Result of FASTA (omim) for
pF1KSDA1379
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1379, 444 aa
1>>>pF1KSDA1379 444 - 444 aa - 444 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.0944+/-0.000528; mu= -4.2966+/- 0.032
mean_var=348.0019+/-73.809, 0's: 0 Z-trim(116.6): 67 B-trim: 53 in 1/55
Lambda= 0.068752
statistics sampled from 27862 (27919) to 27862 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.688), E-opt: 0.2 (0.327), width: 16
Scan time: 9.000
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_065855 (OMIM: 606512) protein kinase C and case ( 444) 3010 312.9 1.1e-84
NP_001186512 (OMIM: 606512) protein kinase C and c ( 444) 3010 312.9 1.1e-84
XP_011512843 (OMIM: 606512) PREDICTED: protein kin ( 444) 3010 312.9 1.1e-84
NP_001171900 (OMIM: 604960) protein kinase C and c ( 445) 2155 228.1 3.6e-59
XP_005261376 (OMIM: 604960) PREDICTED: protein kin ( 445) 2155 228.1 3.6e-59
XP_016884056 (OMIM: 604960) PREDICTED: protein kin ( 447) 2141 226.7 9.5e-59
XP_016884054 (OMIM: 604960) PREDICTED: protein kin ( 447) 2141 226.7 9.5e-59
XP_016884055 (OMIM: 604960) PREDICTED: protein kin ( 447) 2141 226.7 9.5e-59
XP_011528155 (OMIM: 604960) PREDICTED: protein kin ( 447) 2141 226.7 9.5e-59
XP_016884057 (OMIM: 604960) PREDICTED: protein kin ( 406) 1929 205.6 1.9e-52
XP_016884053 (OMIM: 604960) PREDICTED: protein kin ( 486) 1690 182.0 3e-45
NP_001171899 (OMIM: 604960) protein kinase C and c ( 486) 1690 182.0 3e-45
NP_009160 (OMIM: 604960) protein kinase C and case ( 486) 1690 182.0 3e-45
XP_011528148 (OMIM: 604960) PREDICTED: protein kin ( 488) 1676 180.6 7.8e-45
XP_016884052 (OMIM: 604960) PREDICTED: protein kin ( 488) 1676 180.6 7.8e-45
XP_011528151 (OMIM: 604960) PREDICTED: protein kin ( 488) 1676 180.6 7.8e-45
XP_011528150 (OMIM: 604960) PREDICTED: protein kin ( 488) 1676 180.6 7.8e-45
XP_011528149 (OMIM: 604960) PREDICTED: protein kin ( 488) 1676 180.6 7.8e-45
XP_016884051 (OMIM: 604960) PREDICTED: protein kin ( 488) 1676 180.6 7.8e-45
XP_011528153 (OMIM: 604960) PREDICTED: protein kin ( 488) 1676 180.6 7.8e-45
XP_011528152 (OMIM: 604960) PREDICTED: protein kin ( 488) 1676 180.6 7.8e-45
XP_011528154 (OMIM: 604960) PREDICTED: protein kin ( 447) 1464 159.6 1.6e-38
NP_001171903 (OMIM: 606513) protein kinase C and c ( 424) 1318 145.1 3.4e-34
NP_057307 (OMIM: 606513) protein kinase C and case ( 424) 1318 145.1 3.4e-34
NP_001171904 (OMIM: 606513) protein kinase C and c ( 424) 1318 145.1 3.4e-34
XP_011520470 (OMIM: 604416,606347) PREDICTED: prol ( 435) 339 48.0 6e-05
XP_011520465 (OMIM: 604416,606347) PREDICTED: prol ( 432) 313 45.4 0.00036
>>NP_065855 (OMIM: 606512) protein kinase C and casein k (444 aa)
initn: 3010 init1: 3010 opt: 3010 Z-score: 1641.5 bits: 312.9 E(85289): 1.1e-84
Smith-Waterman score: 3010; 100.0% identity (100.0% similar) in 444 aa overlap (1-444:1-444)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSSSYDEASLAPEETTDSFWEVGNYKRTVKRIDDGHRLCNDLMNCVQERAKIEKAYGQQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 MSSSYDEASLAPEETTDSFWEVGNYKRTVKRIDDGHRLCNDLMNCVQERAKIEKAYGQQL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD TDWAKRWRQLIEKGPQYGSLERAWGAIMTEADKVSELHQEVKNNLLNEDLEKVKNWQKDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 TDWAKRWRQLIEKGPQYGSLERAWGAIMTEADKVSELHQEVKNNLLNEDLEKVKNWQKDA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD YHKQIMGGFKETKEAEDGFRKAQKPWAKKMKELEAAKKAYHLACKEEKLAMTREMNSKTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 YHKQIMGGFKETKEAEDGFRKAQKPWAKKMKELEAAKKAYHLACKEEKLAMTREMNSKTE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD QSVTPEQQKKLQDKVDKCKQDVQKTQEKYEKVLEDVGKTTPQYMENMEQVFEQCQQFEEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 QSVTPEQQKKLQDKVDKCKQDVQKTQEKYEKVLEDVGKTTPQYMENMEQVFEQCQQFEEK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD RLVFLKEVLLDIKRHLNLAENSSYIHVYRELEQAIRGADAQEDLRWFRSTSGPGMPMNWP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 RLVFLKEVLLDIKRHLNLAENSSYIHVYRELEQAIRGADAQEDLRWFRSTSGPGMPMNWP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD QFEEWNPDLPHTTTKKEKQPKKAEGVALTNATGAVESTSQAGDRGSVSSYDRGQPYATEW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 QFEEWNPDLPHTTTKKEKQPKKAEGVALTNATGAVESTSQAGDRGSVSSYDRGQPYATEW
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD SDDESGNPFGGSETNGGANPFEDDSKGVRVRALYDYDGQEQDELSFKAGDELTKLGEEDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 SDDESGNPFGGSETNGGANPFEDDSKGVRVRALYDYDGQEQDELSFKAGDELTKLGEEDE
370 380 390 400 410 420
430 440
pF1KSD QGWCRGRLDSGQLGLYPANYVEAI
::::::::::::::::::::::::
NP_065 QGWCRGRLDSGQLGLYPANYVEAI
430 440
>>NP_001186512 (OMIM: 606512) protein kinase C and casei (444 aa)
initn: 3010 init1: 3010 opt: 3010 Z-score: 1641.5 bits: 312.9 E(85289): 1.1e-84
Smith-Waterman score: 3010; 100.0% identity (100.0% similar) in 444 aa overlap (1-444:1-444)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSSSYDEASLAPEETTDSFWEVGNYKRTVKRIDDGHRLCNDLMNCVQERAKIEKAYGQQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MSSSYDEASLAPEETTDSFWEVGNYKRTVKRIDDGHRLCNDLMNCVQERAKIEKAYGQQL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD TDWAKRWRQLIEKGPQYGSLERAWGAIMTEADKVSELHQEVKNNLLNEDLEKVKNWQKDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TDWAKRWRQLIEKGPQYGSLERAWGAIMTEADKVSELHQEVKNNLLNEDLEKVKNWQKDA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD YHKQIMGGFKETKEAEDGFRKAQKPWAKKMKELEAAKKAYHLACKEEKLAMTREMNSKTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YHKQIMGGFKETKEAEDGFRKAQKPWAKKMKELEAAKKAYHLACKEEKLAMTREMNSKTE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD QSVTPEQQKKLQDKVDKCKQDVQKTQEKYEKVLEDVGKTTPQYMENMEQVFEQCQQFEEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QSVTPEQQKKLQDKVDKCKQDVQKTQEKYEKVLEDVGKTTPQYMENMEQVFEQCQQFEEK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD RLVFLKEVLLDIKRHLNLAENSSYIHVYRELEQAIRGADAQEDLRWFRSTSGPGMPMNWP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RLVFLKEVLLDIKRHLNLAENSSYIHVYRELEQAIRGADAQEDLRWFRSTSGPGMPMNWP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD QFEEWNPDLPHTTTKKEKQPKKAEGVALTNATGAVESTSQAGDRGSVSSYDRGQPYATEW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QFEEWNPDLPHTTTKKEKQPKKAEGVALTNATGAVESTSQAGDRGSVSSYDRGQPYATEW
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD SDDESGNPFGGSETNGGANPFEDDSKGVRVRALYDYDGQEQDELSFKAGDELTKLGEEDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SDDESGNPFGGSETNGGANPFEDDSKGVRVRALYDYDGQEQDELSFKAGDELTKLGEEDE
370 380 390 400 410 420
430 440
pF1KSD QGWCRGRLDSGQLGLYPANYVEAI
::::::::::::::::::::::::
NP_001 QGWCRGRLDSGQLGLYPANYVEAI
430 440
>>XP_011512843 (OMIM: 606512) PREDICTED: protein kinase (444 aa)
initn: 3010 init1: 3010 opt: 3010 Z-score: 1641.5 bits: 312.9 E(85289): 1.1e-84
Smith-Waterman score: 3010; 100.0% identity (100.0% similar) in 444 aa overlap (1-444:1-444)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSSSYDEASLAPEETTDSFWEVGNYKRTVKRIDDGHRLCNDLMNCVQERAKIEKAYGQQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MSSSYDEASLAPEETTDSFWEVGNYKRTVKRIDDGHRLCNDLMNCVQERAKIEKAYGQQL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD TDWAKRWRQLIEKGPQYGSLERAWGAIMTEADKVSELHQEVKNNLLNEDLEKVKNWQKDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TDWAKRWRQLIEKGPQYGSLERAWGAIMTEADKVSELHQEVKNNLLNEDLEKVKNWQKDA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD YHKQIMGGFKETKEAEDGFRKAQKPWAKKMKELEAAKKAYHLACKEEKLAMTREMNSKTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YHKQIMGGFKETKEAEDGFRKAQKPWAKKMKELEAAKKAYHLACKEEKLAMTREMNSKTE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD QSVTPEQQKKLQDKVDKCKQDVQKTQEKYEKVLEDVGKTTPQYMENMEQVFEQCQQFEEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QSVTPEQQKKLQDKVDKCKQDVQKTQEKYEKVLEDVGKTTPQYMENMEQVFEQCQQFEEK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD RLVFLKEVLLDIKRHLNLAENSSYIHVYRELEQAIRGADAQEDLRWFRSTSGPGMPMNWP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RLVFLKEVLLDIKRHLNLAENSSYIHVYRELEQAIRGADAQEDLRWFRSTSGPGMPMNWP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD QFEEWNPDLPHTTTKKEKQPKKAEGVALTNATGAVESTSQAGDRGSVSSYDRGQPYATEW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QFEEWNPDLPHTTTKKEKQPKKAEGVALTNATGAVESTSQAGDRGSVSSYDRGQPYATEW
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD SDDESGNPFGGSETNGGANPFEDDSKGVRVRALYDYDGQEQDELSFKAGDELTKLGEEDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SDDESGNPFGGSETNGGANPFEDDSKGVRVRALYDYDGQEQDELSFKAGDELTKLGEEDE
370 380 390 400 410 420
430 440
pF1KSD QGWCRGRLDSGQLGLYPANYVEAI
::::::::::::::::::::::::
XP_011 QGWCRGRLDSGQLGLYPANYVEAI
430 440
>>NP_001171900 (OMIM: 604960) protein kinase C and casei (445 aa)
initn: 2144 init1: 1606 opt: 2155 Z-score: 1183.2 bits: 228.1 E(85289): 3.6e-59
Smith-Waterman score: 2155; 68.4% identity (89.5% similar) in 449 aa overlap (1-444:1-444)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSSSYDEASLAPEETTDSFWEVGNYKRTVKRIDDGHRLCNDLMNCVQERAKIEKAYGQQL
:: .::. :.. : ..:::::::::::::::::::::::.:::::..:::.:::::.:::
NP_001 MSVTYDD-SVGVEVSSDSFWEVGNYKRTVKRIDDGHRLCSDLMNCLHERARIEKAYAQQL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD TDWAKRWRQLIEKGPQYGSLERAWGAIMTEADKVSELHQEVKNNLLNEDLEKVKNWQKDA
:.::.:::::.:::::::..:.:: :.:.::..::::: ::: .:.:.:.::.:::::.:
NP_001 TEWARRWRQLVEKGPQYGTVEKAWMAFMSEAERVSELHLEVKASLMNDDFEKIKNWQKEA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KSD YHKQIMGGFKETKEAEDGFRKAQKPWAKKMKELEAAKKAYHLACKEEKLAMTREMNSKTE
.:::.::::::::::::::::::::::::.::.::::::.: ::::::::..:: :::..
NP_001 FHKQMMGGFKETKEAEDGFRKAQKPWAKKLKEVEAAKKAHHAACKEEKLAISREANSKAD
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KSD QSVTPEQQKKLQDKVDKCKQDVQKTQEKYEKVLEDVGKTTPQYMENMEQVFEQCQQFEEK
:..::: ::::::..:::::: ::.::::: :... . :::::::::::::::::::::
NP_001 PSLNPEQLKKLQDKIEKCKQDVLKTKEKYEKSLKELDQGTPQYMENMEQVFEQCQQFEEK
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KSD RLVFLKEVLLDIKRHLNLAENSSYIHVYRELEQAIRGADAQEDLRWFRSTSGPGMPMNWP
:: :..::::....::.:.. ..: .:..:::.::.::: :::::::.. :::: ::::
NP_001 RLRFFREVLLEVQKHLDLSNVAGYKAIYHDLEQSIRAADAVEDLRWFRANHGPGMAMNWP
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350
pF1KSD QFEEWNPDLPHTTTKKEKQPKKAEGVALT--NATGAVESTSQAGDRGSVSSYDRGQPYAT
:::::. :: .: ...::. : ..::.:: : :: . : . .:::::.. : : :
NP_001 QFEEWSADLNRTLSRREKK-KATDGVTLTGINQTG---DQSLPSKPSSVSSYEKTQSYPT
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD EWSDDESGNPFGGSETNGGANPFEDDSKG---VRVRALYDYDGQEQDELSFKAGDELTKL
.::::::.:::.....:: .:::.::. . :::::::::.:::.:::::::::::::.
NP_001 DWSDDESNNPFSSTDANGDSNPFDDDATSGTEVRVRALYDYEGQEHDELSFKAGDELTKM
360 370 380 390 400 410
420 430 440
pF1KSD GEEDEQGWCRGRLDSGQLGLYPANYVEAI
.:::::::.::::.::.:::::::::::
NP_001 EDEDEQGWCKGRLDNGQVGLYPANYVEAIQ
420 430 440
>>XP_005261376 (OMIM: 604960) PREDICTED: protein kinase (445 aa)
initn: 2144 init1: 1606 opt: 2155 Z-score: 1183.2 bits: 228.1 E(85289): 3.6e-59
Smith-Waterman score: 2155; 68.4% identity (89.5% similar) in 449 aa overlap (1-444:1-444)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSSSYDEASLAPEETTDSFWEVGNYKRTVKRIDDGHRLCNDLMNCVQERAKIEKAYGQQL
:: .::. :.. : ..:::::::::::::::::::::::.:::::..:::.:::::.:::
XP_005 MSVTYDD-SVGVEVSSDSFWEVGNYKRTVKRIDDGHRLCSDLMNCLHERARIEKAYAQQL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD TDWAKRWRQLIEKGPQYGSLERAWGAIMTEADKVSELHQEVKNNLLNEDLEKVKNWQKDA
:.::.:::::.:::::::..:.:: :.:.::..::::: ::: .:.:.:.::.:::::.:
XP_005 TEWARRWRQLVEKGPQYGTVEKAWMAFMSEAERVSELHLEVKASLMNDDFEKIKNWQKEA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KSD YHKQIMGGFKETKEAEDGFRKAQKPWAKKMKELEAAKKAYHLACKEEKLAMTREMNSKTE
.:::.::::::::::::::::::::::::.::.::::::.: ::::::::..:: :::..
XP_005 FHKQMMGGFKETKEAEDGFRKAQKPWAKKLKEVEAAKKAHHAACKEEKLAISREANSKAD
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KSD QSVTPEQQKKLQDKVDKCKQDVQKTQEKYEKVLEDVGKTTPQYMENMEQVFEQCQQFEEK
:..::: ::::::..:::::: ::.::::: :... . :::::::::::::::::::::
XP_005 PSLNPEQLKKLQDKIEKCKQDVLKTKEKYEKSLKELDQGTPQYMENMEQVFEQCQQFEEK
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KSD RLVFLKEVLLDIKRHLNLAENSSYIHVYRELEQAIRGADAQEDLRWFRSTSGPGMPMNWP
:: :..::::....::.:.. ..: .:..:::.::.::: :::::::.. :::: ::::
XP_005 RLRFFREVLLEVQKHLDLSNVAGYKAIYHDLEQSIRAADAVEDLRWFRANHGPGMAMNWP
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350
pF1KSD QFEEWNPDLPHTTTKKEKQPKKAEGVALT--NATGAVESTSQAGDRGSVSSYDRGQPYAT
:::::. :: .: ...::. : ..::.:: : :: . : . .:::::.. : : :
XP_005 QFEEWSADLNRTLSRREKK-KATDGVTLTGINQTG---DQSLPSKPSSVSSYEKTQSYPT
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD EWSDDESGNPFGGSETNGGANPFEDDSKG---VRVRALYDYDGQEQDELSFKAGDELTKL
.::::::.:::.....:: .:::.::. . :::::::::.:::.:::::::::::::.
XP_005 DWSDDESNNPFSSTDANGDSNPFDDDATSGTEVRVRALYDYEGQEHDELSFKAGDELTKM
360 370 380 390 400 410
420 430 440
pF1KSD GEEDEQGWCRGRLDSGQLGLYPANYVEAI
.:::::::.::::.::.:::::::::::
XP_005 EDEDEQGWCKGRLDNGQVGLYPANYVEAIQ
420 430 440
>>XP_016884056 (OMIM: 604960) PREDICTED: protein kinase (447 aa)
initn: 2144 init1: 1729 opt: 2141 Z-score: 1175.7 bits: 226.7 E(85289): 9.5e-59
Smith-Waterman score: 2141; 68.1% identity (89.1% similar) in 451 aa overlap (1-444:1-446)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSSSYDEASLAPEETTDSFWEVGNYKRTVKRIDDGHRLCNDLMNCVQERAKIEKAYGQQL
:: .::. :.. : ..:::::::::::::::::::::::.:::::..:::.:::::.:::
XP_016 MSVTYDD-SVGVEVSSDSFWEVGNYKRTVKRIDDGHRLCSDLMNCLHERARIEKAYAQQL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD TDWAKRWRQLIEKGPQYGSLERAWGAIMTEADKVSELHQEVKNNLLNEDLEKVKNWQKDA
:.::.:::::.:::::::..:.:: :.:.::..::::: ::: .:.:.:.::.:::::.:
XP_016 TEWARRWRQLVEKGPQYGTVEKAWMAFMSEAERVSELHLEVKASLMNDDFEKIKNWQKEA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KSD YHKQIMGGFKETKEAEDGFRKAQKPWAKKMKELEAAKKAYHLACKEEKLAMTREMNSKTE
.:::.::::::::::::::::::::::::.::.::::::.: ::::::::..:: :::..
XP_016 FHKQMMGGFKETKEAEDGFRKAQKPWAKKLKEVEAAKKAHHAACKEEKLAISREANSKAD
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KSD QSVTPEQQKKLQDKVDKCKQDVQKTQEKYEKVLEDVGKTTPQYMENMEQVFEQCQQFEEK
:..::: ::::::..:::::: ::.::::: :... . :::::::::::::::::::::
XP_016 PSLNPEQLKKLQDKIEKCKQDVLKTKEKYEKSLKELDQGTPQYMENMEQVFEQCQQFEEK
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KSD RLVFLKEVLLDIKRHLNLAENSSYIHVYRELEQAIRGADAQEDLRWFRSTSGPGMPMNWP
:: :..::::....::.:.. ..: .:..:::.::.::: :::::::.. :::: ::::
XP_016 RLRFFREVLLEVQKHLDLSNVAGYKAIYHDLEQSIRAADAVEDLRWFRANHGPGMAMNWP
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350
pF1KSD QFE--EWNPDLPHTTTKKEKQPKKAEGVALT--NATGAVESTSQAGDRGSVSSYDRGQPY
::: ::. :: .: ...::. : ..::.:: : :: . : . .:::::.. : :
XP_016 QFEDEEWSADLNRTLSRREKK-KATDGVTLTGINQTG---DQSLPSKPSSVSSYEKTQSY
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD ATEWSDDESGNPFGGSETNGGANPFEDDSKG---VRVRALYDYDGQEQDELSFKAGDELT
:.::::::.:::.....:: .:::.::. . :::::::::.:::.::::::::::::
XP_016 PTDWSDDESNNPFSSTDANGDSNPFDDDATSGTEVRVRALYDYEGQEHDELSFKAGDELT
360 370 380 390 400 410
420 430 440
pF1KSD KLGEEDEQGWCRGRLDSGQLGLYPANYVEAI
:. .:::::::.::::.::.:::::::::::
XP_016 KMEDEDEQGWCKGRLDNGQVGLYPANYVEAIQ
420 430 440
>>XP_016884054 (OMIM: 604960) PREDICTED: protein kinase (447 aa)
initn: 2144 init1: 1729 opt: 2141 Z-score: 1175.7 bits: 226.7 E(85289): 9.5e-59
Smith-Waterman score: 2141; 68.1% identity (89.1% similar) in 451 aa overlap (1-444:1-446)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSSSYDEASLAPEETTDSFWEVGNYKRTVKRIDDGHRLCNDLMNCVQERAKIEKAYGQQL
:: .::. :.. : ..:::::::::::::::::::::::.:::::..:::.:::::.:::
XP_016 MSVTYDD-SVGVEVSSDSFWEVGNYKRTVKRIDDGHRLCSDLMNCLHERARIEKAYAQQL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD TDWAKRWRQLIEKGPQYGSLERAWGAIMTEADKVSELHQEVKNNLLNEDLEKVKNWQKDA
:.::.:::::.:::::::..:.:: :.:.::..::::: ::: .:.:.:.::.:::::.:
XP_016 TEWARRWRQLVEKGPQYGTVEKAWMAFMSEAERVSELHLEVKASLMNDDFEKIKNWQKEA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KSD YHKQIMGGFKETKEAEDGFRKAQKPWAKKMKELEAAKKAYHLACKEEKLAMTREMNSKTE
.:::.::::::::::::::::::::::::.::.::::::.: ::::::::..:: :::..
XP_016 FHKQMMGGFKETKEAEDGFRKAQKPWAKKLKEVEAAKKAHHAACKEEKLAISREANSKAD
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KSD QSVTPEQQKKLQDKVDKCKQDVQKTQEKYEKVLEDVGKTTPQYMENMEQVFEQCQQFEEK
:..::: ::::::..:::::: ::.::::: :... . :::::::::::::::::::::
XP_016 PSLNPEQLKKLQDKIEKCKQDVLKTKEKYEKSLKELDQGTPQYMENMEQVFEQCQQFEEK
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KSD RLVFLKEVLLDIKRHLNLAENSSYIHVYRELEQAIRGADAQEDLRWFRSTSGPGMPMNWP
:: :..::::....::.:.. ..: .:..:::.::.::: :::::::.. :::: ::::
XP_016 RLRFFREVLLEVQKHLDLSNVAGYKAIYHDLEQSIRAADAVEDLRWFRANHGPGMAMNWP
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350
pF1KSD QFE--EWNPDLPHTTTKKEKQPKKAEGVALT--NATGAVESTSQAGDRGSVSSYDRGQPY
::: ::. :: .: ...::. : ..::.:: : :: . : . .:::::.. : :
XP_016 QFEDEEWSADLNRTLSRREKK-KATDGVTLTGINQTG---DQSLPSKPSSVSSYEKTQSY
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD ATEWSDDESGNPFGGSETNGGANPFEDDSKG---VRVRALYDYDGQEQDELSFKAGDELT
:.::::::.:::.....:: .:::.::. . :::::::::.:::.::::::::::::
XP_016 PTDWSDDESNNPFSSTDANGDSNPFDDDATSGTEVRVRALYDYEGQEHDELSFKAGDELT
360 370 380 390 400 410
420 430 440
pF1KSD KLGEEDEQGWCRGRLDSGQLGLYPANYVEAI
:. .:::::::.::::.::.:::::::::::
XP_016 KMEDEDEQGWCKGRLDNGQVGLYPANYVEAIQ
420 430 440
>>XP_016884055 (OMIM: 604960) PREDICTED: protein kinase (447 aa)
initn: 2144 init1: 1729 opt: 2141 Z-score: 1175.7 bits: 226.7 E(85289): 9.5e-59
Smith-Waterman score: 2141; 68.1% identity (89.1% similar) in 451 aa overlap (1-444:1-446)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSSSYDEASLAPEETTDSFWEVGNYKRTVKRIDDGHRLCNDLMNCVQERAKIEKAYGQQL
:: .::. :.. : ..:::::::::::::::::::::::.:::::..:::.:::::.:::
XP_016 MSVTYDD-SVGVEVSSDSFWEVGNYKRTVKRIDDGHRLCSDLMNCLHERARIEKAYAQQL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD TDWAKRWRQLIEKGPQYGSLERAWGAIMTEADKVSELHQEVKNNLLNEDLEKVKNWQKDA
:.::.:::::.:::::::..:.:: :.:.::..::::: ::: .:.:.:.::.:::::.:
XP_016 TEWARRWRQLVEKGPQYGTVEKAWMAFMSEAERVSELHLEVKASLMNDDFEKIKNWQKEA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KSD YHKQIMGGFKETKEAEDGFRKAQKPWAKKMKELEAAKKAYHLACKEEKLAMTREMNSKTE
.:::.::::::::::::::::::::::::.::.::::::.: ::::::::..:: :::..
XP_016 FHKQMMGGFKETKEAEDGFRKAQKPWAKKLKEVEAAKKAHHAACKEEKLAISREANSKAD
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KSD QSVTPEQQKKLQDKVDKCKQDVQKTQEKYEKVLEDVGKTTPQYMENMEQVFEQCQQFEEK
:..::: ::::::..:::::: ::.::::: :... . :::::::::::::::::::::
XP_016 PSLNPEQLKKLQDKIEKCKQDVLKTKEKYEKSLKELDQGTPQYMENMEQVFEQCQQFEEK
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KSD RLVFLKEVLLDIKRHLNLAENSSYIHVYRELEQAIRGADAQEDLRWFRSTSGPGMPMNWP
:: :..::::....::.:.. ..: .:..:::.::.::: :::::::.. :::: ::::
XP_016 RLRFFREVLLEVQKHLDLSNVAGYKAIYHDLEQSIRAADAVEDLRWFRANHGPGMAMNWP
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350
pF1KSD QFE--EWNPDLPHTTTKKEKQPKKAEGVALT--NATGAVESTSQAGDRGSVSSYDRGQPY
::: ::. :: .: ...::. : ..::.:: : :: . : . .:::::.. : :
XP_016 QFEDEEWSADLNRTLSRREKK-KATDGVTLTGINQTG---DQSLPSKPSSVSSYEKTQSY
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD ATEWSDDESGNPFGGSETNGGANPFEDDSKG---VRVRALYDYDGQEQDELSFKAGDELT
:.::::::.:::.....:: .:::.::. . :::::::::.:::.::::::::::::
XP_016 PTDWSDDESNNPFSSTDANGDSNPFDDDATSGTEVRVRALYDYEGQEHDELSFKAGDELT
360 370 380 390 400 410
420 430 440
pF1KSD KLGEEDEQGWCRGRLDSGQLGLYPANYVEAI
:. .:::::::.::::.::.:::::::::::
XP_016 KMEDEDEQGWCKGRLDNGQVGLYPANYVEAIQ
420 430 440
>>XP_011528155 (OMIM: 604960) PREDICTED: protein kinase (447 aa)
initn: 2144 init1: 1729 opt: 2141 Z-score: 1175.7 bits: 226.7 E(85289): 9.5e-59
Smith-Waterman score: 2141; 68.1% identity (89.1% similar) in 451 aa overlap (1-444:1-446)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSSSYDEASLAPEETTDSFWEVGNYKRTVKRIDDGHRLCNDLMNCVQERAKIEKAYGQQL
:: .::. :.. : ..:::::::::::::::::::::::.:::::..:::.:::::.:::
XP_011 MSVTYDD-SVGVEVSSDSFWEVGNYKRTVKRIDDGHRLCSDLMNCLHERARIEKAYAQQL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD TDWAKRWRQLIEKGPQYGSLERAWGAIMTEADKVSELHQEVKNNLLNEDLEKVKNWQKDA
:.::.:::::.:::::::..:.:: :.:.::..::::: ::: .:.:.:.::.:::::.:
XP_011 TEWARRWRQLVEKGPQYGTVEKAWMAFMSEAERVSELHLEVKASLMNDDFEKIKNWQKEA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KSD YHKQIMGGFKETKEAEDGFRKAQKPWAKKMKELEAAKKAYHLACKEEKLAMTREMNSKTE
.:::.::::::::::::::::::::::::.::.::::::.: ::::::::..:: :::..
XP_011 FHKQMMGGFKETKEAEDGFRKAQKPWAKKLKEVEAAKKAHHAACKEEKLAISREANSKAD
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KSD QSVTPEQQKKLQDKVDKCKQDVQKTQEKYEKVLEDVGKTTPQYMENMEQVFEQCQQFEEK
:..::: ::::::..:::::: ::.::::: :... . :::::::::::::::::::::
XP_011 PSLNPEQLKKLQDKIEKCKQDVLKTKEKYEKSLKELDQGTPQYMENMEQVFEQCQQFEEK
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KSD RLVFLKEVLLDIKRHLNLAENSSYIHVYRELEQAIRGADAQEDLRWFRSTSGPGMPMNWP
:: :..::::....::.:.. ..: .:..:::.::.::: :::::::.. :::: ::::
XP_011 RLRFFREVLLEVQKHLDLSNVAGYKAIYHDLEQSIRAADAVEDLRWFRANHGPGMAMNWP
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350
pF1KSD QFE--EWNPDLPHTTTKKEKQPKKAEGVALT--NATGAVESTSQAGDRGSVSSYDRGQPY
::: ::. :: .: ...::. : ..::.:: : :: . : . .:::::.. : :
XP_011 QFEDEEWSADLNRTLSRREKK-KATDGVTLTGINQTG---DQSLPSKPSSVSSYEKTQSY
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD ATEWSDDESGNPFGGSETNGGANPFEDDSKG---VRVRALYDYDGQEQDELSFKAGDELT
:.::::::.:::.....:: .:::.::. . :::::::::.:::.::::::::::::
XP_011 PTDWSDDESNNPFSSTDANGDSNPFDDDATSGTEVRVRALYDYEGQEHDELSFKAGDELT
360 370 380 390 400 410
420 430 440
pF1KSD KLGEEDEQGWCRGRLDSGQLGLYPANYVEAI
:. .:::::::.::::.::.:::::::::::
XP_011 KMEDEDEQGWCKGRLDNGQVGLYPANYVEAIQ
420 430 440
>>XP_016884057 (OMIM: 604960) PREDICTED: protein kinase (406 aa)
initn: 1960 init1: 1545 opt: 1929 Z-score: 1062.6 bits: 205.6 E(85289): 1.9e-52
Smith-Waterman score: 1929; 67.5% identity (89.0% similar) in 409 aa overlap (43-444:1-405)
20 30 40 50 60 70
pF1KSD EETTDSFWEVGNYKRTVKRIDDGHRLCNDLMNCVQERAKIEKAYGQQLTDWAKRWRQLIE
:::..:::.:::::.::::.::.:::::.:
XP_016 MNCLHERARIEKAYAQQLTEWARRWRQLVE
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KSD KGPQYGSLERAWGAIMTEADKVSELHQEVKNNLLNEDLEKVKNWQKDAYHKQIMGGFKET
::::::..:.:: :.:.::..::::: ::: .:.:.:.::.:::::.:.:::.:::::::
XP_016 KGPQYGTVEKAWMAFMSEAERVSELHLEVKASLMNDDFEKIKNWQKEAFHKQMMGGFKET
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KSD KEAEDGFRKAQKPWAKKMKELEAAKKAYHLACKEEKLAMTREMNSKTEQSVTPEQQKKLQ
:::::::::::::::::.::.::::::.: ::::::::..:: :::.. :..::: ::::
XP_016 KEAEDGFRKAQKPWAKKLKEVEAAKKAHHAACKEEKLAISREANSKADPSLNPEQLKKLQ
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KSD DKVDKCKQDVQKTQEKYEKVLEDVGKTTPQYMENMEQVFEQCQQFEEKRLVFLKEVLLDI
::..:::::: ::.::::: :... . ::::::::::::::::::::::: :..::::..
XP_016 DKIEKCKQDVLKTKEKYEKSLKELDQGTPQYMENMEQVFEQCQQFEEKRLRFFREVLLEV
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KSD KRHLNLAENSSYIHVYRELEQAIRGADAQEDLRWFRSTSGPGMPMNWPQFE--EWNPDLP
..::.:.. ..: .:..:::.::.::: :::::::.. :::: ::::::: ::. ::
XP_016 QKHLDLSNVAGYKAIYHDLEQSIRAADAVEDLRWFRANHGPGMAMNWPQFEDEEWSADLN
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360
pF1KSD HTTTKKEKQPKKAEGVALT--NATGAVESTSQAGDRGSVSSYDRGQPYATEWSDDESGNP
.: ...::. : ..::.:: : :: . : . .:::::.. : : :.::::::.::
XP_016 RTLSRREKK-KATDGVTLTGINQTG---DQSLPSKPSSVSSYEKTQSYPTDWSDDESNNP
280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KSD FGGSETNGGANPFEDDSKG---VRVRALYDYDGQEQDELSFKAGDELTKLGEEDEQGWCR
:.....:: .:::.::. . :::::::::.:::.:::::::::::::. .:::::::.
XP_016 FSSTDANGDSNPFDDDATSGTEVRVRALYDYEGQEHDELSFKAGDELTKMEDEDEQGWCK
330 340 350 360 370 380
430 440
pF1KSD GRLDSGQLGLYPANYVEAI
::::.::.:::::::::::
XP_016 GRLDNGQVGLYPANYVEAIQ
390 400
444 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 19:03:24 2016 done: Thu Nov 3 19:03:25 2016
Total Scan time: 9.000 Total Display time: 0.080
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]