Result of FASTA (omim) for
pF1KSDA1253
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1253, 453 aa
1>>>pF1KSDA1253 453 - 453 aa - 453 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8036+/-0.000436; mu= 20.4661+/- 0.027
mean_var=66.3913+/-13.224, 0's: 0 Z-trim(110.7): 38 B-trim: 41 in 1/49
Lambda= 0.157405
statistics sampled from 19061 (19091) to 19061 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.576), E-opt: 0.2 (0.224), width: 16
Scan time: 8.400
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_065806 (OMIM: 614548) serine incorporator 1 pre ( 453) 3064 705.1 9.6e-203
NP_849196 (OMIM: 614549) serine incorporator 2 iso ( 455) 1792 416.3 8.7e-116
NP_061035 (OMIM: 614549) serine incorporator 2 iso ( 459) 1753 407.4 4e-113
NP_001185966 (OMIM: 614549) serine incorporator 2 ( 459) 1749 406.5 7.6e-113
NP_001185967 (OMIM: 614549) serine incorporator 2 ( 464) 1749 406.5 7.6e-113
NP_001185968 (OMIM: 614549) serine incorporator 2 ( 400) 1542 359.4 9.7e-99
NP_006802 (OMIM: 607165) serine incorporator 3 pre ( 473) 1341 313.9 6e-85
NP_945179 (OMIM: 607165) serine incorporator 3 pre ( 473) 1341 313.9 6e-85
NP_001167543 (OMIM: 614551) serine incorporator 5 ( 461) 1124 264.6 4e-70
XP_016883090 (OMIM: 607165) PREDICTED: serine inco ( 418) 1082 255.0 2.8e-67
NP_001167542 (OMIM: 614551) serine incorporator 5 ( 420) 1006 237.7 4.4e-62
XP_011541606 (OMIM: 614551) PREDICTED: serine inco ( 543) 1006 237.8 5.3e-62
NP_840060 (OMIM: 614551) serine incorporator 5 iso ( 423) 1004 237.3 6e-62
XP_016864812 (OMIM: 614551) PREDICTED: serine inco ( 506) 901 214.0 7.6e-55
XP_016864813 (OMIM: 614551) PREDICTED: serine inco ( 506) 901 214.0 7.6e-55
NP_001244960 (OMIM: 614550) serine incorporator 4 ( 518) 696 167.4 8e-41
XP_016864815 (OMIM: 614551) PREDICTED: serine inco ( 235) 425 105.6 1.5e-22
XP_016864814 (OMIM: 614551) PREDICTED: serine inco ( 317) 307 78.9 2.2e-14
NP_001244961 (OMIM: 614550) serine incorporator 4 ( 274) 245 64.8 3.3e-10
>>NP_065806 (OMIM: 614548) serine incorporator 1 precurs (453 aa)
initn: 3064 init1: 3064 opt: 3064 Z-score: 3760.9 bits: 705.1 E(85289): 9.6e-203
Smith-Waterman score: 3064; 100.0% identity (100.0% similar) in 453 aa overlap (1-453:1-453)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MGSVLGLCSMASWIPCLCGSAPCLLCRCCPSGNNSTVTRLIYALFLLVGVCVACVMLIPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 MGSVLGLCSMASWIPCLCGSAPCLLCRCCPSGNNSTVTRLIYALFLLVGVCVACVMLIPG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD MEEQLNKIPGFCENEKGVVPCNILVGYKAVYRLCFGLAMFYLLLSLLMIKVKSSSDPRAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 MEEQLNKIPGFCENEKGVVPCNILVGYKAVYRLCFGLAMFYLLLSLLMIKVKSSSDPRAA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD VHNGFWFFKFAAAIAIIIGAFFIPEGTFTTVWFYVGMAGAFCFILIQLVLLIDFAHSWNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 VHNGFWFFKFAAAIAIIIGAFFIPEGTFTTVWFYVGMAGAFCFILIQLVLLIDFAHSWNE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD SWVEKMEEGNSRCWYAALLSATALNYLLSLVAIVLFFVYYTHPASCSENKAFISVNMLLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 SWVEKMEEGNSRCWYAALLSATALNYLLSLVAIVLFFVYYTHPASCSENKAFISVNMLLC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD VGASVMSILPKIQESQPRSGLLQSSVITVYTMYLTWSAMTNEPETNCNPSLLSIIGYNTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 VGASVMSILPKIQESQPRSGLLQSSVITVYTMYLTWSAMTNEPETNCNPSLLSIIGYNTT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD STVPKEGQSVQWWHAQGIIGLILFLLCVFYSSIRTSNNSQVNKLTLTSDESTLIEDGGAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 STVPKEGQSVQWWHAQGIIGLILFLLCVFYSSIRTSNNSQVNKLTLTSDESTLIEDGGAR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD SDGSLEDGDDVHRAVDNERDGVTYSYSFFHFMLFLASLYIMMTLTNWYRYEPSREMKSQW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 SDGSLEDGDDVHRAVDNERDGVTYSYSFFHFMLFLASLYIMMTLTNWYRYEPSREMKSQW
370 380 390 400 410 420
430 440 450
pF1KSD TAVWVKISSSWIGIVLYVWTLVAPLVLTNRDFD
:::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 TAVWVKISSSWIGIVLYVWTLVAPLVLTNRDFD
430 440 450
>>NP_849196 (OMIM: 614549) serine incorporator 2 isoform (455 aa)
initn: 1799 init1: 909 opt: 1792 Z-score: 2199.8 bits: 416.3 E(85289): 8.7e-116
Smith-Waterman score: 1792; 54.7% identity (79.7% similar) in 459 aa overlap (1-452:1-454)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MGSVLGLCSMASWIPCLCGSAPCLLCRCCPSGNNSTVTRLIYALFLLVGVCVACVMLIPG
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NP_849 MGACLGACSLLSCASCLCGSAPCILCSCCPASRNSTVSRLIFTFFLFLGVLVSIIMLSPG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KSD MEEQLNKIPGFCENEKGV-------VPCNILVGYKAVYRLCFGLAMFYLLLSLLMIKVKS
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NP_849 VESQLYKLPWVCEEGAGIPTVLQGHIDCGSLLGYRAVYRMCFATAAFFFFFTLLMLCVSS
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KSD SSDPRAAVHNGFWFFKFAAAIAIIIGAFFIPEGTFTTVWFYVGMAGAFCFILIQLVLLID
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NP_849 SRDPRAAIQNGFWFFKFLILVGLTVGAFYIPDGSFTNIWFYFGVVGSFLFILIQLVLLID
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KSD FAHSWNESWVEKMEEGNSRCWYAALLSATALNYLLSLVAIVLFFVYYTHPASCSENKAFI
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NP_849 FAHSWNQRWLGKAEECDSRAWYAGLFFFTLLFYLLSIAAVALMFMYYTEPSGCHEGKVFI
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KSD SVNMLLCVGASVMSILPKIQESQPRSGLLQSSVITVYTMYLTWSAMTNEPETNCNPSLLS
:.:. .:: .:. ..:::.:..:: :::::.::::.:::..::::... :: .::: : .
NP_849 SLNLTFCVCVSIAAVLPKVQDAQPNSGLLQASVITLYTMFVTWSALSSIPEQKCNPHLPT
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KSD IIGYNTTSTVPKEGQSVQWWHAQGIIGLILFLLCVFYSSIRTSNNSQVNKLTLTSDESTL
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NP_849 QLGNETVVAGP-EGYETQWWDAPSIVGLIIFLLCTLFISLRSSDHRQVNSLMQTEECPPM
310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD IEDGGARSDGSLEDGDDVHRAVDNERDGVTYSYSFFHFMLFLASLYIMMTLTNWYRYEPS
.. ... . .: :: :::.:::::::::::: : ::::..::::::::. .
NP_849 LDATQQQQQVAACEG----RAFDNEQDGVTYSYSFFHFCLVLASLHVMMTLTNWYKPGET
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450
pF1KSD REMKSQWTAVWVKISSSWIGIVLYVWTLVAPLVLTNRDFD
:.: : :::::::: .:: :..::.:::::::.: ::::
NP_849 RKMISTWTAVWVKICASWAGLLLYLWTLVAPLLLRNRDFS
420 430 440 450
>>NP_061035 (OMIM: 614549) serine incorporator 2 isoform (459 aa)
initn: 1756 init1: 909 opt: 1753 Z-score: 2151.8 bits: 407.4 E(85289): 4e-113
Smith-Waterman score: 1753; 54.2% identity (79.4% similar) in 452 aa overlap (8-452:12-458)
10 20 30 40 50
pF1KSD MGSVLGLCSMASWIPCLCGSAPCLLCRCCPSGNNSTVTRLIYALFLLVGVCVACVM
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NP_061 MGAEGAPDFLSCPRVRRASCLCGSAPCILCSCCPASRNSTVSRLIFTFFLFLGVLVSIIM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KSD LIPGMEEQLNKIPGFCENEKGV-------VPCNILVGYKAVYRLCFGLAMFYLLLSLLMI
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NP_061 LSPGVESQLYKLPWVCEEGAGIPTVLQGHIDCGSLLGYRAVYRMCFATAAFFFFFTLLML
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KSD KVKSSSDPRAAVHNGFWFFKFAAAIAIIIGAFFIPEGTFTTVWFYVGMAGAFCFILIQLV
:.:: :::::..:::::::: ... .:::.::.:.::..::: :..:.: :::::::
NP_061 CVSSSRDPRAAIQNGFWFFKFLILVGLTVGAFYIPDGSFTNIWFYFGVVGSFLFILIQLV
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KSD LLIDFAHSWNESWVEKMEEGNSRCWYAALLSATALNYLLSLVAIVLFFVYYTHPASCSEN
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NP_061 LLIDFAHSWNQRWLGKAEECDSRAWYAGLFFFTLLFYLLSIAAVALMFMYYTEPSGCHEG
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KSD KAFISVNMLLCVGASVMSILPKIQESQPRSGLLQSSVITVYTMYLTWSAMTNEPETNCNP
:.:::.:. .:: .:. ..:::.:..:: :::::.::::.:::..::::... :: .:::
NP_061 KVFISLNLTFCVCVSIAAVLPKVQDAQPNSGLLQASVITLYTMFVTWSALSSIPEQKCNP
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KSD SLLSIIGYNTTSTVPKEGQSVQWWHAQGIIGLILFLLCVFYSSIRTSNNSQVNKLTLTSD
: . .: .:. . : :: .::: : .:.:::.::::... :.:.:.. :::.: : .
NP_061 HLPTQLGNETVVAGP-EGYETQWWDAPSIVGLIIFLLCTLFISLRSSDHRQVNSLMQTEE
310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KSD ESTLIEDGGARSDGSLEDGDDVHRAVDNERDGVTYSYSFFHFMLFLASLYIMMTLTNWYR
... ... . .: :: :::.:::::::::::: : ::::..::::::::.
NP_061 CPPMLDATQQQQQVAACEG----RAFDNEQDGVTYSYSFFHFCLVLASLHVMMTLTNWYK
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450
pF1KSD YEPSREMKSQWTAVWVKISSSWIGIVLYVWTLVAPLVLTNRDFD
.:.: : :::::::: .:: :..::.:::::::.: ::::
NP_061 PGETRKMISTWTAVWVKICASWAGLLLYLWTLVAPLLLRNRDFS
420 430 440 450
>>NP_001185966 (OMIM: 614549) serine incorporator 2 isof (459 aa)
initn: 1756 init1: 909 opt: 1749 Z-score: 2146.9 bits: 406.5 E(85289): 7.6e-113
Smith-Waterman score: 1749; 55.0% identity (80.4% similar) in 444 aa overlap (16-452:20-458)
10 20 30 40 50
pF1KSD MGSVLGLCSMASWIPCLCGSAPCLLCRCCPSGNNSTVTRLIYALFLLVGVCVACVM
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NP_001 MRSMRLREEESPGPSHTASCLCGSAPCILCSCCPASRNSTVSRLIFTFFLFLGVLVSIIM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KSD LIPGMEEQLNKIPGFCENEKGV-------VPCNILVGYKAVYRLCFGLAMFYLLLSLLMI
: ::.: :: :.: ::. :. . :. :.::.::::.::. : :.....:::.
NP_001 LSPGVESQLYKLPWVCEEGAGIPTVLQGHIDCGSLLGYRAVYRMCFATAAFFFFFTLLML
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KSD KVKSSSDPRAAVHNGFWFFKFAAAIAIIIGAFFIPEGTFTTVWFYVGMAGAFCFILIQLV
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NP_001 CVSSSRDPRAAIQNGFWFFKFLILVGLTVGAFYIPDGSFTNIWFYFGVVGSFLFILIQLV
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KSD LLIDFAHSWNESWVEKMEEGNSRCWYAALLSATALNYLLSLVAIVLFFVYYTHPASCSEN
::::::::::. :. : :: .:: :::.:. : : ::::..:..:.:.:::.:..: :.
NP_001 LLIDFAHSWNQRWLGKAEECDSRAWYAGLFFFTLLFYLLSIAAVALMFMYYTEPSGCHEG
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KSD KAFISVNMLLCVGASVMSILPKIQESQPRSGLLQSSVITVYTMYLTWSAMTNEPETNCNP
:.:::.:. .:: .:. ..:::.:..:: :::::.::::.:::..::::... :: .:::
NP_001 KVFISLNLTFCVCVSIAAVLPKVQDAQPNSGLLQASVITLYTMFVTWSALSSIPEQKCNP
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KSD SLLSIIGYNTTSTVPKEGQSVQWWHAQGIIGLILFLLCVFYSSIRTSNNSQVNKLTLTSD
: . .: .:. . : :: .::: : .:.:::.::::... :.:.:.. :::.: : .
NP_001 HLPTQLGNETVVAGP-EGYETQWWDAPSIVGLIIFLLCTLFISLRSSDHRQVNSLMQTEE
310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KSD ESTLIEDGGARSDGSLEDGDDVHRAVDNERDGVTYSYSFFHFMLFLASLYIMMTLTNWYR
... ... . .: :: :::.:::::::::::: : ::::..::::::::.
NP_001 CPPMLDATQQQQQVAACEG----RAFDNEQDGVTYSYSFFHFCLVLASLHVMMTLTNWYK
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450
pF1KSD YEPSREMKSQWTAVWVKISSSWIGIVLYVWTLVAPLVLTNRDFD
.:.: : :::::::: .:: :..::.:::::::.: ::::
NP_001 PGETRKMISTWTAVWVKICASWAGLLLYLWTLVAPLLLRNRDFS
420 430 440 450
>>NP_001185967 (OMIM: 614549) serine incorporator 2 isof (464 aa)
initn: 1756 init1: 909 opt: 1749 Z-score: 2146.9 bits: 406.5 E(85289): 7.6e-113
Smith-Waterman score: 1749; 55.0% identity (80.4% similar) in 444 aa overlap (16-452:25-463)
10 20 30 40 50
pF1KSD MGSVLGLCSMASWIPCLCGSAPCLLCRCCPSGNNSTVTRLIYALFLLVGVC
::::::::.:: :::.. ::::.:::...::..::
NP_001 MDGRMMRSMRLREEESPGPSHTASCLCGSAPCILCSCCPASRNSTVSRLIFTFFLFLGVL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KSD VACVMLIPGMEEQLNKIPGFCENEKGV-------VPCNILVGYKAVYRLCFGLAMFYLLL
:. .:: ::.: :: :.: ::. :. . :. :.::.::::.::. : :....
NP_001 VSIIMLSPGVESQLYKLPWVCEEGAGIPTVLQGHIDCGSLLGYRAVYRMCFATAAFFFFF
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KSD SLLMIKVKSSSDPRAAVHNGFWFFKFAAAIAIIIGAFFIPEGTFTTVWFYVGMAGAFCFI
.:::. :.:: :::::..:::::::: ... .:::.::.:.::..::: :..:.: ::
NP_001 TLLMLCVSSSRDPRAAIQNGFWFFKFLILVGLTVGAFYIPDGSFTNIWFYFGVVGSFLFI
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KSD LIQLVLLIDFAHSWNESWVEKMEEGNSRCWYAALLSATALNYLLSLVAIVLFFVYYTHPA
:::::::::::::::. :. : :: .:: :::.:. : : ::::..:..:.:.:::.:.
NP_001 LIQLVLLIDFAHSWNQRWLGKAEECDSRAWYAGLFFFTLLFYLLSIAAVALMFMYYTEPS
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KSD SCSENKAFISVNMLLCVGASVMSILPKIQESQPRSGLLQSSVITVYTMYLTWSAMTNEPE
.: :.:.:::.:. .:: .:. ..:::.:..:: :::::.::::.:::..::::... ::
NP_001 GCHEGKVFISLNLTFCVCVSIAAVLPKVQDAQPNSGLLQASVITLYTMFVTWSALSSIPE
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KSD TNCNPSLLSIIGYNTTSTVPKEGQSVQWWHAQGIIGLILFLLCVFYSSIRTSNNSQVNKL
.::: : . .: .:. . : :: .::: : .:.:::.::::... :.:.:.. :::.:
NP_001 QKCNPHLPTQLGNETVVAGP-EGYETQWWDAPSIVGLIIFLLCTLFISLRSSDHRQVNSL
310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KSD TLTSDESTLIEDGGARSDGSLEDGDDVHRAVDNERDGVTYSYSFFHFMLFLASLYIMMTL
: . ... ... . .: :: :::.:::::::::::: : ::::..::::
NP_001 MQTEECPPMLDATQQQQQVAACEG----RAFDNEQDGVTYSYSFFHFCLVLASLHVMMTL
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450
pF1KSD TNWYRYEPSREMKSQWTAVWVKISSSWIGIVLYVWTLVAPLVLTNRDFD
::::. .:.: : :::::::: .:: :..::.:::::::.: ::::
NP_001 TNWYKPGETRKMISTWTAVWVKICASWAGLLLYLWTLVAPLLLRNRDFS
420 430 440 450 460
>>NP_001185968 (OMIM: 614549) serine incorporator 2 isof (400 aa)
initn: 1549 init1: 909 opt: 1542 Z-score: 1893.7 bits: 359.4 E(85289): 9.7e-99
Smith-Waterman score: 1542; 54.2% identity (79.5% similar) in 404 aa overlap (56-452:1-399)
30 40 50 60 70
pF1KSD CRCCPSGNNSTVTRLIYALFLLVGVCVACVMLIPGMEEQLNKIPGFCENEKGV-------
:: ::.: :: :.: ::. :.
NP_001 MLSPGVESQLYKLPWVCEEGAGIPTVLQGH
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KSD VPCNILVGYKAVYRLCFGLAMFYLLLSLLMIKVKSSSDPRAAVHNGFWFFKFAAAIAIII
. :. :.::.::::.::. : :.....:::. :.:: :::::..:::::::: ... .
NP_001 IDCGSLLGYRAVYRMCFATAAFFFFFTLLMLCVSSSRDPRAAIQNGFWFFKFLILVGLTV
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KSD GAFFIPEGTFTTVWFYVGMAGAFCFILIQLVLLIDFAHSWNESWVEKMEEGNSRCWYAAL
:::.::.:.::..::: :..:.: :::::::::::::::::. :. : :: .:: :::.:
NP_001 GAFYIPDGSFTNIWFYFGVVGSFLFILIQLVLLIDFAHSWNQRWLGKAEECDSRAWYAGL
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KSD LSATALNYLLSLVAIVLFFVYYTHPASCSENKAFISVNMLLCVGASVMSILPKIQESQPR
. : : ::::..:..:.:.:::.:..: :.:.:::.:. .:: .:. ..:::.:..::
NP_001 FFFTLLFYLLSIAAVALMFMYYTEPSGCHEGKVFISLNLTFCVCVSIAAVLPKVQDAQPN
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KSD SGLLQSSVITVYTMYLTWSAMTNEPETNCNPSLLSIIGYNTTSTVPKEGQSVQWWHAQGI
:::::.::::.:::..::::... :: .::: : . .: .:. . : :: .::: : .:
NP_001 SGLLQASVITLYTMFVTWSALSSIPEQKCNPHLPTQLGNETVVAGP-EGYETQWWDAPSI
220 230 240 250 260
320 330 340 350 360 370
pF1KSD IGLILFLLCVFYSSIRTSNNSQVNKLTLTSDESTLIEDGGARSDGSLEDGDDVHRAVDNE
.:::.::::... :.:.:.. :::.: : . ... ... . .: :: :::
NP_001 VGLIIFLLCTLFISLRSSDHRQVNSLMQTEECPPMLDATQQQQQVAACEG----RAFDNE
270 280 290 300 310 320
380 390 400 410 420 430
pF1KSD RDGVTYSYSFFHFMLFLASLYIMMTLTNWYRYEPSREMKSQWTAVWVKISSSWIGIVLYV
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NP_001 QDGVTYSYSFFHFCLVLASLHVMMTLTNWYKPGETRKMISTWTAVWVKICASWAGLLLYL
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440 450
pF1KSD WTLVAPLVLTNRDFD
:::::::.: ::::
NP_001 WTLVAPLLLRNRDFS
390 400
>>NP_006802 (OMIM: 607165) serine incorporator 3 precurs (473 aa)
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:: :.::::::: .: . :..:::::::::. :..:.:....::::.:::
NP_006 METYLKKIPGFCEGGFKIHEADINADKDCDVLVGYKAVYRISFAMAIFFFVFSLLMFKVK
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pF1KSD SSSDPRAAVHNGFWFFKFAAAIAIIIGAFFIPEGTFTTVWFYVGMAGAFCFILIQLVLLI
.:.: ::::::::::::.:: :.:..:.:.:: : :..::: ::: :: :::::::::.
NP_006 TSKDLRAAVHNGFWFFKIAALIGIMVGSFYIPGGYFSSVWFVVGMIGAALFILIQLVLLV
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:::::::::::..::::: : ::::::: :. :.::.. . :...:::.: .:.::: :
NP_006 DFAHSWNESWVNRMEEGNPRLWYAALLSFTSAFYILSIICVGLLYTYYTKPDGCTENKFF
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pF1KSD ISVNMLLCVGASVMSILPKIQESQPRSGLLQSSVITVYTMYLTWSAMTNEPETNCNPSLL
::.:..::: ::..:: ::::: ::::::::::.::.::::::::::.:::. .:::.:.
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:.: :.:..:: ..: . ....:::..:.::..:::::::.:::
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350 360 370 380 390 400
pF1KSD VNKLTLTSDESTLIEDGGARSDGSLEDGDDVHRAVDNERDGVTYSYSFFHFMLFLASLYI
:.::::....:... : . . .. :::. .::::::..:: ::::.::.:: ::::::
NP_006 VDKLTLSGSDSVILGDTTTSGASDEEDGQP-RRAVDNEKEGVQYSYSLFHLMLCLASLYI
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pF1KSD MMTLTNWYRYEPS-REMKSQWTAVWVKISSSWIGIVLYVWTLVAPLVLTNRDFD
:::::.:: . . . : :.: ::::::::::. ..:::::::::::::.:::
NP_006 MMTLTSWYSPDAKFQSMTSKWPAVWVKISSSWVCLLLYVWTLVAPLVLTSRDFS
420 430 440 450 460 470
>>NP_945179 (OMIM: 607165) serine incorporator 3 precurs (473 aa)
initn: 1685 init1: 1040 opt: 1341 Z-score: 1646.0 bits: 313.9 E(85289): 6e-85
Smith-Waterman score: 1859; 59.2% identity (82.5% similar) in 473 aa overlap (1-452:1-472)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MGSVLGLCSMASWIPCLCGSAPCLLCRCCPSGNNSTVTRLIYALFLLVGVCVACVMLIPG
::.:::. :.:::.::::..: :::: :::...::::::::::..::... :. .:
NP_945 MGAVLGVFSLASWVPCLCSGASCLLCSCCPNSKNSTVTRLIYAFILLLSTVVSYIMQRKE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KSD MEEQLNKIPGFCE-----NEKGVVP---CNILVGYKAVYRLCFGLAMFYLLLSLLMIKVK
:: :.::::::: .: . :..:::::::::. :..:.:....::::.:::
NP_945 METYLKKIPGFCEGGFKIHEADINADKDCDVLVGYKAVYRISFAMAIFFFVFSLLMFKVK
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KSD SSSDPRAAVHNGFWFFKFAAAIAIIIGAFFIPEGTFTTVWFYVGMAGAFCFILIQLVLLI
.:.: ::::::::::::.:: :.:..:.:.:: : :..::: ::: :: :::::::::.
NP_945 TSKDLRAAVHNGFWFFKIAALIGIMVGSFYIPGGYFSSVWFVVGMIGAALFILIQLVLLV
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180 190 200 210 220 230
pF1KSD DFAHSWNESWVEKMEEGNSRCWYAALLSATALNYLLSLVAIVLFFVYYTHPASCSENKAF
:::::::::::..::::: : ::::::: :. :.::.. . :...:::.: .:.::: :
NP_945 DFAHSWNESWVNRMEEGNPRLWYAALLSFTSAFYILSIICVGLLYTYYTKPDGCTENKFF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KSD ISVNMLLCVGASVMSILPKIQESQPRSGLLQSSVITVYTMYLTWSAMTNEPETNCNPSLL
::.:..::: ::..:: ::::: ::::::::::.::.::::::::::.:::. .:::.:.
NP_945 ISINLILCVVASIISIHPKIQEHQPRSGLLQSSLITLYTMYLTWSAMSNEPDRSCNPNLM
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340
pF1KSD SIIGY---------NTTSTVPKE---GQSVQWWHAQGIIGLILFLLCVFYSSIRTSNNSQ
:.: :.:..:: ..: . ....:::..:.::..:::::::.:::
NP_945 SFITRITAPTLAPGNSTAVVPTPTPPSKSGSLLDSDNFIGLFVFVLCLLYSSIRTSTNSQ
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KSD VNKLTLTSDESTLIEDGGARSDGSLEDGDDVHRAVDNERDGVTYSYSFFHFMLFLASLYI
:.::::....:... : . . .. :::. .::::::..:: ::::.::.:: ::::::
NP_945 VDKLTLSGSDSVILGDTTTSGASDEEDGQP-RRAVDNEKEGVQYSYSLFHLMLCLASLYI
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410 420 430 440 450
pF1KSD MMTLTNWYRYEPS-REMKSQWTAVWVKISSSWIGIVLYVWTLVAPLVLTNRDFD
:::::.:: . . . : :.: ::::::::::. ..:::::::::::::.:::
NP_945 MMTLTSWYSPDAKFQSMTSKWPAVWVKISSSWVCLLLYVWTLVAPLVLTSRDFS
420 430 440 450 460 470
>>NP_001167543 (OMIM: 614551) serine incorporator 5 isof (461 aa)
initn: 919 init1: 266 opt: 1124 Z-score: 1379.9 bits: 264.6 E(85289): 4e-70
Smith-Waterman score: 1124; 40.0% identity (68.3% similar) in 460 aa overlap (11-452:7-459)
10 20 30 40 50
pF1KSD MGSVLGLCSMASWIPCLCGSAPC-LLCRCCPSGNNSTVTRLIYALFLLVGVCVACVMLIP
:. . : :::: : : : ::: .: ::..:::.... : . :.:.
NP_001 MSAQCCAGQLACCCGSAGCSLCCDCCPRIRQSLSTRFMYALYFILVVVLCCIMMST
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD GMEEQLNK-IPGFCENEKGVVP---CNILVGYKAVYRLCFGLAMFYLLLSLLMIKVKSSS
. ..... :: : . ::. :. ::::.::::.:::.: :.... :: .:...:.
NP_001 TVAHKMKEHIPFFEDMCKGIKAGDTCEKLVGYSAVYRVCFGMACFFFIFCLLTLKINNSK
60 70 80 90 100 110
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pF1KSD DPRAAVHNGFWFFKFAAAIAIIIGAFFIPE-GTFTTVWFYVGMAGAFCFILIQLVLLIDF
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NP_001 SCRAHIHNGFWFFKLLLLGAMCSGAFFIPDQDTFLNAWRYVGAVGGFLFIGIQLLLLVEF
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pF1KSD AHSWNESWVEKMEEGNSRCWYAALLSATALNYLLSLVAIVLFFVYYTHPASCSENKAFIS
::.::..:. .... :::.: .: . : .. ..::. :.::. :: ::: ...
NP_001 AHKWNKNWTAG--TASNKLWYASLALVTLIMYSIATGGLVLMAVFYTQKDSCMENKILLG
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pF1KSD VNMLLCVGASVMSILPKIQESQPRSGLLQSSVITVYTMYLTWSAMTNEPETNCNPSLLSI
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NP_001 VNGGLCLLISLVAISPWVQNRQPHSGLLQSGVISCYVTYLTFSALSSKPAE----VVLDE
240 250 260 270 280 290
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pF1KSD IGYNTTSTVPKEGQSVQW-WHAQGIIGLILFLLCVFYSSIRTSNNSQVNKLT-------L
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NP_001 HGKNVTICVPDFGQDLYRDENLVTILGTSLLIGCILYSCLTSTTRSSSDALQGRYAAPEL
300 310 320 330 340 350
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pF1KSD TSDESTLIEDGGARSDGSLEDGDDVHRAVDNERDGVTYSYSFFHFMLFLASLYIMMTLTN
. . . :... . : . :.. .:. :..: ::.:::..::::::.:::.::
NP_001 EIARCCFCFSPGGEDTEEQQPGKEGPRVIYDEKKGTVYIYSYFHFVFFLASLYVMMTVTN
360 370 380 390 400 410
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pF1KSD WYRYEPSREMKS----QWTAVWVKISSSWIGIVLYVWTLVAPLVLTNRDFD
:. :: : ...: .:. :::..: :: ..::. :::::: .:.:
NP_001 WFNYE-SANIESFFSGSWSIFWVKMASCWICVLLYLCTLVAPLCCPTREFSV
420 430 440 450 460
>>XP_016883090 (OMIM: 607165) PREDICTED: serine incorpor (418 aa)
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Smith-Waterman score: 1600; 59.3% identity (82.1% similar) in 413 aa overlap (61-452:6-417)
40 50 60 70 80
pF1KSD SGNNSTVTRLIYALFLLVGVCVACVMLIPGMEEQLNKIPGFCE-----NEKGVVP---CN
:: :.::::::: .: . :.
XP_016 MQRKEMETYLKKIPGFCEGGFKIHEADINADKDCD
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90 100 110 120 130 140
pF1KSD ILVGYKAVYRLCFGLAMFYLLLSLLMIKVKSSSDPRAAVHNGFWFFKFAAAIAIIIGAFF
.:::::::::. :..:.:....::::.:::.:.: ::::::::::::.:: :.:..:.:.
XP_016 VLVGYKAVYRISFAMAIFFFVFSLLMFKVKTSKDLRAAVHNGFWFFKIAALIGIMVGSFY
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pF1KSD IPEGTFTTVWFYVGMAGAFCFILIQLVLLIDFAHSWNESWVEKMEEGNSRCWYAALLSAT
:: : :..::: ::: :: :::::::::.:::::::::::..::::: : ::::::: :
XP_016 IPGGYFSSVWFVVGMIGAALFILIQLVLLVDFAHSWNESWVNRMEEGNPRLWYAALLSFT
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KSD ALNYLLSLVAIVLFFVYYTHPASCSENKAFISVNMLLCVGASVMSILPKIQESQPRSGLL
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XP_016 SAFYILSIICVGLLYTYYTKPDGCTENKFFISINLILCVVASIISIHPKIQEHQPRSGLL
160 170 180 190 200 210
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pF1KSD QSSVITVYTMYLTWSAMTNEPETNCNPSLLSIIGY---------NTTSTVPKE---GQSV
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XP_016 QSSLITLYTMYLTWSAMSNEPDRSCNPNLMSFITRITAPTLAPGNSTAVVPTPTPPSKSG
220 230 240 250 260 270
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pF1KSD QWWHAQGIIGLILFLLCVFYSSIRTSNNSQVNKLTLTSDESTLIEDGGARSDGSLEDGDD
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XP_016 SLLDSDNFIGLFVFVLCLLYSSIRTSTNSQVDKLTLSGSDSVILGDTTTSGASDEEDGQP
280 290 300 310 320 330
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pF1KSD VHRAVDNERDGVTYSYSFFHFMLFLASLYIMMTLTNWYRYEPS-REMKSQWTAVWVKISS
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XP_016 -RRAVDNEKEGVQYSYSLFHLMLCLASLYIMMTLTSWYSPDAKFQSMTSKWPAVWVKISS
340 350 360 370 380 390
430 440 450
pF1KSD SWIGIVLYVWTLVAPLVLTNRDFD
::. ..:::::::::::::.:::
XP_016 SWVCLLLYVWTLVAPLVLTSRDFS
400 410
453 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 05:34:58 2016 done: Thu Nov 3 05:35:00 2016
Total Scan time: 8.400 Total Display time: 0.070
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]