FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1277, 1009 aa
1>>>pF1KSDA1277 1009 - 1009 aa - 1009 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.2388+/-0.000942; mu= 4.3726+/- 0.057
mean_var=201.2275+/-40.148, 0's: 0 Z-trim(113.2): 42 B-trim: 583 in 1/50
Lambda= 0.090413
statistics sampled from 13826 (13863) to 13826 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.745), E-opt: 0.2 (0.426), width: 16
Scan time: 5.490
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS43659.1 DENND2A gene_id:27147|Hs108|chr7 (1009) 6769 896.1 0
CCDS83233.1 DENND2A gene_id:27147|Hs108|chr7 ( 795) 5228 695.0 1.6e-199
CCDS7791.1 ST5 gene_id:6764|Hs108|chr11 (1137) 2579 349.5 2.2e-95
CCDS7792.1 ST5 gene_id:6764|Hs108|chr11 ( 717) 2540 344.3 5.2e-94
CCDS58018.1 DENND2C gene_id:163259|Hs108|chr1 ( 928) 2211 301.5 5.3e-81
CCDS875.1 DENND2C gene_id:163259|Hs108|chr1 ( 871) 2199 299.9 1.5e-80
CCDS60219.1 DENND2D gene_id:79961|Hs108|chr1 ( 468) 1127 159.9 1.1e-38
CCDS831.1 DENND2D gene_id:79961|Hs108|chr1 ( 471) 1127 159.9 1.1e-38
>>CCDS43659.1 DENND2A gene_id:27147|Hs108|chr7 (1009 aa)
initn: 6769 init1: 6769 opt: 6769 Z-score: 4780.3 bits: 896.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6769; 99.8% identity (99.9% similar) in 1009 aa overlap (1-1009:1-1009)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MDMFSLDMIISDPAAEASRAGKKQLRGVQNPCPSARARPRHKSLNIKDKISEWEGKKEVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MDMFSLDMIISDPAAEASRAGKKQLRGVQNPCPSARARPRHKSLNIKDKISEWEGKKEVP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD TPAPSRRADGQEDYLPSSTVERRSSDGVRTQVTEAKNGMRPGTESTEKERNKGAVNVGGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TPAPSRRADGQEDYLPSSTVERRSSDGVRTQVTEAKNGMRPGTESTEKERNKGAVNVGGQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD DPEPGQDLSQPEREVDPSWGRGREPRLGKLRFQNDHLSVLKQVKKLEQALKDGSAGLDPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DPEPGQDLSQPEREVDPSWGRGREPRLGKLRFQNDPLSVLKQVKKLEQALKDGSAGLDPQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD LPGTCYSPHCPPDKAEAGSTLPENLGGGSGSEVSQRVHPSDLEGREPTPELVEDRKGSCR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LPGTCYSPHCPPDKAEAGSTLPENLGGGSGSEVSQRVHPSDLEGREPTPELVEDRKGSCR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD RPWDRSLENVYRGSEGSPTKPFINPLPKPRRTFKHAGEGDKDGKPGIGFRKEKRNLPPLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RPWDRSLENVYRGSEGSPTKPFINPLPKPRRTFKHAGEGDKDGKPGIGFRKEKRNLPPLP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD SLPPPPLPSSPPPSSVNRRLWTGRQKSSADHRKSYEFEDLLQSSSESSRVDWYAQTKLGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SLPPPPLPSSPPPSSVNRRLWTGRQKSSADHRKSYEFEDLLQSSSESSRVDWYAQTKLGL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD TRTLSEENVYEDILDPPMKENPYEDIELHGRCLGKKCVLNFPASPTSSIPDTLTKQSLSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TRTLSEENVYEDILDPPMKENPYEDIELHGRCLGKKCVLNFPASPTSSIPDTLTKQSLSK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD PAFFRQNSERRNFKLLDTRKLSRDGTGSPSKISPPSTPSSPDDIFFNLGDPQNGRKKRKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PAFFRQNSERRNFKLLDTRKLSRDGTGSPSKISPPSTPSSPDDIFFNLGDPQNGRKKRKI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD PKLVLRINAIYEVRRGKKRVKRLSQSMESNSGKVTDENSESDSDTEEKLKAHSQRLVNVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PKLVLRINAIYEVRRGKKRVKRLSQSMESNSGKVTDENSESDSDTEEKLKAHSQRLVNVK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD SRLKQAPRYPSLARELIEYQERQLFEYFVVVSLHKKQAGAAYVPELTQQFPLKLERSFKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SRLKQAPRYPSLARELIEYQERQLFEYFVVVSLHKKQAGAAYVPELTQQFPLKLERSFKF
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD MREAEDQLKAIPQFCFPDAKDWVPVQQFTSETFSFVLTGEDGSRRFGYCRRLLPGGKGKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MREAEDQLKAIPQFCFPDAKDWVPVQQFTSETFSFVLTGEDGSRRFGYCRRLLPGGKGKR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD LPEVYCIVSRLGCFSLFSRILDEVEKRRGISPALVQPLMRSVMEAPFPALGKTILVKNFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LPEVYCIVSRLGCFSLFSRILDEVEKRRGISPALVQPLMRSVMEAPFPALGKTILVKNFL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD PGSGTEVIELCRPLDSRLEHVDFESLFSSLSVRHLVCVFASLLLERRVIFIADKLSILSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PGSGTEVIELCRPLDSRLEHVDFESLFSSLSVRHLVCVFASLLLERRVIFIADKLSILSK
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD CCHAMVALIYPFAWQHTYIPVLPPAMVDIVCSPTPFLIGLLSSSLPLLRELPLEEVLVVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 CCHAMVALIYPFAWQHTYIPVLPPAMVDIVCSPTPFLIGLLSSSLPLLRELPLEEVLVVD
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD LVNSRFLRQMDDEDSILPRKLQVVLEHILEQRNELACEQDEGPLDGRHGPESSPLNEVVS
:::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LVNSRFLRQMDDEDSILPRKLQVALEHILEQRNELACEQDEGPLDGRHGPESSPLNEVVS
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD EAFVRFFVEIVGHYSLFLTSGEREERTLQREAFRKAVSSKSLRHFLEVFMETQMFRGFIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 EAFVRFFVEIVGHYSLFLTSGEREERTLQREAFRKAVSSKSLRHFLEVFMETQMFRGFIQ
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000
pF1KSD ERELRRQDAKGLFEVRAQEYLETLPSGEHSGVNKFLKGLGNKMKFLHKK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ERELRRQDAKGLFEVRAQEYLETLPSGEHSGVNKFLKGLGNKMKFLHKK
970 980 990 1000
>>CCDS83233.1 DENND2A gene_id:27147|Hs108|chr7 (795 aa)
initn: 5228 init1: 5228 opt: 5228 Z-score: 3695.5 bits: 695.0 E(32554): 1.6e-199
Smith-Waterman score: 5228; 99.9% identity (99.9% similar) in 775 aa overlap (1-775:1-775)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MDMFSLDMIISDPAAEASRAGKKQLRGVQNPCPSARARPRHKSLNIKDKISEWEGKKEVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 MDMFSLDMIISDPAAEASRAGKKQLRGVQNPCPSARARPRHKSLNIKDKISEWEGKKEVP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD TPAPSRRADGQEDYLPSSTVERRSSDGVRTQVTEAKNGMRPGTESTEKERNKGAVNVGGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 TPAPSRRADGQEDYLPSSTVERRSSDGVRTQVTEAKNGMRPGTESTEKERNKGAVNVGGQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD DPEPGQDLSQPEREVDPSWGRGREPRLGKLRFQNDHLSVLKQVKKLEQALKDGSAGLDPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::
CCDS83 DPEPGQDLSQPEREVDPSWGRGREPRLGKLRFQNDPLSVLKQVKKLEQALKDGSAGLDPQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD LPGTCYSPHCPPDKAEAGSTLPENLGGGSGSEVSQRVHPSDLEGREPTPELVEDRKGSCR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 LPGTCYSPHCPPDKAEAGSTLPENLGGGSGSEVSQRVHPSDLEGREPTPELVEDRKGSCR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD RPWDRSLENVYRGSEGSPTKPFINPLPKPRRTFKHAGEGDKDGKPGIGFRKEKRNLPPLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 RPWDRSLENVYRGSEGSPTKPFINPLPKPRRTFKHAGEGDKDGKPGIGFRKEKRNLPPLP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD SLPPPPLPSSPPPSSVNRRLWTGRQKSSADHRKSYEFEDLLQSSSESSRVDWYAQTKLGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 SLPPPPLPSSPPPSSVNRRLWTGRQKSSADHRKSYEFEDLLQSSSESSRVDWYAQTKLGL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD TRTLSEENVYEDILDPPMKENPYEDIELHGRCLGKKCVLNFPASPTSSIPDTLTKQSLSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 TRTLSEENVYEDILDPPMKENPYEDIELHGRCLGKKCVLNFPASPTSSIPDTLTKQSLSK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD PAFFRQNSERRNFKLLDTRKLSRDGTGSPSKISPPSTPSSPDDIFFNLGDPQNGRKKRKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 PAFFRQNSERRNFKLLDTRKLSRDGTGSPSKISPPSTPSSPDDIFFNLGDPQNGRKKRKI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD PKLVLRINAIYEVRRGKKRVKRLSQSMESNSGKVTDENSESDSDTEEKLKAHSQRLVNVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 PKLVLRINAIYEVRRGKKRVKRLSQSMESNSGKVTDENSESDSDTEEKLKAHSQRLVNVK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD SRLKQAPRYPSLARELIEYQERQLFEYFVVVSLHKKQAGAAYVPELTQQFPLKLERSFKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 SRLKQAPRYPSLARELIEYQERQLFEYFVVVSLHKKQAGAAYVPELTQQFPLKLERSFKF
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD MREAEDQLKAIPQFCFPDAKDWVPVQQFTSETFSFVLTGEDGSRRFGYCRRLLPGGKGKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 MREAEDQLKAIPQFCFPDAKDWVPVQQFTSETFSFVLTGEDGSRRFGYCRRLLPGGKGKR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD LPEVYCIVSRLGCFSLFSRILDEVEKRRGISPALVQPLMRSVMEAPFPALGKTILVKNFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 LPEVYCIVSRLGCFSLFSRILDEVEKRRGISPALVQPLMRSVMEAPFPALGKTILVKNFL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD PGSGTEVIELCRPLDSRLEHVDFESLFSSLSVRHLVCVFASLLLERRVIFIADKLSILSK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 PGSGTEVIELCRPLDSRLEHVDFESLFSSLSVRHLVCVFASLLLERRVIFIADKLRYPPW
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD CCHAMVALIYPFAWQHTYIPVLPPAMVDIVCSPTPFLIGLLSSSLPLLRELPLEEVLVVD
CCDS83 LLLLKRLNDSRSWTL
790
>>CCDS7791.1 ST5 gene_id:6764|Hs108|chr11 (1137 aa)
initn: 2252 init1: 1511 opt: 2579 Z-score: 1825.8 bits: 349.5 E(32554): 2.2e-95
Smith-Waterman score: 2996; 51.4% identity (72.7% similar) in 1009 aa overlap (36-1009:154-1136)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD LDMIISDPAAEASRAGKKQLRGVQNPCPSARARPRHKSLNIKDKISEWEGKKEVPTPAPS
:. : .::.:..::: :::..:. .: :
CCDS77 DVAGVAACLPLAQSTPFPGPAAGPRGVLLTRTGTRAHSLGIREKISAWEGRREA-SPRMS
130 140 150 160 170 180
70 80 90 100 110 120
pF1KSD RRADGQEDYLPSSTVERRSSDGVRTQVTEAKNGMRPGTESTEKERN-KGAVNVGGQDPEP
.. .: .: : .:.: . . . :. :.:: . :: .. :
CCDS77 MCGEKRE----GSGSEWAASEGCPSLGCPS---VVPSPCSSEKTFDFKGLRRMSRTFSEC
190 200 210 220 230
130 140 150 160 170
pF1KSD GQDLSQPEREVDP---SWGRGREPRLGKLR---FQNDHLS------VLKQVKKLEQALKD
. .. : :. : :. : : :::. . : : : ::....:.::.::.
CCDS77 SYPETEEEGEALPVRDSFYR-LEKRLGRSEPSAFLRGHGSRKESSAVLSRIQKIEQVLKE
240 250 260 270 280 290
180 190 200 210 220 230
pF1KSD GSAGLDPQLPGTCYSPHCPPDKAEAGSTLPENLGGGSGSEVSQRVHPSDLEGRE-PTPEL
. ::::..::: :. . ..: : ::.: : :. : . . :. : ::
CCDS77 QPGRGLPQLPSSCYSVDRGKRKTGTLGSLEEPAGGASVSAGSRAVGVAGVAGEAGPPPE-
300 310 320 330 340 350
240 250 260 270 280 290
pF1KSD VEDRKGSCRRPWDRSLENVYRGSEGSPTKPFINPLPKPRRTFKHAGEGDKDGKPGIGFRK
.. .:: . . . : : : .::.:::.:::.. .. . .::. :
CCDS77 -REGSGSTKPGTPGNSPSSQRLPSKSSLDPAVNPVPKPKRTFEYEADKNPKSKPSNG---
360 370 380 390 400
300 310 320 330 340
pF1KSD EKRNLPPLPS-LPPPPLPSSPPPSSVNRRLWTGRQKSSADHRKSYEFEDL--LQSSSESS
::: :. ::::::.: : . : : . ... :::.:::: ::: ::
CCDS77 ----LPPSPTPAAPPPLPSTPAPPVTRRPKKDMRGHRKSQSRKSFEFEDASSLQSLYPSS
410 420 430 440 450 460
350 360 370 380 390
pF1KSD RVD--WYAQTKLGLTRTLSEENVYEDILDPPMKENPYEDIELHGRCLGKKC---------
.. : :.: :: :::.::::. :::::::..:..: :.:
CCDS77 PTENGTENQPKFGSKSTL-EENAYEDIVGDLPKENPYEDVDLKSRRAGRKSQQLSENSLD
470 480 490 500 510 520
400 410 420 430 440 450
pF1KSD VLNFPASPT----SSIPDTLTKQSLSKPAFFRQNSERRNFKLLDT-RKLSRDGTGSPSKI
:. :: .: : :. . :. . :::.. .: .. :.: ...
CCDS77 SLHRMWSPQDRKYNSPPTQLSLKPNSQSLRSGNWSERKSHRLPRLPKRHSHDDMLLLAQL
530 540 550 560 570 580
460 470 480 490 500 510
pF1KSD SPPSTPSS-PDDIFFNLGDPQNGRKKRKIPKLVLRINAIYEVRRGKKRVKRLSQS-MESN
: ::.::: .: . . .. ..:. :.::::: :::.::...:::::.:.::.: .:.
CCDS77 SLPSSPSSLNEDSLSTTSELLSSRRARRIPKLVQRINSIYNAKRGKKRLKKLSMSSIETA
590 600 610 620 630 640
520 530 540 550 560 570
pF1KSD SGKVTDENSESDSDTEEKLKAHSQRLVNVKSRLKQAPRYPSLARELIEYQERQLFEYFVV
: . ::::::.::.....:::.::::...: ::.:: : .: ::.:.:::.:::::::
CCDS77 S--LRDENSESESDSDDRFKAHTQRLVHIQSMLKRAPSYRTLELELLEWQERELFEYFVV
650 660 670 680 690 700
580 590 600 610 620 630
pF1KSD VSLHKKQAGAAYVPELTQQFPLKLERSFKFMREAEDQLKAIPQFCFPDAKDWVPVQQFTS
:::.:: . .:.::.. ::: ::.: : :::::..:::::::::::::::.::....:
CCDS77 VSLKKKPSRNTYLPEVSYQFP-KLDRPTKQMREAEERLKAIPQFCFPDAKDWLPVSEYSS
710 720 730 740 750 760
640 650 660 670 680 690
pF1KSD ETFSFVLTGEDGSRRFGYCRRLLPGGKGKRLPEVYCIVSRLGCFSLFSRILDEVEKRRGI
:::::.::::::::::::::::::.::: :::::::..::::::.:::..:::::.::::
CCDS77 ETFSFMLTGEDGSRRFGYCRRLLPSGKGPRLPEVYCVISRLGCFGLFSKVLDEVERRRGI
770 780 790 800 810 820
700 710 720 730 740 750
pF1KSD SPALVQPLMRSVMEAPFPALGKTILVKNFLPGSGTEVIELCRPLDSRLEHVDFESLFSSL
: ::: :.:::.::.:::: :::: ::.::::.:.::.:: ::.:::::::::: ::. :
CCDS77 SAALVYPFMRSLMESPFPAPGKTIKVKTFLPGAGNEVLELRRPMDSRLEHVDFECLFTCL
830 840 850 860 870 880
760 770 780 790 800 810
pF1KSD SVRHLVCVFASLLLERRVIFIADKLSILSKCCHAMVALIYPFAWQHTYIPVLPPAMVDIV
:::.:. .::::::::::::.::::: ::.: ::.:::.:::.::::.::::: .:.:::
CCDS77 SVRQLIRIFASLLLERRVIFVADKLSTLSSCSHAVVALLYPFSWQHTFIPVLPASMIDIV
890 900 910 920 930 940
820 830 840 850 860 870
pF1KSD CSPTPFLIGLLSSSLPLLRELPLEEVLVVDLVNSRFLRQMDDEDSILPRKLQVVLEHILE
: :::::.:::::::: :.:::.::.:.:.: ..::.:::::::..::::::..::. ::
CCDS77 CCPTPFLVGLLSSSLPKLKELPVEEALMVNLGSDRFIRQMDDEDTLLPRKLQAALEQALE
950 960 970 980 990 1000
880 890 900 910 920 930
pF1KSD QRNELACEQDEGPLDGRHGPESSPLNEVVSEAFVRFFVEIVGHYSLFLTSGEREERTLQR
..::: :: :. : . :: .:::.:.::::: :::::::::..:. ::..::
CCDS77 RKNELIS-QDS---DSDSDDECNTLNGLVSEVFIRFFVETVGHYSLFLTQSEKGERAFQR
1010 1020 1030 1040 1050
940 950 960 970 980 990
pF1KSD EAFRKAVSSKSLRHFLEVFMETQMFRGFIQERELRRQDAKGLFEVRAQEYLETLPSGEHS
:::::.:.:::.:.:::::::.::: ::::.::::. :::::: :...::: ::. :.:
CCDS77 EAFRKSVASKSIRRFLEVFMESQMFAGFIQDRELRKCRAKGLFEQRVEQYLEELPDTEQS
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1000
pF1KSD GVNKFLKGLGNKMKFLHKK
:.::::.::::::::::::
CCDS77 GMNKFLRGLGNKMKFLHKKN
1120 1130
>>CCDS7792.1 ST5 gene_id:6764|Hs108|chr11 (717 aa)
initn: 2103 init1: 1511 opt: 2540 Z-score: 1801.3 bits: 344.3 E(32554): 5.2e-94
Smith-Waterman score: 2655; 60.7% identity (81.2% similar) in 698 aa overlap (332-1009:27-716)
310 320 330 340 350
pF1KSD LPPPPLPSSPPPSSVNRRLWTGRQKSSADHRKSYEFEDL--LQSSSESSRVD--WYAQTK
:::.:::: ::: :: .. : :
CCDS77 MTMTANKNSSITHGAGGTKAPRGTLSRKSFEFEDASSLQSLYPSSPTENGTENQPK
10 20 30 40 50
360 370 380 390 400
pF1KSD LGLTRTLSEENVYEDILDPPMKENPYEDIELHGRCLGKKC---------VLNFPASPT--
.: :: :::.::::. :::::::..:..: :.: :. ::
CCDS77 FGSKSTL-EENAYEDIVGDLPKENPYEDVDLKSRRAGRKSQQLSENSLDSLHRMWSPQDR
60 70 80 90 100 110
410 420 430 440 450 460
pF1KSD --SSIPDTLTKQSLSKPAFFRQNSERRNFKLLDT-RKLSRDGTGSPSKISPPSTPSS-PD
.: : :. . :. . :::.. .: .. :.: ...: ::.::: .
CCDS77 KYNSPPTQLSLKPNSQSLRSGNWSERKSHRLPRLPKRHSHDDMLLLAQLSLPSSPSSLNE
120 130 140 150 160 170
470 480 490 500 510 520
pF1KSD DIFFNLGDPQNGRKKRKIPKLVLRINAIYEVRRGKKRVKRLSQS-MESNSGKVTDENSES
: . . .. ..:. :.::::: :::.::...:::::.:.::.: .:. : . ::::::
CCDS77 DSLSTTSELLSSRRARRIPKLVQRINSIYNAKRGKKRLKKLSMSSIETAS--LRDENSES
180 190 200 210 220 230
530 540 550 560 570 580
pF1KSD DSDTEEKLKAHSQRLVNVKSRLKQAPRYPSLARELIEYQERQLFEYFVVVSLHKKQAGAA
.::.....:::.::::...: ::.:: : .: ::.:.:::.::::::::::.:: . .
CCDS77 ESDSDDRFKAHTQRLVHIQSMLKRAPSYRTLELELLEWQERELFEYFVVVSLKKKPSRNT
240 250 260 270 280 290
590 600 610 620 630 640
pF1KSD YVPELTQQFPLKLERSFKFMREAEDQLKAIPQFCFPDAKDWVPVQQFTSETFSFVLTGED
:.::.. ::: ::.: : :::::..:::::::::::::::.::....::::::.:::::
CCDS77 YLPEVSYQFP-KLDRPTKQMREAEERLKAIPQFCFPDAKDWLPVSEYSSETFSFMLTGED
300 310 320 330 340 350
650 660 670 680 690 700
pF1KSD GSRRFGYCRRLLPGGKGKRLPEVYCIVSRLGCFSLFSRILDEVEKRRGISPALVQPLMRS
:::::::::::::.::: :::::::..::::::.:::..:::::.::::: ::: :.:::
CCDS77 GSRRFGYCRRLLPSGKGPRLPEVYCVISRLGCFGLFSKVLDEVERRRGISAALVYPFMRS
360 370 380 390 400 410
710 720 730 740 750 760
pF1KSD VMEAPFPALGKTILVKNFLPGSGTEVIELCRPLDSRLEHVDFESLFSSLSVRHLVCVFAS
.::.:::: :::: ::.::::.:.::.:: ::.:::::::::: ::. ::::.:. .:::
CCDS77 LMESPFPAPGKTIKVKTFLPGAGNEVLELRRPMDSRLEHVDFECLFTCLSVRQLIRIFAS
420 430 440 450 460 470
770 780 790 800 810 820
pF1KSD LLLERRVIFIADKLSILSKCCHAMVALIYPFAWQHTYIPVLPPAMVDIVCSPTPFLIGLL
:::::::::.::::: ::.: ::.:::.:::.::::.::::: .:.:::: :::::.:::
CCDS77 LLLERRVIFVADKLSTLSSCSHAVVALLYPFSWQHTFIPVLPASMIDIVCCPTPFLVGLL
480 490 500 510 520 530
830 840 850 860 870 880
pF1KSD SSSLPLLRELPLEEVLVVDLVNSRFLRQMDDEDSILPRKLQVVLEHILEQRNELACEQDE
::::: :.:::.::.:.:.: ..::.:::::::..::::::..::. ::..::: ::
CCDS77 SSSLPKLKELPVEEALMVNLGSDRFIRQMDDEDTLLPRKLQAALEQALERKNELIS-QDS
540 550 560 570 580 590
890 900 910 920 930 940
pF1KSD GPLDGRHGPESSPLNEVVSEAFVRFFVEIVGHYSLFLTSGEREERTLQREAFRKAVSSKS
:. : . :: .:::.:.::::: :::::::::..:. ::..:::::::.:.:::
CCDS77 ---DSDSDDECNTLNGLVSEVFIRFFVETVGHYSLFLTQSEKGERAFQREAFRKSVASKS
600 610 620 630 640
950 960 970 980 990 1000
pF1KSD LRHFLEVFMETQMFRGFIQERELRRQDAKGLFEVRAQEYLETLPSGEHSGVNKFLKGLGN
.:.:::::::.::: ::::.::::. :::::: :...::: ::. :.::.::::.::::
CCDS77 IRRFLEVFMESQMFAGFIQDRELRKCRAKGLFEQRVEQYLEELPDTEQSGMNKFLRGLGN
650 660 670 680 690 700
pF1KSD KMKFLHKK
::::::::
CCDS77 KMKFLHKKN
710
>>CCDS58018.1 DENND2C gene_id:163259|Hs108|chr1 (928 aa)
initn: 2483 init1: 1629 opt: 2211 Z-score: 1567.7 bits: 301.5 E(32554): 5.3e-81
Smith-Waterman score: 2508; 45.6% identity (68.9% similar) in 988 aa overlap (40-1009:15-928)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD ISDPAAEASRAGKKQLRGVQNPCPSARARPRHKSLNIKDKISEWEGKKE-VPTPAPSRRA
: . :::.:::.:::. . . .:
CCDS58 MDVGFSRTTVQTLSRSHCKNIKQKISQWEGRANGISNP------
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KSD DGQEDYLPSSTVERRSSDGVRTQVTEAKNGMRPGTESTEKERNKGAVNVGGQDPEPGQDL
: . :.. : . . .. :: . ::.. ..: ... . : :.
CCDS58 ---EKWCPKDFGVRYN---CHQEIRLKKNPI--------AERKSKNLDVTSRE-NVGLDI
40 50 60 70 80
130 140 150 160 170 180
pF1KSD SQPEREVDPSWGRGREPRLGKLRF-QNDHLS--VLKQVKKLEQALKDGSAGLDPQL---P
.. . : : ..... . .: .:. : : ..::..:. .: :::. :
CCDS58 NENTKSHDQSENENKKHEYDDTHFFKNESESNWVCSRVKEIESCKED---VLDPETSLPP
90 100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KSD GTCYSPHCPPDKAEAGSTLPENLGGGSGSEVSQRVHPSDLEGREPTPELVEDRKGSCRRP
:. :. . : :: :: . . .. .. : .: . ..... :
CCDS58 GNFYTSQILWKKIEA---LPPD------KLLNLALEHCDSSEKELNFRVLDSSYG-----
150 160 170 180
250 260 270 280 290 300
pF1KSD WDRSLENVYRGSEGSPTKPFINPLPKPRRTFKHAGEGDKDGKPGIGFRKEKRNLPPLPSL
.::::.: ::. : :::::::::::.. .: .: :. .. :
CCDS58 ITKSLENIYSEPEGQECGPSINPLPKPRRTFRYLSE---SGVTPYKERNCDKKYCENNSC
190 200 210 220 230 240
310 320 330 340 350
pF1KSD PPPPLPSS--PPPSSVNRRLWTGRQKSSADHRKSYEFEDLLQ---SSSESSRVDWYAQTK
: :: : :.. . .. ::.: :::.::::. . .:.. : . ..
CCDS58 AQSSLASSQEPEPKKYGGKI-RGRSK-----RKSFEFEDIQHFRNRNSQTIREELGRNSG
250 260 270 280 290
360 370 380 390 400 410
pF1KSD LGLTRTLSEENVYEDILDPPMKENPYEDIELHGRCLGKK-CVLNFPASPTSSIPDTLTKQ
.: : ::.:.::::. : :::::::: .. . .. . ..: . .. :
CCDS58 SALYYTQSEDNIYEDIIYPT-KENPYEDIPVQPLPMWRSPSAWKLPPAKSAFKAPKLPP-
300 310 320 330 340 350
420 430 440 450 460 470
pF1KSD SLSKPAFF-RQNSERRNFKLLDTRKLSRDGTGSPSKISPPSTPSSPDDIFFNLGDPQNGR
:: :. :.. : .: . ::..: : : .. . .: :. :
CCDS58 ---KPQFLHRKTMEVKNSQAYLRSKLTKD-TTLPVTLTEWK--------LFRAGEVAN-T
360 370 380 390 400
480 490 500 510 520 530
pF1KSD KKRKIPKLVLRINAIYEVRRGKKRVKRLSQSMESNSGK----VTDENSESDSDTEEKLKA
:....:.:::.:. :.: .::::.:: ..: .:: . :.: ..::.: :
CCDS58 KRKNLPRLVLKIDDIFESKRGKKKVK-----LHSYTGKELPPTKGETSGNESDAEYLPKN
410 420 430 440 450
540 550 560 570 580 590
pF1KSD HSQRLVNVKSRLKQAPRYPSLARELIEYQERQLFEYFVVVSLHKKQAGAAYVPELTQQFP
. .::.... :. :.: .: :.::: ::.:::: ::::::.:: .: .:.:.. ::::
CCDS58 RHKRLAQLQPSSKRNPHYQTLERDLIELQEQQLFELFVVVSLQKKPSGISYIPQVIQQFP
460 470 480 490 500 510
600 610 620 630 640 650
pF1KSD LKLERSFKFMREAEDQLKAIPQFCFPDAKDWVPVQQFTSETFSFVLTGEDGSRRFGYCRR
: ....: .. :..::.::.:::::.:::.:.... ::::::::::::::: ::::..
CCDS58 GKDDHGYKQSKDMEERLKVIPKFCFPDSKDWMPTSELKSETFSFVLTGEDGSRWFGYCKK
520 530 540 550 560 570
660 670 680 690 700 710
pF1KSD LLPGGKGKRLPEVYCIVSRLGCFSLFSRILDEVEKRRGISPALVQPLMRSVMEAPFPALG
::: :::::::::::.:::::::.:::.::::::::: .::::: :.::::::::::: :
CCDS58 LLPVGKGKRLPEVYCMVSRLGCFNLFSKILDEVEKRREMSPALVYPFMRSVMEAPFPAPG
580 590 600 610 620 630
720 730 740 750 760 770
pF1KSD KTILVKNFLPGSGTEVIELCRPLDSRLEHVDFESLFSSLSVRHLVCVFASLLLERRVIFI
.:: ::..:::.: : ::::::::::::::::. ::. ::: ::. : :::::::::::.
CCDS58 RTITVKSYLPGAGDESIELCRPLDSRLEHVDFKCLFKCLSVCHLIRVCASLLLERRVIFV
640 650 660 670 680 690
780 790 800 810 820 830
pF1KSD ADKLSILSKCCHAMVALIYPFAWQHTYIPVLPPAMVDIVCSPTPFLIGLLSSSLPLLREL
:..:: :::: ::.:: .:::.:::::::::: .:.::::::::::::.:: ::: :..:
CCDS58 ANSLSTLSKCGHAVVATLYPFTWQHTYIPVLPASMIDIVCSPTPFLIGILSCSLPQLQDL
700 710 720 730 740 750
840 850 860 870 880 890
pF1KSD PLEEVLVVDLVNSRFLRQMDDEDSILPRKLQVVLEHILEQRNELACEQDEGPLDGRHGPE
:.::::.::: ..::....::: ::: :::..: .:::.:::. .... :
CCDS58 PIEEVLIVDLCADKFLQEVSDEDEILPPKLQAALMQILEERNEILTQEQNFSQD------
760 770 780 790 800 810
900 910 920 930 940 950
pF1KSD SSPLNEVVSEAFVRFFVEIVGHYSLFLTSGEREERTLQREAFRKAVSSKSLRHFLEVFME
:: .:::::::::::.:::::: .: :: ::..::: :::. .:.:.::::..:::
CCDS58 -VTLNSLVSEAFVRFFVELVGHYSLNMTVTERGERVFQREPFRKSHTSRSVRHFLDLFME
820 830 840 850 860 870
960 970 980 990 1000
pF1KSD TQMFRGFIQERELRRQDAKGLFEVRAQEYLETLPSGEHSGVNKFLKGLGNKMKFLHKK
:::: ::::.::::.. .:::::.:: .::::.: .: ::.:..:..::.:::::.::
CCDS58 TQMFAGFIQDRELRKSGVKGLFEIRAIQYLETIPESEPSGMNRILRSLGSKMKFLQKK
880 890 900 910 920
>>CCDS875.1 DENND2C gene_id:163259|Hs108|chr1 (871 aa)
initn: 2477 init1: 1629 opt: 2199 Z-score: 1559.7 bits: 299.9 E(32554): 1.5e-80
Smith-Waterman score: 2389; 45.2% identity (66.5% similar) in 986 aa overlap (40-1009:15-871)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD ISDPAAEASRAGKKQLRGVQNPCPSARARPRHKSLNIKDKISEWEGKKE-VPTPAPSRRA
: . :::.:::.:::. . . .:
CCDS87 MDVGFSRTTVQTLSRSHCKNIKQKISQWEGRANGISNP------
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KSD DGQEDYLPSSTVERRSSDGVRTQVTEAKNGMRPGTESTEKERNKGAVNVGGQDPEPGQDL
: . :.. : . . .. :: . ::.. ..: ... . : :.
CCDS87 ---EKWCPKDFGVRYN---CHQEIRLKKNPI--------AERKSKNLDVTSRE-NVGLDI
40 50 60 70 80
130 140 150 160 170 180
pF1KSD SQPEREVDPSWGRGREPRLGKLRF-QNDHLS--VLKQVKKLEQALKDGSAGLDPQL---P
.. . : : ..... . .: .:. : : ..::..:. .: :::. :
CCDS87 NENTKSHDQSENENKKHEYDDTHFFKNESESNWVCSRVKEIESCKED---VLDPETSLPP
90 100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KSD GTCYSPHCPPDKAEAGSTLPENLGGGSGSEVSQRVHPSDLEGREPTPELVEDRKGSCRRP
:. :. . : :: :: . . .. .. : .: . ..... :
CCDS87 GNFYTSQILWKKIEA---LPPD------KLLNLALEHCDSSEKELNFRVLDSSYG-----
150 160 170 180
250 260 270 280 290 300
pF1KSD WDRSLENVYRGSEGSPTKPFINPLPKPRRTFKHAGEGDKDGKPGIGFRKEKRNLPPLPSL
.::::.: ::. : :::::::::::.. .: .: :. .. :
CCDS87 ITKSLENIYSEPEGQECGPSINPLPKPRRTFRYLSE---SGVTPYKERNCDKKYCENNSC
190 200 210 220 230 240
310 320 330 340 350
pF1KSD PPPPLPSS--PPPSSVNRRLWTGRQKSSADHRKSYEFEDLLQ---SSSESSRVDWYAQTK
: :: : :.. . .. ::.: :::.::::. . .:.. : . ..
CCDS87 AQSSLASSQEPEPKKYGGKI-RGRSK-----RKSFEFEDIQHFRNRNSQTIREELGRNSG
250 260 270 280 290
360 370 380 390 400 410
pF1KSD LGLTRTLSEENVYEDILDPPMKENPYEDIELHGRCLGKKCVLNFPASPTSSIPDTLTKQS
.: : ::.:.::::. : :::::::: :..: .:
CCDS87 SALYYTQSEDNIYEDIIYPT-KENPYEDI---------------PVQP---LP-------
300 310 320 330
420 430 440 450 460 470
pF1KSD LSKPAFFRQNSERRNFKLLDTRKLSRDGTGSPSKISPPSTPSSPDDIFFNLGDPQNGRKK
..: ::: . : . :. :
CCDS87 -----MWR----------------------SPSAWKLPPAKSA----F------------
340
480 490 500 510 520 530
pF1KSD RKIPKLVLRINAIYEVRRGKKRVKRLSQSMESNSGK----VTDENSESDSDTEEKLKAHS
: :::::.:. :.: .::::.:: ..: .:: . :.: ..::.: : .
CCDS87 -KAPKLVLKIDDIFESKRGKKKVK-----LHSYTGKELPPTKGETSGNESDAEYLPKNRH
350 360 370 380 390 400
540 550 560 570 580 590
pF1KSD QRLVNVKSRLKQAPRYPSLARELIEYQERQLFEYFVVVSLHKKQAGAAYVPELTQQFPLK
.::.... :. :.: .: :.::: ::.:::: ::::::.:: .: .:.:.. :::: :
CCDS87 KRLAQLQPSSKRNPHYQTLERDLIELQEQQLFELFVVVSLQKKPSGISYIPQVIQQFPGK
410 420 430 440 450 460
600 610 620 630 640 650
pF1KSD LERSFKFMREAEDQLKAIPQFCFPDAKDWVPVQQFTSETFSFVLTGEDGSRRFGYCRRLL
....: .. :..::.::.:::::.:::.:.... ::::::::::::::: ::::..::
CCDS87 DDHGYKQSKDMEERLKVIPKFCFPDSKDWMPTSELKSETFSFVLTGEDGSRWFGYCKKLL
470 480 490 500 510 520
660 670 680 690 700 710
pF1KSD PGGKGKRLPEVYCIVSRLGCFSLFSRILDEVEKRRGISPALVQPLMRSVMEAPFPALGKT
: :::::::::::.:::::::.:::.::::::::: .::::: :.::::::::::: :.:
CCDS87 PVGKGKRLPEVYCMVSRLGCFNLFSKILDEVEKRREMSPALVYPFMRSVMEAPFPAPGRT
530 540 550 560 570 580
720 730 740 750 760 770
pF1KSD ILVKNFLPGSGTEVIELCRPLDSRLEHVDFESLFSSLSVRHLVCVFASLLLERRVIFIAD
: ::..:::.: : ::::::::::::::::. ::. ::: ::. : :::::::::::.:.
CCDS87 ITVKSYLPGAGDESIELCRPLDSRLEHVDFKCLFKCLSVCHLIRVCASLLLERRVIFVAN
590 600 610 620 630 640
780 790 800 810 820 830
pF1KSD KLSILSKCCHAMVALIYPFAWQHTYIPVLPPAMVDIVCSPTPFLIGLLSSSLPLLRELPL
.:: :::: ::.:: .:::.:::::::::: .:.::::::::::::.:: ::: :..::.
CCDS87 SLSTLSKCGHAVVATLYPFTWQHTYIPVLPASMIDIVCSPTPFLIGILSCSLPQLQDLPI
650 660 670 680 690 700
840 850 860 870 880 890
pF1KSD EEVLVVDLVNSRFLRQMDDEDSILPRKLQVVLEHILEQRNELACEQDEGPLDGRHGPESS
::::.::: ..::....::: ::: :::..: .:::.:::. .... :
CCDS87 EEVLIVDLCADKFLQEVSDEDEILPPKLQAALMQILEERNEILTQEQNFSQD-------V
710 720 730 740 750
900 910 920 930 940 950
pF1KSD PLNEVVSEAFVRFFVEIVGHYSLFLTSGEREERTLQREAFRKAVSSKSLRHFLEVFMETQ
:: .:::::::::::.:::::: .: :: ::..::: :::. .:.:.::::..:::::
CCDS87 TLNSLVSEAFVRFFVELVGHYSLNMTVTERGERVFQREPFRKSHTSRSVRHFLDLFMETQ
760 770 780 790 800 810
960 970 980 990 1000
pF1KSD MFRGFIQERELRRQDAKGLFEVRAQEYLETLPSGEHSGVNKFLKGLGNKMKFLHKK
:: ::::.::::.. .:::::.:: .::::.: .: ::.:..:..::.:::::.::
CCDS87 MFAGFIQDRELRKSGVKGLFEIRAIQYLETIPESEPSGMNRILRSLGSKMKFLQKK
820 830 840 850 860 870
>>CCDS60219.1 DENND2D gene_id:79961|Hs108|chr1 (468 aa)
initn: 1302 init1: 1103 opt: 1127 Z-score: 808.0 bits: 159.9 E(32554): 1.1e-38
Smith-Waterman score: 1292; 48.2% identity (73.0% similar) in 423 aa overlap (562-982:48-455)
540 550 560 570 580 590
pF1KSD HSQRLVNVKSRLKQAPRYPSLARELIEYQERQLFEYFVVVSLHKKQAGAAYVPELTQQFP
...:::..::::.::.. : : .: :::
CCDS60 HGGPPQDNSGEALKEPERAQEHSLPNFAGGQHFFEYLLVVSLKKKRSEDDYEPIITYQFP
20 30 40 50 60 70
600 610 620 630 640 650
pF1KSD LKLERSFKFMREAEDQL-KAIPQFCFPDAKDWVPVQQFTSETFSFVLTGEDGSRRFGYCR
: : .. ..: :..: :::: :::::...:. . .. ::::::::. ::::..::::
CCDS60 -KRENLLRGQQEEEERLLKAIPLFCFPDGNEWASLTEYPRETFSFVLTNVDGSRKIGYCR
80 90 100 110 120 130
660 670 680 690 700 710
pF1KSD RLLPGGKGKRLPEVYCIVSRLGCFSLFSRILDEVEKRRGISPALVQPLMRSVMEAPFPAL
::::.: : :::.::::.: .:::.:::.::::::::. :: :.. :.:... :: :::
CCDS60 RLLPAGPGPRLPKVYCIISCIGCFGLFSKILDEVEKRHQISMAVIYPFMQGLREAAFPAP
140 150 160 170 180 190
720 730 740 750 760 770
pF1KSD GKTILVKNFLPGSGTEVIELCRPLDSRLEHVDFESLFSSLSVRHLVCVFASLLLERRVIF
:::. .:.:.: :::: : : :::::.:::::: ::. :: .... .::: .:::..::
CCDS60 GKTVTLKSFIPDSGTEFISLTRPLDSHLEHVDFSSLLHCLSFEQILQIFASAVLERKIIF
200 210 220 230 240 250
780 790 800 810 820 830
pF1KSD IADKLSILSKCCHAMVALIYPFAWQHTYIPVLPPAMVDIVCSPTPFLIGLLSSSLPLLRE
.:. :: ::.: :: .::.:::.: ::::::.: ... :: ::::..:. . .
CCDS60 LAEGLSTLSQCIHAAAALLYPFSWAHTYIPVVPESLLATVCCPTPFMVGVQMRFQQEVMD
260 270 280 290 300 310
840 850 860 870 880
pF1KSD LPLEEVLVVDLVNSRFLRQMDDEDSILPRKLQV-VLEHILEQRNELACEQDEGPLDGRHG
:.::::.:.: .. :: .. :: .::: ::: .:. . . ::: ..
CCDS60 SPMEEVLLVNLCEGTFLMSVGDEKDILPPKLQDDILDSLGQGINELKTAEQ---------
320 330 340 350 360
890 900 910 920 930 940
pF1KSD PESSPLNEVVSEAFVRFFVEIVGHYSLFLTSGEREERTLQREAFRKAVSSKSLRHFLEVF
.:: :: ::.:::.:::::. .. . .:...: ::..::. :.:.. :
CCDS60 -----INEHVSGPFVQFFVKIVGHYASYIKREANGQGHFQERSFCKALTSKTNRRFVKKF
370 380 390 400 410 420
950 960 970 980 990 1000
pF1KSD METQMFRGFIQERELRRQDAKGLFEVRAQEYLETLPSGEHSGVNKFLKGLGNKMKFLHKK
..::.: :::: : .. : :. . :: :
CCDS60 VKTQLFSLFIQEAEKSKNPPAGYFQQKILEYEEQKKQKKPREKTVK
430 440 450 460
>>CCDS831.1 DENND2D gene_id:79961|Hs108|chr1 (471 aa)
initn: 1302 init1: 1103 opt: 1127 Z-score: 808.0 bits: 159.9 E(32554): 1.1e-38
Smith-Waterman score: 1292; 48.2% identity (73.0% similar) in 423 aa overlap (562-982:51-458)
540 550 560 570 580 590
pF1KSD HSQRLVNVKSRLKQAPRYPSLARELIEYQERQLFEYFVVVSLHKKQAGAAYVPELTQQFP
...:::..::::.::.. : : .: :::
CCDS83 RAGPPQDNSGEALKEPERAQEHSLPNFAGGQHFFEYLLVVSLKKKRSEDDYEPIITYQFP
30 40 50 60 70 80
600 610 620 630 640 650
pF1KSD LKLERSFKFMREAEDQL-KAIPQFCFPDAKDWVPVQQFTSETFSFVLTGEDGSRRFGYCR
: : .. ..: :..: :::: :::::...:. . .. ::::::::. ::::..::::
CCDS83 -KRENLLRGQQEEEERLLKAIPLFCFPDGNEWASLTEYPRETFSFVLTNVDGSRKIGYCR
90 100 110 120 130
660 670 680 690 700 710
pF1KSD RLLPGGKGKRLPEVYCIVSRLGCFSLFSRILDEVEKRRGISPALVQPLMRSVMEAPFPAL
::::.: : :::.::::.: .:::.:::.::::::::. :: :.. :.:... :: :::
CCDS83 RLLPAGPGPRLPKVYCIISCIGCFGLFSKILDEVEKRHQISMAVIYPFMQGLREAAFPAP
140 150 160 170 180 190
720 730 740 750 760 770
pF1KSD GKTILVKNFLPGSGTEVIELCRPLDSRLEHVDFESLFSSLSVRHLVCVFASLLLERRVIF
:::. .:.:.: :::: : : :::::.:::::: ::. :: .... .::: .:::..::
CCDS83 GKTVTLKSFIPDSGTEFISLTRPLDSHLEHVDFSSLLHCLSFEQILQIFASAVLERKIIF
200 210 220 230 240 250
780 790 800 810 820 830
pF1KSD IADKLSILSKCCHAMVALIYPFAWQHTYIPVLPPAMVDIVCSPTPFLIGLLSSSLPLLRE
.:. :: ::.: :: .::.:::.: ::::::.: ... :: ::::..:. . .
CCDS83 LAEGLSTLSQCIHAAAALLYPFSWAHTYIPVVPESLLATVCCPTPFMVGVQMRFQQEVMD
260 270 280 290 300 310
840 850 860 870 880
pF1KSD LPLEEVLVVDLVNSRFLRQMDDEDSILPRKLQV-VLEHILEQRNELACEQDEGPLDGRHG
:.::::.:.: .. :: .. :: .::: ::: .:. . . ::: ..
CCDS83 SPMEEVLLVNLCEGTFLMSVGDEKDILPPKLQDDILDSLGQGINELKTAEQ---------
320 330 340 350 360 370
890 900 910 920 930 940
pF1KSD PESSPLNEVVSEAFVRFFVEIVGHYSLFLTSGEREERTLQREAFRKAVSSKSLRHFLEVF
.:: :: ::.:::.:::::. .. . .:...: ::..::. :.:.. :
CCDS83 -----INEHVSGPFVQFFVKIVGHYASYIKREANGQGHFQERSFCKALTSKTNRRFVKKF
380 390 400 410 420
950 960 970 980 990 1000
pF1KSD METQMFRGFIQERELRRQDAKGLFEVRAQEYLETLPSGEHSGVNKFLKGLGNKMKFLHKK
..::.: :::: : .. : :. . :: :
CCDS83 VKTQLFSLFIQEAEKSKNPPAGYFQQKILEYEEQKKQKKPREKTVK
430 440 450 460 470
1009 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 05:43:27 2016 done: Thu Nov 3 05:43:28 2016
Total Scan time: 5.490 Total Display time: 0.270
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]