Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA1206
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1206, 1909 aa
1>>>pF1KSDA1206 1909 - 1909 aa - 1909 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0811+/-0.000916; mu= 21.9629+/- 0.055
mean_var=102.7599+/-19.662, 0's: 0 Z-trim(109.1): 52 B-trim: 64 in 2/49
Lambda= 0.126521
statistics sampled from 10571 (10623) to 10571 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.668), E-opt: 0.2 (0.326), width: 16
Scan time: 7.500
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14729.1 PLXNB3 gene_id:5365|Hs108|chrX (1909) 13063 2396.3 0
CCDS55536.1 PLXNB3 gene_id:5365|Hs108|chrX (1932) 12950 2375.6 0
CCDS2765.1 PLXNB1 gene_id:5364|Hs108|chr3 (2135) 3067 571.7 1e-161
CCDS43646.1 PLXNA4 gene_id:91584|Hs108|chr7 (1894) 1653 313.6 4.7e-84
CCDS31013.1 PLXNA2 gene_id:5362|Hs108|chr1 (1894) 1623 308.1 2.1e-82
CCDS33847.2 PLXNA1 gene_id:5361|Hs108|chr3 (1896) 1531 291.3 2.4e-77
CCDS14752.1 PLXNA3 gene_id:55558|Hs108|chrX (1871) 1477 281.4 2.2e-74
CCDS33854.1 PLXND1 gene_id:23129|Hs108|chr3 (1925) 1015 197.1 5.5e-49
CCDS43035.1 PLXNB2 gene_id:23654|Hs108|chr22 (1838) 1005 195.3 1.9e-48
CCDS9049.1 PLXNC1 gene_id:10154|Hs108|chr12 (1568) 593 120.0 7.2e-26
CCDS43636.1 MET gene_id:4233|Hs108|chr7 (1390) 383 81.7 2.3e-14
CCDS47689.1 MET gene_id:4233|Hs108|chr7 (1408) 349 75.5 1.7e-12
>>CCDS14729.1 PLXNB3 gene_id:5365|Hs108|chrX (1909 aa)
initn: 13063 init1: 13063 opt: 13063 Z-score: 12878.1 bits: 2396.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 13063; 100.0% identity (100.0% similar) in 1909 aa overlap (1-1909:1-1909)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MCHAAQETPLLHHFMAPVMARWPPFGLCLLLLLLSPPPLPLTGAHRFSAPNTTLNHLALA
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CCDS14 MCHAAQETPLLHHFMAPVMARWPPFGLCLLLLLLSPPPLPLTGAHRFSAPNTTLNHLALA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD PGRGTLYVGAVNRLFQLSPELQLEAVAVTGPVIDSPDCVPFRDPAECPQAQLTDNANQLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PGRGTLYVGAVNRLFQLSPELQLEAVAVTGPVIDSPDCVPFRDPAECPQAQLTDNANQLL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LVSSRAQELVACGQVRQGVCETRRLGDVAEVLYQAEDPGDGQFVAANTPGVATVGLVVPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LVSSRAQELVACGQVRQGVCETRRLGDVAEVLYQAEDPGDGQFVAANTPGVATVGLVVPL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD PGRDLLLVARGLAGKLSAGVPPLAIRQLAGSQPFSSEGLGRLVVGDFSDYNNSYVGAFAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PGRDLLLVARGLAGKLSAGVPPLAIRQLAGSQPFSSEGLGRLVVGDFSDYNNSYVGAFAD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD ARSAYFVFRRRGARAQAEYRSYVARVCLGDTNLYSYVEVPLACQGQGLIQAAFLAPGTLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ARSAYFVFRRRGARAQAEYRSYVARVCLGDTNLYSYVEVPLACQGQGLIQAAFLAPGTLL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD GVFAAGPRGTQAALCAFPMVELGASMEQARRLCYTAGGRGPSGAEEATVEYGVTSRCVTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GVFAAGPRGTQAALCAFPMVELGASMEQARRLCYTAGGRGPSGAEEATVEYGVTSRCVTL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD PLDSPESYPCGDEHTPSPIAGRQPLEVQPLLKLGQPVSAVAALQADGHMIAFLGDTQGQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PLDSPESYPCGDEHTPSPIAGRQPLEVQPLLKLGQPVSAVAALQADGHMIAFLGDTQGQL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD YKVFLHGSQGQVYHSQQVGPPGSAISPDLLLDSSGSHLYVLTAHQVDRIPVAACPQFPDC
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CCDS14 YKVFLHGSQGQVYHSQQVGPPGSAISPDLLLDSSGSHLYVLTAHQVDRIPVAACPQFPDC
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD ASCLQAQDPLCGWCVLQGRCTRKGQCGRAGQLNQWLWSYEEDSHCLHIQSLLPGHHPRQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ASCLQAQDPLCGWCVLQGRCTRKGQCGRAGQLNQWLWSYEEDSHCLHIQSLLPGHHPRQE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD QGQVTLSVPRLPILDADEYFHCAFGDYDSLAHVEGPHVACVTPPQDQVPLNPPGTDHVTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 QGQVTLSVPRLPILDADEYFHCAFGDYDSLAHVEGPHVACVTPPQDQVPLNPPGTDHVTV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD PLALMFEDVTVAATNFSFYDCSAVQALEAAAPCRACVGSIWRCHWCPQSSHCVYGEHCPE
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CCDS14 PLALMFEDVTVAATNFSFYDCSAVQALEAAAPCRACVGSIWRCHWCPQSSHCVYGEHCPE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD GERTIYSAQEVDIQVRGPGACPQVEGLAGPHLVPVGWESHLALRVRNLQHFRGLPASFHC
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CCDS14 GERTIYSAQEVDIQVRGPGACPQVEGLAGPHLVPVGWESHLALRVRNLQHFRGLPASFHC
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD WLELPGELRGLPATLEETAGDSGLIHCQAHQFYPSMSQRELPVPIYVTQGEAQRLDNTHA
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CCDS14 WLELPGELRGLPATLEETAGDSGLIHCQAHQFYPSMSQRELPVPIYVTQGEAQRLDNTHA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD LYVILYDCAMGHPDCSHCQAANRSLGCLWCADGQPACRYGPLCPPGAVELLCPAPSIDAV
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CCDS14 LYVILYDCAMGHPDCSHCQAANRSLGCLWCADGQPACRYGPLCPPGAVELLCPAPSIDAV
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD EPLTGPPEGGLALTILGSNLGRAFADVQYAVSVASRPCNPEPSLYRTSARIVCVTSPAPN
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CCDS14 EPLTGPPEGGLALTILGSNLGRAFADVQYAVSVASRPCNPEPSLYRTSARIVCVTSPAPN
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD GTTGPVRVAIKSQPPGISSQHFTYQDPVLLSLSPRWGPQAGGTQLTIRGQHLQTGGNTSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GTTGPVRVAIKSQPPGISSQHFTYQDPVLLSLSPRWGPQAGGTQLTIRGQHLQTGGNTSA
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD FVGGQPCPILEPVCPEAIVCRTRPQAAPGEAAVLVVFGHAQRTLLASPFRYTANPQLVAA
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CCDS14 FVGGQPCPILEPVCPEAIVCRTRPQAAPGEAAVLVVFGHAQRTLLASPFRYTANPQLVAA
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD EPSASFRGGGRLIRVRGTGLDVVQRPLLSVWLEADAEVQASRAQPQDPQPRRSCGAPAAD
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CCDS14 EPSASFRGGGRLIRVRGTGLDVVQRPLLSVWLEADAEVQASRAQPQDPQPRRSCGAPAAD
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD PQACIQLGGGLLQCSTVCSVNSSSLLLCRSPAVPDRAHPQRVFFTLDNVQVDFASASGGQ
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CCDS14 PQACIQLGGGLLQCSTVCSVNSSSLLLCRSPAVPDRAHPQRVFFTLDNVQVDFASASGGQ
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD GFLYQPNPRLAPLSREGPARPYRLKPGHVLDVEGEGLNLGISKEEVRVHIGRGECLVKTL
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CCDS14 GFLYQPNPRLAPLSREGPARPYRLKPGHVLDVEGEGLNLGISKEEVRVHIGRGECLVKTL
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD TRTHLYCEPPAHAPQPANGSGLPQFVVQMGNVQLALGPVQYEAEPPLSAFPVEAQAGVGM
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CCDS14 TRTHLYCEPPAHAPQPANGSGLPQFVVQMGNVQLALGPVQYEAEPPLSAFPVEAQAGVGM
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD GAAVLIAAVLLLTLMYRHKSKQALRDYQKVLVQLESLETGVGDQCRKEFTDLMTEMTDLS
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CCDS14 GAAVLIAAVLLLTLMYRHKSKQALRDYQKVLVQLESLETGVGDQCRKEFTDLMTEMTDLS
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD SDLEGSGIPFLDYRTYAERAFFPGHGGCPLQPKPEGPGEDGHCATVRQGLTQLSNLLNSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SDLEGSGIPFLDYRTYAERAFFPGHGGCPLQPKPEGPGEDGHCATVRQGLTQLSNLLNSK
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KSD LFLLTLIHTLEEQPSFSQRDRCHVASLLSLALHGKLEYLTDIMRTLLGDLAAHYVHRNPK
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CCDS14 LFLLTLIHTLEEQPSFSQRDRCHVASLLSLALHGKLEYLTDIMRTLLGDLAAHYVHRNPK
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KSD LMLRRTETMVEKLLTNWLSICLYAFLREVAGEPLYMLFRAIQYQVDKGPVDAVTGKAKRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LMLRRTETMVEKLLTNWLSICLYAFLREVAGEPLYMLFRAIQYQVDKGPVDAVTGKAKRT
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KSD LNDSRLLREDVEFQPLTLMVLVGPGAGGAAGSSEMQRVPARVLDTDTITQVKEKVLDQVY
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CCDS14 LNDSRLLREDVEFQPLTLMVLVGPGAGGAAGSSEMQRVPARVLDTDTITQVKEKVLDQVY
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KSD KGTPFSQRPSVHALDLEWRSGLAGHLTLSDEDLTSVTQNHWKRLNTLQHYKVPDGATVGL
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CCDS14 KGTPFSQRPSVHALDLEWRSGLAGHLTLSDEDLTSVTQNHWKRLNTLQHYKVPDGATVGL
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KSD VPQLHRGSTISQSLAQRCPLGENIPTLEDGEEGGVCLWHLVKATEEPEGAKVRCSSLRER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VPQLHRGSTISQSLAQRCPLGENIPTLEDGEEGGVCLWHLVKATEEPEGAKVRCSSLRER
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KSD EPARAKAIPEIYLTRLLSMKGTLQKFVDDTFQAILSVNRPIPIAVKYLFDLLDELAEKHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EPARAKAIPEIYLTRLLSMKGTLQKFVDDTFQAILSVNRPIPIAVKYLFDLLDELAEKHG
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KSD IEDPGTLHIWKTNSLLLRFWVNALKNPQLIFDVRVSDNVDAILAVIAQTFIDSCTTSEHK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 IEDPGTLHIWKTNSLLLRFWVNALKNPQLIFDVRVSDNVDAILAVIAQTFIDSCTTSEHK
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KSD VGRDSPVNKLLYAREIPRYKQMVERYYADIRQSSPASYQEMNSALAELSGNYTSAPHCLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VGRDSPVNKLLYAREIPRYKQMVERYYADIRQSSPASYQEMNSALAELSGNYTSAPHCLE
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1870 1880 1890 1900
pF1KSD ALQELYNHIHRYYDQIISALEEDPVGQKLQLACRLQQVAALVENKVTDL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ALQELYNHIHRYYDQIISALEEDPVGQKLQLACRLQQVAALVENKVTDL
1870 1880 1890 1900
>>CCDS55536.1 PLXNB3 gene_id:5365|Hs108|chrX (1932 aa)
initn: 12950 init1: 12950 opt: 12950 Z-score: 12766.6 bits: 2375.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 12950; 100.0% identity (100.0% similar) in 1894 aa overlap (16-1909:39-1932)
10 20 30 40
pF1KSD MCHAAQETPLLHHFMAPVMARWPPFGLCLLLLLLSPPPLPLTGAH
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LTCSLLSPRLPGSFPQLRRVPPCSRPWLPKAPVMARWPPFGLCLLLLLLSPPPLPLTGAH
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KSD RFSAPNTTLNHLALAPGRGTLYVGAVNRLFQLSPELQLEAVAVTGPVIDSPDCVPFRDPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RFSAPNTTLNHLALAPGRGTLYVGAVNRLFQLSPELQLEAVAVTGPVIDSPDCVPFRDPA
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KSD ECPQAQLTDNANQLLLVSSRAQELVACGQVRQGVCETRRLGDVAEVLYQAEDPGDGQFVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ECPQAQLTDNANQLLLVSSRAQELVACGQVRQGVCETRRLGDVAEVLYQAEDPGDGQFVA
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KSD ANTPGVATVGLVVPLPGRDLLLVARGLAGKLSAGVPPLAIRQLAGSQPFSSEGLGRLVVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ANTPGVATVGLVVPLPGRDLLLVARGLAGKLSAGVPPLAIRQLAGSQPFSSEGLGRLVVG
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KSD DFSDYNNSYVGAFADARSAYFVFRRRGARAQAEYRSYVARVCLGDTNLYSYVEVPLACQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DFSDYNNSYVGAFADARSAYFVFRRRGARAQAEYRSYVARVCLGDTNLYSYVEVPLACQG
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KSD QGLIQAAFLAPGTLLGVFAAGPRGTQAALCAFPMVELGASMEQARRLCYTAGGRGPSGAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QGLIQAAFLAPGTLLGVFAAGPRGTQAALCAFPMVELGASMEQARRLCYTAGGRGPSGAE
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KSD EATVEYGVTSRCVTLPLDSPESYPCGDEHTPSPIAGRQPLEVQPLLKLGQPVSAVAALQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EATVEYGVTSRCVTLPLDSPESYPCGDEHTPSPIAGRQPLEVQPLLKLGQPVSAVAALQA
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KSD DGHMIAFLGDTQGQLYKVFLHGSQGQVYHSQQVGPPGSAISPDLLLDSSGSHLYVLTAHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DGHMIAFLGDTQGQLYKVFLHGSQGQVYHSQQVGPPGSAISPDLLLDSSGSHLYVLTAHQ
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KSD VDRIPVAACPQFPDCASCLQAQDPLCGWCVLQGRCTRKGQCGRAGQLNQWLWSYEEDSHC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VDRIPVAACPQFPDCASCLQAQDPLCGWCVLQGRCTRKGQCGRAGQLNQWLWSYEEDSHC
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560 570 580
pF1KSD LHIQSLLPGHHPRQEQGQVTLSVPRLPILDADEYFHCAFGDYDSLAHVEGPHVACVTPPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LHIQSLLPGHHPRQEQGQVTLSVPRLPILDADEYFHCAFGDYDSLAHVEGPHVACVTPPQ
550 560 570 580 590 600
590 600 610 620 630 640
pF1KSD DQVPLNPPGTDHVTVPLALMFEDVTVAATNFSFYDCSAVQALEAAAPCRACVGSIWRCHW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DQVPLNPPGTDHVTVPLALMFEDVTVAATNFSFYDCSAVQALEAAAPCRACVGSIWRCHW
610 620 630 640 650 660
650 660 670 680 690 700
pF1KSD CPQSSHCVYGEHCPEGERTIYSAQEVDIQVRGPGACPQVEGLAGPHLVPVGWESHLALRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 CPQSSHCVYGEHCPEGERTIYSAQEVDIQVRGPGACPQVEGLAGPHLVPVGWESHLALRV
670 680 690 700 710 720
710 720 730 740 750 760
pF1KSD RNLQHFRGLPASFHCWLELPGELRGLPATLEETAGDSGLIHCQAHQFYPSMSQRELPVPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RNLQHFRGLPASFHCWLELPGELRGLPATLEETAGDSGLIHCQAHQFYPSMSQRELPVPI
730 740 750 760 770 780
770 780 790 800 810 820
pF1KSD YVTQGEAQRLDNTHALYVILYDCAMGHPDCSHCQAANRSLGCLWCADGQPACRYGPLCPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 YVTQGEAQRLDNTHALYVILYDCAMGHPDCSHCQAANRSLGCLWCADGQPACRYGPLCPP
790 800 810 820 830 840
830 840 850 860 870 880
pF1KSD GAVELLCPAPSIDAVEPLTGPPEGGLALTILGSNLGRAFADVQYAVSVASRPCNPEPSLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 GAVELLCPAPSIDAVEPLTGPPEGGLALTILGSNLGRAFADVQYAVSVASRPCNPEPSLY
850 860 870 880 890 900
890 900 910 920 930 940
pF1KSD RTSARIVCVTSPAPNGTTGPVRVAIKSQPPGISSQHFTYQDPVLLSLSPRWGPQAGGTQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RTSARIVCVTSPAPNGTTGPVRVAIKSQPPGISSQHFTYQDPVLLSLSPRWGPQAGGTQL
910 920 930 940 950 960
950 960 970 980 990 1000
pF1KSD TIRGQHLQTGGNTSAFVGGQPCPILEPVCPEAIVCRTRPQAAPGEAAVLVVFGHAQRTLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TIRGQHLQTGGNTSAFVGGQPCPILEPVCPEAIVCRTRPQAAPGEAAVLVVFGHAQRTLL
970 980 990 1000 1010 1020
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KSD ASPFRYTANPQLVAAEPSASFRGGGRLIRVRGTGLDVVQRPLLSVWLEADAEVQASRAQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ASPFRYTANPQLVAAEPSASFRGGGRLIRVRGTGLDVVQRPLLSVWLEADAEVQASRAQP
1030 1040 1050 1060 1070 1080
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CCDS55 QDPQPRRSCGAPAADPQACIQLGGGLLQCSTVCSVNSSSLLLCRSPAVPDRAHPQRVFFT
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CCDS55 RKEFTDLMTEMTDLSSDLEGSGIPFLDYRTYAERAFFPGHGGCPLQPKPEGPGEDGHCAT
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CCDS55 TLQHYKVPDGATVGLVPQLHRGSTISQSLAQRCPLGENIPTLEDGEEGGVCLWHLVKATE
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CCDS55 EPEGAKVRCSSLREREPARAKAIPEIYLTRLLSMKGTLQKFVDDTFQAILSVNRPIPIAV
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CCDS55 KYLFDLLDELAEKHGIEDPGTLHIWKTNSLLLRFWVNALKNPQLIFDVRVSDNVDAILAV
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CCDS55 IAQTFIDSCTTSEHKVGRDSPVNKLLYAREIPRYKQMVERYYADIRQSSPASYQEMNSAL
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CCDS55 AELSGNYTSAPHCLEALQELYNHIHRYYDQIISALEEDPVGQKLQLACRLQQVAALVENK
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CCDS55 VTDL
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. .:.: : .:: :.: :. ::.:. ..::::..:::::.:.: :::. :.:. : ..
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:. .:.. .
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:.. .: .:: : . : .: : :. . :: ::. : :: : ... ..
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:.:....:.:.::::..:: :::.::.: . ::.:: .: : : . ::
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:::: : .::::::: .:: .:: :::::. :: :.::. :: . . :..:.
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.::.:. . . ..: . : . .. :.: . :.:::: . :. : ::.::::.::. :.
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.: :: . . :: ::: .: : . :.: :. .:. : : :: ..: : .
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:.:: .:....: :. :: .::: : ::: .::::: : . : : . ::..
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:: .: . :: .:: . : : ::::.:. ::.::.: . : :: :
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:::. :::. . : :. .: : ::. : :. :.: ::: :..::::.:.:..:::
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:: . :: : :.:::::: :::::::.. : : . . .::.:.:::::....::
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:::..: : .:::: ::.:.:.:...: .:....::::.:::::::::.:: .:::.::
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..: :.:.:::::::::::::.::: :::::::::..:::: ::::: ::. . :
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pF1KSD EDGHCATVRQGLTQLSNLLNSKLFLLTLIHTLEEQPSFSQRDRCHVASLLSLALHGKLEY
:. . ::.::: :::::::::::: .::::: : .:: ::: .:::::..::::::::
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.:::.::::.::.:.:: .:::::::::::.::::::::.:::::.:.:. .::::::::
CCDS27 FTDILRTLLSDLVAQYVAKNPKLMLRRTETVVEKLLTNWMSICLYTFVRDSVGEPLYMLF
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:.:..::::::::.:::::: ::::.::::::::..:::: .: :::::: : :
CCDS27 RGIKHQVDKGPVDSVTGKAKYTLNDNRLLREDVEYRPLTLNALLAVGPGAGEAQG-----
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::..::: :::.:.:::.:::.:::.:..:::. ..::.:::::.:::: :::::.::
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.:. :.::::::::::::::::.::: : . . . . : :: : ::: .:::.
CCDS27 VQGLWRRLNTLQHYKVPDGATVALVPCLTK--HVLRENQDYVP-GERTPMLEDVDEGGIR
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CCDS27 PWHLVKPSDEPEPPRPRRGSLRGGERERAKAIPEIYLTRLLSMKGTLQKFVDDLFQVILS
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..::.:.::::.:::::: :..::: : :.:::::::: ::::.: .::::..:::..:
CCDS27 TSRPVPLAVKYFFDLLDEQAQQHGISDQDTIHIWKTNSLPLRFWINIIKNPQFVFDVQTS
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::.::.: ::::::.:.:: ..::.:::::.:::::::.:::::.:::::::::::. ::
CCDS27 DNMDAVLLVIAQTFMDACTLADHKLGRDSPINKLLYARDIPRYKRMVERYYADIRQTVPA
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pF1KSD SYQEMNSALAELSGNYTSAPHCLEALQELYNHIHRYYDQIISALEEDPVGQKLQLACRLQ
: :::::.::::: ::.. ::.:::..:..::::::.::::: ..::.::. :::
CCDS27 SDQEMNSVLAELSWNYSGDLGARVALHELYKYINKYYDQIITALEEDGTAQKMQLGYRLQ
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CCDS27 QIAAAVENKVTDL
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CCDS27 MPALGPALLQALWAGWVLTLQPLPPTA---FTPNGTYLQ
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CCDS27 LVAQGLAGEPLLFVGRGYTSRGVGGGIPPITTRALWPPDPQAAFSYEETAKLAVGRLSEY
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CCDS27 SHHFVSAFARGASAYFLFLRRDLQAQSRAFRAYVSRVCLRDQHYYSYVELPLACEGGRYG
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CCDS31 PMITPDLESGVKVWHLVKNHDHGD----------QKEGDRGSKMVSEIYLTRLLATKGTL
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:::::: :....: :.: .:.:.::.::.::: :..:.:.: . : ::.: : ::::
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CCDS31 SWVERYYADIAKLPAISDQDMNAYLAEQSRLHAVEFNMLSALNEIYSYVSKYSEELIGAL
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CCDS31 EQDEQARRQRLAYKVEQLINAMSIES
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CCDS33 QIHDADVRHTWKSNCLPLRFWVNVIKNPQFVFDIHKNSITDACLSVVAQTFMDSCSTSEH
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CCDS33 KLGKDSPSNKLLYAKDIPNYKSWVERYYADIAKMPAISDQDMSAYLAEQSRLHLSQFNSM
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pF1KSD EALQELYNHIHRYYDQIISALEEDPVGQKLQLACRLQQVAALVENKVTDL
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CCDS33 SALHEIYSYITKYKDEILAALEKDEQARRQRLRSKLEQVVDTMALSS
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CCDS14 AGVIVEQGQGPSKLFVGTAVDGK-SEYFPTLSSRKLISDE--DSADMFSLVYQDEFVSSQ
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CCDS14 IKIPSDTLSLYPAFDIYYIYGFVSASFVYFLTLQLDTQQTLLDTAGEKFFTSKIVRMCAG
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CCDS33 ARYTLSEEWLLRENIEAKPRNLNVSF-QGCG-------MDSLSVRAMDTDTLTQVKEKIL
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CCDS33 EAFCKNVPYSQWPRAEDVDLEWFASSTQSYILRDLDDTSVVEDGRKKLNTLAHYKIPEGA
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.... : :.. . ::. . : : :. .::: :.: :. . :
CCDS33 SLAM-------SLIDK---KDNTLGR-VKDL-DTEK----YFHLVLPTDE--LAEPKKS-
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CCDS33 QAEKRGISDPDTLHIWKTNSLPLRFWVNILKNPQFVFDIDKTDHIDACLSVIAQAFIDAC
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pF1KSD TTSEHKVGRDSPVNKLLYAREIPRYKQMVERYYADIRQSSPASYQEMNSALAELSGNYTS
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CCDS33 SISDLQLGKDSPTNKLLYAKEIPEYRKIVQRYYKQIQDMTPLSEQEMNAHLAEESRKYQN
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pF1KSD APHCLEALQELYNHIHRYYDQIISALEEDPVGQKLQLACRLQQVAALVENKVTDL
. :. :.:.. .:: ::..::: .:.... :: ...::.::.:...
CCDS33 EFNTNVAMAEIYKYAKRYRPQIMAALEANPTARRTQLQHKFEQVVALMEDNIYECYSEA
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CCDS43 -EPRRPVVEQALYQFSNLLNSKSFLINFIHTLENQREFSARAKVYFASLLTVALHGKLEY
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CCDS43 YTDIMHTLFLELLEQYVVAKNPKLMLRRSETVVERMLSNWMSICLYQYLKDSAGEPLYKL
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CCDS43 IPVKVLNCDTISQVKEKIIDQVYRGQPCSCWPRPDSVVLEWRPGSTAQI-LSDLDLTSQR
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CCDS43 EGRWKRVNTLMHYNVRDGATL-ILSKVGVSQQPEDS-QQDLP-GERHALLE--EENRV--
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CCDS43 WHLVRPTDEVDEGKSKRGSVKEKE--RTKAITEIYLTRLLSVKGTLQQFVDNFFQSVLAP
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pF1KSD NRPIPIAVKYLFDLLDELAEKHGIEDPGTLHIWKTNSLLLRFWVNALKNPQLIFDVRVSD
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CCDS43 GHAVPPAVKYFFDFLDEQAEKHNIQDEDTIHIWKTNSLPLRFWVNILKNPHFIFDVHVHE
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CCDS43 VVDASLSVIAQTFMDACTRTEHKLSRDSPSNKLLYAKEISTYKKMVEDYYKGIRQMVQVS
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CCDS43 DQDMNTHLAEISRAHTDSLNTLVALHQLYQYTQKYYDEIINALEEDPAAQKMQLAFRLQQ
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pF1KSD VAALVENKVTDL
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CCDS43 IAAALENKVTDL
1830
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CCDS90 LDCGTLQYREDPRFTGYRVESEVDTELEVKIQKENDNFNISKKDIEITLFHGENGQLNCS
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CCDS90 FENITRNQDLTTILCKIKGIKTASTIANSSKKVRVKLGNLELY---VEQESVPSTWYFLI
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. ..:. ... . . :::::. : .. ::: ::. . . : :..:
CCDS90 -------VLPVLLVIVIFAAVGVTRHKSKELSRKQSQ---QLELLESELRKEIRDGFAEL
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CCDS90 QMDKLDVV-DSFGT-VPFLDYKHFALRTFFPESGGFTHIFTEDMHNRDANDKN--ESLTA
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CCDS90 LDALICNKSFLVTVIHTLEKQKNFSVKDRCLFASFLTIALQTKLVYLTSILEVLTRDLME
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CCDS90 QCSNMQPKLMLRRTESVVEKLLTNWMSVCLSGFLRETVGEPFYLLVTTLNQKINKGPVDV
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CCDS90 ITCKALYTLNEDWLLWQVPEFSTVALNV-VFEKIPENESADVCRNISVNVLDCDTIGQAK
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::.. :.. .:.:.. . .. . :: . : . :. .. . . .. .:::. :
CCDS90 EKIF-QAFLSKNGSPYGLQ--LNEIGLELQMGTRQKELLDIDSSSVILEDGITKLNTIGH
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:.. .:.:. . .. .. . ..: : : :.: : .. .:
CCDS90 YEISNGSTIKVFKKIANFTSDVEYSDDHCHL-----ILPDSE-----------AFQDVQG
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CCDS90 K-------RHRGKHKFK-VKEMYLTKLLSTKVAIHSVLEKLFRSIWSLPNSRAPFAIKYF
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