTLTVPVVIFPIRSSVTHLLCASKDFSWWRHSLITV
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CCDS14 LHMYSQ---KDPLILCVRLAVLLAVTLTVPVVLFPIRRALQQLLFPGKAFSWPRHVAIAL
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pF1KSD SILAFTNLLVIFVPTIRDIFGFIGASAASMLIFILPSAFYIKLVKKE--PMKSVQKIGAL
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CCDS14 ILLVLVNVLVICVPTIRDIFGVIGSTSAPSLIFILPSIFYLRIVPSEVEPFLSWPKIQAL
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pF1KSD FFLLSGVLVMTGSMALIVLDWVHNAPGGGH
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CCDS14 CFGVLGVLFMAVSLGFMFANWATGQSRMSGH
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pF1KSD MGRFSISPDEDSSSYSSNSDFNYSYPTKQAALKSHYADVD-PENQNFLLESNLGKKKYET
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CCDS53 MEASWGSFNAERGWYVSVQQPEEAEAEELSPLLSNELHR
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70 80 90 100 110 120
pF1KSD EFHPGTTSFGMSVFNLSNAIVGSGILGLSYAMANTGIALFIILLTFVSIFSLYSVHLLLK
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CCDS53 QRSPGV-SFGLSVFNLMNAIMGSGILGLAYVLANTGVFGFSFLLLTVALLASYSVHLLLS
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pF1KSD TANEGGSLLYEQLGYKAFGLVGKLAASGSITMQNIGAMSSYLFIVKYELPLVIQALTNIE
. . ::.:: :::: :::...:.: .::::::::::.:.: ::: .: . .
CCDS53 MCIQTAVTSYEDLGLFAFGLPGKLVVAGTIIIQNIGAMSSYLLIIKTELPAAIAEFLT-G
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pF1KSD DKTGLWYLNGNYLVLLVSLVVILPLSLFRNLGYLGYTSGLSLLCMVFFLIVVICKKFQVP
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CCDS53 DYSRYWYLDGQTLLIIICVGIVFPLALLPKIGFLGYTSSLSFFFMMFFALVVIIKKWSIP
160 170 180 190 200 210
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pF1KSD CPVEAALIINETINTTLTQPTALVPALSHNVTENDSCRPHYFIFNSQTVYAVPILIFSFV
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CCDS53 CPL--------TLN--YVEKGFQIS----NVT--DDCKPKLFHFSKESAYALPTMAFSFL
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pF1KSD CHPAVLPIYEELKDRSRRRMMNVSKISFFAMFLMYLLAALFGYLTFYEHVESELLHTYSS
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CCDS53 CHTSILPIYCELQSPSKKRMQNVTNTAIALSFLIYFISALFGYLTFYDKVESELLKGYSK
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pF1KSD ILGTDILLLIVRLAVLMAVTLTVPVVIFPIRSSVTHLLCASKDFSWWRHSLITVSILAFT
:. :.... :.: .:.:: ::::.. :: :..:: .. .. ::: :: :::... .
CCDS53 YLSHDVVVMTVKLCILFAVLLTVPLIHFPARKAVTMMFFSNFPFSWIRHFLITLALNIII
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pF1KSD NLLVIFVPTIRDIFGFIGASAASMLIFILPSAFYIKLVKKEPMKSVQKIGALFFLLSGVL
::.:.:: ::..:: .:::... ::::.:. ::.:: ..: . : .:.:.: .:: :
CCDS53 VLLAIYVPDIRNVFGVVGASTSTCLIFIFPGLFYLKL-SREDFLSWKKLGGL--ILSHRL
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pF1KSD VMTGSMALIVLDWVHNAPGGGH
. .: ..
CCDS53 ACSGVISAHCNLCLPDSSNPPTSASRVAETTGRDTMEMCTQRKGHARTQQEGNCLQAKGR
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CCDS11 MTAAAASNWGL-ITNIVNSIVGVSVLTMPFCFKQCG
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KSD IALFIILLTFVSIFSLYSVHLLLKTANEGGSLLYEQLGYKAFGLVGKLAASGSITMQNIG
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CCDS11 IVLGALLLVFCSWMTHQSCMFLVKSASLSKRRTYAGLAFHAYGKAGKMLVETSMIGLMLG
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pF1KSD AMSSYLFIVKYELPLVIQALTNIEDKTGLWYLNGNYLVLLVSLVVILPLSLFRNL-GYLG
. .. ..: .: . : . : . . .:.. ::: ..::::: ::. . .
CCDS11 TCIAF-YVVIGDLGSNFFARLFGFQVGGTFRM---FLLFAVSLCIVLPLSLQRNMMASIQ
100 110 120 130 140 150
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pF1KSD YTSGLSLLCMVFFLIVVICKKFQVPCPVEAALIINETINTTLTQPTALVPALSHNVTEND
:...:: .. :..:.. . .:.:.. ..
CCDS11 SFSAMALLFYTVFMFVIV------------------------------LSSLKHGLFSGQ
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pF1KSD SCRPHYFIFNSQTVYAVPILIFSFVCHPAVLPIYEELKDRSRRRMMNVSKISFFAMFLMY
: .. . .::. .::.:. ::: :. : . : . : .. :. .. .:
CCDS11 WLRRVSYVRWEGVFRCIPIFGMSFACQSQVLPTYDSLDEPSVKTMSSIFASSLNVVTTFY
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.....:::..: : . ...: . : : :..: :.. .:.:.. :..:.: :....
CCDS11 VMVGFFGYVSFTEATAGNVLMHFPSNLVTEML----RVGFMMSVAVGFPMMILPCRQALS
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pF1KSD HLLCAS--KDFSW--------WRHSLITVSILAFTNLLVIFVPTIRDIFGFIGASAASML
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CCDS11 TLLCEQQQKDGTFAAGGYMPPLRFKALTLSVVFGTMVGGILIPNVETILGLTGATMGSLI
300 310 320 330 340 350
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pF1KSD IFILPSAFYIKLVKKEPMKS--VQKIGALFFLLSGVLVMTGSMALIVLDWVHNAPGGGH
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CCDS11 CFICPALIYKK-IHKNALSSQVVLWVGLGVLVVSTVTTLSVSEE-VPEDLAEEAPGGRLG
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CCDS11 EAEGLMKVEAARLSAQDPVVAVAEDGREKPKLPKEREELEQAQIKGPVDVPGREDGKEAP
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]