FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1217, 1264 aa
1>>>pF1KSDA1217 1264 - 1264 aa - 1264 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.7138+/-0.000425; mu= -15.0597+/- 0.027
mean_var=476.5688+/-99.403, 0's: 0 Z-trim(123.7): 21 B-trim: 0 in 0/61
Lambda= 0.058750
statistics sampled from 43898 (43926) to 43898 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.774), E-opt: 0.2 (0.515), width: 16
Scan time: 20.300
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_016880659 (OMIM: 610786) PREDICTED: SRC kinase (1292) 1244 120.8 5.9e-26
XP_016880663 (OMIM: 610786) PREDICTED: SRC kinase (1035) 1228 119.4 1.3e-25
NP_079524 (OMIM: 610786) SRC kinase signaling inhi (1183) 1228 119.4 1.4e-25
XP_016880662 (OMIM: 610786) PREDICTED: SRC kinase (1208) 1228 119.4 1.4e-25
XP_016880661 (OMIM: 610786) PREDICTED: SRC kinase (1217) 1228 119.4 1.4e-25
XP_016880660 (OMIM: 610786) PREDICTED: SRC kinase (1251) 1228 119.5 1.5e-25
XP_016880658 (OMIM: 610786) PREDICTED: SRC kinase (1479) 805 83.6 1.1e-14
>>XP_016880659 (OMIM: 610786) PREDICTED: SRC kinase sign (1292 aa)
initn: 2089 init1: 651 opt: 1244 Z-score: 586.9 bits: 120.8 E(85289): 5.9e-26
Smith-Waterman score: 2169; 37.4% identity (63.6% similar) in 1210 aa overlap (38-1189:183-1291)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD RKREAFLEHLKQKYPHHASAIMGHQERLRDQTRSPKLSHSPQPPSLGDPVEHLSETSADS
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XP_016 LLSSLCSHLHGDSAPSGAGQPAQQPNYWSFKTRSSRHTQGAQP-GLADQAAKLSYASAES
160 170 180 190 200 210
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LEAMSEGDAPTPFSRGSRTRASLPVVRSTNQTKERSLGVLYLQYGDETKQLRMPNEITSA
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XP_016 LETMSEAELPLGFSRMNRFRQSLPLSRSASQTKLRSPGVLFLQFGEETRRVHITHEVSSL
220 230 240 250 260 270
130 140 150 160 170 180
pF1KSD DTIRALFVSAFPQQLTMKMLESPSVAIYIKDESRNVYYELNDVRNIQDRSLLKVYNKDPA
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XP_016 DTLHALIAHMFPQKLTMGMLKSPNTAILIKDEARNVFYELEDVRDIQDRSIIKIYRKEPL
280 290 300 310 320 330
190 200 210 220 230 240
pF1KSD HAFNHTPKTMNGDMRMQRELVYARGDGPGAPRPGSTAHPPHAIPNSPPSTPVPHSMP---
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XP_016 YAAFPGSHLTNGDLR--REMVYASRESSPTRRLNNLSPAPHLASGSPPPG-LPSGLPSGL
340 350 360 370 380
250 260 270 280 290
pF1KSD ----PSPSRIPYGGTRSMVVPGNATIP----RDRISSLPVSRPISPSPSAILERRDVKPD
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XP_016 QSGSPSRSRLSYAGGRP---PSYAGSPVHHAAERLGGAPAAQGVSPSPSAILERRDVKPD
390 400 410 420 430 440
300 310 320 330 340 350
pF1KSD EDMSGK--NIAMYRNEGFYADPY-LYHEGRMSIASSHGGHPLDVPDHIIAYHRTAIRSAS
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XP_016 EDLASKAGGMVLVKGEGLYADPYGLLHEGRLSLAAA-AGDPFAYPGAGGLYKRGSVRSLS
450 460 470 480 490 500
360 370 380 390 400 410
pF1KSD AYCNPSMQAEMHMEQSLYRQKSRKYPDSHLPTLGSKTPPASPHRVSDLRMIDMHAHYNAH
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XP_016 TYSAAALQSD--LEDSLYKAAGGGGP-LYGDGYGFRLPPSSPQKLADV-----AAPPGGP
510 520 530 540 550
420 430 440 450 460
pF1KSD GPPHTMQ---PDRASPSRQAFKKEPGTL-VYIEKP----RSAAGLSSL----VDLGPPLM
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XP_016 PPPHSPYSGPPSRGSPVRQSFRKDSGSSSVFAESPGGKTRSAGSASTAGAPPSELFPGPG
560 570 580 590 600 610
470 480 490 500 510
pF1KSD EKQVFAYSTATIPKDRETRERMQAMEKQIASLTGLVQSALFKG--PITSYSKDASSEKMM
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XP_016 ERSLVGFGPPVPAKDTETRERMEAMEKQIASLTGLVQSALLRGSEPETPSEKIEGSNGAA
620 630 640 650 660 670
520 530 540 550 560 570
pF1KSD KTTA--NRNHTDSAGTPHVSGGKMLSALESTVPPSQPPPVGTSAIHMSLLEMRRSVAELR
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XP_016 TPSAPCGSGGRSSGATP-VSGPPPPSA--SSTPAGQPTAVSRLQMQLHLRGLQNSASDLR
680 690 700 710 720 730
580 590 600 610 620 630
pF1KSD LQLQQMRQLQLQNQELLRAMMKKAELEISGKVMETMKRLEDPVQRQRVLVEQERQKYLHE
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XP_016 GQLQQLRKLQLQNQESVRALLKRTEAELSMRVSEAARRQEDPLQRQRTLVEEERLRYLND
740 750 760 770 780 790
640 650 660 670 680 690
pF1KSD EEKIVKKLCELEDFVEDLKKDSTAASRLVTLKDVEDGAFLLRQVGEAVATLKGEFPTLQN
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XP_016 EELITQQLNDLEKSVEKIQRDVSHNHRLVPGPELEEKALVLKQLGETLTELKAHFPGLQS
800 810 820 830 840 850
700 710 720 730 740 750
pF1KSD KMRAILRIEVEAVRFLKEEPHKLDSLLKRVRSMTDVLTMLRRHVTDGLLKGTDAAQAAQY
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XP_016 KMRVVLRVEVEAVKFLKEEPQRLDGLLKRCRGVTDTLAQIRRQVDEGVWPPPNN------
860 870 880 890 900
760 770 780 790 800 810
pF1KSD MAMEKATAAEVLKSQEEAAHTSGQPFHSTGAPGDAKSEVVPLSGMMVRHAQSSPVVIQPS
: :: :. :... . :. : ::
XP_016 -----------LLSQSPKKVTAETDFNKS-----VDFEMPP-----------------PS
910 920 930
820 830 840 850 860 870
pF1KSD QHSVALLNPAQNLPHVASSPAVPQEATSTLQMSQAPQSPQIPMNGSAMQSLFIEEIHSVS
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XP_016 --------PPLNL-HELSGPA---EGASLT-----------PKGGNPTKGLDTPGKRSV-
940 950 960 970
880 890 900 910 920 930
pF1KSD AKNRAVSIEKAEKKWEEKRQNLDHYNGKEFEKLLEEAQANIMKSIPNLE-----MP-PAT
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XP_016 --DKAVSVEAAERDWEEKRAALTQYSAKDINRLLEETQAELLKAIPDLDCASKAHPGPAP
980 990 1000 1010 1020
940 950 960 970 980
pF1KSD GP------LPRGDAPVDKVELSEDSPNSEQDLEKLGGKSPP--PPPPPPRRSYLPGSGLT
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XP_016 TPDHKPPKAPHGQKAAPRTEPSGRRGSDELTVPRYRTEKPSKSPPPPPPRRSFPSSHGLT
1030 1040 1050 1060 1070 1080
990 1000 1010 1020 1030
pF1KSD TTRSGDVVYTGRKEN-ITAKASSEDAG-PSPQTRATKYPAE--EPASAWTPSPPPVTTSS
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XP_016 TTRTGEVVVTSKKDSAFIKKAESEELEVQKPQVKLRRAVSEVARPAST-----PPIMASA
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KSD SKDEEEEEEEGDKIMAELQ-----GSSGAPQTSR---MPVPMSAKNRPGTLDKPGKQSKL
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XP_016 IKDEDDE----DRIIAELEVFERSSVSSLPPTPRRQLIPTLLS----PQDLGPPGGSA--
1150 1160 1170 1180 1190
1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD QDPRQYRQANGSAKKSGGDFKPTSPSLPASKIPALSPSSGKSSSLPSSSG--DSSNLPNP
: :...:.. : . : :.. : ::...: .. . .... .
XP_016 --PGPTRKSGGGSVPPMKVVTPGASRLKAAQGQAGSPDKSKHGKQRAEYMRIQAQQQATK
1200 1210 1220 1230 1240 1250
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD PATKPSIASNPLSPQTGPPAHSASLIPSVSNGSLKFQSLTHTGKGHHLSFSPQSQNGRAP
:. . : ... :: . :. : . :: ... . . .:..
XP_016 PSKEMSGSNETSSPVSEKPSASRTSIPVLTSFGARNSSISF
1260 1270 1280 1290
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD PPLSFSSSPPSPASSVSLNQGAKGTRTIHTPSLTSYKAQNGSSSKATPSTAKETS
>>XP_016880663 (OMIM: 610786) PREDICTED: SRC kinase sign (1035 aa)
initn: 1781 init1: 651 opt: 1228 Z-score: 581.0 bits: 119.4 E(85289): 1.3e-25
Smith-Waterman score: 2078; 38.4% identity (63.4% similar) in 1113 aa overlap (71-1132:1-1018)
50 60 70 80 90 100
pF1KSD SPKLSHSPQPPSLGDPVEHLSETSADSLEAMSEGDAPTPFSRGSRTRASLPVVRSTNQTK
:::.. : ::: .: : :::. ::..:::
XP_016 MSEAELPLGFSRMNRFRQSLPLSRSASQTK
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KSD ERSLGVLYLQYGDETKQLRMPNEITSADTIRALFVSAFPQQLTMKMLESPSVAIYIKDES
:: :::.::.:.::..... .:..: ::..::.. :::.::: ::.::..:: ::::.
XP_016 LRSPGVLFLQFGEETRRVHITHEVSSLDTLHALIAHMFPQKLTMGMLKSPNTAILIKDEA
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KSD RNVYYELNDVRNIQDRSLLKVYNKDPAHAFNHTPKTMNGDMRMQRELVYARGDGPGAPRP
:::.:::.:::.:::::..:.: :.: .: . :::.: ::.::: .. . :
XP_016 RNVFYELEDVRDIQDRSIIKIYRKEPLYAAFPGSHLTNGDLR--REMVYASRESSPTRRL
100 110 120 130 140
230 240 250 260 270
pF1KSD GSTAHPPHAIPNSPPSTPVPHSMP-------PSPSRIPYGGTRSMVVPGNATI-PRDRIS
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XP_016 NNLSPAPHLASGSPPPG-LPSGLPSGLQSGSPSRSRLSYAGGRPPSYAGSPVHHAAERLG
150 160 170 180 190 200
280 290 300 310 320
pF1KSD SLPVSRPISPSPSAILERRDVKPDEDMSGK--NIAMYRNEGFYADPY-LYHEGRMSIASS
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XP_016 GAPAAQGVSPSPSAILERRDVKPDEDLASKAGGMVLVKGEGLYADPYGLLHEGRLSLAAA
210 220 230 240 250 260
330 340 350 360 370 380
pF1KSD HGGHPLDVPDHIIAYHRTAIRSASAYCNPSMQAEMHMEQSLYRQKSRKYPDSHLPTLGSK
.: :. : :.: ..:: :.: ..:.. .:.:::. . : . : .
XP_016 -AGDPFAYPGAGGLYKRGSVRSLSTYSAAALQSD--LEDSLYKAAGGGGP-LYGDGYGFR
270 280 290 300 310 320
390 400 410 420 430 440
pF1KSD TPPASPHRVSDLRMIDMHAHYNAHGPPHTMQ---PDRASPSRQAFKKEPGTL-VYIEKP-
::.::....:. : .. :::. :.:.:: ::.:.:. :. :. :.:
XP_016 LPPSSPQKLADVA-----APPGGPPPPHSPYSGPPSRGSPVRQSFRKDSGSSSVFAESPG
330 340 350 360 370
450 460 470 480 490
pF1KSD ---RSAAGLSSL----VDLGPPLMEKQVFAYSTATIPKDRETRERMQAMEKQIASLTGLV
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XP_016 GKTRSAGSASTAGAPPSELFPGPGERSLVGFGPPVPAKDTETRERMEAMEKQIASLTGLV
380 390 400 410 420 430
500 510 520 530 540 550
pF1KSD QSALFKG--PITSYSKDASSEKMMKTTA--NRNHTDSAGTPHVSGGKMLSALESTVPPSQ
::::..: : : : .:. .: . . .:..:: ::: :: :..: .:
XP_016 QSALLRGSEPETPSEKIEGSNGAATPSAPCGSGGRSSGATP-VSGPPPPSA--SSTPAGQ
440 450 460 470 480 490
560 570 580 590 600 610
pF1KSD PPPVGTSAIHMSLLEMRRSVAELRLQLQQMRQLQLQNQELLRAMMKKAELEISGKVMETM
: :. ... : .. :...:: ::::.:.::::::: .::..:..: :.: .: :.
XP_016 PTAVSRLQMQLHLRGLQNSASDLRGQLQQLRKLQLQNQESVRALLKRTEAELSMRVSEAA
500 510 520 530 540 550
620 630 640 650 660 670
pF1KSD KRLEDPVQRQRVLVEQERQKYLHEEEKIVKKLCELEDFVEDLKKDSTAASRLVTLKDVED
.: :::.::::.:::.:: .::..:: :...: .:: :: ...: . ::: ..:.
XP_016 RRQEDPLQRQRTLVEEERLRYLNDEELITQQLNDLEKSVEKIQRDVSHNHRLVPGPELEE
560 570 580 590 600 610
680 690 700 710 720 730
pF1KSD GAFLLRQVGEAVATLKGEFPTLQNKMRAILRIEVEAVRFLKEEPHKLDSLLKRVRSMTDV
:..:.:.::... ::..:: ::.:::..::.:::::.::::::..::.:::: :..::.
XP_016 KALVLKQLGETLTELKAHFPGLQSKMRVVLRVEVEAVKFLKEEPQRLDGLLKRCRGVTDT
620 630 640 650 660 670
740 750 760 770 780 790
pF1KSD LTMLRRHVTDGLLKGTDAAQAAQYMAMEKATAAEVLKSQEEAAHTSGQPFHSTGAPGDAK
:...::.: .:. . : :: :. :... .
XP_016 LAQIRRQVDEGVWPPPNN-----------------LLSQSPKKVTAETDFNKS-----VD
680 690 700 710
800 810 820 830 840 850
pF1KSD SEVVPLSGMMVRHAQSSPVVIQPSQHSVALLNPAQNLPHVASSPAVPQEATSTLQMSQAP
:. : :: : :: : :.:: :..:
XP_016 FEMPP-----------------PS--------PPLNL-HELSGPA---EGASLT------
720 730
860 870 880 890 900 910
pF1KSD QSPQIPMNGSAMQSLFIEEIHSVSAKNRAVSIEKAEKKWEEKRQNLDHYNGKEFEKLLEE
: .:. ..: .:: ..:::.: ::. ::::: : .:..:....::::
XP_016 -----PKGGNPTKGLDTPGKRSV---DKAVSVEAAERDWEEKRAALTQYSAKDINRLLEE
740 750 760 770 780 790
920 930 940 950 960
pF1KSD AQANIMKSIPNLE-----MP-PATGP------LPRGDAPVDKVELSEDSPNSEQDLEKLG
.::...:.::.:. : :: : :.:. . ..: : ..: . .
XP_016 TQAELLKAIPDLDCASKAHPGPAPTPDHKPPKAPHGQKAAPRTEPSGRRGSDELTVPRYR
800 810 820 830 840 850
970 980 990 1000 1010
pF1KSD GKSPP--PPPPPPRRSYLPGSGLTTTRSGDVVYTGRKEN-ITAKASSEDAG-PSPQTRAT
..: :::::::::. . ::::::.:.:: :..:.. . :: ::. .::..
XP_016 TEKPSKSPPPPPPRRSFPSSHGLTTTRTGEVVVTSKKDSAFIKKAESEELEVQKPQVKLR
860 870 880 890 900 910
1020 1030 1040 1050 1060
pF1KSD KYPAEEPASAWTPSPPPVTTSSSKDEEEEEEEGDKIMAELQ-----GSSGAPQTSR---M
. .: : : ::. .:. :::..: :.:.:::. . :. : : : .
XP_016 RAVSEVARPA---STPPIMASAIKDEDDE----DRIIAELEVFERSSVSSLPPTPRRQLI
920 930 940 950 960
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KSD PVPMSAKNRPGTLDKPGKQSKLQDPRQYRQANGSAKKSGGDFKPTSPSLPASKIPALSPS
:. .: : : :: .. : :...:.. : . : :.. : ::.
XP_016 PTLLS----PQDLGPPGGSA----PGPTRKSGGGSVPPMKVVTPGASRLKAAQGQAGSPD
970 980 990 1000 1010
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KSD SGKSSSLPSSSGDSSNLPNPPATKPSIASNPLSPQTGPPAHSASLIPSVSNGSLKFQSLT
..:
XP_016 KSKHGKQRAEYMRIQAQQQV
1020 1030
>>NP_079524 (OMIM: 610786) SRC kinase signaling inhibito (1183 aa)
initn: 1921 init1: 651 opt: 1228 Z-score: 580.1 bits: 119.4 E(85289): 1.4e-25
Smith-Waterman score: 2316; 38.6% identity (64.9% similar) in 1201 aa overlap (1-1136:71-1181)
10 20 30
pF1KSD MQTSEMDRKREAFLEHLKQKYPHHASAIMG
.: .. ::::.::..:::.:::.:: :. :
NP_079 GRRFSNVGLVHTSERRHTVIAAQSLEALSGLQKADADRKRDAFMDHLKSKYPQHALALRG
50 60 70 80 90 100
40 50 60 70 80
pF1KSD HQERLRDQ-------TRSPKLSHSPQPPSLGDPVEHLSETSADSLEAMSEGDAPTPFSRG
.:.:.:.: ::: . ... :: .:.: . .:: .::.:::.:::.. : :::
NP_079 QQDRMREQPNYWSFKTRSSRHTQGAQP-GLADQAAKLSYASAESLETMSEAELPLGFSRM
110 120 130 140 150
90 100 110 120 130 140
pF1KSD SRTRASLPVVRSTNQTKERSLGVLYLQYGDETKQLRMPNEITSADTIRALFVSAFPQQLT
.: : :::. ::..::: :: :::.::.:.::..... .:..: ::..::.. :::.::
NP_079 NRFRQSLPLSRSASQTKLRSPGVLFLQFGEETRRVHITHEVSSLDTLHALIAHMFPQKLT
160 170 180 190 200 210
150 160 170 180 190 200
pF1KSD MKMLESPSVAIYIKDESRNVYYELNDVRNIQDRSLLKVYNKDPAHAFNHTPKTMNGDMRM
: ::.::..:: ::::.:::.:::.:::.:::::..:.: :.: .: . :::.:
NP_079 MGMLKSPNTAILIKDEARNVFYELEDVRDIQDRSIIKIYRKEPLYAAFPGSHLTNGDLR-
220 230 240 250 260 270
210 220 230 240 250
pF1KSD QRELVYARGDGPGAPRPGSTAHPPHAIPNSPPSTPVPHSMP-------PSPSRIPYGGTR
::.::: .. . : .. . :: .::: .: ..: :: ::. :.: :
NP_079 -REMVYASRESSPTRRLNNLSPAPHLASGSPPPG-LPSGLPSGLQSGSPSRSRLSYAGGR
280 290 300 310 320 330
260 270 280 290 300 310
pF1KSD SMVVPGNATIP----RDRISSLPVSRPISPSPSAILERRDVKPDEDMSGK--NIAMYRNE
:. : : .:... :... .::::::::::::::::::...: .... ..:
NP_079 P---PSYAGSPVHHAAERLGGAPAAQGVSPSPSAILERRDVKPDEDLASKAGGMVLVKGE
340 350 360 370 380 390
320 330 340 350 360
pF1KSD GFYADPY-LYHEGRMSIASSHGGHPLDVPDHIIAYHRTAIRSASAYCNPSMQAEMHMEQS
:.::::: : ::::.:.:.. .: :. : :.: ..:: :.: ..:.. .:.:
NP_079 GLYADPYGLLHEGRLSLAAA-AGDPFAYPGAGGLYKRGSVRSLSTYSAAALQSD--LEDS
400 410 420 430 440 450
370 380 390 400 410 420
pF1KSD LYRQKSRKYPDSHLPTLGSKTPPASPHRVSDLRMIDMHAHYNAHGPPHTMQ---PDRASP
::. . : . : . ::.::....:. : .. :::. :.:.::
NP_079 LYKAAGGGGP-LYGDGYGFRLPPSSPQKLADVA-----APPGGPPPPHSPYSGPPSRGSP
460 470 480 490 500
430 440 450 460 470
pF1KSD SRQAFKKEPGTL-VYIEKP----RSAAGLSSL----VDLGPPLMEKQVFAYSTATIPKDR
::.:.:. :. :. :.: :::.. :. .: : :... ... . ::
NP_079 VRQSFRKDSGSSSVFAESPGGKTRSAGSASTAGAPPSELFPGPGERSLVGFGPPVPAKDT
510 520 530 540 550 560
480 490 500 510 520 530
pF1KSD ETRERMQAMEKQIASLTGLVQSALFKG--PITSYSK-DASSEKMMKTTANRNHTDSAGTP
::::::.:::::::::::::::::..: : : : ..:. .. . :.:.
NP_079 ETRERMEAMEKQIASLTGLVQSALLRGSEPETPSEKIEGSNGAATPSAPCGSGGRSSGAT
570 580 590 600 610 620
540 550 560 570 580 590
pF1KSD HVSGGKMLSALESTVPPSQPPPVGTSAIHMSLLEMRRSVAELRLQLQQMRQLQLQNQELL
::: :: :..: .:: :. ... : .. :...:: ::::.:.::::::: .
NP_079 PVSGPPPPSA--SSTPAGQPTAVSRLQMQLHLRGLQNSASDLRGQLQQLRKLQLQNQESV
630 640 650 660 670 680
600 610 620 630 640 650
pF1KSD RAMMKKAELEISGKVMETMKRLEDPVQRQRVLVEQERQKYLHEEEKIVKKLCELEDFVED
::..:..: :.: .: :. .: :::.::::.:::.:: .::..:: :...: .:: ::
NP_079 RALLKRTEAELSMRVSEAARRQEDPLQRQRTLVEEERLRYLNDEELITQQLNDLEKSVEK
690 700 710 720 730 740
660 670 680 690 700 710
pF1KSD LKKDSTAASRLVTLKDVEDGAFLLRQVGEAVATLKGEFPTLQNKMRAILRIEVEAVRFLK
...: . ::: ..:. :..:.:.::... ::..:: ::.:::..::.:::::.:::
NP_079 IQRDVSHNHRLVPGPELEEKALVLKQLGETLTELKAHFPGLQSKMRVVLRVEVEAVKFLK
750 760 770 780 790 800
720 730 740 750 760 770
pF1KSD EEPHKLDSLLKRVRSMTDVLTMLRRHVTDGLLKGTDAAQAAQYMAMEKATAAEVLKSQEE
:::..::.:::: :..::.:...::.: .:. . : ::
NP_079 EEPQRLDGLLKRCRGVTDTLAQIRRQVDEGVWPPPNN-----------------LLSQSP
810 820 830 840
780 790 800 810 820 830
pF1KSD AAHTSGQPFHSTGAPGDAKSEVVPLSGMMVRHAQSSPVVIQPSQHSVALLNPAQNLPHVA
:. :... . :. : :: : :: :
NP_079 KKVTAETDFNKS-----VDFEMPP-----------------PS--------PPLNL-HEL
850 860 870
840 850 860 870 880 890
pF1KSD SSPAVPQEATSTLQMSQAPQSPQIPMNGSAMQSLFIEEIHSVSAKNRAVSIEKAEKKWEE
:.:: :..: : .:. ..: .:: ..:::.: ::. :::
NP_079 SGPA---EGASLT-----------PKGGNPTKGLDTPGKRSV---DKAVSVEAAERDWEE
880 890 900 910
900 910 920 930 940
pF1KSD KRQNLDHYNGKEFEKLLEEAQANIMKSIPNLE-----MP-PATGP------LPRGDAPVD
:: : .:..:....::::.::...:.::.:. : :: : :.:. .
NP_079 KRAALTQYSAKDINRLLEETQAELLKAIPDLDCASKAHPGPAPTPDHKPPKAPHGQKAAP
920 930 940 950 960 970
950 960 970 980 990
pF1KSD KVELSEDSPNSEQDLEKLGGKSPP--PPPPPPRRSYLPGSGLTTTRSGDVVYTGRKEN-I
..: : ..: . . ..: :::::::::. . ::::::.:.:: :..:.. .
NP_079 RTEPSGRRGSDELTVPRYRTEKPSKSPPPPPPRRSFPSSHGLTTTRTGEVVVTSKKDSAF
980 990 1000 1010 1020 1030
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KSD TAKASSEDAG-PSPQTRATKYPAEEPASAWTPSPPPVTTSSSKDEEEEEEEGDKIMAELQ
:: ::. .::.. . .: : : ::. .:. :::..: :.:.:::.
NP_079 IKKAESEELEVQKPQVKLRRAVSE---VARPASTPPIMASAIKDEDDE----DRIIAELE
1040 1050 1060 1070 1080 1090
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KSD GSSGAPQTSRMPVP-----MSAKNRPGTLDKP--GKQ-SKLQDPRQYRQANGSAKKSGGD
...:. .. .: .:... :. :: ::: .. . . .::. .:. .:.
NP_079 SGGGSVPPMKVVTPGASRLKAAQGQAGSPDKSKHGKQRAEYMRIQAQQQATKPSKEMSGS
1100 1110 1120 1130 1140 1150
1120 1130 1140 1150 1160
pF1KSD FKPTSP-----SLPASKIPALSPSSGKSSSLPSSSGDSSNLPNPPATKPSIASNPLSPQT
. .:: : ..::.:. ....::.
NP_079 NETSSPVSEKPSASRTSIPVLTSFGARNSSISF
1160 1170 1180
1170 1180 1190 1200 1210 1220
pF1KSD GPPAHSASLIPSVSNGSLKFQSLTHTGKGHHLSFSPQSQNGRAPPPLSFSSSPPSPASSV
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Smith-Waterman score: 2140; 39.0% identity (64.7% similar) in 1103 aa overlap (38-1088:183-1195)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD RKREAFLEHLKQKYPHHASAIMGHQERLRDQTRSPKLSHSPQPPSLGDPVEHLSETSADS
.::: . ... :: .:.: . .:: .::.:
XP_016 LLSSLCSHLHGDSAPSGAGQPAQQPNYWSFKTRSSRHTQGAQP-GLADQAAKLSYASAES
160 170 180 190 200 210
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LEAMSEGDAPTPFSRGSRTRASLPVVRSTNQTKERSLGVLYLQYGDETKQLRMPNEITSA
::.:::.. : ::: .: : :::. ::..::: :: :::.::.:.::..... .:..:
XP_016 LETMSEAELPLGFSRMNRFRQSLPLSRSASQTKLRSPGVLFLQFGEETRRVHITHEVSSL
220 230 240 250 260 270
130 140 150 160 170 180
pF1KSD DTIRALFVSAFPQQLTMKMLESPSVAIYIKDESRNVYYELNDVRNIQDRSLLKVYNKDPA
::..::.. :::.::: ::.::..:: ::::.:::.:::.:::.:::::..:.: :.:
XP_016 DTLHALIAHMFPQKLTMGMLKSPNTAILIKDEARNVFYELEDVRDIQDRSIIKIYRKEPL
280 290 300 310 320 330
190 200 210 220 230 240
pF1KSD HAFNHTPKTMNGDMRMQRELVYARGDGPGAPRPGSTAHPPHAIPNSPPSTPVPHSMP---
.: . :::.: ::.::: .. . : .. . :: .::: .: ..:
XP_016 YAAFPGSHLTNGDLR--REMVYASRESSPTRRLNNLSPAPHLASGSPPPG-LPSGLPSGL
340 350 360 370 380
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pF1KSD ----PSPSRIPYGGTRSMVVPGNATIP----RDRISSLPVSRPISPSPSAILERRDVKPD
:: ::. :.: : :. : : .:... :... .::::::::::::::::
XP_016 QSGSPSRSRLSYAGGRP---PSYAGSPVHHAAERLGGAPAAQGVSPSPSAILERRDVKPD
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pF1KSD EDMSGK--NIAMYRNEGFYADPY-LYHEGRMSIASSHGGHPLDVPDHIIAYHRTAIRSAS
::...: .... ..::.::::: : ::::.:.:.. .: :. : :.: ..:: :
XP_016 EDLASKAGGMVLVKGEGLYADPYGLLHEGRLSLAAA-AGDPFAYPGAGGLYKRGSVRSLS
450 460 470 480 490 500
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pF1KSD AYCNPSMQAEMHMEQSLYRQKSRKYPDSHLPTLGSKTPPASPHRVSDLRMIDMHAHYNAH
.: ..:... :.:::. . : . : . ::.::....: . : ..
XP_016 TYSAAALQSDL--EDSLYKAAGGGGP-LYGDGYGFRLPPSSPQKLAD-----VAAPPGGP
510 520 530 540 550
420 430 440 450 460
pF1KSD GPPHTMQ---PDRASPSRQAFKKEPGTL-VYIEKP----RSAAGLSSL----VDLGPPLM
:::. :.:.:: ::.:.:. :. :. :.: :::.. :. .: :
XP_016 PPPHSPYSGPPSRGSPVRQSFRKDSGSSSVFAESPGGKTRSAGSASTAGAPPSELFPGPG
560 570 580 590 600 610
470 480 490 500 510
pF1KSD EKQVFAYSTATIPKDRETRERMQAMEKQIASLTGLVQSALFKG--PITSYSK-DASSEKM
:... ... . :: ::::::.:::::::::::::::::..: : : : ..:.
XP_016 ERSLVGFGPPVPAKDTETRERMEAMEKQIASLTGLVQSALLRGSEPETPSEKIEGSNGAA
620 630 640 650 660 670
520 530 540 550 560 570
pF1KSD MKTTANRNHTDSAGTPHVSGGKMLSALESTVPPSQPPPVGTSAIHMSLLEMRRSVAELRL
.. . :.:. ::: :: :..: .:: :. ... : .. :...::
XP_016 TPSAPCGSGGRSSGATPVSGPPPPSA--SSTPAGQPTAVSRLQMQLHLRGLQNSASDLRG
680 690 700 710 720 730
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pF1KSD QLQQMRQLQLQNQELLRAMMKKAELEISGKVMETMKRLEDPVQRQRVLVEQERQKYLHEE
::::.:.::::::: .::..:..: :.: .: :. .: :::.::::.:::.:: .::..:
XP_016 QLQQLRKLQLQNQESVRALLKRTEAELSMRVSEAARRQEDPLQRQRTLVEEERLRYLNDE
740 750 760 770 780 790
640 650 660 670 680 690
pF1KSD EKIVKKLCELEDFVEDLKKDSTAASRLVTLKDVEDGAFLLRQVGEAVATLKGEFPTLQNK
: :...: .:: :: ...: . ::: ..:. :..:.:.::... ::..:: ::.:
XP_016 ELITQQLNDLEKSVEKIQRDVSHNHRLVPGPELEEKALVLKQLGETLTELKAHFPGLQSK
800 810 820 830 840 850
700 710 720 730 740 750
pF1KSD MRAILRIEVEAVRFLKEEPHKLDSLLKRVRSMTDVLTMLRRHVTDGLLKGTDAAQAAQYM
::..::.:::::.::::::..::.:::: :..::.:...::.: .:. .
XP_016 MRVVLRVEVEAVKFLKEEPQRLDGLLKRCRGVTDTLAQIRRQVDEGVWPPPNN-------
860 870 880 890 900
760 770 780 790 800 810
pF1KSD AMEKATAAEVLKSQEEAAHTSGQPFHSTGAPGDAKSEVVPLSGMMVRHAQSSPVVIQPSQ
: :: :. :... . :. : ::
XP_016 ----------LLSQSPKKVTAETDFNKS-----VDFEMPP-----------------PS-
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: :: : :.:: :..: : .:. ..: .::
XP_016 -------PPLNL-HELSGPA---EGASL-----------TPKGGNPTKGLDTPGKRSV--
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pF1KSD KNRAVSIEKAEKKWEEKRQNLDHYNGKEFEKLLEEAQANIMKSIPNLE-----MP-PATG
..:::.: ::. ::::: : .:..:....::::.::...:.::.:. : ::
XP_016 -DKAVSVEAAERDWEEKRAALTQYSAKDINRLLEETQAELLKAIPDLDCASKAHPGPAPT
980 990 1000 1010 1020
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pF1KSD P------LPRGDAPVDKVELSEDSPNSEQDLEKLGGKSPP--PPPPPPRRSYLPGSGLTT
: :.:. . ..: : ..: . . ..: :::::::::. . ::::
XP_016 PDHKPPKAPHGQKAAPRTEPSGRRGSDELTVPRYRTEKPSKSPPPPPPRRSFPSSHGLTT
1030 1040 1050 1060 1070 1080
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pF1KSD TRSGDVVYTGRKEN-ITAKASSEDAG-PSPQTRATKYPAEEPASAWTPSPPPVTTSSSKD
::.:.:: :..:.. . :: ::. .::.. . .: : : ::. .:. ::
XP_016 TRTGEVVVTSKKDSAFIKKAESEELEVQKPQVKLRRAVSE---VARPASTPPIMASAIKD
1090 1100 1110 1120 1130 1140
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pF1KSD EEEEEEEGDKIMAELQGSSGAPQTSRMPVP-----MSAKNRPGTLDKP--GKQSKLQDPR
:..: :.:.:::....:. .. .: .:... :. :: :::
XP_016 EDDE----DRIIAELESGGGSVPPMKVVTPGASRLKAAQGQAGSPDKSKHGKQRAEYMRI
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1100 1110 1120 1130 1140 1150
pF1KSD QYRQANGSAKKSGGDFKPTSPSLPASKIPALSPSSGKSSSLPSSSGDSSNLPNPPATKPS
XP_016 QAQQQV
>>XP_016880661 (OMIM: 610786) PREDICTED: SRC kinase sign (1217 aa)
initn: 1921 init1: 651 opt: 1228 Z-score: 580.0 bits: 119.4 E(85289): 1.4e-25
Smith-Waterman score: 2316; 38.6% identity (64.9% similar) in 1201 aa overlap (1-1136:105-1215)
10 20 30
pF1KSD MQTSEMDRKREAFLEHLKQKYPHHASAIMG
.: .. ::::.::..:::.:::.:: :. :
XP_016 GRRFSNVGLVHTSERRHTVIAAQSLEALSGLQKADADRKRDAFMDHLKSKYPQHALALRG
80 90 100 110 120 130
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pF1KSD HQERLRDQ-------TRSPKLSHSPQPPSLGDPVEHLSETSADSLEAMSEGDAPTPFSRG
.:.:.:.: ::: . ... :: .:.: . .:: .::.:::.:::.. : :::
XP_016 QQDRMREQPNYWSFKTRSSRHTQGAQP-GLADQAAKLSYASAESLETMSEAELPLGFSRM
140 150 160 170 180 190
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pF1KSD SRTRASLPVVRSTNQTKERSLGVLYLQYGDETKQLRMPNEITSADTIRALFVSAFPQQLT
.: : :::. ::..::: :: :::.::.:.::..... .:..: ::..::.. :::.::
XP_016 NRFRQSLPLSRSASQTKLRSPGVLFLQFGEETRRVHITHEVSSLDTLHALIAHMFPQKLT
200 210 220 230 240 250
150 160 170 180 190 200
pF1KSD MKMLESPSVAIYIKDESRNVYYELNDVRNIQDRSLLKVYNKDPAHAFNHTPKTMNGDMRM
: ::.::..:: ::::.:::.:::.:::.:::::..:.: :.: .: . :::.:
XP_016 MGMLKSPNTAILIKDEARNVFYELEDVRDIQDRSIIKIYRKEPLYAAFPGSHLTNGDLR-
260 270 280 290 300 310
210 220 230 240 250
pF1KSD QRELVYARGDGPGAPRPGSTAHPPHAIPNSPPSTPVPHSMP-------PSPSRIPYGGTR
::.::: .. . : .. . :: .::: .: ..: :: ::. :.: :
XP_016 -REMVYASRESSPTRRLNNLSPAPHLASGSPPPG-LPSGLPSGLQSGSPSRSRLSYAGGR
320 330 340 350 360 370
260 270 280 290 300 310
pF1KSD SMVVPGNATIP----RDRISSLPVSRPISPSPSAILERRDVKPDEDMSGK--NIAMYRNE
:. : : .:... :... .::::::::::::::::::...: .... ..:
XP_016 P---PSYAGSPVHHAAERLGGAPAAQGVSPSPSAILERRDVKPDEDLASKAGGMVLVKGE
380 390 400 410 420
320 330 340 350 360
pF1KSD GFYADPY-LYHEGRMSIASSHGGHPLDVPDHIIAYHRTAIRSASAYCNPSMQAEMHMEQS
:.::::: : ::::.:.:.. .: :. : :.: ..:: :.: ..:.. .:.:
XP_016 GLYADPYGLLHEGRLSLAAA-AGDPFAYPGAGGLYKRGSVRSLSTYSAAALQSD--LEDS
430 440 450 460 470 480
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pF1KSD LYRQKSRKYPDSHLPTLGSKTPPASPHRVSDLRMIDMHAHYNAHGPPHTMQ---PDRASP
::. . : . : . ::.::....:. : .. :::. :.:.::
XP_016 LYKAAGGGGP-LYGDGYGFRLPPSSPQKLADVA-----APPGGPPPPHSPYSGPPSRGSP
490 500 510 520 530
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pF1KSD SRQAFKKEPGTL-VYIEKP----RSAAGLSSL----VDLGPPLMEKQVFAYSTATIPKDR
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XP_016 VRQSFRKDSGSSSVFAESPGGKTRSAGSASTAGAPPSELFPGPGERSLVGFGPPVPAKDT
540 550 560 570 580 590
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pF1KSD ETRERMQAMEKQIASLTGLVQSALFKG--PITSYSK-DASSEKMMKTTANRNHTDSAGTP
::::::.:::::::::::::::::..: : : : ..:. .. . :.:.
XP_016 ETRERMEAMEKQIASLTGLVQSALLRGSEPETPSEKIEGSNGAATPSAPCGSGGRSSGAT
600 610 620 630 640 650
540 550 560 570 580 590
pF1KSD HVSGGKMLSALESTVPPSQPPPVGTSAIHMSLLEMRRSVAELRLQLQQMRQLQLQNQELL
::: :: :..: .:: :. ... : .. :...:: ::::.:.::::::: .
XP_016 PVSGPPPPSA--SSTPAGQPTAVSRLQMQLHLRGLQNSASDLRGQLQQLRKLQLQNQESV
660 670 680 690 700 710
600 610 620 630 640 650
pF1KSD RAMMKKAELEISGKVMETMKRLEDPVQRQRVLVEQERQKYLHEEEKIVKKLCELEDFVED
::..:..: :.: .: :. .: :::.::::.:::.:: .::..:: :...: .:: ::
XP_016 RALLKRTEAELSMRVSEAARRQEDPLQRQRTLVEEERLRYLNDEELITQQLNDLEKSVEK
720 730 740 750 760 770
660 670 680 690 700 710
pF1KSD LKKDSTAASRLVTLKDVEDGAFLLRQVGEAVATLKGEFPTLQNKMRAILRIEVEAVRFLK
...: . ::: ..:. :..:.:.::... ::..:: ::.:::..::.:::::.:::
XP_016 IQRDVSHNHRLVPGPELEEKALVLKQLGETLTELKAHFPGLQSKMRVVLRVEVEAVKFLK
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720 730 740 750 760 770
pF1KSD EEPHKLDSLLKRVRSMTDVLTMLRRHVTDGLLKGTDAAQAAQYMAMEKATAAEVLKSQEE
:::..::.:::: :..::.:...::.: .:. . : ::
XP_016 EEPQRLDGLLKRCRGVTDTLAQIRRQVDEGVWPPPNN-----------------LLSQSP
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780 790 800 810 820 830
pF1KSD AAHTSGQPFHSTGAPGDAKSEVVPLSGMMVRHAQSSPVVIQPSQHSVALLNPAQNLPHVA
:. :... . :. : :: : :: :
XP_016 KKVTAETDFNKS-----VDFEMPP-----------------PS--------PPLNL-HEL
880 890 900
840 850 860 870 880 890
pF1KSD SSPAVPQEATSTLQMSQAPQSPQIPMNGSAMQSLFIEEIHSVSAKNRAVSIEKAEKKWEE
:.:: :..: : .:. ..: .:: ..:::.: ::. :::
XP_016 SGPA---EGASLT-----------PKGGNPTKGLDTPGKRSV---DKAVSVEAAERDWEE
910 920 930 940 950
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pF1KSD KRQNLDHYNGKEFEKLLEEAQANIMKSIPNLE-----MP-PATGP------LPRGDAPVD
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XP_016 KRAALTQYSAKDINRLLEETQAELLKAIPDLDCASKAHPGPAPTPDHKPPKAPHGQKAAP
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950 960 970 980 990
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..: : ..: . . ..: :::::::::. . ::::::.:.:: :..:.. .
XP_016 RTEPSGRRGSDELTVPRYRTEKPSKSPPPPPPRRSFPSSHGLTTTRTGEVVVTSKKDSAF
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KSD TAKASSEDAG-PSPQTRATKYPAEEPASAWTPSPPPVTTSSSKDEEEEEEEGDKIMAELQ
:: ::. .::.. . .: : : ::. .:. :::..: :.:.:::.
XP_016 IKKAESEELEVQKPQVKLRRAVSE---VARPASTPPIMASAIKDEDDE----DRIIAELE
1080 1090 1100 1110 1120
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pF1KSD GSSGAPQTSRMPVP-----MSAKNRPGTLDKP--GKQ-SKLQDPRQYRQANGSAKKSGGD
...:. .. .: .:... :. :: ::: .. . . .::. .:. .:.
XP_016 SGGGSVPPMKVVTPGASRLKAAQGQAGSPDKSKHGKQRAEYMRIQAQQQATKPSKEMSGS
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1120 1130 1140 1150 1160
pF1KSD FKPTSP-----SLPASKIPALSPSSGKSSSLPSSSGDSSNLPNPPATKPSIASNPLSPQT
. .:: : ..::.:. ....::.
XP_016 NETSSPVSEKPSASRTSIPVLTSFGARNSSISF
1190 1200 1210
1170 1180 1190 1200 1210 1220
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.::: . ... :: .:.: . .:: .::.:
XP_016 LLSSLCSHLHGDSAPSGAGQPAQQPNYWSFKTRSSRHTQGAQP-GLADQAAKLSYASAES
160 170 180 190 200 210
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XP_016 LETMSEAELPLGFSRMNRFRQSLPLSRSASQTKLRSPGVLFLQFGEETRRVHITHEVSSL
220 230 240 250 260 270
130 140 150 160 170 180
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::..::.. :::.::: ::.::..:: ::::.:::.:::.:::.:::::..:.: :.:
XP_016 DTLHALIAHMFPQKLTMGMLKSPNTAILIKDEARNVFYELEDVRDIQDRSIIKIYRKEPL
280 290 300 310 320 330
190 200 210 220 230 240
pF1KSD HAFNHTPKTMNGDMRMQRELVYARGDGPGAPRPGSTAHPPHAIPNSPPSTPVPHSMP---
.: . :::.: ::.::: .. . : .. . :: .::: .: ..:
XP_016 YAAFPGSHLTNGDLR--REMVYASRESSPTRRLNNLSPAPHLASGSPPPG-LPSGLPSGL
340 350 360 370 380
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pF1KSD ----PSPSRIPYGGTRSMVVPGNATI-PRDRISSLPVSRPISPSPSAILERRDVKPDEDM
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XP_016 QSGSPSRSRLSYAGGRPPSYAGSPVHHAAERLGGAPAAQGVSPSPSAILERRDVKPDEDL
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300 310 320 330 340 350
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..: .... ..::.::::: : ::::.:.:.. .: :. : :.: ..:: :.:
XP_016 ASKAGGMVLVKGEGLYADPYGLLHEGRLSLAAA-AGDPFAYPGAGGLYKRGSVRSLSTYS
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..:... :.:::. . : . : . ::.::.... :. : .. ::
XP_016 AAALQSDL--EDSLYKAAGGGGP-LYGDGYGFRLPPSSPQKLA-----DVAAPPGGPPPP
510 520 530 540 550
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:. :.:.:: ::.:.:. :. :. :.: :::.. :. .: : :..
XP_016 HSPYSGPPSRGSPVRQSFRKDSGSSSVFAESPGGKTRSAGSASTAGAPPSELFPGPGERS
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. ... . :: ::::::.:::::::::::::::::..: : : : .:. .
XP_016 LVGFGPPVPAKDTETRERMEAMEKQIASLTGLVQSALLRGSEPETPSEKIEGSNGAATPS
620 630 640 650 660 670
530 540 550 560 570 580
pF1KSD A--NRNHTDSAGTPHVSGGKMLSALESTVPPSQPPPVGTSAIHMSLLEMRRSVAELRLQL
: . . .:..:: ::: :: :..: .:: :. ... : .. :...:: ::
XP_016 APCGSGGRSSGATP-VSGPPPPSA--SSTPAGQPTAVSRLQMQLHLRGLQNSASDLRGQL
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::.:.::::::: .::..:..: :.: .: :. .: :::.::::.:::.:: .::..::
XP_016 QQLRKLQLQNQESVRALLKRTEAELSMRVSEAARRQEDPLQRQRTLVEEERLRYLNDEEL
740 750 760 770 780 790
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pF1KSD IVKKLCELEDFVEDLKKDSTAASRLVTLKDVEDGAFLLRQVGEAVATLKGEFPTLQNKMR
:...: .:: :: ...: . ::: ..:. :..:.:.::... ::..:: ::.:::
XP_016 ITQQLNDLEKSVEKIQRDVSHNHRLVPGPELEEKALVLKQLGETLTELKAHFPGLQSKMR
800 810 820 830 840 850
710 720 730 740 750 760
pF1KSD AILRIEVEAVRFLKEEPHKLDSLLKRVRSMTDVLTMLRRHVTDGLLKGTDAAQAAQYMAM
..::.:::::.::::::..::.:::: :..::.:...::.: .:. .
XP_016 VVLRVEVEAVKFLKEEPQRLDGLLKRCRGVTDTLAQIRRQVDEGVWPPPNN---------
860 870 880 890 900
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pF1KSD EKATAAEVLKSQEEAAHTSGQPFHSTGAPGDAKSEVVPLSGMMVRHAQSSPVVIQPSQHS
: :: :. :... . :. : ::
XP_016 --------LLSQSPKKVTAETDFNKS-----VDFEMPP-----------------PS---
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830 840 850 860 870 880
pF1KSD VALLNPAQNLPHVASSPAVPQEATSTLQMSQAPQSPQIPMNGSAMQSLFIEEIHSVSAKN
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XP_016 -----PPLNL-HELSGPA---EGASLT-----------PKGGNPTKGLDTPGKRSV---D
940 950 960 970
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pF1KSD RAVSIEKAEKKWEEKRQNLDHYNGKEFEKLLEEAQANIMKSIPNLE-----MP-PATGP-
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XP_016 KAVSVEAAERDWEEKRAALTQYSAKDINRLLEETQAELLKAIPDLDCASKAHPGPAPTPD
980 990 1000 1010 1020 1030
940 950 960 970 980
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:.:. . ..: : ..: . . ..: :::::::::. . ::::::
XP_016 HKPPKAPHGQKAAPRTEPSGRRGSDELTVPRYRTEKPSKSPPPPPPRRSFPSSHGLTTTR
1040 1050 1060 1070 1080 1090
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pF1KSD SGDVVYTGRKEN-ITAKASSEDAG-PSPQTRATKYPAEEPASAWTPSPPPVTTSSSKDEE
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XP_016 TGEVVVTSKKDSAFIKKAESEELEVQKPQVKLRRAVSEVARPA---STPPIMASAIKDED
1100 1110 1120 1130 1140
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XP_016 DE----DRIIAELESGGGSVPPMKVVTPGASRLKAAQGQAGSPDKSKHGKQRAEYMRIQA
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1100 1110 1120 1130 1140 1150
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.::. .:. .:. . .:: : ..::.:. ....::.
XP_016 QQQATKPSKEMSGSNETSSPVSEKPSASRTSIPVLTSFGARNSSISF
1210 1220 1230 1240 1250
1160 1170 1180 1190 1200 1210
pF1KSD TKPSIASNPLSPQTGPPAHSASLIPSVSNGSLKFQSLTHTGKGHHLSFSPQSQNGRAPPP
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10 20 30 40 50 60
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.::: . ... :: .:.: . .:: .::.:
XP_016 LLSSLCSHLHGDSAPSGAGQPAQQPNYWSFKTRSSRHTQGAQP-GLADQAAKLSYASAES
110 120 130 140 150 160
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LEAMSEGDAPTPFSRGSRTRASLPVVRSTNQTKERSLGVLYLQYGDETKQLRMPNEITSA
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XP_016 LETMSEAELPLGFSRMNRFRQSLPLSRSASQTKLRSPGVLFLQFGEETRRVHITHEVSSL
170 180 190 200 210 220
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pF1KSD DTIRALFVSAFPQQLTMKMLESPSVAIYIKDESRNVYYELNDVRNIQDRSLLKVYNKDPA
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XP_016 DTLHALIAHMFPQKLTMGMLKSPNTAILIKDEARNVFYELEDVRDIQDRSIIKIYRKEPL
230 240 250 260 270 280
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290 300 310 320 330
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XP_016 QSGSPSRSRLSYAGGRP---PSYAGSPVHHAAERLGGAPAAQGVSPSPSAILERRDVKPD
340 350 360 370 380 390
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::...: .... ..::.::::: : ::::.:.:.. .: :. : :.: ..:: :
XP_016 EDLASKAGGMVLVKGEGLYADPYGLLHEGRLSLAAA-AGDPFAYPGAGGLYKRGSVRSLS
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.: ..:... :.:::. . : . : . ::.::.... :. : ..
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:::. :.:.:: ::.:.:. :. :. :.: :::.. :. .: :
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470 480 490 500
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:... ... . :: ::: :::.:::::::::::::::::..:
XP_016 ERSLVGFGPPVPAKDTETRRDPMLRGEVAQTPFLPRERMEAMEKQIASLTGLVQSALLRG
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: : : ..:. .. . :.:. ::: :: :..: .:: :.
XP_016 SEPETPSEKIEGSNGAATPSAPCGSGGRSSGATPVSGPPPPSA--SSTPAGQPTAVSRLQ
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pF1KSD IHMSLLEMRRSVAELRLQLQQMRQLQLQNQELLRAMMKKAELEISGKVMETMKRLEDPVQ
... : .. :...:: ::::.:.::::::: .::..:..: :.: .: :. .: :::.:
XP_016 MQLHLRGLQNSASDLRGQLQQLRKLQLQNQESVRALLKRTEAELSMRVSEAARRQEDPLQ
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630 640 650 660 670 680
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::... ::..:: ::.:::..::.:::::.::::::..::.:::: :..::.:...::.:
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pF1KSD TDGLLKGTDAAQAAQYMAMEKATAAEVLKSQEEAAHTSGQPFHSTGAPGDAKSEVVPLSG
.:. . : :: :. :... . :. :
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870 880 890 900
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pF1KSD MMVRHAQSSPVVIQPSQHSVALLNPAQNLPHVASSPAVPQEATSTLQMSQAPQSPQIPMN
:: : :: : :.:: :..: : .
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:. ..: .:: ..:::.: ::. ::::: : .:..:....::::.::...:.
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::.:. : :: : :.:. . ..: : ..: . . ..: :
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1260
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1264 residues in 1 query sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]