Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA1260
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1260, 816 aa
1>>>pF1KSDA1260 816 - 816 aa - 816 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0531+/-0.000894; mu= 17.4453+/- 0.054
mean_var=83.6086+/-16.456, 0's: 0 Z-trim(106.5): 45 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.140265
statistics sampled from 9003 (9044) to 9003 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.636), E-opt: 0.2 (0.278), width: 16
Scan time: 3.500
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14126.1 NLGN4X gene_id:57502|Hs108|chrX ( 816) 5575 1138.4 0
CCDS14788.1 NLGN4Y gene_id:22829|Hs108|chrY ( 816) 5457 1114.6 0
CCDS56619.1 NLGN4Y gene_id:22829|Hs108|chrY ( 648) 4376 895.8 0
CCDS55442.1 NLGN3 gene_id:54413|Hs108|chrX ( 808) 4138 847.6 0
CCDS14407.1 NLGN3 gene_id:54413|Hs108|chrX ( 828) 3538 726.2 5.3e-209
CCDS55441.1 NLGN3 gene_id:54413|Hs108|chrX ( 848) 3538 726.2 5.4e-209
CCDS11103.1 NLGN2 gene_id:57555|Hs108|chr17 ( 835) 2751 567.0 4.7e-161
CCDS3222.1 NLGN1 gene_id:22871|Hs108|chr3 ( 823) 2134 442.1 1.8e-123
CCDS55553.1 NLGN4Y gene_id:22829|Hs108|chrY ( 256) 1017 215.8 7.3e-56
CCDS3198.1 BCHE gene_id:590|Hs108|chr3 ( 602) 942 200.8 5.6e-51
CCDS43896.1 CEL gene_id:1056|Hs108|chr9 ( 756) 912 194.8 4.5e-49
CCDS54022.1 CES3 gene_id:23491|Hs108|chr16 ( 568) 838 179.8 1.1e-44
CCDS10826.1 CES3 gene_id:23491|Hs108|chr16 ( 571) 830 178.2 3.5e-44
CCDS10825.1 CES2 gene_id:8824|Hs108|chr16 ( 623) 785 169.1 2.1e-41
CCDS45507.1 CES2 gene_id:8824|Hs108|chr16 ( 607) 735 159.0 2.3e-38
CCDS45490.1 CES5A gene_id:221223|Hs108|chr16 ( 575) 719 155.7 2.1e-37
CCDS54012.1 CES5A gene_id:221223|Hs108|chr16 ( 604) 719 155.7 2.1e-37
CCDS45488.1 CES1 gene_id:1066|Hs108|chr16 ( 567) 654 142.5 1.8e-33
CCDS32450.1 CES1 gene_id:1066|Hs108|chr16 ( 568) 654 142.5 1.9e-33
CCDS45489.1 CES1 gene_id:1066|Hs108|chr16 ( 566) 643 140.3 8.6e-33
CCDS10755.1 CES5A gene_id:221223|Hs108|chr16 ( 525) 623 136.3 1.3e-31
CCDS5709.1 ACHE gene_id:43|Hs108|chr7 ( 614) 622 136.1 1.8e-31
CCDS5710.1 ACHE gene_id:43|Hs108|chr7 ( 617) 622 136.1 1.8e-31
CCDS34944.1 TG gene_id:7038|Hs108|chr8 (2768) 607 133.4 5.2e-30
CCDS54024.1 CES4A gene_id:283848|Hs108|chr16 ( 463) 577 126.9 7.6e-29
CCDS42174.3 CES4A gene_id:283848|Hs108|chr16 ( 468) 549 121.3 3.9e-27
CCDS54025.1 CES4A gene_id:283848|Hs108|chr16 ( 374) 525 116.4 9.4e-26
CCDS64736.1 ACHE gene_id:43|Hs108|chr7 ( 526) 484 108.1 3.9e-23
>>CCDS14126.1 NLGN4X gene_id:57502|Hs108|chrX (816 aa)
initn: 5575 init1: 5575 opt: 5575 Z-score: 6093.6 bits: 1138.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5575; 100.0% identity (100.0% similar) in 816 aa overlap (1-816:1-816)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSRPQGLLWLPLLFTPVCVMLNSNVLLWLTALAIKFTLIDSQAQYPVVNTNYGKIRGLRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MSRPQGLLWLPLLFTPVCVMLNSNVLLWLTALAIKFTLIDSQAQYPVVNTNYGKIRGLRT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD PLPNEILGPVEQYLGVPYASPPTGERRFQPPEPPSSWTGIRNTTQFAAVCPQHLDERSLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PLPNEILGPVEQYLGVPYASPPTGERRFQPPEPPSSWTGIRNTTQFAAVCPQHLDERSLL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD HDMLPIWFTANLDTLMTYVQDQNEDCLYLNIYVPTEDDIHDQNSKKPVMVYIHGGSYMEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 HDMLPIWFTANLDTLMTYVQDQNEDCLYLNIYVPTEDDIHDQNSKKPVMVYIHGGSYMEG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD TGNMIDGSILASYGNVIVITINYRLGILGFLSTGDQAAKGNYGLLDQIQALRWIEENVGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TGNMIDGSILASYGNVIVITINYRLGILGFLSTGDQAAKGNYGLLDQIQALRWIEENVGA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD FGGDPKRVTIFGSGAGASCVSLLTLSHYSEGLFQKAIIQSGTALSSWAVNYQPAKYTRIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 FGGDPKRVTIFGSGAGASCVSLLTLSHYSEGLFQKAIIQSGTALSSWAVNYQPAKYTRIL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD ADKVGCNMLDTTDMVECLRNKNYKELIQQTITPATYHIAFGPVIDGDVIPDDPQILMEQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ADKVGCNMLDTTDMVECLRNKNYKELIQQTITPATYHIAFGPVIDGDVIPDDPQILMEQG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD EFLNYDIMLGVNQGEGLKFVDGIVDNEDGVTPNDFDFSVSNFVDNLYGYPEGKDTLRETI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EFLNYDIMLGVNQGEGLKFVDGIVDNEDGVTPNDFDFSVSNFVDNLYGYPEGKDTLRETI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD KFMYTDWADKENPETRRKTLVALFTDHQWVAPAVATADLHAQYGSPTYFYAFYHHCQSEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KFMYTDWADKENPETRRKTLVALFTDHQWVAPAVATADLHAQYGSPTYFYAFYHHCQSEM
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD KPSWADSAHGDEVPYVFGIPMIGPTELFSCNFSKNDVMLSAVVMTYWTNFAKTGDPNQPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KPSWADSAHGDEVPYVFGIPMIGPTELFSCNFSKNDVMLSAVVMTYWTNFAKTGDPNQPV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD PQDTKFIHTKPNRFEEVAWSKYNPKDQLYLHIGLKPRVRDHYRATKVAFWLELVPHLHNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PQDTKFIHTKPNRFEEVAWSKYNPKDQLYLHIGLKPRVRDHYRATKVAFWLELVPHLHNL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD NEIFQYVSTTTKVPPPDMTSFPYGTRRSPAKIWPTTKRPAITPANNPKHSKDPHKTGPED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NEIFQYVSTTTKVPPPDMTSFPYGTRRSPAKIWPTTKRPAITPANNPKHSKDPHKTGPED
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD TTVLIETKRDYSTELSVTIAVGASLLFLNILAFAALYYKKDKRRHETHRRPSPQRNTTND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TTVLIETKRDYSTELSVTIAVGASLLFLNILAFAALYYKKDKRRHETHRRPSPQRNTTND
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD IAHIQNEEIMSLQMKQLEHDHECESLQAHDTLRLTCPPDYTLTLRRSPDDIPLMTPNTIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 IAHIQNEEIMSLQMKQLEHDHECESLQAHDTLRLTCPPDYTLTLRRSPDDIPLMTPNTIT
730 740 750 760 770 780
790 800 810
pF1KSD MIPNTLTGMQPLHTFNTFSGGQNSTNLPHGHSTTRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MIPNTLTGMQPLHTFNTFSGGQNSTNLPHGHSTTRV
790 800 810
>>CCDS14788.1 NLGN4Y gene_id:22829|Hs108|chrY (816 aa)
initn: 5457 init1: 5457 opt: 5457 Z-score: 5964.5 bits: 1114.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5457; 97.7% identity (99.3% similar) in 816 aa overlap (1-816:1-816)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSRPQGLLWLPLLFTPVCVMLNSNVLLWLTALAIKFTLIDSQAQYPVVNTNYGKIRGLRT
: ::::::::::::: ::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS14 MLRPQGLLWLPLLFTSVCVMLNSNVLLWITALAIKFTLIDSQAQYPVVNTNYGKIQGLRT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD PLPNEILGPVEQYLGVPYASPPTGERRFQPPEPPSSWTGIRNTTQFAAVCPQHLDERSLL
:::.:::::::::::::::::::::::::::: :::::::::.:::.:::::::::: ::
CCDS14 PLPSEILGPVEQYLGVPYASPPTGERRFQPPESPSSWTGIRNATQFSAVCPQHLDERFLL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD HDMLPIWFTANLDTLMTYVQDQNEDCLYLNIYVPTEDDIHDQNSKKPVMVYIHGGSYMEG
:::::::::..::::::::::::::::::::::: :::::.:::::::::::::::::::
CCDS14 HDMLPIWFTTSLDTLMTYVQDQNEDCLYLNIYVPMEDDIHEQNSKKPVMVYIHGGSYMEG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD TGNMIDGSILASYGNVIVITINYRLGILGFLSTGDQAAKGNYGLLDQIQALRWIEENVGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TGNMIDGSILASYGNVIVITINYRLGILGFLSTGDQAAKGNYGLLDQIQALRWIEENVGA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD FGGDPKRVTIFGSGAGASCVSLLTLSHYSEGLFQKAIIQSGTALSSWAVNYQPAKYTRIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 FGGDPKRVTIFGSGAGASCVSLLTLSHYSEGLFQKAIIQSGTALSSWAVNYQPAKYTRIL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD ADKVGCNMLDTTDMVECLRNKNYKELIQQTITPATYHIAFGPVIDGDVIPDDPQILMEQG
::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ADKVGCNMLDTTDMVECLKNKNYKELIQQTITPATYHIAFGPVIDGDVIPDDPQILMEQG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD EFLNYDIMLGVNQGEGLKFVDGIVDNEDGVTPNDFDFSVSNFVDNLYGYPEGKDTLRETI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EFLNYDIMLGVNQGEGLKFVDGIVDNEDGVTPNDFDFSVSNFVDNLYGYPEGKDTLRETI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD KFMYTDWADKENPETRRKTLVALFTDHQWVAPAVATADLHAQYGSPTYFYAFYHHCQSEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KFMYTDWADKENPETRRKTLVALFTDHQWVAPAVATADLHAQYGSPTYFYAFYHHCQSEM
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD KPSWADSAHGDEVPYVFGIPMIGPTELFSCNFSKNDVMLSAVVMTYWTNFAKTGDPNQPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KPSWADSAHGDEVPYVFGIPMIGPTELFSCNFSKNDVMLSAVVMTYWTNFAKTGDPNQPV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD PQDTKFIHTKPNRFEEVAWSKYNPKDQLYLHIGLKPRVRDHYRATKVAFWLELVPHLHNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PQDTKFIHTKPNRFEEVAWSKYNPKDQLYLHIGLKPRVRDHYRATKVAFWLELVPHLHNL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD NEIFQYVSTTTKVPPPDMTSFPYGTRRSPAKIWPTTKRPAITPANNPKHSKDPHKTGPED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NEIFQYVSTTTKVPPPDMTSFPYGTRRSPAKIWPTTKRPAITPANNPKHSKDPHKTGPED
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD TTVLIETKRDYSTELSVTIAVGASLLFLNILAFAALYYKKDKRRHETHRRPSPQRNTTND
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::
CCDS14 TTVLIETKRDYSTELSVTIAVGASLLFLNILAFAALYYKKDKRRHETHRHPSPQRNTTND
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD IAHIQNEEIMSLQMKQLEHDHECESLQAHDTLRLTCPPDYTLTLRRSPDDIPLMTPNTIT
:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::
CCDS14 ITHIQNEEIMSLQMKQLEHDHECESLQAHDTLRLTCPPDYTLTLRRSPDDIPFMTPNTIT
730 740 750 760 770 780
790 800 810
pF1KSD MIPNTLTGMQPLHTFNTFSGGQNSTNLPHGHSTTRV
:::::: ::::::::.::::::::::::::::::::
CCDS14 MIPNTLMGMQPLHTFKTFSGGQNSTNLPHGHSTTRV
790 800 810
>>CCDS56619.1 NLGN4Y gene_id:22829|Hs108|chrY (648 aa)
initn: 4376 init1: 4376 opt: 4376 Z-score: 4783.8 bits: 895.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4376; 99.1% identity (99.8% similar) in 648 aa overlap (169-816:1-648)
140 150 160 170 180 190
pF1KSD VQDQNEDCLYLNIYVPTEDDIHDQNSKKPVMVYIHGGSYMEGTGNMIDGSILASYGNVIV
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 MVYIHGGSYMEGTGNMIDGSILASYGNVIV
10 20 30
200 210 220 230 240 250
pF1KSD ITINYRLGILGFLSTGDQAAKGNYGLLDQIQALRWIEENVGAFGGDPKRVTIFGSGAGAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 ITINYRLGILGFLSTGDQAAKGNYGLLDQIQALRWIEENVGAFGGDPKRVTIFGSGAGAS
40 50 60 70 80 90
260 270 280 290 300 310
pF1KSD CVSLLTLSHYSEGLFQKAIIQSGTALSSWAVNYQPAKYTRILADKVGCNMLDTTDMVECL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 CVSLLTLSHYSEGLFQKAIIQSGTALSSWAVNYQPAKYTRILADKVGCNMLDTTDMVECL
100 110 120 130 140 150
320 330 340 350 360 370
pF1KSD RNKNYKELIQQTITPATYHIAFGPVIDGDVIPDDPQILMEQGEFLNYDIMLGVNQGEGLK
.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 KNKNYKELIQQTITPATYHIAFGPVIDGDVIPDDPQILMEQGEFLNYDIMLGVNQGEGLK
160 170 180 190 200 210
380 390 400 410 420 430
pF1KSD FVDGIVDNEDGVTPNDFDFSVSNFVDNLYGYPEGKDTLRETIKFMYTDWADKENPETRRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 FVDGIVDNEDGVTPNDFDFSVSNFVDNLYGYPEGKDTLRETIKFMYTDWADKENPETRRK
220 230 240 250 260 270
440 450 460 470 480 490
pF1KSD TLVALFTDHQWVAPAVATADLHAQYGSPTYFYAFYHHCQSEMKPSWADSAHGDEVPYVFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 TLVALFTDHQWVAPAVATADLHAQYGSPTYFYAFYHHCQSEMKPSWADSAHGDEVPYVFG
280 290 300 310 320 330
500 510 520 530 540 550
pF1KSD IPMIGPTELFSCNFSKNDVMLSAVVMTYWTNFAKTGDPNQPVPQDTKFIHTKPNRFEEVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 IPMIGPTELFSCNFSKNDVMLSAVVMTYWTNFAKTGDPNQPVPQDTKFIHTKPNRFEEVA
340 350 360 370 380 390
560 570 580 590 600 610
pF1KSD WSKYNPKDQLYLHIGLKPRVRDHYRATKVAFWLELVPHLHNLNEIFQYVSTTTKVPPPDM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 WSKYNPKDQLYLHIGLKPRVRDHYRATKVAFWLELVPHLHNLNEIFQYVSTTTKVPPPDM
400 410 420 430 440 450
620 630 640 650 660 670
pF1KSD TSFPYGTRRSPAKIWPTTKRPAITPANNPKHSKDPHKTGPEDTTVLIETKRDYSTELSVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 TSFPYGTRRSPAKIWPTTKRPAITPANNPKHSKDPHKTGPEDTTVLIETKRDYSTELSVT
460 470 480 490 500 510
680 690 700 710 720 730
pF1KSD IAVGASLLFLNILAFAALYYKKDKRRHETHRRPSPQRNTTNDIAHIQNEEIMSLQMKQLE
:::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::.::::::::::::::::
CCDS56 IAVGASLLFLNILAFAALYYKKDKRRHETHRHPSPQRNTTNDITHIQNEEIMSLQMKQLE
520 530 540 550 560 570
740 750 760 770 780 790
pF1KSD HDHECESLQAHDTLRLTCPPDYTLTLRRSPDDIPLMTPNTITMIPNTLTGMQPLHTFNTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::: ::::::::.::
CCDS56 HDHECESLQAHDTLRLTCPPDYTLTLRRSPDDIPFMTPNTITMIPNTLMGMQPLHTFKTF
580 590 600 610 620 630
800 810
pF1KSD SGGQNSTNLPHGHSTTRV
::::::::::::::::::
CCDS56 SGGQNSTNLPHGHSTTRV
640
>>CCDS55442.1 NLGN3 gene_id:54413|Hs108|chrX (808 aa)
initn: 3589 init1: 2821 opt: 4138 Z-score: 4522.1 bits: 847.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4138; 75.1% identity (90.1% similar) in 791 aa overlap (27-816:26-808)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSRPQGLLWLPLLFTPVCVMLNSNVLLWLTALAIKFTLIDSQAQYPVVNTNYGKIRGLRT
::. .::.. ..:: :.:::..::.:: :.
CCDS55 MWLRLGPPSLSLSPKPTVGRSLCLTLWFLSLALR---ASTQAPAPTVNTHFGKLRGARV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD PLPNEILGPVEQYLGVPYASPPTGERRFQPPEPPSSWTGIRNTTQFAAVCPQHLDERSLL
:::.::::::.::::::::.:: ::.:: ::::: ::.::::.:.: ::::.. . ..
CCDS55 PLPSEILGPVDQYLGVPYAAPPIGEKRFLPPEPPPSWSGIRNATHFPPVCPQNI-HTAVP
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KSD HDMLPIWFTANLDTLMTYVQDQNEDCLYLNIYVPTEDDIHDQNSKKPVMVYIHGGSYMEG
. :::.::::::: . ::.:. ::::::::.::::::::.:...: ::::::::::::::
CCDS55 EVMLPVWFTANLDIVATYIQEPNEDCLYLNVYVPTEDDIRDSGAK-PVMVYIHGGSYMEG
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KSD TGNMIDGSILASYGNVIVITINYRLGILGFLSTGDQAAKGNYGLLDQIQALRWIEENVGA
::::::::::::::::::::.:::.:.::::::::::::::::::::::::::. ::..
CCDS55 TGNMIDGSILASYGNVIVITLNYRVGVLGFLSTGDQAAKGNYGLLDQIQALRWVSENIAF
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KSD FGGDPKRVTIFGSGAGASCVSLLTLSHYSEGLFQKAIIQSGTALSSWAVNYQPAKYTRIL
:::::.:.:.:::: ::::::::::::.::::::.::::::.:::::::::::.::: .:
CCDS55 FGGDPRRITVFGSGIGASCVSLLTLSHHSEGLFQRAIIQSGSALSSWAVNYQPVKYTSLL
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KSD ADKVGCNMLDTTDMVECLRNKNYKELIQQTITPATYHIAFGPVIDGDVIPDDPQILMEQG
:::::::.:::.:::.:::.:. :::..: : :: ::.:::::::::::::::.::::::
CCDS55 ADKVGCNVLDTVDMVDCLRQKSAKELVEQDIQPARYHVAFGPVIDGDVIPDDPEILMEQG
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KSD EFLNYDIMLGVNQGEGLKFVDGIVDNEDGVTPNDFDFSVSNFVDNLYGYPEGKDTLRETI
::::::::::::::::::::.:.:: ::::. .:::.:::::::::::::::::::::::
CCDS55 EFLNYDIMLGVNQGEGLKFVEGVVDPEDGVSGTDFDYSVSNFVDNLYGYPEGKDTLRETI
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KSD KFMYTDWADKENPETRRKTLVALFTDHQWVAPAVATADLHAQYGSPTYFYAFYHHCQSEM
:::::::::..::::::::::::::::::: :.:.::::::.:::::::::::::::: :
CCDS55 KFMYTDWADRDNPETRRKTLVALFTDHQWVEPSVVTADLHARYGSPTYFYAFYHHCQSLM
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KSD KPSWADSAHGDEVPYVFGIPMIGPTELFSCNFSKNDVMLSAVVMTYWTNFAKTGDPNQPV
::.:.:.:::::::::::.::.:::.:: ::::::::::::::::::::::::::::.::
CCDS55 KPAWSDAAHGDEVPYVFGVPMVGPTDLFPCNFSKNDVMLSAVVMTYWTNFAKTGDPNKPV
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KSD PQDTKFIHTKPNRFEEVAWSKYNPKDQLYLHIGLKPRVRDHYRATKVAFWLELVPHLHNL
:::::::::: :::::::::::::.::::::::::::::::::::::::: .:::::.::
CCDS55 PQDTKFIHTKANRFEEVAWSKYNPRDQLYLHIGLKPRVRDHYRATKVAFWKHLVPHLYNL
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KSD NEIFQYVSTTTKVPPPDMTSFPYGTRRSPAKIWPTTKRPAITPANNPKHSKDPHKTGPED
...:.:.:::::::::: : . ::: .: : .::::::.:: . .... . .
CCDS55 HDMFHYTSTTTKVPPPDTTHSSHITRRPNGKTW-STKRPAISPAYSNENAQGSWNGDQDA
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710
pF1KSD TTVLIETKRDYSTELSVTIAVGASLLFLNILAFAALYYKKDKRRHETHRRPSPQRNT-TN
.:.:. :::::::::::::::::::::.::::::::.:::::.: :.:::::.. .
CCDS55 GPLLVENPRDYSTELSVTIAVGASLLFLNVLAFAALYYRKDKRRQEPLRQPSPQRGAGAP
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KSD DIAHIQNEEIMSLQMKQLEHDHECESLQAHDTLRLTCPPDYTLTLRRSPDDIPLMTPNTI
... .::. .::. .: :::. ::::::: ::::::::::::::::::::::
CCDS55 ELGAAPEEELAALQLGPTHH--ECEAGPPHDTLRLTALPDYTLTLRRSPDDIPLMTPNTI
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810
pF1KSD TMIPNTLTGMQPLHTFNTFSGGQNSTNLPHGHSTTRV
:::::.:.:.: :: .:::..: :::.:::.::::::
CCDS55 TMIPNSLVGLQTLHPYNTFAAGFNSTGLPHSHSTTRV
780 790 800
>>CCDS14407.1 NLGN3 gene_id:54413|Hs108|chrX (828 aa)
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Smith-Waterman score: 4088; 73.2% identity (87.9% similar) in 811 aa overlap (27-816:26-828)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSRPQGLLWLPLLFTPVCVMLNSNVLLWLTALAIKFTLIDSQAQYPVVNTNYGKIRGLRT
::. .::.. ..:: :.:::..::.:: :.
CCDS14 MWLRLGPPSLSLSPKPTVGRSLCLTLWFLSLALR---ASTQAPAPTVNTHFGKLRGARV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD PLPNEILGPVEQYLGVPYASPPTGERRFQPPEPPSSWTGIRNTTQFAAVCPQHLDERSLL
:::.::::::.::::::::.:: ::.:: ::::: ::.::::.:.: ::::.. . ..
CCDS14 PLPSEILGPVDQYLGVPYAAPPIGEKRFLPPEPPPSWSGIRNATHFPPVCPQNI-HTAVP
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160
pF1KSD HDMLPIWFTANLDTLMTYVQDQNEDCLYLNIYVPTED--------------------DIH
. :::.::::::: . ::.:. ::::::::.:::::: ::.
CCDS14 EVMLPVWFTANLDIVATYIQEPNEDCLYLNVYVPTEDGSGAKKQGEDLADNDGDEDEDIR
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KSD DQNSKKPVMVYIHGGSYMEGTGNMIDGSILASYGNVIVITINYRLGILGFLSTGDQAAKG
:...: ::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:.:::::::::::::
CCDS14 DSGAK-PVMVYIHGGSYMEGTGNMIDGSILASYGNVIVITLNYRVGVLGFLSTGDQAAKG
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KSD NYGLLDQIQALRWIEENVGAFGGDPKRVTIFGSGAGASCVSLLTLSHYSEGLFQKAIIQS
:::::::::::::. ::.. :::::.:.:.:::: ::::::::::::.::::::.:::::
CCDS14 NYGLLDQIQALRWVSENIAFFGGDPRRITVFGSGIGASCVSLLTLSHHSEGLFQRAIIQS
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KSD GTALSSWAVNYQPAKYTRILADKVGCNMLDTTDMVECLRNKNYKELIQQTITPATYHIAF
:.:::::::::::.::: .::::::::.:::.:::.:::.:. :::..: : :: ::.::
CCDS14 GSALSSWAVNYQPVKYTSLLADKVGCNVLDTVDMVDCLRQKSAKELVEQDIQPARYHVAF
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KSD GPVIDGDVIPDDPQILMEQGEFLNYDIMLGVNQGEGLKFVDGIVDNEDGVTPNDFDFSVS
:::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::.:.:: ::::. .:::.:::
CCDS14 GPVIDGDVIPDDPEILMEQGEFLNYDIMLGVNQGEGLKFVEGVVDPEDGVSGTDFDYSVS
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KSD NFVDNLYGYPEGKDTLRETIKFMYTDWADKENPETRRKTLVALFTDHQWVAPAVATADLH
:::::::::::::::::::::::::::::..::::::::::::::::::: :.:.:::::
CCDS14 NFVDNLYGYPEGKDTLRETIKFMYTDWADRDNPETRRKTLVALFTDHQWVEPSVVTADLH
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KSD AQYGSPTYFYAFYHHCQSEMKPSWADSAHGDEVPYVFGIPMIGPTELFSCNFSKNDVMLS
:.:::::::::::::::: :::.:.:.:::::::::::.::.:::.:: :::::::::::
CCDS14 ARYGSPTYFYAFYHHCQSLMKPAWSDAAHGDEVPYVFGVPMVGPTDLFPCNFSKNDVMLS
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KSD AVVMTYWTNFAKTGDPNQPVPQDTKFIHTKPNRFEEVAWSKYNPKDQLYLHIGLKPRVRD
:::::::::::::::::.:::::::::::: :::::::::::::.:::::::::::::::
CCDS14 AVVMTYWTNFAKTGDPNKPVPQDTKFIHTKANRFEEVAWSKYNPRDQLYLHIGLKPRVRD
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KSD HYRATKVAFWLELVPHLHNLNEIFQYVSTTTKVPPPDMTSFPYGTRRSPAKIWPTTKRPA
:::::::::: .:::::.::...:.:.:::::::::: : . ::: .: : .:::::
CCDS14 HYRATKVAFWKHLVPHLYNLHDMFHYTSTTTKVPPPDTTHSSHITRRPNGKTW-STKRPA
600 610 620 630 640 650
650 660 670 680 690 700
pF1KSD ITPANNPKHSKDPHKTGPEDTTVLIETKRDYSTELSVTIAVGASLLFLNILAFAALYYKK
:.:: . .... . . .:.:. :::::::::::::::::::::.::::::::.:
CCDS14 ISPAYSNENAQGSWNGDQDAGPLLVENPRDYSTELSVTIAVGASLLFLNVLAFAALYYRK
660 670 680 690 700 710
710 720 730 740 750
pF1KSD DKRRHETHRRPSPQRNT-TNDIAHIQNEEIMSLQMKQLEHDHECESLQAHDTLRLTCPPD
::::.: :.:::::.. . ... .::. .::. .: :::. ::::::: ::
CCDS14 DKRRQEPLRQPSPQRGAGAPELGAAPEEELAALQLGPTHH--ECEAGPPHDTLRLTALPD
720 730 740 750 760 770
760 770 780 790 800 810
pF1KSD YTLTLRRSPDDIPLMTPNTITMIPNTLTGMQPLHTFNTFSGGQNSTNLPHGHSTTRV
:::::::::::::::::::::::::.:.:.: :: .:::..: :::.:::.::::::
CCDS14 YTLTLRRSPDDIPLMTPNTITMIPNSLVGLQTLHPYNTFAAGFNSTGLPHSHSTTRV
780 790 800 810 820
>>CCDS55441.1 NLGN3 gene_id:54413|Hs108|chrX (848 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSRPQGLLWLPLLFTPVCVMLNSNVLLWLTALAIKFTLIDSQAQYPVVNTNYGKIRGLRT
::. .::.. ..:: :.:::..::.:: :.
CCDS55 MWLRLGPPSLSLSPKPTVGRSLCLTLWFLSLALR---ASTQAPAPTVNTHFGKLRGARV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD PLPNEILGPVEQYLGVPYASPPTGERRFQPPEPPSSWTGIRNTTQFAAVCPQHLDERSLL
:::.::::::.::::::::.:: ::.:: ::::: ::.::::.:.: ::::.. . ..
CCDS55 PLPSEILGPVDQYLGVPYAAPPIGEKRFLPPEPPPSWSGIRNATHFPPVCPQNI-HTAVP
60 70 80 90 100 110
130 140 150
pF1KSD HDMLPIWFTANLDTLMTYVQDQNEDCLYLNIYVPTED-----------------------
. :::.::::::: . ::.:. ::::::::.::::::
CCDS55 EVMLPVWFTANLDIVATYIQEPNEDCLYLNVYVPTEDVKRISKECARKPNKKICRKGGSG
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200
pF1KSD -----------------DIHDQNSKKPVMVYIHGGSYMEGTGNMIDGSILASYGNVIVIT
::.:...: ::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 AKKQGEDLADNDGDEDEDIRDSGAK-PVMVYIHGGSYMEGTGNMIDGSILASYGNVIVIT
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KSD INYRLGILGFLSTGDQAAKGNYGLLDQIQALRWIEENVGAFGGDPKRVTIFGSGAGASCV
.:::.:.::::::::::::::::::::::::::. ::.. :::::.:.:.:::: :::::
CCDS55 LNYRVGVLGFLSTGDQAAKGNYGLLDQIQALRWVSENIAFFGGDPRRITVFGSGIGASCV
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KSD SLLTLSHYSEGLFQKAIIQSGTALSSWAVNYQPAKYTRILADKVGCNMLDTTDMVECLRN
:::::::.::::::.::::::.:::::::::::.::: .::::::::.:::.:::.:::.
CCDS55 SLLTLSHHSEGLFQRAIIQSGSALSSWAVNYQPVKYTSLLADKVGCNVLDTVDMVDCLRQ
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KSD KNYKELIQQTITPATYHIAFGPVIDGDVIPDDPQILMEQGEFLNYDIMLGVNQGEGLKFV
:. :::..: : :: ::.:::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KSAKELVEQDIQPARYHVAFGPVIDGDVIPDDPEILMEQGEFLNYDIMLGVNQGEGLKFV
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430 440
pF1KSD DGIVDNEDGVTPNDFDFSVSNFVDNLYGYPEGKDTLRETIKFMYTDWADKENPETRRKTL
.:.:: ::::. .:::.::::::::::::::::::::::::::::::::..:::::::::
CCDS55 EGVVDPEDGVSGTDFDYSVSNFVDNLYGYPEGKDTLRETIKFMYTDWADRDNPETRRKTL
420 430 440 450 460 470
450 460 470 480 490 500
pF1KSD VALFTDHQWVAPAVATADLHAQYGSPTYFYAFYHHCQSEMKPSWADSAHGDEVPYVFGIP
:::::::::: :.:.::::::.:::::::::::::::: :::.:.:.:::::::::::.:
CCDS55 VALFTDHQWVEPSVVTADLHARYGSPTYFYAFYHHCQSLMKPAWSDAAHGDEVPYVFGVP
480 490 500 510 520 530
510 520 530 540 550 560
pF1KSD MIGPTELFSCNFSKNDVMLSAVVMTYWTNFAKTGDPNQPVPQDTKFIHTKPNRFEEVAWS
:.:::.:: ::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::: :::::::::
CCDS55 MVGPTDLFPCNFSKNDVMLSAVVMTYWTNFAKTGDPNKPVPQDTKFIHTKANRFEEVAWS
540 550 560 570 580 590
570 580 590 600 610 620
pF1KSD KYNPKDQLYLHIGLKPRVRDHYRATKVAFWLELVPHLHNLNEIFQYVSTTTKVPPPDMTS
::::.::::::::::::::::::::::::: .:::::.::...:.:.:::::::::: :
CCDS55 KYNPRDQLYLHIGLKPRVRDHYRATKVAFWKHLVPHLYNLHDMFHYTSTTTKVPPPDTTH
600 610 620 630 640 650
630 640 650 660 670 680
pF1KSD FPYGTRRSPAKIWPTTKRPAITPANNPKHSKDPHKTGPEDTTVLIETKRDYSTELSVTIA
. ::: .: : .::::::.:: . .... . . .:.:. ::::::::::::
CCDS55 SSHITRRPNGKTW-STKRPAISPAYSNENAQGSWNGDQDAGPLLVENPRDYSTELSVTIA
660 670 680 690 700 710
690 700 710 720 730
pF1KSD VGASLLFLNILAFAALYYKKDKRRHETHRRPSPQRNT-TNDIAHIQNEEIMSLQMKQLEH
:::::::::.::::::::.:::::.: :.:::::.. . ... .::. .::. .:
CCDS55 VGASLLFLNVLAFAALYYRKDKRRQEPLRQPSPQRGAGAPELGAAPEEELAALQLGPTHH
720 730 740 750 760 770
740 750 760 770 780 790
pF1KSD DHECESLQAHDTLRLTCPPDYTLTLRRSPDDIPLMTPNTITMIPNTLTGMQPLHTFNTFS
:::. ::::::: :::::::::::::::::::::::::::.:.:.: :: .:::.
CCDS55 --ECEAGPPHDTLRLTALPDYTLTLRRSPDDIPLMTPNTITMIPNSLVGLQTLHPYNTFA
780 790 800 810 820 830
800 810
pF1KSD GGQNSTNLPHGHSTTRV
.: :::.:::.::::::
CCDS55 AGFNSTGLPHSHSTTRV
840
>>CCDS11103.1 NLGN2 gene_id:57555|Hs108|chr17 (835 aa)
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Smith-Waterman score: 3458; 64.0% identity (80.8% similar) in 813 aa overlap (42-816:38-835)
20 30 40 50 60 70
pF1KSD LLFTPVCVMLNSNVLLWLTALAIKFTLIDSQAQYPVVNTNYGKIRGLRTPLPNEILGPVE
. ..::::: ::..::.: : :::::::
CCDS11 LVGLAGAQRGGGGPGGGAPGGPGLGLGSLGEERFPVVNTAYGRVRGVRRELNNEILGPVV
10 20 30 40 50 60
80 90 100 110 120 130
pF1KSD QYLGVPYASPPTGERRFQPPEPPSSWTGIRNTTQFAAVCPQHLDERSLLHDMLPIWFTAN
:.::::::.:: : ::::::: :.:: :.::.: . .:::.: . .: :::.::: :
CCDS11 QFLGVPYATPPLGARRFQPPEAPASWPGVRNATTLPPACPQNL-HGALPAIMLPVWFTDN
70 80 90 100 110 120
140 150 160 170
pF1KSD LDTLMTYVQDQNEDCLYLNIYVPTED-----------------DIHDQNSKKPVMVYIHG
:.. ::::.:.:::::::.:::::: ::.: . :::::...::
CCDS11 LEAAATYVQNQSEDCLYLNLYVPTEDGPLTKKRDEATLNPPDTDIRDPG-KKPVMLFLHG
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KSD GSYMEGTGNMIDGSILASYGNVIVITINYRLGILGFLSTGDQAAKGNYGLLDQIQALRWI
::::::::::.:::.::.:::::: :.:::::.::::::::::::::::::::::::::.
CCDS11 GSYMEGTGNMFDGSVLAAYGNVIVATLNYRLGVLGFLSTGDQAAKGNYGLLDQIQALRWL
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KSD EENVGAFGGDPKRVTIFGSGAGASCVSLLTLSHYSEGLFQKAIIQSGTALSSWAVNYQPA
::.. :::::.:.::::::::::::.:: :::.::::::::: :::::.:::.:::::
CCDS11 SENIAHFGGDPERITIFGSGAGASCVNLLILSHHSEGLFQKAIAQSGTAISSWSVNYQPL
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KSD KYTRILADKVGCNMLDTTDMVECLRNKNYKELIQQTITPATYHIAFGPVIDGDVIPDDPQ
::::.:: ::::. :... ::::: : .::..: . :: ::::::::.::::.::::.
CCDS11 KYTRLLAAKVGCDREDSAEAVECLRRKPSRELVDQDVQPARYHIAFGPVVDGDVVPDDPE
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KSD ILMEQGEFLNYDIMLGVNQGEGLKFVDGIVDNEDGVTPNDFDFSVSNFVDNLYGYPEGKD
:::.::::::::...:::::::::::. ...::::. . :::.::::::::::::::::
CCDS11 ILMQQGEFLNYDMLIGVNQGEGLKFVEDSAESEDGVSASAFDFTVSNFVDNLYGYPEGKD
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KSD TLRETIKFMYTDWADKENPETRRKTLVALFTDHQWVAPAVATADLHAQYGSPTYFYAFYH
.::::::::::::::..: : :::::.:::::::::::::::: :::.: ::.:::.:::
CCDS11 VLRETIKFMYTDWADRDNGEMRRKTLLALFTDHQWVAPAVATAKLHADYQSPVYFYTFYH
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KSD HCQSEMKPSWADSAHGDEVPYVFGIPMIGPTELFSCNFSKNDVMLSAVVMTYWTNFAKTG
:::.: .: :::.:::::.:::::.::.: :.:: :::::::::::::::::::::::::
CCDS11 HCQAEGRPEWADAAHGDELPYVFGVPMVGATDLFPCNFSKNDVMLSAVVMTYWTNFAKTG
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KSD DPNQPVPQDTKFIHTKPNRFEEVAWSKYNPKDQLYLHIGLKPRVRDHYRATKVAFWLELV
:::::::::::::::::::::::.:::.: :.. ::::::::::::.:::.:::::::::
CCDS11 DPNQPVPQDTKFIHTKPNRFEEVVWSKFNSKEKQYLHIGLKPRVRDNYRANKVAFWLELV
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KSD PHLHNLN-EIFQYVSTTTKVPPPDMTSFPYGTRRSPAKIWPTTKRPAITPANNPKHSKDP
::::::. :.: .:::..:: : .: : :: : :.:: ::. : . .:
CCDS11 PHLHNLHTELF---TTTTRLPPY-ATRWP---PRPPAGA-PGTRRPP-PPATLPPEP-EP
610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KSD HKTGPEDTTVLIETKRDYSTELSVTIAVGASLLFLNILAFAALYYKKDKRRHETHRRPSP
. ::. . .::::::::::.::::::::::::::::::::.:.:.. :: ::
CCDS11 -EPGPRAYDRFPGDSRDYSTELSVTVAVGASLLFLNILAFAALYYKRDRRQELRCRRLSP
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760
pF1KSD QRNTTNDIAHIQNEEIMSLQMKQLEHDHECESLQAH----------DTLRLTCPPDYTLT
.. . . . .. ..: ..: ::: . ..:: .:::::::.
CCDS11 PGGSGSGVPG--GGPLLPAAGRELPPEEELVSLQLKRGGGVGADPAEALRPACPPDYTLA
720 730 740 750 760 770
770 780 790 800 810
pF1KSD LRRSPDDIPLMTPNTITMIPNTLTGMQP-----LHTFNTF-----SGGQNSTNLPHGHST
:::.:::.::..:...:..:. : : :: :. : .. .....::: :::
CCDS11 LRRAPDDVPLLAPGALTLLPSGLGPPPPPPPPSLHPFGPFPPPPPTATSHNNTLPHPHST
780 790 800 810 820 830
pF1KSD TRV
:::
CCDS11 TRV
>>CCDS3222.1 NLGN1 gene_id:22871|Hs108|chr3 (823 aa)
initn: 2831 init1: 2088 opt: 2134 Z-score: 2330.3 bits: 442.1 E(32554): 1.8e-123
Smith-Waterman score: 4052; 74.9% identity (88.8% similar) in 786 aa overlap (46-816:53-823)
20 30 40 50 60 70
pF1KSD PVCVMLNSNVLLWLTALAIKFTLIDSQAQYPVVNTNYGKIRGLRTPLPNEILGPVEQYLG
:.: ::.:::::.. : ::::::: :.::
CCDS32 RGLGAPLTLCMLGCLLQAGHVLSQKLDDVDPLVATNFGKIRGIKKELNNEILGPVIQFLG
30 40 50 60 70 80
80 90 100 110 120 130
pF1KSD VPYASPPTGERRFQPPEPPSSWTGIRNTTQFAAVCPQHLDERSLLHDMLPIWFTANLDTL
::::.::::::::::::::: :. :::.:::: ::::.. . : . :::.::: :::..
CCDS32 VPYAAPPTGERRFQPPEPPSPWSDIRNATQFAPVCPQNIIDGRLPEVMLPVWFTNNLDVV
90 100 110 120 130 140
140 150 160 170 180 190
pF1KSD MTYVQDQNEDCLYLNIYVPTEDDIHDQNSKKPVMVYIHGGSYMEGTGNMIDGSILASYGN
.:::::.::::::::::::::::.:... ::::::::::::::::::. :::.::::::
CCDS32 SSYVQDQSEDCLYLNIYVPTEDDIRDSGGPKPVMVYIHGGSYMEGTGNLYDGSVLASYGN
150 160 170 180 190 200
200 210 220 230 240 250
pF1KSD VIVITINYRLGILGFLSTGDQAAKGNYGLLDQIQALRWIEENVGAFGGDPKRVTIFGSGA
:::::.:::::.::::::::::::::::::: :::::: ::.: ::::: :.:.:::::
CCDS32 VIVITVNYRLGVLGFLSTGDQAAKGNYGLLDLIQALRWTSENIGFFGGDPLRITVFGSGA
210 220 230 240 250 260
260 270 280 290 300
pF1KSD GASCVSLLTLSHYSEG---------LFQKAIIQSGTALSSWAVNYQPAKYTRILADKVGC
:.:::.:::::::::: :::.:: :::::::::::..:::::.:.:: ::::
CCDS32 GGSCVNLLTLSHYSEGNRWSNSTKGLFQRAIAQSGTALSSWAVSFQPAKYARMLATKVGC
270 280 290 300 310 320
310 320 330 340 350 360
pF1KSD NMLDTTDMVECLRNKNYKELIQQTITPATYHIAFGPVIDGDVIPDDPQILMEQGEFLNYD
:. ::...::::..: ::::..: : :: :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NVSDTVELVECLQKKPYKELVDQDIQPARYHIAFGPVIDGDVIPDDPQILMEQGEFLNYD
330 340 350 360 370 380
370 380 390 400 410 420
pF1KSD IMLGVNQGEGLKFVDGIVDNEDGVTPNDFDFSVSNFVDNLYGYPEGKDTLRETIKFMYTD
::::::::::::::..:::..::.. .::::.::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS32 IMLGVNQGEGLKFVENIVDSDDGISASDFDFAVSNFVDNLYGYPEGKDVLRETIKFMYTD
390 400 410 420 430 440
430 440 450 460 470 480
pF1KSD WADKENPETRRKTLVALFTDHQWVAPAVATADLHAQYGSPTYFYAFYHHCQSEMKPSWAD
:::..:::::::::.:::::::::::::::::::...::::::::::::::... :.:::
CCDS32 WADRHNPETRRKTLLALFTDHQWVAPAVATADLHSNFGSPTYFYAFYHHCQTDQVPAWAD
450 460 470 480 490 500
490 500 510 520 530 540
pF1KSD SAHGDEVPYVFGIPMIGPTELFSCNFSKNDVMLSAVVMTYWTNFAKTGDPNQPVPQDTKF
.:::::::::.::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 AAHGDEVPYVLGIPMIGPTELFPCNFSKNDVMLSAVVMTYWTNFAKTGDPNQPVPQDTKF
510 520 530 540 550 560
550 560 570 580 590 600
pF1KSD IHTKPNRFEEVAWSKYNPKDQLYLHIGLKPRVRDHYRATKVAFWLELVPHLHNLNEIFQY
:::::::::::::..:. ::::::::::::::..::::.:: .::::::::::::.: ::
CCDS32 IHTKPNRFEEVAWTRYSQKDQLYLHIGLKPRVKEHYRANKVNLWLELVPHLHNLNDISQY
570 580 590 600 610 620
610 620 630 640 650 660
pF1KSD VSTTTKVPPPDMTSFPYGTRRSPAKIWPTTKRPAITPANNPKHSKDPHKTGPEDTTVLIE
.::::::: :.: : ::.. . :.:. . ..::.. .: ..
CCDS32 TSTTTKVPSTDITFRP--TRKNSV---PVTSAFPTAKQDDPKQQPSPFSVD---------
630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD TKRDYSTELSVTIAVGASLLFLNILAFAALYYKKDKRRHETHRRPSPQRNTTNDIAHIQN
.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::..::: ::::.::::..: :.
CCDS32 -QRDYSTELSVTIAVGASLLFLNILAFAALYYKKDKRRHDVHRRCSPQRTTTNDLTHAQE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD EEIMSLQMKQLEHDHECESLQAHDT-LRLTCPPDYTLTLRRSPDDIPLMTPNTITMIPNT
:::::::::. . ::::::.. :.. :: .:::::::..::::::.::::::::::::::
CCDS32 EEIMSLQMKHTDLDHECESIHPHEVVLRTACPPDYTLAMRRSPDDVPLMTPNTITMIPNT
730 740 750 760 770 780
790 800 810
pF1KSD LTGMQPLHTFNTFSGGQNST-----NLPHGHSTTRV
. :.:::::::::.::::.: ::.::::::
CCDS32 IPGIQPLHTFNTFTGGQNNTLPHPHPHPHSHSTTRV
790 800 810 820
>>CCDS55553.1 NLGN4Y gene_id:22829|Hs108|chrY (256 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSRPQGLLWLPLLFTPVCVMLNSNVLLWLTALAIKFTLIDSQAQYPVVNTNYGKIRGLRT
: ::::::::::::: ::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS55 MLRPQGLLWLPLLFTSVCVMLNSNVLLWITALAIKFTLIDSQAQYPVVNTNYGKIQGLRT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD PLPNEILGPVEQYLGVPYASPPTGERRFQPPEPPSSWTGIRNTTQFAAVCPQHLDERSLL
:::.:::::::::::::::::::::::::::: :::::::::.:::.:::::::::: ::
CCDS55 PLPSEILGPVEQYLGVPYASPPTGERRFQPPESPSSWTGIRNATQFSAVCPQHLDERFLL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160
pF1KSD HDMLPIWFTANLDTLMTYVQDQNEDCLYLNIYVPTED--------------------DIH
:::::::::..::::::::::::::::::::::: :: :::
CCDS55 HDMLPIWFTTSLDTLMTYVQDQNEDCLYLNIYVPMEDGTNIKRNADDITSNDHGEDKDIH
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KSD DQNSKKPVMVYIHGGSYMEGTGNMIDGSILASYGNVIVITINYRLGILGFLSTGDQAAKG
.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EQNSKKPVMVYIHGGSYMEGTGNMIDGSILASYGNVIVITINYRLGILGMQEARLCGSSK
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KSD NYGLLDQIQALRWIEENVGAFGGDPKRVTIFGSGAGASCVSLLTLSHYSEGLFQKAIIQS
CCDS55 MFNYFKSPFTNLINFF
250
>>CCDS3198.1 BCHE gene_id:590|Hs108|chr3 (602 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSRPQGLLWLPLLFTPVCVMLNSNVLLWLTALAIKFTLIDSQAQYPVVNTNYGKIRGLRT
: .:. . :.:. : . . .. . .. :. ::.::.
CCDS31 MHSKVTIICIRF----LFWFLLLCMLIGKSHTEDDI-IIATKNGKVRGMNL
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KSD PLPNEILGPVEQYLGVPYASPPTGERRFQPPEPPSSWTGIRNTTQFAAVCPQHLDERSLL
. . : : .::.:::.:: :. ::. :. ..:. : :.:..: : :..:.
CCDS31 TVFG---GTVTAFLGIPYAQPPLGRLRFKKPQSLTKWSDIWNATKYANSCCQNIDQSFPG
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KSD HDMLPIWFTANLDTLMTYVQDQNEDCLYLNIYVPTEDDIHDQNSKKPVMVYIHGGSYMEG
.: : .: : .:::::::...:. . .:. :...:.::... :
CCDS31 FHGSEMW---NPNT------DLSEDCLYLNVWIPAP---KPKNAT--VLIWIYGGGFQTG
110 120 130 140
190 200 210 220 230
pF1KSD TGNM--IDGSILASYGNVIVITINYRLGILGFLST-GDQAAKGNYGLLDQIQALRWIEEN
:... ::..:: :::...:::.: ::::. :. : ::.::.:: ::.:...:
CCDS31 TSSLHVYDGKFLARVERVIVVSMNYRVGALGFLALPGNPEAPGNMGLFDQQLALQWVQKN
150 160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KSD VGAFGGDPKRVTIFGSGAGASCVSLLTLSHYSEGLFQKAIIQSGTALSSWAVN--YQPAK
..::::.:: ::.:: .:::. ::: :: :..:: .::.:::. . :::. :. .
CCDS31 IAAFGGNPKSVTLFGESAGAASVSLHLLSPGSHSLFTRAILQSGSFNAPWAVTSLYEARN
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KSD YTRILADKVGCNMLDTTDMVECLRNKNYKELI--QQTITP--ATYHIAFGPVIDGDVIPD
: :: .::. . :....:::::. .:.. . ..: . . :::..::: . :
CCDS31 RTLNLAKLTGCSRENETEIIKCLRNKDPQEILLNEAFVVPYGTPLSVNFGPTVDGDFLTD
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400
pF1KSD DPQILMEQGEFLNYDIMLGVNQGEGLKF-VDGIV----DNEDGVTPNDFDFSVSNFVDNL
:.::.: :.: . .:..:::. :: : : : ::.. .: ..:. ... :
CCDS31 MPDILLELGQFKKTQILVGVNKDEGTAFLVYGAPGFSKDNNSIITRKEFQEGLKIF----
330 340 350 360 370 380
410 420 430 440 450 460
pF1KSD YGYPEGKDTLRETIKFMYTDWADKENPETRRKTLVALFTDHQWVAPAVATADLHAQYGSP
.: .. .:.: : ::::.: . ::. :..: . :.... ::. . ...:.
CCDS31 --FPGVSEFGKESILFHYTDWVDDQRPENYREALGDVVGDYNFICPALEFTKKFSEWGNN
390 400 410 420 430 440
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..:: : :. .. : : :: :. .:::.:. : . :..: . .:: ..
CCDS31 AFFYYFEHRSSKLPWPEWMGVMHGYEIEFVFGLPL----ERRD-NYTKAEEILSRSIVKR
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CCDS31 WANFAKYGNPNE----------TQNN---STSWPVFKSTEQKYLTLNTESTRIMTKLRAQ
500 510 520 530 540
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]