Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA1368
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1368, 1047 aa
1>>>pF1KSDA1368 1047 - 1047 aa - 1047 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.8472+/-0.00101; mu= 9.1516+/- 0.060
mean_var=123.5518+/-24.711, 0's: 0 Z-trim(108.1): 60 B-trim: 172 in 1/50
Lambda= 0.115385
statistics sampled from 9936 (9994) to 9936 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.657), E-opt: 0.2 (0.307), width: 16
Scan time: 4.750
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS75288.1 SEMA6A gene_id:57556|Hs108|chr5 (1047) 7072 1189.2 0
CCDS47256.1 SEMA6A gene_id:57556|Hs108|chr5 (1030) 3956 670.5 5e-192
CCDS32225.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 (1073) 2783 475.3 3.1e-133
CCDS32228.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 ( 597) 2518 431.1 3.5e-120
CCDS32227.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 ( 998) 2511 430.0 1.2e-119
CCDS32226.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 (1017) 2498 427.8 5.7e-119
CCDS32224.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 (1011) 2434 417.2 9.1e-116
CCDS12131.1 SEMA6B gene_id:10501|Hs108|chr19 ( 888) 2393 410.3 9.1e-114
CCDS32229.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 ( 476) 2088 359.5 1e-98
CCDS984.1 SEMA6C gene_id:10500|Hs108|chr1 ( 930) 1851 320.1 1.4e-86
CCDS53364.1 SEMA6C gene_id:10500|Hs108|chr1 ( 962) 1851 320.1 1.4e-86
CCDS53363.1 SEMA6C gene_id:10500|Hs108|chr1 ( 922) 1221 215.2 5.1e-55
CCDS5599.1 SEMA3A gene_id:10371|Hs108|chr7 ( 771) 981 175.3 4.6e-43
CCDS3875.1 SEMA5A gene_id:9037|Hs108|chr5 (1074) 895 161.0 1.3e-38
CCDS74995.1 SEMA5B gene_id:54437|Hs108|chr3 (1057) 835 151.0 1.3e-35
CCDS35491.1 SEMA5B gene_id:54437|Hs108|chr3 (1151) 835 151.0 1.4e-35
CCDS58848.1 SEMA5B gene_id:54437|Hs108|chr3 (1205) 835 151.0 1.4e-35
CCDS74941.1 SEMA3B gene_id:7869|Hs108|chr3 ( 749) 809 146.6 1.9e-34
CCDS47991.1 SEMA4D gene_id:10507|Hs108|chr9 ( 738) 802 145.5 4.1e-34
CCDS6685.1 SEMA4D gene_id:10507|Hs108|chr9 ( 862) 802 145.5 4.7e-34
CCDS77744.1 SEMA3B gene_id:7869|Hs108|chr3 ( 748) 799 145.0 5.9e-34
CCDS82780.1 SEMA3F gene_id:6405|Hs108|chr3 ( 686) 738 134.8 6.2e-31
CCDS82779.1 SEMA3F gene_id:6405|Hs108|chr3 ( 754) 738 134.8 6.8e-31
CCDS2811.1 SEMA3F gene_id:6405|Hs108|chr3 ( 785) 738 134.8 7e-31
CCDS55121.1 SEMA3E gene_id:9723|Hs108|chr7 ( 715) 719 131.6 5.8e-30
CCDS34674.1 SEMA3E gene_id:9723|Hs108|chr7 ( 775) 719 131.6 6.2e-30
CCDS5596.1 SEMA3C gene_id:10512|Hs108|chr7 ( 751) 703 129.0 3.8e-29
CCDS2029.1 SEMA4C gene_id:54910|Hs108|chr2 ( 833) 648 119.8 2.4e-26
CCDS1132.1 SEMA4A gene_id:64218|Hs108|chr1 ( 761) 644 119.2 3.5e-26
CCDS77743.1 SEMA3B gene_id:7869|Hs108|chr3 ( 754) 621 115.3 4.9e-25
CCDS34676.1 SEMA3D gene_id:223117|Hs108|chr7 ( 777) 602 112.2 4.5e-24
CCDS2856.1 SEMA3G gene_id:56920|Hs108|chr3 ( 782) 521 98.7 5.2e-20
CCDS45347.1 SEMA4B gene_id:10509|Hs108|chr15 ( 837) 505 96.0 3.5e-19
CCDS53378.1 SEMA4A gene_id:64218|Hs108|chr1 ( 629) 495 94.3 8.6e-19
CCDS74529.1 SEMA4F gene_id:10505|Hs108|chr2 ( 737) 485 92.7 3.2e-18
CCDS55724.1 SEMA4G gene_id:57715|Hs108|chr10 ( 702) 468 89.8 2.2e-17
CCDS7501.1 SEMA4G gene_id:57715|Hs108|chr10 ( 843) 468 89.9 2.5e-17
CCDS10262.1 SEMA7A gene_id:8482|Hs108|chr15 ( 666) 414 80.8 1e-14
CCDS53959.1 SEMA7A gene_id:8482|Hs108|chr15 ( 652) 407 79.7 2.3e-14
CCDS62942.1 SEMA4F gene_id:10505|Hs108|chr2 ( 615) 385 76.0 2.8e-13
CCDS1955.1 SEMA4F gene_id:10505|Hs108|chr2 ( 770) 357 71.4 8.5e-12
>>CCDS75288.1 SEMA6A gene_id:57556|Hs108|chr5 (1047 aa)
initn: 7072 init1: 7072 opt: 7072 Z-score: 6364.2 bits: 1189.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7072; 100.0% identity (100.0% similar) in 1047 aa overlap (1-1047:1-1047)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MRSEALLLYFTLLHFAGAGFPEDSEPISISHGNYTKQYPVFVGHKPGRNTTQRHRLDIQM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MRSEALLLYFTLLHFAGAGFPEDSEPISISHGNYTKQYPVFVGHKPGRNTTQRHRLDIQM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD IMIMNGTLYIAARDHIYTVDIDTSHTEEIYCSKKLTWKSRQADVDTCRMKGKHKDECHNF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 IMIMNGTLYIAARDHIYTVDIDTSHTEEIYCSKKLTWKSRQADVDTCRMKGKHKDECHNF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD IKVLLKKNDDALFVCGTNAFNPSCRNYKMDTLEPFGDEFSGMARCPYDAKHANVALFADG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 IKVLLKKNDDALFVCGTNAFNPSCRNYKMDTLEPFGDEFSGMARCPYDAKHANVALFADG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD KLYSATVTDFLAIDAVIYRSLGESPTLRTVKHDSKWLKEPYFVQAVDYGDYIYFFFREIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 KLYSATVTDFLAIDAVIYRSLGESPTLRTVKHDSKWLKEPYFVQAVDYGDYIYFFFREIA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD VEYNTMGKVVFPRVAQVCKNDMGGSQRVLEKQWTSFLKARLNCSVPGDSHFYFNILQAVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 VEYNTMGKVVFPRVAQVCKNDMGGSQRVLEKQWTSFLKARLNCSVPGDSHFYFNILQAVT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD DVIRINGRDVVLATFSTPYNSIPGSAVCAYDMLDIASVFTGRFKEQKSPDSTWTPVPDER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 DVIRINGRDVVLATFSTPYNSIPGSAVCAYDMLDIASVFTGRFKEQKSPDSTWTPVPDER
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD VPKPRPGCCAGSSSLERYATSNEFPDDTLNFIKTHPLMDEAVPSIFNRPWFLRTMVRYRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 VPKPRPGCCAGSSSLERYATSNEFPDDTLNFIKTHPLMDEAVPSIFNRPWFLRTMVRYRL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD TKIAVDTAAGPYQNHTVVFLGSEKGIILKFLARIGNSGFLNDSLFLEEMSVYNSEKCSYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 TKIAVDTAAGPYQNHTVVFLGSEKGIILKFLARIGNSGFLNDSLFLEEMSVYNSEKCSYD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD GVEDKRIMGMQLDRASSSLYVAFSTCVIKVPLGRCERHGKCKKTCIASRDPYCGWIKEGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 GVEDKRIMGMQLDRASSSLYVAFSTCVIKVPLGRCERHGKCKKTCIASRDPYCGWIKEGG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD ACSHLSPNSRLTFEQDIERGNTDGLGDCHNSFVALNDISTPLPDNEMSYNTVYGHSSSLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 ACSHLSPNSRLTFEQDIERGNTDGLGDCHNSFVALNDISTPLPDNEMSYNTVYGHSSSLL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD PSTTTSDSTAQEGYESRGGMLDWKHLLDSPDSTDPLGAVSSHNHQDKKGVIRESYLKGHD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 PSTTTSDSTAQEGYESRGGMLDWKHLLDSPDSTDPLGAVSSHNHQDKKGVIRESYLKGHD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD QLVPVTLLAIAVILAFVMGAVFSGITVYCVCDHRRKDVAVVQRKEKELTHSRRGSMSSVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 QLVPVTLLAIAVILAFVMGAVFSGITVYCVCDHRRKDVAVVQRKEKELTHSRRGSMSSVT
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD KLSGLFGDTQSKDPKPEAILTPLMHNGKLATPGNTAKMLIKADQHHLDLTALPTPESTPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 KLSGLFGDTQSKDPKPEAILTPLMHNGKLATPGNTAKMLIKADQHHLDLTALPTPESTPT
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD LQQKRKPSRGSREWERNQNLINACTKDMPPMGSPVIPTDLPLRASPSHIPSVVVLPITQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LQQKRKPSRGSREWERNQNLINACTKDMPPMGSPVIPTDLPLRASPSHIPSVVVLPITQQ
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD GYQHEYVDQPKMSEVAQMALEDQAATLEYKTIKEHLSSKSPNHGVNLVENLDSLPPKVPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 GYQHEYVDQPKMSEVAQMALEDQAATLEYKTIKEHLSSKSPNHGVNLVENLDSLPPKVPQ
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD REASLGPPGASLSQTGLSKRLEMHHSSSYGVDYKRSYPTNSLTRSHQATTLKRNNTNSSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 REASLGPPGASLSQTGLSKRLEMHHSSSYGVDYKRSYPTNSLTRSHQATTLKRNNTNSSN
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD SSHLSRNQSFGRGDNPPPAPQRVDSIQVHSSQPSGQAVTVSRQPSLNAYNSLTRSGLKRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 SSHLSRNQSFGRGDNPPPAPQRVDSIQVHSSQPSGQAVTVSRQPSLNAYNSLTRSGLKRT
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040
pF1KSD PSLKPDVPPKPSFAPLSTSMKPNDACT
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 PSLKPDVPPKPSFAPLSTSMKPNDACT
1030 1040
>>CCDS47256.1 SEMA6A gene_id:57556|Hs108|chr5 (1030 aa)
initn: 3983 init1: 3951 opt: 3956 Z-score: 3561.0 bits: 670.5 E(32554): 5e-192
Smith-Waterman score: 6914; 98.4% identity (98.4% similar) in 1047 aa overlap (1-1047:1-1030)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MRSEALLLYFTLLHFAGAGFPEDSEPISISHGNYTKQYPVFVGHKPGRNTTQRHRLDIQM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MRSEALLLYFTLLHFAGAGFPEDSEPISISHGNYTKQYPVFVGHKPGRNTTQRHRLDIQM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD IMIMNGTLYIAARDHIYTVDIDTSHTEEIYCSKKLTWKSRQADVDTCRMKGKHKDECHNF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 IMIMNGTLYIAARDHIYTVDIDTSHTEEIYCSKKLTWKSRQADVDTCRMKGKHKDECHNF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD IKVLLKKNDDALFVCGTNAFNPSCRNYKMDTLEPFGDEFSGMARCPYDAKHANVALFADG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 IKVLLKKNDDALFVCGTNAFNPSCRNYKMDTLEPFGDEFSGMARCPYDAKHANVALFADG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD KLYSATVTDFLAIDAVIYRSLGESPTLRTVKHDSKWLKEPYFVQAVDYGDYIYFFFREIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KLYSATVTDFLAIDAVIYRSLGESPTLRTVKHDSKWLKEPYFVQAVDYGDYIYFFFREIA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD VEYNTMGKVVFPRVAQVCKNDMGGSQRVLEKQWTSFLKARLNCSVPGDSHFYFNILQAVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VEYNTMGKVVFPRVAQVCKNDMGGSQRVLEKQWTSFLKARLNCSVPGDSHFYFNILQAVT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD DVIRINGRDVVLATFSTPYNSIPGSAVCAYDMLDIASVFTGRFKEQKSPDSTWTPVPDER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DVIRINGRDVVLATFSTPYNSIPGSAVCAYDMLDIASVFTGRFKEQKSPDSTWTPVPDER
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD VPKPRPGCCAGSSSLERYATSNEFPDDTLNFIKTHPLMDEAVPSIFNRPWFLRTMVRYRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VPKPRPGCCAGSSSLERYATSNEFPDDTLNFIKTHPLMDEAVPSIFNRPWFLRTMVRYRL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD TKIAVDTAAGPYQNHTVVFLGSEKGIILKFLARIGNSGFLNDSLFLEEMSVYNSEKCSYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TKIAVDTAAGPYQNHTVVFLGSEKGIILKFLARIGNSGFLNDSLFLEEMSVYNSEKCSYD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD GVEDKRIMGMQLDRASSSLYVAFSTCVIKVPLGRCERHGKCKKTCIASRDPYCGWIKEGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GVEDKRIMGMQLDRASSSLYVAFSTCVIKVPLGRCERHGKCKKTCIASRDPYCGWIKEGG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD ACSHLSPNSRLTFEQDIERGNTDGLGDCHNSFVALNDISTPLPDNEMSYNTVYGHSSSLL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::
CCDS47 ACSHLSPNSRLTFEQDIERGNTDGLGDCHNSFVALN-----------------GHSSSLL
550 560 570 580
610 620 630 640 650 660
pF1KSD PSTTTSDSTAQEGYESRGGMLDWKHLLDSPDSTDPLGAVSSHNHQDKKGVIRESYLKGHD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PSTTTSDSTAQEGYESRGGMLDWKHLLDSPDSTDPLGAVSSHNHQDKKGVIRESYLKGHD
590 600 610 620 630 640
670 680 690 700 710 720
pF1KSD QLVPVTLLAIAVILAFVMGAVFSGITVYCVCDHRRKDVAVVQRKEKELTHSRRGSMSSVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QLVPVTLLAIAVILAFVMGAVFSGITVYCVCDHRRKDVAVVQRKEKELTHSRRGSMSSVT
650 660 670 680 690 700
730 740 750 760 770 780
pF1KSD KLSGLFGDTQSKDPKPEAILTPLMHNGKLATPGNTAKMLIKADQHHLDLTALPTPESTPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KLSGLFGDTQSKDPKPEAILTPLMHNGKLATPGNTAKMLIKADQHHLDLTALPTPESTPT
710 720 730 740 750 760
790 800 810 820 830 840
pF1KSD LQQKRKPSRGSREWERNQNLINACTKDMPPMGSPVIPTDLPLRASPSHIPSVVVLPITQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LQQKRKPSRGSREWERNQNLINACTKDMPPMGSPVIPTDLPLRASPSHIPSVVVLPITQQ
770 780 790 800 810 820
850 860 870 880 890 900
pF1KSD GYQHEYVDQPKMSEVAQMALEDQAATLEYKTIKEHLSSKSPNHGVNLVENLDSLPPKVPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GYQHEYVDQPKMSEVAQMALEDQAATLEYKTIKEHLSSKSPNHGVNLVENLDSLPPKVPQ
830 840 850 860 870 880
910 920 930 940 950 960
pF1KSD REASLGPPGASLSQTGLSKRLEMHHSSSYGVDYKRSYPTNSLTRSHQATTLKRNNTNSSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 REASLGPPGASLSQTGLSKRLEMHHSSSYGVDYKRSYPTNSLTRSHQATTLKRNNTNSSN
890 900 910 920 930 940
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD SSHLSRNQSFGRGDNPPPAPQRVDSIQVHSSQPSGQAVTVSRQPSLNAYNSLTRSGLKRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SSHLSRNQSFGRGDNPPPAPQRVDSIQVHSSQPSGQAVTVSRQPSLNAYNSLTRSGLKRT
950 960 970 980 990 1000
1030 1040
pF1KSD PSLKPDVPPKPSFAPLSTSMKPNDACT
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PSLKPDVPPKPSFAPLSTSMKPNDACT
1010 1020 1030
>>CCDS32225.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 (1073 aa)
initn: 2897 init1: 1929 opt: 2783 Z-score: 2505.4 bits: 475.3 E(32554): 3.1e-133
Smith-Waterman score: 3080; 46.2% identity (70.9% similar) in 1105 aa overlap (1-1042:1-1067)
10 20 30 40 50
pF1KSD MRSEALLLYFTLL---HFAGAGFPEDSEPISISHGNYTKQYPVFVGHKPGRNTTQRHRLD
:: : :. :: .. ...::::.::.. .:..::::: : .:. : .: ::::
CCDS32 MRVFLLCAYILLLMVSQLRAVSFPEDDEPLNTVDYHYSRQYPVFRG-RPSGNESQ-HRLD
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD IQMIMIMNGTLYIAARDHIYTVDIDTSHTEEIYCSKKLTWKSRQADVDTCRMKGKHKDEC
.:... . :::::.::..:::... :. .:::::.::: : ..: :::::::::
CCDS32 FQLMLKIRDTLYIAGRDQVYTVNLNEMPKTEVIPNKKLTWRSRQQDRENCAMKGKHKDEC
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD HNFIKVLLKKNDDALFVCGTNAFNPSCRNYKMDTLEPFGDEFSGMARCPYDAKHANVALF
::::::.. .::. .:::::::::: :: :...::: :.:.::.::::.::...:::::
CCDS32 HNFIKVFVPRNDEMVFVCGTNAFNPMCRYYRLSTLEYDGEEISGLARCPFDARQTNVALF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD ADGKLYSATVTDFLAIDAVIYRSLGESPTLRTVKHDSKWLKEPYFVQAVDYGDYIYFFFR
::::::::::.:::: :::::::.:.. .:::.:.::::.:::.:..:..::.:.:::::
CCDS32 ADGKLYSATVADFLASDAVIYRSMGDGSALRTIKYDSKWIKEPHFLHAIEYGNYVYFFFR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD EIAVEYNTMGKVVFPRVAQVCKNDMGGSQRVLEKQWTSFLKARLNCSVPGDSHFYFNILQ
:::::.:..::.:. :::..::::::::::::::.::::::::::::::::: :::..::
CCDS32 EIAVEHNNLGKAVYSRVARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLKARLNCSVPGDSFFYFDVLQ
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD AVTDVIRINGRDVVLATFSTPYNSIPGSAVCAYDMLDIASVFTGRFKEQKSPDSTWTPVP
..::.:.::: .:...:.: ::::::::::..: :: .:: :::::::.:::.:: ::
CCDS32 SITDIIQINGIPTVVGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQKTPDSVWTAVP
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD DERVPKPRPGCCAGSSSLERYATSNEFPDDTLNFIKTHPLMDEAVPSIFNRPWFLRTMVR
...:::::::::: . : : :: .:::.::.:::.::::: ::: : ..::: .: ::
CCDS32 EDKVPKPRPGCCAKHGLAEAYKTSIDFPDETLSFIKSHPLMDSAVPPIADEPWFTKTRVR
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KSD YRLTKIAVDTAAGPYQNHTVVFLGSEKGIILKFLARIGNSGF-LNDSLFLEEMSVYNSEK
:::: :.:: .::::::.::.:.::: :..:: ::. .: : ::::..:::. .:: :
CCDS32 YRLTAISVDHSAGPYQNYTVIFVGSEAGMVLKVLAK--TSPFSLNDSVLLEEIEAYNHAK
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KSD CSYDGVEDKRIMGMQLDRASSSLYVAFSTCVIKVPLGRCERHGKCKKTCIASRDPYCGWI
:: .. :::.....:::. .::::::.:.:..::.::::.:.:::.:::::::::::.
CCDS32 CSAENEEDKKVISLQLDKDHHALYVAFSSCIIRIPLSRCERYGSCKKSCIASRDPYCGWL
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KSD KEGGACSHLSPNSRLT-FEQDIERGNTDGLGDCHNSFVALNDISTPLPDNEMSYNTVYGH
..: .:....:. .::: : ::: :::::. . .. :: . ..:
CCDS32 SQG-SCGRVTPGMLAEGYEQDTEFGNTAHLGDCHEIL-----PTSTTPDYK-----IFGG
540 550 560 570 580
600 610 620 630 640
pF1KSD SSSLLPSTTTSDSTAQEGYESRGGMLD-WKHLL---------DSP---DSTDPLGAVSSH
.: . ...: .: : ..: :. : :.: : ::::...
CCDS32 PTSDMEVSSSSVTTMASIPEITPKVIDTWRPKLTSSRKFVVQDDPNTSDFTDPLSGIP--
590 600 610 620 630 640
650 660 670 680 690 700
pF1KSD NHQDKKGVIRESYLKGHDQLVPVTLLAIAVILAFVMGAVFSGITVYCVCDHR-RKDVAVV
::: : .:.: ...: :. :::.:: ..:..::: : ::. .
CCDS32 -----KGVRWEVQSGESNQMVHMNVLITCVFAAFVLGAFIAGVAVYCYRDMFVRKNRKI-
650 660 670 680 690
710 720 730 740 750
pF1KSD QRKEKELTHSRRGSMSSVTKLSGLFGDTQSKDPKPEAILTPLMHNGKLAT----P--GNT
.:. : ..: : .: .::.::: :. :. . . : .: .... :.. : :.:
CCDS32 -HKDAESAQSCTDSSGSFAKLNGLF-DSPVKEYQ-QNIDSPKLYSNLLTSRKELPPNGDT
700 710 720 730 740 750
760 770 780 790 800 810
pF1KSD AKMLIKADQHHLDLTALPTPESTPTLQQKRKPSRGSREWERNQNLINACTKDMPPMGSPV
.:.. . .:.:::::::::.:.:: . :. :. .. .: :. : .
CCDS32 KSMVMDHRGQPPELAALPTPESTPVLHQKTLQAMKSHS-EKAHGH-GASRKETPQFFPSS
760 770 780 790 800 810
820 830 840 850 860
pF1KSD IPTDLPLRASPSHIPSVVVLPITQQGYQHEYVD------QPKMSEVAQMALEDQAATLEY
: :: : .::::..::: . . :. . . . :.... . .... .
CCDS32 PPPHSPL--SHGHIPSAIVLPNATHDYNTSFSNSNAHKAEKKLQNIDHPLTKSSSKRDHR
820 830 840 850 860 870
870 880 890 900
pF1KSD KTIK---------EHLSSKSPN-----------HGVNLVENLDSL---PPKVPQREASLG
... .::.. . : : ... . :. :::::.:::::
CCDS32 RSVDSRNTLNDLLKHLNDPNSNPKAIMGDIQMAHQNLMLDPMGSMSEVPPKVPNREASLY
880 890 900 910 920 930
910 920 930 940 950 960
pF1KSD PPGASLSQTGLSKRLEMHHSSSY---GVDYKRSYPTNSLTRSHQATTLKRNNTNSSNSSH
: ..: ... .::... . . ... .:.: :: : :. ... .: :: :.
CCDS32 SPPSTLPRNSPTKRVDVPTTPGVPMTSLERQRGYHKNSSQR-HSISAMPKN-LNSPNGVL
940 950 960 970 980
970 980 990 1000 1010
pF1KSD LSRNQSFGRGDN-PPPAPQRVDSIQ-----VHSSQPSGQAVTVSRQPSLNAYNSLTRSGL
:::. :..:: : :. .:: :: :: ::: .::: : .. ..: :.::
CCDS32 LSRQPSMNRGGYMPTPTGAKVDYIQGTPVSVHL-QPS-----LSRQSSYTSNGTLPRTGL
990 1000 1010 1020 1030 1040
1020 1030 1040
pF1KSD KRTPSLKPDVPPKPSFAPLSTSMKPNDACT
::::::::::::::::.: . :..:
CCDS32 KRTPSLKPDVPPKPSFVPQTPSVRPLNKYTY
1050 1060 1070
>>CCDS32228.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 (597 aa)
initn: 2471 init1: 1928 opt: 2518 Z-score: 2271.2 bits: 431.1 E(32554): 3.5e-120
Smith-Waterman score: 2518; 59.4% identity (84.1% similar) in 596 aa overlap (1-591:1-591)
10 20 30 40 50
pF1KSD MRSEALLLYFTLL---HFAGAGFPEDSEPISISHGNYTKQYPVFVGHKPGRNTTQRHRLD
:: : :. :: .. ...::::.::.. .:..::::: : .:. : .: ::::
CCDS32 MRVFLLCAYILLLMVSQLRAVSFPEDDEPLNTVDYHYSRQYPVFRG-RPSGNESQ-HRLD
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD IQMIMIMNGTLYIAARDHIYTVDIDTSHTEEIYCSKKLTWKSRQADVDTCRMKGKHKDEC
.:... . :::::.::..:::... :. .:::::.::: : ..: :::::::::
CCDS32 FQLMLKIRDTLYIAGRDQVYTVNLNEMPKTEVIPNKKLTWRSRQQDRENCAMKGKHKDEC
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD HNFIKVLLKKNDDALFVCGTNAFNPSCRNYKMDTLEPFGDEFSGMARCPYDAKHANVALF
::::::.. .::. .:::::::::: :: :...::: :.:.::.::::.::...:::::
CCDS32 HNFIKVFVPRNDEMVFVCGTNAFNPMCRYYRLSTLEYDGEEISGLARCPFDARQTNVALF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD ADGKLYSATVTDFLAIDAVIYRSLGESPTLRTVKHDSKWLKEPYFVQAVDYGDYIYFFFR
::::::::::.:::: :::::::.:.. .:::.:.::::.:::.:..:..::.:.:::::
CCDS32 ADGKLYSATVADFLASDAVIYRSMGDGSALRTIKYDSKWIKEPHFLHAIEYGNYVYFFFR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD EIAVEYNTMGKVVFPRVAQVCKNDMGGSQRVLEKQWTSFLKARLNCSVPGDSHFYFNILQ
:::::.:..::.:. :::..::::::::::::::.::::::::::::::::: :::..::
CCDS32 EIAVEHNNLGKAVYSRVARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLKARLNCSVPGDSFFYFDVLQ
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD AVTDVIRINGRDVVLATFSTPYNSIPGSAVCAYDMLDIASVFTGRFKEQKSPDSTWTPVP
..::.:.::: .:...:.: ::::::::::..: :: .:: :::::::.:::.:: ::
CCDS32 SITDIIQINGIPTVVGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQKTPDSVWTAVP
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD DERVPKPRPGCCAGSSSLERYATSNEFPDDTLNFIKTHPLMDEAVPSIFNRPWFLRTMVR
...:::::::::: . : : :: .:::.::.:::.::::: ::: : ..::: .: ::
CCDS32 EDKVPKPRPGCCAKHGLAEAYKTSIDFPDETLSFIKSHPLMDSAVPPIADEPWFTKTRVR
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KSD YRLTKIAVDTAAGPYQNHTVVFLGSEKGIILKFLARIGNSGF-LNDSLFLEEMSVYNSEK
:::: :.:: .::::::.::.:.::: :..:: ::. .: : ::::..:::. .:: :
CCDS32 YRLTAISVDHSAGPYQNYTVIFVGSEAGMVLKVLAK--TSPFSLNDSVLLEEIEAYNHAK
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KSD CSYDGVEDKRIMGMQLDRASSSLYVAFSTCVIKVPLGRCERHGKCKKTCIASRDPYCGWI
:: .. :::.....:::. .::::::.:.:..::.::::.:.:::.:::::::::::.
CCDS32 CSAENEEDKKVISLQLDKDHHALYVAFSSCIIRIPLSRCERYGSCKKSCIASRDPYCGWL
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KSD KEGGACSHLSPNSRLT-FEQDIERGNTDGLGDCHNSFVALNDISTPLPDNEMSYNTVYGH
..: .:....:. .::: : ::: :::::. :. ....: . :.. : ..
CCDS32 SQG-SCGRVTPGMLAEGYEQDTEFGNTAHLGDCHDMEVSSSSVTTMVYDGKSSLESPTRW
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KSD SSSLLPSTTTSDSTAQEGYESRGGMLDWKHLLDSPDSTDPLGAVSSHNHQDKKGVIRESY
CCDS32 ST
>>CCDS32227.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 (998 aa)
initn: 2811 init1: 1929 opt: 2511 Z-score: 2261.3 bits: 430.0 E(32554): 1.2e-119
Smith-Waterman score: 2917; 45.1% identity (68.8% similar) in 1092 aa overlap (1-1042:1-992)
10 20 30 40 50
pF1KSD MRSEALLLYFTLL---HFAGAGFPEDSEPISISHGNYTKQYPVFVGHKPGRNTTQRHRLD
:: : :. :: .. ...::::.::.. .:..::::: : .:. : .: ::::
CCDS32 MRVFLLCAYILLLMVSQLRAVSFPEDDEPLNTVDYHYSRQYPVFRG-RPSGNESQ-HRLD
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD IQMIMIMNGTLYIAARDHIYTVDIDTSHTEEIYCSKKLTWKSRQADVDTCRMKGKHKDEC
.:... . :::::.::..:::... :. .:::::.::: : ..: :::::::::
CCDS32 FQLMLKIRDTLYIAGRDQVYTVNLNEMPKTEVIPNKKLTWRSRQQDRENCAMKGKHKDEC
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD HNFIKVLLKKNDDALFVCGTNAFNPSCRNYKMDTLEPFGDEFSGMARCPYDAKHANVALF
::::::.. .::. .:::::::::: :: :...::: :.:.::.::::.::...:::::
CCDS32 HNFIKVFVPRNDEMVFVCGTNAFNPMCRYYRLSTLEYDGEEISGLARCPFDARQTNVALF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD ADGKLYSATVTDFLAIDAVIYRSLGESPTLRTVKHDSKWLKEPYFVQAVDYGDYIYFFFR
::::::::::.:::: :::::::.:.. .:::.:.::::.:::.:..:..::.:.:::::
CCDS32 ADGKLYSATVADFLASDAVIYRSMGDGSALRTIKYDSKWIKEPHFLHAIEYGNYVYFFFR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD EIAVEYNTMGKVVFPRVAQVCKNDMGGSQRVLEKQWTSFLKARLNCSVPGDSHFYFNILQ
:::::.:..::.:. :::..::::::::::::::.::::::::::::::::: :::..::
CCDS32 EIAVEHNNLGKAVYSRVARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLKARLNCSVPGDSFFYFDVLQ
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD AVTDVIRINGRDVVLATFSTPYNSIPGSAVCAYDMLDIASVFTGRFKEQKSPDSTWTPVP
..::.:.::: .:...:.: ::::::::::..: :: .:: :::::::.:::.:: ::
CCDS32 SITDIIQINGIPTVVGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQKTPDSVWTAVP
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD DERVPKPRPGCCAGSSSLERYATSNEFPDDTLNFIKTHPLMDEAVPSIFNRPWFLRTMVR
...:::::::::: . : : :: .:::.::.:::.::::: ::: : ..::: .: ::
CCDS32 EDKVPKPRPGCCAKHGLAEAYKTSIDFPDETLSFIKSHPLMDSAVPPIADEPWFTKTRVR
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KSD YRLTKIAVDTAAGPYQNHTVVFLGSEKGIILKFLARIGNSGF-LNDSLFLEEMSVYNSEK
:::: :.:: .::::::.::.:.::: :..:: ::. .: : ::::..:::. .:: :
CCDS32 YRLTAISVDHSAGPYQNYTVIFVGSEAGMVLKVLAK--TSPFSLNDSVLLEEIEAYNHAK
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KSD CSYDGVEDKRIMGMQLDRASSSLYVAFSTCVIKVPLGRCERHGKCKKTCIASRDPYCGWI
:: .. :::.....:::. .::::::.:.:..::.::::.:.:::.:::::::::::.
CCDS32 CSAENEEDKKVISLQLDKDHHALYVAFSSCIIRIPLSRCERYGSCKKSCIASRDPYCGWL
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KSD KEGGACSHLSPNSRLT-FEQDIERGNTDGLGDCHNSFVALNDISTPLPDNEMSYNTVYGH
..: .:....:. .::: : ::: :::::.
CCDS32 SQG-SCGRVTPGMLAEGYEQDTEFGNTAHLGDCHG-------------------------
540 550 560 570
600 610 620 630 640 650
pF1KSD SSSLLPSTTTSDSTAQEGYESRGGMLDWKHLLDSPDSTDPLGAVSSHNHQDKKGVIRESY
. :. ..: .:
CCDS32 -------------------------VRWE--VQSGES-----------------------
580
660 670 680 690 700 710
pF1KSD LKGHDQLVPVTLLAIAVILAFVMGAVFSGITVYCVCDHR-RKDVAVVQRKEKELTHSRRG
.:.: ...: :. :::.:: ..:..::: : ::. . .:. : ..:
CCDS32 ----NQMVHMNVLITCVFAAFVLGAFIAGVAVYCYRDMFVRKNRKI--HKDAESAQSCTD
590 600 610 620 630
720 730 740 750 760
pF1KSD SMSSVTKLSGLFGDTQSKDPKPEAILTPLMHNGKLAT----P--GNTAKMLIKADQHHLD
: .: .::.::: :. :. . . : .: .... :.. : :.: .:.. . .
CCDS32 SSGSFAKLNGLF-DSPVKEYQ-QNIDSPKLYSNLLTSRKELPPNGDTKSMVMDHRGQPPE
640 650 660 670 680 690
770 780 790 800 810 820
pF1KSD LTALPTPESTPTLQQKRKPSRGSREWERNQNLINACTKDMPPMGSPVIPTDLPLRASPSH
:.:::::::::.:.:: . :. :. .. .: :. : . : :: : .:
CCDS32 LAALPTPESTPVLHQKTLQAMKSHS-EKAHGH-GASRKETPQFFPSSPPPHSPL--SHGH
700 710 720 730 740
830 840 850 860 870
pF1KSD IPSVVVLPITQQGYQHEYVD------QPKMSEVAQMALEDQAATLEYKTIK---------
:::..::: . . :. . . . :.... . .... . ...
CCDS32 IPSAIVLPNATHDYNTSFSNSNAHKAEKKLQNIDHPLTKSSSKRDHRRSVDSRNTLNDLL
750 760 770 780 790 800
880 890 900 910
pF1KSD EHLSSKSPN-----------HGVNLVENLDSL---PPKVPQREASLGPPGASLSQTGLSK
.::.. . : : ... . :. :::::.::::: : ..: ... .:
CCDS32 KHLNDPNSNPKAIMGDIQMAHQNLMLDPMGSMSEVPPKVPNREASLYSPPSTLPRNSPTK
810 820 830 840 850 860
920 930 940 950 960 970
pF1KSD RLEMHHSSSY---GVDYKRSYPTNSLTRSHQATTLKRNNTNSSNSSHLSRNQSFGRGDN-
:... . . ... .:.: :: : :. ... .: :: :. :::. :..::
CCDS32 RVDVPTTPGVPMTSLERQRGYHKNSSQR-HSISAMPKN-LNSPNGVLLSRQPSMNRGGYM
870 880 890 900 910 920
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KSD PPPAPQRVDSIQ-----VHSSQPSGQAVTVSRQPSLNAYNSLTRSGLKRTPSLKPDVPPK
: :. .:: :: :: ::: .::: : .. ..: :.:::::::::::::::
CCDS32 PTPTGAKVDYIQGTPVSVHL-QPS-----LSRQSSYTSNGTLPRTGLKRTPSLKPDVPPK
930 940 950 960 970 980
1040
pF1KSD PSFAPLSTSMKPNDACT
:::.: . :..:
CCDS32 PSFVPQTPSVRPLNKYTY
990
>>CCDS32226.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 (1017 aa)
initn: 2891 init1: 1929 opt: 2498 Z-score: 2249.4 bits: 427.8 E(32554): 5.7e-119
Smith-Waterman score: 2990; 46.0% identity (69.6% similar) in 1092 aa overlap (1-1042:1-1011)
10 20 30 40 50
pF1KSD MRSEALLLYFTLL---HFAGAGFPEDSEPISISHGNYTKQYPVFVGHKPGRNTTQRHRLD
:: : :. :: .. ...::::.::.. .:..::::: : .:. : .: ::::
CCDS32 MRVFLLCAYILLLMVSQLRAVSFPEDDEPLNTVDYHYSRQYPVFRG-RPSGNESQ-HRLD
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD IQMIMIMNGTLYIAARDHIYTVDIDTSHTEEIYCSKKLTWKSRQADVDTCRMKGKHKDEC
.:... . :::::.::..:::... :. .:::::.::: : ..: :::::::::
CCDS32 FQLMLKIRDTLYIAGRDQVYTVNLNEMPKTEVIPNKKLTWRSRQQDRENCAMKGKHKDEC
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD HNFIKVLLKKNDDALFVCGTNAFNPSCRNYKMDTLEPFGDEFSGMARCPYDAKHANVALF
::::::.. .::. .:::::::::: :: :...::: :.:.::.::::.::...:::::
CCDS32 HNFIKVFVPRNDEMVFVCGTNAFNPMCRYYRLSTLEYDGEEISGLARCPFDARQTNVALF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD ADGKLYSATVTDFLAIDAVIYRSLGESPTLRTVKHDSKWLKEPYFVQAVDYGDYIYFFFR
::::::::::.:::: :::::::.:.. .:::.:.::::.:::.:..:..::.:.:::::
CCDS32 ADGKLYSATVADFLASDAVIYRSMGDGSALRTIKYDSKWIKEPHFLHAIEYGNYVYFFFR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD EIAVEYNTMGKVVFPRVAQVCKNDMGGSQRVLEKQWTSFLKARLNCSVPGDSHFYFNILQ
:::::.:..::.:. :::..::::::::::::::.::::::::::::::::: :::..::
CCDS32 EIAVEHNNLGKAVYSRVARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLKARLNCSVPGDSFFYFDVLQ
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD AVTDVIRINGRDVVLATFSTPYNSIPGSAVCAYDMLDIASVFTGRFKEQKSPDSTWTPVP
..::.:.::: .:...:.: ::::::::::..: :: .:: :::::::.:::.:: ::
CCDS32 SITDIIQINGIPTVVGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQKTPDSVWTAVP
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD DERVPKPRPGCCAGSSSLERYATSNEFPDDTLNFIKTHPLMDEAVPSIFNRPWFLRTMVR
...:::::::::: . : : :: .:::.::.:::.::::: ::: : ..::: .: ::
CCDS32 EDKVPKPRPGCCAKHGLAEAYKTSIDFPDETLSFIKSHPLMDSAVPPIADEPWFTKTRVR
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KSD YRLTKIAVDTAAGPYQNHTVVFLGSEKGIILKFLARIGNSGF-LNDSLFLEEMSVYNSEK
:::: :.:: .::::::.::.:.::: :..:: ::. .: : ::::..:::. .:: :
CCDS32 YRLTAISVDHSAGPYQNYTVIFVGSEAGMVLKVLAK--TSPFSLNDSVLLEEIEAYNHAK
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KSD CSYDGVEDKRIMGMQLDRASSSLYVAFSTCVIKVPLGRCERHGKCKKTCIASRDPYCGWI
:: .. :::.....:::. .::::::.:.:..::.::::.:.:::.:::::::::::.
CCDS32 CSAENEEDKKVISLQLDKDHHALYVAFSSCIIRIPLSRCERYGSCKKSCIASRDPYCGWL
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KSD KEGGACSHLSPNSRLT-FEQDIERGNTDGLGDCHNSFVALNDISTPLPDNEMSYNTVYGH
..: .:....:. .::: : ::: :::::.
CCDS32 SQG-SCGRVTPGMLAEGYEQDTEFGNTAHLGDCHE-------------------------
540 550 560 570
600 610 620 630 640 650
pF1KSD SSSLLPSTTTSDSTAQEGYESRGGMLDWKHLLDSPDSTDPLGAVSSHNHQDKKGVIRESY
.::..:: : :. :: : : :: :
CCDS32 ---ILPTSTTPD------YKIFGG----------PTS----------------GVRWEVQ
580 590
660 670 680 690 700 710
pF1KSD LKGHDQLVPVTLLAIAVILAFVMGAVFSGITVYCVCDHR-RKDVAVVQRKEKELTHSRRG
.:.: ...: :. :::.:: ..:..::: : ::. . .:. : ..:
CCDS32 SGESNQMVHMNVLITCVFAAFVLGAFIAGVAVYCYRDMFVRKNRKI--HKDAESAQSCTD
600 610 620 630 640 650
720 730 740 750 760
pF1KSD SMSSVTKLSGLFGDTQSKDPKPEAILTPLMHNGKLAT----P--GNTAKMLIKADQHHLD
: .: .::.::: :. :. . . : .: .... :.. : :.: .:.. . .
CCDS32 SSGSFAKLNGLF-DSPVKEYQ-QNIDSPKLYSNLLTSRKELPPNGDTKSMVMDHRGQPPE
660 670 680 690 700 710
770 780 790 800 810 820
pF1KSD LTALPTPESTPTLQQKRKPSRGSREWERNQNLINACTKDMPPMGSPVIPTDLPLRASPSH
:.:::::::::.:.:: . :. :. .. .: :. : . : :: : .:
CCDS32 LAALPTPESTPVLHQKTLQAMKSHS-EKAHGH-GASRKETPQFFPSSPPPHSPL--SHGH
720 730 740 750 760
830 840 850 860 870
pF1KSD IPSVVVLPITQQGYQHEYVD------QPKMSEVAQMALEDQAATLEYKTIK---------
:::..::: . . :. . . . :.... . .... . ...
CCDS32 IPSAIVLPNATHDYNTSFSNSNAHKAEKKLQNIDHPLTKSSSKRDHRRSVDSRNTLNDLL
770 780 790 800 810 820
880 890 900 910
pF1KSD EHLSSKSPN-----------HGVNLVENLDSL---PPKVPQREASLGPPGASLSQTGLSK
.::.. . : : ... . :. :::::.::::: : ..: ... .:
CCDS32 KHLNDPNSNPKAIMGDIQMAHQNLMLDPMGSMSEVPPKVPNREASLYSPPSTLPRNSPTK
830 840 850 860 870 880
920 930 940 950 960 970
pF1KSD RLEMHHSSSY---GVDYKRSYPTNSLTRSHQATTLKRNNTNSSNSSHLSRNQSFGRGDN-
:... . . ... .:.: :: : :. ... .: :: :. :::. :..::
CCDS32 RVDVPTTPGVPMTSLERQRGYHKNSSQR-HSISAMPKN-LNSPNGVLLSRQPSMNRGGYM
890 900 910 920 930 940
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KSD PPPAPQRVDSIQ-----VHSSQPSGQAVTVSRQPSLNAYNSLTRSGLKRTPSLKPDVPPK
: :. .:: :: :: ::: .::: : .. ..: :.:::::::::::::::
CCDS32 PTPTGAKVDYIQGTPVSVHL-QPS-----LSRQSSYTSNGTLPRTGLKRTPSLKPDVPPK
950 960 970 980 990
1040
pF1KSD PSFAPLSTSMKPNDACT
:::.: . :..:
CCDS32 PSFVPQTPSVRPLNKYTY
1000 1010
>>CCDS32224.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 (1011 aa)
initn: 2791 init1: 1929 opt: 2434 Z-score: 2191.9 bits: 417.2 E(32554): 9.1e-116
Smith-Waterman score: 2910; 45.3% identity (69.2% similar) in 1091 aa overlap (1-1042:1-1005)
10 20 30 40 50
pF1KSD MRSEALLLYFTLL---HFAGAGFPEDSEPISISHGNYTKQYPVFVGHKPGRNTTQRHRLD
:: : :. :: .. ...::::.::.. .:..::::: : .:. : .: ::::
CCDS32 MRVFLLCAYILLLMVSQLRAVSFPEDDEPLNTVDYHYSRQYPVFRG-RPSGNESQ-HRLD
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD IQMIMIMNGTLYIAARDHIYTVDIDTSHTEEIYCSKKLTWKSRQADVDTCRMKGKHKDEC
.:... . :::::.::..:::... :. .:::::.::: : ..: :::::::::
CCDS32 FQLMLKIRDTLYIAGRDQVYTVNLNEMPKTEVIPNKKLTWRSRQQDRENCAMKGKHKDEC
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD HNFIKVLLKKNDDALFVCGTNAFNPSCRNYKMDTLEPFGDEFSGMARCPYDAKHANVALF
::::::.. .::. .:::::::::: :: :...::: :.:.::.::::.::...:::::
CCDS32 HNFIKVFVPRNDEMVFVCGTNAFNPMCRYYRLSTLEYDGEEISGLARCPFDARQTNVALF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD ADGKLYSATVTDFLAIDAVIYRSLGESPTLRTVKHDSKWLKEPYFVQAVDYGDYIYFFFR
::::::::::.:::: :::::::.:.. .:::.:.::::.:::.:..:..::.:.:::::
CCDS32 ADGKLYSATVADFLASDAVIYRSMGDGSALRTIKYDSKWIKEPHFLHAIEYGNYVYFFFR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD EIAVEYNTMGKVVFPRVAQVCKNDMGGSQRVLEKQWTSFLKARLNCSVPGDSHFYFNILQ
:::::.:..::.:. :::..::::::::::::::.::::::::::::::::: :::..::
CCDS32 EIAVEHNNLGKAVYSRVARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLKARLNCSVPGDSFFYFDVLQ
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD AVTDVIRINGRDVVLATFSTPYNSIPGSAVCAYDMLDIASVFTGRFKEQKSPDSTWTPVP
..::.:.::: .:...:.: ::::::::::..: :: .:: :::::::.:::.:: ::
CCDS32 SITDIIQINGIPTVVGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQKTPDSVWTAVP
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD DERVPKPRPGCCAGSSSLERYATSNEFPDDTLNFIKTHPLMDEAVPSIFNRPWFLRTMVR
...:::::::::: . : : :: .:::.::.:::.::::: ::: : ..::: .: ::
CCDS32 EDKVPKPRPGCCAKHGLAEAYKTSIDFPDETLSFIKSHPLMDSAVPPIADEPWFTKTRVR
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KSD YRLTKIAVDTAAGPYQNHTVVFLGSEKGIILKFLARIGNSGF-LNDSLFLEEMSVYNSEK
:::: :.:: .::::::.::.:.::: :..:: ::. .: : ::::..:::. .:: :
CCDS32 YRLTAISVDHSAGPYQNYTVIFVGSEAGMVLKVLAK--TSPFSLNDSVLLEEIEAYNHAK
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KSD CSYDGVEDKRIMGMQLDRASSSLYVAFSTCVIKVPLGRCERHGKCKKTCIASRDPYCGWI
:: .. :::.....:::. .::::::.:.:..::.::::.:.:::.:::::::::::.
CCDS32 CSAENEEDKKVISLQLDKDHHALYVAFSSCIIRIPLSRCERYGSCKKSCIASRDPYCGWL
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KSD KEGGACSHLSPNSRLTFEQDIERGNTDGLGDCHNSFVALNDISTPLPDNEMSYNTVYGHS
..: .:....:. : :. : :... ::
CCDS32 SQG-SCGRVTPGMLLLTED----------------FFAFHN-----------------HS
540 550 560
600 610 620 630 640 650
pF1KSD SSLLPSTTTSDSTAQEGYESRGGMLDWKHLLDSPDSTDPLGAVSSHNHQDKKGVIRESYL
. ::::. . . : :: : .:: :
CCDS32 A--------------EGYEQDTEFGNTAH----------LG--------DCHGVRWEVQS
570 580 590
660 670 680 690 700 710
pF1KSD KGHDQLVPVTLLAIAVILAFVMGAVFSGITVYCVCDHR-RKDVAVVQRKEKELTHSRRGS
.:.: ...: :. :::.:: ..:..::: : ::. . .:. : ..: :
CCDS32 GESNQMVHMNVLITCVFAAFVLGAFIAGVAVYCYRDMFVRKNRKI--HKDAESAQSCTDS
600 610 620 630 640
720 730 740 750 760
pF1KSD MSSVTKLSGLFGDTQSKDPKPEAILTPLMHNGKLAT----P--GNTAKMLIKADQHHLDL
.: .::.::: :. :. . . : .: .... :.. : :.: .:.. . .:
CCDS32 SGSFAKLNGLF-DSPVKEYQ-QNIDSPKLYSNLLTSRKELPPNGDTKSMVMDHRGQPPEL
650 660 670 680 690 700
770 780 790 800 810 820
pF1KSD TALPTPESTPTLQQKRKPSRGSREWERNQNLINACTKDMPPMGSPVIPTDLPLRASPSHI
.:::::::::.:.:: . :. :. .. .: :. : . : :: : .::
CCDS32 AALPTPESTPVLHQKTLQAMKSHS-EKAHGH-GASRKETPQFFPSSPPPHSPL--SHGHI
710 720 730 740 750 760
830 840 850 860 870
pF1KSD PSVVVLPITQQGYQHEYVD------QPKMSEVAQMALEDQAATLEYKTIK---------E
::..::: . . :. . . . :.... . .... . ... .
CCDS32 PSAIVLPNATHDYNTSFSNSNAHKAEKKLQNIDHPLTKSSSKRDHRRSVDSRNTLNDLLK
770 780 790 800 810 820
880 890 900 910 920
pF1KSD HLSSKSPN-----------HGVNLVENLDSL---PPKVPQREASLGPPGASLSQTGLSKR
::.. . : : ... . :. :::::.::::: : ..: ... .::
CCDS32 HLNDPNSNPKAIMGDIQMAHQNLMLDPMGSMSEVPPKVPNREASLYSPPSTLPRNSPTKR
830 840 850 860 870 880
930 940 950 960 970
pF1KSD LEMHHSSSY---GVDYKRSYPTNSLTRSHQATTLKRNNTNSSNSSHLSRNQSFGRGDN-P
... . . ... .:.: :: : :. ... .: :: :. :::. :..:: :
CCDS32 VDVPTTPGVPMTSLERQRGYHKNSSQR-HSISAMPKN-LNSPNGVLLSRQPSMNRGGYMP
890 900 910 920 930 940
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KSD PPAPQRVDSIQ-----VHSSQPSGQAVTVSRQPSLNAYNSLTRSGLKRTPSLKPDVPPKP
:. .:: :: :: ::: .::: : .. ..: :.::::::::::::::::
CCDS32 TPTGAKVDYIQGTPVSVHL-QPS-----LSRQSSYTSNGTLPRTGLKRTPSLKPDVPPKP
950 960 970 980 990
1040
pF1KSD SFAPLSTSMKPNDACT
::.: . :..:
CCDS32 SFVPQTPSVRPLNKYTY
1000 1010
>>CCDS12131.1 SEMA6B gene_id:10501|Hs108|chr19 (888 aa)
initn: 2183 init1: 1575 opt: 2393 Z-score: 2155.9 bits: 410.3 E(32554): 9.1e-114
Smith-Waterman score: 2485; 44.8% identity (67.2% similar) in 941 aa overlap (5-915:12-846)
10 20 30 40 50
pF1KSD MRSEALLLYFTLLHFAGAGFPEDSEPISISHGNYTKQYPVFVGHKPGRNTTQR
:::: . :: : . :::. :.:.. .: ..:::::: ::: : .
CCDS12 MQTPRASPPRPALLLLLLLLGGAHGLFPEEPPPLSVAPRDYLNHYPVFVGSGPGRLTPAE
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD --HRLDIQMIMIMNGTLYIAARDHIYTVDIDTSHTEEIYCSKKLTWKSRQADVDTCRMKG
:.:: .. .: ::.:. ::..: :... . :. ..::::.: .:...:::::
CCDS12 GADDLNIQRVLRVNRTLFIGDRDNLYRVELEPPTSTELRYQRKLTWRSNPSDINVCRMKG
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KSD KHKDECHNFIKVLLKKNDDALFVCGTNAFNPSCRNYKMDTLEPFGDEFSGMARCPYDAKH
:.. ::.::.:::: .....:::::.::::: : ::..:::.: ::..::::::::: ::
CCDS12 KQEGECRNFVKVLLLRDESTLFVCGSNAFNPVCANYSIDTLQPVGDNISGMARCPYDPKH
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KSD ANVALFADGKLYSATVTDFLAIDAVIYRSLGESPTLRTVKHDSKWLKEPYFVQAVDYGDY
::::::.:: :..::::::::::::::::::. ::::::::::::.::::::.::..:..
CCDS12 ANVALFSDGMLFTATVTDFLAIDAVIYRSLGDRPTLRTVKHDSKWFKEPYFVHAVEWGSH
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KSD IYFFFREIAVEYNTMGKVVFPRVAQVCKNDMGGSQRVLEKQWTSFLKARLNCSVPGDSHF
.::::::::.:.: . ::: :::.:::::.::: :::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VYFFFREIAMEFNYLEKVVVSRVARVCKNDVGGSPRVLEKQWTSFLKARLNCSVPGDSHF
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KSD YFNILQAVTDVIRINGRDVVLATFSTPYNSIPGSAVCAYDMLDIASVFTGRFKEQKSPDS
:::.::::: :. ..:: ::::.:::: ::::::::::.:. ..:.:: :::.:::::.:
CCDS12 YFNVLQAVTGVVSLGGRPVVLAVFSTPSNSIPGSAVCAFDLTQVAAVFEGRFREQKSPES
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KSD TWTPVPDERVPKPRPGCCAGSSSLERYATSNEFPDDTLNFIKTHPLMDEAVPSIFNRPWF
:::::...::.:::::::. . .: .:. .::: :::.::::::::::::. . ::.
CCDS12 IWTPVPEDQVPRPRPGCCAAPGM--QYNASSALPDDILNFVKTHPLMDEAVPSLGHAPWI
370 380 390 400 410
420 430 440 450 460
pF1KSD LRTMVRYRLTKIAVDTAAGPYQNHTVVFLGSEKGIILKFLAR--IGNSGFLNDSLFLEEM
:::..:..::..:::..:::. :.:::::::: : .::::.: ..:: . :.::::.
CCDS12 LRTLMRHQLTRVAVDVGAGPWGNQTVVFLGSEAGTVLKFLVRPNASTSGTSGLSVFLEEF
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KSD SVYNSEKCSYDGVED--KRIMGMQLDRASSSLYVAFSTCVIKVPLGRCERHGKCKKTCIA
.: ..:. : . .:.....:: ::..: .:: ::..::..::.... : :.::.
CCDS12 ETYRPDRCGRPGGGETGQRLLSLELDAASGGLLAAFPRCVVRVPVARCQQYSGCMKNCIG
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KSD SRDPYCGWIKEGGACSHLSPNSRLTFEQDIERGNTDGLGDCHNSFVALNDISTPLPDNEM
:.:::::: .: .: :::..: .::::. ..:.:::::
CCDS12 SQDPYCGWAPDG-SCIFLSPGTRAAFEQDVSGASTSGLGDC-------------------
540 550 560 570
590 600 610 620 630 640
pF1KSD SYNTVYGHSSSLLPSTTTSDSTAQEGYESRGGMLDWKHLLDSPDSTDPLGAVSSHNHQDK
..:: .. . : :.:
CCDS12 ---------TGLLRASLSED---------RAG----------------------------
580 590
650 660 670 680 690 700
pF1KSD KGVIRESYLKGHDQLVPVTLLAIAVILAFVMGAVFSGITV-YCVCDHRRKDVAVVQRKEK
:: :.::. . . :::.::: ::..: . : ..:...: . ::
CCDS12 --------------LVSVNLLVTSSVAAFVVGAVVSGFSVGWFVGLRERRELARRKDKEA
600 610 620 630
710 720 730 740 750
pF1KSD ELTHSRRGSMSSVTKLSGLFGDTQSKDP-------------KPEAILTPLMHNGKLATPG
:.:. .. ::..: :. ... : :::.:.:::.::
CCDS12 ILAHGAGEAVLSVSRL----GERRAQGPGGRGGGGGGGAGVPPEALLAPLMQNGW-----
640 650 660 670 680
760 770 780 790 800
pF1KSD NTAKMLIKADQHHLDLTALPTPESTPTLQQKRKPSR-------GSREWERNQNLINACTK
. :... : :: :::::.:: : ::: :. : : :.... :
CCDS12 -AKATLLQGGPHDLDSGLLPTPEQTP-LPQKRLPTPHPHPHALGPRAWDHGHPL------
690 700 710 720 730 740
810 820 830 840 850 860
pF1KSD DMPPMGSPVIPTDLPLRASPSHIPSVVVLPITQQGYQHEYVDQPKMSEVAQMALEDQAAT
.: .: . : :: : . :. : . :. .: . ... : .:.
CCDS12 -LPASASSSLLLLAPARA-PEQPPA----PGEPTPDGRLYAARPGRASHGDFPLTPHASP
750 760 770 780 790
870 880 890 900 910 920
pF1KSD LEYKTIKEHLSSKSPNHGVNLVENLDSLPPKVPQREASLGP---PGASLSQTGLSKRLEM
. .... . .: ... . : :: :. ::: :.:.: .:
CCDS12 DRRRVVSAPTGPLDPASAADGLPRPWSPPPTGSLRRP-LGPHAPPAATLRRTHTFNSGEA
800 810 820 830 840 850
930 940 950 960 970 980
pF1KSD HHSSSYGVDYKRSYPTNSLTRSHQATTLKRNNTNSSNSSHLSRNQSFGRGDNPPPAPQRV
CCDS12 RPGDRHRGCHARPGTDLAHLLPYGGADRTAPPVP
860 870 880
>>CCDS32229.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 (476 aa)
initn: 2079 init1: 1928 opt: 2088 Z-score: 1885.9 bits: 359.5 E(32554): 1e-98
Smith-Waterman score: 2088; 62.1% identity (84.8% similar) in 480 aa overlap (1-476:1-476)
10 20 30 40 50
pF1KSD MRSEALLLYFTLL---HFAGAGFPEDSEPISISHGNYTKQYPVFVGHKPGRNTTQRHRLD
:: : :. :: .. ...::::.::.. .:..::::: : .:. : .: ::::
CCDS32 MRVFLLCAYILLLMVSQLRAVSFPEDDEPLNTVDYHYSRQYPVFRG-RPSGNESQ-HRLD
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD IQMIMIMNGTLYIAARDHIYTVDIDTSHTEEIYCSKKLTWKSRQADVDTCRMKGKHKDEC
.:... . :::::.::..:::... :. .:::::.::: : ..: :::::::::
CCDS32 FQLMLKIRDTLYIAGRDQVYTVNLNEMPKTEVIPNKKLTWRSRQQDRENCAMKGKHKDEC
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD HNFIKVLLKKNDDALFVCGTNAFNPSCRNYKMDTLEPFGDEFSGMARCPYDAKHANVALF
::::::.. .::. .:::::::::: :: :...::: :.:.::.::::.::...:::::
CCDS32 HNFIKVFVPRNDEMVFVCGTNAFNPMCRYYRLSTLEYDGEEISGLARCPFDARQTNVALF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD ADGKLYSATVTDFLAIDAVIYRSLGESPTLRTVKHDSKWLKEPYFVQAVDYGDYIYFFFR
::::::::::.:::: :::::::.:.. .:::.:.::::.:::.:..:..::.:.:::::
CCDS32 ADGKLYSATVADFLASDAVIYRSMGDGSALRTIKYDSKWIKEPHFLHAIEYGNYVYFFFR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD EIAVEYNTMGKVVFPRVAQVCKNDMGGSQRVLEKQWTSFLKARLNCSVPGDSHFYFNILQ
:::::.:..::.:. :::..::::::::::::::.::::::::::::::::: :::..::
CCDS32 EIAVEHNNLGKAVYSRVARICKNDMGGSQRVLEKHWTSFLKARLNCSVPGDSFFYFDVLQ
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD AVTDVIRINGRDVVLATFSTPYNSIPGSAVCAYDMLDIASVFTGRFKEQKSPDSTWTPVP
..::.:.::: .:...:.: ::::::::::..: :: .:: :::::::.:::.:: ::
CCDS32 SITDIIQINGIPTVVGVFTTQLNSIPGSAVCAFSMDDIEKVFKGRFKEQKTPDSVWTAVP
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD DERVPKPRPGCCAGSSSLERYATSNEFPDDTLNFIKTHPLMDEAVPSIFNRPWFLRTMVR
...:::::::::: . : : :: .:::.::.:::.::::: ::: : ..::: .: ::
CCDS32 EDKVPKPRPGCCAKHGLAEAYKTSIDFPDETLSFIKSHPLMDSAVPPIADEPWFTKTRVR
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KSD YRLTKIAVDTAAGPYQNHTVVFLGSEKGIILKFLARIGNSGF-LNDSLFLEEMSVYNSEK
:::: :.:: .::::::.::.:.::: :..:: ::. .: : ::::..:::. .:: :
CCDS32 YRLTAISVDHSAGPYQNYTVIFVGSEAGMVLKVLAK--TSPFSLNDSVLLEEIEAYNHAK
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KSD CSYDGVEDKRIMGMQLDRASSSLYVAFSTCVIKVPLGRCERHGKCKKTCIASRDPYCGWI
>>CCDS984.1 SEMA6C gene_id:10500|Hs108|chr1 (930 aa)
initn: 1721 init1: 1476 opt: 1851 Z-score: 1668.0 bits: 320.1 E(32554): 1.4e-86
Smith-Waterman score: 1936; 38.7% identity (62.6% similar) in 941 aa overlap (6-921:13-852)
10 20 30 40 50
pF1KSD MRSEALLLYFTLLHFAGAGFPEDSEPISISHGNYTKQYPVFVGHKPGRNTTQR
::: ..: : . :.::.: :. :: . :. : : . ...
CCDS98 MPRAPHFMPLLLLLLLLSLPH-TQAAFPQDPLPLLISDLQGTSPLSWFRGLEDDAVAAEL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD HRLDIQMIMIMNGTLYIAARDHIYTVDIDTSHTEE-IYCSKKLTWKSRQADVDTCRMKGK
::.: .. .: :: .:::::... :... . : . .: :::.:. ::..: ..::
CCDS98 G-LDFQRFLTLNRTLLVAARDHVFSFDLQAEEEGEGLVPNKYLTWRSQ--DVENCAVRGK
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD HKDECHNFIKVLLKKNDDALFVCGTNAFNPSCRNYKMDTLEPFGDEFSGMARCPYDAKHA
:::.:.:.::. ....:..::::.:.: ::.: . .:. :.:.::.::::.:: ..
CCDS98 LTDECYNYIRVLVPWDSQTLLACGTNSFSPVCRSYGITSLQQEGEELSGQARCPFDATQS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD NVALFADGKLYSATVTDFLAIDAVIYRSLGESPTLRTVKHDSKWLKEPYFVQAVDYGDYI
:::.::.:.:::::..:: : :::.::::: .: ::..:.:::::.::.::::...::..
CCDS98 NVAIFAEGSLYSATAADFQASDAVVYRSLGPQPPLRSAKYDSKWLREPHFVQALEHGDHV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD YFFFREIAVEYNTMGKVVFPRVAQVCKNDMGGSQRVLEKQWTSFLKARLNCSVPGDSHFY
::::::..:: .:.: : :::.::: ::::: :.:...:::::: :::::::::: ::
CCDS98 YFFFREVSVEDARLGRVQFSRVARVCKRDMGGSPRALDRHWTSFLKLRLNCSVPGDSTFY
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD FNILQAVTDVIRINGRDVVLATFSTPYNSIPGSAVCAYDMLDIASVFTGRFKEQKSPDST
:..:::.: . ..::......:.: ::::::::::. . .: : :.::::.: :..
CCDS98 FDVLQALTGPVNLHGRSALFGVFTTQTNSIPGSAVCAFYLDEIERGFEGKFKEQRSLDGA
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD WTPVPDERVPKPRPGCCAGSSSLERYATSNEFPDDTLNFIKTHPLMDEAVPSIFNRPWFL
:::: ..:::.:::: ::: .. ...: ..:::.:.:::.:::.: ::: . ..: .:
CCDS98 WTPVSEDRVPSPRPGSCAGVGGAALFSSSRDLPDDVLTFIKAHPLLDPAVPPVTHQP-LL
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KSD RTMVRYRLTKIAVDTAAGPYQNHTVVFLGSEKGIILKFLARIGNSGFLNDSLFLEEMSVY
: ::..::: :::..: ::.::::. : .:: :. : :: . ..:::...:
CCDS98 TLTSRALLTQVAVDGMAGPHSNITVMFLGSNDGTVLKVLTPGGRSGG-PEPILLEEIDAY
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KSD NSEKCSYDGVED--KRIMGMQLDRASSSLYVAFSTCVIKVPLGRCERHGKCKKTCIASRD
. .:: . . .::.:..:: . :.:::: :.. .::.:: ::: :...:.::.:
CCDS98 SPARCSGKRTAQTARRIIGLELDTEGHRLFVAFSGCIVYLPLSRCARHGACQRSCLASQD
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580
pF1KSD PYCGWIKEGGACSHLSPNSRLTFEQDIERGNTDGL--GDCHNSFVALNDISTPLPDNEMS
::::: . : : . .. .: :: ... :::... : .. : :
CCDS98 PYCGWHSSRG-CVDIRGSGGTDVDQ---AGNQESMEHGDCQDG--ATGSQSGP-------
540 550 560 570 580
590 600 610 620 630 640
pF1KSD YNTVYGHSSSLLPSTTTSDSTAQEGYESRGGMLDWKHLLDSPDSTDPLGAVSSHNHQDKK
...:: .: :... ::.
CCDS98 GDSAYGVRRDLPPASA-----------SRS------------------------------
590 600
650 660 670 680 690 700
pF1KSD GVIRESYLKGHDQLVPVTLLAIAVILAFVMGAVFSGITVYCVCD--HRRKDVAVVQRKEK
::. :: .: ::..:: ::. : :.: :::. :.
CCDS98 --------------VPIPLLLASVAAAFALGASVSGLLVSCACRRAHRRRG------KDI
610 620 630 640
710 720 730 740 750 760
pF1KSD ELTHSRRG-SMSSVTKLSGLFGDTQSKDPKPE--AILTPLMHNGKLATPGNTAKMLIKAD
: : :. :...: : : . :. . :. :: ... : : ..
CCDS98 ETPGLPRPLSLRSLARLHG--GGPEPPPPSKDGDAVQTPQLYTTFLPPPEGVPPP-----
650 660 670 680 690
770 780 790 800 810
pF1KSD QHHLDLTALPTPESTPTLQQKRKPSRGSREWERNQNLINACTKDMP-------PMGSPVI
.:. :::::::: : :. . :. :: ::: :: :. : :.:.
CCDS98 ----ELACLPTPESTPELPVKHLRAAGD-PWEWNQNRNNA--KEGPGRSRGGHAAGGPA-
700 710 720 730 740
820 830 840 850 860 870
pF1KSD PTDLPLRASPSHIPSVVVLPIT-QQGYQHEYVDQPKMSEVAQMA-LEDQAATLEYKTIKE
: : .: : :. .: : .. .. . :: . . : : ..: : .
CCDS98 PRVL-VRPPPPGCPGQAVEVTTLEELLRYLHGPQPPRKGAEPPAPLTSRA--LPPEPAPA
750 760 770 780 790 800
880 890 900 910 920
pF1KSD HLSSKSPN-HGVNLVENLDSLPPK-----VPQREASLGPPGASLSQTGLSKRLEMHHSSS
:.. :: : :: .::. .: : : :. :. :. .: ..::
CCDS98 LLGGPSPRPHECASPLRLD-VPPEGRCASAPARPA-LSAPAPRLG-VGGGRRLPFSGHRA
810 820 830 840 850
930 940 950 960 970 980
pF1KSD YGVDYKRSYPTNSLTRSHQATTLKRNNTNSSNSSHLSRNQSFGRGDNPPPAPQRVDSIQV
CCDS98 PPALLTRVPSGGPSRYSGGPGKHLLYLGRPEGYRGRALKRVDVEKPQLSLKPPLVGPSSR
860 870 880 890 900 910
1047 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 06:00:23 2016 done: Thu Nov 3 06:00:23 2016
Total Scan time: 4.750 Total Display time: 0.440
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]