Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA1334
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1334, 980 aa
1>>>pF1KSDA1334 980 - 980 aa - 980 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.7507+/-0.00138; mu= -4.6034+/- 0.083
mean_var=550.5465+/-115.065, 0's: 0 Z-trim(111.2): 247 B-trim: 0 in 0/55
Lambda= 0.054661
statistics sampled from 11951 (12175) to 11951 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.677), E-opt: 0.2 (0.374), width: 16
Scan time: 5.430
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34142.1 RAI14 gene_id:26064|Hs108|chr5 ( 980) 6115 498.3 3e-140
CCDS54839.1 RAI14 gene_id:26064|Hs108|chr5 ( 983) 6049 493.1 1.1e-138
CCDS54838.1 RAI14 gene_id:26064|Hs108|chr5 ( 972) 6042 492.6 1.6e-138
CCDS54837.1 RAI14 gene_id:26064|Hs108|chr5 ( 951) 4524 372.8 1.8e-102
CCDS32280.1 UACA gene_id:55075|Hs108|chr15 (1403) 1105 103.4 3.3e-21
CCDS10235.1 UACA gene_id:55075|Hs108|chr15 (1416) 1105 103.4 3.3e-21
CCDS45925.1 ANKRD24 gene_id:170961|Hs108|chr19 (1146) 916 88.4 8.8e-17
CCDS72867.1 ANKRD35 gene_id:148741|Hs108|chr1 (1001) 774 77.2 1.9e-13
>>CCDS34142.1 RAI14 gene_id:26064|Hs108|chr5 (980 aa)
initn: 6115 init1: 6115 opt: 6115 Z-score: 2631.3 bits: 498.3 E(32554): 3e-140
Smith-Waterman score: 6115; 99.9% identity (100.0% similar) in 980 aa overlap (1-980:1-980)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MKSLKAKFRKSDTNEWNKNDDRLLQAVENGDAEKVASLLGKKGASATKHDSEGKTAFHLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MKSLKAKFRKSDTNEWNKNDDRLLQAVENGDAEKVASLLGKKGASATKHDSEGKTAFHLA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD AAKGHVECLRVMITHGVDVTAQDTTGHSALHLAAKNSHHECIRKLLQSKCPAESVDSSGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AAKGHVECLRVMITHGVDVTAQDTTGHSALHLAAKNSHHECIRKLLQSKCPAESVDSSGK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD TALHYAAAQGCLQAVQILCEHKSPINLKDLDGNIPLLLAVQNGHSEICHFLLDHGADVNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TALHYAAAQGCLQAVQILCEHKSPINLKDLDGNIPLLLAVQNGHSEICHFLLDHGADVNS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD RNKSGRTALMLACEIGSSNAVEALIKKGADLNLVDSLGYNALHYSKLSENAGIQSLLLSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RNKSGRTALMLACEIGSSNAVEALIKKGADLNLVDSLGYNALHYSKLSENAGIQSLLLSK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD ISQDADLKTPTKPKQHDQVSKISSERSGTPKKRKAPPPPISPTQLSDVSSPRSITSTPLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ISQDADLKTPTKPKQHDQVSKISSERSGTPKKRKAPPPPISPTQLSDVSSPRSITSTPLS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD GKESVFFAEPPFKAEISSIRENKDRLSDSTTGADSLLDISSEADQQDLLSLLQAKVASLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GKESVFFAEPPFKAEISSIRENKDRLSDSTTGADSLLDISSEADQQDLLSLLQAKVASLT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD LHNKELQDKLQAKSPKEAEADLSFDSYHSTQTDLGPSLGKPGETSPPDSKSSPSVLIHSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LHNKELQDKLQAKSPKEAEADLSFDSYHSTQTDLGPSLGKPGETSPPDSKSSPSVLIHSL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD GKSTTDNDVRIQQLQEILQDLQKRLESSEAERKQLQVELQSRRAELVCLNNTEISENSSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GKSTTDNDVRIQQLQEILQDLQKRLESSEAERKQLQVELQSRRAELVCLNNTEISENSSD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD LSQKLKETQSKYEEAMKEVLSVQKQMKLGLVSPESMDNYSHFHELRVTEEEINVLKQDLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LSQKLKETQSKYEEAMKEVLSVQKQMKLGLVSPESMDNYSHFHELRVTEEEINVLKQDLQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD NALEESERNKEKVRELEEKLVEREKGTVIKPPVEEYEEMKSSYCSVIENMNKEKAFLFEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NALEESERNKEKVRELEEKLVEREKGTVIKPPVEEYEEMKSSYCSVIENMNKEKAFLFEK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD YQEAQEEIMKLKDTLKSQMTQEASDEAEDMKEAMNRMIDELNKQVSELSQLYKEAQAELE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 YQEAQEEIMKLKDTLKSQMTQEASDEAEDMKEAMNRMIDELNKQVSELSQLYKEAQAELE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD DYRKRKSLEDVTAEYIHKAEHEKLMQLTNVSRAKAEDALSEMKSQYSKVLNELTQLKQLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DYRKRKSLEDVTAEYIHKAEHEKLMQLTNVSRAKAEDALSEMKSQYSKVLNELTQLKQLV
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD DAQKENSVSITEHLQVITTLRTAAKEMEEKISNLKEHLASKEVEVAKLEKQLLEEKAAMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DAQKENSVSITEHLQVITTLRTAAKEMEEKISNLKEHLASKEVEVAKLEKQLLEEKAAMT
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD DAMVPRSSYEKLQSSLESEVSVLASKLKESVKEKEKVHSEVVQIRSEVSQVKREKENIQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DAMVPRSSYEKLQSSLESEVSVLASKLKESVKEKEKVHSEVVQIRSEVSQVKREKENIQT
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD LLKSKEQEVNELLQKFQQAQEELAEMKRYSESSSKLEEDKDKKINEMSKEVTKLKEALNS
:::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LLKSKEQEVNELLQKFQQAQEELAEMKRYAESSSKLEEDKDKKINEMSKEVTKLKEALNS
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD LSQLSYSTSSSKRQSQQLEALQQQVKQLQNQLAECKKQHQEVISVYRMHLLYAVQGQMDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LSQLSYSTSSSKRQSQQLEALQQQVKQLQNQLAECKKQHQEVISVYRMHLLYAVQGQMDE
910 920 930 940 950 960
970 980
pF1KSD DVQKVLKQILTMCKNQSQKK
::::::::::::::::::::
CCDS34 DVQKVLKQILTMCKNQSQKK
970 980
>>CCDS54839.1 RAI14 gene_id:26064|Hs108|chr5 (983 aa)
initn: 6044 init1: 6044 opt: 6049 Z-score: 2603.1 bits: 493.1 E(32554): 1.1e-138
Smith-Waterman score: 6049; 99.4% identity (99.7% similar) in 977 aa overlap (4-980:9-983)
10 20 30 40 50
pF1KSD MKSLKAKFRKSDTNEWNKNDDRLLQAVENGDAEKVASLLGKKGASATKHDSEGKT
:.:: .: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MQPTYLPWLSAKEKK--TNEWNKNDDRLLQAVENGDAEKVASLLGKKGASATKHDSEGKT
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD AFHLAAAKGHVECLRVMITHGVDVTAQDTTGHSALHLAAKNSHHECIRKLLQSKCPAESV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 AFHLAAAKGHVECLRVMITHGVDVTAQDTTGHSALHLAAKNSHHECIRKLLQSKCPAESV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD DSSGKTALHYAAAQGCLQAVQILCEHKSPINLKDLDGNIPLLLAVQNGHSEICHFLLDHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DSSGKTALHYAAAQGCLQAVQILCEHKSPINLKDLDGNIPLLLAVQNGHSEICHFLLDHG
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD ADVNSRNKSGRTALMLACEIGSSNAVEALIKKGADLNLVDSLGYNALHYSKLSENAGIQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ADVNSRNKSGRTALMLACEIGSSNAVEALIKKGADLNLVDSLGYNALHYSKLSENAGIQS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD LLLSKISQDADLKTPTKPKQHDQVSKISSERSGTPKKRKAPPPPISPTQLSDVSSPRSIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LLLSKISQDADLKTPTKPKQHDQVSKISSERSGTPKKRKAPPPPISPTQLSDVSSPRSIT
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD STPLSGKESVFFAEPPFKAEISSIRENKDRLSDSTTGADSLLDISSEADQQDLLSLLQAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 STPLSGKESVFFAEPPFKAEISSIRENKDRLSDSTTGADSLLDISSEADQQDLLSLLQAK
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD VASLTLHNKELQDKLQAKSPKEAEADLSFDSYHSTQTDLGPSLGKPGETSPPDSKSSPSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VASLTLHNKELQDKLQAKSPKEAEADLSFDSYHSTQTDLGPSLGKPGETSPPDSKSSPSV
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KSD LIHSLGKSTTDNDVRIQQLQEILQDLQKRLESSEAERKQLQVELQSRRAELVCLNNTEIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LIHSLGKSTTDNDVRIQQLQEILQDLQKRLESSEAERKQLQVELQSRRAELVCLNNTEIS
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KSD ENSSDLSQKLKETQSKYEEAMKEVLSVQKQMKLGLVSPESMDNYSHFHELRVTEEEINVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ENSSDLSQKLKETQSKYEEAMKEVLSVQKQMKLGLVSPESMDNYSHFHELRVTEEEINVL
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KSD KQDLQNALEESERNKEKVRELEEKLVEREKGTVIKPPVEEYEEMKSSYCSVIENMNKEKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KQDLQNALEESERNKEKVRELEEKLVEREKGTVIKPPVEEYEEMKSSYCSVIENMNKEKA
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KSD FLFEKYQEAQEEIMKLKDTLKSQMTQEASDEAEDMKEAMNRMIDELNKQVSELSQLYKEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 FLFEKYQEAQEEIMKLKDTLKSQMTQEASDEAEDMKEAMNRMIDELNKQVSELSQLYKEA
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KSD QAELEDYRKRKSLEDVTAEYIHKAEHEKLMQLTNVSRAKAEDALSEMKSQYSKVLNELTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QAELEDYRKRKSLEDVTAEYIHKAEHEKLMQLTNVSRAKAEDALSEMKSQYSKVLNELTQ
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KSD LKQLVDAQKENSVSITEHLQVITTLRTAAKEMEEKISNLKEHLASKEVEVAKLEKQLLEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LKQLVDAQKENSVSITEHLQVITTLRTAAKEMEEKISNLKEHLASKEVEVAKLEKQLLEE
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KSD KAAMTDAMVPRSSYEKLQSSLESEVSVLASKLKESVKEKEKVHSEVVQIRSEVSQVKREK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KAAMTDAMVPRSSYEKLQSSLESEVSVLASKLKESVKEKEKVHSEVVQIRSEVSQVKREK
780 790 800 810 820 830
840 850 860 870 880 890
pF1KSD ENIQTLLKSKEQEVNELLQKFQQAQEELAEMKRYSESSSKLEEDKDKKINEMSKEVTKLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ENIQTLLKSKEQEVNELLQKFQQAQEELAEMKRYAESSSKLEEDKDKKINEMSKEVTKLK
840 850 860 870 880 890
900 910 920 930 940 950
pF1KSD EALNSLSQLSYSTSSSKRQSQQLEALQQQVKQLQNQLAECKKQHQEVISVYRMHLLYAVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EALNSLSQLSYSTSSSKRQSQQLEALQQQVKQLQNQLAECKKQHQEVISVYRMHLLYAVQ
900 910 920 930 940 950
960 970 980
pF1KSD GQMDEDVQKVLKQILTMCKNQSQKK
:::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GQMDEDVQKVLKQILTMCKNQSQKK
960 970 980
>>CCDS54838.1 RAI14 gene_id:26064|Hs108|chr5 (972 aa)
initn: 6042 init1: 6042 opt: 6042 Z-score: 2600.2 bits: 492.6 E(32554): 1.6e-138
Smith-Waterman score: 6042; 99.6% identity (99.9% similar) in 971 aa overlap (10-980:2-972)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MKSLKAKFRKSDTNEWNKNDDRLLQAVENGDAEKVASLLGKKGASATKHDSEGKTAFHLA
.. ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MEAKTNEWNKNDDRLLQAVENGDAEKVASLLGKKGASATKHDSEGKTAFHLA
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD AAKGHVECLRVMITHGVDVTAQDTTGHSALHLAAKNSHHECIRKLLQSKCPAESVDSSGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 AAKGHVECLRVMITHGVDVTAQDTTGHSALHLAAKNSHHECIRKLLQSKCPAESVDSSGK
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KSD TALHYAAAQGCLQAVQILCEHKSPINLKDLDGNIPLLLAVQNGHSEICHFLLDHGADVNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TALHYAAAQGCLQAVQILCEHKSPINLKDLDGNIPLLLAVQNGHSEICHFLLDHGADVNS
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KSD RNKSGRTALMLACEIGSSNAVEALIKKGADLNLVDSLGYNALHYSKLSENAGIQSLLLSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RNKSGRTALMLACEIGSSNAVEALIKKGADLNLVDSLGYNALHYSKLSENAGIQSLLLSK
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KSD ISQDADLKTPTKPKQHDQVSKISSERSGTPKKRKAPPPPISPTQLSDVSSPRSITSTPLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ISQDADLKTPTKPKQHDQVSKISSERSGTPKKRKAPPPPISPTQLSDVSSPRSITSTPLS
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KSD GKESVFFAEPPFKAEISSIRENKDRLSDSTTGADSLLDISSEADQQDLLSLLQAKVASLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GKESVFFAEPPFKAEISSIRENKDRLSDSTTGADSLLDISSEADQQDLLSLLQAKVASLT
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KSD LHNKELQDKLQAKSPKEAEADLSFDSYHSTQTDLGPSLGKPGETSPPDSKSSPSVLIHSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LHNKELQDKLQAKSPKEAEADLSFDSYHSTQTDLGPSLGKPGETSPPDSKSSPSVLIHSL
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KSD GKSTTDNDVRIQQLQEILQDLQKRLESSEAERKQLQVELQSRRAELVCLNNTEISENSSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GKSTTDNDVRIQQLQEILQDLQKRLESSEAERKQLQVELQSRRAELVCLNNTEISENSSD
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KSD LSQKLKETQSKYEEAMKEVLSVQKQMKLGLVSPESMDNYSHFHELRVTEEEINVLKQDLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LSQKLKETQSKYEEAMKEVLSVQKQMKLGLVSPESMDNYSHFHELRVTEEEINVLKQDLQ
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KSD NALEESERNKEKVRELEEKLVEREKGTVIKPPVEEYEEMKSSYCSVIENMNKEKAFLFEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NALEESERNKEKVRELEEKLVEREKGTVIKPPVEEYEEMKSSYCSVIENMNKEKAFLFEK
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KSD YQEAQEEIMKLKDTLKSQMTQEASDEAEDMKEAMNRMIDELNKQVSELSQLYKEAQAELE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 YQEAQEEIMKLKDTLKSQMTQEASDEAEDMKEAMNRMIDELNKQVSELSQLYKEAQAELE
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KSD DYRKRKSLEDVTAEYIHKAEHEKLMQLTNVSRAKAEDALSEMKSQYSKVLNELTQLKQLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DYRKRKSLEDVTAEYIHKAEHEKLMQLTNVSRAKAEDALSEMKSQYSKVLNELTQLKQLV
660 670 680 690 700 710
730 740 750 760 770 780
pF1KSD DAQKENSVSITEHLQVITTLRTAAKEMEEKISNLKEHLASKEVEVAKLEKQLLEEKAAMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DAQKENSVSITEHLQVITTLRTAAKEMEEKISNLKEHLASKEVEVAKLEKQLLEEKAAMT
720 730 740 750 760 770
790 800 810 820 830 840
pF1KSD DAMVPRSSYEKLQSSLESEVSVLASKLKESVKEKEKVHSEVVQIRSEVSQVKREKENIQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DAMVPRSSYEKLQSSLESEVSVLASKLKESVKEKEKVHSEVVQIRSEVSQVKREKENIQT
780 790 800 810 820 830
850 860 870 880 890 900
pF1KSD LLKSKEQEVNELLQKFQQAQEELAEMKRYSESSSKLEEDKDKKINEMSKEVTKLKEALNS
:::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LLKSKEQEVNELLQKFQQAQEELAEMKRYAESSSKLEEDKDKKINEMSKEVTKLKEALNS
840 850 860 870 880 890
910 920 930 940 950 960
pF1KSD LSQLSYSTSSSKRQSQQLEALQQQVKQLQNQLAECKKQHQEVISVYRMHLLYAVQGQMDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LSQLSYSTSSSKRQSQQLEALQQQVKQLQNQLAECKKQHQEVISVYRMHLLYAVQGQMDE
900 910 920 930 940 950
970 980
pF1KSD DVQKVLKQILTMCKNQSQKK
::::::::::::::::::::
CCDS54 DVQKVLKQILTMCKNQSQKK
960 970
>>CCDS54837.1 RAI14 gene_id:26064|Hs108|chr5 (951 aa)
initn: 4285 init1: 4285 opt: 4524 Z-score: 1953.4 bits: 372.8 E(32554): 1.8e-102
Smith-Waterman score: 5848; 96.9% identity (97.0% similar) in 980 aa overlap (1-980:1-951)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MKSLKAKFRKSDTNEWNKNDDRLLQAVENGDAEKVASLLGKKGASATKHDSEGKTAFHLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MKSLKAKFRKSDTNEWNKNDDRLLQAVENGDAEKVASLLGKKGASATKHDSEGKTAFHLA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD AAKGHVECLRVMITHGVDVTAQDTTGHSALHLAAKNSHHECIRKLLQSKCPAESVDSSGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 AAKGHVECLRVMITHGVDVTAQDTTGHSALHLAAKNSHHECIRKLLQSKCPAESVDSSGK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD TALHYAAAQGCLQAVQILCEHKSPINLKDLDGNIPLLLAVQNGHSEICHFLLDHGADVNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TALHYAAAQGCLQAVQILCEHKSPINLKDLDGNIPLLLAVQNGHSEICHFLLDHGADVNS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD RNKSGRTALMLACEIGSSNAVEALIKKGADLNLVDSLGYNALHYSKLSENAGIQSLLLSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RNKSGRTALMLACEIGSSNAVEALIKKGADLNLVDSLGYNALHYSKLSENAGIQSLLLSK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD ISQDADLKTPTKPKQHDQVSKISSERSGTPKKRKAPPPPISPTQLSDVSSPRSITSTPLS
::::::::::::::: ::::::::::::::::
CCDS54 ISQDADLKTPTKPKQ-----------------------------LSDVSSPRSITSTPLS
250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KSD GKESVFFAEPPFKAEISSIRENKDRLSDSTTGADSLLDISSEADQQDLLSLLQAKVASLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GKESVFFAEPPFKAEISSIRENKDRLSDSTTGADSLLDISSEADQQDLLSLLQAKVASLT
280 290 300 310 320 330
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pF1KSD LHNKELQDKLQAKSPKEAEADLSFDSYHSTQTDLGPSLGKPGETSPPDSKSSPSVLIHSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LHNKELQDKLQAKSPKEAEADLSFDSYHSTQTDLGPSLGKPGETSPPDSKSSPSVLIHSL
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KSD GKSTTDNDVRIQQLQEILQDLQKRLESSEAERKQLQVELQSRRAELVCLNNTEISENSSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GKSTTDNDVRIQQLQEILQDLQKRLESSEAERKQLQVELQSRRAELVCLNNTEISENSSD
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KSD LSQKLKETQSKYEEAMKEVLSVQKQMKLGLVSPESMDNYSHFHELRVTEEEINVLKQDLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LSQKLKETQSKYEEAMKEVLSVQKQMKLGLVSPESMDNYSHFHELRVTEEEINVLKQDLQ
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KSD NALEESERNKEKVRELEEKLVEREKGTVIKPPVEEYEEMKSSYCSVIENMNKEKAFLFEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NALEESERNKEKVRELEEKLVEREKGTVIKPPVEEYEEMKSSYCSVIENMNKEKAFLFEK
520 530 540 550 560 570
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pF1KSD YQEAQEEIMKLKDTLKSQMTQEASDEAEDMKEAMNRMIDELNKQVSELSQLYKEAQAELE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 YQEAQEEIMKLKDTLKSQMTQEASDEAEDMKEAMNRMIDELNKQVSELSQLYKEAQAELE
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670 680 690 700 710 720
pF1KSD DYRKRKSLEDVTAEYIHKAEHEKLMQLTNVSRAKAEDALSEMKSQYSKVLNELTQLKQLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DYRKRKSLEDVTAEYIHKAEHEKLMQLTNVSRAKAEDALSEMKSQYSKVLNELTQLKQLV
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730 740 750 760 770 780
pF1KSD DAQKENSVSITEHLQVITTLRTAAKEMEEKISNLKEHLASKEVEVAKLEKQLLEEKAAMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DAQKENSVSITEHLQVITTLRTAAKEMEEKISNLKEHLASKEVEVAKLEKQLLEEKAAMT
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pF1KSD DAMVPRSSYEKLQSSLESEVSVLASKLKESVKEKEKVHSEVVQIRSEVSQVKREKENIQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DAMVPRSSYEKLQSSLESEVSVLASKLKESVKEKEKVHSEVVQIRSEVSQVKREKENIQT
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850 860 870 880 890 900
pF1KSD LLKSKEQEVNELLQKFQQAQEELAEMKRYSESSSKLEEDKDKKINEMSKEVTKLKEALNS
:::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LLKSKEQEVNELLQKFQQAQEELAEMKRYAESSSKLEEDKDKKINEMSKEVTKLKEALNS
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910 920 930 940 950 960
pF1KSD LSQLSYSTSSSKRQSQQLEALQQQVKQLQNQLAECKKQHQEVISVYRMHLLYAVQGQMDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LSQLSYSTSSSKRQSQQLEALQQQVKQLQNQLAECKKQHQEVISVYRMHLLYAVQGQMDE
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970 980
pF1KSD DVQKVLKQILTMCKNQSQKK
::::::::::::::::::::
CCDS54 DVQKVLKQILTMCKNQSQKK
940 950
>>CCDS32280.1 UACA gene_id:55075|Hs108|chr15 (1403 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KSD MKSLKAKFRKSDTNEWNKNDDRLLQAVENGDAEKVASLLGKKGASATKHDSEGKTAFH
.::: ::::..:.: ::.:::.:.:.:::.. : : ::...::
CCDS32 MMNCWFSCTPKNRHAADWNKYDDRLMKAAERGDVEKVTSILAKKGVNPGKLDVEGRSVFH
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD LAAAKGHVECLRVMITHGVDVTAQDTTGHSALHLAAKNSHHECIRKLLQSKCPAESVDSS
....::..::: ... ::::.:..::.:..::::::: .: :..:::: .::.: .: .
CCDS32 VVTSKGNLECLNAILIHGVDITTSDTAGRNALHLAAKYGHALCLQKLLQYNCPTEHADLQ
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KSD GKTALHYAAAQGCLQAVQILCEHKSPINLKDLDGNIPLLLAVQNGHSEICHFLLDHGADV
:.:::: :: : ...:.::.: . .: ::.:: ::.::.: .. ::..:.:.::::
CCDS32 GRTALHDAAMADCPSSIQLLCDHGASVNAKDVDGRTPLVLATQMSRPTICQLLIDRGADV
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KSD NSRNKSGRTALMLACEIGSSNAVEALIKKGADLNLVDSLGYNALHYSKLSENAGIQSLL-
:::.:..::::::.:: : .:::.:::.:::..:.:.::... .:.....: : .::
CCDS32 NSRDKQNRTALMLGCEYGCRDAVEVLIKNGADISLLDALGHDSSYYARIGDNLDILTLLK
190 200 210 220 230 240
240 250 260
pF1KSD -----------------------LSKISQDADLKTPTKPKQHDQVSKISSER-----SGT
:.........:. . .:. : .: .:
CCDS32 TASENTNKGRELWKKGPSLQQRNLTHMQDEVNVKSHQREHQNIQDLEIENEDLKERLRKI
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KSD PKKRKAPPPPISPTQLS---DVSSPRSITSTPLSGKESVFFAEPPFKAEISSIRENKDRL
.... .. ::. .: .. : . : . : . . .:. :.:.
CCDS32 QQEQRILLDKVNGLQLQLNEEVMVADDLESEREKLKSLLAAKEKQHEESLRTIEALKNRF
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KSD SDSTTGADSLLDISSEADQQD--LLSLLQAKVASLTLHNKELQDKLQAKSP-KEAEADLS
. . : : . : ..... ::. : .:. . . ..:..: . : .:
CCDS32 KYFES--DHLGSGSHFSNRKEDMLLKQGQMYMADSQCTSPGIPAHMQSRSMLRPLELSLP
370 380 390 400 410
390 400 410 420 430
pF1KSD FDSYHSTQTDLGPSLGKPG---ETSPPDSKSSPSVLIHSLGKSTT----------DNDVR
.. .: . : : :.. : . . : :.... . :.: .
CCDS32 SQTSYSENEILKKELEAMRTFCESAKQDRLKLQNELAHKVAECKALALECERVKEDSDEQ
420 430 440 450 460 470
440 450 460 470 480 490
pF1KSD IQQLQEILQDLQKRLESSEAERKQLQVELQSRRAELVCLNNTEISENSSDLSQKLKETQS
:.::.. :.:.:::. ::.. ::.:... . . .:. . . . .:...::. .
CCDS32 IKQLEDALKDVQKRMYESEGKVKQMQTHFLALKEHLTSEAASGNHRLTEELKDQLKDLKV
480 490 500 510 520 530
500 510 520 530 540 550
pF1KSD KYEEAMKEVLSVQKQMKLGLVSPESMDNYSHFHELRVTEEEINVLKQDLQNALEESERNK
::: : :: ....:.: . . : . : .. ::. . :...:. : :..
CCDS32 KYEGASAEVGKLRNQIKQNEMIVEEFKR----DEGKLIEEN-KRLQKELSMCEMEREKKG
540 550 560 570 580 590
560 570 580 590 600 610
pF1KSD EKVRELEEKLVEREKGTVIKPPVEEYEEMKSSYCSVIENMNKEKAFLFEKYQEAQEEIMK
.:: :.: . : ... :.:..:.:::: . ... :. . . ...... :: .
CCDS32 RKVTEMEGQAKELSAKLALSIPAEKFENMKSSLSNEVNEKAKKLVEMEREHEKSLSEIRQ
600 610 620 630 640 650
620 630 640 650 660
pF1KSD LK---DTLKSQMTQEAS-DEAEDMKEAMNRMIDELNKQVSELSQLYKEAQAELED-YRKR
:: ...:....:... .: :..: ... ::.:...::. . : :.: :
CCDS32 LKRELENVKAKLAQHVKPEEHEQVKSRLEQKSGELGKKITELTLKNQTLQKEIEKVYLDN
660 670 680 690 700 710
670 680 690 700 710
pF1KSD KSLED----VTAE----YI-------HKAEHEKLMQLTNVSRAKAEDALSEMKSQYSKVL
: :.. .: : :. : :. ... : . . . .: : .. :.:
CCDS32 KLLKEQAHNLTIEMKNHYVPLKVSEDMKKSHDAIIDDLNRKLLDVTQKYTEKKLEMEKLL
720 730 740 750 760 770
720 730 740 750 760 770
pF1KSD NELTQLKQLVDAQKENSVSITEHLQVITTLRTAAKEMEEKISNLKEHLASKEVEVAKLEK
: .:.. :. . : .: . : .:.. :.....:.::.. . . .. : .
CCDS32 LENDSLSKDVSRLETVFVPPEKHEKEIIALKSNIVELKKQLSELKKKCGEDQEKIHALTS
780 790 800 810 820 830
780 790 800 810 820 830
pF1KSD QLLEEKAAMTDAMVPRSSYEKLQSSLESEVSVLASKLKESVKEKEKVHSEVVQIRSEVSQ
. . : :.. .:: ...:... .:.. .. .: . :. : ...: :.:...
CCDS32 ENTNLKKMMSNQYVPVKTHEEVKMTLNDTLAKTNRELLDVKKKFEDINQEFVKIKDKNEI
840 850 860 870 880 890
840 850 860 870 880
pF1KSD VKREKENIQTLLKSKEQEVNELLQKFQQAQEELAEMKRYSESSSKLEEDKDK---KINEM
.::. :: :. .:.. . : :... .. :.. ..:.... . : .: .
CCDS32 LKRNLENTQNQIKAEYISLAEHEAKMSSLSQS---MRKVQDSNAEILANYRKGQEEIVTL
900 910 920 930 940 950
890 900 910 920 930 940
pF1KSD SKEVTKLKEALNSLSQ---LSYSTSSSKRQSQQLEALQQQVKQLQNQLAECKKQHQEVIS
:. :. :..... ..:. : .. .. .. :.:..::.: ...
CCDS32 HAEIKAQKKELDTIQECIKVKYAPIVSFEECER--KFKATEKELKDQLSEQTQKYSVSEE
960 970 980 990 1000
950 960 970 980
pF1KSD VYRMHLLYAVQGQMDEDVQKVLKQILTMCKNQSQKK
CCDS32 EVKKNKQENDKLKKEIFTLQKDLRDKTVLIEKSHEMERALSRKTDELNKQLKDLSQKYTE
1010 1020 1030 1040 1050 1060
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10 20 30 40
pF1KSD MKSLKAKFRKSDT---------------NEWNKNDDRLLQAVENGDAEKVASLLGKKGAS
:::::...:..:. .::: ::::..:.: ::.:::.:.:.:::..
CCDS10 MKSLKSRLRRQDVPGPASSGAAAASAHAADWNKYDDRLMKAAERGDVEKVTSILAKKGVN
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KSD ATKHDSEGKTAFHLAAAKGHVECLRVMITHGVDVTAQDTTGHSALHLAAKNSHHECIRKL
: : ::...::....::..::: ... ::::.:..::.:..::::::: .: :..::
CCDS10 PGKLDVEGRSVFHVVTSKGNLECLNAILIHGVDITTSDTAGRNALHLAAKYGHALCLQKL
70 80 90 100 110 120
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pF1KSD LQSKCPAESVDSSGKTALHYAAAQGCLQAVQILCEHKSPINLKDLDGNIPLLLAVQNGHS
:: .::.: .: .:.:::: :: : ...:.::.: . .: ::.:: ::.::.: ..
CCDS10 LQYNCPTEHADLQGRTALHDAAMADCPSSIQLLCDHGASVNAKDVDGRTPLVLATQMSRP
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KSD EICHFLLDHGADVNSRNKSGRTALMLACEIGSSNAVEALIKKGADLNLVDSLGYNALHYS
::..:.:.:::::::.:..::::::.:: : .:::.:::.:::..:.:.::... .:.
CCDS10 TICQLLIDRGADVNSRDKQNRTALMLGCEYGCRDAVEVLIKNGADISLLDALGHDSSYYA
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260
pF1KSD KLSENAGIQSLL------------------------LSKISQDADLKTPTKPKQHDQVSK
....: : .:: :.........:. . .:. : .
CCDS10 RIGDNLDILTLLKTASENTNKGRELWKKGPSLQQRNLTHMQDEVNVKSHQREHQNIQDLE
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310
pF1KSD ISSER-----SGTPKKRKAPPPPISPTQLS---DVSSPRSITSTPLSGKESVFFAEPPFK
: .: .... .. ::. .: .. : . : . : .
CCDS10 IENEDLKERLRKIQQEQRILLDKVNGLQLQLNEEVMVADDLESEREKLKSLLAAKEKQHE
310 320 330 340 350 360
320 330 340 350 360 370
pF1KSD AEISSIRENKDRLSDSTTGADSLLDISSEADQQD--LLSLLQAKVASLTLHNKELQDKLQ
. .:. :.:.. . : : . : ..... ::. : .:. . . ..:
CCDS10 ESLRTIEALKNRFKYFES--DHLGSGSHFSNRKEDMLLKQGQMYMADSQCTSPGIPAHMQ
370 380 390 400 410
380 390 400 410 420
pF1KSD AKSP-KEAEADLSFDSYHSTQTDLGPSLGKPG---ETSPPDSKSSPSVLIHSLGKSTT--
..: . : .: .. .: . : : :.. : . . : :.... .
CCDS10 SRSMLRPLELSLPSQTSYSENEILKKELEAMRTFCESAKQDRLKLQNELAHKVAECKALA
420 430 440 450 460 470
430 440 450 460 470
pF1KSD --------DNDVRIQQLQEILQDLQKRLESSEAERKQLQVELQSRRAELVCLNNTEISEN
:.: .:.::.. :.:.:::. ::.. ::.:... . . .:. . .
CCDS10 LECERVKEDSDEQIKQLEDALKDVQKRMYESEGKVKQMQTHFLALKEHLTSEAASGNHRL
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480 490 500 510 520 530
pF1KSD SSDLSQKLKETQSKYEEAMKEVLSVQKQMKLGLVSPESMDNYSHFHELRVTEEEINVLKQ
. .:...::. . ::: : :: ....:.: . . : . : .. ::. . :..
CCDS10 TEELKDQLKDLKVKYEGASAEVGKLRNQIKQNEMIVEEFKR----DEGKLIEEN-KRLQK
540 550 560 570 580 590
540 550 560 570 580 590
pF1KSD DLQNALEESERNKEKVRELEEKLVEREKGTVIKPPVEEYEEMKSSYCSVIENMNKEKAFL
.:. : :.. .:: :.: . : ... :.:..:.:::: . ... :. . .
CCDS10 ELSMCEMEREKKGRKVTEMEGQAKELSAKLALSIPAEKFENMKSSLSNEVNEKAKKLVEM
600 610 620 630 640 650
600 610 620 630 640 650
pF1KSD FEKYQEAQEEIMKLK---DTLKSQMTQEAS-DEAEDMKEAMNRMIDELNKQVSELSQLYK
...... :: .:: ...:....:... .: :..: ... ::.:...::. .
CCDS10 EREHEKSLSEIRQLKRELENVKAKLAQHVKPEEHEQVKSRLEQKSGELGKKITELTLKNQ
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660 670 680 690
pF1KSD EAQAELED-YRKRKSLED----VTAE----YI-------HKAEHEKLMQLTNVSRAKAED
: :.: : : :.. .: : :. : :. ... : . . .
CCDS10 TLQKEIEKVYLDNKLLKEQAHNLTIEMKNHYVPLKVSEDMKKSHDAIIDDLNRKLLDVTQ
720 730 740 750 760 770
700 710 720 730 740 750
pF1KSD ALSEMKSQYSKVLNELTQLKQLVDAQKENSVSITEHLQVITTLRTAAKEMEEKISNLKEH
.: : .. :.: : .:.. :. . : .: . : .:.. :.....:.::..
CCDS10 KYTEKKLEMEKLLLENDSLSKDVSRLETVFVPPEKHEKEIIALKSNIVELKKQLSELKKK
780 790 800 810 820 830
760 770 780 790 800 810
pF1KSD LASKEVEVAKLEKQLLEEKAAMTDAMVPRSSYEKLQSSLESEVSVLASKLKESVKEKEKV
. . .. : .. . : :.. .:: ...:... .:.. .. .: . :. : .
CCDS10 CGEDQEKIHALTSENTNLKKMMSNQYVPVKTHEEVKMTLNDTLAKTNRELLDVKKKFEDI
840 850 860 870 880 890
820 830 840 850 860 870
pF1KSD HSEVVQIRSEVSQVKREKENIQTLLKSKEQEVNELLQKFQQAQEELAEMKRYSESSSKLE
..: :.:... .::. :: :. .:.. . : :... .. :.. ..:....
CCDS10 NQEFVKIKDKNEILKRNLENTQNQIKAEYISLAEHEAKMSSLSQS---MRKVQDSNAEIL
900 910 920 930 940 950
880 890 900 910 920 930
pF1KSD EDKDK---KINEMSKEVTKLKEALNSLSQ---LSYSTSSSKRQSQQLEALQQQVKQLQNQ
. : .: . :. :. :..... ..:. : .. .. .. :.:..:
CCDS10 ANYRKGQEEIVTLHAEIKAQKKELDTIQECIKVKYAPIVSFEECER--KFKATEKELKDQ
960 970 980 990 1000
940 950 960 970 980
pF1KSD LAECKKQHQEVISVYRMHLLYAVQGQMDEDVQKVLKQILTMCKNQSQKK
:.: ...
CCDS10 LSEQTQKYSVSEEEVKKNKQENDKLKKEIFTLQKDLRDKTVLIEKSHEMERALSRKTDEL
1010 1020 1030 1040 1050 1060
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10 20 30
pF1KSD MKSLKAKFRKSDTNEWNKNDDRLLQAVENGDAEKVASLL
. ....:.:.:.::::::::.:: .::.:.
CCDS45 KKTELRLSPTDLGSCPPCGPCPIPKPAARGRRQSQDWGKSDERLLQAVENNDAPRVAALI
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KSD GKKGASATKHDSEGKTAFHLAAAKGHVECLRVMITHGVDVTAQDTTGHSALHLAAKNSHH
..:: :: : :::.:::::: .: . ::.:::.:: .: . : .:..::::::: .:
CCDS45 ARKGLVPTKLDPEGKSAFHLAAMRGAASCLEVMIAHGSNVMSADGAGYNALHLAAKYGHP
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KSD ECIRKLLQSKCPAESVDSSGKTALHYAAAQGCLQAVQILCEHKSPINLKDLDGNIPLLLA
.:...:::..: .. ::::: ::::.::: :::. ..:: :. .: .: .: ::..:
CCDS45 QCLKQLLQASCVVDVVDSSGWTALHHAAAGGCLSCSEVLCSFKAHLNPQDRSGATPLIIA
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KSD VQNGHSEICHFLLDHGADVNSRNKSGRTALMLACEIGSSNAVEALIKKGADLNLVDSLGY
.: :...:..::..:: .:... .:::::::::: .: ..::.:.. ::. ...:.::
CCDS45 AQMCHTDLCRLLLQQGAAANDQDLQGRTALMLACEGASPETVEVLLQGGAQPGITDALGQ
190 200 210 220 230 240
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