Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA1322
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1322, 693 aa
1>>>pF1KSDA1322 693 - 693 aa - 693 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.2804+/-0.000989; mu= 11.1051+/- 0.060
mean_var=121.7997+/-24.068, 0's: 0 Z-trim(109.0): 75 B-trim: 420 in 1/51
Lambda= 0.116212
statistics sampled from 10488 (10563) to 10488 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.684), E-opt: 0.2 (0.324), width: 16
Scan time: 3.960
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3394.2 TBC1D14 gene_id:57533|Hs108|chr4 ( 693) 4615 785.2 0
CCDS82909.1 TBC1D14 gene_id:57533|Hs108|chr4 ( 465) 3069 525.9 5e-149
CCDS47006.1 TBC1D14 gene_id:57533|Hs108|chr4 ( 413) 2788 478.8 6.9e-135
CCDS75104.1 TBC1D14 gene_id:57533|Hs108|chr4 ( 353) 2391 412.2 6.5e-115
CCDS41553.1 TBC1D12 gene_id:23232|Hs108|chr10 ( 775) 2225 384.5 3e-106
CCDS30774.1 EVI5 gene_id:7813|Hs108|chr1 ( 810) 366 72.9 2.1e-12
CCDS76179.1 EVI5 gene_id:7813|Hs108|chr1 ( 821) 366 72.9 2.1e-12
CCDS12188.1 EVI5L gene_id:115704|Hs108|chr19 ( 794) 361 72.0 3.7e-12
CCDS54209.1 EVI5L gene_id:115704|Hs108|chr19 ( 805) 361 72.0 3.7e-12
CCDS1314.1 RABGAP1L gene_id:9910|Hs108|chr1 ( 815) 351 70.4 1.2e-11
CCDS6848.2 RABGAP1 gene_id:23637|Hs108|chr9 (1069) 338 68.2 6.9e-11
>>CCDS3394.2 TBC1D14 gene_id:57533|Hs108|chr4 (693 aa)
initn: 4615 init1: 4615 opt: 4615 Z-score: 4187.2 bits: 785.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4615; 99.9% identity (100.0% similar) in 693 aa overlap (1-693:1-693)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MTDGKLSTSTNGVAFMGILDGRPGNPLQNLQHVNLKAPRLVSAPEYGPKLKLRALEDRHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS33 MTDGKLSTSTNGVAFMGILDGRPGNPLQNLQHVNLKAPRLLSAPEYGPKLKLRALEDRHS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LQSVDSGIPTLEIGNPEPVPCSAVHVRRKQSDSDLIPERAFQSACALPSCAPPAPSSTER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LQSVDSGIPTLEIGNPEPVPCSAVHVRRKQSDSDLIPERAFQSACALPSCAPPAPSSTER
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD EQSVRKSSTFPRTGYDSVKLYSPTSKALTRSDDVSVCSVSSLGTELSTTLSVSNEDILDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EQSVRKSSTFPRTGYDSVKLYSPTSKALTRSDDVSVCSVSSLGTELSTTLSVSNEDILDL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD VVTSSSSAIVTLENDDDPQFTNVTLSSIKETRGLHQQDCVHEAEEGSKLKILGPFSNFFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VVTSSSSAIVTLENDDDPQFTNVTLSSIKETRGLHQQDCVHEAEEGSKLKILGPFSNFFA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD RNLLARKQSARLDKHNDLGWKLFGKAPLRENAQKDSKRIQKEYEDKAGRPSKPPSPKQNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RNLLARKQSARLDKHNDLGWKLFGKAPLRENAQKDSKRIQKEYEDKAGRPSKPPSPKQNV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD RKNLDFEPLSTTALILEDRPANLPAKPAEEAQKHRQQYEEMVVQAKKRELKEAQRRKKQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RKNLDFEPLSTTALILEDRPANLPAKPAEEAQKHRQQYEEMVVQAKKRELKEAQRRKKQL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD EERCRVEESIGNAVLTWNNEILPNWETMWCSRKVRDLWWQGIPPSVRGKVWSLAIGNELN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EERCRVEESIGNAVLTWNNEILPNWETMWCSRKVRDLWWQGIPPSVRGKVWSLAIGNELN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD ITHELFDICLARAKERWRSLSTGGSEVENEDAGFSAADREASLELIKLDISRTFPNLCIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ITHELFDICLARAKERWRSLSTGGSEVENEDAGFSAADREASLELIKLDISRTFPNLCIF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD QQGGPYHDMLHSILGAYTCYRPDVGYVQGMSFIAAVLILNLDTADAFIAFSNLLNKPCQM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QQGGPYHDMLHSILGAYTCYRPDVGYVQGMSFIAAVLILNLDTADAFIAFSNLLNKPCQM
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD AFFRVDHGLMLTYFAAFEVFFEENLPKLFAHFKKNNLTPDIYLIDWIFTLYSKSLPLDLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 AFFRVDHGLMLTYFAAFEVFFEENLPKLFAHFKKNNLTPDIYLIDWIFTLYSKSLPLDLA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD CRIWDVFCRDGEEFLFRTALGILKLFEDILTKMDFIHMAQFLTRLPEDLPAEELFASIAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 CRIWDVFCRDGEEFLFRTALGILKLFEDILTKMDFIHMAQFLTRLPEDLPAEELFASIAT
610 620 630 640 650 660
670 680 690
pF1KSD IQMQSRNKKWAQVLTALQKDSREMEKGSPSLRH
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 IQMQSRNKKWAQVLTALQKDSREMEKGSPSLRH
670 680 690
>>CCDS82909.1 TBC1D14 gene_id:57533|Hs108|chr4 (465 aa)
initn: 3067 init1: 3067 opt: 3069 Z-score: 2789.0 bits: 525.9 E(32554): 5e-149
Smith-Waterman score: 3069; 98.5% identity (99.1% similar) in 462 aa overlap (232-693:4-465)
210 220 230 240 250 260
pF1KSD NVTLSSIKETRGLHQQDCVHEAEEGSKLKILGPFSNFFARNLLARKQSARLDKHNDLGWK
..: :. :::::::::::::::::::::
CCDS82 MMAISPALLFMDRNLLARKQSARLDKHNDLGWK
10 20 30
270 280 290 300 310 320
pF1KSD LFGKAPLRENAQKDSKRIQKEYEDKAGRPSKPPSPKQNVRKNLDFEPLSTTALILEDRPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 LFGKAPLRENAQKDSKRIQKEYEDKAGRPSKPPSPKQNVRKNLDFEPLSTTALILEDRPA
40 50 60 70 80 90
330 340 350 360 370 380
pF1KSD NLPAKPAEEAQKHRQQYEEMVVQAKKRELKEAQRRKKQLEERCRVEESIGNAVLTWNNEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 NLPAKPAEEAQKHRQQYEEMVVQAKKRELKEAQRRKKQLEERCRVEESIGNAVLTWNNEI
100 110 120 130 140 150
390 400 410 420 430 440
pF1KSD LPNWETMWCSRKVRDLWWQGIPPSVRGKVWSLAIGNELNITHELFDICLARAKERWRSLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 LPNWETMWCSRKVRDLWWQGIPPSVRGKVWSLAIGNELNITHELFDICLARAKERWRSLS
160 170 180 190 200 210
450 460 470 480 490 500
pF1KSD TGGSEVENEDAGFSAADREASLELIKLDISRTFPNLCIFQQGGPYHDMLHSILGAYTCYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 TGGSEVENEDAGFSAADREASLELIKLDISRTFPNLCIFQQGGPYHDMLHSILGAYTCYR
220 230 240 250 260 270
510 520 530 540 550 560
pF1KSD PDVGYVQGMSFIAAVLILNLDTADAFIAFSNLLNKPCQMAFFRVDHGLMLTYFAAFEVFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 PDVGYVQGMSFIAAVLILNLDTADAFIAFSNLLNKPCQMAFFRVDHGLMLTYFAAFEVFF
280 290 300 310 320 330
570 580 590 600 610 620
pF1KSD EENLPKLFAHFKKNNLTPDIYLIDWIFTLYSKSLPLDLACRIWDVFCRDGEEFLFRTALG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 EENLPKLFAHFKKNNLTPDIYLIDWIFTLYSKSLPLDLACRIWDVFCRDGEEFLFRTALG
340 350 360 370 380 390
630 640 650 660 670 680
pF1KSD ILKLFEDILTKMDFIHMAQFLTRLPEDLPAEELFASIATIQMQSRNKKWAQVLTALQKDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 ILKLFEDILTKMDFIHMAQFLTRLPEDLPAEELFASIATIQMQSRNKKWAQVLTALQKDS
400 410 420 430 440 450
690
pF1KSD REMEKGSPSLRH
::::::::::::
CCDS82 REMEKGSPSLRH
460
>>CCDS47006.1 TBC1D14 gene_id:57533|Hs108|chr4 (413 aa)
initn: 2788 init1: 2788 opt: 2788 Z-score: 2535.2 bits: 478.8 E(32554): 6.9e-135
Smith-Waterman score: 2788; 100.0% identity (100.0% similar) in 412 aa overlap (282-693:2-413)
260 270 280 290 300 310
pF1KSD LDKHNDLGWKLFGKAPLRENAQKDSKRIQKEYEDKAGRPSKPPSPKQNVRKNLDFEPLST
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MEYEDKAGRPSKPPSPKQNVRKNLDFEPLST
10 20 30
320 330 340 350 360 370
pF1KSD TALILEDRPANLPAKPAEEAQKHRQQYEEMVVQAKKRELKEAQRRKKQLEERCRVEESIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TALILEDRPANLPAKPAEEAQKHRQQYEEMVVQAKKRELKEAQRRKKQLEERCRVEESIG
40 50 60 70 80 90
380 390 400 410 420 430
pF1KSD NAVLTWNNEILPNWETMWCSRKVRDLWWQGIPPSVRGKVWSLAIGNELNITHELFDICLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 NAVLTWNNEILPNWETMWCSRKVRDLWWQGIPPSVRGKVWSLAIGNELNITHELFDICLA
100 110 120 130 140 150
440 450 460 470 480 490
pF1KSD RAKERWRSLSTGGSEVENEDAGFSAADREASLELIKLDISRTFPNLCIFQQGGPYHDMLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RAKERWRSLSTGGSEVENEDAGFSAADREASLELIKLDISRTFPNLCIFQQGGPYHDMLH
160 170 180 190 200 210
500 510 520 530 540 550
pF1KSD SILGAYTCYRPDVGYVQGMSFIAAVLILNLDTADAFIAFSNLLNKPCQMAFFRVDHGLML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SILGAYTCYRPDVGYVQGMSFIAAVLILNLDTADAFIAFSNLLNKPCQMAFFRVDHGLML
220 230 240 250 260 270
560 570 580 590 600 610
pF1KSD TYFAAFEVFFEENLPKLFAHFKKNNLTPDIYLIDWIFTLYSKSLPLDLACRIWDVFCRDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TYFAAFEVFFEENLPKLFAHFKKNNLTPDIYLIDWIFTLYSKSLPLDLACRIWDVFCRDG
280 290 300 310 320 330
620 630 640 650 660 670
pF1KSD EEFLFRTALGILKLFEDILTKMDFIHMAQFLTRLPEDLPAEELFASIATIQMQSRNKKWA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 EEFLFRTALGILKLFEDILTKMDFIHMAQFLTRLPEDLPAEELFASIATIQMQSRNKKWA
340 350 360 370 380 390
680 690
pF1KSD QVLTALQKDSREMEKGSPSLRH
::::::::::::::::::::::
CCDS47 QVLTALQKDSREMEKGSPSLRH
400 410
>>CCDS75104.1 TBC1D14 gene_id:57533|Hs108|chr4 (353 aa)
initn: 2391 init1: 2391 opt: 2391 Z-score: 2176.5 bits: 412.2 E(32554): 6.5e-115
Smith-Waterman score: 2391; 100.0% identity (100.0% similar) in 353 aa overlap (341-693:1-353)
320 330 340 350 360 370
pF1KSD TTALILEDRPANLPAKPAEEAQKHRQQYEEMVVQAKKRELKEAQRRKKQLEERCRVEESI
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MVVQAKKRELKEAQRRKKQLEERCRVEESI
10 20 30
380 390 400 410 420 430
pF1KSD GNAVLTWNNEILPNWETMWCSRKVRDLWWQGIPPSVRGKVWSLAIGNELNITHELFDICL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 GNAVLTWNNEILPNWETMWCSRKVRDLWWQGIPPSVRGKVWSLAIGNELNITHELFDICL
40 50 60 70 80 90
440 450 460 470 480 490
pF1KSD ARAKERWRSLSTGGSEVENEDAGFSAADREASLELIKLDISRTFPNLCIFQQGGPYHDML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 ARAKERWRSLSTGGSEVENEDAGFSAADREASLELIKLDISRTFPNLCIFQQGGPYHDML
100 110 120 130 140 150
500 510 520 530 540 550
pF1KSD HSILGAYTCYRPDVGYVQGMSFIAAVLILNLDTADAFIAFSNLLNKPCQMAFFRVDHGLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 HSILGAYTCYRPDVGYVQGMSFIAAVLILNLDTADAFIAFSNLLNKPCQMAFFRVDHGLM
160 170 180 190 200 210
560 570 580 590 600 610
pF1KSD LTYFAAFEVFFEENLPKLFAHFKKNNLTPDIYLIDWIFTLYSKSLPLDLACRIWDVFCRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LTYFAAFEVFFEENLPKLFAHFKKNNLTPDIYLIDWIFTLYSKSLPLDLACRIWDVFCRD
220 230 240 250 260 270
620 630 640 650 660 670
pF1KSD GEEFLFRTALGILKLFEDILTKMDFIHMAQFLTRLPEDLPAEELFASIATIQMQSRNKKW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 GEEFLFRTALGILKLFEDILTKMDFIHMAQFLTRLPEDLPAEELFASIATIQMQSRNKKW
280 290 300 310 320 330
680 690
pF1KSD AQVLTALQKDSREMEKGSPSLRH
:::::::::::::::::::::::
CCDS75 AQVLTALQKDSREMEKGSPSLRH
340 350
>>CCDS41553.1 TBC1D12 gene_id:23232|Hs108|chr10 (775 aa)
initn: 2193 init1: 1314 opt: 2225 Z-score: 2020.9 bits: 384.5 E(32554): 3e-106
Smith-Waterman score: 2225; 70.6% identity (89.4% similar) in 463 aa overlap (233-692:316-774)
210 220 230 240 250 260
pF1KSD VTLSSIKETRGLHQQDCVHEAEEGSKLKILGPFSNFFARNLLARKQSARLDK--HNDLGW
: :..::.:::. :.. .: . :. ::
CCDS41 RDHLPPAGPPVPLPAAEQGPAGASARARRSGGFADFFTRNLFP-KRTKELKSVVHSAPGW
290 300 310 320 330 340
270 280 290 300 310 320
pF1KSD KLFGKAPLRENAQKDSKRIQKEYEDKAGRPSKPPSPKQNVRKNLDFEPLSTTALILEDRP
:::::.: ::: :: :: ::.::: ..:: ::: :... :::..:::::::::::::::
CCDS41 KLFGKVPPRENLQKTSKIIQQEYEARTGRTCKPP-PQSSRRKNFEFEPLSTTALILEDRP
350 360 370 380 390 400
330 340 350 360 370 380
pF1KSD ANLPAKPAEEAQKHRQQYEEMVVQAKKRELKEAQRRKKQLEERCRVEESIGNAVLTWNNE
.::::: .::: .:::.:.:::..:::::.:::..::. ..:: . ::.:..:.. : ::
CCDS41 SNLPAKSVEEALRHRQEYDEMVAEAKKREIKEAHKRKRIMKERFKQEENIASAMVIWINE
410 420 430 440 450 460
390 400 410 420 430 440
pF1KSD ILPNWETMWCSRKVRDLWWQGIPPSVRGKVWSLAIGNELNITHELFDICLARAKERWRSL
::::::.: .:.::.:::::.::::::::::::.::::::: ::..: :.::::::.:.
CCDS41 ILPNWEVMRSTRRVRELWWQGLPPSVRGKVWSLAVGNELNITPELYEIFLSRAKERWKSF
470 480 490 500 510 520
450 460 470 480 490 500
pF1KSD STGGSEVENEDAGFSAADREASLELIKLDISRTFPNLCIFQQGGPYHDMLHSILGAYTCY
: .: ::. : :.:::::::::::::::::::.: :::.::::::.:::::::::::
CCDS41 SETSS--ENDTEGVSVADREASLELIKLDISRTFPSLYIFQKGGPYHDVLHSILGAYTCY
530 540 550 560 570 580
510 520 530 540 550 560
pF1KSD RPDVGYVQGMSFIAAVLILNLDTADAFIAFSNLLNKPCQMAFFRVDHGLMLTYFAAFEVF
:::::::::::::::::::::. :::::::.::::::::.:::::::..:: :::.::::
CCDS41 RPDVGYVQGMSFIAAVLILNLEEADAFIAFANLLNKPCQLAFFRVDHSMMLKYFATFEVF
590 600 610 620 630 640
570 580 590 600 610 620
pF1KSD FEENLPKLFAHFKKNNLTPDIYLIDWIFTLYSKSLPLDLACRIWDVFCRDGEEFLFRTAL
::::: ::: :::. .::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::.:
CCDS41 FEENLSKLFLHFKSYSLTPDIYLIDWIFTLYSKSLPLDLACRVWDVFCRDGEEFLFRTGL
650 660 670 680 690 700
630 640 650 660 670 680
pF1KSD GILKLFEDILTKMDFIHMAQFLTRLPEDLPAEELFASIATIQMQSRNKKWAQVLTALQKD
:::.:.:::: .:::::.:::::.::::. .:.::. ::.::::. .:::.::.....::
CCDS41 GILRLYEDILLQMDFIHIAQFLTKLPEDITSEKLFSCIAAIQMQNSTKKWTQVFASVMKD
710 720 730 740 750 760
690
pF1KSD SREMEKGS-PSLRH
.: .:.: :.:.
CCDS41 IKEGDKNSSPALKS
770
>>CCDS30774.1 EVI5 gene_id:7813|Hs108|chr1 (810 aa)
initn: 345 init1: 275 opt: 366 Z-score: 336.2 bits: 72.9 E(32554): 2.1e-12
Smith-Waterman score: 391; 23.8% identity (59.2% similar) in 412 aa overlap (291-686:47-425)
270 280 290 300 310 320
pF1KSD KLFGKAPLRENAQKDSKRIQKEYEDKAGRPSKPPSPKQNVRKNLDFEPLSTTALILEDRP
:. ::. ... . . ::: :: . :
CCDS30 QVATDKVAEKLSSTLSWVKNTVSHTVSQMASQVASPSTSLHTTSSSTTLSTPALS-PSSP
20 30 40 50 60 70
330 340 350 360 370
pF1KSD ANLPAKPAEEAQKHRQQYEEMVVQAKKRELKEAQRRKK--QLEERCRVEESIG----NAV
..: : : ..: . . ...:. . ...::.. .: . ... ..
CCDS30 SQLSPDDLELLAKLEEQNRLLETDSKSLRSVNGSRRNSGSSLVSSSSASSNLSHLEEDSW
80 90 100 110 120 130
380 390 400 410 420 430
pF1KSD LTWNNEILPNWETMWCSR--KVRDLWWQGIPPSVRGKVWSLAIGNELNITHELFDICLAR
. :. .:. .:: . .. .:..: .::: :. ::.: .: :.
CCDS30 ILWG-RIVNEWEDVRKKKEKQVKELVHKGIPHHFRAIVWQL--------------LCSAQ
140 150 160 170 180
440 450 460 470 480
pF1KSD A---KERWRSLSTGGSEVENEDAGFSAADREASLELIKLDISRTFPNLCIFQQGGPY-HD
. :... : : : .::. ::.::.:. .:.. ..
CCDS30 SMPIKDQYSELLKMTSPCE---------------KLIRRDIARTYPEHNFFKEKDSLGQE
190 200 210 220
490 500 510 520 530 540
pF1KSD MLHSILGAYTCYRPDVGYVQGMSFIAAVLILNLDTADAFIAFSNLLNKPCQMAFFRVDHG
.: ... ::. .::: :: .::...:.... .:: .: .:.. .:. . .
CCDS30 VLFNVMKAYSLVDREVGYCQGSAFIVGLLLMQMPEEEAFCVFVKLMQDYRLRELFKPSMA
230 240 250 260 270 280
550 560 570 580 590 600
pF1KSD LMLTYFAAFEVFFEENLPKLFAHFKKNNLTPDIYLIDWIFTLYSKSLPLDLACRIWDVFC
. . :: ...:.::.::.::..... ..: .:..:.. ..:: .: ::.:.:
CCDS30 ELGLCMYQFECMIQEHLPELFVHFQSQSFHTSMYASSWFLTIFLTTFPLPIATRIFDIFM
290 300 310 320 330 340
610 620 630 640 650 660
pF1KSD RDGEEFLFRTALGILKLFEDILTKMDFIHMAQFLTR-LPEDLPA--EELFASIATIQMQS
.: :..::..:..:.. . : ..:. : : . . .:... . ..:. . ....:
CCDS30 SEGLEIVFRVGLALLQMNQAELMQLDMEGMLQHFQKVIPHQFDGVPDKLIQAAYQVKYNS
350 360 370 380 390 400
670 680 690
pF1KSD RN-KKWAQVLTALQKDSREMEKGSPSLRH
.. :: . :... ..:::.
CCDS30 KKMKKLEKEYTTIK--TKEMEEQVEIKRLRTENRLLKQRIETLEKHKCSSNYNEDFVLQL
410 420 430 440 450 460
>>CCDS76179.1 EVI5 gene_id:7813|Hs108|chr1 (821 aa)
initn: 345 init1: 275 opt: 366 Z-score: 336.1 bits: 72.9 E(32554): 2.1e-12
Smith-Waterman score: 391; 23.8% identity (59.2% similar) in 412 aa overlap (291-686:47-425)
270 280 290 300 310 320
pF1KSD KLFGKAPLRENAQKDSKRIQKEYEDKAGRPSKPPSPKQNVRKNLDFEPLSTTALILEDRP
:. ::. ... . . ::: :: . :
CCDS76 QVATDKVAEKLSSTLSWVKNTVSHTVSQMASQVASPSTSLHTTSSSTTLSTPALS-PSSP
20 30 40 50 60 70
330 340 350 360 370
pF1KSD ANLPAKPAEEAQKHRQQYEEMVVQAKKRELKEAQRRKK--QLEERCRVEESIG----NAV
..: : : ..: . . ...:. . ...::.. .: . ... ..
CCDS76 SQLSPDDLELLAKLEEQNRLLETDSKSLRSVNGSRRNSGSSLVSSSSASSNLSHLEEDSW
80 90 100 110 120 130
380 390 400 410 420 430
pF1KSD LTWNNEILPNWETMWCSR--KVRDLWWQGIPPSVRGKVWSLAIGNELNITHELFDICLAR
. :. .:. .:: . .. .:..: .::: :. ::.: .: :.
CCDS76 ILWG-RIVNEWEDVRKKKEKQVKELVHKGIPHHFRAIVWQL--------------LCSAQ
140 150 160 170 180
440 450 460 470 480
pF1KSD A---KERWRSLSTGGSEVENEDAGFSAADREASLELIKLDISRTFPNLCIFQQGGPY-HD
. :... : : : .::. ::.::.:. .:.. ..
CCDS76 SMPIKDQYSELLKMTSPCE---------------KLIRRDIARTYPEHNFFKEKDSLGQE
190 200 210 220
490 500 510 520 530 540
pF1KSD MLHSILGAYTCYRPDVGYVQGMSFIAAVLILNLDTADAFIAFSNLLNKPCQMAFFRVDHG
.: ... ::. .::: :: .::...:.... .:: .: .:.. .:. . .
CCDS76 VLFNVMKAYSLVDREVGYCQGSAFIVGLLLMQMPEEEAFCVFVKLMQDYRLRELFKPSMA
230 240 250 260 270 280
550 560 570 580 590 600
pF1KSD LMLTYFAAFEVFFEENLPKLFAHFKKNNLTPDIYLIDWIFTLYSKSLPLDLACRIWDVFC
. . :: ...:.::.::.::..... ..: .:..:.. ..:: .: ::.:.:
CCDS76 ELGLCMYQFECMIQEHLPELFVHFQSQSFHTSMYASSWFLTIFLTTFPLPIATRIFDIFM
290 300 310 320 330 340
610 620 630 640 650 660
pF1KSD RDGEEFLFRTALGILKLFEDILTKMDFIHMAQFLTR-LPEDLPA--EELFASIATIQMQS
.: :..::..:..:.. . : ..:. : : . . .:... . ..:. . ....:
CCDS76 SEGLEIVFRVGLALLQMNQAELMQLDMEGMLQHFQKVIPHQFDGVPDKLIQAAYQVKYNS
350 360 370 380 390 400
670 680 690
pF1KSD RN-KKWAQVLTALQKDSREMEKGSPSLRH
.. :: . :... ..:::.
CCDS76 KKMKKLEKEYTTIK--TKEMEEQVEIKRLRTENRLLKQRIETLEKESASLADRLIQHKCS
410 420 430 440 450 460
>>CCDS12188.1 EVI5L gene_id:115704|Hs108|chr19 (794 aa)
initn: 332 init1: 262 opt: 361 Z-score: 331.8 bits: 72.0 E(32554): 3.7e-12
Smith-Waterman score: 372; 26.1% identity (59.3% similar) in 322 aa overlap (375-686:88-377)
350 360 370 380 390 400
pF1KSD AKKRELKEAQRRKKQLEERCRVEESIGNAVLTWNNEILPNWETMWCSRK---VRDLWWQG
. :. .: .:: : :: ...: .:
CCDS12 MNGSRRNSGSSLVSSSSASSNLSHLEEDTWILWG-RIANEWEE-WRRRKEKLLKELIRKG
60 70 80 90 100 110
410 420 430 440 450
pF1KSD IPPSVRGKVWSLAIGNELNITHELFDICLAR---AKERWRSLSTGGSEVENEDAGFSAAD
:: :. ::.: .: : .:... : .: :
CCDS12 IPHHFRAIVWQL--------------LCSATDMPVKNQYSELLKMSSPCE----------
120 130 140 150
460 470 480 490 500 510
pF1KSD REASLELIKLDISRTFPNLCIFQ-QGGPYHDMLHSILGAYTCYRPDVGYVQGMSFIAAVL
.::. ::.::.:. .:. : . ...: ... ::. .::: :: .::...:
CCDS12 -----KLIRRDIARTYPEHEFFKGQDSLGQEVLFNVMKAYSLVDREVGYCQGSAFIVGLL
160 170 180 190 200
520 530 540 550 560 570
pF1KSD ILNLDTADAFIAFSNLLNKPCQMAFFRVDHGLMLTYFAAFEVFFEENLPKLFAHFKKNNL
.... .:: .: :... .:. . . . . :: ...:.:: : .::.....
CCDS12 LMQMPEEEAFCVFVRLMQEYRLRELFKPSMAELGLCIYQFEYMLQEQLPDLNTHFRSQSF
210 220 230 240 250 260
580 590 600 610 620 630
pF1KSD TPDIYLIDWIFTLYSKSLPLDLACRIWDVFCRDGEEFLFRTALGILKLFEDILTKMDFIH
..: .:..::. ..:: .: :..:.: .: :..::..:..:.. . : ..:.
CCDS12 HTSMYASSWFLTLFLTTFPLPVATRVFDIFMYEGLEIVFRVGLALLQVNQAELMQLDMEG
270 280 290 300 310 320
640 650 660 670 680 690
pF1KSD MAQFLTR-LPEDLPA--EELFASIATIQMQSRNKKWAQVLTALQKDSREMEKGSPSLRH
:.:.. : .:... . ..: . .... .. : . : .: :.:::.
CCDS12 MSQYFQRVIPHQFDSCPDKLVLKAYQVKYNPKKMKRLEKEYAAMK-SKEMEEQIEIKRLR
330 340 350 360 370 380
CCDS12 TENRLLKQRIETLEKGQVTRAQEAEENYVIKRELAVVRQQCSSAAEDLQKAQSTIRQLQE
390 400 410 420 430 440
>>CCDS54209.1 EVI5L gene_id:115704|Hs108|chr19 (805 aa)
initn: 332 init1: 262 opt: 361 Z-score: 331.7 bits: 72.0 E(32554): 3.7e-12
Smith-Waterman score: 372; 26.1% identity (59.3% similar) in 322 aa overlap (375-686:88-377)
350 360 370 380 390 400
pF1KSD AKKRELKEAQRRKKQLEERCRVEESIGNAVLTWNNEILPNWETMWCSRK---VRDLWWQG
. :. .: .:: : :: ...: .:
CCDS54 MNGSRRNSGSSLVSSSSASSNLSHLEEDTWILWG-RIANEWEE-WRRRKEKLLKELIRKG
60 70 80 90 100 110
410 420 430 440 450
pF1KSD IPPSVRGKVWSLAIGNELNITHELFDICLAR---AKERWRSLSTGGSEVENEDAGFSAAD
:: :. ::.: .: : .:... : .: :
CCDS54 IPHHFRAIVWQL--------------LCSATDMPVKNQYSELLKMSSPCE----------
120 130 140 150
460 470 480 490 500 510
pF1KSD REASLELIKLDISRTFPNLCIFQ-QGGPYHDMLHSILGAYTCYRPDVGYVQGMSFIAAVL
.::. ::.::.:. .:. : . ...: ... ::. .::: :: .::...:
CCDS54 -----KLIRRDIARTYPEHEFFKGQDSLGQEVLFNVMKAYSLVDREVGYCQGSAFIVGLL
160 170 180 190 200
520 530 540 550 560 570
pF1KSD ILNLDTADAFIAFSNLLNKPCQMAFFRVDHGLMLTYFAAFEVFFEENLPKLFAHFKKNNL
.... .:: .: :... .:. . . . . :: ...:.:: : .::.....
CCDS54 LMQMPEEEAFCVFVRLMQEYRLRELFKPSMAELGLCIYQFEYMLQEQLPDLNTHFRSQSF
210 220 230 240 250 260
580 590 600 610 620 630
pF1KSD TPDIYLIDWIFTLYSKSLPLDLACRIWDVFCRDGEEFLFRTALGILKLFEDILTKMDFIH
..: .:..::. ..:: .: :..:.: .: :..::..:..:.. . : ..:.
CCDS54 HTSMYASSWFLTLFLTTFPLPVATRVFDIFMYEGLEIVFRVGLALLQVNQAELMQLDMEG
270 280 290 300 310 320
640 650 660 670 680 690
pF1KSD MAQFLTR-LPEDLPA--EELFASIATIQMQSRNKKWAQVLTALQKDSREMEKGSPSLRH
:.:.. : .:... . ..: . .... .. : . : .: :.:::.
CCDS54 MSQYFQRVIPHQFDSCPDKLVLKAYQVKYNPKKMKRLEKEYAAMK-SKEMEEQIEIKRLR
330 340 350 360 370 380
CCDS54 TENRLLKQRIETLEKESAALADRLIQGQVTRAQEAEENYVIKRELAVVRQQCSSAAEDLQ
390 400 410 420 430 440
>>CCDS1314.1 RABGAP1L gene_id:9910|Hs108|chr1 (815 aa)
initn: 326 init1: 295 opt: 351 Z-score: 322.5 bits: 70.4 E(32554): 1.2e-11
Smith-Waterman score: 386; 27.9% identity (58.9% similar) in 319 aa overlap (376-685:512-804)
350 360 370 380 390 400
pF1KSD KKRELKEAQRRKKQLEERCRVEESIGNAVLTWNNEILPNWETMWCSRK--VRDLWWQGIP
.:. :.: .:.. .: . : .:.:
CCDS13 QDDEAEEESDNELSSGTGDVSKDCPEKILYSWG-ELLGKWHSNLGARPKGLSTLVKSGVP
490 500 510 520 530 540
410 420 430 440 450 460
pF1KSD PSVRGKVWSLAIGNELNITHELFDICLARAKERWRSLSTGGSEVENEDAGFSAADREASL
..:..::.: : . : . ..: :.: : : : :.
CCDS13 EALRAEVWQLLAGCHDN--QAMLD--------RYRILITKDSAQES--------------
550 560 570
470 480 490 500 510 520
pF1KSD ELIKLDISRTFPNLCIFQQ-GGPYHDMLHSILGAYTCYRPDVGYVQGMSFIAAVLILNLD
.: :: :::: :.. :: .. :..: ::. : :.:: ::.::.::::.:..
CCDS13 -VITRDIHRTFPAHDYFKDTGGDGQESLYKICKAYSVYDEDIGYCQGQSFLAAVLLLHMP
580 590 600 610 620 630
530 540 550 560 570 580
pF1KSD TADAFIAFSNLLNKPCQMAFFRVDHGLMLTYFAAFEVFFEENLPKLFAHFKKNNLTPDIY
.:: .. ... ..: . . : .: ...:.:: : .::. :: .:
CCDS13 EEQAFCVLVKIMYDYGLRDLYRNNFEDLHCKFYQLERLMQEQLPDLHSHFSDLNLEAHMY
640 650 660 670 680 690
590 600 610 620 630 640
pF1KSD LIDWIFTLYSKSLPLDLACRIWDVFCRDGEEFLFRTALGILKLFEDILTKMDFIHMAQFL
.:..::.. ..:: .. .: :.. .: ...:..::..:: .. : . :: .:.
CCDS13 ASQWFLTLFTAKFPLCMVFHIIDLLLCEGLNIIFHVALALLKTSKEDLLQADFEGALKFF
700 710 720 730 740 750
650 660 670 680 690
pF1KSD -TRLPEDLPAEE----LFASIATIQMQSRN-KKWAQVLTALQKDSREMEKGSPSLRH
..::. ::: :. . .:.. ... ::. . ...... ..:
CCDS13 RVQLPKRYRAEENARRLMEQACNIKVPTKKLKKYEKEYQTMRESQLQQEDPMDRYKFVYL
760 770 780 790 800 810
693 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 05:49:21 2016 done: Thu Nov 3 05:49:22 2016
Total Scan time: 3.960 Total Display time: 0.110
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]